abp - g44ºb.enzimas
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ENZIMAS
Son proteínas que actúan
como catalizadores:
Modificando la
velocidad de la
reacción que catalizan
Rebajando la energía
de activación de la
reacción que regulan.
ENZIMAS
Para que una reacción se lleve a cabo las moléculas deben alcanzar un estado energético determinado (energía de activación).
Puede conseguirse esta energía, de dos formas:
ENZIMAS
Aumentando la temperatura.
Sin embargo, las enzimas se desnaturalizan a esa T. Además, esa energía debe proceder de otra reacción, lo que aumenta el gasto energético.
ENZIMAS
Con enzimas
Las enzimas
rebajan la
energía de
activación
ENZIMAS
Sin enzimas
ENZIMAS
Con enzimas
ENZIMAS
Con enzimas
Sin enzimas
ENZIMAS: PROPIEDADES DE LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
EFICACIA DE LA CATÁLISIS
ESPECIFICIDAD
REGULACIÓN
REVERSIBILIDAD
ENZIMAS: PROPIEDADES DE LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
EFICACIA DE LA CATÁLISIS
• Son los catalizadores más potentes: actúan en
concentraciones muy pequeñas
• La velocidad de catálisis es muy alta (108-1020 veces
que sin enzimas)
• El rendimiento es muy alto
• Las condiciones de reacción son suaves (fisiológicas)
ENZIMAS: PROPIEDADES DE LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
EFICACIA DE LA CATÁLISIS
ESPECIFICIDAD
Puede ser:
• Absoluta o de sustrato. (v.g. ureasa)
• Relativa o de reacción
• Estereospecificidad (v.g. D-aminooxidasas)
• De grupo (v.g. hexoquinasas)
• De clase (v.g. estearasas)
ENZIMAS: PROPIEDADES DE LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
EFICACIA DE LA CATÁLISIS
ESPECIFICIDAD
ENZIMAS: PROPIEDADES DE LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
EFICACIA DE LA CATÁLISIS
ESPECIFICIDAD
REGULACIÓN
• Mediante la cantidad de enzima, regulando la
expresión génica (transcripción)
• Mediante el control de la actividad enzimática
ENZIMAS: PROPIEDADES DE LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
EFICACIA DE LA CATÁLISIS
ESPECIFICIDAD
REGULACIÓN
REVERSIBILIDAD
Mecanismos de irreversibilidad:
- Salto energético grande
- Compartimentación celular de algún paso, lo que
separa enzima y sustrato
ENZIMAS
Nomenclatura
Nomenclatura histórica:
SUSTRATO + ACTIVIDAD + SUFIJO(asa)
(v.g. glucoquinasa)
SUSTRATO + SUFIJO(asa)
(v.g. ureasa)
DONADOR + ACEPTOR + ACTIVIDAD + SUFIJO(asa)
(v.g. oxalacetilaminotransferasa)
Nomenclatura IUB (1972): 6 grupos según la reacción catalizada
Sin transferencia de hidrógenos
1. OXIDORREDUCTASAS
ENZIMAS
Nomenclatura
• Regulan reacciones REDOX
• Existen dos tipos esenciales:
• Con transferencia de
hidrógenos
• Sin transferencia de
hidrógenos
1. OXIDORREDUCTASAS
ENZIMAS
Nomenclatura
• Regulan reacciones REDOX
• Existen dos tipos esenciales:
• Con transferencia de
hidrógenos
• Sin transferencia de
hidrógenos
Con transferencia de hidrógenos
ENZIMAS
Nomenclatura
2. TRANSFERASAS • Transfieren grupos funcionales
3. HIDROLASAS
ENZIMAS
Nomenclatura
•Rotura de enlaces por medio de
agua
4. LIASAS
ENZIMAS
Nomenclatura
•Rotura o formación de
moléculas sin intervención de
agua.
