cinética e inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

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Universidad de La Serena Facultad de Ciencias Departamento de Biología Laboratorio Bioquímica General Ingeniería en Alimentos Alumna: Natalia Vargas Guzmán Profesora: Carla Maturana Valdivia I Semestre 2013

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Page 1: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Universidad de La Serena

Facultad de Ciencias

Departamento de Biología

Laboratorio Bioquímica General

Ingeniería en Alimentos

Alumna: Natalia Vargas Guzmán

Profesora: Carla Maturana Valdivia

I Semestre 2013

Page 2: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

La concentración de sustrato determina la actividad enzimática

medida como la velocidad de la catálisis enzimática. Si la

concentración de la enzima se mantiene saturada, la

producción de producto será a una velocidad máxima.

Page 3: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Gráfica Michaelis-Menten: Ecuación Michaelis-Menten:

Page 4: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Gráfica Lineweaver-Burk:

Ecuación Lineweaver-Burk:

Page 5: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Gráfica Eadie-Hofstee:

Ecuación Eadie-Hofstee:

Page 6: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Gráfica Hanes-Woolf:

Ecuación Hanes-Woolf:

Page 7: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Velocidad de reacción

enzimática

Inhibidores

Irreversible Reversible

Competitiva

No competitiva

Acompetitiva

Activadores

La forma de representar la

inhibición gráficamente es con la doble reciproca

Page 8: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

En la inhibición competitiva, el inhibidor

compite con el sustrato por el sitio activo.

Km Aument

a

Vmax Constant

e

Page 9: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

En la inhibición no competitiva el inhibidor

se une a la enzima en otro lado, no es su

sitio activo

Km

Vmax

Constant

e

Disminuy

e

Page 10: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

En la inhibición acompetitiva el inhibidor se

une al complejo enzima-sustrato ya

conformado.

Cambio

proporcional en Km

y Vmax

Page 11: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)
Page 12: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Objetivos:

- Estudiar la influencia de la concentración de sustrato en

la velocidad de una reacción enzimática.

- Calcular la constante de Michaelis-Menten.

Fundamento: Determinar de la actividad enzimática de

una preparación de β-fructofuranosidasa en presencia

de diferentes concentraciones de sacarosa como

sustrato.

Page 13: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Materiales:• 8 tubos de ensayo

• Pipeta

• Baño termorregulador a 27°C

• Espectrofotómetro

• 8 Cubetas de espectrofotómetro

Reactivos:• Solución Glucosa-Fructosa 0,01M

• Soluciones de sacarosa (distintas concentraciones)

• Reactivo DNS (inhibe o detiene la act. Enzimática)

• Buffer acetato

• Solución extracto de β-fructofuranosidasa con una dilución que asegure un producto 5 moles/min.

Page 14: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Procedimientos:

1. Disponer serie de 6 tubos de ensayo con concentración creciente de

sacarosa.

2. Luego agregar :

- 1,5 mL Buffer acetato

- 0,5 mL solución enzima 1/2000.

3. Equilibrar a 27°C por 3 minutos (Agregar sacarosa 1 mL).

4. Dejar en baño a 27°C por 40 minutos.

5. Agregar 2 mL de DNS, enfriar.

6. Agregar 15 mL de Agua destilada

7. Medir absorbancia (540nm).

Page 15: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Resultados y ConclusionesPara calcular la concentración de glucosa usaremos la ecuación de la

recta obtenida por la curva de calibración:

y = 0,183x - 0,0085r² = 0,9992

0

0.2

0.4

0.6

0.8

1

1.2

1.4

1.6

1.8

2

0.00 2.00 4.00 6.00 8.00 10.00 12.00

Ab

sorb

an

cia

a 5

40

nm

Concentración Glucosa (mM)

Curva de calibración Glucosa-Fructosa por el Método DNS

Abs =0,183 [Glucosa]-0,0085[Glucosa] = Abs+0,0085

0,183

Page 16: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Abs =0,183 [Glucosa]-0,0085[Glucosa] = Abs+0,0085

0,183

Reemplazamos la absorbancia de cada tubo para calcular la concentración de glucosa.

