Strama- och Svebardag 2019

Sammanställningar från Svebar –aktuellt och fortsatt planering

Barbro MäkitaloHanna BillströmOlle AspevallTomas Söderblom

.Sid

Agenda

• Utveckling av Svebar och rapporter

• Utmaningar vid sammanställning av data

• Rapporter– Blodrapport 2018 –

o Visualiserade data.

– Swedres-Svarm

– Nämnardata

– Urinrapporter

o Beskriva innehåll, hur de utvecklas. Val av provmaterial. Ålder- o könsfördelning –

hur?

– Särskilda sammanställningar från ’rutinuttag’

• Ny funktion för datauttag i Svebar

• Diskussion, vidare utveckling av rapporter

2019-11-262

.Sid

Svebar, utvecklingsarbete

– Anslutning av de kvarvarande laboratorierna.

– Valideringar vid anslutning av laboratorier.

– Byte till Linux-server och uppgradering av Svebar.

– Planering, specifikation Svebar 2.0 ???

• Rapporter– Rutinrapporter, blod, urin, sårsekret, luftvägar

o Noggrann validering tillsammans med lab av de första rapporterna för en provtyp,

ex blod, enklare process för liknande rapporter, ex annan art inom samma provtyp.

– Visualiserade data – anpassningar.

– Särskilda sammanställningar (oftast för behandlingsrekommendationer)

o Enklare att göra subanalyser från redan validerade dataset, t ex ålders- eller

könsfördelning, ytterligare antibiotikum.

– Sammanställningar för utveckling och diskussion

o HI och pnk

o KNS

o Andra av intresse?

3 2019-11-26

.Sid

Utmaningar vid sammanställning, ex

• Antal blododlingar – en flaska/två flaskor/fyra flaskor. - nämnardata

• Olika ab läggs vid olika lab. Svarsrutiner – ibland flera namn (iv, po, 4h etc) för ’samma’ antibiotika. -> synonymisering leder till flera resultat per ab.

• Ej enhetliga provmaterial, analystyper – kompromiss. Svårigheter vid validering pga den synonymisering som gjorts.

• ATU – ny utmaning. S/I/R +ATU. ATU kan för närvarande inte lagras som tolkning i Svebar mm-zon.

• Speciellt anpassade utsökningar per lab fungerar inte i längden.

• Det här ger också ett problem vid validering – motsvarar laboratoriets datauttag det som har gjorts i Svebar?

2019-11-264

Rapporter från Svebar

5

.Sid

Var hittar jag publicerade rapporter från Svebar?

2019-11-266

https://www.folkhalsomyndigheten.se/svebar

https://www.folkhalsomyndigheten.se/svebar

.Sid

• PDF• Excel

• Inom kort även 2018

.Sid

Blodrapporter från Svebar

8

Nationell rapport Laboratoriets rapport

Att tänka på:• I nationell rapport, del 4, presenteras resultat om minst 5 laboratorier har AST av antibiotika enligt

90%-regeln.• Laboratoriets rapport kan följaktligen innehålla resultat från fler testade antibiotika (om 90%-regeln

är uppfylld).

.Sid

Förändringar av blodrapporten

9 2019-11-26

Ny tabell 2 Antal odlingar

Ny tabell 4 Artfördelning

• Både nationell och lokal rapport• Möjlighet att använda de delar av data som fungerar = ökad användning av resistensdata• Öka tydligheten vilken data som ingår

.Sid

Användbarheten av data i Svebarrapporterna

• Aktiviteter på Folkhälsomyndigheten1. Olika rutinrapporter.

2. Bildpaket direkt i PDF/PPT

3. Omorganisering av Excelfiler för att öka användbarheten

4. FolkhälsoData/FolkhälsoStudio – Öppen sökbar data som kan visualiseras

• Alla pågående.

