TRABAJO FIN DE GRADO BIBLIOGRÁFICO (MICROBIOLOGÍA)

Título: Biofertilizantes microbianos que proporcionan macro nutrientes a las plantas y su aplicación en una agricultura más sostenible.

Tutor: Ana Buendía Clavería

La vida de las plantas está condicionada por la existencia de muchos microorganismos que viven asociados con ellas. Estos microorganismos de la rizosfera participan en la nutrición y en la salud de las plantas.

Bibliografía relacionada con este trabajo:

Gage, DJ. Infection and invasion of roots by symbiotic,nitrogen-fixing rhizobia during nodulation of temperate legumes. 2004. Microbiol Mol Biol Rev 68: 280-300. Giles E.D., Oldroyd, J, Murray, D, Poole, P. and Allan Downie. The Rules of Engagement in the Legume-Rhizobial Symbiosis. 2011. Annu. Rev. Genet. 45:119–44. Graham, P.H. and Vance, C.P. 2000. Nitrogen fixation in perspective: An overview of research and extension needs. Field Crops Research 65: 93–106.

Kereszt, A. , Mergaert, P and Kondorosi, E. Bacteroid Development in Legume Nodules: Evolution of mutual Benefit or of Sacrificial Victims? 2011. MPMI Vol. 24, No.11: 1300–1309 Microorganisms in Soils: Roles in Genesis and Functions. 2005. Buscot, F. and Varma, A. (eds.) Springer-Verlag. Berlin, Germany.

Rodríguez, H., Fraga, R., González, T. & Bashan, Y. (2006). Genetics of phosphate solubilization and its potential applications for improving plant growth-promoting bacteria. Plant and Soil 287: 15-21

Subba Rao, N.S. (ed.). Soil Microbiology. 1999. Science Publisher. Inc. Enfield (NH), USA.

TRABAJO FIN DE GRADO BIBLIOGRÁFICO (MICROBIOLOGÍA)

Título: Los sistemas de células inmovilizadas en la industria Tutora: Mª Cristina Limón Mortés Descripción

En este Trabajo de Fin de Grado se deberá hacer una revisión de los sistemas de células inmovilizadas que se utilizan en la industria, así como de los soportes que se emplean y los criterios que se aplican para su selección. Además, se deberá analizar cuáles son las ventajas y las limitaciones de la inmovilización y los posibles efectos sobre la célula. Por último, además de las aplicaciones ya conocidas, se hará un estudio acerca de las posibles utilidades de estos sistemas.

Bibliografía introductoria

- Junter GA, Jouenne T (2004) Immobilized viable microbial cells: from the process to the proteome em leader or the cart before the horse. Biotechnol Adv. 22(8): 633-58

- Brányik T, Vicente AA, Dostálek P, Teixeira JA (2005) Continuous beer fermentation using immobilized yeast cell bioreactor systems. Biotechnol Prog. 21(3): 653-63

- Coradin T, Boissière M, Livage J (2006) Sol-gel chemistry in medicinal science. Curr Med Chem. 13(1):99-108

- Verbelen PJ, De Schutter DP, Delvaux F, Verstrepen KJ, Delvaux FR (2006) Inmobilized yeast cell systems for continuous fermentation applications. Biotechnol Lett. 28(19): 1515-25

- Singh OV, Kumar R (2007) Biotechnological production of gluconic acid: future implications. Appl Microbiol Biotechnol. 75(4): 713-22

- Bai FW, Anderson WA, Moo-Young M (2008) Ethanol fermentation technologies from sugar and starch feedstocks. Biotechnol Adv. 26(1): 89-105

- Desimone MF, Alvarez GS, Foglia ML, Diaz LE (2009) Development of sol-gel hybrid materials for whole cell immobilization. Recent Pat Biotechnol. 3(1): 55-60

- Rodríguez Couto S (2009) Dye removal by immobilized fungi. Biotechnol Adv. 27(3): 227-35

- Dagher SF, Ragout AL, Siñeriz F, Bruno-Bárcena JM (2010) Cell immobilization for production of lactic acid biofilms do it naturally. Adv Appl Microbiol. 71: 113-48

