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RENATA RODRIGUES GOMES
Phomopsis spp ENDOacuteFITOS DE PLANTAS MEDICINAIS DIVERSIDADE
GENEacuteTICA E ANTAGONISMO AO FUNGO Guignardia citricarpa
2008
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RENATA RODRIGUES GOMES
Phomopsis spp ENDOacuteFITOS DE PLANTAS MEDICINAIS DIVERSIDADE
GENEacuteTICA E ANTAGONISMO AO FUNGO Guignardia citricarpa
Dissertaccedilatildeo apresentada ao Programa de Poacutes-Graduaccedilatildeo em Geneacutetica da Universidade Federal do Paranaacute como requisito parcial para a obtenccedilatildeo do grau de Mestre em Ciecircncias Bioloacutegicas Aacuterea de Concentraccedilatildeo em Geneacutetica
Orientadora Profordf Drordf Chirlei Glienke
Co-orientador Prof Dr Joatildeo Luacutecio de Azevedo
CURITIBA 2008
AGRADECIMENTOS
Agrave minha orientadora Profordf Drordf Chirlei Glienke pela oportunidade ensinamentos
inestimaacuteveis sugestotildees e contribuiccedilotildees oferecidas as quais sem duacutevidas muito
enriqueceram o trabalho Sobretudo pelo exemplo de dedicaccedilatildeo agrave vida acadecircmica
Ao meu co-orientador Prof Dr Joatildeo Lucio Azevedo pela dedicaccedilatildeo e
valorizaccedilatildeo da pesquisa cientiacutefica e pela oportunidade de realizaccedilatildeo desse trabalho
Agrave minha banca de acompanhamento Profordf Drordf Patriacutecia Dalzoto e a Drordf Kaacutetia
Rodrigues pelas sugestotildees e contribuiccedilotildees oferecidas cooperando para o
desenvolvimento desse trabalho
Agraves Profas Dras Lygia Vitoacuteria Galli-Terasawa e Vanessa Kava-Cordeiro pela
convivecircncia sugestotildees e auxiacutelio no LabGeM
Ao Dr Aacutelvaro Almeida da EMBRAPA de Londrina-PR e a Drordf Socircnia Pillegi pelas
linhagens de Phomopsis que muito contribuiacuteram para elucidaccedilatildeo da pesquisa
Ao Prof Dr Joseacute Odair Pereira e a MsC Antonia Souza da Universidade Federal
do Amazonas e a MsC Josiane Gomes pelas linhagens de Pestalotiopsis utilizadas
neste trabalho
Agrave EMBRAPA de Colombo Paranaacute pela disponibilidade da coleta de folhas de
espinheira santa
Agrave Profordf Drordf Thelma Alvim que sempre se disponibilizou no auxiacutelio a microscopia
oacutetica
Aos Professores do Mestrado em Geneacutetica que contribuiacuteram para minha
formaccedilatildeo
Aos meus amigos de turma da poacutes-graduaccedilatildeo Carolina Abuaacutezar Caroline
Bernardi Clineu Uehara Daniele Matoso Dellyana Boberg Fabio Rigoti Maacutercia
Oliveira Patriacutecia de Franccedila Thaiacutes Sczepanski Virginia Coser e Vitor Dantas pelos
momentos de convivecircncia e conforto durante essa jornada Sem vocecircs jamais
suportaria a saudade
Agrave minha amiga Tatiane pelos momentos alegres na convivecircncia diaacuteria pelo
carinho companheirismo pelo conforto durante as minhas preocupaccedilotildees e receios
dentro e fora do laboratoacuterio Assim como pelas excelentes ideacuteias que muito contribuiacuteram
neste trabalho
Aos alunos de Poacutes-graduaccedilatildeo do LabGeM Jociney Josiele Josiane em
especial a Danyelle e Juliana pela amizade e cooperaccedilatildeo no desenvolvimento deste
trabalho
Ao doutorando Rafael Noleto do Laboratoacuterio de Citogeneacutetica Animal pelo
auxiacutelio no desenvolvimento deste trabalho
Aos amigos do LabGeM pela agradaacutevel convivecircncia e ajuda nos momentos
mais difiacuteceis Andreacute Carol Andrade Carol Silvano Douglas Flaacutevia Fernanda Larice
Lisiane Lucinir Maysa Patriacutecia Rosana e Taciana
Agrave amiga Izolde Gartner pela ajuda e disponibilidade
Agrave Anilda Gomes da Silva pelo eventual auxiacutelio teacutecnico na SEAD
Agrave Luciana Marques secretaacuteria do Programa de Poacutes-Graduaccedilatildeo em Geneacutetica
pelas orientaccedilotildees e informaccedilotildees
Aos meus pais Gislene Rodrigues Gomes e Raimundo de Andrade Gomes por
terem ensinado a buscar meus ideais e pelo esforccedilo e compreensatildeo em manterem-se
distantes todos esses anos que dediquei aos estudos
Ao meu companheiro Helder Franklin pela compreensatildeo o carinho e pela sua
admiraacutevel placidez sobretudo ao apoio e contribuiccedilatildeo para a realizaccedilatildeo deste ideal
Aos meus amigos e familiares pelo carinho compreensatildeo e incentivo nesse
periacuteodo de ausecircncia Sobretudo pelos exemplos de dedicaccedilatildeo e respeito ao proacuteximo
Agrave minha amiga Hafiza pelos conselhos compreensatildeo incentivo paciecircncia e
apoio
ldquoDe tudo ficaram trecircs coisas
A certeza de que estamos sempre comeccedilando
A certeza de que precisamos continuar
A certeza de que seremos interrompidos antes
de terminar
Portanto devemos
Fazer da interrupccedilatildeo um caminho novo
Da queda um passo de danccedila
Do medo uma escada
Do sonho uma ponte
Da procura um encontrordquo
(Fernando Pessoa)
RESUMO Phomopsis spp ENDOacuteFITOS DE PLANTAS MEDICINAIS DIVERSIDADE GENEacuteTICA E ANTAGONISMO AO FUNGO Guignardia citricarpa Autora Renata Rodrigues Gomes Orientadora Chirlei Glienke Microrganismos endofiacuteticos vivem no interior das plantas sem causar dano ao seu hospedeiro podendo produzir compostos biologicamente ativos antibioacuteticos fungicidas e herbicidas Essa comunidade endofiacutetica pode estar relacionada com a accedilatildeo antimicrobiana de plantas medicinais A planta Maytenus ilicifollia conhecida como espinheira-santa eacute uma planta medicinal muito utilizada no tratamento de uacutelceras gaacutestricas e tratamentos digestivos tiacutepica da Ameacuterica do Sul em especial da regiatildeo Sul do Brasil e atualmente encontra-se ameaccedilada de extinccedilatildeo As plantas medicinais Spondias mombin Myracrodruon urundeuva Schinus terebinthifolius e Aspidosperma tomentosun tecircm sido usadas na medicina devido as suas propriedades antimicrobianas No presente trabalho foram isolados fungos endofiacuteticos do gecircnero Phomopsis e avaliados quanto a sua variabilidade geneacutetica e estrutura populacional por meio de marcadores RAPD Observou-se que as plantas medicinais analisadas satildeo colonizadas por grande diversidade de espeacutecies de Phomopsis com grande variabilidade morfoloacutegica e geneacutetica intra e interespeciacuteficas Os isolados foram identificados por meio de sequumlecircncias das regiotildees ITS1 58S e ITS2 do DNA ribossomal e testados quanto ao potencial antimicrobiano contra as linhagens PC1396 e PC3305 de Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta do Citros Foi possiacutevel identificar nove isolados em niacutevel de espeacutecie por meio de sequumlecircncias ITS do rDNA sendo 4 como P michaeliae 2 como P theicola 2 como P longicolla e 1 como P sojae Foi possiacutevel verificar que as plantas de Maytenus ilicifolia analisadas satildeo colonizadas endofiticamente por pelo menos dez espeacutecies de Phomopsis e as plantas de Schinus terebinthifolius por pelo menos seis espeacutecies deste gecircnero As anaacutelises morfoloacutegicas por meio de marcadores RAPD e sequenciamento de ITS do rDNA permitem sugerir que as espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo satildeo hospedeiro-especiacuteficas sendo necessaacuteria a redefiniccedilatildeo do conceito de espeacutecie para este gecircnero Na anaacutelise antimicrobiana todos os isolados apresentaram grande potencial no controle in vitro do fungo G citricarpa destacando-se os isolados ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ES2AB1 (Phomopsis sp S6) ES2WF1 (Phomopsis sp S4) e ESFH1 (P theicola) que inibiram o crescimento das linhagens PC1396 e PC3305 de G citricarpa em trecircs metodologias avaliadas Desta forma esse estudo indica que os isolados de Phomopsis spp endoacutefitos de plantas medicinais satildeo produtores de substacircncias bioativas que devem ser melhor caracterizadas Palavras chaves Phomopsis spp endoacutefitos plantas medicinais RAPD sequumlecircncias da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
ABSTRACT Phomopsis spp ENDOPHYTES OF MEDICINAL PLANTS GENETIC DIVERSITY AND ANTAGONISM IN THE FUNGUS Guignardia citricarpa Author Renata Rodrigues Gomes Adviser Chirlei Glienke-Blanco Endophytic microorganisms live in plants without causing damage to their host being able to produce active biological compounds antibiotics fungicides and herbicides This endophytic community may be related to the antimicrobial action of medicinal plants The plant Maytenus ilicifolia known as ldquoespinheira santardquo is a medicinal plant greatly used for the treatment of stomach ulcers and digestive problems typical from the South America especially in the southern part of Brazil and currently is in danger of extinction The medicinal plants Spondias mombin Myracrodruon urundeuva Schinus terebinthifolius and Aspidosperma tomentosun have been used in medicine due to their antimicrobial properties In the present work endophytic fungi of the genus Phomopsis were isolated and their genetic variability and population structure assessed using RAPD markers The medicinal plants analyzed are colonized by a great variety of Phomopsis species with a high morphological and genetic variability both intra and interspecific The isolated fungi were identified through sequences of ITS1 58S and ITS2 regions of ribosomal DNA and tested in their antimicrobial potential against the PC1396 and PC3305 lineages of Guignardia citricarpa the responsible for the ldquoblack spot in Citrusrdquo It was possible to identify 9 isolates at the level of species through the analysis of ITS sequences of rDNA and among these isolates 4 were identified as P michaeliae 2 as P theicola 2 as P longicolla and 1 as P sojae It was possible to verify that the Maytenus ilicifolia plants analyzed are endophytically colonized by at least ten Phomopsis species and that Schinus terebinthifolius are colonized by at least six species of this genus The morphological analyses using RAPD markers and sequencing of ITS regions of rDNA make possible to suggest that the analyzed species of Phomopsis are not host-specific being necessary the redefinition of the species concept for this genus For the antimicrobial analysis all the isolates presented a high in vitro control potential of the fungus G citricarpa particularly the isolates ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ES2AB1 (Phomopsis sp S6) ES2WF1 (Phomopsis sp S4) and ESFH1 (P theicola) that inhibited the growth of the PC1396 and PC3305 lineages of G citricarpa in the three methodologies tested Thus this study indicates that the isolates of Phomopsis spp endophytic of medicinal plants are producers of bioactive substances which should be better characterized Key words Phomopsis spp endophytes medicinal plants RAPD ITS1 58S and ITS2 of rDNA sequences
LISTA DE FIGURAS
FIGURA 1- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis DE Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT 9811 e AT 9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 59
FIGURA 2- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE
Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 61
FIGURA 3- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 64
FIGURA 4- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
PATOGEcircNICOS OBTIDOS DE Glycine max EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 68
FIGURA 5- DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp EM MEIO MEA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 69
FIGURA 6- DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 70
FIGURA 7- AVALIACcedilAtildeO DAS MEacuteDIAS DO DIAcircMETRO DAS COLOcircNIAS DOS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO AV APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 71
FIGURA 8- FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis EM BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 73
FIGURA 9- FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DO ISOLADO SM9713 EM
MEIOS BDA e AV APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB
LUZ CONTIacuteNUA 74 FIGURA 10- COMPRIMENTO DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS
DE Phomopsis spp APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO EM BDA A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 75
FIGURA 11- DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE
SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 77
FIGURA 12- ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE
MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 78
FIGURA 13- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX11 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 79
FIGURA 14- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX14 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 79
FIGURA 15- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX19 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 80
FIGURA 16- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO OPE
08 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 80
FIGURA 17- DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE
SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS DE Phomopsis POR MEIO DE MARCADORES MOLECULARES RAPD 82
FIGURA 18- ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE
GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 84 FIGURA 19- AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA
REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MEacuteTODO DE PARCIMOcircMIA) 86
FIGURA 20- AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA PARCIAL BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MODELO NEIGHBOR-JOINING COM CORRECcedilAtildeO KIMURA DOIS PARAcircMETROS) 87
FIGURA 21- INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa PC1396 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA 93
FIGURA 22- INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia
citricarpa 3305 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA 96 FIGURA 23- AVALIACcedilAtildeO DO CRESCIMENTO DAS COLOcircNIAS DO
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 e PC3305 INOCULADAS APOacuteS RETIRADA DO PAPEL CELOFANE PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS EM MEIO BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 98
FIGURA 24- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 99
FIGURA 25- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 100
LISTA DE TABELAS
TABELA 1- ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR 32
TABELA 2- ISOLADOS GRUPO EXTERNO PARA ANAacuteLISE DE
VARIABILIDADE GENEacuteTICA POR RAPD 35 TABELA 3- EacutePOCAS DO ANO OacuteRGAtildeOS DA PLANTA CONDICcedilOtildeES DE
INCUBACcedilAtildeO E Nordm DE FRAGMENTOS PLAQUEADOS NAS QUATRO COLETAS DE ENDOacuteFITOS DE ESPINHEIRA-SANTA 42
TABELA 4- SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA
AMPLIFICACcedilAtildeO DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL 47
TABELA 5- SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA
AMPLIFICACcedilAtildeO DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL 49
TABELA- 6- Linhagens de Phomopsis spp E de Pestalotiopsis vismae utilizadas
como grupo externo 52 TABELA 7- PORCENTAGEM DE ISOLAMENTO DE Phomopsis
ENDOFIacuteTICOS DE PLANTAS DE ESPINHEIRA SANTA 56 TABELA 8- PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE
OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC1396 94
TABELA 9- PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE
OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 96
TABELA 10- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 101
LISTA DE ANEXOS
ANEXO 1- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM DIFERENTES MEIOS DE CULTURA 125
ANEXO 2- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO BDA 126
ANEXO 3- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO AVEIA 128
ANEXO 4- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO MEA 130
ANEXO 5- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO DOS
ESPOROS BETACONIacuteDIOS DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA 132
ANEXO 6- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 134
ANEXO 7- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 135
ANEXO 8- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 136
ANEXO 9- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 137
ANEXO 10- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS 139
ANEXO 11- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
141
ANEXO 12- MATRIZ DE DADOS PARA CARACTERIZACcedilAtildeO 143 ANEXO 13- LOCAL DA COLETA DE FOLHAS DE Schinus terebinthifolius
CENTRO POLITEacuteCNICO ndash CURITIBA PR 149
SUMAacuteRIO 1 INTRODUCcedilAtildeO 1
2 OBJETIVOS 3
3 REVISAtildeO BIBLIOGRAacuteFICA 4
31 Microrganismos Endofiacuteticos 4
32 Ocorrecircncia de endoacutefitos 7
33 Fungos endofiacuteticos de plantas medicinais 9
34 Endoacutefitos Produtores de Substacircncias Antimicrobianas 11
35 Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss 14
351 Componentes quiacutemicos e propriedades terapecircuticas 16
352 Endoacutefitos isolados de Maytenus ilicifolia 18
36 Guignardia citricarpa Kiely e a Mancha preta do citros 18
361 Mancha Preta do Citros 21
37 O Gecircnero Phomopsis sp 22
38 Marcadores Moleculares 25
381 Marcadores RAPD 27
382 Marcadores ITS 29
4 MATERIAL E MEacuteTODOS 32
41 Material Bioloacutegico 32
411 Fungos endofiacuteticos 32
412 Microrganismos usados para teste de antagonismo 35
413 Fungos endofiacuteticos utilizados para anaacutelise de variabilidade geneacutetica 35
42 Meios de Cultura 35
421 Caldo MEB (Extrato de Malte) 35
422 Meio AV (Aveia-Aacutegar) 36
423 Meio BDA (Meio Batata-Dextrose-Aacutegar) 36
424 Meio MC (Meio Completo) PONTECORVO et al 1953 37
425 Meio MEA (Extrato de Malte) PATERSON e BRIDGE 1994 37
43 Soluccedilotildees e Reagentes 38
431 Clorofane 38
432 Clorofil 38
433 Derozal Bayerreg 38
434 Dodecil Sulfato de Soacutedio (SDS) 10 38
435 Fenol Saturado 38
436 Gel de Agarose (08) 38
437 Gel de Agarose (15) 38
438 Lactofenol azul 38
439 Marcador de peso molecular (DNA de fago lambda clivado com Hind III
Gibco) 39
4310 Marcador de peso molecular (DNA Ladder 100pb Ludwing Biotec) 39
4311 Oligonucleotiacutedeos (Invitrogen) 39
4312 RNAse (invitrogen) 39
4313 Soluccedilatildeo de Vitaminas 40
4314 Soluccedilatildeo salina (pv) 40
4315 Soluccedilatildeo Tween-80 01 (vv) 40
4316 Soluccedilatildeo de Tetraciclina 40
4317 Soluccedilatildeo de EDTA 05M 40
4318 Soluccedilatildeo de brometo de etiacutedio 40
4319 Tampatildeo TE (Tris-EDTA) 41
4320 Tampatildeo de Extraccedilatildeo de DNA 41
4321 Tampatildeo da Amostra (6x) 41
4322 Tampatildeo de corrida TBE 10x 41
44 Isolamento 42
45 Conservaccedilatildeo dos fungos 43
46 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica 43
47 Obtenccedilatildeo de colocircnia monospoacuterica 44
48 Caracterizaccedilatildeo Molecular 44
481 Extraccedilatildeo do DNA (RAEDER e BRODA 1985 modificado por GLIENKE
1995) 44
482 RAPD 45
4821 Anaacutelise da Variabilidade Geneacutetica 46
483 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA 47
4831 Amplificaccedilatildeo 47
4832 Purificaccedilatildeo da PCR 48
48321 Purificaccedilatildeo com PEG 48
48322 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio 48
4833 Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento 49
4834 Purificaccedilatildeo da Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento 50
48341 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em tubos 50
48342 Purificaccedilatildeo com Purificaccedilatildeo com Isopropanol em placa 50
48343 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio 51
4835 Ediccedilatildeo e Anaacutelise das Sequumlecircncia 51
49 Avaliaccedilatildeo da Atividade Antimicrobiana 52
491 Cultura Pareada 52
492 Avaliaccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis 53
493 Atividade dos Extratos metanoacutelicos 54
4931 Obtenccedilatildeo dos extratos 54
4932 Crescimento micelial 55
410 Anaacutelise Estatiacutestica 55
5 RESULTADOS E DISCUSSAtildeO 56
51 Isolamento 56
52 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de Phomopsis 58
53 Caracterizaccedilatildeo Molecular de Phomopsis spp 78
531 RAPD 78
532 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA 85
54 Avaliaccedilatildeo da atividade antimicrobiana 92
541 Cultura pareada 92
542 Teste para detecccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis 97
543 Avaliaccedilatildeo da accedilatildeo dos Extratos 98
6 CONCLUSOtildeES 104
7 REFEREcircNCIAS BIBLIOGRAacuteFICAS 106
ANEXOS 125
1
1 INTRODUCcedilAtildeO
A bioprospecccedilatildeo visa identificar plantas e microrganismos dentre a diversidade
de vida existente em determinado local que possam servir como fonte de substacircncias
bioativas que em uacuteltima instacircncia sejam uacuteteis para o desenvolvimento de novas
drogas Neste contexto os fungos endofiacuteticos satildeo considerados de grande importacircncia
pois representam uma fonte potencial de novos compostos quiacutemicos e bioloacutegicos
podendo ser utilizados natildeo somente na Medicina mas tambeacutem na Fitopatologia e
Veterinaacuteria (STROBEL 2002 STROBEL 2003) O potencial de aplicaccedilatildeo de
microrganismos endofiacuteticos no controle bioloacutegico tambeacutem vem sendo explorado
Os microrganismos endofiacuteticos vivem no interior das plantas interagindo com
diferentes espeacutecies sem causar dano ao seu hospedeiro Esses microrganismos
podem influenciar vaacuterias caracteriacutesticas das plantas e conferir certos benefiacutecios a este
vegetal como por exemplo produccedilatildeo de antibioacuteticos Haacute alguns anos natildeo se conhecia
a grande potencialidade dos endofiacuteticos entretanto este interesse vem aumentando
com a descoberta recente de caracteriacutesticas como a produccedilatildeo de compostos
biologicamente ativos antibioacuteticos fungicidas e herbicidas
Plantas medicinais com propriedades antimicrobianas tambeacutem satildeo habitadas por
microrganismos endofiacuteticos sugerindo que a accedilatildeo antibacteriana ou antifuacutengica poderia
estar no endoacutefito e natildeo na planta ou provavelmente na sua interaccedilatildeo No Brasil vaacuterios
autores mostraram a produccedilatildeo de faacutermacos por endoacutefitos como Xylaria sp Fusarium
moniliforme Colletotrichum sp Guignardia sp e tambeacutem Phomopsis sp
Fungos do gecircnero Phomopsis satildeo encontrados como endoacutefitos nos espaccedilos
intercelulares de tecidos de diversos vegetais entre eles a espinheira-santa (Maytenus
ilicifolia Mart Reiss) planta pertencente agrave famiacutelia Celastraceae Essa planta medicinal
encontrada principalmente no sul do Brasil foi acrescentada agrave lista das espeacutecies
consideradas em extinccedilatildeo no Paranaacute pelo governo do Estado em 1995 Tendo em
vista que pouco se conhece a respeito da comunidade endofiacutetica existente nessa
planta sua diversidade e seu potencial antimicrobiano tornam-se relevantes estudos
de diversidade e bioprospecccedilatildeo
2
Pileggi (2006) demonstrou existir alta diversidade de isolados do gecircnero
Colletotrichum dentre outros fungos filamentosos bacteacuterias e actinomicetos em plantas
de Maytenus ilicifolia do pomar do Centro Nacional de Pesquisa de Florestas (CNPF)
da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaacuteria (EMBRAPAPR) Alguns desses
isolados apresentaram potencial antimicrobiano inibindo o crescimento de Fusarium
sp Guignardia citricarpa e Micrococcus luteus
Endoacutefitos com atividade antagonista contra o fungo Guignardia citricarpa agente
causal da Mancha Preta dos Citros (MPC) poderiam ser utilizados no controle bioloacutegico
desta doenccedila uma vez que o emprego sucessivo de fungicidas como controle de
doenccedilas de plantas apresenta dentre outros problemas a seleccedilatildeo de linhagens
resistentes do patoacutegeno
O gecircnero Phomopsis representa uma fonte potencial de novos compostos
quiacutemicos e bioloacutegicos como vem sendo relatado em diversos trabalhos Oito dos
isolados que foram estudados nesse trabalho jaacute haviam sido avaliados no
IOCFIOCRUZRJ e possuem potencial antimicrobiano (RODRIGUES et al 2004)
Poreacutem tais isolados ainda natildeo haviam sido caracterizados geneticamente nem
identificados em niacutevel de espeacutecie A identificaccedilatildeo e a caracterizaccedilatildeo molecular dos
microrganismos endofiacuteticos satildeo uacuteteis pois o gecircnero Phomopsis eacute de difiacutecil identificaccedilatildeo
em niacutevel de espeacutecie utilizando-se apenas caracteriacutesticas morfoloacutegicas
Estudos moleculares satildeo realizados na busca de padrotildees geneacuteticos nestes
organismos complementando sua caracterizaccedilatildeo O polimorfismo do DNA amplificado
ao acaso (RAPD) propicia uma forma raacutepida para avaliar a diversidade geneacutetica
existente nestes organismos a estruturaccedilatildeo populacional e para auxiliar na
identificaccedilatildeo ao niacutevel de espeacutecie comparando-as com linhagens referecircncia Outra
estrateacutegia importante nessa caracterizaccedilatildeo baseia-se em marcadores de Sequumlecircncias
Internas Transcritas do DNA Ribossocircmico (ITS) para identificaccedilatildeo taxonocircmica dos
isolados
3
2 OBJETIVOS
1 Isolar linhagens endofiacuteticas de Phomopsis spp de plantas sadias de Maytenus
ilicifolia e Identificar os isolados utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas
2 Caracterizaccedilatildeo de Phomopsis spp endofiacuteticos das plantas medicinais Schinus
terebinthifolius Myracrodruon urundeuva Spondias mombin Aspidosperma
tomentosum pertencentes agrave coleccedilatildeo do LABGEM
3 Avaliar a variabilidade geneacutetica e estrutura populacional das linhagens de
Phomopsis spp por meio de marcadores RAPD (Polimorfismo do DNA
Amplificado ao Acaso)
4 Identificar as linhagens por meio de sequumlecircncias da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do
DNA ribossomal
5 Testar a atividade antimicrobiana de linhagens do fungo Phomopsis spp contra
linhagens do fitopatoacutegeno Guignardia citricarpa
4
3 REVISAtildeO BIBLIOGRAacuteFICA
31 Microrganismos Endofiacuteticos
Microrganismos endofiacuteticos satildeo aqueles que vivem no interior das plantas
interagindo com outras espeacutecies de microrganismos sem causar dano ou prejuiacutezo ao
seu hospedeiro Esses microrganismos podem influenciar em vaacuterias caracteriacutesticas
expressas pelas plantas Segundo Neto Azevedo e Araujo (2002) os endoacutefitos podem
desempenhar relevante funccedilatildeo para a sanidade vegetal jaacute que atuam como agentes
controladores de microrganismos fitopatogecircnicos no controle de insetos e ateacute na
proteccedilatildeo da planta contra herbiacutevoros Todas as plantas jaacute estudadas satildeo habitadas por
microrganismos endofiacuteticos principalmente fungos e bacteacuterias
A comunidade endofiacutetica cuja composiccedilatildeo varia em funccedilatildeo do hospedeiro e das
condiccedilotildees ambientais tem indiviacuteduos que se inter-relacionam dentro da planta em um
equiliacutebrio harmocircnico O desequiliacutebrio dessa harmonia afeta o comportamento de todos
os integrantes da comunidade dando condiccedilotildees para que fungos oportunistas
manifestem seu potencial patoloacutegico contra hospedeiro (MAKI 2006)
A distinccedilatildeo entre endofiacuteticos fitopatogecircnicos e oportunistas eacute puramente
didaacutetica Haacute um gradiente tecircnue que os separa e assim agrave distacircncia entre um e outro
pode ser muito pequena sendo difiacutecil impor limites para separar cada categoria Assim
um microrganismo pode ser considerado endofiacutetico mas com a reduccedilatildeo dos
mecanismos de defesa da planta pode se comportar como um patoacutegeno (AZEVEDO et
al 2000)
A ocorrecircncia de microrganismos endofiacuteticos nos vegetais resulta da penetraccedilatildeo
atraveacutes de feridas ocasionadas nas raiacutezes pela abrasatildeo destas com o solo aberturas
naturais como hidatoacutedios e estocircmatos aberturas artificiais sofridas pela accedilatildeo de
pragas animais e o homem ou agressotildees abioacuteticas (RIBEIRO 1995) ou ainda atraveacutes
da secreccedilatildeo de enzimas hidroliacuteticas (ESPOacuteSITO e AZEVEDO 2004) A penetraccedilatildeo
pode ocorrer por meio de esporos levados pelo vento ou hifas que invadem os tecidos
Muitos endoacutefitos produzem massas de coniacutedios delgados caracteriacutestica associada com
5
a dispersatildeo por chuvas (RIBEIRO 1995) Outra forma de propagaccedilatildeo se daacute pela
transmissatildeo vertical por meio de sementes (WHITE MORGAN-JONES E MORROW
1993 CLAY 2004)
Viret e Petrini (1994) usando microscopia eletrocircnica de varredura e transmissatildeo
detectaram a presenccedila de fungos no interior dos hospedeiros Clay (1987) verificou a
presenccedila de hifas dos fungos Acremonium lolli e A coenophialum no espaccedilo
intercelular da regiatildeo meristemaacutetica no mesofilo das folhas no cerne da inflorescecircncia
na semente
Os endoacutefitos apresentam uma relaccedilatildeo mutualiacutestica antagoniacutestica ou neutra com
o hospedeiro A interaccedilatildeo de um fungo com seu hospedeiro vegetal variam e depende
do modo pelo qual o fungo infecta a planta e tambeacutem da extensatildeo da resposta de
defesa desta A colonizaccedilatildeo pode ser sistecircmica ou local inter ou intracelular (ARAUacuteJO
SILVA E AZEVEDO 2000)
Os fungos endofiacuteticos atuam no controle bioloacutegico de fitopatoacutegenos por
ocuparem o mesmo nicho ecoloacutegico destes (ARAUacuteJO SILVA E AZEVEDO 2000)
Segundo Schulz e Boyle (2005) aproximadamente 80 dos fungos endofiacuteticos
produzem compostos biologicamente ativos como antibioacuteticos fungicidas e herbicidas
Esses microrganismos endofiacuteticos podem ser utilizados como fontes de
metaboacutelitos primaacuterios (STAMFORD ARAUacuteJO E STAMFORD 1998) e secundaacuterios que
inibem o desenvolvimento de patoacutegenos (LI et al 2001 LI e STROBEL 2001 ZOU e
TAN 2001) Como exemplo pode-se citar o taxol uma droga quimioterapecircutica usada
no tratamento de cacircncer de mama e ovaacuterio (WANG et al 2000 e STROBEL et al
2003) O aacutecido coletoacutetrico um metaboacutelico do fungo endofiacutetico Colletotrichum
gloeosporioides isolado da Artemisia mongoacutelica apresenta atividade antimicrobiana
contra Bacillus subtilis Staphylococcus aureus Sarcina lutea e contra o fungo
patogecircnico Helminthosporium sativum (ZOU et al 2000) Lu et al (2000) identificaram
trecircs novos metaboacutelitos do fungo endofiacutetico Colletotrichum sp isolado de Artemisia
annua com propriedades antimicrobianas Diversos autores relatam agrave accedilatildeo
antimicrobiana de substacircncias produzidas por fungos endofiacuteticos como Rodrigues
6
Hesse e Werner (2000) Liu et al (2001) Stinson et al (2003) Bao e Lazarivits (2001)
Huang et al (2001) Strobel (2003) Rodrigues (2004) Chareprasert et al (2006)
Os microrganismos endofiacuteticos satildeo tambeacutem capazes de produzirem anti-
helmiacutenticos e inseticidas (AZEVEDO et al 2000 ESPOacuteSITO e AZEVEDO 2004)
apresentando grande potencial que pode ser explorado na agricultura (ZOU e TAN
2001)
Schulz et al (2002) isolaram mais de seis mil e quinhentos fungos endofiacuteticos de
aacutervores e herbaacuteceas na busca de novos metaboacutelitos com potencial para novos
produtos industriais e sugerem que a associaccedilatildeo entre fungos endofiacuteticos e seus
hospedeiros conduza agrave produccedilatildeo de metaboacutelitos secundaacuterios com atividade
antimicrobiana e anti-herbicida
Autores sugerem que certos fungos endofiacuteticos produzem compostos igualmente
presentes em suas plantas hospedeiras como o taxol utilizado para o tratamento de
cacircncer presente tanto na planta medicinal Taxus brevifolia como no fungo endofiacutetico
Taxomyces andreanae (STIERLE et al 1995) Outros exemplos satildeo algumas enzimas
(celulases e lignases) em Xylaria sp fatores de crescimento como giberelina em
Fuzarium moniliforme Indicando uma possiacutevel transposiccedilatildeo de genes entre plantas e
fungos em uma verdadeira engenharia geneacutetica in vivo Se esses casos forem
confirmados ficaraacute evidente que vegetais e fungos transgecircnicos podem ocorrer
naturalmente pela transferecircncia de genes entre espeacutecies pertencentes a diferentes
reinos (AZEVEDO 1998)
Rodrigues Hesse e Werner (2000) pesquisaram a atividade bioativa de extratos
de fungos endofiacuteticos isolados da planta Spondias mombin L (cajazeiro) Estes extratos
incluindo o de Phomopsis sp foram testados contra determinados microrganismos O
fungo apresentou atividade contra actinomicetos Cladosporium elatum Mycotypha sp
e S cerevisae
Aleacutem da produccedilatildeo de antimicrobianos fungos endofiacuteticos podem excluir
patoacutegenos que ocupem o mesmo nicho ecoloacutegico por competiccedilatildeo como relatado por
Bao e Lazarovits (2001) com Fusarium oxysporum f sp Lycopersici patogecircnico e
Fusarium oxysporum natildeo patogecircnico
7
Os fungos endofiacuteticos satildeo de grande importacircncia pois representam uma fonte
potencial de novos compostos quiacutemicos e bioloacutegicos podendo ser utilizados natildeo
somente na Medicina mas tambeacutem na Fitopatologia e Veterinaacuteria (STROBEL 2002
STROBEL 2003) Tendo em vista essa importacircncia vaacuterios trabalhos vecircm sendo
recentemente publicados envolvendo a capacidade de endofiacuteticos antagonizarem
fitopatoacutegenos assim como satildeo descobertos e descritos metaboacutelitos e outras
substacircncias de interesses produzidos por endofiacuteticos
3 2 Ocorrecircncia de endoacutefitos Uma diversidade de microrganismos endofiacuteticos estaacute presente no interior de
plantas aparentemente saudaacuteveis com potencial para serem estudadas A composiccedilatildeo
das espeacutecies pode variar de acordo com o hospedeiro distribuiccedilatildeo geograacutefica idade da
planta condiccedilotildees ecoloacutegicas e sazonais incluindo altitude e precipitaccedilatildeo Uma ou duas
espeacutecies satildeo predominantes como endofiacuteticas em um dado hospedeiro enquanto
outros isolados satildeo pouco frequumlentes (CARROLL 1978 ARNOLD 2003)
Petrini Stone e Carroll (1982) verificaram um padratildeo de dominacircncia de espeacutecies
em que o endoacutefito encontrado com maior frequumlecircncia em uma determinada espeacutecie
vegetal era isolado menos frequentemente de outros hospedeiros Por outro lado os
endoacutefitos encontrados com menor frequumlecircncia em uma planta pareciam ser menos
especiacuteficos pois eram isolados em um amplo espectro de hospedeiros mas com baixa
frequumlecircncia
A colonizaccedilatildeo do fungo endofiacutetico Stagonospora sp no hospedeiro Phragmites
australis ocorre de forma diferenciada no decorrer do ano Na primavera o endoacutefito eacute
encontrado somente na raiz enquanto no outono ele eacute encontrado em todo o vegetal
(ERNEST MENDGEN e WIRSEL 2003) Gao et al (2005) constataram uma flutuaccedilatildeo
sazonal para os endoacutefitos isolados de Heterosmilax japonica Kunth os autores
verificaram maior abundancia de populaccedilotildees endofiacuteticas em amostras coletadas na
primavera do que no veratildeo
8
Tanto a planta hospedeira como a regiatildeo onde os endofiacuteticos satildeo isolados pode
influenciar a produccedilatildeo de metaboacutelitos secundaacuterios De acordo com dados estatiacutesticos
Bills et al (2002) compararam a produccedilatildeo de metaboacutelitos de endofiacuteticos provenientes
de regiotildees tropicais e de regiotildees temperadas Os dados revelaram que regiotildees tropicais
satildeo mais ricas na produccedilatildeo tanto de endoacutefitos como dos metaboacutelitos secundaacuterios
A presenccedila de endoacutefitos em plantas pode variar dentro de espeacutecies de um
mesmo hospedeiro Nestes hospedeiros tambeacutem eacute encontrada uma grande variedade
geneacutetica entre isolados endofiacuteticos da mesma espeacutecie Tal variabilidade foi encontrada
em isolados do fungo Guignardia citricarpa obtidos de citros (GLIENKE 1995) em
duas espeacutecies de Colletotrichum sp isoladas de Maytenus ilicifolia (PILEGGI 2006) e
tambeacutem Pestalotiopsis sp isolados de Maytenus ilicifolia (FIGUEIREDO 2006)
O gecircnero Phomopsis tem sido frequentemente isolado como endoacutefito em uma
grande variedade de plantas
Azevedo et al (2000) apresentaram algumas plantas hospedeiras de onde jaacute
foram isoladas espeacutecies de Phomopsis entre elas Sabal bermudana Trachycarpus
fortunei Cavendishia pubescens Stylosanthes guianensis Anacardium occidentale e
Mangifera indica Corrado e Rodrigues (2004) isolaram endofiacuteticos de Phomopsis das
plantas medicinais Spondias mombin e Aspidosperma tomentosun
Bussabam et al (2001) isolaram predominantemente Phomopsis sp
Colletotrichum gloeosporiodes Glomerella sp e Xylaria sp endoacutefitos de folhas
pseudocaules e rizomas de gengibre (Amomum siamense Criab) coletadas em dois
locais na Tailacircndia
Em plantas de cacau (Theobroma cacao L) resistentes e suscetiacuteveis ao agente
causal da vassoura da bruxa endoacutefitos foram identificados por caracteriacutesticas
morfoloacutegicas e sequumlenciamento de rDNA como pertencentes aos gecircneros
Acremonium Blastomyces Botryosphaeria Cladosporium Colletotrichum
Cordyceps Diaporthe Fusarium Geotrichum Gibberella Gliocladium Lasiodiplodia
Monilochoetes Nectria Pestalotiopsis Phomopsis Pleurotus Pseudofusarium
Rhizopycnis Syncephalastrum Trichoderma Verticillium e Xylaria Os autores
identificaram ainda alguns endoacutefitos potencialmente antagonistas destacando-se
9
Gliocladium catenulatum que reduziu em 70 a incidecircncia da vassoura da bruxa in
vivo em placircntulas de cacaueiro (RUBINI et al 2005)
O gecircnero Phomopsis foi isolado como endoacutefito de graviola (Annona muricata L)
e pinha (Annona squamosa L) dois isolados promoveram eficientemente o crescimento
vegetal mostrando-se promissores para agricultura uma vez que satildeo capazes de
aumentar a produccedilatildeo dessas culturas (SILVA et al 2006) A capacidade de estimular o
crescimento vegetal apresentada por esses organismos tem sido atribuiacuteda a
mecanismos diretos tais como a fixaccedilatildeo do nitrogecircnio produccedilatildeo de fitohormocircnios e
indiretos como antagonismo em relaccedilatildeo a patoacutegenos levando consequumlentemente ao
aumento na taxa de germinaccedilatildeo crescimento das raiacutezes e parte aeacuterea nuacutemero de
folhas e flores aacuterea foliar e rendimento de culturas (SILVEIRA 2001)
Alguns dos relatos citam o gecircnero Phomopsis como fitopatoacutegeno isolado de
Citrus aurantium (Laranjeira) Citrus nobilis (Tangerineira) Citrus paradisi (Pomelo)
Citrus australis (Laranja) Citrus sinensis (Laranja da China) Citrus sp (Citros)
Mangifera indica (Mangueira) Glycine max (Soja) Ficus carica (Figueira) e Anacardium
occidentale (Cajueiro) entre muitas outras plantas (CENARGEN EMBRAPA 2005) Foi
descrito como agente causal da mancha foliar em Myracrodruon urundeuva (ANJOS
CHARCHAR e GUIMARAtildeES 2001) O fungo Phomopsis sp tambeacutem eacute encontrado
associado a sementes de Dipteryx alata e Cybistax antisyphilitica espeacutecies comuns nos
Cerrados (SANTOS 1996)
33 Fungos endofiacuteticos de plantas medicinais Os microrganismos endofiacuteticos satildeo encontrados em muitas espeacutecies de plantas
medicinais A accedilatildeo antimicrobiana de algumas dessas plantas poderiam estar
relacionadas agrave sua comunidade endofiacutetica sugere-se entatildeo que o princiacutepio ativo
antimicrobiano pode ser produzido pelo microrganismo e natildeo propriamente pelo
vegetal ou provavelmente pela interaccedilatildeo planta-hospedeiro
As plantas Aspidosperma tomentosum e Spondias mombin satildeo utilizada no
Brasil devido as suas propriedades antimicrobianas A avaliaccedilatildeo dos metaboacutelitos
10
secundaacuterios produzidos pelo fungo endofiacutetico Phomopsis sp isolado dessas plantas
demonstraram excelentes resultados na inibiccedilatildeo de bacteacuterias fungos filamentosos e
leveduras (CORRADO e RODRIGUES 2004)
Rodrigues Hesse e Werner (2000) avaliaram metaboacutelitos produzidos por fungos
endofiticos isolados de Spondias mombin Guignardia sp apresentaram atividade
contra Escherichia coli Staphylococcus aureus Saccharomyces cerevisiae Geotrichum
sp e Penicillium canadesis Metaboacutelitos de Pestalotiopsis guepinii apresentaram
atividade contra S cerevisiae Os metaboacutelitos produzidos por Phomopsis sp foram
eficientes contra Cladosporium elantum Mycotypha sp e S cerevisiae
Heterosmilax japonica Kunth eacute uma planta medicinal conhecida na China por
seus efeitos diureacuteticos Gao et al (2005) avaliaram a comunidade de fungos endofiacuteticos
e observaram uma grande variedade de fungos colonizando o interior das plantas entre
eles Phomopsis Mycospharella Aureobasidium Cladosporium Glomerella
Botryosphaeria e Guignardia
Plantas do gecircnero Taxus demonstraram atividade anticanceriacutegena assim como
isolados endofiacuteticos dessas plantas O paclitaxel e alguns de seus derivados utilizados
no tratamento de cacircncer satildeo produzidos pelo fungo endofiacutetico Taxus andreanae
isolado da planta medicinal T brevifolia (STROBEL et al 1993 STIERLE et al 1995) e
pelos fungos endofiacuteticos Sporormia minima e Trichothecium sp isolados da planta
medicinal T wallichiana (SHRESTHA et al 2001) A planta medicinal T marei de onde
foi isolado o fungo Tubercularia sp tambeacutem demonstrou atividade anticanceriacutegena
(WANG et al 2000)
O fungo Colletotrichum sp foi isolado como endoacutefito da planta medicinal
Artemisia annua utilizada pelos chineses como uma droga antimalaacuterica produziu
atividade antimicrobiana contra patoacutegenos humanos e de plantas (LU et al 2000) O
fungo endofiacutetico C gloeosporioides da espeacutecie A mongoacutelica sintetiza aacutecido coletoacutetrico
que apresenta atividade antimicrobiana (ZOU et al 2000)
11
34 Endoacutefitos Produtores de Substacircncias Antimicrobianas
A antibiose eacute definida como a interaccedilatildeo entre organismos na qual um ou mais
metaboacutelitos produzidos por um organismo tecircm efeito danoso sobre o outro (BETTIOL e
GHINI 1995) Segundo Melo (1998) muitos fungos e bacteacuterias inibem fitopatoacutegenos
competindo por nutrientes parasitando eou produzindo metaboacutelitos secundaacuterios como
enzimas liacuteticas e antibioacuteticos O resultado dessas interaccedilotildees antagocircnicas tais como
antibiose competiccedilatildeo induccedilatildeo de defesa e parasitismo leva ao controle bioloacutegico de
doenccedilas de plantas assim como pode desenvolver um papel muito importante na
medicina com a descoberta de novos faacutermacos
RODRIGUES HESSE e WERNER (2000) pesquisaram a atividade
antimicrobiana de metaboacutelitos secundaacuterios produzidos por fungos endofiacuteticos de
Spondias mombin (Anacardiaceae) contra actinomicetos bacteacuterias Gram-positivas e
Gram-negativas leveduras e fungos filamentosos e verificaram que os extratos de
Guignardia sp Phomopsis sp e Pestalotiopsis guepinii inibiram o crescimento de
actinomicetos Os extratos de Guignardia sp tambeacutem apresentaram atividade
antimicrobiana contra Escherichia coli Staphylococcus aureus Saccharomyces
cerevisiae Geotrichum sp e Penicillium canadensis Metaboacutelitos de P guepinii foram
ativos contra S cerevisae e os isolados de Phomopsis sp mostraram accedilatildeo antifuacutengica
contra Cladosporium elatum Mycotypha sp e S cerevisae
Liu et al (2001) estudaram a atividade antifuacutengica de fungos endofiacuteticos isolados
de Artemisia annua sobre os fitopatoacutegenos Gaeumannomyces graminis Fusarium
graminearum Rhizoctnia cerealis Phytophthora capsici helminthosporium sativum e
Gerlachia nivalis encontrando isolados com accedilatildeo inibitoacuteria para todos os patoacutegenos Lu
et al (2000) estudando a mesma planta constataram atividade de trecircs novos
metaboacutelitos produzidos pelo fungo Colletotrichum sp apresentando atividade
antifuacutengica contra Bacillus subtilis Sataphylococcus aureus Sarcina lutea
Pseudomonas sp Candida albicans Aspergillus niger e inibiccedilatildeo de crescimento dos
fungos patogecircnicos Gaeumannomyces graminis var tritici Rhizoctonia cerealis
Helminthosporium sativum e Phytophora capisici
12
A Cinnamomum zeylnicum (canela) eacute uma planta utilizada no tratamento de
uacutelceras estomacais hipertensatildeo arterial resfriados e dores abdominais Ezra e Strobel
(2003) isolaram dessa planta o fungo Muscodor albus que apresenta accedilatildeo fungicida
fungistaacutetica bactericida e bacteriostaacutetica por emissatildeo de compostos orgacircnicos volaacuteteis
O mesmo foi relatado para o fungo Gliocladium sp da planta Eucryphia cordifolia
inibindo o crescimento dos fungos fitopatogecircnicos Pythium ultimum e Verticillum dahliae
(STINSON et al 2003)
Citocalasinas satildeo metaboacutelitos fuacutengicos relacionados pela estrutura e atividade
bioloacutegica com capacidade antitumoral e atividade antibioacutetica Estas substacircncias
apresentam efeitos que incluem a inibiccedilatildeo da divisatildeo do citoplasma e dos movimentos
celulares induccedilatildeo do deslocamento nuclear retraccedilatildeo de coaacutegulos e agregaccedilatildeo de
plaquetas transporte de glucose e secreccedilatildeo da tireoacuteide Recentemente trecircs novas
citocalasinas foram relatadas como provenientes do fungo endofiacutetico Rhinocladiella sp
de Tripterygium wilfordii (WAGENAAR et al 2000)
Li e Strobel (2001) purificaram duas ciclohexenonas produzidas pelo fungo
endofiacutetico Pestalotiopsis jesteri isolado da planta Fragraea bodenii (Gentianaceae) a
jesterona e a hidroxil-jesterona das quais a primeira apresentou atividade antifuacutengica
contra o patoacutegeno Pythium ultimum Outro metaboacutelito isoldado de P microspora
isolado endofiticamente da planta Terminalia morobensis a isopestacina
(isobenzofuranona) tambeacutem se mostrou ativo contra Pythium ultimum entre outros
fungos como Sclerotinia sclerotiorum e Rhizoctonia (STROBEL et al 2002)
Adicionalmente a isopestacina apresentou atividade antioxidante contra uma variedade
de radicais livres testados
A Monstera sp eacute uma planta que cresce sobre o tronco de aacutervores dela foi
isolado o endoacutefito Streptomyces sp MSU-2110 na Amazocircnia Peruana Este
actinomiceto produz um peptiacutedeo denominado coronamicina com atividade
antimicrobiana contra o fungo patogecircnico Cryptococcus neoformans e agrave bacteacuteria
Streptococcus pneumoniae mas a melhor atividade foi a demonstrada contra
protozoaacuterio Plasmodium falciparum sugerindo potencialidade como uma droga
13
antimalaacuterica Aleacutem da coronamicina este endoacutefito tambeacutem produz outros compostos
com atividades antifuacutengicas (EZRA et al 2004)
Castillo et al (2002) isolaram e caracterizaram um antibioacutetico de largo espectro
a munumbicina produzida por uma outra linhagem endofiacutetica de Streptomyces
denominada NRRL 30562 isolada da planta medicinal Kennedia nigriscans nativa do
Norte da Austraacutelia O extrato do endoacutefito obtido com solvente orgacircnico foi purificado e
submetido a HPLC (Cromatografia Liacutequida de Alta Eficiecircncia) Os quatro componentes
principais resultantes foram denominados munumbicinas A B C e D Estes compostos
demonstraram em geral atividade contra bacteacuterias Gram positivas como Bacillus
anthracis e Mycobacterium tuberculosis multi-resistente A munumbicina B inibiu
Staphylococcus aureus resistente a meticilina (MRSA) enquanto a munumbicina D
apresentou atividade contra o parasita da malaacuteria Plasmodium falciparum O extrato da
linhagem de Streptomyces foi testado ainda contra vaacuterios patoacutegenos de plantas
apresentando atividade contra Pythium ultimum Phytophthora infestans Sclerotinia
sclerotiorum Erwinia carotovora Cochliobolus carbonum e Penicillium sp mostrando o
grande potencial destas novas substacircncias para a medicina e agricultura
O aacutecido coletotricum produzido pelo fungo Colletotrichum gloeosporioides
(Penz) Penz amp Sacc isolado da planta medicinal Artemiacutesia mongolica apresentou
inibiccedilatildeo do crescimento de Bacillus subtilis Staphylococcus aureus e Sarcina lutea e
atividade antifuacutengica contra o patoacutegeno Helminthosporium sativum (ZOU et al 2000)
Corrado e Rodrigues (2004) observaram a atividade bactericida de linhagens do
fungo endofiacutetico Phomopsis sp isolado das folhas de Aspidosperma tomentosum e
peciacuteolos da planta medicinal Spondias mombin Todos os extratos avaliados inibiram o
crescimento de bacteacuterias fungos filamentosos e leveduras testadas mostrando o
grande potencial deste fungo como fonte de produtos bioativos
Chareprasert et al (2006) isolaram fungos endofiacuteticos de Tectona grandis e de
Samanea saman e testaram sua capacidade antimicrobiana Dentre os isolados
testados Phomopsis foi o gecircnero dominante produzindo substacircncias inibidoras contra
Bacillus subtilis S aureus E coli e Candida albicans
14
Aleacutem da capacidade antimicrobiana fungos endofiacuteticos mostram-se importantes
com um grande potencial antitumoral e com habilidade em inibir enzimas sugerindo
que podem representar uma estimada fonte para uso terapecircutico
Rodrigues et al (2005) verificaram que fungos endofiacuteticos possuem a
capacidade de inibir colinesterase dentre eles linhagens de Phomopsis sp Entretanto
o melhor resultado foi obtido com extratos de Penicillium indicando que estes podem
ter aplicaccedilotildees farmacecircuticas
Huang et al (2001) testaram agrave accedilatildeo de fungos endofiacuteticos isolados de plantas
medicinais frente a outros fungos e tumores Os resultados indicaram que esses fungos
satildeo importantes em medicina como agentes antimicrobianos e antitumorais
Silva et al (2005) isolaram dois novos metaboacutelitos de Phomopsis cassiae
endofiacutetico de Cassia specatabilis as substacircncias 24-diidroxi-56-dimetil benzoato de
etila e phomopsilactona que exibiram forte atividade antifuacutengica contra fitopatoacutegenos
bem como citotoxicidade contra a linhagem celular de tumor cervical humano (HeLa)
Outros fungos como o Gliocladium sp da planta Eucryphia cordifolia tambeacutem possuem
atividade contra fungos fitopatogecircnicos (STINSON et al 2003 STROBEL 2003)
Em 2001 Rodrigues-Heerklotz et al elucidaram a estrutura quiacutemica e a siacutentese
assimeacutetrica de um novo metaboacutelito o aacutecido guignardico produzido pelo fungo endofiacutetico
Guignardia sp isolados de Spondias mombin
Satildeo vaacuterios os relatos de fungos endofiticos produtores de substacircncias
antimicrobianas inclusive isolados de plantas medicinais Esses microrganismos tem
se mostrado como uma fonte promissora de agentes bioativos antitumorais e
antifuacutengicos
35 Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss
A planta Maytenus ilicifolia Mart Ex Reiss pertence agrave classe Magnoliopsida
ordem Celastrales e famiacutelia Celastraceae a qual compreende 50 gecircneros e cerca de
800 espeacutecies (CRONQUIST 1981) Conhecida popularmente nos diferentes paiacuteses da
Ameacuterica do Sul pode receber diferentes denominaccedilotildees congorosa quebrachillo e
15
capororoca na Argentina (GONZALEZ LOMBARDO e VALLARINO 1937) espinheira-
divina cancorosa cancerosa cancrosa sombra-de-touro no Uruguai (SIMOtildeES et al
1986 ALICE et al 1995) coromilho-do-campo e salva-vidas (CARLINI e BRAZ 1988)
espinheira santa espinheira-divina erva-cancrosa e erva-santa (CARVALHO-OKANO
1992) cancorosa-de-Deus limatildeozinho maiteno marteno pau-joseacute salva-vidas
sombra-de-touro no Brasil (BITTENCOURT 2000)
Eacute descrita como uma aacutervore perene de porte arboacutereo-arbustivo encontrada na
mata de clima subtropical e temperado presente em sub-bosques das florestas de
Araucaacuteria nas margens de rios e em regiotildees de estepes Pode se propagar usualmente
por sementes (TAYLOR-ROSA e BARROS 1994) ou estacas de galho Preferindo
climas mais amenos ocorrendo espontaneamente ou por meio de cultivo A colheita
das folhas pode ser feita em qualquer eacutepoca do ano (PANIZZA 1998) Eacute nativa da
Ameacuterica do Sul encontrada no leste da Argentina Paraguai Boliacutevia com menor
intensidade no Chile e Uruguai No Brasil eacute predominante nos estados do Sul
(CARVALHO-OKANO 1992)
Maytenus ilicifolia eacute um arbusto de ocorrecircncia natural da Floresta Ombroacutefila Mista
(Floresta com Araucaacuteria) (BITTENCOURT 2001) Muitas vezes essa planta eacute
encontrada em ambientes ciliares e nos agrupamentos arboacutereos (capotildees) na regiatildeo de
predomiacutenio das estepes (CERVI et al 1989)
Esta planta eacute descrita como um subarbusto ou aacutervore ramificado desde a base
medindo ateacute 50 m de altura Ramos novos glabros angulosos tetra ou multicarenados
Peciacuteolo com 02-05 cm de comprimento A folha apresenta a margem inteira ou com
espinhos em nuacutemero de um a vaacuterios distribuiacutedos regular e irregularmente no bordo
geralmente concentrados na metade apical de um ou de ambos os semilimbos o limbo
com aproximadamente 22 a 89 cm de comprimento e 11 a 30 cm de largura e
nervuras na face abaxial Fruto caacutepsula bivalvar orbicular pericarpo maduro de
coloraccedilatildeo vermelho-alaranjada A presenccedila de disco nectariacutefero eacute um recurso a mais
para atrair os pequenos polinizadores como himenoacutepteros e formigas formando um
conjunto neacutectar-poacutelen interessante para a polinizaccedilatildeo uma vez que as flores satildeo
pequenas brancas e pouco vistosas O florescimento ocorre entre os meses de
16
setembro a outubro enquanto os frutos surgem entre outubro e fevereiro (CARVALHO-
OKANO 1992 RAMDOMSKI 1998 BITTENCOURT 2000)
A fragmentaccedilatildeo da Floresta com araucaacuterias nas uacuteltimas deacutecadas juntamente
com a comprovaccedilatildeo terapecircutica contra males gaacutestricos e o uso em larga escala
causaram grande devastaccedilatildeo de populaccedilotildees naturais de Maytenus ilicifolia
(BITTENCOURT 2001)
351 Componentes quiacutemicos e propriedades terapecircuticas Plantas sempre foram usadas como fonte terapecircutica na medicina tanto em
remeacutedios tradicionais quanto em produtos industrializados A planta Maytenus ilicifolia
Mart eacute geralmente utilizada na medicina popular brasileira As folhas secas desta
planta satildeo usadas como uma infusatildeo para aliviar dores de estocircmago e naacuteuseas e no
tratamento de uacutelceras e gastrites (CAMPAROTO et al 2002) Vaacuterios compostos
isolados de M ilicifolia foram descritos apresentando accedilatildeo antitumoral tambeacutem usado
como analgeacutesico antinflamatoacuterio e antiaacutecido (JORGE 2004)
Esta espeacutecie tem uso popular em comunidades tradicionais e povos indiacutegenas no
Brasil (BITTENCOURT 2001) No Paraguai e Boliacutevia tribos indiacutegenas e populaccedilotildees
rurais a utilizam como substacircncia controladora da fertilidade (CORDEIRO VILEGAS e
LANCcedilAS 1999) e no Paraguai e Argentina eacute usada como contraceptiva e abortiva
(MONTANARI CARVALHO e DOLDER 1998) Citada tambeacutem com uso no tratamento
de febres palustres (MEIRA PENNA 1946) afecccedilotildees pruriginosas cutacircneas
(COIMBRA 1958) dispepsias (CRUZ 1965) Inflamaccedilotildees ulceras e gaacutestricas (JORGE
2004)
As propriedades terapecircuticas de Maytenus ilicifolia foram atribuiacutedas agrave produccedilatildeo
de compostos terpecircnicos como maitenina e pristimerina tanto pelas raiacutezes (LIMA et al
1971 ITOKAWA et al 1991) como em ramos de folhas (JORGE et al 2004) Assim
como fenoacuteis taninos gaacutelicos (CAMPAROTO et al 2002) flavonoacuteides e outros
compostos (SILVA et al 1991 LEITE et al 2001)
17
Jorge et al (2004) avaliaram a eficaacutecia de extratos de M ilicifolia como
antinflamatoacuterio na proteccedilatildeo contra lesotildees gaacutestricas incluindo a cicatrizaccedilatildeo e
citoproteccedilatildeo sugerindo que os extratos de Maytenus ilicifolia podem representar uma
importante alternativa cliacutenica em antinflamatoacuterios e antiulcerogecircnico
Souza-Formigoni et al (1991) avaliaram a potencialidade dos efeitos
antiulcerogecircnicos das folhas de espinheira santa em experimentos realizados em ratos
com ulceras O uso de chaacute tanto por via oral como intraperitoneal mostrou resultados
semelhantes agrave droga cicatrizante cimetidina M ilicifolia assim como outras espeacutecies da
famiacutelia Celastraceae foram investigadas quanto aos seus constituintes de accedilatildeo
citotoacutexica sendo isolados triterpenos aromaacuteticos de accedilatildeo antitumoral Segundo Itokawa
et al (1991 1993) e Shirota et al (1994) os triterpenos satildeo capazes de estimular
fatores atuantes na proteccedilatildeo da mucosa gaacutestrica como a produccedilatildeo de muco e
prostaglandinas
A cimetidina eacute um potente agente na supressatildeo de aacutecido gaacutestrico e pepsina ela
age como antagonista competitivo da histamina nos receptores H2 das ceacutelulas parietais
gaacutestricas produtoras de aacutecido dessa forma bloqueia a secreccedilatildeo aacutecida (SOUZA-
FORMIGONI et al 1991) Ferreira et al (2004) investigaram o efeito e possiacutevel
mecanismo de accedilatildeo do extrato aquoso liofilizado de M ilicifolia sobre a secreccedilatildeo de
aacutecidos em mucosa gaacutestrica de sapos Foi observada uma reduccedilatildeo de 16 da secreccedilatildeo
aacutecida sugerindo os autores que essa reduccedilatildeo ocorra devido a uma atividade
antagoniacutestica dos extratos nos receptores de H2 de histidina
Montanari Carvalho e Dolder (1998) analisaram os efeitos de extratos
etanoacutelicos de M ilicifolia na espermatogecircnese de camundongos e natildeo encontraram
qualquer defeito ou distuacuterbio Poreacutem Montanari e Bevilacqua (2002) em estudos com
fecircmeas de ratos constataram uma diminuiccedilatildeo significativa na implantaccedilatildeo dos embriotildees
com a utilizaccedilatildeo de extrato liofilizado das folhas
18
352 Endoacutefitos isolados de Maytenus ilicifolia
Pileggi (2006) isolou microrganismos endofiacuteticos de folhas peciacuteolos e sementes
de Maytenus ilicifolia e investigou o potencial farmacoloacutegico dos mesmos Foram
isolados em maior frequumlecircncia os fungos Alternaria sp Colletotricum sp Bipolaris sp
Phyllosticta sp e Cladosporium sp Entre os fungos e bacteacuterias testados 15
apresentaram potencial para o controle bioloacutegico Na anaacutelise de caracterizaccedilatildeo
morfoloacutegica por RAPD foi sugerida a presenccedila de duas espeacutecies de Coletotricum
isolados de Maytenus ilicifolia
Figueiredo (2006) isolou de Maytenus ilicifolia fungos endofiacuteticos e os avaliou
quanto ao potencial antimicrobiano contra bacteacuterias patogecircnicas em humanos e o fungo
fitopatogecircnico Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta do Citros Os
extratos metanoacutelicos de dois isolados exibiram accedilatildeo fungistaacutetica na germinaccedilatildeo e no
crescimento micelial de G citricarpa Dois extratos de Pestalotiopsis sp inibiram o
crescimento dos microrganismos-teste (S aureus oxalino resistente Klebsiella
pneumoniae Micrococcus luteus Staphylococcus aureus e Escherichia coli)
Bacteacuterias com potencial anti-leucemico foram isoladas de Maytenus essas
bacteacuterias interagem com as plantas na produccedilatildeo de alguns metaboacutelitos como a
maytensina substancia que tambeacutem apresenta propriedades antifuacutengicas
Azevedo et al (2000) relataram a presenccedila de bacteacuterias endofiacuteticas em folhas de
Maytenus aquifolium Foram isolados vinte gecircneros os mais frequumlentes foram Bacillus
Clavibacter e Streptomyces aleacutem de actinomicetos Testes preliminares mostraram que
algumas das bacteacuterias podem produzir ansamacroliacutedeos que tambeacutem satildeo produzidos
pela planta hospedeira
36 Guignardia citricarpa Kiely e a Mancha preta do citros
O gecircnero Guignardia foi descrito em 1982 por Viala e Ravaz e compreende as
formas teleomoacuterficas de espeacutecies de Phyllosticta e de alguns outros gecircneros
19
relacionados de fungos imperfeitos geralmente saproacutefitas ou semiparasitas de folhas
(SIVANESAN 1984)
Diversos autores isolaram espeacutecies de Phyllosticta de plantas aparentemente
sadias descrevendo-as como endofiacuteticas (CARROLL e CARROLL 1978 PETRINI
1986 LEUCHTMANN et al 1992 GLIENKE 1995 PENNA 2000) No entanto existe
um grande nuacutemero de relatos citando este gecircnero como fitopatogecircnico de diversas
culturas com grande importacircncia econocircmica como arroz (SUGHA SINGH E SHARMA
1986) cana-de-accediluacutecar (PONS 1990) tabaco (PATEL et al 1988) e eucalipto (CROUS
et al 1993) e tambeacutem frutiacuteferas como abacate e tomate (BAKER 1938) manga e
mamatildeo (McMILLAN JR 1986) uva (IBRAHIM e BAYCA 1989) e principalmente em
citros (McONIE 1964a 1964b HERBERT e GRECH 1985 JOHNSTON e
FULLERTON 1988)
O fungo Guignardia citricarpa Kiely (anamorfo Phyllosticta citricarpa (McALP)
Van Der Aa) eacute um Ascomiceto da ordem Dothideales famiacutelia Dothideaceae Possui
estroma plectenquimatoso pseudoteacutecio globoso a subgloboso medindo 125 a 360 μm
de diacircmetro contendo um poro de 14 a 16 μm e paredes espessas com 20 a 22 μm
Seu asco apresenta forma de clava arredondado na extremidade superior e eacute
bitunicado Conteacutem oito ascoacutesporos unicelulares hialinos ligeiramente cinzentos
romboacuteides contendo gracircnulos e um grande vacuacuteolo central Os ascoacutesporos satildeo
cobertos com um quepe gelatinoso nas extremidades Segundo Sivanesam (1984)
pseudoparaacutefises satildeo encontradas em pseudoteacutecios maduros De acordo com Johnston
e Fullerton (1988) as formas anamorfas e teleomorfa geralmente satildeo encontradas
associadas
As estruturas de frutificaccedilatildeo satildeo os picniacutedios que macroscopicamente satildeo
pequenos globosos pretos e semi-eruptivos A fase sexuada corresponde agrave produccedilatildeo
de ascoacutesporos os quais se encontram em nuacutemero de oito no interior dos ascos Estes
apresentam forma de clava satildeo arredondados na extremidade superior e bitunicados
Os ascoacutesporos satildeo unicelulares hialinos levemente acinzentados romboacuteides
contendo gracircnulos e um grande vacuacuteolo central cobertos com um quepe gelatinoso nas
extremidades (SIVANESAN 1984)
20
Fialho (2004) avaliou in vitro o potencial de linhagens de S cerevisiae como
agentes no controle bioloacutegico contra G citricarpa nos frutos poacutes-colheita Rodrigues
(2006) avaliou o efeito dos principais fungicidas utilizados no campo para o controle da
doenccedila Tambeacutem avaliou 96 linhagens de fungos para a seleccedilatildeo de potenciais agentes
no controle bioloacutegico demonstrando que algumas espeacutecies de Trichoderma satildeo
capazes de atuar in vitro como biocontroladores do fitopatoacutegeno G citricarpa
Cardoso-Filho (2003) avaliou o uso de indutores de resistecircncia Saccharomyces
cerevisiae Bionreg e aacutecido saliciacutelico ao fitopatoacutegeno G citricarpa O autor destaca que os
compostos presentes no albedo (mesocarpo) da laranja como a celulose carboidratos
soluacuteveis pectinas compostos fenoacutelicos (flavonoacuteides) aminoaacutecidos e vitaminas podem
exibir a accedilatildeo antimicrobiana para o controle da MPC Neste contexto ele avaliou os
extratos produzidos pelo albedo da laranja e comprovou accedilatildeo fungicida ou fungistaacutetica
inibindo a germinaccedilatildeo esporulaccedilatildeo e crescimento micelial in vitro de G citricarpa
Blanco (1999) e Christo (2002) observaram esta variabilidade entre linhagens
isoladas de lesatildeo de Mancha Preta de Citros (MPC) ou seja linhagens de G citricarpa
utilizando dados de RAPD Esta variabilidade tambeacutem foi evidenciada em linhagens
isoladas em plantas assintomaacuteticas atualmente descritas como Guignardia mangiferae
(GLIENKE-BLANCO et al 2002 CHRISTO 2002 BAAYEN et al 2002 OKANI
NAKAGIRI e ITO 2001 RODRIGUES et al 2004)
Em 1999 Glienke-Blanco comparou geneticamente por meio de marcadores de
RAPD linhagens de populaccedilotildees patogecircnicas e endofiacuteticas de Guignardia sp de
diversas regiotildees e hospedeiros constatando a existecircncia de trecircs populaccedilotildees de
Guignardia geneticamente muito diferentes coexistindo em citros sendo duas
endofiacuteticas e uma patogecircnica sugerindo que talvez estas trecircs populaccedilotildees pudessem
pertencer a espeacutecies distintas O desenvolvimento de um par de oligonucleotiacutedeos
capaz de amplificar um fragmento de 370 pb especiacutefico para linhagens patogecircnicas de
G citricarpa veio a corroborar para distinccedilatildeo geneacutetica entre estes grupos (GLIENKE et
al 2007)
21
361 Mancha Preta do Citros
A doenccedila mancha preta dos citros (MPC) foi descrita na Austraacutelia em 1985 por
Kiely posteriormente na Aacutefrica do Sul como consequumlecircncia da importaccedilatildeo de mudas da
Austraacutelia Atualmente estaacute distribuiacuteda em regiotildees subtropicais do mundo entre elas o
Brasil (GOacuteES et al 2005)
O ciclo da doenccedila (MPC) inicia-se com a disseminaccedilatildeo dos coniacutedios ou
picnidioacutesporos (esporos assexuais) e ascoacutesporos (esporos sexuais) do fungo
Guignardia citricarpa Os coniacutedios (picnidioacutesporos) satildeo responsaacuteveis pelas infecccedilotildees agrave
curta distacircncia e estatildeo localizados no interior dos picniacutedios oriundos dos frutos
infectados Um agregado de coniacutedios emerge atraveacutes da abertura do picniacutedio (ostiacuteolo)
dissolve-se na aacutegua da chuva orvalho ou irrigaccedilatildeo e cai sobre os pequenos frutos
susceptiacuteveis que se formam apoacutes as floradas Jaacute os ascoacutesporos satildeo responsaacuteveis pela
disseminaccedilatildeo agrave curta e longa distacircncia pois satildeo lanccedilados dos periteacutecios que se
formam em folhas caiacutedas ao solo e satildeo levados por correntes aeacutereas infectando
pequenos frutos susceptiacuteveis (ROBES 1990)
Em estudo epidemioloacutegico da MPC Spoacutesito et al (2008) analisou 27270 frutos
colhidos de 303 aacutervores quanto agrave incidecircncia da doenccedila (porcentagem de frutos doentes
por aacutervore) e quanto agrave severidade da doenccedila (aacuterea com sintoma do fruto) O autor
encontrou frutos doentes em 251 aacutervores das 303 analisadas (83) com diferentes
niacuteveis de incidecircncia Algumas aacutervores tinham a maioria das frutas com lesotildees
agregadas e de alta gravidade enquanto outras tinham a maioria das frutas com
poucas lesotildees e baixa gravidade Segundo os autores quando o agente patogecircnico eacute
disperso pela aacutegua da chuva esta pode transportar muitos esporos de uma vez
formando uma lesatildeo O padratildeo de sintomas resultantes a partir deste tipo de dispersatildeo
eacute tipicamente agregada Os autores concluiacuteram que os ascoacutesporos satildeo os mais
importantes inoacuteculos de G citricarpa
A MPC caracteriza-se por apresentar lesotildees com bordas salientes e com
depressatildeo no centro onde se observam pequenos pontos pretos os picniacutedios As
lesotildees podem atingir os frutos maduros ou no iniacutecio de maturaccedilatildeo podendo aparecer
22
apoacutes a colheita no transporte e armazenamento (ROBES et al 1995) A MPC afeta
apenas a casca do fruto e o flavedo (epicarpo) sem causar dano internamente limitado
pelo albedo (mesocarpo) Poreacutem sua comercializaccedilatildeo no mercado de frutas eacute
prejudicada assim como a sua exportaccedilatildeo devido agrave barreira fitossanitaacuteria existente na
Uniatildeo Europeacuteia por ser uma doenccedila quarentenaacuteria A1 Nos casos em que a doenccedila
atinge o pedicelo do fruto pode ocorrer agrave queda prematura do fruto aumentando as
perdas na produccedilatildeo e ateacute limitando seriamente a citricultura em vaacuterios estados
brasileiros (GOacuteES et al 2005 ROBES et al 1995)
Em funccedilatildeo dos prejuiacutezos causados por G citricarpa na comercializaccedilatildeo de
frutos in natura principalmente no mercado externo satildeo crescentes os estudos que
datildeo ecircnfase ao controle bioloacutegico da doenccedila
37 O Gecircnero Phomopsis sp
O gecircnero Phomopsis descrito em 1905 por (Sacc) Bubak (RIEDL 1981) forma
picniacutedios escuros com ostiacuteolo normalmente em forma de pecircra conidioacuteforos simples
alfa coniacutedios hialinos com gotas nas extremidades predominantemente elipsoacuteides sem
septos unicelulares de forma ovoacuteide Apresenta tambeacutem beta coniacutedios hialinos sem
gotas filiformes a maioria curvos em uma das extremidades sem septos (HANLIN e
MENEZES 1996)
Outra caracteriacutestica dos fungos do gecircnero Phomopsis eacute a formaccedilatildeo de linhas
negras estreitas em tecidos de plantas contaminadas assim como no meio de cultura
em que satildeo repicados (BRAYFORD 1990)
O gecircnero Phomopsis pertence ao filo Ascomycota subfilo Pezizomycotin classe
Sordariomycetes subclasse Sordariomycetidae ordem Diaporthales famiacutelia Valsaceae
mitosporic Valsaceae Apresenta-se na forma anamoacuterfica o seu teleomorfo eacute o
Diaporthe cujo habitat eacute o caule de plantas lenhosas e herbaacuteceas (HANLIN e
MENEZES 1996)
Espeacutecies de Phomopsis satildeo comumente encontradas como patoacutegenos e
endoacutefitos de plantas (BODDY e GRIFFITH 1989) Tradicionalmente o gecircnero tem sido
23
considerado altamente patogecircnico (REHNER e UECKER 1994) mas algumas
espeacutecies de Phomopsis satildeo entretanto endoacutefitos mutualiacutesticos (WEBBER e GIBBS
1984 CARROLL 1986)
Espeacutecie de Phomopsis e Diaporthe tecircm sido tradicionalmente descritos com
base na espeacutecie hospedeira Poreacutem algumas espeacutecies e isolados podem infectar mais
de um hospedeiro (BRAYFORD 1990 FARR CASTLEBURY e ROSSMAN 2002) tal
estrateacutegia tem sido frequentemente questionada (REHNER e UECKER 1994)
Trabalhos incluindo estudos de cruzamentos mostraram que esse criteacuterio natildeo eacute
suficiente para classificaccedilatildeo ao niacutevel de espeacutecie Aleacutem disso isolados de Phomopsis
provenientes do mesmo hospedeiro natildeo necessariamente pertencem agrave mesma espeacutecie
assim como uma mesma espeacutecie de Phomopsis pode infectar diferentes hospedeiros
(REHNER e UECKER 1994)
Foram descritas mais de 1000 espeacutecies do gecircnero Phomopsis baseado
principalmente na associaccedilatildeo com o hospedeiro (UECKER 1988) Embora o
hospedeiro seja atualmente considerado menos importante na definiccedilatildeo de espeacutecies
nenhuma revisatildeo do gecircnero foi realizada A fase teleomoacuterfica (Diaporthe) foi descrita
apenas para aproximadamente 20 das espeacutecies do gecircnero Phomopsis (PHILLIPS
2006) Essa ausecircncia da fase teleomorfica (Diaporthe) em meio de cultura
(principalmente quando isolado endofiticamente) torna a identificaccedilatildeo ao niacutevel de
espeacutecie neste gecircnero muito difiacutecil (REHNER e UECKER 1994)
Wehmeyer (1933) elaborou uma revisatildeo do gecircnero Diaporthe o autor
considerou a associaccedilatildeo com o hospedeiro uma caracteriacutestica de menor importacircncia
tendo reduzido de 650 para 70 o nuacutemero de espeacutecies no gecircnero No entanto este
estudo baseou-se unicamente em caracteriacutesticas morfoloacutegicas do teleomorfo natildeo tendo
sido consideradas as caracteriacutesticas do anamorfo
A delimitaccedilatildeo de espeacutecies de Phomopsis baseado apenas em caracteriacutesticas
morfoloacutegicas demonstrou-se inadequada (VAN DER AA 1990) Em adiccedilatildeo as
caracteriacutesticas de morfologia do coniacutedio e caracteriacutesticas da colocircnia usadas para
identificar espeacutecies alguns autores tecircm utilizado caracteres alternativos que incluem
virulecircncia (VIDIC 1991) proteiacutenas e sorologia (LEE e SNOW 1992 VELICHETI et al
24
1991) sequumlecircncias ITS (ZHANG et al 1998) e enzimas e metaboacutelitos secundaacuterios
(SHIVAS ALLEN e WILLIAMSON 1991) Infelizmente nenhum caraacuteter foi aplicaacutevel
para distinguir todos os grupos de isolados (REHNER e UECKER 1994)
O entendimento sobre o gecircnero expandiu-se por meio de estudos de sequumlecircncias
ITS nos quais alguns dos isolados agruparam-se por regiotildees geograacuteficas (REHNER e
UECKER 1994) Alguns trabalhos tecircm comparado dados morfoloacutegicos com dados
moleculares principalmente o uso de sequumlecircncias da regiatildeo ITS do DNA ribossomal
Zhang et al (1998) destingiu cinco taacutexons de Phomopsis isolados de Soja (Glycine
max) utilizando sequumlecircncias da regiatildeo ITS do DNA ribossomal poreacutem natildeo foram
capazes de diferenciar-los com base nas caracteriacutesticas morfoloacutegicas Farr et al (2002)
caracterizaram por anaacutelise molecular com o uso de sequumlecircncias ITS1 58S ITS2 e por
caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de Phomopsis sp isolados de Vaccinium
corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse estudo verificaram que a maioria dos
isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma vez que as sequumlecircncias agruparam-se
com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
Castlebury e Mengistu (2006) avaliaram Phomopsis isolados de soja e outros
hospedeiros combinando dados de sequumlecircncias de ITS do DNA ribossomal o
sequumlenciamento do gene EF1-alpha e genes de actina seis grupos de Phomopsis
foram formados desses trecircs correspondem aos taacutexons P longicolla Diaporthe
melonis e D phaseolorum Os autores concluiacuteram entatildeo que agrave ausecircncia de distinccedilatildeo
morfoloacutegica e informaccedilatildeo bioloacutegica torna problemaacutetica a identificaccedilatildeo de espeacutecies aos
grupos de isolados geneticamente distintos Aleacutem disso natildeo estaacute esclarecida a
importacircncia bioloacutegica e geneacutetica dos diferentes grupos e trabalhos adicionais quanto
aos hospedeiros patogenicidade e morfologia satildeo necessaacuterios para resolver a distinccedilatildeo
de espeacutecies neste gecircnero
O gecircnero Phomopsis eacute um importante grupo de fungos com potencial
biotecnoloacutegico devido agrave produccedilatildeo de importantes metaboacutelitos secundaacuterios entre os
quais se incluem o micotoxinas que afeta o sistema nervoso de vertebrados (BILLS et
al 2002) alcaloacuteides com capacidades farmacoloacutegicas tais como phomopsins
(COCKRUM PETTERSON e EDGAR 1994) e 24-diidroxi-56-dimetil benzoato de etila
25
e phomopsilactona produzidos por Phomopsis cassiae endofiacutetico de Cassia
specatabilis (SILVA et al 2005)
38 Marcadores Moleculares
A variabilidade geneacutetica em microrganismos pode ser detectada por teacutecnicas
claacutessicas ou moleculares As teacutecnicas claacutessicas baseiam-se na anaacutelise de fenoacutetipos a
partir da caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica (produccedilatildeo de coniacutedios crescimento radial da
colocircnia) ou bioquiacutemica (produccedilatildeo de substacircncias auxotrofias) restringindo a
possibilidade de se conduzir estudos populacionais e muitas vezes de sistemaacutetica As
teacutecnicas moleculares por sua vez fornecem ferramentas para evidenciar e entender
melhor diversos aspectos relacionados direta ou indiretamente com o DNA Desta
forma a anaacutelise dos aacutecidos nucleacuteicos vem sendo amplamente utilizada na diferenciaccedilatildeo
de organismos e no esclarecimento taxonocircmico e filogeneacutetico dos organismos
estudados
Os diversos meacutetodos de detecccedilatildeo de polimorfismo geneacutetico diretamente ao niacutevel
de aacutecidos nucleacuteicos tecircm permitido a anaacutelise molecular da variabilidade do DNA
determinando pontos de referecircncia nos cromossomos tecnicamente denominados
ldquomarcadores molecularesrdquo Por marcador molecular define-se todo e qualquer fenoacutetipo
molecular oriundo de um gene expresso ou de um segmento especiacutefico de DNA
(GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Os dados moleculares frequumlentemente complementam e corroboram hipoacuteteses
baseadas em estudos morfoloacutegicos embora algumas vezes os resultados obtidos da
anaacutelise de DNA sejam conflitantes com dados de anaacutelise exclusivamente feneacuteticas
Esta contradiccedilatildeo pode ser observada principalmente na classificaccedilatildeo taxonocircmica de
microrganismos (SAMUELES e SEIFERT 1995)
Algumas teacutecnicas moleculares utilizadas principalmente em fungos para a
detecccedilatildeo do polimorfismo geneacutetico de sequumlecircncias de DNA satildeo Eletroforese em Campo
Pulsado (PFGE) Polimorfismos dos fragmentos de Restriccedilatildeo (RFLPs) Polimorfismos
26
do DNA Amplificados ao Acaso (RAPDs) Sequumlenciamento das Regiotildees Internas
Transcritas (ITS1 e ITS2) do DNA ribossocircmico (rDNA)
Aleacutem de avaliarem a variabilidade geneacutetica estes marcadores moleculares
podem determinar relaccedilotildees filogeneacuteticas como tambeacutem colaborar na identificaccedilatildeo de
um determinado isolado Tais marcadores podem ser gerados independentemente do
fenoacutetipo e revelar polimorfismos altamente informativos em sequumlecircncias de DNA
A teacutecnica de RFLP surgiu a partir da descoberta de que os siacutetios para enzimas
de restriccedilatildeo poderiam ser polimoacuterficos ou seja alteraccedilotildees em um uacutenico par de bases
que muitas vezes satildeo neutras poderiam ser detectadas pela presenccedila ou ausecircncia
destes siacutetios para endonucleases Esta teacutecnica propiciou a introduccedilatildeo de um elevado
nuacutemero de marcadores moleculares nas anaacutelises de variabilidade geneacutetica (ALBERTS
et al 2004) Dentre as inuacutemeras aplicaccedilotildees dos marcadores RFLP pode-se citar o
estudo da evoluccedilatildeo dos genomas a identificaccedilatildeo de genes especiacuteficos o estudo de
geneacutetica de populaccedilotildees a taxonomia e obtenccedilatildeo de mapas geneacuteticos (MICHELEMORE
e HULBERT 1987) Entretanto seu uso torna-se limitado pois eacute necessaacuterio DNA de
alta qualidade e em grande quantidade (GLIENKE 1995)
O uso do DNA ribossomal (rDNA) como marcador molecular tambeacutem pode ser
empregado na anaacutelise da variabilidade geneacutetica para uma ampla faixa de niacuteveis
taxonocircmicos As sequumlecircncias codificantes do rDNA evoluem muito lentamente e satildeo
altamente conservadas possibilitando a sua utilizaccedilatildeo em estudos com organismos
pouco relacionados taxonomicamente Ao contraacuterio do rDNA as regiotildees espaccediladoras
internas destes genes conhecidas como ITS evoluem rapidamente apresentando alto
polimorfismo e sendo desta forma de grande interesse nos estudos filogeneacuteticos de
gecircneros espeacutecies e populaccedilotildees (WHITE e MORROW 1990)
A reaccedilatildeo em cadeia da polimerase (PCR) tornou-se uma das mais importantes e
utilizadas teacutecnicas em Biologia Molecular por apresentar rapidez baixo custo e
capacidade de amplificaccedilatildeo de pequenas quantidades de DNA (MULLIS e FALOONA
1987 WHITE e MORROW 1989)
Concebida por KARY MULLIS em meados da deacutecada de 80 a teacutecnica baseia-se
em amplificar fragmentos de sequumlecircncias de DNA com alta especificidade e fidelidade
27
utilizando oligonucleotiacutedeos especiacuteficos ou natildeo Tais oligonucleotiacutedeos delimitam a
sequumlecircncia de DNA gerando um sinal molecular que pode ser amplificado (MULLIS e
FALOONA 1987 WHITE e MORROW 1989 McPHERSON QUIRKE e TAYLOR
1991 GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
A PCR consiste em uma teacutecnica in vitro capaz de produzir muacuteltiplas coacutepias de
sequumlecircncias especificas de DNA Alterando-se as condiccedilotildees de reaccedilatildeo pode-se
amplificar cadeias simples de DNA detectar e distinguir entre genes portadores de
mutaccedilatildeo em uma uacutenica base ou proporcionar quantidades suficientes de DNA para
anaacutelise eou manipulaccedilatildeo subsequumlente (WALKER e RAPLEY 1999)
Uma das limitaccedilotildees da teacutecnica PCR eacute a necessidade do conhecimento preacutevio da
sequumlecircncia que flanqueia o segmento a ser amplificado para que os oligonucleotiacutedeos
possam ser construiacutedos (WATSON et al 1992 ALBERTS et al 2004) A teacutecnica de
RAPD entretanto natildeo apresenta este obstaacuteculo pois segundo Williams et al (1990)
esta teacutecnica baseia-se na amplificaccedilatildeo de segmentos de DNA por um uacutenico
oligonucleotiacutedeo de sequumlecircncia arbitraacuteria que amplifica vaacuterias regiotildees simultaneamente
381 Marcadores RAPD
O RAPD (polimorfismo do DNA amplificado ao acaso) envolve a utilizaccedilatildeo de
oligonucleotiacutedeos de sequumlecircncia arbitraacuteria que amplificam vaacuterias regiotildees do genoma
simultaneamente (WILLIAMS et al 1990 WELSH E MCCLELLAND 1990
VILARINHOS et al 1995 FUNGARO et al 1996 ALZATE-MARIN et al 1997
ABBASI et al 1999 PAAVANEM-HUHTALA AVIKAINEM e YLI-MATTILA 2000)
Dessa forma natildeo eacute necessaacuterio o desenvolvimento preacutevio de uma biblioteca de sondas
especiacuteficas para o organismo de interesse
A teacutecnica de RAPD utiliza o mesmo princiacutepio da PCR (SAIKI et al 1985) A
principal diferenccedila entre a PCR usual e o RAPD estaacute na reaccedilatildeo de amplificaccedilatildeo que
utiliza apenas um uacutenico oligonucleotiacutedeo com sequumlecircncia arbitraacuteria de 10 a 15 bases A
amplificaccedilatildeo somente ocorre se este oligonucleotiacutedeo for complementar a um siacutetio em
uma das fitas e complementar a um mesmo siacutetio (orientaccedilatildeo invertida) na outra fita de
28
DNA (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998) Segundo Williams et al (1993) o tamanho
ideal do oligonucleotiacutedeo para amplificaccedilatildeo de RAPD eacute em torno de dez bases
devendo seu conteuacutedo GC ser em torno de 50 a 70 e no miacutenimo de 40 Aleacutem disso
os oligonucleotiacutedeos natildeo devem conter sequumlecircncias palindrocircmicas a fim de evitar o
autopareamento
Os marcadores RAPD tecircm sido amplamente utilizados para o estudo de diversos
grupos de seres vivos A partir dos marcadores moleculares clonados e sequumlenciados
haacute a possibilidade de sintetizar oligonucleotiacutedeos especiacuteficos aumentando o seu poder
de resoluccedilatildeo (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Esses marcadores permitem caracterizar e avaliar o grau de similaridade
geneacutetica entre genoacutetipos em niacuteveis inter e intraespeciacuteficos sendo altamente sensiacuteveis
quanto diferenccedilas de ateacute um uacutenico nucleotiacutedeo entre o oligonucleotiacutedeo e o DNA molde
Permitem ainda analisar a estrutura geneacutetica de populaccedilotildees naturais populaccedilotildees de
melhoramento e bancos de germoplasma a construccedilatildeo de mapas geneacuteticos de alta
cobertura genocircmica a localizaccedilatildeo de genes de interesse econocircmico e ainda a
obtenccedilatildeo de novos marcadores para diagnoacutesticos via PCR (FUNGARO e VIEIRA 1998
FUNGARO 2000 GLIENKE-BLANCO et al 2002 ANCHORENA-MATIENZO 2002)
Diferentes niacuteveis taxonocircmicos podem ser inferidos atraveacutes de marcadores
RAPD cujos padrotildees podem apresentar-se como variaacuteveis quando polimoacuterficos e
constantes quando natildeo-polimoacuterficos
Avaliando a variabilidade geneacutetica de organismos geneticamente relacionados
diversos autores confrontaram resultados obtidos a partir de anaacutelises moleculares ao
niacutevel de proteiacutenas com os dados obtidos a partir de marcadores moleculares de DNA
Meijer Megnegneau e Linders (1994) estudando linhagens de Phomopsis subordinaria
isoladas de 23 localidades diferentes chegaram a resultados conflitantes obtidos por
RAPD e isoenzimas Os marcadores de RAPD mostraram alta similaridade entre 47
linhagens de P subordinaria isoladas de oito localidades diferentes enquanto a anaacutelise
por isoenzimas sugeriu que todas as linhagens eram idecircnticas
Jaacute Pioli et al (2003) caracterizaram por RAPD isolados do complexo
DiaporthePhomopsis coletados de soja na Argentina Eles foram separados em quatro
29
grupos (i) Diaporthe phaseolorum variedade meridionalis (ii) D phaseolorum variedade
caulivora (iii) D phaseolorum variedade sojae and (iv) Phomopsis longicolla revelando
a existecircncia de variabilidade entre isolados da mesma variedade
Fernandez e Hanlin (1996) obtiveram resultados concordantes entre a anaacutelise
molecular por RAPD e as caracteriacutesticas morfoculturais separando os isolados
coletados de soja em dois grupos Diaporthe phaseolorum e Phomopsis longicolla
Os marcadores de RAPD tambeacutem podem ser usados na anaacutelise de
recombinantes obtidos por parameiose em Beauveria bassiana (DALZOTO et al 2003)
A teacutecnica RAPD tambeacutem eacute utilizada como um meacutetodo eficiente na diferenciaccedilatildeo
de microrganismos patogecircnicos e natildeo patogecircnicos Guthirie et al (1992) e Vasconcelos
(1994) caracterizaram diferentes espeacutecies do gecircnero Colletotrichum diferenciando-as
quanto agrave sua patogenicidade
Grajal-Martin Simon e Muehlbauer (1993) conseguiram diferenciar o tipo 2 de
Fusarium oxysporum f sp pisi de trecircs outros grupos por marcadores RAPDs Da
mesma maneira isolados patogecircnicos de Fusarium oxysporum f sp dianthi que
atacam cravos puderam ser distinguidas de vaacuterios natildeo patogecircnicos por marcadores
RAPD (MANULIS et al 1993)
Blanco (1999) utilizando seis oligonucleotiacutedeos de RAPD confirmou a existecircncia
de trecircs populaccedilotildees distintas de Guignardia citricarpa coexistindo em citros sendo duas
endofiacuteticas e uma patogecircnica responsaacutevel pelas lesotildees da mancha preta nos citros
Glienke-Blanco et al (2002) utilizando sete oligonucleotiacutedeos de RAPD encontraram
alta variabilidade geneacutetica em linhagens endofiacuteticas de Guignardia citricarpa isoladas
de plantas assintomaacuteticas de citros
382 Marcadores ITS
O DNA ribossocircmico contido nas regiotildees organizadoras de nucleacuteolos (NOR) tem
sido objeto de um grande nuacutemero de estudos com diversas aplicaccedilotildees em geneacutetica
evoluccedilatildeo e melhoramento Tal interesse estaacute diretamente relacionado agrave estrutura
destas regiotildees que se encontram em locais especiacuteficos do genoma e repetidos em
30
sequumlecircncia inuacutemeras vezes A funccedilatildeo do rDNA eacute codificar as diferentes moleacuteculas de
RNA ribossocircmico (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Segundo White et al (1990) as regiotildees espaccediladoras internas do DNA
ribossomal (ITS) evoluem rapidamente apresentando alto polimorfismo ao contraacuterio
do rDNA e sendo assim essas regiotildees satildeo de grande interesse nos estudos
filogeneacuteticos em niacuteveis de gecircnero espeacutecies e populaccedilotildees Esta caracteriacutestica permite
ainda a sua utilizaccedilatildeo na obtenccedilatildeo de polimorfismos de comprimento de fragmentos
(RFLP) nos loci de rDNA O nuacutemero de coacutepias de uma determinada sequumlecircncia de
rDNA e variaccedilotildees de nucleotiacutedeos nestas sequumlecircncias tambeacutem tecircm sido utilizados em
tais estudos (FERREIRA 1994)
Orsquodonnell e Gray (1995) avaliaram a relaccedilatildeo filogeneacutetica e a variaccedilatildeo geneacutetica
dentro de 24 isolados do complexo Fusarium solani por meio da sequecircncia de rDNA e
marcador RFLP e concluiacuteram que esta espeacutecie eacute formada por espeacutecies filogeneacuteticas
distintas Utilizando a mesma teacutecnica Ouellet e Seiffert (1993) diferenciaram F
graminearum de outras 11 espeacutecies que atacam trigo aleacutem de terem permitido a
identificaccedilatildeo de diversas raccedilas desta espeacutecie provenientes de isolados
morfologicamente semelhantes
Jasalavich Ostrofskf e Jellison (2000) utilizaram os oligonucleotiacutedeos ITS1 e
ITS4 (especiacutefico para basidiomicetos) na identificaccedilatildeo de microrganismos A
amplificaccedilatildeo da regiatildeo ITS1-58S-ITS2 detectou a presenccedila de basidiomicetos em
diferentes amostras Testes complementares foram realizados no produto da
amplificaccedilatildeo por meio da teacutecnica de RFLP permitindo a identificaccedilatildeo de espeacutecie
Satoko et al (2000) e Promputtha et al (2005) utilizaram a regiatildeo ITS1 58S e
ITS2 do rDNA para identificar fungos endofiacuteticos que natildeo esporularam sendo relatados
como Phomopsis e Diaporthe (anamoacuterfico Phomopsis)
Farr Castlebury e Rossman (2002) caracterizaram por anaacutelise molecular com o
uso de sequumlecircncias ITS1 58S ITS2 e por caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de
Phomopsis sp isolados de Vaccinium corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse
estudo verificaram que a maioria dos isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma
vez que as sequumlecircncias agruparam-se com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
31
Mostert et al (2001) tambeacutem usaram anaacutelise filogeneacutetica das regiotildees 58S ITS1
e ITS2 e DNA mitocondrial para elucidar a taxonomia de espeacutecies de Phomopsis
obtidas de vinhedos Eles observaram que os fungos endofiacuteticos tratavam-se de
Diaporthe perjuncta e Phomopsis sp taacutexon 1 Jaacute os isolados patogecircnicos e com alta
virulecircncia pertenciam a espeacutecie Phomopsis viticola assim como os isolados descritos
em estudos anteriores como Phomopsis taacutexon 2 Eles tambeacutem puderam elucidar que
os isolados descritos na Austraacutelia como Phomopsis taacutexon 4 tratavam-se de Libertella
sp excluindo-o do complexo P viticola
Djaouida et al (2004) sequenciaram as regiotildees ITS1 58S e ITS2 e do gene
mitocondrial atp6 para avaliar a diversidade molecular de linhagens patogecircnicas contra
o girassol de Diaporthe helianthi (anamoacuterfico Phomopsis helianthi) isolados de
diferentes origens geograacuteficas
32
4 MATERIAL E MEacuteTODOS 41 Material Bioloacutegico 411 Fungos endofiacuteticos
Quarenta e oito isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp e um de Diaporthe sp
foram utilizados neste estudo (TABELA 1) Destes oito foram cedidos cordialmente pela
Dra Kaacutetia Rodriguez e foram isolados de Spondias mombin (Cajazeiro) Myracrodruon
urundeuva (Aroeira) e Aspidosperma tomentosum (Peroba-de-campos) e dois isolados
de Maytenus ilicifolia (Espinheira Santa) cedidos gentilmente pela Dra Socircnia Pileggi
Dezessete isolados foram obtidos de amostras de folhas de Schinus terebinthifolius
(Aroeira Vermelha) coletados em 2007 pelo MsC Jocinei Lima e fazem parte do banco
bioloacutegico do Laboratoacuterio de Geneacutetica de Microrganismos (LABGEM) da Universidade
Federal do Paranaacute Curitiba Paranaacute Vinte e um isolados de Phomopsis sp e um
isolado de Diaporthe sp foram obtidos como endoacutefitos de folhas e peciacuteolos de M
ilicifolia (espinheira santa) em quatro coletas de outubro de 2006 a julho de 2007 no
Centro Nacional de Pesquisa de Floresta (CNPF) da EMBRAPA (Empresa Brasileira de
Pesquisa Agropecuaacuteria) localizada no municiacutepio de Colombo Paranaacute Dois isolados de
Phomopsis patoacutegenos de soja foram utilizados como linhagens referecircncia (TABELA 1)
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUA)
Coacutedigo Hospedeiro Procedecircncia Isolados por SM9631 Spondias mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9713 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9638 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9714 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)MU0123 Myracrodruon urundeuva Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)AT9810 Aspidosperma Jardim Botacircnico do Dra Kaacutetia Rodriguez do
33
tomentosum Rio de JaneiroRJ IOC (FIOCRUZRJ)AT9811 A tomentosum Jardim Botacircnico do
Rio de JaneiroRJ Dra Kaacutetia Rodriguez do IOC (FIOCRUZRJ)
AT9906 A tomentosum Jardim Botacircnico do Rio de JaneiroRJ
Dra Kaacutetia Rodriguez do IOC (FIOCRUZRJ)
ES80J Maytenus ilicifolia ColomboPR Dra Socircnia A V Pileggi no LABGEMPR
ESPAC22 Maytenus ilicifolia ColomboPR Dra Socircnia A V Pileggi no LABGEMPR
A135 Schinus terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A113 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A115B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A323 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A123 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A131 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A216B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A126 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A333B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A134 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A132 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A333A S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A124 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A215A S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A116 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A334 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A321 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
ES2WF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2WC1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2KF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2NA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUACcedilAtildeO)
34
ES2AB1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESBA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESDF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFH1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFB2 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESGA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESGF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESIE1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESIA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJH1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJG1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJE1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJE2 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESKD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESRD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESSD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
PHO1 (Phomopsis longicolla)
Glycine max (L) Merr Mato Grosso Dr Aacutelvaro Almeida EMBRAPALondrina-PR
PHO19 Glycine max (L) Merr Roraima Dr Aacutelvaro Almeida EMBRAPALondrina-PR
FONTE O autor
NOTA patoacutegenos de soja
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUACcedilAtildeO)
35
412 Microrganismos usados para teste de antagonismo
Para determinar a atividade antimicrobiana dos isolados foram utilizadas as
seguintes linhagens teste G citricarpa linhagens PC1396 e PC3305 pertencentes ao
banco bioloacutegico do Laboratoacuterio de Geneacutetica de Microrganismos da Universidade
Federal do Paranaacute
413 Fungos endofiacuteticos utilizados para anaacutelise de variabilidade geneacutetica
Como grupo externo para anaacutelise de variabilidade geneacutetica por RAPD foram
utilizadas cinco linhagens de Pestalotiopsis sp (TABELA 2)
TABELA 2 ISOLADOS GRUPO EXTERNO PARA ANAacuteLISE DE VARIABILIDADE GENEacuteTICA POR RAPD
Coacutedigo Hospedeiro Procedecircncia Pestalotiopsis phothiniae Gustavia cf eliacuteptica Amazonia Pestalotiopsis neglecta voucher Muraya paniculata Amazonia Pestalotiopsis vismeae Maytenus ilicifolia Paranaacute Pestalotiopsis sp 3 Maytenus ilicifolia Paranaacute Pestalotiopsis sp 11 Maytenus ilicifolia Paranaacute FONTE O autor NOTA Isolado cedidos pelo Profordm Dr Joseacute Odair Pereira da Universidade Federal do Amazonas Isolados por Josiane Gomes Figueiredo no LABGEMPR 42 Meios de Cultura 421 Caldo MEB (Extrato de Malte)
Extrato de Malte 20g
Glicose 20g
Peptona 1g
Aacutegua destilada p1000mL
36
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
422 Meio AV (Aveia-Aacutegar) Aveia 300 g
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
A aveia foi fervida durante 30 minutos com metade do volume da aacutegua A
suspensatildeo foi filtrada com gaze Adicionou-se aacutegua para completar o volume O pH foi
ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a necessidade
Acrescentou-se o aacutegar
423 Meio BDA (Meio Batata-Dextrose-Aacutegar)
Batata 2000g
Dextrose 100g
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
As batatas foram cozidas em 500 mL de aacutegua destilada durante 20 minutos Em
seguida foram filtradas com gaze adicionou-se a dextrose ao caldo e completou-se
com aacutegua destilada para 1000 mL O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N
eou HCl 1N conforme a necessidade Acrescentou-se o aacutegar
37
424 Meio MC (Meio Completo) PONTECORVO et al 1953
NaNO3 60g
KH2PO4 15g
KCl 05g
MgSO47H2O 05g
FeSO4 002g
ZnSO4 002g
Glicose 100g
Peptona 20g
Extrato de levedura 20g
Caseiacutena hidrolisada 15g
Soluccedilatildeo de vitaminas 10mL
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
425 Meio MEA (Extrato de Malte) PATERSON e BRIDGE 1994
Extrato de Malte 20g
Glicose 20g
Peptona 1g
Agar 15g
Aacutegua destilada p1000mL
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
38
OBS Todos os meios de cultura foram autoclavados durante 20 minutos a 1 atm e
armazenados em temperatura ambiente
43 Soluccedilotildees e Reagentes 431 Clorofane ndash FenolClorofoacutermio (11)
432 Clorofil ndash ClorofoacutermioAacutelcool Isoamiacutelico (241)
433 Derozal Bayerreg - 1mg de carbendazim em 1mL de aacutegua destilada
434 Dodecil Sulfato de Soacutedio (SDS) 10 (pv) em aacutegua destilada
435 Fenol Saturado
Um volume de fenol cristalizado foi dissolvido em banho-maria a 60degC e
acrescentado um volume de tampatildeo Tris-HCl 02 M pH 80 Apoacutes agitaccedilatildeo por 30
minutos a fase aquosa foi retirada e entatildeo acrescentado um volume de tampatildeo Tris-
HCl 02 M pH 80 Este processo foi repetido ateacute atingir o pH desejado (pH 80) Em
seguida foi adicionado um volume final de 110 do tampatildeo Tris-HCl 02 M pH 80 e
estocado em frasco escuro a uma temperatura de 4degC usado apoacutes 48 horas
(SAMBROOK E MANIATS 1989)
436 Gel de Agarose 08 (pv) em Tampatildeo TBE 1x
437 Gel de Agarose15 (pv) em em Tampatildeo TBE 1x
438 Lactofenol azul Aacutecido laacutetico 200 g
Cristais de fenol 200 g
Glicerina 200 g
39
Azul de algodatildeo (Metyl Blue Difco) 005 g
Aacutegua destilada 200 mL
Os cristais de fenol foram derretidos em banho-maria Adicionaram-se os demais
componentes Depois de 24 horas filtrou-se e armazenou-se em frasco escuro
439 Marcador de peso molecular (DNA de fago lambda clivado com Hind III Gibco)
O marcador de peso molecular do DNA foi fornecido concentrado e no momento
do uso diluiu-se na proporccedilatildeo de 1 μL do marcador 1 μL do tampatildeo da amostra 4 μL
de aacutegua Milli-Q esterilizada Na corrida eletroforeacutetica foi utilizado 6 μL do marcador
4310 Marcador de peso molecular (DNA Ladder 100pb Ludwing Biotec)
O marcador de peso molecular foi fornecido concentrado e no momento do uso
diluiu-se na proporccedilatildeo de 1 μL do marcador 2 μL do tampatildeo da amostra 7 μL de aacutegua
Milli-Q autoclavada Na corrida eletroforeacutetica foram utilizados 15 μL do marcador
4311 Oligonucleotiacutedeos (Invitrogen)
Foi adicionado Tris-HCl 10 mM pH70 aos oligonucleotiacutedeos para obter uma
soluccedilatildeo estoque com 50 μM No momento do uso a soluccedilatildeo estoque foi diluiacuteda para
concentraccedilatildeo final de 4μM
4312 RNAse (invitrogen)
A soluccedilatildeo foi preparada na concentraccedilatildeo de 10 mM de Tris-HCl pH 75 e 15 mM
de NaCl Aqueceu-se a 100degC por 15 minutos e estocou-se a ndash 20degC
40
4313 Soluccedilatildeo de Vitaminas Aacutecido Nicotiacutenico 1000 mg
Aacutecido para Aminobenzoacuteico 100 mg
Biotina 02 mg
Piridoxina 500 mg
Riboflavina 1000 mg
Tiamina 500 mg
Aacutegua destilada esterilizada p 1000 mL
A soluccedilatildeo foi aquecida em banho-maria a 98degC por 15 minutos e armazenada em
frasco escuro previamente autoclavado a 4degC
4314 Soluccedilatildeo de NaCl 085 (pv) em aacutegua destilada
4315 Soluccedilatildeo Tween-80 01 (vv) em aacutegua destilada
4316 Soluccedilatildeo de Tetraciclina 5 (pv) em etanol absoluto Preparou-se a soluccedilatildeo sob
agitaccedilatildeo e estocou-se em frasco escuro a ndash 20degC
4317 Soluccedilatildeo de EDTA 05M em aacutegua destilada O pH foi ajustado para 80
adicionando-se NaOH 1N
4318 Soluccedilatildeo de brometo de etiacutedio 1 (pv) em aacutegua destilada O brometo de etiacutedio
foi dissolvido em aacutegua destilada agitou-se e estocou-se a temperatura ambiente
protegido de luz No momento do uso adicionou-se 3μL desta soluccedilatildeo a 100 mL de
tampatildeo TBE (1X)
41
4319 Tampatildeo TE (Tris-EDTA)
Tris-HCl pH 80 100 mM
EDTA pH 80 10 mM
4320 Tampatildeo de Extraccedilatildeo de DNA Tris-HCl pH 80 2000 mM
EDTA pH 80 250 mM
NaCl 2500 mM
SDS (pv) 1
O tampatildeo de Extraccedilatildeo foi preparado no momento do uso
4321 Tampatildeo da Amostra (6x)
Azul de bromofenol3 1000 mL
Glicerol 1035 mL
Aacutegua destilada p 50 mL
4322 Tampatildeo de corrida TBE 10x
Trizma base 54g
Aacutecido boacuterico 275g
EDTA 465g
Aacutegua Milli-Q p 500mL
A soluccedilatildeo foi autoclavada e estocada a temperatura ambiente No momento do
uso diluiu-se 10 vezes com aacutegua Milli-Q
42
44 Isolamento
A metodologia utilizada para o isolamento dos microrganismos endofiacuteticos foi
descrita por Petrini (1991) modificada por Glienke (1995) Os diferentes oacutergatildeos da
planta temperatura de incubaccedilatildeo nuacutemero de plantas e o de fragmentos plaqueados
estatildeo listados na tabela 3
Isolamento Eacutepoca do ano Oacutergatildeo da
planta Temperatura
de incubaccedilatildeo
Nuacutemero de Plantas
Nuacutemero de fragmentos plaqueados
1 Outubro de 2006 Folha 28deg C 20 360 2 Marccedilo de 2007 Folha 22-23deg C 30 540 3 Julho de 2007 Folha 22-23deg C 20 360 4 Julho de 2007 Peciacuteolo 22-23deg C 20 160
Total de fragmentos plaqueados 1360
FONTE O autor
Os fungos foram isolados de plantas aparentemente sadias com folhas sem
marcas arranhaduras ou ferimentos Apoacutes a coleta as folhas foram colocadas em
sacos plaacutesticos devidamente identificados em seguida as superfiacutecies das folhas foram
lavadas em aacutegua corrente com auxiacutelio de uma esponja para a remoccedilatildeo dos
microrganismos epifiacuteticos e outros contaminantes Os peciacuteolos foram vedados com
parafina derretida para evitar a entrada dos desinfetantes nos seus tecidos internos
desta forma preservando os endoacutefitos a serem isolados As folhas vedadas foram
mergulhadas em frascos com aacutegua destilada autoclavada sendo mantidos por 1
minuto em etanol 70 por 1 minuto em hipoclorito de soacutedio (NaOCl) a 3 por 6
minutos etanol 70 por 30 segundos e por uacuteltimo em aacutegua destilada autoclavada por
6 minutos Devido agrave dificuldade de isolar fungos do gecircnero Phomopsis nos isolamentos
1 e 2 foi reduzido o tempo de tratamento com hipoclorito de soacutedio para 4 minutos nos
isolamentos 3 e 4 (TABELA 3) As folhas foram cortadas em seis fragmentos de 5-7 mm
e os peciacuteolos foram cortados das folhas e oito deles foram transferidos para placas de
TABELA 3 EacutePOCAS DO ANO OacuteRGAtildeOS DA PLANTA CONDICcedilOtildeES DE INCUBACcedilAtildeO E NUacuteMERO DE FRAGMENTOS PLAQUEADOS NAS QUATRO COLETAS DE ENDOacuteFITOS DE ESPINHEIRA-SANTA
43
Petri (90 mm) contendo os meios de cultura BDA adicionados de Tetraciclina (10
mgmL) para impedir o crescimento bacteriano (ARAUJO et al 2002)
Como controle apoacutes o processo de desinfestaccedilatildeo foram inoculados 01 mL da
uacuteltima aacutegua autoclavada utilizada no tratamento em trecircs placas de Petri As placas
permaneceram incubadas nas mesmas condiccedilotildees do isolamento
45 Conservaccedilatildeo dos fungos
Os isolados foram estocados utilizando-se duas metodologias 1) em frascos
contendo meio de cultura BDA inclinado apoacutes sete dias de crescimento a 28degC foram
mantidos a 4degC realizando-se repiques mensalmente 2) em frascos contendo aacutegua
destilada esterilizada com 12 discos de 5 mm meio de cultura BDA contendo miceacutelios
Repetiu-se o procedimento a cada trecircs meses
46 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica
A caracterizaccedilatildeo macromorfoloacutegica dos isolados de Phomopsis foi realizada com
base na forma dos bordos crescimento micelial aspecto da colocircnia e a sua coloraccedilatildeo
no verso e reverso da placa em diferentes meios de cultura Discos de miceacutelio (8 mm)
provenientes de colocircnias de Phomopsis com sete dias de crescimento em meio de
cultura BDA foram inoculados no centro de placas de Petri com diferentes meios de
cultura Batata-dextrose-aacutegar (BDA) aveia-aacutegar (MAV) e extrato de malte-aacutegar (MEA)
Foram incubados durante 14 dias a 22ordmC sob luz contiacutenua Os ensaios foram
realizados em triplicata O diacircmetro das colocircnias foi medido a partir do terceiro dia de
crescimento ateacute o quinto dia quando alguns atingiram completamente as bordas da
placa de Petri
Para anaacutelise da micromorfologia foram avaliados os coniacutedios apoacutes 21 dias de
crescimento Os picniacutedios foram comprimidos entre a lacircmina e a lamiacutenula com uma
gota de lactofenol azul de algodatildeo possibilitando a observaccedilatildeo ao microscoacutepio oacuteptico
44
com aumento de 1000x O comprimento e largura dos coniacutedios foram medidos usando
uma reacutegua na objetiva com escala de 1μM
47 Obtenccedilatildeo de colocircnia monospoacuterica
Apoacutes os isolados terem sido identificados como pertencentes ao gecircnero
Phomopsis colocircnias monospoacutericas foram obtidas cultivando os isolados endofiacuteticos em
placas de Petri com meio BDA a 28degC Observou-se o crescimento da colocircnia e
monitorou-se com observaccedilatildeo em microscopia oacuteptica a produccedilatildeo de esporos Os
picniacutedios foram coletados e macerados em soluccedilatildeo de ldquoTween 80rdquo 01 A suspensatildeo
de esporos foi filtrada com seringas contendo latilde de vidro Em seguida adicionou-se 10
mL de soluccedilatildeo salina Centrifugou-se a soluccedilatildeo filtrada durante 4 minutos a 7000 rpm
Descartou-se o sobrenadante adicionou-se 400 μL de soluccedilatildeo salina para suspender o
precipitado onde ficaram contidos os esporos retirou-se 10 μL desta suspensatildeo sendo
a concentraccedilatildeo estimada em Cacircmara de Neubauer Quando necessaacuterio diluiu-se em
soluccedilatildeo salina para viabilizar a contagem dos esporos Foram semeados 100 μL de
suspensatildeo em uma placa de Petri contendo meio BDA espalhou-se com alccedila de
Drigalsky incubou-se a 28degC Colocircnias isoladas foram selecionadas e repicadas em
tubos com BDA inclinado que apoacutes crescimento por sete dias a 28ordmC foram mantidos a
4degC
48 Caracterizaccedilatildeo Molecular 481 Extraccedilatildeo do DNA (RAEDER e BRODA 1985 modificado por GLIENKE 1995)
O DNA genocircmico foi obtido de acordo com a metodologia descrita por Raeder e
Broda (1985) modificada por Glienke (1995) Os isolados endofiacuteticos de Phomopsis
foram cultivados em meio MEA durante cinco dias a 28degC O miceacutelio obtido a partir da
raspagem da colocircnia com espaacutetula esterilizada foi liofilizado e mantido em freezer ou na
45
sequumlecircncia macerados com adiccedilatildeo de nitrogecircnio liacutequido O material foi pesado e para
cada grama de miceacutelio acrescentou-se 1 mL de Tampatildeo de Extraccedilatildeo Incubou-se a
soluccedilatildeo homogeneizada durante 20 minutos em banho-maria a 70degC Acrescentou-se
