®

Neinvazivni prenatalni test

1866

1947

1977

1959

1879

2008

2005

19971986

1928

1953

®

2010

Odkritje DNA v krvnem obtoku.

Določitev strukture dvojne vijačnice DNA

Trisomija kromosoma 21 povzroča Downov

sindrom

Razvita tehnologija klasičnega sekvenci-

ranja

Prvi avtomatiziran sekvenatorOdkritje proste plodove

DNA v krvnem obtoku matere

Razvita tehnologija sekveniranja nove

generacije

Odkritje kromosomovPrvič opisan Downov sindrom Odkritje, da se na

kromosomih nahajo geni

Začetek prvega NIPT kliničnega

testiranja

Preizkus in potrditev metodologije testa

NIFTY®

Test NIFTY® je bil validiran v največji do sedaj objavljeni študiji v katero je

bilo vključenih 147.314 nosečnic

NIFTY®

Dodano testiranje za prve mikrodelecije

V zadnjem desetletju sta razvoj v znanosti genetike in ogromen napredek na področju genetske tehnologije spremenila naše razumevanje bolezni, postavljanje diagnoz in zagotavljanje učinkovitega zdravljenja.

Prav tako so področje predrojstvenega testiranja zaznamovali novi neinvazivni predrojstveni testi na podlagi DNK (NIPT), ki prinašajo zelo natančno presejalno metodo za odkrivanje anevploidij ploda. NIFTY® test (Non-Invasive Fetal TrisomY test) je bil prvi NIPT uporabljen v klinični praksi, in sicer leta 2010, v Evropi pa v prvem četrtletju leta 2013. S testom odkrivamo najpogostejše trisomije, anevploidije spolnih kromosomov, možna je detekcija spola in najpogostejših mikrodelecij. NIFTY® je veliko bolj zanesljiv kot tradicionalni presejalni testi. Do sedaj je bilo po svetu narejenih že več kot 2.000.000 NIFTY® testov.

Predstavitev testa NIFTY®

RAZVOJ ODKRITIJ, TEHNOLOGIJE IN TESTA NIFTY®

2013 2015 2017

NIFTY® novice

Genetska odkritja

Razvoj genskega inženiringa

2012

Opravljenih prvih 10.000 testov NIFTY®

Opravljenih 2.000.000 testov

NIFTY®

Incidenca na 100.000 rojstev

Prevalenca ni znana

Klinefelte

rjev s

indro

m (XXY)

Downov s

indro

m (triso

mija 2

1)XYY

XXX

Turn

erjev s

indro

m (X)

1p36

Edwardso

v sind

rom (tr

isomija

18)

Patau

jev sind

rom (tr

isomija

13)

Cri-du-

Chat (5

p)

2q33.1

200

150

100

50

0

TRISOMIJE

Trisomija je izraz, ki označuje genetsko nepravilnost pri kateri gre za tri kromosome namesto običajnega para. Trisomija 21 (Downov sindrom), trisomija 18 (Edwardsov sindrom) in trisomija 13 (Patauov sindrom) so tri najbolj pogoste avtosomalne kromosomske anevploidije pri živo rojenih. Nastanejo zaradi dodatne kopije ali delne kopije kromosoma 21, 18 ali 13. Dodatni genetski material lahko povzroči značilne obrazne poteze, prirojene deformacije in različne stopnje motenj v duševnem razvoju.

ANEVPLOIDIJE SPOLNIH KROMOSOMOV

Anevploidije spolnih kromosomov so definirane kot številčne nepravilnosti kromosomov X ali Y, z možnostjo dodatnega oziroma pomanjkanjem celotnega kromosoma X ali Y. Kljub temu, da se anevploidije spolnih kromosomov v večini primerov kažejo v blagi obliki brez motenj v duševnem razvoju, je v nekaterih primerih možen določen fenotip, ki lahko vključuje fizične nepravilnosti, težave pri učenju in neplodnost.

SINDROMI DELECIJ

Sindromi delecij so definirani kot skupina klinično prepoznavnih nepravilnosti, ki nastanejo zaradi delecije dela kromosoma. Velikost in položaj delecije določata katere klinične lastnosti so izražene in kako resne so. Klinične značilnosti delecij lahko vključujejo zaostanek v razvoju in motnje v duševnem razvoju, počasno rast, vedenjske motnje, težave pri hranjenju, nizek mišični tonus, epileptične napade, značilne obrazne poteze in druge malformacije.

