cinética enzimática corr

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1Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernández Profesora de Bioquímica. Instituto Tecnológico de Morelia Velocidad de reacción afectada por pH, temperatura y concentración de sustrato La acción de las enzimas es modificada por cambios en el pH, por aumento de temperatura y por la concentración del sustrato. Efecto del pH sobre la velocidad de reacción El pH tiene una influencia marcada sobre la velocidad de las reacciones enzimáticas. Característicamente, para cada enzima hay un valor de pH al cual la velocidad es óptima y a cada lado del óptimo la velocidad es inferior. Esto se debe a que los sitios activos de la enzima se componen a menudo de grupos ionizables que deben encontrarse en la forma iónica adecuada, con el fin de mantener la conformación del sitio activo, unir los sustratos o catalizar la reacción. Además, uno o más de los sustratos pueden contener grupos ionizables y sólo una forma iónica del sustrato puede unirse a la enzima y experimentar la catálisis. La relación pH-actividad de la enzima depende del comportamiento ácido-básico de la enzima y del sustrato. La disminución de la actividad enzimática podría deberse a la formación de una forma iónica incorrecta del sustrato o de la enzima, o de ambos. El pH óptimo de la enzima y el pH de su entorno celular no siempre es el mismo; de tal manera que, en ocasiones, la regulación intracelular de su actividad es el pH. FIGURA 2.13 Velocidad frente al pH, un modelo monoprótico sencillo Considerar un sistema en el que el sustrato es un ácido débil, HA, pero sólo la forma ionizada A - se une a la enzima. El verdadero sustrato es entonces A - . Para una concentración total fija de ácido débil, la proporción que se encuentra en la forma iónica apropiada se calcula con la ecuación de Henderson-Hasselbalch. Cuando el pH es superior en una unidad al pK a 10/11 del total se encuentran como A - . Cuando el pH = pK a + 2, 100/101 del total se encuentran como A - . Cuando el pH es

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Estudia la cinética de las enzimas y los efectos de los diferentes inhibidores de enzimas.

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  • 1Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    Velocidad de reaccin afectada por pH, temperatura y concentracin de sustrato La accin de las enzimas es modificada por cambios en el pH, por aumento de temperatura y por la concentracin del sustrato.

    Efecto del pH sobre la velocidad de reaccin

    El pH tiene una influencia marcada sobre la velocidad de las reacciones enzimticas.

    Caractersticamente, para cada enzima hay un valor de pH al cual la velocidad es

    ptima y a cada lado del ptimo la velocidad es inferior. Esto se debe a que los sitios

    activos de la enzima se componen a menudo de grupos ionizables que deben

    encontrarse en la forma inica adecuada, con el fin de mantener la conformacin del

    sitio activo, unir los sustratos o catalizar la reaccin. Adems, uno o ms de los

    sustratos pueden contener grupos ionizables y slo una forma inica del sustrato

    puede unirse a la enzima y experimentar la catlisis. La relacin pH-actividad de la

    enzima depende del comportamiento cido-bsico de la enzima y del sustrato. La

    disminucin de la actividad enzimtica podra deberse a la formacin de una forma inica incorrecta del sustrato o de la enzima, o de ambos. El pH ptimo de la enzima y el pH de su entorno celular no siempre es el mismo; de tal manera que, en

    ocasiones, la regulacin intracelular de su actividad es el pH.

    FIGURA 2.13

    Velocidad frente al pH, un modelo monoprtico sencillo Considerar un sistema en el que el sustrato es un cido dbil, HA, pero slo la forma

    ionizada A- se une a la enzima. El verdadero sustrato es entonces A-. Para una

    concentracin total fija de cido dbil, la proporcin que se encuentra en la forma

    inica apropiada se calcula con la ecuacin de Henderson-Hasselbalch.

    Cuando el pH es superior en una unidad al pKa 10/11 del total se encuentran como A-.