um volume de fenol saturado misturaram-se as fases e centrifugou-se durante 15
minutos a 5000 rpm Coletou-se a fase aquosa colocou-se em um novo tubo e
adicionou-se a este um volume de Clorofane Centrifugou-se novamente sob as
mesmas condiccedilotildees anteriores Coletou-se a fase aquosa como na etapa anterior e
adicionou-se um volume de Clorofil repetindo-se o processo de centrifugaccedilatildeo sob as
mesmas condiccedilotildees Coletou-se a fase aquosa em um novo tubo e adicionou-se etanol
absoluto O material foi incubado a ndash 20ordmC durante uma hora Apoacutes este periacuteodo a
suspensatildeo foi centrifugada (10000 rpm por 20 min) desprezou-se o sobrenadante
Acrescentou-se 500 μL de etanol 70 centrifugou-se a 10000 rpm durante 5 minutos
descartou-se o aacutelcool 70 inverteu-se o tubo sobre uma folha de papel absorvente
para secar a borda do tubo e este secou a uma temperatura de 37degC durante 30
minutos Ressuspendeu-se o DNA com 200 μL de aacutegua milli-Q por uma hora
temperatura ambiente As amostras foram tratadas RNAse (30 μgmL) a 37degC por uma
hora
A concentraccedilatildeo de DNA foi estimada por meio de eletroforese em gel de agarose
08 utilizando como padratildeo de peso molecular o DNA do fago λ (Gibco) clivado com
HindIII com concentraccedilatildeo conhecida Apoacutes a eletroforese o gel foi corado com brometo
de etiacutedio observado sobre transiluminador de luz ultravioleta e fotodocumentado
482 RAPD
As soluccedilotildees foram realizadas de acordo com as condiccedilotildees descritas por Glienke-
Blanco et al (2002) onde foram utilizados 50ng de DNA tampatildeo PCR 1x 05U de Taq
polimerase 02mM de oligonucleotideos 02mM de dNTP 3mM de MgCl2 em um
volume final de 25microL Foi realizada uma preacutevia seleccedilatildeo usando-se os oligonucleotiacutedeos
46
da linha OPX11 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) OPX14 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) OPX19 (5rsquo
TCACCACGGT 3rsquo) e OPE 08 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) da Operon Technologiesreg
A amplificaccedilatildeo foi realizada com as condiccedilotildees descritas por Pioli et al (2003)
com modificaccedilotildees sendo cada reaccedilatildeo submetida a 40 ciclos apoacutes a desnaturaccedilatildeo
inicial a 940C por 4 minutos Cada ciclo consiste de 1 minuto a 940C 1 minuto e 30
segundos a 350C e 2 minutos a 720C
4821 Anaacutelise da Variabilidade Geneacutetica
Os produtos de amplificaccedilatildeo foram separados por eletroforese (3 Vcm) em gel
de agarose 15 e posteriormente corados por 20 minutos com soluccedilatildeo de brometo de
etiacutedio Os fragmentos amplificados foram visualizados em um transiluminador de luz
Ultravioleta e a imagem do gel documentada atraveacutes de sistema fotograacutefico Digi-doc it
O marcador de peso molecular utilizado foi o Ladder de 100 pb (Ludwing Biotec)
A anaacutelise da variabilidade geneacutetica foi realizada pelo agrupamento das linhagens
segundo os princiacutepios adotados em taxonomia numeacuterica utilizando o coeficiente de
similaridade de Jaccard que permite calcular similaridades com base em variaacuteveis
binaacuterias (0 para ausecircncia e 1 para presenccedila de banda) As bandas foram consideradas
como variaacuteveis enquanto as linhagens como unidades O coeficiente foi calculado
segundo a foacutermula J=MP onde M eacute o nuacutemero de concordacircncias positivas e P o
nuacutemero total de variaacuteveis menos concordacircncias negativas (SNEATH e SOKAL 1973)
Desta forma o coeficiente de similaridade Jaccard (J) leva em conta apenas as
discordacircncias e as concordacircncias positivas quanto agrave presenccedila ou ausecircncia de bandas
desconsiderando as concordacircncias negativas Quanto maior a semelhanccedila entre duas
linhagens maior eacute o valor de similaridade As unidades foram agrupadas atraveacutes do
meacutetodo UPGMA (Unweighted Pair-Group Method with Arithmetical Average) que eacute um
modelo de agrupamento hieraacuterquico e permite a construccedilatildeo de dendrogramas
(SNEATH e SOKAL 1973) Matrizes e dendrogramas foram elaborados usando o
software NTSYS (Numerical taxonomy system of multivariate programs) (ROHLF
1988)
47
Para verificar a consistecircncia dos agrupamentos verificados foi realizada uma
anaacutelise bootstrap segundo Felsenstein (1985) utilizando o software BOOD (COELHO
2005)
483 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
4831 Amplificaccedilatildeo
A reaccedilatildeo foi realizada com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D (TABELA 4) que
satildeo universais para fungos e permitem amplificar a regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do DNA
Ribossomal
Oligonucleotiacutedeos Sequumlecircncia
LS266 5 TTACGTCCCTGCCCTTTGTA 3
V9D 5GCATTCCCA AA C AACTCGAC 3rsquo
FONTE O autor
As condiccedilotildees da reaccedilatildeo foram realizadas de acordo com a descriccedilatildeo de White et
al (1990) com algumas modificaccedilotildees 50 ng de DNA tampatildeo PCR 1x 15U de Taq
DNA polimerase 08microM de oligonucleotiacutedeos 02mM de dNTP 3mM de MgCl2 para um
volume final de 50microL
A amplificaccedilatildeo foi realizada em um termociclador Eppendorf (Modelo
Mastercycler Gradiente) com desnaturaccedilatildeo inicial a 94degC por 2 minutos 30 ciclos de 30
segundos a 94degC 1 minuto a 56degC 1 minuto a 72degC seguida de extensatildeo final de 3
minutos a 72degC
TABELA 4 SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA AMPLIFICACcedilAtildeO DAREGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL
48
4832 Purificaccedilatildeo da PCR
Foram testadas duas metodologias de purificaccedilatildeo da reaccedilatildeo de PCR
48321 Purificaccedilatildeo com PEG
Aos produtos da amplificaccedilatildeo da PCR com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D
foram acrescentados 50microL de PEG os tubos foram incubados a 37ordmC por 30 minutos
em seguida foram centrifugados por 15 minutos a 14000rpm O sobrenadante foi
descartado com micropipeta Adicionou-se 125microL de Etanol 80 gelado apoacutes 1min os
tubos foram centrifugados por 2 min a 13000 rpm descartou-se o sobrenadante Foram
adicionados 125microL de Etanol 96 (gelado) descartou-se o sobrenadante O Etanol foi
evaporado em speed vac por 10min a 70ordmC O pellet foi ressuspendido em 15 microL de
aacutegua Milli-Q e misturado em seguida ficou agrave temperatura ambiente por pelo menos 2
horas
Para confirmaccedilatildeo da presenccedila do DNA na amostra 1microL foi submetido agrave
eletroforese em gel de agarose 15
48322 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio
Aos produtos da amplificaccedilatildeo da PCR com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D
foram acrescentados 34 microL de acetato de amocircnio (AcNH4) 75M e 100 microL de etanol
96 Os tubos ficaram em temperatura ambiente por 10 minutos e em seguida foram
centrifugados por 15 minutos a 14000rpm Os pellets resultantes foram lavados com
250 microL de etanol 70 (receacutem preparado) centrifugou-se por 15 minutos a 14000rpm e
descartou-se o etanol O pellet foi seco na estufa a 37ordmC por 30 mim e ressuspendidos
em 15microL de aacutegua Milli-Q
Para confirmaccedilatildeo da presenccedila do DNA na amostra 1microL foi submetido a
eletroforese em gel de agarose 15
49
4833 Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento
Foram realizadas trecircs reaccedilotildees de sequumlenciamento a primeira foi realizada
usando o produto tratado com PEG e nas duas posteriores usou-se o produto de PCR
tratado com acetato de amocircnia Para o restante da metodologia natildeo houve alteraccedilatildeo
O sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA foi realizado pelo
meacutetodo de terminaccedilatildeo de cadeia segundo Sanger et al (1977) utilizando a
incorporaccedilatildeo de dideoxinucleotiacutedeos fluorescentes em Sequumlenciador Automaacutetico de
DNA megaBACE
Para a reaccedilatildeo de sequumlenciamento foram utilizados cerca de 50ng da reaccedilatildeo de
PCR purificada 02 microM do oligonucleotiacutedeo ITS1 (TABELA 5) e 4microL de mistura para
sequumlecircnciamento ET (Kit ldquoDYEnamic ET Dye Terminator Cycle Sequencing Kit for
MegaBACErdquo da Amersham Biosciences) completando com aacutegua milli-Q para um
volume final de 10microL As mesmas condiccedilotildees foram aplicadas para o oligonucleotiacutedeo
ITS4 (TABELA 5)
FONTE O autor
A amplificaccedilatildeo foi realizada em um termociclador Eppendorf (Modelo
Mastercycler Gradient) seguindo uma desnaturaccedilatildeo inicial a 96degC por 1 minuto 30
ciclos de 10 segundos a 96degC 1 minuto e 5 segundos a 50degC 4 minutos a 60degC 20 min
a 8degC
Oligonucleotiacutedeos Sequumlecircncia
ITS1 5rsquoTCCGTAGGTGAACCTGCGG3rsquo
ITS4 5rsquoTCCTCCGCTTATTGATATGC3rsquo
TABELA 5 SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA AMPLIFICACcedilAtildeO DAREGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL
50
4834 Purificaccedilatildeo da Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento
Foram testadas trecircs metodologias de purificaccedilatildeo da reaccedilatildeo de sequumlenciamento
48341 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em tubos
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com PEG (item 38321) foram adicionados 40 microL de isopropanol 75
sendo precipitados por um spin down As amostras ficaram agrave temperatura ambiente por
20 minutos em seguida foram centrifugadas por 25 minutos a 13000 rpm e o
isopropanol foi removido por inversatildeo dos tubos Foram adicionados 200 microL de etanol
70 natildeo gelado e centrifugado por 5 minutos a 13000 rpm em seguida o etanol foi
removido com auxiacutelio de uma micropipeta e foi submetido a secagem em speed vac por
45 minutos a 60degC
Apoacutes esse tratamento cada amostra foi ressuspendida em 10 microL Loading
Solution e submetida agrave eletroforese em Sequumlenciador Automaacutetico de DNA modelo
megaBACE da Amersham Biosciences Com os seguintes paracircmetros voltagem de
injeccedilatildeo 2V tempo de injeccedilatildeo 80 segundos voltagem da corrida 8V por 160 minutos
48342 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em placa
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com acetato de amocircnio (item 38322) foram adicionados 40microL de
isopropanol 75 sendo precipitados por um spin down As amostras ficaram agrave
temperatura ambiente por 20 minutos e em seguida foram centrifugadas por 50
minutos a 4000 rpm O isopropanol foi removido por inversatildeo da placa Foram
adicionados 100microL de etanol 70 natildeo gelado e centrifugado por 30 minutos a 4000
rpm em seguida o etanol foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um spin a
300 rpm por 1 minuto Em seguida a placa ficou em estufa a 37degC durante 3 minutos
Apoacutes esse tratamento as amostras foram processadas como no item anterior
51
48343 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com acetato de amocircnio (item 38322) foram adicionados 1 microL de acetato
de amocircnio (AcNH4) 75M e 30 microL de etanol 96 Apoacutes a homogeneizaccedilatildeo por inversatildeo
30 vezes a placa foi centrifugada por 45 minutos a 2500 RCF a 4degC
O sobrenadante foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um spin a 500
RCF com a placa invertida sobre papel toalha O pellet foi lavado com 100 microL de etanol
70 (receacutem preparado natildeo gelado) Seguindo-se uma nova centrifugaccedilatildeo a 2500 RCF
por 45 minutos e o sobrenadante foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um
spin a 750 RCF com a placa invertida sobre papel toalha Em seguida a placa ficou em
estufa a 37degC durante 3 minutos
Apoacutes esse tratamento cada amostra foi ressuspendida e tratada como nos itens
anteriores
Todos os procedimentos desde a reaccedilatildeo de sequumlenciamento foram realizados
sob proteccedilatildeo de luz direta cobrindo a placa com papel alumiacutenio
4835 Ediccedilatildeo e Anaacutelise das Sequumlecircncias
As sequumlecircncias foram entatildeo alinhadas utilizando-se o programa CLUSTAL-W
versatildeo 17 (THOMPSON HIGGINS e GIBSON 1994) sendo realizada posterior
inspeccedilatildeo visual atraveacutes do programa BioEdit 7053 (HALL 1999) Apoacutes a ediccedilatildeo
alinhamento e anaacutelise preacutevia das sequumlecircncias estas foram submetidas ao software
MEGA 31 (KUMAR TAMURA NEI 2004) para obtenccedilatildeo das aacutervores filogeneacuteticas
baseadas em distacircncia A consistecircncia dos noacutes obtidos foi avaliada pelo procedimento
de bootstrap (FELSENSTEIN 1985) com 10000 reamostragens Foram utilizadas como
referecircncias linhagens de Phomopsis sp Diaporthe e Pestalotiopsis vismae (como
grupo externo) depositadas no GenBank (httpwwwncbinlmnihgov) (TABELA 6)
52
TABELA 6 LINHAGENS DE Phomopsis spp E DE Pestalotiopsis vismae UTILIZADAS COMO GRUPO EXTERNO
Espeacutecie Nuacutemero de acesso (GenBank)
Diaporthe Melonis AB105147 D melonis AB105148 Phomopsis longicolla AY857868 P longicolla AF000207 P camptothecae AY622996 D Phaselorum AF001024 D helianthi AJ312348 D helianthi AJ312363 D helianthi AF358441 Phomopsis sp P7 DQ235673 Phomopsis sp P3 DQ235669 P sojae AY050627 P chimonanthi AY622993 Phomopsis sp P4 DQ235670 D conorum AB201443 D conorum DQ116551 P theicola DQ286286 P theicola DQ286287 Phomopsis sp 1 AY485724 Phomopsis sp CBS DQ286285 Phomopsis sp Taxon 3 AF230762 Diaporthe AJ312359 Diaporthe AY745024 Pestalotiopsis vismae EF451801
FONTE O autor
49 Avaliaccedilatildeo da Atividade Antimicrobiana
491 Cultura Pareada
Para avaliar a atividade antimicrobiana dos 49 isolados de Phomopsis sp
endofiacuteticos (TABELA 1) contra o fitopatoacutegeno Guignardia citricarpa foi utilizado a
metodologia de Cultura Pareada (MARIANO1993) Os discos contendo miceacutelio eou
coniacutedios dos isolados endofiacuteticos ou dos fitopatoacutegenos ensaiados foram obtidos de
53
colocircnias crescidas em BDA durante sete dias a 28degC incubadas em estufa BOD e com
fotoperiacuteodo de 12 horas Apoacutes este periacuteodo foram retirados os discos da borda das
colocircnias com auxiacutelio de vazador de rolhas
Em placas de Petri contendo meio de cultura BDA colocou-se um disco (Oslash 8
mm) da cultura do fitopatoacutegeno G citricarpa Apoacutes trecircs dias de crescimento foi
adicionado no lado oposto um disco com o isolado de Phomopsis sp endofiacutetico a ser
avaliado ambos a 10 cm da borda Apoacutes o pareamento as placas foram vedadas com
filme de PVC e mantidas durante 14 dias em estufa BOD com fotoperiacuteodo de 12 h a
28degC Foi realizado um delineamento inteiramente casualizado com cinco repeticcedilotildees O
controle recebeu apenas o fitopatoacutegeno A avaliaccedilatildeo foi realizada mediante mediccedilatildeo do
diacircmetro da colocircnia comparando com o controle e observaccedilatildeo das interaccedilotildees entre as
colocircnias
Para determinar a porcentagem de inibiccedilatildeo do crescimento mediu-se o diacircmetro
das colocircnias do fitopatoacutegeno com 14 dias de crescimento subtraindo-se o diacircmetro do
inoacuteculo original Os caacutelculos foram realizados de acordo com Edginton et al (1971)
pela foacutermula
Onde Dc eacute o diacircmetro meacutedio da colocircnia do fitopatoacutegeno no controle e Dt eacute o
diacircmetro meacutedio da colocircnia do patoacutegeno nos tratamentos testados
492 Avaliaccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
Cobriu-se assepticamente toda a superfiacutecie do meio PDA inclusive nas bordas
com discos de papel celofane (Oslash11 cm) esterilizado A seguir foi inoculado no centro
sobre a superfiacutecie do papel celofane discos de aacutegar (Oslash8 mm) contendo miceacutelio do
isolado endofiacutetico As placas foram incubadas por quatro dias a temperatura de 28degC
as placas controles receberam apenas o fitopatoacutegeno incubados por 7 dias com
Dc -Dt
Dc
Porcentagem de inibiccedilatildeo (PI) = X 100
54
fotoperiacuteodo de 12 horas Mediu-se o diacircmetro da colocircnia e retirou-se o papel celofane
(juntamente com a colocircnia do isolado) Sobre a superfiacutecie de meio PDA inoculou-se um
disco de miceacutelio do fitopatoacutegeno a ser avaliado no centro da placa Foi realizado um
delineamento inteiramente casualizado com cinco repeticcedilotildees As placas foram
incubadas a 28degC com fotoperiacuteodo de 12 horas Apoacutes 7 e 14 dias mediu-se o
crescimento das colocircnias e comparou-se com o controle (ETHUR CEMBRANEL e
SILVA 2001 Adaptado por Figueiredo 2006)
493 Atividade dos Extratos Metanoacutelicos 4931 Obtenccedilatildeo dos extratos
Para avaliaccedilatildeo da atividade dos extratos metanoacutelicos foi utilizada a metodologia
descrita por Rodrigues Hesse e Werner (2000) com algumas modificaccedilotildees No
processo de fermentaccedilatildeo trecircs discos (Oslash 8 mm) dos 49 isolados endofiacuteticos de
Phomopsis (TABELA 1) foram inoculados em Erlenmeyer (250 mL) contendo 100 mL
de caldo extrato de malte Incubou-se durante 7 dias (110 rpm 28degC fotoperiacuteodo de 12
horas)
Apoacutes a fermentaccedilatildeo o miceacutelio foi separado do liacutequido fermentado por filtraccedilatildeo
em papel Whatman ndeg 4 Ao volume do filtrado obtido adicionou-se o mesmo volume
de acetato de etila (EtOAc) (Merck) em um balatildeo de separaccedilatildeo Agitou-se
vigorosamente por trecircs vezes e aguardou-se a formaccedilatildeo de duas camadas uma
aquosa na parte inferior e outra orgacircnica na parte superior Transferiu-se a fase
orgacircnica para um novo recipiente e submeteu-se a fase aquosa a mais uma extraccedilatildeo
com EtOAc Repetiu-se o procedimento por mais duas vezes Adicionou-se agrave fase
orgacircnica 5 de sulfato de soacutedio anidro e filtrou-se novamente com papel Whatman ndeg
4 Obteve-se extrato bruto seco passando a fase orgacircnica em rotaevaporador O extrato
foi pesado e diluiacutedo em metanol (10mgmL)
55
4932 Crescimento micelial
Foram obtidos discos (Oslash 12 mm) de colocircnias com 14 dias de crescimento em
meio completo da cultura do fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396 ou PC3305 Estes
foram inoculados no centro de placas de Petri contendo meio de cultura BDA A 10 cm
da borda em posiccedilatildeo oposta foi colocado um disco de papel filtro esterilizado (Oslash 5 mm)
e sobre este foram inoculados 100μL do extrato metanoacutelico a ser avaliado As placas
foram fechadas com filme de PVC e mantidas a 28degC fotoperiacuteodo de 12 horas em
BOD Avaliou-se o potencial de inibiccedilatildeo medindo-se o diacircmetro das colocircnias apoacutes sete
dias de crescimento comparando-se com o controle negativo onde foi inoculado aacutegua
destilada autoclavada ou metanol Como controle positivo foi utilizado fungicida Derosal reg (10 mgmL) (QUIROGA SAMPIETRO e VATTUONE 2001 adaptado por
FIGUEIREDO 2006)
410 Anaacutelise Estatiacutestica
Todos os experimentos foram realizados com delineamento inteiramente
casualizado (DIC) com 5 repeticcedilotildees As anaacutelises de variacircncia foram realizadas em
todas as etapas do trabalho Sempre que foi encontrado um valor significativo em
relaccedilatildeo ao teste F completou-se a anaacutelise com teste de Tukey para comparaccedilatildeo das
meacutedias utilizando software ASSISTAT (SILVA 1996 e SILVA 2002) ou o teste de Scott
Knott utilizando software SISVAR (FERREIRA 1994)
56
5 Resultados e Discussatildeo
51 Isolamento
Foram isolados 1005 endoacutefitos de folhas e peciacuteolos de 30 plantas de Espinheira
Santa (M ilicifolia) Destes 21 foram identificados a partir de anaacutelise em microscopia
oacuteptica como pertencentes ao gecircnero Phomopsis A tabela 7 compara os resultados
obtidos quanto agrave proporccedilatildeo de isolamento de Phomopsis sobre os diferentes tecidos da
planta nos quatro isolamentos realizados A frequumlecircncia dos isolamentos foi calculada
de acordo com Souza et al (2004)
TABELA 7 PORCENTAGEM DE ISOLAMENTO DE Phomopsis ENDOFIacuteTICOS DE PLANTAS DE ESPINHEIRA SANTA
Isolamento Oacutergatildeo da planta
Nuacutemero de fragmentos plaqueados
Endoacutefitos Nuacutemero ()
Phomopsis Nuacutemero ()
Frequumlecircncia isolamento Phomopsis
1 Folha 360 140 (39) 0 (0) 0
2 Folha 540 310 (57) 2 (064) 037
3 Folha 360 375 (gt100) 3 (08) 083
TOTAL FOLHA
1260 825 (65) 5 (061) 04
4 Peciacuteolo 160 180 (gt100) 16 (89) 100
TOTAL 1420 1005 (71) 21 (209) 15 FONTE O Autor
Observando a tabela 7 percebe-se claramente que a partir de peciacuteolo a
frequumlecircncia de isolamento de Phomopsis (10) foi maior do que em folhas (04) tanto
em relaccedilatildeo ao nuacutemero de fragmentos plaqueados quanto em comparaccedilatildeo ao nuacutemero
total de endoacutefitos isolados (89 contra 061) Provavelmente devido agrave menor
frequumlecircncia de fungos filamentosos de crescimento raacutepido que pudessem sobrepor ao
crescimento de Phomopsis Segundo Souza et al (2004) as folhas dos vegetais
57
hospedeiros satildeo provavelmente as portas de entrada para os microrganismos pois
apresentam tecidos mais fraacutegeis e expostos pela presenccedila de estocircmatos ocorrendo
posterior migraccedilatildeo para outros tecidos da planta O mesmo jaacute foi relatado em espeacutecies
de Citrus para o isolamento de fungos do gecircnero Guignardia sendo o peciacuteolo o tecido
de mais faacutecil isolamento deste gecircnero por apresentar menor colonizaccedilatildeo por
Colletotrichum (BLANCO 1999)
Assim sugere-se que em trabalhos futuros de isolamento de Phomopsis sejam
tambeacutem utilizados os peciacuteolos especialmente em Espinheira Santa
Foram tambeacutem obtidos 18 isolados de Phomopsis de trecircs plantas de S
terebinthifolius (Aroeira Vermelha) representando uma frequumlecircncia de 11 Em Aroeira
a frequumlecircncia do isolamento de Phomopsis em folha foi maior do que em Espinheira
Santa em todos os isolamentos realizados
Fungos do gecircnero Phomopsis Phyllosticta e Colletotrichum satildeo comumente
isolados como endoacutefitos de tecidos de diferentes espeacutecies de plantas em muitos casos
esses fungos estatildeo juntos num mesmo hospedeiro (PANDEY et al 2003 LU et al
2004)
O gecircnero Phomopsis tem sido descrito com grande frequumlecircncia em isolamentos
de diversas plantas (UECKER 1988 BODDY e GRIFFITH 1989) Azevedo et al (2000)
apresentaram algumas plantas hospedeiras de onde jaacute foram isoladas espeacutecies de
Phomopsis entre elas Sabal bermudana Trachycarpus fortunei Cavendishia
pubescens Stylosanthes guianensis Anacardium occidentale e Mangifera indica
Corrado e Rodrigues (2004) isolaram endofiacuteticos de Phomopsis das plantas medicinais
Spondias mombin e Aspidosperma tomentosun
Bussabam et al (2001) isolaram entre outros fungos o gecircnero Phomopsis
endoacutefitos de folhas pseudocaules e rizomas de gengibre (Amomum siamense Criab)
coletadas em dois locais na Tailacircndia Silva et al (2006) isolou Phomopsis como
endoacutefito de graviola (Annona muricata L) e pinha (Annona squamosa L)
Alguns dos relatos citam o gecircnero Phomopsis como fitopatoacutegeno isolado de
diversas espeacutecies de Citrus Mangifera indica (Mangueira) Glycine max (Soja) Ficus
carica (Figueira) e Anacardium occidentale (Cajueiro) entre muitas outras plantas
58
(CENARGEN EMBRAPA 2005) Natildeo haacute relatos de gecircnero Phomopsis como
fitopatoacutegeno das plantas medicinais utilizadas no presente trabalho Aspidosperma
tomentosum Spondias mombin e Maytenus ilicifolia assim como em Aroeira Vermelha
(Schinus terebinthifolius) Entretanto o gecircnero foi relatado por Anjos Charchar e
Guimaratildees (2001) como patoacutegeno em culturas de Aroeira (Myracrodruon urundeuva)
causando sintomas de queimas nas folhas que consiste de uma necrose escura
predominantemente nos bordos dos foliacuteolos
52 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de Phomopsis
A caracterizaccedilatildeo macromorfoloacutegica das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de
Phomopsis sp foi realizada de acordo com a forma dos bordos crescimento micelial
aspecto da colocircnia e a sua coloraccedilatildeo no verso e reverso da placa em diferentes meios
de cultura (FIGURAS 1 a 4 ANEXO 12)
A coloraccedilatildeo das colocircnias dos isolados de Phomopsis apresentaram elevada
variabilidade tanto no verso quanto reverso da placa nos trecircs meios de cultura
ensaiados Em geral variou entre combinaccedilotildees das cores branca preto verde claro e
oliva amarelo marrom marrom avermelhado cinza e bege
Os isolados de Phomopsis apresentaram no verso da placa com meio Aveia (AV)
coloraccedilatildeo branca alguns isolados apresentaram combinaccedilotildees de branco com marrom
verde amarelo e cinza exceto os isolados ESJG1 ES2KF1 ES2WF1 ESPAC22
ES80J ESFB2 ESGF1 A134 A333B que diferiram dos demais por apresentarem
coloraccedilatildeo intensa e o isolado A116 de coloraccedilatildeo marrom e verde (FIGURAS 1 a 4)
Nos meios de cultura MEA e BDA observou-se que a coloraccedilatildeo no verso da
placa foi mais variaacutevel do que no meio Aveia Igualmente o reverso das placas
contendo as colocircnias de Phomopsis mostrou-se bastante variaacutevel entre os isolados e
os trecircs meios de cultura utilizados havendo variaccedilatildeo intra-individual com coloraccedilotildees
branca preto verde claro e oliva amarelo marrom marrom avermelhado cinza e
bege
59
A morfologia micelial nos meios de cultura ensaiados variou de granuloso aeacutereo
a algodonoso Nos meios de cultura MEA e BDA todos os isolados apresentaram
miceacutelio denso poreacutem no meio AV esses dois tipos de miceacutelio variaram de denso a ralo
A maioria dos isolados de Phomopsis analisados possuem miceacutelio granuloso aeacutereo em
todos os meios ensaiados exceto os isolados SM9638 SM9631 e Phomopsis longicolla
PHO1 que apresentam miceacutelio algodonoso Observou-se variaccedilatildeo intra-individual na
morfologia micelial entre os meios de cultura nos isolados A333B e A323 que
apresentaram miceacutelio algodoso no meio AV e granuloso aeacutereo nos meios MEA e BDA
Igualmente os isolados A123 e SM9811 apresentaram-se algodonoso no meio MEA e
granuloso aeacutereo nos meios AV e BDA
O aspecto dos bordos das colocircnias mostrou variaccedilatildeo intra-individual entre os
diferentes meios de cultura para a maioria dos isolados exceto os isolados de
Phomopsis SM9638 ESKD1 ESPAC22 A323 A113 A331 A115 que apresentaram
bordos regulares e os isolados SM9714 ES2WC1 ESJG1 A126 A333A PHO1
(Phomopsis longicolla) e o isolado PHO19 que possuem bordos irregulares em todos os
meios utilizados
FIGURA 1 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis DE Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT 9811 e AT 9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
AV MEA BDA
M
U 0
123
S
M97
13
60
FIGURA 1 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE
Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT9811 e AT9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
SM
9631
SM
9638
AT
9811
A
T990
6
AT9
810
SM
9714
AV MEA BDA
61
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
A32
1
A
132
A21
5A
A
113
A
323
A13
1
AV MEA BDA
62
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
A
135
A11
6
A
115B
A
124
A12
6
A21
6 B
AV MEA BDA
63
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
A
134
A33
3A
A
334
A12
3
A33
3B
AV MEA BDA
64
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
E
S2N
A1
E
SIE1
ES
GA
1
ES8
0J
E
SPA
C22
ES2
WF1
AV MEA BDA
65
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
ESFB
2
ESJ
D1
ESK
D1
E
SJH
1
ESD
F1
E
S2A
B1
AV MEA BDA
66
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
E
S2K
F1
ESJ
E2
ESJ
E1
ESG
F1
ESF
H1
ESF
F1
AV MEA BDA
67
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis E Diaporthe (BA1) ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
ESB
A1
ESI
A1
ES
RD
1
E
S2W
C1
ESS
D1
ES
JG1
AV MEA BDA
68
Na avaliaccedilatildeo do diacircmetro das colocircnias houve diferenccedila significativa entre os
isolados de Phomopsis dentro dos diversos meios de cultura avaliados Entre os meios
de cultura MEA BDA e AV houve diferenccedila significativa de crescimento em geral o
crescimento micelial foi menor no meio AV (ANEXO 1) Portanto os grupos de
Phomopsis formados quando considerada agrave taxa de crescimento foram inferidos para
os meios de cultura separadamente
Na figura 5 observa-se o resultado do diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados
apoacutes 5 dias de crescimento em meio MEA Os isolados foram reunidos em oito grupos
diferentes A A323 SM9631 ESKD1 A134 e ESIE1 B A116 A334 A215A ESSD1
C A321 MU0123 ESGF1 ESRD1 AT9811 SM9713 A123 ESJH1 ESDF1 A131
ESIA1 ESBA1 ESJD1 D A333A A135 ES2NA1 A124 A132 SM9714 ESFB2 E A115B ES2AB1 A216B A113 F PHO1 SM9638 ES2WF1 A126 ESJE1 ESPAC22
ESFF1 ES2KF1 ESJG1 ES80J G ESJE2 ESFH1 AT9906 ESGA1 AT9810
ES2WC1 Os isolados do grupo A apresentaram os maiores valores de crescimento
radial em torno de 70 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) e o grupo H apresentou menor
crescimento micelial em torno de 20 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) (ANEXO 4)
FIGURA 4 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS PATOGEcircNICOS OBTIDOS DE Glycine max EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
PH
O19
P
lon
gico
lla (P
HO
1) AV MEA BDA
69
O diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados apoacutes 5 dias de crescimento em meio
BDA estaacute representado na figura 6 Os isolados foram reunidos em seis grupos
diferentes A ESBA1 A323 A215A ESSD1 SM9713 ESGF1 SM9631 ESJD1
ESKD1 A334 B ESDF1 A132 A123 A333A MU0123 ESJH1 A321 ESRD1 A116
A134 A115B C ESIA1 A131 SM9714 A135 ESIE1 ESFB2 A124 ESPAC22
ES2KF1 A113 ESJE1 D ESJE2 ESFH1 ESJG1 ES2WC1 PHO1 SM9638
ES2NA1 ES2AB1 ESFF1 AT9811 AT9810 ES2WF1 A126 PHO19 A216B ES80J
ESGA1 E AT9906 F A333B Em geral a taxa de crescimento foi maior em meio BDA Os isolados do grupo A
apresentaram as maiores taxas de crescimento em torno de 70 cm (apoacutes 5 dias de
FONTE O autor
000
100
200
300
400
500
600
700
800
EB A F HD G C
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 4) A A323 SM9631 ESKD1 A134 e ESIE1 B A116 A334 A215A ESSD1 C A321 MU0123 ESGF1 ESRD1 AT9811 SM9713 A123 ESJH1 ESDF1 A131 ESIA1 ESBA1 ESJD1 D A333A A135 ES2NA1 A124 A132 SM9714 ESFB2 E A115B ES2AB1 A216B A113 F PHO1 SM9638 ES2WF1 A126 ESJE1 ESPAC22 ESFF1 ES2KF1 ESJG1 ES80J G ESJE2 ESFH1 AT9906 ESGA1 AT9810 ES2WC1
FIGURA 5 DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO MEA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
Diacirc
met
ro e
m c
m
70
crescimento) e o grupo F representado pelo isolado A333B apresentou menor
crescimento micelial (ANEXO 2)
Estudos sobre fisiologia envolvendo o gecircnero Phomopsis satildeo escassos Almeida
(1982) estudando Phomopsis sojae isolados de sementes de soja em seis diferentes
meios de cultura e nos regimes de luminosidade claro contiacutenuo e escuro contiacutenuo
verificou maior crescimento do fungo nos meios de haste de soja extrato de malte
aveia cenoura e BDA natildeo houve efeito da luz sobre o crescimento micelial de nenhum
dos isolados
Gurgel Menezes e Coelho (1997) verificaram maior crescimento micelial de P
anacardii e P mangiferae no meio BDA e uma melhor esporulaccedilatildeo nos meios BDA e V8
(Campbell CO) apoacutes 15 e 30 dias de incubaccedilatildeo No presente trabalho foi verificado
maior crescimento dos isolados de Phomopsis em meio BDA seguido do meio MEA em
meio AV a taxa de crescimento foi inferior
FONTE O autor
000
100
200
300
400
500
600
700
B A FEC D
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 2) A ESBA1 A323 A215A ESSD1 SM9713 ESGF1 SM9631 ESJD1 ESKD1 A334 B ESDF1 A132 A123 A333A MU0123 ESJH1 A321 ESRD1 A116 A134 A115B C ESIA1 A131 SM9714 A135 ESIE1 ESFB2 A124 ESPAC22 ES2KF1 A113 ESJE1 D ESJE2 ESFH1 ESJG1 ES2WC1 PHO1 SM9638 ES2NA1 ES2AB1 ESFF1 AT9811 AT9810 ES2WF1 A126 PHO19 A216B ES80J ESGA1 E AT9906 F A333B
FIGURA 6 DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
Diacirc
met
ro e
m c
m
71
O diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados apoacutes 5 dias de crescimento em meio
AV estaacute representado na figura 7 Os isolados foram reunidos em sete grupos
diferentes A ESKD1 B ESJE2 A123 C ESJE1 SM9638 AT9811 SM9713 PHO1
ESBA1 SM9631 ESFB2 A334 A323 MU0123 D A333A ESJD1 ESGF1 A116 E ESPAC22 ESDF1 A321 A132 ES2KF1 ESJG1 ESRD1 PHO19 A115B A124
ESFF1 A134 ESIE1 A135 A131 A113 ES2WF1 ESSD1 ESIA1 F ESGA1 ESJH1
ESFH1 AT9906 ES2NA1 A216B ES80J A215A G AT9810 A333B ES2AB1
SM9714 ES2WC1 A126 Apenas o isolado ESKD1 representante do grupo A
apresentou taxa de crescimento raacutepida de 70 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) a
maioria dos isolados tiveram crescimento lento (ANEXO 3)
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 3) A ESKD1 B ESJE2 A123 C ESJE1 SM9638 AT9811 SM9713 PHO1 ESBA1 SM9631 ESFB2 A334 A323 0123 D A333A ESJD1 ESGF1 A116 E ESPAC22 ESDF1 A321 A132 ES2KF1 ESJG1 ESRD1 PHO19 A115B A124 ESFF1 A134 ESIE1 A135 A131 A113 ES2WF1 ESSD1 ESIA1 F ESGA1 ESJH1 ESFH1 AT9906 ES2NA1 A216B ES80J A215A G AT9810 A333B ES2AB1 SM9714 ES2WC1 A126
FIGURA 7 AVALIACcedilAtildeO DAS MEacuteDIAS DO DIAcircMETRO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO AV APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
000
100
200
300
400
500
600
700
B A F C GD E
FONTE O autor
Diacirc
met
ro e
m c
m
72
Foi observado que dos 49 endoacutefitos e os 2 isolados patogecircnicos de Phomopsis
spp avaliados (TABELA 1) 27 apresentaram variaccedilatildeo intra-individual quanto ao
crescimento nos diversos meios Por exemplo os isolados A323 e SM9631 em meio
MEA e BDA pertencem ao grupo A e no meio AV ao grupo C Os outros 24 isolados
natildeo apresentaram variaccedilatildeo entre os agrupamentos formados nos diferentes meios
Os isolados que se agrupam baseados no crescimento nos trecircs meios natildeo satildeo
os mesmos quando se considera a cor do verso e reverso da placa assim como natildeo
satildeo semelhantes aos agrupamentos formados quando comparados com os bordos e
aspecto da colocircnia
Gurgel Menezes e Coelho (2002) estudando Phomopsis anacardii e Phomopsis
mangiferae observaram maior produccedilatildeo de picniacutedios nos meios de extrato de malte
aveia haste de soja e cenoura somente quando mantidos sob luz contiacutenua A
produccedilatildeo de picniacutedios foi reduzida em alternacircncia de luz e quase nula no escuro
contiacutenuo No presente trabalho foi observado que a maioria dos isolados formaram
estruturas de reproduccedilatildeo com o uso de luz contiacutenua em baixas temperaturas 22 a 25 degC
e pH 58 nos trecircs meios avaliados apoacutes 14 dias de crescimento
Segundo Cochrane (1959) e Griffin (1994) a luminosidade promove formaccedilatildeo
das estruturas reprodutivas assim como estatildeo diretamente ligadas agrave composiccedilatildeo do
meio de cultura atraveacutes de diferentes reaccedilotildees enzimaacuteticas Leonian (1924) descreve
que o efeito da luz como indutor da reproduccedilatildeo de fungos estaacute associado agraves
modificaccedilotildees que ocorrem no seu metabolismo celular combinados aos elementos que
constituem o meio de cultura
Timnick Lilly e Barnett (1951) detectaram efeito positivo da luz para a formaccedilatildeo
de picniacutedios ao verificarem que o regime escuro contiacutenuo inibia a formaccedilatildeo de picniacutedios
de Diaporthe phaseolorum Resultados semelhantes foram observados por Correcirca
(1995) avaliando Phomopsis sp provenientes de sementes florestais observou uma
melhor esporulaccedilatildeo em meio aveia sob regime de claro contiacutenuo por 12 dias de
incubaccedilatildeo
Na anaacutelise da micromorfologia observou-se que os isolados apresentavam
estruturas de reproduccedilatildeo a partir de 14 dias ateacute 21 dias de crescimento (FIGURA 8)
73
exceto os isolados SM9811 SM9638 e Phomopsis longicolla PHO1 que natildeo formaram
estruturas de reproduccedilatildeo em nenhum dos meios ensaiados Os isolados SM9811 e
SM9638 foram descritos como pertencentes ao gecircnero Phomopsis e depositados na
Coleccedilatildeo de Cultura de Fungos do Departamento de Micologia (IOC) da FIOCRUZ e
foram descritos por Rodrigues e Samules (1999) O isolado PHO1 foi isolado e
identificado pela EMBRAPA (Londrina-PR) como pertencente agrave espeacutecie P longicolla
Os coniacutedios do tipo alfa foram menos frequumlentes do que os do tipo beta Em
meio de cultura BDA apenas 11 isolados apresentaram o tipo de esporo alfa jaacute os beta
coniacutedios filiformes curvos na extremidade ou ligeiramente curvos foram visualizados
em quase todos os isolados de Phomopsis spp
Foi observado que para os isolados que apresentaram os dois tipos de esporos
foram visualizados com 14 dias de crescimento apenas alfa coniacutedios hialinos com
vacuacuteolos nas extremidades de forma ovoacuteide e natildeo foram visualizados beta coniacutedios
Apoacutes 21 dias os dois tipos de esporos foram visualizados nesses isolados (FIGURA 8a
e 8c) Alguns alfa coniacutedios apresentavam mais de dois vacuacuteolos nas extremidades
(FIGURA 8b) Essa variaccedilatildeo intra-individual tambeacutem foi observada em relaccedilatildeo agrave
morfologia do beta coniacutedio em que alguns apresentam curvatura na extremidade
outros ligeiramente curvos (FIGURA 8c)
NOTA A - isolado SM9631 aumento de 400x B- isolado SM9714 aumento de 1000x C- isolado SM9713 aumento de 400x microscopia oacuteptica Setas pretas indicam os alfa coniacutedios e setas vermelhas os beta coniacutedios Escala em 1μM
FONTE O autor
FIGURA 8 FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis EM BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
A B C
74
Alfa coniacutedios do isolado SM9713 provenientes dos meios de cultura AV (FIGURA
9a) e BDA (FIGURA 9e) apresentaram grande variaccedilatildeo morfoloacutegica Na figura 9 no
mesmo conidioacuteforo eacute visiacutevel a diferenccedila morfoloacutegica do alfa coniacutedio Na figura 9e o
conidioacuteforo apresenta alfa coniacutedios com mais de duas gotas nas extremidades (SETA 1)
e alfa coniacutedios com apenas dois vacuacuteolos (SETA 2) Em maior aumento eacute possiacutevel
perceber que existem variaccedilotildees de dois trecircs e ateacute quatro vacuacuteolos no mesmo isolado
(FIGURA 9a 9b e 9c) Tal variaccedilatildeo pode ser decorrente de diferenciados graus de
maturaccedilatildeo destes coniacutedios o que dificulta a caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de espeacutecies do
gecircnero Phomopsis
A medida do comprimento dos beta coniacutedios em meio BDA mostrou que os
isolados apresentam diferenccedilas estatiacutesticas significativas reunindo os isolados em 15
FIGURA 9 FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DO ISOLADO SM9713 EM MEIOS BDA e AV APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
1 2 A
B C D
E
NOTA A - em meio AV aumento de 400x B C e D- em meio BDA aumento de 650x E- em meio BDA aumento de 400x Microscopia oacutetica
FONTE O autor
75
grupos diferentes (ANEXO 5) A (AT9906 AT8010) B (ESFH1) C (ESPAC22 ES2KF1
SM9631) D (ESGA1 PHO19) E (ES80J) F (ESRD1) G (ESJE2 ESFB2 ESJE1) H
(ESJG1) I (A323) J (A333A A135 A124 A126 A132 A131 A134 A115B ESIE1) K
(ES2WC1 ES2WF1) L (SM9713 A334 ESIA1 A333B ESFF1 ESGF1) M (ES2AB1
A123 A113 ESJD1) N (ESKD1 ES2NA1 A215A SM9714) O (ESSD1 ESJH1
MU0123 A321 ESDF1 A216B A116) (FIGURA 10) Os isolados tambeacutem natildeo se
agrupam de acordo com os outros criteacuterios avaliados como a cor do verso e reverso
da placa diacircmetro das colocircnias assim como natildeo satildeo semelhantes aos agrupamentos
formados quando comparados com os bordos e aspecto do miceacutelio
NOTA As letras maiuacutesculas indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo agrave meacutedia do comprimento de beta coniacutedio dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Isolados de cada agrupamento A (AT9906 AT8010) B (ESFH1) C (ESPAC22 ES2KF1 SM9631) D (ESGA1 PHO19) E (ES80J) F (ESRD1) G (ESJE2 ESFB2 ESJE1) H (ESJG1) I (A323) J (A333A A135 A124 A126 A132 A131 A134 A115B ESIE1) K (ES2WC1 ES2WF1) L (SM9713 A334 ESIA1 A333B ESFF1 ESGF1) M (ES2AB1 A123 A113 ESJD1) N (ESKD1 ES2NA1 A215A SM9714) O (ESSD1 ESJH1 MU0123 A321 ESDF1 A216B A116) As meacutedias seguidas pela mesma letra minuacutescula natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 5)
FIGURA 10 COMPRIMENTO DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO EM BDA A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
0
5
10
15
20
25
30
35
40
B C E F MID LJA N H K OG
a
b
c
cd
de
ef
efg
fgh
fghi
ghij
ghil
hil
him
im
m
FONTE O autor
Diacirc
met
ro e
m μ
M
76
Desta forma as caracteriacutesticas macroscoacutepicas (coloraccedilatildeo bordos e tipos de
miceacutelio da colocircnia) e de micromorfologia dos coniacutedios avaliadas isoladamente natildeo
permitiram propor identificaccedilatildeo das espeacutecies dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis
Sendo assim optou-se por realizar uma anaacutelise polifaacutesica agrupando as caracteriacutesticas
morfoloacutegicas analisadas tais como crescimento micelial coloraccedilatildeo e bordos da
colocircnia tipo de miceacutelio comprimento dos coniacutedios e tipos de coniacutedios produzidos em
deferentes meios Essa metodologia foi descrita por Figueiredo et al (2006) para
caracterizar isolados de Pestalotiopsis Para todas estas caracteriacutesticas foram
atribuiacutedas notas de 0 ou 1 onde 0 representou ausecircncia da caracteriacutestica e 1 a
presenccedila (ANEXO 12) Os resultados compuseram uma matriz binaacuteria analisada pelo
software NTSYS (coeficiente Jaccard) com o agrupamento pelo meacutetodo UPGMA
permitindo a construccedilatildeo de um dendrograma de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
De acordo com o dendrograma de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
sugere-se a formaccedilatildeo de seis grupos com elevados valores de bootstrap que conferem
robustez aos agrupamentos No grupo I estatildeo reunidos os isolados MU0123 e
SM9713 no grupo II os isolados AT9810 e AT9906 no grupo III os isolados ESJE1 e
ESJE2 no grupo IV os isolados ESFB2 e ESFF1 no grupo V os isolados ES2KF1 e
ESJG1 e no grupo VI os isolados ES2WF1 e ES80J Os demais agrupamentos
formados natildeo foram considerados pois apresentam baixos valores de bootstrap e ou
baixos valores de similaridade morfoloacutegica
Os dados mostram elevada variabilidade morfoloacutegica dos isolados de Phomopsis
avaliados o que dificulta a delimitaccedilatildeo de espeacutecies apenas com dados morfoloacutegicos
Segundo Parmeter (1958) e Rehner e Uecker (1994) o alto grau de plasticidade das
caracteriacutesticas morfoloacutegicas impossibilita a delimitaccedilatildeo de espeacutecies no gecircnero
Phomopsis Gamboa-Gaitaacuten Laureano e Bayman (2005) estudando isolados de
Phomopsis endofiacuteticos de Guarea guidonia (Meliaceae) de duas regiotildees de Luquillo
(Porto Rico) relataram elevados niacuteveis de variabilidade morfoloacutegica entre os isolados
avaliados Eles observaram uma mistura de diferentes morfotipos em ambas as regiotildees
estudadas
77
Neste trabalho foi observado um elevado niacutevel de variabilidade morfoloacutegica dos
isolados de Phomopsis spp obtidos de seis diferentes espeacutecies de plantas e regiotildees
geograacuteficas Natildeo foi possiacutevel observar estruturaccedilatildeo populacional dos isolados em
funccedilatildeo da espeacutecie hospedeira Na figura 12 os isolados de M ilicifolia encontram-se na
coloraccedilatildeo rosa e distribuiacutedos ao longo dos dois eixos que representam os dois
principais componentes de variaccedilatildeo Igualmente os isolados em preto representam as
linhagens provindas de S terebinthifolius e tambeacutem encontram-se dispersos Tais
resultados natildeo surpreendem pois eacute possiacutevel que a mesma espeacutecie de Phomopsis seja
isolada em diferentes hospedeiros
NOTA I II III IV V VI satildeo grupos formados para inferir sobre a diversidade dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis Os valores a esquerda dos noacutes indicam os valores de bootstrap
COEFICIEcircNTE DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA
FIGURA 11 DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp
FONTE O autor
r = 07577 (P= 00001)
V VI
IV
I II III
78
FONTE O autor FIGURA 12 ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp NOTA Isolados em coloraccedilatildeo rosa obtidos de Maytenus ilicifolia Em preto Schinus terebinthifolius Em azul escuro Myracrodruon urundeuva Em azul claro Aspidosperma tomentosun Em verde Spondias mombin 53 Caracterizaccedilatildeo Molecular de Phomopsis spp 531 RAPD
Os isolados de Phomopsis spp foram avaliados por meio de marcadores
moleculares do tipo RAPD a fim de verificar a magnitude da variabilidade geneacutetica
Foram analisados por esta metodologia 54 isolados Destes 47 Phomopsis spp
endoacutefitos os isolados MU0123 e SM9638 natildeo amplificaram em nenhuma das
condiccedilotildees ensaiadas dois isolados de Phomopsis patoacutegenos de soja e cinco isolados
de Pestalotiopsis Foram utilizados 4 oligonucleotiacutedeos gerando 99 bandas O tamanho
dos fragmentos amplificados variou de 400 a 2600 pb e podem ser visualizados nas
Figuras 13 a 16
79
FIG
UR
A 1
4 P
ER
FIL
DE
AM
PLI
FIC
ACcedil
AtildeO
CO
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OLI
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FIG
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A 1
3 P
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lotio
psis
80
FIG
UR
A 1
5 P
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PLI
FIC
ACcedil
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CLE
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19 D
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CO
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lotio
psis
FIG
UR
A 1
6 P
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FIL
DE
AM
PLI
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NU
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08 D
OS
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CO
S D
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hom
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s sp
E
GR
UP
O E
XTE
RN
O P
esta
lotio
psis
81
A anaacutelise destes marcadores RAPD permitiu a construccedilatildeo de um dendrograma
de similaridade geneacutetica (FIGURA 17) O coeficiente de correlaccedilatildeo das matrizes de
similaridade geneacutetica e cofeneacutetica obtido pelo teste de Mantel foi elevado (r=08157 e
p=00001) indicando que o dendrograma representa de forma adequada a matriz de
similaridade geneacutetica obtida pelos marcadores de RAPD Entretanto os valores de
bootstrap da maioria dos agrupamentos formados foram baixos Desta forma somente
foram considerados na anaacutelise os agrupamentos com bom suporte de bootstrap e
coeficientes de similaridade superiores a 50
Os dados indicam elevada variabilidade geneacutetica dos isolados de Phomopsis
spp avaliados (FIGURAS 17 e 18) com a formaccedilatildeo de sete grupos Os isolados de
Pestalotiopsis utilizados como grupo externo formaram um grupo (boostrap = 100)
isolado (FIGURA 17) sendo relevante para inferir a magnitude da variabilidade geneacutetica
observada entre os isolados de Phomopsis spp
O primeiro agrupamento reuacutene trecircs endoacutefitos de Espinheira Santa ESBA1
ES2AB1 e ESSD1 (49 de similaridade e bootstrap = 64) Esses isolados foram
obtidos do mesmo isolamento e pomar (CNPFEMPRAPA ColomboPR) poreacutem de
tecidos e plantas diferentes Os isolados ESBA1 e ESSD1 foram obtidos de peciacuteolo
enquanto ES2AB1 foi isolado de folha Eacute importante observar que o isolado ESBA1
apresentou estrutura de reproduccedilatildeo sexual sendo classificado como Diaporthe sp e
no entanto apresenta alto valor de similaridade geneacutetica com os isolados de Phomopsis
sp sugerindo assim que pertenccedilam ao mesmo complexo Phomopsis Diaporthe
Esses isolados natildeo se agrupam quanto aos caracteres morfoloacutegicos (FIGURAS 11 e
12)
O segundo agrupamento com 893 de similaridade geneacutetica e com bootstrap
de 100 compreende P longicolla (PHO1) uma linhagem patogecircnica de soja isolada
em Primavera do Leste ndash MT e o isolado SM9713 endoacutefito de Spondias mombin
coletado em Redenccedilatildeo ndash PA Aleacutem de coletados em lugares e hospedeiros totalmente
diferentes esses isolados apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas divergentes pois
natildeo pertencem ao mesmo agrupamento em nenhuma das caracteriacutesticas morfoloacutegicas
analisadas Entretanto a alta similaridade geneacutetica destes isolados sugere que
82
pertenccedilam agrave mesma espeacutecie o que reforccedila as observaccedilotildees anteriores de que a
definiccedilatildeo de espeacutecie do gecircnero Phomopsis natildeo eacute possiacutevel utilizando-se apenas
caracteriacutesticas morfoloacutegicas
FIGURA 17 DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS DE Phomopsis spp POR MEIO DE MARCADORES MOLECULARES RAPD
COEFICIENTE DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA
FONTE O autor
I II
III IV V VI VII
GRUPO EXTERNO
r= 08157 (p=00001)
100
83
O terceiro agrupamento com 75 de similaridade geneacutetica (FIGURA 17)
compreende dois isolados endofiacuteticos de Aspidosperma tomentosun AT9810 e AT9906
Esses isolados apresentaram caracteriacutesticas morfoloacutegicas muito semelhantes
formando o agrupamento II com 81 de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
O quarto agrupamento com 72 de similaridade geneacutetica compreende os
isolados ESFH1 e ESFF1 provenientes do peciacuteolo de Espinheira Santa da mesma
coleta poreacutem novamente eles natildeo se agrupam quanto aos caracteres morfoloacutegicos
observados (FIGURAS 11 e12)
O quinto agrupamento com 85 de similaridade geneacutetica reuacutene os isolados
ESKD1 e ESJH2 e ESJH1 provenientes de peciacuteolo da Espinheira Santa coletados na
mesma data Os isolados ESJH1 e ESJH2 foram obtidos do mesmo peciacuteolo e
apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas mais semelhantes entre si do que quando
comparados ao isolado ESKD1 (FIGURA 11) Entretanto a figura 17 revela que por
meio de marcadores RAPD os isolados ESKD1 e ESJH2 satildeo mais proacuteximos (92 de
similaridade geneacutetica) Sugere-se assim que os 3 isolados pertenccedilam agrave mesma
espeacutecie
O sexto agrupamento com 52 de similaridade (FIGURA 17) compreende os
isolados A321 obtido de Aroeira e ESIA1 obtido de Espinheira Santa Aleacutem de
coletados em lugares e hospedeiros totalmente diferentes esses isolados apresentam
caracteriacutesticas morfoloacutegicas diferentes (FIGURAS 11 e 12) Apesar do valor de
bootstrap atribuir confiabilidade a este agrupamento (77) o valor de similaridade
observado (52) natildeo eacute alto Assim natildeo eacute possiacutevel inferir que pertenccedilam agrave mesma
espeacutecie
O mesmo ocorre com o seacutetimo agrupamento que com 55 de similaridade
compreende os isolados A333A obtido de Aroeira e ESRD1 obtido de Espinheira Santa
Aleacutem de coletados em lugares e hospedeiros totalmente diferentes esses isolados
apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas diferentes natildeo pertencendo ao mesmo
agrupamento quanto aos caracteres morfoloacutegicos (FIGURAS 11 e 12)
Esses resultados mostram que caracteriacutesticas morfoloacutegicas natildeo satildeo suficientes
para inferir espeacutecies neste gecircnero analisadas individualmente ou em anaacutelise polifaacutesica
84
Aleacutem disso natildeo haacute estruturaccedilatildeo populacional quanto ao hospedeiro Esses dados
reforccedilam a necessidade de revisatildeo na classificaccedilatildeo de espeacutecies do gecircnero Phomopsis
Atualmente a anaacutelise polifaacutesica vem sendo realizada em estudos de diversidade
bacteriana utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas bioquiacutemicas fisioloacutegicas e
moleculares (KIM et al 2006 a b NEDASHKOVSKAYA et al 2006) e
esporadicamente na identificaccedilatildeo de leveduras (SAMPAIO et al 1999 VILLA-
CARVAJAL et al 2004) Em fungos filamentosos a anaacutelise polifaacutesica de caracteriacutesticas
morfoloacutegicas foi utilizada com sucesso na taxonomia de Penicillium (FRISVAD e
SAMSON 2004) Aspergillus (FRISVAD et al 2004) e Pestalotiopsis (FIGUEIREDO
2006)
FIGURA 18 ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp
FONTE O autor
85
532 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
Visando elucidar a taxonomia dos isolados de Phomopsis spp utilizados neste
trabalho foi realizado com sucesso o sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 - 58S - ITS2 do
rDNA de 29 isolados Apoacutes o alinhamento e ediccedilatildeo destas sequumlecircncias foi realizada
uma busca no banco de dados de sequumlecircncias (httpwwwncbinlmnihgov) a fim de
identificar sequumlecircncias similares Os isolados estatildeo representados na aacutervore filogeneacutetica
(FIGURA 19)
Os isolados agruparam-se em 16 clados sugerindo que as plantas medicinais
estudadas satildeo colonizadas por pelo menos dezesseis diferentes espeacutecies de
Phomopsis (FIGURA 19) Entretanto a maioria dos isolados natildeo apresentaram
sequumlecircncias ITS com identidade superior a 90 com nenhuma sequumlecircncia depositada no
GenBank e portanto foram identificados como Phomopsis sp S1 a Phomopsis sp
S12
O primeiro clado (suportado com bootstrap de 98) estaacute representado na figura
20 e reuacutene os isolados A113 A131 A133 ESIA1 e A321 que apresentaram identidade
com P chimonanthi e com uma linhagem de Phomopsis sp endofiacutetica de Coffea
robusta (DQ123615) Esta linhagem foi isolada e sequumlenciada por Sette et al (2006) e
apresentou 99 de similaridade com as mesmas espeacutecies P chimonanthi P
michaeliae e Diaporthe helianthi (FIGURAS 19 e 20) A espeacutecie P chimonanthi foi
recentemente proposta por Chang e colaboradores (dados natildeo publicados) para
isolados antes denominados de P michaeliae Como esta espeacutecie foi descrita em 1987
e aceita ateacute o momento no presente trabalho sugere-se que os isolados A113 A131
A133 ESIA1 e A321 sejam classificados como P michaeliae
O isolado ESIA1 foi obtido de Espinheira Santa (Maytenus ilicifolia) enquanto os
demais isolados deste clado foram obtidos de Aroeira Vermelha (Schinus
terebinthifolius) Esses isolados apresentaram baixa similaridade geneacutetica quando
avaliados por RAPD e similaridade parcial quanto agraves caracteriacutesticas morfoloacutegicas uma
vez que fazem parte do mesmo agrupamento no diacircmetro da colocircnia em meio BDA
(Grupo C) e MEA (Grupo E)
86
FONTE O autor FIGURA 19 AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MEacuteTODO DE PARCIMOcircNIA)
ESIA1
A321
A113
A131
AY6229931| Phomopsis
P michaellae
Phomopsis sp S5 A116
ESRD1
ESJE2
ESKD1
Phomopsis sp S1
Phomopsis sp S9 A124
A334
A323Phomopsis sp S8
Phomopsis sp S2 A123
AJ3123481| Diaporthe helianthi
DQ2862851| Phomopsis sp CBS
AY8578681| Phomopsis longicolla
AF000207| Phomopsis longicolla
AF0010242| Diaporthe phaseolorum
DQ2356701| Phomopsis sp P4
Phomopsis sp S10 ESGA1
DQ2356731| Phomopsis sp P7
PHO19
AY0506271| Phomopsis sojae
DQ2356691| Phomopsis sp P3
P sojae
AF3584411 Diaporthe helianthi
AJ3123631| Diaporthe helianthi
SM9713
P longicolla PHO1
MU0123
P longicolla
A126
ESJH1Phomopsis sp S11
Phomopsis sp S12 ESJD1
Phomopsis sp S7 ESDF1
AB1051481| Diaporthe melonis
ES2AB1
ESBA1Phomopsis sp S6
AB1051471| Diaporthe melonis
AY6229961| Phomopsis camptothecae
AJ3123591| Diaporthe
AY7450241| Diaporthe
ES2KF1
ES2WF1
ESPAC22
Phomopsis sp S4
Phomopsis sp S3 ESGF1
AB2014431| Diaporthe conorum
DQ1165511| Diaporthe conorum CBS
SM9638
ESFH1
DQ2862861| Phomopsis theicola
AF230762 Phomopsis sp taxon 3
AY4857241| Phomopsis sp 1
DQ2862871| P theicola CBS
P theicola
Pestalotiopsis vismae
99
99
3599
98
91
7786
78
75
73
2973
5
5
3
2
11
71
70
25
22
33
40
67
63
33
44
65
41
34
29
27
21
21
18
13
12
8
7
5
3
3
0
0
0
19
32
23
31
87
Os isolados ESRD1 ESKD1 e ESJE2 apresentaram homologia quanto as
sequumlecircncias de ITS com suporte de bootstrap de 95 (FIGURA 19) Entretanto a figura
17 revela que por meio de marcadores RAPD os isolados ESKD1 e ESJE2 satildeo mais
proacuteximos apresentando 92 de similaridade geneacutetica (com bootstrap de 65) e 85
de similaridade desses isolados com o ESJE1 Assim sugere-se que estes 3 isolados
pertenccedilam agrave mesma espeacutecie Entretanto as sequumlecircncias ITS natildeo apresentaram
identidade superior a 90 com nenhuma sequumlecircncia depositada no GenBank Assim
esses isolados foram denominados de Phomopsis sp S1
FONTE O autor FIGURA 20 AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA PARCIAL BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MODELO NEIGHBOR-JOINING COM CORRECcedilAtildeO KIMURA DOIS PARAcircMETROS)
O isolado PHO19 (patogecircnico de soja) foi classificado como Phomopsis sojae
formou um clado com um endoacutefito natildeo identificado (P3) e com um isolado da espeacutecie P
sojae (FIGURA 19) O isolado Phomopsis sp P3 foi obtido como endoacutefito de Tectona
grandis por Murali Surynarayanan e Geeta (2006)
A113
DQ1236151| Phomopsis sp CBMAI
ESIA1
AY6229931| Phomopsis chimonanthi
A131
A133
P michae liae
A124
A334
ESGA1
DQ1165521| Diaporthe conorum cbs 199-3990
98
62252719
0005
88
Os isolados MU0123 SM9713 e P longicolla (PHO1) apresentaram alta
homologia das sequumlecircncias (clado suportado com 99 de bootstrap) (FIGURA 19) Os
isolados SM9713 e P longicolla (PHO1) apresentaram 893 de similaridade geneacutetica
(com suporte de bootstrap de 100) utilizando-se marcadores RAPD (FIGURA 17) Na
anaacutelise morfoloacutegica os isolados MU0123 e SM9713 apresentaram mais de 70 de
similaridade poreacutem o isolado P longicolla (PHO1) apresentou caracteriacutesticas
morfoloacutegicas diferentes dos isolados MU0123 e SM9713 (FIGURA 11) O isolado PHO1
foi isolado como patoacutegeno de soja (Glycine max (L) Merr) no Mato Grosso enquanto os
isolados MU0123 e SM9713 foram obtidos como endofiacuteticos de Aroeira (Myracrodruon
urundeuva) e Cajaacute (Spondias mombin) respectivamente ambos no estado do Paraacute Em
funccedilatildeo das similaridades geneacuteticas observadas e por ser o isolado PHO1 utilizado
como referecircncia de P longicolla os isolados endofiacuteticos MU0123 e SM9713 foram
identificados como pertencentes a esta espeacutecie A alta similaridade geneacutetica destes
isolados sugere que pertenccedilam agrave mesma espeacutecie o que reforccedila as observaccedilotildees
anteriores de que a definiccedilatildeo de espeacutecie do gecircnero Phomopsis natildeo eacute possiacutevel
utilizando-se apenas caracteriacutesticas morfoloacutegicas O fato de isolados endofiacuteticos de S
mombin e M urundeuva serem identificados como P longicolla demonstra que
espeacutecies patogecircnicas para um hospedeiro podem colonizar de forma assintomaacutetica
diferentes espeacutecies vegetais Isso jaacute foi observado para outros gecircneros como
Guignardia e Phyllosticta (BAAYEN et al 2002 GLIENKE-BLANCO et al 2002)
Os endoacutefitos ESBA1 e ES2AB1 foram reunidos no mesmo clado sendo
denominados de Phomopsis sp S6 (FIGURA 19) esses isolados fazem parte do
mesmo agrupamento utilizando-se marcadores RAPD (FIGURA 17)
Os isolados A323 e A334 apresentaram grande identidade geneacutetica (suportado
com bootstrap de 70) e seu agrupamento estaacute representado na figura 19 Esses
isolados natildeo apresentaram identidade moderada a nenhuma das sequumlecircncias
depositadas no GenBank e portanto natildeo foi possiacutevel inferir sobre a espeacutecie desses
endoacutefitos Sugere-se que esses isolados de Aroeira pertenccedilam agrave mesma espeacutecie e
portanto foram denominados de Phomopsis sp S8 Os isolados ES2KF1 ES2WF1 e
89
ESPAC22 endoacutefitos de Espinheira Santa foram reunidos num mesmo clado sendo
denominados de Phomopsis sp S4 (FIGURA 19)
Os isolados A126 e ESJH1 foram reunidos no mesmo clado sendo denominados
de Phomopsis sp S11 eles foram isolados de diferentes plantas hospedeiras O
isolado ESJH1 foi obtido de Espinheira Santa (Maytenus ilicifolia) enquanto o isolado
A126 foi obtido de Aroeira Vermelha (Schinus terebinthifolius) Estes resultados
reforccedilam a dificuldade em inferir espeacutecies do gecircnero Phomopsis com base na planta
hospedeira
Os isolados A116 A124 A123 ESGA1 ESJD1 ESDF1 e ESGF1 natildeo
apresentaram identidade com nenhuma sequumlecircncia depositada no GenBank nem
similaridade com outros isolados analisados no presente trabalho Sugere-se que esses
endoacutefitos pertenccedilam a diferentes espeacutecies
No uacuteltimo clado o isolado ESFH1 apresentou homologia com a regiatildeo ITS1-
rDNA 58S - ITS2 da espeacutecie P theicola (DQ286286 e DQ286287) e com o isolado
SM9638 (FIGURA 19) Estes dois isolados foram obtidos de diferentes plantas
hospedeiras O isolado ESFH1 foi obtido em 2006 de M ilicifolia no Paranaacute enquanto o
isolado SM9638 foi obtido em 1996 como endofiacutetico da planta Spondias mombin no
Estado do Paraacute Esses isolados apresentam baixa similaridade morfoloacutegica (FIGURAS
11 e 12) Estes resultados reforccedilam a dificuldade em inferir espeacutecies do gecircnero
Phomopsis especialmente utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas
No presente trabalho observou-se que vaacuterias espeacutecies de Phomopsis foram
isoladas de um mesmo hospedeiro assim como uma mesma espeacutecie foi encontrada
colonizando diferentes hospedeiros Isto jaacute foi relatado no gecircnero Phomopsis por
Brayford (1990) Farr Castlebury e Rossman (2002) e por Rehner e Uecker (1994)
Esses resultados reforccedilam a necessidade de revisatildeo do conceito de espeacutecie para o
gecircnero Phomopsis uma vez que muitas espeacutecies tecircm sido identificadas com base na
planta hospedeira (GAMBOA-GAITAacuteN LAUREANO e BAYMAN 2005 MURALI
SURYANARAYANAN GEETA 2006)
Os dados morfoloacutegicos e de RAPD foram altamente variaacuteveis e a anaacutelise das
sequumlecircncias da regiatildeo ITS1- 58S - ITS2 do rDNA foi informativa para alguns dos
90
isolados analisados Entretanto mais estudos satildeo necessaacuterios para a identificaccedilatildeo
precisa dessas espeacutecies A literatura eacute escassa quanto a trabalhos de taxonomia
morfologia biologia e ecologia de isolados endofiacuteticos do gecircnero Phomopsis Segundo
Phillips (2006) a identificaccedilatildeo das espeacutecies do gecircnero Phomopsis eacute difiacutecil porque as
espeacutecies natildeo estatildeo claramente definidas e existe uma sobreposiccedilatildeo entre os caracteres
morfoloacutegicos que as definem
A maioria das sequumlecircncias depositadas no GenBank satildeo de isolados
provenientes de lesotildees sendo portanto de espeacutecies patogecircnicas No presente trabalho
eacute possiacutevel que os isolados pertencentes a clados que natildeo se agruparam com nenhuma
sequumlecircncia jaacute depositada pertenccedilam a novas espeacutecies ou ainda a espeacutecies de
endoacutefitos ainda natildeo sequumlenciados Murali Surynarayanan e Geeta (2006)
caracterizaram por meio de sequumlenciamento da regiatildeo ITS e dados morfoloacutegicos 11
isolados endofiacuteticos de Phomopsis obtidos de Tectona grandis e Cassia fistula Eles
sugerem que apesar da grande variabilidade encontrada os isolados devem ser
reunidos em apenas dois grupos entretanto natildeo foi possiacutevel a identificaccedilatildeo em niacutevel
de espeacutecie Segundo os autores isto natildeo foi possiacutevel em funccedilatildeo dos fungos deste
gecircnero natildeo terem hospedeiros especiacuteficos e pela necessidade de revisatildeo do conceito
de espeacutecie em Phomopsis
Farr Castlebury e Rossman (2002) caracterizaram por anaacutelise de sequumlecircncias
ITS1 58S ITS2 e por caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de Phomopsis sp
isolados de Vaccinium corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse estudo
verificaram que a maioria dos isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma vez que
as sequumlecircncias agruparam-se com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
Castlebury e Mengistu (2006) avaliaram Phomopsis isolados de soja e outros
hospedeiros combinando dados de sequumlecircncias de ITS do rDNA do gene do fator1 alfa
de elongaccedilatildeo da traduccedilatildeo (ef-1) e genes de actina Foram formados seis grupos de
Phomopsis sendo que trecircs correspondem aos taacutexons P longicolla Diaporthe melonis e
D phaseolorum Os autores concluiacuteram que a ausecircncia de distinccedilatildeo morfoloacutegica e
informaccedilatildeo bioloacutegica tornam problemaacutetica a identificaccedilatildeo de espeacutecies deste gecircnero
91
No presente trabalho com base nos dados de RAPD (FIGURAS 17 e 18) pode-
se sugerir a existecircncia de pelo menos 10 espeacutecies de Phomopsis colonizando de forma
endofiacutetica as plantas de Maytenus ilicifolia analisadas Tais plantas satildeo provenientes de
um uacutenico pomar localizado no CNPFEMPRAPA em ColomboPR Ainda eacute possiacutevel
sugerir a existecircncia de pelo menos seis espeacutecies de Phomopsis colonizando de forma
endofiacutetica a planta de S terebinthifolius analisada neste trabalho Esta planta natildeo
recebeu qualquer tratamento com fungicidas ou outro agrotoacutexico uma vez que se
encontra isolada entre dois blocos do Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas da UFPR (ANEXO
13) Talvez isso justifique a grande diversidade de isolados encontrada Esses dados
demonstram a importacircncia de estudos da comunidade endofiacutetica em plantas medicinais
e apontam para o problema da reduccedilatildeo de diversidade de microrganismos endofiacuteticos
pelo uso continuado de fungicidas
Resultados semelhantes foram obtidos por Gamboa-Gaitaacuten Laureano e Bayman
(2005) estudando isolados de Phomopsis endofiacuteticos da planta medicinal Guarea
guidonia (Meliaceae) Os autores relataram elevados niacuteveis de variabilidade geneacutetica
avaliada pela digestatildeo da regiatildeo ITS e tambeacutem a alta variabilidade morfoloacutegica entre
os isolados avaliados A aacutervore molecular agrupou indiviacuteduos fenotipicamente
diferentes Por outro lado Fernandez e Hanlin (1996) obtiveram resultados
concordantes entre a anaacutelise molecular por RAPD e as caracteriacutesticas morfoculturais
separando os isolados coletados de soja em dois grupos Diaporthe phaseolorum e
Phomopsis longicolla
Pioli et al (2003) caracterizaram por RAPD isolados do complexo
DiaporthePhomopsis coletados de soja na Argentina Eles foram separados em quatro
grupos (i) Diaporthe phaseolorum variedade meridionalis (ii) D phaseolorum variedade
caulivora (iii) D phaseolorum variedade sojae and (iv) Phomopsis longicolla revelando
a existecircncia de variabilidade entre isolados da mesma variedade
92
54 Avaliaccedilatildeo da atividade antimicrobiana 541 Cultura pareada
Os isolados de Phomopsis foram avaliados pela teacutecnica de cultura pareada
contra as linhagens PC1396 e PC3305 do fitopatoacutegeno G citricarpa As interaccedilotildees
foram classificadas em trecircs tipos 1) Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno com
sobreposiccedilatildeo de hifas 2) Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno sem sobreposiccedilatildeo
de hifas e 3) Ausecircncia de inibiccedilatildeo de crescimento Os resultados obtidos estatildeo
apresentados nas Tabelas 9 e 10
Todos os isolados de Phomopsis inibiram significativamente o crescimento das
duas linhagens de Guignardia exceto o isolado ES2WC1 (Phomopsis sp) que
apresentou interaccedilatildeo do tipo 3 em que natildeo houve inibiccedilatildeo significativa do fitopatoacutegeno
apenas 287 e 828 contra PC1396 e PC3305 respectivamente (ANEXO 6 7 8 e
9) Foi observado que as duas linhagens de G citricarpa apresentaram o mesmo tipo
de interaccedilatildeo frente ao mesmo isolado de Phomopsis ou seja natildeo houve variaccedilatildeo
quanto a linhagem do fitopatoacutegeno avaliado Tal observaccedilatildeo reforccedila a importacircncia dos
resultados aqui apresentados
Dos 49 isolados de Phomopsis endoacutefitos de plantas medicinais avaliados 38
inibiram o crescimento das duas linhagens do fitopatoacutegeno G citricarpa com
porcentagem de inibiccedilatildeo superior a 50 Os isolados A333B (Phomopsis sp) ESGF1
(Phomopsis sp S3) SM9638 (P theicola) AT9810 (Phomopsis sp) AT9906
(Phomopsis sp) e ES2WC1 (Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo inferiores
a 50 contra PC1396 e PC3305 os isolados ES80J (Phomopsis sp) e AT9811
(Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo inferiores a 50 apenas contra a
linhagem PC1396 enquanto contra a PC3305 a inibiccedilatildeo foi de 5132 e 5397
respectivamente Por outro lado os isolados de Phomopsis ESFF1 (Phomopsis sp)
SM9714 (Phomopsis sp) e A132 (Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo
inferiores a 50 apenas contra a linhagem PC3305 enquanto contra PC1396 a
inibiccedilatildeo foi de 5017 6215 e 5492 respectivamente
93
A anaacutelise estatiacutestica demonstrou que haacute diferenccedila significativa entre o controle e
os isolados avaliados O fungicida Derosal apresentou inibiccedilatildeo do crescimento do
fitopatoacutegeno em aproximadamente 19 todos os isolados de Phomopsis que
apresentaram inibiccedilatildeo superior ao fungicida com significacircncia no teste estatiacutestico exceto
o isolado ES2WC1 (Phomopsis sp) como citado anteriormente (TABELA 8 e 9 ANEXO
6 7 8 e 9)
As interaccedilotildees do tipo 1 nas quais ocorre agrave sobreposiccedilatildeo de hifas do endoacutefito
sobre o fitopatoacutegeno sugere a ocorrecircncia de parasitismo Esse tipo de interaccedilatildeo entre
os isolados de Phomopsis e as linhagens de G citricarpa ocorreu em 47 dos isolados
Tais isolados apresentam diferenccedila significativa entre o controle destacando-se os
isolados ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) (FIGURA 21) ESJD1
(Phomopsis sp S12) e ESJH1 (Phomopsis sp S11) que inibiram o crescimento de G
citricarpa PC1396 em 7338 6885 6826 e 6792 respectivamente A anaacutelise
estatiacutestica demonstra que haacute diferenccedila significativa entre o controle e estes isolados
poreacutem natildeo haacute diferenccedila significativa entre os mesmos (ANEXO 6 7 e 8)
As interaccedilotildees do tipo 2 nas quais natildeo ocorre sobreposiccedilatildeo de hifas ocorreram
em 51 dos isolados destacando-se os isolados ESSD1 (Phomopsis sp) e SM9713
(P longicolla) que inibiram o crescimento da linhagem PC1396 de G citricarpa em
7324 e 6763 respectivamente A anaacutelise estatiacutestica demonstra que haacute diferenccedila
significativa entre o controle e os isolados ESSD1 (Phomopsis sp) e SM9713 (P
longicolla) os isolados de Phomopsis tambeacutem diferem entre si (TABELA 8) Essas
interaccedilotildees devem ser avaliadas posteriormente em microscopia oacutetica para confirmar se
estaacute ocorrendo parasitismo
FIGURA 21 INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa PC1396 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA
Phomopsis A134
G Citricarpa PC1396
Phomopsis SM9713
G Citricarpa PC1396
G Citricarpa PC1396 Controle
G Citricarpa PC1396
Fungicida Derosal
FONTE O autor
94
Isolados Identificaccedilatildeo Tipo de Interaccedilatildeo Inibiccedilatildeo () Fungicida 19
ESDF1 Phomopsis sp S7 1 7338 ESSD1 Phomopsis sp 2 7324 A134 Phomopsis sp 1 6885
ESJD1 Phomopsis sp S12 1 6826 ESJH1 Phomopsis sp S11 1 6792 SM9713 P longicolla 2 6763 ESIE1 Phomopsis sp 1 6758 ESFB2 Phomopsis sp 1 6724
MU0123 P longicolla 2 6663 ESRD1 Phomopsis sp S1 2 6655 ESJG1 Phomopsis sp 2 6621 ESJE1 Phomopsis sp S1 1 6621
ESPAC22 Phomopsis sp S4 1 6516 A131 P michaeliae 2 6393 A126 Phomopsis sp S11 1 6352 A123 Phomopsis sp S2 1 6270 A113 P michaeliae 1 6270
SM9631 Phomopsis sp 1 6265 ES2AB1 Phomopsis sp S6 1 6246 ESJE2 Phomopsis sp S1 1 6246 A323 Phomopsis sp S8 1 6230
SM9714 Phomopsis sp 1 6215 ES2NA1 Phomopsis sp 1 6212
A334 Phomopsis sp S8 1 6189 ESBA1 Phomopsis sp S6 2 6177 A321 P michaeliae 1 6148
ESKD1 Phomopsis sp S1 1 6109 A216B Phomopsis sp 2 6025
ES2KF1 Phomopsis sp S4 2 5939 ESIA1 P michaeliae 2 5904 A135 Phomopsis sp 2 5902 A124 Phomopsis sp S9 2 5861
A115B Phomopsis sp 1 5861 A116 Phomopsis sp S5 2 5820
A215A Phomopsis sp 1 5656 A132 Phomopsis sp 2 5492
ESFH1 P theicola 2 5427 A333A Phomopsis sp 1 5369 ESGA1 Phomopsis sp S10 2 5324
ES2WF1 Phomopsis sp S4 2 5205 ESFF1 Phomopsis sp 2 5017 AT9811 Phomopsis sp 1 4920 ESGF1 Phomopsis sp S3 2 4642 SM9638 P theicola 1 4522 A333B Phomopsis sp 1 4426 ES80J Phomopsis sp 2 4344 AT9810 Phomopsis sp 2 4173 AT9906 Phomopsis sp 2 3078 ES2WC1 Phomopsis sp 3 287
FONTE O autor
TABELA 8 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC1396
95
A interaccedilatildeo do tipo 1 entre os isolados de Phomopsis e a linhagem PC3305 de
G citricarpa ocorreu em 47 dos isolados a reduccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno
apresentou diferenccedila significativa quando comparados com o controle destacando-se
os isolados A215A (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ESDF1 (Phomopsis sp
S7) ESJD1 (Phomopsis sp S12) A123 (Phomopsis sp S2) que inibiram o crescimento
da linhagem PC3305 de G citricarpa em 7947 7616 7152 7119 e 7119
respectivamente (TABELA 9 FIGURA 22) A anaacutelise estatiacutestica demonstra que haacute
diferenccedila significativa entre o controle e os isolados A215A (Phomopsis sp) A115B
(Phomopsis sp) ESDF1 (Phomopsis sp S7) ESJD1 (Phomopsis sp S12) A123
(Phomopsis sp S2) A215A A115B ESDF1 ESJD1 A123 mas os isolados de
Phomopsis natildeo diferem entre si (ANEXO 9)
Os isolados ESRD1 (Phomopsis sp S1) e A135 (Phomopsis sp) apresentaram
as maiores taxas de inibiccedilatildeo do crescimento da linhagem PC3305 de G citricarpa pela
interaccedilatildeo do tipo 2 6887 e 6623 respectivamente (TABELA 9) A anaacutelise estatiacutestica
demonstra que haacute diferenccedila significativa entre o controle e os isolados ESRD1
(Phomopsis sp S1) e A135 (Phomopsis sp) esses isolados de Phomopsis diferem
entre si (ANEXO 9) Essas interaccedilotildees devem ser avaliadas posteriormente ao
microscoacutepio para confirmar se estaacute ocorrendo parasitismo
O isolado SM9713 (P longicolla) inibiu o crescimento do patoacutegeno G citricarpa e
produziu esporos em volta da colocircnia Segundo Boosalis (1964) a esporulaccedilatildeo pode
ocorrer quando determinados hospedeiros estimulam a reproduccedilatildeo de seus parasitas
Resultados semelhantes foram encontrados por Martins-Corder e Melo (1998) onde
observaram que a maioria dos isolados de Trichoderma spp antagonistas colonizou e
produziu esporos em abundacircncia sobre as colocircnias de Verticillium dahliae
As interaccedilotildees do tipo 2 mostram inibiccedilatildeo mutua na qual o endoacutefito natildeo sobrepotildee
a colocircnia do fitopatoacutegeno apesar de inibir seu crescimento Segundo Bell et al (1982)
os antagonistas selecionados pelo confronto direto satildeo aqueles que apresentam
crescimento sobre o fitopatoacutegeno Poreacutem a relaccedilatildeo entre o tipo de interaccedilatildeo e a
porcentagem de inibiccedilatildeo observada nos resultados natildeo satildeo congruentes uma vez que
96
a porcentagem de inibiccedilatildeo para alguns isolados com interaccedilatildeo do Tipo 2 eacute maior do que
para aqueles com interaccedilatildeo do Tipo 1
Isolados Identificaccedilatildeo Tipo de Interaccedilatildeo
Inibiccedilatildeo ()
Fungicida 1921 A215A Phomopsis sp 1 7947 A115B Phomopsis sp 1 7616 ESDF1 Phomopsis sp S7 1 7152 ESJD1 Phomopsis sp S12 1 7119 A123 Phomopsis sp S2 1 7119
ESFB2 Phomopsis sp 1 7086 ESJE2 Phomopsis sp S1 1 7020 ESJH1 Phomopsis sp S11 1 7020
SM9631 Phomopsis sp 1 6921 ESRD1 Phomopsis sp S1 2 6887 A135 Phomopsis sp 2 6623 A126 Phomopsis sp S11 1 6490
ESPAC22 Phomopsis sp S4 1 6424 A131 P michaeliae 2 6424
ESJE1 Phomopsis sp 1 6358 ES2KF1 Phomopsis sp S4 2 6298
A334 Phomopsis sp S8 1 6291 A124 Phomopsis sp S9 2 6258 ESIA1 P michaeliae 2 6126 ESKD1 Phomopsis sp S1 1 5993 ESSD1 Phomopsis sp L5 2 5960 A134 Phomopsis sp 1 5861 A113 P michaeliae 1 5795
TABELA 9 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 (CONTINUA)
FIGURA 22 INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa 3305 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA
G citricarpa PC3305
Phomopsis ESRD1
Phomopsis ESDF1
G citricarpa PC3305
G citricarpa PC3305 controle
Fungicida Derosal
G citricarpa PC3305
FONTE O autor
97
A333A Phomopsis sp 1 5728 ESIE1 Phomopsis sp 1 5695 ESJG1 Phomopsis sp 2 5662 A323 Phomopsis sp S8 1 5629
ES2AB1 Phomopsis sp S6 1 5596 ESBA1 Phomopsis sp S6 2 5563 A116 Phomopsis sp S5 2 5464
AT9811 Phomopsis sp 1 5397 A216B Phomopsis sp 2 5364 A321 P michaeliae 1 5331
SM9713 P longicolla 2 5298 ES2NA1 Phomopsis sp 1 5265 MU0123 P longicolla 2 5232 ESFH1 Phomopsis sp 2 5132 ES80J Phomopsis sp 2 5132 ESGA1 Phomopsis sp S10 2 5079
ES2WF1 Phomopsis sp S4 2 5033 ESFF1 P theicola 2 4934
SM9714 Phomopsis sp 1 4735 A132 Phomopsis sp 2 4470
A333B Phomopsis sp 1 3775 ESGF1 Phomopsis sp S3 2 3344 SM9638 P theicola 1 2781 AT9810 Phomopsis sp 2 2649 AT9906 Phomopsis sp 2 2583 ES2WC1 Phomopsis sp 3 828
FONTE O autor 542 Teste para detecccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
No teste de metaboacutelitos volaacuteteis observou-se reduccedilatildeo do crescimento da
linhagem PC1396 e PC3305 de G citricarpa apoacutes a retirada do celofane onde
inicialmente foram inoculados os isolados de Phomopsis Todos os isolados testados
inibiram significativamente o crescimento das duas linhagens de G citricarpa Os
isolados A115B (Phomopsis sp) A134 (Phomopsis sp) ESFF1 (Phomopsis sp)
ESFH1 (Phomopsis theicola) A123 (Phomopsis sp S2) e S2WF1 (Phomopsis sp S4)
apresentaram maior inibiccedilatildeo do crescimento das duas linhagens do fitopatoacutegeno
(ANEXO 10 e 11 e FIGURA 23) sugerindo que a interaccedilatildeo entre os isolados de
Phomopsis e o fitopatoacutegeno ocorre devido agrave produccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
TABELA 9 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 (CONTINUACcedilAtildeO)
98
FONTE O autor FIGURA 23 AVALIACcedilAtildeO DO CRESCIMENTO DAS COLOcircNIAS DO FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 e PC3305 INOCULADAS APOacuteS RETIRADA DO PAPEL CELOFANE PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS EM MEIO BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
Nota a Placa com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC3305 inoculado apoacutes retirada do celofane onde previamente foi inoculado o isolado ESFH1 b Placa controle com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC3305 c Placa com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396 inoculado apoacutes retirada do celofane onde previamente foi inoculado o isolado ESFH1 d Placa controle com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396
FIGUEIREDO (2006) utilizou a teacutecnica de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis em
Pestalotiopsis isolados endofiacuteticos de Maytenus ilicifolia e observou uma reduccedilatildeo do
crescimento da linhagem PC1396 de G citricarpa demonstrando que a interaccedilatildeo
ocorre principalmente pela produccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
Os resultados apresentados aqui demonstram o grande potencial que tais
linhagens endofiacuteticas de Phomopsis possuem como agentes de controle da Mancha
Preta dos Citros e o seu potencial na produccedilatildeo de metaboacutelitos
543 Avaliaccedilatildeo da accedilatildeo dos Extratos
Na avaliaccedilatildeo dos extratos quanto agrave inibiccedilatildeo do crescimento das linhagens
PC1396 e PC3305 de G citricarpa os resultados indicam que a maioria dos extratos
metanoacutelicos produzidos a partir dos isolados de Phomopsis reduziram o crescimento
micelial de ambas as linhagens do fitopatoacutegeno da MPC A inibiccedilatildeo ocorreu devido aos
metaboacutelitos secundaacuterios produzidos pelos isolados endofiacuteticos quando comparados
com o crescimento micelial dos controles com metanol (onde o extrato foi diluiacutedo) e
com aacutegua destilada (FIGURA 24 25 e TABELA 10)
a b c d
99
Foi observado que os isolados de Phomopsis que apresentaram as maiores
porcentagens de inibiccedilatildeo pela teacutecnica de cultura pareada tambeacutem inibiram o
crescimento quando foi utilizado o extrato metanoacutelico Entretanto o isolado ES2WC1
(Phomopsis sp) que natildeo inibiu o crescimento pela teacutecnica de cultura pareada
apresentou reduccedilatildeo no crescimento micelial dos dois fitopatoacutegenos avaliados
utilizando-se o seu extrato metanoacutelico Provavelmente essa falta de inibiccedilatildeo pela
teacutecnica de cultura pareada tenha ocorrido pelo fato do isolado ES2WC1 (Phomopsis
sp) apresentar crescimento lento fazendo com que o crescimento do fitopatoacutegeno natildeo
diferisse significativamente do controle
Os isolados ES80J (Phomopsis sp) ESFF1 (Phomopsis sp) A132 (Phomopsis
sp) A333B (Phomopsis sp) e SM9638 (P theicola) natildeo inibiram o crescimento micelial
de nenhum dos fitopatoacutegenos avaliados Para alguns isolados de Phomopsis natildeo foi
possiacutevel determinar o potencial antimicrobiano dos extratos metanoacutelicos pois houve
grande variaccedilatildeo de accedilatildeo entre as repeticcedilotildees do experimento
FONTE O autor
C
D E F
A B
NOTA A Placa controle com aacutegua destilada autoclavada B Placa controle com metanolC Placa controle com fungicida Derosal reg (10 mgmL) D Placa com extrato metanoacutelicodo isolado ES2WC1 E Placa com extrato metanoacutelico do isolado A215A F Placa comextrato metanoacutelico do isolado ESDF1
FIGURA 24 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NOCRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC3305 DE G citricarpa EMMEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
100
Rodrigues-Heerklotz et al (2001) elucidaram a estrutura quiacutemica e a siacutentese
assimeacutetrica de um novo metaboacutelito o aacutecido guignardico produzido pelo fungo endofiacutetico
Guignardia sp isolado de Spondias mombin Silva et al (2005) isolaram dois
metaboacutelitos de Phomopsis cassiae endofiacutetico de Cassia specatabilis 24-diidroxi-56-
dimetil benzoato de etila e phomopsilactona que exibiram forte atividade antifuacutengica
contra fitopatoacutegenos bem como citotoxicidade contra a linhagem celular de tumor
cervical humano (HeLa) Estudos adicionais devem ser realizados para determinar a
estrutura quiacutemica produzida pelos endoacutefitos de Phomopsis estudados
NOTA A Placa controle com aacutegua destilada autoclavada B Placa controle commetanol C Placa controle com fungicida Derosal reg (10 mgmL)D Placa com extratometanoacutelico do isolado ES2WC1 E Placa com extrato metanoacutelico do isolado ESGA1 FPlaca com extrato metanoacutelico do isolado ESSD1
FONTE O autor FIGURA 25 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NOCRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 DE G citricarpa EMMEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
C
D E F
A B
101
Os resultados da tabela 10 revelam que os isolados endofiacuteticos de Phomopsis
spp avaliados satildeo bastante promissores demonstrando um potencial na produccedilatildeo de
metaboacutelitos Resultados semelhantes foram obtidos por Moller Weber e Dreyfuss
(1996) que avaliaram a accedilatildeo de endoacutefitos de plantas tropicais com alta produccedilatildeo de
metaboacutelitos secundaacuterios
Identificaccedilatildeo Isolados Inibiccedilatildeo PC3305 Cultura Pareada
Inibiccedilatildeo PC3305 Extrato
Metanoacutelico
Inibiccedilatildeo () PC1396 Cultura Pareada
Inibiccedilatildeo PC1396 Extrato
Metanoacutelico Derosal Fungicida 1921 I 19 I
P longicolla SM9713 5298 I 6763 I P longicolla MU0123 5232 ND 6663 I P michaeliae A131 6424 I 6393 I P michaeliae ESIA1 6126 I 5904 I Phomopsis sp A333A 5728 I 5369 I P michaeliae A321 5331 I 6148 I P michaeliae A113 5795 ND 627 ND Phomopsis sp S2 A123 7119 ND 627 ND P theicola ESFH1 5132 I 5427 I Phomopsis sp ESFF1 4934 NI 5017 NI P theicola SM9638 2781 NI 4522 NI Phomopsis sp S4 ES2WF1 5033 I 5205 I Phomopsis sp S3 ESGF1 3344 I 4642 I Phomopsis sp S10 ESGA1 5079 I 5324 I Phomopsis sp S1 ESRD1 6887 I 6655 I Phomopsis sp S8 A334 6291 I 6189 I Phomopsis sp S9 A124 6258 I 5861 I Phomopsis sp S7 ESDF1 7152 I 7338 I Phomopsis sp ESSD1 596 I 7324 I Phomopsis sp S6 ES2AB1 5596 I 6246 I Phomopsis sp S6 ESBA1 5563 I 6177 I Phomopsis sp S11 A126 649 ND 6352 ND Phomopsis sp S12 ESJD1 7119 I 6826 I Phomopsis sp S1 ESJE1 6358 I 6621 I Phomopsis sp S1 ESJE2 702 ND 6246 ND Phomopsis sp S1 ESKD1 5993 ND 6109 ND Phomopsis sp A115B 7616 I 5861 I Phomopsis sp ESFB2 7086 I 6724 I Phomopsis sp S11 ESJH1 702 I 6792 I Phomopsis sp A135 6623 I 5902 ND Phomopsis sp A134 5861 I 6885 I Phomopsis sp ESIE1 5695 I 6758 I Phomopsis sp ESJG1 5662 ND 6621 I
TABELA 10 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO CRESCIMENTO MICELIAL DASCOLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTOA 28ordmC (CONTINUA)
102
Phomopsis sp AT9811 5397 I 492 I Phomopsis sp A216B 5364 I 6025 I Phomopsis sp ES2NA1 5265 I 6212 I Phomopsis sp SM9714 4735 I 6215 I Phomopsis sp ES2WC1 828 I 287 I Phomopsis sp SM9631 6921 ND 6265 ND Phomopsis sp S4 ESPAC22 6424 ND 6516 ND Phomopsis sp S4 ES2KF1 6298 ND 5939 ND Phomopsis sp S8 A323 5629 ND 623 ND Phomopsis sp S5 A116 5464 ND 582 ND Phomopsis sp AT9810 2649 ND 4173 ND Phomopsis sp AT9906 2583 ND 3078 ND Phomopsis sp ES80J 5132 NI 4344 NI Phomopsis sp A132 447 NI 5492 NI Phomopsis sp A333B 3775 NI 4426 NI Phomopsis sp A215A 7947 I 5656 I
FONTE O autor
NOTA I- Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno NI- Natildeo ocorreu inibiccedilatildeo do fitopatoacutegeno ND- Natildeo foi determinado a inibiccedilatildeo
No Brasil as plantas Spondias mombin e A tomentosum tecircm sido usadas na
medicina devido as suas propriedades antimicrobianas (AJAO SHONUKAN e FEMI
1984) Os isolados de Phomopsis obtidos como endoacutefitos de S mombin (SM9713 (P
longicolla) SM9638 (P theicola) e SM9714 (Phomopsis sp)) e A tomentosum (AT9810
(Phomopsis sp) AT9811 (Phomopsis sp) e AT9906 (Phomopsis sp)) avaliados no
presente trabalho jaacute haviam sido relatados por Corrado e Rodrigues (2004) como
produtores de compostos bioativos Os autores relatam que os extratos metanoacutelicos
inibiram o crescimento de E coli S aureus P aeruginosa C albicans A niger e F
oxysporum No presente trabalho os isolados de S mombin e A tomentosum inibiram
o crescimento de Guignardia citricarpa confirmando o potencial desses isolados em
produzir substacircncias bioativas mais estudos devem ser realizados para verificar o
potencial antimicrobiano desses extratos contra bacteacuterias patogecircnicas e
fitopatogecircnicas
A planta Schinus terebinthifolius eacute usada no Brasil na medicina alternativa contra
doenccedilas da coacuternea (CORREcircA 1926) doenccedilas reumaacuteticas uacutelceras feridas tumores
linfaacuteticos erisipela e outras moleacutestias provocadas por bacteacuterias que se manifestam em
forma de edema ou eritema (BALBACH 1992) As linhagens de Phomopsis isoladas de
S terebinthifolius avaliadas nesse trabalho A135 (Phomopsis sp) A113 (P michaelae)
TABELA 10 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO CRESCIMENTO MICELIAL DASCOLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DECRESCIMENTO A 28ordmC (CONTINUACcedilAtildeO)
103
A115B (Phomopsis sp) A323 (Phomopsis sp S8) A132 (Phomopsis sp) A134
(Phomopsis sp) A333B (Phomopsis sp) A321 (P michaelae) A126 (Phomopsis sp
S11) A216B (Phomopsis sp) A334 (Phomopsis sp S8) A116 (Phomopsis sp S5)
A215A (Phomopsis sp) A124 (Phomopsis sp S9) A333A (Phomopsis sp) A131 (P
michaeliae) e A123 (Phomopsis sp S2) apresentaram excelentes resultados contra G
citricarpa
Extratos da planta M ilicifolia jaacute foram descritos na literatura apresentando
atividade antitumoral tambeacutem usado como analgeacutesico antinflamatoacuterio e antiaacutecido
(JORGE 2004 DUARTE 2005) Pileggi (2006) isolou microrganismos endofiacuteticos de
plantas de Maytenus ilicifolia do mesmo pomar investigado neste trabalho e avaliou o
potencial farmacoloacutegico dos mesmos Entre os fungos e bacteacuterias testados 15
apresentaram potencial para controle bioloacutegico
Figueiredo (2006) isolou fungos endofiacuteticos de plantas de M ilicifolia do mesmo
pomar investigado neste trabalho especialmente Pestalotiopsis spp e os avaliou quanto
ao potencial antimicrobiano contra bacteacuterias patogecircnicas em humanos e o fitopatoacutegeno
G citricarpa Os extratos metanoacutelicos de dois isolados exibiram accedilatildeo fungistaacutetica na
germinaccedilatildeo e no crescimento micelial das linhagens PC1396 e PC3305 de G
citricarpa Aleacutem disso dois extratos de Pestalotiopsis spp inibiram o crescimento dos
microrganismos-teste (S aureus oxalino resistente Klebsiella pneumoniae
Micrococcus luteus Staphylococcus aureus e Escherichia coli)
No presente trabalho observou-se que as linhagens de Phomopsis spp isolados
de M ilicifolia apresentaram excelentes resultados in vitro contra G citricarpa Pouco se
conhece a respeito da comunidade endofiacutetica existente nessas plantas e os resultados
desse trabalho demostram que abrigam uma grande variabilidade de PC1396 e
PC3305 espeacutecies de Phomopsis com portencial para bioprospecccedilatildeo Isto reforccedila a
importacircncia de estudos de microrganismos endofiacuteticos em plantas medicinais em
especial M ilicifolia e S terebinthifolius Faz-se necessaacuterio tambeacutem o estudo da
composiccedilatildeo quiacutemica dos extratos avaliados
104
6 CONCLUSOtildeES Os resultados obtidos no presente trabalho permitiram as seguintes conclusotildees
bull As espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo podem ser identificadas
apenas por caracteriacutesticas morfoloacutegicas ou marcadores moleculares
RAPD sendo necessaacuteria uma anaacutelise polifaacutesica incluindo
sequumlenciamento de vaacuterias regiotildees do genoma
bull As plantas medicinais analisadas satildeo colonizadas por grande
diversidade de espeacutecies de Phomopsis com grande variabilidade
morfoloacutegica e geneacutetica intra e interespeciacuteficas
bull As plantas de Maytenus ilicifolia analisadas satildeo colonizadas
endofiticamente por pelo menos 10 espeacutecies de Phomopsis sendo
possiacutevel identificar por sequumlecircncias ITS do rDNA isolados de P theicola e
P michaeliae
bull A planta de Schinus terebinthifolius analisada eacute colonizada
endofiticamente por pelo menos 6 espeacutecies de Phomopsis sendo
possiacutevel identificar por sequumlecircncias ITS do rDNA isolados de P
michaeliae
bull As espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo satildeo hospedeiro-especiacuteficas
sendo necessaacuteria a redefiniccedilatildeo do conceito de espeacutecie para este gecircnero
bull Os isolados de Phomopsis spp apresentaram grande potencial no
controle in vitro do fungo G citricarpa Os isolados ESIA1 e A131 (P
michaeliae) ESJE1 ESJE2 ESKD1 e ESRD1 (Phomopsis sp S1) A123
(Phomopsis sp S2) ES2KF1 e ESPAC22 (Phomopsis sp S4) ESDF1
105
(Phomopsis sp S7) A334 (Phomopsis sp S8) A124 (Phomopsis sp
S9) A126 e ESJH1 (Phomopsis sp S11) ESJD1 (Phomopsis sp S12) e
os isolados A134 A135 A115B A215A SM9631 ESFB2 e ESSD1
(Phomopsis sp) foram os mais promissores em inibir o crescimento das
linhagens PC1396 e PC3305 de G citricarpa nas metodologias
avaliadas
106
7 REFEREcircNCIAS BIBLIOGRAacuteFICAS ALBERTS B LEWIS J RALF M ROBERTS K WATSON J D Molecular Biology of the Cell 4ordf ed New York Garland Publishing 2004 ALICE C B SIQUEIRA N C S MENTZ L A SILVA G A A B JOSEacute K F D Plantas medicinais de uso popular Atlas farmacognoacutestico Canoas Editora da ULBRA 1995 ALZATE-MARIN A L BAIacuteA G S FALEIRO F G CARVALHO G A PAULA JR T J MOREIRA M A BARROS E G Anaacutelise da diversidade geneacutetica de raccedilas de Colletotrichum lindemuthianum que ocorrem em algumas regiotildees do Brasil por marcadores RAPD Fitopatologia Brasileira v 22 p 85-88 1997 ALMEIDA A M R Efeito de luz e meios de cultura sobre crescimento micelial formaccedilatildeo e tamanho de picniacutedios e esporulaccedilatildeo de isolados de Phomopsis sojae Leh In SEMINAacuteRIO NACIONAL DE PESQUISA DE SOJA Brasiacutelia 2 1981 Londrina Anais Brasiacutelia EmbrapaSNI 1982 p 216-226 ANCHORENA-MATIENZO P Re-identificaccedilatildeo e caracterizaccedilatildeo geneacutetica de levedura IZ-987 utilizando marcadores moleculares 2002 81p Dissertaccedilatildeo (Mestrado) ndash ESALQ USP Piracicaba Satildeo Paulo 2002 ANJOS J R N CHARCHAR M J A GUIMARAtildeES D P Ocorrecircncia de Queima das Folhas Causada por Phomopsis sp Em Aroeira No Distrito Federal Fitopatologia Brasileira v 26 n 3 p 649-650 2001 ARAUacuteJO J M SILVA A C AZEVEDO J L Isolation of endophytic actinomycetes from roots and leaves of maize (Zea mays L) Brazilian Archives of Biology and Technology v 43 n 4 p 447-451 2000 ARAUacuteJO W L AZEVEDO J L LIMA A O S MARCOM J SOBRAL J L LACAVA P T Manual Isolamentos de fungos endofiacuteticos Escola Superior da Agricultura Luiz de Queiroz Universidade de Satildeo Paulo Piracicaba 2002 ARNOLD E A MEJIacuteA C L KYLLO D ROJAS E I MAYNARD Z ROBBINS N HERRE E A Fungal endophytes limit pathogen damage in a tropical tree PNAS v 100 p 15649-15654 2003 AZEVEDO J L Microrganismos Endofiacuteticos In MELO I S AZEVEDO J L Ecologia Microbiana Editora EMBRAPA Jaguariuacutena-SP p 117-137 1998 AZEVEDO J L JUacuteNIOR W M PEREIRA J O ARAUacuteJO W L Endophytic microganisms a review on insect control and recent advances on tropical plants
107
Environmental Biotechnology v 3 n1 p 40-65 2000 BAAYEN R P BONANTS P J M VERKLEY G CARROL G C VAN DER AA M WEERDT M BROUWERSHAVEN G C SCHUTTE G C MACCHERONI JR W GLIENKE-BLANCO C AZEVEDO J L Nonpathogenic Strains of the Citrus Black Spot Fungus Guignardia citricarpa Identified as a Cosmopolitan Endophyte of Woody Plants Guignardia mangiferae (Phyllosticta capitalensis) Phytopathology v 92 p 464-477 2002 BAKER R E D Studies in the pathogenicity of tropical fungi II The occurrence of latent infections in developing fruits Annals of Botany London v 2 p 919-931 1938 BAO J R LAZAROVITS G Differential colonization of tomato roots by nonpathogenic and pathogenic Fusarium oxysporum strains may influence Fusarium wilt control Phytopathology Lancaster v 91 p 449-456 2001 BELL D K WELLS H D MARKHABELL D K WELLS C R In vitro antagonism ot Trichoderma species against six fungal plant pathogens Phytopathology v 72 p 379-382 1982 BETTIOL W GHINI R Controle Bioloacutegico In Manual de Fitopatologia Bergamin FILHO A AMORIM L e KIMATI H (Eds) 3ordf ed Satildeo Paulo Ceres 1995 919p BILLS G DOMBROWSKY A PELAEZ F POLISHOOK J Recent and future discoveries of pharmacologically active metabolites from tropical fungi Tropical mycology micromycetes v 2 p 165-194 2002 BITTENCOURT J V M Variabilidade geneacutetica em populaccedilotildees naturais de Maytenus ilicifolia por meio de marcadores RAPD Curitiba 2000 58p Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Agronomia ndash Produccedilatildeo Vegetal) Universidade Federal do Paranaacute BITTENCOURT J V M Variabilidade Geneacutetica em Populaccedilotildees Naturais de Maytenus Ilicifolia por Meio de Marcadores RAPD Scientia Agraacuteria v 2 p1-2 2001 BLANCO C G Guignardia citricarpa Kiely Anaacutelise geneacutetica cariotiacutepica e interaccedilatildeo com o hospedeiro Piracicaba 1999 Tese de Doutorado- escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Universidade de Satildeo Paulo BOSSALIS M C Hyperparasitism Annual Review of Phytopathology v 2 p 363-375 1964 BRAYFORD D Vegetative incompatibility in Phomopsis from elm Mycological Research v 94 n 6 p 745-752 1990
108
BODDY L GRIFFITH G S Role of endophytes and latent invasion in the development of decay communities in sapwood of angiospermous trees Sydowia v 41 p 41-73 1989 BUSSABAN B LUMYONG S LUMYONG P McKENZIE E H HYDE K D Endophytic fun i from Amomum siamense Canadian Journal of Microbiology v 47 n 10 p 943-948 2001 CAMPAROTO M L TEIXEIRA R O MANTOVANI M S VICENTINI P Effects of Maytenus ilicifolia Mart and Bauhinia candicans Benth onion root-tip and rat bone-marrow cells Genetics and Molecular Biology v 25 n1 p 85-89 2002 CARDOSO-FILHO J L Efeito de extratos de albedo de laranja (Citrus sinesis) dos indutores de resistecircncia aacutecido salicilico acil-benzolar ndash S- metil e Saccharomyces cerevisiae no controle de Phyllosticta citricarpa (Teleomorfo Guignardia citricarpa) Piracicaba 2003 125f Dissertaccedilatildeo (Doutorado) ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo CARROLL G C CARROLL F E Studies on the incidence of coniferous needle endophytes in the Pacitfic Northwest Canadian Jornal of Botany v 56 p 3034-3043 1978 CARROLL G C The Biology of endophytism in plants with particular reference to woody perennials In FOKKEMA N J HEAVEL J Van Der (Eds) Microbiology of the Phyllosphere Cambridge Cambridge University Press 1986 p 205-222 CASTLEBURY LA MENGISTU A Phylogenetic distinction of DiaporthePhomopsis isolates from soybeans [resumo] Systematic Mycology and Microbiology I v 57 n 4 p 13 2006 CENARGEN Banco de Dados on Line Disponiacutevel em lthttpicewall2cenargenembrapabr84micwebmichtmlfgbd01aspPgt Acesso em Maio de 2005 CERVI A C PACIORNIK E F VIEIRA R F MARQUES L C Espeacutecies vegetais de um remanescente de Floresta de Araucaacuteria (Curitiba-Brasil) estudo preliminar I Acta Bioloacutegica Paranaense Curitiba v18 n1-4 p73-114 1989 CHAREPRASERT S PIAPUKIEW J THIENHIRUN S WHALLEY A J S SIHANONTH P Endophytic fungi of teak leaves Tectona grandis L and rain tree leaves Samanea saman Merr Journal of Microbiology amp Biotechnology v 22 n 5 p 481-486 2006 CHRISTO D Variabilidade Geneacutetica e Diferenciaccedilatildeo Molecular de Isolados Endofiacuteticos e Patogecircnicos de Guignardia spp e Phyllosticta sp Curitiba 2002
109
78 f Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Geneacutetica) ndash Universidade Federal do Paranaacute CLAY K Effects of fungal endophyteson the seed and seedling biology of Lolium perenne and Festuca arundinacea Oecologia (Berlin) Berlin v73 p 358-362 1987 CLAY K Fungi and the food of the goods Nature v 427 p 401-402 2004 COCHRANE VW Physiology of fungi New York John Wiley 1958 524p COCKRUM P A PETTERSON D S EDGAR J A 1994 Identification of novel Phomopsins in Lupin seed extracts In Plant-associated toxins Agricultural phytochemical and ecological aspects DORLING P R p 232-237 Wallingford CAB In-ternational COELHO AG Software Bood v 3 04 2005 COIMBRA R SILVA E D Notas de Fitoterapia 2ordf ed Laboratoacuterio Cliacutenico Silva Arauacutejo SA 1958 CORDEIRO P J M VILEGAS J H Y LANCcedilAS F M HRGC-MS Analysis of Terpenoids from Maytenus ilicifolia and Maytenus aquifolium (ldquoEspinheira Santardquo) Journal of Brazilian Chemistry Society v 10 p 523-526 1999 CORRADO M RODRRIGUES KF Antimicrobial evaluation of fungal extracts produced by endophytic strains of Phomopsis sp Journal Basic Micrrobiol v44 p157-160 2004 CORREcircA RMS Caracterizaccedilatildeo de Phomopsis e Phoma obtidos de sementes de espeacutecies florestais 1995 72p Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Fitopatologia) ndash Universidade Federal de Lavras Lavras 1995 CRONQUIST A An integrated system of classification of flowering plants New York Columbia University Press 1981 CROUS PW WINGFIELD MJ FERREIRA FA ALFENAS A Mycosphaerella parkii and Phyllosticta eucalyptorum two new species from eucaliptus leaves in Brazil Mycological Research Cambridge v97 p 582-584 1993 CRUZ GL Livro Verde VolII 1a Editora Belo Horizonte-Minas Gerais 1965 DALZOTO P R GLIENKE-BLANCO C KAVA-CORDEIRO V ARAUacuteJO W L AZEVEDO J L RAPD analyses of recombinatiom process in the entomopathogenic fungus Beauveria bassiana Mycological Research v 107 p 1069-1074 2003 DJAOUIDA R SORBO G D REGGIO C ZOINA A FIRRAO G Polymorphisms in nuclear rDNA and mtDNA reveal the polyphyletic nature of isolates of Phomopsis
110
pathogenic to sunflower and a tight monophyletic clade of defined geographic origin Mycologia v 108 n 4 p 393-402 2004 DUARTE M R DEBUR M C Stem and leaf morphoanatomy of Maytenus ilicifolia Fitoterapia v 76 p 41-49 2005 EDGINTON L V KNEW K L BARRON G L Fungitoxic spectrum of benzimidazole compounds Phitopathology v 62 n 7 p 42-44 1971 EMBRAPA Fungos Endofiacuteticos Introduccedilatildeo Disponiacutevel em lthttpwwwcnpmaembrapabrprojetosendofiticosintroducaohtm1gt Acesso em Maio de 2005 ERNEST M MENDGEN W K WIRSEL W Endophytic Fungal Mutualists Seed-Borne Stagonospora spp Enhance reed biomass production in axenic microosms Molecular Plant-Microbe Interations v 16 n 7 p 580-587 2003 ESPOacuteSITO E AZEVEDO J L Fungos uma introduccedilatildeo agrave biologia bioquiacutemica e biotecnologia Caxias do Sul Edusc 510p 2004 ETHUR L Z CEMBRANEL C Z SILVA A C F Seleccedilatildeo de Trichoderma spp visando controle de Sclerotinia sclerotiorium in vitro Ciecircncia Rural v 31 n 5 p 885-887 2001 EZRA D STROBEL G A Effects of substrate on the bioactivity of volatile antimicrobials produced by Muscodor albus Plant Science St Paul v165 p913-922 2003 EZRA D CASTILLO U F STROBEL G A HESS W M PORTER H JENSEN J B CONDRON M A M TEPLOW D B SEARS J MARANTA M HUNTER M WEBER B YAVER D Coronamycins peptide antibiotics produced by a verticillate Streptomyces sp (MSU-2110) endophytic on Monstera sp Microbiology v 150 p 785-793 2004 FARR D F CASTLEBURY L A ROSSMAN A Y Morphological and molecular characterization of Phomopsis vaccinii and additional isolates of Phomopsis from blueberry and cranberry in the eastern United States Mycologia v 94 n 3 p 494-504 2002 FELSENTEIN J Conficence limits on phylogenies an approch using the bootstrap International Journal of Organic Evolution Lancaster v 39 p 366-369 1985 FERNANDEZ F A HANLIN R T Morphological and RAPD analyses of Diaporthe phaseolorum from soybean Mycologia v 88 n 3 p 425-440 1996
111
FERREIRA M E Aplicaccedilatildeo de Marcadores Moleculares no Mapeamento Geneacutetico de Plantas In III Curso de Marcadores Moleculares EMBRAPACENARGEN ndash Brasiacutelia DF 1994 FERREIRA D F Anaacutelise estatiacutestica por meio do SISVAR para Windows Versatildeo 40 In REUNIAtildeO ANUAL DA REGIAtildeO BRASILEIRA DA SOCIEDADE INTERNACIONAL DE BIOMETRIA 45 2000 Satildeo Carlos Anais Satildeo Carlos SSPSIB 2000 p 255-268 VAN SOEST P J Nutritional ecology of the ruminant 2 ed Ithaca Cornell University PressConstock Pub-lish1994 476 p FERREIRA MP OLIVEIRA CNOLIVEIRA BA LOPES MJALZAMORA F VIEIRA MAR A lyophilized aqueous extract of Maytenus ilicifolia leaves inhibits histamine-mediated acid secretion in isolated frog gastric mucose Planta v 219 p 319-324 2004 FIALHO M B Efeito in vitro Sacharomyces cerevicea sobre Guignardia citricarpa agente causal da pinta preta dos citros Piracicaba 2004 60f Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo FIGUEIREDO J G Bioprospecccedilatildeo Caracterizaccedilatildeo Morfoloacutegica e Molecular de Endoacutefitos de Maytenus ilicifolia com Ecircnfase EM Pestalotiopsis spp Curitiba 2006 Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade Federal do Paranaacute FRISVAD J C SAMSON R A Polyphasic taxonomy of Penicillium subgenus Penicillium - A guide to identification of food and air-borne terverticillate Penicillia and their mycotoxins Studies in Mycology v 49 p 1-173 2004 FRISVAD J C FRANK J M HOUBRAKEN J A M P KUIJPERS A F A SAMSON R A New ochratoxin A producing species of Aspergillus section Circumdati Studies in Mycology v 50 p 23-43 2004 FUNGARO M H P VIEIRA M L C Aplicaccedilotildees da PCR em ecologia molecular In MELO I S AZEVEDO J L (Eds) Ecologia microbiana Jaguarariuacutena Embrapa-CNPMA 1998 cap8 p205-227 FUNGARO M H P PCR na Micologia Biotecnologia Ciecircncia amp Desenvolvimento Brasiacutelia n14 p12-16 2000 GAMBOA-GAITAacuteN M A LAUREANO S BAYMAN P Endophytic Phomopsis Strains from of Guarea guidonia (Meliaceae) Journal of Science v 41 n 2 p 215-224 2005 GAO X ZHOU H XU D YU C CHEN Y QU L Hi h diversity of endophytic fun i from the pharmaceutical plant Heterosmilax japonica Kunth
112
revealed y cultivation-independent approach FEMS Microbiology Letters v 249 p 255-266 2005 GLIENKE C CHRISTO D MACCHERONI JR W AZEVEDO J L High molecular diversity of the fungus Guignardia citricarpa and Guignardia mangiferae and new primers for the diagnosis of the Citrus Black Spot Brazilian Archives of Biology and Technology Submetido 2007 GLIENKE C Variabilidade geneacutetica no fungo endoacutefito Guignardia citricarpa kiely detectada por RAPD Curitiba 1995 Dissertaccedilatildeo de Mestrado- Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade federal do Paranaacute GLIENKE-BLANCO C AGUILAR-VILDOSO CI VIEIRA MLC BARROSOP A V AZEVEDO JL Genetics variabilityb in the endophytic fungus Guignardia citricarpa isolated from citrus plants Genetics and Molecular Biology v 25 n 2 p 251-255 2002 GOacuteES A Etiologia aspectos epidemioloacutegicos e controle de Guignardia citricarpa agente causal da mancha preta do citros 100 p Relatoacuterio teacutecnico 2005 GONZALEZ M LOMBARDO A VALLARINO A J Plantas de la medicina vulgar del Uruguay Uruguay Talleres Grfificos Cerrito 149 p 1937 GUTHRIE P A I MAGILL C W FREDERIKSEN R A ODVODY G N Random amplified polymorphic DNA markers a systems for identifying and differentiating isolates of Colletotrichum graminicola Phytopathology St Paul v 82 p 832-835 1992 GURGEL LMS MENEZES M COELHO RSB Caracterizaccedilatildeo patogecircnica fisioloacutegica e isoenzimaacutetica de Phomopsis anacardii e Phomopsis mangiferae In CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA 30 1997 Poccedilos de Caldas Resumos Brasiacutelia Sociedade Brasileira de Fitopatologia 1997 p 269 GURGEL LMS MENEZES M COEcircLHO RSB Estudo comparativo de isolados de Phomopsis anacardii e Phomopsis mangiferae atraveacutes da patogenicidade e nutriccedilatildeo de C e N em trecircs regimes de luminosidade Summa Phytopathologica v 28 p 160-166 2002 GRAJAL-MARTIN M J SIMON C J MUEHLBAUER F J Use of Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) to characterize race 2 of Fusarium oxysporum fsp pisi Phytopatology v 83 p 612-14 1993 GRATTAPAGLIA D FERREIRA M E Introduccedilatildeo ao uso de marcadores moleculares em anaacutelise geneacutetica EMBRAPA Brasiacutelia 3 ed 220p 1998
113
GRIFFIN DH Fungal physiology 2ed New York Wiley-Liss 1994 458p HALL T A BioEdit48 Raileigh 1997-2001 1 arquivo (115M) Disponiacutevel em httpwwwmbioncsuedubioedithtml BioEdit a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windons 9598NT HANLIN R T MENEZES M Gecircneros ilustrados de ascomicetos UFRPE Recife-PE 1996 274p HERBERT J A GRECH NM A strain of Guignardia citricarpa the citrus black spot pathogen resistent to benomyl in South Africa Plant Disease St Paul v 69 p 1007 1985 HUANG Y WANG J LI G ZHENG Z SU W Antitumor and antifungal activities in endophytic fungi isolated from pharmaceutical plants taxus mairei Cephalataxus fortunei and Torreya grandis FEMS Immunology and Medical Microbiology v31 n47 p163-167 2001 IBRAHIM G BAYCA B Fungal bacterial and nematological problems of citrus grape and stone fruits in Arab countries Arab Journal of Plant Protection Beirut v7 n2 p190-197 1989 ITOKAWA H SHIROTA O IKUTA H MORITA H TAKEYA K IITAKA Y Triterpenes fom Maytenus ilicifolia Phytochemistry v 30 n 11 p 3713-37161991 ITOKAWA H SHIROTA O IKUTA H MORITA H TAKEYA K IITAKA Y Oligo-nicotinated sesquiterpene polyesters from Maytenus ilicifolia Journal of natural Prodcts v 56 p 1479-14851993 JASALAVICH C OSTROFSKY A JELLISON J Detection and identification of decay fungi in spruce wood by restriction fragment length polymorphism analisis of amplified genes encoding rRNA Applied and Environmental Microbiology Washington v66 n11 p 4725-4734 2000 JOHNSTON P R FULLERTON R A Cryptosporiopsis citri sp Nov cause of a citrus leal spot in the Pacific Islands New Zealand Journal of Experimental Agriculture Wellington v16 p159-163 1988 JORGE R M LEITE J P V OLIVEIRA A B TAGLIATI C A Evaluation of antinociceptive anti-inflammatory and antiulcerogenic activities of Maytenus ilicifolia Journal Ethnopharmacol v 94 n1 p 93-100 2004 KIM K H TEN L N LIU Q M IM W T LEE S T Sphingobacterium daejeonense sp nov isolated from a compost sample International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2031-2036 2006