•Suele producirse adición a
dobles enlaces: C=C, C=O,
C=N
5. ISOMERASAS
ENZIMAS
Nomenclatura
Cambio de posición de grupos
dentro de la molécula
6. LIGASAS O SINTETASAS
ENZIMAS
Nomenclatura
Formación de enlaces con
rotura de ATP
Activación del
complejo enzima-
sustrato
Transformación del
complejo E-S en E-P
(enzima-productos)
ENZIMAS
Mecanismo de actuación
Formación del
complejo enzima-
sustrato
Liberación de los
productos y de la
enzima
ENZIMAS
Cinética enzimática
• Es la concentración de sustrato a la
que la velocidad de reacción es la
mitad de la velocidad máxima.
• Es una medida de la afinidad de la
enzima por el sustrato:
KM alta AFINIDAD baja
ENZIMAS
Cinética enzimática¿Cómo calcular la
velocidad máxima?
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
Moduladores ambientales
pH
Cada enzima tiene su pH óptimo de actuación
La velocidad enzimática aumenta con la T
hasta un valor crítico en el que la proteína se
inactiva por desnaturalización
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
Moduladores ambientales
pH
T
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
Moduladores ambientales
pH
T
s
Cocatalizadores
Activadores e inhibidores
La concentración salina puede llegar a precipitar
una proteína e inactivarla
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
Moduladores ambientales
Cocatalizadores
Algunas enzimas requieren la presencia de una molécula no
proteica para la catálisis: son las proteínas CONJUGADAS u
HOLOENZIMAS
APOENZIMA: parte proteica
Según la complejidad de la
porción no proteica:
• Cofactor
• Coenzima
• Grupo prostético
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
Moduladores ambientales
Cocatalizadores
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
Moduladores ambientales
Cocatalizadores
GRUPO PROSTÉTICO
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
Moduladores ambientales
Cocatalizadores
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
Moduladores ambientales
Cocatalizadores
Activadores e Inhibidores
REGULACIÓN ALOSTÉRICA
La unión no covalente de una
molécula a la enzima, en un
sitio diferente del centro
activo (sitio alostérico)
provoca un cambio
conformacional que modifica
la afinidad de la enzima por
el sustrato.
El regulador alostérico puede
ser activador o inhibidor
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
Moduladores ambientales
Cocatalizadores
Activadores e Inhibidores
REGULACIÓN ALOSTÉRICA
Las enzimas alostéricas son grandes,
oligoméricas y su cinética no se
ajusta a la curva de Michaelis-
Menten, por presentar
cooperativismo:
La unión del sustrato a un centro
activo favorece la unión de más
sustratos a los demás centros
activos de las demás subunidades.
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
Moduladores ambientales
Cocatalizadores
Activadores e Inhibidores
REGULACIÓN ALOSTÉRICA TIPOS
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
Moduladores ambientales
Cocatalizadores
Activadores e Inhibidores
REGULACIÓN NO ALOSTÉRICA (ISOSTÉRICA)• El inhibidor o activador actúa sobre el centro activo.
• La enzima muestra una cinética de Michaelis-Menten, aunque
alterada respecto de la gráfica normal.
• Puede ser:
• IRREVERSIBLE: si el enzima queda modificado
covalentemente, alterando su estructura terciaria. Su
reversión requiere la acción enzimática.
• REVERSIBLE: La inactivación no es permanente.
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
INHIBICIÓN IRREVERSIBLE
– Ejemplo: zimógenos o proenzimas
–Ejemplo: compuestos organofosforados:• Actúan sobre enzimas serínicas
• Únicamente sobre la Ser activa
• Insecticidas: Parathion, Malathion
• Inhibidores de la Acetilcolinesterasa
•Neurogases
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
INHIBICIÓN IRREVERSIBLE
CH CH2 OHSer
PF O
CH
CH
H3C CH3
CH3H3C
CH CH2 O P O
CH
CH
H3C CH3
CH3H3C
Ser
DFP:Diisopropil fluorofosfato
Los animales envenenados
con este gas quedan
paralizados, debido a la
imposibilidad de transmitir
adecuadamente los
impulsos nerviosos.