• Behöver vägas mot andra aktiviteter

10

.Sid

Öppen sökbar data som kan visualiseras

2019-11-2611

.Sid 2019-11-2612

.Sid 2019-11-2613

.Sid

FolkhälsoStudio

2019-11-2614

Både nationell och laboratoriedata – ej fullständiga 5 år (resistensdata)Endast nationell data artfördelning, antal positiva/negativa odlingar

.Sid 2019-11-2615

.Sid 2019-11-2616

Swedres-Svarm

2019-11-2617

.Sid

Swedres-Svarm

2019-11-2618

.Sid

Nytt i år

2019-11-2619

.Sid

E. coli blododling trender

2019-11-2620

.Sid

Bakgrundsdata tillgänglig i gem

2019-11-2621

Rapport från urinE. coli och K. pneumoniae

2019-11-2622

.Sid

Urinrapporter 2018, E. coli och K. pneumoniae

23 2019-11-26

Provtyp

URINURIN PUNKTIONURIN TAPPAD

Provtyp

URIN KADURIN PÅSEURIN STOMIURIN SUPRAPUBISKURIN, BRICKERBLÅSAAnalys

URINODLING

5 % av urin, mer resistens?

95 % av urinFramtida rapport?

.Sid

Provtyper urin (synonymer)

2019-11-2624

URIN URIN ÖVRIGA PROVTYPER URIN TAPPAD URIN KAD URIN-PYELO/NEFROSTOMI

AIK-URIN URIN, KASTAD RESIDUAL-URIN KAD URIN-STOMI

KASTAD-URIN URIN, KASTAD (GRAVID) RIK-URIN KAD-URIN URIN-UROSTOMI

KASTAD URIN URIN, KASTAD (UTÖKAD) TAPPAD-URIN KATETER-URIN URIN (NEFROSTOMI)

KONKREMENT, URIN URIN, MITTSTRÅLE URIN-CYSTOSKOPI URIN-KAD URIN NEFROSTOMI/ PYELOSTOMI

MITTSTRÅLE URIN URIN, NITRIT POSITIV URIN-ENGÅNGSKATETER/TAPPAT URIN-KAD PRIMÄRVÅRD URIN PYELOSTOMI

NJURBÄCKENURIN URIN, OSPECIFICERAD URIN-PROV, CYSTOSKOPI ELLER MOTSVARANDE URIN-PROV, KAD URIN UROSTOMI

PAD-URIN URIN, TAPPAD URIN-PROV, KATETER URIN (KAD) URIN, NEFROSTOMI

URETÄR-URIN URIN, URETÄR URIN-PROV, RIK URIN KAD URIN, PYELOSTOMI

URETÄR-URIN HÖ URIN, UTVIDGAD ODL. URIN-PROV, TAPPAT URIN KAD 2 URIN, UROSTOMI

URETÄR-URIN VÄ URINODLING URIN-RIK URIN(KAD) URINPROV, NEFROSTOMI-PYELOSTOMI

URETÄRURIN URINPROV URIN-TAPPAD URIN(KATETER) URINPROV, PYELOSTOMI

URIN-KASTAD URINPROV, CYSTOFIX URIN-URETÄR KATETER URIN, ENGÃ¥NGSKATETER URINPROV, UROSTOMI

URIN-MITTSTRÅLE URINPROV, KASTAT URIN - ENGÅNGSKATERISERING URIN, KAD URIN SUPRAPUBISK

URIN-MITTSTRÅLE PRIMÄRVÅRD URINPROV, OSPEC URIN - KATETER URIN, NJURKATETER S-KAD

URIN-PROV URINRÖRSMYNNING URIN (ENGÅNGSKAT.) URIN PÅSE SUPRAPUB.KAT.