114
KIM B Y WEON H Y LEE K H SEOK S J KWON S W GO S J STACKEBRANDT E Dyella yeojuensis sp nov isolated from greenhouse soil in Korea International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2079-2082 2006 LEE Y H SNOW J P Phenotypic and genetic variations in Diaporte phaseolorum var caulivora the soybean stem canker pathogen Phytopathology v 81 p1205 1992 LEITE J P V RASTRELLI L ROMUSSI G OLIVEIRA A B VILEGAS J H Y VILEGAS W PIZZA C Isolation and HPLC quantitative analysis of flavonoid glycosides from razilian evera es (Maytenus ilici olia and M aqui olium) Journal of Agricultural and Food Chemistry v 49 p 3796-3801 2001 LEONIAN L H A study of the factors promoting pycnidium ndash formation in some Sphaeropsidales American Journal Botanic Columbus v11 p 19-50 1924 LEUCHTMANN A PETRINI O PETRINI LE CARROLL GC Isozyme polymorphism in six endophytic Phyllosticta species Mycological Research Cambridge v96 n 4 p 287-294 1992 LI J Y STROBEL G A Jesterone and hydroxy-jesterone antioomycete cyclohexenone epoxides from the endophytic fungus Pestalotiopsis jesteri Phytochemistry v 57 p 261-265 2001 LIMA O G de COELHO J S de B WEIGERT E DrsquoALBUQUERQUE I L LIMA D de A SOUZA M A de M Substacircncias antimicrobianas de plantas superiores ndash Sobre a presenccedila de maitenina e pristimerina na parte cortical das raiacutezes de Maytenus ilicifolia procedente do Brasil Meridional Revista do Instituto de Antibioacuteticos v 11 n 1 p 35-38 1971 LIU C H ZOU W X LU H TAN R X Antifungal activity of Artemisia annuaendophyte cultures against phytopathogenic fungi Journal of Biotechnology v88 p 277-282 2001 LU H ZOU W X MENG J C HU J TAN R X New bioactive metabolites produced by Colletotrichum sp an endophytic fungus in Artemisia annua Plant Science Oxford v 151 n 1 p 67-73 2000 LU G Z CANNON P F REID A SIMMONS C M Diversity and molecular relationships of endophytic Colletotrichum isolates from the Iwokrama Forest Reserve Guyana Mycological Research v 108 n 1 p 53-63 2004 MAKI C S Diversidade e Potencial Biotecnoloacutegico de Fungos Endofiacuteticos de Cacau Theobroma cacao L Piracicaba 2006 Dissertaccedilatildeo de Doutorado ndash Setor de Agronomia- Geneacutetica e Melhoramento de Plantas Universidade Escola Superior de
115
Agricultura Luiz de Queiroz MANULIS S KOGAN N REUVEN M BEN-YEPHET Y Use of the RAPD technique for identification of Fusarium oxysporum f sp dianthi from carnation Phytopathology v84 p98-101 1993 MARTINS-CORDER M P MELO I S ANTAGONISMO IN VITRO DE Trichoderma spp A Verticillium dahliae KLEB Scientia Agriacutecola v 55 n1 p1-7 1998 MARIANO R L R Meacutetodos de seleccedilatildeo in vitro para o controle microbioloacutegico de patoacutegenos de plantas Revisatildeo Anual de Patologia de Plantas v I p 369-409 1993 McMILLAN JR RT Guignardia citricarpa a cause of black spot on mango foliage in Florida Journal of Phytopathology Berlin v117 p 260-264 1986 McPHERSON M J QUIRKE P TAYLOR G R PCR 1 A pratical approach IRL New York v1 348p 1991 McONIE K C The latent occurrence in citrus and other hosts of a Guignardia easily confused with G citricarpa the citrus black spot pathogen Phytopathology St Paul v 54 p 40-43 1964a McONIE K C Source of inoculum of Guignardia citricarpa the citrus black spot pathogen Phytopathology St Paul v 54 p 64-67 1964b MEIJER G MEGNEGNEAU G LINDERS E G Avariability for isozyme vegetative compatibility and RAPD markers in natural populations of Phomopsis subordinaria Mycological Research v98 n3 p267-276 1994 MEIRA PENNA Dicionaacuterio Brasileiro de Plantas Medicinais 3a Ed Editora Kosmos Rio de Janeiro 1946 MELO I S Agentes microbianos de controle de fungos fitopatogecircnicos In Controle bioloacutegico v I MELO I S e AZEVEDO J L (Eds) Jaguariuacutena SP Embrapa-CNPMA 1998 264p MICHELMORE R W HULBERT S H Molecular markers for genetic analysis of phytopathogenic fungi Annual Review of Phytopathology Palo Alto v 25 p 383-404 1987 MOLLER C WEBER G DREYFUSS M M Intraespecific diversity in the fungal species Chaunopycnis alba implications fo microbial screening programs Journal of industrial microbiology v 17 p 359-372 1996
116
MONTANARI T CARVALHO J E de DOLDER H Effect of Maytenus ilicifolia Martex Reiss on spermatogenesis Contraception v 57 p 335-3391998 MONTANARI T BEVILACQUIA E Effect of Maytenus ilicifolia Mart On pregnant mice Contraception v 65 p 171-1752002 MOSTERT L CROUS P W KANG J PHILLIPS A J L Species of Phomopsis and a Libertella sp occurring on grapevines with specific reference to South Africa morphological cultural molecular and pathological characterization Mycologia v 93 n 1 p 146-167 2001 MULLIS K B F A FALOONA Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction Methods Enzymol v 155 p 335-350 1987 MURALI T S SURYNARAYANAN T S GEETA R Endophytic Phomopsis species Host range and implications for diversity estimates NRC Research Press Canadaacute 2006 NEDASHKOVSKAYA O I VANCANNEYT M KALINOSKAYA N I MIKHAILOV V V SWINGS J Aquimarina intermedia sp nov reclassification of Stanierella latercula (Lewin 1969) as Aquimarina latercula comb nov and Gaetbulimicrobium brevivitae International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2037-2041 2006 NETO P A S AZEVEDO J L ARAUacuteJO W L Microrganismos Endofiacuteticos Interaccedilatildeo com Plantas e Potencial Biotecnoloacutegico Revista Biotecnologia v5 n29 2002 OrsquoDONNELL K GRAY L E Phylogenetc relationships of the soyobean sudden death syndrome pathogen Fusarium solani f sp phaseoli inferred from rDNA sequence data and PCR primers for its identification Molecular Plant Microbe Interact v 8 p 709-716 1995 OKANE I NAKAGIRI A ITO T Endophytic fun i in leaves of ericaceous plants Canadian Journal of Botany v 76 p 657-663 1998 OULLET T SEIFFERT K A Genetic characterization of Fusarium graminearum strains using RAPD e PCR amplification Phytopathology v 83 p 1003-1007 1993 PAAVANEM-HUHTALA S AVIKAINEM H YLI-MATTILA T Development of strain-specific primers for a strain of Gliocladium catenulatum used in bioological control European Journal Plant Pathological Dordrecht v106 n2 p187-198 2000 PANIZZA S Plantas que Curam (Cheiro de Mato) 15deg ed Satildeo Paulo IBRASA 1998 265 p PATEL B N PATEL R C TILVA D G Phyllosticta leaf spot a new disease in Bidi
117
tobacco nursey Tobacco Research Rajahmundry v14 p 1176-1178 1988 PATERSON R R M BRIDGE P D Biochemical techniques for filamentous fungi CAB International 125 p 1994 PARMETER J R An effect of substrate on spore form in Phomopsis Phytopatholog v 48 p 396-397 1958 PENNA E B da S Microrganismos endofiacuteticos de erva-mate (Ilex paraguariensis STHIL) e variabilidade geneacutetica em Phyllosticta sp por RAPD Curitiba 2000 123 f Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Universidade Federal do Paranaacute PETRINI O Taxonomy of endophytic fungi of arial plant tissues In FOKKEMA N J HEUVEL JVAN DEN (Ed) Microbiology of the Phyllosphere Cambrige University Press p 175-87 1986 PETRINI O Fungal endophytes of tree leaves In ANDREWS J H HIRANO S S (Eds) Microbial Ecology of Leaves New York Sprin er-Verla 1991 p 179-197 PETRINI O STONE K CARROLL F E Endophytic fungi in evergreen shrubs in western Oregon a preliminary study Canadian Journal of Botany v 60 p 789-796 1982 PHILLIPS A J L The plant pathogenic genus Phomopsis and its teleomorph (Diaporthe) Development and application of morphological biological and phylogenetic species concepts Disponiacutevel em lthttpwwwcremfctunlptbotryosphaeria_sitepersonal_web_pagehtmgt Acesso em Dezembro de 2006 PILEGGI S A V Isolamento e Caracterizaccedilatildeo de Microrganismos Endofiacuteticosde Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss por Meio de Marcadores RAPD eseu Potencial Farmacoloacutegico Curitiba 2006 Dissertaccedilatildeo de Doutorado - Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade Federal do Paranaacute PIOLI R N MORANDI E N MARTIacuteNEZ M C LUCCA F TOZZINI BISARO V HOPP H E Morphologic molecular and pathogenic characterization of diaporthe phaseolorum variability in the core soybean ndash Producing Aacuterea of Argentina Phytopathology v 93 n2 p136-146 2003 PONTECORVO G ROPER J A HEMMOS LM MAC DONALD K D BUFTON A W J The genetics of Aspergillus nidulans Advances in Genetics v 5 p141-238 1953 PONS N Estudio taxonomico de especies de Phoma y Phyllosticta sobre cantildea de azucar (Saccharum sp) Fitopatologia Venezolana Maracay v 3 p 34-43 1990
118
PROMPUTTHA I JEEWON R LUMYONG S MCKENZIE E H C HYDE K D Ribosomal DNA fingerprinting in the identification of non sporulating endophytes from Magnolia liliifera (Magnoliaceae) Fungal Diversity v 20 p 167-186 2005 QUIROGA E N SAMPIETRO A R VATTUONE M Screening antifungal activitis of selected medicinal plants Journal of Ethnopharmacology v 74 p 89-96 2001 RAEDER U BRODA P Rapid preparation of DNA from filamentous fungi Letters in Applied Microbiology Oxford v1 p17-20 1985 REHNER S A UECKER F A Nuclear ribosomal internal transcribed spacer phylogeny and host diversity in the coelomycete Phomopsis Canadian Journal of Botanic v 72 p1666-1674 1994 RIBEIRO L A de Variabilidade Geneacutetica por RAPD em fungos endoacutefitos de Gecircnero Penicillium provenientes de Zea mays L Curitiba 1995 90 f Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Universidade Federal do Paranaacute RIEDL H WECHTL E Proposal to conserve the name Phomopsis (Sacc) Bubak (1905) against Myxolibertella Hohnel (1903) Taxon v 30 n 4 p 826-828 1981 ROBES C F A mancha preta dos fungos ciacutetricos (Phyllosticta citricarpa) ameaccedila a citricultura paulista Laranja Cordeiroacutepolis v 11 p 75-86 1990 ROBES C F BITTENCUCOURT S M A mancha preta dos frutos um dos fatores limitantes agrave produccedilatildeo citricola do estado do Rio de Janeiro Comunicado Teacutecnico ndash CTAA-EMBRAPA n 19 p 1-5 1995 RODRIGUES K F SAMULES G J Fungal endophytes of Spondias mombin in Brazil a preliminary study Journal of Basic Microbiology v 39 p 131 ndash 135 1999 RODRIGUES KF HESSE M WERNER C Antimicrobial activities of secondary metabolites produced by endophytic fungi from Spondias mombin Journal of Basic Microbiology v 40 n 4 p 261-267 2000 RODRIGUES-HEERKLOTZ KF DRANDAROV K HEERKLOTZ J HESSE M WERNER C Guignardia Acid a Novel Type of Secondary Metabolite Produced by the Endophytic fungus Guignardia sp Isolation Structure Elucidation and Asymmetric Synthesis Helvetica Chimica Acta v 84 p 3766-3772 2001 RODRIGUES K F SIEBER T N GRUumlNIG R C HOLDENRIEDER O Characterization of Guignardia mangiferae isolated from tropical plants based on morphology ISSR-PCR amplifications and ITS1-58S-ITS2 sequences Mycological
119
Research Cambridge v 108 p 45-52 2004 RODRIGUES K F COSTA G L CARVALHO M P EPIFANIO R A Evaluation of extracts produced by some tropical fungi as potential cholinesterase inhibitors Journal of Microbiology and Biotechnology v21 p1617-1621 2005 RODRIGUES M B C Controle de Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta dos Citros Piracicaba 2006 67 p Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo ROHLF F J NTSYS-PC Numerical taxonomy and multivariate analysis system New York Exeter Publishing 1988 RUBINI M R SILVA-RIBEIRO R T POMELLA A W V MAKI C S ARAUacuteJO W L SANTOS D R AZEVEDO J L Diversity of endophytic fungal community of cacao (Theobroma cacao L) and biological control of Crinipellis perniciosa causal agent of Witches Broom Disease International journal of Biological Sciences v 1 n 1 p 24-33 2005 SAIKI R K SCHARF S J FALOONA F MULLIS K B HORN G T ERLICH H A ARNHEIM N Enzymatic amplification of β-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia Science v 230 p1350-1354 1985 SAMPAIO J P FELL J W GADANHO M BAUER R Kurtzmanomyces insolitus sp nov a new anamorphic heterobasidiomycetous yeast species Systematic and Applied Micorbiology v 22 p 619-625 1999 SAMUELES G J SEIFERT K A The impact of molecularcharacters on systematics of filamentous ascomycetes Annual Review of Phytopathogy Palo Alto v 33 p 37-67 1995 SANGER F NICKLEN S COULSON A R DNA Sequencing with chain terminating inhibitors Proceedings of the National Academy of Sciences of the United states of America Washington v 74 p 5463-5467 1977 SANTOS MF Anaacutelise da micoflora associada ao baru (Dipteryx alata Vog) e a caroba (Cybistax antisyphilitica (Mart) Mart) BrasiacuteliaDF 1996 Dissertaccedilatildeo de Mestrado Universidade Nacional de Brasiacutelia SATOKO K MINAKA N KOBAYASHI T KUDO A OHTSU Y Molecular Phylogenetic Analysis of Ribosomal DNA Internal Transcribed Spacer Regions and Comparison of Fertility in Phomopsis Isolates from Fruit Trees Plant Pathology v 66 p 191-210 2000
120
SCHULZ B BOYLE C DRAEGER S ROumlMMERT A KROHN K Endophytic fungi a source of novel biologically active secondary metabolites Mycological Research Cambridge v 106 p 996-1004 2002 SCHULZ B BOYLE C The endophytic continuum Mycological Research Cambridge v 109 p 661-686 2005 SETTE L D PASSARINI M R Z DELARMELINA C SALATI F DUARTE M C T Molecular characterization and antimicrobial activity of endophytic fungi from coffee plants World Journal of Microbiology and Biotechnology v 22 p 1185-1195 2006 SHIROTA O MORITA H TAKEYA K ITOKAWA H ITAKA YCytotoxic aromatic triterpenes from Maytenus ilicifolia and Maytenus chuchuhuasca Journal of Natural Products v 57 p 1675-1681 1994 SHIVAS R G ALLEN J G WILLIAMSON P M Infraspecific variation demonstrated in Phomopsis leptostromiformis using cultural and biochemical techniques Mycological Research Cambridge v 95 p 320-323 1991 SHRESTHA K STROBEL G A PRAKASH S GEWALI M Evidence for paclitaxel from three new endophytic fungi of Himalayan yew of Nepal Planta Medicinal v 67 p 374-376 2001 SILVA C G RECIO R A OLIVEIRA A B de PAIVA R L R Coleta e avaliaccedilatildeo da qualidade fitoquiacutemica de Maytenus ilicifolia M (espinheira-santa) Tribuna Farmacecircutica v 5759 p 46-50 1991 SILVA F A S The ASSISTAT Software statistical assistance In INTERNATIONAL CONFERENCE ON COMPUTERS IN AGRICULTURE 6 Anais Cancun American Society of Agricultural Engineers p 294-298 1996 SILVA F de A S AZEVEDO C A V de Versatildeo do programa computacional Assistat para o sistema operacional Windows Revista Brasileira de Produtos Agroindustriais Campina Grande v 4n 1 p 71-78 2002 SILVA G H TELES H L TREVISAN H C BOLZANI V S YOUNG M C M PFENNING L H EBERLIN M N HADDAD R COSTA-NETO C M ARAUacuteJO A R New Bioactive Metabolites Produced by Phomopsis cassiae an Endophytic Fungus in Cassia spectabilis Journal Brasileiro Chemical Society v16 n6 p 1463-1466 2005 SILVA R L DE O LUZ J S SILVEIRA E B CAVALCANTE T Fungos endofiacuteticos em Annona spp isolamento caracterizaccedilatildeo enzimaacutetica e promoccedilatildeo do crescimento em mudas de pinha (Annona squamosa L) Acta Botanica Brasilica v
121
20 n 3 p 649-655 2006 SILVEIRA EB 2001 Bacteacuterias promotoras de crescimento de plantas e biocontrole de doenccedilas Pp 71-100 In R Barros e SJ Michereff Proteccedilatildeo de plantas na agricultura sustentaacutevel Recife Imprensa Universitaacuteria da UFRPE SIMOtildeES C M O MENTZ L A SCHENKEL E P IRGANG B E STEHMANN J R Plantas da medicina popular no Rio Grande do Sul Porto Alegre Editora da UniversidadeUFRGS 174p 1986 SIVANESAN A The bitunicate ascomycetes and their anamorphs J Cramer Germany 701p 1984 SNEATH P H A SOKAL R R Numerical Taxonomy W H freeman Co San Francisco 1973 SOUZA FORMIGONI M L OLIVEIRA M G MONTEIRO M G DA SILVEIRA FILHO N G BRAZ S CARLINI E A Antiulcerogenic effects of two Maytenus species in laboratory animals Journal of Ethnopharmacology v 34 n 1 p 21-27 1991 SOUZA A Q L SOUZA A D L SPARTACO A F PINHEIRO M L B SARQUIS M I M PEREIRA J O Atividade antimicrobiana de fungos endofiacuteticos isolados de plantas toacutexicas da Amazocircnia Palicourea longiflora (aubl) rich e Strychnos cogens bentham Acta Amazocircnica v 34 n 2 p 185-195 Manaus 2004 SPOacuteSITO MB AMORIM L BASSANEZI RB BERGAMIN FILHO A HAU B Spatial pattern of black spot incidence within citrus trees related to disease severity and pathogen dispersal Plant Pathology p 103-108 2008 STAMFORD T L M ARAUacuteJO J M STAMFORD N P Atividade enzimaacutetica de microrganismos isolados do Jacatupeacute (Pachyrhizus erosus L Urban) Ciecircncia Tecnoloacutegica de Alimentos v 18 p 382-385 1998 STIERLE A STROBEL G STIERLE D GROTHAUS P BIGNAMI G The search for a taxol-producin microor anism amon the endophytic fun i of the Pacific yew Taxus bre i olia Journal of Natural Products v 58 n 9 p 1315-1324 1995 STINSON M ERZA D HESS W M SEARS J STROBEL G An endophytic Gliocladium sp Of Eucryphia cordifolia producing selective volatile antimicrobial compounds Plant Science St Paul v165 p 913-922 2003 STROBEL A G Rainforest Endophytes and Bioactive Products Critical Reviews in Biotechnology Boca Raton v 22 n 4 p 315-333 2002
122
STROBEL G A Endophytes as sources of bioactive products Microbes and Infection v 5 p 535-544 2003 STROBEL G DAISY B Bioprospecting for Microbial Endophytes and their Natural Products Microbiology and Molecular Biology Reviews v 67 n 4 p 491-502 2003 SUGHA SK SINGH BM SHARMA BM Studies on Phyllosticta glumarum causing glume blight of rice (Oryza sativa L) Himachal Journal of Agricultural Research Palampur v 12 n 1 p 11-14 1986 TAYLOR-ROSA S G BARROS I BCaracterizaccedilatildeo das sementes de Maytenus ilicifolia Mart Ex Reiss espinheira - santa e viabilidade de sua propagaccedilatildeo sexuada Porto Alegre 1994106f Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Universidade Federal do Rio Grande do Sul THOMPSON J D HIGGINS D G GIBSON T J Clustal W Improving the sensitiviy of rogressive multiple alignment through sequence weighting positions-specific gap penalties and weight matrix choice Nucleic Acids Research v 22 p 4673-4680 1994 TIMNICK MB LILLY VG BARNETT HL Factors affeting sporulation of Diaporthe phaseolorum var batatatis from soybean Phytopathology St Paul v 41 n 4 p 327-336 1951 UECKER F A A World list of Phomopsis names with notes on nomenclature morphology and biology National Fungus Collection v 13 1988 VAN DER AA H A Studies in Phyllosticta I Studies in Mycology n 5 1973 VAN DER AA H A M E Noordeloos and J de Gruy-ter Species concepts in some larger genera of the Coelomycetes Studies in Mycology v 32 p 3-19 1990 VASCONCELOS MJV ALMEIDA MA HENNING AMR BARROS AA MOREIRA EG Differentiation of Colletotrichum truncatum isolates by random amplified polymorphic DNA Fitopatologia Brasileira Brasiacutelia v 19 p 520-523 1994 VELICHETI R K McCCLARY C LAMISON R D SINCLAIR J B Immunodetection of the Diaporthe and Phomopsis complex of soybeans Phytopathology v 81 p 1212 1991 VIDIC M Variability in Diaporthe phaseolorum var caulivora on soybean in the Vojvodina Providence in Serbia Zastita Bilja v 42 p 183-189 1991
123
VILARINHOS A D PAULA JR T J BARROS E G MOUREIRA M A Characterization of races of Colletotrichum lindemutianum by the random amplified polymorfic DNA technique Fitopatologia Brasileira Brasiacutelia v20 p194-198 1995 VILLA- CARVAJAL M COQUE J J R ALVAREacuteZ-RODRIGUEacuteZ M L URUBURU F BELLOCH C Polyphasic identication of yeasts isolated from bark of cork oak during the manufacturing process of cork stoppers FEMS Yeast Research v 4 p 745-750 2004 VIRET O PETRINI O Colonization of eech leaves (Fagus syl atica) by the endophyte Discula umbrinella (teleomorph Apiognomonia errabunda) Mycological Research v 98 p 423-432 1994 WAGENAAR M CORWIN J STROBEL G A CLARDY J Three new chytochalasins produced by an endophytic fungus in the genus Rhinocladiella Journal Natural Products v 63 p1692-1695 2000 WALKER M R RAPLEY R Guia de rotas na tecnologia do gene Atheneu Satildeo Paulo 1999 334p WANG J Li G LU H ZHENG Z HUANGY SU W Taxol from Tubercularia sp strain TF5 an endophytic fungus of Taxus mairei FEMS Microbiology Letters v 193 p 249-253 2000 WATSON J D GILMAN M WITKOSWSKI J ZOLLER M Recombinant DNA 2 ed New York Freeman and Company 1992 WELSH J McCLELLAND M Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers Nucleic Acid Research Oxford v 18 p 7213-7218 1990 WHITE Jr J MORROW A C Endophyte-host associations in forage grasses XII A fungal endophyte to Trichachne insularis belonging to Psedocercosporella Mycologia Lawrence v 78 n 5 p 846-850 1989 WHITE Jr J F MORROW A C Endophyte-host associations in forage grasses XII A fungal endophyte of Trichachne insularis belonging to Pseudocercosporella Mycologia Lawrence v 82 p 218-226 1990 WHITE Jr J F MORGAN-JONES G MORROW AC Taxonomy life cycle reprodution and detection of Acremonium endophytes Agriculture Ecosystem amp Environment v 44 p13-37 1993 WILLIAMS J G K KUBELIK A R LIVAK K J RAFALSKI J A TINGER S V DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers Nucleic Acids Research v 18 n 22 p 6531-6535 1990
124
WILLIAMS J G K HANAFEY M K RAFALSKI J A TINGEY S V Genetic analysis using random amplifield polymorphic DNA markers Methods in Enzymology San Diego v 218 p 704-740 1993 ZHANG A W RICCIONI L PEDERSENW L KOLLIPARA K P HARTMAN G L Molecular identi-fication and phylogenetic grouping of Diaporthe phaseolorum and Phomopsis longicolla isolates from soybean Phytopathology v 88 p1306 -1314 1998 ZOU W X MENG J C LU H CHEN G X SHI G X ZHANG T Y TAN R X Meta olites of Colletotrichum gloeosporioides an endophytic fun us in Artemisia mongolica Journal of Natural Products v 63 n 11 p 1529-1530 2000 ZOU W X TAN R X Endophytes a rich source of functional metabolites Natural Product Reports v18 p 448-459 2001
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ANEXOS
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 496671024 9933420 94396 MEIOS DE CULTURA 2 137912854 68956427 655287 INTERACcedilAtildeO A 100 193198257 1931983 18359 INTERACcedilAtildeO b 100 10989107 0109891 1044 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
INTERACcedilAtildeO A INTERACcedilAtildeO ENTRE OS MEIOS DE CULTURA E OS ISOLADOS de Phomopsis INTERACcedilAtildeO B INTERACcedilAtildeO ENTRE AS REPETICcedilOtildeES DOS ISOLADOS DE Phomopsis significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS ENTRE OS MEIOS DE CULTURA
BDA 5169935 a MEA 4973856 b AV 3921569 c
CV = 62
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 1 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM DIFERENTES MEIOS DE CULTURA
126
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 230248366 4604967 43761 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS ESBA1 700 a A323 700 a A215A 700 a ESSD1 700 a SM9713 700 a ESGF1 700 a SM9631 700 a ESJD1 700 a ESKD1 667 a A334 667 a ESDF1 633 b A132 633 b A123 600 b A333A 600 b MU0123 600 b ESJH1 600 b A321 600 b ESRD1 600 b A116 600 b A134 567 b A115B 567 b ESIA1 533 c
ANEXO 2ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO BDA
127
A131 500 c SM9714 500 c A135 500 c ESIE1 500 c ESFB2 500 c A124 500 c ESPAC22 500 c ES2KF1 500 c A113 500 c ESJE1 500 c ESJE2 433 d ESFH1 400 d ESJG1 400 d ES2WC1 400 d PHO1 400 d SM9638 400 d ES2NA1 400 d ES2AB1 400 d ESFF1 400 d AT9811 400 d AT9810 400 d ES2WF1 400 d A126 400 d PHO19 400 d A216B 400 d ES80J 367 d ESGA1 367 d AT9906 300 e A333B 233 f
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
128
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 189058824 3781176 35932 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS ESKD1 700 a ESJE2 600 b A123 600 b ESJE1 533 c SM9638 500 c AT9811 500 c SM9713 500 c PHO1 500 c ESBA1 500 c SM9631 500 c ESFB2 500 c A334 500 c A323 500 c MU0123 500 c A333A 433 d ESJD1 433 d ESGF1 433 d A116 433 d PAC22 400 e ESDF1 400 e A321 400 e A132 400 e ES2KF1 400 e
ANEXO 3ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO AVEIA
129
ESJG1 400 e ESRD1 400 e PHO19 400 e A115B 400 e A124 400 e ESFF1 367 e A134 367 e ESIE1 367 e A135 367 e A131 367 e A113 367 e ES2WF1 367 e SD1 367 e ESIA1 333 e ESGA1 300 f ESJH1 300 f ESFH1 300 f AT9906 300 f ES2NA1 300 f A216B 300 f ES80J 300 f ESA215A 267 f AT9810 200 g A333B 200 g ES2AB1 200 g SM9714 200 g ES2WC1 200 g
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
130
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 270562092 5411242 51423 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS A323 733 a SM9631 700 a ESKD1 700 a A134 700 a ESIE1 700 a A116 667 b A334 667 b A215A 633 b ESSD1 633 b A321 600 c MU0123 600 c ESGF1 600 c ESRD1 600 c AT9811 600 c SM9713 600 c A123 600 c ESJH1 600 c ESDF1 600 c A131 567 c IA1 567 c ESBA1 567 c ESJD1 567 c A333A 533 d A135 500 d
ANEXO 4ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO MEA
131
ES2NA1 500 d A124 500 d A132 500 d SM9714 500 d ESFB2 500 d A115B 467 e ES2AB1 433 e A216B 433 e A113 433 e PHO1 400 f SM9638 400 f ES2WF1 400 f A126 400 f ESJE1 400 f ESPAC22 400 f ESFF1 400 f ES2KF1 400 f ESJG1 367 f ES80J 367 f ESJE2 333 g ESFH1 333 g AT9906 300 g ESGA1 300 g SM9810 300 g ES2WC1 300 g A333B 233 h PHO19 233 h
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
132
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 46 1602192500 34089202 1617590 RESIacuteDUO 432 91040000 210741 Total 478 1693232500
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO AT9906 352 a AT9810 353 a ESFH1 297 b ESPAC22 195 c ES2KF1 194 c SM9631 193 c ESGA1 184 cd PHO19 184 cd ES80J 166 de ESRD1 152 ef ESFB2 143 efg ESJE2 142 efg ESJE1 142 efg ESJG1 131 fgh A323 127 fghi A333A 126 ghij A135 123 ghij A124 123 ghij A126 123 ghij A132 123 ghij A131 123 ghij A134 123 ghij
ANEXO 5 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO DOS ESPOROS BETACONIacuteDIOSDOS ISOLADOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA
133
A115B 123 ghij ESIE1 123 ghij ES2WC1 119 ghil ES2WF1 119 ghil SM9713 116 hil A334 116 hil ESIA1 115 hil A333B 113 hil ESFF1 113 hil ESGF1 111 hil ES2AB1 107 him A123 107 him A113 107 him ESJD1 106 him ESKD1 105 im ES2NA1 104 im A215A 103 im SM9714 102 im ESSD1 101 m ESJH1 97 m MU0123 96 m A321 96 m ESDF1 95 m A216B 95 m A116 85 m
DMS = 259444 CV = 1052904
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
134
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 21 2674219 127344 459861 RESIacuteDUO 88 243688 002769 Total 109 2917907
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 293 a Fungicida Derosal 236 b ESGF1 157 c ESGA1 137 cde ESFH1 134 cdef ESIA1 120 cdefg ES2KF1 119 cdefgh ESFF1 146 cdefgh ES2NA1 111 defgh ES2AB1 110 defgh ESKD1 114 defgh ESJE2 110 defgh ESBA1 112 defgh ESRD1 098 efgh ESJG1 099 efgh ESJE1 099 efgh ESFB2 096 fgh ESJH1 094 gh ESJD1 093 gh ESIE1 095 gh ESSD1 078 h ESDF1 078 h
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 6 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
DMS = 039023 CV = 1340825
135
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 9 974154 108239 225325 RESIacuteDUO 40 192148 004804 Total 49 1166302
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 201 a
fungicida 174 ab AT9906 139 bc AT9810 117 cd AT9811 102 cde SM9638 110 cde SM9714 076 de SM9631 075 de MU0123 067 e SM9713 065 e
DMS = 046460 CV = 1946824
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 7 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
136
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 22 2382133 108279 239352 RESIacuteDUO 92 416192 004524 Total 114 2798325
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 244 a ES2WC1 237 a fungicida 185 b ES80J 138 bc A333B 136 cd ES2WF1 117 cde A333A 113 cde A132 110 cde A215A 106 cde A116 102 cde A124 101 cde A115B 101 cde A135 100 cde A215B 097 cde A321 094 cde A334 093 cde A323 092 cde A123 091 cde A113 091 cde A126 089 de A131 088 e ESPAC22 085 e A134 076 e
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 8 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
DMS = 050157 CV = 1809416
137
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA
FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 6210037 124201 165056 RESIacuteDUO 204 1535052 007525 Total 254 7745089
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 302 a FUNGICIDA Derosal 244 abc ES2WC1 277 ab AT9906 224 bcd AT9810 222 bcde SM9638 218 bcdef ESGF1 201 cdefg A333B 188 cdefgh A132 167 defghi SM9714 159 defghij ESFF1 153 efghil ES2WF1 150 fghil ESGA1 149 fghil ESFH1 147 ghil ES80J 147 ghil MU0123 144 ghil ES2NA1 143 ghil AT9713 142 ghim A321 141 ghim A216B 140 ghim AT9811 139 ghim A116 137 ghim
ANEXO 9 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305
138
ESBA1 134 ghim ES2AB1 133 ghim A323 132 ghin ESJG1 131 ghin ESIE1 130 hin A333A 129 hin A113 127 hin A134 125 hin ESSD1 122 hin ESKD1 121 hin ESIA1 117 in A124 113 in A334 112 in ES2KF1 112 in ESJE1 110 in ESPAC22 108 in A131 108 in A126 106 in A135 102 in ESRD1 094 n SM9631 093 n ESJE2 090 n ESJH1 090 n ESFB2 088 n ESJD1 087 n A123 087 n ESDF1 086 n A115B 072 n A215A 062 n
DMS = 070465 CV = 1983267
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
139
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 28 2145366 076620 407144 RESIacuteDUO 116 218300 001882 Total 144 2363666
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 222 a ESRD1 19 b A131 176 b ESIA1 178 b SM9713 162 bc ESJD1 162 bc A126 154 bcd MU0123 149 bcde A333A 134 cdef ESGA1 134 cdef A113 133 cdef ESGF1 130 cdef A334 130 cdef ESBA1 140 cdef SM9638 127 def ESJH1 119 efg ESDF1 115 fgh ESSD1 112 fgh ESKD1 113 fgh ES2AB1 111 fghi A124 111 fghi
ANEXO 10 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 PARA DETECCcedilAtildeODE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
140
A215A 109 fghi A321 108 fghi A134 089 ghij A115B 082 hij ESFF1 078 ij ESFH1 071 l A123 062 l ES2WF1 042 l
DMS = 033193 CV = 1095343
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
141
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA
FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 28 11264938 402319 481124 RESIacuteDUO 116 970000 008362 Total 144 12234938
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 422 a ESGA1 275 b ESGF1 267 bc ESBA1 265 bc SM9713 261 bc A333A 251 bcd ESSD1 235 bcde MU0123 234 bcde ESKD1 211 bcdef A215A 203 cdef A321 188 defg A131 173 efgh SM9638 167 efgh A124 148 fghi ESJD1 147 fghi A113 130 ghij ESIA1 122 ghij ES2AB1 128 ghij ESDF1 124 ghij A334 112 hij A115B 106 hij
ANEXO 11 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 PARA DETECCcedilAtildeODE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
142
ESRD1 104 hij ES2WF1 086 il A134 083 il A126 080 il ESFF1 075 l A123 065 l ESFH1 025 l ESJH1 017 l
DMS = 069970 CV = 1193907
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
43
ANE
XO
12
ndash M
ATR
IZ D
E D
AD
OS
PA
RA
CA
RA
CTE
RIZ
ACcedil
AtildeO
CR
ITEacuteR
IOS
ME
DID
AS
ME
IOS
DE
C
ULT
UR
A
MU
0123
SM
9631
SM
9638
SM
9713
SM
9714
AT9
810
AT9
811
AT9
906
ES
2AB
1
ES
2KF1
ES2N
A1
ES2W
C1
ES2W
F1
ES
80J
ESBA
1
ESD
F1
ES
FB2
ES
FF1
ESFH
1
ES
GA
1
ESG
F1
ESIA
1
ESIE
1
ESJD
1
ESJE
1
ESJE
2
1 AV 1 0 1 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 MEA 0 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 BDA 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 1 1 0
2 AV 1 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1 1 1 3 AV 0 0 0 0 1 0 0 1 1 1 0 1 0 0 0 1 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 4 AV 1 0 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
MEA 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
5 AV 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
6 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0 BDA 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1
7 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 BDA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0
8 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 0 0 0
9 AV 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 1 BDA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1
10 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 MEA 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1
11 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
12 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
13 AV 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 MEA 0 0 1 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 1 0 1 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0
14 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 1 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 0
44
BDA 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 15 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0
16 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 0
17 AV 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 1 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0
18 AV 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 MEA 0 1 0 0 1 0 1 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 BDA 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1
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677 a 633 cm MEA 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 600 a 567 cm MEA 0 1 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 467 a 433cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 400 a 367cm MEA 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 333 a 300cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
233cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 700 a 667cm BDA 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 633 a 567cm BDA 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 1 1 0 1 0 0 533 a 500cm BDA 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 433 a 367cm BDA 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1
300cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 233cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 700cm AV 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
600cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 433cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 400 a 333cm AV 1 0 0 1 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 1 300 a 267cm AV 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 200cm AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0
Nota - Caracteriacutestica avaliada nos trecircs meios As caracteriacutesticas foram avaliadas seguindo os seguintes criteacuterios
48
1 Bordos da colocircnia regular (1) ou irregular (0) 2 Miceacutelio denso 3 Miceacutelio ralo 4 Miceacutelio granuloso aeacutereo 5 Miceacutelio algodonoso 6 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Branco 7 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Marrom 8 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Cinza 9 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Verde 10 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Amarelo 11 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Bege 12 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Preto 13 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Branco 14 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Marrom 15 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Preto 16 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Cinza 17 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Verde 18 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Amarelo 19 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Bege 20 Esporulaccedilatildeo com esporulaccedilatildeo (1) sem esporulaccedilatildeo (0) 21 Coniacutedio do tipo alfa 22 Coniacutedio do tipo beta 23 Comprimento dos coniacutedios do tipo beta 24 Diacircmetro meacutedio do crescimento das colocircnias
49 ANEXO 13 LOCAL DA COLETA DE FOLHAS DE Schinus terebinthifoliusCENTRO POLITEacuteCNICO ndash CURITIBAPR
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RENATA RODRIGUES GOMES
Phomopsis spp ENDOacuteFITOS DE PLANTAS MEDICINAIS DIVERSIDADE
GENEacuteTICA E ANTAGONISMO AO FUNGO Guignardia citricarpa
Dissertaccedilatildeo apresentada ao Programa de Poacutes-Graduaccedilatildeo em Geneacutetica da Universidade Federal do Paranaacute como requisito parcial para a obtenccedilatildeo do grau de Mestre em Ciecircncias Bioloacutegicas Aacuterea de Concentraccedilatildeo em Geneacutetica
Orientadora Profordf Drordf Chirlei Glienke
Co-orientador Prof Dr Joatildeo Luacutecio de Azevedo
CURITIBA 2008
AGRADECIMENTOS
Agrave minha orientadora Profordf Drordf Chirlei Glienke pela oportunidade ensinamentos
inestimaacuteveis sugestotildees e contribuiccedilotildees oferecidas as quais sem duacutevidas muito
enriqueceram o trabalho Sobretudo pelo exemplo de dedicaccedilatildeo agrave vida acadecircmica
Ao meu co-orientador Prof Dr Joatildeo Lucio Azevedo pela dedicaccedilatildeo e
valorizaccedilatildeo da pesquisa cientiacutefica e pela oportunidade de realizaccedilatildeo desse trabalho
Agrave minha banca de acompanhamento Profordf Drordf Patriacutecia Dalzoto e a Drordf Kaacutetia
Rodrigues pelas sugestotildees e contribuiccedilotildees oferecidas cooperando para o
desenvolvimento desse trabalho
Agraves Profas Dras Lygia Vitoacuteria Galli-Terasawa e Vanessa Kava-Cordeiro pela
convivecircncia sugestotildees e auxiacutelio no LabGeM
Ao Dr Aacutelvaro Almeida da EMBRAPA de Londrina-PR e a Drordf Socircnia Pillegi pelas
linhagens de Phomopsis que muito contribuiacuteram para elucidaccedilatildeo da pesquisa
Ao Prof Dr Joseacute Odair Pereira e a MsC Antonia Souza da Universidade Federal
do Amazonas e a MsC Josiane Gomes pelas linhagens de Pestalotiopsis utilizadas
neste trabalho
Agrave EMBRAPA de Colombo Paranaacute pela disponibilidade da coleta de folhas de
espinheira santa
Agrave Profordf Drordf Thelma Alvim que sempre se disponibilizou no auxiacutelio a microscopia
oacutetica
Aos Professores do Mestrado em Geneacutetica que contribuiacuteram para minha
formaccedilatildeo
Aos meus amigos de turma da poacutes-graduaccedilatildeo Carolina Abuaacutezar Caroline
Bernardi Clineu Uehara Daniele Matoso Dellyana Boberg Fabio Rigoti Maacutercia
Oliveira Patriacutecia de Franccedila Thaiacutes Sczepanski Virginia Coser e Vitor Dantas pelos
momentos de convivecircncia e conforto durante essa jornada Sem vocecircs jamais
suportaria a saudade
Agrave minha amiga Tatiane pelos momentos alegres na convivecircncia diaacuteria pelo
carinho companheirismo pelo conforto durante as minhas preocupaccedilotildees e receios
dentro e fora do laboratoacuterio Assim como pelas excelentes ideacuteias que muito contribuiacuteram
neste trabalho
Aos alunos de Poacutes-graduaccedilatildeo do LabGeM Jociney Josiele Josiane em
especial a Danyelle e Juliana pela amizade e cooperaccedilatildeo no desenvolvimento deste
trabalho
Ao doutorando Rafael Noleto do Laboratoacuterio de Citogeneacutetica Animal pelo
auxiacutelio no desenvolvimento deste trabalho
Aos amigos do LabGeM pela agradaacutevel convivecircncia e ajuda nos momentos
mais difiacuteceis Andreacute Carol Andrade Carol Silvano Douglas Flaacutevia Fernanda Larice
Lisiane Lucinir Maysa Patriacutecia Rosana e Taciana
Agrave amiga Izolde Gartner pela ajuda e disponibilidade
Agrave Anilda Gomes da Silva pelo eventual auxiacutelio teacutecnico na SEAD
Agrave Luciana Marques secretaacuteria do Programa de Poacutes-Graduaccedilatildeo em Geneacutetica
pelas orientaccedilotildees e informaccedilotildees
Aos meus pais Gislene Rodrigues Gomes e Raimundo de Andrade Gomes por
terem ensinado a buscar meus ideais e pelo esforccedilo e compreensatildeo em manterem-se
distantes todos esses anos que dediquei aos estudos
Ao meu companheiro Helder Franklin pela compreensatildeo o carinho e pela sua
admiraacutevel placidez sobretudo ao apoio e contribuiccedilatildeo para a realizaccedilatildeo deste ideal
Aos meus amigos e familiares pelo carinho compreensatildeo e incentivo nesse
periacuteodo de ausecircncia Sobretudo pelos exemplos de dedicaccedilatildeo e respeito ao proacuteximo
Agrave minha amiga Hafiza pelos conselhos compreensatildeo incentivo paciecircncia e
apoio
ldquoDe tudo ficaram trecircs coisas
A certeza de que estamos sempre comeccedilando
A certeza de que precisamos continuar
A certeza de que seremos interrompidos antes
de terminar
Portanto devemos
Fazer da interrupccedilatildeo um caminho novo
Da queda um passo de danccedila
Do medo uma escada
Do sonho uma ponte
Da procura um encontrordquo
(Fernando Pessoa)
RESUMO Phomopsis spp ENDOacuteFITOS DE PLANTAS MEDICINAIS DIVERSIDADE GENEacuteTICA E ANTAGONISMO AO FUNGO Guignardia citricarpa Autora Renata Rodrigues Gomes Orientadora Chirlei Glienke Microrganismos endofiacuteticos vivem no interior das plantas sem causar dano ao seu hospedeiro podendo produzir compostos biologicamente ativos antibioacuteticos fungicidas e herbicidas Essa comunidade endofiacutetica pode estar relacionada com a accedilatildeo antimicrobiana de plantas medicinais A planta Maytenus ilicifollia conhecida como espinheira-santa eacute uma planta medicinal muito utilizada no tratamento de uacutelceras gaacutestricas e tratamentos digestivos tiacutepica da Ameacuterica do Sul em especial da regiatildeo Sul do Brasil e atualmente encontra-se ameaccedilada de extinccedilatildeo As plantas medicinais Spondias mombin Myracrodruon urundeuva Schinus terebinthifolius e Aspidosperma tomentosun tecircm sido usadas na medicina devido as suas propriedades antimicrobianas No presente trabalho foram isolados fungos endofiacuteticos do gecircnero Phomopsis e avaliados quanto a sua variabilidade geneacutetica e estrutura populacional por meio de marcadores RAPD Observou-se que as plantas medicinais analisadas satildeo colonizadas por grande diversidade de espeacutecies de Phomopsis com grande variabilidade morfoloacutegica e geneacutetica intra e interespeciacuteficas Os isolados foram identificados por meio de sequumlecircncias das regiotildees ITS1 58S e ITS2 do DNA ribossomal e testados quanto ao potencial antimicrobiano contra as linhagens PC1396 e PC3305 de Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta do Citros Foi possiacutevel identificar nove isolados em niacutevel de espeacutecie por meio de sequumlecircncias ITS do rDNA sendo 4 como P michaeliae 2 como P theicola 2 como P longicolla e 1 como P sojae Foi possiacutevel verificar que as plantas de Maytenus ilicifolia analisadas satildeo colonizadas endofiticamente por pelo menos dez espeacutecies de Phomopsis e as plantas de Schinus terebinthifolius por pelo menos seis espeacutecies deste gecircnero As anaacutelises morfoloacutegicas por meio de marcadores RAPD e sequenciamento de ITS do rDNA permitem sugerir que as espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo satildeo hospedeiro-especiacuteficas sendo necessaacuteria a redefiniccedilatildeo do conceito de espeacutecie para este gecircnero Na anaacutelise antimicrobiana todos os isolados apresentaram grande potencial no controle in vitro do fungo G citricarpa destacando-se os isolados ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ES2AB1 (Phomopsis sp S6) ES2WF1 (Phomopsis sp S4) e ESFH1 (P theicola) que inibiram o crescimento das linhagens PC1396 e PC3305 de G citricarpa em trecircs metodologias avaliadas Desta forma esse estudo indica que os isolados de Phomopsis spp endoacutefitos de plantas medicinais satildeo produtores de substacircncias bioativas que devem ser melhor caracterizadas Palavras chaves Phomopsis spp endoacutefitos plantas medicinais RAPD sequumlecircncias da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
ABSTRACT Phomopsis spp ENDOPHYTES OF MEDICINAL PLANTS GENETIC DIVERSITY AND ANTAGONISM IN THE FUNGUS Guignardia citricarpa Author Renata Rodrigues Gomes Adviser Chirlei Glienke-Blanco Endophytic microorganisms live in plants without causing damage to their host being able to produce active biological compounds antibiotics fungicides and herbicides This endophytic community may be related to the antimicrobial action of medicinal plants The plant Maytenus ilicifolia known as ldquoespinheira santardquo is a medicinal plant greatly used for the treatment of stomach ulcers and digestive problems typical from the South America especially in the southern part of Brazil and currently is in danger of extinction The medicinal plants Spondias mombin Myracrodruon urundeuva Schinus terebinthifolius and Aspidosperma tomentosun have been used in medicine due to their antimicrobial properties In the present work endophytic fungi of the genus Phomopsis were isolated and their genetic variability and population structure assessed using RAPD markers The medicinal plants analyzed are colonized by a great variety of Phomopsis species with a high morphological and genetic variability both intra and interspecific The isolated fungi were identified through sequences of ITS1 58S and ITS2 regions of ribosomal DNA and tested in their antimicrobial potential against the PC1396 and PC3305 lineages of Guignardia citricarpa the responsible for the ldquoblack spot in Citrusrdquo It was possible to identify 9 isolates at the level of species through the analysis of ITS sequences of rDNA and among these isolates 4 were identified as P michaeliae 2 as P theicola 2 as P longicolla and 1 as P sojae It was possible to verify that the Maytenus ilicifolia plants analyzed are endophytically colonized by at least ten Phomopsis species and that Schinus terebinthifolius are colonized by at least six species of this genus The morphological analyses using RAPD markers and sequencing of ITS regions of rDNA make possible to suggest that the analyzed species of Phomopsis are not host-specific being necessary the redefinition of the species concept for this genus For the antimicrobial analysis all the isolates presented a high in vitro control potential of the fungus G citricarpa particularly the isolates ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ES2AB1 (Phomopsis sp S6) ES2WF1 (Phomopsis sp S4) and ESFH1 (P theicola) that inhibited the growth of the PC1396 and PC3305 lineages of G citricarpa in the three methodologies tested Thus this study indicates that the isolates of Phomopsis spp endophytic of medicinal plants are producers of bioactive substances which should be better characterized Key words Phomopsis spp endophytes medicinal plants RAPD ITS1 58S and ITS2 of rDNA sequences
LISTA DE FIGURAS
FIGURA 1- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis DE Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT 9811 e AT 9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 59
FIGURA 2- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE
Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 61
FIGURA 3- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 64
FIGURA 4- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
PATOGEcircNICOS OBTIDOS DE Glycine max EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 68
FIGURA 5- DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp EM MEIO MEA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 69
FIGURA 6- DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 70
FIGURA 7- AVALIACcedilAtildeO DAS MEacuteDIAS DO DIAcircMETRO DAS COLOcircNIAS DOS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO AV APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 71
FIGURA 8- FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis EM BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 73
FIGURA 9- FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DO ISOLADO SM9713 EM
MEIOS BDA e AV APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB
LUZ CONTIacuteNUA 74 FIGURA 10- COMPRIMENTO DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS
DE Phomopsis spp APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO EM BDA A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 75
FIGURA 11- DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE
SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 77
FIGURA 12- ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE
MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 78
FIGURA 13- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX11 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 79
FIGURA 14- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX14 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 79
FIGURA 15- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX19 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 80
FIGURA 16- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO OPE
08 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 80
FIGURA 17- DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE
SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS DE Phomopsis POR MEIO DE MARCADORES MOLECULARES RAPD 82
FIGURA 18- ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE
GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 84 FIGURA 19- AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA
REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MEacuteTODO DE PARCIMOcircMIA) 86
FIGURA 20- AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA PARCIAL BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MODELO NEIGHBOR-JOINING COM CORRECcedilAtildeO KIMURA DOIS PARAcircMETROS) 87
FIGURA 21- INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa PC1396 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA 93
FIGURA 22- INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia
citricarpa 3305 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA 96 FIGURA 23- AVALIACcedilAtildeO DO CRESCIMENTO DAS COLOcircNIAS DO
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 e PC3305 INOCULADAS APOacuteS RETIRADA DO PAPEL CELOFANE PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS EM MEIO BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 98
FIGURA 24- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 99
FIGURA 25- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 100
LISTA DE TABELAS
TABELA 1- ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR 32
TABELA 2- ISOLADOS GRUPO EXTERNO PARA ANAacuteLISE DE
VARIABILIDADE GENEacuteTICA POR RAPD 35 TABELA 3- EacutePOCAS DO ANO OacuteRGAtildeOS DA PLANTA CONDICcedilOtildeES DE
INCUBACcedilAtildeO E Nordm DE FRAGMENTOS PLAQUEADOS NAS QUATRO COLETAS DE ENDOacuteFITOS DE ESPINHEIRA-SANTA 42
TABELA 4- SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA
AMPLIFICACcedilAtildeO DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL 47
TABELA 5- SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA
AMPLIFICACcedilAtildeO DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL 49
TABELA- 6- Linhagens de Phomopsis spp E de Pestalotiopsis vismae utilizadas
como grupo externo 52 TABELA 7- PORCENTAGEM DE ISOLAMENTO DE Phomopsis
ENDOFIacuteTICOS DE PLANTAS DE ESPINHEIRA SANTA 56 TABELA 8- PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE
OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC1396 94
TABELA 9- PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE
OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 96
TABELA 10- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 101
LISTA DE ANEXOS
ANEXO 1- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM DIFERENTES MEIOS DE CULTURA 125
ANEXO 2- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO BDA 126
ANEXO 3- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO AVEIA 128
ANEXO 4- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO MEA 130
ANEXO 5- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO DOS
ESPOROS BETACONIacuteDIOS DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA 132
ANEXO 6- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 134
ANEXO 7- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 135
ANEXO 8- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 136
ANEXO 9- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 137
ANEXO 10- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS 139
ANEXO 11- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
141
ANEXO 12- MATRIZ DE DADOS PARA CARACTERIZACcedilAtildeO 143 ANEXO 13- LOCAL DA COLETA DE FOLHAS DE Schinus terebinthifolius
CENTRO POLITEacuteCNICO ndash CURITIBA PR 149
SUMAacuteRIO 1 INTRODUCcedilAtildeO 1
2 OBJETIVOS 3
3 REVISAtildeO BIBLIOGRAacuteFICA 4
31 Microrganismos Endofiacuteticos 4
32 Ocorrecircncia de endoacutefitos 7
33 Fungos endofiacuteticos de plantas medicinais 9
34 Endoacutefitos Produtores de Substacircncias Antimicrobianas 11
35 Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss 14
351 Componentes quiacutemicos e propriedades terapecircuticas 16
352 Endoacutefitos isolados de Maytenus ilicifolia 18
36 Guignardia citricarpa Kiely e a Mancha preta do citros 18
361 Mancha Preta do Citros 21
37 O Gecircnero Phomopsis sp 22
38 Marcadores Moleculares 25
381 Marcadores RAPD 27
382 Marcadores ITS 29
4 MATERIAL E MEacuteTODOS 32
41 Material Bioloacutegico 32
411 Fungos endofiacuteticos 32
412 Microrganismos usados para teste de antagonismo 35
413 Fungos endofiacuteticos utilizados para anaacutelise de variabilidade geneacutetica 35
42 Meios de Cultura 35
421 Caldo MEB (Extrato de Malte) 35
422 Meio AV (Aveia-Aacutegar) 36
423 Meio BDA (Meio Batata-Dextrose-Aacutegar) 36
424 Meio MC (Meio Completo) PONTECORVO et al 1953 37
425 Meio MEA (Extrato de Malte) PATERSON e BRIDGE 1994 37
43 Soluccedilotildees e Reagentes 38
431 Clorofane 38
432 Clorofil 38
433 Derozal Bayerreg 38
434 Dodecil Sulfato de Soacutedio (SDS) 10 38
435 Fenol Saturado 38
436 Gel de Agarose (08) 38
437 Gel de Agarose (15) 38
438 Lactofenol azul 38
439 Marcador de peso molecular (DNA de fago lambda clivado com Hind III
Gibco) 39
4310 Marcador de peso molecular (DNA Ladder 100pb Ludwing Biotec) 39
4311 Oligonucleotiacutedeos (Invitrogen) 39
4312 RNAse (invitrogen) 39
4313 Soluccedilatildeo de Vitaminas 40
4314 Soluccedilatildeo salina (pv) 40
4315 Soluccedilatildeo Tween-80 01 (vv) 40
4316 Soluccedilatildeo de Tetraciclina 40
4317 Soluccedilatildeo de EDTA 05M 40
4318 Soluccedilatildeo de brometo de etiacutedio 40
4319 Tampatildeo TE (Tris-EDTA) 41
4320 Tampatildeo de Extraccedilatildeo de DNA 41
4321 Tampatildeo da Amostra (6x) 41
4322 Tampatildeo de corrida TBE 10x 41
44 Isolamento 42
45 Conservaccedilatildeo dos fungos 43
46 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica 43
47 Obtenccedilatildeo de colocircnia monospoacuterica 44
48 Caracterizaccedilatildeo Molecular 44
481 Extraccedilatildeo do DNA (RAEDER e BRODA 1985 modificado por GLIENKE
1995) 44
482 RAPD 45
4821 Anaacutelise da Variabilidade Geneacutetica 46
483 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA 47
4831 Amplificaccedilatildeo 47
4832 Purificaccedilatildeo da PCR 48
48321 Purificaccedilatildeo com PEG 48
48322 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio 48
4833 Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento 49
4834 Purificaccedilatildeo da Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento 50
48341 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em tubos 50
48342 Purificaccedilatildeo com Purificaccedilatildeo com Isopropanol em placa 50
48343 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio 51
4835 Ediccedilatildeo e Anaacutelise das Sequumlecircncia 51
49 Avaliaccedilatildeo da Atividade Antimicrobiana 52
491 Cultura Pareada 52
492 Avaliaccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis 53
493 Atividade dos Extratos metanoacutelicos 54
4931 Obtenccedilatildeo dos extratos 54
4932 Crescimento micelial 55
410 Anaacutelise Estatiacutestica 55
5 RESULTADOS E DISCUSSAtildeO 56
51 Isolamento 56
52 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de Phomopsis 58
53 Caracterizaccedilatildeo Molecular de Phomopsis spp 78
531 RAPD 78
532 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA 85
54 Avaliaccedilatildeo da atividade antimicrobiana 92
541 Cultura pareada 92
542 Teste para detecccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis 97
543 Avaliaccedilatildeo da accedilatildeo dos Extratos 98
6 CONCLUSOtildeES 104
7 REFEREcircNCIAS BIBLIOGRAacuteFICAS 106
ANEXOS 125
1
1 INTRODUCcedilAtildeO
A bioprospecccedilatildeo visa identificar plantas e microrganismos dentre a diversidade
de vida existente em determinado local que possam servir como fonte de substacircncias
bioativas que em uacuteltima instacircncia sejam uacuteteis para o desenvolvimento de novas
drogas Neste contexto os fungos endofiacuteticos satildeo considerados de grande importacircncia
pois representam uma fonte potencial de novos compostos quiacutemicos e bioloacutegicos
podendo ser utilizados natildeo somente na Medicina mas tambeacutem na Fitopatologia e
Veterinaacuteria (STROBEL 2002 STROBEL 2003) O potencial de aplicaccedilatildeo de
microrganismos endofiacuteticos no controle bioloacutegico tambeacutem vem sendo explorado
Os microrganismos endofiacuteticos vivem no interior das plantas interagindo com
diferentes espeacutecies sem causar dano ao seu hospedeiro Esses microrganismos
podem influenciar vaacuterias caracteriacutesticas das plantas e conferir certos benefiacutecios a este
vegetal como por exemplo produccedilatildeo de antibioacuteticos Haacute alguns anos natildeo se conhecia
a grande potencialidade dos endofiacuteticos entretanto este interesse vem aumentando
com a descoberta recente de caracteriacutesticas como a produccedilatildeo de compostos
biologicamente ativos antibioacuteticos fungicidas e herbicidas
Plantas medicinais com propriedades antimicrobianas tambeacutem satildeo habitadas por
microrganismos endofiacuteticos sugerindo que a accedilatildeo antibacteriana ou antifuacutengica poderia
estar no endoacutefito e natildeo na planta ou provavelmente na sua interaccedilatildeo No Brasil vaacuterios
autores mostraram a produccedilatildeo de faacutermacos por endoacutefitos como Xylaria sp Fusarium
moniliforme Colletotrichum sp Guignardia sp e tambeacutem Phomopsis sp
Fungos do gecircnero Phomopsis satildeo encontrados como endoacutefitos nos espaccedilos
intercelulares de tecidos de diversos vegetais entre eles a espinheira-santa (Maytenus
ilicifolia Mart Reiss) planta pertencente agrave famiacutelia Celastraceae Essa planta medicinal
encontrada principalmente no sul do Brasil foi acrescentada agrave lista das espeacutecies
consideradas em extinccedilatildeo no Paranaacute pelo governo do Estado em 1995 Tendo em
vista que pouco se conhece a respeito da comunidade endofiacutetica existente nessa
planta sua diversidade e seu potencial antimicrobiano tornam-se relevantes estudos
de diversidade e bioprospecccedilatildeo
2
Pileggi (2006) demonstrou existir alta diversidade de isolados do gecircnero
Colletotrichum dentre outros fungos filamentosos bacteacuterias e actinomicetos em plantas
de Maytenus ilicifolia do pomar do Centro Nacional de Pesquisa de Florestas (CNPF)
da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaacuteria (EMBRAPAPR) Alguns desses
isolados apresentaram potencial antimicrobiano inibindo o crescimento de Fusarium
sp Guignardia citricarpa e Micrococcus luteus
Endoacutefitos com atividade antagonista contra o fungo Guignardia citricarpa agente
causal da Mancha Preta dos Citros (MPC) poderiam ser utilizados no controle bioloacutegico
desta doenccedila uma vez que o emprego sucessivo de fungicidas como controle de
doenccedilas de plantas apresenta dentre outros problemas a seleccedilatildeo de linhagens
resistentes do patoacutegeno
O gecircnero Phomopsis representa uma fonte potencial de novos compostos
quiacutemicos e bioloacutegicos como vem sendo relatado em diversos trabalhos Oito dos
isolados que foram estudados nesse trabalho jaacute haviam sido avaliados no
IOCFIOCRUZRJ e possuem potencial antimicrobiano (RODRIGUES et al 2004)
Poreacutem tais isolados ainda natildeo haviam sido caracterizados geneticamente nem
identificados em niacutevel de espeacutecie A identificaccedilatildeo e a caracterizaccedilatildeo molecular dos
microrganismos endofiacuteticos satildeo uacuteteis pois o gecircnero Phomopsis eacute de difiacutecil identificaccedilatildeo
em niacutevel de espeacutecie utilizando-se apenas caracteriacutesticas morfoloacutegicas
Estudos moleculares satildeo realizados na busca de padrotildees geneacuteticos nestes
organismos complementando sua caracterizaccedilatildeo O polimorfismo do DNA amplificado
ao acaso (RAPD) propicia uma forma raacutepida para avaliar a diversidade geneacutetica
existente nestes organismos a estruturaccedilatildeo populacional e para auxiliar na
identificaccedilatildeo ao niacutevel de espeacutecie comparando-as com linhagens referecircncia Outra
estrateacutegia importante nessa caracterizaccedilatildeo baseia-se em marcadores de Sequumlecircncias
Internas Transcritas do DNA Ribossocircmico (ITS) para identificaccedilatildeo taxonocircmica dos
isolados
3
2 OBJETIVOS
1 Isolar linhagens endofiacuteticas de Phomopsis spp de plantas sadias de Maytenus
ilicifolia e Identificar os isolados utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas
2 Caracterizaccedilatildeo de Phomopsis spp endofiacuteticos das plantas medicinais Schinus
terebinthifolius Myracrodruon urundeuva Spondias mombin Aspidosperma
tomentosum pertencentes agrave coleccedilatildeo do LABGEM
3 Avaliar a variabilidade geneacutetica e estrutura populacional das linhagens de
Phomopsis spp por meio de marcadores RAPD (Polimorfismo do DNA
Amplificado ao Acaso)
4 Identificar as linhagens por meio de sequumlecircncias da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do
DNA ribossomal
5 Testar a atividade antimicrobiana de linhagens do fungo Phomopsis spp contra
linhagens do fitopatoacutegeno Guignardia citricarpa
4
3 REVISAtildeO BIBLIOGRAacuteFICA
31 Microrganismos Endofiacuteticos
Microrganismos endofiacuteticos satildeo aqueles que vivem no interior das plantas
interagindo com outras espeacutecies de microrganismos sem causar dano ou prejuiacutezo ao
seu hospedeiro Esses microrganismos podem influenciar em vaacuterias caracteriacutesticas
expressas pelas plantas Segundo Neto Azevedo e Araujo (2002) os endoacutefitos podem
desempenhar relevante funccedilatildeo para a sanidade vegetal jaacute que atuam como agentes
controladores de microrganismos fitopatogecircnicos no controle de insetos e ateacute na
proteccedilatildeo da planta contra herbiacutevoros Todas as plantas jaacute estudadas satildeo habitadas por
microrganismos endofiacuteticos principalmente fungos e bacteacuterias
A comunidade endofiacutetica cuja composiccedilatildeo varia em funccedilatildeo do hospedeiro e das
condiccedilotildees ambientais tem indiviacuteduos que se inter-relacionam dentro da planta em um
equiliacutebrio harmocircnico O desequiliacutebrio dessa harmonia afeta o comportamento de todos
os integrantes da comunidade dando condiccedilotildees para que fungos oportunistas
manifestem seu potencial patoloacutegico contra hospedeiro (MAKI 2006)
A distinccedilatildeo entre endofiacuteticos fitopatogecircnicos e oportunistas eacute puramente
didaacutetica Haacute um gradiente tecircnue que os separa e assim agrave distacircncia entre um e outro
pode ser muito pequena sendo difiacutecil impor limites para separar cada categoria Assim
um microrganismo pode ser considerado endofiacutetico mas com a reduccedilatildeo dos
mecanismos de defesa da planta pode se comportar como um patoacutegeno (AZEVEDO et
al 2000)
A ocorrecircncia de microrganismos endofiacuteticos nos vegetais resulta da penetraccedilatildeo
atraveacutes de feridas ocasionadas nas raiacutezes pela abrasatildeo destas com o solo aberturas
naturais como hidatoacutedios e estocircmatos aberturas artificiais sofridas pela accedilatildeo de
pragas animais e o homem ou agressotildees abioacuteticas (RIBEIRO 1995) ou ainda atraveacutes
da secreccedilatildeo de enzimas hidroliacuteticas (ESPOacuteSITO e AZEVEDO 2004) A penetraccedilatildeo
pode ocorrer por meio de esporos levados pelo vento ou hifas que invadem os tecidos
Muitos endoacutefitos produzem massas de coniacutedios delgados caracteriacutestica associada com
5
a dispersatildeo por chuvas (RIBEIRO 1995) Outra forma de propagaccedilatildeo se daacute pela
transmissatildeo vertical por meio de sementes (WHITE MORGAN-JONES E MORROW
1993 CLAY 2004)
Viret e Petrini (1994) usando microscopia eletrocircnica de varredura e transmissatildeo
detectaram a presenccedila de fungos no interior dos hospedeiros Clay (1987) verificou a
presenccedila de hifas dos fungos Acremonium lolli e A coenophialum no espaccedilo
intercelular da regiatildeo meristemaacutetica no mesofilo das folhas no cerne da inflorescecircncia
na semente
Os endoacutefitos apresentam uma relaccedilatildeo mutualiacutestica antagoniacutestica ou neutra com
o hospedeiro A interaccedilatildeo de um fungo com seu hospedeiro vegetal variam e depende
do modo pelo qual o fungo infecta a planta e tambeacutem da extensatildeo da resposta de
defesa desta A colonizaccedilatildeo pode ser sistecircmica ou local inter ou intracelular (ARAUacuteJO
SILVA E AZEVEDO 2000)
Os fungos endofiacuteticos atuam no controle bioloacutegico de fitopatoacutegenos por
ocuparem o mesmo nicho ecoloacutegico destes (ARAUacuteJO SILVA E AZEVEDO 2000)
Segundo Schulz e Boyle (2005) aproximadamente 80 dos fungos endofiacuteticos
produzem compostos biologicamente ativos como antibioacuteticos fungicidas e herbicidas
Esses microrganismos endofiacuteticos podem ser utilizados como fontes de
metaboacutelitos primaacuterios (STAMFORD ARAUacuteJO E STAMFORD 1998) e secundaacuterios que
inibem o desenvolvimento de patoacutegenos (LI et al 2001 LI e STROBEL 2001 ZOU e
TAN 2001) Como exemplo pode-se citar o taxol uma droga quimioterapecircutica usada
no tratamento de cacircncer de mama e ovaacuterio (WANG et al 2000 e STROBEL et al
2003) O aacutecido coletoacutetrico um metaboacutelico do fungo endofiacutetico Colletotrichum
gloeosporioides isolado da Artemisia mongoacutelica apresenta atividade antimicrobiana
contra Bacillus subtilis Staphylococcus aureus Sarcina lutea e contra o fungo
patogecircnico Helminthosporium sativum (ZOU et al 2000) Lu et al (2000) identificaram
trecircs novos metaboacutelitos do fungo endofiacutetico Colletotrichum sp isolado de Artemisia
annua com propriedades antimicrobianas Diversos autores relatam agrave accedilatildeo
antimicrobiana de substacircncias produzidas por fungos endofiacuteticos como Rodrigues
6
Hesse e Werner (2000) Liu et al (2001) Stinson et al (2003) Bao e Lazarivits (2001)
Huang et al (2001) Strobel (2003) Rodrigues (2004) Chareprasert et al (2006)
Os microrganismos endofiacuteticos satildeo tambeacutem capazes de produzirem anti-
helmiacutenticos e inseticidas (AZEVEDO et al 2000 ESPOacuteSITO e AZEVEDO 2004)
apresentando grande potencial que pode ser explorado na agricultura (ZOU e TAN
2001)
Schulz et al (2002) isolaram mais de seis mil e quinhentos fungos endofiacuteticos de
aacutervores e herbaacuteceas na busca de novos metaboacutelitos com potencial para novos
produtos industriais e sugerem que a associaccedilatildeo entre fungos endofiacuteticos e seus
hospedeiros conduza agrave produccedilatildeo de metaboacutelitos secundaacuterios com atividade
antimicrobiana e anti-herbicida
Autores sugerem que certos fungos endofiacuteticos produzem compostos igualmente
presentes em suas plantas hospedeiras como o taxol utilizado para o tratamento de
cacircncer presente tanto na planta medicinal Taxus brevifolia como no fungo endofiacutetico
Taxomyces andreanae (STIERLE et al 1995) Outros exemplos satildeo algumas enzimas
(celulases e lignases) em Xylaria sp fatores de crescimento como giberelina em
Fuzarium moniliforme Indicando uma possiacutevel transposiccedilatildeo de genes entre plantas e
fungos em uma verdadeira engenharia geneacutetica in vivo Se esses casos forem
confirmados ficaraacute evidente que vegetais e fungos transgecircnicos podem ocorrer
naturalmente pela transferecircncia de genes entre espeacutecies pertencentes a diferentes
reinos (AZEVEDO 1998)
Rodrigues Hesse e Werner (2000) pesquisaram a atividade bioativa de extratos
de fungos endofiacuteticos isolados da planta Spondias mombin L (cajazeiro) Estes extratos
incluindo o de Phomopsis sp foram testados contra determinados microrganismos O
fungo apresentou atividade contra actinomicetos Cladosporium elatum Mycotypha sp
e S cerevisae
Aleacutem da produccedilatildeo de antimicrobianos fungos endofiacuteticos podem excluir
patoacutegenos que ocupem o mesmo nicho ecoloacutegico por competiccedilatildeo como relatado por
Bao e Lazarovits (2001) com Fusarium oxysporum f sp Lycopersici patogecircnico e
Fusarium oxysporum natildeo patogecircnico
7
Os fungos endofiacuteticos satildeo de grande importacircncia pois representam uma fonte
potencial de novos compostos quiacutemicos e bioloacutegicos podendo ser utilizados natildeo
somente na Medicina mas tambeacutem na Fitopatologia e Veterinaacuteria (STROBEL 2002
STROBEL 2003) Tendo em vista essa importacircncia vaacuterios trabalhos vecircm sendo
recentemente publicados envolvendo a capacidade de endofiacuteticos antagonizarem
fitopatoacutegenos assim como satildeo descobertos e descritos metaboacutelitos e outras
substacircncias de interesses produzidos por endofiacuteticos
3 2 Ocorrecircncia de endoacutefitos Uma diversidade de microrganismos endofiacuteticos estaacute presente no interior de
plantas aparentemente saudaacuteveis com potencial para serem estudadas A composiccedilatildeo
das espeacutecies pode variar de acordo com o hospedeiro distribuiccedilatildeo geograacutefica idade da
planta condiccedilotildees ecoloacutegicas e sazonais incluindo altitude e precipitaccedilatildeo Uma ou duas
espeacutecies satildeo predominantes como endofiacuteticas em um dado hospedeiro enquanto
outros isolados satildeo pouco frequumlentes (CARROLL 1978 ARNOLD 2003)
Petrini Stone e Carroll (1982) verificaram um padratildeo de dominacircncia de espeacutecies
em que o endoacutefito encontrado com maior frequumlecircncia em uma determinada espeacutecie
vegetal era isolado menos frequentemente de outros hospedeiros Por outro lado os
endoacutefitos encontrados com menor frequumlecircncia em uma planta pareciam ser menos
especiacuteficos pois eram isolados em um amplo espectro de hospedeiros mas com baixa
frequumlecircncia
A colonizaccedilatildeo do fungo endofiacutetico Stagonospora sp no hospedeiro Phragmites
australis ocorre de forma diferenciada no decorrer do ano Na primavera o endoacutefito eacute
encontrado somente na raiz enquanto no outono ele eacute encontrado em todo o vegetal
(ERNEST MENDGEN e WIRSEL 2003) Gao et al (2005) constataram uma flutuaccedilatildeo
sazonal para os endoacutefitos isolados de Heterosmilax japonica Kunth os autores
verificaram maior abundancia de populaccedilotildees endofiacuteticas em amostras coletadas na
primavera do que no veratildeo
8
Tanto a planta hospedeira como a regiatildeo onde os endofiacuteticos satildeo isolados pode
influenciar a produccedilatildeo de metaboacutelitos secundaacuterios De acordo com dados estatiacutesticos
Bills et al (2002) compararam a produccedilatildeo de metaboacutelitos de endofiacuteticos provenientes
de regiotildees tropicais e de regiotildees temperadas Os dados revelaram que regiotildees tropicais
satildeo mais ricas na produccedilatildeo tanto de endoacutefitos como dos metaboacutelitos secundaacuterios
A presenccedila de endoacutefitos em plantas pode variar dentro de espeacutecies de um
mesmo hospedeiro Nestes hospedeiros tambeacutem eacute encontrada uma grande variedade
geneacutetica entre isolados endofiacuteticos da mesma espeacutecie Tal variabilidade foi encontrada
em isolados do fungo Guignardia citricarpa obtidos de citros (GLIENKE 1995) em
duas espeacutecies de Colletotrichum sp isoladas de Maytenus ilicifolia (PILEGGI 2006) e
tambeacutem Pestalotiopsis sp isolados de Maytenus ilicifolia (FIGUEIREDO 2006)
O gecircnero Phomopsis tem sido frequentemente isolado como endoacutefito em uma
grande variedade de plantas
Azevedo et al (2000) apresentaram algumas plantas hospedeiras de onde jaacute
foram isoladas espeacutecies de Phomopsis entre elas Sabal bermudana Trachycarpus
fortunei Cavendishia pubescens Stylosanthes guianensis Anacardium occidentale e
Mangifera indica Corrado e Rodrigues (2004) isolaram endofiacuteticos de Phomopsis das
plantas medicinais Spondias mombin e Aspidosperma tomentosun
Bussabam et al (2001) isolaram predominantemente Phomopsis sp
Colletotrichum gloeosporiodes Glomerella sp e Xylaria sp endoacutefitos de folhas
pseudocaules e rizomas de gengibre (Amomum siamense Criab) coletadas em dois
locais na Tailacircndia
Em plantas de cacau (Theobroma cacao L) resistentes e suscetiacuteveis ao agente
causal da vassoura da bruxa endoacutefitos foram identificados por caracteriacutesticas
morfoloacutegicas e sequumlenciamento de rDNA como pertencentes aos gecircneros
Acremonium Blastomyces Botryosphaeria Cladosporium Colletotrichum
Cordyceps Diaporthe Fusarium Geotrichum Gibberella Gliocladium Lasiodiplodia
Monilochoetes Nectria Pestalotiopsis Phomopsis Pleurotus Pseudofusarium
Rhizopycnis Syncephalastrum Trichoderma Verticillium e Xylaria Os autores
identificaram ainda alguns endoacutefitos potencialmente antagonistas destacando-se
9
Gliocladium catenulatum que reduziu em 70 a incidecircncia da vassoura da bruxa in
vivo em placircntulas de cacaueiro (RUBINI et al 2005)
O gecircnero Phomopsis foi isolado como endoacutefito de graviola (Annona muricata L)
e pinha (Annona squamosa L) dois isolados promoveram eficientemente o crescimento
vegetal mostrando-se promissores para agricultura uma vez que satildeo capazes de
aumentar a produccedilatildeo dessas culturas (SILVA et al 2006) A capacidade de estimular o
crescimento vegetal apresentada por esses organismos tem sido atribuiacuteda a
mecanismos diretos tais como a fixaccedilatildeo do nitrogecircnio produccedilatildeo de fitohormocircnios e
indiretos como antagonismo em relaccedilatildeo a patoacutegenos levando consequumlentemente ao
aumento na taxa de germinaccedilatildeo crescimento das raiacutezes e parte aeacuterea nuacutemero de
folhas e flores aacuterea foliar e rendimento de culturas (SILVEIRA 2001)
Alguns dos relatos citam o gecircnero Phomopsis como fitopatoacutegeno isolado de
Citrus aurantium (Laranjeira) Citrus nobilis (Tangerineira) Citrus paradisi (Pomelo)
Citrus australis (Laranja) Citrus sinensis (Laranja da China) Citrus sp (Citros)
Mangifera indica (Mangueira) Glycine max (Soja) Ficus carica (Figueira) e Anacardium
occidentale (Cajueiro) entre muitas outras plantas (CENARGEN EMBRAPA 2005) Foi
descrito como agente causal da mancha foliar em Myracrodruon urundeuva (ANJOS
CHARCHAR e GUIMARAtildeES 2001) O fungo Phomopsis sp tambeacutem eacute encontrado
associado a sementes de Dipteryx alata e Cybistax antisyphilitica espeacutecies comuns nos
Cerrados (SANTOS 1996)
33 Fungos endofiacuteticos de plantas medicinais Os microrganismos endofiacuteticos satildeo encontrados em muitas espeacutecies de plantas
medicinais A accedilatildeo antimicrobiana de algumas dessas plantas poderiam estar
relacionadas agrave sua comunidade endofiacutetica sugere-se entatildeo que o princiacutepio ativo
antimicrobiano pode ser produzido pelo microrganismo e natildeo propriamente pelo
vegetal ou provavelmente pela interaccedilatildeo planta-hospedeiro
As plantas Aspidosperma tomentosum e Spondias mombin satildeo utilizada no
Brasil devido as suas propriedades antimicrobianas A avaliaccedilatildeo dos metaboacutelitos
10
secundaacuterios produzidos pelo fungo endofiacutetico Phomopsis sp isolado dessas plantas
demonstraram excelentes resultados na inibiccedilatildeo de bacteacuterias fungos filamentosos e
leveduras (CORRADO e RODRIGUES 2004)
Rodrigues Hesse e Werner (2000) avaliaram metaboacutelitos produzidos por fungos
endofiticos isolados de Spondias mombin Guignardia sp apresentaram atividade
contra Escherichia coli Staphylococcus aureus Saccharomyces cerevisiae Geotrichum
sp e Penicillium canadesis Metaboacutelitos de Pestalotiopsis guepinii apresentaram
atividade contra S cerevisiae Os metaboacutelitos produzidos por Phomopsis sp foram
eficientes contra Cladosporium elantum Mycotypha sp e S cerevisiae
Heterosmilax japonica Kunth eacute uma planta medicinal conhecida na China por
seus efeitos diureacuteticos Gao et al (2005) avaliaram a comunidade de fungos endofiacuteticos
e observaram uma grande variedade de fungos colonizando o interior das plantas entre
eles Phomopsis Mycospharella Aureobasidium Cladosporium Glomerella
Botryosphaeria e Guignardia
Plantas do gecircnero Taxus demonstraram atividade anticanceriacutegena assim como
isolados endofiacuteticos dessas plantas O paclitaxel e alguns de seus derivados utilizados
no tratamento de cacircncer satildeo produzidos pelo fungo endofiacutetico Taxus andreanae
isolado da planta medicinal T brevifolia (STROBEL et al 1993 STIERLE et al 1995) e
pelos fungos endofiacuteticos Sporormia minima e Trichothecium sp isolados da planta
medicinal T wallichiana (SHRESTHA et al 2001) A planta medicinal T marei de onde
foi isolado o fungo Tubercularia sp tambeacutem demonstrou atividade anticanceriacutegena
(WANG et al 2000)
O fungo Colletotrichum sp foi isolado como endoacutefito da planta medicinal
Artemisia annua utilizada pelos chineses como uma droga antimalaacuterica produziu
atividade antimicrobiana contra patoacutegenos humanos e de plantas (LU et al 2000) O
fungo endofiacutetico C gloeosporioides da espeacutecie A mongoacutelica sintetiza aacutecido coletoacutetrico
que apresenta atividade antimicrobiana (ZOU et al 2000)
11
34 Endoacutefitos Produtores de Substacircncias Antimicrobianas
A antibiose eacute definida como a interaccedilatildeo entre organismos na qual um ou mais
metaboacutelitos produzidos por um organismo tecircm efeito danoso sobre o outro (BETTIOL e
GHINI 1995) Segundo Melo (1998) muitos fungos e bacteacuterias inibem fitopatoacutegenos
competindo por nutrientes parasitando eou produzindo metaboacutelitos secundaacuterios como
enzimas liacuteticas e antibioacuteticos O resultado dessas interaccedilotildees antagocircnicas tais como
antibiose competiccedilatildeo induccedilatildeo de defesa e parasitismo leva ao controle bioloacutegico de
doenccedilas de plantas assim como pode desenvolver um papel muito importante na
medicina com a descoberta de novos faacutermacos
RODRIGUES HESSE e WERNER (2000) pesquisaram a atividade
antimicrobiana de metaboacutelitos secundaacuterios produzidos por fungos endofiacuteticos de
Spondias mombin (Anacardiaceae) contra actinomicetos bacteacuterias Gram-positivas e
Gram-negativas leveduras e fungos filamentosos e verificaram que os extratos de
Guignardia sp Phomopsis sp e Pestalotiopsis guepinii inibiram o crescimento de
actinomicetos Os extratos de Guignardia sp tambeacutem apresentaram atividade
antimicrobiana contra Escherichia coli Staphylococcus aureus Saccharomyces
cerevisiae Geotrichum sp e Penicillium canadensis Metaboacutelitos de P guepinii foram
ativos contra S cerevisae e os isolados de Phomopsis sp mostraram accedilatildeo antifuacutengica
contra Cladosporium elatum Mycotypha sp e S cerevisae
Liu et al (2001) estudaram a atividade antifuacutengica de fungos endofiacuteticos isolados
de Artemisia annua sobre os fitopatoacutegenos Gaeumannomyces graminis Fusarium
graminearum Rhizoctnia cerealis Phytophthora capsici helminthosporium sativum e
Gerlachia nivalis encontrando isolados com accedilatildeo inibitoacuteria para todos os patoacutegenos Lu
et al (2000) estudando a mesma planta constataram atividade de trecircs novos
metaboacutelitos produzidos pelo fungo Colletotrichum sp apresentando atividade
antifuacutengica contra Bacillus subtilis Sataphylococcus aureus Sarcina lutea
Pseudomonas sp Candida albicans Aspergillus niger e inibiccedilatildeo de crescimento dos
fungos patogecircnicos Gaeumannomyces graminis var tritici Rhizoctonia cerealis
Helminthosporium sativum e Phytophora capisici
12
A Cinnamomum zeylnicum (canela) eacute uma planta utilizada no tratamento de
uacutelceras estomacais hipertensatildeo arterial resfriados e dores abdominais Ezra e Strobel
(2003) isolaram dessa planta o fungo Muscodor albus que apresenta accedilatildeo fungicida
fungistaacutetica bactericida e bacteriostaacutetica por emissatildeo de compostos orgacircnicos volaacuteteis
O mesmo foi relatado para o fungo Gliocladium sp da planta Eucryphia cordifolia
inibindo o crescimento dos fungos fitopatogecircnicos Pythium ultimum e Verticillum dahliae
(STINSON et al 2003)
Citocalasinas satildeo metaboacutelitos fuacutengicos relacionados pela estrutura e atividade
bioloacutegica com capacidade antitumoral e atividade antibioacutetica Estas substacircncias
apresentam efeitos que incluem a inibiccedilatildeo da divisatildeo do citoplasma e dos movimentos
celulares induccedilatildeo do deslocamento nuclear retraccedilatildeo de coaacutegulos e agregaccedilatildeo de
plaquetas transporte de glucose e secreccedilatildeo da tireoacuteide Recentemente trecircs novas
citocalasinas foram relatadas como provenientes do fungo endofiacutetico Rhinocladiella sp
de Tripterygium wilfordii (WAGENAAR et al 2000)
Li e Strobel (2001) purificaram duas ciclohexenonas produzidas pelo fungo
endofiacutetico Pestalotiopsis jesteri isolado da planta Fragraea bodenii (Gentianaceae) a
jesterona e a hidroxil-jesterona das quais a primeira apresentou atividade antifuacutengica
contra o patoacutegeno Pythium ultimum Outro metaboacutelito isoldado de P microspora
isolado endofiticamente da planta Terminalia morobensis a isopestacina
(isobenzofuranona) tambeacutem se mostrou ativo contra Pythium ultimum entre outros
fungos como Sclerotinia sclerotiorum e Rhizoctonia (STROBEL et al 2002)
Adicionalmente a isopestacina apresentou atividade antioxidante contra uma variedade
de radicais livres testados
A Monstera sp eacute uma planta que cresce sobre o tronco de aacutervores dela foi
isolado o endoacutefito Streptomyces sp MSU-2110 na Amazocircnia Peruana Este
actinomiceto produz um peptiacutedeo denominado coronamicina com atividade
antimicrobiana contra o fungo patogecircnico Cryptococcus neoformans e agrave bacteacuteria
Streptococcus pneumoniae mas a melhor atividade foi a demonstrada contra
protozoaacuterio Plasmodium falciparum sugerindo potencialidade como uma droga
13
antimalaacuterica Aleacutem da coronamicina este endoacutefito tambeacutem produz outros compostos
com atividades antifuacutengicas (EZRA et al 2004)
Castillo et al (2002) isolaram e caracterizaram um antibioacutetico de largo espectro
a munumbicina produzida por uma outra linhagem endofiacutetica de Streptomyces
denominada NRRL 30562 isolada da planta medicinal Kennedia nigriscans nativa do
Norte da Austraacutelia O extrato do endoacutefito obtido com solvente orgacircnico foi purificado e
submetido a HPLC (Cromatografia Liacutequida de Alta Eficiecircncia) Os quatro componentes
principais resultantes foram denominados munumbicinas A B C e D Estes compostos
demonstraram em geral atividade contra bacteacuterias Gram positivas como Bacillus
anthracis e Mycobacterium tuberculosis multi-resistente A munumbicina B inibiu
Staphylococcus aureus resistente a meticilina (MRSA) enquanto a munumbicina D
apresentou atividade contra o parasita da malaacuteria Plasmodium falciparum O extrato da
linhagem de Streptomyces foi testado ainda contra vaacuterios patoacutegenos de plantas
apresentando atividade contra Pythium ultimum Phytophthora infestans Sclerotinia
sclerotiorum Erwinia carotovora Cochliobolus carbonum e Penicillium sp mostrando o
grande potencial destas novas substacircncias para a medicina e agricultura
O aacutecido coletotricum produzido pelo fungo Colletotrichum gloeosporioides
(Penz) Penz amp Sacc isolado da planta medicinal Artemiacutesia mongolica apresentou
inibiccedilatildeo do crescimento de Bacillus subtilis Staphylococcus aureus e Sarcina lutea e
atividade antifuacutengica contra o patoacutegeno Helminthosporium sativum (ZOU et al 2000)
Corrado e Rodrigues (2004) observaram a atividade bactericida de linhagens do
fungo endofiacutetico Phomopsis sp isolado das folhas de Aspidosperma tomentosum e
peciacuteolos da planta medicinal Spondias mombin Todos os extratos avaliados inibiram o
crescimento de bacteacuterias fungos filamentosos e leveduras testadas mostrando o
grande potencial deste fungo como fonte de produtos bioativos
Chareprasert et al (2006) isolaram fungos endofiacuteticos de Tectona grandis e de
Samanea saman e testaram sua capacidade antimicrobiana Dentre os isolados
testados Phomopsis foi o gecircnero dominante produzindo substacircncias inibidoras contra
Bacillus subtilis S aureus E coli e Candida albicans
14
Aleacutem da capacidade antimicrobiana fungos endofiacuteticos mostram-se importantes
com um grande potencial antitumoral e com habilidade em inibir enzimas sugerindo
que podem representar uma estimada fonte para uso terapecircutico
Rodrigues et al (2005) verificaram que fungos endofiacuteticos possuem a
capacidade de inibir colinesterase dentre eles linhagens de Phomopsis sp Entretanto
o melhor resultado foi obtido com extratos de Penicillium indicando que estes podem
ter aplicaccedilotildees farmacecircuticas
Huang et al (2001) testaram agrave accedilatildeo de fungos endofiacuteticos isolados de plantas
medicinais frente a outros fungos e tumores Os resultados indicaram que esses fungos
satildeo importantes em medicina como agentes antimicrobianos e antitumorais
Silva et al (2005) isolaram dois novos metaboacutelitos de Phomopsis cassiae
endofiacutetico de Cassia specatabilis as substacircncias 24-diidroxi-56-dimetil benzoato de
etila e phomopsilactona que exibiram forte atividade antifuacutengica contra fitopatoacutegenos
bem como citotoxicidade contra a linhagem celular de tumor cervical humano (HeLa)
Outros fungos como o Gliocladium sp da planta Eucryphia cordifolia tambeacutem possuem
atividade contra fungos fitopatogecircnicos (STINSON et al 2003 STROBEL 2003)
Em 2001 Rodrigues-Heerklotz et al elucidaram a estrutura quiacutemica e a siacutentese
assimeacutetrica de um novo metaboacutelito o aacutecido guignardico produzido pelo fungo endofiacutetico
Guignardia sp isolados de Spondias mombin
Satildeo vaacuterios os relatos de fungos endofiticos produtores de substacircncias
antimicrobianas inclusive isolados de plantas medicinais Esses microrganismos tem
se mostrado como uma fonte promissora de agentes bioativos antitumorais e
antifuacutengicos
35 Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss
A planta Maytenus ilicifolia Mart Ex Reiss pertence agrave classe Magnoliopsida
ordem Celastrales e famiacutelia Celastraceae a qual compreende 50 gecircneros e cerca de
800 espeacutecies (CRONQUIST 1981) Conhecida popularmente nos diferentes paiacuteses da
Ameacuterica do Sul pode receber diferentes denominaccedilotildees congorosa quebrachillo e
15
capororoca na Argentina (GONZALEZ LOMBARDO e VALLARINO 1937) espinheira-
divina cancorosa cancerosa cancrosa sombra-de-touro no Uruguai (SIMOtildeES et al
1986 ALICE et al 1995) coromilho-do-campo e salva-vidas (CARLINI e BRAZ 1988)
espinheira santa espinheira-divina erva-cancrosa e erva-santa (CARVALHO-OKANO
1992) cancorosa-de-Deus limatildeozinho maiteno marteno pau-joseacute salva-vidas
sombra-de-touro no Brasil (BITTENCOURT 2000)
Eacute descrita como uma aacutervore perene de porte arboacutereo-arbustivo encontrada na
mata de clima subtropical e temperado presente em sub-bosques das florestas de
Araucaacuteria nas margens de rios e em regiotildees de estepes Pode se propagar usualmente
por sementes (TAYLOR-ROSA e BARROS 1994) ou estacas de galho Preferindo
climas mais amenos ocorrendo espontaneamente ou por meio de cultivo A colheita
das folhas pode ser feita em qualquer eacutepoca do ano (PANIZZA 1998) Eacute nativa da
Ameacuterica do Sul encontrada no leste da Argentina Paraguai Boliacutevia com menor
intensidade no Chile e Uruguai No Brasil eacute predominante nos estados do Sul
(CARVALHO-OKANO 1992)
Maytenus ilicifolia eacute um arbusto de ocorrecircncia natural da Floresta Ombroacutefila Mista
(Floresta com Araucaacuteria) (BITTENCOURT 2001) Muitas vezes essa planta eacute
encontrada em ambientes ciliares e nos agrupamentos arboacutereos (capotildees) na regiatildeo de
predomiacutenio das estepes (CERVI et al 1989)
Esta planta eacute descrita como um subarbusto ou aacutervore ramificado desde a base
medindo ateacute 50 m de altura Ramos novos glabros angulosos tetra ou multicarenados
Peciacuteolo com 02-05 cm de comprimento A folha apresenta a margem inteira ou com
espinhos em nuacutemero de um a vaacuterios distribuiacutedos regular e irregularmente no bordo
geralmente concentrados na metade apical de um ou de ambos os semilimbos o limbo
com aproximadamente 22 a 89 cm de comprimento e 11 a 30 cm de largura e
nervuras na face abaxial Fruto caacutepsula bivalvar orbicular pericarpo maduro de
coloraccedilatildeo vermelho-alaranjada A presenccedila de disco nectariacutefero eacute um recurso a mais
para atrair os pequenos polinizadores como himenoacutepteros e formigas formando um
conjunto neacutectar-poacutelen interessante para a polinizaccedilatildeo uma vez que as flores satildeo
pequenas brancas e pouco vistosas O florescimento ocorre entre os meses de
16
setembro a outubro enquanto os frutos surgem entre outubro e fevereiro (CARVALHO-
OKANO 1992 RAMDOMSKI 1998 BITTENCOURT 2000)
A fragmentaccedilatildeo da Floresta com araucaacuterias nas uacuteltimas deacutecadas juntamente
com a comprovaccedilatildeo terapecircutica contra males gaacutestricos e o uso em larga escala
causaram grande devastaccedilatildeo de populaccedilotildees naturais de Maytenus ilicifolia
(BITTENCOURT 2001)
351 Componentes quiacutemicos e propriedades terapecircuticas Plantas sempre foram usadas como fonte terapecircutica na medicina tanto em
remeacutedios tradicionais quanto em produtos industrializados A planta Maytenus ilicifolia
Mart eacute geralmente utilizada na medicina popular brasileira As folhas secas desta
planta satildeo usadas como uma infusatildeo para aliviar dores de estocircmago e naacuteuseas e no
tratamento de uacutelceras e gastrites (CAMPAROTO et al 2002) Vaacuterios compostos
isolados de M ilicifolia foram descritos apresentando accedilatildeo antitumoral tambeacutem usado
como analgeacutesico antinflamatoacuterio e antiaacutecido (JORGE 2004)
Esta espeacutecie tem uso popular em comunidades tradicionais e povos indiacutegenas no
Brasil (BITTENCOURT 2001) No Paraguai e Boliacutevia tribos indiacutegenas e populaccedilotildees
rurais a utilizam como substacircncia controladora da fertilidade (CORDEIRO VILEGAS e
LANCcedilAS 1999) e no Paraguai e Argentina eacute usada como contraceptiva e abortiva
(MONTANARI CARVALHO e DOLDER 1998) Citada tambeacutem com uso no tratamento
de febres palustres (MEIRA PENNA 1946) afecccedilotildees pruriginosas cutacircneas
(COIMBRA 1958) dispepsias (CRUZ 1965) Inflamaccedilotildees ulceras e gaacutestricas (JORGE
2004)
As propriedades terapecircuticas de Maytenus ilicifolia foram atribuiacutedas agrave produccedilatildeo
de compostos terpecircnicos como maitenina e pristimerina tanto pelas raiacutezes (LIMA et al
1971 ITOKAWA et al 1991) como em ramos de folhas (JORGE et al 2004) Assim
como fenoacuteis taninos gaacutelicos (CAMPAROTO et al 2002) flavonoacuteides e outros
compostos (SILVA et al 1991 LEITE et al 2001)
17
Jorge et al (2004) avaliaram a eficaacutecia de extratos de M ilicifolia como
antinflamatoacuterio na proteccedilatildeo contra lesotildees gaacutestricas incluindo a cicatrizaccedilatildeo e
citoproteccedilatildeo sugerindo que os extratos de Maytenus ilicifolia podem representar uma
importante alternativa cliacutenica em antinflamatoacuterios e antiulcerogecircnico
Souza-Formigoni et al (1991) avaliaram a potencialidade dos efeitos
antiulcerogecircnicos das folhas de espinheira santa em experimentos realizados em ratos
com ulceras O uso de chaacute tanto por via oral como intraperitoneal mostrou resultados
semelhantes agrave droga cicatrizante cimetidina M ilicifolia assim como outras espeacutecies da
famiacutelia Celastraceae foram investigadas quanto aos seus constituintes de accedilatildeo
citotoacutexica sendo isolados triterpenos aromaacuteticos de accedilatildeo antitumoral Segundo Itokawa
et al (1991 1993) e Shirota et al (1994) os triterpenos satildeo capazes de estimular
fatores atuantes na proteccedilatildeo da mucosa gaacutestrica como a produccedilatildeo de muco e
prostaglandinas
A cimetidina eacute um potente agente na supressatildeo de aacutecido gaacutestrico e pepsina ela
age como antagonista competitivo da histamina nos receptores H2 das ceacutelulas parietais
gaacutestricas produtoras de aacutecido dessa forma bloqueia a secreccedilatildeo aacutecida (SOUZA-
FORMIGONI et al 1991) Ferreira et al (2004) investigaram o efeito e possiacutevel
mecanismo de accedilatildeo do extrato aquoso liofilizado de M ilicifolia sobre a secreccedilatildeo de
aacutecidos em mucosa gaacutestrica de sapos Foi observada uma reduccedilatildeo de 16 da secreccedilatildeo
aacutecida sugerindo os autores que essa reduccedilatildeo ocorra devido a uma atividade
antagoniacutestica dos extratos nos receptores de H2 de histidina
Montanari Carvalho e Dolder (1998) analisaram os efeitos de extratos
etanoacutelicos de M ilicifolia na espermatogecircnese de camundongos e natildeo encontraram
qualquer defeito ou distuacuterbio Poreacutem Montanari e Bevilacqua (2002) em estudos com
fecircmeas de ratos constataram uma diminuiccedilatildeo significativa na implantaccedilatildeo dos embriotildees
com a utilizaccedilatildeo de extrato liofilizado das folhas
18
352 Endoacutefitos isolados de Maytenus ilicifolia
Pileggi (2006) isolou microrganismos endofiacuteticos de folhas peciacuteolos e sementes
de Maytenus ilicifolia e investigou o potencial farmacoloacutegico dos mesmos Foram
isolados em maior frequumlecircncia os fungos Alternaria sp Colletotricum sp Bipolaris sp
Phyllosticta sp e Cladosporium sp Entre os fungos e bacteacuterias testados 15
apresentaram potencial para o controle bioloacutegico Na anaacutelise de caracterizaccedilatildeo
morfoloacutegica por RAPD foi sugerida a presenccedila de duas espeacutecies de Coletotricum
isolados de Maytenus ilicifolia
Figueiredo (2006) isolou de Maytenus ilicifolia fungos endofiacuteticos e os avaliou
quanto ao potencial antimicrobiano contra bacteacuterias patogecircnicas em humanos e o fungo
fitopatogecircnico Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta do Citros Os
extratos metanoacutelicos de dois isolados exibiram accedilatildeo fungistaacutetica na germinaccedilatildeo e no
crescimento micelial de G citricarpa Dois extratos de Pestalotiopsis sp inibiram o
crescimento dos microrganismos-teste (S aureus oxalino resistente Klebsiella
pneumoniae Micrococcus luteus Staphylococcus aureus e Escherichia coli)
Bacteacuterias com potencial anti-leucemico foram isoladas de Maytenus essas
bacteacuterias interagem com as plantas na produccedilatildeo de alguns metaboacutelitos como a
maytensina substancia que tambeacutem apresenta propriedades antifuacutengicas
Azevedo et al (2000) relataram a presenccedila de bacteacuterias endofiacuteticas em folhas de
Maytenus aquifolium Foram isolados vinte gecircneros os mais frequumlentes foram Bacillus
Clavibacter e Streptomyces aleacutem de actinomicetos Testes preliminares mostraram que
algumas das bacteacuterias podem produzir ansamacroliacutedeos que tambeacutem satildeo produzidos
pela planta hospedeira
36 Guignardia citricarpa Kiely e a Mancha preta do citros
O gecircnero Guignardia foi descrito em 1982 por Viala e Ravaz e compreende as
formas teleomoacuterficas de espeacutecies de Phyllosticta e de alguns outros gecircneros
19
relacionados de fungos imperfeitos geralmente saproacutefitas ou semiparasitas de folhas
(SIVANESAN 1984)
Diversos autores isolaram espeacutecies de Phyllosticta de plantas aparentemente
sadias descrevendo-as como endofiacuteticas (CARROLL e CARROLL 1978 PETRINI
1986 LEUCHTMANN et al 1992 GLIENKE 1995 PENNA 2000) No entanto existe
um grande nuacutemero de relatos citando este gecircnero como fitopatogecircnico de diversas
culturas com grande importacircncia econocircmica como arroz (SUGHA SINGH E SHARMA
1986) cana-de-accediluacutecar (PONS 1990) tabaco (PATEL et al 1988) e eucalipto (CROUS
et al 1993) e tambeacutem frutiacuteferas como abacate e tomate (BAKER 1938) manga e
mamatildeo (McMILLAN JR 1986) uva (IBRAHIM e BAYCA 1989) e principalmente em
citros (McONIE 1964a 1964b HERBERT e GRECH 1985 JOHNSTON e
FULLERTON 1988)
O fungo Guignardia citricarpa Kiely (anamorfo Phyllosticta citricarpa (McALP)
Van Der Aa) eacute um Ascomiceto da ordem Dothideales famiacutelia Dothideaceae Possui
estroma plectenquimatoso pseudoteacutecio globoso a subgloboso medindo 125 a 360 μm
de diacircmetro contendo um poro de 14 a 16 μm e paredes espessas com 20 a 22 μm
Seu asco apresenta forma de clava arredondado na extremidade superior e eacute
bitunicado Conteacutem oito ascoacutesporos unicelulares hialinos ligeiramente cinzentos
romboacuteides contendo gracircnulos e um grande vacuacuteolo central Os ascoacutesporos satildeo
cobertos com um quepe gelatinoso nas extremidades Segundo Sivanesam (1984)
pseudoparaacutefises satildeo encontradas em pseudoteacutecios maduros De acordo com Johnston
e Fullerton (1988) as formas anamorfas e teleomorfa geralmente satildeo encontradas
associadas
As estruturas de frutificaccedilatildeo satildeo os picniacutedios que macroscopicamente satildeo
pequenos globosos pretos e semi-eruptivos A fase sexuada corresponde agrave produccedilatildeo
de ascoacutesporos os quais se encontram em nuacutemero de oito no interior dos ascos Estes
apresentam forma de clava satildeo arredondados na extremidade superior e bitunicados
Os ascoacutesporos satildeo unicelulares hialinos levemente acinzentados romboacuteides
contendo gracircnulos e um grande vacuacuteolo central cobertos com um quepe gelatinoso nas
extremidades (SIVANESAN 1984)
20
Fialho (2004) avaliou in vitro o potencial de linhagens de S cerevisiae como
agentes no controle bioloacutegico contra G citricarpa nos frutos poacutes-colheita Rodrigues
(2006) avaliou o efeito dos principais fungicidas utilizados no campo para o controle da
doenccedila Tambeacutem avaliou 96 linhagens de fungos para a seleccedilatildeo de potenciais agentes
no controle bioloacutegico demonstrando que algumas espeacutecies de Trichoderma satildeo
capazes de atuar in vitro como biocontroladores do fitopatoacutegeno G citricarpa
Cardoso-Filho (2003) avaliou o uso de indutores de resistecircncia Saccharomyces
cerevisiae Bionreg e aacutecido saliciacutelico ao fitopatoacutegeno G citricarpa O autor destaca que os
compostos presentes no albedo (mesocarpo) da laranja como a celulose carboidratos
soluacuteveis pectinas compostos fenoacutelicos (flavonoacuteides) aminoaacutecidos e vitaminas podem
exibir a accedilatildeo antimicrobiana para o controle da MPC Neste contexto ele avaliou os
extratos produzidos pelo albedo da laranja e comprovou accedilatildeo fungicida ou fungistaacutetica
inibindo a germinaccedilatildeo esporulaccedilatildeo e crescimento micelial in vitro de G citricarpa
Blanco (1999) e Christo (2002) observaram esta variabilidade entre linhagens
isoladas de lesatildeo de Mancha Preta de Citros (MPC) ou seja linhagens de G citricarpa
utilizando dados de RAPD Esta variabilidade tambeacutem foi evidenciada em linhagens
isoladas em plantas assintomaacuteticas atualmente descritas como Guignardia mangiferae
(GLIENKE-BLANCO et al 2002 CHRISTO 2002 BAAYEN et al 2002 OKANI
NAKAGIRI e ITO 2001 RODRIGUES et al 2004)
Em 1999 Glienke-Blanco comparou geneticamente por meio de marcadores de
RAPD linhagens de populaccedilotildees patogecircnicas e endofiacuteticas de Guignardia sp de
diversas regiotildees e hospedeiros constatando a existecircncia de trecircs populaccedilotildees de
Guignardia geneticamente muito diferentes coexistindo em citros sendo duas
endofiacuteticas e uma patogecircnica sugerindo que talvez estas trecircs populaccedilotildees pudessem
pertencer a espeacutecies distintas O desenvolvimento de um par de oligonucleotiacutedeos
capaz de amplificar um fragmento de 370 pb especiacutefico para linhagens patogecircnicas de
G citricarpa veio a corroborar para distinccedilatildeo geneacutetica entre estes grupos (GLIENKE et
al 2007)
21
361 Mancha Preta do Citros
A doenccedila mancha preta dos citros (MPC) foi descrita na Austraacutelia em 1985 por
Kiely posteriormente na Aacutefrica do Sul como consequumlecircncia da importaccedilatildeo de mudas da
Austraacutelia Atualmente estaacute distribuiacuteda em regiotildees subtropicais do mundo entre elas o
Brasil (GOacuteES et al 2005)
O ciclo da doenccedila (MPC) inicia-se com a disseminaccedilatildeo dos coniacutedios ou
picnidioacutesporos (esporos assexuais) e ascoacutesporos (esporos sexuais) do fungo
Guignardia citricarpa Os coniacutedios (picnidioacutesporos) satildeo responsaacuteveis pelas infecccedilotildees agrave
curta distacircncia e estatildeo localizados no interior dos picniacutedios oriundos dos frutos
infectados Um agregado de coniacutedios emerge atraveacutes da abertura do picniacutedio (ostiacuteolo)
dissolve-se na aacutegua da chuva orvalho ou irrigaccedilatildeo e cai sobre os pequenos frutos
susceptiacuteveis que se formam apoacutes as floradas Jaacute os ascoacutesporos satildeo responsaacuteveis pela
disseminaccedilatildeo agrave curta e longa distacircncia pois satildeo lanccedilados dos periteacutecios que se
formam em folhas caiacutedas ao solo e satildeo levados por correntes aeacutereas infectando
pequenos frutos susceptiacuteveis (ROBES 1990)
Em estudo epidemioloacutegico da MPC Spoacutesito et al (2008) analisou 27270 frutos
colhidos de 303 aacutervores quanto agrave incidecircncia da doenccedila (porcentagem de frutos doentes
por aacutervore) e quanto agrave severidade da doenccedila (aacuterea com sintoma do fruto) O autor
encontrou frutos doentes em 251 aacutervores das 303 analisadas (83) com diferentes
niacuteveis de incidecircncia Algumas aacutervores tinham a maioria das frutas com lesotildees
agregadas e de alta gravidade enquanto outras tinham a maioria das frutas com
poucas lesotildees e baixa gravidade Segundo os autores quando o agente patogecircnico eacute
disperso pela aacutegua da chuva esta pode transportar muitos esporos de uma vez
formando uma lesatildeo O padratildeo de sintomas resultantes a partir deste tipo de dispersatildeo
eacute tipicamente agregada Os autores concluiacuteram que os ascoacutesporos satildeo os mais
importantes inoacuteculos de G citricarpa
A MPC caracteriza-se por apresentar lesotildees com bordas salientes e com
depressatildeo no centro onde se observam pequenos pontos pretos os picniacutedios As
lesotildees podem atingir os frutos maduros ou no iniacutecio de maturaccedilatildeo podendo aparecer
22
apoacutes a colheita no transporte e armazenamento (ROBES et al 1995) A MPC afeta
apenas a casca do fruto e o flavedo (epicarpo) sem causar dano internamente limitado
pelo albedo (mesocarpo) Poreacutem sua comercializaccedilatildeo no mercado de frutas eacute
prejudicada assim como a sua exportaccedilatildeo devido agrave barreira fitossanitaacuteria existente na
Uniatildeo Europeacuteia por ser uma doenccedila quarentenaacuteria A1 Nos casos em que a doenccedila
atinge o pedicelo do fruto pode ocorrer agrave queda prematura do fruto aumentando as
perdas na produccedilatildeo e ateacute limitando seriamente a citricultura em vaacuterios estados
brasileiros (GOacuteES et al 2005 ROBES et al 1995)
Em funccedilatildeo dos prejuiacutezos causados por G citricarpa na comercializaccedilatildeo de
frutos in natura principalmente no mercado externo satildeo crescentes os estudos que
datildeo ecircnfase ao controle bioloacutegico da doenccedila
37 O Gecircnero Phomopsis sp
O gecircnero Phomopsis descrito em 1905 por (Sacc) Bubak (RIEDL 1981) forma
picniacutedios escuros com ostiacuteolo normalmente em forma de pecircra conidioacuteforos simples
alfa coniacutedios hialinos com gotas nas extremidades predominantemente elipsoacuteides sem
septos unicelulares de forma ovoacuteide Apresenta tambeacutem beta coniacutedios hialinos sem
gotas filiformes a maioria curvos em uma das extremidades sem septos (HANLIN e
MENEZES 1996)
Outra caracteriacutestica dos fungos do gecircnero Phomopsis eacute a formaccedilatildeo de linhas
negras estreitas em tecidos de plantas contaminadas assim como no meio de cultura
em que satildeo repicados (BRAYFORD 1990)
O gecircnero Phomopsis pertence ao filo Ascomycota subfilo Pezizomycotin classe
Sordariomycetes subclasse Sordariomycetidae ordem Diaporthales famiacutelia Valsaceae
mitosporic Valsaceae Apresenta-se na forma anamoacuterfica o seu teleomorfo eacute o
Diaporthe cujo habitat eacute o caule de plantas lenhosas e herbaacuteceas (HANLIN e
MENEZES 1996)
Espeacutecies de Phomopsis satildeo comumente encontradas como patoacutegenos e
endoacutefitos de plantas (BODDY e GRIFFITH 1989) Tradicionalmente o gecircnero tem sido
23
considerado altamente patogecircnico (REHNER e UECKER 1994) mas algumas
espeacutecies de Phomopsis satildeo entretanto endoacutefitos mutualiacutesticos (WEBBER e GIBBS
1984 CARROLL 1986)
Espeacutecie de Phomopsis e Diaporthe tecircm sido tradicionalmente descritos com
base na espeacutecie hospedeira Poreacutem algumas espeacutecies e isolados podem infectar mais
de um hospedeiro (BRAYFORD 1990 FARR CASTLEBURY e ROSSMAN 2002) tal
estrateacutegia tem sido frequentemente questionada (REHNER e UECKER 1994)
Trabalhos incluindo estudos de cruzamentos mostraram que esse criteacuterio natildeo eacute
suficiente para classificaccedilatildeo ao niacutevel de espeacutecie Aleacutem disso isolados de Phomopsis
provenientes do mesmo hospedeiro natildeo necessariamente pertencem agrave mesma espeacutecie
assim como uma mesma espeacutecie de Phomopsis pode infectar diferentes hospedeiros
(REHNER e UECKER 1994)
Foram descritas mais de 1000 espeacutecies do gecircnero Phomopsis baseado
principalmente na associaccedilatildeo com o hospedeiro (UECKER 1988) Embora o
hospedeiro seja atualmente considerado menos importante na definiccedilatildeo de espeacutecies
nenhuma revisatildeo do gecircnero foi realizada A fase teleomoacuterfica (Diaporthe) foi descrita
apenas para aproximadamente 20 das espeacutecies do gecircnero Phomopsis (PHILLIPS
2006) Essa ausecircncia da fase teleomorfica (Diaporthe) em meio de cultura
(principalmente quando isolado endofiticamente) torna a identificaccedilatildeo ao niacutevel de
espeacutecie neste gecircnero muito difiacutecil (REHNER e UECKER 1994)
Wehmeyer (1933) elaborou uma revisatildeo do gecircnero Diaporthe o autor
considerou a associaccedilatildeo com o hospedeiro uma caracteriacutestica de menor importacircncia
tendo reduzido de 650 para 70 o nuacutemero de espeacutecies no gecircnero No entanto este
estudo baseou-se unicamente em caracteriacutesticas morfoloacutegicas do teleomorfo natildeo tendo
sido consideradas as caracteriacutesticas do anamorfo
A delimitaccedilatildeo de espeacutecies de Phomopsis baseado apenas em caracteriacutesticas
morfoloacutegicas demonstrou-se inadequada (VAN DER AA 1990) Em adiccedilatildeo as
caracteriacutesticas de morfologia do coniacutedio e caracteriacutesticas da colocircnia usadas para
identificar espeacutecies alguns autores tecircm utilizado caracteres alternativos que incluem
virulecircncia (VIDIC 1991) proteiacutenas e sorologia (LEE e SNOW 1992 VELICHETI et al
24
1991) sequumlecircncias ITS (ZHANG et al 1998) e enzimas e metaboacutelitos secundaacuterios
