wirusowe zakażenia układu pokarmowego problemy związane z ... · mutacje punktowe są...
TRANSCRIPT
Anna Majewska
Katedra i Zakład Mikrobiologii Lekarskiej, WUM
2018
Wirusowe zakażenia układu pokarmowego
Problemy związane z grypą pochodzenia
zwierzęcego
Wirusy wnikające do organizmu drogą pokarmową mogą być przyczyną
chorób:
▪ zapalenie żołądka i jelit (gastroenteritis),
np. norowirusy, rotawirusy
▪ zapalenie wątroby (hepatitis),
wirus zapalenia wątroby typu A (HAV)
wirus zapalenia wątroby typu E (HEV),
▪ chorób różnych narządów, jeśli po replikacji w przewodzie pokarmowym
wirusy przedostają się do krwiobiegu i z krwią docierają do permisywnych
komórek.
Wirusowe zakażenia układu pokarmowego
W szerzeniu się zakażeń wirusowych czynnikiem ryzyka jest zawierająca
wirusy żywność i woda
▪ Do jej skażenia dochodzi najczęściej za sprawą siewców zatrudnionych
przy produkcji, dystrybucji żywności, a także podczas przygotowywania
posiłków do konsumpcji
Wirusy przenoszone są do różnych produktów żywności (pochodzenia
zwierzęcego i roślinnego)
▪ Przyczyną zakażeń są także produkty pierwotnie skażone patogennymi
wirusami: owoce morza,
choroba/zakażenie
zapalenie błony śluzowej
żołądka i jelit
zap. wątroby inne
Norowirus
Rotawirus
Adenowirus (40/41)
Sapowirus
Astrowirus
Koronawirus
HAV
HEV
Enterowirus
(wirus polio )
Epidemia
(z gr. epi: nawiedzający + demos: ludzi) – występowanie w określonym
czasie i na określonym terenie przypadków zachorowań w liczbie
większej niż oczekiwana
Epidemie o niewielkiej liczbie przypadków zachorowań ograniczone do
określonego obszaru i czasu określa się terminem ognisko epidemiczne
Epizootie - masowe zachorowania zwierząt, wywoływane przez
chorobotwórcze wirusy lub bakterie
Pandemia (gr. pan = 'wszyscy' + gr. demos = 'lud') – epidemia choroby
zakaźnej w różnych środowiskach, na dużym obszarze - różnych
kontynentach w tym samym czasie
▪ 60% gatunków drobnoustrojów wywołujących choroby zakaźne
ludzi pochodzi od zwierząt (rezerwuar, wektor)
▪ 75% nowych zakaźnych chorób człowieka (emerging diseases) to
choroby odzwierzęce, czyli zoonozy
7GRYPA
▪ sezonowa
▪ zoonotyczna (ptaków, świń) u ludzi
▪ Orthomyxoviridae
▪ coroczne zachorowania (grypa sezonowa)
▪ epidemie, pandemie
▪ wymierne skutki zdrowotne, społeczne i ekonomiczne
▪ profilaktyka nieswoista, swoista–szczepienia
▪ leczenie objawowe
▪ zanamiwir
▪ oseltamiwir
▪ peramiwir
Rodzina: Orthomyxoviridae (Ortomyksowirusy)
Gatunek: wirus grypy typu A (pandemiczny)
- ludzie, konie, świnie, norki, ssaki wodne
- wykazuje polimorfizm i zmienność antygenową
Gatunek: wirus grypy typu B
- ludzie
- łagodne epidemie
Gatunek: wirus grypy typu C
- ludzie i świnie, nie wywołuje epidemii
- zakażenia bezobjawowe (ograniczone do kataru i zapalenia spojówek)
Gatunek: wirus grypy typu D
- zachorowania u bydła, brak informacji o zachorowaniach wśród ludzi
2012 r. 1 460 037
2013 r. 3 164 405
2014 r. 3 137 056
2015 r. 3 843 438
2016 r. 4 316 823
2017 r. 5 043 543
Liczba zachorowań na grypę oraz podejrzenia grypy w Polsce w
latach 2012–2017 w populacji ogólnej
11
NA
otoczka
lipidowa
białko M
NA (1-9)
• odpowiada za wniknięcie wirusa
• uwalnianie wirionów potomnych z zakażonej komórki
• zwiększa ruchliwość wirusa w środowisku mucyny pokrywającej nabłonek
dróg oddechowych
wypustki glikoproteinowe – 80% z nich to hemaglutynina (HA), a 20% to
neuraminidaza (NA)
HA (1-16) - hemaglutynina jest antygenem powierzchniowym wirusa
▪ warunkuje chorobotwórczość
▪ rozpoznaje specyficzne receptory komórkowe
▪ związanie hemaglutyniny z kwasem sialowym na powierzchni komórki
dryf genetyczny (przesunięcie antygenowe)
- punktowe, spontaniczne mutacje w genomie
- drobne zmiany w segmentach kodujących antygeny powierzchniowe
(powszechne i częste)
- zachodzą podczas replikacji, powodują zmiany antygenowe wirusowych
glikoprotein - hemaglutyniny (H) i neuraminidazy (N)
Polimeraza RNA, zależna od RNA, jest enzymem dokonującym licznych pomyłek,
polegających na wstawianiu błędnych zasad podczas syntezy potomnych
łańcuchów RNA
Polimerazy RNA nie mają tzw. własności autokorektorskich i nie potrafią ich
usunąć.
