recombinación conservativa sitio-específica

Recombinación conservativa sitio-específica

Biología Molecular I

Licenciatura en Ciencias Genómicas

UNAM

Conservativa porque…

• Cada enlace que se rompe es resellado por la recombinasa.

• No se necesita energía externa para el corte del DNA ni la unión mediada por las proteínas

Tipos de rearreglos

Repeats

http://biologyforhighschool.net/wp-content/uploads/2013/12/inverted-and-direct-repeats.jpg

http://2012.igem.org/wiki/images/thumb/f/f2/Syn_MR_Inversion_Deletion.png/400px-Syn_MR_Inversion_Deletion.png

Recombinasas

• Ser • Tyr

Ser

• Corte en las 4 cadenas

• 4 subunidades

• Rotación 180°

• Ataque al 3’-OH

• Ligación

http://openi.nlm.nih.gov/detailedresult.php?img=3241657_gkr652f1&req=4

Flagelina H2 Flagelina H1

Ejemplo animado: Hin invertasa

• Video 2

http://elifesciences.org/content/2/e01211

Tyr

• Corte y unión de 2 en 2

• 4 subunidades

• Estructura Holliday

• Resolución

http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1097276505000882

Ejemplo animado: Fago lambda

• http://sites.fas.harvard.edu/~biotext/animations/sitespecific.html

APLICACIONES

Datsenko

Colección Keio

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1681482/figure/f2/

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Mol Syst Biol. 2006; 2: 2006.0008.

Gap repair cloning