2. genleri̇n ve kromozomlarin yapisi ve fonksi̇yonu

Upload: ugur-cigdem

Post on 24-Feb-2018

283 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    1/92

    NSAN GENOMU: GENLERN VEKROMOZOMLARIN YAPISI VE

    FONKSYONU

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    2/92

    DNAnn Yaps

    DNA: bir nesilden dier nesile geen kaltsal materyaldir.

    DNA replikasyonuyla her bir genin tam kopyas yavru hcrelere aktarlr.

    Gen: Fonksiyonal bir proteini kodlayan DNA paras

    DNA ! niteden olu"an polimerik bir nkleik asitmakromolekldr: #unlar $ %&lu "eker 'deoksiribo() a(ot ta"yan birba( ve bir *os*at grubudur.

    Not : +NA molekl iin "eker olarak ribo( kullanlr. Deoksiribo( ilearalarndaki *ark ise ribo( "ekerinde bir adet *a(la oksi,en bulunur.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    3/92

    #a(lar prin ve pirimidin olmak (ere iki tiptir. DNA&da iki prin ba(adenin 'A)ve guanin '-) ile iki primidin ba( sito(in '%) ve timin ')bulunur. +NA iin ise timin yerine urasil '/) bulunur. #ir ba( bir *os*at vebir "eker grubundan olu"an nkleotidler $&0!& *os*odiester ba ile u(un

    nkleotid (inciri meydana getirirler. 1nsan genomundaki bu polinkleotid(incirler 'i*t sarmal yapda) y( milyonlarca nkleotid u(unluundadr.#oyutlar yakla"k olarak $2 milyon bp 'en kk kromo(om 34.) ile 3$2milyon bp 'en byk kromo(om4.) arasnda dei"mektedir.

    5ames 6atson ve Francis %rick&in 47$! ylnda akladklar gibi DNA

    yaps bir i*t sarmaldan olu"maktadr. #u helikal yap ba(lar arasndaki8idro,en #a ile bir arada tutulan ve ters y9nde ilerleyen iki polinkleotid(incirinden olu"mu" saa d9n"l spiral bir merdivene ben(emektedir.DNA&nn kar" iki iplii arasndaki ba( e"le"mesi ise A0 -0% "eklindeolmaktadr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    4/92

    onu olarak bir (incirdeki nkleotid ba( di(isine ait bilgi dier(incirin ba( di(isini otomatik olarak belirlemektedir. DNA moleklleri i*tsarmal yap sayesinde iki (incirin ayrlmasn takiben ori,inal kalp(incirdeki di(iye uygun olarak iki yeni komplementer di(inin

    sente(lenmesiyle tamamen replike olmaktadr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    5/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    6/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    7/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    8/92

    Santra Do!"a

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    9/92

    -enetik bilgi hcre nkleusu iindeki kromo(omlarda bulunanDNA&da ta"nmaktadr ancak DNA&da kodlanan bilginin kullanldprotein sente(i sitopla(mada yer almaktadr. #u kompartmanla"ma insanorgani(masnn 9karyot olduu gereini yanstmaktadr. #u ise insanhcrelerinin sitopla(madan nkleer bir membranla ayrlm" olan ve DNAta"yan gerek bir nkleusa sahip olduu anlamna gelmektedir. #unakar"n E. coli gibi prokaryotlarda DNA nkleus ile evrelenmemi"tir.;karyotik hcrelerin kompartmanla"mas nedeniyle nkleustansitopla(maya doru olan bilgi trans*eri karma"k bir i"lemdir.

    #irbiriyle ili"kili olan bu iki bilgi 'genlerin DNA kodu ile proteinlerinaminoasit kodu bilgisi) arasndaki molekler balant ribonkleik asit'+NA)&tir. +NA&nn kimyasal yaps her nkleotidin deoksiribo( yerineribo( "ekeri bile"eni ta"mas hari DNA&ya ok ben(er< ayrca +NA&datimin yerine urasil '/) bulunur.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    10/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    11/92

    +NA ve DNA arasndaki bir dier *ark da canllarn ounda DNA i*tsarmal iken +NA&nn birok canlda tek iplikli bir molekl halinde

    bulunmasdr.

    DNA +NA ve protein arasndaki ili"ki birbiri iine gemi"tir: DNA

    +NA&nn +NA ise polipeptidin sente(i ve di(isini belirler. DNA ve+NA&nn sente( ve metaboli(masnda 9(gl proteinler yer almaktadr. #ubilgi ak" molekler biyolo,inin santral dogmas olarak adlandrlr.

