swiecace bakterie prof węgrzyn
TRANSCRIPT
Świecące bakterie
Prof. dr hab. Grzegorz WęgrzynKatedra Biologii Molekularnej Uniwersytet Gdański
Bioluminescencja to reakcja chemiczna, którejefektem jest produkcja i emisja kwantu światła przez
organizmy żywe
do wyprodukowania kwantu światła potrzebne są dwa związki chemiczne:
lucyferyna i lucyferaza
do zajścia kolejnej rundy reakcji konieczna jest nowa porcja substratu
czasami lucyferyna i lucyferaza wraz z kofaktorami tworzą razem jeden kompleks białkowy zwany fotoproteiną
za http://www.rudimentsofwisdom.com
Światło emitowane przez organizmy morskie jest koloru niebiesko-zielonego
światło o długości fali 470nm najlepiej penetruje toń wodną
większość organizmów morskich jest wrażliwych tylko na światło niebieskie
wyjątek: ryby głębinowe z rodziny Malacosteidae (Malacosteus, Aristostomias, Pachystomias) potrafią emitować oprócz światła zielonego światło czerwone (625nm)
za http://www.lifesci.ucsb.edu/
za http://www.schools.net.au/
za http://www.hboi.edu/marinesci/biolum.html
Emisja światła
większość organizmów morskich emituje krótkie błyski światła
u organizmów wielokomórkowych luminescencja podlega kontroli sympatycznego systemu nerwowego
niektóre bruzdnice mogą emitować serie błysków światła
emisja światła w sposób ciągły obserwowana jest u ryb i głowonogów, których organy świetlne zasiedlone są przez luminescencyjne bakterie
za http://www.mbari.org/, http://www.rain.org/
Organizmy morskie emitujące światło
bakterie
bruzdnice
zooplankton
parzydełkowce
mięczaki
skorupiaki
jeżowce
ryby
za http://www.glowexhibit.com/, http://www.mcb.harvard.edu/, http://www.elenas-vieques.com
Bakterie emitujące światło bakterie
morskie należą do rodzajów Vibrio oraz Photobacterium.
większość z nich to organizmy symbiotyczne
luminescencja regulowana jest na zasadzie regulacji zmysłu gęstościowego
Symbioza między bakteriami luminescencyjnymi a organizmami wyższymi
Vibrio fischeri
ryby z rodziny Monocentridae oraz głowonogi z rodziny Sepiolidae
Photobacterium leionghati
głowonogi z rodziny Loliginidae oraz ryby z rodziny
Leiognathidae
Photobacterium phosphoreum
ryby z rodziny Lophiiformidae oraz Anomalopidae
Microbiology Today2002 nr 29
za http://www.cephbase.dal.ca/
Bruzdnice
Gonyaulax sp.
sygnałem do emisji krótkich błysków światła może być stymulacja mechaniczna, sygnałem do produkcji ciągłej światła – stymulacja chemiczna lub termiczna
korelacja emisji światła z cyklem dobowym
emisja światła w odpowiedzi na bodźce mechaniczne to alarm antywłamaniowy
za http://www.lifesci.ucsb.edu, http://www.bion.si/, http://www.elenas-vieques.com, http://www.hwi.buffalo.edu/
Promienice (radiolarie)
pierwotniaki
emisja światła w odpowiedzi na uszkodzenie kolonii
fotoproteina radiolarii aktywowana jest jonami wapnia
syntetyzowany na wzór ,,biofilmu” tworzonego przez komórki radiolarii sztuczny luminescencyjny silikon uważany jest za materiał mogący przyczynić się do rozwoju nanotechnologii
za http://biomaritime.free.fr/
syntetyczne diatomy i ,,żywe” radiolarie
Parzydełkowce
Ctenophora
Scyphozoa (meduzy np. Eurhamphea vexiligera Pelagia nocticula)
Hydrozoa (hydromeduzy np. Aequoria victoria)
Anthozoa (koralowce np. Ptilosarcus gurneyi)
za www.bertholdtech.com, http://www.plantsci.cam.ac.uk/, www.bio.davidson.edu , www.ucmp.berkeley.edu , www.jervisbay.com
Aequoria victoria i białko GFP
aekworyna to kompleks
białkowy złożony z apoproteiny, tlenu
cząsteczkowego i kolentrazyny
kwant światła wzbudza białko
GFP, które emituje światło o
długości 508nm odpowiadające barwie zielonej
za http://www.plantsci.cam.ac.uk, http://ag.arizona.edu/, http://www.biochemtech.uni-halle.de/
Zastosowanie białka GFP z hydromeduzy
fuzje białkowe GFP z
białkami wchodzącymi w
skład membran aparatu
Golgiego roślin
komórki nabłonka ludzkiego
– mikrotubule (zielone),
DNA (niebieski)
lokalizacja guzów
nowotworowych
Prolume – ,,świecące” jedzenie
,,świecące” zwierzęta
© Prolume Ltd
Photo: Chrystelle Fontaine
za http://www.biologie.uni-hamburg.dehttp, http //www.cquest.utoronto.ca
za http://www.lightools.com oraz AntiCancer Inc
Modyfikacje GFP