(SHIVAS ALLEN e WILLIAMSON 1991) Infelizmente nenhum caraacuteter foi aplicaacutevel
para distinguir todos os grupos de isolados (REHNER e UECKER 1994)
O entendimento sobre o gecircnero expandiu-se por meio de estudos de sequumlecircncias
ITS nos quais alguns dos isolados agruparam-se por regiotildees geograacuteficas (REHNER e
UECKER 1994) Alguns trabalhos tecircm comparado dados morfoloacutegicos com dados
moleculares principalmente o uso de sequumlecircncias da regiatildeo ITS do DNA ribossomal
Zhang et al (1998) destingiu cinco taacutexons de Phomopsis isolados de Soja (Glycine
max) utilizando sequumlecircncias da regiatildeo ITS do DNA ribossomal poreacutem natildeo foram
capazes de diferenciar-los com base nas caracteriacutesticas morfoloacutegicas Farr et al (2002)
caracterizaram por anaacutelise molecular com o uso de sequumlecircncias ITS1 58S ITS2 e por
caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de Phomopsis sp isolados de Vaccinium
corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse estudo verificaram que a maioria dos
isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma vez que as sequumlecircncias agruparam-se
com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
Castlebury e Mengistu (2006) avaliaram Phomopsis isolados de soja e outros
hospedeiros combinando dados de sequumlecircncias de ITS do DNA ribossomal o
sequumlenciamento do gene EF1-alpha e genes de actina seis grupos de Phomopsis
foram formados desses trecircs correspondem aos taacutexons P longicolla Diaporthe
melonis e D phaseolorum Os autores concluiacuteram entatildeo que agrave ausecircncia de distinccedilatildeo
morfoloacutegica e informaccedilatildeo bioloacutegica torna problemaacutetica a identificaccedilatildeo de espeacutecies aos
grupos de isolados geneticamente distintos Aleacutem disso natildeo estaacute esclarecida a
importacircncia bioloacutegica e geneacutetica dos diferentes grupos e trabalhos adicionais quanto
aos hospedeiros patogenicidade e morfologia satildeo necessaacuterios para resolver a distinccedilatildeo
de espeacutecies neste gecircnero
O gecircnero Phomopsis eacute um importante grupo de fungos com potencial
biotecnoloacutegico devido agrave produccedilatildeo de importantes metaboacutelitos secundaacuterios entre os
quais se incluem o micotoxinas que afeta o sistema nervoso de vertebrados (BILLS et
al 2002) alcaloacuteides com capacidades farmacoloacutegicas tais como phomopsins
(COCKRUM PETTERSON e EDGAR 1994) e 24-diidroxi-56-dimetil benzoato de etila
25
e phomopsilactona produzidos por Phomopsis cassiae endofiacutetico de Cassia
specatabilis (SILVA et al 2005)
38 Marcadores Moleculares
A variabilidade geneacutetica em microrganismos pode ser detectada por teacutecnicas
claacutessicas ou moleculares As teacutecnicas claacutessicas baseiam-se na anaacutelise de fenoacutetipos a
partir da caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica (produccedilatildeo de coniacutedios crescimento radial da
colocircnia) ou bioquiacutemica (produccedilatildeo de substacircncias auxotrofias) restringindo a
possibilidade de se conduzir estudos populacionais e muitas vezes de sistemaacutetica As
teacutecnicas moleculares por sua vez fornecem ferramentas para evidenciar e entender
melhor diversos aspectos relacionados direta ou indiretamente com o DNA Desta
forma a anaacutelise dos aacutecidos nucleacuteicos vem sendo amplamente utilizada na diferenciaccedilatildeo
de organismos e no esclarecimento taxonocircmico e filogeneacutetico dos organismos
estudados
Os diversos meacutetodos de detecccedilatildeo de polimorfismo geneacutetico diretamente ao niacutevel
de aacutecidos nucleacuteicos tecircm permitido a anaacutelise molecular da variabilidade do DNA
determinando pontos de referecircncia nos cromossomos tecnicamente denominados
ldquomarcadores molecularesrdquo Por marcador molecular define-se todo e qualquer fenoacutetipo
molecular oriundo de um gene expresso ou de um segmento especiacutefico de DNA
(GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Os dados moleculares frequumlentemente complementam e corroboram hipoacuteteses
baseadas em estudos morfoloacutegicos embora algumas vezes os resultados obtidos da
anaacutelise de DNA sejam conflitantes com dados de anaacutelise exclusivamente feneacuteticas
Esta contradiccedilatildeo pode ser observada principalmente na classificaccedilatildeo taxonocircmica de
microrganismos (SAMUELES e SEIFERT 1995)
Algumas teacutecnicas moleculares utilizadas principalmente em fungos para a
detecccedilatildeo do polimorfismo geneacutetico de sequumlecircncias de DNA satildeo Eletroforese em Campo
Pulsado (PFGE) Polimorfismos dos fragmentos de Restriccedilatildeo (RFLPs) Polimorfismos
26
do DNA Amplificados ao Acaso (RAPDs) Sequumlenciamento das Regiotildees Internas
Transcritas (ITS1 e ITS2) do DNA ribossocircmico (rDNA)
Aleacutem de avaliarem a variabilidade geneacutetica estes marcadores moleculares
podem determinar relaccedilotildees filogeneacuteticas como tambeacutem colaborar na identificaccedilatildeo de
um determinado isolado Tais marcadores podem ser gerados independentemente do
fenoacutetipo e revelar polimorfismos altamente informativos em sequumlecircncias de DNA
A teacutecnica de RFLP surgiu a partir da descoberta de que os siacutetios para enzimas
de restriccedilatildeo poderiam ser polimoacuterficos ou seja alteraccedilotildees em um uacutenico par de bases
que muitas vezes satildeo neutras poderiam ser detectadas pela presenccedila ou ausecircncia
destes siacutetios para endonucleases Esta teacutecnica propiciou a introduccedilatildeo de um elevado
nuacutemero de marcadores moleculares nas anaacutelises de variabilidade geneacutetica (ALBERTS
et al 2004) Dentre as inuacutemeras aplicaccedilotildees dos marcadores RFLP pode-se citar o
estudo da evoluccedilatildeo dos genomas a identificaccedilatildeo de genes especiacuteficos o estudo de
geneacutetica de populaccedilotildees a taxonomia e obtenccedilatildeo de mapas geneacuteticos (MICHELEMORE
e HULBERT 1987) Entretanto seu uso torna-se limitado pois eacute necessaacuterio DNA de
alta qualidade e em grande quantidade (GLIENKE 1995)
O uso do DNA ribossomal (rDNA) como marcador molecular tambeacutem pode ser
empregado na anaacutelise da variabilidade geneacutetica para uma ampla faixa de niacuteveis
taxonocircmicos As sequumlecircncias codificantes do rDNA evoluem muito lentamente e satildeo
altamente conservadas possibilitando a sua utilizaccedilatildeo em estudos com organismos
pouco relacionados taxonomicamente Ao contraacuterio do rDNA as regiotildees espaccediladoras
internas destes genes conhecidas como ITS evoluem rapidamente apresentando alto
polimorfismo e sendo desta forma de grande interesse nos estudos filogeneacuteticos de
gecircneros espeacutecies e populaccedilotildees (WHITE e MORROW 1990)
A reaccedilatildeo em cadeia da polimerase (PCR) tornou-se uma das mais importantes e
utilizadas teacutecnicas em Biologia Molecular por apresentar rapidez baixo custo e
capacidade de amplificaccedilatildeo de pequenas quantidades de DNA (MULLIS e FALOONA
1987 WHITE e MORROW 1989)
Concebida por KARY MULLIS em meados da deacutecada de 80 a teacutecnica baseia-se
em amplificar fragmentos de sequumlecircncias de DNA com alta especificidade e fidelidade
27
utilizando oligonucleotiacutedeos especiacuteficos ou natildeo Tais oligonucleotiacutedeos delimitam a
sequumlecircncia de DNA gerando um sinal molecular que pode ser amplificado (MULLIS e
FALOONA 1987 WHITE e MORROW 1989 McPHERSON QUIRKE e TAYLOR
1991 GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
A PCR consiste em uma teacutecnica in vitro capaz de produzir muacuteltiplas coacutepias de
sequumlecircncias especificas de DNA Alterando-se as condiccedilotildees de reaccedilatildeo pode-se
amplificar cadeias simples de DNA detectar e distinguir entre genes portadores de
mutaccedilatildeo em uma uacutenica base ou proporcionar quantidades suficientes de DNA para
anaacutelise eou manipulaccedilatildeo subsequumlente (WALKER e RAPLEY 1999)
Uma das limitaccedilotildees da teacutecnica PCR eacute a necessidade do conhecimento preacutevio da
sequumlecircncia que flanqueia o segmento a ser amplificado para que os oligonucleotiacutedeos
possam ser construiacutedos (WATSON et al 1992 ALBERTS et al 2004) A teacutecnica de
RAPD entretanto natildeo apresenta este obstaacuteculo pois segundo Williams et al (1990)
esta teacutecnica baseia-se na amplificaccedilatildeo de segmentos de DNA por um uacutenico
oligonucleotiacutedeo de sequumlecircncia arbitraacuteria que amplifica vaacuterias regiotildees simultaneamente
381 Marcadores RAPD
O RAPD (polimorfismo do DNA amplificado ao acaso) envolve a utilizaccedilatildeo de
oligonucleotiacutedeos de sequumlecircncia arbitraacuteria que amplificam vaacuterias regiotildees do genoma
simultaneamente (WILLIAMS et al 1990 WELSH E MCCLELLAND 1990
VILARINHOS et al 1995 FUNGARO et al 1996 ALZATE-MARIN et al 1997
ABBASI et al 1999 PAAVANEM-HUHTALA AVIKAINEM e YLI-MATTILA 2000)
Dessa forma natildeo eacute necessaacuterio o desenvolvimento preacutevio de uma biblioteca de sondas
especiacuteficas para o organismo de interesse
A teacutecnica de RAPD utiliza o mesmo princiacutepio da PCR (SAIKI et al 1985) A
principal diferenccedila entre a PCR usual e o RAPD estaacute na reaccedilatildeo de amplificaccedilatildeo que
utiliza apenas um uacutenico oligonucleotiacutedeo com sequumlecircncia arbitraacuteria de 10 a 15 bases A
amplificaccedilatildeo somente ocorre se este oligonucleotiacutedeo for complementar a um siacutetio em
uma das fitas e complementar a um mesmo siacutetio (orientaccedilatildeo invertida) na outra fita de
28
DNA (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998) Segundo Williams et al (1993) o tamanho
ideal do oligonucleotiacutedeo para amplificaccedilatildeo de RAPD eacute em torno de dez bases
devendo seu conteuacutedo GC ser em torno de 50 a 70 e no miacutenimo de 40 Aleacutem disso
os oligonucleotiacutedeos natildeo devem conter sequumlecircncias palindrocircmicas a fim de evitar o
autopareamento
Os marcadores RAPD tecircm sido amplamente utilizados para o estudo de diversos
grupos de seres vivos A partir dos marcadores moleculares clonados e sequumlenciados
haacute a possibilidade de sintetizar oligonucleotiacutedeos especiacuteficos aumentando o seu poder
de resoluccedilatildeo (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Esses marcadores permitem caracterizar e avaliar o grau de similaridade
geneacutetica entre genoacutetipos em niacuteveis inter e intraespeciacuteficos sendo altamente sensiacuteveis
quanto diferenccedilas de ateacute um uacutenico nucleotiacutedeo entre o oligonucleotiacutedeo e o DNA molde
Permitem ainda analisar a estrutura geneacutetica de populaccedilotildees naturais populaccedilotildees de
melhoramento e bancos de germoplasma a construccedilatildeo de mapas geneacuteticos de alta
cobertura genocircmica a localizaccedilatildeo de genes de interesse econocircmico e ainda a
obtenccedilatildeo de novos marcadores para diagnoacutesticos via PCR (FUNGARO e VIEIRA 1998
FUNGARO 2000 GLIENKE-BLANCO et al 2002 ANCHORENA-MATIENZO 2002)
Diferentes niacuteveis taxonocircmicos podem ser inferidos atraveacutes de marcadores
RAPD cujos padrotildees podem apresentar-se como variaacuteveis quando polimoacuterficos e
constantes quando natildeo-polimoacuterficos
Avaliando a variabilidade geneacutetica de organismos geneticamente relacionados
diversos autores confrontaram resultados obtidos a partir de anaacutelises moleculares ao
niacutevel de proteiacutenas com os dados obtidos a partir de marcadores moleculares de DNA
Meijer Megnegneau e Linders (1994) estudando linhagens de Phomopsis subordinaria
isoladas de 23 localidades diferentes chegaram a resultados conflitantes obtidos por
RAPD e isoenzimas Os marcadores de RAPD mostraram alta similaridade entre 47
linhagens de P subordinaria isoladas de oito localidades diferentes enquanto a anaacutelise
por isoenzimas sugeriu que todas as linhagens eram idecircnticas
Jaacute Pioli et al (2003) caracterizaram por RAPD isolados do complexo
DiaporthePhomopsis coletados de soja na Argentina Eles foram separados em quatro
29
grupos (i) Diaporthe phaseolorum variedade meridionalis (ii) D phaseolorum variedade
caulivora (iii) D phaseolorum variedade sojae and (iv) Phomopsis longicolla revelando
a existecircncia de variabilidade entre isolados da mesma variedade
Fernandez e Hanlin (1996) obtiveram resultados concordantes entre a anaacutelise
molecular por RAPD e as caracteriacutesticas morfoculturais separando os isolados
coletados de soja em dois grupos Diaporthe phaseolorum e Phomopsis longicolla
Os marcadores de RAPD tambeacutem podem ser usados na anaacutelise de
recombinantes obtidos por parameiose em Beauveria bassiana (DALZOTO et al 2003)
A teacutecnica RAPD tambeacutem eacute utilizada como um meacutetodo eficiente na diferenciaccedilatildeo
de microrganismos patogecircnicos e natildeo patogecircnicos Guthirie et al (1992) e Vasconcelos
(1994) caracterizaram diferentes espeacutecies do gecircnero Colletotrichum diferenciando-as
quanto agrave sua patogenicidade
Grajal-Martin Simon e Muehlbauer (1993) conseguiram diferenciar o tipo 2 de
Fusarium oxysporum f sp pisi de trecircs outros grupos por marcadores RAPDs Da
mesma maneira isolados patogecircnicos de Fusarium oxysporum f sp dianthi que
atacam cravos puderam ser distinguidas de vaacuterios natildeo patogecircnicos por marcadores
RAPD (MANULIS et al 1993)
Blanco (1999) utilizando seis oligonucleotiacutedeos de RAPD confirmou a existecircncia
de trecircs populaccedilotildees distintas de Guignardia citricarpa coexistindo em citros sendo duas
endofiacuteticas e uma patogecircnica responsaacutevel pelas lesotildees da mancha preta nos citros
Glienke-Blanco et al (2002) utilizando sete oligonucleotiacutedeos de RAPD encontraram
alta variabilidade geneacutetica em linhagens endofiacuteticas de Guignardia citricarpa isoladas
de plantas assintomaacuteticas de citros
382 Marcadores ITS
O DNA ribossocircmico contido nas regiotildees organizadoras de nucleacuteolos (NOR) tem
sido objeto de um grande nuacutemero de estudos com diversas aplicaccedilotildees em geneacutetica
evoluccedilatildeo e melhoramento Tal interesse estaacute diretamente relacionado agrave estrutura
destas regiotildees que se encontram em locais especiacuteficos do genoma e repetidos em
30
sequumlecircncia inuacutemeras vezes A funccedilatildeo do rDNA eacute codificar as diferentes moleacuteculas de
RNA ribossocircmico (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Segundo White et al (1990) as regiotildees espaccediladoras internas do DNA
ribossomal (ITS) evoluem rapidamente apresentando alto polimorfismo ao contraacuterio
do rDNA e sendo assim essas regiotildees satildeo de grande interesse nos estudos
filogeneacuteticos em niacuteveis de gecircnero espeacutecies e populaccedilotildees Esta caracteriacutestica permite
ainda a sua utilizaccedilatildeo na obtenccedilatildeo de polimorfismos de comprimento de fragmentos
(RFLP) nos loci de rDNA O nuacutemero de coacutepias de uma determinada sequumlecircncia de
rDNA e variaccedilotildees de nucleotiacutedeos nestas sequumlecircncias tambeacutem tecircm sido utilizados em
tais estudos (FERREIRA 1994)
Orsquodonnell e Gray (1995) avaliaram a relaccedilatildeo filogeneacutetica e a variaccedilatildeo geneacutetica
dentro de 24 isolados do complexo Fusarium solani por meio da sequecircncia de rDNA e
marcador RFLP e concluiacuteram que esta espeacutecie eacute formada por espeacutecies filogeneacuteticas
distintas Utilizando a mesma teacutecnica Ouellet e Seiffert (1993) diferenciaram F
graminearum de outras 11 espeacutecies que atacam trigo aleacutem de terem permitido a
identificaccedilatildeo de diversas raccedilas desta espeacutecie provenientes de isolados
morfologicamente semelhantes
Jasalavich Ostrofskf e Jellison (2000) utilizaram os oligonucleotiacutedeos ITS1 e
ITS4 (especiacutefico para basidiomicetos) na identificaccedilatildeo de microrganismos A
amplificaccedilatildeo da regiatildeo ITS1-58S-ITS2 detectou a presenccedila de basidiomicetos em
diferentes amostras Testes complementares foram realizados no produto da
amplificaccedilatildeo por meio da teacutecnica de RFLP permitindo a identificaccedilatildeo de espeacutecie
Satoko et al (2000) e Promputtha et al (2005) utilizaram a regiatildeo ITS1 58S e
ITS2 do rDNA para identificar fungos endofiacuteticos que natildeo esporularam sendo relatados
como Phomopsis e Diaporthe (anamoacuterfico Phomopsis)
Farr Castlebury e Rossman (2002) caracterizaram por anaacutelise molecular com o
uso de sequumlecircncias ITS1 58S ITS2 e por caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de
Phomopsis sp isolados de Vaccinium corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse
estudo verificaram que a maioria dos isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma
vez que as sequumlecircncias agruparam-se com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
31
Mostert et al (2001) tambeacutem usaram anaacutelise filogeneacutetica das regiotildees 58S ITS1
e ITS2 e DNA mitocondrial para elucidar a taxonomia de espeacutecies de Phomopsis
obtidas de vinhedos Eles observaram que os fungos endofiacuteticos tratavam-se de
Diaporthe perjuncta e Phomopsis sp taacutexon 1 Jaacute os isolados patogecircnicos e com alta
virulecircncia pertenciam a espeacutecie Phomopsis viticola assim como os isolados descritos
em estudos anteriores como Phomopsis taacutexon 2 Eles tambeacutem puderam elucidar que
os isolados descritos na Austraacutelia como Phomopsis taacutexon 4 tratavam-se de Libertella
sp excluindo-o do complexo P viticola
Djaouida et al (2004) sequenciaram as regiotildees ITS1 58S e ITS2 e do gene
mitocondrial atp6 para avaliar a diversidade molecular de linhagens patogecircnicas contra
o girassol de Diaporthe helianthi (anamoacuterfico Phomopsis helianthi) isolados de
diferentes origens geograacuteficas
32
4 MATERIAL E MEacuteTODOS 41 Material Bioloacutegico 411 Fungos endofiacuteticos
Quarenta e oito isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp e um de Diaporthe sp
foram utilizados neste estudo (TABELA 1) Destes oito foram cedidos cordialmente pela
Dra Kaacutetia Rodriguez e foram isolados de Spondias mombin (Cajazeiro) Myracrodruon
urundeuva (Aroeira) e Aspidosperma tomentosum (Peroba-de-campos) e dois isolados
de Maytenus ilicifolia (Espinheira Santa) cedidos gentilmente pela Dra Socircnia Pileggi
Dezessete isolados foram obtidos de amostras de folhas de Schinus terebinthifolius
(Aroeira Vermelha) coletados em 2007 pelo MsC Jocinei Lima e fazem parte do banco
bioloacutegico do Laboratoacuterio de Geneacutetica de Microrganismos (LABGEM) da Universidade
Federal do Paranaacute Curitiba Paranaacute Vinte e um isolados de Phomopsis sp e um
isolado de Diaporthe sp foram obtidos como endoacutefitos de folhas e peciacuteolos de M
ilicifolia (espinheira santa) em quatro coletas de outubro de 2006 a julho de 2007 no
Centro Nacional de Pesquisa de Floresta (CNPF) da EMBRAPA (Empresa Brasileira de
Pesquisa Agropecuaacuteria) localizada no municiacutepio de Colombo Paranaacute Dois isolados de
Phomopsis patoacutegenos de soja foram utilizados como linhagens referecircncia (TABELA 1)
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUA)
Coacutedigo Hospedeiro Procedecircncia Isolados por SM9631 Spondias mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9713 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9638 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9714 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)MU0123 Myracrodruon urundeuva Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)AT9810 Aspidosperma Jardim Botacircnico do Dra Kaacutetia Rodriguez do
33
tomentosum Rio de JaneiroRJ IOC (FIOCRUZRJ)AT9811 A tomentosum Jardim Botacircnico do
Rio de JaneiroRJ Dra Kaacutetia Rodriguez do IOC (FIOCRUZRJ)
AT9906 A tomentosum Jardim Botacircnico do Rio de JaneiroRJ
Dra Kaacutetia Rodriguez do IOC (FIOCRUZRJ)
ES80J Maytenus ilicifolia ColomboPR Dra Socircnia A V Pileggi no LABGEMPR
ESPAC22 Maytenus ilicifolia ColomboPR Dra Socircnia A V Pileggi no LABGEMPR
A135 Schinus terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A113 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A115B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A323 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A123 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A131 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A216B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A126 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A333B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A134 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A132 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A333A S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A124 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A215A S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A116 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A334 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A321 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
ES2WF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2WC1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2KF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2NA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUACcedilAtildeO)
34
ES2AB1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESBA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESDF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFH1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFB2 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESGA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESGF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESIE1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESIA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJH1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJG1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJE1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJE2 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESKD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESRD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESSD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
PHO1 (Phomopsis longicolla)
Glycine max (L) Merr Mato Grosso Dr Aacutelvaro Almeida EMBRAPALondrina-PR
PHO19 Glycine max (L) Merr Roraima Dr Aacutelvaro Almeida EMBRAPALondrina-PR
FONTE O autor
NOTA patoacutegenos de soja
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUACcedilAtildeO)
35
412 Microrganismos usados para teste de antagonismo
Para determinar a atividade antimicrobiana dos isolados foram utilizadas as
seguintes linhagens teste G citricarpa linhagens PC1396 e PC3305 pertencentes ao
banco bioloacutegico do Laboratoacuterio de Geneacutetica de Microrganismos da Universidade
Federal do Paranaacute
413 Fungos endofiacuteticos utilizados para anaacutelise de variabilidade geneacutetica
Como grupo externo para anaacutelise de variabilidade geneacutetica por RAPD foram
utilizadas cinco linhagens de Pestalotiopsis sp (TABELA 2)
TABELA 2 ISOLADOS GRUPO EXTERNO PARA ANAacuteLISE DE VARIABILIDADE GENEacuteTICA POR RAPD
Coacutedigo Hospedeiro Procedecircncia Pestalotiopsis phothiniae Gustavia cf eliacuteptica Amazonia Pestalotiopsis neglecta voucher Muraya paniculata Amazonia Pestalotiopsis vismeae Maytenus ilicifolia Paranaacute Pestalotiopsis sp 3 Maytenus ilicifolia Paranaacute Pestalotiopsis sp 11 Maytenus ilicifolia Paranaacute FONTE O autor NOTA Isolado cedidos pelo Profordm Dr Joseacute Odair Pereira da Universidade Federal do Amazonas Isolados por Josiane Gomes Figueiredo no LABGEMPR 42 Meios de Cultura 421 Caldo MEB (Extrato de Malte)
Extrato de Malte 20g
Glicose 20g
Peptona 1g
Aacutegua destilada p1000mL
36
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
422 Meio AV (Aveia-Aacutegar) Aveia 300 g
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
A aveia foi fervida durante 30 minutos com metade do volume da aacutegua A
suspensatildeo foi filtrada com gaze Adicionou-se aacutegua para completar o volume O pH foi
ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a necessidade
Acrescentou-se o aacutegar
423 Meio BDA (Meio Batata-Dextrose-Aacutegar)
Batata 2000g
Dextrose 100g
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
As batatas foram cozidas em 500 mL de aacutegua destilada durante 20 minutos Em
seguida foram filtradas com gaze adicionou-se a dextrose ao caldo e completou-se
com aacutegua destilada para 1000 mL O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N
eou HCl 1N conforme a necessidade Acrescentou-se o aacutegar
37
424 Meio MC (Meio Completo) PONTECORVO et al 1953
NaNO3 60g
KH2PO4 15g
KCl 05g
MgSO47H2O 05g
FeSO4 002g
ZnSO4 002g
Glicose 100g
Peptona 20g
Extrato de levedura 20g
Caseiacutena hidrolisada 15g
Soluccedilatildeo de vitaminas 10mL
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
425 Meio MEA (Extrato de Malte) PATERSON e BRIDGE 1994
Extrato de Malte 20g
Glicose 20g
Peptona 1g
Agar 15g
Aacutegua destilada p1000mL
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
38
OBS Todos os meios de cultura foram autoclavados durante 20 minutos a 1 atm e
armazenados em temperatura ambiente
43 Soluccedilotildees e Reagentes 431 Clorofane ndash FenolClorofoacutermio (11)
432 Clorofil ndash ClorofoacutermioAacutelcool Isoamiacutelico (241)
433 Derozal Bayerreg - 1mg de carbendazim em 1mL de aacutegua destilada
434 Dodecil Sulfato de Soacutedio (SDS) 10 (pv) em aacutegua destilada
435 Fenol Saturado
Um volume de fenol cristalizado foi dissolvido em banho-maria a 60degC e
acrescentado um volume de tampatildeo Tris-HCl 02 M pH 80 Apoacutes agitaccedilatildeo por 30
minutos a fase aquosa foi retirada e entatildeo acrescentado um volume de tampatildeo Tris-
HCl 02 M pH 80 Este processo foi repetido ateacute atingir o pH desejado (pH 80) Em
seguida foi adicionado um volume final de 110 do tampatildeo Tris-HCl 02 M pH 80 e
estocado em frasco escuro a uma temperatura de 4degC usado apoacutes 48 horas
(SAMBROOK E MANIATS 1989)
436 Gel de Agarose 08 (pv) em Tampatildeo TBE 1x
437 Gel de Agarose15 (pv) em em Tampatildeo TBE 1x
438 Lactofenol azul Aacutecido laacutetico 200 g
Cristais de fenol 200 g
Glicerina 200 g
39
Azul de algodatildeo (Metyl Blue Difco) 005 g
Aacutegua destilada 200 mL
Os cristais de fenol foram derretidos em banho-maria Adicionaram-se os demais
componentes Depois de 24 horas filtrou-se e armazenou-se em frasco escuro
439 Marcador de peso molecular (DNA de fago lambda clivado com Hind III Gibco)
O marcador de peso molecular do DNA foi fornecido concentrado e no momento
do uso diluiu-se na proporccedilatildeo de 1 μL do marcador 1 μL do tampatildeo da amostra 4 μL
de aacutegua Milli-Q esterilizada Na corrida eletroforeacutetica foi utilizado 6 μL do marcador
4310 Marcador de peso molecular (DNA Ladder 100pb Ludwing Biotec)
O marcador de peso molecular foi fornecido concentrado e no momento do uso
diluiu-se na proporccedilatildeo de 1 μL do marcador 2 μL do tampatildeo da amostra 7 μL de aacutegua
Milli-Q autoclavada Na corrida eletroforeacutetica foram utilizados 15 μL do marcador
4311 Oligonucleotiacutedeos (Invitrogen)
Foi adicionado Tris-HCl 10 mM pH70 aos oligonucleotiacutedeos para obter uma
soluccedilatildeo estoque com 50 μM No momento do uso a soluccedilatildeo estoque foi diluiacuteda para
concentraccedilatildeo final de 4μM
4312 RNAse (invitrogen)
A soluccedilatildeo foi preparada na concentraccedilatildeo de 10 mM de Tris-HCl pH 75 e 15 mM
de NaCl Aqueceu-se a 100degC por 15 minutos e estocou-se a ndash 20degC
40
4313 Soluccedilatildeo de Vitaminas Aacutecido Nicotiacutenico 1000 mg
Aacutecido para Aminobenzoacuteico 100 mg
Biotina 02 mg
Piridoxina 500 mg
Riboflavina 1000 mg
Tiamina 500 mg
Aacutegua destilada esterilizada p 1000 mL
A soluccedilatildeo foi aquecida em banho-maria a 98degC por 15 minutos e armazenada em
frasco escuro previamente autoclavado a 4degC
4314 Soluccedilatildeo de NaCl 085 (pv) em aacutegua destilada
4315 Soluccedilatildeo Tween-80 01 (vv) em aacutegua destilada
4316 Soluccedilatildeo de Tetraciclina 5 (pv) em etanol absoluto Preparou-se a soluccedilatildeo sob
agitaccedilatildeo e estocou-se em frasco escuro a ndash 20degC
4317 Soluccedilatildeo de EDTA 05M em aacutegua destilada O pH foi ajustado para 80
adicionando-se NaOH 1N
4318 Soluccedilatildeo de brometo de etiacutedio 1 (pv) em aacutegua destilada O brometo de etiacutedio
foi dissolvido em aacutegua destilada agitou-se e estocou-se a temperatura ambiente
protegido de luz No momento do uso adicionou-se 3μL desta soluccedilatildeo a 100 mL de
tampatildeo TBE (1X)
41
4319 Tampatildeo TE (Tris-EDTA)
Tris-HCl pH 80 100 mM
EDTA pH 80 10 mM
4320 Tampatildeo de Extraccedilatildeo de DNA Tris-HCl pH 80 2000 mM
EDTA pH 80 250 mM
NaCl 2500 mM
SDS (pv) 1
O tampatildeo de Extraccedilatildeo foi preparado no momento do uso
4321 Tampatildeo da Amostra (6x)
Azul de bromofenol3 1000 mL
Glicerol 1035 mL
Aacutegua destilada p 50 mL
4322 Tampatildeo de corrida TBE 10x
Trizma base 54g
Aacutecido boacuterico 275g
EDTA 465g
Aacutegua Milli-Q p 500mL
A soluccedilatildeo foi autoclavada e estocada a temperatura ambiente No momento do
uso diluiu-se 10 vezes com aacutegua Milli-Q
42
44 Isolamento
A metodologia utilizada para o isolamento dos microrganismos endofiacuteticos foi
descrita por Petrini (1991) modificada por Glienke (1995) Os diferentes oacutergatildeos da
planta temperatura de incubaccedilatildeo nuacutemero de plantas e o de fragmentos plaqueados
estatildeo listados na tabela 3
Isolamento Eacutepoca do ano Oacutergatildeo da
planta Temperatura
de incubaccedilatildeo
Nuacutemero de Plantas
Nuacutemero de fragmentos plaqueados
1 Outubro de 2006 Folha 28deg C 20 360 2 Marccedilo de 2007 Folha 22-23deg C 30 540 3 Julho de 2007 Folha 22-23deg C 20 360 4 Julho de 2007 Peciacuteolo 22-23deg C 20 160
Total de fragmentos plaqueados 1360
FONTE O autor
Os fungos foram isolados de plantas aparentemente sadias com folhas sem
marcas arranhaduras ou ferimentos Apoacutes a coleta as folhas foram colocadas em
sacos plaacutesticos devidamente identificados em seguida as superfiacutecies das folhas foram
lavadas em aacutegua corrente com auxiacutelio de uma esponja para a remoccedilatildeo dos
microrganismos epifiacuteticos e outros contaminantes Os peciacuteolos foram vedados com
parafina derretida para evitar a entrada dos desinfetantes nos seus tecidos internos
desta forma preservando os endoacutefitos a serem isolados As folhas vedadas foram
mergulhadas em frascos com aacutegua destilada autoclavada sendo mantidos por 1
minuto em etanol 70 por 1 minuto em hipoclorito de soacutedio (NaOCl) a 3 por 6
minutos etanol 70 por 30 segundos e por uacuteltimo em aacutegua destilada autoclavada por
6 minutos Devido agrave dificuldade de isolar fungos do gecircnero Phomopsis nos isolamentos
1 e 2 foi reduzido o tempo de tratamento com hipoclorito de soacutedio para 4 minutos nos
isolamentos 3 e 4 (TABELA 3) As folhas foram cortadas em seis fragmentos de 5-7 mm
e os peciacuteolos foram cortados das folhas e oito deles foram transferidos para placas de
TABELA 3 EacutePOCAS DO ANO OacuteRGAtildeOS DA PLANTA CONDICcedilOtildeES DE INCUBACcedilAtildeO E NUacuteMERO DE FRAGMENTOS PLAQUEADOS NAS QUATRO COLETAS DE ENDOacuteFITOS DE ESPINHEIRA-SANTA
43
Petri (90 mm) contendo os meios de cultura BDA adicionados de Tetraciclina (10
mgmL) para impedir o crescimento bacteriano (ARAUJO et al 2002)
Como controle apoacutes o processo de desinfestaccedilatildeo foram inoculados 01 mL da
uacuteltima aacutegua autoclavada utilizada no tratamento em trecircs placas de Petri As placas
permaneceram incubadas nas mesmas condiccedilotildees do isolamento
45 Conservaccedilatildeo dos fungos
Os isolados foram estocados utilizando-se duas metodologias 1) em frascos
contendo meio de cultura BDA inclinado apoacutes sete dias de crescimento a 28degC foram
mantidos a 4degC realizando-se repiques mensalmente 2) em frascos contendo aacutegua
destilada esterilizada com 12 discos de 5 mm meio de cultura BDA contendo miceacutelios
Repetiu-se o procedimento a cada trecircs meses
46 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica
A caracterizaccedilatildeo macromorfoloacutegica dos isolados de Phomopsis foi realizada com
base na forma dos bordos crescimento micelial aspecto da colocircnia e a sua coloraccedilatildeo
no verso e reverso da placa em diferentes meios de cultura Discos de miceacutelio (8 mm)
provenientes de colocircnias de Phomopsis com sete dias de crescimento em meio de
cultura BDA foram inoculados no centro de placas de Petri com diferentes meios de
cultura Batata-dextrose-aacutegar (BDA) aveia-aacutegar (MAV) e extrato de malte-aacutegar (MEA)
Foram incubados durante 14 dias a 22ordmC sob luz contiacutenua Os ensaios foram
realizados em triplicata O diacircmetro das colocircnias foi medido a partir do terceiro dia de
crescimento ateacute o quinto dia quando alguns atingiram completamente as bordas da
placa de Petri
Para anaacutelise da micromorfologia foram avaliados os coniacutedios apoacutes 21 dias de
crescimento Os picniacutedios foram comprimidos entre a lacircmina e a lamiacutenula com uma
gota de lactofenol azul de algodatildeo possibilitando a observaccedilatildeo ao microscoacutepio oacuteptico
44
com aumento de 1000x O comprimento e largura dos coniacutedios foram medidos usando
uma reacutegua na objetiva com escala de 1μM
47 Obtenccedilatildeo de colocircnia monospoacuterica
Apoacutes os isolados terem sido identificados como pertencentes ao gecircnero
Phomopsis colocircnias monospoacutericas foram obtidas cultivando os isolados endofiacuteticos em
placas de Petri com meio BDA a 28degC Observou-se o crescimento da colocircnia e
monitorou-se com observaccedilatildeo em microscopia oacuteptica a produccedilatildeo de esporos Os
picniacutedios foram coletados e macerados em soluccedilatildeo de ldquoTween 80rdquo 01 A suspensatildeo
de esporos foi filtrada com seringas contendo latilde de vidro Em seguida adicionou-se 10
mL de soluccedilatildeo salina Centrifugou-se a soluccedilatildeo filtrada durante 4 minutos a 7000 rpm
Descartou-se o sobrenadante adicionou-se 400 μL de soluccedilatildeo salina para suspender o
precipitado onde ficaram contidos os esporos retirou-se 10 μL desta suspensatildeo sendo
a concentraccedilatildeo estimada em Cacircmara de Neubauer Quando necessaacuterio diluiu-se em
soluccedilatildeo salina para viabilizar a contagem dos esporos Foram semeados 100 μL de
suspensatildeo em uma placa de Petri contendo meio BDA espalhou-se com alccedila de
Drigalsky incubou-se a 28degC Colocircnias isoladas foram selecionadas e repicadas em
tubos com BDA inclinado que apoacutes crescimento por sete dias a 28ordmC foram mantidos a
4degC
48 Caracterizaccedilatildeo Molecular 481 Extraccedilatildeo do DNA (RAEDER e BRODA 1985 modificado por GLIENKE 1995)
O DNA genocircmico foi obtido de acordo com a metodologia descrita por Raeder e
Broda (1985) modificada por Glienke (1995) Os isolados endofiacuteticos de Phomopsis
foram cultivados em meio MEA durante cinco dias a 28degC O miceacutelio obtido a partir da
raspagem da colocircnia com espaacutetula esterilizada foi liofilizado e mantido em freezer ou na
45
sequumlecircncia macerados com adiccedilatildeo de nitrogecircnio liacutequido O material foi pesado e para
cada grama de miceacutelio acrescentou-se 1 mL de Tampatildeo de Extraccedilatildeo Incubou-se a
soluccedilatildeo homogeneizada durante 20 minutos em banho-maria a 70degC Acrescentou-se
um volume de fenol saturado misturaram-se as fases e centrifugou-se durante 15
minutos a 5000 rpm Coletou-se a fase aquosa colocou-se em um novo tubo e
adicionou-se a este um volume de Clorofane Centrifugou-se novamente sob as
mesmas condiccedilotildees anteriores Coletou-se a fase aquosa como na etapa anterior e
adicionou-se um volume de Clorofil repetindo-se o processo de centrifugaccedilatildeo sob as
mesmas condiccedilotildees Coletou-se a fase aquosa em um novo tubo e adicionou-se etanol
absoluto O material foi incubado a ndash 20ordmC durante uma hora Apoacutes este periacuteodo a
suspensatildeo foi centrifugada (10000 rpm por 20 min) desprezou-se o sobrenadante
Acrescentou-se 500 μL de etanol 70 centrifugou-se a 10000 rpm durante 5 minutos
descartou-se o aacutelcool 70 inverteu-se o tubo sobre uma folha de papel absorvente
para secar a borda do tubo e este secou a uma temperatura de 37degC durante 30
minutos Ressuspendeu-se o DNA com 200 μL de aacutegua milli-Q por uma hora
temperatura ambiente As amostras foram tratadas RNAse (30 μgmL) a 37degC por uma
hora
A concentraccedilatildeo de DNA foi estimada por meio de eletroforese em gel de agarose
08 utilizando como padratildeo de peso molecular o DNA do fago λ (Gibco) clivado com
HindIII com concentraccedilatildeo conhecida Apoacutes a eletroforese o gel foi corado com brometo
de etiacutedio observado sobre transiluminador de luz ultravioleta e fotodocumentado
482 RAPD
As soluccedilotildees foram realizadas de acordo com as condiccedilotildees descritas por Glienke-
Blanco et al (2002) onde foram utilizados 50ng de DNA tampatildeo PCR 1x 05U de Taq
polimerase 02mM de oligonucleotideos 02mM de dNTP 3mM de MgCl2 em um
volume final de 25microL Foi realizada uma preacutevia seleccedilatildeo usando-se os oligonucleotiacutedeos
46
da linha OPX11 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) OPX14 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) OPX19 (5rsquo
TCACCACGGT 3rsquo) e OPE 08 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) da Operon Technologiesreg
A amplificaccedilatildeo foi realizada com as condiccedilotildees descritas por Pioli et al (2003)
com modificaccedilotildees sendo cada reaccedilatildeo submetida a 40 ciclos apoacutes a desnaturaccedilatildeo
inicial a 940C por 4 minutos Cada ciclo consiste de 1 minuto a 940C 1 minuto e 30
segundos a 350C e 2 minutos a 720C
4821 Anaacutelise da Variabilidade Geneacutetica
Os produtos de amplificaccedilatildeo foram separados por eletroforese (3 Vcm) em gel
de agarose 15 e posteriormente corados por 20 minutos com soluccedilatildeo de brometo de
etiacutedio Os fragmentos amplificados foram visualizados em um transiluminador de luz
Ultravioleta e a imagem do gel documentada atraveacutes de sistema fotograacutefico Digi-doc it
O marcador de peso molecular utilizado foi o Ladder de 100 pb (Ludwing Biotec)
A anaacutelise da variabilidade geneacutetica foi realizada pelo agrupamento das linhagens
segundo os princiacutepios adotados em taxonomia numeacuterica utilizando o coeficiente de
similaridade de Jaccard que permite calcular similaridades com base em variaacuteveis
binaacuterias (0 para ausecircncia e 1 para presenccedila de banda) As bandas foram consideradas
como variaacuteveis enquanto as linhagens como unidades O coeficiente foi calculado
segundo a foacutermula J=MP onde M eacute o nuacutemero de concordacircncias positivas e P o
nuacutemero total de variaacuteveis menos concordacircncias negativas (SNEATH e SOKAL 1973)
Desta forma o coeficiente de similaridade Jaccard (J) leva em conta apenas as
discordacircncias e as concordacircncias positivas quanto agrave presenccedila ou ausecircncia de bandas
desconsiderando as concordacircncias negativas Quanto maior a semelhanccedila entre duas
linhagens maior eacute o valor de similaridade As unidades foram agrupadas atraveacutes do
meacutetodo UPGMA (Unweighted Pair-Group Method with Arithmetical Average) que eacute um
modelo de agrupamento hieraacuterquico e permite a construccedilatildeo de dendrogramas
(SNEATH e SOKAL 1973) Matrizes e dendrogramas foram elaborados usando o
software NTSYS (Numerical taxonomy system of multivariate programs) (ROHLF
1988)
47
Para verificar a consistecircncia dos agrupamentos verificados foi realizada uma
anaacutelise bootstrap segundo Felsenstein (1985) utilizando o software BOOD (COELHO
2005)
483 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
4831 Amplificaccedilatildeo
A reaccedilatildeo foi realizada com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D (TABELA 4) que
satildeo universais para fungos e permitem amplificar a regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do DNA
Ribossomal
Oligonucleotiacutedeos Sequumlecircncia
LS266 5 TTACGTCCCTGCCCTTTGTA 3
V9D 5GCATTCCCA AA C AACTCGAC 3rsquo
FONTE O autor
As condiccedilotildees da reaccedilatildeo foram realizadas de acordo com a descriccedilatildeo de White et
al (1990) com algumas modificaccedilotildees 50 ng de DNA tampatildeo PCR 1x 15U de Taq
DNA polimerase 08microM de oligonucleotiacutedeos 02mM de dNTP 3mM de MgCl2 para um
volume final de 50microL
A amplificaccedilatildeo foi realizada em um termociclador Eppendorf (Modelo
Mastercycler Gradiente) com desnaturaccedilatildeo inicial a 94degC por 2 minutos 30 ciclos de 30
segundos a 94degC 1 minuto a 56degC 1 minuto a 72degC seguida de extensatildeo final de 3
minutos a 72degC
TABELA 4 SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA AMPLIFICACcedilAtildeO DAREGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL
48
4832 Purificaccedilatildeo da PCR
Foram testadas duas metodologias de purificaccedilatildeo da reaccedilatildeo de PCR
48321 Purificaccedilatildeo com PEG
Aos produtos da amplificaccedilatildeo da PCR com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D
foram acrescentados 50microL de PEG os tubos foram incubados a 37ordmC por 30 minutos
em seguida foram centrifugados por 15 minutos a 14000rpm O sobrenadante foi
descartado com micropipeta Adicionou-se 125microL de Etanol 80 gelado apoacutes 1min os
tubos foram centrifugados por 2 min a 13000 rpm descartou-se o sobrenadante Foram
adicionados 125microL de Etanol 96 (gelado) descartou-se o sobrenadante O Etanol foi
evaporado em speed vac por 10min a 70ordmC O pellet foi ressuspendido em 15 microL de
aacutegua Milli-Q e misturado em seguida ficou agrave temperatura ambiente por pelo menos 2
horas
Para confirmaccedilatildeo da presenccedila do DNA na amostra 1microL foi submetido agrave
eletroforese em gel de agarose 15
48322 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio
Aos produtos da amplificaccedilatildeo da PCR com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D
foram acrescentados 34 microL de acetato de amocircnio (AcNH4) 75M e 100 microL de etanol
96 Os tubos ficaram em temperatura ambiente por 10 minutos e em seguida foram
centrifugados por 15 minutos a 14000rpm Os pellets resultantes foram lavados com
250 microL de etanol 70 (receacutem preparado) centrifugou-se por 15 minutos a 14000rpm e
descartou-se o etanol O pellet foi seco na estufa a 37ordmC por 30 mim e ressuspendidos
em 15microL de aacutegua Milli-Q
Para confirmaccedilatildeo da presenccedila do DNA na amostra 1microL foi submetido a
eletroforese em gel de agarose 15
49
4833 Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento
Foram realizadas trecircs reaccedilotildees de sequumlenciamento a primeira foi realizada
usando o produto tratado com PEG e nas duas posteriores usou-se o produto de PCR
tratado com acetato de amocircnia Para o restante da metodologia natildeo houve alteraccedilatildeo
O sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA foi realizado pelo
meacutetodo de terminaccedilatildeo de cadeia segundo Sanger et al (1977) utilizando a
incorporaccedilatildeo de dideoxinucleotiacutedeos fluorescentes em Sequumlenciador Automaacutetico de
DNA megaBACE
Para a reaccedilatildeo de sequumlenciamento foram utilizados cerca de 50ng da reaccedilatildeo de
PCR purificada 02 microM do oligonucleotiacutedeo ITS1 (TABELA 5) e 4microL de mistura para
sequumlecircnciamento ET (Kit ldquoDYEnamic ET Dye Terminator Cycle Sequencing Kit for
MegaBACErdquo da Amersham Biosciences) completando com aacutegua milli-Q para um
volume final de 10microL As mesmas condiccedilotildees foram aplicadas para o oligonucleotiacutedeo
ITS4 (TABELA 5)
FONTE O autor
A amplificaccedilatildeo foi realizada em um termociclador Eppendorf (Modelo
Mastercycler Gradient) seguindo uma desnaturaccedilatildeo inicial a 96degC por 1 minuto 30
ciclos de 10 segundos a 96degC 1 minuto e 5 segundos a 50degC 4 minutos a 60degC 20 min
a 8degC
Oligonucleotiacutedeos Sequumlecircncia
ITS1 5rsquoTCCGTAGGTGAACCTGCGG3rsquo
ITS4 5rsquoTCCTCCGCTTATTGATATGC3rsquo
TABELA 5 SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA AMPLIFICACcedilAtildeO DAREGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL
50
4834 Purificaccedilatildeo da Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento
Foram testadas trecircs metodologias de purificaccedilatildeo da reaccedilatildeo de sequumlenciamento
48341 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em tubos
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com PEG (item 38321) foram adicionados 40 microL de isopropanol 75
sendo precipitados por um spin down As amostras ficaram agrave temperatura ambiente por
20 minutos em seguida foram centrifugadas por 25 minutos a 13000 rpm e o
isopropanol foi removido por inversatildeo dos tubos Foram adicionados 200 microL de etanol
70 natildeo gelado e centrifugado por 5 minutos a 13000 rpm em seguida o etanol foi
removido com auxiacutelio de uma micropipeta e foi submetido a secagem em speed vac por
45 minutos a 60degC
Apoacutes esse tratamento cada amostra foi ressuspendida em 10 microL Loading
Solution e submetida agrave eletroforese em Sequumlenciador Automaacutetico de DNA modelo
megaBACE da Amersham Biosciences Com os seguintes paracircmetros voltagem de
injeccedilatildeo 2V tempo de injeccedilatildeo 80 segundos voltagem da corrida 8V por 160 minutos
48342 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em placa
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com acetato de amocircnio (item 38322) foram adicionados 40microL de
isopropanol 75 sendo precipitados por um spin down As amostras ficaram agrave
temperatura ambiente por 20 minutos e em seguida foram centrifugadas por 50
minutos a 4000 rpm O isopropanol foi removido por inversatildeo da placa Foram
adicionados 100microL de etanol 70 natildeo gelado e centrifugado por 30 minutos a 4000
rpm em seguida o etanol foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um spin a
300 rpm por 1 minuto Em seguida a placa ficou em estufa a 37degC durante 3 minutos
Apoacutes esse tratamento as amostras foram processadas como no item anterior
51
48343 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com acetato de amocircnio (item 38322) foram adicionados 1 microL de acetato
de amocircnio (AcNH4) 75M e 30 microL de etanol 96 Apoacutes a homogeneizaccedilatildeo por inversatildeo
30 vezes a placa foi centrifugada por 45 minutos a 2500 RCF a 4degC
O sobrenadante foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um spin a 500
RCF com a placa invertida sobre papel toalha O pellet foi lavado com 100 microL de etanol
70 (receacutem preparado natildeo gelado) Seguindo-se uma nova centrifugaccedilatildeo a 2500 RCF
por 45 minutos e o sobrenadante foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um
spin a 750 RCF com a placa invertida sobre papel toalha Em seguida a placa ficou em
estufa a 37degC durante 3 minutos
Apoacutes esse tratamento cada amostra foi ressuspendida e tratada como nos itens
anteriores
Todos os procedimentos desde a reaccedilatildeo de sequumlenciamento foram realizados
sob proteccedilatildeo de luz direta cobrindo a placa com papel alumiacutenio
4835 Ediccedilatildeo e Anaacutelise das Sequumlecircncias
As sequumlecircncias foram entatildeo alinhadas utilizando-se o programa CLUSTAL-W
versatildeo 17 (THOMPSON HIGGINS e GIBSON 1994) sendo realizada posterior
inspeccedilatildeo visual atraveacutes do programa BioEdit 7053 (HALL 1999) Apoacutes a ediccedilatildeo
alinhamento e anaacutelise preacutevia das sequumlecircncias estas foram submetidas ao software
MEGA 31 (KUMAR TAMURA NEI 2004) para obtenccedilatildeo das aacutervores filogeneacuteticas
baseadas em distacircncia A consistecircncia dos noacutes obtidos foi avaliada pelo procedimento
de bootstrap (FELSENSTEIN 1985) com 10000 reamostragens Foram utilizadas como
referecircncias linhagens de Phomopsis sp Diaporthe e Pestalotiopsis vismae (como
grupo externo) depositadas no GenBank (httpwwwncbinlmnihgov) (TABELA 6)
52
TABELA 6 LINHAGENS DE Phomopsis spp E DE Pestalotiopsis vismae UTILIZADAS COMO GRUPO EXTERNO
Espeacutecie Nuacutemero de acesso (GenBank)
Diaporthe Melonis AB105147 D melonis AB105148 Phomopsis longicolla AY857868 P longicolla AF000207 P camptothecae AY622996 D Phaselorum AF001024 D helianthi AJ312348 D helianthi AJ312363 D helianthi AF358441 Phomopsis sp P7 DQ235673 Phomopsis sp P3 DQ235669 P sojae AY050627 P chimonanthi AY622993 Phomopsis sp P4 DQ235670 D conorum AB201443 D conorum DQ116551 P theicola DQ286286 P theicola DQ286287 Phomopsis sp 1 AY485724 Phomopsis sp CBS DQ286285 Phomopsis sp Taxon 3 AF230762 Diaporthe AJ312359 Diaporthe AY745024 Pestalotiopsis vismae EF451801
FONTE O autor
49 Avaliaccedilatildeo da Atividade Antimicrobiana
491 Cultura Pareada
Para avaliar a atividade antimicrobiana dos 49 isolados de Phomopsis sp
endofiacuteticos (TABELA 1) contra o fitopatoacutegeno Guignardia citricarpa foi utilizado a
metodologia de Cultura Pareada (MARIANO1993) Os discos contendo miceacutelio eou
coniacutedios dos isolados endofiacuteticos ou dos fitopatoacutegenos ensaiados foram obtidos de
53
colocircnias crescidas em BDA durante sete dias a 28degC incubadas em estufa BOD e com
fotoperiacuteodo de 12 horas Apoacutes este periacuteodo foram retirados os discos da borda das
colocircnias com auxiacutelio de vazador de rolhas
Em placas de Petri contendo meio de cultura BDA colocou-se um disco (Oslash 8
mm) da cultura do fitopatoacutegeno G citricarpa Apoacutes trecircs dias de crescimento foi
adicionado no lado oposto um disco com o isolado de Phomopsis sp endofiacutetico a ser
avaliado ambos a 10 cm da borda Apoacutes o pareamento as placas foram vedadas com
filme de PVC e mantidas durante 14 dias em estufa BOD com fotoperiacuteodo de 12 h a
28degC Foi realizado um delineamento inteiramente casualizado com cinco repeticcedilotildees O
controle recebeu apenas o fitopatoacutegeno A avaliaccedilatildeo foi realizada mediante mediccedilatildeo do
diacircmetro da colocircnia comparando com o controle e observaccedilatildeo das interaccedilotildees entre as
colocircnias
Para determinar a porcentagem de inibiccedilatildeo do crescimento mediu-se o diacircmetro
das colocircnias do fitopatoacutegeno com 14 dias de crescimento subtraindo-se o diacircmetro do
inoacuteculo original Os caacutelculos foram realizados de acordo com Edginton et al (1971)
pela foacutermula
Onde Dc eacute o diacircmetro meacutedio da colocircnia do fitopatoacutegeno no controle e Dt eacute o
diacircmetro meacutedio da colocircnia do patoacutegeno nos tratamentos testados
492 Avaliaccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
Cobriu-se assepticamente toda a superfiacutecie do meio PDA inclusive nas bordas
com discos de papel celofane (Oslash11 cm) esterilizado A seguir foi inoculado no centro
sobre a superfiacutecie do papel celofane discos de aacutegar (Oslash8 mm) contendo miceacutelio do
isolado endofiacutetico As placas foram incubadas por quatro dias a temperatura de 28degC
as placas controles receberam apenas o fitopatoacutegeno incubados por 7 dias com
Dc -Dt
Dc
Porcentagem de inibiccedilatildeo (PI) = X 100
54
fotoperiacuteodo de 12 horas Mediu-se o diacircmetro da colocircnia e retirou-se o papel celofane
(juntamente com a colocircnia do isolado) Sobre a superfiacutecie de meio PDA inoculou-se um
disco de miceacutelio do fitopatoacutegeno a ser avaliado no centro da placa Foi realizado um
delineamento inteiramente casualizado com cinco repeticcedilotildees As placas foram
incubadas a 28degC com fotoperiacuteodo de 12 horas Apoacutes 7 e 14 dias mediu-se o
crescimento das colocircnias e comparou-se com o controle (ETHUR CEMBRANEL e
SILVA 2001 Adaptado por Figueiredo 2006)
493 Atividade dos Extratos Metanoacutelicos 4931 Obtenccedilatildeo dos extratos
Para avaliaccedilatildeo da atividade dos extratos metanoacutelicos foi utilizada a metodologia
descrita por Rodrigues Hesse e Werner (2000) com algumas modificaccedilotildees No
processo de fermentaccedilatildeo trecircs discos (Oslash 8 mm) dos 49 isolados endofiacuteticos de
Phomopsis (TABELA 1) foram inoculados em Erlenmeyer (250 mL) contendo 100 mL
de caldo extrato de malte Incubou-se durante 7 dias (110 rpm 28degC fotoperiacuteodo de 12
horas)
Apoacutes a fermentaccedilatildeo o miceacutelio foi separado do liacutequido fermentado por filtraccedilatildeo
em papel Whatman ndeg 4 Ao volume do filtrado obtido adicionou-se o mesmo volume
de acetato de etila (EtOAc) (Merck) em um balatildeo de separaccedilatildeo Agitou-se
vigorosamente por trecircs vezes e aguardou-se a formaccedilatildeo de duas camadas uma
aquosa na parte inferior e outra orgacircnica na parte superior Transferiu-se a fase
orgacircnica para um novo recipiente e submeteu-se a fase aquosa a mais uma extraccedilatildeo
com EtOAc Repetiu-se o procedimento por mais duas vezes Adicionou-se agrave fase
orgacircnica 5 de sulfato de soacutedio anidro e filtrou-se novamente com papel Whatman ndeg
4 Obteve-se extrato bruto seco passando a fase orgacircnica em rotaevaporador O extrato
foi pesado e diluiacutedo em metanol (10mgmL)
55
4932 Crescimento micelial
Foram obtidos discos (Oslash 12 mm) de colocircnias com 14 dias de crescimento em
meio completo da cultura do fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396 ou PC3305 Estes
foram inoculados no centro de placas de Petri contendo meio de cultura BDA A 10 cm
da borda em posiccedilatildeo oposta foi colocado um disco de papel filtro esterilizado (Oslash 5 mm)
e sobre este foram inoculados 100μL do extrato metanoacutelico a ser avaliado As placas
foram fechadas com filme de PVC e mantidas a 28degC fotoperiacuteodo de 12 horas em
BOD Avaliou-se o potencial de inibiccedilatildeo medindo-se o diacircmetro das colocircnias apoacutes sete
dias de crescimento comparando-se com o controle negativo onde foi inoculado aacutegua
destilada autoclavada ou metanol Como controle positivo foi utilizado fungicida Derosal reg (10 mgmL) (QUIROGA SAMPIETRO e VATTUONE 2001 adaptado por
FIGUEIREDO 2006)
410 Anaacutelise Estatiacutestica
Todos os experimentos foram realizados com delineamento inteiramente
casualizado (DIC) com 5 repeticcedilotildees As anaacutelises de variacircncia foram realizadas em
todas as etapas do trabalho Sempre que foi encontrado um valor significativo em
relaccedilatildeo ao teste F completou-se a anaacutelise com teste de Tukey para comparaccedilatildeo das
meacutedias utilizando software ASSISTAT (SILVA 1996 e SILVA 2002) ou o teste de Scott
Knott utilizando software SISVAR (FERREIRA 1994)
56
5 Resultados e Discussatildeo
51 Isolamento
Foram isolados 1005 endoacutefitos de folhas e peciacuteolos de 30 plantas de Espinheira
Santa (M ilicifolia) Destes 21 foram identificados a partir de anaacutelise em microscopia
oacuteptica como pertencentes ao gecircnero Phomopsis A tabela 7 compara os resultados
obtidos quanto agrave proporccedilatildeo de isolamento de Phomopsis sobre os diferentes tecidos da
planta nos quatro isolamentos realizados A frequumlecircncia dos isolamentos foi calculada
de acordo com Souza et al (2004)
TABELA 7 PORCENTAGEM DE ISOLAMENTO DE Phomopsis ENDOFIacuteTICOS DE PLANTAS DE ESPINHEIRA SANTA
Isolamento Oacutergatildeo da planta
Nuacutemero de fragmentos plaqueados
Endoacutefitos Nuacutemero ()
Phomopsis Nuacutemero ()
Frequumlecircncia isolamento Phomopsis
1 Folha 360 140 (39) 0 (0) 0
2 Folha 540 310 (57) 2 (064) 037
3 Folha 360 375 (gt100) 3 (08) 083
TOTAL FOLHA
1260 825 (65) 5 (061) 04
4 Peciacuteolo 160 180 (gt100) 16 (89) 100
TOTAL 1420 1005 (71) 21 (209) 15 FONTE O Autor
Observando a tabela 7 percebe-se claramente que a partir de peciacuteolo a
frequumlecircncia de isolamento de Phomopsis (10) foi maior do que em folhas (04) tanto
em relaccedilatildeo ao nuacutemero de fragmentos plaqueados quanto em comparaccedilatildeo ao nuacutemero
total de endoacutefitos isolados (89 contra 061) Provavelmente devido agrave menor
frequumlecircncia de fungos filamentosos de crescimento raacutepido que pudessem sobrepor ao
crescimento de Phomopsis Segundo Souza et al (2004) as folhas dos vegetais
57
hospedeiros satildeo provavelmente as portas de entrada para os microrganismos pois
apresentam tecidos mais fraacutegeis e expostos pela presenccedila de estocircmatos ocorrendo
posterior migraccedilatildeo para outros tecidos da planta O mesmo jaacute foi relatado em espeacutecies
de Citrus para o isolamento de fungos do gecircnero Guignardia sendo o peciacuteolo o tecido
de mais faacutecil isolamento deste gecircnero por apresentar menor colonizaccedilatildeo por
Colletotrichum (BLANCO 1999)
Assim sugere-se que em trabalhos futuros de isolamento de Phomopsis sejam
tambeacutem utilizados os peciacuteolos especialmente em Espinheira Santa
Foram tambeacutem obtidos 18 isolados de Phomopsis de trecircs plantas de S
terebinthifolius (Aroeira Vermelha) representando uma frequumlecircncia de 11 Em Aroeira
a frequumlecircncia do isolamento de Phomopsis em folha foi maior do que em Espinheira
Santa em todos os isolamentos realizados
Fungos do gecircnero Phomopsis Phyllosticta e Colletotrichum satildeo comumente
isolados como endoacutefitos de tecidos de diferentes espeacutecies de plantas em muitos casos
esses fungos estatildeo juntos num mesmo hospedeiro (PANDEY et al 2003 LU et al
2004)
O gecircnero Phomopsis tem sido descrito com grande frequumlecircncia em isolamentos
de diversas plantas (UECKER 1988 BODDY e GRIFFITH 1989) Azevedo et al (2000)
apresentaram algumas plantas hospedeiras de onde jaacute foram isoladas espeacutecies de
Phomopsis entre elas Sabal bermudana Trachycarpus fortunei Cavendishia
pubescens Stylosanthes guianensis Anacardium occidentale e Mangifera indica
Corrado e Rodrigues (2004) isolaram endofiacuteticos de Phomopsis das plantas medicinais
Spondias mombin e Aspidosperma tomentosun
Bussabam et al (2001) isolaram entre outros fungos o gecircnero Phomopsis
endoacutefitos de folhas pseudocaules e rizomas de gengibre (Amomum siamense Criab)
coletadas em dois locais na Tailacircndia Silva et al (2006) isolou Phomopsis como
endoacutefito de graviola (Annona muricata L) e pinha (Annona squamosa L)
Alguns dos relatos citam o gecircnero Phomopsis como fitopatoacutegeno isolado de
diversas espeacutecies de Citrus Mangifera indica (Mangueira) Glycine max (Soja) Ficus
carica (Figueira) e Anacardium occidentale (Cajueiro) entre muitas outras plantas
58
(CENARGEN EMBRAPA 2005) Natildeo haacute relatos de gecircnero Phomopsis como
fitopatoacutegeno das plantas medicinais utilizadas no presente trabalho Aspidosperma
tomentosum Spondias mombin e Maytenus ilicifolia assim como em Aroeira Vermelha
(Schinus terebinthifolius) Entretanto o gecircnero foi relatado por Anjos Charchar e
Guimaratildees (2001) como patoacutegeno em culturas de Aroeira (Myracrodruon urundeuva)
causando sintomas de queimas nas folhas que consiste de uma necrose escura
predominantemente nos bordos dos foliacuteolos
52 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de Phomopsis
A caracterizaccedilatildeo macromorfoloacutegica das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de
Phomopsis sp foi realizada de acordo com a forma dos bordos crescimento micelial
aspecto da colocircnia e a sua coloraccedilatildeo no verso e reverso da placa em diferentes meios
de cultura (FIGURAS 1 a 4 ANEXO 12)
A coloraccedilatildeo das colocircnias dos isolados de Phomopsis apresentaram elevada
variabilidade tanto no verso quanto reverso da placa nos trecircs meios de cultura
ensaiados Em geral variou entre combinaccedilotildees das cores branca preto verde claro e
oliva amarelo marrom marrom avermelhado cinza e bege
Os isolados de Phomopsis apresentaram no verso da placa com meio Aveia (AV)
coloraccedilatildeo branca alguns isolados apresentaram combinaccedilotildees de branco com marrom
verde amarelo e cinza exceto os isolados ESJG1 ES2KF1 ES2WF1 ESPAC22
ES80J ESFB2 ESGF1 A134 A333B que diferiram dos demais por apresentarem
coloraccedilatildeo intensa e o isolado A116 de coloraccedilatildeo marrom e verde (FIGURAS 1 a 4)
Nos meios de cultura MEA e BDA observou-se que a coloraccedilatildeo no verso da
placa foi mais variaacutevel do que no meio Aveia Igualmente o reverso das placas
contendo as colocircnias de Phomopsis mostrou-se bastante variaacutevel entre os isolados e
os trecircs meios de cultura utilizados havendo variaccedilatildeo intra-individual com coloraccedilotildees
branca preto verde claro e oliva amarelo marrom marrom avermelhado cinza e
bege
59
A morfologia micelial nos meios de cultura ensaiados variou de granuloso aeacutereo
a algodonoso Nos meios de cultura MEA e BDA todos os isolados apresentaram
miceacutelio denso poreacutem no meio AV esses dois tipos de miceacutelio variaram de denso a ralo
A maioria dos isolados de Phomopsis analisados possuem miceacutelio granuloso aeacutereo em
todos os meios ensaiados exceto os isolados SM9638 SM9631 e Phomopsis longicolla
PHO1 que apresentam miceacutelio algodonoso Observou-se variaccedilatildeo intra-individual na
morfologia micelial entre os meios de cultura nos isolados A333B e A323 que
apresentaram miceacutelio algodoso no meio AV e granuloso aeacutereo nos meios MEA e BDA
Igualmente os isolados A123 e SM9811 apresentaram-se algodonoso no meio MEA e
granuloso aeacutereo nos meios AV e BDA
O aspecto dos bordos das colocircnias mostrou variaccedilatildeo intra-individual entre os
diferentes meios de cultura para a maioria dos isolados exceto os isolados de
Phomopsis SM9638 ESKD1 ESPAC22 A323 A113 A331 A115 que apresentaram
bordos regulares e os isolados SM9714 ES2WC1 ESJG1 A126 A333A PHO1
(Phomopsis longicolla) e o isolado PHO19 que possuem bordos irregulares em todos os
meios utilizados
FIGURA 1 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis DE Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT 9811 e AT 9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
AV MEA BDA
M
U 0
123
S
M97
13
60
FIGURA 1 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE
Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT9811 e AT9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
SM
9631
SM
9638
AT
9811
A
T990
6
AT9
810
SM
9714
AV MEA BDA
61
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
A32
1
A
132
A21
5A
A
113
A
323
A13
1
AV MEA BDA
62
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
A
135
A11
6
A
115B
A
124
A12
6
A21
6 B
AV MEA BDA
63
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
A
134
A33
3A
A
334
A12
3
A33
3B
AV MEA BDA
64
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
E
S2N
A1
E
SIE1
ES
GA
1
ES8
0J
E
SPA
C22
ES2
WF1
AV MEA BDA
65
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
ESFB
2
ESJ
D1
ESK
D1
E
SJH
1
ESD
F1
E
S2A
B1
AV MEA BDA
66
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
E
S2K
F1
ESJ
E2
ESJ
E1
ESG
F1
ESF
H1
ESF
F1
AV MEA BDA
67
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis E Diaporthe (BA1) ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
ESB
A1
ESI
A1
ES
RD
1
E
S2W
C1
ESS
D1
ES
JG1
AV MEA BDA
68
Na avaliaccedilatildeo do diacircmetro das colocircnias houve diferenccedila significativa entre os
isolados de Phomopsis dentro dos diversos meios de cultura avaliados Entre os meios
de cultura MEA BDA e AV houve diferenccedila significativa de crescimento em geral o
crescimento micelial foi menor no meio AV (ANEXO 1) Portanto os grupos de
Phomopsis formados quando considerada agrave taxa de crescimento foram inferidos para
os meios de cultura separadamente
Na figura 5 observa-se o resultado do diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados
apoacutes 5 dias de crescimento em meio MEA Os isolados foram reunidos em oito grupos
diferentes A A323 SM9631 ESKD1 A134 e ESIE1 B A116 A334 A215A ESSD1
C A321 MU0123 ESGF1 ESRD1 AT9811 SM9713 A123 ESJH1 ESDF1 A131
ESIA1 ESBA1 ESJD1 D A333A A135 ES2NA1 A124 A132 SM9714 ESFB2 E A115B ES2AB1 A216B A113 F PHO1 SM9638 ES2WF1 A126 ESJE1 ESPAC22
ESFF1 ES2KF1 ESJG1 ES80J G ESJE2 ESFH1 AT9906 ESGA1 AT9810
ES2WC1 Os isolados do grupo A apresentaram os maiores valores de crescimento
radial em torno de 70 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) e o grupo H apresentou menor
crescimento micelial em torno de 20 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) (ANEXO 4)
FIGURA 4 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS PATOGEcircNICOS OBTIDOS DE Glycine max EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
PH
O19
P
lon
gico
lla (P
HO
1) AV MEA BDA
69
O diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados apoacutes 5 dias de crescimento em meio
BDA estaacute representado na figura 6 Os isolados foram reunidos em seis grupos
diferentes A ESBA1 A323 A215A ESSD1 SM9713 ESGF1 SM9631 ESJD1
ESKD1 A334 B ESDF1 A132 A123 A333A MU0123 ESJH1 A321 ESRD1 A116
A134 A115B C ESIA1 A131 SM9714 A135 ESIE1 ESFB2 A124 ESPAC22
ES2KF1 A113 ESJE1 D ESJE2 ESFH1 ESJG1 ES2WC1 PHO1 SM9638
ES2NA1 ES2AB1 ESFF1 AT9811 AT9810 ES2WF1 A126 PHO19 A216B ES80J
ESGA1 E AT9906 F A333B Em geral a taxa de crescimento foi maior em meio BDA Os isolados do grupo A
apresentaram as maiores taxas de crescimento em torno de 70 cm (apoacutes 5 dias de
FONTE O autor
000
100
200
300
400
500
600
700
800
EB A F HD G C
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 4) A A323 SM9631 ESKD1 A134 e ESIE1 B A116 A334 A215A ESSD1 C A321 MU0123 ESGF1 ESRD1 AT9811 SM9713 A123 ESJH1 ESDF1 A131 ESIA1 ESBA1 ESJD1 D A333A A135 ES2NA1 A124 A132 SM9714 ESFB2 E A115B ES2AB1 A216B A113 F PHO1 SM9638 ES2WF1 A126 ESJE1 ESPAC22 ESFF1 ES2KF1 ESJG1 ES80J G ESJE2 ESFH1 AT9906 ESGA1 AT9810 ES2WC1
FIGURA 5 DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO MEA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
Diacirc
met
ro e
m c
m
70
crescimento) e o grupo F representado pelo isolado A333B apresentou menor
crescimento micelial (ANEXO 2)
Estudos sobre fisiologia envolvendo o gecircnero Phomopsis satildeo escassos Almeida
(1982) estudando Phomopsis sojae isolados de sementes de soja em seis diferentes
meios de cultura e nos regimes de luminosidade claro contiacutenuo e escuro contiacutenuo
verificou maior crescimento do fungo nos meios de haste de soja extrato de malte
aveia cenoura e BDA natildeo houve efeito da luz sobre o crescimento micelial de nenhum
dos isolados
Gurgel Menezes e Coelho (1997) verificaram maior crescimento micelial de P
anacardii e P mangiferae no meio BDA e uma melhor esporulaccedilatildeo nos meios BDA e V8
(Campbell CO) apoacutes 15 e 30 dias de incubaccedilatildeo No presente trabalho foi verificado
maior crescimento dos isolados de Phomopsis em meio BDA seguido do meio MEA em
meio AV a taxa de crescimento foi inferior
FONTE O autor
000
100
200
300
400
500
600
700
B A FEC D
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 2) A ESBA1 A323 A215A ESSD1 SM9713 ESGF1 SM9631 ESJD1 ESKD1 A334 B ESDF1 A132 A123 A333A MU0123 ESJH1 A321 ESRD1 A116 A134 A115B C ESIA1 A131 SM9714 A135 ESIE1 ESFB2 A124 ESPAC22 ES2KF1 A113 ESJE1 D ESJE2 ESFH1 ESJG1 ES2WC1 PHO1 SM9638 ES2NA1 ES2AB1 ESFF1 AT9811 AT9810 ES2WF1 A126 PHO19 A216B ES80J ESGA1 E AT9906 F A333B
FIGURA 6 DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
Diacirc
met
ro e
m c
m
71
O diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados apoacutes 5 dias de crescimento em meio
AV estaacute representado na figura 7 Os isolados foram reunidos em sete grupos
diferentes A ESKD1 B ESJE2 A123 C ESJE1 SM9638 AT9811 SM9713 PHO1
ESBA1 SM9631 ESFB2 A334 A323 MU0123 D A333A ESJD1 ESGF1 A116 E ESPAC22 ESDF1 A321 A132 ES2KF1 ESJG1 ESRD1 PHO19 A115B A124
ESFF1 A134 ESIE1 A135 A131 A113 ES2WF1 ESSD1 ESIA1 F ESGA1 ESJH1
ESFH1 AT9906 ES2NA1 A216B ES80J A215A G AT9810 A333B ES2AB1
SM9714 ES2WC1 A126 Apenas o isolado ESKD1 representante do grupo A
apresentou taxa de crescimento raacutepida de 70 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) a
maioria dos isolados tiveram crescimento lento (ANEXO 3)
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 3) A ESKD1 B ESJE2 A123 C ESJE1 SM9638 AT9811 SM9713 PHO1 ESBA1 SM9631 ESFB2 A334 A323 0123 D A333A ESJD1 ESGF1 A116 E ESPAC22 ESDF1 A321 A132 ES2KF1 ESJG1 ESRD1 PHO19 A115B A124 ESFF1 A134 ESIE1 A135 A131 A113 ES2WF1 ESSD1 ESIA1 F ESGA1 ESJH1 ESFH1 AT9906 ES2NA1 A216B ES80J A215A G AT9810 A333B ES2AB1 SM9714 ES2WC1 A126
FIGURA 7 AVALIACcedilAtildeO DAS MEacuteDIAS DO DIAcircMETRO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO AV APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
000
100
200
300
400
500
600
700
B A F C GD E
FONTE O autor
Diacirc
met
ro e
m c
m
72
Foi observado que dos 49 endoacutefitos e os 2 isolados patogecircnicos de Phomopsis
spp avaliados (TABELA 1) 27 apresentaram variaccedilatildeo intra-individual quanto ao
crescimento nos diversos meios Por exemplo os isolados A323 e SM9631 em meio
MEA e BDA pertencem ao grupo A e no meio AV ao grupo C Os outros 24 isolados
natildeo apresentaram variaccedilatildeo entre os agrupamentos formados nos diferentes meios
Os isolados que se agrupam baseados no crescimento nos trecircs meios natildeo satildeo
os mesmos quando se considera a cor do verso e reverso da placa assim como natildeo
satildeo semelhantes aos agrupamentos formados quando comparados com os bordos e
aspecto da colocircnia
Gurgel Menezes e Coelho (2002) estudando Phomopsis anacardii e Phomopsis
mangiferae observaram maior produccedilatildeo de picniacutedios nos meios de extrato de malte
aveia haste de soja e cenoura somente quando mantidos sob luz contiacutenua A
produccedilatildeo de picniacutedios foi reduzida em alternacircncia de luz e quase nula no escuro
contiacutenuo No presente trabalho foi observado que a maioria dos isolados formaram
estruturas de reproduccedilatildeo com o uso de luz contiacutenua em baixas temperaturas 22 a 25 degC
e pH 58 nos trecircs meios avaliados apoacutes 14 dias de crescimento
Segundo Cochrane (1959) e Griffin (1994) a luminosidade promove formaccedilatildeo
das estruturas reprodutivas assim como estatildeo diretamente ligadas agrave composiccedilatildeo do
meio de cultura atraveacutes de diferentes reaccedilotildees enzimaacuteticas Leonian (1924) descreve
que o efeito da luz como indutor da reproduccedilatildeo de fungos estaacute associado agraves
modificaccedilotildees que ocorrem no seu metabolismo celular combinados aos elementos que
constituem o meio de cultura
Timnick Lilly e Barnett (1951) detectaram efeito positivo da luz para a formaccedilatildeo
de picniacutedios ao verificarem que o regime escuro contiacutenuo inibia a formaccedilatildeo de picniacutedios
de Diaporthe phaseolorum Resultados semelhantes foram observados por Correcirca
(1995) avaliando Phomopsis sp provenientes de sementes florestais observou uma
melhor esporulaccedilatildeo em meio aveia sob regime de claro contiacutenuo por 12 dias de
incubaccedilatildeo
Na anaacutelise da micromorfologia observou-se que os isolados apresentavam
estruturas de reproduccedilatildeo a partir de 14 dias ateacute 21 dias de crescimento (FIGURA 8)
73
exceto os isolados SM9811 SM9638 e Phomopsis longicolla PHO1 que natildeo formaram
estruturas de reproduccedilatildeo em nenhum dos meios ensaiados Os isolados SM9811 e
SM9638 foram descritos como pertencentes ao gecircnero Phomopsis e depositados na
Coleccedilatildeo de Cultura de Fungos do Departamento de Micologia (IOC) da FIOCRUZ e
foram descritos por Rodrigues e Samules (1999) O isolado PHO1 foi isolado e
identificado pela EMBRAPA (Londrina-PR) como pertencente agrave espeacutecie P longicolla
Os coniacutedios do tipo alfa foram menos frequumlentes do que os do tipo beta Em
meio de cultura BDA apenas 11 isolados apresentaram o tipo de esporo alfa jaacute os beta
coniacutedios filiformes curvos na extremidade ou ligeiramente curvos foram visualizados
em quase todos os isolados de Phomopsis spp
Foi observado que para os isolados que apresentaram os dois tipos de esporos
foram visualizados com 14 dias de crescimento apenas alfa coniacutedios hialinos com
vacuacuteolos nas extremidades de forma ovoacuteide e natildeo foram visualizados beta coniacutedios
Apoacutes 21 dias os dois tipos de esporos foram visualizados nesses isolados (FIGURA 8a
e 8c) Alguns alfa coniacutedios apresentavam mais de dois vacuacuteolos nas extremidades
(FIGURA 8b) Essa variaccedilatildeo intra-individual tambeacutem foi observada em relaccedilatildeo agrave
morfologia do beta coniacutedio em que alguns apresentam curvatura na extremidade
outros ligeiramente curvos (FIGURA 8c)
NOTA A - isolado SM9631 aumento de 400x B- isolado SM9714 aumento de 1000x C- isolado SM9713 aumento de 400x microscopia oacuteptica Setas pretas indicam os alfa coniacutedios e setas vermelhas os beta coniacutedios Escala em 1μM
FONTE O autor
FIGURA 8 FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis EM BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
A B C
74
Alfa coniacutedios do isolado SM9713 provenientes dos meios de cultura AV (FIGURA
9a) e BDA (FIGURA 9e) apresentaram grande variaccedilatildeo morfoloacutegica Na figura 9 no
mesmo conidioacuteforo eacute visiacutevel a diferenccedila morfoloacutegica do alfa coniacutedio Na figura 9e o
conidioacuteforo apresenta alfa coniacutedios com mais de duas gotas nas extremidades (SETA 1)
e alfa coniacutedios com apenas dois vacuacuteolos (SETA 2) Em maior aumento eacute possiacutevel
perceber que existem variaccedilotildees de dois trecircs e ateacute quatro vacuacuteolos no mesmo isolado
(FIGURA 9a 9b e 9c) Tal variaccedilatildeo pode ser decorrente de diferenciados graus de
maturaccedilatildeo destes coniacutedios o que dificulta a caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de espeacutecies do
gecircnero Phomopsis
A medida do comprimento dos beta coniacutedios em meio BDA mostrou que os
isolados apresentam diferenccedilas estatiacutesticas significativas reunindo os isolados em 15
FIGURA 9 FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DO ISOLADO SM9713 EM MEIOS BDA e AV APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
1 2 A
B C D
E
NOTA A - em meio AV aumento de 400x B C e D- em meio BDA aumento de 650x E- em meio BDA aumento de 400x Microscopia oacutetica
FONTE O autor
75
grupos diferentes (ANEXO 5) A (AT9906 AT8010) B (ESFH1) C (ESPAC22 ES2KF1
SM9631) D (ESGA1 PHO19) E (ES80J) F (ESRD1) G (ESJE2 ESFB2 ESJE1) H
(ESJG1) I (A323) J (A333A A135 A124 A126 A132 A131 A134 A115B ESIE1) K
(ES2WC1 ES2WF1) L (SM9713 A334 ESIA1 A333B ESFF1 ESGF1) M (ES2AB1
A123 A113 ESJD1) N (ESKD1 ES2NA1 A215A SM9714) O (ESSD1 ESJH1
MU0123 A321 ESDF1 A216B A116) (FIGURA 10) Os isolados tambeacutem natildeo se
agrupam de acordo com os outros criteacuterios avaliados como a cor do verso e reverso
da placa diacircmetro das colocircnias assim como natildeo satildeo semelhantes aos agrupamentos
formados quando comparados com os bordos e aspecto do miceacutelio
NOTA As letras maiuacutesculas indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo agrave meacutedia do comprimento de beta coniacutedio dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Isolados de cada agrupamento A (AT9906 AT8010) B (ESFH1) C (ESPAC22 ES2KF1 SM9631) D (ESGA1 PHO19) E (ES80J) F (ESRD1) G (ESJE2 ESFB2 ESJE1) H (ESJG1) I (A323) J (A333A A135 A124 A126 A132 A131 A134 A115B ESIE1) K (ES2WC1 ES2WF1) L (SM9713 A334 ESIA1 A333B ESFF1 ESGF1) M (ES2AB1 A123 A113 ESJD1) N (ESKD1 ES2NA1 A215A SM9714) O (ESSD1 ESJH1 MU0123 A321 ESDF1 A216B A116) As meacutedias seguidas pela mesma letra minuacutescula natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 5)
FIGURA 10 COMPRIMENTO DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO EM BDA A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
0
5
10
15
20
25
30
35
40
B C E F MID LJA N H K OG
a
b
c
cd
de
ef
efg
fgh
fghi
ghij
ghil
hil
him
im
m
FONTE O autor
Diacirc
met
ro e
m μ
M
76
Desta forma as caracteriacutesticas macroscoacutepicas (coloraccedilatildeo bordos e tipos de
miceacutelio da colocircnia) e de micromorfologia dos coniacutedios avaliadas isoladamente natildeo
permitiram propor identificaccedilatildeo das espeacutecies dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis
Sendo assim optou-se por realizar uma anaacutelise polifaacutesica agrupando as caracteriacutesticas
morfoloacutegicas analisadas tais como crescimento micelial coloraccedilatildeo e bordos da
colocircnia tipo de miceacutelio comprimento dos coniacutedios e tipos de coniacutedios produzidos em
deferentes meios Essa metodologia foi descrita por Figueiredo et al (2006) para
caracterizar isolados de Pestalotiopsis Para todas estas caracteriacutesticas foram
atribuiacutedas notas de 0 ou 1 onde 0 representou ausecircncia da caracteriacutestica e 1 a
presenccedila (ANEXO 12) Os resultados compuseram uma matriz binaacuteria analisada pelo
software NTSYS (coeficiente Jaccard) com o agrupamento pelo meacutetodo UPGMA
permitindo a construccedilatildeo de um dendrograma de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
De acordo com o dendrograma de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
sugere-se a formaccedilatildeo de seis grupos com elevados valores de bootstrap que conferem
robustez aos agrupamentos No grupo I estatildeo reunidos os isolados MU0123 e
SM9713 no grupo II os isolados AT9810 e AT9906 no grupo III os isolados ESJE1 e
ESJE2 no grupo IV os isolados ESFB2 e ESFF1 no grupo V os isolados ES2KF1 e
ESJG1 e no grupo VI os isolados ES2WF1 e ES80J Os demais agrupamentos
formados natildeo foram considerados pois apresentam baixos valores de bootstrap e ou
baixos valores de similaridade morfoloacutegica
Os dados mostram elevada variabilidade morfoloacutegica dos isolados de Phomopsis
avaliados o que dificulta a delimitaccedilatildeo de espeacutecies apenas com dados morfoloacutegicos
Segundo Parmeter (1958) e Rehner e Uecker (1994) o alto grau de plasticidade das
caracteriacutesticas morfoloacutegicas impossibilita a delimitaccedilatildeo de espeacutecies no gecircnero
Phomopsis Gamboa-Gaitaacuten Laureano e Bayman (2005) estudando isolados de
Phomopsis endofiacuteticos de Guarea guidonia (Meliaceae) de duas regiotildees de Luquillo
(Porto Rico) relataram elevados niacuteveis de variabilidade morfoloacutegica entre os isolados
avaliados Eles observaram uma mistura de diferentes morfotipos em ambas as regiotildees
estudadas
77
Neste trabalho foi observado um elevado niacutevel de variabilidade morfoloacutegica dos
isolados de Phomopsis spp obtidos de seis diferentes espeacutecies de plantas e regiotildees
geograacuteficas Natildeo foi possiacutevel observar estruturaccedilatildeo populacional dos isolados em
funccedilatildeo da espeacutecie hospedeira Na figura 12 os isolados de M ilicifolia encontram-se na
coloraccedilatildeo rosa e distribuiacutedos ao longo dos dois eixos que representam os dois
principais componentes de variaccedilatildeo Igualmente os isolados em preto representam as
linhagens provindas de S terebinthifolius e tambeacutem encontram-se dispersos Tais
resultados natildeo surpreendem pois eacute possiacutevel que a mesma espeacutecie de Phomopsis seja
isolada em diferentes hospedeiros
NOTA I II III IV V VI satildeo grupos formados para inferir sobre a diversidade dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis Os valores a esquerda dos noacutes indicam os valores de bootstrap
COEFICIEcircNTE DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA
FIGURA 11 DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp
FONTE O autor
r = 07577 (P= 00001)
V VI
IV
I II III
78
FONTE O autor FIGURA 12 ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp NOTA Isolados em coloraccedilatildeo rosa obtidos de Maytenus ilicifolia Em preto Schinus terebinthifolius Em azul escuro Myracrodruon urundeuva Em azul claro Aspidosperma tomentosun Em verde Spondias mombin 53 Caracterizaccedilatildeo Molecular de Phomopsis spp 531 RAPD
Os isolados de Phomopsis spp foram avaliados por meio de marcadores
moleculares do tipo RAPD a fim de verificar a magnitude da variabilidade geneacutetica
Foram analisados por esta metodologia 54 isolados Destes 47 Phomopsis spp
endoacutefitos os isolados MU0123 e SM9638 natildeo amplificaram em nenhuma das
condiccedilotildees ensaiadas dois isolados de Phomopsis patoacutegenos de soja e cinco isolados
de Pestalotiopsis Foram utilizados 4 oligonucleotiacutedeos gerando 99 bandas O tamanho
dos fragmentos amplificados variou de 400 a 2600 pb e podem ser visualizados nas
Figuras 13 a 16
79
FIG
UR
A 1
4 P
ER
FIL
DE
AM
PLI
FIC
ACcedil
AtildeO
CO
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OLI
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s sp
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lotio
psis
FIG
UR
A 1
3 P
ER
FIL
DE
AM
PLI
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AtildeO
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E
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O E
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O P
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lotio
psis
80
FIG
UR
A 1
5 P
ER
FIL
DE
AM
PLI
FIC
ACcedil
AtildeO
CO
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NU
CLE
OTIacute
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O O
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19 D
OS
ISO
LAD
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EN
DO
FIacuteTI
CO
S D
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s sp
E
GR
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O E
XTE
RN
O P
esta
lotio
psis
FIG
UR
A 1
6 P
ER
FIL
DE
AM
PLI
FIC
ACcedil
AtildeO
CO
M O
OLI
GO
NU
CLE
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DE
O O
PE
08 D
OS
ISO
LAD
OS
EN
DO
FIacuteTI
CO
S D
E P
hom
opsi
s sp
E
GR
UP
O E
XTE
RN
O P
esta
lotio
psis
81
A anaacutelise destes marcadores RAPD permitiu a construccedilatildeo de um dendrograma
de similaridade geneacutetica (FIGURA 17) O coeficiente de correlaccedilatildeo das matrizes de
similaridade geneacutetica e cofeneacutetica obtido pelo teste de Mantel foi elevado (r=08157 e
p=00001) indicando que o dendrograma representa de forma adequada a matriz de
similaridade geneacutetica obtida pelos marcadores de RAPD Entretanto os valores de
bootstrap da maioria dos agrupamentos formados foram baixos Desta forma somente
foram considerados na anaacutelise os agrupamentos com bom suporte de bootstrap e
coeficientes de similaridade superiores a 50
Os dados indicam elevada variabilidade geneacutetica dos isolados de Phomopsis
spp avaliados (FIGURAS 17 e 18) com a formaccedilatildeo de sete grupos Os isolados de
Pestalotiopsis utilizados como grupo externo formaram um grupo (boostrap = 100)
isolado (FIGURA 17) sendo relevante para inferir a magnitude da variabilidade geneacutetica
observada entre os isolados de Phomopsis spp
O primeiro agrupamento reuacutene trecircs endoacutefitos de Espinheira Santa ESBA1
ES2AB1 e ESSD1 (49 de similaridade e bootstrap = 64) Esses isolados foram
obtidos do mesmo isolamento e pomar (CNPFEMPRAPA ColomboPR) poreacutem de
tecidos e plantas diferentes Os isolados ESBA1 e ESSD1 foram obtidos de peciacuteolo
enquanto ES2AB1 foi isolado de folha Eacute importante observar que o isolado ESBA1
apresentou estrutura de reproduccedilatildeo sexual sendo classificado como Diaporthe sp e
no entanto apresenta alto valor de similaridade geneacutetica com os isolados de Phomopsis
sp sugerindo assim que pertenccedilam ao mesmo complexo Phomopsis Diaporthe
Esses isolados natildeo se agrupam quanto aos caracteres morfoloacutegicos (FIGURAS 11 e
12)
O segundo agrupamento com 893 de similaridade geneacutetica e com bootstrap
de 100 compreende P longicolla (PHO1) uma linhagem patogecircnica de soja isolada
em Primavera do Leste ndash MT e o isolado SM9713 endoacutefito de Spondias mombin
coletado em Redenccedilatildeo ndash PA Aleacutem de coletados em lugares e hospedeiros totalmente
diferentes esses isolados apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas divergentes pois
natildeo pertencem ao mesmo agrupamento em nenhuma das caracteriacutesticas morfoloacutegicas
analisadas Entretanto a alta similaridade geneacutetica destes isolados sugere que
82
pertenccedilam agrave mesma espeacutecie o que reforccedila as observaccedilotildees anteriores de que a
definiccedilatildeo de espeacutecie do gecircnero Phomopsis natildeo eacute possiacutevel utilizando-se apenas
caracteriacutesticas morfoloacutegicas
FIGURA 17 DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS DE Phomopsis spp POR MEIO DE MARCADORES MOLECULARES RAPD
COEFICIENTE DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA
FONTE O autor
I II
III IV V VI VII
GRUPO EXTERNO
r= 08157 (p=00001)
100
83
O terceiro agrupamento com 75 de similaridade geneacutetica (FIGURA 17)
compreende dois isolados endofiacuteticos de Aspidosperma tomentosun AT9810 e AT9906
Esses isolados apresentaram caracteriacutesticas morfoloacutegicas muito semelhantes
formando o agrupamento II com 81 de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
O quarto agrupamento com 72 de similaridade geneacutetica compreende os
isolados ESFH1 e ESFF1 provenientes do peciacuteolo de Espinheira Santa da mesma
coleta poreacutem novamente eles natildeo se agrupam quanto aos caracteres morfoloacutegicos
observados (FIGURAS 11 e12)
O quinto agrupamento com 85 de similaridade geneacutetica reuacutene os isolados
ESKD1 e ESJH2 e ESJH1 provenientes de peciacuteolo da Espinheira Santa coletados na
mesma data Os isolados ESJH1 e ESJH2 foram obtidos do mesmo peciacuteolo e
apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas mais semelhantes entre si do que quando
comparados ao isolado ESKD1 (FIGURA 11) Entretanto a figura 17 revela que por
meio de marcadores RAPD os isolados ESKD1 e ESJH2 satildeo mais proacuteximos (92 de
similaridade geneacutetica) Sugere-se assim que os 3 isolados pertenccedilam agrave mesma
espeacutecie
O sexto agrupamento com 52 de similaridade (FIGURA 17) compreende os
isolados A321 obtido de Aroeira e ESIA1 obtido de Espinheira Santa Aleacutem de
coletados em lugares e hospedeiros totalmente diferentes esses isolados apresentam
caracteriacutesticas morfoloacutegicas diferentes (FIGURAS 11 e 12) Apesar do valor de
bootstrap atribuir confiabilidade a este agrupamento (77) o valor de similaridade
observado (52) natildeo eacute alto Assim natildeo eacute possiacutevel inferir que pertenccedilam agrave mesma
espeacutecie
O mesmo ocorre com o seacutetimo agrupamento que com 55 de similaridade
compreende os isolados A333A obtido de Aroeira e ESRD1 obtido de Espinheira Santa
Aleacutem de coletados em lugares e hospedeiros totalmente diferentes esses isolados
apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas diferentes natildeo pertencendo ao mesmo
agrupamento quanto aos caracteres morfoloacutegicos (FIGURAS 11 e 12)
Esses resultados mostram que caracteriacutesticas morfoloacutegicas natildeo satildeo suficientes
para inferir espeacutecies neste gecircnero analisadas individualmente ou em anaacutelise polifaacutesica
84
Aleacutem disso natildeo haacute estruturaccedilatildeo populacional quanto ao hospedeiro Esses dados
reforccedilam a necessidade de revisatildeo na classificaccedilatildeo de espeacutecies do gecircnero Phomopsis
Atualmente a anaacutelise polifaacutesica vem sendo realizada em estudos de diversidade
bacteriana utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas bioquiacutemicas fisioloacutegicas e
moleculares (KIM et al 2006 a b NEDASHKOVSKAYA et al 2006) e
esporadicamente na identificaccedilatildeo de leveduras (SAMPAIO et al 1999 VILLA-
CARVAJAL et al 2004) Em fungos filamentosos a anaacutelise polifaacutesica de caracteriacutesticas
morfoloacutegicas foi utilizada com sucesso na taxonomia de Penicillium (FRISVAD e
SAMSON 2004) Aspergillus (FRISVAD et al 2004) e Pestalotiopsis (FIGUEIREDO
2006)
FIGURA 18 ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp
FONTE O autor
85
532 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
Visando elucidar a taxonomia dos isolados de Phomopsis spp utilizados neste
trabalho foi realizado com sucesso o sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 - 58S - ITS2 do
rDNA de 29 isolados Apoacutes o alinhamento e ediccedilatildeo destas sequumlecircncias foi realizada
uma busca no banco de dados de sequumlecircncias (httpwwwncbinlmnihgov) a fim de
identificar sequumlecircncias similares Os isolados estatildeo representados na aacutervore filogeneacutetica
(FIGURA 19)
Os isolados agruparam-se em 16 clados sugerindo que as plantas medicinais
estudadas satildeo colonizadas por pelo menos dezesseis diferentes espeacutecies de
Phomopsis (FIGURA 19) Entretanto a maioria dos isolados natildeo apresentaram
sequumlecircncias ITS com identidade superior a 90 com nenhuma sequumlecircncia depositada no
GenBank e portanto foram identificados como Phomopsis sp S1 a Phomopsis sp
S12
O primeiro clado (suportado com bootstrap de 98) estaacute representado na figura
20 e reuacutene os isolados A113 A131 A133 ESIA1 e A321 que apresentaram identidade
com P chimonanthi e com uma linhagem de Phomopsis sp endofiacutetica de Coffea
robusta (DQ123615) Esta linhagem foi isolada e sequumlenciada por Sette et al (2006) e
apresentou 99 de similaridade com as mesmas espeacutecies P chimonanthi P
michaeliae e Diaporthe helianthi (FIGURAS 19 e 20) A espeacutecie P chimonanthi foi
recentemente proposta por Chang e colaboradores (dados natildeo publicados) para
isolados antes denominados de P michaeliae Como esta espeacutecie foi descrita em 1987
e aceita ateacute o momento no presente trabalho sugere-se que os isolados A113 A131
A133 ESIA1 e A321 sejam classificados como P michaeliae
O isolado ESIA1 foi obtido de Espinheira Santa (Maytenus ilicifolia) enquanto os
demais isolados deste clado foram obtidos de Aroeira Vermelha (Schinus
terebinthifolius) Esses isolados apresentaram baixa similaridade geneacutetica quando
avaliados por RAPD e similaridade parcial quanto agraves caracteriacutesticas morfoloacutegicas uma
vez que fazem parte do mesmo agrupamento no diacircmetro da colocircnia em meio BDA
(Grupo C) e MEA (Grupo E)
86
FONTE O autor FIGURA 19 AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MEacuteTODO DE PARCIMOcircNIA)
ESIA1
A321
A113
A131
AY6229931| Phomopsis
P michaellae
Phomopsis sp S5 A116
ESRD1
ESJE2
ESKD1
Phomopsis sp S1
Phomopsis sp S9 A124
A334
A323Phomopsis sp S8
Phomopsis sp S2 A123
AJ3123481| Diaporthe helianthi
DQ2862851| Phomopsis sp CBS
AY8578681| Phomopsis longicolla
AF000207| Phomopsis longicolla
AF0010242| Diaporthe phaseolorum
DQ2356701| Phomopsis sp P4
Phomopsis sp S10 ESGA1
DQ2356731| Phomopsis sp P7
PHO19
AY0506271| Phomopsis sojae
DQ2356691| Phomopsis sp P3
P sojae
AF3584411 Diaporthe helianthi
AJ3123631| Diaporthe helianthi
SM9713
P longicolla PHO1
MU0123
P longicolla
A126
ESJH1Phomopsis sp S11
Phomopsis sp S12 ESJD1
Phomopsis sp S7 ESDF1
AB1051481| Diaporthe melonis
ES2AB1
ESBA1Phomopsis sp S6
AB1051471| Diaporthe melonis
AY6229961| Phomopsis camptothecae
AJ3123591| Diaporthe
AY7450241| Diaporthe
ES2KF1
ES2WF1
ESPAC22
Phomopsis sp S4
Phomopsis sp S3 ESGF1
AB2014431| Diaporthe conorum
DQ1165511| Diaporthe conorum CBS
SM9638
ESFH1
DQ2862861| Phomopsis theicola
AF230762 Phomopsis sp taxon 3
AY4857241| Phomopsis sp 1
DQ2862871| P theicola CBS
P theicola
Pestalotiopsis vismae
99
99
3599
98
91
7786
78
75
73
2973
5
5
3
2
11
71
70
25
22
33
40
67
63
33
44
65
41
34
29
27
21
21
18
13
12
8
7
5
3
3
0
0
0
19
32
23
31
87
Os isolados ESRD1 ESKD1 e ESJE2 apresentaram homologia quanto as
sequumlecircncias de ITS com suporte de bootstrap de 95 (FIGURA 19) Entretanto a figura
17 revela que por meio de marcadores RAPD os isolados ESKD1 e ESJE2 satildeo mais
proacuteximos apresentando 92 de similaridade geneacutetica (com bootstrap de 65) e 85
de similaridade desses isolados com o ESJE1 Assim sugere-se que estes 3 isolados
pertenccedilam agrave mesma espeacutecie Entretanto as sequumlecircncias ITS natildeo apresentaram
identidade superior a 90 com nenhuma sequumlecircncia depositada no GenBank Assim
esses isolados foram denominados de Phomopsis sp S1
FONTE O autor FIGURA 20 AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA PARCIAL BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MODELO NEIGHBOR-JOINING COM CORRECcedilAtildeO KIMURA DOIS PARAcircMETROS)
O isolado PHO19 (patogecircnico de soja) foi classificado como Phomopsis sojae
formou um clado com um endoacutefito natildeo identificado (P3) e com um isolado da espeacutecie P
sojae (FIGURA 19) O isolado Phomopsis sp P3 foi obtido como endoacutefito de Tectona
grandis por Murali Surynarayanan e Geeta (2006)
A113
DQ1236151| Phomopsis sp CBMAI
ESIA1
AY6229931| Phomopsis chimonanthi
A131
A133
P michae liae
A124
A334
ESGA1
DQ1165521| Diaporthe conorum cbs 199-3990
98
62252719
0005
88
Os isolados MU0123 SM9713 e P longicolla (PHO1) apresentaram alta
homologia das sequumlecircncias (clado suportado com 99 de bootstrap) (FIGURA 19) Os
isolados SM9713 e P longicolla (PHO1) apresentaram 893 de similaridade geneacutetica
(com suporte de bootstrap de 100) utilizando-se marcadores RAPD (FIGURA 17) Na
anaacutelise morfoloacutegica os isolados MU0123 e SM9713 apresentaram mais de 70 de
similaridade poreacutem o isolado P longicolla (PHO1) apresentou caracteriacutesticas
morfoloacutegicas diferentes dos isolados MU0123 e SM9713 (FIGURA 11) O isolado PHO1
foi isolado como patoacutegeno de soja (Glycine max (L) Merr) no Mato Grosso enquanto os
isolados MU0123 e SM9713 foram obtidos como endofiacuteticos de Aroeira (Myracrodruon
urundeuva) e Cajaacute (Spondias mombin) respectivamente ambos no estado do Paraacute Em
funccedilatildeo das similaridades geneacuteticas observadas e por ser o isolado PHO1 utilizado
como referecircncia de P longicolla os isolados endofiacuteticos MU0123 e SM9713 foram
identificados como pertencentes a esta espeacutecie A alta similaridade geneacutetica destes
isolados sugere que pertenccedilam agrave mesma espeacutecie o que reforccedila as observaccedilotildees
anteriores de que a definiccedilatildeo de espeacutecie do gecircnero Phomopsis natildeo eacute possiacutevel
utilizando-se apenas caracteriacutesticas morfoloacutegicas O fato de isolados endofiacuteticos de S
mombin e M urundeuva serem identificados como P longicolla demonstra que
espeacutecies patogecircnicas para um hospedeiro podem colonizar de forma assintomaacutetica
diferentes espeacutecies vegetais Isso jaacute foi observado para outros gecircneros como
Guignardia e Phyllosticta (BAAYEN et al 2002 GLIENKE-BLANCO et al 2002)
Os endoacutefitos ESBA1 e ES2AB1 foram reunidos no mesmo clado sendo
denominados de Phomopsis sp S6 (FIGURA 19) esses isolados fazem parte do
mesmo agrupamento utilizando-se marcadores RAPD (FIGURA 17)
Os isolados A323 e A334 apresentaram grande identidade geneacutetica (suportado
com bootstrap de 70) e seu agrupamento estaacute representado na figura 19 Esses
isolados natildeo apresentaram identidade moderada a nenhuma das sequumlecircncias
depositadas no GenBank e portanto natildeo foi possiacutevel inferir sobre a espeacutecie desses
endoacutefitos Sugere-se que esses isolados de Aroeira pertenccedilam agrave mesma espeacutecie e
portanto foram denominados de Phomopsis sp S8 Os isolados ES2KF1 ES2WF1 e
89
ESPAC22 endoacutefitos de Espinheira Santa foram reunidos num mesmo clado sendo
denominados de Phomopsis sp S4 (FIGURA 19)
Os isolados A126 e ESJH1 foram reunidos no mesmo clado sendo denominados
de Phomopsis sp S11 eles foram isolados de diferentes plantas hospedeiras O
isolado ESJH1 foi obtido de Espinheira Santa (Maytenus ilicifolia) enquanto o isolado
A126 foi obtido de Aroeira Vermelha (Schinus terebinthifolius) Estes resultados
reforccedilam a dificuldade em inferir espeacutecies do gecircnero Phomopsis com base na planta
hospedeira
Os isolados A116 A124 A123 ESGA1 ESJD1 ESDF1 e ESGF1 natildeo
apresentaram identidade com nenhuma sequumlecircncia depositada no GenBank nem
similaridade com outros isolados analisados no presente trabalho Sugere-se que esses
endoacutefitos pertenccedilam a diferentes espeacutecies
No uacuteltimo clado o isolado ESFH1 apresentou homologia com a regiatildeo ITS1-
rDNA 58S - ITS2 da espeacutecie P theicola (DQ286286 e DQ286287) e com o isolado
SM9638 (FIGURA 19) Estes dois isolados foram obtidos de diferentes plantas
hospedeiras O isolado ESFH1 foi obtido em 2006 de M ilicifolia no Paranaacute enquanto o
isolado SM9638 foi obtido em 1996 como endofiacutetico da planta Spondias mombin no
Estado do Paraacute Esses isolados apresentam baixa similaridade morfoloacutegica (FIGURAS
11 e 12) Estes resultados reforccedilam a dificuldade em inferir espeacutecies do gecircnero
Phomopsis especialmente utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas
No presente trabalho observou-se que vaacuterias espeacutecies de Phomopsis foram
isoladas de um mesmo hospedeiro assim como uma mesma espeacutecie foi encontrada
colonizando diferentes hospedeiros Isto jaacute foi relatado no gecircnero Phomopsis por
Brayford (1990) Farr Castlebury e Rossman (2002) e por Rehner e Uecker (1994)
Esses resultados reforccedilam a necessidade de revisatildeo do conceito de espeacutecie para o
gecircnero Phomopsis uma vez que muitas espeacutecies tecircm sido identificadas com base na
planta hospedeira (GAMBOA-GAITAacuteN LAUREANO e BAYMAN 2005 MURALI
SURYANARAYANAN GEETA 2006)
Os dados morfoloacutegicos e de RAPD foram altamente variaacuteveis e a anaacutelise das
sequumlecircncias da regiatildeo ITS1- 58S - ITS2 do rDNA foi informativa para alguns dos
90
isolados analisados Entretanto mais estudos satildeo necessaacuterios para a identificaccedilatildeo
precisa dessas espeacutecies A literatura eacute escassa quanto a trabalhos de taxonomia
morfologia biologia e ecologia de isolados endofiacuteticos do gecircnero Phomopsis Segundo
Phillips (2006) a identificaccedilatildeo das espeacutecies do gecircnero Phomopsis eacute difiacutecil porque as
espeacutecies natildeo estatildeo claramente definidas e existe uma sobreposiccedilatildeo entre os caracteres
morfoloacutegicos que as definem
A maioria das sequumlecircncias depositadas no GenBank satildeo de isolados
provenientes de lesotildees sendo portanto de espeacutecies patogecircnicas No presente trabalho
eacute possiacutevel que os isolados pertencentes a clados que natildeo se agruparam com nenhuma
sequumlecircncia jaacute depositada pertenccedilam a novas espeacutecies ou ainda a espeacutecies de
endoacutefitos ainda natildeo sequumlenciados Murali Surynarayanan e Geeta (2006)
caracterizaram por meio de sequumlenciamento da regiatildeo ITS e dados morfoloacutegicos 11
isolados endofiacuteticos de Phomopsis obtidos de Tectona grandis e Cassia fistula Eles
sugerem que apesar da grande variabilidade encontrada os isolados devem ser
reunidos em apenas dois grupos entretanto natildeo foi possiacutevel a identificaccedilatildeo em niacutevel
de espeacutecie Segundo os autores isto natildeo foi possiacutevel em funccedilatildeo dos fungos deste
gecircnero natildeo terem hospedeiros especiacuteficos e pela necessidade de revisatildeo do conceito
de espeacutecie em Phomopsis
Farr Castlebury e Rossman (2002) caracterizaram por anaacutelise de sequumlecircncias
ITS1 58S ITS2 e por caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de Phomopsis sp
isolados de Vaccinium corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse estudo
verificaram que a maioria dos isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma vez que
as sequumlecircncias agruparam-se com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
Castlebury e Mengistu (2006) avaliaram Phomopsis isolados de soja e outros
hospedeiros combinando dados de sequumlecircncias de ITS do rDNA do gene do fator1 alfa
de elongaccedilatildeo da traduccedilatildeo (ef-1) e genes de actina Foram formados seis grupos de
Phomopsis sendo que trecircs correspondem aos taacutexons P longicolla Diaporthe melonis e
D phaseolorum Os autores concluiacuteram que a ausecircncia de distinccedilatildeo morfoloacutegica e
informaccedilatildeo bioloacutegica tornam problemaacutetica a identificaccedilatildeo de espeacutecies deste gecircnero
91
No presente trabalho com base nos dados de RAPD (FIGURAS 17 e 18) pode-
se sugerir a existecircncia de pelo menos 10 espeacutecies de Phomopsis colonizando de forma
endofiacutetica as plantas de Maytenus ilicifolia analisadas Tais plantas satildeo provenientes de
um uacutenico pomar localizado no CNPFEMPRAPA em ColomboPR Ainda eacute possiacutevel
sugerir a existecircncia de pelo menos seis espeacutecies de Phomopsis colonizando de forma
endofiacutetica a planta de S terebinthifolius analisada neste trabalho Esta planta natildeo
recebeu qualquer tratamento com fungicidas ou outro agrotoacutexico uma vez que se
encontra isolada entre dois blocos do Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas da UFPR (ANEXO
13) Talvez isso justifique a grande diversidade de isolados encontrada Esses dados
demonstram a importacircncia de estudos da comunidade endofiacutetica em plantas medicinais
e apontam para o problema da reduccedilatildeo de diversidade de microrganismos endofiacuteticos
pelo uso continuado de fungicidas
Resultados semelhantes foram obtidos por Gamboa-Gaitaacuten Laureano e Bayman
(2005) estudando isolados de Phomopsis endofiacuteticos da planta medicinal Guarea
guidonia (Meliaceae) Os autores relataram elevados niacuteveis de variabilidade geneacutetica
avaliada pela digestatildeo da regiatildeo ITS e tambeacutem a alta variabilidade morfoloacutegica entre
os isolados avaliados A aacutervore molecular agrupou indiviacuteduos fenotipicamente
diferentes Por outro lado Fernandez e Hanlin (1996) obtiveram resultados
concordantes entre a anaacutelise molecular por RAPD e as caracteriacutesticas morfoculturais
separando os isolados coletados de soja em dois grupos Diaporthe phaseolorum e
Phomopsis longicolla
Pioli et al (2003) caracterizaram por RAPD isolados do complexo
DiaporthePhomopsis coletados de soja na Argentina Eles foram separados em quatro
grupos (i) Diaporthe phaseolorum variedade meridionalis (ii) D phaseolorum variedade
caulivora (iii) D phaseolorum variedade sojae and (iv) Phomopsis longicolla revelando
a existecircncia de variabilidade entre isolados da mesma variedade
92
54 Avaliaccedilatildeo da atividade antimicrobiana 541 Cultura pareada
Os isolados de Phomopsis foram avaliados pela teacutecnica de cultura pareada
contra as linhagens PC1396 e PC3305 do fitopatoacutegeno G citricarpa As interaccedilotildees
foram classificadas em trecircs tipos 1) Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno com
sobreposiccedilatildeo de hifas 2) Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno sem sobreposiccedilatildeo
de hifas e 3) Ausecircncia de inibiccedilatildeo de crescimento Os resultados obtidos estatildeo
apresentados nas Tabelas 9 e 10
Todos os isolados de Phomopsis inibiram significativamente o crescimento das
duas linhagens de Guignardia exceto o isolado ES2WC1 (Phomopsis sp) que
apresentou interaccedilatildeo do tipo 3 em que natildeo houve inibiccedilatildeo significativa do fitopatoacutegeno
apenas 287 e 828 contra PC1396 e PC3305 respectivamente (ANEXO 6 7 8 e
9) Foi observado que as duas linhagens de G citricarpa apresentaram o mesmo tipo
de interaccedilatildeo frente ao mesmo isolado de Phomopsis ou seja natildeo houve variaccedilatildeo
quanto a linhagem do fitopatoacutegeno avaliado Tal observaccedilatildeo reforccedila a importacircncia dos
resultados aqui apresentados
Dos 49 isolados de Phomopsis endoacutefitos de plantas medicinais avaliados 38
inibiram o crescimento das duas linhagens do fitopatoacutegeno G citricarpa com
porcentagem de inibiccedilatildeo superior a 50 Os isolados A333B (Phomopsis sp) ESGF1
(Phomopsis sp S3) SM9638 (P theicola) AT9810 (Phomopsis sp) AT9906
(Phomopsis sp) e ES2WC1 (Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo inferiores
a 50 contra PC1396 e PC3305 os isolados ES80J (Phomopsis sp) e AT9811
(Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo inferiores a 50 apenas contra a
linhagem PC1396 enquanto contra a PC3305 a inibiccedilatildeo foi de 5132 e 5397
respectivamente Por outro lado os isolados de Phomopsis ESFF1 (Phomopsis sp)
SM9714 (Phomopsis sp) e A132 (Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo
inferiores a 50 apenas contra a linhagem PC3305 enquanto contra PC1396 a
inibiccedilatildeo foi de 5017 6215 e 5492 respectivamente
93
A anaacutelise estatiacutestica demonstrou que haacute diferenccedila significativa entre o controle e
os isolados avaliados O fungicida Derosal apresentou inibiccedilatildeo do crescimento do
fitopatoacutegeno em aproximadamente 19 todos os isolados de Phomopsis que
apresentaram inibiccedilatildeo superior ao fungicida com significacircncia no teste estatiacutestico exceto
o isolado ES2WC1 (Phomopsis sp) como citado anteriormente (TABELA 8 e 9 ANEXO
6 7 8 e 9)
As interaccedilotildees do tipo 1 nas quais ocorre agrave sobreposiccedilatildeo de hifas do endoacutefito
sobre o fitopatoacutegeno sugere a ocorrecircncia de parasitismo Esse tipo de interaccedilatildeo entre
os isolados de Phomopsis e as linhagens de G citricarpa ocorreu em 47 dos isolados
Tais isolados apresentam diferenccedila significativa entre o controle destacando-se os
isolados ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) (FIGURA 21) ESJD1
(Phomopsis sp S12) e ESJH1 (Phomopsis sp S11) que inibiram o crescimento de G
citricarpa PC1396 em 7338 6885 6826 e 6792 respectivamente A anaacutelise
estatiacutestica demonstra que haacute diferenccedila significativa entre o controle e estes isolados
poreacutem natildeo haacute diferenccedila significativa entre os mesmos (ANEXO 6 7 e 8)
As interaccedilotildees do tipo 2 nas quais natildeo ocorre sobreposiccedilatildeo de hifas ocorreram
em 51 dos isolados destacando-se os isolados ESSD1 (Phomopsis sp) e SM9713
(P longicolla) que inibiram o crescimento da linhagem PC1396 de G citricarpa em
7324 e 6763 respectivamente A anaacutelise estatiacutestica demonstra que haacute diferenccedila
significativa entre o controle e os isolados ESSD1 (Phomopsis sp) e SM9713 (P
longicolla) os isolados de Phomopsis tambeacutem diferem entre si (TABELA 8) Essas
interaccedilotildees devem ser avaliadas posteriormente em microscopia oacutetica para confirmar se
estaacute ocorrendo parasitismo
FIGURA 21 INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa PC1396 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA
Phomopsis A134
G Citricarpa PC1396
Phomopsis SM9713
G Citricarpa PC1396
G Citricarpa PC1396 Controle
G Citricarpa PC1396
Fungicida Derosal
FONTE O autor
94
Isolados Identificaccedilatildeo Tipo de Interaccedilatildeo Inibiccedilatildeo () Fungicida 19
ESDF1 Phomopsis sp S7 1 7338 ESSD1 Phomopsis sp 2 7324 A134 Phomopsis sp 1 6885
ESJD1 Phomopsis sp S12 1 6826 ESJH1 Phomopsis sp S11 1 6792 SM9713 P longicolla 2 6763 ESIE1 Phomopsis sp 1 6758 ESFB2 Phomopsis sp 1 6724
MU0123 P longicolla 2 6663 ESRD1 Phomopsis sp S1 2 6655 ESJG1 Phomopsis sp 2 6621 ESJE1 Phomopsis sp S1 1 6621
ESPAC22 Phomopsis sp S4 1 6516 A131 P michaeliae 2 6393 A126 Phomopsis sp S11 1 6352 A123 Phomopsis sp S2 1 6270 A113 P michaeliae 1 6270
SM9631 Phomopsis sp 1 6265 ES2AB1 Phomopsis sp S6 1 6246 ESJE2 Phomopsis sp S1 1 6246 A323 Phomopsis sp S8 1 6230