    -enetik bilgi DNA&da kod aracl ile saklanr. #u kodlar polipeptidlerinaminoasit di(ilerini belirleyen ve birbirlerine kom"u olan ba( di(ileridir. 1lkolarak +NA transkripsiyon olarak bilinen bir i"lemle DNA kalb (erindensente(lenir. onra mesa,c +NA 'm+NA) olarak adlandrlan ve kodlanm"

    bilgiyi ta"yan bir +NA tipi ile nkleustan sitopla(maya ta"nr ve buradaproteindeki aminoasit di(isini belirlemek (ere +NA di(isi 9(lrtranslasyona urar.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    12/92

    ranslasyon i"lemi ribo(omlarda gerekle"ir. +ibo(omlar m+NA&lardadahil olmak (ere protein sente(ine katlan tm molekllerin balanmab9lgelerinin bulunduu sitopla(mik organellerdir. +ibo(omlar ribo(omal+NA 'r+NA)) olarak bilinen 9(el bir +NA tipi ve onunla ili"ki kuranbirok *arkl yapsal proteinden olu"mu"tur. ranslasyon i"leminde ncbir +NA tipi daha vardr< bu 9(elle"mi" +NA m+NA&da kodlanm" olanba( di(isi ile proteinin aminoasit di(isi arasnda molekler ili"kiyi kurantran*er +NA 't+NA)&dr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    13/92

    Gen Yaps #e Or!an$%as&on'

    Y()se) *)ar&otarn Gen Yaps

    1nsan genomunun sadece =404.$&lik ksm protein kodlayan akti* gen'yapsal gen) b9lgesinden olu"ur. -enomun yakla"k =3$&i intronlardanolu"ur ve =$2&dan *a(las e"itli tipte tekrarlayan ve dublike DNA

    di(ilerinden olu"ur. >alan ksm ise ps9dogenler gen arasndakitekrarlanmayan aralayc di(iler ve m+NA&larn $& ve !& ularnda bulunanproteine evrilmeyen e?on di(ilerinden olu"ur.

    Y()se) +)ar&ot !eno"arnn art", '%'n'-'. /+&e0e 1a2a3a%a sa&1a !ene 1e-$. 4o) "$)tarar1a te)rara&an 1$%$ #e $ntron

    #ar-na /a-1r5

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    14/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    15/92

    *KARYO6P GENLERN YAPISI

    @ ou 9karyotik genler kodlayan di(iler yani B>CN&lar ierirler.

    @ #u ek(onlar arasnda 1N+N&lar bulunur.

    @ B>CN ve 1N+N&larn her ikisi de primer +NA elde etmek iintranskrip edilirler.

    @ lgunla"m" +NA 'mature +NA)&nn "ekillenmesi iin intronlaru(akla"trlr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    16/92

    FARE-GLOBN GEN

    @ #u gen 3 intron ierir

    @ #u intronlar ek(onu birbirinden ayrr

    @ Bk(on 4 4&de !2&a amino asitleri kodlarken@ Bk(on 3 !4&den 42E&e ve Bk(on ! de 42$&den 4E&ya amino asitleri

    kodlarlar.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    17/92

    Geno" 7(&()(-(

    ;karyot genomlar prokaryot genomlarndan olduka byktr. 8crebyklne bal olarak genom bykl de artar. An0a). !eno"/(&()(-( $e or!an$%"ann )ar"a,)- orant 1e-$1$r5

    *rne): Za"/a) !eno" 8 nsan !eno"'

    #ir genomda bulunan DNA miktar o genomun bykln i*ade eder.

    E-er DNA %$n0$r$ 1(% /$r 4$%!$ ,e)$n1e a4sa $nsan !eno"'n'o',t'ran 9 )ro"o%o" ; "etre1en 1a2a 3a%a '%a&a/$$r1$5 E-er

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    18/92

    *)ar&ot !eno"ar

    @ >odlanmayan DNA di(ileri ierir

    @ 1nsan genomunun =7G.$&i kodlanmayan DNA olu"turur.

    Ko1an"a&an !eno"arn !+re#er$ neer1$r?

