VIRUSVIRUS

KULIAH IVKULIAH IV

MIKROBIOLOGI FARMASI 2008MIKROBIOLOGI FARMASI 2008

Prion, Viroid dan VirusPrion, Viroid dan Virus PrionPrion: molekul protein spesifik yang infektif. Prion memiliki : molekul protein spesifik yang infektif. Prion memiliki

informasi yang mengkode replikasinya, a.l. penyebab informasi yang mengkode replikasinya, a.l. penyebab penyakit sapi gila (penyakit sapi gila (cow mad diseasecow mad disease atau atau bovine spongiform bovine spongiform encephalophatyencephalophaty, BSE), dan CJD (Creutz-Jakob disease) pada , BSE), dan CJD (Creutz-Jakob disease) pada manusia.manusia.

ViroidViroid merupakan jasad yang terdiri dari RNA saja yang merupakan jasad yang terdiri dari RNA saja yang menjadi materi pengkode reproduksinya. Genome RNA-nya menjadi materi pengkode reproduksinya. Genome RNA-nya kecil, dalam sel inang viroid mampu memulai replikasi kecil, dalam sel inang viroid mampu memulai replikasi dirinya. Replikasi kadangkala ditunjukkan sebagai dirinya. Replikasi kadangkala ditunjukkan sebagai symptomsymptom penyakit dalam hewan inangnya. Contoh penyakit umbi penyakit dalam hewan inangnya. Contoh penyakit umbi kentang dan penyakit eksokortis pada tanaman jeruk. kentang dan penyakit eksokortis pada tanaman jeruk.

VirusVirus merupakan mikroba non seluler dan merupakan merupakan mikroba non seluler dan merupakan parasit obligat intraselluler. parasit obligat intraselluler. Untuk dapat bertahan di Untuk dapat bertahan di lingkungan virus harus mampu berpindah dari inang satu ke lingkungan virus harus mampu berpindah dari inang satu ke lainnya, menginfeksi dan replikasi pada inang yang sesuai. lainnya, menginfeksi dan replikasi pada inang yang sesuai. Suatu partikel virus didefinisikan sebagai struktur yang Suatu partikel virus didefinisikan sebagai struktur yang terlibat dalam transfer asam nukleat dari satu sel ke lainnya. terlibat dalam transfer asam nukleat dari satu sel ke lainnya. Asam nukleat dapat berupa DNA atau RNA, dengan benang Asam nukleat dapat berupa DNA atau RNA, dengan benang tunggal atau ganda, linear, bersegmen, atau mungkin tunggal atau ganda, linear, bersegmen, atau mungkin sirkuler. sirkuler.

VirusesViruses

Deskripsi: Virus bukan sel

Karakteristik: non-seluler, parasit obligat intraseluler

Tipe Nutrien : tidak memiliki

Bentuk proteksi diri: sebagian partikel virion memiliki pelindung untuk bertahan

• Respirasi• Jalur Fekal-Oral• Kontak langsung dengan materi

dari penderita (muntah, luka, saliva)

• Zoonosis (insekta dan hewan lainnya)

• Darah• Hubungan seksual• Ibu-Bayi neonatal

Cara Penularan

Penyebaran melalui jalur fekal-Penyebaran melalui jalur fekal-oraloral

Virus pada air limbah dengan pengukuran lewat kultur sel- Air limbah tanpa diolah: 1.82 x102 - 9.2 x104 per liter- Air limbah dengan diolah: 1.0 x 103 -1.0 x102 per liter

Major Diseases Important Viruses

AIDS HIV-1

HepatitisHAV, HBV, HCV,

HDV, HEV, CMV, EBV

CancerHPV, HCV, EBV,

HBV, HHV-8, HTLV-I

EncephalitisHSV, togaviruses, flaviviruses,

rabies, picornaviruses

MeningitisEnteroviruses, mumps,

HSV-2, VZV

Gastrointestinal TractRotavirus, caliciviruses,

adenoviruses (40, 41)

Common ColdRhinoviruses, coronaviruses,

adenoviruses

Lower Respiratory TractInfluenza, parainfluenza,

ReSV,adenoviruses, SARS-CoVCongenital & Neonatal

InfectionsCMV, Parvovirus B19,

rubella, HSV, HIV

ACUTE

LATENT(RECURREN

T)

CHRONIC

SLOW

SARSSARSCharacterization of a Novel Coronavirus Associated

with Severe Acute Respiratory Syndrome

Paul A. Rota 1*, M. Steven Oberste 1, Stephan S. Monroe 1, W. Allan Nix 1, Ray Campagnoli 1, Joseph P. Icenogle 1, Silvia Peñaranda 1, Bettina Bankamp 1, Kaija Maher 1, Min-hsin Chen 1, Suxiong Tong 1, Azaibi Tamin 1, Luis Lowe 1, Michael Frace 1, Joseph L. DeRisi 2, Qi Chen 1, David Wang 2, Dean D. Erdman 1, Teresa C. T. Peret 1, Cara Burns 1, Thomas G. Ksiazek 1, Pierre E. Rollin 1, Anthony Sanchez 1, Stephanie Liffick 1, Brian Holloway 1, Josef Limor 1, Karen McCaustland 1, Melissa Olsen-Rassmussen 1, Ron Fouchier 3, Stephan Günther 4, Albert D. M. E. Osterhaus 3, Christian Drosten 4, Mark A. Pallansch 1, Larry J. Anderson 1, William J. Bellini 1

In March 2003, a novel coronavirus (SARS-CoV) was discovered in association with cases of severe acute respiratory syndrome (SARS). The sequence of the complete genome of SARS-CoV was determined, and the initial characterization of the viral genome is presented in this report. The genome of SARS-CoV is 29,727 nucleotides in length, has 11 open reading frames, and the genome organization is similar to that of other coronaviruses. Phylogenetic analyses and sequence comparisons showed that SARS-CoV is not closely related to any of the previously characterized coronaviruses.