SM9714 Phomopsis sp 1 6215 ES2NA1 Phomopsis sp 1 6212
A334 Phomopsis sp S8 1 6189 ESBA1 Phomopsis sp S6 2 6177 A321 P michaeliae 1 6148
ESKD1 Phomopsis sp S1 1 6109 A216B Phomopsis sp 2 6025
ES2KF1 Phomopsis sp S4 2 5939 ESIA1 P michaeliae 2 5904 A135 Phomopsis sp 2 5902 A124 Phomopsis sp S9 2 5861
A115B Phomopsis sp 1 5861 A116 Phomopsis sp S5 2 5820
A215A Phomopsis sp 1 5656 A132 Phomopsis sp 2 5492
ESFH1 P theicola 2 5427 A333A Phomopsis sp 1 5369 ESGA1 Phomopsis sp S10 2 5324
ES2WF1 Phomopsis sp S4 2 5205 ESFF1 Phomopsis sp 2 5017 AT9811 Phomopsis sp 1 4920 ESGF1 Phomopsis sp S3 2 4642 SM9638 P theicola 1 4522 A333B Phomopsis sp 1 4426 ES80J Phomopsis sp 2 4344 AT9810 Phomopsis sp 2 4173 AT9906 Phomopsis sp 2 3078 ES2WC1 Phomopsis sp 3 287
FONTE O autor
TABELA 8 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC1396
95
A interaccedilatildeo do tipo 1 entre os isolados de Phomopsis e a linhagem PC3305 de
G citricarpa ocorreu em 47 dos isolados a reduccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno
apresentou diferenccedila significativa quando comparados com o controle destacando-se
os isolados A215A (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ESDF1 (Phomopsis sp
S7) ESJD1 (Phomopsis sp S12) A123 (Phomopsis sp S2) que inibiram o crescimento
da linhagem PC3305 de G citricarpa em 7947 7616 7152 7119 e 7119
respectivamente (TABELA 9 FIGURA 22) A anaacutelise estatiacutestica demonstra que haacute
diferenccedila significativa entre o controle e os isolados A215A (Phomopsis sp) A115B
(Phomopsis sp) ESDF1 (Phomopsis sp S7) ESJD1 (Phomopsis sp S12) A123
(Phomopsis sp S2) A215A A115B ESDF1 ESJD1 A123 mas os isolados de
Phomopsis natildeo diferem entre si (ANEXO 9)
Os isolados ESRD1 (Phomopsis sp S1) e A135 (Phomopsis sp) apresentaram
as maiores taxas de inibiccedilatildeo do crescimento da linhagem PC3305 de G citricarpa pela
interaccedilatildeo do tipo 2 6887 e 6623 respectivamente (TABELA 9) A anaacutelise estatiacutestica
demonstra que haacute diferenccedila significativa entre o controle e os isolados ESRD1
(Phomopsis sp S1) e A135 (Phomopsis sp) esses isolados de Phomopsis diferem
entre si (ANEXO 9) Essas interaccedilotildees devem ser avaliadas posteriormente ao
microscoacutepio para confirmar se estaacute ocorrendo parasitismo
O isolado SM9713 (P longicolla) inibiu o crescimento do patoacutegeno G citricarpa e
produziu esporos em volta da colocircnia Segundo Boosalis (1964) a esporulaccedilatildeo pode
ocorrer quando determinados hospedeiros estimulam a reproduccedilatildeo de seus parasitas
Resultados semelhantes foram encontrados por Martins-Corder e Melo (1998) onde
observaram que a maioria dos isolados de Trichoderma spp antagonistas colonizou e
produziu esporos em abundacircncia sobre as colocircnias de Verticillium dahliae
As interaccedilotildees do tipo 2 mostram inibiccedilatildeo mutua na qual o endoacutefito natildeo sobrepotildee
a colocircnia do fitopatoacutegeno apesar de inibir seu crescimento Segundo Bell et al (1982)
os antagonistas selecionados pelo confronto direto satildeo aqueles que apresentam
crescimento sobre o fitopatoacutegeno Poreacutem a relaccedilatildeo entre o tipo de interaccedilatildeo e a
porcentagem de inibiccedilatildeo observada nos resultados natildeo satildeo congruentes uma vez que
96
a porcentagem de inibiccedilatildeo para alguns isolados com interaccedilatildeo do Tipo 2 eacute maior do que
para aqueles com interaccedilatildeo do Tipo 1
Isolados Identificaccedilatildeo Tipo de Interaccedilatildeo
Inibiccedilatildeo ()
Fungicida 1921 A215A Phomopsis sp 1 7947 A115B Phomopsis sp 1 7616 ESDF1 Phomopsis sp S7 1 7152 ESJD1 Phomopsis sp S12 1 7119 A123 Phomopsis sp S2 1 7119
ESFB2 Phomopsis sp 1 7086 ESJE2 Phomopsis sp S1 1 7020 ESJH1 Phomopsis sp S11 1 7020
SM9631 Phomopsis sp 1 6921 ESRD1 Phomopsis sp S1 2 6887 A135 Phomopsis sp 2 6623 A126 Phomopsis sp S11 1 6490
ESPAC22 Phomopsis sp S4 1 6424 A131 P michaeliae 2 6424
ESJE1 Phomopsis sp 1 6358 ES2KF1 Phomopsis sp S4 2 6298
A334 Phomopsis sp S8 1 6291 A124 Phomopsis sp S9 2 6258 ESIA1 P michaeliae 2 6126 ESKD1 Phomopsis sp S1 1 5993 ESSD1 Phomopsis sp L5 2 5960 A134 Phomopsis sp 1 5861 A113 P michaeliae 1 5795
TABELA 9 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 (CONTINUA)
FIGURA 22 INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa 3305 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA
G citricarpa PC3305
Phomopsis ESRD1
Phomopsis ESDF1
G citricarpa PC3305
G citricarpa PC3305 controle
Fungicida Derosal
G citricarpa PC3305
FONTE O autor
97
A333A Phomopsis sp 1 5728 ESIE1 Phomopsis sp 1 5695 ESJG1 Phomopsis sp 2 5662 A323 Phomopsis sp S8 1 5629
ES2AB1 Phomopsis sp S6 1 5596 ESBA1 Phomopsis sp S6 2 5563 A116 Phomopsis sp S5 2 5464
AT9811 Phomopsis sp 1 5397 A216B Phomopsis sp 2 5364 A321 P michaeliae 1 5331
SM9713 P longicolla 2 5298 ES2NA1 Phomopsis sp 1 5265 MU0123 P longicolla 2 5232 ESFH1 Phomopsis sp 2 5132 ES80J Phomopsis sp 2 5132 ESGA1 Phomopsis sp S10 2 5079
ES2WF1 Phomopsis sp S4 2 5033 ESFF1 P theicola 2 4934
SM9714 Phomopsis sp 1 4735 A132 Phomopsis sp 2 4470
A333B Phomopsis sp 1 3775 ESGF1 Phomopsis sp S3 2 3344 SM9638 P theicola 1 2781 AT9810 Phomopsis sp 2 2649 AT9906 Phomopsis sp 2 2583 ES2WC1 Phomopsis sp 3 828
FONTE O autor 542 Teste para detecccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
No teste de metaboacutelitos volaacuteteis observou-se reduccedilatildeo do crescimento da
linhagem PC1396 e PC3305 de G citricarpa apoacutes a retirada do celofane onde
inicialmente foram inoculados os isolados de Phomopsis Todos os isolados testados
inibiram significativamente o crescimento das duas linhagens de G citricarpa Os
isolados A115B (Phomopsis sp) A134 (Phomopsis sp) ESFF1 (Phomopsis sp)
ESFH1 (Phomopsis theicola) A123 (Phomopsis sp S2) e S2WF1 (Phomopsis sp S4)
apresentaram maior inibiccedilatildeo do crescimento das duas linhagens do fitopatoacutegeno
(ANEXO 10 e 11 e FIGURA 23) sugerindo que a interaccedilatildeo entre os isolados de
Phomopsis e o fitopatoacutegeno ocorre devido agrave produccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
TABELA 9 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 (CONTINUACcedilAtildeO)
98
FONTE O autor FIGURA 23 AVALIACcedilAtildeO DO CRESCIMENTO DAS COLOcircNIAS DO FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 e PC3305 INOCULADAS APOacuteS RETIRADA DO PAPEL CELOFANE PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS EM MEIO BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
Nota a Placa com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC3305 inoculado apoacutes retirada do celofane onde previamente foi inoculado o isolado ESFH1 b Placa controle com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC3305 c Placa com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396 inoculado apoacutes retirada do celofane onde previamente foi inoculado o isolado ESFH1 d Placa controle com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396
FIGUEIREDO (2006) utilizou a teacutecnica de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis em
Pestalotiopsis isolados endofiacuteticos de Maytenus ilicifolia e observou uma reduccedilatildeo do
crescimento da linhagem PC1396 de G citricarpa demonstrando que a interaccedilatildeo
ocorre principalmente pela produccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
Os resultados apresentados aqui demonstram o grande potencial que tais
linhagens endofiacuteticas de Phomopsis possuem como agentes de controle da Mancha
Preta dos Citros e o seu potencial na produccedilatildeo de metaboacutelitos
543 Avaliaccedilatildeo da accedilatildeo dos Extratos
Na avaliaccedilatildeo dos extratos quanto agrave inibiccedilatildeo do crescimento das linhagens
PC1396 e PC3305 de G citricarpa os resultados indicam que a maioria dos extratos
metanoacutelicos produzidos a partir dos isolados de Phomopsis reduziram o crescimento
micelial de ambas as linhagens do fitopatoacutegeno da MPC A inibiccedilatildeo ocorreu devido aos
metaboacutelitos secundaacuterios produzidos pelos isolados endofiacuteticos quando comparados
com o crescimento micelial dos controles com metanol (onde o extrato foi diluiacutedo) e
com aacutegua destilada (FIGURA 24 25 e TABELA 10)
a b c d
99
Foi observado que os isolados de Phomopsis que apresentaram as maiores
porcentagens de inibiccedilatildeo pela teacutecnica de cultura pareada tambeacutem inibiram o
crescimento quando foi utilizado o extrato metanoacutelico Entretanto o isolado ES2WC1
(Phomopsis sp) que natildeo inibiu o crescimento pela teacutecnica de cultura pareada
apresentou reduccedilatildeo no crescimento micelial dos dois fitopatoacutegenos avaliados
utilizando-se o seu extrato metanoacutelico Provavelmente essa falta de inibiccedilatildeo pela
teacutecnica de cultura pareada tenha ocorrido pelo fato do isolado ES2WC1 (Phomopsis
sp) apresentar crescimento lento fazendo com que o crescimento do fitopatoacutegeno natildeo
diferisse significativamente do controle
Os isolados ES80J (Phomopsis sp) ESFF1 (Phomopsis sp) A132 (Phomopsis
sp) A333B (Phomopsis sp) e SM9638 (P theicola) natildeo inibiram o crescimento micelial
de nenhum dos fitopatoacutegenos avaliados Para alguns isolados de Phomopsis natildeo foi
possiacutevel determinar o potencial antimicrobiano dos extratos metanoacutelicos pois houve
grande variaccedilatildeo de accedilatildeo entre as repeticcedilotildees do experimento
FONTE O autor
C
D E F
A B
NOTA A Placa controle com aacutegua destilada autoclavada B Placa controle com metanolC Placa controle com fungicida Derosal reg (10 mgmL) D Placa com extrato metanoacutelicodo isolado ES2WC1 E Placa com extrato metanoacutelico do isolado A215A F Placa comextrato metanoacutelico do isolado ESDF1
FIGURA 24 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NOCRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC3305 DE G citricarpa EMMEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
100
Rodrigues-Heerklotz et al (2001) elucidaram a estrutura quiacutemica e a siacutentese
assimeacutetrica de um novo metaboacutelito o aacutecido guignardico produzido pelo fungo endofiacutetico
Guignardia sp isolado de Spondias mombin Silva et al (2005) isolaram dois
metaboacutelitos de Phomopsis cassiae endofiacutetico de Cassia specatabilis 24-diidroxi-56-
dimetil benzoato de etila e phomopsilactona que exibiram forte atividade antifuacutengica
contra fitopatoacutegenos bem como citotoxicidade contra a linhagem celular de tumor
cervical humano (HeLa) Estudos adicionais devem ser realizados para determinar a
estrutura quiacutemica produzida pelos endoacutefitos de Phomopsis estudados
NOTA A Placa controle com aacutegua destilada autoclavada B Placa controle commetanol C Placa controle com fungicida Derosal reg (10 mgmL)D Placa com extratometanoacutelico do isolado ES2WC1 E Placa com extrato metanoacutelico do isolado ESGA1 FPlaca com extrato metanoacutelico do isolado ESSD1
FONTE O autor FIGURA 25 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NOCRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 DE G citricarpa EMMEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
C
D E F
A B
101
Os resultados da tabela 10 revelam que os isolados endofiacuteticos de Phomopsis
spp avaliados satildeo bastante promissores demonstrando um potencial na produccedilatildeo de
metaboacutelitos Resultados semelhantes foram obtidos por Moller Weber e Dreyfuss
(1996) que avaliaram a accedilatildeo de endoacutefitos de plantas tropicais com alta produccedilatildeo de
metaboacutelitos secundaacuterios
Identificaccedilatildeo Isolados Inibiccedilatildeo PC3305 Cultura Pareada
Inibiccedilatildeo PC3305 Extrato
Metanoacutelico
Inibiccedilatildeo () PC1396 Cultura Pareada
Inibiccedilatildeo PC1396 Extrato
Metanoacutelico Derosal Fungicida 1921 I 19 I
P longicolla SM9713 5298 I 6763 I P longicolla MU0123 5232 ND 6663 I P michaeliae A131 6424 I 6393 I P michaeliae ESIA1 6126 I 5904 I Phomopsis sp A333A 5728 I 5369 I P michaeliae A321 5331 I 6148 I P michaeliae A113 5795 ND 627 ND Phomopsis sp S2 A123 7119 ND 627 ND P theicola ESFH1 5132 I 5427 I Phomopsis sp ESFF1 4934 NI 5017 NI P theicola SM9638 2781 NI 4522 NI Phomopsis sp S4 ES2WF1 5033 I 5205 I Phomopsis sp S3 ESGF1 3344 I 4642 I Phomopsis sp S10 ESGA1 5079 I 5324 I Phomopsis sp S1 ESRD1 6887 I 6655 I Phomopsis sp S8 A334 6291 I 6189 I Phomopsis sp S9 A124 6258 I 5861 I Phomopsis sp S7 ESDF1 7152 I 7338 I Phomopsis sp ESSD1 596 I 7324 I Phomopsis sp S6 ES2AB1 5596 I 6246 I Phomopsis sp S6 ESBA1 5563 I 6177 I Phomopsis sp S11 A126 649 ND 6352 ND Phomopsis sp S12 ESJD1 7119 I 6826 I Phomopsis sp S1 ESJE1 6358 I 6621 I Phomopsis sp S1 ESJE2 702 ND 6246 ND Phomopsis sp S1 ESKD1 5993 ND 6109 ND Phomopsis sp A115B 7616 I 5861 I Phomopsis sp ESFB2 7086 I 6724 I Phomopsis sp S11 ESJH1 702 I 6792 I Phomopsis sp A135 6623 I 5902 ND Phomopsis sp A134 5861 I 6885 I Phomopsis sp ESIE1 5695 I 6758 I Phomopsis sp ESJG1 5662 ND 6621 I
TABELA 10 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO CRESCIMENTO MICELIAL DASCOLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTOA 28ordmC (CONTINUA)
102
Phomopsis sp AT9811 5397 I 492 I Phomopsis sp A216B 5364 I 6025 I Phomopsis sp ES2NA1 5265 I 6212 I Phomopsis sp SM9714 4735 I 6215 I Phomopsis sp ES2WC1 828 I 287 I Phomopsis sp SM9631 6921 ND 6265 ND Phomopsis sp S4 ESPAC22 6424 ND 6516 ND Phomopsis sp S4 ES2KF1 6298 ND 5939 ND Phomopsis sp S8 A323 5629 ND 623 ND Phomopsis sp S5 A116 5464 ND 582 ND Phomopsis sp AT9810 2649 ND 4173 ND Phomopsis sp AT9906 2583 ND 3078 ND Phomopsis sp ES80J 5132 NI 4344 NI Phomopsis sp A132 447 NI 5492 NI Phomopsis sp A333B 3775 NI 4426 NI Phomopsis sp A215A 7947 I 5656 I
FONTE O autor
NOTA I- Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno NI- Natildeo ocorreu inibiccedilatildeo do fitopatoacutegeno ND- Natildeo foi determinado a inibiccedilatildeo
No Brasil as plantas Spondias mombin e A tomentosum tecircm sido usadas na
medicina devido as suas propriedades antimicrobianas (AJAO SHONUKAN e FEMI
1984) Os isolados de Phomopsis obtidos como endoacutefitos de S mombin (SM9713 (P
longicolla) SM9638 (P theicola) e SM9714 (Phomopsis sp)) e A tomentosum (AT9810
(Phomopsis sp) AT9811 (Phomopsis sp) e AT9906 (Phomopsis sp)) avaliados no
presente trabalho jaacute haviam sido relatados por Corrado e Rodrigues (2004) como
produtores de compostos bioativos Os autores relatam que os extratos metanoacutelicos
inibiram o crescimento de E coli S aureus P aeruginosa C albicans A niger e F
oxysporum No presente trabalho os isolados de S mombin e A tomentosum inibiram
o crescimento de Guignardia citricarpa confirmando o potencial desses isolados em
produzir substacircncias bioativas mais estudos devem ser realizados para verificar o
potencial antimicrobiano desses extratos contra bacteacuterias patogecircnicas e
fitopatogecircnicas
A planta Schinus terebinthifolius eacute usada no Brasil na medicina alternativa contra
doenccedilas da coacuternea (CORREcircA 1926) doenccedilas reumaacuteticas uacutelceras feridas tumores
linfaacuteticos erisipela e outras moleacutestias provocadas por bacteacuterias que se manifestam em
forma de edema ou eritema (BALBACH 1992) As linhagens de Phomopsis isoladas de
S terebinthifolius avaliadas nesse trabalho A135 (Phomopsis sp) A113 (P michaelae)
TABELA 10 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO CRESCIMENTO MICELIAL DASCOLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DECRESCIMENTO A 28ordmC (CONTINUACcedilAtildeO)
103
A115B (Phomopsis sp) A323 (Phomopsis sp S8) A132 (Phomopsis sp) A134
(Phomopsis sp) A333B (Phomopsis sp) A321 (P michaelae) A126 (Phomopsis sp
S11) A216B (Phomopsis sp) A334 (Phomopsis sp S8) A116 (Phomopsis sp S5)
A215A (Phomopsis sp) A124 (Phomopsis sp S9) A333A (Phomopsis sp) A131 (P
michaeliae) e A123 (Phomopsis sp S2) apresentaram excelentes resultados contra G
citricarpa
Extratos da planta M ilicifolia jaacute foram descritos na literatura apresentando
atividade antitumoral tambeacutem usado como analgeacutesico antinflamatoacuterio e antiaacutecido
(JORGE 2004 DUARTE 2005) Pileggi (2006) isolou microrganismos endofiacuteticos de
plantas de Maytenus ilicifolia do mesmo pomar investigado neste trabalho e avaliou o
potencial farmacoloacutegico dos mesmos Entre os fungos e bacteacuterias testados 15
apresentaram potencial para controle bioloacutegico
Figueiredo (2006) isolou fungos endofiacuteticos de plantas de M ilicifolia do mesmo
pomar investigado neste trabalho especialmente Pestalotiopsis spp e os avaliou quanto
ao potencial antimicrobiano contra bacteacuterias patogecircnicas em humanos e o fitopatoacutegeno
G citricarpa Os extratos metanoacutelicos de dois isolados exibiram accedilatildeo fungistaacutetica na
germinaccedilatildeo e no crescimento micelial das linhagens PC1396 e PC3305 de G
citricarpa Aleacutem disso dois extratos de Pestalotiopsis spp inibiram o crescimento dos
microrganismos-teste (S aureus oxalino resistente Klebsiella pneumoniae
Micrococcus luteus Staphylococcus aureus e Escherichia coli)
No presente trabalho observou-se que as linhagens de Phomopsis spp isolados
de M ilicifolia apresentaram excelentes resultados in vitro contra G citricarpa Pouco se
conhece a respeito da comunidade endofiacutetica existente nessas plantas e os resultados
desse trabalho demostram que abrigam uma grande variabilidade de PC1396 e
PC3305 espeacutecies de Phomopsis com portencial para bioprospecccedilatildeo Isto reforccedila a
importacircncia de estudos de microrganismos endofiacuteticos em plantas medicinais em
especial M ilicifolia e S terebinthifolius Faz-se necessaacuterio tambeacutem o estudo da
composiccedilatildeo quiacutemica dos extratos avaliados
104
6 CONCLUSOtildeES Os resultados obtidos no presente trabalho permitiram as seguintes conclusotildees
bull As espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo podem ser identificadas
apenas por caracteriacutesticas morfoloacutegicas ou marcadores moleculares
RAPD sendo necessaacuteria uma anaacutelise polifaacutesica incluindo
sequumlenciamento de vaacuterias regiotildees do genoma
bull As plantas medicinais analisadas satildeo colonizadas por grande
diversidade de espeacutecies de Phomopsis com grande variabilidade
morfoloacutegica e geneacutetica intra e interespeciacuteficas
bull As plantas de Maytenus ilicifolia analisadas satildeo colonizadas
endofiticamente por pelo menos 10 espeacutecies de Phomopsis sendo
possiacutevel identificar por sequumlecircncias ITS do rDNA isolados de P theicola e
P michaeliae
bull A planta de Schinus terebinthifolius analisada eacute colonizada
endofiticamente por pelo menos 6 espeacutecies de Phomopsis sendo
possiacutevel identificar por sequumlecircncias ITS do rDNA isolados de P
michaeliae
bull As espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo satildeo hospedeiro-especiacuteficas
sendo necessaacuteria a redefiniccedilatildeo do conceito de espeacutecie para este gecircnero
bull Os isolados de Phomopsis spp apresentaram grande potencial no
controle in vitro do fungo G citricarpa Os isolados ESIA1 e A131 (P
michaeliae) ESJE1 ESJE2 ESKD1 e ESRD1 (Phomopsis sp S1) A123
(Phomopsis sp S2) ES2KF1 e ESPAC22 (Phomopsis sp S4) ESDF1
105
(Phomopsis sp S7) A334 (Phomopsis sp S8) A124 (Phomopsis sp
S9) A126 e ESJH1 (Phomopsis sp S11) ESJD1 (Phomopsis sp S12) e
os isolados A134 A135 A115B A215A SM9631 ESFB2 e ESSD1
(Phomopsis sp) foram os mais promissores em inibir o crescimento das
linhagens PC1396 e PC3305 de G citricarpa nas metodologias
avaliadas
106
7 REFEREcircNCIAS BIBLIOGRAacuteFICAS ALBERTS B LEWIS J RALF M ROBERTS K WATSON J D Molecular Biology of the Cell 4ordf ed New York Garland Publishing 2004 ALICE C B SIQUEIRA N C S MENTZ L A SILVA G A A B JOSEacute K F D Plantas medicinais de uso popular Atlas farmacognoacutestico Canoas Editora da ULBRA 1995 ALZATE-MARIN A L BAIacuteA G S FALEIRO F G CARVALHO G A PAULA JR T J MOREIRA M A BARROS E G Anaacutelise da diversidade geneacutetica de raccedilas de Colletotrichum lindemuthianum que ocorrem em algumas regiotildees do Brasil por marcadores RAPD Fitopatologia Brasileira v 22 p 85-88 1997 ALMEIDA A M R Efeito de luz e meios de cultura sobre crescimento micelial formaccedilatildeo e tamanho de picniacutedios e esporulaccedilatildeo de isolados de Phomopsis sojae Leh In SEMINAacuteRIO NACIONAL DE PESQUISA DE SOJA Brasiacutelia 2 1981 Londrina Anais Brasiacutelia EmbrapaSNI 1982 p 216-226 ANCHORENA-MATIENZO P Re-identificaccedilatildeo e caracterizaccedilatildeo geneacutetica de levedura IZ-987 utilizando marcadores moleculares 2002 81p Dissertaccedilatildeo (Mestrado) ndash ESALQ USP Piracicaba Satildeo Paulo 2002 ANJOS J R N CHARCHAR M J A GUIMARAtildeES D P Ocorrecircncia de Queima das Folhas Causada por Phomopsis sp Em Aroeira No Distrito Federal Fitopatologia Brasileira v 26 n 3 p 649-650 2001 ARAUacuteJO J M SILVA A C AZEVEDO J L Isolation of endophytic actinomycetes from roots and leaves of maize (Zea mays L) Brazilian Archives of Biology and Technology v 43 n 4 p 447-451 2000 ARAUacuteJO W L AZEVEDO J L LIMA A O S MARCOM J SOBRAL J L LACAVA P T Manual Isolamentos de fungos endofiacuteticos Escola Superior da Agricultura Luiz de Queiroz Universidade de Satildeo Paulo Piracicaba 2002 ARNOLD E A MEJIacuteA C L KYLLO D ROJAS E I MAYNARD Z ROBBINS N HERRE E A Fungal endophytes limit pathogen damage in a tropical tree PNAS v 100 p 15649-15654 2003 AZEVEDO J L Microrganismos Endofiacuteticos In MELO I S AZEVEDO J L Ecologia Microbiana Editora EMBRAPA Jaguariuacutena-SP p 117-137 1998 AZEVEDO J L JUacuteNIOR W M PEREIRA J O ARAUacuteJO W L Endophytic microganisms a review on insect control and recent advances on tropical plants
107
Environmental Biotechnology v 3 n1 p 40-65 2000 BAAYEN R P BONANTS P J M VERKLEY G CARROL G C VAN DER AA M WEERDT M BROUWERSHAVEN G C SCHUTTE G C MACCHERONI JR W GLIENKE-BLANCO C AZEVEDO J L Nonpathogenic Strains of the Citrus Black Spot Fungus Guignardia citricarpa Identified as a Cosmopolitan Endophyte of Woody Plants Guignardia mangiferae (Phyllosticta capitalensis) Phytopathology v 92 p 464-477 2002 BAKER R E D Studies in the pathogenicity of tropical fungi II The occurrence of latent infections in developing fruits Annals of Botany London v 2 p 919-931 1938 BAO J R LAZAROVITS G Differential colonization of tomato roots by nonpathogenic and pathogenic Fusarium oxysporum strains may influence Fusarium wilt control Phytopathology Lancaster v 91 p 449-456 2001 BELL D K WELLS H D MARKHABELL D K WELLS C R In vitro antagonism ot Trichoderma species against six fungal plant pathogens Phytopathology v 72 p 379-382 1982 BETTIOL W GHINI R Controle Bioloacutegico In Manual de Fitopatologia Bergamin FILHO A AMORIM L e KIMATI H (Eds) 3ordf ed Satildeo Paulo Ceres 1995 919p BILLS G DOMBROWSKY A PELAEZ F POLISHOOK J Recent and future discoveries of pharmacologically active metabolites from tropical fungi Tropical mycology micromycetes v 2 p 165-194 2002 BITTENCOURT J V M Variabilidade geneacutetica em populaccedilotildees naturais de Maytenus ilicifolia por meio de marcadores RAPD Curitiba 2000 58p Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Agronomia ndash Produccedilatildeo Vegetal) Universidade Federal do Paranaacute BITTENCOURT J V M Variabilidade Geneacutetica em Populaccedilotildees Naturais de Maytenus Ilicifolia por Meio de Marcadores RAPD Scientia Agraacuteria v 2 p1-2 2001 BLANCO C G Guignardia citricarpa Kiely Anaacutelise geneacutetica cariotiacutepica e interaccedilatildeo com o hospedeiro Piracicaba 1999 Tese de Doutorado- escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Universidade de Satildeo Paulo BOSSALIS M C Hyperparasitism Annual Review of Phytopathology v 2 p 363-375 1964 BRAYFORD D Vegetative incompatibility in Phomopsis from elm Mycological Research v 94 n 6 p 745-752 1990
108
BODDY L GRIFFITH G S Role of endophytes and latent invasion in the development of decay communities in sapwood of angiospermous trees Sydowia v 41 p 41-73 1989 BUSSABAN B LUMYONG S LUMYONG P McKENZIE E H HYDE K D Endophytic fun i from Amomum siamense Canadian Journal of Microbiology v 47 n 10 p 943-948 2001 CAMPAROTO M L TEIXEIRA R O MANTOVANI M S VICENTINI P Effects of Maytenus ilicifolia Mart and Bauhinia candicans Benth onion root-tip and rat bone-marrow cells Genetics and Molecular Biology v 25 n1 p 85-89 2002 CARDOSO-FILHO J L Efeito de extratos de albedo de laranja (Citrus sinesis) dos indutores de resistecircncia aacutecido salicilico acil-benzolar ndash S- metil e Saccharomyces cerevisiae no controle de Phyllosticta citricarpa (Teleomorfo Guignardia citricarpa) Piracicaba 2003 125f Dissertaccedilatildeo (Doutorado) ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo CARROLL G C CARROLL F E Studies on the incidence of coniferous needle endophytes in the Pacitfic Northwest Canadian Jornal of Botany v 56 p 3034-3043 1978 CARROLL G C The Biology of endophytism in plants with particular reference to woody perennials In FOKKEMA N J HEAVEL J Van Der (Eds) Microbiology of the Phyllosphere Cambridge Cambridge University Press 1986 p 205-222 CASTLEBURY LA MENGISTU A Phylogenetic distinction of DiaporthePhomopsis isolates from soybeans [resumo] Systematic Mycology and Microbiology I v 57 n 4 p 13 2006 CENARGEN Banco de Dados on Line Disponiacutevel em lthttpicewall2cenargenembrapabr84micwebmichtmlfgbd01aspPgt Acesso em Maio de 2005 CERVI A C PACIORNIK E F VIEIRA R F MARQUES L C Espeacutecies vegetais de um remanescente de Floresta de Araucaacuteria (Curitiba-Brasil) estudo preliminar I Acta Bioloacutegica Paranaense Curitiba v18 n1-4 p73-114 1989 CHAREPRASERT S PIAPUKIEW J THIENHIRUN S WHALLEY A J S SIHANONTH P Endophytic fungi of teak leaves Tectona grandis L and rain tree leaves Samanea saman Merr Journal of Microbiology amp Biotechnology v 22 n 5 p 481-486 2006 CHRISTO D Variabilidade Geneacutetica e Diferenciaccedilatildeo Molecular de Isolados Endofiacuteticos e Patogecircnicos de Guignardia spp e Phyllosticta sp Curitiba 2002
109
78 f Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Geneacutetica) ndash Universidade Federal do Paranaacute CLAY K Effects of fungal endophyteson the seed and seedling biology of Lolium perenne and Festuca arundinacea Oecologia (Berlin) Berlin v73 p 358-362 1987 CLAY K Fungi and the food of the goods Nature v 427 p 401-402 2004 COCHRANE VW Physiology of fungi New York John Wiley 1958 524p COCKRUM P A PETTERSON D S EDGAR J A 1994 Identification of novel Phomopsins in Lupin seed extracts In Plant-associated toxins Agricultural phytochemical and ecological aspects DORLING P R p 232-237 Wallingford CAB In-ternational COELHO AG Software Bood v 3 04 2005 COIMBRA R SILVA E D Notas de Fitoterapia 2ordf ed Laboratoacuterio Cliacutenico Silva Arauacutejo SA 1958 CORDEIRO P J M VILEGAS J H Y LANCcedilAS F M HRGC-MS Analysis of Terpenoids from Maytenus ilicifolia and Maytenus aquifolium (ldquoEspinheira Santardquo) Journal of Brazilian Chemistry Society v 10 p 523-526 1999 CORRADO M RODRRIGUES KF Antimicrobial evaluation of fungal extracts produced by endophytic strains of Phomopsis sp Journal Basic Micrrobiol v44 p157-160 2004 CORREcircA RMS Caracterizaccedilatildeo de Phomopsis e Phoma obtidos de sementes de espeacutecies florestais 1995 72p Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Fitopatologia) ndash Universidade Federal de Lavras Lavras 1995 CRONQUIST A An integrated system of classification of flowering plants New York Columbia University Press 1981 CROUS PW WINGFIELD MJ FERREIRA FA ALFENAS A Mycosphaerella parkii and Phyllosticta eucalyptorum two new species from eucaliptus leaves in Brazil Mycological Research Cambridge v97 p 582-584 1993 CRUZ GL Livro Verde VolII 1a Editora Belo Horizonte-Minas Gerais 1965 DALZOTO P R GLIENKE-BLANCO C KAVA-CORDEIRO V ARAUacuteJO W L AZEVEDO J L RAPD analyses of recombinatiom process in the entomopathogenic fungus Beauveria bassiana Mycological Research v 107 p 1069-1074 2003 DJAOUIDA R SORBO G D REGGIO C ZOINA A FIRRAO G Polymorphisms in nuclear rDNA and mtDNA reveal the polyphyletic nature of isolates of Phomopsis
110
pathogenic to sunflower and a tight monophyletic clade of defined geographic origin Mycologia v 108 n 4 p 393-402 2004 DUARTE M R DEBUR M C Stem and leaf morphoanatomy of Maytenus ilicifolia Fitoterapia v 76 p 41-49 2005 EDGINTON L V KNEW K L BARRON G L Fungitoxic spectrum of benzimidazole compounds Phitopathology v 62 n 7 p 42-44 1971 EMBRAPA Fungos Endofiacuteticos Introduccedilatildeo Disponiacutevel em lthttpwwwcnpmaembrapabrprojetosendofiticosintroducaohtm1gt Acesso em Maio de 2005 ERNEST M MENDGEN W K WIRSEL W Endophytic Fungal Mutualists Seed-Borne Stagonospora spp Enhance reed biomass production in axenic microosms Molecular Plant-Microbe Interations v 16 n 7 p 580-587 2003 ESPOacuteSITO E AZEVEDO J L Fungos uma introduccedilatildeo agrave biologia bioquiacutemica e biotecnologia Caxias do Sul Edusc 510p 2004 ETHUR L Z CEMBRANEL C Z SILVA A C F Seleccedilatildeo de Trichoderma spp visando controle de Sclerotinia sclerotiorium in vitro Ciecircncia Rural v 31 n 5 p 885-887 2001 EZRA D STROBEL G A Effects of substrate on the bioactivity of volatile antimicrobials produced by Muscodor albus Plant Science St Paul v165 p913-922 2003 EZRA D CASTILLO U F STROBEL G A HESS W M PORTER H JENSEN J B CONDRON M A M TEPLOW D B SEARS J MARANTA M HUNTER M WEBER B YAVER D Coronamycins peptide antibiotics produced by a verticillate Streptomyces sp (MSU-2110) endophytic on Monstera sp Microbiology v 150 p 785-793 2004 FARR D F CASTLEBURY L A ROSSMAN A Y Morphological and molecular characterization of Phomopsis vaccinii and additional isolates of Phomopsis from blueberry and cranberry in the eastern United States Mycologia v 94 n 3 p 494-504 2002 FELSENTEIN J Conficence limits on phylogenies an approch using the bootstrap International Journal of Organic Evolution Lancaster v 39 p 366-369 1985 FERNANDEZ F A HANLIN R T Morphological and RAPD analyses of Diaporthe phaseolorum from soybean Mycologia v 88 n 3 p 425-440 1996
111
FERREIRA M E Aplicaccedilatildeo de Marcadores Moleculares no Mapeamento Geneacutetico de Plantas In III Curso de Marcadores Moleculares EMBRAPACENARGEN ndash Brasiacutelia DF 1994 FERREIRA D F Anaacutelise estatiacutestica por meio do SISVAR para Windows Versatildeo 40 In REUNIAtildeO ANUAL DA REGIAtildeO BRASILEIRA DA SOCIEDADE INTERNACIONAL DE BIOMETRIA 45 2000 Satildeo Carlos Anais Satildeo Carlos SSPSIB 2000 p 255-268 VAN SOEST P J Nutritional ecology of the ruminant 2 ed Ithaca Cornell University PressConstock Pub-lish1994 476 p FERREIRA MP OLIVEIRA CNOLIVEIRA BA LOPES MJALZAMORA F VIEIRA MAR A lyophilized aqueous extract of Maytenus ilicifolia leaves inhibits histamine-mediated acid secretion in isolated frog gastric mucose Planta v 219 p 319-324 2004 FIALHO M B Efeito in vitro Sacharomyces cerevicea sobre Guignardia citricarpa agente causal da pinta preta dos citros Piracicaba 2004 60f Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo FIGUEIREDO J G Bioprospecccedilatildeo Caracterizaccedilatildeo Morfoloacutegica e Molecular de Endoacutefitos de Maytenus ilicifolia com Ecircnfase EM Pestalotiopsis spp Curitiba 2006 Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade Federal do Paranaacute FRISVAD J C SAMSON R A Polyphasic taxonomy of Penicillium subgenus Penicillium - A guide to identification of food and air-borne terverticillate Penicillia and their mycotoxins Studies in Mycology v 49 p 1-173 2004 FRISVAD J C FRANK J M HOUBRAKEN J A M P KUIJPERS A F A SAMSON R A New ochratoxin A producing species of Aspergillus section Circumdati Studies in Mycology v 50 p 23-43 2004 FUNGARO M H P VIEIRA M L C Aplicaccedilotildees da PCR em ecologia molecular In MELO I S AZEVEDO J L (Eds) Ecologia microbiana Jaguarariuacutena Embrapa-CNPMA 1998 cap8 p205-227 FUNGARO M H P PCR na Micologia Biotecnologia Ciecircncia amp Desenvolvimento Brasiacutelia n14 p12-16 2000 GAMBOA-GAITAacuteN M A LAUREANO S BAYMAN P Endophytic Phomopsis Strains from of Guarea guidonia (Meliaceae) Journal of Science v 41 n 2 p 215-224 2005 GAO X ZHOU H XU D YU C CHEN Y QU L Hi h diversity of endophytic fun i from the pharmaceutical plant Heterosmilax japonica Kunth
112
revealed y cultivation-independent approach FEMS Microbiology Letters v 249 p 255-266 2005 GLIENKE C CHRISTO D MACCHERONI JR W AZEVEDO J L High molecular diversity of the fungus Guignardia citricarpa and Guignardia mangiferae and new primers for the diagnosis of the Citrus Black Spot Brazilian Archives of Biology and Technology Submetido 2007 GLIENKE C Variabilidade geneacutetica no fungo endoacutefito Guignardia citricarpa kiely detectada por RAPD Curitiba 1995 Dissertaccedilatildeo de Mestrado- Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade federal do Paranaacute GLIENKE-BLANCO C AGUILAR-VILDOSO CI VIEIRA MLC BARROSOP A V AZEVEDO JL Genetics variabilityb in the endophytic fungus Guignardia citricarpa isolated from citrus plants Genetics and Molecular Biology v 25 n 2 p 251-255 2002 GOacuteES A Etiologia aspectos epidemioloacutegicos e controle de Guignardia citricarpa agente causal da mancha preta do citros 100 p Relatoacuterio teacutecnico 2005 GONZALEZ M LOMBARDO A VALLARINO A J Plantas de la medicina vulgar del Uruguay Uruguay Talleres Grfificos Cerrito 149 p 1937 GUTHRIE P A I MAGILL C W FREDERIKSEN R A ODVODY G N Random amplified polymorphic DNA markers a systems for identifying and differentiating isolates of Colletotrichum graminicola Phytopathology St Paul v 82 p 832-835 1992 GURGEL LMS MENEZES M COELHO RSB Caracterizaccedilatildeo patogecircnica fisioloacutegica e isoenzimaacutetica de Phomopsis anacardii e Phomopsis mangiferae In CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA 30 1997 Poccedilos de Caldas Resumos Brasiacutelia Sociedade Brasileira de Fitopatologia 1997 p 269 GURGEL LMS MENEZES M COEcircLHO RSB Estudo comparativo de isolados de Phomopsis anacardii e Phomopsis mangiferae atraveacutes da patogenicidade e nutriccedilatildeo de C e N em trecircs regimes de luminosidade Summa Phytopathologica v 28 p 160-166 2002 GRAJAL-MARTIN M J SIMON C J MUEHLBAUER F J Use of Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) to characterize race 2 of Fusarium oxysporum fsp pisi Phytopatology v 83 p 612-14 1993 GRATTAPAGLIA D FERREIRA M E Introduccedilatildeo ao uso de marcadores moleculares em anaacutelise geneacutetica EMBRAPA Brasiacutelia 3 ed 220p 1998
113
GRIFFIN DH Fungal physiology 2ed New York Wiley-Liss 1994 458p HALL T A BioEdit48 Raileigh 1997-2001 1 arquivo (115M) Disponiacutevel em httpwwwmbioncsuedubioedithtml BioEdit a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windons 9598NT HANLIN R T MENEZES M Gecircneros ilustrados de ascomicetos UFRPE Recife-PE 1996 274p HERBERT J A GRECH NM A strain of Guignardia citricarpa the citrus black spot pathogen resistent to benomyl in South Africa Plant Disease St Paul v 69 p 1007 1985 HUANG Y WANG J LI G ZHENG Z SU W Antitumor and antifungal activities in endophytic fungi isolated from pharmaceutical plants taxus mairei Cephalataxus fortunei and Torreya grandis FEMS Immunology and Medical Microbiology v31 n47 p163-167 2001 IBRAHIM G BAYCA B Fungal bacterial and nematological problems of citrus grape and stone fruits in Arab countries Arab Journal of Plant Protection Beirut v7 n2 p190-197 1989 ITOKAWA H SHIROTA O IKUTA H MORITA H TAKEYA K IITAKA Y Triterpenes fom Maytenus ilicifolia Phytochemistry v 30 n 11 p 3713-37161991 ITOKAWA H SHIROTA O IKUTA H MORITA H TAKEYA K IITAKA Y Oligo-nicotinated sesquiterpene polyesters from Maytenus ilicifolia Journal of natural Prodcts v 56 p 1479-14851993 JASALAVICH C OSTROFSKY A JELLISON J Detection and identification of decay fungi in spruce wood by restriction fragment length polymorphism analisis of amplified genes encoding rRNA Applied and Environmental Microbiology Washington v66 n11 p 4725-4734 2000 JOHNSTON P R FULLERTON R A Cryptosporiopsis citri sp Nov cause of a citrus leal spot in the Pacific Islands New Zealand Journal of Experimental Agriculture Wellington v16 p159-163 1988 JORGE R M LEITE J P V OLIVEIRA A B TAGLIATI C A Evaluation of antinociceptive anti-inflammatory and antiulcerogenic activities of Maytenus ilicifolia Journal Ethnopharmacol v 94 n1 p 93-100 2004 KIM K H TEN L N LIU Q M IM W T LEE S T Sphingobacterium daejeonense sp nov isolated from a compost sample International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2031-2036 2006
114
KIM B Y WEON H Y LEE K H SEOK S J KWON S W GO S J STACKEBRANDT E Dyella yeojuensis sp nov isolated from greenhouse soil in Korea International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2079-2082 2006 LEE Y H SNOW J P Phenotypic and genetic variations in Diaporte phaseolorum var caulivora the soybean stem canker pathogen Phytopathology v 81 p1205 1992 LEITE J P V RASTRELLI L ROMUSSI G OLIVEIRA A B VILEGAS J H Y VILEGAS W PIZZA C Isolation and HPLC quantitative analysis of flavonoid glycosides from razilian evera es (Maytenus ilici olia and M aqui olium) Journal of Agricultural and Food Chemistry v 49 p 3796-3801 2001 LEONIAN L H A study of the factors promoting pycnidium ndash formation in some Sphaeropsidales American Journal Botanic Columbus v11 p 19-50 1924 LEUCHTMANN A PETRINI O PETRINI LE CARROLL GC Isozyme polymorphism in six endophytic Phyllosticta species Mycological Research Cambridge v96 n 4 p 287-294 1992 LI J Y STROBEL G A Jesterone and hydroxy-jesterone antioomycete cyclohexenone epoxides from the endophytic fungus Pestalotiopsis jesteri Phytochemistry v 57 p 261-265 2001 LIMA O G de COELHO J S de B WEIGERT E DrsquoALBUQUERQUE I L LIMA D de A SOUZA M A de M Substacircncias antimicrobianas de plantas superiores ndash Sobre a presenccedila de maitenina e pristimerina na parte cortical das raiacutezes de Maytenus ilicifolia procedente do Brasil Meridional Revista do Instituto de Antibioacuteticos v 11 n 1 p 35-38 1971 LIU C H ZOU W X LU H TAN R X Antifungal activity of Artemisia annuaendophyte cultures against phytopathogenic fungi Journal of Biotechnology v88 p 277-282 2001 LU H ZOU W X MENG J C HU J TAN R X New bioactive metabolites produced by Colletotrichum sp an endophytic fungus in Artemisia annua Plant Science Oxford v 151 n 1 p 67-73 2000 LU G Z CANNON P F REID A SIMMONS C M Diversity and molecular relationships of endophytic Colletotrichum isolates from the Iwokrama Forest Reserve Guyana Mycological Research v 108 n 1 p 53-63 2004 MAKI C S Diversidade e Potencial Biotecnoloacutegico de Fungos Endofiacuteticos de Cacau Theobroma cacao L Piracicaba 2006 Dissertaccedilatildeo de Doutorado ndash Setor de Agronomia- Geneacutetica e Melhoramento de Plantas Universidade Escola Superior de
115
Agricultura Luiz de Queiroz MANULIS S KOGAN N REUVEN M BEN-YEPHET Y Use of the RAPD technique for identification of Fusarium oxysporum f sp dianthi from carnation Phytopathology v84 p98-101 1993 MARTINS-CORDER M P MELO I S ANTAGONISMO IN VITRO DE Trichoderma spp A Verticillium dahliae KLEB Scientia Agriacutecola v 55 n1 p1-7 1998 MARIANO R L R Meacutetodos de seleccedilatildeo in vitro para o controle microbioloacutegico de patoacutegenos de plantas Revisatildeo Anual de Patologia de Plantas v I p 369-409 1993 McMILLAN JR RT Guignardia citricarpa a cause of black spot on mango foliage in Florida Journal of Phytopathology Berlin v117 p 260-264 1986 McPHERSON M J QUIRKE P TAYLOR G R PCR 1 A pratical approach IRL New York v1 348p 1991 McONIE K C The latent occurrence in citrus and other hosts of a Guignardia easily confused with G citricarpa the citrus black spot pathogen Phytopathology St Paul v 54 p 40-43 1964a McONIE K C Source of inoculum of Guignardia citricarpa the citrus black spot pathogen Phytopathology St Paul v 54 p 64-67 1964b MEIJER G MEGNEGNEAU G LINDERS E G Avariability for isozyme vegetative compatibility and RAPD markers in natural populations of Phomopsis subordinaria Mycological Research v98 n3 p267-276 1994 MEIRA PENNA Dicionaacuterio Brasileiro de Plantas Medicinais 3a Ed Editora Kosmos Rio de Janeiro 1946 MELO I S Agentes microbianos de controle de fungos fitopatogecircnicos In Controle bioloacutegico v I MELO I S e AZEVEDO J L (Eds) Jaguariuacutena SP Embrapa-CNPMA 1998 264p MICHELMORE R W HULBERT S H Molecular markers for genetic analysis of phytopathogenic fungi Annual Review of Phytopathology Palo Alto v 25 p 383-404 1987 MOLLER C WEBER G DREYFUSS M M Intraespecific diversity in the fungal species Chaunopycnis alba implications fo microbial screening programs Journal of industrial microbiology v 17 p 359-372 1996
116
MONTANARI T CARVALHO J E de DOLDER H Effect of Maytenus ilicifolia Martex Reiss on spermatogenesis Contraception v 57 p 335-3391998 MONTANARI T BEVILACQUIA E Effect of Maytenus ilicifolia Mart On pregnant mice Contraception v 65 p 171-1752002 MOSTERT L CROUS P W KANG J PHILLIPS A J L Species of Phomopsis and a Libertella sp occurring on grapevines with specific reference to South Africa morphological cultural molecular and pathological characterization Mycologia v 93 n 1 p 146-167 2001 MULLIS K B F A FALOONA Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction Methods Enzymol v 155 p 335-350 1987 MURALI T S SURYNARAYANAN T S GEETA R Endophytic Phomopsis species Host range and implications for diversity estimates NRC Research Press Canadaacute 2006 NEDASHKOVSKAYA O I VANCANNEYT M KALINOSKAYA N I MIKHAILOV V V SWINGS J Aquimarina intermedia sp nov reclassification of Stanierella latercula (Lewin 1969) as Aquimarina latercula comb nov and Gaetbulimicrobium brevivitae International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2037-2041 2006 NETO P A S AZEVEDO J L ARAUacuteJO W L Microrganismos Endofiacuteticos Interaccedilatildeo com Plantas e Potencial Biotecnoloacutegico Revista Biotecnologia v5 n29 2002 OrsquoDONNELL K GRAY L E Phylogenetc relationships of the soyobean sudden death syndrome pathogen Fusarium solani f sp phaseoli inferred from rDNA sequence data and PCR primers for its identification Molecular Plant Microbe Interact v 8 p 709-716 1995 OKANE I NAKAGIRI A ITO T Endophytic fun i in leaves of ericaceous plants Canadian Journal of Botany v 76 p 657-663 1998 OULLET T SEIFFERT K A Genetic characterization of Fusarium graminearum strains using RAPD e PCR amplification Phytopathology v 83 p 1003-1007 1993 PAAVANEM-HUHTALA S AVIKAINEM H YLI-MATTILA T Development of strain-specific primers for a strain of Gliocladium catenulatum used in bioological control European Journal Plant Pathological Dordrecht v106 n2 p187-198 2000 PANIZZA S Plantas que Curam (Cheiro de Mato) 15deg ed Satildeo Paulo IBRASA 1998 265 p PATEL B N PATEL R C TILVA D G Phyllosticta leaf spot a new disease in Bidi
117
tobacco nursey Tobacco Research Rajahmundry v14 p 1176-1178 1988 PATERSON R R M BRIDGE P D Biochemical techniques for filamentous fungi CAB International 125 p 1994 PARMETER J R An effect of substrate on spore form in Phomopsis Phytopatholog v 48 p 396-397 1958 PENNA E B da S Microrganismos endofiacuteticos de erva-mate (Ilex paraguariensis STHIL) e variabilidade geneacutetica em Phyllosticta sp por RAPD Curitiba 2000 123 f Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Universidade Federal do Paranaacute PETRINI O Taxonomy of endophytic fungi of arial plant tissues In FOKKEMA N J HEUVEL JVAN DEN (Ed) Microbiology of the Phyllosphere Cambrige University Press p 175-87 1986 PETRINI O Fungal endophytes of tree leaves In ANDREWS J H HIRANO S S (Eds) Microbial Ecology of Leaves New York Sprin er-Verla 1991 p 179-197 PETRINI O STONE K CARROLL F E Endophytic fungi in evergreen shrubs in western Oregon a preliminary study Canadian Journal of Botany v 60 p 789-796 1982 PHILLIPS A J L The plant pathogenic genus Phomopsis and its teleomorph (Diaporthe) Development and application of morphological biological and phylogenetic species concepts Disponiacutevel em lthttpwwwcremfctunlptbotryosphaeria_sitepersonal_web_pagehtmgt Acesso em Dezembro de 2006 PILEGGI S A V Isolamento e Caracterizaccedilatildeo de Microrganismos Endofiacuteticosde Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss por Meio de Marcadores RAPD eseu Potencial Farmacoloacutegico Curitiba 2006 Dissertaccedilatildeo de Doutorado - Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade Federal do Paranaacute PIOLI R N MORANDI E N MARTIacuteNEZ M C LUCCA F TOZZINI BISARO V HOPP H E Morphologic molecular and pathogenic characterization of diaporthe phaseolorum variability in the core soybean ndash Producing Aacuterea of Argentina Phytopathology v 93 n2 p136-146 2003 PONTECORVO G ROPER J A HEMMOS LM MAC DONALD K D BUFTON A W J The genetics of Aspergillus nidulans Advances in Genetics v 5 p141-238 1953 PONS N Estudio taxonomico de especies de Phoma y Phyllosticta sobre cantildea de azucar (Saccharum sp) Fitopatologia Venezolana Maracay v 3 p 34-43 1990
118
PROMPUTTHA I JEEWON R LUMYONG S MCKENZIE E H C HYDE K D Ribosomal DNA fingerprinting in the identification of non sporulating endophytes from Magnolia liliifera (Magnoliaceae) Fungal Diversity v 20 p 167-186 2005 QUIROGA E N SAMPIETRO A R VATTUONE M Screening antifungal activitis of selected medicinal plants Journal of Ethnopharmacology v 74 p 89-96 2001 RAEDER U BRODA P Rapid preparation of DNA from filamentous fungi Letters in Applied Microbiology Oxford v1 p17-20 1985 REHNER S A UECKER F A Nuclear ribosomal internal transcribed spacer phylogeny and host diversity in the coelomycete Phomopsis Canadian Journal of Botanic v 72 p1666-1674 1994 RIBEIRO L A de Variabilidade Geneacutetica por RAPD em fungos endoacutefitos de Gecircnero Penicillium provenientes de Zea mays L Curitiba 1995 90 f Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Universidade Federal do Paranaacute RIEDL H WECHTL E Proposal to conserve the name Phomopsis (Sacc) Bubak (1905) against Myxolibertella Hohnel (1903) Taxon v 30 n 4 p 826-828 1981 ROBES C F A mancha preta dos fungos ciacutetricos (Phyllosticta citricarpa) ameaccedila a citricultura paulista Laranja Cordeiroacutepolis v 11 p 75-86 1990 ROBES C F BITTENCUCOURT S M A mancha preta dos frutos um dos fatores limitantes agrave produccedilatildeo citricola do estado do Rio de Janeiro Comunicado Teacutecnico ndash CTAA-EMBRAPA n 19 p 1-5 1995 RODRIGUES K F SAMULES G J Fungal endophytes of Spondias mombin in Brazil a preliminary study Journal of Basic Microbiology v 39 p 131 ndash 135 1999 RODRIGUES KF HESSE M WERNER C Antimicrobial activities of secondary metabolites produced by endophytic fungi from Spondias mombin Journal of Basic Microbiology v 40 n 4 p 261-267 2000 RODRIGUES-HEERKLOTZ KF DRANDAROV K HEERKLOTZ J HESSE M WERNER C Guignardia Acid a Novel Type of Secondary Metabolite Produced by the Endophytic fungus Guignardia sp Isolation Structure Elucidation and Asymmetric Synthesis Helvetica Chimica Acta v 84 p 3766-3772 2001 RODRIGUES K F SIEBER T N GRUumlNIG R C HOLDENRIEDER O Characterization of Guignardia mangiferae isolated from tropical plants based on morphology ISSR-PCR amplifications and ITS1-58S-ITS2 sequences Mycological
119
Research Cambridge v 108 p 45-52 2004 RODRIGUES K F COSTA G L CARVALHO M P EPIFANIO R A Evaluation of extracts produced by some tropical fungi as potential cholinesterase inhibitors Journal of Microbiology and Biotechnology v21 p1617-1621 2005 RODRIGUES M B C Controle de Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta dos Citros Piracicaba 2006 67 p Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo ROHLF F J NTSYS-PC Numerical taxonomy and multivariate analysis system New York Exeter Publishing 1988 RUBINI M R SILVA-RIBEIRO R T POMELLA A W V MAKI C S ARAUacuteJO W L SANTOS D R AZEVEDO J L Diversity of endophytic fungal community of cacao (Theobroma cacao L) and biological control of Crinipellis perniciosa causal agent of Witches Broom Disease International journal of Biological Sciences v 1 n 1 p 24-33 2005 SAIKI R K SCHARF S J FALOONA F MULLIS K B HORN G T ERLICH H A ARNHEIM N Enzymatic amplification of β-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia Science v 230 p1350-1354 1985 SAMPAIO J P FELL J W GADANHO M BAUER R Kurtzmanomyces insolitus sp nov a new anamorphic heterobasidiomycetous yeast species Systematic and Applied Micorbiology v 22 p 619-625 1999 SAMUELES G J SEIFERT K A The impact of molecularcharacters on systematics of filamentous ascomycetes Annual Review of Phytopathogy Palo Alto v 33 p 37-67 1995 SANGER F NICKLEN S COULSON A R DNA Sequencing with chain terminating inhibitors Proceedings of the National Academy of Sciences of the United states of America Washington v 74 p 5463-5467 1977 SANTOS MF Anaacutelise da micoflora associada ao baru (Dipteryx alata Vog) e a caroba (Cybistax antisyphilitica (Mart) Mart) BrasiacuteliaDF 1996 Dissertaccedilatildeo de Mestrado Universidade Nacional de Brasiacutelia SATOKO K MINAKA N KOBAYASHI T KUDO A OHTSU Y Molecular Phylogenetic Analysis of Ribosomal DNA Internal Transcribed Spacer Regions and Comparison of Fertility in Phomopsis Isolates from Fruit Trees Plant Pathology v 66 p 191-210 2000
120
SCHULZ B BOYLE C DRAEGER S ROumlMMERT A KROHN K Endophytic fungi a source of novel biologically active secondary metabolites Mycological Research Cambridge v 106 p 996-1004 2002 SCHULZ B BOYLE C The endophytic continuum Mycological Research Cambridge v 109 p 661-686 2005 SETTE L D PASSARINI M R Z DELARMELINA C SALATI F DUARTE M C T Molecular characterization and antimicrobial activity of endophytic fungi from coffee plants World Journal of Microbiology and Biotechnology v 22 p 1185-1195 2006 SHIROTA O MORITA H TAKEYA K ITOKAWA H ITAKA YCytotoxic aromatic triterpenes from Maytenus ilicifolia and Maytenus chuchuhuasca Journal of Natural Products v 57 p 1675-1681 1994 SHIVAS R G ALLEN J G WILLIAMSON P M Infraspecific variation demonstrated in Phomopsis leptostromiformis using cultural and biochemical techniques Mycological Research Cambridge v 95 p 320-323 1991 SHRESTHA K STROBEL G A PRAKASH S GEWALI M Evidence for paclitaxel from three new endophytic fungi of Himalayan yew of Nepal Planta Medicinal v 67 p 374-376 2001 SILVA C G RECIO R A OLIVEIRA A B de PAIVA R L R Coleta e avaliaccedilatildeo da qualidade fitoquiacutemica de Maytenus ilicifolia M (espinheira-santa) Tribuna Farmacecircutica v 5759 p 46-50 1991 SILVA F A S The ASSISTAT Software statistical assistance In INTERNATIONAL CONFERENCE ON COMPUTERS IN AGRICULTURE 6 Anais Cancun American Society of Agricultural Engineers p 294-298 1996 SILVA F de A S AZEVEDO C A V de Versatildeo do programa computacional Assistat para o sistema operacional Windows Revista Brasileira de Produtos Agroindustriais Campina Grande v 4n 1 p 71-78 2002 SILVA G H TELES H L TREVISAN H C BOLZANI V S YOUNG M C M PFENNING L H EBERLIN M N HADDAD R COSTA-NETO C M ARAUacuteJO A R New Bioactive Metabolites Produced by Phomopsis cassiae an Endophytic Fungus in Cassia spectabilis Journal Brasileiro Chemical Society v16 n6 p 1463-1466 2005 SILVA R L DE O LUZ J S SILVEIRA E B CAVALCANTE T Fungos endofiacuteticos em Annona spp isolamento caracterizaccedilatildeo enzimaacutetica e promoccedilatildeo do crescimento em mudas de pinha (Annona squamosa L) Acta Botanica Brasilica v
121
20 n 3 p 649-655 2006 SILVEIRA EB 2001 Bacteacuterias promotoras de crescimento de plantas e biocontrole de doenccedilas Pp 71-100 In R Barros e SJ Michereff Proteccedilatildeo de plantas na agricultura sustentaacutevel Recife Imprensa Universitaacuteria da UFRPE SIMOtildeES C M O MENTZ L A SCHENKEL E P IRGANG B E STEHMANN J R Plantas da medicina popular no Rio Grande do Sul Porto Alegre Editora da UniversidadeUFRGS 174p 1986 SIVANESAN A The bitunicate ascomycetes and their anamorphs J Cramer Germany 701p 1984 SNEATH P H A SOKAL R R Numerical Taxonomy W H freeman Co San Francisco 1973 SOUZA FORMIGONI M L OLIVEIRA M G MONTEIRO M G DA SILVEIRA FILHO N G BRAZ S CARLINI E A Antiulcerogenic effects of two Maytenus species in laboratory animals Journal of Ethnopharmacology v 34 n 1 p 21-27 1991 SOUZA A Q L SOUZA A D L SPARTACO A F PINHEIRO M L B SARQUIS M I M PEREIRA J O Atividade antimicrobiana de fungos endofiacuteticos isolados de plantas toacutexicas da Amazocircnia Palicourea longiflora (aubl) rich e Strychnos cogens bentham Acta Amazocircnica v 34 n 2 p 185-195 Manaus 2004 SPOacuteSITO MB AMORIM L BASSANEZI RB BERGAMIN FILHO A HAU B Spatial pattern of black spot incidence within citrus trees related to disease severity and pathogen dispersal Plant Pathology p 103-108 2008 STAMFORD T L M ARAUacuteJO J M STAMFORD N P Atividade enzimaacutetica de microrganismos isolados do Jacatupeacute (Pachyrhizus erosus L Urban) Ciecircncia Tecnoloacutegica de Alimentos v 18 p 382-385 1998 STIERLE A STROBEL G STIERLE D GROTHAUS P BIGNAMI G The search for a taxol-producin microor anism amon the endophytic fun i of the Pacific yew Taxus bre i olia Journal of Natural Products v 58 n 9 p 1315-1324 1995 STINSON M ERZA D HESS W M SEARS J STROBEL G An endophytic Gliocladium sp Of Eucryphia cordifolia producing selective volatile antimicrobial compounds Plant Science St Paul v165 p 913-922 2003 STROBEL A G Rainforest Endophytes and Bioactive Products Critical Reviews in Biotechnology Boca Raton v 22 n 4 p 315-333 2002
122
STROBEL G A Endophytes as sources of bioactive products Microbes and Infection v 5 p 535-544 2003 STROBEL G DAISY B Bioprospecting for Microbial Endophytes and their Natural Products Microbiology and Molecular Biology Reviews v 67 n 4 p 491-502 2003 SUGHA SK SINGH BM SHARMA BM Studies on Phyllosticta glumarum causing glume blight of rice (Oryza sativa L) Himachal Journal of Agricultural Research Palampur v 12 n 1 p 11-14 1986 TAYLOR-ROSA S G BARROS I BCaracterizaccedilatildeo das sementes de Maytenus ilicifolia Mart Ex Reiss espinheira - santa e viabilidade de sua propagaccedilatildeo sexuada Porto Alegre 1994106f Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Universidade Federal do Rio Grande do Sul THOMPSON J D HIGGINS D G GIBSON T J Clustal W Improving the sensitiviy of rogressive multiple alignment through sequence weighting positions-specific gap penalties and weight matrix choice Nucleic Acids Research v 22 p 4673-4680 1994 TIMNICK MB LILLY VG BARNETT HL Factors affeting sporulation of Diaporthe phaseolorum var batatatis from soybean Phytopathology St Paul v 41 n 4 p 327-336 1951 UECKER F A A World list of Phomopsis names with notes on nomenclature morphology and biology National Fungus Collection v 13 1988 VAN DER AA H A Studies in Phyllosticta I Studies in Mycology n 5 1973 VAN DER AA H A M E Noordeloos and J de Gruy-ter Species concepts in some larger genera of the Coelomycetes Studies in Mycology v 32 p 3-19 1990 VASCONCELOS MJV ALMEIDA MA HENNING AMR BARROS AA MOREIRA EG Differentiation of Colletotrichum truncatum isolates by random amplified polymorphic DNA Fitopatologia Brasileira Brasiacutelia v 19 p 520-523 1994 VELICHETI R K McCCLARY C LAMISON R D SINCLAIR J B Immunodetection of the Diaporthe and Phomopsis complex of soybeans Phytopathology v 81 p 1212 1991 VIDIC M Variability in Diaporthe phaseolorum var caulivora on soybean in the Vojvodina Providence in Serbia Zastita Bilja v 42 p 183-189 1991
123
VILARINHOS A D PAULA JR T J BARROS E G MOUREIRA M A Characterization of races of Colletotrichum lindemutianum by the random amplified polymorfic DNA technique Fitopatologia Brasileira Brasiacutelia v20 p194-198 1995 VILLA- CARVAJAL M COQUE J J R ALVAREacuteZ-RODRIGUEacuteZ M L URUBURU F BELLOCH C Polyphasic identication of yeasts isolated from bark of cork oak during the manufacturing process of cork stoppers FEMS Yeast Research v 4 p 745-750 2004 VIRET O PETRINI O Colonization of eech leaves (Fagus syl atica) by the endophyte Discula umbrinella (teleomorph Apiognomonia errabunda) Mycological Research v 98 p 423-432 1994 WAGENAAR M CORWIN J STROBEL G A CLARDY J Three new chytochalasins produced by an endophytic fungus in the genus Rhinocladiella Journal Natural Products v 63 p1692-1695 2000 WALKER M R RAPLEY R Guia de rotas na tecnologia do gene Atheneu Satildeo Paulo 1999 334p WANG J Li G LU H ZHENG Z HUANGY SU W Taxol from Tubercularia sp strain TF5 an endophytic fungus of Taxus mairei FEMS Microbiology Letters v 193 p 249-253 2000 WATSON J D GILMAN M WITKOSWSKI J ZOLLER M Recombinant DNA 2 ed New York Freeman and Company 1992 WELSH J McCLELLAND M Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers Nucleic Acid Research Oxford v 18 p 7213-7218 1990 WHITE Jr J MORROW A C Endophyte-host associations in forage grasses XII A fungal endophyte to Trichachne insularis belonging to Psedocercosporella Mycologia Lawrence v 78 n 5 p 846-850 1989 WHITE Jr J F MORROW A C Endophyte-host associations in forage grasses XII A fungal endophyte of Trichachne insularis belonging to Pseudocercosporella Mycologia Lawrence v 82 p 218-226 1990 WHITE Jr J F MORGAN-JONES G MORROW AC Taxonomy life cycle reprodution and detection of Acremonium endophytes Agriculture Ecosystem amp Environment v 44 p13-37 1993 WILLIAMS J G K KUBELIK A R LIVAK K J RAFALSKI J A TINGER S V DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers Nucleic Acids Research v 18 n 22 p 6531-6535 1990
124
WILLIAMS J G K HANAFEY M K RAFALSKI J A TINGEY S V Genetic analysis using random amplifield polymorphic DNA markers Methods in Enzymology San Diego v 218 p 704-740 1993 ZHANG A W RICCIONI L PEDERSENW L KOLLIPARA K P HARTMAN G L Molecular identi-fication and phylogenetic grouping of Diaporthe phaseolorum and Phomopsis longicolla isolates from soybean Phytopathology v 88 p1306 -1314 1998 ZOU W X MENG J C LU H CHEN G X SHI G X ZHANG T Y TAN R X Meta olites of Colletotrichum gloeosporioides an endophytic fun us in Artemisia mongolica Journal of Natural Products v 63 n 11 p 1529-1530 2000 ZOU W X TAN R X Endophytes a rich source of functional metabolites Natural Product Reports v18 p 448-459 2001
125
ANEXOS
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 496671024 9933420 94396 MEIOS DE CULTURA 2 137912854 68956427 655287 INTERACcedilAtildeO A 100 193198257 1931983 18359 INTERACcedilAtildeO b 100 10989107 0109891 1044 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
INTERACcedilAtildeO A INTERACcedilAtildeO ENTRE OS MEIOS DE CULTURA E OS ISOLADOS de Phomopsis INTERACcedilAtildeO B INTERACcedilAtildeO ENTRE AS REPETICcedilOtildeES DOS ISOLADOS DE Phomopsis significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS ENTRE OS MEIOS DE CULTURA
BDA 5169935 a MEA 4973856 b AV 3921569 c
CV = 62
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 1 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM DIFERENTES MEIOS DE CULTURA
126
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 230248366 4604967 43761 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS ESBA1 700 a A323 700 a A215A 700 a ESSD1 700 a SM9713 700 a ESGF1 700 a SM9631 700 a ESJD1 700 a ESKD1 667 a A334 667 a ESDF1 633 b A132 633 b A123 600 b A333A 600 b MU0123 600 b ESJH1 600 b A321 600 b ESRD1 600 b A116 600 b A134 567 b A115B 567 b ESIA1 533 c
ANEXO 2ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO BDA
127
A131 500 c SM9714 500 c A135 500 c ESIE1 500 c ESFB2 500 c A124 500 c ESPAC22 500 c ES2KF1 500 c A113 500 c ESJE1 500 c ESJE2 433 d ESFH1 400 d ESJG1 400 d ES2WC1 400 d PHO1 400 d SM9638 400 d ES2NA1 400 d ES2AB1 400 d ESFF1 400 d AT9811 400 d AT9810 400 d ES2WF1 400 d A126 400 d PHO19 400 d A216B 400 d ES80J 367 d ESGA1 367 d AT9906 300 e A333B 233 f
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
128
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 189058824 3781176 35932 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS ESKD1 700 a ESJE2 600 b A123 600 b ESJE1 533 c SM9638 500 c AT9811 500 c SM9713 500 c PHO1 500 c ESBA1 500 c SM9631 500 c ESFB2 500 c A334 500 c A323 500 c MU0123 500 c A333A 433 d ESJD1 433 d ESGF1 433 d A116 433 d PAC22 400 e ESDF1 400 e A321 400 e A132 400 e ES2KF1 400 e
ANEXO 3ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO AVEIA
129
ESJG1 400 e ESRD1 400 e PHO19 400 e A115B 400 e A124 400 e ESFF1 367 e A134 367 e ESIE1 367 e A135 367 e A131 367 e A113 367 e ES2WF1 367 e SD1 367 e ESIA1 333 e ESGA1 300 f ESJH1 300 f ESFH1 300 f AT9906 300 f ES2NA1 300 f A216B 300 f ES80J 300 f ESA215A 267 f AT9810 200 g A333B 200 g ES2AB1 200 g SM9714 200 g ES2WC1 200 g
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
130
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 270562092 5411242 51423 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS A323 733 a SM9631 700 a ESKD1 700 a A134 700 a ESIE1 700 a A116 667 b A334 667 b A215A 633 b ESSD1 633 b A321 600 c MU0123 600 c ESGF1 600 c ESRD1 600 c AT9811 600 c SM9713 600 c A123 600 c ESJH1 600 c ESDF1 600 c A131 567 c IA1 567 c ESBA1 567 c ESJD1 567 c A333A 533 d A135 500 d
ANEXO 4ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO MEA
131
ES2NA1 500 d A124 500 d A132 500 d SM9714 500 d ESFB2 500 d A115B 467 e ES2AB1 433 e A216B 433 e A113 433 e PHO1 400 f SM9638 400 f ES2WF1 400 f A126 400 f ESJE1 400 f ESPAC22 400 f ESFF1 400 f ES2KF1 400 f ESJG1 367 f ES80J 367 f ESJE2 333 g ESFH1 333 g AT9906 300 g ESGA1 300 g SM9810 300 g ES2WC1 300 g A333B 233 h PHO19 233 h
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
132
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 46 1602192500 34089202 1617590 RESIacuteDUO 432 91040000 210741 Total 478 1693232500
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO AT9906 352 a AT9810 353 a ESFH1 297 b ESPAC22 195 c ES2KF1 194 c SM9631 193 c ESGA1 184 cd PHO19 184 cd ES80J 166 de ESRD1 152 ef ESFB2 143 efg ESJE2 142 efg ESJE1 142 efg ESJG1 131 fgh A323 127 fghi A333A 126 ghij A135 123 ghij A124 123 ghij A126 123 ghij A132 123 ghij A131 123 ghij A134 123 ghij
ANEXO 5 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO DOS ESPOROS BETACONIacuteDIOSDOS ISOLADOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA
133
A115B 123 ghij ESIE1 123 ghij ES2WC1 119 ghil ES2WF1 119 ghil SM9713 116 hil A334 116 hil ESIA1 115 hil A333B 113 hil ESFF1 113 hil ESGF1 111 hil ES2AB1 107 him A123 107 him A113 107 him ESJD1 106 him ESKD1 105 im ES2NA1 104 im A215A 103 im SM9714 102 im ESSD1 101 m ESJH1 97 m MU0123 96 m A321 96 m ESDF1 95 m A216B 95 m A116 85 m
DMS = 259444 CV = 1052904
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
134
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 21 2674219 127344 459861 RESIacuteDUO 88 243688 002769 Total 109 2917907
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 293 a Fungicida Derosal 236 b ESGF1 157 c ESGA1 137 cde ESFH1 134 cdef ESIA1 120 cdefg ES2KF1 119 cdefgh ESFF1 146 cdefgh ES2NA1 111 defgh ES2AB1 110 defgh ESKD1 114 defgh ESJE2 110 defgh ESBA1 112 defgh ESRD1 098 efgh ESJG1 099 efgh ESJE1 099 efgh ESFB2 096 fgh ESJH1 094 gh ESJD1 093 gh ESIE1 095 gh ESSD1 078 h ESDF1 078 h
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 6 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
DMS = 039023 CV = 1340825
135
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 9 974154 108239 225325 RESIacuteDUO 40 192148 004804 Total 49 1166302
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 201 a
fungicida 174 ab AT9906 139 bc AT9810 117 cd AT9811 102 cde SM9638 110 cde SM9714 076 de SM9631 075 de MU0123 067 e SM9713 065 e
DMS = 046460 CV = 1946824
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 7 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
136
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 22 2382133 108279 239352 RESIacuteDUO 92 416192 004524 Total 114 2798325
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 244 a ES2WC1 237 a fungicida 185 b ES80J 138 bc A333B 136 cd ES2WF1 117 cde A333A 113 cde A132 110 cde A215A 106 cde A116 102 cde A124 101 cde A115B 101 cde A135 100 cde A215B 097 cde A321 094 cde A334 093 cde A323 092 cde A123 091 cde A113 091 cde A126 089 de A131 088 e ESPAC22 085 e A134 076 e
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 8 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
DMS = 050157 CV = 1809416
137
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA
FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 6210037 124201 165056 RESIacuteDUO 204 1535052 007525 Total 254 7745089
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 302 a FUNGICIDA Derosal 244 abc ES2WC1 277 ab AT9906 224 bcd AT9810 222 bcde SM9638 218 bcdef ESGF1 201 cdefg A333B 188 cdefgh A132 167 defghi SM9714 159 defghij ESFF1 153 efghil ES2WF1 150 fghil ESGA1 149 fghil ESFH1 147 ghil ES80J 147 ghil MU0123 144 ghil ES2NA1 143 ghil AT9713 142 ghim A321 141 ghim A216B 140 ghim AT9811 139 ghim A116 137 ghim
ANEXO 9 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305
138
ESBA1 134 ghim ES2AB1 133 ghim A323 132 ghin ESJG1 131 ghin ESIE1 130 hin A333A 129 hin A113 127 hin A134 125 hin ESSD1 122 hin ESKD1 121 hin ESIA1 117 in A124 113 in A334 112 in ES2KF1 112 in ESJE1 110 in ESPAC22 108 in A131 108 in A126 106 in A135 102 in ESRD1 094 n SM9631 093 n ESJE2 090 n ESJH1 090 n ESFB2 088 n ESJD1 087 n A123 087 n ESDF1 086 n A115B 072 n A215A 062 n
DMS = 070465 CV = 1983267
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
139
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 28 2145366 076620 407144 RESIacuteDUO 116 218300 001882 Total 144 2363666
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 222 a ESRD1 19 b A131 176 b ESIA1 178 b SM9713 162 bc ESJD1 162 bc A126 154 bcd MU0123 149 bcde A333A 134 cdef ESGA1 134 cdef A113 133 cdef ESGF1 130 cdef A334 130 cdef ESBA1 140 cdef SM9638 127 def ESJH1 119 efg ESDF1 115 fgh ESSD1 112 fgh ESKD1 113 fgh ES2AB1 111 fghi A124 111 fghi
ANEXO 10 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 PARA DETECCcedilAtildeODE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
140
A215A 109 fghi A321 108 fghi A134 089 ghij A115B 082 hij ESFF1 078 ij ESFH1 071 l A123 062 l ES2WF1 042 l
DMS = 033193 CV = 1095343
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
141
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA
FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 28 11264938 402319 481124 RESIacuteDUO 116 970000 008362 Total 144 12234938
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 422 a ESGA1 275 b ESGF1 267 bc ESBA1 265 bc SM9713 261 bc A333A 251 bcd ESSD1 235 bcde MU0123 234 bcde ESKD1 211 bcdef A215A 203 cdef A321 188 defg A131 173 efgh SM9638 167 efgh A124 148 fghi ESJD1 147 fghi A113 130 ghij ESIA1 122 ghij ES2AB1 128 ghij ESDF1 124 ghij A334 112 hij A115B 106 hij
ANEXO 11 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 PARA DETECCcedilAtildeODE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
142
ESRD1 104 hij ES2WF1 086 il A134 083 il A126 080 il ESFF1 075 l A123 065 l ESFH1 025 l ESJH1 017 l
DMS = 069970 CV = 1193907
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
43
ANE
XO
12
ndash M
ATR
IZ D
E D
AD
OS
PA
RA
CA
RA
CTE
RIZ
ACcedil
AtildeO
CR
ITEacuteR
IOS
ME
DID
AS
ME
IOS
DE
C
ULT
UR
A
MU
0123
SM
9631
SM
9638
SM
9713
SM
9714
AT9
810
AT9
811
AT9
906
ES
2AB
1
ES
2KF1
ES2N
A1
ES2W
C1
ES2W
F1
ES
80J
ESBA
1
ESD
F1
ES
FB2
ES
FF1
ESFH
1
ES
GA
1
ESG
F1
ESIA
1
ESIE
1
ESJD
1
ESJE
1
ESJE
2
1 AV 1 0 1 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 MEA 0 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 BDA 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 1 1 0
2 AV 1 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1 1 1 3 AV 0 0 0 0 1 0 0 1 1 1 0 1 0 0 0 1 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 4 AV 1 0 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
MEA 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
5 AV 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
6 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0 BDA 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1
7 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 BDA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0
8 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 0 0 0
9 AV 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 1 BDA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1
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44
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16 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
17 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 MEA 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 BDA 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0
18 AV 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 0 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0 1 1 BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
19 AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 BDA 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0
20 ESP 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 21 AV 1 1 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1
MEA 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1 0 1 1 0 0 1 BDA 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 0
22 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1
47
BDA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 23 352 a 353μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
297 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 195 a 193 μM BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
184 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 166 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 152 μM BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
143 a 142 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 131 μM BDA 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 127 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
126 a 123 μM BDA 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 1 1 0 1 0 0 119 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
116 a 111 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 107 a 106 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 105 a 102μM BDA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0
97 a 85μM BDA 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 24 733 a 700cm MEA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0
677 a 633 cm MEA 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 600 a 567 cm MEA 0 1 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 467 a 433cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 400 a 367cm MEA 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 333 a 300cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
233cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 700 a 667cm BDA 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 633 a 567cm BDA 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 1 1 0 1 0 0 533 a 500cm BDA 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 433 a 367cm BDA 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1
300cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 233cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 700cm AV 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
600cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 433cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 400 a 333cm AV 1 0 0 1 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 1 300 a 267cm AV 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 200cm AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0
Nota - Caracteriacutestica avaliada nos trecircs meios As caracteriacutesticas foram avaliadas seguindo os seguintes criteacuterios
48
1 Bordos da colocircnia regular (1) ou irregular (0) 2 Miceacutelio denso 3 Miceacutelio ralo 4 Miceacutelio granuloso aeacutereo 5 Miceacutelio algodonoso 6 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Branco 7 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Marrom 8 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Cinza 9 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Verde 10 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Amarelo 11 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Bege 12 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Preto 13 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Branco 14 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Marrom 15 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Preto 16 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Cinza 17 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Verde 18 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Amarelo 19 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Bege 20 Esporulaccedilatildeo com esporulaccedilatildeo (1) sem esporulaccedilatildeo (0) 21 Coniacutedio do tipo alfa 22 Coniacutedio do tipo beta 23 Comprimento dos coniacutedios do tipo beta 24 Diacircmetro meacutedio do crescimento das colocircnias
49 ANEXO 13 LOCAL DA COLETA DE FOLHAS DE Schinus terebinthifoliusCENTRO POLITEacuteCNICO ndash CURITIBAPR
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RENATA RODRIGUES GOMES
Phomopsis spp ENDOacuteFITOS DE PLANTAS MEDICINAIS DIVERSIDADE
GENEacuteTICA E ANTAGONISMO AO FUNGO Guignardia citricarpa
Dissertaccedilatildeo apresentada ao Programa de Poacutes-Graduaccedilatildeo em Geneacutetica da Universidade Federal do Paranaacute como requisito parcial para a obtenccedilatildeo do grau de Mestre em Ciecircncias Bioloacutegicas Aacuterea de Concentraccedilatildeo em Geneacutetica
Orientadora Profordf Drordf Chirlei Glienke
Co-orientador Prof Dr Joatildeo Luacutecio de Azevedo
CURITIBA 2008
AGRADECIMENTOS
Agrave minha orientadora Profordf Drordf Chirlei Glienke pela oportunidade ensinamentos
inestimaacuteveis sugestotildees e contribuiccedilotildees oferecidas as quais sem duacutevidas muito
enriqueceram o trabalho Sobretudo pelo exemplo de dedicaccedilatildeo agrave vida acadecircmica
Ao meu co-orientador Prof Dr Joatildeo Lucio Azevedo pela dedicaccedilatildeo e
valorizaccedilatildeo da pesquisa cientiacutefica e pela oportunidade de realizaccedilatildeo desse trabalho
Agrave minha banca de acompanhamento Profordf Drordf Patriacutecia Dalzoto e a Drordf Kaacutetia
Rodrigues pelas sugestotildees e contribuiccedilotildees oferecidas cooperando para o
desenvolvimento desse trabalho
Agraves Profas Dras Lygia Vitoacuteria Galli-Terasawa e Vanessa Kava-Cordeiro pela
convivecircncia sugestotildees e auxiacutelio no LabGeM
Ao Dr Aacutelvaro Almeida da EMBRAPA de Londrina-PR e a Drordf Socircnia Pillegi pelas
linhagens de Phomopsis que muito contribuiacuteram para elucidaccedilatildeo da pesquisa
Ao Prof Dr Joseacute Odair Pereira e a MsC Antonia Souza da Universidade Federal
do Amazonas e a MsC Josiane Gomes pelas linhagens de Pestalotiopsis utilizadas
neste trabalho
Agrave EMBRAPA de Colombo Paranaacute pela disponibilidade da coleta de folhas de
espinheira santa
Agrave Profordf Drordf Thelma Alvim que sempre se disponibilizou no auxiacutelio a microscopia
oacutetica
Aos Professores do Mestrado em Geneacutetica que contribuiacuteram para minha
formaccedilatildeo
Aos meus amigos de turma da poacutes-graduaccedilatildeo Carolina Abuaacutezar Caroline
Bernardi Clineu Uehara Daniele Matoso Dellyana Boberg Fabio Rigoti Maacutercia
Oliveira Patriacutecia de Franccedila Thaiacutes Sczepanski Virginia Coser e Vitor Dantas pelos
momentos de convivecircncia e conforto durante essa jornada Sem vocecircs jamais
suportaria a saudade
Agrave minha amiga Tatiane pelos momentos alegres na convivecircncia diaacuteria pelo
carinho companheirismo pelo conforto durante as minhas preocupaccedilotildees e receios
dentro e fora do laboratoacuterio Assim como pelas excelentes ideacuteias que muito contribuiacuteram
neste trabalho
Aos alunos de Poacutes-graduaccedilatildeo do LabGeM Jociney Josiele Josiane em
especial a Danyelle e Juliana pela amizade e cooperaccedilatildeo no desenvolvimento deste
trabalho
Ao doutorando Rafael Noleto do Laboratoacuterio de Citogeneacutetica Animal pelo
auxiacutelio no desenvolvimento deste trabalho
Aos amigos do LabGeM pela agradaacutevel convivecircncia e ajuda nos momentos
mais difiacuteceis Andreacute Carol Andrade Carol Silvano Douglas Flaacutevia Fernanda Larice
Lisiane Lucinir Maysa Patriacutecia Rosana e Taciana
Agrave amiga Izolde Gartner pela ajuda e disponibilidade
Agrave Anilda Gomes da Silva pelo eventual auxiacutelio teacutecnico na SEAD
Agrave Luciana Marques secretaacuteria do Programa de Poacutes-Graduaccedilatildeo em Geneacutetica
pelas orientaccedilotildees e informaccedilotildees
Aos meus pais Gislene Rodrigues Gomes e Raimundo de Andrade Gomes por
terem ensinado a buscar meus ideais e pelo esforccedilo e compreensatildeo em manterem-se
distantes todos esses anos que dediquei aos estudos
Ao meu companheiro Helder Franklin pela compreensatildeo o carinho e pela sua
admiraacutevel placidez sobretudo ao apoio e contribuiccedilatildeo para a realizaccedilatildeo deste ideal
Aos meus amigos e familiares pelo carinho compreensatildeo e incentivo nesse
periacuteodo de ausecircncia Sobretudo pelos exemplos de dedicaccedilatildeo e respeito ao proacuteximo
Agrave minha amiga Hafiza pelos conselhos compreensatildeo incentivo paciecircncia e
apoio
ldquoDe tudo ficaram trecircs coisas
A certeza de que estamos sempre comeccedilando
A certeza de que precisamos continuar
A certeza de que seremos interrompidos antes
de terminar
Portanto devemos
Fazer da interrupccedilatildeo um caminho novo
Da queda um passo de danccedila
Do medo uma escada
Do sonho uma ponte
Da procura um encontrordquo
(Fernando Pessoa)
RESUMO Phomopsis spp ENDOacuteFITOS DE PLANTAS MEDICINAIS DIVERSIDADE GENEacuteTICA E ANTAGONISMO AO FUNGO Guignardia citricarpa Autora Renata Rodrigues Gomes Orientadora Chirlei Glienke Microrganismos endofiacuteticos vivem no interior das plantas sem causar dano ao seu hospedeiro podendo produzir compostos biologicamente ativos antibioacuteticos fungicidas e herbicidas Essa comunidade endofiacutetica pode estar relacionada com a accedilatildeo antimicrobiana de plantas medicinais A planta Maytenus ilicifollia conhecida como espinheira-santa eacute uma planta medicinal muito utilizada no tratamento de uacutelceras gaacutestricas e tratamentos digestivos tiacutepica da Ameacuterica do Sul em especial da regiatildeo Sul do Brasil e atualmente encontra-se ameaccedilada de extinccedilatildeo As plantas medicinais Spondias mombin Myracrodruon urundeuva Schinus terebinthifolius e Aspidosperma tomentosun tecircm sido usadas na medicina devido as suas propriedades antimicrobianas No presente trabalho foram isolados fungos endofiacuteticos do gecircnero Phomopsis e avaliados quanto a sua variabilidade geneacutetica e estrutura populacional por meio de marcadores RAPD Observou-se que as plantas medicinais analisadas satildeo colonizadas por grande diversidade de espeacutecies de Phomopsis com grande variabilidade morfoloacutegica e geneacutetica intra e interespeciacuteficas Os isolados foram identificados por meio de sequumlecircncias das regiotildees ITS1 58S e ITS2 do DNA ribossomal e testados quanto ao potencial antimicrobiano contra as linhagens PC1396 e PC3305 de Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta do Citros Foi possiacutevel identificar nove isolados em niacutevel de espeacutecie por meio de sequumlecircncias ITS do rDNA sendo 4 como P michaeliae 2 como P theicola 2 como P longicolla e 1 como P sojae Foi possiacutevel verificar que as plantas de Maytenus ilicifolia analisadas satildeo colonizadas endofiticamente por pelo menos dez espeacutecies de Phomopsis e as plantas de Schinus terebinthifolius por pelo menos seis espeacutecies deste gecircnero As anaacutelises morfoloacutegicas por meio de marcadores RAPD e sequenciamento de ITS do rDNA permitem sugerir que as espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo satildeo hospedeiro-especiacuteficas sendo necessaacuteria a redefiniccedilatildeo do conceito de espeacutecie para este gecircnero Na anaacutelise antimicrobiana todos os isolados apresentaram grande potencial no controle in vitro do fungo G citricarpa destacando-se os isolados ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ES2AB1 (Phomopsis sp S6) ES2WF1 (Phomopsis sp S4) e ESFH1 (P theicola) que inibiram o crescimento das linhagens PC1396 e PC3305 de G citricarpa em trecircs metodologias avaliadas Desta forma esse estudo indica que os isolados de Phomopsis spp endoacutefitos de plantas medicinais satildeo produtores de substacircncias bioativas que devem ser melhor caracterizadas Palavras chaves Phomopsis spp endoacutefitos plantas medicinais RAPD sequumlecircncias da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
ABSTRACT Phomopsis spp ENDOPHYTES OF MEDICINAL PLANTS GENETIC DIVERSITY AND ANTAGONISM IN THE FUNGUS Guignardia citricarpa Author Renata Rodrigues Gomes Adviser Chirlei Glienke-Blanco Endophytic microorganisms live in plants without causing damage to their host being able to produce active biological compounds antibiotics fungicides and herbicides This endophytic community may be related to the antimicrobial action of medicinal plants The plant Maytenus ilicifolia known as ldquoespinheira santardquo is a medicinal plant greatly used for the treatment of stomach ulcers and digestive problems typical from the South America especially in the southern part of Brazil and currently is in danger of extinction The medicinal plants Spondias mombin Myracrodruon urundeuva Schinus terebinthifolius and Aspidosperma tomentosun have been used in medicine due to their antimicrobial properties In the present work endophytic fungi of the genus Phomopsis were isolated and their genetic variability and population structure assessed using RAPD markers The medicinal plants analyzed are colonized by a great variety of Phomopsis species with a high morphological and genetic variability both intra and interspecific The isolated fungi were identified through sequences of ITS1 58S and ITS2 regions of ribosomal DNA and tested in their antimicrobial potential against the PC1396 and PC3305 lineages of Guignardia citricarpa the responsible for the ldquoblack spot in Citrusrdquo It was possible to identify 9 isolates at the level of species through the analysis of ITS sequences of rDNA and among these isolates 4 were identified as P michaeliae 2 as P theicola 2 as P longicolla and 1 as P sojae It was possible to verify that the Maytenus ilicifolia plants analyzed are endophytically colonized by at least ten Phomopsis species and that Schinus terebinthifolius are colonized by at least six species of this genus The morphological analyses using RAPD markers and sequencing of ITS regions of rDNA make possible to suggest that the analyzed species of Phomopsis are not host-specific being necessary the redefinition of the species concept for this genus For the antimicrobial analysis all the isolates presented a high in vitro control potential of the fungus G citricarpa particularly the isolates ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ES2AB1 (Phomopsis sp S6) ES2WF1 (Phomopsis sp S4) and ESFH1 (P theicola) that inhibited the growth of the PC1396 and PC3305 lineages of G citricarpa in the three methodologies tested Thus this study indicates that the isolates of Phomopsis spp endophytic of medicinal plants are producers of bioactive substances which should be better characterized Key words Phomopsis spp endophytes medicinal plants RAPD ITS1 58S and ITS2 of rDNA sequences
LISTA DE FIGURAS
FIGURA 1- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis DE Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT 9811 e AT 9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 59
FIGURA 2- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE
Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 61
FIGURA 3- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 64
FIGURA 4- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
PATOGEcircNICOS OBTIDOS DE Glycine max EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 68
FIGURA 5- DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp EM MEIO MEA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 69
FIGURA 6- DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 70
FIGURA 7- AVALIACcedilAtildeO DAS MEacuteDIAS DO DIAcircMETRO DAS COLOcircNIAS DOS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO AV APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 71
FIGURA 8- FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis EM BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 73
FIGURA 9- FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DO ISOLADO SM9713 EM
MEIOS BDA e AV APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB
LUZ CONTIacuteNUA 74 FIGURA 10- COMPRIMENTO DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS
DE Phomopsis spp APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO EM BDA A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 75
FIGURA 11- DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE
SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 77
FIGURA 12- ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE
MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 78
FIGURA 13- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX11 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 79
FIGURA 14- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX14 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 79
FIGURA 15- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX19 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 80
FIGURA 16- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO OPE
08 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 80
FIGURA 17- DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE
SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS DE Phomopsis POR MEIO DE MARCADORES MOLECULARES RAPD 82
FIGURA 18- ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE
GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 84 FIGURA 19- AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA
REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MEacuteTODO DE PARCIMOcircMIA) 86
FIGURA 20- AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA PARCIAL BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MODELO NEIGHBOR-JOINING COM CORRECcedilAtildeO KIMURA DOIS PARAcircMETROS) 87
FIGURA 21- INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa PC1396 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA 93
FIGURA 22- INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia
citricarpa 3305 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA 96 FIGURA 23- AVALIACcedilAtildeO DO CRESCIMENTO DAS COLOcircNIAS DO
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 e PC3305 INOCULADAS APOacuteS RETIRADA DO PAPEL CELOFANE PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS EM MEIO BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 98
FIGURA 24- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 99
FIGURA 25- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 100
LISTA DE TABELAS
TABELA 1- ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR 32
TABELA 2- ISOLADOS GRUPO EXTERNO PARA ANAacuteLISE DE
VARIABILIDADE GENEacuteTICA POR RAPD 35 TABELA 3- EacutePOCAS DO ANO OacuteRGAtildeOS DA PLANTA CONDICcedilOtildeES DE
INCUBACcedilAtildeO E Nordm DE FRAGMENTOS PLAQUEADOS NAS QUATRO COLETAS DE ENDOacuteFITOS DE ESPINHEIRA-SANTA 42
TABELA 4- SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA
AMPLIFICACcedilAtildeO DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL 47
TABELA 5- SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA
AMPLIFICACcedilAtildeO DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL 49
TABELA- 6- Linhagens de Phomopsis spp E de Pestalotiopsis vismae utilizadas
como grupo externo 52 TABELA 7- PORCENTAGEM DE ISOLAMENTO DE Phomopsis
ENDOFIacuteTICOS DE PLANTAS DE ESPINHEIRA SANTA 56 TABELA 8- PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE
OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC1396 94
TABELA 9- PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE
OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 96
TABELA 10- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 101
LISTA DE ANEXOS
ANEXO 1- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM DIFERENTES MEIOS DE CULTURA 125
ANEXO 2- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO BDA 126
ANEXO 3- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO AVEIA 128
ANEXO 4- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO MEA 130
ANEXO 5- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO DOS
ESPOROS BETACONIacuteDIOS DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA 132
ANEXO 6- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 134
ANEXO 7- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 135
ANEXO 8- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 136
ANEXO 9- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 137
ANEXO 10- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS 139
ANEXO 11- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
141
ANEXO 12- MATRIZ DE DADOS PARA CARACTERIZACcedilAtildeO 143 ANEXO 13- LOCAL DA COLETA DE FOLHAS DE Schinus terebinthifolius
CENTRO POLITEacuteCNICO ndash CURITIBA PR 149
SUMAacuteRIO 1 INTRODUCcedilAtildeO 1
2 OBJETIVOS 3
3 REVISAtildeO BIBLIOGRAacuteFICA 4
31 Microrganismos Endofiacuteticos 4
32 Ocorrecircncia de endoacutefitos 7
33 Fungos endofiacuteticos de plantas medicinais 9
34 Endoacutefitos Produtores de Substacircncias Antimicrobianas 11
35 Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss 14
351 Componentes quiacutemicos e propriedades terapecircuticas 16
352 Endoacutefitos isolados de Maytenus ilicifolia 18
36 Guignardia citricarpa Kiely e a Mancha preta do citros 18
361 Mancha Preta do Citros 21
37 O Gecircnero Phomopsis sp 22
38 Marcadores Moleculares 25
381 Marcadores RAPD 27
382 Marcadores ITS 29
4 MATERIAL E MEacuteTODOS 32
41 Material Bioloacutegico 32
411 Fungos endofiacuteticos 32
412 Microrganismos usados para teste de antagonismo 35
413 Fungos endofiacuteticos utilizados para anaacutelise de variabilidade geneacutetica 35
42 Meios de Cultura 35
421 Caldo MEB (Extrato de Malte) 35
422 Meio AV (Aveia-Aacutegar) 36
423 Meio BDA (Meio Batata-Dextrose-Aacutegar) 36
424 Meio MC (Meio Completo) PONTECORVO et al 1953 37
425 Meio MEA (Extrato de Malte) PATERSON e BRIDGE 1994 37
43 Soluccedilotildees e Reagentes 38
431 Clorofane 38
432 Clorofil 38
433 Derozal Bayerreg 38
434 Dodecil Sulfato de Soacutedio (SDS) 10 38
435 Fenol Saturado 38
436 Gel de Agarose (08) 38
437 Gel de Agarose (15) 38
438 Lactofenol azul 38
439 Marcador de peso molecular (DNA de fago lambda clivado com Hind III
Gibco) 39
4310 Marcador de peso molecular (DNA Ladder 100pb Ludwing Biotec) 39
4311 Oligonucleotiacutedeos (Invitrogen) 39
4312 RNAse (invitrogen) 39
4313 Soluccedilatildeo de Vitaminas 40
4314 Soluccedilatildeo salina (pv) 40
4315 Soluccedilatildeo Tween-80 01 (vv) 40
4316 Soluccedilatildeo de Tetraciclina 40
4317 Soluccedilatildeo de EDTA 05M 40
4318 Soluccedilatildeo de brometo de etiacutedio 40
4319 Tampatildeo TE (Tris-EDTA) 41
4320 Tampatildeo de Extraccedilatildeo de DNA 41
4321 Tampatildeo da Amostra (6x) 41
4322 Tampatildeo de corrida TBE 10x 41
44 Isolamento 42
45 Conservaccedilatildeo dos fungos 43
46 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica 43
47 Obtenccedilatildeo de colocircnia monospoacuterica 44
48 Caracterizaccedilatildeo Molecular 44
481 Extraccedilatildeo do DNA (RAEDER e BRODA 1985 modificado por GLIENKE
1995) 44
482 RAPD 45
4821 Anaacutelise da Variabilidade Geneacutetica 46
483 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA 47
4831 Amplificaccedilatildeo 47
4832 Purificaccedilatildeo da PCR 48
48321 Purificaccedilatildeo com PEG 48
48322 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio 48
4833 Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento 49
4834 Purificaccedilatildeo da Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento 50
48341 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em tubos 50
48342 Purificaccedilatildeo com Purificaccedilatildeo com Isopropanol em placa 50
48343 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio 51
4835 Ediccedilatildeo e Anaacutelise das Sequumlecircncia 51
49 Avaliaccedilatildeo da Atividade Antimicrobiana 52
491 Cultura Pareada 52
492 Avaliaccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis 53
493 Atividade dos Extratos metanoacutelicos 54
4931 Obtenccedilatildeo dos extratos 54
4932 Crescimento micelial 55
410 Anaacutelise Estatiacutestica 55
5 RESULTADOS E DISCUSSAtildeO 56
51 Isolamento 56
52 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de Phomopsis 58
53 Caracterizaccedilatildeo Molecular de Phomopsis spp 78
531 RAPD 78
532 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA 85
54 Avaliaccedilatildeo da atividade antimicrobiana 92
541 Cultura pareada 92
542 Teste para detecccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis 97
543 Avaliaccedilatildeo da accedilatildeo dos Extratos 98
6 CONCLUSOtildeES 104
7 REFEREcircNCIAS BIBLIOGRAacuteFICAS 106
ANEXOS 125
1
1 INTRODUCcedilAtildeO
A bioprospecccedilatildeo visa identificar plantas e microrganismos dentre a diversidade
de vida existente em determinado local que possam servir como fonte de substacircncias
bioativas que em uacuteltima instacircncia sejam uacuteteis para o desenvolvimento de novas
drogas Neste contexto os fungos endofiacuteticos satildeo considerados de grande importacircncia
pois representam uma fonte potencial de novos compostos quiacutemicos e bioloacutegicos
podendo ser utilizados natildeo somente na Medicina mas tambeacutem na Fitopatologia e
Veterinaacuteria (STROBEL 2002 STROBEL 2003) O potencial de aplicaccedilatildeo de
microrganismos endofiacuteticos no controle bioloacutegico tambeacutem vem sendo explorado
Os microrganismos endofiacuteticos vivem no interior das plantas interagindo com
diferentes espeacutecies sem causar dano ao seu hospedeiro Esses microrganismos
podem influenciar vaacuterias caracteriacutesticas das plantas e conferir certos benefiacutecios a este
vegetal como por exemplo produccedilatildeo de antibioacuteticos Haacute alguns anos natildeo se conhecia
a grande potencialidade dos endofiacuteticos entretanto este interesse vem aumentando
com a descoberta recente de caracteriacutesticas como a produccedilatildeo de compostos
biologicamente ativos antibioacuteticos fungicidas e herbicidas
Plantas medicinais com propriedades antimicrobianas tambeacutem satildeo habitadas por
microrganismos endofiacuteticos sugerindo que a accedilatildeo antibacteriana ou antifuacutengica poderia
estar no endoacutefito e natildeo na planta ou provavelmente na sua interaccedilatildeo No Brasil vaacuterios
autores mostraram a produccedilatildeo de faacutermacos por endoacutefitos como Xylaria sp Fusarium
moniliforme Colletotrichum sp Guignardia sp e tambeacutem Phomopsis sp
Fungos do gecircnero Phomopsis satildeo encontrados como endoacutefitos nos espaccedilos
intercelulares de tecidos de diversos vegetais entre eles a espinheira-santa (Maytenus
ilicifolia Mart Reiss) planta pertencente agrave famiacutelia Celastraceae Essa planta medicinal
encontrada principalmente no sul do Brasil foi acrescentada agrave lista das espeacutecies
consideradas em extinccedilatildeo no Paranaacute pelo governo do Estado em 1995 Tendo em
vista que pouco se conhece a respeito da comunidade endofiacutetica existente nessa
planta sua diversidade e seu potencial antimicrobiano tornam-se relevantes estudos
de diversidade e bioprospecccedilatildeo
2
Pileggi (2006) demonstrou existir alta diversidade de isolados do gecircnero
Colletotrichum dentre outros fungos filamentosos bacteacuterias e actinomicetos em plantas
de Maytenus ilicifolia do pomar do Centro Nacional de Pesquisa de Florestas (CNPF)
da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaacuteria (EMBRAPAPR) Alguns desses
isolados apresentaram potencial antimicrobiano inibindo o crescimento de Fusarium
sp Guignardia citricarpa e Micrococcus luteus
Endoacutefitos com atividade antagonista contra o fungo Guignardia citricarpa agente
causal da Mancha Preta dos Citros (MPC) poderiam ser utilizados no controle bioloacutegico
desta doenccedila uma vez que o emprego sucessivo de fungicidas como controle de
doenccedilas de plantas apresenta dentre outros problemas a seleccedilatildeo de linhagens
resistentes do patoacutegeno
O gecircnero Phomopsis representa uma fonte potencial de novos compostos
quiacutemicos e bioloacutegicos como vem sendo relatado em diversos trabalhos Oito dos
isolados que foram estudados nesse trabalho jaacute haviam sido avaliados no
IOCFIOCRUZRJ e possuem potencial antimicrobiano (RODRIGUES et al 2004)
Poreacutem tais isolados ainda natildeo haviam sido caracterizados geneticamente nem
identificados em niacutevel de espeacutecie A identificaccedilatildeo e a caracterizaccedilatildeo molecular dos
microrganismos endofiacuteticos satildeo uacuteteis pois o gecircnero Phomopsis eacute de difiacutecil identificaccedilatildeo
em niacutevel de espeacutecie utilizando-se apenas caracteriacutesticas morfoloacutegicas
Estudos moleculares satildeo realizados na busca de padrotildees geneacuteticos nestes
organismos complementando sua caracterizaccedilatildeo O polimorfismo do DNA amplificado
ao acaso (RAPD) propicia uma forma raacutepida para avaliar a diversidade geneacutetica
existente nestes organismos a estruturaccedilatildeo populacional e para auxiliar na
identificaccedilatildeo ao niacutevel de espeacutecie comparando-as com linhagens referecircncia Outra
estrateacutegia importante nessa caracterizaccedilatildeo baseia-se em marcadores de Sequumlecircncias
Internas Transcritas do DNA Ribossocircmico (ITS) para identificaccedilatildeo taxonocircmica dos
isolados
3
2 OBJETIVOS
1 Isolar linhagens endofiacuteticas de Phomopsis spp de plantas sadias de Maytenus
ilicifolia e Identificar os isolados utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas
2 Caracterizaccedilatildeo de Phomopsis spp endofiacuteticos das plantas medicinais Schinus
terebinthifolius Myracrodruon urundeuva Spondias mombin Aspidosperma
tomentosum pertencentes agrave coleccedilatildeo do LABGEM
3 Avaliar a variabilidade geneacutetica e estrutura populacional das linhagens de
Phomopsis spp por meio de marcadores RAPD (Polimorfismo do DNA
Amplificado ao Acaso)
4 Identificar as linhagens por meio de sequumlecircncias da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do
DNA ribossomal
5 Testar a atividade antimicrobiana de linhagens do fungo Phomopsis spp contra
linhagens do fitopatoacutegeno Guignardia citricarpa
4
3 REVISAtildeO BIBLIOGRAacuteFICA
31 Microrganismos Endofiacuteticos
Microrganismos endofiacuteticos satildeo aqueles que vivem no interior das plantas
interagindo com outras espeacutecies de microrganismos sem causar dano ou prejuiacutezo ao
seu hospedeiro Esses microrganismos podem influenciar em vaacuterias caracteriacutesticas
expressas pelas plantas Segundo Neto Azevedo e Araujo (2002) os endoacutefitos podem
desempenhar relevante funccedilatildeo para a sanidade vegetal jaacute que atuam como agentes
controladores de microrganismos fitopatogecircnicos no controle de insetos e ateacute na
proteccedilatildeo da planta contra herbiacutevoros Todas as plantas jaacute estudadas satildeo habitadas por
microrganismos endofiacuteticos principalmente fungos e bacteacuterias
A comunidade endofiacutetica cuja composiccedilatildeo varia em funccedilatildeo do hospedeiro e das
condiccedilotildees ambientais tem indiviacuteduos que se inter-relacionam dentro da planta em um
equiliacutebrio harmocircnico O desequiliacutebrio dessa harmonia afeta o comportamento de todos
os integrantes da comunidade dando condiccedilotildees para que fungos oportunistas
manifestem seu potencial patoloacutegico contra hospedeiro (MAKI 2006)
A distinccedilatildeo entre endofiacuteticos fitopatogecircnicos e oportunistas eacute puramente
didaacutetica Haacute um gradiente tecircnue que os separa e assim agrave distacircncia entre um e outro
pode ser muito pequena sendo difiacutecil impor limites para separar cada categoria Assim
um microrganismo pode ser considerado endofiacutetico mas com a reduccedilatildeo dos
mecanismos de defesa da planta pode se comportar como um patoacutegeno (AZEVEDO et
al 2000)
A ocorrecircncia de microrganismos endofiacuteticos nos vegetais resulta da penetraccedilatildeo
atraveacutes de feridas ocasionadas nas raiacutezes pela abrasatildeo destas com o solo aberturas
naturais como hidatoacutedios e estocircmatos aberturas artificiais sofridas pela accedilatildeo de
pragas animais e o homem ou agressotildees abioacuteticas (RIBEIRO 1995) ou ainda atraveacutes
da secreccedilatildeo de enzimas hidroliacuteticas (ESPOacuteSITO e AZEVEDO 2004) A penetraccedilatildeo
pode ocorrer por meio de esporos levados pelo vento ou hifas que invadem os tecidos
Muitos endoacutefitos produzem massas de coniacutedios delgados caracteriacutestica associada com
5
a dispersatildeo por chuvas (RIBEIRO 1995) Outra forma de propagaccedilatildeo se daacute pela
transmissatildeo vertical por meio de sementes (WHITE MORGAN-JONES E MORROW
1993 CLAY 2004)
Viret e Petrini (1994) usando microscopia eletrocircnica de varredura e transmissatildeo
detectaram a presenccedila de fungos no interior dos hospedeiros Clay (1987) verificou a
presenccedila de hifas dos fungos Acremonium lolli e A coenophialum no espaccedilo
intercelular da regiatildeo meristemaacutetica no mesofilo das folhas no cerne da inflorescecircncia
na semente
Os endoacutefitos apresentam uma relaccedilatildeo mutualiacutestica antagoniacutestica ou neutra com
o hospedeiro A interaccedilatildeo de um fungo com seu hospedeiro vegetal variam e depende
do modo pelo qual o fungo infecta a planta e tambeacutem da extensatildeo da resposta de
defesa desta A colonizaccedilatildeo pode ser sistecircmica ou local inter ou intracelular (ARAUacuteJO
SILVA E AZEVEDO 2000)
Os fungos endofiacuteticos atuam no controle bioloacutegico de fitopatoacutegenos por
ocuparem o mesmo nicho ecoloacutegico destes (ARAUacuteJO SILVA E AZEVEDO 2000)
Segundo Schulz e Boyle (2005) aproximadamente 80 dos fungos endofiacuteticos
produzem compostos biologicamente ativos como antibioacuteticos fungicidas e herbicidas
Esses microrganismos endofiacuteticos podem ser utilizados como fontes de
metaboacutelitos primaacuterios (STAMFORD ARAUacuteJO E STAMFORD 1998) e secundaacuterios que
inibem o desenvolvimento de patoacutegenos (LI et al 2001 LI e STROBEL 2001 ZOU e
TAN 2001) Como exemplo pode-se citar o taxol uma droga quimioterapecircutica usada
no tratamento de cacircncer de mama e ovaacuterio (WANG et al 2000 e STROBEL et al
2003) O aacutecido coletoacutetrico um metaboacutelico do fungo endofiacutetico Colletotrichum
gloeosporioides isolado da Artemisia mongoacutelica apresenta atividade antimicrobiana
contra Bacillus subtilis Staphylococcus aureus Sarcina lutea e contra o fungo
patogecircnico Helminthosporium sativum (ZOU et al 2000) Lu et al (2000) identificaram
trecircs novos metaboacutelitos do fungo endofiacutetico Colletotrichum sp isolado de Artemisia
annua com propriedades antimicrobianas Diversos autores relatam agrave accedilatildeo
antimicrobiana de substacircncias produzidas por fungos endofiacuteticos como Rodrigues
6
Hesse e Werner (2000) Liu et al (2001) Stinson et al (2003) Bao e Lazarivits (2001)
Huang et al (2001) Strobel (2003) Rodrigues (2004) Chareprasert et al (2006)
Os microrganismos endofiacuteticos satildeo tambeacutem capazes de produzirem anti-
helmiacutenticos e inseticidas (AZEVEDO et al 2000 ESPOacuteSITO e AZEVEDO 2004)
apresentando grande potencial que pode ser explorado na agricultura (ZOU e TAN
2001)
Schulz et al (2002) isolaram mais de seis mil e quinhentos fungos endofiacuteticos de
aacutervores e herbaacuteceas na busca de novos metaboacutelitos com potencial para novos
produtos industriais e sugerem que a associaccedilatildeo entre fungos endofiacuteticos e seus
hospedeiros conduza agrave produccedilatildeo de metaboacutelitos secundaacuterios com atividade
antimicrobiana e anti-herbicida
Autores sugerem que certos fungos endofiacuteticos produzem compostos igualmente
presentes em suas plantas hospedeiras como o taxol utilizado para o tratamento de
cacircncer presente tanto na planta medicinal Taxus brevifolia como no fungo endofiacutetico
Taxomyces andreanae (STIERLE et al 1995) Outros exemplos satildeo algumas enzimas
(celulases e lignases) em Xylaria sp fatores de crescimento como giberelina em
Fuzarium moniliforme Indicando uma possiacutevel transposiccedilatildeo de genes entre plantas e
fungos em uma verdadeira engenharia geneacutetica in vivo Se esses casos forem
confirmados ficaraacute evidente que vegetais e fungos transgecircnicos podem ocorrer
naturalmente pela transferecircncia de genes entre espeacutecies pertencentes a diferentes
reinos (AZEVEDO 1998)
Rodrigues Hesse e Werner (2000) pesquisaram a atividade bioativa de extratos
de fungos endofiacuteticos isolados da planta Spondias mombin L (cajazeiro) Estes extratos
incluindo o de Phomopsis sp foram testados contra determinados microrganismos O
fungo apresentou atividade contra actinomicetos Cladosporium elatum Mycotypha sp
e S cerevisae
Aleacutem da produccedilatildeo de antimicrobianos fungos endofiacuteticos podem excluir
patoacutegenos que ocupem o mesmo nicho ecoloacutegico por competiccedilatildeo como relatado por
Bao e Lazarovits (2001) com Fusarium oxysporum f sp Lycopersici patogecircnico e
Fusarium oxysporum natildeo patogecircnico
7
Os fungos endofiacuteticos satildeo de grande importacircncia pois representam uma fonte
potencial de novos compostos quiacutemicos e bioloacutegicos podendo ser utilizados natildeo
somente na Medicina mas tambeacutem na Fitopatologia e Veterinaacuteria (STROBEL 2002
STROBEL 2003) Tendo em vista essa importacircncia vaacuterios trabalhos vecircm sendo
recentemente publicados envolvendo a capacidade de endofiacuteticos antagonizarem
fitopatoacutegenos assim como satildeo descobertos e descritos metaboacutelitos e outras
substacircncias de interesses produzidos por endofiacuteticos
3 2 Ocorrecircncia de endoacutefitos Uma diversidade de microrganismos endofiacuteticos estaacute presente no interior de
plantas aparentemente saudaacuteveis com potencial para serem estudadas A composiccedilatildeo
das espeacutecies pode variar de acordo com o hospedeiro distribuiccedilatildeo geograacutefica idade da
planta condiccedilotildees ecoloacutegicas e sazonais incluindo altitude e precipitaccedilatildeo Uma ou duas
espeacutecies satildeo predominantes como endofiacuteticas em um dado hospedeiro enquanto
outros isolados satildeo pouco frequumlentes (CARROLL 1978 ARNOLD 2003)
Petrini Stone e Carroll (1982) verificaram um padratildeo de dominacircncia de espeacutecies
em que o endoacutefito encontrado com maior frequumlecircncia em uma determinada espeacutecie
vegetal era isolado menos frequentemente de outros hospedeiros Por outro lado os
endoacutefitos encontrados com menor frequumlecircncia em uma planta pareciam ser menos
especiacuteficos pois eram isolados em um amplo espectro de hospedeiros mas com baixa
frequumlecircncia
A colonizaccedilatildeo do fungo endofiacutetico Stagonospora sp no hospedeiro Phragmites
australis ocorre de forma diferenciada no decorrer do ano Na primavera o endoacutefito eacute
encontrado somente na raiz enquanto no outono ele eacute encontrado em todo o vegetal
(ERNEST MENDGEN e WIRSEL 2003) Gao et al (2005) constataram uma flutuaccedilatildeo
sazonal para os endoacutefitos isolados de Heterosmilax japonica Kunth os autores
verificaram maior abundancia de populaccedilotildees endofiacuteticas em amostras coletadas na
primavera do que no veratildeo
8