    @ -en i*adelerinin kontrol

    #ir genin hangi hcrede ne (aman ne kadar etkile"eceini 'akti*olacan) denetler.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    19/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    20/92

    6e)rara&an DNA D$%$er$

    1nsan genomunun yakla"k =$2&si tekrarlayan di(ilerden olu"ur.Ancak karma"k 9karyot genomlarnn daha da byk bir ksm oksayda tekrarlanan ve kodlanmayan DNA di(ilerinden olu"ur ve bu

    di(ilerin dei"ik tipleri vardr. #unlardan bir ksm genomda kmelenmi"halde bulunurken bir ksm DNA&ya dalm" halde bulunurlar.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    21/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    22/92

    K("een"$, 6e)rar D$%$er$

    >lasik atelit

    Hini atelit

    Hikro atelit

    Geno"a Da-", 6e)rar D$%$er$

    I+ 'Iong terminal repeats)

    I1NB 'long interspersed elements)

    DNA transposon

    1NB 'short interspersed elements)

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    23/92

    K("een"$, 6e)rar D$%$er$

    #u di(iler ard"k halde ok sayda tekrarlardan olu"an ksa DNAdi(ilerdir ve genomda belli b9lgelerde kmelenmi" halde bulunurlar. 40$22nkleotidden olu"an milyonlarca ard"k tekrarlardan olu"ur ve genomun= 42&unu olu"tururlar. Ard"k ksa tekrar di(ileri transkribe olma( veproteine evrilme( 'i"levsel genetik bilgi ta"ma(). Ancak kromo(omunyapsnda 9nemli rol oynarlar. >melenmi" ard"k tekrar di(ileri anaDNA ksmndan *arkl bir bant olu"tururlar. #unlara 'ard"k tekrar

    di(ilerine) uydu veya satellit DNA denir ve kromo(omlarn sentromerb9lgelerinde bulunurlar.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    24/92

    1nsandaki satellit di(ilerin ba(lar pentankleotid "eklinde bulunurlar.#9yle satellit DNA&lar 4.7. ve 4. kromo(omun kollarnda proksimalb9lgede J kromo(omunun u(un kolunun hemen hemen tamamndabulunurlar.

    Dier satellit DNA&lar ise bira( daha u(un ba(di(isinden olu"tur.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    25/92

    1nsan genomunda satellit DNA&nn bir alt grubu olan mini satellitDNA&larda bulunur. #unlarn toplam di(i u(unluklar snrl olup birka kbu(unluundadr. Hini satellitler a( veya ok her kromo(omun u(unluuboyunca dalm"lardr. Farkl bireylerin genomlar arasndaki varyasyonuincelemek iin 9nemli bir molekler ara olarak kullanlrlar. #u nedenle

    bunlara DNA marker&larda denir. Adli tpta kromo(om anali(indegenomun haritalanmasnda kaltsal kromo(om hastalklarnn tansndakullanm asndan 9enmlidir.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    26/92

    Geno"a Da-", 6e)rar D$%$er$

    #unlar satellit DNA&lardan *arkl olarak genoma dalm" haldebulunurlar. #u tekrar di(ileri ard"k olmayan ksa veya u(un DNA tekrar

    di(ilerinden olu"ur. -enoma dalm" olan tekrar di(ileri hareketli DNAdi(ileridir. -enom iinde hareket edebilen hareketli DNA tekrar di(ilerinetranspozon denir. ekrar di(ilerinin genom iinde bir genden ba"ka birgen b9lgesine hareket etmesine transpozisyon denir.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    27/92

    Geno"a Da-", 6e)rar D$%$er$n$n *%e$)er$

    #u nedenle kromo(omlar (erindeki genlerin yeri sabit deildir. #uhareketli DNA paralar gen aktivitesinden ve genlerin d(enlenmesinden

    sorumludurlar. #u dalm" tekrarlayan elemanlar genomun byklnebyk katkda bulunur ve insan genom DNA&snn =$2sini olu"tururlar.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    28/92

    Geno"a 1a-", te)rar 1$%$er$n 4e,$t$ t$per$ #ar1r:

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    29/92

    6ranspo%on B Care)et e1e/$en ee"ent B 6es

    8areket ederler ve genom ierisindeki saylarn artrlar. rayangenlerK 5unk DNA '9p DNA)K veya genomun 'kara tara*) bilinmeyentara*K adece ;karyortlarda deil bakterilerde de bulunur.

    )$ te"e sn3a a&rrar

    0 Retrotranspo%onar

    0 DNA transpo%onar

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    30/92

    5 Retro#$r(s /en%er$ ee"anar: Jakla"k 3042 kb u(unluundadr.1nsan genomunda yakla"k E$2.222 retrovirs ben(eri eleman vardr veinsan DNA&snn yakla"k =G&ini olu"tururlar.

