第三章 酶 (enzymes)

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第三章 酶 (enzymes). 主要内容:主要讲解酶的化学本质、结构和特性;酶促反应动力学;酶的作用机理;酶活性的调节;酶的应用;还介绍了别构酶、共价调节酶、同工酶等的概念、性质、生物学意义。. 制作人 :05 技术 (2) 班吕达. 一、酶的发展史. 二、酶的概念. 酶是一类由活细胞产生的,具有催化活性和高度专一性的生物分子,大多数酶主要是蛋白质。   酶的催化活性依赖于天然的完整蛋白质的构象,如果酶蛋白变性或解离为亚基,其催化活性通常会丧失。. 第一节 通伦 1 酶是生物催化剂. 1 .酶与一般催化剂比较 共性. - PowerPoint PPT Presentation

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Page 1: 第三章  酶  (enzymes)

第三章 酶 第三章 酶 (enzymes)(enzymes)

主要内容:主要讲解酶的化学本质、结构和特性;酶促反应动力学;酶的作用机理;酶活性的调节;酶的应用;还介绍了别构酶、共价调节酶、同工酶等的概念、性质、生物学意义。

制作人 :05 技术 (2) 班吕达

Page 2: 第三章  酶  (enzymes)

  酶是一类由活细胞产生的,具有催化活性和高度专一性的生物分子,大多数酶主要是蛋白质。  酶的催化活性依赖于天然的完整蛋白质的构象,如果酶蛋白变性或解离为亚基,其催化活性通常会丧失。

二、酶的概念

一、酶的发展史

Page 3: 第三章  酶  (enzymes)

第一节 通伦第一节 通伦1 1 酶是生物催化剂酶是生物催化剂

1 .酶与一般催化剂比较共性

( 1 )用量少而催化效率高:细胞内含量少;

( 2 )能加快化学反应的速度,但不改变平衡点,反应前后本身不发生变化;

( 3 )降低反应所需的活化能

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2 .酶作为生物催化剂的特性

( 1 )高的催化效率

就分子比 (molecular ratio) 而言, 以摩尔为单位进行比较,酶的催化效率比化学催化剂高 107 ~ 1013 倍,比非催化反应高 108 ~ 1020 倍。

例 : 2H2O2→2H2O+O2

1mol H2O2 酶能催化 5×106mol H2O2 的分解

1mol Fe3+ 只能催化 6×10-4molH2O2 的分解

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( 2 )高的专一性( 3 )温和的反应条件( 4 )酶在体内受到严格调控:如酶浓度的调节、激素调节、反馈调节、抑制剂和激活剂的调节、别构调节、酶的共价修饰调节、酶原活化等。 ( 5 )酶的催化活力与辅酶、辅基和金属离子有关

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Page 7: 第三章  酶  (enzymes)

20 世纪 80 年代发现某些 RNA 有催化活性,还有一些抗体也有催化活性,甚至有些 DNA 也有催化活性,使酶是蛋白质的传统概念受到很大冲击。 某些 RNA 有催化活性 1982 年美国 T. Cech 等人发现四膜虫的 rRNA 前体能在完全没有蛋白质的情况下进行自我加工,发现 RNA 有催化活性

Thomas Cech, University of Colorado at Boulder, USA

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1983 年美国 S.Altman 等研究 RNaseP (由 20% 蛋白质和 80% 的 RNA 组成),发现 RNaseP 中的 RNA 可催化E. coli tRNA 的前体加工。

Sidney Altman Yale University New Haven, CT, USA

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第二节 酶的命名和分类第二节 酶的命名和分类

1961 年国际酶学委员会( enzyme commission )提出

的酶的命名和分类方法。

国际系统命名法

( 1 )标明底物,催化反应的性质 例 :G-6-P→F-6-P G-6-P 异构酶

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( 2 )两个底物参加反应时应同时列出,中间用冒号( : )分开。如其中一个底物为水时,水可略去。例 1 : 丙氨酸 +α- 酮戊二酸 → 谷氨酸 + 丙酮酸 丙氨酸 :α- 酮戊二酸氨基转移酶例 2 :

脂肪 +H2O → 脂酸 + 甘油

脂肪水解酶

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2 .习惯名称( recommended name )( 1 )底物 ( 2 )反应性质 ( 3 )底物,反应性质( 4 )来源或其它特点

国际系统分类法1 .分类 : 6 大类酶,氧化还原、转移、水解、 裂合、异构、连接注意顺序不能变!

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(( 22 )酶的组成)酶的组成

1 .单纯蛋白质酶类 2 .结合蛋白质酶类全酶 = 酶蛋白 + 辅助因子(辅酶、辅基或金属离子)注意几个概念辅酶( coenzyme )辅基( prosthetic group )单体酶( monomeric enzyme )寡聚酶( oligomeric enzyme ) 多酶复合体( multienzyme complex )

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第三节 酶催化作用的结构基础( 1 )酶的活性中心( active center ) 1 、活性中心的概念 酶是蛋白质,是大分子化合物,在这样一个大分子中只有一小部分是与底物结合,并与催化作用直接有关,这个部位称酶的活性中心。组成酶活性中心的氨基酸侧链基团主要有 Glu 和 ASP 的 -COOH ,Lys 的 ε-NH2 , His 的咪唑基, Ser 的 -OH , Cys 的 -SH , Tyr

的侧链基团。

酶活性中心

结合部位(结合位)

催化部位(催化位)

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酶的专一性(特异性, specificity )

1 、绝对专一性( absolute specificity )

C O

NH2

NH2

H2O

脲酶CO2 + 2NH3

C O

NH2

NHCH3

H2O

脲酶X

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1 、溶菌酶( Lysozyme )

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(2) (2) 酶原的激活酶原的激活

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第四节 酶催化作用的机理第四节 酶催化作用的机理

酶依靠降低活化能加速化学反应

底物 substrate

产物 product

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3 、酸碱催化( acid-base catalysis )

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OH

N N OH

酚 吡啶 α-羟基吡啶

Page 22: 第三章  酶  (enzymes)

4 、共价催化( covalent catalysis )

什么是共价催化?