URIN-PROV, KASTAT URINX URIN KATETER URIN-PROV, PÅSE SUPRAPUBIS

URIN-PROV, KASTAT (UTV.ODL.) URIN PUNKTION URIN TAPPAD ELLER CYSTOSKOPI URIN-PÅSPROV SUPRAPUBISKATETER

URIN-PROV, KASTAT + GBS BLÃ¥SPUNKTAT URIN TAPPAT URIN, PÃ¥SPROV URIN-SUPRAPUBISKATETER

URIN-PROV, OSPEC BLÅSPUNKTION URIN, CYSTOSCOPI URIN, PÅSE URIN, SUPRAP.KAT

URIN-ÖVRIGT URIN-BLÅSPUNKTION URIN, CYSTOSKOPI ELLER MOTSVARANDE URIN, PÅSPROV URIN, SUPRAPUBIS

URIN - OSPECIFICERAD URIN-PROV, BLÅSPUNKTION URIN, ENGÅNGSKATETER URIN STOMI URIN, SUPRAPUBISKAT

URIN (FÖRSTAVAL MAN) URIN - BLÅSPUNKTION URIN, TAPPAD (RIK) NB-KAT URIN, SUPRAPUBISKATETER

URIN (SVAMPSTUD DA/LA) URIN (BLÅSPUNKTION) URIN, TAPPAT NEFROSTOMI 1 URIN, BRICKERBLÅSA

URIN 1 URIN BLÃ¥SPUNKTION URINPROV, KATETER NEFROSTOMI 2 URIN-BRICKERBLÅSA

URIN 2 URIN BLÅSPUNKTION URINPROV, TAPPAT PYELOSTOMI URINPROV, BRICKERBLÅSA

URIN 3 URIN(BLÃ¥SPUNKTION) STOMI-URIN URINPROV, BRICKERBLÅSA/UROSTOMI

URIN KASTAD URIN, BLÃ¥SPUNKTION URIN-PROV, NEFROSTOMI URIN/CERVIX/VAGINAL-SEKRET

URIN KASTAD (SVAMPÖVERV) URIN, BLÅSPUNKTION URIN-PROV, NEFROSTOMI/PYELOSTOMI

URIN KASTAT URINPROV, BLÅSPUNKTION URIN-PROV, UROSTOMI

URIN UNS

.Sid

Kommande urinrapport E. coli och K. pneumoniae

• Inledning

• Urval av resistensbestämningsdata – tabell 1

• Deltagande laboratorium – tabell 2

• Artfördelning – tabell 3

• Resistens mot enskild antibiotika – tabell 4– Cefadroxil– Mecillinam– Trimetoprim– Ciprofloxacin– Nitrofurantoino Ampicillin/amoxicillin/amoxicillin-klavulansyra?

• Resistens mot enskild antibiotika per laboratorium – tabell 5– Antibiotika som kan presenteras enligt urvalsmodell

• Samtidig resistens – tabell 6

2019-11-2625

.Sid

Figurer resistensnivåerE. coli - ålder- och könsfördelat

2019-11-2626

• Åldersgrupper?• Redovisa antal testade isolat per laboratorium?• Redovisa S - behandlingsalternativ

.Sid

Urinrapporter svebar 2018, ålder och kön

27 2019-11-26

.Sid

Åldersfördelad data med 95 % CI

2019-11-2628

.Sid

Samtidig resistens och känslighet

2019-11-2629

Trimetoprim

Trimetoprim + ciprofloxacin

Trimetoprim + ciprofloxacin + cefadroxil

Trimetoprim + ciprofloxacin + cefadroxil + mecillinam

Trimetoprim + ciprofloxacin + cefadroxil + mecillinam + nitrofurantoin

• Känslighet eller resistens?• Karbapenem med?

Nämnardata

.Sid

Nämnardata-enkätenAntal genomförda analyser

Blod (flaskpar)

Likvor

Nasofarynxodlingar (totalt)

Svalgodlingar (totalt)

"Allmänodling (Kliniska odlingar från sår/sekret/var) "

"Screenodling för multiresistenta bakterier (MRSA, VRE, Gramnegativer))"

Urinodlingar (totalt)

Faecesodlingar frågeställning SSYC

Faeces- frågeställning C. difficile (toxin)

