Szerkezet alapú virtuális Szerkezet alapú virtuális gyógyszerkutatásgyógyszerkutatás
/ a humán H4 receptoron // a humán H4 receptoron /
Szerkezet alapú virtuális Szerkezet alapú virtuális gyógyszerkutatásgyógyszerkutatás
/ a humán H4 receptoron // a humán H4 receptoron /
Kiss Kiss Róbert Róbert 11
1 Semmelweis Egyetem, Gyógyszerészi Kémiai Intézet, Budapest, H-1092, Hungary
/Tel: +36-70/3626271 Email: [email protected]/
G-protein G-protein kapcsoltkapcsolt receptor receptorokok
• 1 Palczewski K, Kumasaka T, Hori T, Behnke CA, Motoshima H, Fox BA, Le Trong I, Teller DC, Okada T, Stenkamp RE, Yamamoto M, Miyano M (2000) Science 289(5480):739-45
• Transzmembrán receptorok
• Nagyfokú homológia a transzmembrán domain-ben
• Specifikus motívumok• A mai gyógyszerek kb. 40%-a GPCR-eken keresztül hat• Eddig 1 GPCR-ről van experimentális 3D szerkezet• Homológia modellezés
• 7 alfa hélix
??Homológia modellezésHomológia modellezés
A humán hisztamin H4 receptor szerkezete
Bovine rhodopsin kristály szerkezete
AA hum humáán hisn hiszztamin H4 receptortamin H4 receptor szerkezeteszerkezete
HisHisztamin kötődésztamin kötődés
VirtuVirtuáállisis screening screening
• Építettünk egy jól működő modellt a humán H4 receptorra
• Összegyűjtöttük számos cég megrendelhető molekula adatbázisát
Virtuális screening
In vitro screening
A világ eddigi legnagyobb szerkezet A világ eddigi legnagyobb szerkezet alapú virtuális screening-je…alapú virtuális screening-je…
Számítógépes kapacitás
Software támogatás
ClusterGrid Project
FlexX license 1000CPU-ra
~ 8 800 000
molekula
És a többiekÉs a többiek……
Köszönöm a figyelmetKöszönöm a figyelmet!!