    Cuando el pH = pKa + 2, 100/101 del total se encuentran como A-. Cuando el pH es

  • 2Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    una unidad menor que el pKa 1/11 se encuentran como A-; as podemos esperar que la

    velocidad aumente a medida que se in-cremente el pH, como se muestra en la figura

    2.14 donde el pKa del sustrato se supone que es 4. Se supone tambin que el sitio

    activo de la enzima contiene un grupo bsico B que deber estar protonado, BH+, para

    unirse al sustrato A-. La proporcin de concentracin total de enzima en la forma inica

    adecuada BH+ disminuye al aumentar el pH, como se ilustra en la figura 2.14 donde el

    pKa del sitio ac-tivo se supone es 7. La actividad mxima terica se dar a un pH en el

    que toda la enzima se encuen-tra como BH+ y todo el sustrato como A-. Sin embargo,

    los dos valores de pKa se diferencian slo en tres unidades y, por lo tanto, la

    combinacin mxima de BH+ y A- se dar a un pH de 5.5 en el que el 97% del sustrato

    total y enzima total estarn en la forma inica adecuada.

    Efecto de la temperatura sobre la velocidad de reaccin

    Muchas reacciones qumicas transcurren a una velocidad mayor si la temperatura

    aumenta. Un aumento en la T comunica ms energa cintica a las molculas del

    reactivo, dando ms colisiones eficaces por unidad de tiempo. Las reacciones

    catalizadas enzimticamente se comportan anlogamente hasta cierto punto. Las

    enzimas son molculas proteicas complejas; su actividad cataltica se debe a una

    estructura terciaria altamente ordenada y exacta que da lugar a la formacin de sitios

    estereoespecficos de unin del sustrato con el centro cataltico. La estructura terciaria

    de una enzima se conserva por un gran nmero de enlaces dbiles no covalentes; por

    lo tanto, una enzima es una estructura frgil y muy delicada. Si la enzima absorbe

    demasiada energa, la estructura terciaria se rompe y la enzima se des-naturaliza y

    pierde su actividad cataltica. As, al elevarse la temperatura, el aumento esperado en

    velo-cidad debido al incremento de colisiones E+S es anulado por el aumento de la

  • 3Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    velocidad de desna-turalizacin; por lo tanto, una representacin de actividad cataltica

    frente a T generalmente muestra un pico que se conoce como temperatura ptima. Las enzimas de peso molecular bajo compuestas de cadenas polipeptdicas sencillas y

    que poseen puentes disulfuro son, generalmente, ms estables al calor que las de

    peso molecular alto como las enzimas oligomricas.

    La curva que presentan las reacciones catalizadas por enzimas se debe:

    Al incremento habitual de la reaccin por aumento de la temperatura.

    Desnaturalizacin de la enzima que se lleva a cabo entre 45 - 60 C.

    Como se mencion anteriormente, la relacin entre la constante de velocidad k, y la

    energa de activa-cin Ea viene dada por la ecuacin de Arrhenius

    RTE

    - a

    Ae =k que tambin se puede expresar

    [y = m x + b]

    La forma integrada de la ecuacin de Arrhenius es:

    O bien

    AlogT1

    R303.2

    Eklog a +=

    12

    12a

    1

    2

    TT

    TT

    R303.2

    E

    k

    klog

    =

    1

    2

    12

    12

    a k

    klog

    TT

    TRT303.2E

    =

  • 4Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    Donde k1 y k2 son las constantes especficas de velocidad de reaccin a dos

    temperaturas diferentes, t1 y t2, respectivamente.

    En un sistema sencillo de equilibrio rpido, Vmax/[E]t = kp, constante de

    velocidad de primer or-den. As, una representacin de log Vmax/[E]t frente a 1/T da Ea

    para el proceso cataltico. En la prctica slo puede representarse log Vmax, ya que la

    Vmax de una preparacin dada es proporcional a kp.

    El efecto de temperatura sobre la velocidad de reaccin se expresa

    frecuentemente en trmi-nos de un coeficiente de temperatura, Q10, que es el factor en que aumenta la velocidad al incre-mentar la temperatura 10 C.

    Efecto de la concentracin del sustrato sobre la velocidad de reaccin

    La velocidad de una reaccin catalizada por una enzima se incrementa al aumentar la

    concentracin de sustrato hasta un punto en el cual ya no hay incremento, aun con la

    adicin de ms sustrato. En esta fase, el sustrato ha saturado los sitios activos de la

    enzima y se ha logrado la velocidad mxima de la reaccin, la cual depende de la

    afinidad de la enzima y el sustrato correspondiente.

    Cintica enzimtica Para que una reaccin qumica se lleve a cabo es necesario:

    Que las molculas se reconozcan qumicamente; es decir, que tengan una

    orientacin espacial ptima.