- Rooke JC, Léonard A, Meunier CF, Su BL (2011) Designing photobioreactors based on living cells immobilized in silica gel for carbon dioxide mitigation. ChemSusChem. 4(9): 1249-57

- Michelini E, Roda A (2012) Staying alive: new perspectives on cell immobilization for biosensig purposes. Anal Bioanal Chem. 402(5): 1785-97

TRABAJO FIN DE GRADO EXPERIMENTAL (MICROBIOLOGÍA) Título: Estudio del papel en la simbiosis con las leguminosas de las proteínas efectoras secretadas a través del sistema de secreción de tipo III (T3SS) de Sinorhizobium fredii HH103. Tutor: Francisco Javier López Baena. Descripción

El trabajo de nuestro grupo de investigación se centra en el estudio de diferentes señales moleculares implicadas en el desarrollo efectivo de la simbiosis entre la estirpe de alto rango de hospedador Ensifer (Sinorhizobium) fredii HH103 y sus leguminosas hospedadoras. Entre estas señales se encuentran las proteínas secretadas a través del sistema de secreción de tipo III. El alumno podrá participar en la obtención de mutantes en genes que codifican estas proteínas efectoras y/o en la regulación de su expresión, en su caracterización funcional o la determinación del fenotipo simbiótico de diferentes mutantes con leguminosas hospedadoras de interés agronómico como la soja. El alumno podrá adquirir experiencia en técnicas básicas de Microbiología y Biología Molecular, así como en el manejo de bibliografía científica en inglés. Bibliografía:

Margaret I, Becker A, Blom J, Bonilla I, Goesmann A, Göttfert M, Lloret J, Mittard-Runte V, Rückert C, Ruiz-Sainz JE, Vinardell JM, Weidner S. 2011. Symbiotic properties and first analyses of the genomic sequence of the fast growing model strain Sinorhizobium fredii HH103 nodulating soybean. J Biotechnol. 155: 11-19.

Downie JA. 2010. The roles of extracellular proteins, polysaccharides and signals in

the interactions of rhizobia with legume roots. FEMS Microbiol. Rev. 34: 150-170. Deakin WJ, Broughton WJ. 2009. Symbiotic use of pathogenic strategies: rhizobial

protein secretion systems. Nat. Rev. Microbiol. 7: 312-320. López-Baena FJ, Monreal JA, Pérez-Montaño F, Guasch-Vidal B, Bellogín RA,

Vinardell JM, Ollero FJ. 2009. The absence of Nops secretion in Sinorhizobium fredii HH103 increases GmPR1 expression in Williams soybean. Mol. Plant Microbe Interact. 22: 1445-1454.

López-Baena FJ, Vinardell JM, Pérez-Montaño F, Crespo-Rivas JC, Bellogín RA,

Espuny Mdel R, Ollero FJ. 2008. Regulation and symbiotic significance of nodulation outer proteins secretion in Sinorhizobium fredii HH103. Microbiology 154: 1825-1836.

Rodrigues JA, López-Baena FJ, Ollero FJ, Vinardell JM, Espuny Mdel R, Bellogín

RA, Ruiz-Sainz JE, Thomas JR, Sumpton D, Ault J, Thomas-Oates J. 2007. J. Proteome Res. 6: 1029-1037.

de Lyra Mdo C, Lopez-Baena FJ, Madinabeitia N, Vinardell JM, Espuny Mdel R,

Cubo MT, Belloguin RA, Ruiz-Sainz JE, Ollero FJ. 2006. Inactivation of the Sinorhizobium fredii HH103 rhcJ gene abolishes nodulation outer proteins (Nops) secretion and decreases the symbiotic capacity with soybean. Int. Microbiol. 9: 125-133.