Na czym polega zmienność wirusa grypy
SKUTKI
pojawiania się nowych wariantów antygenowych uprzednio występujących
podtypów
Mutacje punktowe są odpowiedzialne za:
- sezonowe epidemie lub epizootie,
- są przyczyną powstania wariantów mogących wywołać pandemię
wytworzenie przeciwciał przeciwko jednemu wariantowi nie chroni przed
zakażeniem nowo powstałym wariantem danego podtypu wirusa grypy
trudności w walce z wirusem grypy (coroczna konieczność zmiany
składu szczepionki przeciwgrypowej)
skok antygenowy (tzw. reasortacja, antigenic shift)
spowodowany rekombinacją, wymianą segmentów genomu między
różnymi wirusami grypy
Dochodzi do tego w sytuacji, gdy jedna komórka zostanie zainfekowana
przez dwa różniące się od siebie szczepy wirusa grypy w tym samym
czasie.
Wirusy grypy A krążą między różnymi gatunkami zwierząt i człowiekiem.
Bliskie kontakty ze zwierzętami, np: hodowla, sprzyjają reasortacji, w
wyniku czego powstaje nowy podtyp wirusa
Takie zmiany mają miejsce co kilka lub kilkadziesiąt lat
Na czym polega zmienność wirusa grypy
Równoczesne zakażenie komórki szczepem ludzkim i
ptasim może doprowadzić do powstania nowych
podtypów.
Powstający wirus posiada część segmentów
pochodzących z genomu od jednego szczepu, a część
od drugiego szczepu.
Najbardziej niebezpieczny mechanizm zmienności
zachodzi w przyrodzie co 20-50 lat. Reasortanty mają
wtedy ogromny potencjał pandemiczny, gdyż napotykają
na populację ludzi lub zwierząt, ze względu na brak
wcześniejszego kontaktu, w pełni na nie wrażliwych
Skok antygenowy
może dotyczyć każdego z ośmiu segmentów genomu wirusa. Potencjalnie może pojawić
się 256 różnych genetycznie szczepów potomnych.
▪ Wirusy grypy o różnych antygenach powierzchniowych od H1
do H 16 oraz od N1 do N9 występują u ptaków domowych i
ptaków dzikich
▪ Izolowano je od ptaków ozdobnych
▪ W populacjach ptaków wodnych odnotowano występowanie
wszystkich możliwych kombinacji antygenów H i N
▪ Podtypy patogenne dla jednego gatunku ptaków mogą być
niepatogenne dla innych gatunków
Grypa
zakaźna i zaraźliwa choroba występująca u ludzi i u zwierząt ze
zbliżonymi objawami klinicznymi
▪ wysoka gorączka,
▪ kaszel,
▪ duszność
▪ wyciek z oczu i nosa.
Cechami charakterystycznymi zakażenia są:
▪ charakter epidemiczny (zachorowalność wynosi zwykle 100%)
▪ duża zakaźność (choroba obejmuje w ciągu 1–2 dni całe stado/populację)
▪ stała mutacja wirusa
▪ poważne, pomimo relatywnie niskiej śmiertelności (ok. 1%), skutki ekonomiczne
Patogenność (czyli zdolność do wywoływania choroby)
wirusów grypy ptaków jest bardzo zróżnicowana
dzieli się je zasadniczo na dwie grupy:
▪ Wysoce patogenne wirusy (highly pathogenic avian influenza, HPAI)
▪ Nisko patogenne wirusy (low pathogenic avian influenza, LPAI)
WYSOCE ZJADLIWA GRYPA PTAKÓW (HPAI)
Powodują grypę ptaków o ciężkim przebiegu, ostra choroba ogólnoustrojowa,
ze śmiertelnością blisko 100% u ptaków grzebiących.