    Que posean la suficiente energa para alcanzar un estado de transicin en el

    cual la probabilidad de establecer o romper un enlace sea elevada. Este

    estado de transicin se encuentra en la barrera de energa que separa

    reactivos y productos. Se puede esquematizar de la siguiente manera:

    10

    QlogTRT303.2E

    1012

    a =

  • 5Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    Energa de activacin Es la energa necesaria para llevar las molculas de un mol de sustancia al estado de transicin.

    Energa de activacin y catlisis Se sabe que los procesos espontneos transcurren con disminucin de la energa

    libre. La energa adi-cional que hay que suministrar al sustrato para que se transforme

    en producto recibe el nombre de energa de activacin, como se haba mencionado.

    La energa de activacin est relacionada con la constante de velocidad de la reaccin

    qumica, como se indica:

    S Pk

    k = - dSdt

    = dPdt

    k = constante de velocidad

    V = k[S]

    La energa de activacin y la constante de velocidad estn relacionadas por la ecuacin de Arrhe-nius

    en donde

    A = nmero de molculas que tienen la suficiente energa para reaccionar e = base de logaritmo natural R = 1.99 cal/Kmol T = 273 + C Sacando logaritmo natural a los dos miembros de la ecuacin, tenemos que

    RTE - a

    Ae =k

  • 6Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    RT

    E -ln A eln ln A =k ln aRT

    E- a

    =

    Sustituyendo ln A = B.

    ln k = B - ERT

    a

    Esta ecuacin permite deducir que la velocidad de cualquier reaccin qumica ser

    mayor al aumentar la temperatura de la reaccin y disminuir la energa de activacin.

    Se sabe que por cada 10 de elevacin de temperatura la velocidad de

    reaccin se duplica. Precisamente, los catalizadores disminuyen la energa de activacin y en consecuencia aumentan considerablemente la velocidad de la reaccin catalizada.

    Llamamos k a la constante de velocidad de la reaccin espontnea, y k a la

    catalizada:

    ln k = B - ERT

    y ln k' = B - ERT

    a a '

    Restando mutuamente, tenemos

    2.303 RT

    'E - E =

    kk'

    log ,bieno,RT

    'E - E =

    kk'

    ln aaaa

    Esta relacin nos indica cuantas veces es ms rpida una reaccin catalizada de una no catalizada.

    Principios de la cintica enzimtica

    La cintica es el estudio de las velocidades de reaccin y el conocimiento de los

    principios que rigen dichas reacciones. Vamos a relacionar la velocidad de la reaccin

    con la concentracin de los reactivos mediante la expresin

    V = k[ ]

    Sea la reaccin

    en donde,

    kf = constante de formacin kr = constante de reversibilidad

    A B + C A B + Ck kf r

    V = kf [A] V = kr [B][C]

  • 7Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    Sobre una base cintica, las reacciones qumicas se pueden clasificar por el orden de

    reaccin en: de primer orden, de segundo orden, de tercer orden y de orden cero.

    Reacciones de primer orden

    Son aqullas cuya velocidad depende de la concentracin de un reaccionante.

    A P

    La velocidad de reaccin en cualquier tiempo t est dada por:

    V = k[A]

    Puesto que V = mol/seg, y [A] = mol, despejando k tenemos

    k = seg-1 La forma integrada de esta ecuacin, que es ms til para la realizacin de clculos cinticos, es En las reacciones de primer orden, la mitad del tiempo est dada por:

    Reacciones de segundo orden

    Son aqullas cuya velocidad es proporcional a la concentracin de dos reaccionantes

    A + B P

    La velocidad de esta reaccin se puede expresar como

    si [A] = [B] V = k [A]2

    despejando k tenemos

    V = -d[A]

    dt =

    d[P]dt

    V = -d[A]

    dt = -

    d[B]dt

    = d[P]dt

    303.2kt

    ]A[]A[

    log o =

    k693.0

    t2

    1 =

    [ ] [ ]Ak=dtAd-=V

    [ ] k[A][B]=dtAd-=V

  • 8Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    ]B][A[]A][B[log

    ]B[]A[k303.2t

    o

    o

    o =

    k = (seg mol)-1

    La forma integrada de la expresin de segundo orden es en donde

    [Ao] y [Bo] son las concentraciones iniciales

    [A] y [B] son las concentraciones en el tiempo t

    En las reacciones de segundo orden, cuyas concentraciones de los reaccionantes son

    iguales, el tiempo mitad es igual a

    en donde

    Co = concentracin inicial de los reaccionantes

    k = constante de velocidad de segundo orden

    Reacciones de tercer orden

    Son aqullas cuya velocidad es proporcional a la concentracin de tres reaccionantes