stosowane systemy detekcji umożliwiają wykrycie około 1 mM białka GFP
zmodyfikowane GFP – EGFP, YGFP, CGFP oraz BGFP
EGFP u transgenicznych myszy
fluoryzujące na żółto i fioletowo kolonie E. coli
komórki linii HeLa (fuzja białka EYFP z białkiem jądrowym oraz ECFP z białkiem
mitochondrialnym)
Renilla
Renilla reniformis i Renilla mulleri
kolonia zbudowana z szeregu polipów
emisja światła zachodzi w odpowiedzi na uszkodzenie kolonii
emitowane światło ma barwę zieloną, co jest efektem emisji kwantu światła przez uprzednio wzbudzone białko GFP
za http://www.whitney.ufl.edu/
za http://bmbiris.bmb.uga.edu/ oraz JE Wampler, 1997
Zastosowanie białka GFP z Renilla
badanie procesów dimeryzacji białek
monitorowanie poziomu ekspresji genów oraz monitorowanie lokalizacji białek
za pubs.acs.org/, www.nature.com, www.stratagene.com, http://www.biocompare.com
Mięczaki
za www.imagequest3d.com, http://www.elenas-vieques.com, http://www.tonmo.com, http://tolweb.org, http://www.dal.ca/~ceph/
ośmiornice oraz kałamarnice
luminescencja jest rzadko spotykana u mięczaków należących do innych rzędów
emisja światła: fotofory świecący tusz symbiotyczne bakterie
Ryby
luminescencja może być wynikiem produkcji światła przez ryby lub efektem świecenia symbiotycznych bakterii
u angler oraz flashlightfish
(rodzina Anomapalidae) fotofory nie mają połączenia z przewodem pokarmowym
większość ryb (dragonfish, lanternfish, hatchetfish) posiada własne systemy lucyferyna -lucyferaza
za http://ramseydoran.com, http://www.uog.edu, http://www.mbayaq.org, http://departments.oxy.edu/
Porichthys sp.
rodzaj Porichthys wymaga
odpowiedniej diety (Vargula
hilgendorfii), aby emitować
światło
za http://departments.oxy.edu/, http://www.afrlhorizons.com/, http://umiho.net
Rola luminescencji
odstraszanie napastników
Rola luminescencji
mylenie napastników
Rola luminescencji
zwabianie ofiar
Rola luminescencji
zwabianie ofiar
Rola luminescencji
kamuflaż
Rola luminescencji
komunikacja
Rola luminescencji
Dlaczego bakterie świecą?
DO NIEDAWNA:
?
Rola luminescencji
Powstanie i wczesna ewolucja luminescencji jest problematycznym punktem w teorii Karola Darwina
Jeśli założyć, że znaczenie biologiczne luminescencja ma tylko wtedy, gdy emitowane światło może być widziane przez inne organizmy, to trudno jest sobie wyobrazić powstanie i wczesną ewolucję systemów bioluminescencji
DOBÓR NATURALNY
Kolejne pokolenia Kolejne pokolenia
EWOLUCJA SYSTEMÓW BIOLUMINESCENCJI
Kolejne pokolenia Kolejne pokolenia
Kolejne pokolenia Kolejne pokolenia
Problem 1: Światło o małej intensywności nie jest widziane przez inne organizmy, zatem nie może być selekcji świecących osobników
Kolejne pokolenia Kolejne pokolenia
Problem 2: Bardzo wydajne systemy luminescencji, zapewniające odbieranie bodźców świetlnych przez inne organizmy, nie mogły powstać nagle, gdyż wymagają one zajścia skomplikowanych reakcji biochemicznych
Jeśli pierwotne systemy luminescencji były mało wydajne, to jaka była pozytywna selekcja osobników emitujących bardziej wydajnie światło, które wciąż było jednak za słabe aby mogło być odbierane przez narządy wzroku?
?
Fotoreaktywacja
naprawa powstałych wskutek naświetlania komórek światłem
UV (o długości fali 190-300 nm) fotodimerów tymidynowych
za http://www.hanovia.net/, http://saturn.roswellpark.org/, http://helios.acomp.usf.edu/, www.liv.ac.uk/
Stymulacja naprawy DNA przez fotoreaktywację jest funkcją bakteryjnej bioluminescencji i mogła być
motorem ewolucji wczesnych systemów luminescencji
Fotoliaza
NAPRAWA DNA
Pojawienie się i wczesna ewolucja luminescencji były możliwe dzięki stymulacji procesu fotoreakywacji
przez niewielkie ilości światła, zbyt małe aby mogły być widziane przez inne organizmy
Kolejne pokolenia Kolejne pokolenia
Rola luminescencji
odstraszanie i mylenie napastników
wabienie ofiar
kamuflaż
komunikacja
naprawa DNA
większość organizmów zdolnych do świecenia to organizmy związane ze środowiskiem morskim
emitowane światło powstaje jako produkt reakcji utlenienia lucyferyny, katalizowanej przez enzym lucyferazę
luminescencja pełni różnorodne funkcje biologiczne