Objawy kliniczne grypy ptaków u drobiu:
▪ gwałtowny spadek/utrata produkcji jaj,
▪ miękkie skorupy jaj,
▪ objawy - ukł. nerwowy
▪ zasinienie i obrzęk grzebienia i dzwonków,
▪ silne łzawienie, obrzęk zatok podoczodołowych,
▪ kichanie, duszność, biegunka
▪ padnięcia ptaków - nagłe, bez widocznych objawów.
▪ śmiertelność - do 100%.
Najbardziej wrażliwe: indyki, kury.
Do tej grupy nalezą podtypy H5 (np. H5N1) i H7
Wirusy HPAI mogą się namnażać w całym organizmie gospodarza i uszkadzać
narządy ważne dla życia, co jest zwykle przyczyną śmierci.
Głównym źródłem zagrożenia dla zdrowia ludzi i zwierząt (drobiu) są dzikie
ptaki, będące bezobjawowymi nosicielami wirusa grypy ptaków.
Nisko patogenne wirusy (low pathogenic avian influenza, LPAI)
wywołują zwykle łagodną postać grypy ptaków z objawami ze strony
układu oddechowego i pokarmowego
Przy zakażeniu wirusem grypy o niskiej zjadliwości mogą wystąpić
objawy:
ze strony układu oddechowego (z reguły łagodne),
biegunka,
zmniejszona produkcja jaj u niosek.
NISKO ZJADLIWA GRYPA PTAKÓW (HPA)I
Ptaki wędrujące i dzikie ptactwo wodne
Uważane są za naturalny rezerwuar wszystkich wirusów grypy A
źródłem zakażenia drobiu domowego jest bezpośredni lub pośredni
kontakt z wędrującymi ptakami dzikimi, zwykle ptactwem wodnym
rozprzestrzenienie wirusa może następować poprzez:
▪ zanieczyszczoną paszę
▪ wodę
▪ nawóz
▪ sprzęt
▪ środki transportu.
▪ człowiek (zanieczyszczone ubranie, obuwie, sprzęt i produkty np. jaja)
może przyczynić się do rozprzestrzeniania choroby
H5N1
▪ wysoce patogenny wirus występował głównie u ptaków domowych
▪ zakażenia u ludzi w wyniku bliskiego kontaktu z ptakami
lub skontaminowanym środowiskiem
Zakażone ptaki wydalają duże ilości wirusa:
▪ w wydzielinie z oczu i dróg oddechowych
▪ z kałem
wirus grypy ptaków może zachowywać aktywność w środowisku kurnika przez 5
tygodni
WAŻNE!
▪ zabezpieczenie pomieszczeń, sprzętu, nawozu oraz dokładne ich
oczyszczenie i odkażenie.
▪ wirusy grypy są wrażliwe na powszechnie stosowane środki dezynfekcyjne
oraz detergenty.
▪ niszczy go obróbka termiczna (smażenie, gotowanie)
Potencjał zoonotyczny grypy ptaków
▪ W 1996 r. - podtyp H7N7, który u jednej osoby wywołał zapalenie spojówek
▪ W 1997 r. w Hong Kongu na skutek zakażenia od drobiu podtypem H5N1
zachorowało 18 osób, a zmarło 6
▪ W latach 1998-1999 na terenie Hong Kongu i Chin zakażeniu uległo kilka osób,
od których izolowano podtyp H9N2
▪ Pięć kolejnych zachorowań po zakażeniu wirusem H5N1 zanotowano w 2000 r.
w Chinach,
▪ dwa kolejne zachorowania i jeden przypadek śmiertelny miały miejsce w Hong
Kongu w 2003 r.; przyczyną był podtyp H5N1
H5N1
Zakażenia w 15 krajach w Azji, Afryce, Europie i na Bliskim Wschodzie.
Blisko 60% zakażonych zmarło
w 2011, 62 osoby zakażone H5N1
34 osoby zmarły (Bangladesz, Kambodża, Chiny, Egipt, Indonezja)
ponad 135 osób zakażonych A(H7N9) we Wschodnich Prowincjach Chin,
Zapalenie płuc, 30% zgony
Rezerwuar zoonotyczny (kury, kaczki, gołębie dzikie i hodowlane), próbki
środowiskowe
Sekwencjonowanie genomu wskazuje na to, że materiał genetyczny H7N9
pochodzi od 3 różnych szczepów o niskiej patogenności (low-pathogenic avian IAV)
A H7N9
20-letnia kobieta na Tajwanie została zakażona H6N1
▪ Rozprzestrzeniony u drobiu
▪ Nie patogenny dla człowieka
mutatcja G228S – pokonanie bariery gatunkowej
▪ Pacjentka została przyjęta do szpitala z charakterystycznymi obawami
grypy — m.in. zapaleniem płuc.