Tanto a planta hospedeira como a regiatildeo onde os endofiacuteticos satildeo isolados pode
influenciar a produccedilatildeo de metaboacutelitos secundaacuterios De acordo com dados estatiacutesticos
Bills et al (2002) compararam a produccedilatildeo de metaboacutelitos de endofiacuteticos provenientes
de regiotildees tropicais e de regiotildees temperadas Os dados revelaram que regiotildees tropicais
satildeo mais ricas na produccedilatildeo tanto de endoacutefitos como dos metaboacutelitos secundaacuterios
A presenccedila de endoacutefitos em plantas pode variar dentro de espeacutecies de um
mesmo hospedeiro Nestes hospedeiros tambeacutem eacute encontrada uma grande variedade
geneacutetica entre isolados endofiacuteticos da mesma espeacutecie Tal variabilidade foi encontrada
em isolados do fungo Guignardia citricarpa obtidos de citros (GLIENKE 1995) em
duas espeacutecies de Colletotrichum sp isoladas de Maytenus ilicifolia (PILEGGI 2006) e
tambeacutem Pestalotiopsis sp isolados de Maytenus ilicifolia (FIGUEIREDO 2006)
O gecircnero Phomopsis tem sido frequentemente isolado como endoacutefito em uma
grande variedade de plantas
Azevedo et al (2000) apresentaram algumas plantas hospedeiras de onde jaacute
foram isoladas espeacutecies de Phomopsis entre elas Sabal bermudana Trachycarpus
fortunei Cavendishia pubescens Stylosanthes guianensis Anacardium occidentale e
Mangifera indica Corrado e Rodrigues (2004) isolaram endofiacuteticos de Phomopsis das
plantas medicinais Spondias mombin e Aspidosperma tomentosun
Bussabam et al (2001) isolaram predominantemente Phomopsis sp
Colletotrichum gloeosporiodes Glomerella sp e Xylaria sp endoacutefitos de folhas
pseudocaules e rizomas de gengibre (Amomum siamense Criab) coletadas em dois
locais na Tailacircndia
Em plantas de cacau (Theobroma cacao L) resistentes e suscetiacuteveis ao agente
causal da vassoura da bruxa endoacutefitos foram identificados por caracteriacutesticas
morfoloacutegicas e sequumlenciamento de rDNA como pertencentes aos gecircneros
Acremonium Blastomyces Botryosphaeria Cladosporium Colletotrichum
Cordyceps Diaporthe Fusarium Geotrichum Gibberella Gliocladium Lasiodiplodia
Monilochoetes Nectria Pestalotiopsis Phomopsis Pleurotus Pseudofusarium
Rhizopycnis Syncephalastrum Trichoderma Verticillium e Xylaria Os autores
identificaram ainda alguns endoacutefitos potencialmente antagonistas destacando-se
9
Gliocladium catenulatum que reduziu em 70 a incidecircncia da vassoura da bruxa in
vivo em placircntulas de cacaueiro (RUBINI et al 2005)
O gecircnero Phomopsis foi isolado como endoacutefito de graviola (Annona muricata L)
e pinha (Annona squamosa L) dois isolados promoveram eficientemente o crescimento
vegetal mostrando-se promissores para agricultura uma vez que satildeo capazes de
aumentar a produccedilatildeo dessas culturas (SILVA et al 2006) A capacidade de estimular o
crescimento vegetal apresentada por esses organismos tem sido atribuiacuteda a
mecanismos diretos tais como a fixaccedilatildeo do nitrogecircnio produccedilatildeo de fitohormocircnios e
indiretos como antagonismo em relaccedilatildeo a patoacutegenos levando consequumlentemente ao
aumento na taxa de germinaccedilatildeo crescimento das raiacutezes e parte aeacuterea nuacutemero de
folhas e flores aacuterea foliar e rendimento de culturas (SILVEIRA 2001)
Alguns dos relatos citam o gecircnero Phomopsis como fitopatoacutegeno isolado de
Citrus aurantium (Laranjeira) Citrus nobilis (Tangerineira) Citrus paradisi (Pomelo)
Citrus australis (Laranja) Citrus sinensis (Laranja da China) Citrus sp (Citros)
Mangifera indica (Mangueira) Glycine max (Soja) Ficus carica (Figueira) e Anacardium
occidentale (Cajueiro) entre muitas outras plantas (CENARGEN EMBRAPA 2005) Foi
descrito como agente causal da mancha foliar em Myracrodruon urundeuva (ANJOS
CHARCHAR e GUIMARAtildeES 2001) O fungo Phomopsis sp tambeacutem eacute encontrado
associado a sementes de Dipteryx alata e Cybistax antisyphilitica espeacutecies comuns nos
Cerrados (SANTOS 1996)
33 Fungos endofiacuteticos de plantas medicinais Os microrganismos endofiacuteticos satildeo encontrados em muitas espeacutecies de plantas
medicinais A accedilatildeo antimicrobiana de algumas dessas plantas poderiam estar
relacionadas agrave sua comunidade endofiacutetica sugere-se entatildeo que o princiacutepio ativo
antimicrobiano pode ser produzido pelo microrganismo e natildeo propriamente pelo
vegetal ou provavelmente pela interaccedilatildeo planta-hospedeiro
As plantas Aspidosperma tomentosum e Spondias mombin satildeo utilizada no
Brasil devido as suas propriedades antimicrobianas A avaliaccedilatildeo dos metaboacutelitos
10
secundaacuterios produzidos pelo fungo endofiacutetico Phomopsis sp isolado dessas plantas
demonstraram excelentes resultados na inibiccedilatildeo de bacteacuterias fungos filamentosos e
leveduras (CORRADO e RODRIGUES 2004)
Rodrigues Hesse e Werner (2000) avaliaram metaboacutelitos produzidos por fungos
endofiticos isolados de Spondias mombin Guignardia sp apresentaram atividade
contra Escherichia coli Staphylococcus aureus Saccharomyces cerevisiae Geotrichum
sp e Penicillium canadesis Metaboacutelitos de Pestalotiopsis guepinii apresentaram
atividade contra S cerevisiae Os metaboacutelitos produzidos por Phomopsis sp foram
eficientes contra Cladosporium elantum Mycotypha sp e S cerevisiae
Heterosmilax japonica Kunth eacute uma planta medicinal conhecida na China por
seus efeitos diureacuteticos Gao et al (2005) avaliaram a comunidade de fungos endofiacuteticos
e observaram uma grande variedade de fungos colonizando o interior das plantas entre
eles Phomopsis Mycospharella Aureobasidium Cladosporium Glomerella
Botryosphaeria e Guignardia
Plantas do gecircnero Taxus demonstraram atividade anticanceriacutegena assim como
isolados endofiacuteticos dessas plantas O paclitaxel e alguns de seus derivados utilizados
no tratamento de cacircncer satildeo produzidos pelo fungo endofiacutetico Taxus andreanae
isolado da planta medicinal T brevifolia (STROBEL et al 1993 STIERLE et al 1995) e
pelos fungos endofiacuteticos Sporormia minima e Trichothecium sp isolados da planta
medicinal T wallichiana (SHRESTHA et al 2001) A planta medicinal T marei de onde
foi isolado o fungo Tubercularia sp tambeacutem demonstrou atividade anticanceriacutegena
(WANG et al 2000)
O fungo Colletotrichum sp foi isolado como endoacutefito da planta medicinal
Artemisia annua utilizada pelos chineses como uma droga antimalaacuterica produziu
atividade antimicrobiana contra patoacutegenos humanos e de plantas (LU et al 2000) O
fungo endofiacutetico C gloeosporioides da espeacutecie A mongoacutelica sintetiza aacutecido coletoacutetrico
que apresenta atividade antimicrobiana (ZOU et al 2000)
11
34 Endoacutefitos Produtores de Substacircncias Antimicrobianas
A antibiose eacute definida como a interaccedilatildeo entre organismos na qual um ou mais
metaboacutelitos produzidos por um organismo tecircm efeito danoso sobre o outro (BETTIOL e
GHINI 1995) Segundo Melo (1998) muitos fungos e bacteacuterias inibem fitopatoacutegenos
competindo por nutrientes parasitando eou produzindo metaboacutelitos secundaacuterios como
enzimas liacuteticas e antibioacuteticos O resultado dessas interaccedilotildees antagocircnicas tais como
antibiose competiccedilatildeo induccedilatildeo de defesa e parasitismo leva ao controle bioloacutegico de
doenccedilas de plantas assim como pode desenvolver um papel muito importante na
medicina com a descoberta de novos faacutermacos
RODRIGUES HESSE e WERNER (2000) pesquisaram a atividade
antimicrobiana de metaboacutelitos secundaacuterios produzidos por fungos endofiacuteticos de
Spondias mombin (Anacardiaceae) contra actinomicetos bacteacuterias Gram-positivas e
Gram-negativas leveduras e fungos filamentosos e verificaram que os extratos de
Guignardia sp Phomopsis sp e Pestalotiopsis guepinii inibiram o crescimento de
actinomicetos Os extratos de Guignardia sp tambeacutem apresentaram atividade
antimicrobiana contra Escherichia coli Staphylococcus aureus Saccharomyces
cerevisiae Geotrichum sp e Penicillium canadensis Metaboacutelitos de P guepinii foram
ativos contra S cerevisae e os isolados de Phomopsis sp mostraram accedilatildeo antifuacutengica
contra Cladosporium elatum Mycotypha sp e S cerevisae
Liu et al (2001) estudaram a atividade antifuacutengica de fungos endofiacuteticos isolados
de Artemisia annua sobre os fitopatoacutegenos Gaeumannomyces graminis Fusarium
graminearum Rhizoctnia cerealis Phytophthora capsici helminthosporium sativum e
Gerlachia nivalis encontrando isolados com accedilatildeo inibitoacuteria para todos os patoacutegenos Lu
et al (2000) estudando a mesma planta constataram atividade de trecircs novos
metaboacutelitos produzidos pelo fungo Colletotrichum sp apresentando atividade
antifuacutengica contra Bacillus subtilis Sataphylococcus aureus Sarcina lutea
Pseudomonas sp Candida albicans Aspergillus niger e inibiccedilatildeo de crescimento dos
fungos patogecircnicos Gaeumannomyces graminis var tritici Rhizoctonia cerealis
Helminthosporium sativum e Phytophora capisici
12
A Cinnamomum zeylnicum (canela) eacute uma planta utilizada no tratamento de
uacutelceras estomacais hipertensatildeo arterial resfriados e dores abdominais Ezra e Strobel
(2003) isolaram dessa planta o fungo Muscodor albus que apresenta accedilatildeo fungicida
fungistaacutetica bactericida e bacteriostaacutetica por emissatildeo de compostos orgacircnicos volaacuteteis
O mesmo foi relatado para o fungo Gliocladium sp da planta Eucryphia cordifolia
inibindo o crescimento dos fungos fitopatogecircnicos Pythium ultimum e Verticillum dahliae
(STINSON et al 2003)
Citocalasinas satildeo metaboacutelitos fuacutengicos relacionados pela estrutura e atividade
bioloacutegica com capacidade antitumoral e atividade antibioacutetica Estas substacircncias
apresentam efeitos que incluem a inibiccedilatildeo da divisatildeo do citoplasma e dos movimentos
celulares induccedilatildeo do deslocamento nuclear retraccedilatildeo de coaacutegulos e agregaccedilatildeo de
plaquetas transporte de glucose e secreccedilatildeo da tireoacuteide Recentemente trecircs novas
citocalasinas foram relatadas como provenientes do fungo endofiacutetico Rhinocladiella sp
de Tripterygium wilfordii (WAGENAAR et al 2000)
Li e Strobel (2001) purificaram duas ciclohexenonas produzidas pelo fungo
endofiacutetico Pestalotiopsis jesteri isolado da planta Fragraea bodenii (Gentianaceae) a
jesterona e a hidroxil-jesterona das quais a primeira apresentou atividade antifuacutengica
contra o patoacutegeno Pythium ultimum Outro metaboacutelito isoldado de P microspora
isolado endofiticamente da planta Terminalia morobensis a isopestacina
(isobenzofuranona) tambeacutem se mostrou ativo contra Pythium ultimum entre outros
fungos como Sclerotinia sclerotiorum e Rhizoctonia (STROBEL et al 2002)
Adicionalmente a isopestacina apresentou atividade antioxidante contra uma variedade
de radicais livres testados
A Monstera sp eacute uma planta que cresce sobre o tronco de aacutervores dela foi
isolado o endoacutefito Streptomyces sp MSU-2110 na Amazocircnia Peruana Este
actinomiceto produz um peptiacutedeo denominado coronamicina com atividade
antimicrobiana contra o fungo patogecircnico Cryptococcus neoformans e agrave bacteacuteria
Streptococcus pneumoniae mas a melhor atividade foi a demonstrada contra
protozoaacuterio Plasmodium falciparum sugerindo potencialidade como uma droga
13
antimalaacuterica Aleacutem da coronamicina este endoacutefito tambeacutem produz outros compostos
com atividades antifuacutengicas (EZRA et al 2004)
Castillo et al (2002) isolaram e caracterizaram um antibioacutetico de largo espectro
a munumbicina produzida por uma outra linhagem endofiacutetica de Streptomyces
denominada NRRL 30562 isolada da planta medicinal Kennedia nigriscans nativa do
Norte da Austraacutelia O extrato do endoacutefito obtido com solvente orgacircnico foi purificado e
submetido a HPLC (Cromatografia Liacutequida de Alta Eficiecircncia) Os quatro componentes
principais resultantes foram denominados munumbicinas A B C e D Estes compostos
demonstraram em geral atividade contra bacteacuterias Gram positivas como Bacillus
anthracis e Mycobacterium tuberculosis multi-resistente A munumbicina B inibiu
Staphylococcus aureus resistente a meticilina (MRSA) enquanto a munumbicina D
apresentou atividade contra o parasita da malaacuteria Plasmodium falciparum O extrato da
linhagem de Streptomyces foi testado ainda contra vaacuterios patoacutegenos de plantas
apresentando atividade contra Pythium ultimum Phytophthora infestans Sclerotinia
sclerotiorum Erwinia carotovora Cochliobolus carbonum e Penicillium sp mostrando o
grande potencial destas novas substacircncias para a medicina e agricultura
O aacutecido coletotricum produzido pelo fungo Colletotrichum gloeosporioides
(Penz) Penz amp Sacc isolado da planta medicinal Artemiacutesia mongolica apresentou
inibiccedilatildeo do crescimento de Bacillus subtilis Staphylococcus aureus e Sarcina lutea e
atividade antifuacutengica contra o patoacutegeno Helminthosporium sativum (ZOU et al 2000)
Corrado e Rodrigues (2004) observaram a atividade bactericida de linhagens do
fungo endofiacutetico Phomopsis sp isolado das folhas de Aspidosperma tomentosum e
peciacuteolos da planta medicinal Spondias mombin Todos os extratos avaliados inibiram o
crescimento de bacteacuterias fungos filamentosos e leveduras testadas mostrando o
grande potencial deste fungo como fonte de produtos bioativos
Chareprasert et al (2006) isolaram fungos endofiacuteticos de Tectona grandis e de
Samanea saman e testaram sua capacidade antimicrobiana Dentre os isolados
testados Phomopsis foi o gecircnero dominante produzindo substacircncias inibidoras contra
Bacillus subtilis S aureus E coli e Candida albicans
14
Aleacutem da capacidade antimicrobiana fungos endofiacuteticos mostram-se importantes
com um grande potencial antitumoral e com habilidade em inibir enzimas sugerindo
que podem representar uma estimada fonte para uso terapecircutico
Rodrigues et al (2005) verificaram que fungos endofiacuteticos possuem a
capacidade de inibir colinesterase dentre eles linhagens de Phomopsis sp Entretanto
o melhor resultado foi obtido com extratos de Penicillium indicando que estes podem
ter aplicaccedilotildees farmacecircuticas
Huang et al (2001) testaram agrave accedilatildeo de fungos endofiacuteticos isolados de plantas
medicinais frente a outros fungos e tumores Os resultados indicaram que esses fungos
satildeo importantes em medicina como agentes antimicrobianos e antitumorais
Silva et al (2005) isolaram dois novos metaboacutelitos de Phomopsis cassiae
endofiacutetico de Cassia specatabilis as substacircncias 24-diidroxi-56-dimetil benzoato de
etila e phomopsilactona que exibiram forte atividade antifuacutengica contra fitopatoacutegenos
bem como citotoxicidade contra a linhagem celular de tumor cervical humano (HeLa)
Outros fungos como o Gliocladium sp da planta Eucryphia cordifolia tambeacutem possuem
atividade contra fungos fitopatogecircnicos (STINSON et al 2003 STROBEL 2003)
Em 2001 Rodrigues-Heerklotz et al elucidaram a estrutura quiacutemica e a siacutentese
assimeacutetrica de um novo metaboacutelito o aacutecido guignardico produzido pelo fungo endofiacutetico
Guignardia sp isolados de Spondias mombin
Satildeo vaacuterios os relatos de fungos endofiticos produtores de substacircncias
antimicrobianas inclusive isolados de plantas medicinais Esses microrganismos tem
se mostrado como uma fonte promissora de agentes bioativos antitumorais e
antifuacutengicos
35 Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss
A planta Maytenus ilicifolia Mart Ex Reiss pertence agrave classe Magnoliopsida
ordem Celastrales e famiacutelia Celastraceae a qual compreende 50 gecircneros e cerca de
800 espeacutecies (CRONQUIST 1981) Conhecida popularmente nos diferentes paiacuteses da
Ameacuterica do Sul pode receber diferentes denominaccedilotildees congorosa quebrachillo e
15
capororoca na Argentina (GONZALEZ LOMBARDO e VALLARINO 1937) espinheira-
divina cancorosa cancerosa cancrosa sombra-de-touro no Uruguai (SIMOtildeES et al
1986 ALICE et al 1995) coromilho-do-campo e salva-vidas (CARLINI e BRAZ 1988)
espinheira santa espinheira-divina erva-cancrosa e erva-santa (CARVALHO-OKANO
1992) cancorosa-de-Deus limatildeozinho maiteno marteno pau-joseacute salva-vidas
sombra-de-touro no Brasil (BITTENCOURT 2000)
Eacute descrita como uma aacutervore perene de porte arboacutereo-arbustivo encontrada na
mata de clima subtropical e temperado presente em sub-bosques das florestas de
Araucaacuteria nas margens de rios e em regiotildees de estepes Pode se propagar usualmente
por sementes (TAYLOR-ROSA e BARROS 1994) ou estacas de galho Preferindo
climas mais amenos ocorrendo espontaneamente ou por meio de cultivo A colheita
das folhas pode ser feita em qualquer eacutepoca do ano (PANIZZA 1998) Eacute nativa da
Ameacuterica do Sul encontrada no leste da Argentina Paraguai Boliacutevia com menor
intensidade no Chile e Uruguai No Brasil eacute predominante nos estados do Sul
(CARVALHO-OKANO 1992)
Maytenus ilicifolia eacute um arbusto de ocorrecircncia natural da Floresta Ombroacutefila Mista
(Floresta com Araucaacuteria) (BITTENCOURT 2001) Muitas vezes essa planta eacute
encontrada em ambientes ciliares e nos agrupamentos arboacutereos (capotildees) na regiatildeo de
predomiacutenio das estepes (CERVI et al 1989)
Esta planta eacute descrita como um subarbusto ou aacutervore ramificado desde a base
medindo ateacute 50 m de altura Ramos novos glabros angulosos tetra ou multicarenados
Peciacuteolo com 02-05 cm de comprimento A folha apresenta a margem inteira ou com
espinhos em nuacutemero de um a vaacuterios distribuiacutedos regular e irregularmente no bordo
geralmente concentrados na metade apical de um ou de ambos os semilimbos o limbo
com aproximadamente 22 a 89 cm de comprimento e 11 a 30 cm de largura e
nervuras na face abaxial Fruto caacutepsula bivalvar orbicular pericarpo maduro de
coloraccedilatildeo vermelho-alaranjada A presenccedila de disco nectariacutefero eacute um recurso a mais
para atrair os pequenos polinizadores como himenoacutepteros e formigas formando um
conjunto neacutectar-poacutelen interessante para a polinizaccedilatildeo uma vez que as flores satildeo
pequenas brancas e pouco vistosas O florescimento ocorre entre os meses de
16
setembro a outubro enquanto os frutos surgem entre outubro e fevereiro (CARVALHO-
OKANO 1992 RAMDOMSKI 1998 BITTENCOURT 2000)
A fragmentaccedilatildeo da Floresta com araucaacuterias nas uacuteltimas deacutecadas juntamente
com a comprovaccedilatildeo terapecircutica contra males gaacutestricos e o uso em larga escala
causaram grande devastaccedilatildeo de populaccedilotildees naturais de Maytenus ilicifolia
(BITTENCOURT 2001)
351 Componentes quiacutemicos e propriedades terapecircuticas Plantas sempre foram usadas como fonte terapecircutica na medicina tanto em
remeacutedios tradicionais quanto em produtos industrializados A planta Maytenus ilicifolia
Mart eacute geralmente utilizada na medicina popular brasileira As folhas secas desta
planta satildeo usadas como uma infusatildeo para aliviar dores de estocircmago e naacuteuseas e no
tratamento de uacutelceras e gastrites (CAMPAROTO et al 2002) Vaacuterios compostos
isolados de M ilicifolia foram descritos apresentando accedilatildeo antitumoral tambeacutem usado
como analgeacutesico antinflamatoacuterio e antiaacutecido (JORGE 2004)
Esta espeacutecie tem uso popular em comunidades tradicionais e povos indiacutegenas no
Brasil (BITTENCOURT 2001) No Paraguai e Boliacutevia tribos indiacutegenas e populaccedilotildees
rurais a utilizam como substacircncia controladora da fertilidade (CORDEIRO VILEGAS e
LANCcedilAS 1999) e no Paraguai e Argentina eacute usada como contraceptiva e abortiva
(MONTANARI CARVALHO e DOLDER 1998) Citada tambeacutem com uso no tratamento
de febres palustres (MEIRA PENNA 1946) afecccedilotildees pruriginosas cutacircneas
(COIMBRA 1958) dispepsias (CRUZ 1965) Inflamaccedilotildees ulceras e gaacutestricas (JORGE
2004)
As propriedades terapecircuticas de Maytenus ilicifolia foram atribuiacutedas agrave produccedilatildeo
de compostos terpecircnicos como maitenina e pristimerina tanto pelas raiacutezes (LIMA et al
1971 ITOKAWA et al 1991) como em ramos de folhas (JORGE et al 2004) Assim
como fenoacuteis taninos gaacutelicos (CAMPAROTO et al 2002) flavonoacuteides e outros
compostos (SILVA et al 1991 LEITE et al 2001)
17
Jorge et al (2004) avaliaram a eficaacutecia de extratos de M ilicifolia como
antinflamatoacuterio na proteccedilatildeo contra lesotildees gaacutestricas incluindo a cicatrizaccedilatildeo e
citoproteccedilatildeo sugerindo que os extratos de Maytenus ilicifolia podem representar uma
importante alternativa cliacutenica em antinflamatoacuterios e antiulcerogecircnico
Souza-Formigoni et al (1991) avaliaram a potencialidade dos efeitos
antiulcerogecircnicos das folhas de espinheira santa em experimentos realizados em ratos
com ulceras O uso de chaacute tanto por via oral como intraperitoneal mostrou resultados
semelhantes agrave droga cicatrizante cimetidina M ilicifolia assim como outras espeacutecies da
famiacutelia Celastraceae foram investigadas quanto aos seus constituintes de accedilatildeo
citotoacutexica sendo isolados triterpenos aromaacuteticos de accedilatildeo antitumoral Segundo Itokawa
et al (1991 1993) e Shirota et al (1994) os triterpenos satildeo capazes de estimular
fatores atuantes na proteccedilatildeo da mucosa gaacutestrica como a produccedilatildeo de muco e
prostaglandinas
A cimetidina eacute um potente agente na supressatildeo de aacutecido gaacutestrico e pepsina ela
age como antagonista competitivo da histamina nos receptores H2 das ceacutelulas parietais
gaacutestricas produtoras de aacutecido dessa forma bloqueia a secreccedilatildeo aacutecida (SOUZA-
FORMIGONI et al 1991) Ferreira et al (2004) investigaram o efeito e possiacutevel
mecanismo de accedilatildeo do extrato aquoso liofilizado de M ilicifolia sobre a secreccedilatildeo de
aacutecidos em mucosa gaacutestrica de sapos Foi observada uma reduccedilatildeo de 16 da secreccedilatildeo
aacutecida sugerindo os autores que essa reduccedilatildeo ocorra devido a uma atividade
antagoniacutestica dos extratos nos receptores de H2 de histidina
Montanari Carvalho e Dolder (1998) analisaram os efeitos de extratos
etanoacutelicos de M ilicifolia na espermatogecircnese de camundongos e natildeo encontraram
qualquer defeito ou distuacuterbio Poreacutem Montanari e Bevilacqua (2002) em estudos com
fecircmeas de ratos constataram uma diminuiccedilatildeo significativa na implantaccedilatildeo dos embriotildees
com a utilizaccedilatildeo de extrato liofilizado das folhas
18
352 Endoacutefitos isolados de Maytenus ilicifolia
Pileggi (2006) isolou microrganismos endofiacuteticos de folhas peciacuteolos e sementes
de Maytenus ilicifolia e investigou o potencial farmacoloacutegico dos mesmos Foram
isolados em maior frequumlecircncia os fungos Alternaria sp Colletotricum sp Bipolaris sp
Phyllosticta sp e Cladosporium sp Entre os fungos e bacteacuterias testados 15
apresentaram potencial para o controle bioloacutegico Na anaacutelise de caracterizaccedilatildeo
morfoloacutegica por RAPD foi sugerida a presenccedila de duas espeacutecies de Coletotricum
isolados de Maytenus ilicifolia
Figueiredo (2006) isolou de Maytenus ilicifolia fungos endofiacuteticos e os avaliou
quanto ao potencial antimicrobiano contra bacteacuterias patogecircnicas em humanos e o fungo
fitopatogecircnico Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta do Citros Os
extratos metanoacutelicos de dois isolados exibiram accedilatildeo fungistaacutetica na germinaccedilatildeo e no
crescimento micelial de G citricarpa Dois extratos de Pestalotiopsis sp inibiram o
crescimento dos microrganismos-teste (S aureus oxalino resistente Klebsiella
pneumoniae Micrococcus luteus Staphylococcus aureus e Escherichia coli)
Bacteacuterias com potencial anti-leucemico foram isoladas de Maytenus essas
bacteacuterias interagem com as plantas na produccedilatildeo de alguns metaboacutelitos como a
maytensina substancia que tambeacutem apresenta propriedades antifuacutengicas
Azevedo et al (2000) relataram a presenccedila de bacteacuterias endofiacuteticas em folhas de
Maytenus aquifolium Foram isolados vinte gecircneros os mais frequumlentes foram Bacillus
Clavibacter e Streptomyces aleacutem de actinomicetos Testes preliminares mostraram que
algumas das bacteacuterias podem produzir ansamacroliacutedeos que tambeacutem satildeo produzidos
pela planta hospedeira
36 Guignardia citricarpa Kiely e a Mancha preta do citros
O gecircnero Guignardia foi descrito em 1982 por Viala e Ravaz e compreende as
formas teleomoacuterficas de espeacutecies de Phyllosticta e de alguns outros gecircneros
19
relacionados de fungos imperfeitos geralmente saproacutefitas ou semiparasitas de folhas
(SIVANESAN 1984)
Diversos autores isolaram espeacutecies de Phyllosticta de plantas aparentemente
sadias descrevendo-as como endofiacuteticas (CARROLL e CARROLL 1978 PETRINI
1986 LEUCHTMANN et al 1992 GLIENKE 1995 PENNA 2000) No entanto existe
um grande nuacutemero de relatos citando este gecircnero como fitopatogecircnico de diversas
culturas com grande importacircncia econocircmica como arroz (SUGHA SINGH E SHARMA
1986) cana-de-accediluacutecar (PONS 1990) tabaco (PATEL et al 1988) e eucalipto (CROUS
et al 1993) e tambeacutem frutiacuteferas como abacate e tomate (BAKER 1938) manga e
mamatildeo (McMILLAN JR 1986) uva (IBRAHIM e BAYCA 1989) e principalmente em
citros (McONIE 1964a 1964b HERBERT e GRECH 1985 JOHNSTON e
FULLERTON 1988)
O fungo Guignardia citricarpa Kiely (anamorfo Phyllosticta citricarpa (McALP)
Van Der Aa) eacute um Ascomiceto da ordem Dothideales famiacutelia Dothideaceae Possui
estroma plectenquimatoso pseudoteacutecio globoso a subgloboso medindo 125 a 360 μm
de diacircmetro contendo um poro de 14 a 16 μm e paredes espessas com 20 a 22 μm
Seu asco apresenta forma de clava arredondado na extremidade superior e eacute
bitunicado Conteacutem oito ascoacutesporos unicelulares hialinos ligeiramente cinzentos
romboacuteides contendo gracircnulos e um grande vacuacuteolo central Os ascoacutesporos satildeo
cobertos com um quepe gelatinoso nas extremidades Segundo Sivanesam (1984)
pseudoparaacutefises satildeo encontradas em pseudoteacutecios maduros De acordo com Johnston
e Fullerton (1988) as formas anamorfas e teleomorfa geralmente satildeo encontradas
associadas
As estruturas de frutificaccedilatildeo satildeo os picniacutedios que macroscopicamente satildeo
pequenos globosos pretos e semi-eruptivos A fase sexuada corresponde agrave produccedilatildeo
de ascoacutesporos os quais se encontram em nuacutemero de oito no interior dos ascos Estes
apresentam forma de clava satildeo arredondados na extremidade superior e bitunicados
Os ascoacutesporos satildeo unicelulares hialinos levemente acinzentados romboacuteides
contendo gracircnulos e um grande vacuacuteolo central cobertos com um quepe gelatinoso nas
extremidades (SIVANESAN 1984)
20
Fialho (2004) avaliou in vitro o potencial de linhagens de S cerevisiae como
agentes no controle bioloacutegico contra G citricarpa nos frutos poacutes-colheita Rodrigues
(2006) avaliou o efeito dos principais fungicidas utilizados no campo para o controle da
doenccedila Tambeacutem avaliou 96 linhagens de fungos para a seleccedilatildeo de potenciais agentes
no controle bioloacutegico demonstrando que algumas espeacutecies de Trichoderma satildeo
capazes de atuar in vitro como biocontroladores do fitopatoacutegeno G citricarpa
Cardoso-Filho (2003) avaliou o uso de indutores de resistecircncia Saccharomyces
cerevisiae Bionreg e aacutecido saliciacutelico ao fitopatoacutegeno G citricarpa O autor destaca que os
compostos presentes no albedo (mesocarpo) da laranja como a celulose carboidratos
soluacuteveis pectinas compostos fenoacutelicos (flavonoacuteides) aminoaacutecidos e vitaminas podem
exibir a accedilatildeo antimicrobiana para o controle da MPC Neste contexto ele avaliou os
extratos produzidos pelo albedo da laranja e comprovou accedilatildeo fungicida ou fungistaacutetica
inibindo a germinaccedilatildeo esporulaccedilatildeo e crescimento micelial in vitro de G citricarpa
Blanco (1999) e Christo (2002) observaram esta variabilidade entre linhagens
isoladas de lesatildeo de Mancha Preta de Citros (MPC) ou seja linhagens de G citricarpa
utilizando dados de RAPD Esta variabilidade tambeacutem foi evidenciada em linhagens
isoladas em plantas assintomaacuteticas atualmente descritas como Guignardia mangiferae
(GLIENKE-BLANCO et al 2002 CHRISTO 2002 BAAYEN et al 2002 OKANI
NAKAGIRI e ITO 2001 RODRIGUES et al 2004)
Em 1999 Glienke-Blanco comparou geneticamente por meio de marcadores de
RAPD linhagens de populaccedilotildees patogecircnicas e endofiacuteticas de Guignardia sp de
diversas regiotildees e hospedeiros constatando a existecircncia de trecircs populaccedilotildees de
Guignardia geneticamente muito diferentes coexistindo em citros sendo duas
endofiacuteticas e uma patogecircnica sugerindo que talvez estas trecircs populaccedilotildees pudessem
pertencer a espeacutecies distintas O desenvolvimento de um par de oligonucleotiacutedeos
capaz de amplificar um fragmento de 370 pb especiacutefico para linhagens patogecircnicas de
G citricarpa veio a corroborar para distinccedilatildeo geneacutetica entre estes grupos (GLIENKE et
al 2007)
21
361 Mancha Preta do Citros
A doenccedila mancha preta dos citros (MPC) foi descrita na Austraacutelia em 1985 por
Kiely posteriormente na Aacutefrica do Sul como consequumlecircncia da importaccedilatildeo de mudas da
Austraacutelia Atualmente estaacute distribuiacuteda em regiotildees subtropicais do mundo entre elas o
Brasil (GOacuteES et al 2005)
O ciclo da doenccedila (MPC) inicia-se com a disseminaccedilatildeo dos coniacutedios ou
picnidioacutesporos (esporos assexuais) e ascoacutesporos (esporos sexuais) do fungo
Guignardia citricarpa Os coniacutedios (picnidioacutesporos) satildeo responsaacuteveis pelas infecccedilotildees agrave
curta distacircncia e estatildeo localizados no interior dos picniacutedios oriundos dos frutos
infectados Um agregado de coniacutedios emerge atraveacutes da abertura do picniacutedio (ostiacuteolo)
dissolve-se na aacutegua da chuva orvalho ou irrigaccedilatildeo e cai sobre os pequenos frutos
susceptiacuteveis que se formam apoacutes as floradas Jaacute os ascoacutesporos satildeo responsaacuteveis pela
disseminaccedilatildeo agrave curta e longa distacircncia pois satildeo lanccedilados dos periteacutecios que se
formam em folhas caiacutedas ao solo e satildeo levados por correntes aeacutereas infectando
pequenos frutos susceptiacuteveis (ROBES 1990)
Em estudo epidemioloacutegico da MPC Spoacutesito et al (2008) analisou 27270 frutos
colhidos de 303 aacutervores quanto agrave incidecircncia da doenccedila (porcentagem de frutos doentes
por aacutervore) e quanto agrave severidade da doenccedila (aacuterea com sintoma do fruto) O autor
encontrou frutos doentes em 251 aacutervores das 303 analisadas (83) com diferentes
niacuteveis de incidecircncia Algumas aacutervores tinham a maioria das frutas com lesotildees
agregadas e de alta gravidade enquanto outras tinham a maioria das frutas com
poucas lesotildees e baixa gravidade Segundo os autores quando o agente patogecircnico eacute
disperso pela aacutegua da chuva esta pode transportar muitos esporos de uma vez
formando uma lesatildeo O padratildeo de sintomas resultantes a partir deste tipo de dispersatildeo
eacute tipicamente agregada Os autores concluiacuteram que os ascoacutesporos satildeo os mais
importantes inoacuteculos de G citricarpa
A MPC caracteriza-se por apresentar lesotildees com bordas salientes e com
depressatildeo no centro onde se observam pequenos pontos pretos os picniacutedios As
lesotildees podem atingir os frutos maduros ou no iniacutecio de maturaccedilatildeo podendo aparecer
22
apoacutes a colheita no transporte e armazenamento (ROBES et al 1995) A MPC afeta
apenas a casca do fruto e o flavedo (epicarpo) sem causar dano internamente limitado
pelo albedo (mesocarpo) Poreacutem sua comercializaccedilatildeo no mercado de frutas eacute
prejudicada assim como a sua exportaccedilatildeo devido agrave barreira fitossanitaacuteria existente na
Uniatildeo Europeacuteia por ser uma doenccedila quarentenaacuteria A1 Nos casos em que a doenccedila
atinge o pedicelo do fruto pode ocorrer agrave queda prematura do fruto aumentando as
perdas na produccedilatildeo e ateacute limitando seriamente a citricultura em vaacuterios estados
brasileiros (GOacuteES et al 2005 ROBES et al 1995)
Em funccedilatildeo dos prejuiacutezos causados por G citricarpa na comercializaccedilatildeo de
frutos in natura principalmente no mercado externo satildeo crescentes os estudos que
datildeo ecircnfase ao controle bioloacutegico da doenccedila
37 O Gecircnero Phomopsis sp
O gecircnero Phomopsis descrito em 1905 por (Sacc) Bubak (RIEDL 1981) forma
picniacutedios escuros com ostiacuteolo normalmente em forma de pecircra conidioacuteforos simples
alfa coniacutedios hialinos com gotas nas extremidades predominantemente elipsoacuteides sem
septos unicelulares de forma ovoacuteide Apresenta tambeacutem beta coniacutedios hialinos sem
gotas filiformes a maioria curvos em uma das extremidades sem septos (HANLIN e
MENEZES 1996)
Outra caracteriacutestica dos fungos do gecircnero Phomopsis eacute a formaccedilatildeo de linhas
negras estreitas em tecidos de plantas contaminadas assim como no meio de cultura
em que satildeo repicados (BRAYFORD 1990)
O gecircnero Phomopsis pertence ao filo Ascomycota subfilo Pezizomycotin classe
Sordariomycetes subclasse Sordariomycetidae ordem Diaporthales famiacutelia Valsaceae
mitosporic Valsaceae Apresenta-se na forma anamoacuterfica o seu teleomorfo eacute o
Diaporthe cujo habitat eacute o caule de plantas lenhosas e herbaacuteceas (HANLIN e
MENEZES 1996)
Espeacutecies de Phomopsis satildeo comumente encontradas como patoacutegenos e
endoacutefitos de plantas (BODDY e GRIFFITH 1989) Tradicionalmente o gecircnero tem sido
23
considerado altamente patogecircnico (REHNER e UECKER 1994) mas algumas
espeacutecies de Phomopsis satildeo entretanto endoacutefitos mutualiacutesticos (WEBBER e GIBBS
1984 CARROLL 1986)
Espeacutecie de Phomopsis e Diaporthe tecircm sido tradicionalmente descritos com
base na espeacutecie hospedeira Poreacutem algumas espeacutecies e isolados podem infectar mais
de um hospedeiro (BRAYFORD 1990 FARR CASTLEBURY e ROSSMAN 2002) tal
estrateacutegia tem sido frequentemente questionada (REHNER e UECKER 1994)
Trabalhos incluindo estudos de cruzamentos mostraram que esse criteacuterio natildeo eacute
suficiente para classificaccedilatildeo ao niacutevel de espeacutecie Aleacutem disso isolados de Phomopsis
provenientes do mesmo hospedeiro natildeo necessariamente pertencem agrave mesma espeacutecie
assim como uma mesma espeacutecie de Phomopsis pode infectar diferentes hospedeiros
(REHNER e UECKER 1994)
Foram descritas mais de 1000 espeacutecies do gecircnero Phomopsis baseado
principalmente na associaccedilatildeo com o hospedeiro (UECKER 1988) Embora o
hospedeiro seja atualmente considerado menos importante na definiccedilatildeo de espeacutecies
nenhuma revisatildeo do gecircnero foi realizada A fase teleomoacuterfica (Diaporthe) foi descrita
apenas para aproximadamente 20 das espeacutecies do gecircnero Phomopsis (PHILLIPS
2006) Essa ausecircncia da fase teleomorfica (Diaporthe) em meio de cultura
(principalmente quando isolado endofiticamente) torna a identificaccedilatildeo ao niacutevel de
espeacutecie neste gecircnero muito difiacutecil (REHNER e UECKER 1994)
Wehmeyer (1933) elaborou uma revisatildeo do gecircnero Diaporthe o autor
considerou a associaccedilatildeo com o hospedeiro uma caracteriacutestica de menor importacircncia
tendo reduzido de 650 para 70 o nuacutemero de espeacutecies no gecircnero No entanto este
estudo baseou-se unicamente em caracteriacutesticas morfoloacutegicas do teleomorfo natildeo tendo
sido consideradas as caracteriacutesticas do anamorfo
A delimitaccedilatildeo de espeacutecies de Phomopsis baseado apenas em caracteriacutesticas
morfoloacutegicas demonstrou-se inadequada (VAN DER AA 1990) Em adiccedilatildeo as
caracteriacutesticas de morfologia do coniacutedio e caracteriacutesticas da colocircnia usadas para
identificar espeacutecies alguns autores tecircm utilizado caracteres alternativos que incluem
virulecircncia (VIDIC 1991) proteiacutenas e sorologia (LEE e SNOW 1992 VELICHETI et al
24
1991) sequumlecircncias ITS (ZHANG et al 1998) e enzimas e metaboacutelitos secundaacuterios
(SHIVAS ALLEN e WILLIAMSON 1991) Infelizmente nenhum caraacuteter foi aplicaacutevel
para distinguir todos os grupos de isolados (REHNER e UECKER 1994)
O entendimento sobre o gecircnero expandiu-se por meio de estudos de sequumlecircncias
ITS nos quais alguns dos isolados agruparam-se por regiotildees geograacuteficas (REHNER e
UECKER 1994) Alguns trabalhos tecircm comparado dados morfoloacutegicos com dados
moleculares principalmente o uso de sequumlecircncias da regiatildeo ITS do DNA ribossomal
Zhang et al (1998) destingiu cinco taacutexons de Phomopsis isolados de Soja (Glycine
max) utilizando sequumlecircncias da regiatildeo ITS do DNA ribossomal poreacutem natildeo foram
capazes de diferenciar-los com base nas caracteriacutesticas morfoloacutegicas Farr et al (2002)
caracterizaram por anaacutelise molecular com o uso de sequumlecircncias ITS1 58S ITS2 e por
caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de Phomopsis sp isolados de Vaccinium
corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse estudo verificaram que a maioria dos
isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma vez que as sequumlecircncias agruparam-se
com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
Castlebury e Mengistu (2006) avaliaram Phomopsis isolados de soja e outros
hospedeiros combinando dados de sequumlecircncias de ITS do DNA ribossomal o
sequumlenciamento do gene EF1-alpha e genes de actina seis grupos de Phomopsis
foram formados desses trecircs correspondem aos taacutexons P longicolla Diaporthe
melonis e D phaseolorum Os autores concluiacuteram entatildeo que agrave ausecircncia de distinccedilatildeo
morfoloacutegica e informaccedilatildeo bioloacutegica torna problemaacutetica a identificaccedilatildeo de espeacutecies aos
grupos de isolados geneticamente distintos Aleacutem disso natildeo estaacute esclarecida a
importacircncia bioloacutegica e geneacutetica dos diferentes grupos e trabalhos adicionais quanto
aos hospedeiros patogenicidade e morfologia satildeo necessaacuterios para resolver a distinccedilatildeo
de espeacutecies neste gecircnero
O gecircnero Phomopsis eacute um importante grupo de fungos com potencial
biotecnoloacutegico devido agrave produccedilatildeo de importantes metaboacutelitos secundaacuterios entre os
quais se incluem o micotoxinas que afeta o sistema nervoso de vertebrados (BILLS et
al 2002) alcaloacuteides com capacidades farmacoloacutegicas tais como phomopsins
(COCKRUM PETTERSON e EDGAR 1994) e 24-diidroxi-56-dimetil benzoato de etila
25
e phomopsilactona produzidos por Phomopsis cassiae endofiacutetico de Cassia
specatabilis (SILVA et al 2005)
38 Marcadores Moleculares
A variabilidade geneacutetica em microrganismos pode ser detectada por teacutecnicas
claacutessicas ou moleculares As teacutecnicas claacutessicas baseiam-se na anaacutelise de fenoacutetipos a
partir da caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica (produccedilatildeo de coniacutedios crescimento radial da
colocircnia) ou bioquiacutemica (produccedilatildeo de substacircncias auxotrofias) restringindo a
possibilidade de se conduzir estudos populacionais e muitas vezes de sistemaacutetica As
teacutecnicas moleculares por sua vez fornecem ferramentas para evidenciar e entender
melhor diversos aspectos relacionados direta ou indiretamente com o DNA Desta
forma a anaacutelise dos aacutecidos nucleacuteicos vem sendo amplamente utilizada na diferenciaccedilatildeo
de organismos e no esclarecimento taxonocircmico e filogeneacutetico dos organismos
estudados
Os diversos meacutetodos de detecccedilatildeo de polimorfismo geneacutetico diretamente ao niacutevel
de aacutecidos nucleacuteicos tecircm permitido a anaacutelise molecular da variabilidade do DNA
determinando pontos de referecircncia nos cromossomos tecnicamente denominados
ldquomarcadores molecularesrdquo Por marcador molecular define-se todo e qualquer fenoacutetipo
molecular oriundo de um gene expresso ou de um segmento especiacutefico de DNA
(GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Os dados moleculares frequumlentemente complementam e corroboram hipoacuteteses
baseadas em estudos morfoloacutegicos embora algumas vezes os resultados obtidos da
anaacutelise de DNA sejam conflitantes com dados de anaacutelise exclusivamente feneacuteticas
Esta contradiccedilatildeo pode ser observada principalmente na classificaccedilatildeo taxonocircmica de
microrganismos (SAMUELES e SEIFERT 1995)
Algumas teacutecnicas moleculares utilizadas principalmente em fungos para a
detecccedilatildeo do polimorfismo geneacutetico de sequumlecircncias de DNA satildeo Eletroforese em Campo
Pulsado (PFGE) Polimorfismos dos fragmentos de Restriccedilatildeo (RFLPs) Polimorfismos
26
do DNA Amplificados ao Acaso (RAPDs) Sequumlenciamento das Regiotildees Internas
Transcritas (ITS1 e ITS2) do DNA ribossocircmico (rDNA)
Aleacutem de avaliarem a variabilidade geneacutetica estes marcadores moleculares
podem determinar relaccedilotildees filogeneacuteticas como tambeacutem colaborar na identificaccedilatildeo de
um determinado isolado Tais marcadores podem ser gerados independentemente do
fenoacutetipo e revelar polimorfismos altamente informativos em sequumlecircncias de DNA
A teacutecnica de RFLP surgiu a partir da descoberta de que os siacutetios para enzimas
de restriccedilatildeo poderiam ser polimoacuterficos ou seja alteraccedilotildees em um uacutenico par de bases
que muitas vezes satildeo neutras poderiam ser detectadas pela presenccedila ou ausecircncia
destes siacutetios para endonucleases Esta teacutecnica propiciou a introduccedilatildeo de um elevado
nuacutemero de marcadores moleculares nas anaacutelises de variabilidade geneacutetica (ALBERTS
et al 2004) Dentre as inuacutemeras aplicaccedilotildees dos marcadores RFLP pode-se citar o
estudo da evoluccedilatildeo dos genomas a identificaccedilatildeo de genes especiacuteficos o estudo de
geneacutetica de populaccedilotildees a taxonomia e obtenccedilatildeo de mapas geneacuteticos (MICHELEMORE
e HULBERT 1987) Entretanto seu uso torna-se limitado pois eacute necessaacuterio DNA de
alta qualidade e em grande quantidade (GLIENKE 1995)
O uso do DNA ribossomal (rDNA) como marcador molecular tambeacutem pode ser
empregado na anaacutelise da variabilidade geneacutetica para uma ampla faixa de niacuteveis
taxonocircmicos As sequumlecircncias codificantes do rDNA evoluem muito lentamente e satildeo
altamente conservadas possibilitando a sua utilizaccedilatildeo em estudos com organismos
pouco relacionados taxonomicamente Ao contraacuterio do rDNA as regiotildees espaccediladoras
internas destes genes conhecidas como ITS evoluem rapidamente apresentando alto
polimorfismo e sendo desta forma de grande interesse nos estudos filogeneacuteticos de
gecircneros espeacutecies e populaccedilotildees (WHITE e MORROW 1990)
A reaccedilatildeo em cadeia da polimerase (PCR) tornou-se uma das mais importantes e
utilizadas teacutecnicas em Biologia Molecular por apresentar rapidez baixo custo e
capacidade de amplificaccedilatildeo de pequenas quantidades de DNA (MULLIS e FALOONA
1987 WHITE e MORROW 1989)
Concebida por KARY MULLIS em meados da deacutecada de 80 a teacutecnica baseia-se
em amplificar fragmentos de sequumlecircncias de DNA com alta especificidade e fidelidade
27
utilizando oligonucleotiacutedeos especiacuteficos ou natildeo Tais oligonucleotiacutedeos delimitam a
sequumlecircncia de DNA gerando um sinal molecular que pode ser amplificado (MULLIS e
FALOONA 1987 WHITE e MORROW 1989 McPHERSON QUIRKE e TAYLOR
1991 GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
A PCR consiste em uma teacutecnica in vitro capaz de produzir muacuteltiplas coacutepias de
sequumlecircncias especificas de DNA Alterando-se as condiccedilotildees de reaccedilatildeo pode-se
amplificar cadeias simples de DNA detectar e distinguir entre genes portadores de
mutaccedilatildeo em uma uacutenica base ou proporcionar quantidades suficientes de DNA para
anaacutelise eou manipulaccedilatildeo subsequumlente (WALKER e RAPLEY 1999)
Uma das limitaccedilotildees da teacutecnica PCR eacute a necessidade do conhecimento preacutevio da
sequumlecircncia que flanqueia o segmento a ser amplificado para que os oligonucleotiacutedeos
possam ser construiacutedos (WATSON et al 1992 ALBERTS et al 2004) A teacutecnica de
RAPD entretanto natildeo apresenta este obstaacuteculo pois segundo Williams et al (1990)
esta teacutecnica baseia-se na amplificaccedilatildeo de segmentos de DNA por um uacutenico
oligonucleotiacutedeo de sequumlecircncia arbitraacuteria que amplifica vaacuterias regiotildees simultaneamente
381 Marcadores RAPD
O RAPD (polimorfismo do DNA amplificado ao acaso) envolve a utilizaccedilatildeo de
oligonucleotiacutedeos de sequumlecircncia arbitraacuteria que amplificam vaacuterias regiotildees do genoma
simultaneamente (WILLIAMS et al 1990 WELSH E MCCLELLAND 1990
VILARINHOS et al 1995 FUNGARO et al 1996 ALZATE-MARIN et al 1997
ABBASI et al 1999 PAAVANEM-HUHTALA AVIKAINEM e YLI-MATTILA 2000)
Dessa forma natildeo eacute necessaacuterio o desenvolvimento preacutevio de uma biblioteca de sondas
especiacuteficas para o organismo de interesse
A teacutecnica de RAPD utiliza o mesmo princiacutepio da PCR (SAIKI et al 1985) A
principal diferenccedila entre a PCR usual e o RAPD estaacute na reaccedilatildeo de amplificaccedilatildeo que
utiliza apenas um uacutenico oligonucleotiacutedeo com sequumlecircncia arbitraacuteria de 10 a 15 bases A
amplificaccedilatildeo somente ocorre se este oligonucleotiacutedeo for complementar a um siacutetio em
uma das fitas e complementar a um mesmo siacutetio (orientaccedilatildeo invertida) na outra fita de
28
DNA (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998) Segundo Williams et al (1993) o tamanho
ideal do oligonucleotiacutedeo para amplificaccedilatildeo de RAPD eacute em torno de dez bases
devendo seu conteuacutedo GC ser em torno de 50 a 70 e no miacutenimo de 40 Aleacutem disso
os oligonucleotiacutedeos natildeo devem conter sequumlecircncias palindrocircmicas a fim de evitar o
autopareamento
Os marcadores RAPD tecircm sido amplamente utilizados para o estudo de diversos
grupos de seres vivos A partir dos marcadores moleculares clonados e sequumlenciados
haacute a possibilidade de sintetizar oligonucleotiacutedeos especiacuteficos aumentando o seu poder
de resoluccedilatildeo (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Esses marcadores permitem caracterizar e avaliar o grau de similaridade
geneacutetica entre genoacutetipos em niacuteveis inter e intraespeciacuteficos sendo altamente sensiacuteveis
quanto diferenccedilas de ateacute um uacutenico nucleotiacutedeo entre o oligonucleotiacutedeo e o DNA molde
Permitem ainda analisar a estrutura geneacutetica de populaccedilotildees naturais populaccedilotildees de
melhoramento e bancos de germoplasma a construccedilatildeo de mapas geneacuteticos de alta
cobertura genocircmica a localizaccedilatildeo de genes de interesse econocircmico e ainda a
obtenccedilatildeo de novos marcadores para diagnoacutesticos via PCR (FUNGARO e VIEIRA 1998
FUNGARO 2000 GLIENKE-BLANCO et al 2002 ANCHORENA-MATIENZO 2002)
Diferentes niacuteveis taxonocircmicos podem ser inferidos atraveacutes de marcadores
RAPD cujos padrotildees podem apresentar-se como variaacuteveis quando polimoacuterficos e
constantes quando natildeo-polimoacuterficos
Avaliando a variabilidade geneacutetica de organismos geneticamente relacionados
diversos autores confrontaram resultados obtidos a partir de anaacutelises moleculares ao
niacutevel de proteiacutenas com os dados obtidos a partir de marcadores moleculares de DNA
Meijer Megnegneau e Linders (1994) estudando linhagens de Phomopsis subordinaria
isoladas de 23 localidades diferentes chegaram a resultados conflitantes obtidos por
RAPD e isoenzimas Os marcadores de RAPD mostraram alta similaridade entre 47
linhagens de P subordinaria isoladas de oito localidades diferentes enquanto a anaacutelise
por isoenzimas sugeriu que todas as linhagens eram idecircnticas
Jaacute Pioli et al (2003) caracterizaram por RAPD isolados do complexo
DiaporthePhomopsis coletados de soja na Argentina Eles foram separados em quatro
29
grupos (i) Diaporthe phaseolorum variedade meridionalis (ii) D phaseolorum variedade
caulivora (iii) D phaseolorum variedade sojae and (iv) Phomopsis longicolla revelando
a existecircncia de variabilidade entre isolados da mesma variedade
Fernandez e Hanlin (1996) obtiveram resultados concordantes entre a anaacutelise
molecular por RAPD e as caracteriacutesticas morfoculturais separando os isolados
coletados de soja em dois grupos Diaporthe phaseolorum e Phomopsis longicolla
Os marcadores de RAPD tambeacutem podem ser usados na anaacutelise de
recombinantes obtidos por parameiose em Beauveria bassiana (DALZOTO et al 2003)
A teacutecnica RAPD tambeacutem eacute utilizada como um meacutetodo eficiente na diferenciaccedilatildeo
de microrganismos patogecircnicos e natildeo patogecircnicos Guthirie et al (1992) e Vasconcelos
(1994) caracterizaram diferentes espeacutecies do gecircnero Colletotrichum diferenciando-as
quanto agrave sua patogenicidade
Grajal-Martin Simon e Muehlbauer (1993) conseguiram diferenciar o tipo 2 de
Fusarium oxysporum f sp pisi de trecircs outros grupos por marcadores RAPDs Da
mesma maneira isolados patogecircnicos de Fusarium oxysporum f sp dianthi que
atacam cravos puderam ser distinguidas de vaacuterios natildeo patogecircnicos por marcadores
RAPD (MANULIS et al 1993)
Blanco (1999) utilizando seis oligonucleotiacutedeos de RAPD confirmou a existecircncia
de trecircs populaccedilotildees distintas de Guignardia citricarpa coexistindo em citros sendo duas
endofiacuteticas e uma patogecircnica responsaacutevel pelas lesotildees da mancha preta nos citros
Glienke-Blanco et al (2002) utilizando sete oligonucleotiacutedeos de RAPD encontraram
alta variabilidade geneacutetica em linhagens endofiacuteticas de Guignardia citricarpa isoladas
de plantas assintomaacuteticas de citros
382 Marcadores ITS
O DNA ribossocircmico contido nas regiotildees organizadoras de nucleacuteolos (NOR) tem
sido objeto de um grande nuacutemero de estudos com diversas aplicaccedilotildees em geneacutetica
evoluccedilatildeo e melhoramento Tal interesse estaacute diretamente relacionado agrave estrutura
destas regiotildees que se encontram em locais especiacuteficos do genoma e repetidos em
30
sequumlecircncia inuacutemeras vezes A funccedilatildeo do rDNA eacute codificar as diferentes moleacuteculas de
RNA ribossocircmico (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Segundo White et al (1990) as regiotildees espaccediladoras internas do DNA
ribossomal (ITS) evoluem rapidamente apresentando alto polimorfismo ao contraacuterio
do rDNA e sendo assim essas regiotildees satildeo de grande interesse nos estudos
filogeneacuteticos em niacuteveis de gecircnero espeacutecies e populaccedilotildees Esta caracteriacutestica permite
ainda a sua utilizaccedilatildeo na obtenccedilatildeo de polimorfismos de comprimento de fragmentos
(RFLP) nos loci de rDNA O nuacutemero de coacutepias de uma determinada sequumlecircncia de
rDNA e variaccedilotildees de nucleotiacutedeos nestas sequumlecircncias tambeacutem tecircm sido utilizados em
tais estudos (FERREIRA 1994)
Orsquodonnell e Gray (1995) avaliaram a relaccedilatildeo filogeneacutetica e a variaccedilatildeo geneacutetica
dentro de 24 isolados do complexo Fusarium solani por meio da sequecircncia de rDNA e
marcador RFLP e concluiacuteram que esta espeacutecie eacute formada por espeacutecies filogeneacuteticas
distintas Utilizando a mesma teacutecnica Ouellet e Seiffert (1993) diferenciaram F
graminearum de outras 11 espeacutecies que atacam trigo aleacutem de terem permitido a
identificaccedilatildeo de diversas raccedilas desta espeacutecie provenientes de isolados
morfologicamente semelhantes
Jasalavich Ostrofskf e Jellison (2000) utilizaram os oligonucleotiacutedeos ITS1 e
ITS4 (especiacutefico para basidiomicetos) na identificaccedilatildeo de microrganismos A
amplificaccedilatildeo da regiatildeo ITS1-58S-ITS2 detectou a presenccedila de basidiomicetos em
diferentes amostras Testes complementares foram realizados no produto da
amplificaccedilatildeo por meio da teacutecnica de RFLP permitindo a identificaccedilatildeo de espeacutecie
Satoko et al (2000) e Promputtha et al (2005) utilizaram a regiatildeo ITS1 58S e
ITS2 do rDNA para identificar fungos endofiacuteticos que natildeo esporularam sendo relatados
como Phomopsis e Diaporthe (anamoacuterfico Phomopsis)
Farr Castlebury e Rossman (2002) caracterizaram por anaacutelise molecular com o
uso de sequumlecircncias ITS1 58S ITS2 e por caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de
Phomopsis sp isolados de Vaccinium corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse
estudo verificaram que a maioria dos isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma
vez que as sequumlecircncias agruparam-se com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
31
Mostert et al (2001) tambeacutem usaram anaacutelise filogeneacutetica das regiotildees 58S ITS1
e ITS2 e DNA mitocondrial para elucidar a taxonomia de espeacutecies de Phomopsis
obtidas de vinhedos Eles observaram que os fungos endofiacuteticos tratavam-se de
Diaporthe perjuncta e Phomopsis sp taacutexon 1 Jaacute os isolados patogecircnicos e com alta
virulecircncia pertenciam a espeacutecie Phomopsis viticola assim como os isolados descritos
em estudos anteriores como Phomopsis taacutexon 2 Eles tambeacutem puderam elucidar que
os isolados descritos na Austraacutelia como Phomopsis taacutexon 4 tratavam-se de Libertella
sp excluindo-o do complexo P viticola
Djaouida et al (2004) sequenciaram as regiotildees ITS1 58S e ITS2 e do gene
mitocondrial atp6 para avaliar a diversidade molecular de linhagens patogecircnicas contra
o girassol de Diaporthe helianthi (anamoacuterfico Phomopsis helianthi) isolados de
diferentes origens geograacuteficas
32
4 MATERIAL E MEacuteTODOS 41 Material Bioloacutegico 411 Fungos endofiacuteticos
Quarenta e oito isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp e um de Diaporthe sp
foram utilizados neste estudo (TABELA 1) Destes oito foram cedidos cordialmente pela
Dra Kaacutetia Rodriguez e foram isolados de Spondias mombin (Cajazeiro) Myracrodruon
urundeuva (Aroeira) e Aspidosperma tomentosum (Peroba-de-campos) e dois isolados
de Maytenus ilicifolia (Espinheira Santa) cedidos gentilmente pela Dra Socircnia Pileggi
Dezessete isolados foram obtidos de amostras de folhas de Schinus terebinthifolius
(Aroeira Vermelha) coletados em 2007 pelo MsC Jocinei Lima e fazem parte do banco
bioloacutegico do Laboratoacuterio de Geneacutetica de Microrganismos (LABGEM) da Universidade
Federal do Paranaacute Curitiba Paranaacute Vinte e um isolados de Phomopsis sp e um
isolado de Diaporthe sp foram obtidos como endoacutefitos de folhas e peciacuteolos de M
ilicifolia (espinheira santa) em quatro coletas de outubro de 2006 a julho de 2007 no
Centro Nacional de Pesquisa de Floresta (CNPF) da EMBRAPA (Empresa Brasileira de
Pesquisa Agropecuaacuteria) localizada no municiacutepio de Colombo Paranaacute Dois isolados de
Phomopsis patoacutegenos de soja foram utilizados como linhagens referecircncia (TABELA 1)
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUA)
Coacutedigo Hospedeiro Procedecircncia Isolados por SM9631 Spondias mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9713 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9638 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9714 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)MU0123 Myracrodruon urundeuva Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)AT9810 Aspidosperma Jardim Botacircnico do Dra Kaacutetia Rodriguez do
33
tomentosum Rio de JaneiroRJ IOC (FIOCRUZRJ)AT9811 A tomentosum Jardim Botacircnico do
Rio de JaneiroRJ Dra Kaacutetia Rodriguez do IOC (FIOCRUZRJ)
AT9906 A tomentosum Jardim Botacircnico do Rio de JaneiroRJ
Dra Kaacutetia Rodriguez do IOC (FIOCRUZRJ)
ES80J Maytenus ilicifolia ColomboPR Dra Socircnia A V Pileggi no LABGEMPR
ESPAC22 Maytenus ilicifolia ColomboPR Dra Socircnia A V Pileggi no LABGEMPR
A135 Schinus terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A113 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A115B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A323 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A123 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A131 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A216B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A126 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A333B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A134 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A132 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A333A S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A124 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A215A S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A116 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A334 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A321 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
ES2WF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2WC1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2KF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2NA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUACcedilAtildeO)
34
ES2AB1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESBA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESDF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFH1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFB2 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESGA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESGF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESIE1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESIA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJH1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJG1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJE1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJE2 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESKD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESRD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESSD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
PHO1 (Phomopsis longicolla)
Glycine max (L) Merr Mato Grosso Dr Aacutelvaro Almeida EMBRAPALondrina-PR
PHO19 Glycine max (L) Merr Roraima Dr Aacutelvaro Almeida EMBRAPALondrina-PR
FONTE O autor
NOTA patoacutegenos de soja
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUACcedilAtildeO)
35
412 Microrganismos usados para teste de antagonismo
Para determinar a atividade antimicrobiana dos isolados foram utilizadas as
seguintes linhagens teste G citricarpa linhagens PC1396 e PC3305 pertencentes ao
banco bioloacutegico do Laboratoacuterio de Geneacutetica de Microrganismos da Universidade
Federal do Paranaacute
413 Fungos endofiacuteticos utilizados para anaacutelise de variabilidade geneacutetica
Como grupo externo para anaacutelise de variabilidade geneacutetica por RAPD foram
utilizadas cinco linhagens de Pestalotiopsis sp (TABELA 2)
TABELA 2 ISOLADOS GRUPO EXTERNO PARA ANAacuteLISE DE VARIABILIDADE GENEacuteTICA POR RAPD
Coacutedigo Hospedeiro Procedecircncia Pestalotiopsis phothiniae Gustavia cf eliacuteptica Amazonia Pestalotiopsis neglecta voucher Muraya paniculata Amazonia Pestalotiopsis vismeae Maytenus ilicifolia Paranaacute Pestalotiopsis sp 3 Maytenus ilicifolia Paranaacute Pestalotiopsis sp 11 Maytenus ilicifolia Paranaacute FONTE O autor NOTA Isolado cedidos pelo Profordm Dr Joseacute Odair Pereira da Universidade Federal do Amazonas Isolados por Josiane Gomes Figueiredo no LABGEMPR 42 Meios de Cultura 421 Caldo MEB (Extrato de Malte)
Extrato de Malte 20g
Glicose 20g
Peptona 1g
Aacutegua destilada p1000mL
36
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
422 Meio AV (Aveia-Aacutegar) Aveia 300 g
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
A aveia foi fervida durante 30 minutos com metade do volume da aacutegua A
suspensatildeo foi filtrada com gaze Adicionou-se aacutegua para completar o volume O pH foi
ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a necessidade
Acrescentou-se o aacutegar
423 Meio BDA (Meio Batata-Dextrose-Aacutegar)
Batata 2000g
Dextrose 100g
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
As batatas foram cozidas em 500 mL de aacutegua destilada durante 20 minutos Em
seguida foram filtradas com gaze adicionou-se a dextrose ao caldo e completou-se
com aacutegua destilada para 1000 mL O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N
eou HCl 1N conforme a necessidade Acrescentou-se o aacutegar
37
424 Meio MC (Meio Completo) PONTECORVO et al 1953
NaNO3 60g
KH2PO4 15g
KCl 05g
MgSO47H2O 05g
FeSO4 002g
ZnSO4 002g
Glicose 100g
Peptona 20g
Extrato de levedura 20g
Caseiacutena hidrolisada 15g
Soluccedilatildeo de vitaminas 10mL
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
425 Meio MEA (Extrato de Malte) PATERSON e BRIDGE 1994
Extrato de Malte 20g
Glicose 20g
Peptona 1g
Agar 15g
Aacutegua destilada p1000mL
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
38
OBS Todos os meios de cultura foram autoclavados durante 20 minutos a 1 atm e
armazenados em temperatura ambiente
43 Soluccedilotildees e Reagentes 431 Clorofane ndash FenolClorofoacutermio (11)
432 Clorofil ndash ClorofoacutermioAacutelcool Isoamiacutelico (241)
433 Derozal Bayerreg - 1mg de carbendazim em 1mL de aacutegua destilada
434 Dodecil Sulfato de Soacutedio (SDS) 10 (pv) em aacutegua destilada
435 Fenol Saturado
Um volume de fenol cristalizado foi dissolvido em banho-maria a 60degC e
acrescentado um volume de tampatildeo Tris-HCl 02 M pH 80 Apoacutes agitaccedilatildeo por 30
minutos a fase aquosa foi retirada e entatildeo acrescentado um volume de tampatildeo Tris-
HCl 02 M pH 80 Este processo foi repetido ateacute atingir o pH desejado (pH 80) Em
seguida foi adicionado um volume final de 110 do tampatildeo Tris-HCl 02 M pH 80 e
estocado em frasco escuro a uma temperatura de 4degC usado apoacutes 48 horas
(SAMBROOK E MANIATS 1989)
436 Gel de Agarose 08 (pv) em Tampatildeo TBE 1x
437 Gel de Agarose15 (pv) em em Tampatildeo TBE 1x
438 Lactofenol azul Aacutecido laacutetico 200 g
Cristais de fenol 200 g
Glicerina 200 g
39
Azul de algodatildeo (Metyl Blue Difco) 005 g
Aacutegua destilada 200 mL
Os cristais de fenol foram derretidos em banho-maria Adicionaram-se os demais
componentes Depois de 24 horas filtrou-se e armazenou-se em frasco escuro
439 Marcador de peso molecular (DNA de fago lambda clivado com Hind III Gibco)
O marcador de peso molecular do DNA foi fornecido concentrado e no momento
do uso diluiu-se na proporccedilatildeo de 1 μL do marcador 1 μL do tampatildeo da amostra 4 μL
de aacutegua Milli-Q esterilizada Na corrida eletroforeacutetica foi utilizado 6 μL do marcador
4310 Marcador de peso molecular (DNA Ladder 100pb Ludwing Biotec)
O marcador de peso molecular foi fornecido concentrado e no momento do uso
diluiu-se na proporccedilatildeo de 1 μL do marcador 2 μL do tampatildeo da amostra 7 μL de aacutegua
Milli-Q autoclavada Na corrida eletroforeacutetica foram utilizados 15 μL do marcador
4311 Oligonucleotiacutedeos (Invitrogen)
Foi adicionado Tris-HCl 10 mM pH70 aos oligonucleotiacutedeos para obter uma
soluccedilatildeo estoque com 50 μM No momento do uso a soluccedilatildeo estoque foi diluiacuteda para
concentraccedilatildeo final de 4μM
4312 RNAse (invitrogen)
A soluccedilatildeo foi preparada na concentraccedilatildeo de 10 mM de Tris-HCl pH 75 e 15 mM
de NaCl Aqueceu-se a 100degC por 15 minutos e estocou-se a ndash 20degC
40
4313 Soluccedilatildeo de Vitaminas Aacutecido Nicotiacutenico 1000 mg
Aacutecido para Aminobenzoacuteico 100 mg
Biotina 02 mg
Piridoxina 500 mg
Riboflavina 1000 mg
Tiamina 500 mg
Aacutegua destilada esterilizada p 1000 mL
A soluccedilatildeo foi aquecida em banho-maria a 98degC por 15 minutos e armazenada em
frasco escuro previamente autoclavado a 4degC
4314 Soluccedilatildeo de NaCl 085 (pv) em aacutegua destilada
4315 Soluccedilatildeo Tween-80 01 (vv) em aacutegua destilada
4316 Soluccedilatildeo de Tetraciclina 5 (pv) em etanol absoluto Preparou-se a soluccedilatildeo sob
agitaccedilatildeo e estocou-se em frasco escuro a ndash 20degC
4317 Soluccedilatildeo de EDTA 05M em aacutegua destilada O pH foi ajustado para 80
adicionando-se NaOH 1N
4318 Soluccedilatildeo de brometo de etiacutedio 1 (pv) em aacutegua destilada O brometo de etiacutedio
foi dissolvido em aacutegua destilada agitou-se e estocou-se a temperatura ambiente
protegido de luz No momento do uso adicionou-se 3μL desta soluccedilatildeo a 100 mL de
tampatildeo TBE (1X)
41
4319 Tampatildeo TE (Tris-EDTA)
Tris-HCl pH 80 100 mM
EDTA pH 80 10 mM
4320 Tampatildeo de Extraccedilatildeo de DNA Tris-HCl pH 80 2000 mM
EDTA pH 80 250 mM
NaCl 2500 mM
SDS (pv) 1
O tampatildeo de Extraccedilatildeo foi preparado no momento do uso
4321 Tampatildeo da Amostra (6x)
Azul de bromofenol3 1000 mL
Glicerol 1035 mL
Aacutegua destilada p 50 mL
4322 Tampatildeo de corrida TBE 10x
Trizma base 54g
Aacutecido boacuterico 275g
EDTA 465g
Aacutegua Milli-Q p 500mL
A soluccedilatildeo foi autoclavada e estocada a temperatura ambiente No momento do
uso diluiu-se 10 vezes com aacutegua Milli-Q
42
44 Isolamento
A metodologia utilizada para o isolamento dos microrganismos endofiacuteticos foi
descrita por Petrini (1991) modificada por Glienke (1995) Os diferentes oacutergatildeos da
planta temperatura de incubaccedilatildeo nuacutemero de plantas e o de fragmentos plaqueados
estatildeo listados na tabela 3
Isolamento Eacutepoca do ano Oacutergatildeo da
planta Temperatura
de incubaccedilatildeo
Nuacutemero de Plantas
Nuacutemero de fragmentos plaqueados
1 Outubro de 2006 Folha 28deg C 20 360 2 Marccedilo de 2007 Folha 22-23deg C 30 540 3 Julho de 2007 Folha 22-23deg C 20 360 4 Julho de 2007 Peciacuteolo 22-23deg C 20 160
Total de fragmentos plaqueados 1360
FONTE O autor
Os fungos foram isolados de plantas aparentemente sadias com folhas sem
marcas arranhaduras ou ferimentos Apoacutes a coleta as folhas foram colocadas em
sacos plaacutesticos devidamente identificados em seguida as superfiacutecies das folhas foram
lavadas em aacutegua corrente com auxiacutelio de uma esponja para a remoccedilatildeo dos
microrganismos epifiacuteticos e outros contaminantes Os peciacuteolos foram vedados com
parafina derretida para evitar a entrada dos desinfetantes nos seus tecidos internos
desta forma preservando os endoacutefitos a serem isolados As folhas vedadas foram
mergulhadas em frascos com aacutegua destilada autoclavada sendo mantidos por 1
minuto em etanol 70 por 1 minuto em hipoclorito de soacutedio (NaOCl) a 3 por 6
minutos etanol 70 por 30 segundos e por uacuteltimo em aacutegua destilada autoclavada por
6 minutos Devido agrave dificuldade de isolar fungos do gecircnero Phomopsis nos isolamentos
1 e 2 foi reduzido o tempo de tratamento com hipoclorito de soacutedio para 4 minutos nos
isolamentos 3 e 4 (TABELA 3) As folhas foram cortadas em seis fragmentos de 5-7 mm
e os peciacuteolos foram cortados das folhas e oito deles foram transferidos para placas de
TABELA 3 EacutePOCAS DO ANO OacuteRGAtildeOS DA PLANTA CONDICcedilOtildeES DE INCUBACcedilAtildeO E NUacuteMERO DE FRAGMENTOS PLAQUEADOS NAS QUATRO COLETAS DE ENDOacuteFITOS DE ESPINHEIRA-SANTA
43
Petri (90 mm) contendo os meios de cultura BDA adicionados de Tetraciclina (10
mgmL) para impedir o crescimento bacteriano (ARAUJO et al 2002)
Como controle apoacutes o processo de desinfestaccedilatildeo foram inoculados 01 mL da
uacuteltima aacutegua autoclavada utilizada no tratamento em trecircs placas de Petri As placas
permaneceram incubadas nas mesmas condiccedilotildees do isolamento
45 Conservaccedilatildeo dos fungos
Os isolados foram estocados utilizando-se duas metodologias 1) em frascos
contendo meio de cultura BDA inclinado apoacutes sete dias de crescimento a 28degC foram
mantidos a 4degC realizando-se repiques mensalmente 2) em frascos contendo aacutegua
destilada esterilizada com 12 discos de 5 mm meio de cultura BDA contendo miceacutelios
Repetiu-se o procedimento a cada trecircs meses
46 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica
A caracterizaccedilatildeo macromorfoloacutegica dos isolados de Phomopsis foi realizada com
base na forma dos bordos crescimento micelial aspecto da colocircnia e a sua coloraccedilatildeo
no verso e reverso da placa em diferentes meios de cultura Discos de miceacutelio (8 mm)
provenientes de colocircnias de Phomopsis com sete dias de crescimento em meio de
cultura BDA foram inoculados no centro de placas de Petri com diferentes meios de
cultura Batata-dextrose-aacutegar (BDA) aveia-aacutegar (MAV) e extrato de malte-aacutegar (MEA)
Foram incubados durante 14 dias a 22ordmC sob luz contiacutenua Os ensaios foram
realizados em triplicata O diacircmetro das colocircnias foi medido a partir do terceiro dia de
crescimento ateacute o quinto dia quando alguns atingiram completamente as bordas da
placa de Petri
Para anaacutelise da micromorfologia foram avaliados os coniacutedios apoacutes 21 dias de
crescimento Os picniacutedios foram comprimidos entre a lacircmina e a lamiacutenula com uma
gota de lactofenol azul de algodatildeo possibilitando a observaccedilatildeo ao microscoacutepio oacuteptico
44
com aumento de 1000x O comprimento e largura dos coniacutedios foram medidos usando
uma reacutegua na objetiva com escala de 1μM
47 Obtenccedilatildeo de colocircnia monospoacuterica
Apoacutes os isolados terem sido identificados como pertencentes ao gecircnero
Phomopsis colocircnias monospoacutericas foram obtidas cultivando os isolados endofiacuteticos em
placas de Petri com meio BDA a 28degC Observou-se o crescimento da colocircnia e
monitorou-se com observaccedilatildeo em microscopia oacuteptica a produccedilatildeo de esporos Os
picniacutedios foram coletados e macerados em soluccedilatildeo de ldquoTween 80rdquo 01 A suspensatildeo
de esporos foi filtrada com seringas contendo latilde de vidro Em seguida adicionou-se 10
mL de soluccedilatildeo salina Centrifugou-se a soluccedilatildeo filtrada durante 4 minutos a 7000 rpm
Descartou-se o sobrenadante adicionou-se 400 μL de soluccedilatildeo salina para suspender o
precipitado onde ficaram contidos os esporos retirou-se 10 μL desta suspensatildeo sendo
a concentraccedilatildeo estimada em Cacircmara de Neubauer Quando necessaacuterio diluiu-se em
soluccedilatildeo salina para viabilizar a contagem dos esporos Foram semeados 100 μL de
suspensatildeo em uma placa de Petri contendo meio BDA espalhou-se com alccedila de
Drigalsky incubou-se a 28degC Colocircnias isoladas foram selecionadas e repicadas em
tubos com BDA inclinado que apoacutes crescimento por sete dias a 28ordmC foram mantidos a
4degC
48 Caracterizaccedilatildeo Molecular 481 Extraccedilatildeo do DNA (RAEDER e BRODA 1985 modificado por GLIENKE 1995)
O DNA genocircmico foi obtido de acordo com a metodologia descrita por Raeder e
Broda (1985) modificada por Glienke (1995) Os isolados endofiacuteticos de Phomopsis
foram cultivados em meio MEA durante cinco dias a 28degC O miceacutelio obtido a partir da
raspagem da colocircnia com espaacutetula esterilizada foi liofilizado e mantido em freezer ou na
45
sequumlecircncia macerados com adiccedilatildeo de nitrogecircnio liacutequido O material foi pesado e para
cada grama de miceacutelio acrescentou-se 1 mL de Tampatildeo de Extraccedilatildeo Incubou-se a
soluccedilatildeo homogeneizada durante 20 minutos em banho-maria a 70degC Acrescentou-se
um volume de fenol saturado misturaram-se as fases e centrifugou-se durante 15
minutos a 5000 rpm Coletou-se a fase aquosa colocou-se em um novo tubo e
adicionou-se a este um volume de Clorofane Centrifugou-se novamente sob as
mesmas condiccedilotildees anteriores Coletou-se a fase aquosa como na etapa anterior e
adicionou-se um volume de Clorofil repetindo-se o processo de centrifugaccedilatildeo sob as
mesmas condiccedilotildees Coletou-se a fase aquosa em um novo tubo e adicionou-se etanol
absoluto O material foi incubado a ndash 20ordmC durante uma hora Apoacutes este periacuteodo a
suspensatildeo foi centrifugada (10000 rpm por 20 min) desprezou-se o sobrenadante
Acrescentou-se 500 μL de etanol 70 centrifugou-se a 10000 rpm durante 5 minutos
descartou-se o aacutelcool 70 inverteu-se o tubo sobre uma folha de papel absorvente
para secar a borda do tubo e este secou a uma temperatura de 37degC durante 30
minutos Ressuspendeu-se o DNA com 200 μL de aacutegua milli-Q por uma hora
temperatura ambiente As amostras foram tratadas RNAse (30 μgmL) a 37degC por uma
hora
A concentraccedilatildeo de DNA foi estimada por meio de eletroforese em gel de agarose
08 utilizando como padratildeo de peso molecular o DNA do fago λ (Gibco) clivado com
HindIII com concentraccedilatildeo conhecida Apoacutes a eletroforese o gel foi corado com brometo
de etiacutedio observado sobre transiluminador de luz ultravioleta e fotodocumentado
482 RAPD
As soluccedilotildees foram realizadas de acordo com as condiccedilotildees descritas por Glienke-
Blanco et al (2002) onde foram utilizados 50ng de DNA tampatildeo PCR 1x 05U de Taq
polimerase 02mM de oligonucleotideos 02mM de dNTP 3mM de MgCl2 em um
volume final de 25microL Foi realizada uma preacutevia seleccedilatildeo usando-se os oligonucleotiacutedeos
46
da linha OPX11 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) OPX14 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) OPX19 (5rsquo
TCACCACGGT 3rsquo) e OPE 08 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) da Operon Technologiesreg
A amplificaccedilatildeo foi realizada com as condiccedilotildees descritas por Pioli et al (2003)
com modificaccedilotildees sendo cada reaccedilatildeo submetida a 40 ciclos apoacutes a desnaturaccedilatildeo
inicial a 940C por 4 minutos Cada ciclo consiste de 1 minuto a 940C 1 minuto e 30
segundos a 350C e 2 minutos a 720C
4821 Anaacutelise da Variabilidade Geneacutetica
Os produtos de amplificaccedilatildeo foram separados por eletroforese (3 Vcm) em gel
de agarose 15 e posteriormente corados por 20 minutos com soluccedilatildeo de brometo de
etiacutedio Os fragmentos amplificados foram visualizados em um transiluminador de luz
Ultravioleta e a imagem do gel documentada atraveacutes de sistema fotograacutefico Digi-doc it
O marcador de peso molecular utilizado foi o Ladder de 100 pb (Ludwing Biotec)
A anaacutelise da variabilidade geneacutetica foi realizada pelo agrupamento das linhagens
segundo os princiacutepios adotados em taxonomia numeacuterica utilizando o coeficiente de
similaridade de Jaccard que permite calcular similaridades com base em variaacuteveis
binaacuterias (0 para ausecircncia e 1 para presenccedila de banda) As bandas foram consideradas
como variaacuteveis enquanto as linhagens como unidades O coeficiente foi calculado
segundo a foacutermula J=MP onde M eacute o nuacutemero de concordacircncias positivas e P o
nuacutemero total de variaacuteveis menos concordacircncias negativas (SNEATH e SOKAL 1973)
Desta forma o coeficiente de similaridade Jaccard (J) leva em conta apenas as
discordacircncias e as concordacircncias positivas quanto agrave presenccedila ou ausecircncia de bandas
desconsiderando as concordacircncias negativas Quanto maior a semelhanccedila entre duas
linhagens maior eacute o valor de similaridade As unidades foram agrupadas atraveacutes do
meacutetodo UPGMA (Unweighted Pair-Group Method with Arithmetical Average) que eacute um
modelo de agrupamento hieraacuterquico e permite a construccedilatildeo de dendrogramas
(SNEATH e SOKAL 1973) Matrizes e dendrogramas foram elaborados usando o
software NTSYS (Numerical taxonomy system of multivariate programs) (ROHLF
1988)
47
Para verificar a consistecircncia dos agrupamentos verificados foi realizada uma
anaacutelise bootstrap segundo Felsenstein (1985) utilizando o software BOOD (COELHO
2005)
483 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
4831 Amplificaccedilatildeo
A reaccedilatildeo foi realizada com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D (TABELA 4) que
satildeo universais para fungos e permitem amplificar a regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do DNA
Ribossomal
Oligonucleotiacutedeos Sequumlecircncia
LS266 5 TTACGTCCCTGCCCTTTGTA 3
V9D 5GCATTCCCA AA C AACTCGAC 3rsquo
FONTE O autor
As condiccedilotildees da reaccedilatildeo foram realizadas de acordo com a descriccedilatildeo de White et
al (1990) com algumas modificaccedilotildees 50 ng de DNA tampatildeo PCR 1x 15U de Taq
DNA polimerase 08microM de oligonucleotiacutedeos 02mM de dNTP 3mM de MgCl2 para um
volume final de 50microL
A amplificaccedilatildeo foi realizada em um termociclador Eppendorf (Modelo
Mastercycler Gradiente) com desnaturaccedilatildeo inicial a 94degC por 2 minutos 30 ciclos de 30
segundos a 94degC 1 minuto a 56degC 1 minuto a 72degC seguida de extensatildeo final de 3
minutos a 72degC
TABELA 4 SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA AMPLIFICACcedilAtildeO DAREGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL
48
4832 Purificaccedilatildeo da PCR
Foram testadas duas metodologias de purificaccedilatildeo da reaccedilatildeo de PCR
48321 Purificaccedilatildeo com PEG
Aos produtos da amplificaccedilatildeo da PCR com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D
foram acrescentados 50microL de PEG os tubos foram incubados a 37ordmC por 30 minutos
em seguida foram centrifugados por 15 minutos a 14000rpm O sobrenadante foi
descartado com micropipeta Adicionou-se 125microL de Etanol 80 gelado apoacutes 1min os
tubos foram centrifugados por 2 min a 13000 rpm descartou-se o sobrenadante Foram
adicionados 125microL de Etanol 96 (gelado) descartou-se o sobrenadante O Etanol foi
evaporado em speed vac por 10min a 70ordmC O pellet foi ressuspendido em 15 microL de
aacutegua Milli-Q e misturado em seguida ficou agrave temperatura ambiente por pelo menos 2
horas
Para confirmaccedilatildeo da presenccedila do DNA na amostra 1microL foi submetido agrave
eletroforese em gel de agarose 15
48322 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio
Aos produtos da amplificaccedilatildeo da PCR com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D
foram acrescentados 34 microL de acetato de amocircnio (AcNH4) 75M e 100 microL de etanol
96 Os tubos ficaram em temperatura ambiente por 10 minutos e em seguida foram
centrifugados por 15 minutos a 14000rpm Os pellets resultantes foram lavados com
250 microL de etanol 70 (receacutem preparado) centrifugou-se por 15 minutos a 14000rpm e
descartou-se o etanol O pellet foi seco na estufa a 37ordmC por 30 mim e ressuspendidos
em 15microL de aacutegua Milli-Q
Para confirmaccedilatildeo da presenccedila do DNA na amostra 1microL foi submetido a
eletroforese em gel de agarose 15
49
4833 Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento
Foram realizadas trecircs reaccedilotildees de sequumlenciamento a primeira foi realizada
usando o produto tratado com PEG e nas duas posteriores usou-se o produto de PCR
tratado com acetato de amocircnia Para o restante da metodologia natildeo houve alteraccedilatildeo
O sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA foi realizado pelo
meacutetodo de terminaccedilatildeo de cadeia segundo Sanger et al (1977) utilizando a
incorporaccedilatildeo de dideoxinucleotiacutedeos fluorescentes em Sequumlenciador Automaacutetico de
DNA megaBACE
Para a reaccedilatildeo de sequumlenciamento foram utilizados cerca de 50ng da reaccedilatildeo de
PCR purificada 02 microM do oligonucleotiacutedeo ITS1 (TABELA 5) e 4microL de mistura para
sequumlecircnciamento ET (Kit ldquoDYEnamic ET Dye Terminator Cycle Sequencing Kit for
MegaBACErdquo da Amersham Biosciences) completando com aacutegua milli-Q para um
volume final de 10microL As mesmas condiccedilotildees foram aplicadas para o oligonucleotiacutedeo
ITS4 (TABELA 5)
FONTE O autor
A amplificaccedilatildeo foi realizada em um termociclador Eppendorf (Modelo
Mastercycler Gradient) seguindo uma desnaturaccedilatildeo inicial a 96degC por 1 minuto 30
ciclos de 10 segundos a 96degC 1 minuto e 5 segundos a 50degC 4 minutos a 60degC 20 min
a 8degC
Oligonucleotiacutedeos Sequumlecircncia
ITS1 5rsquoTCCGTAGGTGAACCTGCGG3rsquo
ITS4 5rsquoTCCTCCGCTTATTGATATGC3rsquo
TABELA 5 SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA AMPLIFICACcedilAtildeO DAREGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL
50
4834 Purificaccedilatildeo da Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento
Foram testadas trecircs metodologias de purificaccedilatildeo da reaccedilatildeo de sequumlenciamento
48341 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em tubos
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com PEG (item 38321) foram adicionados 40 microL de isopropanol 75
sendo precipitados por um spin down As amostras ficaram agrave temperatura ambiente por
20 minutos em seguida foram centrifugadas por 25 minutos a 13000 rpm e o
isopropanol foi removido por inversatildeo dos tubos Foram adicionados 200 microL de etanol
70 natildeo gelado e centrifugado por 5 minutos a 13000 rpm em seguida o etanol foi
removido com auxiacutelio de uma micropipeta e foi submetido a secagem em speed vac por
45 minutos a 60degC
Apoacutes esse tratamento cada amostra foi ressuspendida em 10 microL Loading
Solution e submetida agrave eletroforese em Sequumlenciador Automaacutetico de DNA modelo
megaBACE da Amersham Biosciences Com os seguintes paracircmetros voltagem de
injeccedilatildeo 2V tempo de injeccedilatildeo 80 segundos voltagem da corrida 8V por 160 minutos
48342 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em placa
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com acetato de amocircnio (item 38322) foram adicionados 40microL de
isopropanol 75 sendo precipitados por um spin down As amostras ficaram agrave
temperatura ambiente por 20 minutos e em seguida foram centrifugadas por 50
minutos a 4000 rpm O isopropanol foi removido por inversatildeo da placa Foram
adicionados 100microL de etanol 70 natildeo gelado e centrifugado por 30 minutos a 4000
rpm em seguida o etanol foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um spin a
300 rpm por 1 minuto Em seguida a placa ficou em estufa a 37degC durante 3 minutos
Apoacutes esse tratamento as amostras foram processadas como no item anterior
51
48343 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com acetato de amocircnio (item 38322) foram adicionados 1 microL de acetato
de amocircnio (AcNH4) 75M e 30 microL de etanol 96 Apoacutes a homogeneizaccedilatildeo por inversatildeo
30 vezes a placa foi centrifugada por 45 minutos a 2500 RCF a 4degC
O sobrenadante foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um spin a 500
RCF com a placa invertida sobre papel toalha O pellet foi lavado com 100 microL de etanol
70 (receacutem preparado natildeo gelado) Seguindo-se uma nova centrifugaccedilatildeo a 2500 RCF
por 45 minutos e o sobrenadante foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um
spin a 750 RCF com a placa invertida sobre papel toalha Em seguida a placa ficou em
estufa a 37degC durante 3 minutos
Apoacutes esse tratamento cada amostra foi ressuspendida e tratada como nos itens
anteriores
Todos os procedimentos desde a reaccedilatildeo de sequumlenciamento foram realizados
sob proteccedilatildeo de luz direta cobrindo a placa com papel alumiacutenio
4835 Ediccedilatildeo e Anaacutelise das Sequumlecircncias
As sequumlecircncias foram entatildeo alinhadas utilizando-se o programa CLUSTAL-W
versatildeo 17 (THOMPSON HIGGINS e GIBSON 1994) sendo realizada posterior
inspeccedilatildeo visual atraveacutes do programa BioEdit 7053 (HALL 1999) Apoacutes a ediccedilatildeo
alinhamento e anaacutelise preacutevia das sequumlecircncias estas foram submetidas ao software
MEGA 31 (KUMAR TAMURA NEI 2004) para obtenccedilatildeo das aacutervores filogeneacuteticas
baseadas em distacircncia A consistecircncia dos noacutes obtidos foi avaliada pelo procedimento
de bootstrap (FELSENSTEIN 1985) com 10000 reamostragens Foram utilizadas como
referecircncias linhagens de Phomopsis sp Diaporthe e Pestalotiopsis vismae (como
grupo externo) depositadas no GenBank (httpwwwncbinlmnihgov) (TABELA 6)
52
TABELA 6 LINHAGENS DE Phomopsis spp E DE Pestalotiopsis vismae UTILIZADAS COMO GRUPO EXTERNO
Espeacutecie Nuacutemero de acesso (GenBank)
Diaporthe Melonis AB105147 D melonis AB105148 Phomopsis longicolla AY857868 P longicolla AF000207 P camptothecae AY622996 D Phaselorum AF001024 D helianthi AJ312348 D helianthi AJ312363 D helianthi AF358441 Phomopsis sp P7 DQ235673 Phomopsis sp P3 DQ235669 P sojae AY050627 P chimonanthi AY622993 Phomopsis sp P4 DQ235670 D conorum AB201443 D conorum DQ116551 P theicola DQ286286 P theicola DQ286287 Phomopsis sp 1 AY485724 Phomopsis sp CBS DQ286285 Phomopsis sp Taxon 3 AF230762 Diaporthe AJ312359 Diaporthe AY745024 Pestalotiopsis vismae EF451801
FONTE O autor
49 Avaliaccedilatildeo da Atividade Antimicrobiana
491 Cultura Pareada
Para avaliar a atividade antimicrobiana dos 49 isolados de Phomopsis sp
endofiacuteticos (TABELA 1) contra o fitopatoacutegeno Guignardia citricarpa foi utilizado a
metodologia de Cultura Pareada (MARIANO1993) Os discos contendo miceacutelio eou
coniacutedios dos isolados endofiacuteticos ou dos fitopatoacutegenos ensaiados foram obtidos de
53
colocircnias crescidas em BDA durante sete dias a 28degC incubadas em estufa BOD e com
fotoperiacuteodo de 12 horas Apoacutes este periacuteodo foram retirados os discos da borda das
colocircnias com auxiacutelio de vazador de rolhas
Em placas de Petri contendo meio de cultura BDA colocou-se um disco (Oslash 8
mm) da cultura do fitopatoacutegeno G citricarpa Apoacutes trecircs dias de crescimento foi
adicionado no lado oposto um disco com o isolado de Phomopsis sp endofiacutetico a ser
avaliado ambos a 10 cm da borda Apoacutes o pareamento as placas foram vedadas com
filme de PVC e mantidas durante 14 dias em estufa BOD com fotoperiacuteodo de 12 h a
28degC Foi realizado um delineamento inteiramente casualizado com cinco repeticcedilotildees O
controle recebeu apenas o fitopatoacutegeno A avaliaccedilatildeo foi realizada mediante mediccedilatildeo do
diacircmetro da colocircnia comparando com o controle e observaccedilatildeo das interaccedilotildees entre as
colocircnias
Para determinar a porcentagem de inibiccedilatildeo do crescimento mediu-se o diacircmetro
das colocircnias do fitopatoacutegeno com 14 dias de crescimento subtraindo-se o diacircmetro do
inoacuteculo original Os caacutelculos foram realizados de acordo com Edginton et al (1971)
pela foacutermula
Onde Dc eacute o diacircmetro meacutedio da colocircnia do fitopatoacutegeno no controle e Dt eacute o
diacircmetro meacutedio da colocircnia do patoacutegeno nos tratamentos testados
492 Avaliaccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
Cobriu-se assepticamente toda a superfiacutecie do meio PDA inclusive nas bordas
com discos de papel celofane (Oslash11 cm) esterilizado A seguir foi inoculado no centro
sobre a superfiacutecie do papel celofane discos de aacutegar (Oslash8 mm) contendo miceacutelio do
isolado endofiacutetico As placas foram incubadas por quatro dias a temperatura de 28degC
as placas controles receberam apenas o fitopatoacutegeno incubados por 7 dias com
Dc -Dt
Dc
Porcentagem de inibiccedilatildeo (PI) = X 100
54
fotoperiacuteodo de 12 horas Mediu-se o diacircmetro da colocircnia e retirou-se o papel celofane
(juntamente com a colocircnia do isolado) Sobre a superfiacutecie de meio PDA inoculou-se um
disco de miceacutelio do fitopatoacutegeno a ser avaliado no centro da placa Foi realizado um
delineamento inteiramente casualizado com cinco repeticcedilotildees As placas foram
incubadas a 28degC com fotoperiacuteodo de 12 horas Apoacutes 7 e 14 dias mediu-se o
crescimento das colocircnias e comparou-se com o controle (ETHUR CEMBRANEL e
SILVA 2001 Adaptado por Figueiredo 2006)
493 Atividade dos Extratos Metanoacutelicos 4931 Obtenccedilatildeo dos extratos
Para avaliaccedilatildeo da atividade dos extratos metanoacutelicos foi utilizada a metodologia
descrita por Rodrigues Hesse e Werner (2000) com algumas modificaccedilotildees No
processo de fermentaccedilatildeo trecircs discos (Oslash 8 mm) dos 49 isolados endofiacuteticos de
Phomopsis (TABELA 1) foram inoculados em Erlenmeyer (250 mL) contendo 100 mL
de caldo extrato de malte Incubou-se durante 7 dias (110 rpm 28degC fotoperiacuteodo de 12
horas)
Apoacutes a fermentaccedilatildeo o miceacutelio foi separado do liacutequido fermentado por filtraccedilatildeo
em papel Whatman ndeg 4 Ao volume do filtrado obtido adicionou-se o mesmo volume
de acetato de etila (EtOAc) (Merck) em um balatildeo de separaccedilatildeo Agitou-se
vigorosamente por trecircs vezes e aguardou-se a formaccedilatildeo de duas camadas uma
aquosa na parte inferior e outra orgacircnica na parte superior Transferiu-se a fase
orgacircnica para um novo recipiente e submeteu-se a fase aquosa a mais uma extraccedilatildeo
com EtOAc Repetiu-se o procedimento por mais duas vezes Adicionou-se agrave fase
orgacircnica 5 de sulfato de soacutedio anidro e filtrou-se novamente com papel Whatman ndeg
4 Obteve-se extrato bruto seco passando a fase orgacircnica em rotaevaporador O extrato
foi pesado e diluiacutedo em metanol (10mgmL)
55
4932 Crescimento micelial
Foram obtidos discos (Oslash 12 mm) de colocircnias com 14 dias de crescimento em
meio completo da cultura do fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396 ou PC3305 Estes
foram inoculados no centro de placas de Petri contendo meio de cultura BDA A 10 cm
da borda em posiccedilatildeo oposta foi colocado um disco de papel filtro esterilizado (Oslash 5 mm)
e sobre este foram inoculados 100μL do extrato metanoacutelico a ser avaliado As placas
foram fechadas com filme de PVC e mantidas a 28degC fotoperiacuteodo de 12 horas em
BOD Avaliou-se o potencial de inibiccedilatildeo medindo-se o diacircmetro das colocircnias apoacutes sete
dias de crescimento comparando-se com o controle negativo onde foi inoculado aacutegua
destilada autoclavada ou metanol Como controle positivo foi utilizado fungicida Derosal reg (10 mgmL) (QUIROGA SAMPIETRO e VATTUONE 2001 adaptado por
FIGUEIREDO 2006)
410 Anaacutelise Estatiacutestica
Todos os experimentos foram realizados com delineamento inteiramente
casualizado (DIC) com 5 repeticcedilotildees As anaacutelises de variacircncia foram realizadas em
todas as etapas do trabalho Sempre que foi encontrado um valor significativo em
relaccedilatildeo ao teste F completou-se a anaacutelise com teste de Tukey para comparaccedilatildeo das
meacutedias utilizando software ASSISTAT (SILVA 1996 e SILVA 2002) ou o teste de Scott
Knott utilizando software SISVAR (FERREIRA 1994)
56
5 Resultados e Discussatildeo
51 Isolamento
Foram isolados 1005 endoacutefitos de folhas e peciacuteolos de 30 plantas de Espinheira
Santa (M ilicifolia) Destes 21 foram identificados a partir de anaacutelise em microscopia
oacuteptica como pertencentes ao gecircnero Phomopsis A tabela 7 compara os resultados
obtidos quanto agrave proporccedilatildeo de isolamento de Phomopsis sobre os diferentes tecidos da
planta nos quatro isolamentos realizados A frequumlecircncia dos isolamentos foi calculada
de acordo com Souza et al (2004)
TABELA 7 PORCENTAGEM DE ISOLAMENTO DE Phomopsis ENDOFIacuteTICOS DE PLANTAS DE ESPINHEIRA SANTA
Isolamento Oacutergatildeo da planta
Nuacutemero de fragmentos plaqueados
Endoacutefitos Nuacutemero ()
Phomopsis Nuacutemero ()
Frequumlecircncia isolamento Phomopsis
1 Folha 360 140 (39) 0 (0) 0
2 Folha 540 310 (57) 2 (064) 037
3 Folha 360 375 (gt100) 3 (08) 083
TOTAL FOLHA
1260 825 (65) 5 (061) 04
4 Peciacuteolo 160 180 (gt100) 16 (89) 100
TOTAL 1420 1005 (71) 21 (209) 15 FONTE O Autor
Observando a tabela 7 percebe-se claramente que a partir de peciacuteolo a
frequumlecircncia de isolamento de Phomopsis (10) foi maior do que em folhas (04) tanto
em relaccedilatildeo ao nuacutemero de fragmentos plaqueados quanto em comparaccedilatildeo ao nuacutemero
total de endoacutefitos isolados (89 contra 061) Provavelmente devido agrave menor
frequumlecircncia de fungos filamentosos de crescimento raacutepido que pudessem sobrepor ao
crescimento de Phomopsis Segundo Souza et al (2004) as folhas dos vegetais
57
hospedeiros satildeo provavelmente as portas de entrada para os microrganismos pois
apresentam tecidos mais fraacutegeis e expostos pela presenccedila de estocircmatos ocorrendo
posterior migraccedilatildeo para outros tecidos da planta O mesmo jaacute foi relatado em espeacutecies
de Citrus para o isolamento de fungos do gecircnero Guignardia sendo o peciacuteolo o tecido
de mais faacutecil isolamento deste gecircnero por apresentar menor colonizaccedilatildeo por
Colletotrichum (BLANCO 1999)
Assim sugere-se que em trabalhos futuros de isolamento de Phomopsis sejam
tambeacutem utilizados os peciacuteolos especialmente em Espinheira Santa
Foram tambeacutem obtidos 18 isolados de Phomopsis de trecircs plantas de S
terebinthifolius (Aroeira Vermelha) representando uma frequumlecircncia de 11 Em Aroeira
a frequumlecircncia do isolamento de Phomopsis em folha foi maior do que em Espinheira
Santa em todos os isolamentos realizados
Fungos do gecircnero Phomopsis Phyllosticta e Colletotrichum satildeo comumente
isolados como endoacutefitos de tecidos de diferentes espeacutecies de plantas em muitos casos
esses fungos estatildeo juntos num mesmo hospedeiro (PANDEY et al 2003 LU et al
2004)
O gecircnero Phomopsis tem sido descrito com grande frequumlecircncia em isolamentos
de diversas plantas (UECKER 1988 BODDY e GRIFFITH 1989) Azevedo et al (2000)
apresentaram algumas plantas hospedeiras de onde jaacute foram isoladas espeacutecies de
Phomopsis entre elas Sabal bermudana Trachycarpus fortunei Cavendishia
pubescens Stylosanthes guianensis Anacardium occidentale e Mangifera indica
Corrado e Rodrigues (2004) isolaram endofiacuteticos de Phomopsis das plantas medicinais
Spondias mombin e Aspidosperma tomentosun
Bussabam et al (2001) isolaram entre outros fungos o gecircnero Phomopsis
endoacutefitos de folhas pseudocaules e rizomas de gengibre (Amomum siamense Criab)
coletadas em dois locais na Tailacircndia Silva et al (2006) isolou Phomopsis como
endoacutefito de graviola (Annona muricata L) e pinha (Annona squamosa L)
Alguns dos relatos citam o gecircnero Phomopsis como fitopatoacutegeno isolado de
diversas espeacutecies de Citrus Mangifera indica (Mangueira) Glycine max (Soja) Ficus
carica (Figueira) e Anacardium occidentale (Cajueiro) entre muitas outras plantas
58
(CENARGEN EMBRAPA 2005) Natildeo haacute relatos de gecircnero Phomopsis como
fitopatoacutegeno das plantas medicinais utilizadas no presente trabalho Aspidosperma
tomentosum Spondias mombin e Maytenus ilicifolia assim como em Aroeira Vermelha
(Schinus terebinthifolius) Entretanto o gecircnero foi relatado por Anjos Charchar e
Guimaratildees (2001) como patoacutegeno em culturas de Aroeira (Myracrodruon urundeuva)
causando sintomas de queimas nas folhas que consiste de uma necrose escura
predominantemente nos bordos dos foliacuteolos
52 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de Phomopsis
A caracterizaccedilatildeo macromorfoloacutegica das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de
Phomopsis sp foi realizada de acordo com a forma dos bordos crescimento micelial
aspecto da colocircnia e a sua coloraccedilatildeo no verso e reverso da placa em diferentes meios
de cultura (FIGURAS 1 a 4 ANEXO 12)
A coloraccedilatildeo das colocircnias dos isolados de Phomopsis apresentaram elevada
variabilidade tanto no verso quanto reverso da placa nos trecircs meios de cultura
ensaiados Em geral variou entre combinaccedilotildees das cores branca preto verde claro e
oliva amarelo marrom marrom avermelhado cinza e bege
Os isolados de Phomopsis apresentaram no verso da placa com meio Aveia (AV)
coloraccedilatildeo branca alguns isolados apresentaram combinaccedilotildees de branco com marrom
verde amarelo e cinza exceto os isolados ESJG1 ES2KF1 ES2WF1 ESPAC22
ES80J ESFB2 ESGF1 A134 A333B que diferiram dos demais por apresentarem
coloraccedilatildeo intensa e o isolado A116 de coloraccedilatildeo marrom e verde (FIGURAS 1 a 4)
Nos meios de cultura MEA e BDA observou-se que a coloraccedilatildeo no verso da
placa foi mais variaacutevel do que no meio Aveia Igualmente o reverso das placas
contendo as colocircnias de Phomopsis mostrou-se bastante variaacutevel entre os isolados e
os trecircs meios de cultura utilizados havendo variaccedilatildeo intra-individual com coloraccedilotildees
branca preto verde claro e oliva amarelo marrom marrom avermelhado cinza e
bege
59
A morfologia micelial nos meios de cultura ensaiados variou de granuloso aeacutereo
a algodonoso Nos meios de cultura MEA e BDA todos os isolados apresentaram
miceacutelio denso poreacutem no meio AV esses dois tipos de miceacutelio variaram de denso a ralo
A maioria dos isolados de Phomopsis analisados possuem miceacutelio granuloso aeacutereo em
todos os meios ensaiados exceto os isolados SM9638 SM9631 e Phomopsis longicolla
PHO1 que apresentam miceacutelio algodonoso Observou-se variaccedilatildeo intra-individual na
morfologia micelial entre os meios de cultura nos isolados A333B e A323 que
apresentaram miceacutelio algodoso no meio AV e granuloso aeacutereo nos meios MEA e BDA
Igualmente os isolados A123 e SM9811 apresentaram-se algodonoso no meio MEA e
granuloso aeacutereo nos meios AV e BDA
O aspecto dos bordos das colocircnias mostrou variaccedilatildeo intra-individual entre os
diferentes meios de cultura para a maioria dos isolados exceto os isolados de
Phomopsis SM9638 ESKD1 ESPAC22 A323 A113 A331 A115 que apresentaram
bordos regulares e os isolados SM9714 ES2WC1 ESJG1 A126 A333A PHO1
(Phomopsis longicolla) e o isolado PHO19 que possuem bordos irregulares em todos os
meios utilizados
FIGURA 1 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis DE Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT 9811 e AT 9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
AV MEA BDA
M
U 0
123
S
M97
13
60
FIGURA 1 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE
Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT9811 e AT9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
SM
9631
SM
9638
AT
9811
A
T990
6
AT9
810
SM
9714
AV MEA BDA
61
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
A32
1
A
132
A21
5A
A
113
A
323
A13
1
AV MEA BDA
62
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
A
135
A11
6
A
115B
A
124
A12
6
A21
6 B
AV MEA BDA
63
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
A
134
A33
3A
A
334
A12
3
A33
3B
AV MEA BDA
64
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
E
S2N
A1
E
SIE1
ES
GA
1
ES8
0J
E
SPA
C22
ES2
WF1
AV MEA BDA
65
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
ESFB
2
ESJ
D1
ESK
D1
E
SJH
1
ESD
F1
E
S2A
B1
AV MEA BDA
66
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
E
S2K
F1
ESJ
E2
ESJ
E1
ESG
F1
ESF
H1
ESF
F1
AV MEA BDA
67
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis E Diaporthe (BA1) ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
ESB
A1
ESI
A1
ES
RD
1
E
S2W
C1
ESS
D1
ES
JG1
AV MEA BDA
68
Na avaliaccedilatildeo do diacircmetro das colocircnias houve diferenccedila significativa entre os
isolados de Phomopsis dentro dos diversos meios de cultura avaliados Entre os meios
de cultura MEA BDA e AV houve diferenccedila significativa de crescimento em geral o
crescimento micelial foi menor no meio AV (ANEXO 1) Portanto os grupos de
Phomopsis formados quando considerada agrave taxa de crescimento foram inferidos para
os meios de cultura separadamente
Na figura 5 observa-se o resultado do diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados
apoacutes 5 dias de crescimento em meio MEA Os isolados foram reunidos em oito grupos
diferentes A A323 SM9631 ESKD1 A134 e ESIE1 B A116 A334 A215A ESSD1
C A321 MU0123 ESGF1 ESRD1 AT9811 SM9713 A123 ESJH1 ESDF1 A131
ESIA1 ESBA1 ESJD1 D A333A A135 ES2NA1 A124 A132 SM9714 ESFB2 E A115B ES2AB1 A216B A113 F PHO1 SM9638 ES2WF1 A126 ESJE1 ESPAC22
ESFF1 ES2KF1 ESJG1 ES80J G ESJE2 ESFH1 AT9906 ESGA1 AT9810
ES2WC1 Os isolados do grupo A apresentaram os maiores valores de crescimento
radial em torno de 70 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) e o grupo H apresentou menor
crescimento micelial em torno de 20 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) (ANEXO 4)
FIGURA 4 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS PATOGEcircNICOS OBTIDOS DE Glycine max EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
PH
O19
P
lon
gico
lla (P
HO
1) AV MEA BDA
69
O diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados apoacutes 5 dias de crescimento em meio
BDA estaacute representado na figura 6 Os isolados foram reunidos em seis grupos
diferentes A ESBA1 A323 A215A ESSD1 SM9713 ESGF1 SM9631 ESJD1
ESKD1 A334 B ESDF1 A132 A123 A333A MU0123 ESJH1 A321 ESRD1 A116
A134 A115B C ESIA1 A131 SM9714 A135 ESIE1 ESFB2 A124 ESPAC22
ES2KF1 A113 ESJE1 D ESJE2 ESFH1 ESJG1 ES2WC1 PHO1 SM9638
ES2NA1 ES2AB1 ESFF1 AT9811 AT9810 ES2WF1 A126 PHO19 A216B ES80J
ESGA1 E AT9906 F A333B Em geral a taxa de crescimento foi maior em meio BDA Os isolados do grupo A
apresentaram as maiores taxas de crescimento em torno de 70 cm (apoacutes 5 dias de
FONTE O autor
000
100
200
300
400
500
600
700
800
EB A F HD G C
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 4) A A323 SM9631 ESKD1 A134 e ESIE1 B A116 A334 A215A ESSD1 C A321 MU0123 ESGF1 ESRD1 AT9811 SM9713 A123 ESJH1 ESDF1 A131 ESIA1 ESBA1 ESJD1 D A333A A135 ES2NA1 A124 A132 SM9714 ESFB2 E A115B ES2AB1 A216B A113 F PHO1 SM9638 ES2WF1 A126 ESJE1 ESPAC22 ESFF1 ES2KF1 ESJG1 ES80J G ESJE2 ESFH1 AT9906 ESGA1 AT9810 ES2WC1
FIGURA 5 DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO MEA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
Diacirc
met
ro e
m c
m
70
crescimento) e o grupo F representado pelo isolado A333B apresentou menor
crescimento micelial (ANEXO 2)
Estudos sobre fisiologia envolvendo o gecircnero Phomopsis satildeo escassos Almeida
(1982) estudando Phomopsis sojae isolados de sementes de soja em seis diferentes
meios de cultura e nos regimes de luminosidade claro contiacutenuo e escuro contiacutenuo
verificou maior crescimento do fungo nos meios de haste de soja extrato de malte
aveia cenoura e BDA natildeo houve efeito da luz sobre o crescimento micelial de nenhum
dos isolados
Gurgel Menezes e Coelho (1997) verificaram maior crescimento micelial de P
anacardii e P mangiferae no meio BDA e uma melhor esporulaccedilatildeo nos meios BDA e V8
(Campbell CO) apoacutes 15 e 30 dias de incubaccedilatildeo No presente trabalho foi verificado
maior crescimento dos isolados de Phomopsis em meio BDA seguido do meio MEA em
meio AV a taxa de crescimento foi inferior
FONTE O autor
000
100
200
300
400
500
600
700
B A FEC D
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 2) A ESBA1 A323 A215A ESSD1 SM9713 ESGF1 SM9631 ESJD1 ESKD1 A334 B ESDF1 A132 A123 A333A MU0123 ESJH1 A321 ESRD1 A116 A134 A115B C ESIA1 A131 SM9714 A135 ESIE1 ESFB2 A124 ESPAC22 ES2KF1 A113 ESJE1 D ESJE2 ESFH1 ESJG1 ES2WC1 PHO1 SM9638 ES2NA1 ES2AB1 ESFF1 AT9811 AT9810 ES2WF1 A126 PHO19 A216B ES80J ESGA1 E AT9906 F A333B
FIGURA 6 DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
Diacirc
met
ro e
m c
m
71
O diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados apoacutes 5 dias de crescimento em meio
AV estaacute representado na figura 7 Os isolados foram reunidos em sete grupos
diferentes A ESKD1 B ESJE2 A123 C ESJE1 SM9638 AT9811 SM9713 PHO1
ESBA1 SM9631 ESFB2 A334 A323 MU0123 D A333A ESJD1 ESGF1 A116 E ESPAC22 ESDF1 A321 A132 ES2KF1 ESJG1 ESRD1 PHO19 A115B A124
ESFF1 A134 ESIE1 A135 A131 A113 ES2WF1 ESSD1 ESIA1 F ESGA1 ESJH1
ESFH1 AT9906 ES2NA1 A216B ES80J A215A G AT9810 A333B ES2AB1
SM9714 ES2WC1 A126 Apenas o isolado ESKD1 representante do grupo A
apresentou taxa de crescimento raacutepida de 70 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) a
maioria dos isolados tiveram crescimento lento (ANEXO 3)
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 3) A ESKD1 B ESJE2 A123 C ESJE1 SM9638 AT9811 SM9713 PHO1 ESBA1 SM9631 ESFB2 A334 A323 0123 D A333A ESJD1 ESGF1 A116 E ESPAC22 ESDF1 A321 A132 ES2KF1 ESJG1 ESRD1 PHO19 A115B A124 ESFF1 A134 ESIE1 A135 A131 A113 ES2WF1 ESSD1 ESIA1 F ESGA1 ESJH1 ESFH1 AT9906 ES2NA1 A216B ES80J A215A G AT9810 A333B ES2AB1 SM9714 ES2WC1 A126
FIGURA 7 AVALIACcedilAtildeO DAS MEacuteDIAS DO DIAcircMETRO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO AV APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
000
100
200
300
400
500
600
700
B A F C GD E
FONTE O autor
Diacirc
met
ro e
m c
m
72
Foi observado que dos 49 endoacutefitos e os 2 isolados patogecircnicos de Phomopsis
spp avaliados (TABELA 1) 27 apresentaram variaccedilatildeo intra-individual quanto ao
crescimento nos diversos meios Por exemplo os isolados A323 e SM9631 em meio
MEA e BDA pertencem ao grupo A e no meio AV ao grupo C Os outros 24 isolados
natildeo apresentaram variaccedilatildeo entre os agrupamentos formados nos diferentes meios
Os isolados que se agrupam baseados no crescimento nos trecircs meios natildeo satildeo
os mesmos quando se considera a cor do verso e reverso da placa assim como natildeo
satildeo semelhantes aos agrupamentos formados quando comparados com os bordos e
aspecto da colocircnia
Gurgel Menezes e Coelho (2002) estudando Phomopsis anacardii e Phomopsis
mangiferae observaram maior produccedilatildeo de picniacutedios nos meios de extrato de malte
aveia haste de soja e cenoura somente quando mantidos sob luz contiacutenua A
produccedilatildeo de picniacutedios foi reduzida em alternacircncia de luz e quase nula no escuro
contiacutenuo No presente trabalho foi observado que a maioria dos isolados formaram
estruturas de reproduccedilatildeo com o uso de luz contiacutenua em baixas temperaturas 22 a 25 degC
e pH 58 nos trecircs meios avaliados apoacutes 14 dias de crescimento
Segundo Cochrane (1959) e Griffin (1994) a luminosidade promove formaccedilatildeo
das estruturas reprodutivas assim como estatildeo diretamente ligadas agrave composiccedilatildeo do
meio de cultura atraveacutes de diferentes reaccedilotildees enzimaacuteticas Leonian (1924) descreve
que o efeito da luz como indutor da reproduccedilatildeo de fungos estaacute associado agraves
modificaccedilotildees que ocorrem no seu metabolismo celular combinados aos elementos que
constituem o meio de cultura
Timnick Lilly e Barnett (1951) detectaram efeito positivo da luz para a formaccedilatildeo