Calcular concentración de sacarosa en reacción para cada

tubo:

C1 x V1 = C2 x V2

Concentración del tubo 1:

0,45M x 1 mL = C2 x 3 mL

C2 = 0,15 M Sacarosa en reacción

Para calcular la velocidad de la reacción:

V= [glucosa] tiempo de reacción: 40

minutos

tiempo reacción

Page 17: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Tabla: Valores obtenidos

Tubo[sacarosa]

M

Absorbanci

a

[Sacarosa

en reacción]

M

[Glucosa] Velocidad de

reacción

(M/min)

1 0,45 2,950,15 16,1 0,40

2 0,3 3,07 0,1 16,8 0,42

3 0,2 3,010,066 16,49 0,41

4 0,1 2,04 0,033 11,2 0,28

5 0,05 1,420,0166 7,8 0,19

6 0,03 1,14 0,01 6,27 0,15

P 0,45 0,570,15 3,17 0,079

Page 18: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

[sacarosa] MVelocidad de reacción

(M/min)

0,45 0,40

0,3 0,42

0,2 0,41

0,1 0,28

0,05 0,19

0,03 0,15

Tabla datos gráfico Michaelis-Menten

Vmax

Km= Vmax

2

Vmax = 0,21

(M/min)

2

Km = 0,02 M

Page 19: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

0

0.05

0.1

0.15

0.2

0.25

0.3

0.35

0.4

0.45

0 0.02 0.04 0.06 0.08 0.1 0.12 0.14 0.16

Ve

loci

dad

(M/m

in)

Concentración sacarosa (M)

Grafico Michaelis-Menten: Influencia de la concentración de sacarosa sobre la velocidad de reacción catalizada por la

-fructofuranosidasa

Km

Vmax

Vmax2

Page 20: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

y = 0,0484x + 2,0082R² = 0,9818

0

1

2

3

4

5

6

7

8

0 20 40 60 80 100 120

1/v

(M

/min

)

1/[S] (M)

Grafico Lineweaver-Burk: Influencia de la concentración de sacarosa sobre la velocidad de reacción catalizada por la

-fructofuranosidasa

Page 21: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

1/s 1/v

6,67 2,5

10 2,38

15,15 2,44

30,30 3,57

60,24 5,26

100 6,67

Tabla datos gráfico Lineweaver-Burk

y = 0,0484x + 2,0082

1 = 2,0082 (M/min)

Vmax

Km = 0,0484

Vmax

Vmax = 0,4979 (M/min)

1 = 41,49 (M)

Km

Km = 0,0241 (M)

Page 22: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)
Page 23: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

v/s v2,67 0,44,2 0,42

6,21 0,418,48 0,28

11,45 0,1915 0,15

Tabla datos gráfico Eadie-Hofstee:

y = -0,0245x + 0,5043

Km = 0,0245 (M) Vmax = 0,5043 (M/min)

Page 24: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Grafico Vmax (M/min) Km (M)

Michaelis-Menten 0,42 0,02

Lineweaver-Burk 0,49 0,024

Eadie-Hofstee 0,50 0,024

Observamos que los resultados obtenidos son

muy similares, gracias a los diferentes gráficos

podemos calcular la actividad enzimática y su

valores de Km y Vmax.

A mi parecer el gráfico mas eficiente es el de

Lineweaver-Burk ya que la actividad enzimática representada de forma lineal facilita los cálculos.

Page 25: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Objetivos:

- Estudiar la acción de inhibidores no competitivos sobre la

velocidad de una reacción enzimática.

Fundamento: Determinar la velocidad de la hidrólisis de

sacarosa a diferentes concentraciones por la β-

fructofuranosidasa en presencia de una concentración

constante de yodo acetato.

Page 26: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Materiales:

• 14 tubos de ensayo

• Pipeta

Reactivos:

• Yodo acetato 0,001M

• Solución de Glucosa - Fructosa 0,01M

• Solución de sacarosa a diferentes concentraciones

• Reactivo DNS (inhibe o detiene la actividad enzimática)

• Buffer acetato pH=4,7 0,05 M

• Solución extracto β-fructofuranosidasa

Page 27: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Procedimientos:

Luego agregar:

- 1 mL Buffer acetato

Equilibrar a 27°C por 3 minutos.