Kaj lahko testiramo s testom NIFTY®

Predstavitev testa NIFTY®

Test NIFTY® je najbolj celosten cfDNK test na tržišču, saj nudi testiranje širokega nabora nepravilnosti po dostopni ceni.

Test NIFTY® je validiran in preizkušen v največji do sedaj objavljeni klinični študiji do sedaj (147.000 nosečnic). Do sedaj je bilo opravljenih že več kot 2 milijona testov NIFTY.

Test NIFTY® ima najnižji delež ponovnih odvzemov in najnižji delež (0,098 %) primerov pri katerih ni mogoče pridobiti rezultatov testiranja.

Test je primeren tudi za:

PREDNOSTI

Nosečnost z donirano jajčno celico

Nosečnost po postopku oploditve z biomedicinsko pomočjo (IVF)

Dvoplodne nosečnosti (samo za trisomije 21, 18 in 13)

Rezultati testa so običajno znani v 6 do 10 dneh

NIFTY® test je možen že od 10. tedna dalje

Za NIFTY® test je potrebnih 10 ml materine krvi

Metodologija testa NIFTY®

PROSTO CELIČNA DNA IN PROSTO CELIČNA PLODOVA DNA

Prosto celični fragmenti DNK (cfDNA) so kratki deli DNK, ki krožijo v krvi. V nosečnosti se v materinem krvnem obtoku nahajajo prosto celični fragmenti DNK matere in ploda. Prosto celična plodova DNK (cffDNA) je prisotna le kot manjši delež celotne cfDNK v materini plazmi, kar za nekatere metode NIPT predstavlja precejšnji tehnični izziv.

KAKO DELUJE NIFTY®?

Za izvedbo NIFTY® testa je potreben le 10-ml vzorec materine krvi, ki jo analiziramo, da bi odkrili morebitne kromosomske nepravilnosti. Če je anevploidija prisotna, pri štetju določenega kromosoma zaznamo majhen višek ali pomanjkanje.

NIFTY® učinkovito premaguje težavno merjenje majhnih viškov določenega kromosoma v koncentraciji DNK z uporabo tehnologije masivnega paralelnega sekvenciranja. To pomeni, da z NIFTY™ testom v vsakem vzorcu sekvencira milijone fragmentov plodove in materine DNK. S tehnologijo vsegenomskega sekvenciranja in štirimi različnimi lastnimi bioinformatskimi logaritmi lahko analiziramo podatke celotnega genoma in primerjamo kromosome v testiranem vzorcu z optimalnimi referenčnimi kromosomi, ter tako natančno določimo prisotnost genetskih nepravilnosti.

V nasprotju z metodami ‘ciljnega sekvenciranja’, ki jih uporabljajo nekateri drugi NIPT testi, metodologija NIFTY® testa omogoča izjemno natančne rezultate ne glede na klinične simptome pacientke in širšo paleto možnosti testiranja, vključno s testiranjem za trisomije, anevploidije spolnih kromosomov in mikrodelecije.

Materina DNK

Prosto-celična plodova DNK

Preden se nosečnica odloči za NIFTY® test se mora posvetovati z usposobljenim zdravnikom, da dobi izčrpne informacije o neinvazivnem predrojstvenem testiranju in neusmerjeno svetovanje o človeški genetiki. NIFTY®

je na voljo od 10. tedna nosečnosti.

Podjetje BGI, ki je bilo ustanovljeno leta 1999 z vizijo uporabiti najnovejša spoznanja v genetiki v korist človeštvu, je trenutno največja organizacija na področju genomike svetu. BGI je v tem času zrasel v multinacionalno genomsko podjetje, ki ima svoje laboratorije za sekvenciranje v ZDA, Evropi, Hong Kongu in na Kitajskem.

BGI ponuja tudi širok spekter prilagojenih genetskih testov za hude bolezni, kar zdravstvenim ponudnikom in pacientom po vsem svetu omogoča vpogled v možnosti diagnostike in personalizirane zdravstvene oskrbe na osnovi genomike. Storitve in rešitve podjetja BGI so na voljo v več kot 50 državah po vsem svetu.