de picniacutedios ao verificarem que o regime escuro contiacutenuo inibia a formaccedilatildeo de picniacutedios
de Diaporthe phaseolorum Resultados semelhantes foram observados por Correcirca
(1995) avaliando Phomopsis sp provenientes de sementes florestais observou uma
melhor esporulaccedilatildeo em meio aveia sob regime de claro contiacutenuo por 12 dias de
incubaccedilatildeo
Na anaacutelise da micromorfologia observou-se que os isolados apresentavam
estruturas de reproduccedilatildeo a partir de 14 dias ateacute 21 dias de crescimento (FIGURA 8)
73
exceto os isolados SM9811 SM9638 e Phomopsis longicolla PHO1 que natildeo formaram
estruturas de reproduccedilatildeo em nenhum dos meios ensaiados Os isolados SM9811 e
SM9638 foram descritos como pertencentes ao gecircnero Phomopsis e depositados na
Coleccedilatildeo de Cultura de Fungos do Departamento de Micologia (IOC) da FIOCRUZ e
foram descritos por Rodrigues e Samules (1999) O isolado PHO1 foi isolado e
identificado pela EMBRAPA (Londrina-PR) como pertencente agrave espeacutecie P longicolla
Os coniacutedios do tipo alfa foram menos frequumlentes do que os do tipo beta Em
meio de cultura BDA apenas 11 isolados apresentaram o tipo de esporo alfa jaacute os beta
coniacutedios filiformes curvos na extremidade ou ligeiramente curvos foram visualizados
em quase todos os isolados de Phomopsis spp
Foi observado que para os isolados que apresentaram os dois tipos de esporos
foram visualizados com 14 dias de crescimento apenas alfa coniacutedios hialinos com
vacuacuteolos nas extremidades de forma ovoacuteide e natildeo foram visualizados beta coniacutedios
Apoacutes 21 dias os dois tipos de esporos foram visualizados nesses isolados (FIGURA 8a
e 8c) Alguns alfa coniacutedios apresentavam mais de dois vacuacuteolos nas extremidades
(FIGURA 8b) Essa variaccedilatildeo intra-individual tambeacutem foi observada em relaccedilatildeo agrave
morfologia do beta coniacutedio em que alguns apresentam curvatura na extremidade
outros ligeiramente curvos (FIGURA 8c)
NOTA A - isolado SM9631 aumento de 400x B- isolado SM9714 aumento de 1000x C- isolado SM9713 aumento de 400x microscopia oacuteptica Setas pretas indicam os alfa coniacutedios e setas vermelhas os beta coniacutedios Escala em 1μM
FONTE O autor
FIGURA 8 FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis EM BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
A B C
74
Alfa coniacutedios do isolado SM9713 provenientes dos meios de cultura AV (FIGURA
9a) e BDA (FIGURA 9e) apresentaram grande variaccedilatildeo morfoloacutegica Na figura 9 no
mesmo conidioacuteforo eacute visiacutevel a diferenccedila morfoloacutegica do alfa coniacutedio Na figura 9e o
conidioacuteforo apresenta alfa coniacutedios com mais de duas gotas nas extremidades (SETA 1)
e alfa coniacutedios com apenas dois vacuacuteolos (SETA 2) Em maior aumento eacute possiacutevel
perceber que existem variaccedilotildees de dois trecircs e ateacute quatro vacuacuteolos no mesmo isolado
(FIGURA 9a 9b e 9c) Tal variaccedilatildeo pode ser decorrente de diferenciados graus de
maturaccedilatildeo destes coniacutedios o que dificulta a caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de espeacutecies do
gecircnero Phomopsis
A medida do comprimento dos beta coniacutedios em meio BDA mostrou que os
isolados apresentam diferenccedilas estatiacutesticas significativas reunindo os isolados em 15
FIGURA 9 FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DO ISOLADO SM9713 EM MEIOS BDA e AV APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
1 2 A
B C D
E
NOTA A - em meio AV aumento de 400x B C e D- em meio BDA aumento de 650x E- em meio BDA aumento de 400x Microscopia oacutetica
FONTE O autor
75
grupos diferentes (ANEXO 5) A (AT9906 AT8010) B (ESFH1) C (ESPAC22 ES2KF1
SM9631) D (ESGA1 PHO19) E (ES80J) F (ESRD1) G (ESJE2 ESFB2 ESJE1) H
(ESJG1) I (A323) J (A333A A135 A124 A126 A132 A131 A134 A115B ESIE1) K
(ES2WC1 ES2WF1) L (SM9713 A334 ESIA1 A333B ESFF1 ESGF1) M (ES2AB1
A123 A113 ESJD1) N (ESKD1 ES2NA1 A215A SM9714) O (ESSD1 ESJH1
MU0123 A321 ESDF1 A216B A116) (FIGURA 10) Os isolados tambeacutem natildeo se
agrupam de acordo com os outros criteacuterios avaliados como a cor do verso e reverso
da placa diacircmetro das colocircnias assim como natildeo satildeo semelhantes aos agrupamentos
formados quando comparados com os bordos e aspecto do miceacutelio
NOTA As letras maiuacutesculas indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo agrave meacutedia do comprimento de beta coniacutedio dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Isolados de cada agrupamento A (AT9906 AT8010) B (ESFH1) C (ESPAC22 ES2KF1 SM9631) D (ESGA1 PHO19) E (ES80J) F (ESRD1) G (ESJE2 ESFB2 ESJE1) H (ESJG1) I (A323) J (A333A A135 A124 A126 A132 A131 A134 A115B ESIE1) K (ES2WC1 ES2WF1) L (SM9713 A334 ESIA1 A333B ESFF1 ESGF1) M (ES2AB1 A123 A113 ESJD1) N (ESKD1 ES2NA1 A215A SM9714) O (ESSD1 ESJH1 MU0123 A321 ESDF1 A216B A116) As meacutedias seguidas pela mesma letra minuacutescula natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 5)
FIGURA 10 COMPRIMENTO DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO EM BDA A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
0
5
10
15
20
25
30
35
40
B C E F MID LJA N H K OG
a
b
c
cd
de
ef
efg
fgh
fghi
ghij
ghil
hil
him
im
m
FONTE O autor
Diacirc
met
ro e
m μ
M
76
Desta forma as caracteriacutesticas macroscoacutepicas (coloraccedilatildeo bordos e tipos de
miceacutelio da colocircnia) e de micromorfologia dos coniacutedios avaliadas isoladamente natildeo
permitiram propor identificaccedilatildeo das espeacutecies dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis
Sendo assim optou-se por realizar uma anaacutelise polifaacutesica agrupando as caracteriacutesticas
morfoloacutegicas analisadas tais como crescimento micelial coloraccedilatildeo e bordos da
colocircnia tipo de miceacutelio comprimento dos coniacutedios e tipos de coniacutedios produzidos em
deferentes meios Essa metodologia foi descrita por Figueiredo et al (2006) para
caracterizar isolados de Pestalotiopsis Para todas estas caracteriacutesticas foram
atribuiacutedas notas de 0 ou 1 onde 0 representou ausecircncia da caracteriacutestica e 1 a
presenccedila (ANEXO 12) Os resultados compuseram uma matriz binaacuteria analisada pelo
software NTSYS (coeficiente Jaccard) com o agrupamento pelo meacutetodo UPGMA
permitindo a construccedilatildeo de um dendrograma de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
De acordo com o dendrograma de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
sugere-se a formaccedilatildeo de seis grupos com elevados valores de bootstrap que conferem
robustez aos agrupamentos No grupo I estatildeo reunidos os isolados MU0123 e
SM9713 no grupo II os isolados AT9810 e AT9906 no grupo III os isolados ESJE1 e
ESJE2 no grupo IV os isolados ESFB2 e ESFF1 no grupo V os isolados ES2KF1 e
ESJG1 e no grupo VI os isolados ES2WF1 e ES80J Os demais agrupamentos
formados natildeo foram considerados pois apresentam baixos valores de bootstrap e ou
baixos valores de similaridade morfoloacutegica
Os dados mostram elevada variabilidade morfoloacutegica dos isolados de Phomopsis
avaliados o que dificulta a delimitaccedilatildeo de espeacutecies apenas com dados morfoloacutegicos
Segundo Parmeter (1958) e Rehner e Uecker (1994) o alto grau de plasticidade das
caracteriacutesticas morfoloacutegicas impossibilita a delimitaccedilatildeo de espeacutecies no gecircnero
Phomopsis Gamboa-Gaitaacuten Laureano e Bayman (2005) estudando isolados de
Phomopsis endofiacuteticos de Guarea guidonia (Meliaceae) de duas regiotildees de Luquillo
(Porto Rico) relataram elevados niacuteveis de variabilidade morfoloacutegica entre os isolados
avaliados Eles observaram uma mistura de diferentes morfotipos em ambas as regiotildees
estudadas
77
Neste trabalho foi observado um elevado niacutevel de variabilidade morfoloacutegica dos
isolados de Phomopsis spp obtidos de seis diferentes espeacutecies de plantas e regiotildees
geograacuteficas Natildeo foi possiacutevel observar estruturaccedilatildeo populacional dos isolados em
funccedilatildeo da espeacutecie hospedeira Na figura 12 os isolados de M ilicifolia encontram-se na
coloraccedilatildeo rosa e distribuiacutedos ao longo dos dois eixos que representam os dois
principais componentes de variaccedilatildeo Igualmente os isolados em preto representam as
linhagens provindas de S terebinthifolius e tambeacutem encontram-se dispersos Tais
resultados natildeo surpreendem pois eacute possiacutevel que a mesma espeacutecie de Phomopsis seja
isolada em diferentes hospedeiros
NOTA I II III IV V VI satildeo grupos formados para inferir sobre a diversidade dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis Os valores a esquerda dos noacutes indicam os valores de bootstrap
COEFICIEcircNTE DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA
FIGURA 11 DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp
FONTE O autor
r = 07577 (P= 00001)
V VI
IV
I II III
78
FONTE O autor FIGURA 12 ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp NOTA Isolados em coloraccedilatildeo rosa obtidos de Maytenus ilicifolia Em preto Schinus terebinthifolius Em azul escuro Myracrodruon urundeuva Em azul claro Aspidosperma tomentosun Em verde Spondias mombin 53 Caracterizaccedilatildeo Molecular de Phomopsis spp 531 RAPD
Os isolados de Phomopsis spp foram avaliados por meio de marcadores
moleculares do tipo RAPD a fim de verificar a magnitude da variabilidade geneacutetica
Foram analisados por esta metodologia 54 isolados Destes 47 Phomopsis spp
endoacutefitos os isolados MU0123 e SM9638 natildeo amplificaram em nenhuma das
condiccedilotildees ensaiadas dois isolados de Phomopsis patoacutegenos de soja e cinco isolados
de Pestalotiopsis Foram utilizados 4 oligonucleotiacutedeos gerando 99 bandas O tamanho
dos fragmentos amplificados variou de 400 a 2600 pb e podem ser visualizados nas
Figuras 13 a 16
79
FIG
UR
A 1
4 P
ER
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DE
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XTE
RN
O P
esta
lotio
psis
81
A anaacutelise destes marcadores RAPD permitiu a construccedilatildeo de um dendrograma
de similaridade geneacutetica (FIGURA 17) O coeficiente de correlaccedilatildeo das matrizes de
similaridade geneacutetica e cofeneacutetica obtido pelo teste de Mantel foi elevado (r=08157 e
p=00001) indicando que o dendrograma representa de forma adequada a matriz de
similaridade geneacutetica obtida pelos marcadores de RAPD Entretanto os valores de
bootstrap da maioria dos agrupamentos formados foram baixos Desta forma somente
foram considerados na anaacutelise os agrupamentos com bom suporte de bootstrap e
coeficientes de similaridade superiores a 50
Os dados indicam elevada variabilidade geneacutetica dos isolados de Phomopsis
spp avaliados (FIGURAS 17 e 18) com a formaccedilatildeo de sete grupos Os isolados de
Pestalotiopsis utilizados como grupo externo formaram um grupo (boostrap = 100)
isolado (FIGURA 17) sendo relevante para inferir a magnitude da variabilidade geneacutetica
observada entre os isolados de Phomopsis spp
O primeiro agrupamento reuacutene trecircs endoacutefitos de Espinheira Santa ESBA1
ES2AB1 e ESSD1 (49 de similaridade e bootstrap = 64) Esses isolados foram
obtidos do mesmo isolamento e pomar (CNPFEMPRAPA ColomboPR) poreacutem de
tecidos e plantas diferentes Os isolados ESBA1 e ESSD1 foram obtidos de peciacuteolo
enquanto ES2AB1 foi isolado de folha Eacute importante observar que o isolado ESBA1
apresentou estrutura de reproduccedilatildeo sexual sendo classificado como Diaporthe sp e
no entanto apresenta alto valor de similaridade geneacutetica com os isolados de Phomopsis
sp sugerindo assim que pertenccedilam ao mesmo complexo Phomopsis Diaporthe
Esses isolados natildeo se agrupam quanto aos caracteres morfoloacutegicos (FIGURAS 11 e
12)
O segundo agrupamento com 893 de similaridade geneacutetica e com bootstrap
de 100 compreende P longicolla (PHO1) uma linhagem patogecircnica de soja isolada
em Primavera do Leste ndash MT e o isolado SM9713 endoacutefito de Spondias mombin
coletado em Redenccedilatildeo ndash PA Aleacutem de coletados em lugares e hospedeiros totalmente
diferentes esses isolados apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas divergentes pois
natildeo pertencem ao mesmo agrupamento em nenhuma das caracteriacutesticas morfoloacutegicas
analisadas Entretanto a alta similaridade geneacutetica destes isolados sugere que
82
pertenccedilam agrave mesma espeacutecie o que reforccedila as observaccedilotildees anteriores de que a
definiccedilatildeo de espeacutecie do gecircnero Phomopsis natildeo eacute possiacutevel utilizando-se apenas
caracteriacutesticas morfoloacutegicas
FIGURA 17 DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS DE Phomopsis spp POR MEIO DE MARCADORES MOLECULARES RAPD
COEFICIENTE DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA
FONTE O autor
I II
III IV V VI VII
GRUPO EXTERNO
r= 08157 (p=00001)
100
83
O terceiro agrupamento com 75 de similaridade geneacutetica (FIGURA 17)
compreende dois isolados endofiacuteticos de Aspidosperma tomentosun AT9810 e AT9906
Esses isolados apresentaram caracteriacutesticas morfoloacutegicas muito semelhantes
formando o agrupamento II com 81 de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
O quarto agrupamento com 72 de similaridade geneacutetica compreende os
isolados ESFH1 e ESFF1 provenientes do peciacuteolo de Espinheira Santa da mesma
coleta poreacutem novamente eles natildeo se agrupam quanto aos caracteres morfoloacutegicos
observados (FIGURAS 11 e12)
O quinto agrupamento com 85 de similaridade geneacutetica reuacutene os isolados
ESKD1 e ESJH2 e ESJH1 provenientes de peciacuteolo da Espinheira Santa coletados na
mesma data Os isolados ESJH1 e ESJH2 foram obtidos do mesmo peciacuteolo e
apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas mais semelhantes entre si do que quando
comparados ao isolado ESKD1 (FIGURA 11) Entretanto a figura 17 revela que por
meio de marcadores RAPD os isolados ESKD1 e ESJH2 satildeo mais proacuteximos (92 de
similaridade geneacutetica) Sugere-se assim que os 3 isolados pertenccedilam agrave mesma
espeacutecie
O sexto agrupamento com 52 de similaridade (FIGURA 17) compreende os
isolados A321 obtido de Aroeira e ESIA1 obtido de Espinheira Santa Aleacutem de
coletados em lugares e hospedeiros totalmente diferentes esses isolados apresentam
caracteriacutesticas morfoloacutegicas diferentes (FIGURAS 11 e 12) Apesar do valor de
bootstrap atribuir confiabilidade a este agrupamento (77) o valor de similaridade
observado (52) natildeo eacute alto Assim natildeo eacute possiacutevel inferir que pertenccedilam agrave mesma
espeacutecie
O mesmo ocorre com o seacutetimo agrupamento que com 55 de similaridade
compreende os isolados A333A obtido de Aroeira e ESRD1 obtido de Espinheira Santa
Aleacutem de coletados em lugares e hospedeiros totalmente diferentes esses isolados
apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas diferentes natildeo pertencendo ao mesmo
agrupamento quanto aos caracteres morfoloacutegicos (FIGURAS 11 e 12)
Esses resultados mostram que caracteriacutesticas morfoloacutegicas natildeo satildeo suficientes
para inferir espeacutecies neste gecircnero analisadas individualmente ou em anaacutelise polifaacutesica
84
Aleacutem disso natildeo haacute estruturaccedilatildeo populacional quanto ao hospedeiro Esses dados
reforccedilam a necessidade de revisatildeo na classificaccedilatildeo de espeacutecies do gecircnero Phomopsis
Atualmente a anaacutelise polifaacutesica vem sendo realizada em estudos de diversidade
bacteriana utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas bioquiacutemicas fisioloacutegicas e
moleculares (KIM et al 2006 a b NEDASHKOVSKAYA et al 2006) e
esporadicamente na identificaccedilatildeo de leveduras (SAMPAIO et al 1999 VILLA-
CARVAJAL et al 2004) Em fungos filamentosos a anaacutelise polifaacutesica de caracteriacutesticas
morfoloacutegicas foi utilizada com sucesso na taxonomia de Penicillium (FRISVAD e
SAMSON 2004) Aspergillus (FRISVAD et al 2004) e Pestalotiopsis (FIGUEIREDO
2006)
FIGURA 18 ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp
FONTE O autor
85
532 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
Visando elucidar a taxonomia dos isolados de Phomopsis spp utilizados neste
trabalho foi realizado com sucesso o sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 - 58S - ITS2 do
rDNA de 29 isolados Apoacutes o alinhamento e ediccedilatildeo destas sequumlecircncias foi realizada
uma busca no banco de dados de sequumlecircncias (httpwwwncbinlmnihgov) a fim de
identificar sequumlecircncias similares Os isolados estatildeo representados na aacutervore filogeneacutetica
(FIGURA 19)
Os isolados agruparam-se em 16 clados sugerindo que as plantas medicinais
estudadas satildeo colonizadas por pelo menos dezesseis diferentes espeacutecies de
Phomopsis (FIGURA 19) Entretanto a maioria dos isolados natildeo apresentaram
sequumlecircncias ITS com identidade superior a 90 com nenhuma sequumlecircncia depositada no
GenBank e portanto foram identificados como Phomopsis sp S1 a Phomopsis sp
S12
O primeiro clado (suportado com bootstrap de 98) estaacute representado na figura
20 e reuacutene os isolados A113 A131 A133 ESIA1 e A321 que apresentaram identidade
com P chimonanthi e com uma linhagem de Phomopsis sp endofiacutetica de Coffea
robusta (DQ123615) Esta linhagem foi isolada e sequumlenciada por Sette et al (2006) e
apresentou 99 de similaridade com as mesmas espeacutecies P chimonanthi P
michaeliae e Diaporthe helianthi (FIGURAS 19 e 20) A espeacutecie P chimonanthi foi
recentemente proposta por Chang e colaboradores (dados natildeo publicados) para
isolados antes denominados de P michaeliae Como esta espeacutecie foi descrita em 1987
e aceita ateacute o momento no presente trabalho sugere-se que os isolados A113 A131
A133 ESIA1 e A321 sejam classificados como P michaeliae
O isolado ESIA1 foi obtido de Espinheira Santa (Maytenus ilicifolia) enquanto os
demais isolados deste clado foram obtidos de Aroeira Vermelha (Schinus
terebinthifolius) Esses isolados apresentaram baixa similaridade geneacutetica quando
avaliados por RAPD e similaridade parcial quanto agraves caracteriacutesticas morfoloacutegicas uma
vez que fazem parte do mesmo agrupamento no diacircmetro da colocircnia em meio BDA
(Grupo C) e MEA (Grupo E)
86
FONTE O autor FIGURA 19 AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MEacuteTODO DE PARCIMOcircNIA)
ESIA1
A321
A113
A131
AY6229931| Phomopsis
P michaellae
Phomopsis sp S5 A116
ESRD1
ESJE2
ESKD1
Phomopsis sp S1
Phomopsis sp S9 A124
A334
A323Phomopsis sp S8
Phomopsis sp S2 A123
AJ3123481| Diaporthe helianthi
DQ2862851| Phomopsis sp CBS
AY8578681| Phomopsis longicolla
AF000207| Phomopsis longicolla
AF0010242| Diaporthe phaseolorum
DQ2356701| Phomopsis sp P4
Phomopsis sp S10 ESGA1
DQ2356731| Phomopsis sp P7
PHO19
AY0506271| Phomopsis sojae
DQ2356691| Phomopsis sp P3
P sojae
AF3584411 Diaporthe helianthi
AJ3123631| Diaporthe helianthi
SM9713
P longicolla PHO1
MU0123
P longicolla
A126
ESJH1Phomopsis sp S11
Phomopsis sp S12 ESJD1
Phomopsis sp S7 ESDF1
AB1051481| Diaporthe melonis
ES2AB1
ESBA1Phomopsis sp S6
AB1051471| Diaporthe melonis
AY6229961| Phomopsis camptothecae
AJ3123591| Diaporthe
AY7450241| Diaporthe
ES2KF1
ES2WF1
ESPAC22
Phomopsis sp S4
Phomopsis sp S3 ESGF1
AB2014431| Diaporthe conorum
DQ1165511| Diaporthe conorum CBS
SM9638
ESFH1
DQ2862861| Phomopsis theicola
AF230762 Phomopsis sp taxon 3
AY4857241| Phomopsis sp 1
DQ2862871| P theicola CBS
P theicola
Pestalotiopsis vismae
99
99
3599
98
91
7786
78
75
73
2973
5
5
3
2
11
71
70
25
22
33
40
67
63
33
44
65
41
34
29
27
21
21
18
13
12
8
7
5
3
3
0
0
0
19
32
23
31
87
Os isolados ESRD1 ESKD1 e ESJE2 apresentaram homologia quanto as
sequumlecircncias de ITS com suporte de bootstrap de 95 (FIGURA 19) Entretanto a figura
17 revela que por meio de marcadores RAPD os isolados ESKD1 e ESJE2 satildeo mais
proacuteximos apresentando 92 de similaridade geneacutetica (com bootstrap de 65) e 85
de similaridade desses isolados com o ESJE1 Assim sugere-se que estes 3 isolados
pertenccedilam agrave mesma espeacutecie Entretanto as sequumlecircncias ITS natildeo apresentaram
identidade superior a 90 com nenhuma sequumlecircncia depositada no GenBank Assim
esses isolados foram denominados de Phomopsis sp S1
FONTE O autor FIGURA 20 AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA PARCIAL BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MODELO NEIGHBOR-JOINING COM CORRECcedilAtildeO KIMURA DOIS PARAcircMETROS)
O isolado PHO19 (patogecircnico de soja) foi classificado como Phomopsis sojae
formou um clado com um endoacutefito natildeo identificado (P3) e com um isolado da espeacutecie P
sojae (FIGURA 19) O isolado Phomopsis sp P3 foi obtido como endoacutefito de Tectona
grandis por Murali Surynarayanan e Geeta (2006)
A113
DQ1236151| Phomopsis sp CBMAI
ESIA1
AY6229931| Phomopsis chimonanthi
A131
A133
P michae liae
A124
A334
ESGA1
DQ1165521| Diaporthe conorum cbs 199-3990
98
62252719
0005
88
Os isolados MU0123 SM9713 e P longicolla (PHO1) apresentaram alta
homologia das sequumlecircncias (clado suportado com 99 de bootstrap) (FIGURA 19) Os
isolados SM9713 e P longicolla (PHO1) apresentaram 893 de similaridade geneacutetica
(com suporte de bootstrap de 100) utilizando-se marcadores RAPD (FIGURA 17) Na
anaacutelise morfoloacutegica os isolados MU0123 e SM9713 apresentaram mais de 70 de
similaridade poreacutem o isolado P longicolla (PHO1) apresentou caracteriacutesticas
morfoloacutegicas diferentes dos isolados MU0123 e SM9713 (FIGURA 11) O isolado PHO1
foi isolado como patoacutegeno de soja (Glycine max (L) Merr) no Mato Grosso enquanto os
isolados MU0123 e SM9713 foram obtidos como endofiacuteticos de Aroeira (Myracrodruon
urundeuva) e Cajaacute (Spondias mombin) respectivamente ambos no estado do Paraacute Em
funccedilatildeo das similaridades geneacuteticas observadas e por ser o isolado PHO1 utilizado
como referecircncia de P longicolla os isolados endofiacuteticos MU0123 e SM9713 foram
identificados como pertencentes a esta espeacutecie A alta similaridade geneacutetica destes
isolados sugere que pertenccedilam agrave mesma espeacutecie o que reforccedila as observaccedilotildees
anteriores de que a definiccedilatildeo de espeacutecie do gecircnero Phomopsis natildeo eacute possiacutevel
utilizando-se apenas caracteriacutesticas morfoloacutegicas O fato de isolados endofiacuteticos de S
mombin e M urundeuva serem identificados como P longicolla demonstra que
espeacutecies patogecircnicas para um hospedeiro podem colonizar de forma assintomaacutetica
diferentes espeacutecies vegetais Isso jaacute foi observado para outros gecircneros como
Guignardia e Phyllosticta (BAAYEN et al 2002 GLIENKE-BLANCO et al 2002)
Os endoacutefitos ESBA1 e ES2AB1 foram reunidos no mesmo clado sendo
denominados de Phomopsis sp S6 (FIGURA 19) esses isolados fazem parte do
mesmo agrupamento utilizando-se marcadores RAPD (FIGURA 17)
Os isolados A323 e A334 apresentaram grande identidade geneacutetica (suportado
com bootstrap de 70) e seu agrupamento estaacute representado na figura 19 Esses
isolados natildeo apresentaram identidade moderada a nenhuma das sequumlecircncias
depositadas no GenBank e portanto natildeo foi possiacutevel inferir sobre a espeacutecie desses
endoacutefitos Sugere-se que esses isolados de Aroeira pertenccedilam agrave mesma espeacutecie e
portanto foram denominados de Phomopsis sp S8 Os isolados ES2KF1 ES2WF1 e
89
ESPAC22 endoacutefitos de Espinheira Santa foram reunidos num mesmo clado sendo
denominados de Phomopsis sp S4 (FIGURA 19)
Os isolados A126 e ESJH1 foram reunidos no mesmo clado sendo denominados
de Phomopsis sp S11 eles foram isolados de diferentes plantas hospedeiras O
isolado ESJH1 foi obtido de Espinheira Santa (Maytenus ilicifolia) enquanto o isolado
A126 foi obtido de Aroeira Vermelha (Schinus terebinthifolius) Estes resultados
reforccedilam a dificuldade em inferir espeacutecies do gecircnero Phomopsis com base na planta
hospedeira
Os isolados A116 A124 A123 ESGA1 ESJD1 ESDF1 e ESGF1 natildeo
apresentaram identidade com nenhuma sequumlecircncia depositada no GenBank nem
similaridade com outros isolados analisados no presente trabalho Sugere-se que esses
endoacutefitos pertenccedilam a diferentes espeacutecies
No uacuteltimo clado o isolado ESFH1 apresentou homologia com a regiatildeo ITS1-
rDNA 58S - ITS2 da espeacutecie P theicola (DQ286286 e DQ286287) e com o isolado
SM9638 (FIGURA 19) Estes dois isolados foram obtidos de diferentes plantas
hospedeiras O isolado ESFH1 foi obtido em 2006 de M ilicifolia no Paranaacute enquanto o
isolado SM9638 foi obtido em 1996 como endofiacutetico da planta Spondias mombin no
Estado do Paraacute Esses isolados apresentam baixa similaridade morfoloacutegica (FIGURAS
11 e 12) Estes resultados reforccedilam a dificuldade em inferir espeacutecies do gecircnero
Phomopsis especialmente utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas
No presente trabalho observou-se que vaacuterias espeacutecies de Phomopsis foram
isoladas de um mesmo hospedeiro assim como uma mesma espeacutecie foi encontrada
colonizando diferentes hospedeiros Isto jaacute foi relatado no gecircnero Phomopsis por
Brayford (1990) Farr Castlebury e Rossman (2002) e por Rehner e Uecker (1994)
Esses resultados reforccedilam a necessidade de revisatildeo do conceito de espeacutecie para o
gecircnero Phomopsis uma vez que muitas espeacutecies tecircm sido identificadas com base na
planta hospedeira (GAMBOA-GAITAacuteN LAUREANO e BAYMAN 2005 MURALI
SURYANARAYANAN GEETA 2006)
Os dados morfoloacutegicos e de RAPD foram altamente variaacuteveis e a anaacutelise das
sequumlecircncias da regiatildeo ITS1- 58S - ITS2 do rDNA foi informativa para alguns dos
90
isolados analisados Entretanto mais estudos satildeo necessaacuterios para a identificaccedilatildeo
precisa dessas espeacutecies A literatura eacute escassa quanto a trabalhos de taxonomia
morfologia biologia e ecologia de isolados endofiacuteticos do gecircnero Phomopsis Segundo
Phillips (2006) a identificaccedilatildeo das espeacutecies do gecircnero Phomopsis eacute difiacutecil porque as
espeacutecies natildeo estatildeo claramente definidas e existe uma sobreposiccedilatildeo entre os caracteres
morfoloacutegicos que as definem
A maioria das sequumlecircncias depositadas no GenBank satildeo de isolados
provenientes de lesotildees sendo portanto de espeacutecies patogecircnicas No presente trabalho
eacute possiacutevel que os isolados pertencentes a clados que natildeo se agruparam com nenhuma
sequumlecircncia jaacute depositada pertenccedilam a novas espeacutecies ou ainda a espeacutecies de
endoacutefitos ainda natildeo sequumlenciados Murali Surynarayanan e Geeta (2006)
caracterizaram por meio de sequumlenciamento da regiatildeo ITS e dados morfoloacutegicos 11
isolados endofiacuteticos de Phomopsis obtidos de Tectona grandis e Cassia fistula Eles
sugerem que apesar da grande variabilidade encontrada os isolados devem ser
reunidos em apenas dois grupos entretanto natildeo foi possiacutevel a identificaccedilatildeo em niacutevel
de espeacutecie Segundo os autores isto natildeo foi possiacutevel em funccedilatildeo dos fungos deste
gecircnero natildeo terem hospedeiros especiacuteficos e pela necessidade de revisatildeo do conceito
de espeacutecie em Phomopsis
Farr Castlebury e Rossman (2002) caracterizaram por anaacutelise de sequumlecircncias
ITS1 58S ITS2 e por caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de Phomopsis sp
isolados de Vaccinium corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse estudo
verificaram que a maioria dos isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma vez que
as sequumlecircncias agruparam-se com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
Castlebury e Mengistu (2006) avaliaram Phomopsis isolados de soja e outros
hospedeiros combinando dados de sequumlecircncias de ITS do rDNA do gene do fator1 alfa
de elongaccedilatildeo da traduccedilatildeo (ef-1) e genes de actina Foram formados seis grupos de
Phomopsis sendo que trecircs correspondem aos taacutexons P longicolla Diaporthe melonis e
D phaseolorum Os autores concluiacuteram que a ausecircncia de distinccedilatildeo morfoloacutegica e
informaccedilatildeo bioloacutegica tornam problemaacutetica a identificaccedilatildeo de espeacutecies deste gecircnero
91
No presente trabalho com base nos dados de RAPD (FIGURAS 17 e 18) pode-
se sugerir a existecircncia de pelo menos 10 espeacutecies de Phomopsis colonizando de forma
endofiacutetica as plantas de Maytenus ilicifolia analisadas Tais plantas satildeo provenientes de
um uacutenico pomar localizado no CNPFEMPRAPA em ColomboPR Ainda eacute possiacutevel
sugerir a existecircncia de pelo menos seis espeacutecies de Phomopsis colonizando de forma
endofiacutetica a planta de S terebinthifolius analisada neste trabalho Esta planta natildeo
recebeu qualquer tratamento com fungicidas ou outro agrotoacutexico uma vez que se
encontra isolada entre dois blocos do Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas da UFPR (ANEXO
13) Talvez isso justifique a grande diversidade de isolados encontrada Esses dados
demonstram a importacircncia de estudos da comunidade endofiacutetica em plantas medicinais
e apontam para o problema da reduccedilatildeo de diversidade de microrganismos endofiacuteticos
pelo uso continuado de fungicidas
Resultados semelhantes foram obtidos por Gamboa-Gaitaacuten Laureano e Bayman
(2005) estudando isolados de Phomopsis endofiacuteticos da planta medicinal Guarea
guidonia (Meliaceae) Os autores relataram elevados niacuteveis de variabilidade geneacutetica
avaliada pela digestatildeo da regiatildeo ITS e tambeacutem a alta variabilidade morfoloacutegica entre
os isolados avaliados A aacutervore molecular agrupou indiviacuteduos fenotipicamente
diferentes Por outro lado Fernandez e Hanlin (1996) obtiveram resultados
concordantes entre a anaacutelise molecular por RAPD e as caracteriacutesticas morfoculturais
separando os isolados coletados de soja em dois grupos Diaporthe phaseolorum e
Phomopsis longicolla
Pioli et al (2003) caracterizaram por RAPD isolados do complexo
DiaporthePhomopsis coletados de soja na Argentina Eles foram separados em quatro
grupos (i) Diaporthe phaseolorum variedade meridionalis (ii) D phaseolorum variedade
caulivora (iii) D phaseolorum variedade sojae and (iv) Phomopsis longicolla revelando
a existecircncia de variabilidade entre isolados da mesma variedade
92
54 Avaliaccedilatildeo da atividade antimicrobiana 541 Cultura pareada
Os isolados de Phomopsis foram avaliados pela teacutecnica de cultura pareada
contra as linhagens PC1396 e PC3305 do fitopatoacutegeno G citricarpa As interaccedilotildees
foram classificadas em trecircs tipos 1) Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno com
sobreposiccedilatildeo de hifas 2) Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno sem sobreposiccedilatildeo
de hifas e 3) Ausecircncia de inibiccedilatildeo de crescimento Os resultados obtidos estatildeo
apresentados nas Tabelas 9 e 10
Todos os isolados de Phomopsis inibiram significativamente o crescimento das
duas linhagens de Guignardia exceto o isolado ES2WC1 (Phomopsis sp) que
apresentou interaccedilatildeo do tipo 3 em que natildeo houve inibiccedilatildeo significativa do fitopatoacutegeno
apenas 287 e 828 contra PC1396 e PC3305 respectivamente (ANEXO 6 7 8 e
9) Foi observado que as duas linhagens de G citricarpa apresentaram o mesmo tipo
de interaccedilatildeo frente ao mesmo isolado de Phomopsis ou seja natildeo houve variaccedilatildeo
quanto a linhagem do fitopatoacutegeno avaliado Tal observaccedilatildeo reforccedila a importacircncia dos
resultados aqui apresentados
Dos 49 isolados de Phomopsis endoacutefitos de plantas medicinais avaliados 38
inibiram o crescimento das duas linhagens do fitopatoacutegeno G citricarpa com
porcentagem de inibiccedilatildeo superior a 50 Os isolados A333B (Phomopsis sp) ESGF1
(Phomopsis sp S3) SM9638 (P theicola) AT9810 (Phomopsis sp) AT9906
(Phomopsis sp) e ES2WC1 (Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo inferiores
a 50 contra PC1396 e PC3305 os isolados ES80J (Phomopsis sp) e AT9811
(Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo inferiores a 50 apenas contra a
linhagem PC1396 enquanto contra a PC3305 a inibiccedilatildeo foi de 5132 e 5397
respectivamente Por outro lado os isolados de Phomopsis ESFF1 (Phomopsis sp)
SM9714 (Phomopsis sp) e A132 (Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo
inferiores a 50 apenas contra a linhagem PC3305 enquanto contra PC1396 a
inibiccedilatildeo foi de 5017 6215 e 5492 respectivamente
93
A anaacutelise estatiacutestica demonstrou que haacute diferenccedila significativa entre o controle e
os isolados avaliados O fungicida Derosal apresentou inibiccedilatildeo do crescimento do
fitopatoacutegeno em aproximadamente 19 todos os isolados de Phomopsis que
apresentaram inibiccedilatildeo superior ao fungicida com significacircncia no teste estatiacutestico exceto
o isolado ES2WC1 (Phomopsis sp) como citado anteriormente (TABELA 8 e 9 ANEXO
6 7 8 e 9)
As interaccedilotildees do tipo 1 nas quais ocorre agrave sobreposiccedilatildeo de hifas do endoacutefito
sobre o fitopatoacutegeno sugere a ocorrecircncia de parasitismo Esse tipo de interaccedilatildeo entre
os isolados de Phomopsis e as linhagens de G citricarpa ocorreu em 47 dos isolados
Tais isolados apresentam diferenccedila significativa entre o controle destacando-se os
isolados ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) (FIGURA 21) ESJD1
(Phomopsis sp S12) e ESJH1 (Phomopsis sp S11) que inibiram o crescimento de G
citricarpa PC1396 em 7338 6885 6826 e 6792 respectivamente A anaacutelise
estatiacutestica demonstra que haacute diferenccedila significativa entre o controle e estes isolados
poreacutem natildeo haacute diferenccedila significativa entre os mesmos (ANEXO 6 7 e 8)
As interaccedilotildees do tipo 2 nas quais natildeo ocorre sobreposiccedilatildeo de hifas ocorreram
em 51 dos isolados destacando-se os isolados ESSD1 (Phomopsis sp) e SM9713
(P longicolla) que inibiram o crescimento da linhagem PC1396 de G citricarpa em
7324 e 6763 respectivamente A anaacutelise estatiacutestica demonstra que haacute diferenccedila
significativa entre o controle e os isolados ESSD1 (Phomopsis sp) e SM9713 (P
longicolla) os isolados de Phomopsis tambeacutem diferem entre si (TABELA 8) Essas
interaccedilotildees devem ser avaliadas posteriormente em microscopia oacutetica para confirmar se
estaacute ocorrendo parasitismo
FIGURA 21 INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa PC1396 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA
Phomopsis A134
G Citricarpa PC1396
Phomopsis SM9713
G Citricarpa PC1396
G Citricarpa PC1396 Controle
G Citricarpa PC1396
Fungicida Derosal
FONTE O autor
94
Isolados Identificaccedilatildeo Tipo de Interaccedilatildeo Inibiccedilatildeo () Fungicida 19
ESDF1 Phomopsis sp S7 1 7338 ESSD1 Phomopsis sp 2 7324 A134 Phomopsis sp 1 6885
ESJD1 Phomopsis sp S12 1 6826 ESJH1 Phomopsis sp S11 1 6792 SM9713 P longicolla 2 6763 ESIE1 Phomopsis sp 1 6758 ESFB2 Phomopsis sp 1 6724
MU0123 P longicolla 2 6663 ESRD1 Phomopsis sp S1 2 6655 ESJG1 Phomopsis sp 2 6621 ESJE1 Phomopsis sp S1 1 6621
ESPAC22 Phomopsis sp S4 1 6516 A131 P michaeliae 2 6393 A126 Phomopsis sp S11 1 6352 A123 Phomopsis sp S2 1 6270 A113 P michaeliae 1 6270
SM9631 Phomopsis sp 1 6265 ES2AB1 Phomopsis sp S6 1 6246 ESJE2 Phomopsis sp S1 1 6246 A323 Phomopsis sp S8 1 6230
SM9714 Phomopsis sp 1 6215 ES2NA1 Phomopsis sp 1 6212
A334 Phomopsis sp S8 1 6189 ESBA1 Phomopsis sp S6 2 6177 A321 P michaeliae 1 6148
ESKD1 Phomopsis sp S1 1 6109 A216B Phomopsis sp 2 6025
ES2KF1 Phomopsis sp S4 2 5939 ESIA1 P michaeliae 2 5904 A135 Phomopsis sp 2 5902 A124 Phomopsis sp S9 2 5861
A115B Phomopsis sp 1 5861 A116 Phomopsis sp S5 2 5820
A215A Phomopsis sp 1 5656 A132 Phomopsis sp 2 5492
ESFH1 P theicola 2 5427 A333A Phomopsis sp 1 5369 ESGA1 Phomopsis sp S10 2 5324
ES2WF1 Phomopsis sp S4 2 5205 ESFF1 Phomopsis sp 2 5017 AT9811 Phomopsis sp 1 4920 ESGF1 Phomopsis sp S3 2 4642 SM9638 P theicola 1 4522 A333B Phomopsis sp 1 4426 ES80J Phomopsis sp 2 4344 AT9810 Phomopsis sp 2 4173 AT9906 Phomopsis sp 2 3078 ES2WC1 Phomopsis sp 3 287
FONTE O autor
TABELA 8 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC1396
95
A interaccedilatildeo do tipo 1 entre os isolados de Phomopsis e a linhagem PC3305 de
G citricarpa ocorreu em 47 dos isolados a reduccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno
apresentou diferenccedila significativa quando comparados com o controle destacando-se
os isolados A215A (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ESDF1 (Phomopsis sp
S7) ESJD1 (Phomopsis sp S12) A123 (Phomopsis sp S2) que inibiram o crescimento
da linhagem PC3305 de G citricarpa em 7947 7616 7152 7119 e 7119
respectivamente (TABELA 9 FIGURA 22) A anaacutelise estatiacutestica demonstra que haacute
diferenccedila significativa entre o controle e os isolados A215A (Phomopsis sp) A115B
(Phomopsis sp) ESDF1 (Phomopsis sp S7) ESJD1 (Phomopsis sp S12) A123
(Phomopsis sp S2) A215A A115B ESDF1 ESJD1 A123 mas os isolados de
Phomopsis natildeo diferem entre si (ANEXO 9)
Os isolados ESRD1 (Phomopsis sp S1) e A135 (Phomopsis sp) apresentaram
as maiores taxas de inibiccedilatildeo do crescimento da linhagem PC3305 de G citricarpa pela
interaccedilatildeo do tipo 2 6887 e 6623 respectivamente (TABELA 9) A anaacutelise estatiacutestica
demonstra que haacute diferenccedila significativa entre o controle e os isolados ESRD1
(Phomopsis sp S1) e A135 (Phomopsis sp) esses isolados de Phomopsis diferem
entre si (ANEXO 9) Essas interaccedilotildees devem ser avaliadas posteriormente ao
microscoacutepio para confirmar se estaacute ocorrendo parasitismo
O isolado SM9713 (P longicolla) inibiu o crescimento do patoacutegeno G citricarpa e
produziu esporos em volta da colocircnia Segundo Boosalis (1964) a esporulaccedilatildeo pode
ocorrer quando determinados hospedeiros estimulam a reproduccedilatildeo de seus parasitas
Resultados semelhantes foram encontrados por Martins-Corder e Melo (1998) onde
observaram que a maioria dos isolados de Trichoderma spp antagonistas colonizou e
produziu esporos em abundacircncia sobre as colocircnias de Verticillium dahliae
As interaccedilotildees do tipo 2 mostram inibiccedilatildeo mutua na qual o endoacutefito natildeo sobrepotildee
a colocircnia do fitopatoacutegeno apesar de inibir seu crescimento Segundo Bell et al (1982)
os antagonistas selecionados pelo confronto direto satildeo aqueles que apresentam
crescimento sobre o fitopatoacutegeno Poreacutem a relaccedilatildeo entre o tipo de interaccedilatildeo e a
porcentagem de inibiccedilatildeo observada nos resultados natildeo satildeo congruentes uma vez que
96
a porcentagem de inibiccedilatildeo para alguns isolados com interaccedilatildeo do Tipo 2 eacute maior do que
para aqueles com interaccedilatildeo do Tipo 1
Isolados Identificaccedilatildeo Tipo de Interaccedilatildeo
Inibiccedilatildeo ()
Fungicida 1921 A215A Phomopsis sp 1 7947 A115B Phomopsis sp 1 7616 ESDF1 Phomopsis sp S7 1 7152 ESJD1 Phomopsis sp S12 1 7119 A123 Phomopsis sp S2 1 7119
ESFB2 Phomopsis sp 1 7086 ESJE2 Phomopsis sp S1 1 7020 ESJH1 Phomopsis sp S11 1 7020
SM9631 Phomopsis sp 1 6921 ESRD1 Phomopsis sp S1 2 6887 A135 Phomopsis sp 2 6623 A126 Phomopsis sp S11 1 6490
ESPAC22 Phomopsis sp S4 1 6424 A131 P michaeliae 2 6424
ESJE1 Phomopsis sp 1 6358 ES2KF1 Phomopsis sp S4 2 6298
A334 Phomopsis sp S8 1 6291 A124 Phomopsis sp S9 2 6258 ESIA1 P michaeliae 2 6126 ESKD1 Phomopsis sp S1 1 5993 ESSD1 Phomopsis sp L5 2 5960 A134 Phomopsis sp 1 5861 A113 P michaeliae 1 5795
TABELA 9 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 (CONTINUA)
FIGURA 22 INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa 3305 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA
G citricarpa PC3305
Phomopsis ESRD1
Phomopsis ESDF1
G citricarpa PC3305
G citricarpa PC3305 controle
Fungicida Derosal
G citricarpa PC3305
FONTE O autor
97
A333A Phomopsis sp 1 5728 ESIE1 Phomopsis sp 1 5695 ESJG1 Phomopsis sp 2 5662 A323 Phomopsis sp S8 1 5629
ES2AB1 Phomopsis sp S6 1 5596 ESBA1 Phomopsis sp S6 2 5563 A116 Phomopsis sp S5 2 5464
AT9811 Phomopsis sp 1 5397 A216B Phomopsis sp 2 5364 A321 P michaeliae 1 5331
SM9713 P longicolla 2 5298 ES2NA1 Phomopsis sp 1 5265 MU0123 P longicolla 2 5232 ESFH1 Phomopsis sp 2 5132 ES80J Phomopsis sp 2 5132 ESGA1 Phomopsis sp S10 2 5079
ES2WF1 Phomopsis sp S4 2 5033 ESFF1 P theicola 2 4934
SM9714 Phomopsis sp 1 4735 A132 Phomopsis sp 2 4470
A333B Phomopsis sp 1 3775 ESGF1 Phomopsis sp S3 2 3344 SM9638 P theicola 1 2781 AT9810 Phomopsis sp 2 2649 AT9906 Phomopsis sp 2 2583 ES2WC1 Phomopsis sp 3 828
FONTE O autor 542 Teste para detecccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
No teste de metaboacutelitos volaacuteteis observou-se reduccedilatildeo do crescimento da
linhagem PC1396 e PC3305 de G citricarpa apoacutes a retirada do celofane onde
inicialmente foram inoculados os isolados de Phomopsis Todos os isolados testados
inibiram significativamente o crescimento das duas linhagens de G citricarpa Os
isolados A115B (Phomopsis sp) A134 (Phomopsis sp) ESFF1 (Phomopsis sp)
ESFH1 (Phomopsis theicola) A123 (Phomopsis sp S2) e S2WF1 (Phomopsis sp S4)
apresentaram maior inibiccedilatildeo do crescimento das duas linhagens do fitopatoacutegeno
(ANEXO 10 e 11 e FIGURA 23) sugerindo que a interaccedilatildeo entre os isolados de
Phomopsis e o fitopatoacutegeno ocorre devido agrave produccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
TABELA 9 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 (CONTINUACcedilAtildeO)
98
FONTE O autor FIGURA 23 AVALIACcedilAtildeO DO CRESCIMENTO DAS COLOcircNIAS DO FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 e PC3305 INOCULADAS APOacuteS RETIRADA DO PAPEL CELOFANE PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS EM MEIO BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
Nota a Placa com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC3305 inoculado apoacutes retirada do celofane onde previamente foi inoculado o isolado ESFH1 b Placa controle com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC3305 c Placa com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396 inoculado apoacutes retirada do celofane onde previamente foi inoculado o isolado ESFH1 d Placa controle com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396
FIGUEIREDO (2006) utilizou a teacutecnica de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis em
Pestalotiopsis isolados endofiacuteticos de Maytenus ilicifolia e observou uma reduccedilatildeo do
crescimento da linhagem PC1396 de G citricarpa demonstrando que a interaccedilatildeo
ocorre principalmente pela produccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
Os resultados apresentados aqui demonstram o grande potencial que tais
linhagens endofiacuteticas de Phomopsis possuem como agentes de controle da Mancha
Preta dos Citros e o seu potencial na produccedilatildeo de metaboacutelitos
543 Avaliaccedilatildeo da accedilatildeo dos Extratos
Na avaliaccedilatildeo dos extratos quanto agrave inibiccedilatildeo do crescimento das linhagens
PC1396 e PC3305 de G citricarpa os resultados indicam que a maioria dos extratos
metanoacutelicos produzidos a partir dos isolados de Phomopsis reduziram o crescimento
micelial de ambas as linhagens do fitopatoacutegeno da MPC A inibiccedilatildeo ocorreu devido aos
metaboacutelitos secundaacuterios produzidos pelos isolados endofiacuteticos quando comparados
com o crescimento micelial dos controles com metanol (onde o extrato foi diluiacutedo) e
com aacutegua destilada (FIGURA 24 25 e TABELA 10)
a b c d
99
Foi observado que os isolados de Phomopsis que apresentaram as maiores
porcentagens de inibiccedilatildeo pela teacutecnica de cultura pareada tambeacutem inibiram o
crescimento quando foi utilizado o extrato metanoacutelico Entretanto o isolado ES2WC1
(Phomopsis sp) que natildeo inibiu o crescimento pela teacutecnica de cultura pareada
apresentou reduccedilatildeo no crescimento micelial dos dois fitopatoacutegenos avaliados
utilizando-se o seu extrato metanoacutelico Provavelmente essa falta de inibiccedilatildeo pela
teacutecnica de cultura pareada tenha ocorrido pelo fato do isolado ES2WC1 (Phomopsis
sp) apresentar crescimento lento fazendo com que o crescimento do fitopatoacutegeno natildeo
diferisse significativamente do controle
Os isolados ES80J (Phomopsis sp) ESFF1 (Phomopsis sp) A132 (Phomopsis
sp) A333B (Phomopsis sp) e SM9638 (P theicola) natildeo inibiram o crescimento micelial
de nenhum dos fitopatoacutegenos avaliados Para alguns isolados de Phomopsis natildeo foi
possiacutevel determinar o potencial antimicrobiano dos extratos metanoacutelicos pois houve
grande variaccedilatildeo de accedilatildeo entre as repeticcedilotildees do experimento
FONTE O autor
C
D E F
A B
NOTA A Placa controle com aacutegua destilada autoclavada B Placa controle com metanolC Placa controle com fungicida Derosal reg (10 mgmL) D Placa com extrato metanoacutelicodo isolado ES2WC1 E Placa com extrato metanoacutelico do isolado A215A F Placa comextrato metanoacutelico do isolado ESDF1
FIGURA 24 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NOCRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC3305 DE G citricarpa EMMEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
100
Rodrigues-Heerklotz et al (2001) elucidaram a estrutura quiacutemica e a siacutentese
assimeacutetrica de um novo metaboacutelito o aacutecido guignardico produzido pelo fungo endofiacutetico
Guignardia sp isolado de Spondias mombin Silva et al (2005) isolaram dois
metaboacutelitos de Phomopsis cassiae endofiacutetico de Cassia specatabilis 24-diidroxi-56-
dimetil benzoato de etila e phomopsilactona que exibiram forte atividade antifuacutengica
contra fitopatoacutegenos bem como citotoxicidade contra a linhagem celular de tumor
cervical humano (HeLa) Estudos adicionais devem ser realizados para determinar a
estrutura quiacutemica produzida pelos endoacutefitos de Phomopsis estudados
NOTA A Placa controle com aacutegua destilada autoclavada B Placa controle commetanol C Placa controle com fungicida Derosal reg (10 mgmL)D Placa com extratometanoacutelico do isolado ES2WC1 E Placa com extrato metanoacutelico do isolado ESGA1 FPlaca com extrato metanoacutelico do isolado ESSD1
FONTE O autor FIGURA 25 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NOCRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 DE G citricarpa EMMEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
C
D E F
A B
101
Os resultados da tabela 10 revelam que os isolados endofiacuteticos de Phomopsis
spp avaliados satildeo bastante promissores demonstrando um potencial na produccedilatildeo de
metaboacutelitos Resultados semelhantes foram obtidos por Moller Weber e Dreyfuss
(1996) que avaliaram a accedilatildeo de endoacutefitos de plantas tropicais com alta produccedilatildeo de
metaboacutelitos secundaacuterios
Identificaccedilatildeo Isolados Inibiccedilatildeo PC3305 Cultura Pareada
Inibiccedilatildeo PC3305 Extrato
Metanoacutelico
Inibiccedilatildeo () PC1396 Cultura Pareada
Inibiccedilatildeo PC1396 Extrato
Metanoacutelico Derosal Fungicida 1921 I 19 I
P longicolla SM9713 5298 I 6763 I P longicolla MU0123 5232 ND 6663 I P michaeliae A131 6424 I 6393 I P michaeliae ESIA1 6126 I 5904 I Phomopsis sp A333A 5728 I 5369 I P michaeliae A321 5331 I 6148 I P michaeliae A113 5795 ND 627 ND Phomopsis sp S2 A123 7119 ND 627 ND P theicola ESFH1 5132 I 5427 I Phomopsis sp ESFF1 4934 NI 5017 NI P theicola SM9638 2781 NI 4522 NI Phomopsis sp S4 ES2WF1 5033 I 5205 I Phomopsis sp S3 ESGF1 3344 I 4642 I Phomopsis sp S10 ESGA1 5079 I 5324 I Phomopsis sp S1 ESRD1 6887 I 6655 I Phomopsis sp S8 A334 6291 I 6189 I Phomopsis sp S9 A124 6258 I 5861 I Phomopsis sp S7 ESDF1 7152 I 7338 I Phomopsis sp ESSD1 596 I 7324 I Phomopsis sp S6 ES2AB1 5596 I 6246 I Phomopsis sp S6 ESBA1 5563 I 6177 I Phomopsis sp S11 A126 649 ND 6352 ND Phomopsis sp S12 ESJD1 7119 I 6826 I Phomopsis sp S1 ESJE1 6358 I 6621 I Phomopsis sp S1 ESJE2 702 ND 6246 ND Phomopsis sp S1 ESKD1 5993 ND 6109 ND Phomopsis sp A115B 7616 I 5861 I Phomopsis sp ESFB2 7086 I 6724 I Phomopsis sp S11 ESJH1 702 I 6792 I Phomopsis sp A135 6623 I 5902 ND Phomopsis sp A134 5861 I 6885 I Phomopsis sp ESIE1 5695 I 6758 I Phomopsis sp ESJG1 5662 ND 6621 I
TABELA 10 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO CRESCIMENTO MICELIAL DASCOLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTOA 28ordmC (CONTINUA)
102
Phomopsis sp AT9811 5397 I 492 I Phomopsis sp A216B 5364 I 6025 I Phomopsis sp ES2NA1 5265 I 6212 I Phomopsis sp SM9714 4735 I 6215 I Phomopsis sp ES2WC1 828 I 287 I Phomopsis sp SM9631 6921 ND 6265 ND Phomopsis sp S4 ESPAC22 6424 ND 6516 ND Phomopsis sp S4 ES2KF1 6298 ND 5939 ND Phomopsis sp S8 A323 5629 ND 623 ND Phomopsis sp S5 A116 5464 ND 582 ND Phomopsis sp AT9810 2649 ND 4173 ND Phomopsis sp AT9906 2583 ND 3078 ND Phomopsis sp ES80J 5132 NI 4344 NI Phomopsis sp A132 447 NI 5492 NI Phomopsis sp A333B 3775 NI 4426 NI Phomopsis sp A215A 7947 I 5656 I
FONTE O autor
NOTA I- Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno NI- Natildeo ocorreu inibiccedilatildeo do fitopatoacutegeno ND- Natildeo foi determinado a inibiccedilatildeo
No Brasil as plantas Spondias mombin e A tomentosum tecircm sido usadas na
medicina devido as suas propriedades antimicrobianas (AJAO SHONUKAN e FEMI
1984) Os isolados de Phomopsis obtidos como endoacutefitos de S mombin (SM9713 (P
longicolla) SM9638 (P theicola) e SM9714 (Phomopsis sp)) e A tomentosum (AT9810
(Phomopsis sp) AT9811 (Phomopsis sp) e AT9906 (Phomopsis sp)) avaliados no
presente trabalho jaacute haviam sido relatados por Corrado e Rodrigues (2004) como
produtores de compostos bioativos Os autores relatam que os extratos metanoacutelicos
inibiram o crescimento de E coli S aureus P aeruginosa C albicans A niger e F
oxysporum No presente trabalho os isolados de S mombin e A tomentosum inibiram
o crescimento de Guignardia citricarpa confirmando o potencial desses isolados em
produzir substacircncias bioativas mais estudos devem ser realizados para verificar o
potencial antimicrobiano desses extratos contra bacteacuterias patogecircnicas e
fitopatogecircnicas
A planta Schinus terebinthifolius eacute usada no Brasil na medicina alternativa contra
doenccedilas da coacuternea (CORREcircA 1926) doenccedilas reumaacuteticas uacutelceras feridas tumores
linfaacuteticos erisipela e outras moleacutestias provocadas por bacteacuterias que se manifestam em
forma de edema ou eritema (BALBACH 1992) As linhagens de Phomopsis isoladas de
S terebinthifolius avaliadas nesse trabalho A135 (Phomopsis sp) A113 (P michaelae)
TABELA 10 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO CRESCIMENTO MICELIAL DASCOLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DECRESCIMENTO A 28ordmC (CONTINUACcedilAtildeO)
103
A115B (Phomopsis sp) A323 (Phomopsis sp S8) A132 (Phomopsis sp) A134
(Phomopsis sp) A333B (Phomopsis sp) A321 (P michaelae) A126 (Phomopsis sp
S11) A216B (Phomopsis sp) A334 (Phomopsis sp S8) A116 (Phomopsis sp S5)
A215A (Phomopsis sp) A124 (Phomopsis sp S9) A333A (Phomopsis sp) A131 (P
michaeliae) e A123 (Phomopsis sp S2) apresentaram excelentes resultados contra G
citricarpa
Extratos da planta M ilicifolia jaacute foram descritos na literatura apresentando
atividade antitumoral tambeacutem usado como analgeacutesico antinflamatoacuterio e antiaacutecido
(JORGE 2004 DUARTE 2005) Pileggi (2006) isolou microrganismos endofiacuteticos de
plantas de Maytenus ilicifolia do mesmo pomar investigado neste trabalho e avaliou o
potencial farmacoloacutegico dos mesmos Entre os fungos e bacteacuterias testados 15
apresentaram potencial para controle bioloacutegico
Figueiredo (2006) isolou fungos endofiacuteticos de plantas de M ilicifolia do mesmo
pomar investigado neste trabalho especialmente Pestalotiopsis spp e os avaliou quanto
ao potencial antimicrobiano contra bacteacuterias patogecircnicas em humanos e o fitopatoacutegeno
G citricarpa Os extratos metanoacutelicos de dois isolados exibiram accedilatildeo fungistaacutetica na
germinaccedilatildeo e no crescimento micelial das linhagens PC1396 e PC3305 de G
citricarpa Aleacutem disso dois extratos de Pestalotiopsis spp inibiram o crescimento dos
microrganismos-teste (S aureus oxalino resistente Klebsiella pneumoniae
Micrococcus luteus Staphylococcus aureus e Escherichia coli)
No presente trabalho observou-se que as linhagens de Phomopsis spp isolados
de M ilicifolia apresentaram excelentes resultados in vitro contra G citricarpa Pouco se
conhece a respeito da comunidade endofiacutetica existente nessas plantas e os resultados
desse trabalho demostram que abrigam uma grande variabilidade de PC1396 e
PC3305 espeacutecies de Phomopsis com portencial para bioprospecccedilatildeo Isto reforccedila a
importacircncia de estudos de microrganismos endofiacuteticos em plantas medicinais em
especial M ilicifolia e S terebinthifolius Faz-se necessaacuterio tambeacutem o estudo da
composiccedilatildeo quiacutemica dos extratos avaliados
104
6 CONCLUSOtildeES Os resultados obtidos no presente trabalho permitiram as seguintes conclusotildees
bull As espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo podem ser identificadas
apenas por caracteriacutesticas morfoloacutegicas ou marcadores moleculares
RAPD sendo necessaacuteria uma anaacutelise polifaacutesica incluindo
sequumlenciamento de vaacuterias regiotildees do genoma
bull As plantas medicinais analisadas satildeo colonizadas por grande
diversidade de espeacutecies de Phomopsis com grande variabilidade
morfoloacutegica e geneacutetica intra e interespeciacuteficas
bull As plantas de Maytenus ilicifolia analisadas satildeo colonizadas
endofiticamente por pelo menos 10 espeacutecies de Phomopsis sendo
possiacutevel identificar por sequumlecircncias ITS do rDNA isolados de P theicola e
P michaeliae
bull A planta de Schinus terebinthifolius analisada eacute colonizada
endofiticamente por pelo menos 6 espeacutecies de Phomopsis sendo
possiacutevel identificar por sequumlecircncias ITS do rDNA isolados de P
michaeliae
bull As espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo satildeo hospedeiro-especiacuteficas
sendo necessaacuteria a redefiniccedilatildeo do conceito de espeacutecie para este gecircnero
bull Os isolados de Phomopsis spp apresentaram grande potencial no
controle in vitro do fungo G citricarpa Os isolados ESIA1 e A131 (P
michaeliae) ESJE1 ESJE2 ESKD1 e ESRD1 (Phomopsis sp S1) A123
(Phomopsis sp S2) ES2KF1 e ESPAC22 (Phomopsis sp S4) ESDF1
105
(Phomopsis sp S7) A334 (Phomopsis sp S8) A124 (Phomopsis sp
S9) A126 e ESJH1 (Phomopsis sp S11) ESJD1 (Phomopsis sp S12) e
os isolados A134 A135 A115B A215A SM9631 ESFB2 e ESSD1
(Phomopsis sp) foram os mais promissores em inibir o crescimento das
linhagens PC1396 e PC3305 de G citricarpa nas metodologias
avaliadas
106
7 REFEREcircNCIAS BIBLIOGRAacuteFICAS ALBERTS B LEWIS J RALF M ROBERTS K WATSON J D Molecular Biology of the Cell 4ordf ed New York Garland Publishing 2004 ALICE C B SIQUEIRA N C S MENTZ L A SILVA G A A B JOSEacute K F D Plantas medicinais de uso popular Atlas farmacognoacutestico Canoas Editora da ULBRA 1995 ALZATE-MARIN A L BAIacuteA G S FALEIRO F G CARVALHO G A PAULA JR T J MOREIRA M A BARROS E G Anaacutelise da diversidade geneacutetica de raccedilas de Colletotrichum lindemuthianum que ocorrem em algumas regiotildees do Brasil por marcadores RAPD Fitopatologia Brasileira v 22 p 85-88 1997 ALMEIDA A M R Efeito de luz e meios de cultura sobre crescimento micelial formaccedilatildeo e tamanho de picniacutedios e esporulaccedilatildeo de isolados de Phomopsis sojae Leh In SEMINAacuteRIO NACIONAL DE PESQUISA DE SOJA Brasiacutelia 2 1981 Londrina Anais Brasiacutelia EmbrapaSNI 1982 p 216-226 ANCHORENA-MATIENZO P Re-identificaccedilatildeo e caracterizaccedilatildeo geneacutetica de levedura IZ-987 utilizando marcadores moleculares 2002 81p Dissertaccedilatildeo (Mestrado) ndash ESALQ USP Piracicaba Satildeo Paulo 2002 ANJOS J R N CHARCHAR M J A GUIMARAtildeES D P Ocorrecircncia de Queima das Folhas Causada por Phomopsis sp Em Aroeira No Distrito Federal Fitopatologia Brasileira v 26 n 3 p 649-650 2001 ARAUacuteJO J M SILVA A C AZEVEDO J L Isolation of endophytic actinomycetes from roots and leaves of maize (Zea mays L) Brazilian Archives of Biology and Technology v 43 n 4 p 447-451 2000 ARAUacuteJO W L AZEVEDO J L LIMA A O S MARCOM J SOBRAL J L LACAVA P T Manual Isolamentos de fungos endofiacuteticos Escola Superior da Agricultura Luiz de Queiroz Universidade de Satildeo Paulo Piracicaba 2002 ARNOLD E A MEJIacuteA C L KYLLO D ROJAS E I MAYNARD Z ROBBINS N HERRE E A Fungal endophytes limit pathogen damage in a tropical tree PNAS v 100 p 15649-15654 2003 AZEVEDO J L Microrganismos Endofiacuteticos In MELO I S AZEVEDO J L Ecologia Microbiana Editora EMBRAPA Jaguariuacutena-SP p 117-137 1998 AZEVEDO J L JUacuteNIOR W M PEREIRA J O ARAUacuteJO W L Endophytic microganisms a review on insect control and recent advances on tropical plants
107
Environmental Biotechnology v 3 n1 p 40-65 2000 BAAYEN R P BONANTS P J M VERKLEY G CARROL G C VAN DER AA M WEERDT M BROUWERSHAVEN G C SCHUTTE G C MACCHERONI JR W GLIENKE-BLANCO C AZEVEDO J L Nonpathogenic Strains of the Citrus Black Spot Fungus Guignardia citricarpa Identified as a Cosmopolitan Endophyte of Woody Plants Guignardia mangiferae (Phyllosticta capitalensis) Phytopathology v 92 p 464-477 2002 BAKER R E D Studies in the pathogenicity of tropical fungi II The occurrence of latent infections in developing fruits Annals of Botany London v 2 p 919-931 1938 BAO J R LAZAROVITS G Differential colonization of tomato roots by nonpathogenic and pathogenic Fusarium oxysporum strains may influence Fusarium wilt control Phytopathology Lancaster v 91 p 449-456 2001 BELL D K WELLS H D MARKHABELL D K WELLS C R In vitro antagonism ot Trichoderma species against six fungal plant pathogens Phytopathology v 72 p 379-382 1982 BETTIOL W GHINI R Controle Bioloacutegico In Manual de Fitopatologia Bergamin FILHO A AMORIM L e KIMATI H (Eds) 3ordf ed Satildeo Paulo Ceres 1995 919p BILLS G DOMBROWSKY A PELAEZ F POLISHOOK J Recent and future discoveries of pharmacologically active metabolites from tropical fungi Tropical mycology micromycetes v 2 p 165-194 2002 BITTENCOURT J V M Variabilidade geneacutetica em populaccedilotildees naturais de Maytenus ilicifolia por meio de marcadores RAPD Curitiba 2000 58p Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Agronomia ndash Produccedilatildeo Vegetal) Universidade Federal do Paranaacute BITTENCOURT J V M Variabilidade Geneacutetica em Populaccedilotildees Naturais de Maytenus Ilicifolia por Meio de Marcadores RAPD Scientia Agraacuteria v 2 p1-2 2001 BLANCO C G Guignardia citricarpa Kiely Anaacutelise geneacutetica cariotiacutepica e interaccedilatildeo com o hospedeiro Piracicaba 1999 Tese de Doutorado- escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Universidade de Satildeo Paulo BOSSALIS M C Hyperparasitism Annual Review of Phytopathology v 2 p 363-375 1964 BRAYFORD D Vegetative incompatibility in Phomopsis from elm Mycological Research v 94 n 6 p 745-752 1990
108
BODDY L GRIFFITH G S Role of endophytes and latent invasion in the development of decay communities in sapwood of angiospermous trees Sydowia v 41 p 41-73 1989 BUSSABAN B LUMYONG S LUMYONG P McKENZIE E H HYDE K D Endophytic fun i from Amomum siamense Canadian Journal of Microbiology v 47 n 10 p 943-948 2001 CAMPAROTO M L TEIXEIRA R O MANTOVANI M S VICENTINI P Effects of Maytenus ilicifolia Mart and Bauhinia candicans Benth onion root-tip and rat bone-marrow cells Genetics and Molecular Biology v 25 n1 p 85-89 2002 CARDOSO-FILHO J L Efeito de extratos de albedo de laranja (Citrus sinesis) dos indutores de resistecircncia aacutecido salicilico acil-benzolar ndash S- metil e Saccharomyces cerevisiae no controle de Phyllosticta citricarpa (Teleomorfo Guignardia citricarpa) Piracicaba 2003 125f Dissertaccedilatildeo (Doutorado) ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo CARROLL G C CARROLL F E Studies on the incidence of coniferous needle endophytes in the Pacitfic Northwest Canadian Jornal of Botany v 56 p 3034-3043 1978 CARROLL G C The Biology of endophytism in plants with particular reference to woody perennials In FOKKEMA N J HEAVEL J Van Der (Eds) Microbiology of the Phyllosphere Cambridge Cambridge University Press 1986 p 205-222 CASTLEBURY LA MENGISTU A Phylogenetic distinction of DiaporthePhomopsis isolates from soybeans [resumo] Systematic Mycology and Microbiology I v 57 n 4 p 13 2006 CENARGEN Banco de Dados on Line Disponiacutevel em lthttpicewall2cenargenembrapabr84micwebmichtmlfgbd01aspPgt Acesso em Maio de 2005 CERVI A C PACIORNIK E F VIEIRA R F MARQUES L C Espeacutecies vegetais de um remanescente de Floresta de Araucaacuteria (Curitiba-Brasil) estudo preliminar I Acta Bioloacutegica Paranaense Curitiba v18 n1-4 p73-114 1989 CHAREPRASERT S PIAPUKIEW J THIENHIRUN S WHALLEY A J S SIHANONTH P Endophytic fungi of teak leaves Tectona grandis L and rain tree leaves Samanea saman Merr Journal of Microbiology amp Biotechnology v 22 n 5 p 481-486 2006 CHRISTO D Variabilidade Geneacutetica e Diferenciaccedilatildeo Molecular de Isolados Endofiacuteticos e Patogecircnicos de Guignardia spp e Phyllosticta sp Curitiba 2002
109
78 f Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Geneacutetica) ndash Universidade Federal do Paranaacute CLAY K Effects of fungal endophyteson the seed and seedling biology of Lolium perenne and Festuca arundinacea Oecologia (Berlin) Berlin v73 p 358-362 1987 CLAY K Fungi and the food of the goods Nature v 427 p 401-402 2004 COCHRANE VW Physiology of fungi New York John Wiley 1958 524p COCKRUM P A PETTERSON D S EDGAR J A 1994 Identification of novel Phomopsins in Lupin seed extracts In Plant-associated toxins Agricultural phytochemical and ecological aspects DORLING P R p 232-237 Wallingford CAB In-ternational COELHO AG Software Bood v 3 04 2005 COIMBRA R SILVA E D Notas de Fitoterapia 2ordf ed Laboratoacuterio Cliacutenico Silva Arauacutejo SA 1958 CORDEIRO P J M VILEGAS J H Y LANCcedilAS F M HRGC-MS Analysis of Terpenoids from Maytenus ilicifolia and Maytenus aquifolium (ldquoEspinheira Santardquo) Journal of Brazilian Chemistry Society v 10 p 523-526 1999 CORRADO M RODRRIGUES KF Antimicrobial evaluation of fungal extracts produced by endophytic strains of Phomopsis sp Journal Basic Micrrobiol v44 p157-160 2004 CORREcircA RMS Caracterizaccedilatildeo de Phomopsis e Phoma obtidos de sementes de espeacutecies florestais 1995 72p Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Fitopatologia) ndash Universidade Federal de Lavras Lavras 1995 CRONQUIST A An integrated system of classification of flowering plants New York Columbia University Press 1981 CROUS PW WINGFIELD MJ FERREIRA FA ALFENAS A Mycosphaerella parkii and Phyllosticta eucalyptorum two new species from eucaliptus leaves in Brazil Mycological Research Cambridge v97 p 582-584 1993 CRUZ GL Livro Verde VolII 1a Editora Belo Horizonte-Minas Gerais 1965 DALZOTO P R GLIENKE-BLANCO C KAVA-CORDEIRO V ARAUacuteJO W L AZEVEDO J L RAPD analyses of recombinatiom process in the entomopathogenic fungus Beauveria bassiana Mycological Research v 107 p 1069-1074 2003 DJAOUIDA R SORBO G D REGGIO C ZOINA A FIRRAO G Polymorphisms in nuclear rDNA and mtDNA reveal the polyphyletic nature of isolates of Phomopsis
110
pathogenic to sunflower and a tight monophyletic clade of defined geographic origin Mycologia v 108 n 4 p 393-402 2004 DUARTE M R DEBUR M C Stem and leaf morphoanatomy of Maytenus ilicifolia Fitoterapia v 76 p 41-49 2005 EDGINTON L V KNEW K L BARRON G L Fungitoxic spectrum of benzimidazole compounds Phitopathology v 62 n 7 p 42-44 1971 EMBRAPA Fungos Endofiacuteticos Introduccedilatildeo Disponiacutevel em lthttpwwwcnpmaembrapabrprojetosendofiticosintroducaohtm1gt Acesso em Maio de 2005 ERNEST M MENDGEN W K WIRSEL W Endophytic Fungal Mutualists Seed-Borne Stagonospora spp Enhance reed biomass production in axenic microosms Molecular Plant-Microbe Interations v 16 n 7 p 580-587 2003 ESPOacuteSITO E AZEVEDO J L Fungos uma introduccedilatildeo agrave biologia bioquiacutemica e biotecnologia Caxias do Sul Edusc 510p 2004 ETHUR L Z CEMBRANEL C Z SILVA A C F Seleccedilatildeo de Trichoderma spp visando controle de Sclerotinia sclerotiorium in vitro Ciecircncia Rural v 31 n 5 p 885-887 2001 EZRA D STROBEL G A Effects of substrate on the bioactivity of volatile antimicrobials produced by Muscodor albus Plant Science St Paul v165 p913-922 2003 EZRA D CASTILLO U F STROBEL G A HESS W M PORTER H JENSEN J B CONDRON M A M TEPLOW D B SEARS J MARANTA M HUNTER M WEBER B YAVER D Coronamycins peptide antibiotics produced by a verticillate Streptomyces sp (MSU-2110) endophytic on Monstera sp Microbiology v 150 p 785-793 2004 FARR D F CASTLEBURY L A ROSSMAN A Y Morphological and molecular characterization of Phomopsis vaccinii and additional isolates of Phomopsis from blueberry and cranberry in the eastern United States Mycologia v 94 n 3 p 494-504 2002 FELSENTEIN J Conficence limits on phylogenies an approch using the bootstrap International Journal of Organic Evolution Lancaster v 39 p 366-369 1985 FERNANDEZ F A HANLIN R T Morphological and RAPD analyses of Diaporthe phaseolorum from soybean Mycologia v 88 n 3 p 425-440 1996
111
FERREIRA M E Aplicaccedilatildeo de Marcadores Moleculares no Mapeamento Geneacutetico de Plantas In III Curso de Marcadores Moleculares EMBRAPACENARGEN ndash Brasiacutelia DF 1994 FERREIRA D F Anaacutelise estatiacutestica por meio do SISVAR para Windows Versatildeo 40 In REUNIAtildeO ANUAL DA REGIAtildeO BRASILEIRA DA SOCIEDADE INTERNACIONAL DE BIOMETRIA 45 2000 Satildeo Carlos Anais Satildeo Carlos SSPSIB 2000 p 255-268 VAN SOEST P J Nutritional ecology of the ruminant 2 ed Ithaca Cornell University PressConstock Pub-lish1994 476 p FERREIRA MP OLIVEIRA CNOLIVEIRA BA LOPES MJALZAMORA F VIEIRA MAR A lyophilized aqueous extract of Maytenus ilicifolia leaves inhibits histamine-mediated acid secretion in isolated frog gastric mucose Planta v 219 p 319-324 2004 FIALHO M B Efeito in vitro Sacharomyces cerevicea sobre Guignardia citricarpa agente causal da pinta preta dos citros Piracicaba 2004 60f Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo FIGUEIREDO J G Bioprospecccedilatildeo Caracterizaccedilatildeo Morfoloacutegica e Molecular de Endoacutefitos de Maytenus ilicifolia com Ecircnfase EM Pestalotiopsis spp Curitiba 2006 Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade Federal do Paranaacute FRISVAD J C SAMSON R A Polyphasic taxonomy of Penicillium subgenus Penicillium - A guide to identification of food and air-borne terverticillate Penicillia and their mycotoxins Studies in Mycology v 49 p 1-173 2004 FRISVAD J C FRANK J M HOUBRAKEN J A M P KUIJPERS A F A SAMSON R A New ochratoxin A producing species of Aspergillus section Circumdati Studies in Mycology v 50 p 23-43 2004 FUNGARO M H P VIEIRA M L C Aplicaccedilotildees da PCR em ecologia molecular In MELO I S AZEVEDO J L (Eds) Ecologia microbiana Jaguarariuacutena Embrapa-CNPMA 1998 cap8 p205-227 FUNGARO M H P PCR na Micologia Biotecnologia Ciecircncia amp Desenvolvimento Brasiacutelia n14 p12-16 2000 GAMBOA-GAITAacuteN M A LAUREANO S BAYMAN P Endophytic Phomopsis Strains from of Guarea guidonia (Meliaceae) Journal of Science v 41 n 2 p 215-224 2005 GAO X ZHOU H XU D YU C CHEN Y QU L Hi h diversity of endophytic fun i from the pharmaceutical plant Heterosmilax japonica Kunth
112
revealed y cultivation-independent approach FEMS Microbiology Letters v 249 p 255-266 2005 GLIENKE C CHRISTO D MACCHERONI JR W AZEVEDO J L High molecular diversity of the fungus Guignardia citricarpa and Guignardia mangiferae and new primers for the diagnosis of the Citrus Black Spot Brazilian Archives of Biology and Technology Submetido 2007 GLIENKE C Variabilidade geneacutetica no fungo endoacutefito Guignardia citricarpa kiely detectada por RAPD Curitiba 1995 Dissertaccedilatildeo de Mestrado- Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade federal do Paranaacute GLIENKE-BLANCO C AGUILAR-VILDOSO CI VIEIRA MLC BARROSOP A V AZEVEDO JL Genetics variabilityb in the endophytic fungus Guignardia citricarpa isolated from citrus plants Genetics and Molecular Biology v 25 n 2 p 251-255 2002 GOacuteES A Etiologia aspectos epidemioloacutegicos e controle de Guignardia citricarpa agente causal da mancha preta do citros 100 p Relatoacuterio teacutecnico 2005 GONZALEZ M LOMBARDO A VALLARINO A J Plantas de la medicina vulgar del Uruguay Uruguay Talleres Grfificos Cerrito 149 p 1937 GUTHRIE P A I MAGILL C W FREDERIKSEN R A ODVODY G N Random amplified polymorphic DNA markers a systems for identifying and differentiating isolates of Colletotrichum graminicola Phytopathology St Paul v 82 p 832-835 1992 GURGEL LMS MENEZES M COELHO RSB Caracterizaccedilatildeo patogecircnica fisioloacutegica e isoenzimaacutetica de Phomopsis anacardii e Phomopsis mangiferae In CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA 30 1997 Poccedilos de Caldas Resumos Brasiacutelia Sociedade Brasileira de Fitopatologia 1997 p 269 GURGEL LMS MENEZES M COEcircLHO RSB Estudo comparativo de isolados de Phomopsis anacardii e Phomopsis mangiferae atraveacutes da patogenicidade e nutriccedilatildeo de C e N em trecircs regimes de luminosidade Summa Phytopathologica v 28 p 160-166 2002 GRAJAL-MARTIN M J SIMON C J MUEHLBAUER F J Use of Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) to characterize race 2 of Fusarium oxysporum fsp pisi Phytopatology v 83 p 612-14 1993 GRATTAPAGLIA D FERREIRA M E Introduccedilatildeo ao uso de marcadores moleculares em anaacutelise geneacutetica EMBRAPA Brasiacutelia 3 ed 220p 1998
113
GRIFFIN DH Fungal physiology 2ed New York Wiley-Liss 1994 458p HALL T A BioEdit48 Raileigh 1997-2001 1 arquivo (115M) Disponiacutevel em httpwwwmbioncsuedubioedithtml BioEdit a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windons 9598NT HANLIN R T MENEZES M Gecircneros ilustrados de ascomicetos UFRPE Recife-PE 1996 274p HERBERT J A GRECH NM A strain of Guignardia citricarpa the citrus black spot pathogen resistent to benomyl in South Africa Plant Disease St Paul v 69 p 1007 1985 HUANG Y WANG J LI G ZHENG Z SU W Antitumor and antifungal activities in endophytic fungi isolated from pharmaceutical plants taxus mairei Cephalataxus fortunei and Torreya grandis FEMS Immunology and Medical Microbiology v31 n47 p163-167 2001 IBRAHIM G BAYCA B Fungal bacterial and nematological problems of citrus grape and stone fruits in Arab countries Arab Journal of Plant Protection Beirut v7 n2 p190-197 1989 ITOKAWA H SHIROTA O IKUTA H MORITA H TAKEYA K IITAKA Y Triterpenes fom Maytenus ilicifolia Phytochemistry v 30 n 11 p 3713-37161991 ITOKAWA H SHIROTA O IKUTA H MORITA H TAKEYA K IITAKA Y Oligo-nicotinated sesquiterpene polyesters from Maytenus ilicifolia Journal of natural Prodcts v 56 p 1479-14851993 JASALAVICH C OSTROFSKY A JELLISON J Detection and identification of decay fungi in spruce wood by restriction fragment length polymorphism analisis of amplified genes encoding rRNA Applied and Environmental Microbiology Washington v66 n11 p 4725-4734 2000 JOHNSTON P R FULLERTON R A Cryptosporiopsis citri sp Nov cause of a citrus leal spot in the Pacific Islands New Zealand Journal of Experimental Agriculture Wellington v16 p159-163 1988 JORGE R M LEITE J P V OLIVEIRA A B TAGLIATI C A Evaluation of antinociceptive anti-inflammatory and antiulcerogenic activities of Maytenus ilicifolia Journal Ethnopharmacol v 94 n1 p 93-100 2004 KIM K H TEN L N LIU Q M IM W T LEE S T Sphingobacterium daejeonense sp nov isolated from a compost sample International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2031-2036 2006
114
KIM B Y WEON H Y LEE K H SEOK S J KWON S W GO S J STACKEBRANDT E Dyella yeojuensis sp nov isolated from greenhouse soil in Korea International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2079-2082 2006 LEE Y H SNOW J P Phenotypic and genetic variations in Diaporte phaseolorum var caulivora the soybean stem canker pathogen Phytopathology v 81 p1205 1992 LEITE J P V RASTRELLI L ROMUSSI G OLIVEIRA A B VILEGAS J H Y VILEGAS W PIZZA C Isolation and HPLC quantitative analysis of flavonoid glycosides from razilian evera es (Maytenus ilici olia and M aqui olium) Journal of Agricultural and Food Chemistry v 49 p 3796-3801 2001 LEONIAN L H A study of the factors promoting pycnidium ndash formation in some Sphaeropsidales American Journal Botanic Columbus v11 p 19-50 1924 LEUCHTMANN A PETRINI O PETRINI LE CARROLL GC Isozyme polymorphism in six endophytic Phyllosticta species Mycological Research Cambridge v96 n 4 p 287-294 1992 LI J Y STROBEL G A Jesterone and hydroxy-jesterone antioomycete cyclohexenone epoxides from the endophytic fungus Pestalotiopsis jesteri Phytochemistry v 57 p 261-265 2001 LIMA O G de COELHO J S de B WEIGERT E DrsquoALBUQUERQUE I L LIMA D de A SOUZA M A de M Substacircncias antimicrobianas de plantas superiores ndash Sobre a presenccedila de maitenina e pristimerina na parte cortical das raiacutezes de Maytenus ilicifolia procedente do Brasil Meridional Revista do Instituto de Antibioacuteticos v 11 n 1 p 35-38 1971 LIU C H ZOU W X LU H TAN R X Antifungal activity of Artemisia annuaendophyte cultures against phytopathogenic fungi Journal of Biotechnology v88 p 277-282 2001 LU H ZOU W X MENG J C HU J TAN R X New bioactive metabolites produced by Colletotrichum sp an endophytic fungus in Artemisia annua Plant Science Oxford v 151 n 1 p 67-73 2000 LU G Z CANNON P F REID A SIMMONS C M Diversity and molecular relationships of endophytic Colletotrichum isolates from the Iwokrama Forest Reserve Guyana Mycological Research v 108 n 1 p 53-63 2004 MAKI C S Diversidade e Potencial Biotecnoloacutegico de Fungos Endofiacuteticos de Cacau Theobroma cacao L Piracicaba 2006 Dissertaccedilatildeo de Doutorado ndash Setor de Agronomia- Geneacutetica e Melhoramento de Plantas Universidade Escola Superior de
115
Agricultura Luiz de Queiroz MANULIS S KOGAN N REUVEN M BEN-YEPHET Y Use of the RAPD technique for identification of Fusarium oxysporum f sp dianthi from carnation Phytopathology v84 p98-101 1993 MARTINS-CORDER M P MELO I S ANTAGONISMO IN VITRO DE Trichoderma spp A Verticillium dahliae KLEB Scientia Agriacutecola v 55 n1 p1-7 1998 MARIANO R L R Meacutetodos de seleccedilatildeo in vitro para o controle microbioloacutegico de patoacutegenos de plantas Revisatildeo Anual de Patologia de Plantas v I p 369-409 1993 McMILLAN JR RT Guignardia citricarpa a cause of black spot on mango foliage in Florida Journal of Phytopathology Berlin v117 p 260-264 1986 McPHERSON M J QUIRKE P TAYLOR G R PCR 1 A pratical approach IRL New York v1 348p 1991 McONIE K C The latent occurrence in citrus and other hosts of a Guignardia easily confused with G citricarpa the citrus black spot pathogen Phytopathology St Paul v 54 p 40-43 1964a McONIE K C Source of inoculum of Guignardia citricarpa the citrus black spot pathogen Phytopathology St Paul v 54 p 64-67 1964b MEIJER G MEGNEGNEAU G LINDERS E G Avariability for isozyme vegetative compatibility and RAPD markers in natural populations of Phomopsis subordinaria Mycological Research v98 n3 p267-276 1994 MEIRA PENNA Dicionaacuterio Brasileiro de Plantas Medicinais 3a Ed Editora Kosmos Rio de Janeiro 1946 MELO I S Agentes microbianos de controle de fungos fitopatogecircnicos In Controle bioloacutegico v I MELO I S e AZEVEDO J L (Eds) Jaguariuacutena SP Embrapa-CNPMA 1998 264p MICHELMORE R W HULBERT S H Molecular markers for genetic analysis of phytopathogenic fungi Annual Review of Phytopathology Palo Alto v 25 p 383-404 1987 MOLLER C WEBER G DREYFUSS M M Intraespecific diversity in the fungal species Chaunopycnis alba implications fo microbial screening programs Journal of industrial microbiology v 17 p 359-372 1996
116
MONTANARI T CARVALHO J E de DOLDER H Effect of Maytenus ilicifolia Martex Reiss on spermatogenesis Contraception v 57 p 335-3391998 MONTANARI T BEVILACQUIA E Effect of Maytenus ilicifolia Mart On pregnant mice Contraception v 65 p 171-1752002 MOSTERT L CROUS P W KANG J PHILLIPS A J L Species of Phomopsis and a Libertella sp occurring on grapevines with specific reference to South Africa morphological cultural molecular and pathological characterization Mycologia v 93 n 1 p 146-167 2001 MULLIS K B F A FALOONA Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction Methods Enzymol v 155 p 335-350 1987 MURALI T S SURYNARAYANAN T S GEETA R Endophytic Phomopsis species Host range and implications for diversity estimates NRC Research Press Canadaacute 2006 NEDASHKOVSKAYA O I VANCANNEYT M KALINOSKAYA N I MIKHAILOV V V SWINGS J Aquimarina intermedia sp nov reclassification of Stanierella latercula (Lewin 1969) as Aquimarina latercula comb nov and Gaetbulimicrobium brevivitae International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2037-2041 2006 NETO P A S AZEVEDO J L ARAUacuteJO W L Microrganismos Endofiacuteticos Interaccedilatildeo com Plantas e Potencial Biotecnoloacutegico Revista Biotecnologia v5 n29 2002 OrsquoDONNELL K GRAY L E Phylogenetc relationships of the soyobean sudden death syndrome pathogen Fusarium solani f sp phaseoli inferred from rDNA sequence data and PCR primers for its identification Molecular Plant Microbe Interact v 8 p 709-716 1995 OKANE I NAKAGIRI A ITO T Endophytic fun i in leaves of ericaceous plants Canadian Journal of Botany v 76 p 657-663 1998 OULLET T SEIFFERT K A Genetic characterization of Fusarium graminearum strains using RAPD e PCR amplification Phytopathology v 83 p 1003-1007 1993 PAAVANEM-HUHTALA S AVIKAINEM H YLI-MATTILA T Development of strain-specific primers for a strain of Gliocladium catenulatum used in bioological control European Journal Plant Pathological Dordrecht v106 n2 p187-198 2000 PANIZZA S Plantas que Curam (Cheiro de Mato) 15deg ed Satildeo Paulo IBRASA 1998 265 p PATEL B N PATEL R C TILVA D G Phyllosticta leaf spot a new disease in Bidi
117
tobacco nursey Tobacco Research Rajahmundry v14 p 1176-1178 1988 PATERSON R R M BRIDGE P D Biochemical techniques for filamentous fungi CAB International 125 p 1994 PARMETER J R An effect of substrate on spore form in Phomopsis Phytopatholog v 48 p 396-397 1958 PENNA E B da S Microrganismos endofiacuteticos de erva-mate (Ilex paraguariensis STHIL) e variabilidade geneacutetica em Phyllosticta sp por RAPD Curitiba 2000 123 f Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Universidade Federal do Paranaacute PETRINI O Taxonomy of endophytic fungi of arial plant tissues In FOKKEMA N J HEUVEL JVAN DEN (Ed) Microbiology of the Phyllosphere Cambrige University Press p 175-87 1986 PETRINI O Fungal endophytes of tree leaves In ANDREWS J H HIRANO S S (Eds) Microbial Ecology of Leaves New York Sprin er-Verla 1991 p 179-197 PETRINI O STONE K CARROLL F E Endophytic fungi in evergreen shrubs in western Oregon a preliminary study Canadian Journal of Botany v 60 p 789-796 1982 PHILLIPS A J L The plant pathogenic genus Phomopsis and its teleomorph (Diaporthe) Development and application of morphological biological and phylogenetic species concepts Disponiacutevel em lthttpwwwcremfctunlptbotryosphaeria_sitepersonal_web_pagehtmgt Acesso em Dezembro de 2006 PILEGGI S A V Isolamento e Caracterizaccedilatildeo de Microrganismos Endofiacuteticosde Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss por Meio de Marcadores RAPD eseu Potencial Farmacoloacutegico Curitiba 2006 Dissertaccedilatildeo de Doutorado - Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade Federal do Paranaacute PIOLI R N MORANDI E N MARTIacuteNEZ M C LUCCA F TOZZINI BISARO V HOPP H E Morphologic molecular and pathogenic characterization of diaporthe phaseolorum variability in the core soybean ndash Producing Aacuterea of Argentina Phytopathology v 93 n2 p136-146 2003 PONTECORVO G ROPER J A HEMMOS LM MAC DONALD K D BUFTON A W J The genetics of Aspergillus nidulans Advances in Genetics v 5 p141-238 1953 PONS N Estudio taxonomico de especies de Phoma y Phyllosticta sobre cantildea de azucar (Saccharum sp) Fitopatologia Venezolana Maracay v 3 p 34-43 1990
118
PROMPUTTHA I JEEWON R LUMYONG S MCKENZIE E H C HYDE K D Ribosomal DNA fingerprinting in the identification of non sporulating endophytes from Magnolia liliifera (Magnoliaceae) Fungal Diversity v 20 p 167-186 2005 QUIROGA E N SAMPIETRO A R VATTUONE M Screening antifungal activitis of selected medicinal plants Journal of Ethnopharmacology v 74 p 89-96 2001 RAEDER U BRODA P Rapid preparation of DNA from filamentous fungi Letters in Applied Microbiology Oxford v1 p17-20 1985 REHNER S A UECKER F A Nuclear ribosomal internal transcribed spacer phylogeny and host diversity in the coelomycete Phomopsis Canadian Journal of Botanic v 72 p1666-1674 1994 RIBEIRO L A de Variabilidade Geneacutetica por RAPD em fungos endoacutefitos de Gecircnero Penicillium provenientes de Zea mays L Curitiba 1995 90 f Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Universidade Federal do Paranaacute RIEDL H WECHTL E Proposal to conserve the name Phomopsis (Sacc) Bubak (1905) against Myxolibertella Hohnel (1903) Taxon v 30 n 4 p 826-828 1981 ROBES C F A mancha preta dos fungos ciacutetricos (Phyllosticta citricarpa) ameaccedila a citricultura paulista Laranja Cordeiroacutepolis v 11 p 75-86 1990 ROBES C F BITTENCUCOURT S M A mancha preta dos frutos um dos fatores limitantes agrave produccedilatildeo citricola do estado do Rio de Janeiro Comunicado Teacutecnico ndash CTAA-EMBRAPA n 19 p 1-5 1995 RODRIGUES K F SAMULES G J Fungal endophytes of Spondias mombin in Brazil a preliminary study Journal of Basic Microbiology v 39 p 131 ndash 135 1999 RODRIGUES KF HESSE M WERNER C Antimicrobial activities of secondary metabolites produced by endophytic fungi from Spondias mombin Journal of Basic Microbiology v 40 n 4 p 261-267 2000 RODRIGUES-HEERKLOTZ KF DRANDAROV K HEERKLOTZ J HESSE M WERNER C Guignardia Acid a Novel Type of Secondary Metabolite Produced by the Endophytic fungus Guignardia sp Isolation Structure Elucidation and Asymmetric Synthesis Helvetica Chimica Acta v 84 p 3766-3772 2001 RODRIGUES K F SIEBER T N GRUumlNIG R C HOLDENRIEDER O Characterization of Guignardia mangiferae isolated from tropical plants based on morphology ISSR-PCR amplifications and ITS1-58S-ITS2 sequences Mycological
119
Research Cambridge v 108 p 45-52 2004 RODRIGUES K F COSTA G L CARVALHO M P EPIFANIO R A Evaluation of extracts produced by some tropical fungi as potential cholinesterase inhibitors Journal of Microbiology and Biotechnology v21 p1617-1621 2005 RODRIGUES M B C Controle de Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta dos Citros Piracicaba 2006 67 p Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo ROHLF F J NTSYS-PC Numerical taxonomy and multivariate analysis system New York Exeter Publishing 1988 RUBINI M R SILVA-RIBEIRO R T POMELLA A W V MAKI C S ARAUacuteJO W L SANTOS D R AZEVEDO J L Diversity of endophytic fungal community of cacao (Theobroma cacao L) and biological control of Crinipellis perniciosa causal agent of Witches Broom Disease International journal of Biological Sciences v 1 n 1 p 24-33 2005 SAIKI R K SCHARF S J FALOONA F MULLIS K B HORN G T ERLICH H A ARNHEIM N Enzymatic amplification of β-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia Science v 230 p1350-1354 1985 SAMPAIO J P FELL J W GADANHO M BAUER R Kurtzmanomyces insolitus sp nov a new anamorphic heterobasidiomycetous yeast species Systematic and Applied Micorbiology v 22 p 619-625 1999 SAMUELES G J SEIFERT K A The impact of molecularcharacters on systematics of filamentous ascomycetes Annual Review of Phytopathogy Palo Alto v 33 p 37-67 1995 SANGER F NICKLEN S COULSON A R DNA Sequencing with chain terminating inhibitors Proceedings of the National Academy of Sciences of the United states of America Washington v 74 p 5463-5467 1977 SANTOS MF Anaacutelise da micoflora associada ao baru (Dipteryx alata Vog) e a caroba (Cybistax antisyphilitica (Mart) Mart) BrasiacuteliaDF 1996 Dissertaccedilatildeo de Mestrado Universidade Nacional de Brasiacutelia SATOKO K MINAKA N KOBAYASHI T KUDO A OHTSU Y Molecular Phylogenetic Analysis of Ribosomal DNA Internal Transcribed Spacer Regions and Comparison of Fertility in Phomopsis Isolates from Fruit Trees Plant Pathology v 66 p 191-210 2000
120
SCHULZ B BOYLE C DRAEGER S ROumlMMERT A KROHN K Endophytic fungi a source of novel biologically active secondary metabolites Mycological Research Cambridge v 106 p 996-1004 2002 SCHULZ B BOYLE C The endophytic continuum Mycological Research Cambridge v 109 p 661-686 2005 SETTE L D PASSARINI M R Z DELARMELINA C SALATI F DUARTE M C T Molecular characterization and antimicrobial activity of endophytic fungi from coffee plants World Journal of Microbiology and Biotechnology v 22 p 1185-1195 2006 SHIROTA O MORITA H TAKEYA K ITOKAWA H ITAKA YCytotoxic aromatic triterpenes from Maytenus ilicifolia and Maytenus chuchuhuasca Journal of Natural Products v 57 p 1675-1681 1994 SHIVAS R G ALLEN J G WILLIAMSON P M Infraspecific variation demonstrated in Phomopsis leptostromiformis using cultural and biochemical techniques Mycological Research Cambridge v 95 p 320-323 1991 SHRESTHA K STROBEL G A PRAKASH S GEWALI M Evidence for paclitaxel from three new endophytic fungi of Himalayan yew of Nepal Planta Medicinal v 67 p 374-376 2001 SILVA C G RECIO R A OLIVEIRA A B de PAIVA R L R Coleta e avaliaccedilatildeo da qualidade fitoquiacutemica de Maytenus ilicifolia M (espinheira-santa) Tribuna Farmacecircutica v 5759 p 46-50 1991 SILVA F A S The ASSISTAT Software statistical assistance In INTERNATIONAL CONFERENCE ON COMPUTERS IN AGRICULTURE 6 Anais Cancun American Society of Agricultural Engineers p 294-298 1996 SILVA F de A S AZEVEDO C A V de Versatildeo do programa computacional Assistat para o sistema operacional Windows Revista Brasileira de Produtos Agroindustriais Campina Grande v 4n 1 p 71-78 2002 SILVA G H TELES H L TREVISAN H C BOLZANI V S YOUNG M C M PFENNING L H EBERLIN M N HADDAD R COSTA-NETO C M ARAUacuteJO A R New Bioactive Metabolites Produced by Phomopsis cassiae an Endophytic Fungus in Cassia spectabilis Journal Brasileiro Chemical Society v16 n6 p 1463-1466 2005 SILVA R L DE O LUZ J S SILVEIRA E B CAVALCANTE T Fungos endofiacuteticos em Annona spp isolamento caracterizaccedilatildeo enzimaacutetica e promoccedilatildeo do crescimento em mudas de pinha (Annona squamosa L) Acta Botanica Brasilica v
121
20 n 3 p 649-655 2006 SILVEIRA EB 2001 Bacteacuterias promotoras de crescimento de plantas e biocontrole de doenccedilas Pp 71-100 In R Barros e SJ Michereff Proteccedilatildeo de plantas na agricultura sustentaacutevel Recife Imprensa Universitaacuteria da UFRPE SIMOtildeES C M O MENTZ L A SCHENKEL E P IRGANG B E STEHMANN J R Plantas da medicina popular no Rio Grande do Sul Porto Alegre Editora da UniversidadeUFRGS 174p 1986 SIVANESAN A The bitunicate ascomycetes and their anamorphs J Cramer Germany 701p 1984 SNEATH P H A SOKAL R R Numerical Taxonomy W H freeman Co San Francisco 1973 SOUZA FORMIGONI M L OLIVEIRA M G MONTEIRO M G DA SILVEIRA FILHO N G BRAZ S CARLINI E A Antiulcerogenic effects of two Maytenus species in laboratory animals Journal of Ethnopharmacology v 34 n 1 p 21-27 1991 SOUZA A Q L SOUZA A D L SPARTACO A F PINHEIRO M L B SARQUIS M I M PEREIRA J O Atividade antimicrobiana de fungos endofiacuteticos isolados de plantas toacutexicas da Amazocircnia Palicourea longiflora (aubl) rich e Strychnos cogens bentham Acta Amazocircnica v 34 n 2 p 185-195 Manaus 2004 SPOacuteSITO MB AMORIM L BASSANEZI RB BERGAMIN FILHO A HAU B Spatial pattern of black spot incidence within citrus trees related to disease severity and pathogen dispersal Plant Pathology p 103-108 2008 STAMFORD T L M ARAUacuteJO J M STAMFORD N P Atividade enzimaacutetica de microrganismos isolados do Jacatupeacute (Pachyrhizus erosus L Urban) Ciecircncia Tecnoloacutegica de Alimentos v 18 p 382-385 1998 STIERLE A STROBEL G STIERLE D GROTHAUS P BIGNAMI G The search for a taxol-producin microor anism amon the endophytic fun i of the Pacific yew Taxus bre i olia Journal of Natural Products v 58 n 9 p 1315-1324 1995 STINSON M ERZA D HESS W M SEARS J STROBEL G An endophytic Gliocladium sp Of Eucryphia cordifolia producing selective volatile antimicrobial compounds Plant Science St Paul v165 p 913-922 2003 STROBEL A G Rainforest Endophytes and Bioactive Products Critical Reviews in Biotechnology Boca Raton v 22 n 4 p 315-333 2002
122
STROBEL G A Endophytes as sources of bioactive products Microbes and Infection v 5 p 535-544 2003 STROBEL G DAISY B Bioprospecting for Microbial Endophytes and their Natural Products Microbiology and Molecular Biology Reviews v 67 n 4 p 491-502 2003 SUGHA SK SINGH BM SHARMA BM Studies on Phyllosticta glumarum causing glume blight of rice (Oryza sativa L) Himachal Journal of Agricultural Research Palampur v 12 n 1 p 11-14 1986 TAYLOR-ROSA S G BARROS I BCaracterizaccedilatildeo das sementes de Maytenus ilicifolia Mart Ex Reiss espinheira - santa e viabilidade de sua propagaccedilatildeo sexuada Porto Alegre 1994106f Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Universidade Federal do Rio Grande do Sul THOMPSON J D HIGGINS D G GIBSON T J Clustal W Improving the sensitiviy of rogressive multiple alignment through sequence weighting positions-specific gap penalties and weight matrix choice Nucleic Acids Research v 22 p 4673-4680 1994 TIMNICK MB LILLY VG BARNETT HL Factors affeting sporulation of Diaporthe phaseolorum var batatatis from soybean Phytopathology St Paul v 41 n 4 p 327-336 1951 UECKER F A A World list of Phomopsis names with notes on nomenclature morphology and biology National Fungus Collection v 13 1988 VAN DER AA H A Studies in Phyllosticta I Studies in Mycology n 5 1973 VAN DER AA H A M E Noordeloos and J de Gruy-ter Species concepts in some larger genera of the Coelomycetes Studies in Mycology v 32 p 3-19 1990 VASCONCELOS MJV ALMEIDA MA HENNING AMR BARROS AA MOREIRA EG Differentiation of Colletotrichum truncatum isolates by random amplified polymorphic DNA Fitopatologia Brasileira Brasiacutelia v 19 p 520-523 1994 VELICHETI R K McCCLARY C LAMISON R D SINCLAIR J B Immunodetection of the Diaporthe and Phomopsis complex of soybeans Phytopathology v 81 p 1212 1991 VIDIC M Variability in Diaporthe phaseolorum var caulivora on soybean in the Vojvodina Providence in Serbia Zastita Bilja v 42 p 183-189 1991
123
VILARINHOS A D PAULA JR T J BARROS E G MOUREIRA M A Characterization of races of Colletotrichum lindemutianum by the random amplified polymorfic DNA technique Fitopatologia Brasileira Brasiacutelia v20 p194-198 1995 VILLA- CARVAJAL M COQUE J J R ALVAREacuteZ-RODRIGUEacuteZ M L URUBURU F BELLOCH C Polyphasic identication of yeasts isolated from bark of cork oak during the manufacturing process of cork stoppers FEMS Yeast Research v 4 p 745-750 2004 VIRET O PETRINI O Colonization of eech leaves (Fagus syl atica) by the endophyte Discula umbrinella (teleomorph Apiognomonia errabunda) Mycological Research v 98 p 423-432 1994 WAGENAAR M CORWIN J STROBEL G A CLARDY J Three new chytochalasins produced by an endophytic fungus in the genus Rhinocladiella Journal Natural Products v 63 p1692-1695 2000 WALKER M R RAPLEY R Guia de rotas na tecnologia do gene Atheneu Satildeo Paulo 1999 334p WANG J Li G LU H ZHENG Z HUANGY SU W Taxol from Tubercularia sp strain TF5 an endophytic fungus of Taxus mairei FEMS Microbiology Letters v 193 p 249-253 2000 WATSON J D GILMAN M WITKOSWSKI J ZOLLER M Recombinant DNA 2 ed New York Freeman and Company 1992 WELSH J McCLELLAND M Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers Nucleic Acid Research Oxford v 18 p 7213-7218 1990 WHITE Jr J MORROW A C Endophyte-host associations in forage grasses XII A fungal endophyte to Trichachne insularis belonging to Psedocercosporella Mycologia Lawrence v 78 n 5 p 846-850 1989 WHITE Jr J F MORROW A C Endophyte-host associations in forage grasses XII A fungal endophyte of Trichachne insularis belonging to Pseudocercosporella Mycologia Lawrence v 82 p 218-226 1990 WHITE Jr J F MORGAN-JONES G MORROW AC Taxonomy life cycle reprodution and detection of Acremonium endophytes Agriculture Ecosystem amp Environment v 44 p13-37 1993 WILLIAMS J G K KUBELIK A R LIVAK K J RAFALSKI J A TINGER S V DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers Nucleic Acids Research v 18 n 22 p 6531-6535 1990
124
WILLIAMS J G K HANAFEY M K RAFALSKI J A TINGEY S V Genetic analysis using random amplifield polymorphic DNA markers Methods in Enzymology San Diego v 218 p 704-740 1993 ZHANG A W RICCIONI L PEDERSENW L KOLLIPARA K P HARTMAN G L Molecular identi-fication and phylogenetic grouping of Diaporthe phaseolorum and Phomopsis longicolla isolates from soybean Phytopathology v 88 p1306 -1314 1998 ZOU W X MENG J C LU H CHEN G X SHI G X ZHANG T Y TAN R X Meta olites of Colletotrichum gloeosporioides an endophytic fun us in Artemisia mongolica Journal of Natural Products v 63 n 11 p 1529-1530 2000 ZOU W X TAN R X Endophytes a rich source of functional metabolites Natural Product Reports v18 p 448-459 2001
125
ANEXOS
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 496671024 9933420 94396 MEIOS DE CULTURA 2 137912854 68956427 655287 INTERACcedilAtildeO A 100 193198257 1931983 18359 INTERACcedilAtildeO b 100 10989107 0109891 1044 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
INTERACcedilAtildeO A INTERACcedilAtildeO ENTRE OS MEIOS DE CULTURA E OS ISOLADOS de Phomopsis INTERACcedilAtildeO B INTERACcedilAtildeO ENTRE AS REPETICcedilOtildeES DOS ISOLADOS DE Phomopsis significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS ENTRE OS MEIOS DE CULTURA
BDA 5169935 a MEA 4973856 b AV 3921569 c
CV = 62
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 1 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM DIFERENTES MEIOS DE CULTURA
126
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 230248366 4604967 43761 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS ESBA1 700 a A323 700 a A215A 700 a ESSD1 700 a SM9713 700 a ESGF1 700 a SM9631 700 a ESJD1 700 a ESKD1 667 a A334 667 a ESDF1 633 b A132 633 b A123 600 b A333A 600 b MU0123 600 b ESJH1 600 b A321 600 b ESRD1 600 b A116 600 b A134 567 b A115B 567 b ESIA1 533 c
ANEXO 2ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO BDA
127
A131 500 c SM9714 500 c A135 500 c ESIE1 500 c ESFB2 500 c A124 500 c ESPAC22 500 c ES2KF1 500 c A113 500 c ESJE1 500 c ESJE2 433 d ESFH1 400 d ESJG1 400 d ES2WC1 400 d PHO1 400 d SM9638 400 d ES2NA1 400 d ES2AB1 400 d ESFF1 400 d AT9811 400 d AT9810 400 d ES2WF1 400 d A126 400 d PHO19 400 d A216B 400 d ES80J 367 d ESGA1 367 d AT9906 300 e A333B 233 f
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
128
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 189058824 3781176 35932 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS ESKD1 700 a ESJE2 600 b A123 600 b ESJE1 533 c SM9638 500 c AT9811 500 c SM9713 500 c PHO1 500 c ESBA1 500 c SM9631 500 c ESFB2 500 c A334 500 c A323 500 c MU0123 500 c A333A 433 d ESJD1 433 d ESGF1 433 d A116 433 d PAC22 400 e ESDF1 400 e A321 400 e A132 400 e ES2KF1 400 e
ANEXO 3ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO AVEIA
129
ESJG1 400 e ESRD1 400 e PHO19 400 e A115B 400 e A124 400 e ESFF1 367 e A134 367 e ESIE1 367 e A135 367 e A131 367 e A113 367 e ES2WF1 367 e SD1 367 e ESIA1 333 e ESGA1 300 f ESJH1 300 f ESFH1 300 f AT9906 300 f ES2NA1 300 f A216B 300 f ES80J 300 f ESA215A 267 f AT9810 200 g A333B 200 g ES2AB1 200 g SM9714 200 g ES2WC1 200 g
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
130
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 270562092 5411242 51423 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS A323 733 a SM9631 700 a ESKD1 700 a A134 700 a ESIE1 700 a A116 667 b A334 667 b A215A 633 b ESSD1 633 b A321 600 c MU0123 600 c ESGF1 600 c ESRD1 600 c AT9811 600 c SM9713 600 c A123 600 c ESJH1 600 c ESDF1 600 c A131 567 c IA1 567 c ESBA1 567 c ESJD1 567 c A333A 533 d A135 500 d
ANEXO 4ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO MEA
131
ES2NA1 500 d A124 500 d A132 500 d SM9714 500 d ESFB2 500 d A115B 467 e ES2AB1 433 e A216B 433 e A113 433 e PHO1 400 f SM9638 400 f ES2WF1 400 f A126 400 f ESJE1 400 f ESPAC22 400 f ESFF1 400 f ES2KF1 400 f ESJG1 367 f ES80J 367 f ESJE2 333 g ESFH1 333 g AT9906 300 g ESGA1 300 g SM9810 300 g ES2WC1 300 g A333B 233 h PHO19 233 h
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
132
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 46 1602192500 34089202 1617590 RESIacuteDUO 432 91040000 210741 Total 478 1693232500
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO AT9906 352 a AT9810 353 a ESFH1 297 b ESPAC22 195 c ES2KF1 194 c SM9631 193 c ESGA1 184 cd PHO19 184 cd ES80J 166 de ESRD1 152 ef ESFB2 143 efg ESJE2 142 efg ESJE1 142 efg ESJG1 131 fgh A323 127 fghi A333A 126 ghij A135 123 ghij A124 123 ghij A126 123 ghij A132 123 ghij A131 123 ghij A134 123 ghij
ANEXO 5 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO DOS ESPOROS BETACONIacuteDIOSDOS ISOLADOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA
133
A115B 123 ghij ESIE1 123 ghij ES2WC1 119 ghil ES2WF1 119 ghil SM9713 116 hil A334 116 hil ESIA1 115 hil A333B 113 hil ESFF1 113 hil ESGF1 111 hil ES2AB1 107 him A123 107 him A113 107 him ESJD1 106 him ESKD1 105 im ES2NA1 104 im A215A 103 im SM9714 102 im ESSD1 101 m ESJH1 97 m MU0123 96 m A321 96 m ESDF1 95 m A216B 95 m A116 85 m
DMS = 259444 CV = 1052904
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
134
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 21 2674219 127344 459861 RESIacuteDUO 88 243688 002769 Total 109 2917907
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 293 a Fungicida Derosal 236 b ESGF1 157 c ESGA1 137 cde ESFH1 134 cdef ESIA1 120 cdefg ES2KF1 119 cdefgh ESFF1 146 cdefgh ES2NA1 111 defgh ES2AB1 110 defgh ESKD1 114 defgh ESJE2 110 defgh ESBA1 112 defgh ESRD1 098 efgh ESJG1 099 efgh ESJE1 099 efgh ESFB2 096 fgh ESJH1 094 gh ESJD1 093 gh ESIE1 095 gh ESSD1 078 h ESDF1 078 h
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 6 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
DMS = 039023 CV = 1340825
135
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 9 974154 108239 225325 RESIacuteDUO 40 192148 004804 Total 49 1166302
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 201 a
fungicida 174 ab AT9906 139 bc AT9810 117 cd AT9811 102 cde SM9638 110 cde SM9714 076 de SM9631 075 de MU0123 067 e SM9713 065 e
DMS = 046460 CV = 1946824
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 7 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
136
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 22 2382133 108279 239352 RESIacuteDUO 92 416192 004524 Total 114 2798325
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 244 a ES2WC1 237 a fungicida 185 b ES80J 138 bc A333B 136 cd ES2WF1 117 cde A333A 113 cde A132 110 cde A215A 106 cde A116 102 cde A124 101 cde A115B 101 cde A135 100 cde A215B 097 cde A321 094 cde A334 093 cde A323 092 cde A123 091 cde A113 091 cde A126 089 de A131 088 e ESPAC22 085 e A134 076 e
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 8 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
DMS = 050157 CV = 1809416
137
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA
FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 6210037 124201 165056 RESIacuteDUO 204 1535052 007525 Total 254 7745089
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 302 a FUNGICIDA Derosal 244 abc ES2WC1 277 ab AT9906 224 bcd AT9810 222 bcde SM9638 218 bcdef ESGF1 201 cdefg A333B 188 cdefgh A132 167 defghi SM9714 159 defghij ESFF1 153 efghil ES2WF1 150 fghil ESGA1 149 fghil ESFH1 147 ghil ES80J 147 ghil MU0123 144 ghil ES2NA1 143 ghil AT9713 142 ghim A321 141 ghim A216B 140 ghim AT9811 139 ghim A116 137 ghim
ANEXO 9 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305
138
ESBA1 134 ghim ES2AB1 133 ghim A323 132 ghin ESJG1 131 ghin ESIE1 130 hin A333A 129 hin A113 127 hin A134 125 hin ESSD1 122 hin ESKD1 121 hin ESIA1 117 in A124 113 in A334 112 in ES2KF1 112 in ESJE1 110 in ESPAC22 108 in A131 108 in A126 106 in A135 102 in ESRD1 094 n SM9631 093 n ESJE2 090 n ESJH1 090 n ESFB2 088 n ESJD1 087 n A123 087 n ESDF1 086 n A115B 072 n A215A 062 n
DMS = 070465 CV = 1983267
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
139
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 28 2145366 076620 407144 RESIacuteDUO 116 218300 001882 Total 144 2363666
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 222 a ESRD1 19 b A131 176 b ESIA1 178 b SM9713 162 bc ESJD1 162 bc A126 154 bcd MU0123 149 bcde A333A 134 cdef ESGA1 134 cdef A113 133 cdef ESGF1 130 cdef A334 130 cdef ESBA1 140 cdef SM9638 127 def ESJH1 119 efg ESDF1 115 fgh ESSD1 112 fgh ESKD1 113 fgh ES2AB1 111 fghi A124 111 fghi
ANEXO 10 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 PARA DETECCcedilAtildeODE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
140
A215A 109 fghi A321 108 fghi A134 089 ghij A115B 082 hij ESFF1 078 ij ESFH1 071 l A123 062 l ES2WF1 042 l
DMS = 033193 CV = 1095343
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
141
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA
FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 28 11264938 402319 481124 RESIacuteDUO 116 970000 008362 Total 144 12234938
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 422 a ESGA1 275 b ESGF1 267 bc ESBA1 265 bc SM9713 261 bc A333A 251 bcd ESSD1 235 bcde MU0123 234 bcde ESKD1 211 bcdef A215A 203 cdef A321 188 defg A131 173 efgh SM9638 167 efgh A124 148 fghi ESJD1 147 fghi A113 130 ghij ESIA1 122 ghij ES2AB1 128 ghij ESDF1 124 ghij A334 112 hij A115B 106 hij
ANEXO 11 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 PARA DETECCcedilAtildeODE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
142
ESRD1 104 hij ES2WF1 086 il A134 083 il A126 080 il ESFF1 075 l A123 065 l ESFH1 025 l ESJH1 017 l
DMS = 069970 CV = 1193907
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
43
ANE
XO
12
ndash M
ATR
IZ D
E D
AD
OS
PA
RA
CA
RA
CTE
RIZ
ACcedil
AtildeO
CR
ITEacuteR
IOS
ME
DID
AS
ME
IOS
DE
C
ULT
UR
A
MU
0123
SM
9631
SM
9638
SM
9713
SM
9714
AT9
810
AT9
811
AT9
906
ES
2AB
1
ES
2KF1
ES2N
A1
ES2W
C1
ES2W
F1
ES
80J
ESBA
1
ESD
F1
ES
FB2
ES
FF1
ESFH
1
ES
GA
1
ESG
F1
ESIA
1
ESIE
1
ESJD
1
ESJE
1
ESJE
2
1 AV 1 0 1 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 MEA 0 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 BDA 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 1 1 0
2 AV 1 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1 1 1 3 AV 0 0 0 0 1 0 0 1 1 1 0 1 0 0 0 1 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 4 AV 1 0 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
MEA 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
5 AV 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
6 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0 BDA 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1
7 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 BDA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0
8 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 0 0 0
9 AV 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 1 BDA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1
10 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 MEA 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1
11 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
12 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
13 AV 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 MEA 0 0 1 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 1 0 1 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0
14 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 1 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 0
44
BDA 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 15 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0
16 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 0
17 AV 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 1 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0
18 AV 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 MEA 0 1 0 0 1 0 1 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 BDA 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1
19 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0
20 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21 AV 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 0 1 0 1 1 1 0 0 1 1 1 1
MEA 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 0 BDA 1 1 0 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0
22 AV 1 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
23 352 a 353μM BDA 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 297 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0
195 a 193 μM BDA 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 184 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 166 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 152 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
143 a 142 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 131 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 127 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
126 a 123 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 119 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
116 a 111 μM BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 107 a 106 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 105 a 102μM BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
97 a 85μM BDA 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24 733 a 700cm MEA 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0
677 a 633 cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 600 a 567 cm MEA 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 533 a 500cm MEA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
45
467 a 433cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 400 a 367cm MEA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 333 a 300cm MEA 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1
233cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 700 a 667cm BDA 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 633 a 567cm BDA 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 433 a 367cm BDA 0 0 1 0 0 1 1 0 1 0 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 1
300cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 233cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 700cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
600cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 533 a 500cm AV 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 433cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 400 a 333cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 300 a 267cm AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 200cm AV 0 0 0 0 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
CR
ITEacuteR
IOS
ME
IOS
DE
C
ULT
UR
A
ES
JG1
ES
JH2
ES
KD
1
ES
PA
C22
ES
RD
1
ES
SD
1
A131
A126
A123
A323
A113
A334
A321
A216
B
A135
A115
B
A124
A116
A215
A
A132
A333
A
A333
B
A134
P l
ongi
colla
PH
O19