–Ejemplo: ligandos de coordinación de
metales:• Cianuro: bloquea el Fe hemínico de la
citocromoxidasa –enzima de la cadena
respiratoria-, impidiendo toda modificación
posterior, por lo que es muy tóxico
• Agentes quelantes (EDTA: tetracetato de
etilendiamina: quelación del calcio en la
aterosclerosis; eliminación de metales
pesados (Pb) de aguas, suelos y sangre;
detergente, anticoagulante (captura calcio)
e inactivación de enzimas que afectan al
ADN
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
INHIBICIÓN IRREVERSIBLE
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
INHIBICIÓN REVERSIBLE
– La inactivación no es permanente.
– Según su modo de actuación puede ser:
Competitiva: se unen al centro activo del enzima
Acompetitiva: se une al complejo E-S
No competitiva: puede unirse a ambos
E + S E-S E-P
Ic Iac
Inc
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
INHIBICIÓN REVERSIBLE: COMPETITIVA
El inhibidor se fija al centro activo de la enzima
libre, impidiendo la fijación del substrato.
Los inhibidores compiten con el sustrato por el
centro activo, debido a su similar estructura
espacial.
Se revierte su efecto aumentando la concentración
de sustrato
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
INHIBICIÓN REVERSIBLE: COMPETITIVA
COO-
CH2
CH2
COO-
FAD FADH2COO-
CH
CH
COO-
Succinato Fumarato
SDH
COO-
CH2
COO-
Malonato
COO-
C O
CH2
COO-
Oxalacetato
Inhibición de la succinato deshidrogenasa por malonato u oxalacetato
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
INHIBICIÓN REVERSIBLE: COMPETITIVA
COO-
C O
CH2
COO-
Oxalacetato
Inhibición de la succinato deshidrogenasa por malonato u oxalacetato
COO-
CH2
CH2
COO-
Succinato
COO-
C O
CH2
COO-
Oxalacetato
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
INHIBICIÓN REVERSIBLE: ACOMPETITIVA
El inhibidor se une al complejo E-S, inactivándolo.
La inhibición acompetitiva es poco frecuente en las reacciones de un solo sustrato, pero es corriente en las reacciones de dos sustratos.
INHIBICIÓN REVERSIBLE: NO COMPETITIVA
– El inhibidor se fija a la enzima independientemente de que lo haga o no el
substrato; el inhibidor, por tanto, no impide la fijación del substrato a la
enzima, pero sí impide la acción catalítica.
– Esta inhibición se caracteriza por que no se puede revertir el efecto del
inhibidor, aumentando la concentración del substrato.
– Ejemplo : inhibición de la deshidrogenasa del gliceraldehido-3-fosfato por
la yodo-acetamida:
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
Enzima-SH + I-CH2 - CONH2 Enzima-S-CH2 - CONH2 + IH
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
INHIBICIÓN REVERSIBLE:
CINÉTICA DE LA INHIBICIÓN
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
INHIBICIÓN REVERSIBLE:
CINÉTICA DE LA INHIBICIÓN
=Inc
=Iac
=Ic
KM aparentePendienteVmaxTipo
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
INHIBICIÓN MIXTA: SUSTRATOS SUICIDAS
Son inhibidores activados enzimáticamente.
Se trata de moléculas que se unen al centro activo de manera específica, igual que el substrato o los inhibidores competitivos.
Una vez unidos al centro activo, la enzima transforma la molécula en una especie química muy reactiva que modifica covalentemente a la enzima, inactivándola.
Tienen por tanto la especificidad del inhibidor competitivo y la potencia de los inhibidores irreversibles
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
INHIBICIÓN MIXTA: SUSTRATOS SUICIDAS
E + I EI EI* E’ + I*1 2 3
1. El inhibidor se fija a la enzima
2. La acción catalítica de la enzima convierte al inhibidor I en una especie
altamente reactiva I*
3. I* modifica covalentemente a la enzima, inactivándola de forma definitiva
al igual que un inhibidor irreversible.
Ejemplo: Sistema de la monoaminooxidasa (MAO) cerebral
• Los estados depresivos, en general, están relacionados con un
descenso en la concentración de neurotransmisores adrenérgicos
(dopamina, noradrenalina, etc.) en determinadas regiones del
cerebro.