    95 DNA transpo%onar: 1nsan genomunda yakla"k !22.222 kopya DNAtranspo(onu vardr ve bunlar G20!222 ba( i*ti u(unluunda olup insanDNA&snn =!&n olu"tururlar. 8areketli DNA elemanlarnn genomdahareket etmeleri 3 tipte olur:

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    31/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    32/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    33/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    34/92

    ;5 DNA 6ranspo%onar

    DNA aracl ile hareket ederler. #u di(iler genom iindekopyalanrlar ve tekrar DNA&da yeni bir b9lgeye yerle"irler. #9ylecegenomun yars replike olmu" ve genom iinde DNA veya +NAaraclyla hareket eden serpi"tirilmi" tekrarlayan elemanlardan olu"ur.#u elemanlarn yarsnn +NA aracl ile hareket etmesi 9nemlidir ve bu"ekilde ters transkripsiyon insan genomunun = E2&ndan *a(lasnnolu"masndan sorumludur. #u tekrarlayan di(ilerin byk ounluununhcreye bir katks yoktur ama ba(lar gen i*adesinin d(enlenmesinekatkda bulunur. Ayrca gen d(enlenmesini uyararak genetik e"itliliin

    olu"masnda 9nemli evrimsel rolleri vardr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    35/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    36/92

    Gen A$eer$

    #irbirinin ayn veya ben(eri olan nkleotid di(ilerine sahip genkopyalarnn bir araya gelmesiyle !en a$eer$ o','r5 -enellikledublikasyonla meydana gelirler. #irok gen ailesinin yeleri DNA&da bir

    b9lgede toplanm" bulunurken ok a( ksm *arkl kromo(omlara dalm"olarak bulunur. #ir gen ailesinin yeleri nkleotid di(ilimi asndan diergen ailelerinin yelerine g9re birbirlerine ben(erdir. Fonksiyonel olarak9(de" olabilirler.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    37/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    38/92

    Ps+1o!ener

    #a( durumlarda bu gen gruplarnn yelerinin urad mutasyonlarmutasyona urayan gen yelerini *onksiyonlarn yapama( hale getirir.Japsal genlere ok ben(eyen ama *onksiyon yapamayan gen kopyalarnaps9dogen denir. #u ps9dogenlerin herhangi bir i"levi olmamasna ramengenomun bykln artrr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    39/92

    ntronar #e E)sonar ne1$r?

    #ir genin kodlanan DNA di(ilerine e)son.bir gen iinde kodlanmayan DNAdi(ilerine de $ntron denir.

    ntronarn $,e#$?

    5 am olarak aydnlatlamam"tr.

    5DNA di(ileri ek(onlardan u(undur.

    51nsan genomunun = 72&ndan *a(las intronlardan olu"ur.

    5 #ir genin ek(onlarnn *arkl kombinasyonlarda birle"mesini yani genin

    *arkl "ekilde d(enlenmesini salar.5Farkl genlerin kombinasyonuna yol aar. Farkl genler arasnda olu"an bukombinasyon ek(on karma olarak adlandrlr.

    5 Asl g9revleri gen i*adelerinin kontrol edilmesinde rol oynamaktr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    40/92

    Cer !en1e $ntron #ar "1r ?

    8ayr intronlar evrensel deildir. ;rnein histon proteini sente(leyengenler intron ierme(ler. #u da genlerin i"levsel olabilmesi iin intronlarn"art olmad g9sterir. Haya gibi basit 9karyot hcrelerinin genomlarnda

    intron bulunma(. Mrokaryotik hcrelerdede ba( nadir genlerde intronlarbulunur.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    41/92

    6rans)r$ps$&on

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    42/92

    ranskripsiyon 'veya ya(lma veya ya(lm) DNAy olu"turannkleotit di(isinin +NA polimera( en(imi tara*ndan bir +NA di(isi olarakkopyalanmas srecidir. #a"ka bir deyi"le DNAdan +NAya genetikbilginin aktarmdr. +NAya ya(lan bir DNA parasna Otranskripsiyon

    birimiO denir. DNA sente(inde olduu gibi transkripsiyonda da +NAsente(i $PQ!dorultusunda ilerler. Jani eski polimer!PQ$dorultusunda okunur< yeni tmleyici polimer $ Q !dorultusunda olu"ur.

    *)ar&otar1a 6rans)r$ps$&on

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    43/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    44/92

    6RANSKRPSYONUN *ZELLKLER

    5ranskripsiyon ok seicidir.