Nasofarynxodlingar frågeställning B. Pertussis

PCR nasofarynx påvisning av pertussis DNA

Serum analys av IgG antikroppar mot pertussistoxin

Antal positiva prov

Blod (flaskpar)

Angiv totalantalet fynd (oavsett provtyp)

S. aureus

Streptococcus pyogenes

Streptococcus pneumoniae

E. coli

Clostridioides difficile (toxinpositiva)

31 2019-11-26

.Sid

Nämnardata utfall 2018

32 2019-11-26

Nämnardata enkät

vanligen selekterat utifrån provmaterial sedan selekterat på

analyser

Differens (%) Diff (%)

svebardata-labbets egna data (”blod” labb)

labb inte med i blodrapport

Blod (flaskpar) BLODODLINGSPROV-BLODODLING AEROB ANAEROB

-4,6; -1,7; -1,0; 0,6; 2,5; 7,5; -44

Likvor CEREBROSPINALVÄTSKA -27; -16,-3,4, -1,6; -1,4; 2,5; 4,0

Nasofarynxodlingar (totalt) NASOFARYNXSEKRET-NASOFARYNXODLING:

-0,7; 0,3; 0,3; 0,6; 2,0; 4,1; 29 -9,1; 1,5; 3,3; 3,8; 4,7

Svalgodlingar (totalt) SVALGSEKRET-SVALGODLING -27; -0,9; -0,5; -0,4; 0,6; 0,1; 2,8 -13;-1,6; 0,5; 0,9, 1,0; 1,2

Allmänodling (Kliniska odlingar från sår/sekret/var)

selekterat på provmaterial sedan selekterat på analyser

-9,5; -7,7; -2,0; -0,6; 17; 28; 77 ?

Screenodling för multiresistenta bakterier (MRSA, VRE, Gramnegativer)

ESBL/MRG-SCREENING plus MRB-ODLING

-86; -25; -9,4; -3,4; -1,8; 11,5 ?

Urinodlingar (totalt)

URIN, URIN KAD, URIN PUNKTION, URIN STOMI, URIN TAPPAD-URINODLING plus URINODLING, UTVIDGAD

-4,2; -2,5; 0; 0,8; 1,7; 2,6; 2,7 -6,7; 4,2; 4,5; 4,9; 7,6; 8,4

Faecesodlingar frågeställning SSYC FECES - FECESODLING -18; -4,6; -3,3; -1,9; -1,4; -0,6; 1,1 ?

Positiv blod (flaskpar) -6,8; -2,8; -2,0; 2,0; 6,2; 8,1; 9,6

S. aureus -6,0; -1,6; -0,8; -0,2; 0,1; 5,4; 11 -9,6; -6,0; -3,9; -0,8; 7,7; 21

Streptococcus pyogenes -8,0; -4,8; -3,4; -1,7; -1,1; -0,4; 5,7 -46; -22; -13; -11; -1,5

Streptococcus pneumoniae -4,0; -3,6; -2,9; -1,0; 0; 1,0; 7,3 -24; -16; -10; -7,8; -5,7; -5,6

E. coli -1,7; -1,5; -1,1; -0,7; -0,7; 0,3; 5,6 -12; -6,5; -5,6; -1,4; 9,3; 9,6

Särskilda uttag

2019-11-2633

.Sid

Särskilda sammanställningar från ’rutinuttag’

• Gäller redan rapporterade dataset, t ex E coli från blododling.

• Förfrågan gäller vanligen för nationella behandlingsrekommendationer.

• Under hösten: Infektionsläkarföreningen till febrila UVI respektive sepsis, ålders- och könsfördelat, E. coli, K. pne, S. aur. och pnk. Urin och blod.

• LMV, luftvägsinfektioner, artfördelning i bihålesekret – ännu enbart arbetsmaterial

• Nationella data.

• Informera lab och publicera på Svebars hemsida.

• Förenklad framtagning (ej ytterligare validering/godkännande).

2019-11-2634

Nytt i Svebar

2019-11-2635

.Sid

Ny funktionalitet i Svebar

2019-11-2636