TRABAJO FIN DE GRADO EXPERIMENTAL EN EMPRESA (MICROBIOLOGÍA) Título: Búsqueda y aislamiento de microorganismos eficientes para su uso como agentes de biocontrol. Tutor Universidad: Francisco Javier Ollero Márquez Empresa: ResBioAgro SL. Director de I+D: Hamid Manyani Charroudi Descripción La agricultura intensiva y de alta productividad ha permitido cumplir parcialmente con el objetivo de alimentar a la población mundial. Sin embargo, el coste ha sido muy alto tanto desde un punto de vista económico como medioambiental. El elevado consumo de agroquímicos junto con un laboreo intensivo dirigido a mejorar la producción a corto plazo, ha producido un fuerte deterioro de los suelos, que pierden su biodiversidad y estructura hasta hacerlos poco productivos. Por ello, la agricultura actual tiende a ser más respetuosa con el medio ambiente, disminuyendo el uso de fertilizantes, pesticidas y desarrollando técnicas que permiten la conservación de los suelos Nuestro Empresa desarrolla productos a base de microorganismos destinados a la agricultura. Para ello, parte de nuestra investigación se centra en la búsqueda de nuevos microorganismos rizosféricos que promuevan el crecimiento vegetal (PGPR). Uno de los campos de interés para la empresa ResBioAgro SL. es el biocontrol de enfermedades y de plagas. En este sentido la empresa tiene abierta una linea de investigación destinada a la búsqueda, aislamiento y caracterización de microorganismos con capacidad de biocontrol. El alumno participará en el procesamientos de muestras de suelo que potencialmente puedan tener microorganismos con capacidad bionestecida, fungicida, entre otras. El alumno adquirirá experiencia en técnicas de Microbiología, Biología Molecular y Bioinformática y sobre todo la expreriencia de trabajar en una empresa biotecnológica pudiendo ver como a partir una idea plasmada en un proyecto I+D puede cristalizar en un producto útil para la empresa, para el agricultor y para el medio ambiente. Bibliografía: Armengol G, Escobar M, Maldonado M, Ordúz S. (2007). Diversity of Colombian strains of Bacillus thuringiensis with insecticidal activity against dipteran and lepidopteran insects. J. Appl. Microbiol., 102: 77-88. Barboza-Corona J, Reyes-Ríos D, Salcedo-Hernández R, Bideshi D. (2008). Molecular and Biochemical Characterization of an Endochitinase (ChiA-HD73) from Bacillus thuringiensis subsp. kurstaki HD-73. Mol. Biotechnol., 39: 29-37. Martins E, Aguiar R, Martins N, Melatti V, Falcão R, Gomes A, et al. (2008). Recombinant Cry1Ia protein is highly toxic to cotton boll weevil (Anthonomus grandis Boheman) and fall armyworm (Spodoptera frugiperda). J. Appl. Microbiol., 104: 1363-1371. Salehi Jouzani G, Pourjan Abad A, Seifinejad A, Marzban R, Kariman K, Maleki B. (2008). Distribution and diversity of dipteranspecific cry and cyt genes in native Bacillus thuringiensis strains obtained from different ecosystems of Iran. J. Ind. Microbiol. Biotechnol., 35: 83-94. Sauka D, Amadio A, Zandomeni R, Benintende G. (2007). Strategy for amplification and sequencing of insecticidal cry1A genes from Bacillus thuringiensis. Antonie van Leeuwenhoek, 91: 423-430.

TRABAJO FIN DE GRADO EXPERIMENTAL (MICROBIOLOGÍA) Título: Estudio de genes de Sinorhizobium fredii HH103 implicados en la producción de polisacáridos superficiales. Tutor: José María Vinardell González Descripción Nuestro grupo trabaja en la interacción simbiótica fijadora de nitrógeno que se establece entre la bacteria Sinorhizobium fredii HH103 y diversas leguminosas, entre las que destaca la soja. Los polisacáridos superficiales bacterianos (como los lipopolisacáridos, LPS, o los exopolisacáridos, EPS) desempeñan diversas funciones importantes para la bacteria en vida libre y para un correcto desarrollo de la simbiosis. El alumno participará en la obtención de mutantes rizobianos afectados en la producción de algún polisacárido superficial y/o en la caracterización fisiológica (como formación de biopelículas, estudios de expresión génica, etc) y simbiótica (eficiencia de la interacción con diversas leguminosas hospedadoras de S. fredii) de dichos mutantes. La secuencia del genomio de esta bacteria se está completando en este momento, lo que facilitará el diseño de las estrategias de mutagénesis. El alumno adquirirá experiencia en técnicas de microbiología, biología molecular y bioinformática., así como en el manejo de bibliografía en inglés. Bibliografía:

Crespo-Rivas J.C., Margaret I., Hidalgo A., Buendía-Clavería A.M., Ollero F.J., López-Baena F.J., Murdoch P.S., Rodríguez-Carvajal M.A., Soria-Díaz M.E., Reguera M., Lloret J., Sumpton D.P., Mosely J.A., Thomas-Oates J.E., van Brussel A.A.N., Gil-Serrano A., Vinardell J.M., Ruiz-Sainz J.E. 2009. Sinorhizobium fredii HH103 cgs mutants are unable to nodulate determinate- and indeterminate nodule-forming legumes and overproduce an altered EPS, Mol. Plant-Microbe Interact. 22:575–588.

Downie, J.A. 2010. The roles of extracellular proteins, polysaccharides and signals in the interactions of rhizobia with legume roots. FEMS Microbiol. Rev. 34:150-170.

Hidalgo, A., Margaret, I., Crespo-Rivas, J. M., Parada, M., Murdoch, P. S., López, A., Buendía-Clavería, A. M., Moreno, J., Albareda, M., Gil-Serrano,

A. M., Rodríguez-Carvajal, M. A., Palacios, J. M., Ruiz-Sainz, J. E., and Vinardell, J. M. 2010. The rkpU gene of Sinorhizobium fredii HH103 is required for bacterial K-antigen polysaccharide production and for efficient nodulation with soybean but not with cowpea. Microbiology 156:3398-3411.

Margaret I, Becker A, Blom J, Bonilla I, Goesmann A, Göttfert M, Lloret J, Mittard-Runte V, Rückert C, Ruiz-Sainz JE, Vinardell JM, Weidner S. 2011. Symbiotic properties and first analyses of the genomic sequence of the fast growing model strain Sinorhizobium fredii HH103 nodulating soybean. J Biotechnol. 155:11-19.

Margaret I., Crespo-Rivas J.C., Acosta-Jurado S., Buendia-Claveria A.M., Cubo M.T., Gil-Serrano A., Moreno J., Dr. Murdoch P.S., Rodriguez-Carvajal M.A., Rodríguez-Navarro D.N., Ruiz-Sainz J.E., Sanjuan J., Soto M.J., Vinardell J.M. 2012. Sinorhizobium fredii HH103 rkp-3 genes are required for KPS biosynthesis, affect LPS structure and are essential for infection of legumes forming determinate nodules. Mol Plant-Microbe Interact. 25:825-838.