    5lu"an +NA transkripti e"itli modi*ikasyonlara urar.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    45/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    46/92

    6A6A K't's'

    ranskripsiyonun ba"lama noktasndan !2 nkleotit i*ti yukardabulunur. Di(i tamamen A ve &lerden olu"ur. Fonksiyonu sarmaln9(lmesini kolayla"trarak transkripsiyonun ba"lama noktasn

    belirlemektir.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    47/92

    AA6 K't's'

    Mromotorun iinde transkripsiyonun ba"lama noktasnn G2 nkleotityukarsnda yer alr. #u yap --%%AA% di(isi ierir. FonksiyonuAA kutusu ile beraber reglat9r b9lgelerde promotorun '+NA polimera(LL& nin baland b9lge) verimli al"masn salamaktr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    48/92

    En2en0ers

    -enellikle bir genin ok yukarsnda yada a"asnda ve hatta iindebulunabilirler. ranskripsiyonu u(aktan kontrol etme potansiyelinesahiptirler. >alba balanmada dorudan rol oynamasa da transkripsiyonun etkin bir biimde ba"lamasnda rol oynarlar.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    49/92

    ranskripsiyonda %is0acting d(enleyiciler yannda RtransactingS*akt9rleri de vardr. #u *akt9rler +NA polimera( LL&nin kalp DNA&yabalanarak transkripsiyonun ba"lamasna yardmc olan transkripsiyon*akt9rleridir. RNA po$"era% II trans)r$ps$&on 3a)t+rer$ o"a1an+)ar&ot$) pro"ot+r /+!eer$ne 1o-r'1an /a-ana"a% #e

    trans)r$ps$&on' /a,ata"a%5

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    50/92

    ranskripsiyonda +NA polimera( en(imi DNA nn transkripsiyonaurayacak gen ksmnn ba"nda bulunan nkleotid di(esini 'promotorb9lge) tanr. onra DNA y bir kalp olarak kullanr ve buna komplementerbir +NA olu"turur.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    51/92

    ranskripsiyon *akt9rleri FLLA FLL# FLLD .... "eklindeadlandrlr. ranskripsiyonun ilk a"amasnda FLLD dorudan AAkutusu di(isine balanr ve yakla"k 42 adet polipeptit alt birimlerindenolu"ur. #u alt birimlerden biri AA0balanma proteini '#M) olarak

    adlandrlr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    52/92

    DNA&ya ilk FLLD balandktan sonra en a( T *arkl transkripsiyon*akt9r daha FLLD ve DNA ya balanarak transkripsiyonu salayacakolan +NA polimera(n balanaca byk 9nclU ba"lama kompleksiniolu"tururlar. FLL8 AM hidroli( ener,isini kullanarak iki DNA (incirinitranskripsiyonun ba"lama noktasndan ayrr ayn (amanda +NA

    polimera( LL&yi *os*orile eder ve bu *os*orliasyonla ba( F&leri polimera((erinde oturduklar yerden kalkarlar nk *os*orilasyonla polimera(biim dei"iklii gerekle"tirir. V(erindeki *a(lalklardan 'Fleri) kurtulan+NA polimera( sente(e ba"lar.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    53/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    54/92

    ; U%a"aCincirin u(amasnda balanan nkleotidin $ *os*at grubu ile +NA

    (incirindeki ! hidroksil grubu arasnda bir *os*odiester ba olu"ur. ente(srasnda geici bir DNA0+NA ikilisi olu"ur ama sonra +NA DNAdan

    ayr"r ve DNA tekrar kapanp normal i*t sarmall haline geri d9ner.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    55/92

    Sonan"a+NA polimera( genin 'veya genlerin) son ksmnda bulunan DNA

    di(elerini 'sonlandrma b9lgesi) tanr ve en(im kompleksi karars( halegelir ve hem DNA hem de byyen +NA (inciri en(imden ayrlr. #iti"

    noktas ise A0 bakmndan (engindir. #u A0&ce (engin biti" b9lgesindeise 2a$rp$n denilen 'sa tokas) yap olu"ur. #u olu"an yap +NApolimera( iin *i(yolo,ik bir stres yaratr ki bunun sayesinde +NApolimera( yapdan ayrlr. #u *i(yolo,ik stresin gerekle"mediidurumlarda R2o 1epen1ent sonlanma gerekle"ir. +ho *akt9r bir protein

    olup +NA polimera(n yapdan ayrlmasn indkler.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    56/92

    O!'n "RNA O','"' 4$n RNA Pro0ess$n! H4 ,e"$ Kapsar:

    4) !& ucuna poliadenilat 'poliA) taks taklmas.

    3) $& ucunun cap strktr denen yap ile kapatlmas.

    !) Mrimer +NA molekl iinden ba( b9lgelerin karlmas 'm+NAplicing)

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    57/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    58/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    59/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    60/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    61/92

    6ransas&on

    6ransas&on ne1$r?

