ANALISIS KEKERABATAN

TUJUAN Mengetahui jauh-dekatnya hubungan kekerabatan antara takson-takson (OTU=Operational Taxonomy Unit) yang diuji

PENDEKATANFENETIK - Berdasarkan derajat kesamaan dari ciri-ciri yang dipilih- Tanpa memperhatikan faktor evolusi - Hasilnya dalam bentuk Fenogram/Dendrogram

PENDEKATAN (lanjutan)Phylogenetik - Berdasarkan kesamaan ciri moyangnya- Memperhatikan faktor evolusi- Hasilnya Cladogram

Prinsip Kerja Analisis FenetikMenentukan Operational Taxonomy Unit (OUT)Menentukan ciri dan sifat ciri,lalu ditentukan kode numerik (choding characters)Menghitung nilai koefisien kesamaan, setiap OUT yang diujiMembuat Dendrogram=pohon kekerabatan

Penghitungan Nilai KoefisienNilai Koefisien KesamaanNilai koefisien Ketidaksamaan

MENUNJUKAN JARAK KEKERABATAN

MetodeJaccardSimple Matching Coeficient (SMC) Besarnya nilai perbandingan antara jumlah total ciri berkode sama pada dua OTU dibagi dengan jumlah total ciriDengan Rumus : Sij = a + d pDimana Sij= Nilai Koefisien kesamaan antara OTUi dan OTUj, a dan d adalah jumlah ciri berkode sama, p adalah jumlah total ciri

Contoh

Nilai Koefisien kesamaanOTU A & B = 3/5=0,6 A & C = 4/5=0,8 A & D = 2/5=0,4 B & C = 2/5=0,4 B & D = 2/5=0,4 C & D = 1/5= 0,2 Nilai Koefisien disusun ke dalam matriks

Matriks Nilai kesamaan

Clustering MethodsSingle Linkage Clustering Nilai koefisien kesamaan paling besar Complete Linkage Clustering Nilai koefisien kesamaan paling kecilAverage linkage Clustering rata-rata nilai koefisien kesamaan

Contoh Dendrogram