TRABAJO FIN DE GRADO EXPERIMENTAL (MICROBIOLOGÍA) Título: Estudio de genes de Sinorhizobium fredii HH103 que pudieran estar implicados en la captación de hierro. Tutor: José Enrique Ruiz Sainz. El grupo PAI AGR162, del que soy investigador responsable, trabaja en la simbiosis fijadora de nitrógeno que la bacteria Sinorhizobium fredii HH103 establece con Glycine max (soja) y otras leguminosas herbáceas, arbustivas y arbóreas. Como resultado de la secuenciación del genomio completo de esta bacteria, se han localizado una serie de genes que pudieran estar implicados en la toma de hierro. El alumno participará en la obtención de mutantes de S. fredii HH103 afectados en alguno de estos genes y/o investigará si las mutaciones obtenidas provocan algún impacto en la capacidad simbiótica de la bacteria con plantas de soja crecidas con y sin deficiencia de hierro. El alumno adquirirá experiencia en técnicas de microbiología, biología molecular, en el cultivo de plantas en cámaras iluminadas y en la inducción de deficiencias de hierro en plantas de soja. Bibliografía relacionada con este proyecto: Downie, J.A. 2010. The roles of extracellular proteins, polysaccharides and signals in the interactions of rhizobia with legume roots. FEMS Microbiol. Rev. 34:150-170. Hidalgo, A., Margaret, I., Crespo-Rivas, J. M., Parada, M., Murdoch, P. S., López, A., Buendía-Clavería, A. M., Moreno, J., Albareda, M., Gil-Serrano, A. M., Rodríguez-Carvajal, M. A., Palacios, J. M., Ruiz-Sainz, J. E., and Vinardell, J. M. 2010. The rkpU gene of Sinorhizobium fredii HH103 is required for bacterial K-antigen polysaccharide production and for efficient nodulation with soybean but not with cowpea. Microbiology 156:3398-3411. Margaret I, Becker A, Blom J, Bonilla I, Goesmann A, Göttfert M, Lloret J, Mittard-Runte V, Rückert C, Ruiz-Sainz JE, Vinardell JM, Weidner S. 2011. Symbiotic properties and first analyses of the genomic sequence of the fast growing model strain Sinorhizobium fredii HH103 nodulating soybean. Journal of Biotechnology 155:11-19. Margaret I., Crespo-Rivas J.C., Acosta-Jurado S., Buendia-Claveria A.M., Cubo M.T., Gil-Serrano A., Moreno J., Dr. Murdoch P.S., Rodriguez-Carvajal M.A., Rodríguez-Navarro D.N., Ruiz-Sainz J.E., Sanjuan J., Soto M.J., Vinardell J.M. 2012. Sinorhizobium fredii HH103 rkp-3 genes are required for KPS biosynthesis, affect LPS structure and are essential for infection of legumes forming determinate nodules. Molecular Plant-Microbe Interacttions 25:825-838. Rodríguez-Navarro, D.N., Margaret Oliver, I., Albareda Contreras, M., and Ruiz-Sainz, J.E. 2010. Soybean interactions with soil microbes, agronomical and molecular aspects. Agronomy for Sustainable Development. (DOI 10.1051/agro/2010023). Weidner, S., Becker, A., Bonilla, I., Jaenicke, S., Lloret, J., Margaret, I., Pühler, A., Ruiz-Sainz, J.E., Schneiker-Bekel, S., Szczepanowski1, R., Vinardell, J.M., Zehner, S. and Michael Göttfert. 2012. Genome Sequence of the Soybean Symbiont Sinorhizobium fredii HH103. Journal of Bacteriology, 194:1617-1618 (2012).