    @ m+NA&nn kontrol altnda meydana gelen polipeptid sente(idir

    @ #u (incir katlanarak etkin bir protein haline gelir.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    62/92

    6ransas&on'n /$r 4o) )o"ponent$ #ar1r5 En +ne"$ ; )o"ponent:

    R$/o%o": #yk ve kk olmak (ere 3 alt birimden olu"ur. Mrotein ver+NA olu"turur.

    tRNA: ranslasyon srasnda amino asitleri ribo(omlara ta"yan ve

    antikodonlar olu"turan molekldr. m+NA ve protein arasnda translatorg9revi g9rr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    63/92

    tRNAarn 7a% *%e$)er$

    t+NA&lar T$072 nkleotid ierirler yaplar prokaryot ve 9karyotlardaolduka ben(erdir. +NA tiplerinin en kdr. ranslasyon srasndaa.a.leri ribo(omlara ta"r. +ibo(omla ayn anda birok t+NA ili"ki kuraca

    iin molekln kk olmas bu etkile"imleri kolayla"trr. 8crede herbiri *arkl bir a. a. tanyan ve ta"yan en a( 32 *arkl t+NA bulunur. ;rn.:t+NAAla t+NA-ly

    t+NA&larn $ M ular daima -uanin '-) ile ba"lar ! 8 ular daima%%A ile biter. #u b9lgeye spesi*ik bir a. a. kovalent olarak baland iin

    balanma b9lgesi 'attachment site) denir. t+NA&nn ! halkal bir yapsvardr: A.a. balamam" "ekli RIS har*ine balam" "ekli yonca yapranaben(er '8olley0Jonca yapra modeli). 1erdii nkleotidlerin ba(larmodi*iyedir: My Mu ve W gibi

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    64/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    65/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    66/92

    6ransas&on ana /asa"a)ta !er4e)e,$r

    4. #a"lama 'Lnitiation) XY#a"la kodonu A/-

    3. /(ama 'Blongiation)

    !. onlanma 'ermination)XYDur kodonu /AA/-A/A-

    5 m basamaklarda m+NA ribo(om aminoail t+NA ve protein*akt9rlerine ihtiya duyulurZ

    5 #a"lama ve u(ama iin ener,iye de ihtiya vardr.#u ener,i ihtiyac

    -M&lerce kar"lanrZ

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    67/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    68/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    69/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    70/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    71/92

    ;U%a"a5m+NA daima $Q! y9nne doru okunur.

    5Mrotein sente(i daima N830ucundan Q %0 0ucuna doru gerekle"ir.

    5/(ama basamanda da '%a"a 3a)t+rer$ @eon!at$on 3a0tor. EF !+re# ar5

    5/(ayan polipeptid (inciri daima P /+!es$n1e /''n'r5

    5 #ir sonraki kodonun komplementer antikodonunu ta"yan aminoail0t+NABFu aracl ile A /+!es$nebalanr.

    5 D(gn bir kodon0antikodon etkile"imi gerekle"tiinde BF0u G6P1en

    ener$ salayarak aa0t+NA&y A b9lgesine yerle"tirir.5BF0u -DM b9lgeden ayrlr.

    5#u basamak translasyonun en yava" basamadr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    72/92

    58ata oran yakla"k olarak 4[42.222& dir.5 1ki aminoasit arasndaki peptid ban ribo(omun $2 byk alt biriminde

    bulunan ;S rRNA o',t'r'r5

    5Meptid bann olu"turulmasndan sonra ribo(om +NA (erinden ileri kayar.

    Son'4 oara)

    . Jeni gelen ve u(amaya ba"layan polipeptid (incirini ta"yan t+NA Mb9lgesine geer.

    . Daha 9nce polipeptid (incirini ta"m" olan t+NA ise B b9lgesine geer vesonra B b9lgesinden serbest braklr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    73/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    74/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    75/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    76/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    77/92

    Sonan"a5 /(ama basama m+NA (erindeki ilk M kodonuna ula"lana kadar

    devam eder.

    5Molipeptid sente(i o anda sonlanma basama ile bitirilir.

    5onlama i"lemi iin sonlanma *akt9rleri 'releasing *actor +F) gereklidir.