    A + B + C P

    La velocidad de esta reaccin se puede expresar como

    si [A] = [B] = [C] V = k [A]3 despejando k tenemos

    k = (seg mol )2 -1

    Reacciones de orden cero

    Son independientes de la concentracin de cualquiera de los reaccionantes. La

    velocidad puede de-pender de la concentracin del catalizador

    V = -d[A]

    dt = -

    d[B]dt

    = -d[C]dt

    = d[P]dt

    kC1

    to

    21 =

    [ ] k[A][B][C]=dtAd-=V

  • 9Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    [ ]V = - d Adt

    = k[A] = ko

    despejando k

    k = mol/seg

    Obsrvese que la velocidad es una constante a lo largo del tiempo que dura la

    reaccin.

    Los principios generales de cintica de las reacciones qumicas son aplicables

    a las reacciones enzimticas, pero stas tienen una caracterstica que no se observa

    en las reacciones qumicas no enzimticas y es la saturacin con el sustrato. Los primeros conocimientos sobre el comportamiento enzimtico se deben a V.

    Henri y ms tarde a L. Michaelis y Maud L. Menten. El modelo de accin enzimtica de

    Michaelis-Menten ha sido la base de la cintica enzimtica. Su trabajo experimental se

    realiz con un extracto de levaduras ricas en invertasa (hidroliza la sacarosa). Se

    recopilaron los datos de dos experimentos independientes, los cuales se indican a

    continuacin.

    1) Mientras la concentracin del sustrato se mantuvo constante, en tanto se

    haca variar la con-centracin de enzima, se observ lo siguiente:

    2) El experimento inverso, cuando la concentracin de enzima se mantuvo

    constante y la concentracin de sustrato se hizo variar, se observ lo

    siguiente:

  • 10Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    Este ltimo comportamiento se explica suponiendo que: A concentraciones muy bajas de sustrato [S] < 0.01 Km la representacin de V

    frente a [S] es prcticamente lineal. Esta es la regin de cintica de primer orden.

    A medida que aumenta la [S], la velocidad disminuye y deja de ser

    proporcional a la [S]; en esta zona la reaccin es de orden mixto.

    Al aumentar la [S], [S] > 100 Km, la velocidad es prcticamente independiente de la [S]. Esta es la regin de cintica de orden cero.

    Cuando la [S] est entre 0.1 Km y 10 Km, la cintica que muestra es la cintica clsica de Michaelis-Menten.

    Eleonor Michaelis Maud Menten

    En 1913, Michaelis-Menten explicaron de manera sencilla este comportamiento.

    Supusieron que la enzima poda combinarse de modo reversible con el sustrato para

    formar un complejo intermedio enzima-sustrato (ES), el cual se descompone para

    formar los productos y la enzima queda libre en su forma original.

    La velocidad de formacin del complejo ES

    Vf ES = Vf = k1[E][S]

    la velocidad de disociacin del complejo ES

    VD ES = VD = K3[ES] + k2[ES]

    cuando se alcanza el equilibrio para ES

    Vf = VD

  • 11Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    k1[E][S] = K3[ES] + k2[ES]

    simplificando

    k1[E][S] = (k2 + K3) [ES]

    Si [E] = [ET] - [ES]. Sustituyendo [E] tenemos, ET = Enzima total

    k1 ( [ET] - [ES] ) [S] = (k2 + K3) [ES]

    despejando las k tenemos

    [ES]

    [S] ) [ES] - ][E ( =

    k

    k + k T

    1

    32

    en donde

    .Michaelis) de (constante K= k

    k + km

    1

    32 Sustituyendo

    [ES]

    [S] ) [ES] - ][E ( = K Tm

    simplificando

    [ES]

    ) [S] [ES] ( - ) [S] ][E ( = K Tm

    [S] - [ES]

    [S] ][E = K Tm

    La velocidad de formacin del producto es V = k3 [ES]; esta velocidad la podemos llamar velocidad inicial (Vo);

    entonces [ES] = Vo / k3

    sustituyendo [ES]

    [ES][S] ][E = [S]+K Tm

    [S]+K[S] ][E = [ES]

    m

    T

  • 12Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    [S]+K

    [S] ][E =

    k

    V

    m

    T

    3

    o

    despejando Vo

    [S]+K

    [S] ][E k=V

    m

    T3o

    Si Vo = k3 [ES] la velocidad mxima (Vmax) se alcanzar cuando toda la enzima est unida al sustrato;

    entonces

    Vmax = k3 [ET]

    sustituyendo k3 [ET]

    Esta es la ecuacin cintica clsica de Michaelis-Menten y corresponde a una hiprbola con Vo y [S] como coordenadas, y con la constante Vmax como asntota.