TRABAJO FIN DE GRADO BIBLIOGRÁFICO (MICROBIOLOGÍA) Título: El microbioma humano en la salud y la enfermedad. Tutor: María Dolores Tortolero García. Descripción El alumno debe hacer una revisión de la microbiota que reside en las superficies internas y externas del cuerpo humano. Especialmente en la piel y en la mucosa intestinal. Deberá abordar qué microorganismos conforman nuestra microbiota, qué hacen, cuál es nuestra respuesta, cómo se mantiene el equilibrio entre las distintas especies y qué consecuencias tiene la alteración de dicho equilibrio. Se centrará en el papel de nuestra microbiota en la obesidad, la diabetes, la enfermedad inflamatoria del intestino y otras enfermedades inflamatorias. Bibliografía preliminar: - Fredrik Bäckhed, Ruth E. Ley, Justin L. Sonnenburg, Daniel A. Peterson, Jeffrey I. Gordon (2005) Host-Bacterial Mutualism in the Human Intestine. Science, 307, 1915- 1920. - Peter J. Turnbaugh, Ruth E. Ley, Micah Hamady, Claire M. Fraser-Liggett, Rob Knight & Jeffrey I. Gordon (2007) The Human Microbiome Project. Nature, 449: 804-810. - Elizabeth A. Grice et al. Topographical and Temporal Diversity of the Human Skin Microbiome (2009) Science 324:1190-1192. - Peter J. Turnbaugh, Vanessa K. Ridaura, Jeremiah J. Faith, Federico E. Rey, Rob Knight, and Jeffrey I. Gordon. The Effect of Diet on the Human Gut Microbiome: A Metagenomic Analysis in Humanized Gnotobiotic Mice (2009) Sci Transl Med. 1: 1-19. - Peter J. Turnbaugh, et al. A core gut microbiome in obese and lean twins (2009) Nature, 457: 480-485. - Martin J. Blaser and Stanley Falkow. What are the consequences of the disappearing human microbiota (2009) Nature Reviews Microbiology 7: 887-894. -Baoli Zhu, Xin Wang, Lanjuan Li . Human gut microbiome: the second genome of human body (2010) Protein Cell, 1: 718–725 -The NIH HMP Working Group. The NIH Human Microbiome Project. Genome Research (2009) Published by Cold Spring Harbor Laboratory Press, pp 2317-2323. -Kevin J. Maloy & Fiona Powrie. Intestinal homeostasis and its breakdown in inflammatory bowel disease (2011) Nature, 474: 298-306. -Jacques Amar, et al. Intestinal mucosal adherence and translocation of commensal bacteria at the early onset of type 2 diabetes: molecular mechanisms and probiotic treatment (2011) EMBO Mol Med, 3, 559–572. -Manimozhiyan Arumugam et al. Enterotypes of the human gut microbiome (2011) Nature, 473: 174-180. - Elizabeth A. Grice and Julia A. Segre. The skin microbiome (2011)Nature Reviews Microbiology 9: 244-253. - Aymé Spor, Omry Koren and Ruth Ley. Unravelling the effects of the environment and host genotype on the gut microbiome (2011) Nature Reviews Microbiology, 9: 279-290. - Benjamin P. Willing, Shannon L. Russell and B. Brett Finlay. Shifting the balance: antibiotic effects on host–microbiota mutualism (2011) Nature Reviews Microbiology, 9: 233-243. - Michael A. McGuckin, Sara K. Lindén, Philip Sutton and Timothy H. Florin. Mucin dynamics and enteric pathogens (2011) Nature Reviews Microbiology, 9: 265-278. - Ellen F. Foxman and Akiko Iwasaki. Genome–virome interactions: examining the role of common viral infections in complex disease (2011) Nature Reviews Microbiology 9: 254-264. - Sharon Greenblum, Peter J. Turnbaughb, and Elhanan Borenstein. Metagenomic systems biology of the human gutmicrobiome reveals topological shifts associated with obesity and inflammatory bowel disease (2012) PNAS, 109: 594–599.