Indikacije

TEST NIFTY® JE MED DRUGIM PRIMEREN ZA NOSEČNICE Z NASLEDNJIMI INDIKACIJAMI:

TEST NIFTY® NI PRIMEREN ZA NOSEČNICE Z NASLEDNJIMI INDIKACIJAMI:

Starost matere 35 ali več ob rojstvu.

Kontraindikacija za invazivno prenatalno testiranje kot je placenta prevaria, povečano tvegaje za splav, HBV infekcija itd.

Predhodne nosečnosti z znanimi kromo-somskimi abnormalnostmi.

Ultrazvočni pregled nakazuje na povečano tveganje za T21, T18 ali T13.

Za nosečnice, ki želijo dodatno potrditev po predhodno opravljenih presejalnih testih.

Za nosečnice, ki so zanosile po IVF postopku ali so imele predhodne spontane splave.

Znana prisotnost mozaicizma matere, fetusa ali posteljice.

Znana prisotnost uravnoteženih in neuravnoteženih kromosomskih translokacij in inverzij pri materi ali fetusu.

Za pacientke, ki so prejele trasfuzijo krvi v času enega leta pred opravljanjem testa.

Za pacientke, ki so imele transplantacijo organov.

Za pacientke, ki so se zdravile z matičnimi celicami.

Testa ni priporočljivo opravljati v primeru nosečnosti pri kateri je prišlo do izginanja ploda (Vanishing Twin). V teh primerih je test mogoče opraviti v kolikor je od odmrtja ploda do odvzema krvi preteklo najmanj 8 tednov.

VALIDACIJA TESTA NIFTY®

Test NIFTY® je bil validiran v največji do sedaj objavljeni klinični študiji: Non-Invasive Prenatal Testing For Trisomy 21, 18 and 13 – Clinical Experience from 146,958 Pregnancies Wei Wang et al, Journal of Ultrasound in Obstetrics and Gynecology. Vzorci vključeni v raziskavo so bili odvzeti med januarjem 2011 and avgustom 2013. Raziskava je bila objavljena v reviji Journal of Ultrasound in Obstetrics and Gynecology.

Klinična validacija

Število vseh nosečnic vključenih v študijo

Število uspešno analiziranih vzorcev

Vzorci z znanim kliničnim izidom

Pozitivni NIPT: Negativni NIPT:

Neustrezni vzorci: 211Neuspešno testiranje: 145

Neznan klinični izid:34.289

(kariotip ali rojstvo)

147.314

99,17 % 98,24 % 100 %

POVZETEK RAZISKAVE SENZITIVNOST

T21Downov Sindrom

T18Edwardsov

Sindrom

T13Patau

Sindrom

Združena stopnja lažno

pozitivnih primerov

<0.05%146.958

112.669

1.066 111.603

*TP - Resnično Pozitivni Rezultati (angl. Number of True Positive), PPV - Pozitivna napovedna vrednost (angl. Positive Predictive Value), NPV - Negativ-na napovedna vrednost (angl. Negative Predictive Value)

Ostale publikacije o testu NIFTY® so dostopne na: ww.niftytest.si

Rezultati študije izračunani na vzrocu 112.669 nosečnic z znanim kliničnim izidom:

TRISOMIJA TP* SENZITIVNOST SPECIFIČNOST PPV* NPV*

T21 720 99,17 % 99,95 % 92,19 % 99,99 %

T18 167 98,24 % 99,95 % 76,61 % 100 %

T13 22 100 % 96,96 % 32,84 % 100 %

TOTAL 909 99,02 % 99,86 % 85,27 % 99,99 %

Publikacije

1. METODOLOGIJA

1. Chiu RW, et al. Non-invasive prenatal assessment of trisomy 21 by multiplexed mate rnal plasma DNA sequencing: large scale validity study. BMJ. 2011; 342:c7401, doi:10.1136/bmj.c7401.

2. Chen EZ, et al. Non-invasive prenatal diagnosis of fetal trisomy 18 and trisomy 13 by maternal plasma DNA sequencing. PLoS One. 2011;6(7):e21791. doi:10.1371/ journal.pone.0021791.

3. Dan S, et al. Prenatal detection of aneuploidy and imbalanced chromosomal arrangements by massively parallel sequencing. PLoS One. 2012;7(2):e27835.