    Cuando Vo = Vmax los sitios activos de la enzima estn ocupados y toda la

    enzima est como ES y no hay enzima libre; esta condicin se llama saturacin al 100%. Cuando la saturacin es al 50%

    Vo = Vmax

    sustituyendo Vo en la ecuacin de Michaelis-Menten:

    V2

    = V [S]K +[S]

    max max

    m

    simplificando

    Km + [S] = 2 [S]

    Km = 2 [S] - [S]

    Km = [S]

    [S]+K[S] V =V

    m

    maxo

  • 13Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    Km = [S], a la que se alcanza la mitad de la mxima velocidad. Esto habla de la especificidad de

    la enzima. Mientras ms pequea es la Km, mayor es la especificidad de la enzima por ese sustrato.

    La fraccin de sitios unidos a una determinada concentracin de sustrato puede ser

    calculada por:

    [S]+K[S]

    = V mmax

    Vf ES =

    La aproximacin del estado estacionario

    En 1925, Briggs y Haldane establecieron una hiptesis. Estos autores sealaron una

    importante cir-cunstancia que se muestra en la figura siguiente

    Este diagrama muestra cmo tienden a variar las concentraciones de los distintos

    componentes de una reaccin enzimtica en el curso de la misma.

  • 14Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    De acuerdo con esto, despus de un primer momento transitorio [S] y [P] cambian

    mucho ms rpida-mente en trminos absolutos que [E] y [ES]. Si la enzima est

    presente en cantidades catalticas; es decir, [S] >> [ET], entonces, inmediatamente despus de mezclar E y S se alcanza un estado estacio-nario en el que [ES]

    permanece, prcticamente, constante con el tiempo. Cabe considerar cero la velocidad

    de cambio de [E] y [ES] respecto al tiempo, en comparacin con la velocidad de

    cambio con [S] y [P]. Esta suposicin de Briggs y Haldane se conoce como

    aproximacin del estado estacionario. De esto puede deducirse una ecuacin de velocidad de forma similar a la descrita por Michaelis-Menten.

    Cintica de primer orden

    La relacin lineal entre V y [S] cuando [S] Km, la Km puede deducirse a partir de la

    ecuacin de Mi-chaelis-Menten.

    Cuando [S] >> Km, la Km en el denominador se deprecia y la ecuacin se

    reduce a:

    [S][S] V =V maxo , simplificando Vo = Vmax

    Para efectos prcticos, la velocidad es constante e independiente de [S].

    Cuando la [S] est entre 0.1 Km y 10 Km, la cintica que muestra es la cintica clsica de Michaelis-Menten.

    [S]+K[S] V =V

    m

    maxo

  • 15Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    Determinacin de Km y Vmax por representacin doble directa

    Conocidos dos o ms puntos de la hiprbola Michaeliana, de coordenadas individuales

    (x1, y1), se pue-den trazar todas las rectas que pasen por los puntos (x1,0) y (0, y1),

    obtenindose as un haz que con-fluye en el punto de coordenadas (-Km, Vmax) como

    muestra la figura:

    Transformacin de la ecuacin de Michaelis-Menten Representacin de Lineweaver-Burk

    De V = V [S]

    K +[S]omax

    m

    El recproco de esta ecuacin es

    1V

    = K +[S]V [S]o

    m

    max

    Simplificando 1

    V= K

    V1

    [S] + 1

    Vom

    max max

    [y = m x + b] Ecuacin de una recta

  • 16Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    Representacin de Eadie-Hofstee

    La ecuacin de Michaelis-Menten se transforma en la ecuacin que corresponde a una recta.

    V = - K V[S]

    + Vm max

    [y = m x + b]

    Representacin de Dixon La ecuacin de Michaelis-Menten puede tambin generar una recta al expresarla en la

    forma

    max

    m

    max VK +

    V[S] =

    V[S]

    [y = m x + b]

    ndice de recambio

  • 17Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    El trmino ndice de recambio puede utilizarse de dos formas. Una, que ha sido definida como activi-dad molecular, es el nmero de moles de sustrato transformados por minuto por mol de enzima en condiciones ptimas. Otra, considerando que muchas enzimas son oligmeros que contienen n subunidades, es el nmero de moles de sustrato transformados por minuto por mol de subuni-dad activa o centro cataltico en condiciones ptimas. Esta ltima definicin de poder cataltico se llama actividad de centro cataltico.