▪ Podano tamiflu (oseltamivir)
A H6N1
Osobom podróżującym w rejony, gdzie potwierdzono
przypadki zachorowań na grypę ptaków u ludzi,
w celu zmniejszenia ryzyka zakażenia zaleca się:
1. przestrzeganie zasad higieny osobistej, szczególnie mycie rąk przed spożywaniem
pokarmów, po wyjściu z toalety, po kichaniu itp.,
2. unikanie bliskiego kontaktu z osobami chorymi,
3. przestrzeganie higieny kaszlu i kichania, w tym, w czasie kaszlu lub kichania zakrycie
ust i nosa chusteczką oraz natychmiastowe wyrzucenie zużytej chusteczki
bezpośrednio po użyciu (gdy nie jest to możliwe należy kasłać lub kichać w zgięcie
łokcia)
4. unikanie kontaktu ze zwierzętami,
5. spożywanie tylko żywności poddanej właściwej obróbce termicznej (gotowanej,
pieczonej, duszonej, dobrze wysmażonej);
6. stosowanie się do zaleceń miejscowych służb sanitarnych oraz lekarzy.
▪ Zwykle wirusy grypy świń nie zakażają ludzi.
▪ Sporadyczne przypadki zakażeń, najczęściej na skutek bezpośredniego
kontaktu ze zwierzętami (np. dzieci bawiące się blisko zwierząt lub
pracownicy ferm).
▪ udokumentowane przypadki przeniesienia wirusów grypy świń bezpośrednio
z człowieka na człowieka.
Obecnie od świń izoluje się głównie szczepy H1N1, H1N2, H3N2 i H3N1
Świnie mogą zostać zakażone przez wirusy grypy ptaków, ludzi i świń.
Kiedy dojdzie do jednoczesnego zakażenia świni wirusami
pochodzącymi od różnych gatunków, może dojść do reasortacji, w
wyniku której powstanie nowy szczep wirusa.
Obserwacje prowadzone w gospodarstwach produkujących trzodę
chlewną wskazują, że zainfekowane świnie mogą zakażać personel
pracujący przy ich obsłudze
zdarza się to rzadko – jeden przypadek na 1–2 lata,
UWAGA! zakażony człowiek może być źródłem zakażenia dla świń.
Grypa świń
Grypa świń
▪ jest zakaźną chorobą układu oddechowego świń, wywoływaną
przez wirus grypy typu A
▪ pneumotropowy wirus grypy typu A (swine influenza virus– SIV)
▪ U świń wirusy te powodują liczne zachorowania, jednakże
śmiertelność na skutek zakażenia jest niska
▪ wirus grypy świń typu A/H1N1 został wyizolowany po raz pierwszy
u świń w 1930 roku
Pośrednim wskaźnikiem potwierdzającym dane o międzygatunkowych
zakażeniach wirusem grypy może być wykrycie obecności przeciwciał
swoistych dla wirusów grypy świń we krwi ludzi.
Uważa się, że około 20% osób mających kontakt ze świniami i członków rodzin
hodowców świń ma we krwi przeciwciała swoiste dla wirusa grypy świń.
Fakty te uzasadniają celowość monitorowania stad trzody chlewnej w celu
określenia wariantów antygenowych wirusa krążących aktualnie w tej populacji.
Grypa świń
Diagnostyka grypy
Materiał
▪wymaz z gardła, nosa, nosogardzieli
▪aspirat, popłuczyny z nosogardzieli
▪popłuczyny z nosa
▪popłuczyny z drzewa oskrzelowego
▪PMR
▪wysięk z ucha środkowego
Metody
▪szybkie testy chromatograficzne
▪RT-PCR
▪izolacja wirusa w hodowli komórkowej
Hemaglutynacja [Hirst 1941]
Stosowania do wykrywania wirusów
posiadających na swej otoczce
hemaglutyniny np. wirus grypy
Uwolnione wirusy w pożywce hodowlanej
+ krwinki czerwone = aglutynacja erytrocytów
konglomeraty erytrocytarnowirusowe
Dokładna identyfikacja wirusa namnożonego w hodowli
komórkowej wymaga zastosowania
dodatkowych technik diagnostycznych