4. Fuman Jiang, et al. Non-invasive Fetal Trisomy (NIFTY) test: an advanced non-invasive prenatal diagnosis methodology for fetal autosomal and sex chromosomal aneuploidies . BMC Med Genomics. 2012 Dec 1;5:57.

5. Yuan Y, et al. Feasibility study of semiconductor sequencing for noninvasive prenatal detection of fetal aneuploidy. Clin Chem. 2013 May; 59(5):846-9.

6. Chen S, et al. A method for noninvasive detection of fetal large deletions/duplications coverage massively parallel sequencing. Prenat. Diagn.

2013 Jun;33(6):58490.

2. KLINIČNA VALIDACIJA

7. Lau TK, et al. Non-invasive prenatal diagnosis of common fetal chromosomal aneuploidies by maternal plasma DNA sequencing. J Matern. Fetal Neonatal Med. 2012 Aug; 25(8):1370-4.

8. Dan S, et al. Clinical application of massively parallel sequencing-based prenatal noninvasive fetal trisomy test for trisomies 21 and 18 in 11,105 pregnancies with mixed risk factors. Prenat Diagn. 2012 Dec;32(13):1225-32.

9. Lau TK, et al. Clinical utility of non-invasive fetal trisomy (NIFTY) test--early experience. J Matern Fetal Neonatal Med. 2012 Oct;25(10):1856-9. 10. Lau TK, et al. Non-invasive prenatal screening of fetal sex chromosomal abnormalities: perspective of pregnant women. Maternal Fetal Neonatal

Med. 2012 Dec;25(12):2616-9. 11. Lau TK, Cheung SW, Lo PS, et al. Non-invasive prenatal testing for fetal chromsomal abnormalities by low-coverage whole-genome sequencing

of maternal plasma DNA: review of 1982 consecutive cases in a single center. Ultrasound Obstet Gynecol. 2014 Mar;43(3): 254-64. 12. Yao H, Jiang F, Hu H, et al., Detection of Fetal Sex Chromosome Aneuploidy by Massively Parallel Sequencing of Maternal Plasma DNA: Initial

Experience in a Chinese Hospital. Ultrasound Obstet Gynecol. 2014 Mar 10. doi: 10.1002/uog.13361. [Epub ahead of print]. 13. Zhou Q, Pan L, Chen S, et al. Clinical application of noninvasive prenatal testing for the detection of trisomies 21, 18, and 13: a hospital experience.

Prenat Diagn. 2014 Jun 4. doi: 10.1002/pd.4428. [Epub ahead of print].

3. ŠTUDIJE PRIMEROV

14. Yao H, et al. Non-invasive prenatal genetic testing for fetal aneuploidy dete cts maternal trisomy X . Prenat Diagn. 2012 Nov;32(11):111415. Choi H, et al. Fetal aneuploidy screening by maternal plasma DNA sequencing: ‘ false positive’ due to confined placental mosaicism. Prenat

Diagn. 2013 Feb;33(2):198-200. 16. Pan M, Li FT, Li Y, et al. Discordant results between fetal karyotyping and non-invasive parenatal testing by maternal plasma sequencing in a case

of uniparental disomy 21 due to trisomic rescue. Prenat Diagn. 2013 Jun; 33(6): 598-601. 17. Lau TK, Jiang FM, Stevenson RJ et al. Secondary findings from non-invasive prenatal testing for common fetal aneuploidies by whole genome

sequencing as a clini cal service. Prenat Diagn. 2013 Jun; 33(6): 602-8. 18. Gao Y, Stejskal D, Jiang F, Wang W. A T18 false negative result by NIPT in a XXX, T18 case due to placental mosaicism. Ultrasound Obstet

Gynecol. 2013 Nov 1.

4. RAZISKAVE NA DVOPLODNIH NOSEČNOSTIH

19. Huang X, et al. Non-invasive prenatal screening of fetal Down syndrome by maternal plasma DNA sequencing in twin pregnancies. J Matern Fetal Neonatal Med. 2013 Mar;26(4):434-7.

20. Jing Zheng. et al. Effective Non-invasive Zygosity Determination by Maternal Plasma Target Region equencing. PLOS ONE. 2013: 8 (6) :e65050

®

www.niftytest.si

+386 59 22 66 09

nifty.test@geneplanet.com

genEplanet d.o.o. | Cesta na Poljane 24 | 1000 Ljubljana | Slovenija