    Inhibicin enzimtica Cualquier sustancia que reduzca la velocidad de una reaccin catalizada

    enzimticamente se puede considerar como un inhibidor. Tanto la velocidad mxima como la Km pueden verse afectadas de diferentes maneras. La inhibicin de la

    actividad enzimtica es uno de los mecanismos de regulacin de las clulas vivas y

    uno de los procedimientos ms importantes de diagnstico enzimtico.

    En la vida cotidiana, los inhibidores enzimticos pueden encontrarse en sustancias

    como dro-gas, antibiticos, conservadores, venenos y toxinas.

    Inhibicin irreversible

    En primer lugar, se reconoce la inhibicin irreversible que supone una unin covalente enzima-inhibidor que lesiona o suprime la actividad enzimtica, sin

    posibilidad de regeneracin. As, por ejemplo, el iodoacetato o el

    diisopropilfluorofosfato pueden bloquear a los aminocidos cistena o serina del centro

    activo de la enzima inutilizndola como catalizador

    CysSH + ICH2COOH CysSCH2COOH + HI

    [ ]tmax

    p E

    Vk =

  • 18Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    Inhibicin reversible

    En la inhibicin reversible, la unin enzima-inhibidor (EI) suele ser no covalente y, por tanto, temporal. El complejo (EI) se podr formar y destruir de acuerdo con las

    leyes de los equilibrios qumicos. Se describen tres tipos fundamentales de inhibicin

    reversible: inhibicin competitiva; inhibicin no competitiva a) pura y b)mixta; e inhibicin acompetitiva.

    Inhibicin competitiva

    Un inhibidor competitivo es una sustancia que se combina con la enzima libre, de

    forma que impide la unin con el sustrato. Es decir, el inhibidor y el sustrato se

    excluyen mutuamente. Un inhibidor competitivo puede ser un anlogo no metabolizable, un derivado del verdadero sustrato, otro sustrato para la enzima o un

    producto de reaccin. Esta inhibicin se puede compensar aumentando la

    concentracin de sustrato lo que permite alcanzar la misma velocidad mxima. El

    efecto aparente del inhibidor es disminuir la afinidad de la enzima por el sustrato.

    El cido malnico es un ejemplo clsico de un verdadero inhibidor competitivo. Inhibe

    la succinato deshidrogenasa que cataliza la oxidacin del cido succnico a cido

    fumrico.

    El cido malnico se parece al cido succnico lo suficiente como para combinarse con

    la enzima en el sitio activo

  • 19Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    Esta inhibicin se diagnostica midiendo Vo contra [S] en ausencia y en presencia de

    inhibidor. Sus representaciones grficas son:

    Inhibicin competitiva

    De V = V [S]

    K +[S]omax

    m

    En esta inhibicin se ve afectada la Km por el factor (1 + [I]/KI ), el cual puede

    considerarse como un factor estadstico dependiente de la [I], que indica la distribucin

    de enzima entre las formas E y EI. As, tenemos que

    I

    mm K[I]

    +1 K = 'K

    La constante de Michaelis aparente (Km) aumenta.

    La ecuacin se transforma en la ecuacin correspondiente a una recta

    [ y = m x + b ]

    [ ][ ] maxImax

    m

    V

    1

    S

    1

    K

    I1

    V

    K

    V

    1+

    +=

    [S]+ K[I] + 1 K

    [S] V =V

    Im

    maxo

  • 20Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    Como ejemplos de esta inhibicin estn los antibiticos, insecticidas, herbicidas y

    medicamentos contra el cncer, por mencionar algunos.

    Modelos de inhibicin competitiva

    El modelo 1 ilustra la inhibicin competitiva clsica en la que un inhibidor compite con

    el sustrato por un sitio nico de unin. Los modelos 2-4 representan otras formas en

    las que un inhibidor y un sustrato se excluyen mutuamente: impedimento estrico

    (modelo 2); impedimento estrico o competicin por un grupo de unin comn

    (modelo 3) y sitios de unin superpuestos (modelo 4).