• Una de las enzimas encargadas de la degradación de estos
neurotransmisores es la monoaminooxidasa (EC 1.4.3.4).
• Por tanto, la inhibición de la monoaminooxidasa se emplea como
tratamiento de los estados depresivos. Se han desarrollado muchos
inhibidores suicidas de la MAO
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
INHIBICIÓN MIXTA: SUSTRATOS SUICIDAS
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
INHIBICIÓN MIXTA: SUSTRATOS SUICIDAS
Ejemplo: Sistema de la monoaminooxidasa (MAO) cerebral
HO
HO
CHOH CH2 NH2
O2 + H2O
NH3 + H2O2
HO
HO
CHOH CHO
Noradrenalina
Dihidroxifenilglicol
MAO
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
INHIBICIÓN MIXTA: SUSTRATOS SUICIDAS
Ejemplo: Sistema de la monoaminooxidasa (MAO) cerebral
La MAO es una flavoproteína: lleva como coenzima fundamental
para la catálisis, el FAD. Los inhibidores suicidas de la MAO inactivan
al FAD.
Ejemplo: Sistema de la monoaminooxidasa (MAO) cerebral
ENZIMASFactores que influyen en la actividad enzimática
INHIBICIÓN MIXTA: SUSTRATOS SUICIDAS
Inhibición suicida de la
MAO mediante Pargilina
HC C CH N+CH3
CH3
N
NNH
N
H3C
H2C
O
OSE
R
N
NNH
NH
H3C
H2C
O
OSE
R
CH
CHCHN+H3C
H3C
Flavina
Flavina
INACTIVA
pargilin
a
ENZIMASIsoenzimas
Es un modo de regulación que consiste en la existencia de
distintas formas moleculares de una misma enzima que
presentan o muestran especificidad por el mismo sustrato y
realizan la misma función.
Su distribución varía con los tejidos y la localización
subcelular, de forma que unas se encuentran en el citoplasma,
otras en las mitocondrias, algunas en cloroplastos, etc.
Se diferencian entre sí por su composición de aminoácidos, al
estar codificadas por genes distintos (con un origen evolutivo
común, por duplicación génica)
La lactato deshidrogenasa cataliza la transformación de pirúvico a láctico, que se produce en condiciones de anoxia, dando lugar a una fermentación a partir de la glucosa.
ENZIMASIsoenzimas
Está formada por 5 isoenzimas, con el mismo peso molecular, con una estructura tetramérica: combinaciones de 2 tipos de cadenas, M y H.
ENZIMASIsoenzimas
LDH-1 (H4): en corazón, músculos y eritrocitos.
LDH-2 (H3M): en sistema retículoendotelial y leucocitos.
LDH-3 (H2M2): en pulmones.
LDH-4 (HM3): en riñones, placenta y páncreas.
LDH-5 (M4): en hígado y músculo esquelético.
ENZIMASIsoenzimas
Estas isoenzimas presentan carácterísticas cinéticas distintas.
ENZIMASIsoenzimas
M4KM piruvato baja (afinidad alta) Tejido especializado en el uso
anaeróbico de la glucosa con
alta formación de lactatoV máx alta
H4
KM piruvato alta (afinidad baja) Especializado en el uso
aeróbico del pirúvico. Sólo se
emplea la ruta anaeróbica en
emergencias.V máx pequeña
ENZIMASSistemas multienzimáticos
Son asociaciones de enzimas que realizan funciones complementarias, actuando de modo secuencial, catalizando reacciones consecutivas: el producto de una reacción es el sustrato de la siguiente.
La eficacia de la reacción aumenta, al favorecer el encuentro del enzima y el sustrato.
Existen dos niveles de asociación:
Complejos multienzimáticos: existe unión covalente entre las enzimas. Generalmente estas enzimas no funcionan fuera del complejo. Ej: sintetasa de ácidos grasos de levadura (7 enzimas)
Asociación a membranas. Ej: cadena respiratoria en la membrana mitocondrial interna.
ENZIMASSistemas multienzimáticos