    5 Jeni sente(lenmi" polipeptid (inciri kompleksten ayrldktan sonrakompleksi olu"turan komponentler birbirinden ayrlr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    78/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    79/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    80/92

    Post 6ransas&one ,en"eranslasyon sonucu olu"mu" proteinin akti* bir "ekilde i"lem yapabilmesiiin ba( dei"ikliklere uramas gerekmektedir. ;ncelikle proteini olu"turansinyal peptida(n kesilmesi ile bu i"lem ba"lar. Ardndan gliko(illenme ilekarbonhidrat yaplarnn proteine eklenmesi yada N0miristillenmepalmitillenme prenillenme ve -ML0apas eklenmesi i"lemi ile proteine yamoleklleri eklenir. #u modi*ikasyonlar endopla(mik retikulum ve golgiorganellerinde gerekle"ir. Japlan bu kon*ormasyonel dei"ikliklerin nedeniise ba"ta protein lokali(asyonunu doru bir "ekilde salamak olmaklabirlikte proteinlerin doru lokali(e ve stabili(e olmasn hcre0hcre

    etkile"imindeki proteinlerin birbirini tanmasn ve doru bir "ekildebalanmasn hcre membranna yerle"ecek membran geecek veyatransmembran olacak proteinlerin ise kolayca yerle"mesini salamada9(nrln artrmak iindir.

    K Y

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    81/92

    nsan Kro"o%o" Yaps

    DNA ve DNA&y paketleyen protein kompleksine kromatin denir.

    ;karyotik kromatinin organi(asyonu prokaryotlara g9re dahakarma"ktr. #yk miktarda protein ile munta(am bir kompleksolu"turmu"tur. lu"an kromatin hcre d9ngs srasnda arpc

    dei"iklikler geirir. Lnter*a( srasnda ekirdek ierisinde ince0u(uniplikler "eklinde g9rntlenirler. Hito(a ha(rlk srasnda ise ksa ve kalnkromo(omlar olu"turmak (ere bklr ve katlanrlar 'younla"rlar). 8erbir kromo(omda bir adet dorusal DNA i*t sarmal bulunur. 1nsanlarda busarmal ortalama olarak 3?42G nkleotit i*ti ierir. #u DNA u(atlm"olsayd yakla"k cm u(unlua denk gelecekti. #u u(unluk hcreekirdeinin apndan binlerce kat daha u(undur. Ancak bunun gibi Ekromo(omun DNA&s daha munta(am bir "ekilde paketlenerek ekirdeesdrlr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    82/92

    ;karyotik kromatinde DNA&nn ilk d(ey paketlenmesinden sorumluproteinler histonlardr. >romatindeki histon ktlesi yakla"k olarak DNAktlesine e"ittir. 8istonlar yksek oranda po(iti* ykl aminoasitler ierir'li(in ve ar,inin). #u aminoasitler negati* ykl DNA&ya skca balanr.8istonun be" e"idi vardr. #ir 9karyottan dierine ben(er yapdadrlar.

    #en(er proteinler bakterilerde de bulunur. 8iston genleri evrimsel sreteok *a(la korunmu"tur. A"adaki "ekilde g9rlen her bir boncuk ve onabiti"ik DNA nkleo(om ad verilen yapy olu"turur.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    83/92

    8er bir nkleo(om< '83A83# 8! ve 8E) proteinlerinden iki"er adet vebir de bunlarn etra*n saran DNA&dan ibarettir. 84 ise kromatin birsonraki d(eyde paketlenme geirdiinde boncuun yanndaki DNA&yabalanr. 8istonlar sadece replikasyon srasnda DNA&dan geici olarakayrlrlar. ranskripsiyon srasnda ise DNA ile birlikte kalrlar. #upaketlenmenin youn olduu yerler heterokromatin b9lgelerdir.Maketlenmenin heterokromatin b9lgeye g9re daha a( youn olduuksmlar ise 9kromatin b9lgelerdir. ;kromatin b9lgelerde transkripsiyondaima olurken heterokromatin b9lgeler iki e"ittir. Daima heterokromatinb9lgelerde transkripsiyon olma(ken 'sentromer gibi) geici heterokromatin

    b9lgelerde hcrenin iinde bulunduu duruma g9re transkripsiyongerekle"ebilir. #u da gen ekspresyonunun d(eyini ve e"ittililiiniayarlamaktadr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    84/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    85/92

    nsan Geno" Or!an$%as&on'

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    86/92

    nsan Geno" Or!an$%as&on'

    #ilinen tm genomlar iinde bi(i en ok insan genomununilgilendirmesi doal g9rlmelidir. O1nsan -enom Mro,esiOnin ana hede*i iseinsan genomunun yaps ve organi(asyonunu ortaya karmak bunaparalel olarak dier model organi(malarn genomlarn al"arak ben(erveya *arkl genleri belirlemek ve biyolo,ik i"levlerin nasl al"tna

    aklk getirmektir.