TRABAJO FIN DE GRADO BIBLIOGRÁFICO (MICROBIOLOGÍA) Título : El Citoesqueleto y su evolución. Tutor: Purificación Calvo Ruiz. Descripción: El alumno hará un estudio de la función del citoesqueleto, centrándose principalmente en el citoesqueleto de procariotas. Analizará los procesos celulares en los que está implicado: morfología celular, división, segregación de DNA, movilidad por deslizamiento etc. Hará un estudio comparativo de las proteínas homólogas y no homologas de procariotas y eucariotas y un análisis crítico de la evolución del citoesqueleto en los tres Dominios Bacteria, Archaea y Eukarya. Bibliografía preliminar: - Kenn Gerdes, Jakob Moller-Jensen, Gitte Ebersbach, Thomas Kruse and Kurt Nordström. (2004). Bacterial Mitotic Machineries. Cell, 116:359-366 - Yu- Ling Shih and Lawrence Rothfield. (2006). The Bacterial Cytoskeleton. Microbiol. Mol. Biol. Rev, 70 : 729-754. - Natalie A. Dye and Lucy Shapiro. (2007).The push and pull of the bacterial cytoskeleton. Trends Cell Biol, 17: 239-245. - Peter L. Graumann.(2007). Cytoskeletal Elements in Bacteria. Annu.Rev Microbiol,61: 589-618 - Joe Pogliano (2008). The bacterial cytoskeleton. Curr Opin Cell Biol, 20: 19-27. - Daniel A. Fletcher and Dyche Mullins. (2010). Cell mechanics and the cytoskeleton. Nature, 463: 485-492. - Harold P. Erickson, David E. Anderson and Masaki Osawa. (2010). FTsZ in Bacterial Cytokinesis: Cytoskeleton and Force Generator All in One. Microbiol Mol Biol Rev, 74:504-528. -Juliane Kühn, Ariane Briegel, Erhard Mörschel, Jörg Kahnt, Katja Leser, Stephanie Wick, Grant J Jensen and Martin Thanbichler. (2010). Bactofilins, a ubiquitous class of cytoskeletal proteins mediating polar localization of a cell wall synthase in Caulobacter crescentus. EMBO J. 29: 327-339. -Matthew T. Cabeen and Christine Jacobs-Wagner. (2010). The Bacterial Cytoskeleton. Annu. Rev. Genet. 44: 365-392. - Michael Ingerson-Mahar, Ariane Briegel, John N. Werner, Grant J. Jensen and Zemer Gitai. (2010). The metabolic enzyme CTP synthase forms cytoskeletal filaments. Nature Cell Biology, 12: 739-746. - Antonio J. Martin-Galiano, María A. Oliva, Laura Sanz , Anamitra Bhattacharyya, Marina Serna, Hugo Yebenes, José M. Valpuesta and José M Andreu. (2011). Bacterial Tubulin Distinct Loop Sequences and Primitive Assembly Properties Support Ist Origin from a Eukaryotic Tubulin Ancestor. J. Biol Chem 286: 19789-19803. - Beiyan Nan and David R. Zusman. (2011). Uncovering the Mystery of Gliding Motility In the Myxobacteria. Annu.Rev. Genet. 45: 21-39. - Bill Wickstead and Keith Gull. (2011). The evolution of the cytoskeleton. J. Cell. Biol. 194:513-525. - Hongyuan Jiang, Fangwei Si, William Margolin and Sean X. Sun. (2011). Mechanical Control of Bacterial Cell Shape. Biophysical J. 101: 327-335.

- Rachael M Barry and Zemer Gitai. (2011). Self-assembling enzymes and the origins of the cytoskeleton. Curr. Opin. Microbiol. 14: 704-711. - Sean X. Sun and Hongyuan Jiang. (2011). Physics of Bacterial Morphogenesis. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 75: 543-565. - Sven van Teeffelen and Zemer Gitai. (2011). Rotate into shape: MreB and bacterial morphogenesis. EMBO J. 30: 4856-4857. - An-Chun Chien, Norbert S. Hill and Petra Anne Levin. ( 2012). Cell Size Control in Bacteria. Curr. Biol. 22:R340- R349. - Athanasios Typas, Manuel Banzhaf. Carol A. Gross and Waldemar Vollmer. (2012) From the regulation of peptidoglycan synthesis to bacterial growth and morphology. Nature Reviews Microbiology 10: 123-136 - Courtney L. White and James W. Gober ( 2012). Mreb: pilot or passenger of cell wall synthesis? Trends Microbiol. 20:74-79. - Michael Ingerson- Mahar and Zemer Gitai ( 2012). A growing family: the expanding universe of the bacterial cytoskeleton. FEMS Microbiology Reviews 36: 256-267. - Michal Letek, María Fiuza, Almudena F. Villadangos, Luís M. Mateos and José A. Gil. ((2012). Cytoskeletal Proteins of Actinobacteria. International Journal of Cell Biology 2012 : 1-10. - Lei Yan, Shuang Zhang, Peng Chen, Hetao Liu, Huanhuan Yin and Tong liu.(2012). Magnetotactic bacteria, magnetosomes and their application. Microbiological Research ( in press). -Wanderley de Souza (2012) Prokaryotic cells: structural organization of the cytoskeleton and organelles. Memorias Instituto Oswaldo Cruz 107: 283-293.