    Inhibicin no competitiva

    Inhibicin no competitiva pura El inhibidor no se fija en el centro activo, sino en otro punto de la molcula enzimtica,

    modificando la eficacia cataltica de sta. La unin del inhibidor a la enzima no es

    excluyente para el sustrato, pero el complejo ternario ESI no origina productos de

    reaccin.

    Esta inhibicin no afecta a la constante de Michaelis de la enzima, pero disminuye la

    velocidad mxima. El resultado aparente es que hay menos molculas enzimticas

    dispuestas a actuar sobre el sustrato. El efecto de inhibicin no se contrarresta al

    aumentar la concentracin de sustrato; la inhibi-cin depende slo de la concentracin

    del inhibidor.

  • 21Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    Sus representaciones grficas son:

    De V = V [S]K +[S]o

    max

    m

    En esta inhibicin se ve afectada la velocidad por el factor (1 + [I]/KI ), as:

    ) [S]+K ( K[I]

    + 1

    [S] V =V

    m

    I

    maxo

    K[I]

    +1

    V = 'V

    I

    maxmax

    La Vmax aparente disminuye

    Ecuacin de Lineweaver-Burk afectada:

    [ ]

    ++

    +

    II KI

    VK11

    S1I1

    VK=

    V1

    maxmax

    m

    o

    [ y = m x + b ]

  • 22Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    Como ejemplos de esta inhibicin tenemos enzimas que tienen como cofactores

    metales y son inhibi-os reversiblemente por EDTA o enzimas que tienen grupos

    tilicos (-SH) que reaccionan reversible-mente con metales pesados, como Pb++, Hg++

    y Ag+.

    Inhibicin no competitiva mixta

    En la cintica de la inhibicin no competitiva mixta, tanto la Vmax como la Km se ven

    afectadas. En la figura se representan las caractersticas de esta inhibicin

    De V = V [S]

    K +[S]omax

    m

    En esta inhibicin el factor (1 + [I]/KI) afecta de la siguiente manera:

    [S]+ K[I] + 1 K

    [S]

    K[I] + 1

    V =V

    Im

    I

    maxo

  • 23Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    K[I]+1

    V = 'V

    I

    maxmax

    La Vmax aparente disminuye

    Imm K

    [I]+1 K = 'K

    La constante de Michaelis aparente (Km) aumenta.

    Ecuacin de Lineweaver-Burk afectada:

    [ ]

    ++

    +

    ImaxI KI

    VK11

    S1I1

    VK=

    V1

    max

    m

    o

    [ y = m x + b ]

    Inhibicin acompetitiva

    El inhibidor slo se une al complejo enzima-sustrato, y no a la enzima libre. El

    complejo ternario ESI tampoco origina producto final. Como resultado, la velocidad

    mxima disminuye (ya que no todos los complejos ES van a producir reaccin) pero la

    constante de Michaelis aparente disminuye: aumenta la estabilidad del complejo ES

    por la presencia del inhibidor.

    La grfica registra las caractersticas de este tipo de inhibicin

  • 24Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    FIGURA 2.21

    De V = V [S]

    K +[S]omax

    m

    En esta inhibicin el factor (1 + [I]/KI) afecta de la siguiente manera:

    [S]+

    K[I] + 1

    K

    [S]

    K[I] + 1

    V =V

    I

    m

    I

    maxo

    Sacando comn denominador

    K[I] + 1

    K[I] + 1 [S]+K

    [S]

    K[I] + 1

    V =V

    I

    Im

    I

    maxo

    Por ley de la herradura

  • 25Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    K[I] + 1 [S]+K

    K[I] + 1 [S]

    K[I] + 1

    V =V

    Im

    I

    I

    maxo

    Eliminando trminos

    Finalmente

    K[I] + 1 [S]+K

    [S] V =V

    Im

    maxo

    K[I]+1

    V = 'V

    I

    maxmax

    La Vmax aparente disminuye

    K[I]+1

    K = 'K

    I

    mm

    La constante de Michaelis aparente (Km) disminuye.

    Ecuacin de Lineweaver-Burk afectada:

    [ ]

    ++

    Imax KI

    V11

    S1

    VK=

    V1

    max

    m

    o

    [ y = m x + b ]

  • 26Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    Ejemplos. La inhibicin acompetitiva es rara en sistemas unirreactivos. Sin embargo

    merece la pena considerarla porque es un ejemplo sencillo de adicin secuencial de

    los ligandos enzimticos en un orden obligado. La inhibicin acompetitiva es comn en

    sistemas multirreactivos.