SARS Returns or Lab Accident? SARS Returns or Lab Accident? Singapore WondersSingapore Wonders (Reuters)(Reuters)

Wed September 10, 2003Wed September 10, 2003

Gambar sebaran 20-11-07

MonkeypoxMonkeypox

SmallpoxSmallpoxPoxvirusPoxvirus

ConjunctivitisConjunctivitisAdenovirusAdenovirus

MEASLES RASH

HerpesvirusHerpesvirusHSV-1 Cold SoreHSV-1 Cold Sore

Penyakit sebagai manifestasi AIDS

Poliovirus,Poliovirus,prototype picornavirusprototype picornavirus

Pemberantasan Polio Isu eradikasi:Isu eradikasi:

1. Vaksin hidup ? 1. Vaksin hidup ? 2. Muncul strain baru? 2. Muncul strain baru? 3. Vaksin mati? 3. Vaksin mati?

Ukuran dan Struktur Virus

1. Bervariasi, diameter 15 - 300 nm

2. Terdiri dari materi utama asam nukleat dan dibungkus protein

a. DNA atau RNA b. Bungkus protein sering bersisi 20

Virion – partikel virus lengkap

Kapsid – mantel protein yang menyelubungi genom asam nukleat

Kapsomer – rangkaian sub-unit protein yang menyusun kapsid

Protomer – rantai polipeptida yang menyusun kapsomer

PARVOVIRUS SS linear

PAPOVAVIRUS DS, circular

ADENOVIRUS DS, linear

HERPESVIRUS DS, linear

POXVIRUS DS, linear

HEPADNAVIRUS DS, circular

DNA VIRUSES GENOME

PICORNAVIRUSES SS +

CALICIVIRUS SS +

REOVIRUS DS (+/-)

TOGAVIRUS SS +

FLAVIVIRUS SS +

RHABDOVIRUS SS -

PARAMYXOVIRUS SS -

ORTHOMYXOVIRUS SS -

RETROVIRUS SS + (two identical)

FILOVIRUS SS -

ARENAVIRUS SS -

BUNYAVIRUS SS -

CORONAVIRUS SS +

RNA VIRUSES GENOME

~300 nm

~25 nm

Reproduksi Virus

1. Virus bereplikasi dengan memanfaatkan sel inang

2. Virus harus menempel pada sel inang yang tepat/rentan

3. Setelah menembus, DNA/RNA segera mensintesa partikel viral baru

4. Banyak virus bermutasi dengan cepat5. Virus akan mempengaruhi metabolisme sel-sel

inang6. Sel-sel terinfeksi dapat membentuk interferon

yang memproteksi sel yang tidak terinfeksi

Jalur masuk virus ke dalam sel inang

Fusi Permukaan

Receptor-Mediated Endocytosis

Fusi dalam endosomaLisis dalam endosoma

Siklus Hidup

Model umum replikasi

Siklus hidup virus DNASiklus hidup virus DNA

Karakter genom yang dilihat antara lain: ukuran, Karakter genom yang dilihat antara lain: ukuran, bentuk, ada tidaknya peplomer dan sifatnya, ada bentuk, ada tidaknya peplomer dan sifatnya, ada tidaknya sampul, simetri dan struktur kapsid. tidaknya sampul, simetri dan struktur kapsid.

Sifat-sifat fisikokimia dan fisik meliputi antara Sifat-sifat fisikokimia dan fisik meliputi antara lain: berat massa virion, koefisien sedimentasi lain: berat massa virion, koefisien sedimentasi virion, stabilitas terhadap pH, stabilitas terhadap virion, stabilitas terhadap pH, stabilitas terhadap suhu, stabilitas terhadap kation (Mg2+, Mn2+), suhu, stabilitas terhadap kation (Mg2+, Mn2+), densitas pengapungan virion (dalam CsCl, densitas pengapungan virion (dalam CsCl, sukrosa), stabilitas terhadap pelarut, stabilitas sukrosa), stabilitas terhadap pelarut, stabilitas terhadap deterjen, stabilitas terhadap iradiasi, terhadap deterjen, stabilitas terhadap iradiasi, dan protein. dan protein.

Sifat antigenik yang dilihat misalnya sifat Sifat antigenik yang dilihat misalnya sifat serologiknya. serologiknya.

Sifat-sifat biologisnya meliputi: inang, cara Sifat-sifat biologisnya meliputi: inang, cara transmisi, hubungan dengan vektor, distribusi transmisi, hubungan dengan vektor, distribusi geografi, patogenisitas.geografi, patogenisitas.

Dasar klasifikasi virus: morfologi, Dasar klasifikasi virus: morfologi, genom, sifat-sifat fisiko-kimia dan fisik, genom, sifat-sifat fisiko-kimia dan fisik, sifat antigenik dan sifat biologis.sifat antigenik dan sifat biologis.