    NSAN GENOMUNUN FZKSEL YAPISI

    1nsan genomu iki *arkl ksmdan olu"ur:

    Je)$r1e) !eno"': 1nsan ekirdek genomu yakla"k milyar ba(

    i*tinden olu"an DNA&dr. Dei"ik organi(malarn genomunun bykl0 *arkldr. 1nsanda ekirdek genomu kromo(om ad verilen 3E DNAyab9lnm"tr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    87/92

    8er kromo(om $2 ile 3$2 milyon ba( i*ti kapsamaktadr 'ablo 4). Bn u(unkromo(om yakla"k 3$2 Hb en ksas yakla"k $$ Hb&dr. 3E kromo(omun33si oto(omal kromo(omlar dier ikisi ise seks kromo(omlar \ ve J dir.1nsan kromo(omlarnn yakla"k u(unluklar ablo 4&de g9sterilmi"tir.

    M$to)on1r$ !eno"': Dairesel bir DNA molekldr ve 4$7 ba( i*tiierir. Bner,i metaboli(masndan sorumlu olan bir mitokondri organeli oksayda mitokondri DNA&s bulundurur.

    Jeti"kin insan vcudunda bulunan yakla"k 424! hcre kendi genomkopyasn bulundurur. Britrositler gibi tamamen *arklla"m" krm0 ( kanhcreleri ise DNA bulundurma(lar.

    8crelerin ou diploidtir. Jani her oto(omal kromo(omdan iki kopya ve\\ veya \J iki seks kromo(omu olmak (ere toplam E kromo(ombulundururlar. #u hcrelere somatik hcreler ad verilir.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    88/92

    eks hcreleri veya gametler ise haploidtir. Jani her oto(omal kromo(omdan birkopya ve bir seks kromo(omu olmak (ere 3! kromo(om bulundururlar.

    #ir somatik veya seks hcresinde yakla"k her mitokondri organelinden 42 veyadaha *a(la olmak (ere toplam G222 kopya mitokondriyel genom bulunur.

    -enler g9rnmm( boyumu(u cinsiyetimi(i ve vcudumu(un dei"ik

    etkilere nasl tepki vereceini belirler ve organi(mann beslenmesinig9rnmn en*eksiyonla sava"masn salayan gerekli proteinlerin yapm ileilgili bilgileri ta"rlar. Dnyada alt milyar insan olmasna ramen hepsinin

    birbirinden *arkl olmasn salayan genlerdir. 1nsan genlerinin bykl okdei"kendir ve sklkla bir gen binlerce ba( (erine dalm"tr. -enomunsadece =3&sinin protein kodlama ile ilgili olduu d"nlmektedir ve bu

    b9lgelere ek(on ad verilir geri kalan ksm ise kodlama yapmayan b9lgelerdir'genlerin i*adesini kontrol eden di(iler ve gen ii b9lgeler) ve i"levleri tam

    bilinmemektedir.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    89/92

    Gen e)spres&on'n'n Je,$t$$-$ #e 6pa !$s$

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    90/92

    Gen e)spres&on'n'n Je,$t$$-$ #e 6pa !$s$

    1nsan kromo(omlar tara*ndan kodlanan tahmini $2.222 geninekspresyonunun d(enlenmesi *arkl kontrol d(eyleri arasnda bir serikarma"k ili"kiyi gerektirmektedir. #unlar< uygun gen do(a, 'kromo(omreplikasyon ve segregasyon mekani(malaryla kontrol edilen) gen yapstranskripsiyon m+NA stabilitesi translasyon protein i"lenmesi ve protein

    degredasyonudur. #a( genler iin genin yapsndaki kaltsaldei"ikliklerin veya diyet[evre gibi genetik olmayan *akt9rlerleindklenen dei"ikliklerin neden olduu *onksiyonel gen rnd(eyindeki dalgalanmalar ok 9nemli deildir. Dier genlerin ekspresyond(eyindeki dei"iklikler bu genlerin rnlerinin biyolo,ik yollarda

    9nemini yanstacak "ekilde 9nemli klinik sonulara neden olabilir.>romo(omlar ve genlerin yap *onksiyonlarndaki kaltsal e"itlilikler vebu e"itliliklerin 9(gl 9(elliklerin ekspresyonuna olan etkisi tbbi vemolekler genetiin esasn olu"turmaktadr.

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    91/92

  • 7/25/2019 2. Genlern Ve Kromozomlarin Yapisi Ve Fonksyonu

    92/92