    Cintica de las enzimas alostricas La cintica que se ha estudiado (de tipo hiperblico) no resulta aplicable a la totalidad

    de las enzimas. Existen muchas enzimas de estructura oligomrica cuyas subunidades

    se influyen mutuamente; es decir, la actuacin de una de ellas repercute en el

    comportamiento de las dems. Como consecuencia de este fenmeno, la cintica de

    estas enzimas suele ser ms compleja: en general, de tipo sigmoideo.

    Cooperatividad: Ecuacin de Hill La concentracin de sustrato puede influir en la velocidad de reaccin de las enzimas

    reguladoras, dando lugar a la mencionada cintica sigmoidea.

    El efecto cooperativo se atribuye a que la enzima presenta varios centros activos (uno

    por cada monmero), ya que puede adoptar dos conformaciones espaciales distintas:

    la forma R (relajada) ms activa, y la forma T (tensa) menos activa, en equilibrio dinmico. La presencia del sustrato puede despla-zar el equilibrio, favoreciendo la

    adopcin de una de ellas, de acuerdo con el esquema siguiente:

  • 27Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    La ecuacin simplificada de Hill explica matemticamente la cintica sigmoidea al suponer la capaci-dad preferente de la enzima para unirse simultneamente a n

    molculas de sustrato, segn la ecuacin

    Por un razonamiento anlogo al seguido con la deduccin de la ecuacin de Michaelis

    se llega a lo siguiente:

    [ ][ ]SKmSVVo

    +=

    max

    El sentido qumico de K 0.5 (anlogo al descrito para Km) es el de aquella concentracin

    de sustrato que permite a la enzima trabajar a la mitad de la mxima velocidad. Al

    operar matemticamente la ecuacin tenemos

    PE ++ nES Sn E

    nn0.5

    nmax

    [S] K[S]V

    V+

    =

    ( ) [ ] SV [S] KV nmaxn0.5n =+[ ] SV V[S] VK nmaxn0.5n =+

    [ ] V[S] -SV VK nnmax0.5n =

    nn0.5

    nmax

    [S] K[S]V

    V+

    =

  • 28Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    Al aplicar logaritmos se obtiene

    A n se le denomina coeficiente de Hill. Si su valor es 1, no existe cooperatividad; si es

    mayor que 1, hay cooperatividad positiva; y si es menor que 1, la cooperatividad es

    negativa. Sus valores habituales en las enzimas reguladoras oscilan entre 2 y 3

    Efectores alostricos

    Las enzimas alostricas modifican su actividad cataltica al fijar determinados ligandos

    sobre el centro activo: sustrato natural, sustrato anlogo, inhibidores competitivos,

    [S] V) -(V VK nmax0.5n =

    V

    [S] V) -(V K

    nmax

    0.5n =

    V

    V) -(V

    SK max

    n

    0.5n

    =

    n

    KS

    V

    =

    5.0max

    VV

    5.0max

    loglog V

    Vlog knSnV

    =

    bmxY =

  • 29Recopilado por Luz del Carmen Ornelas Hernndez Profesora de Bioqumica. Instituto Tecnolgico de Morelia

    entre otros. Estos ligandos se podran denominar ligandos homotrpicos, pero con frecuencia estos u otros compuestos pueden fijarse a centros diferentes del centro cataltico, llamados centros alostricos. Estos ligandos sern heterotrpicos y tambin son capaces de modificar la actividad cataltica de las enzimas reguladoras.

    Los inhibidores alostricos disminuyen o anulan la actividad cataltica de la enzima y los activadores alostricos la aumentan. La activacin o inhibicin puede afectar a diversos parmetros de la cintica

    enzimtica. Entre los modelos clsicos se consideran los sistemas K en los que se ve afectada la K0.5 y los sistemas V, en los que resulta alterada la velocidad mxima. En el esquema A es activador o modulador positivo e I es modulador negativo o

    inhibidor.

    En la figura anterior se representan las modificaciones cinticas producidas por un

    activador (A) o un inhibidor (I) en los dos sistemas considerados.

    Velocidad frente al pH, un modelo monoprtico sencilloLa aproximacin del estado estacionario

    En 1925, Briggs y Haldane establecieron una hiptesis. Estos autores sealaron una importante cir-cunstancia que se muestra en la figura siguienteModelos de inhibicin competitiva

    Cintica de las enzimas alostricasCooperatividad: Ecuacin de Hill