TRABAJO FIN DE GRADO BIBLIOGRÁFICO (MICROBIOLOGÍA) Título: “Quorum sensing” en bacterias. Tutor: Ramón A. Bellogín Izquierdo. Descripción: El alumno debe hacer una revisión sobre este mecanismo de comunicación entre bacterias dependiente de la densidad celular y que, en los diferentes sistemas descritos hasta ahora, está mediado por moléculas de diferente naturaleza. Bibliografía preliminar: Boyer, M and Wisniewski-Dy, F. (2009): Cell-cell signalling in bacteria: not simply a matter of quorum. FEMS Microbiology Ecology 70: 1–19. Brelles-Mariño, G. and, Bedmar, E.J. (2001): Detection, purification and characterisation of quorum-sensing signal molecules in plant-associated bacteria. Journal of Biotechnology, 91: 197–209. Heeb, S., Fletcher, M.P., Chhabra, S.R., Diggle, S.P., Williams, P. and Cámara, M. (2011): Quinolones: from antibiotics to autoinducers. FEMS Microbiology Reviews, 35: 247–274 Holden, M.T.G., Diggle, S.P. and Williams, P. (2007): Quorum Sensing. Encyclopedia of Life Sciences, John Wiley & Sons, Ltd. Hughes, D.T. and Sperandio, V. (2008): Inter-kingdom signalling: communication between bacteria and their hosts. Nature Reviews Microbiology, 6: 111-120. Schertzer, J.W., Boulette, M.L. and Whiteley, M. (2009): More than a signal: non-signaling properties of quorum sensing molecules. Trends in Microbiology, 17: 189-195. Shank, E.A. and Kolter, R. (2009): New developments in microbial interspecies signalling. Current Opinion in Microbiology, 12 :205–214. Steindler, L. and Venturi, V. (2007): Detection of quorum-sensing N -acyl homoserine lactone signal molecules by bacterial biosensors. FEMS Microbiology Letters, 266: 1–9. Williams, P. (2007): Quorum sensing, communication and cross-kingdom signalling in the bacterial world. Microbiology, 153: 3923–3938. Williams, P. and Cámara, M (2009):Quorum sensing and environmental adaptation in Pseudomonas aeruginosa: a tale of regulatory networks and multifunctional signal molecules. Current Opinion in Microbiology, 12:182–191.

TRABAJO FIN DE GRADO BIBLIOGRÁFICO (MICROBIOLOGÍA) Título: Utilización de los bacteriófagos en la investigación de enfermedades infecciosas, aparición de nuevos virus. Tutor: Mª Teresa Cubo Sánchez Descripción El alumno debe hacer una revisión sobre los distintos aspectos que actualmente se están realizando con los bacteriófagos en el desarrollo tanto de nuevas técnicas de Biología Molecular como de técnicas encaminadas al tratamiento de enfermedades. Por ejemplo, uso de fagos para la identificación de distintos tipos de bacterias. El uso de fagos o sus productos (phage therapy) como bioagentes para el tratamiento o profilaxis de enfermedades infecciosas producidas por bacterias. Producción de anticuerpos monoclonales mediante la tecnología Phage-Display, etc. Bibliografía preliminar

Brekke, O.H. and Sandlie, I. 2003. Therapeutic antibodies for human diseases at the dawn of the twenty-first century. Nature rev. drugdisc, 2: 52- 62.

Broyles, J. M.; O’Connell, K. P. and D. M. Korniewicz. 2002. A PCR-based method for detecting viral penetration of medical exam gloves. J. Clin. Microbiol. 40:2725–2728.

Cardinale, D.; Carette N. and Thierry Michon, 2012. Virus scaffolds as enzyme nano-carriers. Trends Biotechnol. May 2. http://dx.doi.org/10.1016/j.tibtech.2012.04.001.

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Dourado, A.C.; Alves, P.I.L.; Tenreiro, T.; Ferreira, E.M.; Tenreiro, R.; Fareleira, P. and Barreto Crespo, M.T. 2009. Identification of Sinorhizobium (Ensifer) medicae based on a specific genomic sequence unveiled by M13-PCR fingerprinting. Interna. Microbiol. 12:215-225.

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