Agregar 0,5 mL solución enzima 1/250.

Dejar en baño a 27°C por 5 minutos.

Agregar 2 mL de DNS a 100°C por 5 minutos (enfriar).

Agregar 15 mL de Agua destilada

Medir absorbancia (540nm).

Con inhibidor

Sin inhibidor

Page 28: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Abs =0,183 [Glucosa]-0,0085

[Glucosa] = Abs+0,0085

0,183

Reemplazamos la absorbancia de cada tubo para calcular la concentración de glucosa.

Calcular concentración de sacarosa en reacción para cada

tubo:

C1 x V1 = C2 x V2

Concentración del tubo 1:

0,45M x 1 mL = C2 x 3 mL

C2 = 0,15 M Sacarosa en reacción

Para calcular la velocidad de la reacción:

V= [glucosa] tiempo de reacción: 40

minutos

tiempo reacción

Resultados y Conclusiones

Haremos los mismos procedimientos pero ahora calcularemos velocidad con y sin inhibidor

Page 29: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Tabla valores

obtenidosSIN INHIBIDOR CON INHIBIDOR

Tub

o

[sa

ca

ros

a]

M [Sacaros

a en

reacción

] M

Abs

[Glucosa

]

M

Velocida

d

(M/min)

Abs

[Glucos

a]

M

Velocida

d

(M/min)

10,45 0,15 2,46 13,51 2,70 2,95 9,85 1,97

20,3 0,1 2,05 11,25 2,25 3,07 8,10 1,62

3 0,2 0,066 1,67 9,19 1,83 3,01 6,88 1,37

40,1 0,033 0,87 4,77 0,95 2,04 4,67 0,93

5 0,05 0,0166 0,56 3,10 0,62 1,42 3,12 0,62

60,03 0,01 0,45 2,48 0,49 1,14 2,30 0,46

Page 30: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

[Sacarosa] M Velocidad C.I.

M/min

0,15 1,97

0,1 1,62

0,066 1,37

0,033 0,93

0,0166 0,62

0,01 0,46

[Sacarosa] M Velocidad S.I.

M/min

0,15 2,70

0,1 2,25

0,066 1,83

0,033 0,95

0,0166 0,62

0,01 0,49

Tablas para gráfico Michaelis-Menten

Page 31: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)
Page 32: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

CON INHIBIDORSIN INHIBIDOR

Vmax = 2,7 (M/min)

Vmax = 1,35 (M/min)

2

Km = 0,04 (M)

Vmax = 1,97 (M/min)

Vmax = 0,985 (M/min)

2

Km = 0,028 (M)

Vmax = Km

2

Page 33: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

1/[S] M 1/v S.I.

(M/min)

6,67 0,507

10 0,617

16,67 0,729

33,33 1,075

62,5 1,613

100 2,174

1/[S] M 1/v C.I.

(M/min)

6,67 0,370

10 0,444

16,67 0,546

33,33 1,052

62,5 1,612

100 2,040

Tablas para gráfico Lineweaver-Burk

Page 34: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)
Page 35: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

SIN INHIBIDOR CON INHIBIDOR

Km = 0,0186

Vmax

1 = 0,3016 (M/min)

Vmax

1 x 1 = 1

Vmax 0,0186 Km

1 = 16,21 (M)

Km

Km = 0,0178

Vmax

1 = 0,4385 (M/min)

Vmax

1 x 1 = 1

Vmax 0,0178 Km

1 = 24,63 (M)

Km

Page 36: Cinética e Inhibición enzimática (laboratorio bioquimica)

Gráfico Michaelis-Menten:

Vmax (M/min) Km (M)

Sin inhibidor 2,70 0,040

Con inhibidor 1,97 0,028

Observamos que en presencia del Inhibidor yodo

acetato , la Vmax y Km disminuye. Estamos en

presencia de un inhibidor acompetitivo ya que el

resultado es un cambio proporcional en la Vmax y Km

Gráfico Lineweaver-Burk:

Vmax (M/min) Km (M)

Sin inhibidor 3,32 0,061

Con inhibidor 2,28 0,040