共价催化

亲电子催化

亲核催化

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酶催化功能的几个实例 1 、溶菌酶( Lysozyme )

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2 、胰凝乳蛋白酶( chymotrypsin )

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3 、羧肽酶 A ( carboxypeptidase A , CpA )

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第五节、酶的作用动力学(第五节、酶的作用动力学( kineticskinetics ))

(一)底物浓度对酶反应速度的影响 1 .米氏方程的提出

中间复合物学说: 第一步 : E+S ES

第二步 : ES→E+P V [ES] ∝

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(二)酶浓度对酶反应速度的影响 1 .反应速度与酶浓度成正比

[S]>>[E] V [E] ∝

2 . V 与 [E] 关系的几点讨论

(三) pH对酶反应速度的影响 1 .酶反应的最适 pH ( optimum pH )

反应速度

pH最适pH

6 8 100

2 . pH影响反应速度的原因 ( 1 ) pH影响了酶分子、底物分子和 ES复合物的解离状态。

( 2 ) 过高、过低的 pH导致酶蛋白变性。

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(四)温度对酶反应速度的影响

1 .最适温度( optimum temperature )

最适温度与最适 pH 一样,也不是一个固定的常数,它随底物的种类、浓度 , 溶液的离子强度 , pH, 反应时间等的影响。

例 : 反应时间短,最适温度高。

反应时间长,最适温度低。

Page 29: 第三章  酶  (enzymes)

(五)激活剂对酶反应速度的影响

(六)酶的抑制作用和抑制作用动力学

1 、不可逆抑制作用( irreversible inhibition )

2 、可逆抑制作用 (reversible inhibition)及其动力学

( 1 )竞争性抑制作用( competitive inhibition )

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第六节 重要酶类及其活性调节第六节 重要酶类及其活性调节一、别构酶(也称变构酶,一、别构酶(也称变构酶, allosteric enzymeallosteric enzyme ))

(一)别构酶结构上的特点

(二)别构酶性质上的特点

(三)别构酶的别构效应( allosteric effect )

1 、什么是别构效应

2 、同促效应与异促效应

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(四)别构酶的作用动力学

1 、正协同效应( positive cooperative effect )

Page 32: 第三章  酶  (enzymes)

2 、负协同效应( negative cooperative effect )

3 、正协同效应别构酶与米氏酶动力学比较

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4 、负协同效应别构酶与米氏酶动力学比较

Page 34: 第三章  酶  (enzymes)

二、同工酶(二、同工酶( isoenzyme or isozymeisoenzyme or isozyme ))

(一)同工酶的概念

同工酶的概念

同工酶的性质

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第七节、酶的分离、纯化及活力测定第七节、酶的分离、纯化及活力测定(一)酶的分离纯化1 .选材2 .破碎细胞3 .抽提4 .去核酸、去多糖5 .纯化6 .保存由于酶的特殊性,在提纯过程中要注意 :1 .全部操作在低温 0 ~ 4℃。 2 .在分离提纯过程中,不能剧烈搅拌。3 .在提纯溶剂中加一些保护剂,如少量 EDTA 、少量 β-巯基乙醇。 4 .在分离提纯过程中要不断测定酶活力和蛋白质浓度,从而求得比活力,还要计算总活力。

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比活力= 酶活力蛋白质浓度

总活力=单位体积的酶活力 (U/ml)× 分离溶液总体积 (ml)

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(二)酶活力的测定

酶活力( enzyme activity, 也称酶活性)酶活力的测定 1 .测定酶活力时应注意几点( 1 )应测反应初速度( initial velocity or initial speed )( 2 )酶的反应速度一般用单位时间内产物的增加量来表示。 ( 3 )测酶活力时应使反应温度、pH 、离子强度和底物浓度等因素保持恒定。( 4 )测定酶反应速度时,应使 [S]>>[E] 。

产 物 浓 度 [P]

(t)

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2 .酶活力和比活力表示方式 ( 1 )酶活力( enzyme activity )

( 2 )酶的比活力( specific activity ,也称比活性) 比活力:指每mg 蛋白质所具有的酶活力,一般用 U/mg 蛋白质来表示,比活力说明酶的纯度。 比活力 = 酶活力( U/ml ) / 蛋白质浓度( mg/ml )

( 3 )转换数( TN or kcat)

( 4 )分子活性( molecular activity )

( 5 )催化中心活性( catalytic center activity )

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3. 酶活力的测定方法

分光光度法( spectrophotometry )

该法要求酶的底物和产物在紫外或可见光部分光吸收不同。

优点:简便、迅速、准确。一个样品可多次测定,有利于动力学研究。可检测到 10-9mol/L 水平的变化。