1 AV 0 0 1 1 0 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 0 0 MEA 0 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 1 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 BDA 0 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 1 1 0 1 0 1 1 1 0 0 0 0 0
2 AV 0 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 3 AV 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 4 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1
MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 BDA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1
5 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0
6 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 0 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 0 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1
7 AV 1 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0
46
MEA 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 BDA 0 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0
8 AV 0 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 MEA 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1 BDA 0 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1
9 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 MEA 0 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0 BDA 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0
10 AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
11 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
12 MEA 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0
13 AV 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 0 1 1 1 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 1 1
14 AV 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 1 0 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 0 BDA 0 1 0 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0 1 0 1 0 1 0
15 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0
16 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
17 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 MEA 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 BDA 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0
18 AV 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 0 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0 1 1 BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
19 AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 BDA 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0
20 ESP 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 21 AV 1 1 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1
MEA 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1 0 1 1 0 0 1 BDA 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 0
22 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1
47
BDA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 23 352 a 353μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
297 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 195 a 193 μM BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
184 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 166 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 152 μM BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
143 a 142 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 131 μM BDA 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 127 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
126 a 123 μM BDA 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 1 1 0 1 0 0 119 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
116 a 111 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 107 a 106 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 105 a 102μM BDA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0
97 a 85μM BDA 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 24 733 a 700cm MEA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0
677 a 633 cm MEA 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 600 a 567 cm MEA 0 1 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 467 a 433cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 400 a 367cm MEA 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 333 a 300cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
233cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 700 a 667cm BDA 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 633 a 567cm BDA 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 1 1 0 1 0 0 533 a 500cm BDA 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 433 a 367cm BDA 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1
300cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 233cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 700cm AV 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
600cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 433cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 400 a 333cm AV 1 0 0 1 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 1 300 a 267cm AV 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 200cm AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0
Nota - Caracteriacutestica avaliada nos trecircs meios As caracteriacutesticas foram avaliadas seguindo os seguintes criteacuterios
48
1 Bordos da colocircnia regular (1) ou irregular (0) 2 Miceacutelio denso 3 Miceacutelio ralo 4 Miceacutelio granuloso aeacutereo 5 Miceacutelio algodonoso 6 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Branco 7 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Marrom 8 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Cinza 9 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Verde 10 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Amarelo 11 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Bege 12 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Preto 13 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Branco 14 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Marrom 15 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Preto 16 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Cinza 17 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Verde 18 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Amarelo 19 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Bege 20 Esporulaccedilatildeo com esporulaccedilatildeo (1) sem esporulaccedilatildeo (0) 21 Coniacutedio do tipo alfa 22 Coniacutedio do tipo beta 23 Comprimento dos coniacutedios do tipo beta 24 Diacircmetro meacutedio do crescimento das colocircnias
49 ANEXO 13 LOCAL DA COLETA DE FOLHAS DE Schinus terebinthifoliusCENTRO POLITEacuteCNICO ndash CURITIBAPR
Livros Graacutetis( httpwwwlivrosgratiscombr )
Milhares de Livros para Download Baixar livros de AdministraccedilatildeoBaixar livros de AgronomiaBaixar livros de ArquiteturaBaixar livros de ArtesBaixar livros de AstronomiaBaixar livros de Biologia GeralBaixar livros de Ciecircncia da ComputaccedilatildeoBaixar livros de Ciecircncia da InformaccedilatildeoBaixar livros de Ciecircncia PoliacuteticaBaixar livros de Ciecircncias da SauacutedeBaixar livros de ComunicaccedilatildeoBaixar livros do Conselho Nacional de Educaccedilatildeo - CNEBaixar livros de Defesa civilBaixar livros de DireitoBaixar livros de Direitos humanosBaixar livros de EconomiaBaixar livros de Economia DomeacutesticaBaixar livros de EducaccedilatildeoBaixar livros de Educaccedilatildeo - TracircnsitoBaixar livros de Educaccedilatildeo FiacutesicaBaixar livros de Engenharia AeroespacialBaixar livros de FarmaacuteciaBaixar livros de FilosofiaBaixar livros de FiacutesicaBaixar livros de GeociecircnciasBaixar livros de GeografiaBaixar livros de HistoacuteriaBaixar livros de Liacutenguas
Baixar livros de LiteraturaBaixar livros de Literatura de CordelBaixar livros de Literatura InfantilBaixar livros de MatemaacuteticaBaixar livros de MedicinaBaixar livros de Medicina VeterinaacuteriaBaixar livros de Meio AmbienteBaixar livros de MeteorologiaBaixar Monografias e TCCBaixar livros MultidisciplinarBaixar livros de MuacutesicaBaixar livros de PsicologiaBaixar livros de QuiacutemicaBaixar livros de Sauacutede ColetivaBaixar livros de Serviccedilo SocialBaixar livros de SociologiaBaixar livros de TeologiaBaixar livros de TrabalhoBaixar livros de Turismo
AGRADECIMENTOS
Agrave minha orientadora Profordf Drordf Chirlei Glienke pela oportunidade ensinamentos
inestimaacuteveis sugestotildees e contribuiccedilotildees oferecidas as quais sem duacutevidas muito
enriqueceram o trabalho Sobretudo pelo exemplo de dedicaccedilatildeo agrave vida acadecircmica
Ao meu co-orientador Prof Dr Joatildeo Lucio Azevedo pela dedicaccedilatildeo e
valorizaccedilatildeo da pesquisa cientiacutefica e pela oportunidade de realizaccedilatildeo desse trabalho
Agrave minha banca de acompanhamento Profordf Drordf Patriacutecia Dalzoto e a Drordf Kaacutetia
Rodrigues pelas sugestotildees e contribuiccedilotildees oferecidas cooperando para o
desenvolvimento desse trabalho
Agraves Profas Dras Lygia Vitoacuteria Galli-Terasawa e Vanessa Kava-Cordeiro pela
convivecircncia sugestotildees e auxiacutelio no LabGeM
Ao Dr Aacutelvaro Almeida da EMBRAPA de Londrina-PR e a Drordf Socircnia Pillegi pelas
linhagens de Phomopsis que muito contribuiacuteram para elucidaccedilatildeo da pesquisa
Ao Prof Dr Joseacute Odair Pereira e a MsC Antonia Souza da Universidade Federal
do Amazonas e a MsC Josiane Gomes pelas linhagens de Pestalotiopsis utilizadas
neste trabalho
Agrave EMBRAPA de Colombo Paranaacute pela disponibilidade da coleta de folhas de
espinheira santa
Agrave Profordf Drordf Thelma Alvim que sempre se disponibilizou no auxiacutelio a microscopia
oacutetica
Aos Professores do Mestrado em Geneacutetica que contribuiacuteram para minha
formaccedilatildeo
Aos meus amigos de turma da poacutes-graduaccedilatildeo Carolina Abuaacutezar Caroline
Bernardi Clineu Uehara Daniele Matoso Dellyana Boberg Fabio Rigoti Maacutercia
Oliveira Patriacutecia de Franccedila Thaiacutes Sczepanski Virginia Coser e Vitor Dantas pelos
momentos de convivecircncia e conforto durante essa jornada Sem vocecircs jamais
suportaria a saudade
Agrave minha amiga Tatiane pelos momentos alegres na convivecircncia diaacuteria pelo
carinho companheirismo pelo conforto durante as minhas preocupaccedilotildees e receios
dentro e fora do laboratoacuterio Assim como pelas excelentes ideacuteias que muito contribuiacuteram
neste trabalho
Aos alunos de Poacutes-graduaccedilatildeo do LabGeM Jociney Josiele Josiane em
especial a Danyelle e Juliana pela amizade e cooperaccedilatildeo no desenvolvimento deste
trabalho
Ao doutorando Rafael Noleto do Laboratoacuterio de Citogeneacutetica Animal pelo
auxiacutelio no desenvolvimento deste trabalho
Aos amigos do LabGeM pela agradaacutevel convivecircncia e ajuda nos momentos
mais difiacuteceis Andreacute Carol Andrade Carol Silvano Douglas Flaacutevia Fernanda Larice
Lisiane Lucinir Maysa Patriacutecia Rosana e Taciana
Agrave amiga Izolde Gartner pela ajuda e disponibilidade
Agrave Anilda Gomes da Silva pelo eventual auxiacutelio teacutecnico na SEAD
Agrave Luciana Marques secretaacuteria do Programa de Poacutes-Graduaccedilatildeo em Geneacutetica
pelas orientaccedilotildees e informaccedilotildees
Aos meus pais Gislene Rodrigues Gomes e Raimundo de Andrade Gomes por
terem ensinado a buscar meus ideais e pelo esforccedilo e compreensatildeo em manterem-se
distantes todos esses anos que dediquei aos estudos
Ao meu companheiro Helder Franklin pela compreensatildeo o carinho e pela sua
admiraacutevel placidez sobretudo ao apoio e contribuiccedilatildeo para a realizaccedilatildeo deste ideal
Aos meus amigos e familiares pelo carinho compreensatildeo e incentivo nesse
periacuteodo de ausecircncia Sobretudo pelos exemplos de dedicaccedilatildeo e respeito ao proacuteximo
Agrave minha amiga Hafiza pelos conselhos compreensatildeo incentivo paciecircncia e
apoio
ldquoDe tudo ficaram trecircs coisas
A certeza de que estamos sempre comeccedilando
A certeza de que precisamos continuar
A certeza de que seremos interrompidos antes
de terminar
Portanto devemos
Fazer da interrupccedilatildeo um caminho novo
Da queda um passo de danccedila
Do medo uma escada
Do sonho uma ponte
Da procura um encontrordquo
(Fernando Pessoa)
RESUMO Phomopsis spp ENDOacuteFITOS DE PLANTAS MEDICINAIS DIVERSIDADE GENEacuteTICA E ANTAGONISMO AO FUNGO Guignardia citricarpa Autora Renata Rodrigues Gomes Orientadora Chirlei Glienke Microrganismos endofiacuteticos vivem no interior das plantas sem causar dano ao seu hospedeiro podendo produzir compostos biologicamente ativos antibioacuteticos fungicidas e herbicidas Essa comunidade endofiacutetica pode estar relacionada com a accedilatildeo antimicrobiana de plantas medicinais A planta Maytenus ilicifollia conhecida como espinheira-santa eacute uma planta medicinal muito utilizada no tratamento de uacutelceras gaacutestricas e tratamentos digestivos tiacutepica da Ameacuterica do Sul em especial da regiatildeo Sul do Brasil e atualmente encontra-se ameaccedilada de extinccedilatildeo As plantas medicinais Spondias mombin Myracrodruon urundeuva Schinus terebinthifolius e Aspidosperma tomentosun tecircm sido usadas na medicina devido as suas propriedades antimicrobianas No presente trabalho foram isolados fungos endofiacuteticos do gecircnero Phomopsis e avaliados quanto a sua variabilidade geneacutetica e estrutura populacional por meio de marcadores RAPD Observou-se que as plantas medicinais analisadas satildeo colonizadas por grande diversidade de espeacutecies de Phomopsis com grande variabilidade morfoloacutegica e geneacutetica intra e interespeciacuteficas Os isolados foram identificados por meio de sequumlecircncias das regiotildees ITS1 58S e ITS2 do DNA ribossomal e testados quanto ao potencial antimicrobiano contra as linhagens PC1396 e PC3305 de Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta do Citros Foi possiacutevel identificar nove isolados em niacutevel de espeacutecie por meio de sequumlecircncias ITS do rDNA sendo 4 como P michaeliae 2 como P theicola 2 como P longicolla e 1 como P sojae Foi possiacutevel verificar que as plantas de Maytenus ilicifolia analisadas satildeo colonizadas endofiticamente por pelo menos dez espeacutecies de Phomopsis e as plantas de Schinus terebinthifolius por pelo menos seis espeacutecies deste gecircnero As anaacutelises morfoloacutegicas por meio de marcadores RAPD e sequenciamento de ITS do rDNA permitem sugerir que as espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo satildeo hospedeiro-especiacuteficas sendo necessaacuteria a redefiniccedilatildeo do conceito de espeacutecie para este gecircnero Na anaacutelise antimicrobiana todos os isolados apresentaram grande potencial no controle in vitro do fungo G citricarpa destacando-se os isolados ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ES2AB1 (Phomopsis sp S6) ES2WF1 (Phomopsis sp S4) e ESFH1 (P theicola) que inibiram o crescimento das linhagens PC1396 e PC3305 de G citricarpa em trecircs metodologias avaliadas Desta forma esse estudo indica que os isolados de Phomopsis spp endoacutefitos de plantas medicinais satildeo produtores de substacircncias bioativas que devem ser melhor caracterizadas Palavras chaves Phomopsis spp endoacutefitos plantas medicinais RAPD sequumlecircncias da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
ABSTRACT Phomopsis spp ENDOPHYTES OF MEDICINAL PLANTS GENETIC DIVERSITY AND ANTAGONISM IN THE FUNGUS Guignardia citricarpa Author Renata Rodrigues Gomes Adviser Chirlei Glienke-Blanco Endophytic microorganisms live in plants without causing damage to their host being able to produce active biological compounds antibiotics fungicides and herbicides This endophytic community may be related to the antimicrobial action of medicinal plants The plant Maytenus ilicifolia known as ldquoespinheira santardquo is a medicinal plant greatly used for the treatment of stomach ulcers and digestive problems typical from the South America especially in the southern part of Brazil and currently is in danger of extinction The medicinal plants Spondias mombin Myracrodruon urundeuva Schinus terebinthifolius and Aspidosperma tomentosun have been used in medicine due to their antimicrobial properties In the present work endophytic fungi of the genus Phomopsis were isolated and their genetic variability and population structure assessed using RAPD markers The medicinal plants analyzed are colonized by a great variety of Phomopsis species with a high morphological and genetic variability both intra and interspecific The isolated fungi were identified through sequences of ITS1 58S and ITS2 regions of ribosomal DNA and tested in their antimicrobial potential against the PC1396 and PC3305 lineages of Guignardia citricarpa the responsible for the ldquoblack spot in Citrusrdquo It was possible to identify 9 isolates at the level of species through the analysis of ITS sequences of rDNA and among these isolates 4 were identified as P michaeliae 2 as P theicola 2 as P longicolla and 1 as P sojae It was possible to verify that the Maytenus ilicifolia plants analyzed are endophytically colonized by at least ten Phomopsis species and that Schinus terebinthifolius are colonized by at least six species of this genus The morphological analyses using RAPD markers and sequencing of ITS regions of rDNA make possible to suggest that the analyzed species of Phomopsis are not host-specific being necessary the redefinition of the species concept for this genus For the antimicrobial analysis all the isolates presented a high in vitro control potential of the fungus G citricarpa particularly the isolates ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ES2AB1 (Phomopsis sp S6) ES2WF1 (Phomopsis sp S4) and ESFH1 (P theicola) that inhibited the growth of the PC1396 and PC3305 lineages of G citricarpa in the three methodologies tested Thus this study indicates that the isolates of Phomopsis spp endophytic of medicinal plants are producers of bioactive substances which should be better characterized Key words Phomopsis spp endophytes medicinal plants RAPD ITS1 58S and ITS2 of rDNA sequences
LISTA DE FIGURAS
FIGURA 1- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis DE Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT 9811 e AT 9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 59
FIGURA 2- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE
Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 61
FIGURA 3- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 64
FIGURA 4- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
PATOGEcircNICOS OBTIDOS DE Glycine max EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 68
FIGURA 5- DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp EM MEIO MEA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 69
FIGURA 6- DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 70
FIGURA 7- AVALIACcedilAtildeO DAS MEacuteDIAS DO DIAcircMETRO DAS COLOcircNIAS DOS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO AV APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 71
FIGURA 8- FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis EM BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 73
FIGURA 9- FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DO ISOLADO SM9713 EM
MEIOS BDA e AV APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB
LUZ CONTIacuteNUA 74 FIGURA 10- COMPRIMENTO DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS
DE Phomopsis spp APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO EM BDA A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 75
FIGURA 11- DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE
SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 77
FIGURA 12- ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE
MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 78
FIGURA 13- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX11 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 79
FIGURA 14- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX14 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 79
FIGURA 15- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX19 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 80
FIGURA 16- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO OPE
08 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 80
FIGURA 17- DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE
SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS DE Phomopsis POR MEIO DE MARCADORES MOLECULARES RAPD 82
FIGURA 18- ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE
GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 84 FIGURA 19- AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA
REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MEacuteTODO DE PARCIMOcircMIA) 86
FIGURA 20- AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA PARCIAL BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MODELO NEIGHBOR-JOINING COM CORRECcedilAtildeO KIMURA DOIS PARAcircMETROS) 87
FIGURA 21- INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa PC1396 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA 93
FIGURA 22- INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia
citricarpa 3305 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA 96 FIGURA 23- AVALIACcedilAtildeO DO CRESCIMENTO DAS COLOcircNIAS DO
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 e PC3305 INOCULADAS APOacuteS RETIRADA DO PAPEL CELOFANE PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS EM MEIO BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 98
FIGURA 24- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 99
FIGURA 25- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 100
LISTA DE TABELAS
TABELA 1- ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR 32
TABELA 2- ISOLADOS GRUPO EXTERNO PARA ANAacuteLISE DE
VARIABILIDADE GENEacuteTICA POR RAPD 35 TABELA 3- EacutePOCAS DO ANO OacuteRGAtildeOS DA PLANTA CONDICcedilOtildeES DE
INCUBACcedilAtildeO E Nordm DE FRAGMENTOS PLAQUEADOS NAS QUATRO COLETAS DE ENDOacuteFITOS DE ESPINHEIRA-SANTA 42
TABELA 4- SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA
AMPLIFICACcedilAtildeO DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL 47
TABELA 5- SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA
AMPLIFICACcedilAtildeO DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL 49
TABELA- 6- Linhagens de Phomopsis spp E de Pestalotiopsis vismae utilizadas
como grupo externo 52 TABELA 7- PORCENTAGEM DE ISOLAMENTO DE Phomopsis
ENDOFIacuteTICOS DE PLANTAS DE ESPINHEIRA SANTA 56 TABELA 8- PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE
OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC1396 94
TABELA 9- PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE
OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 96
TABELA 10- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 101
LISTA DE ANEXOS
ANEXO 1- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM DIFERENTES MEIOS DE CULTURA 125
ANEXO 2- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO BDA 126
ANEXO 3- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO AVEIA 128
ANEXO 4- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO MEA 130
ANEXO 5- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO DOS
ESPOROS BETACONIacuteDIOS DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA 132
ANEXO 6- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 134
ANEXO 7- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 135
ANEXO 8- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 136
ANEXO 9- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 137
ANEXO 10- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS 139
ANEXO 11- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
141
ANEXO 12- MATRIZ DE DADOS PARA CARACTERIZACcedilAtildeO 143 ANEXO 13- LOCAL DA COLETA DE FOLHAS DE Schinus terebinthifolius
CENTRO POLITEacuteCNICO ndash CURITIBA PR 149
SUMAacuteRIO 1 INTRODUCcedilAtildeO 1
2 OBJETIVOS 3
3 REVISAtildeO BIBLIOGRAacuteFICA 4
31 Microrganismos Endofiacuteticos 4
32 Ocorrecircncia de endoacutefitos 7
33 Fungos endofiacuteticos de plantas medicinais 9
34 Endoacutefitos Produtores de Substacircncias Antimicrobianas 11
35 Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss 14
351 Componentes quiacutemicos e propriedades terapecircuticas 16
352 Endoacutefitos isolados de Maytenus ilicifolia 18
36 Guignardia citricarpa Kiely e a Mancha preta do citros 18
361 Mancha Preta do Citros 21
37 O Gecircnero Phomopsis sp 22
38 Marcadores Moleculares 25
381 Marcadores RAPD 27
382 Marcadores ITS 29
4 MATERIAL E MEacuteTODOS 32
41 Material Bioloacutegico 32
411 Fungos endofiacuteticos 32
412 Microrganismos usados para teste de antagonismo 35
413 Fungos endofiacuteticos utilizados para anaacutelise de variabilidade geneacutetica 35
42 Meios de Cultura 35
421 Caldo MEB (Extrato de Malte) 35
422 Meio AV (Aveia-Aacutegar) 36
423 Meio BDA (Meio Batata-Dextrose-Aacutegar) 36
424 Meio MC (Meio Completo) PONTECORVO et al 1953 37
425 Meio MEA (Extrato de Malte) PATERSON e BRIDGE 1994 37
43 Soluccedilotildees e Reagentes 38
431 Clorofane 38
432 Clorofil 38
433 Derozal Bayerreg 38
434 Dodecil Sulfato de Soacutedio (SDS) 10 38
435 Fenol Saturado 38
436 Gel de Agarose (08) 38
437 Gel de Agarose (15) 38
438 Lactofenol azul 38
439 Marcador de peso molecular (DNA de fago lambda clivado com Hind III
Gibco) 39
4310 Marcador de peso molecular (DNA Ladder 100pb Ludwing Biotec) 39
4311 Oligonucleotiacutedeos (Invitrogen) 39
4312 RNAse (invitrogen) 39
4313 Soluccedilatildeo de Vitaminas 40
4314 Soluccedilatildeo salina (pv) 40
4315 Soluccedilatildeo Tween-80 01 (vv) 40
4316 Soluccedilatildeo de Tetraciclina 40
4317 Soluccedilatildeo de EDTA 05M 40
4318 Soluccedilatildeo de brometo de etiacutedio 40
4319 Tampatildeo TE (Tris-EDTA) 41
4320 Tampatildeo de Extraccedilatildeo de DNA 41
4321 Tampatildeo da Amostra (6x) 41
4322 Tampatildeo de corrida TBE 10x 41
44 Isolamento 42
45 Conservaccedilatildeo dos fungos 43
46 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica 43
47 Obtenccedilatildeo de colocircnia monospoacuterica 44
48 Caracterizaccedilatildeo Molecular 44
481 Extraccedilatildeo do DNA (RAEDER e BRODA 1985 modificado por GLIENKE
1995) 44
482 RAPD 45
4821 Anaacutelise da Variabilidade Geneacutetica 46
483 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA 47
4831 Amplificaccedilatildeo 47
4832 Purificaccedilatildeo da PCR 48
48321 Purificaccedilatildeo com PEG 48
48322 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio 48
4833 Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento 49
4834 Purificaccedilatildeo da Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento 50
48341 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em tubos 50
48342 Purificaccedilatildeo com Purificaccedilatildeo com Isopropanol em placa 50
48343 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio 51
4835 Ediccedilatildeo e Anaacutelise das Sequumlecircncia 51
49 Avaliaccedilatildeo da Atividade Antimicrobiana 52
491 Cultura Pareada 52
492 Avaliaccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis 53
493 Atividade dos Extratos metanoacutelicos 54
4931 Obtenccedilatildeo dos extratos 54
4932 Crescimento micelial 55
410 Anaacutelise Estatiacutestica 55
5 RESULTADOS E DISCUSSAtildeO 56
51 Isolamento 56
52 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de Phomopsis 58
53 Caracterizaccedilatildeo Molecular de Phomopsis spp 78
531 RAPD 78
532 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA 85
54 Avaliaccedilatildeo da atividade antimicrobiana 92
541 Cultura pareada 92
542 Teste para detecccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis 97
543 Avaliaccedilatildeo da accedilatildeo dos Extratos 98
6 CONCLUSOtildeES 104
7 REFEREcircNCIAS BIBLIOGRAacuteFICAS 106
ANEXOS 125
1
1 INTRODUCcedilAtildeO
A bioprospecccedilatildeo visa identificar plantas e microrganismos dentre a diversidade
de vida existente em determinado local que possam servir como fonte de substacircncias
bioativas que em uacuteltima instacircncia sejam uacuteteis para o desenvolvimento de novas
drogas Neste contexto os fungos endofiacuteticos satildeo considerados de grande importacircncia
pois representam uma fonte potencial de novos compostos quiacutemicos e bioloacutegicos
podendo ser utilizados natildeo somente na Medicina mas tambeacutem na Fitopatologia e
Veterinaacuteria (STROBEL 2002 STROBEL 2003) O potencial de aplicaccedilatildeo de
microrganismos endofiacuteticos no controle bioloacutegico tambeacutem vem sendo explorado
Os microrganismos endofiacuteticos vivem no interior das plantas interagindo com
diferentes espeacutecies sem causar dano ao seu hospedeiro Esses microrganismos
podem influenciar vaacuterias caracteriacutesticas das plantas e conferir certos benefiacutecios a este
vegetal como por exemplo produccedilatildeo de antibioacuteticos Haacute alguns anos natildeo se conhecia
a grande potencialidade dos endofiacuteticos entretanto este interesse vem aumentando
com a descoberta recente de caracteriacutesticas como a produccedilatildeo de compostos
biologicamente ativos antibioacuteticos fungicidas e herbicidas
Plantas medicinais com propriedades antimicrobianas tambeacutem satildeo habitadas por
microrganismos endofiacuteticos sugerindo que a accedilatildeo antibacteriana ou antifuacutengica poderia
estar no endoacutefito e natildeo na planta ou provavelmente na sua interaccedilatildeo No Brasil vaacuterios
autores mostraram a produccedilatildeo de faacutermacos por endoacutefitos como Xylaria sp Fusarium
moniliforme Colletotrichum sp Guignardia sp e tambeacutem Phomopsis sp
Fungos do gecircnero Phomopsis satildeo encontrados como endoacutefitos nos espaccedilos
intercelulares de tecidos de diversos vegetais entre eles a espinheira-santa (Maytenus
ilicifolia Mart Reiss) planta pertencente agrave famiacutelia Celastraceae Essa planta medicinal
encontrada principalmente no sul do Brasil foi acrescentada agrave lista das espeacutecies
consideradas em extinccedilatildeo no Paranaacute pelo governo do Estado em 1995 Tendo em
vista que pouco se conhece a respeito da comunidade endofiacutetica existente nessa
planta sua diversidade e seu potencial antimicrobiano tornam-se relevantes estudos
de diversidade e bioprospecccedilatildeo
2
Pileggi (2006) demonstrou existir alta diversidade de isolados do gecircnero
Colletotrichum dentre outros fungos filamentosos bacteacuterias e actinomicetos em plantas
de Maytenus ilicifolia do pomar do Centro Nacional de Pesquisa de Florestas (CNPF)
da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaacuteria (EMBRAPAPR) Alguns desses
isolados apresentaram potencial antimicrobiano inibindo o crescimento de Fusarium
sp Guignardia citricarpa e Micrococcus luteus
Endoacutefitos com atividade antagonista contra o fungo Guignardia citricarpa agente
causal da Mancha Preta dos Citros (MPC) poderiam ser utilizados no controle bioloacutegico
desta doenccedila uma vez que o emprego sucessivo de fungicidas como controle de
doenccedilas de plantas apresenta dentre outros problemas a seleccedilatildeo de linhagens
resistentes do patoacutegeno
O gecircnero Phomopsis representa uma fonte potencial de novos compostos
quiacutemicos e bioloacutegicos como vem sendo relatado em diversos trabalhos Oito dos
isolados que foram estudados nesse trabalho jaacute haviam sido avaliados no
IOCFIOCRUZRJ e possuem potencial antimicrobiano (RODRIGUES et al 2004)
Poreacutem tais isolados ainda natildeo haviam sido caracterizados geneticamente nem
identificados em niacutevel de espeacutecie A identificaccedilatildeo e a caracterizaccedilatildeo molecular dos
microrganismos endofiacuteticos satildeo uacuteteis pois o gecircnero Phomopsis eacute de difiacutecil identificaccedilatildeo
em niacutevel de espeacutecie utilizando-se apenas caracteriacutesticas morfoloacutegicas
Estudos moleculares satildeo realizados na busca de padrotildees geneacuteticos nestes
organismos complementando sua caracterizaccedilatildeo O polimorfismo do DNA amplificado
ao acaso (RAPD) propicia uma forma raacutepida para avaliar a diversidade geneacutetica
existente nestes organismos a estruturaccedilatildeo populacional e para auxiliar na
identificaccedilatildeo ao niacutevel de espeacutecie comparando-as com linhagens referecircncia Outra
estrateacutegia importante nessa caracterizaccedilatildeo baseia-se em marcadores de Sequumlecircncias
Internas Transcritas do DNA Ribossocircmico (ITS) para identificaccedilatildeo taxonocircmica dos
isolados
3
2 OBJETIVOS
1 Isolar linhagens endofiacuteticas de Phomopsis spp de plantas sadias de Maytenus
ilicifolia e Identificar os isolados utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas
2 Caracterizaccedilatildeo de Phomopsis spp endofiacuteticos das plantas medicinais Schinus
terebinthifolius Myracrodruon urundeuva Spondias mombin Aspidosperma
tomentosum pertencentes agrave coleccedilatildeo do LABGEM
3 Avaliar a variabilidade geneacutetica e estrutura populacional das linhagens de
Phomopsis spp por meio de marcadores RAPD (Polimorfismo do DNA
Amplificado ao Acaso)
4 Identificar as linhagens por meio de sequumlecircncias da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do
DNA ribossomal
5 Testar a atividade antimicrobiana de linhagens do fungo Phomopsis spp contra
linhagens do fitopatoacutegeno Guignardia citricarpa
4
3 REVISAtildeO BIBLIOGRAacuteFICA
31 Microrganismos Endofiacuteticos
Microrganismos endofiacuteticos satildeo aqueles que vivem no interior das plantas
interagindo com outras espeacutecies de microrganismos sem causar dano ou prejuiacutezo ao
seu hospedeiro Esses microrganismos podem influenciar em vaacuterias caracteriacutesticas
expressas pelas plantas Segundo Neto Azevedo e Araujo (2002) os endoacutefitos podem
desempenhar relevante funccedilatildeo para a sanidade vegetal jaacute que atuam como agentes
controladores de microrganismos fitopatogecircnicos no controle de insetos e ateacute na
proteccedilatildeo da planta contra herbiacutevoros Todas as plantas jaacute estudadas satildeo habitadas por
microrganismos endofiacuteticos principalmente fungos e bacteacuterias
A comunidade endofiacutetica cuja composiccedilatildeo varia em funccedilatildeo do hospedeiro e das
condiccedilotildees ambientais tem indiviacuteduos que se inter-relacionam dentro da planta em um
equiliacutebrio harmocircnico O desequiliacutebrio dessa harmonia afeta o comportamento de todos
os integrantes da comunidade dando condiccedilotildees para que fungos oportunistas
manifestem seu potencial patoloacutegico contra hospedeiro (MAKI 2006)
A distinccedilatildeo entre endofiacuteticos fitopatogecircnicos e oportunistas eacute puramente
didaacutetica Haacute um gradiente tecircnue que os separa e assim agrave distacircncia entre um e outro
pode ser muito pequena sendo difiacutecil impor limites para separar cada categoria Assim
um microrganismo pode ser considerado endofiacutetico mas com a reduccedilatildeo dos
mecanismos de defesa da planta pode se comportar como um patoacutegeno (AZEVEDO et
al 2000)
A ocorrecircncia de microrganismos endofiacuteticos nos vegetais resulta da penetraccedilatildeo
atraveacutes de feridas ocasionadas nas raiacutezes pela abrasatildeo destas com o solo aberturas
naturais como hidatoacutedios e estocircmatos aberturas artificiais sofridas pela accedilatildeo de
pragas animais e o homem ou agressotildees abioacuteticas (RIBEIRO 1995) ou ainda atraveacutes
da secreccedilatildeo de enzimas hidroliacuteticas (ESPOacuteSITO e AZEVEDO 2004) A penetraccedilatildeo
pode ocorrer por meio de esporos levados pelo vento ou hifas que invadem os tecidos
Muitos endoacutefitos produzem massas de coniacutedios delgados caracteriacutestica associada com
5
a dispersatildeo por chuvas (RIBEIRO 1995) Outra forma de propagaccedilatildeo se daacute pela
transmissatildeo vertical por meio de sementes (WHITE MORGAN-JONES E MORROW
1993 CLAY 2004)
Viret e Petrini (1994) usando microscopia eletrocircnica de varredura e transmissatildeo
detectaram a presenccedila de fungos no interior dos hospedeiros Clay (1987) verificou a
presenccedila de hifas dos fungos Acremonium lolli e A coenophialum no espaccedilo
intercelular da regiatildeo meristemaacutetica no mesofilo das folhas no cerne da inflorescecircncia
na semente
Os endoacutefitos apresentam uma relaccedilatildeo mutualiacutestica antagoniacutestica ou neutra com
o hospedeiro A interaccedilatildeo de um fungo com seu hospedeiro vegetal variam e depende
do modo pelo qual o fungo infecta a planta e tambeacutem da extensatildeo da resposta de
defesa desta A colonizaccedilatildeo pode ser sistecircmica ou local inter ou intracelular (ARAUacuteJO
SILVA E AZEVEDO 2000)
Os fungos endofiacuteticos atuam no controle bioloacutegico de fitopatoacutegenos por
ocuparem o mesmo nicho ecoloacutegico destes (ARAUacuteJO SILVA E AZEVEDO 2000)
Segundo Schulz e Boyle (2005) aproximadamente 80 dos fungos endofiacuteticos
produzem compostos biologicamente ativos como antibioacuteticos fungicidas e herbicidas
Esses microrganismos endofiacuteticos podem ser utilizados como fontes de
metaboacutelitos primaacuterios (STAMFORD ARAUacuteJO E STAMFORD 1998) e secundaacuterios que
inibem o desenvolvimento de patoacutegenos (LI et al 2001 LI e STROBEL 2001 ZOU e
TAN 2001) Como exemplo pode-se citar o taxol uma droga quimioterapecircutica usada
no tratamento de cacircncer de mama e ovaacuterio (WANG et al 2000 e STROBEL et al
2003) O aacutecido coletoacutetrico um metaboacutelico do fungo endofiacutetico Colletotrichum
gloeosporioides isolado da Artemisia mongoacutelica apresenta atividade antimicrobiana
contra Bacillus subtilis Staphylococcus aureus Sarcina lutea e contra o fungo
patogecircnico Helminthosporium sativum (ZOU et al 2000) Lu et al (2000) identificaram
trecircs novos metaboacutelitos do fungo endofiacutetico Colletotrichum sp isolado de Artemisia
annua com propriedades antimicrobianas Diversos autores relatam agrave accedilatildeo
antimicrobiana de substacircncias produzidas por fungos endofiacuteticos como Rodrigues
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Hesse e Werner (2000) Liu et al (2001) Stinson et al (2003) Bao e Lazarivits (2001)
Huang et al (2001) Strobel (2003) Rodrigues (2004) Chareprasert et al (2006)
Os microrganismos endofiacuteticos satildeo tambeacutem capazes de produzirem anti-
helmiacutenticos e inseticidas (AZEVEDO et al 2000 ESPOacuteSITO e AZEVEDO 2004)
apresentando grande potencial que pode ser explorado na agricultura (ZOU e TAN
2001)
Schulz et al (2002) isolaram mais de seis mil e quinhentos fungos endofiacuteticos de
aacutervores e herbaacuteceas na busca de novos metaboacutelitos com potencial para novos
produtos industriais e sugerem que a associaccedilatildeo entre fungos endofiacuteticos e seus
hospedeiros conduza agrave produccedilatildeo de metaboacutelitos secundaacuterios com atividade
antimicrobiana e anti-herbicida
Autores sugerem que certos fungos endofiacuteticos produzem compostos igualmente
presentes em suas plantas hospedeiras como o taxol utilizado para o tratamento de
cacircncer presente tanto na planta medicinal Taxus brevifolia como no fungo endofiacutetico
Taxomyces andreanae (STIERLE et al 1995) Outros exemplos satildeo algumas enzimas
(celulases e lignases) em Xylaria sp fatores de crescimento como giberelina em
Fuzarium moniliforme Indicando uma possiacutevel transposiccedilatildeo de genes entre plantas e
fungos em uma verdadeira engenharia geneacutetica in vivo Se esses casos forem
confirmados ficaraacute evidente que vegetais e fungos transgecircnicos podem ocorrer
naturalmente pela transferecircncia de genes entre espeacutecies pertencentes a diferentes
reinos (AZEVEDO 1998)
Rodrigues Hesse e Werner (2000) pesquisaram a atividade bioativa de extratos
de fungos endofiacuteticos isolados da planta Spondias mombin L (cajazeiro) Estes extratos
incluindo o de Phomopsis sp foram testados contra determinados microrganismos O
fungo apresentou atividade contra actinomicetos Cladosporium elatum Mycotypha sp
e S cerevisae
Aleacutem da produccedilatildeo de antimicrobianos fungos endofiacuteticos podem excluir
patoacutegenos que ocupem o mesmo nicho ecoloacutegico por competiccedilatildeo como relatado por
Bao e Lazarovits (2001) com Fusarium oxysporum f sp Lycopersici patogecircnico e
Fusarium oxysporum natildeo patogecircnico
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Os fungos endofiacuteticos satildeo de grande importacircncia pois representam uma fonte
potencial de novos compostos quiacutemicos e bioloacutegicos podendo ser utilizados natildeo
somente na Medicina mas tambeacutem na Fitopatologia e Veterinaacuteria (STROBEL 2002
STROBEL 2003) Tendo em vista essa importacircncia vaacuterios trabalhos vecircm sendo
recentemente publicados envolvendo a capacidade de endofiacuteticos antagonizarem
fitopatoacutegenos assim como satildeo descobertos e descritos metaboacutelitos e outras
substacircncias de interesses produzidos por endofiacuteticos
3 2 Ocorrecircncia de endoacutefitos Uma diversidade de microrganismos endofiacuteticos estaacute presente no interior de
plantas aparentemente saudaacuteveis com potencial para serem estudadas A composiccedilatildeo
das espeacutecies pode variar de acordo com o hospedeiro distribuiccedilatildeo geograacutefica idade da
planta condiccedilotildees ecoloacutegicas e sazonais incluindo altitude e precipitaccedilatildeo Uma ou duas
espeacutecies satildeo predominantes como endofiacuteticas em um dado hospedeiro enquanto
outros isolados satildeo pouco frequumlentes (CARROLL 1978 ARNOLD 2003)
Petrini Stone e Carroll (1982) verificaram um padratildeo de dominacircncia de espeacutecies
em que o endoacutefito encontrado com maior frequumlecircncia em uma determinada espeacutecie
vegetal era isolado menos frequentemente de outros hospedeiros Por outro lado os
endoacutefitos encontrados com menor frequumlecircncia em uma planta pareciam ser menos
especiacuteficos pois eram isolados em um amplo espectro de hospedeiros mas com baixa
frequumlecircncia
A colonizaccedilatildeo do fungo endofiacutetico Stagonospora sp no hospedeiro Phragmites
australis ocorre de forma diferenciada no decorrer do ano Na primavera o endoacutefito eacute
encontrado somente na raiz enquanto no outono ele eacute encontrado em todo o vegetal
(ERNEST MENDGEN e WIRSEL 2003) Gao et al (2005) constataram uma flutuaccedilatildeo
sazonal para os endoacutefitos isolados de Heterosmilax japonica Kunth os autores
verificaram maior abundancia de populaccedilotildees endofiacuteticas em amostras coletadas na
primavera do que no veratildeo
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Tanto a planta hospedeira como a regiatildeo onde os endofiacuteticos satildeo isolados pode
influenciar a produccedilatildeo de metaboacutelitos secundaacuterios De acordo com dados estatiacutesticos
Bills et al (2002) compararam a produccedilatildeo de metaboacutelitos de endofiacuteticos provenientes
de regiotildees tropicais e de regiotildees temperadas Os dados revelaram que regiotildees tropicais
satildeo mais ricas na produccedilatildeo tanto de endoacutefitos como dos metaboacutelitos secundaacuterios
A presenccedila de endoacutefitos em plantas pode variar dentro de espeacutecies de um
mesmo hospedeiro Nestes hospedeiros tambeacutem eacute encontrada uma grande variedade
geneacutetica entre isolados endofiacuteticos da mesma espeacutecie Tal variabilidade foi encontrada
em isolados do fungo Guignardia citricarpa obtidos de citros (GLIENKE 1995) em
duas espeacutecies de Colletotrichum sp isoladas de Maytenus ilicifolia (PILEGGI 2006) e
tambeacutem Pestalotiopsis sp isolados de Maytenus ilicifolia (FIGUEIREDO 2006)
O gecircnero Phomopsis tem sido frequentemente isolado como endoacutefito em uma
grande variedade de plantas
Azevedo et al (2000) apresentaram algumas plantas hospedeiras de onde jaacute
foram isoladas espeacutecies de Phomopsis entre elas Sabal bermudana Trachycarpus
fortunei Cavendishia pubescens Stylosanthes guianensis Anacardium occidentale e
Mangifera indica Corrado e Rodrigues (2004) isolaram endofiacuteticos de Phomopsis das
plantas medicinais Spondias mombin e Aspidosperma tomentosun
Bussabam et al (2001) isolaram predominantemente Phomopsis sp
Colletotrichum gloeosporiodes Glomerella sp e Xylaria sp endoacutefitos de folhas
pseudocaules e rizomas de gengibre (Amomum siamense Criab) coletadas em dois
locais na Tailacircndia
Em plantas de cacau (Theobroma cacao L) resistentes e suscetiacuteveis ao agente
causal da vassoura da bruxa endoacutefitos foram identificados por caracteriacutesticas
morfoloacutegicas e sequumlenciamento de rDNA como pertencentes aos gecircneros
Acremonium Blastomyces Botryosphaeria Cladosporium Colletotrichum
Cordyceps Diaporthe Fusarium Geotrichum Gibberella Gliocladium Lasiodiplodia
Monilochoetes Nectria Pestalotiopsis Phomopsis Pleurotus Pseudofusarium
Rhizopycnis Syncephalastrum Trichoderma Verticillium e Xylaria Os autores
identificaram ainda alguns endoacutefitos potencialmente antagonistas destacando-se
9
Gliocladium catenulatum que reduziu em 70 a incidecircncia da vassoura da bruxa in
vivo em placircntulas de cacaueiro (RUBINI et al 2005)
O gecircnero Phomopsis foi isolado como endoacutefito de graviola (Annona muricata L)
e pinha (Annona squamosa L) dois isolados promoveram eficientemente o crescimento
vegetal mostrando-se promissores para agricultura uma vez que satildeo capazes de
aumentar a produccedilatildeo dessas culturas (SILVA et al 2006) A capacidade de estimular o
crescimento vegetal apresentada por esses organismos tem sido atribuiacuteda a
mecanismos diretos tais como a fixaccedilatildeo do nitrogecircnio produccedilatildeo de fitohormocircnios e
indiretos como antagonismo em relaccedilatildeo a patoacutegenos levando consequumlentemente ao
aumento na taxa de germinaccedilatildeo crescimento das raiacutezes e parte aeacuterea nuacutemero de
folhas e flores aacuterea foliar e rendimento de culturas (SILVEIRA 2001)
Alguns dos relatos citam o gecircnero Phomopsis como fitopatoacutegeno isolado de
Citrus aurantium (Laranjeira) Citrus nobilis (Tangerineira) Citrus paradisi (Pomelo)
Citrus australis (Laranja) Citrus sinensis (Laranja da China) Citrus sp (Citros)
Mangifera indica (Mangueira) Glycine max (Soja) Ficus carica (Figueira) e Anacardium
occidentale (Cajueiro) entre muitas outras plantas (CENARGEN EMBRAPA 2005) Foi
descrito como agente causal da mancha foliar em Myracrodruon urundeuva (ANJOS
CHARCHAR e GUIMARAtildeES 2001) O fungo Phomopsis sp tambeacutem eacute encontrado
associado a sementes de Dipteryx alata e Cybistax antisyphilitica espeacutecies comuns nos
Cerrados (SANTOS 1996)
33 Fungos endofiacuteticos de plantas medicinais Os microrganismos endofiacuteticos satildeo encontrados em muitas espeacutecies de plantas
medicinais A accedilatildeo antimicrobiana de algumas dessas plantas poderiam estar
relacionadas agrave sua comunidade endofiacutetica sugere-se entatildeo que o princiacutepio ativo
antimicrobiano pode ser produzido pelo microrganismo e natildeo propriamente pelo
vegetal ou provavelmente pela interaccedilatildeo planta-hospedeiro
As plantas Aspidosperma tomentosum e Spondias mombin satildeo utilizada no
Brasil devido as suas propriedades antimicrobianas A avaliaccedilatildeo dos metaboacutelitos
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secundaacuterios produzidos pelo fungo endofiacutetico Phomopsis sp isolado dessas plantas
demonstraram excelentes resultados na inibiccedilatildeo de bacteacuterias fungos filamentosos e
leveduras (CORRADO e RODRIGUES 2004)
Rodrigues Hesse e Werner (2000) avaliaram metaboacutelitos produzidos por fungos
endofiticos isolados de Spondias mombin Guignardia sp apresentaram atividade
contra Escherichia coli Staphylococcus aureus Saccharomyces cerevisiae Geotrichum
sp e Penicillium canadesis Metaboacutelitos de Pestalotiopsis guepinii apresentaram
atividade contra S cerevisiae Os metaboacutelitos produzidos por Phomopsis sp foram
eficientes contra Cladosporium elantum Mycotypha sp e S cerevisiae
Heterosmilax japonica Kunth eacute uma planta medicinal conhecida na China por
seus efeitos diureacuteticos Gao et al (2005) avaliaram a comunidade de fungos endofiacuteticos
e observaram uma grande variedade de fungos colonizando o interior das plantas entre
eles Phomopsis Mycospharella Aureobasidium Cladosporium Glomerella
Botryosphaeria e Guignardia
Plantas do gecircnero Taxus demonstraram atividade anticanceriacutegena assim como
isolados endofiacuteticos dessas plantas O paclitaxel e alguns de seus derivados utilizados
no tratamento de cacircncer satildeo produzidos pelo fungo endofiacutetico Taxus andreanae
isolado da planta medicinal T brevifolia (STROBEL et al 1993 STIERLE et al 1995) e
pelos fungos endofiacuteticos Sporormia minima e Trichothecium sp isolados da planta
medicinal T wallichiana (SHRESTHA et al 2001) A planta medicinal T marei de onde
foi isolado o fungo Tubercularia sp tambeacutem demonstrou atividade anticanceriacutegena
(WANG et al 2000)
O fungo Colletotrichum sp foi isolado como endoacutefito da planta medicinal
Artemisia annua utilizada pelos chineses como uma droga antimalaacuterica produziu
atividade antimicrobiana contra patoacutegenos humanos e de plantas (LU et al 2000) O
fungo endofiacutetico C gloeosporioides da espeacutecie A mongoacutelica sintetiza aacutecido coletoacutetrico
que apresenta atividade antimicrobiana (ZOU et al 2000)
11
34 Endoacutefitos Produtores de Substacircncias Antimicrobianas
A antibiose eacute definida como a interaccedilatildeo entre organismos na qual um ou mais
metaboacutelitos produzidos por um organismo tecircm efeito danoso sobre o outro (BETTIOL e
GHINI 1995) Segundo Melo (1998) muitos fungos e bacteacuterias inibem fitopatoacutegenos
competindo por nutrientes parasitando eou produzindo metaboacutelitos secundaacuterios como
enzimas liacuteticas e antibioacuteticos O resultado dessas interaccedilotildees antagocircnicas tais como
antibiose competiccedilatildeo induccedilatildeo de defesa e parasitismo leva ao controle bioloacutegico de
doenccedilas de plantas assim como pode desenvolver um papel muito importante na
medicina com a descoberta de novos faacutermacos
RODRIGUES HESSE e WERNER (2000) pesquisaram a atividade
antimicrobiana de metaboacutelitos secundaacuterios produzidos por fungos endofiacuteticos de
Spondias mombin (Anacardiaceae) contra actinomicetos bacteacuterias Gram-positivas e
Gram-negativas leveduras e fungos filamentosos e verificaram que os extratos de
Guignardia sp Phomopsis sp e Pestalotiopsis guepinii inibiram o crescimento de
actinomicetos Os extratos de Guignardia sp tambeacutem apresentaram atividade
antimicrobiana contra Escherichia coli Staphylococcus aureus Saccharomyces
cerevisiae Geotrichum sp e Penicillium canadensis Metaboacutelitos de P guepinii foram
ativos contra S cerevisae e os isolados de Phomopsis sp mostraram accedilatildeo antifuacutengica
contra Cladosporium elatum Mycotypha sp e S cerevisae
Liu et al (2001) estudaram a atividade antifuacutengica de fungos endofiacuteticos isolados
de Artemisia annua sobre os fitopatoacutegenos Gaeumannomyces graminis Fusarium
graminearum Rhizoctnia cerealis Phytophthora capsici helminthosporium sativum e
Gerlachia nivalis encontrando isolados com accedilatildeo inibitoacuteria para todos os patoacutegenos Lu
et al (2000) estudando a mesma planta constataram atividade de trecircs novos
metaboacutelitos produzidos pelo fungo Colletotrichum sp apresentando atividade
antifuacutengica contra Bacillus subtilis Sataphylococcus aureus Sarcina lutea
Pseudomonas sp Candida albicans Aspergillus niger e inibiccedilatildeo de crescimento dos
fungos patogecircnicos Gaeumannomyces graminis var tritici Rhizoctonia cerealis
Helminthosporium sativum e Phytophora capisici
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A Cinnamomum zeylnicum (canela) eacute uma planta utilizada no tratamento de
uacutelceras estomacais hipertensatildeo arterial resfriados e dores abdominais Ezra e Strobel
(2003) isolaram dessa planta o fungo Muscodor albus que apresenta accedilatildeo fungicida
fungistaacutetica bactericida e bacteriostaacutetica por emissatildeo de compostos orgacircnicos volaacuteteis
O mesmo foi relatado para o fungo Gliocladium sp da planta Eucryphia cordifolia
inibindo o crescimento dos fungos fitopatogecircnicos Pythium ultimum e Verticillum dahliae
(STINSON et al 2003)
Citocalasinas satildeo metaboacutelitos fuacutengicos relacionados pela estrutura e atividade
bioloacutegica com capacidade antitumoral e atividade antibioacutetica Estas substacircncias
apresentam efeitos que incluem a inibiccedilatildeo da divisatildeo do citoplasma e dos movimentos
celulares induccedilatildeo do deslocamento nuclear retraccedilatildeo de coaacutegulos e agregaccedilatildeo de
plaquetas transporte de glucose e secreccedilatildeo da tireoacuteide Recentemente trecircs novas
citocalasinas foram relatadas como provenientes do fungo endofiacutetico Rhinocladiella sp
de Tripterygium wilfordii (WAGENAAR et al 2000)
Li e Strobel (2001) purificaram duas ciclohexenonas produzidas pelo fungo
endofiacutetico Pestalotiopsis jesteri isolado da planta Fragraea bodenii (Gentianaceae) a
jesterona e a hidroxil-jesterona das quais a primeira apresentou atividade antifuacutengica
contra o patoacutegeno Pythium ultimum Outro metaboacutelito isoldado de P microspora
isolado endofiticamente da planta Terminalia morobensis a isopestacina
(isobenzofuranona) tambeacutem se mostrou ativo contra Pythium ultimum entre outros
fungos como Sclerotinia sclerotiorum e Rhizoctonia (STROBEL et al 2002)
Adicionalmente a isopestacina apresentou atividade antioxidante contra uma variedade
de radicais livres testados
A Monstera sp eacute uma planta que cresce sobre o tronco de aacutervores dela foi
isolado o endoacutefito Streptomyces sp MSU-2110 na Amazocircnia Peruana Este
actinomiceto produz um peptiacutedeo denominado coronamicina com atividade
antimicrobiana contra o fungo patogecircnico Cryptococcus neoformans e agrave bacteacuteria
Streptococcus pneumoniae mas a melhor atividade foi a demonstrada contra
protozoaacuterio Plasmodium falciparum sugerindo potencialidade como uma droga
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antimalaacuterica Aleacutem da coronamicina este endoacutefito tambeacutem produz outros compostos
com atividades antifuacutengicas (EZRA et al 2004)
Castillo et al (2002) isolaram e caracterizaram um antibioacutetico de largo espectro
a munumbicina produzida por uma outra linhagem endofiacutetica de Streptomyces
denominada NRRL 30562 isolada da planta medicinal Kennedia nigriscans nativa do
Norte da Austraacutelia O extrato do endoacutefito obtido com solvente orgacircnico foi purificado e
submetido a HPLC (Cromatografia Liacutequida de Alta Eficiecircncia) Os quatro componentes
principais resultantes foram denominados munumbicinas A B C e D Estes compostos
demonstraram em geral atividade contra bacteacuterias Gram positivas como Bacillus
anthracis e Mycobacterium tuberculosis multi-resistente A munumbicina B inibiu
Staphylococcus aureus resistente a meticilina (MRSA) enquanto a munumbicina D
apresentou atividade contra o parasita da malaacuteria Plasmodium falciparum O extrato da
linhagem de Streptomyces foi testado ainda contra vaacuterios patoacutegenos de plantas
apresentando atividade contra Pythium ultimum Phytophthora infestans Sclerotinia
sclerotiorum Erwinia carotovora Cochliobolus carbonum e Penicillium sp mostrando o
grande potencial destas novas substacircncias para a medicina e agricultura
O aacutecido coletotricum produzido pelo fungo Colletotrichum gloeosporioides
(Penz) Penz amp Sacc isolado da planta medicinal Artemiacutesia mongolica apresentou
inibiccedilatildeo do crescimento de Bacillus subtilis Staphylococcus aureus e Sarcina lutea e
atividade antifuacutengica contra o patoacutegeno Helminthosporium sativum (ZOU et al 2000)
Corrado e Rodrigues (2004) observaram a atividade bactericida de linhagens do
fungo endofiacutetico Phomopsis sp isolado das folhas de Aspidosperma tomentosum e
peciacuteolos da planta medicinal Spondias mombin Todos os extratos avaliados inibiram o
crescimento de bacteacuterias fungos filamentosos e leveduras testadas mostrando o
grande potencial deste fungo como fonte de produtos bioativos
Chareprasert et al (2006) isolaram fungos endofiacuteticos de Tectona grandis e de
Samanea saman e testaram sua capacidade antimicrobiana Dentre os isolados
testados Phomopsis foi o gecircnero dominante produzindo substacircncias inibidoras contra
Bacillus subtilis S aureus E coli e Candida albicans
14
Aleacutem da capacidade antimicrobiana fungos endofiacuteticos mostram-se importantes
com um grande potencial antitumoral e com habilidade em inibir enzimas sugerindo
que podem representar uma estimada fonte para uso terapecircutico
Rodrigues et al (2005) verificaram que fungos endofiacuteticos possuem a
capacidade de inibir colinesterase dentre eles linhagens de Phomopsis sp Entretanto
o melhor resultado foi obtido com extratos de Penicillium indicando que estes podem
ter aplicaccedilotildees farmacecircuticas
Huang et al (2001) testaram agrave accedilatildeo de fungos endofiacuteticos isolados de plantas
medicinais frente a outros fungos e tumores Os resultados indicaram que esses fungos
satildeo importantes em medicina como agentes antimicrobianos e antitumorais
Silva et al (2005) isolaram dois novos metaboacutelitos de Phomopsis cassiae
endofiacutetico de Cassia specatabilis as substacircncias 24-diidroxi-56-dimetil benzoato de
etila e phomopsilactona que exibiram forte atividade antifuacutengica contra fitopatoacutegenos
bem como citotoxicidade contra a linhagem celular de tumor cervical humano (HeLa)
Outros fungos como o Gliocladium sp da planta Eucryphia cordifolia tambeacutem possuem
atividade contra fungos fitopatogecircnicos (STINSON et al 2003 STROBEL 2003)
Em 2001 Rodrigues-Heerklotz et al elucidaram a estrutura quiacutemica e a siacutentese
assimeacutetrica de um novo metaboacutelito o aacutecido guignardico produzido pelo fungo endofiacutetico
Guignardia sp isolados de Spondias mombin
Satildeo vaacuterios os relatos de fungos endofiticos produtores de substacircncias
antimicrobianas inclusive isolados de plantas medicinais Esses microrganismos tem
se mostrado como uma fonte promissora de agentes bioativos antitumorais e
antifuacutengicos
35 Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss
A planta Maytenus ilicifolia Mart Ex Reiss pertence agrave classe Magnoliopsida
ordem Celastrales e famiacutelia Celastraceae a qual compreende 50 gecircneros e cerca de
800 espeacutecies (CRONQUIST 1981) Conhecida popularmente nos diferentes paiacuteses da
Ameacuterica do Sul pode receber diferentes denominaccedilotildees congorosa quebrachillo e
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capororoca na Argentina (GONZALEZ LOMBARDO e VALLARINO 1937) espinheira-
divina cancorosa cancerosa cancrosa sombra-de-touro no Uruguai (SIMOtildeES et al
1986 ALICE et al 1995) coromilho-do-campo e salva-vidas (CARLINI e BRAZ 1988)
espinheira santa espinheira-divina erva-cancrosa e erva-santa (CARVALHO-OKANO
1992) cancorosa-de-Deus limatildeozinho maiteno marteno pau-joseacute salva-vidas
sombra-de-touro no Brasil (BITTENCOURT 2000)
Eacute descrita como uma aacutervore perene de porte arboacutereo-arbustivo encontrada na
mata de clima subtropical e temperado presente em sub-bosques das florestas de
Araucaacuteria nas margens de rios e em regiotildees de estepes Pode se propagar usualmente
por sementes (TAYLOR-ROSA e BARROS 1994) ou estacas de galho Preferindo
climas mais amenos ocorrendo espontaneamente ou por meio de cultivo A colheita
das folhas pode ser feita em qualquer eacutepoca do ano (PANIZZA 1998) Eacute nativa da
Ameacuterica do Sul encontrada no leste da Argentina Paraguai Boliacutevia com menor
intensidade no Chile e Uruguai No Brasil eacute predominante nos estados do Sul
(CARVALHO-OKANO 1992)
Maytenus ilicifolia eacute um arbusto de ocorrecircncia natural da Floresta Ombroacutefila Mista
(Floresta com Araucaacuteria) (BITTENCOURT 2001) Muitas vezes essa planta eacute
encontrada em ambientes ciliares e nos agrupamentos arboacutereos (capotildees) na regiatildeo de
predomiacutenio das estepes (CERVI et al 1989)
Esta planta eacute descrita como um subarbusto ou aacutervore ramificado desde a base
medindo ateacute 50 m de altura Ramos novos glabros angulosos tetra ou multicarenados
Peciacuteolo com 02-05 cm de comprimento A folha apresenta a margem inteira ou com
espinhos em nuacutemero de um a vaacuterios distribuiacutedos regular e irregularmente no bordo
geralmente concentrados na metade apical de um ou de ambos os semilimbos o limbo
com aproximadamente 22 a 89 cm de comprimento e 11 a 30 cm de largura e
nervuras na face abaxial Fruto caacutepsula bivalvar orbicular pericarpo maduro de
coloraccedilatildeo vermelho-alaranjada A presenccedila de disco nectariacutefero eacute um recurso a mais
para atrair os pequenos polinizadores como himenoacutepteros e formigas formando um
conjunto neacutectar-poacutelen interessante para a polinizaccedilatildeo uma vez que as flores satildeo
pequenas brancas e pouco vistosas O florescimento ocorre entre os meses de
16
setembro a outubro enquanto os frutos surgem entre outubro e fevereiro (CARVALHO-
OKANO 1992 RAMDOMSKI 1998 BITTENCOURT 2000)
A fragmentaccedilatildeo da Floresta com araucaacuterias nas uacuteltimas deacutecadas juntamente
com a comprovaccedilatildeo terapecircutica contra males gaacutestricos e o uso em larga escala
causaram grande devastaccedilatildeo de populaccedilotildees naturais de Maytenus ilicifolia
(BITTENCOURT 2001)
351 Componentes quiacutemicos e propriedades terapecircuticas Plantas sempre foram usadas como fonte terapecircutica na medicina tanto em
remeacutedios tradicionais quanto em produtos industrializados A planta Maytenus ilicifolia
Mart eacute geralmente utilizada na medicina popular brasileira As folhas secas desta
planta satildeo usadas como uma infusatildeo para aliviar dores de estocircmago e naacuteuseas e no
tratamento de uacutelceras e gastrites (CAMPAROTO et al 2002) Vaacuterios compostos
isolados de M ilicifolia foram descritos apresentando accedilatildeo antitumoral tambeacutem usado
como analgeacutesico antinflamatoacuterio e antiaacutecido (JORGE 2004)
Esta espeacutecie tem uso popular em comunidades tradicionais e povos indiacutegenas no
Brasil (BITTENCOURT 2001) No Paraguai e Boliacutevia tribos indiacutegenas e populaccedilotildees
rurais a utilizam como substacircncia controladora da fertilidade (CORDEIRO VILEGAS e
LANCcedilAS 1999) e no Paraguai e Argentina eacute usada como contraceptiva e abortiva
(MONTANARI CARVALHO e DOLDER 1998) Citada tambeacutem com uso no tratamento
de febres palustres (MEIRA PENNA 1946) afecccedilotildees pruriginosas cutacircneas
(COIMBRA 1958) dispepsias (CRUZ 1965) Inflamaccedilotildees ulceras e gaacutestricas (JORGE
2004)
As propriedades terapecircuticas de Maytenus ilicifolia foram atribuiacutedas agrave produccedilatildeo
de compostos terpecircnicos como maitenina e pristimerina tanto pelas raiacutezes (LIMA et al
1971 ITOKAWA et al 1991) como em ramos de folhas (JORGE et al 2004) Assim
como fenoacuteis taninos gaacutelicos (CAMPAROTO et al 2002) flavonoacuteides e outros
compostos (SILVA et al 1991 LEITE et al 2001)
17
Jorge et al (2004) avaliaram a eficaacutecia de extratos de M ilicifolia como
antinflamatoacuterio na proteccedilatildeo contra lesotildees gaacutestricas incluindo a cicatrizaccedilatildeo e
citoproteccedilatildeo sugerindo que os extratos de Maytenus ilicifolia podem representar uma
importante alternativa cliacutenica em antinflamatoacuterios e antiulcerogecircnico
Souza-Formigoni et al (1991) avaliaram a potencialidade dos efeitos
antiulcerogecircnicos das folhas de espinheira santa em experimentos realizados em ratos
com ulceras O uso de chaacute tanto por via oral como intraperitoneal mostrou resultados
semelhantes agrave droga cicatrizante cimetidina M ilicifolia assim como outras espeacutecies da
famiacutelia Celastraceae foram investigadas quanto aos seus constituintes de accedilatildeo
citotoacutexica sendo isolados triterpenos aromaacuteticos de accedilatildeo antitumoral Segundo Itokawa
et al (1991 1993) e Shirota et al (1994) os triterpenos satildeo capazes de estimular
fatores atuantes na proteccedilatildeo da mucosa gaacutestrica como a produccedilatildeo de muco e
prostaglandinas
A cimetidina eacute um potente agente na supressatildeo de aacutecido gaacutestrico e pepsina ela
age como antagonista competitivo da histamina nos receptores H2 das ceacutelulas parietais
gaacutestricas produtoras de aacutecido dessa forma bloqueia a secreccedilatildeo aacutecida (SOUZA-
FORMIGONI et al 1991) Ferreira et al (2004) investigaram o efeito e possiacutevel
mecanismo de accedilatildeo do extrato aquoso liofilizado de M ilicifolia sobre a secreccedilatildeo de
aacutecidos em mucosa gaacutestrica de sapos Foi observada uma reduccedilatildeo de 16 da secreccedilatildeo
aacutecida sugerindo os autores que essa reduccedilatildeo ocorra devido a uma atividade
antagoniacutestica dos extratos nos receptores de H2 de histidina
Montanari Carvalho e Dolder (1998) analisaram os efeitos de extratos
etanoacutelicos de M ilicifolia na espermatogecircnese de camundongos e natildeo encontraram
qualquer defeito ou distuacuterbio Poreacutem Montanari e Bevilacqua (2002) em estudos com
fecircmeas de ratos constataram uma diminuiccedilatildeo significativa na implantaccedilatildeo dos embriotildees
com a utilizaccedilatildeo de extrato liofilizado das folhas
18
352 Endoacutefitos isolados de Maytenus ilicifolia
Pileggi (2006) isolou microrganismos endofiacuteticos de folhas peciacuteolos e sementes
de Maytenus ilicifolia e investigou o potencial farmacoloacutegico dos mesmos Foram
isolados em maior frequumlecircncia os fungos Alternaria sp Colletotricum sp Bipolaris sp
Phyllosticta sp e Cladosporium sp Entre os fungos e bacteacuterias testados 15
apresentaram potencial para o controle bioloacutegico Na anaacutelise de caracterizaccedilatildeo
morfoloacutegica por RAPD foi sugerida a presenccedila de duas espeacutecies de Coletotricum
isolados de Maytenus ilicifolia
Figueiredo (2006) isolou de Maytenus ilicifolia fungos endofiacuteticos e os avaliou
quanto ao potencial antimicrobiano contra bacteacuterias patogecircnicas em humanos e o fungo
fitopatogecircnico Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta do Citros Os
extratos metanoacutelicos de dois isolados exibiram accedilatildeo fungistaacutetica na germinaccedilatildeo e no
crescimento micelial de G citricarpa Dois extratos de Pestalotiopsis sp inibiram o
crescimento dos microrganismos-teste (S aureus oxalino resistente Klebsiella
pneumoniae Micrococcus luteus Staphylococcus aureus e Escherichia coli)
Bacteacuterias com potencial anti-leucemico foram isoladas de Maytenus essas
bacteacuterias interagem com as plantas na produccedilatildeo de alguns metaboacutelitos como a
maytensina substancia que tambeacutem apresenta propriedades antifuacutengicas
Azevedo et al (2000) relataram a presenccedila de bacteacuterias endofiacuteticas em folhas de
Maytenus aquifolium Foram isolados vinte gecircneros os mais frequumlentes foram Bacillus
Clavibacter e Streptomyces aleacutem de actinomicetos Testes preliminares mostraram que
algumas das bacteacuterias podem produzir ansamacroliacutedeos que tambeacutem satildeo produzidos
pela planta hospedeira
36 Guignardia citricarpa Kiely e a Mancha preta do citros
O gecircnero Guignardia foi descrito em 1982 por Viala e Ravaz e compreende as
formas teleomoacuterficas de espeacutecies de Phyllosticta e de alguns outros gecircneros
19
relacionados de fungos imperfeitos geralmente saproacutefitas ou semiparasitas de folhas
(SIVANESAN 1984)
Diversos autores isolaram espeacutecies de Phyllosticta de plantas aparentemente
sadias descrevendo-as como endofiacuteticas (CARROLL e CARROLL 1978 PETRINI
1986 LEUCHTMANN et al 1992 GLIENKE 1995 PENNA 2000) No entanto existe
um grande nuacutemero de relatos citando este gecircnero como fitopatogecircnico de diversas
culturas com grande importacircncia econocircmica como arroz (SUGHA SINGH E SHARMA
1986) cana-de-accediluacutecar (PONS 1990) tabaco (PATEL et al 1988) e eucalipto (CROUS
et al 1993) e tambeacutem frutiacuteferas como abacate e tomate (BAKER 1938) manga e
mamatildeo (McMILLAN JR 1986) uva (IBRAHIM e BAYCA 1989) e principalmente em
citros (McONIE 1964a 1964b HERBERT e GRECH 1985 JOHNSTON e
FULLERTON 1988)
O fungo Guignardia citricarpa Kiely (anamorfo Phyllosticta citricarpa (McALP)
Van Der Aa) eacute um Ascomiceto da ordem Dothideales famiacutelia Dothideaceae Possui
estroma plectenquimatoso pseudoteacutecio globoso a subgloboso medindo 125 a 360 μm
de diacircmetro contendo um poro de 14 a 16 μm e paredes espessas com 20 a 22 μm
Seu asco apresenta forma de clava arredondado na extremidade superior e eacute
bitunicado Conteacutem oito ascoacutesporos unicelulares hialinos ligeiramente cinzentos
romboacuteides contendo gracircnulos e um grande vacuacuteolo central Os ascoacutesporos satildeo
cobertos com um quepe gelatinoso nas extremidades Segundo Sivanesam (1984)
pseudoparaacutefises satildeo encontradas em pseudoteacutecios maduros De acordo com Johnston
e Fullerton (1988) as formas anamorfas e teleomorfa geralmente satildeo encontradas
associadas
As estruturas de frutificaccedilatildeo satildeo os picniacutedios que macroscopicamente satildeo
pequenos globosos pretos e semi-eruptivos A fase sexuada corresponde agrave produccedilatildeo
de ascoacutesporos os quais se encontram em nuacutemero de oito no interior dos ascos Estes
apresentam forma de clava satildeo arredondados na extremidade superior e bitunicados
Os ascoacutesporos satildeo unicelulares hialinos levemente acinzentados romboacuteides
contendo gracircnulos e um grande vacuacuteolo central cobertos com um quepe gelatinoso nas
extremidades (SIVANESAN 1984)
20
Fialho (2004) avaliou in vitro o potencial de linhagens de S cerevisiae como
agentes no controle bioloacutegico contra G citricarpa nos frutos poacutes-colheita Rodrigues
(2006) avaliou o efeito dos principais fungicidas utilizados no campo para o controle da
doenccedila Tambeacutem avaliou 96 linhagens de fungos para a seleccedilatildeo de potenciais agentes
no controle bioloacutegico demonstrando que algumas espeacutecies de Trichoderma satildeo
capazes de atuar in vitro como biocontroladores do fitopatoacutegeno G citricarpa
Cardoso-Filho (2003) avaliou o uso de indutores de resistecircncia Saccharomyces
cerevisiae Bionreg e aacutecido saliciacutelico ao fitopatoacutegeno G citricarpa O autor destaca que os
compostos presentes no albedo (mesocarpo) da laranja como a celulose carboidratos
soluacuteveis pectinas compostos fenoacutelicos (flavonoacuteides) aminoaacutecidos e vitaminas podem
exibir a accedilatildeo antimicrobiana para o controle da MPC Neste contexto ele avaliou os
extratos produzidos pelo albedo da laranja e comprovou accedilatildeo fungicida ou fungistaacutetica
inibindo a germinaccedilatildeo esporulaccedilatildeo e crescimento micelial in vitro de G citricarpa
Blanco (1999) e Christo (2002) observaram esta variabilidade entre linhagens
isoladas de lesatildeo de Mancha Preta de Citros (MPC) ou seja linhagens de G citricarpa
utilizando dados de RAPD Esta variabilidade tambeacutem foi evidenciada em linhagens
isoladas em plantas assintomaacuteticas atualmente descritas como Guignardia mangiferae
(GLIENKE-BLANCO et al 2002 CHRISTO 2002 BAAYEN et al 2002 OKANI
NAKAGIRI e ITO 2001 RODRIGUES et al 2004)
Em 1999 Glienke-Blanco comparou geneticamente por meio de marcadores de
RAPD linhagens de populaccedilotildees patogecircnicas e endofiacuteticas de Guignardia sp de
diversas regiotildees e hospedeiros constatando a existecircncia de trecircs populaccedilotildees de
Guignardia geneticamente muito diferentes coexistindo em citros sendo duas
endofiacuteticas e uma patogecircnica sugerindo que talvez estas trecircs populaccedilotildees pudessem
pertencer a espeacutecies distintas O desenvolvimento de um par de oligonucleotiacutedeos
capaz de amplificar um fragmento de 370 pb especiacutefico para linhagens patogecircnicas de
G citricarpa veio a corroborar para distinccedilatildeo geneacutetica entre estes grupos (GLIENKE et
al 2007)
21
361 Mancha Preta do Citros
A doenccedila mancha preta dos citros (MPC) foi descrita na Austraacutelia em 1985 por
Kiely posteriormente na Aacutefrica do Sul como consequumlecircncia da importaccedilatildeo de mudas da
Austraacutelia Atualmente estaacute distribuiacuteda em regiotildees subtropicais do mundo entre elas o
Brasil (GOacuteES et al 2005)
O ciclo da doenccedila (MPC) inicia-se com a disseminaccedilatildeo dos coniacutedios ou
picnidioacutesporos (esporos assexuais) e ascoacutesporos (esporos sexuais) do fungo
Guignardia citricarpa Os coniacutedios (picnidioacutesporos) satildeo responsaacuteveis pelas infecccedilotildees agrave
curta distacircncia e estatildeo localizados no interior dos picniacutedios oriundos dos frutos
infectados Um agregado de coniacutedios emerge atraveacutes da abertura do picniacutedio (ostiacuteolo)
dissolve-se na aacutegua da chuva orvalho ou irrigaccedilatildeo e cai sobre os pequenos frutos
susceptiacuteveis que se formam apoacutes as floradas Jaacute os ascoacutesporos satildeo responsaacuteveis pela
disseminaccedilatildeo agrave curta e longa distacircncia pois satildeo lanccedilados dos periteacutecios que se
formam em folhas caiacutedas ao solo e satildeo levados por correntes aeacutereas infectando
pequenos frutos susceptiacuteveis (ROBES 1990)
Em estudo epidemioloacutegico da MPC Spoacutesito et al (2008) analisou 27270 frutos
colhidos de 303 aacutervores quanto agrave incidecircncia da doenccedila (porcentagem de frutos doentes
por aacutervore) e quanto agrave severidade da doenccedila (aacuterea com sintoma do fruto) O autor
encontrou frutos doentes em 251 aacutervores das 303 analisadas (83) com diferentes
niacuteveis de incidecircncia Algumas aacutervores tinham a maioria das frutas com lesotildees
agregadas e de alta gravidade enquanto outras tinham a maioria das frutas com
poucas lesotildees e baixa gravidade Segundo os autores quando o agente patogecircnico eacute
disperso pela aacutegua da chuva esta pode transportar muitos esporos de uma vez
formando uma lesatildeo O padratildeo de sintomas resultantes a partir deste tipo de dispersatildeo
eacute tipicamente agregada Os autores concluiacuteram que os ascoacutesporos satildeo os mais
importantes inoacuteculos de G citricarpa
A MPC caracteriza-se por apresentar lesotildees com bordas salientes e com
depressatildeo no centro onde se observam pequenos pontos pretos os picniacutedios As
lesotildees podem atingir os frutos maduros ou no iniacutecio de maturaccedilatildeo podendo aparecer
22
apoacutes a colheita no transporte e armazenamento (ROBES et al 1995) A MPC afeta
apenas a casca do fruto e o flavedo (epicarpo) sem causar dano internamente limitado
pelo albedo (mesocarpo) Poreacutem sua comercializaccedilatildeo no mercado de frutas eacute
prejudicada assim como a sua exportaccedilatildeo devido agrave barreira fitossanitaacuteria existente na
Uniatildeo Europeacuteia por ser uma doenccedila quarentenaacuteria A1 Nos casos em que a doenccedila
atinge o pedicelo do fruto pode ocorrer agrave queda prematura do fruto aumentando as
perdas na produccedilatildeo e ateacute limitando seriamente a citricultura em vaacuterios estados
brasileiros (GOacuteES et al 2005 ROBES et al 1995)
Em funccedilatildeo dos prejuiacutezos causados por G citricarpa na comercializaccedilatildeo de
frutos in natura principalmente no mercado externo satildeo crescentes os estudos que
datildeo ecircnfase ao controle bioloacutegico da doenccedila
37 O Gecircnero Phomopsis sp
O gecircnero Phomopsis descrito em 1905 por (Sacc) Bubak (RIEDL 1981) forma
picniacutedios escuros com ostiacuteolo normalmente em forma de pecircra conidioacuteforos simples
alfa coniacutedios hialinos com gotas nas extremidades predominantemente elipsoacuteides sem
septos unicelulares de forma ovoacuteide Apresenta tambeacutem beta coniacutedios hialinos sem
gotas filiformes a maioria curvos em uma das extremidades sem septos (HANLIN e
MENEZES 1996)
Outra caracteriacutestica dos fungos do gecircnero Phomopsis eacute a formaccedilatildeo de linhas
negras estreitas em tecidos de plantas contaminadas assim como no meio de cultura
em que satildeo repicados (BRAYFORD 1990)
O gecircnero Phomopsis pertence ao filo Ascomycota subfilo Pezizomycotin classe
Sordariomycetes subclasse Sordariomycetidae ordem Diaporthales famiacutelia Valsaceae
mitosporic Valsaceae Apresenta-se na forma anamoacuterfica o seu teleomorfo eacute o
Diaporthe cujo habitat eacute o caule de plantas lenhosas e herbaacuteceas (HANLIN e
MENEZES 1996)
Espeacutecies de Phomopsis satildeo comumente encontradas como patoacutegenos e
endoacutefitos de plantas (BODDY e GRIFFITH 1989) Tradicionalmente o gecircnero tem sido
23
considerado altamente patogecircnico (REHNER e UECKER 1994) mas algumas
espeacutecies de Phomopsis satildeo entretanto endoacutefitos mutualiacutesticos (WEBBER e GIBBS
1984 CARROLL 1986)
Espeacutecie de Phomopsis e Diaporthe tecircm sido tradicionalmente descritos com
base na espeacutecie hospedeira Poreacutem algumas espeacutecies e isolados podem infectar mais
de um hospedeiro (BRAYFORD 1990 FARR CASTLEBURY e ROSSMAN 2002) tal
estrateacutegia tem sido frequentemente questionada (REHNER e UECKER 1994)
Trabalhos incluindo estudos de cruzamentos mostraram que esse criteacuterio natildeo eacute
suficiente para classificaccedilatildeo ao niacutevel de espeacutecie Aleacutem disso isolados de Phomopsis
provenientes do mesmo hospedeiro natildeo necessariamente pertencem agrave mesma espeacutecie
assim como uma mesma espeacutecie de Phomopsis pode infectar diferentes hospedeiros
(REHNER e UECKER 1994)
Foram descritas mais de 1000 espeacutecies do gecircnero Phomopsis baseado
principalmente na associaccedilatildeo com o hospedeiro (UECKER 1988) Embora o
hospedeiro seja atualmente considerado menos importante na definiccedilatildeo de espeacutecies
nenhuma revisatildeo do gecircnero foi realizada A fase teleomoacuterfica (Diaporthe) foi descrita
apenas para aproximadamente 20 das espeacutecies do gecircnero Phomopsis (PHILLIPS
2006) Essa ausecircncia da fase teleomorfica (Diaporthe) em meio de cultura
(principalmente quando isolado endofiticamente) torna a identificaccedilatildeo ao niacutevel de
espeacutecie neste gecircnero muito difiacutecil (REHNER e UECKER 1994)
Wehmeyer (1933) elaborou uma revisatildeo do gecircnero Diaporthe o autor
considerou a associaccedilatildeo com o hospedeiro uma caracteriacutestica de menor importacircncia
tendo reduzido de 650 para 70 o nuacutemero de espeacutecies no gecircnero No entanto este
estudo baseou-se unicamente em caracteriacutesticas morfoloacutegicas do teleomorfo natildeo tendo
sido consideradas as caracteriacutesticas do anamorfo
A delimitaccedilatildeo de espeacutecies de Phomopsis baseado apenas em caracteriacutesticas
morfoloacutegicas demonstrou-se inadequada (VAN DER AA 1990) Em adiccedilatildeo as
caracteriacutesticas de morfologia do coniacutedio e caracteriacutesticas da colocircnia usadas para
identificar espeacutecies alguns autores tecircm utilizado caracteres alternativos que incluem
virulecircncia (VIDIC 1991) proteiacutenas e sorologia (LEE e SNOW 1992 VELICHETI et al
24
1991) sequumlecircncias ITS (ZHANG et al 1998) e enzimas e metaboacutelitos secundaacuterios
(SHIVAS ALLEN e WILLIAMSON 1991) Infelizmente nenhum caraacuteter foi aplicaacutevel
para distinguir todos os grupos de isolados (REHNER e UECKER 1994)
O entendimento sobre o gecircnero expandiu-se por meio de estudos de sequumlecircncias
ITS nos quais alguns dos isolados agruparam-se por regiotildees geograacuteficas (REHNER e
UECKER 1994) Alguns trabalhos tecircm comparado dados morfoloacutegicos com dados
moleculares principalmente o uso de sequumlecircncias da regiatildeo ITS do DNA ribossomal
Zhang et al (1998) destingiu cinco taacutexons de Phomopsis isolados de Soja (Glycine
max) utilizando sequumlecircncias da regiatildeo ITS do DNA ribossomal poreacutem natildeo foram
capazes de diferenciar-los com base nas caracteriacutesticas morfoloacutegicas Farr et al (2002)
caracterizaram por anaacutelise molecular com o uso de sequumlecircncias ITS1 58S ITS2 e por
caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de Phomopsis sp isolados de Vaccinium
corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse estudo verificaram que a maioria dos
isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma vez que as sequumlecircncias agruparam-se
com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
Castlebury e Mengistu (2006) avaliaram Phomopsis isolados de soja e outros
hospedeiros combinando dados de sequumlecircncias de ITS do DNA ribossomal o
sequumlenciamento do gene EF1-alpha e genes de actina seis grupos de Phomopsis
foram formados desses trecircs correspondem aos taacutexons P longicolla Diaporthe
melonis e D phaseolorum Os autores concluiacuteram entatildeo que agrave ausecircncia de distinccedilatildeo
morfoloacutegica e informaccedilatildeo bioloacutegica torna problemaacutetica a identificaccedilatildeo de espeacutecies aos
grupos de isolados geneticamente distintos Aleacutem disso natildeo estaacute esclarecida a
importacircncia bioloacutegica e geneacutetica dos diferentes grupos e trabalhos adicionais quanto
aos hospedeiros patogenicidade e morfologia satildeo necessaacuterios para resolver a distinccedilatildeo
de espeacutecies neste gecircnero
O gecircnero Phomopsis eacute um importante grupo de fungos com potencial
biotecnoloacutegico devido agrave produccedilatildeo de importantes metaboacutelitos secundaacuterios entre os
quais se incluem o micotoxinas que afeta o sistema nervoso de vertebrados (BILLS et
al 2002) alcaloacuteides com capacidades farmacoloacutegicas tais como phomopsins
(COCKRUM PETTERSON e EDGAR 1994) e 24-diidroxi-56-dimetil benzoato de etila
25
e phomopsilactona produzidos por Phomopsis cassiae endofiacutetico de Cassia
specatabilis (SILVA et al 2005)
38 Marcadores Moleculares
A variabilidade geneacutetica em microrganismos pode ser detectada por teacutecnicas
claacutessicas ou moleculares As teacutecnicas claacutessicas baseiam-se na anaacutelise de fenoacutetipos a
partir da caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica (produccedilatildeo de coniacutedios crescimento radial da
colocircnia) ou bioquiacutemica (produccedilatildeo de substacircncias auxotrofias) restringindo a
possibilidade de se conduzir estudos populacionais e muitas vezes de sistemaacutetica As
teacutecnicas moleculares por sua vez fornecem ferramentas para evidenciar e entender
melhor diversos aspectos relacionados direta ou indiretamente com o DNA Desta
forma a anaacutelise dos aacutecidos nucleacuteicos vem sendo amplamente utilizada na diferenciaccedilatildeo
de organismos e no esclarecimento taxonocircmico e filogeneacutetico dos organismos
estudados
Os diversos meacutetodos de detecccedilatildeo de polimorfismo geneacutetico diretamente ao niacutevel
de aacutecidos nucleacuteicos tecircm permitido a anaacutelise molecular da variabilidade do DNA
determinando pontos de referecircncia nos cromossomos tecnicamente denominados
ldquomarcadores molecularesrdquo Por marcador molecular define-se todo e qualquer fenoacutetipo
molecular oriundo de um gene expresso ou de um segmento especiacutefico de DNA
(GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Os dados moleculares frequumlentemente complementam e corroboram hipoacuteteses
baseadas em estudos morfoloacutegicos embora algumas vezes os resultados obtidos da
anaacutelise de DNA sejam conflitantes com dados de anaacutelise exclusivamente feneacuteticas
Esta contradiccedilatildeo pode ser observada principalmente na classificaccedilatildeo taxonocircmica de
microrganismos (SAMUELES e SEIFERT 1995)
Algumas teacutecnicas moleculares utilizadas principalmente em fungos para a
detecccedilatildeo do polimorfismo geneacutetico de sequumlecircncias de DNA satildeo Eletroforese em Campo
Pulsado (PFGE) Polimorfismos dos fragmentos de Restriccedilatildeo (RFLPs) Polimorfismos
26
do DNA Amplificados ao Acaso (RAPDs) Sequumlenciamento das Regiotildees Internas
Transcritas (ITS1 e ITS2) do DNA ribossocircmico (rDNA)
Aleacutem de avaliarem a variabilidade geneacutetica estes marcadores moleculares
podem determinar relaccedilotildees filogeneacuteticas como tambeacutem colaborar na identificaccedilatildeo de
um determinado isolado Tais marcadores podem ser gerados independentemente do
fenoacutetipo e revelar polimorfismos altamente informativos em sequumlecircncias de DNA
A teacutecnica de RFLP surgiu a partir da descoberta de que os siacutetios para enzimas
de restriccedilatildeo poderiam ser polimoacuterficos ou seja alteraccedilotildees em um uacutenico par de bases
que muitas vezes satildeo neutras poderiam ser detectadas pela presenccedila ou ausecircncia
destes siacutetios para endonucleases Esta teacutecnica propiciou a introduccedilatildeo de um elevado
nuacutemero de marcadores moleculares nas anaacutelises de variabilidade geneacutetica (ALBERTS
et al 2004) Dentre as inuacutemeras aplicaccedilotildees dos marcadores RFLP pode-se citar o
estudo da evoluccedilatildeo dos genomas a identificaccedilatildeo de genes especiacuteficos o estudo de
geneacutetica de populaccedilotildees a taxonomia e obtenccedilatildeo de mapas geneacuteticos (MICHELEMORE
e HULBERT 1987) Entretanto seu uso torna-se limitado pois eacute necessaacuterio DNA de
alta qualidade e em grande quantidade (GLIENKE 1995)
O uso do DNA ribossomal (rDNA) como marcador molecular tambeacutem pode ser
empregado na anaacutelise da variabilidade geneacutetica para uma ampla faixa de niacuteveis
taxonocircmicos As sequumlecircncias codificantes do rDNA evoluem muito lentamente e satildeo
altamente conservadas possibilitando a sua utilizaccedilatildeo em estudos com organismos
pouco relacionados taxonomicamente Ao contraacuterio do rDNA as regiotildees espaccediladoras
internas destes genes conhecidas como ITS evoluem rapidamente apresentando alto
polimorfismo e sendo desta forma de grande interesse nos estudos filogeneacuteticos de
gecircneros espeacutecies e populaccedilotildees (WHITE e MORROW 1990)
A reaccedilatildeo em cadeia da polimerase (PCR) tornou-se uma das mais importantes e
utilizadas teacutecnicas em Biologia Molecular por apresentar rapidez baixo custo e
capacidade de amplificaccedilatildeo de pequenas quantidades de DNA (MULLIS e FALOONA
1987 WHITE e MORROW 1989)
Concebida por KARY MULLIS em meados da deacutecada de 80 a teacutecnica baseia-se
em amplificar fragmentos de sequumlecircncias de DNA com alta especificidade e fidelidade
27
utilizando oligonucleotiacutedeos especiacuteficos ou natildeo Tais oligonucleotiacutedeos delimitam a
sequumlecircncia de DNA gerando um sinal molecular que pode ser amplificado (MULLIS e
FALOONA 1987 WHITE e MORROW 1989 McPHERSON QUIRKE e TAYLOR
1991 GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
A PCR consiste em uma teacutecnica in vitro capaz de produzir muacuteltiplas coacutepias de
sequumlecircncias especificas de DNA Alterando-se as condiccedilotildees de reaccedilatildeo pode-se
amplificar cadeias simples de DNA detectar e distinguir entre genes portadores de
mutaccedilatildeo em uma uacutenica base ou proporcionar quantidades suficientes de DNA para
anaacutelise eou manipulaccedilatildeo subsequumlente (WALKER e RAPLEY 1999)
Uma das limitaccedilotildees da teacutecnica PCR eacute a necessidade do conhecimento preacutevio da
sequumlecircncia que flanqueia o segmento a ser amplificado para que os oligonucleotiacutedeos
possam ser construiacutedos (WATSON et al 1992 ALBERTS et al 2004) A teacutecnica de
RAPD entretanto natildeo apresenta este obstaacuteculo pois segundo Williams et al (1990)
esta teacutecnica baseia-se na amplificaccedilatildeo de segmentos de DNA por um uacutenico
oligonucleotiacutedeo de sequumlecircncia arbitraacuteria que amplifica vaacuterias regiotildees simultaneamente
381 Marcadores RAPD
O RAPD (polimorfismo do DNA amplificado ao acaso) envolve a utilizaccedilatildeo de
oligonucleotiacutedeos de sequumlecircncia arbitraacuteria que amplificam vaacuterias regiotildees do genoma
simultaneamente (WILLIAMS et al 1990 WELSH E MCCLELLAND 1990
VILARINHOS et al 1995 FUNGARO et al 1996 ALZATE-MARIN et al 1997
ABBASI et al 1999 PAAVANEM-HUHTALA AVIKAINEM e YLI-MATTILA 2000)
Dessa forma natildeo eacute necessaacuterio o desenvolvimento preacutevio de uma biblioteca de sondas
especiacuteficas para o organismo de interesse
A teacutecnica de RAPD utiliza o mesmo princiacutepio da PCR (SAIKI et al 1985) A
principal diferenccedila entre a PCR usual e o RAPD estaacute na reaccedilatildeo de amplificaccedilatildeo que
utiliza apenas um uacutenico oligonucleotiacutedeo com sequumlecircncia arbitraacuteria de 10 a 15 bases A
amplificaccedilatildeo somente ocorre se este oligonucleotiacutedeo for complementar a um siacutetio em
uma das fitas e complementar a um mesmo siacutetio (orientaccedilatildeo invertida) na outra fita de
28
DNA (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998) Segundo Williams et al (1993) o tamanho
ideal do oligonucleotiacutedeo para amplificaccedilatildeo de RAPD eacute em torno de dez bases
devendo seu conteuacutedo GC ser em torno de 50 a 70 e no miacutenimo de 40 Aleacutem disso
os oligonucleotiacutedeos natildeo devem conter sequumlecircncias palindrocircmicas a fim de evitar o
autopareamento
Os marcadores RAPD tecircm sido amplamente utilizados para o estudo de diversos
grupos de seres vivos A partir dos marcadores moleculares clonados e sequumlenciados
haacute a possibilidade de sintetizar oligonucleotiacutedeos especiacuteficos aumentando o seu poder
de resoluccedilatildeo (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Esses marcadores permitem caracterizar e avaliar o grau de similaridade
geneacutetica entre genoacutetipos em niacuteveis inter e intraespeciacuteficos sendo altamente sensiacuteveis
quanto diferenccedilas de ateacute um uacutenico nucleotiacutedeo entre o oligonucleotiacutedeo e o DNA molde
Permitem ainda analisar a estrutura geneacutetica de populaccedilotildees naturais populaccedilotildees de
melhoramento e bancos de germoplasma a construccedilatildeo de mapas geneacuteticos de alta
cobertura genocircmica a localizaccedilatildeo de genes de interesse econocircmico e ainda a
obtenccedilatildeo de novos marcadores para diagnoacutesticos via PCR (FUNGARO e VIEIRA 1998
FUNGARO 2000 GLIENKE-BLANCO et al 2002 ANCHORENA-MATIENZO 2002)
Diferentes niacuteveis taxonocircmicos podem ser inferidos atraveacutes de marcadores
RAPD cujos padrotildees podem apresentar-se como variaacuteveis quando polimoacuterficos e
constantes quando natildeo-polimoacuterficos
Avaliando a variabilidade geneacutetica de organismos geneticamente relacionados
diversos autores confrontaram resultados obtidos a partir de anaacutelises moleculares ao
niacutevel de proteiacutenas com os dados obtidos a partir de marcadores moleculares de DNA
Meijer Megnegneau e Linders (1994) estudando linhagens de Phomopsis subordinaria
isoladas de 23 localidades diferentes chegaram a resultados conflitantes obtidos por
RAPD e isoenzimas Os marcadores de RAPD mostraram alta similaridade entre 47
linhagens de P subordinaria isoladas de oito localidades diferentes enquanto a anaacutelise
por isoenzimas sugeriu que todas as linhagens eram idecircnticas
Jaacute Pioli et al (2003) caracterizaram por RAPD isolados do complexo
DiaporthePhomopsis coletados de soja na Argentina Eles foram separados em quatro
29
grupos (i) Diaporthe phaseolorum variedade meridionalis (ii) D phaseolorum variedade
caulivora (iii) D phaseolorum variedade sojae and (iv) Phomopsis longicolla revelando
a existecircncia de variabilidade entre isolados da mesma variedade
Fernandez e Hanlin (1996) obtiveram resultados concordantes entre a anaacutelise
molecular por RAPD e as caracteriacutesticas morfoculturais separando os isolados
coletados de soja em dois grupos Diaporthe phaseolorum e Phomopsis longicolla
Os marcadores de RAPD tambeacutem podem ser usados na anaacutelise de
recombinantes obtidos por parameiose em Beauveria bassiana (DALZOTO et al 2003)
A teacutecnica RAPD tambeacutem eacute utilizada como um meacutetodo eficiente na diferenciaccedilatildeo
de microrganismos patogecircnicos e natildeo patogecircnicos Guthirie et al (1992) e Vasconcelos
(1994) caracterizaram diferentes espeacutecies do gecircnero Colletotrichum diferenciando-as
quanto agrave sua patogenicidade
Grajal-Martin Simon e Muehlbauer (1993) conseguiram diferenciar o tipo 2 de
Fusarium oxysporum f sp pisi de trecircs outros grupos por marcadores RAPDs Da
mesma maneira isolados patogecircnicos de Fusarium oxysporum f sp dianthi que
atacam cravos puderam ser distinguidas de vaacuterios natildeo patogecircnicos por marcadores
RAPD (MANULIS et al 1993)
Blanco (1999) utilizando seis oligonucleotiacutedeos de RAPD confirmou a existecircncia
de trecircs populaccedilotildees distintas de Guignardia citricarpa coexistindo em citros sendo duas
endofiacuteticas e uma patogecircnica responsaacutevel pelas lesotildees da mancha preta nos citros
Glienke-Blanco et al (2002) utilizando sete oligonucleotiacutedeos de RAPD encontraram
alta variabilidade geneacutetica em linhagens endofiacuteticas de Guignardia citricarpa isoladas
de plantas assintomaacuteticas de citros
382 Marcadores ITS
O DNA ribossocircmico contido nas regiotildees organizadoras de nucleacuteolos (NOR) tem
sido objeto de um grande nuacutemero de estudos com diversas aplicaccedilotildees em geneacutetica
evoluccedilatildeo e melhoramento Tal interesse estaacute diretamente relacionado agrave estrutura
destas regiotildees que se encontram em locais especiacuteficos do genoma e repetidos em
30
sequumlecircncia inuacutemeras vezes A funccedilatildeo do rDNA eacute codificar as diferentes moleacuteculas de
RNA ribossocircmico (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Segundo White et al (1990) as regiotildees espaccediladoras internas do DNA
ribossomal (ITS) evoluem rapidamente apresentando alto polimorfismo ao contraacuterio
do rDNA e sendo assim essas regiotildees satildeo de grande interesse nos estudos
filogeneacuteticos em niacuteveis de gecircnero espeacutecies e populaccedilotildees Esta caracteriacutestica permite
ainda a sua utilizaccedilatildeo na obtenccedilatildeo de polimorfismos de comprimento de fragmentos
(RFLP) nos loci de rDNA O nuacutemero de coacutepias de uma determinada sequumlecircncia de
rDNA e variaccedilotildees de nucleotiacutedeos nestas sequumlecircncias tambeacutem tecircm sido utilizados em
tais estudos (FERREIRA 1994)
Orsquodonnell e Gray (1995) avaliaram a relaccedilatildeo filogeneacutetica e a variaccedilatildeo geneacutetica
dentro de 24 isolados do complexo Fusarium solani por meio da sequecircncia de rDNA e
marcador RFLP e concluiacuteram que esta espeacutecie eacute formada por espeacutecies filogeneacuteticas
distintas Utilizando a mesma teacutecnica Ouellet e Seiffert (1993) diferenciaram F
graminearum de outras 11 espeacutecies que atacam trigo aleacutem de terem permitido a
identificaccedilatildeo de diversas raccedilas desta espeacutecie provenientes de isolados
morfologicamente semelhantes
Jasalavich Ostrofskf e Jellison (2000) utilizaram os oligonucleotiacutedeos ITS1 e
ITS4 (especiacutefico para basidiomicetos) na identificaccedilatildeo de microrganismos A
amplificaccedilatildeo da regiatildeo ITS1-58S-ITS2 detectou a presenccedila de basidiomicetos em
diferentes amostras Testes complementares foram realizados no produto da
amplificaccedilatildeo por meio da teacutecnica de RFLP permitindo a identificaccedilatildeo de espeacutecie
Satoko et al (2000) e Promputtha et al (2005) utilizaram a regiatildeo ITS1 58S e
ITS2 do rDNA para identificar fungos endofiacuteticos que natildeo esporularam sendo relatados
como Phomopsis e Diaporthe (anamoacuterfico Phomopsis)
Farr Castlebury e Rossman (2002) caracterizaram por anaacutelise molecular com o
uso de sequumlecircncias ITS1 58S ITS2 e por caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de
Phomopsis sp isolados de Vaccinium corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse
estudo verificaram que a maioria dos isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma
vez que as sequumlecircncias agruparam-se com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
31
Mostert et al (2001) tambeacutem usaram anaacutelise filogeneacutetica das regiotildees 58S ITS1
e ITS2 e DNA mitocondrial para elucidar a taxonomia de espeacutecies de Phomopsis
obtidas de vinhedos Eles observaram que os fungos endofiacuteticos tratavam-se de
Diaporthe perjuncta e Phomopsis sp taacutexon 1 Jaacute os isolados patogecircnicos e com alta
virulecircncia pertenciam a espeacutecie Phomopsis viticola assim como os isolados descritos
em estudos anteriores como Phomopsis taacutexon 2 Eles tambeacutem puderam elucidar que
os isolados descritos na Austraacutelia como Phomopsis taacutexon 4 tratavam-se de Libertella
sp excluindo-o do complexo P viticola
Djaouida et al (2004) sequenciaram as regiotildees ITS1 58S e ITS2 e do gene
mitocondrial atp6 para avaliar a diversidade molecular de linhagens patogecircnicas contra
o girassol de Diaporthe helianthi (anamoacuterfico Phomopsis helianthi) isolados de
diferentes origens geograacuteficas
32
4 MATERIAL E MEacuteTODOS 41 Material Bioloacutegico 411 Fungos endofiacuteticos
Quarenta e oito isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp e um de Diaporthe sp
foram utilizados neste estudo (TABELA 1) Destes oito foram cedidos cordialmente pela
Dra Kaacutetia Rodriguez e foram isolados de Spondias mombin (Cajazeiro) Myracrodruon
urundeuva (Aroeira) e Aspidosperma tomentosum (Peroba-de-campos) e dois isolados
de Maytenus ilicifolia (Espinheira Santa) cedidos gentilmente pela Dra Socircnia Pileggi
Dezessete isolados foram obtidos de amostras de folhas de Schinus terebinthifolius
(Aroeira Vermelha) coletados em 2007 pelo MsC Jocinei Lima e fazem parte do banco
bioloacutegico do Laboratoacuterio de Geneacutetica de Microrganismos (LABGEM) da Universidade
Federal do Paranaacute Curitiba Paranaacute Vinte e um isolados de Phomopsis sp e um
isolado de Diaporthe sp foram obtidos como endoacutefitos de folhas e peciacuteolos de M
ilicifolia (espinheira santa) em quatro coletas de outubro de 2006 a julho de 2007 no
Centro Nacional de Pesquisa de Floresta (CNPF) da EMBRAPA (Empresa Brasileira de
Pesquisa Agropecuaacuteria) localizada no municiacutepio de Colombo Paranaacute Dois isolados de
Phomopsis patoacutegenos de soja foram utilizados como linhagens referecircncia (TABELA 1)
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUA)
Coacutedigo Hospedeiro Procedecircncia Isolados por SM9631 Spondias mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9713 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9638 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9714 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)MU0123 Myracrodruon urundeuva Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)AT9810 Aspidosperma Jardim Botacircnico do Dra Kaacutetia Rodriguez do
33
tomentosum Rio de JaneiroRJ IOC (FIOCRUZRJ)AT9811 A tomentosum Jardim Botacircnico do
Rio de JaneiroRJ Dra Kaacutetia Rodriguez do IOC (FIOCRUZRJ)
AT9906 A tomentosum Jardim Botacircnico do Rio de JaneiroRJ
Dra Kaacutetia Rodriguez do IOC (FIOCRUZRJ)
ES80J Maytenus ilicifolia ColomboPR Dra Socircnia A V Pileggi no LABGEMPR
ESPAC22 Maytenus ilicifolia ColomboPR Dra Socircnia A V Pileggi no LABGEMPR
A135 Schinus terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A113 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A115B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A323 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A123 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A131 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A216B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A126 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A333B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A134 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A132 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A333A S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A124 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A215A S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A116 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A334 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A321 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
ES2WF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2WC1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2KF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2NA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUACcedilAtildeO)
34
ES2AB1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESBA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESDF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFH1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFB2 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESGA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESGF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESIE1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESIA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJH1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJG1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJE1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJE2 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESKD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESRD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESSD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
PHO1 (Phomopsis longicolla)
Glycine max (L) Merr Mato Grosso Dr Aacutelvaro Almeida EMBRAPALondrina-PR
PHO19 Glycine max (L) Merr Roraima Dr Aacutelvaro Almeida EMBRAPALondrina-PR
FONTE O autor
NOTA patoacutegenos de soja
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUACcedilAtildeO)
35
412 Microrganismos usados para teste de antagonismo
Para determinar a atividade antimicrobiana dos isolados foram utilizadas as
seguintes linhagens teste G citricarpa linhagens PC1396 e PC3305 pertencentes ao
banco bioloacutegico do Laboratoacuterio de Geneacutetica de Microrganismos da Universidade
Federal do Paranaacute
413 Fungos endofiacuteticos utilizados para anaacutelise de variabilidade geneacutetica
Como grupo externo para anaacutelise de variabilidade geneacutetica por RAPD foram
utilizadas cinco linhagens de Pestalotiopsis sp (TABELA 2)
TABELA 2 ISOLADOS GRUPO EXTERNO PARA ANAacuteLISE DE VARIABILIDADE GENEacuteTICA POR RAPD
Coacutedigo Hospedeiro Procedecircncia Pestalotiopsis phothiniae Gustavia cf eliacuteptica Amazonia Pestalotiopsis neglecta voucher Muraya paniculata Amazonia Pestalotiopsis vismeae Maytenus ilicifolia Paranaacute Pestalotiopsis sp 3 Maytenus ilicifolia Paranaacute Pestalotiopsis sp 11 Maytenus ilicifolia Paranaacute FONTE O autor NOTA Isolado cedidos pelo Profordm Dr Joseacute Odair Pereira da Universidade Federal do Amazonas Isolados por Josiane Gomes Figueiredo no LABGEMPR 42 Meios de Cultura 421 Caldo MEB (Extrato de Malte)
Extrato de Malte 20g
Glicose 20g
Peptona 1g
Aacutegua destilada p1000mL
36
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
422 Meio AV (Aveia-Aacutegar) Aveia 300 g
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
A aveia foi fervida durante 30 minutos com metade do volume da aacutegua A
suspensatildeo foi filtrada com gaze Adicionou-se aacutegua para completar o volume O pH foi
ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a necessidade
Acrescentou-se o aacutegar
423 Meio BDA (Meio Batata-Dextrose-Aacutegar)
Batata 2000g
Dextrose 100g
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
As batatas foram cozidas em 500 mL de aacutegua destilada durante 20 minutos Em
seguida foram filtradas com gaze adicionou-se a dextrose ao caldo e completou-se
com aacutegua destilada para 1000 mL O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N
eou HCl 1N conforme a necessidade Acrescentou-se o aacutegar
37
424 Meio MC (Meio Completo) PONTECORVO et al 1953
NaNO3 60g
KH2PO4 15g
KCl 05g
MgSO47H2O 05g
FeSO4 002g
ZnSO4 002g
Glicose 100g
Peptona 20g
Extrato de levedura 20g
Caseiacutena hidrolisada 15g
Soluccedilatildeo de vitaminas 10mL
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
425 Meio MEA (Extrato de Malte) PATERSON e BRIDGE 1994
Extrato de Malte 20g
Glicose 20g
Peptona 1g
Agar 15g
Aacutegua destilada p1000mL
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
38
OBS Todos os meios de cultura foram autoclavados durante 20 minutos a 1 atm e
armazenados em temperatura ambiente
43 Soluccedilotildees e Reagentes 431 Clorofane ndash FenolClorofoacutermio (11)
432 Clorofil ndash ClorofoacutermioAacutelcool Isoamiacutelico (241)
433 Derozal Bayerreg - 1mg de carbendazim em 1mL de aacutegua destilada
434 Dodecil Sulfato de Soacutedio (SDS) 10 (pv) em aacutegua destilada
435 Fenol Saturado
Um volume de fenol cristalizado foi dissolvido em banho-maria a 60degC e
acrescentado um volume de tampatildeo Tris-HCl 02 M pH 80 Apoacutes agitaccedilatildeo por 30
minutos a fase aquosa foi retirada e entatildeo acrescentado um volume de tampatildeo Tris-
HCl 02 M pH 80 Este processo foi repetido ateacute atingir o pH desejado (pH 80) Em
seguida foi adicionado um volume final de 110 do tampatildeo Tris-HCl 02 M pH 80 e
estocado em frasco escuro a uma temperatura de 4degC usado apoacutes 48 horas
(SAMBROOK E MANIATS 1989)
436 Gel de Agarose 08 (pv) em Tampatildeo TBE 1x
437 Gel de Agarose15 (pv) em em Tampatildeo TBE 1x
438 Lactofenol azul Aacutecido laacutetico 200 g
Cristais de fenol 200 g
Glicerina 200 g
39
Azul de algodatildeo (Metyl Blue Difco) 005 g
Aacutegua destilada 200 mL
Os cristais de fenol foram derretidos em banho-maria Adicionaram-se os demais
componentes Depois de 24 horas filtrou-se e armazenou-se em frasco escuro
439 Marcador de peso molecular (DNA de fago lambda clivado com Hind III Gibco)
O marcador de peso molecular do DNA foi fornecido concentrado e no momento
do uso diluiu-se na proporccedilatildeo de 1 μL do marcador 1 μL do tampatildeo da amostra 4 μL
de aacutegua Milli-Q esterilizada Na corrida eletroforeacutetica foi utilizado 6 μL do marcador
4310 Marcador de peso molecular (DNA Ladder 100pb Ludwing Biotec)
O marcador de peso molecular foi fornecido concentrado e no momento do uso
diluiu-se na proporccedilatildeo de 1 μL do marcador 2 μL do tampatildeo da amostra 7 μL de aacutegua
Milli-Q autoclavada Na corrida eletroforeacutetica foram utilizados 15 μL do marcador
4311 Oligonucleotiacutedeos (Invitrogen)
Foi adicionado Tris-HCl 10 mM pH70 aos oligonucleotiacutedeos para obter uma
soluccedilatildeo estoque com 50 μM No momento do uso a soluccedilatildeo estoque foi diluiacuteda para
concentraccedilatildeo final de 4μM
4312 RNAse (invitrogen)
A soluccedilatildeo foi preparada na concentraccedilatildeo de 10 mM de Tris-HCl pH 75 e 15 mM
de NaCl Aqueceu-se a 100degC por 15 minutos e estocou-se a ndash 20degC
40
4313 Soluccedilatildeo de Vitaminas Aacutecido Nicotiacutenico 1000 mg
Aacutecido para Aminobenzoacuteico 100 mg
Biotina 02 mg
Piridoxina 500 mg
Riboflavina 1000 mg
Tiamina 500 mg
Aacutegua destilada esterilizada p 1000 mL
A soluccedilatildeo foi aquecida em banho-maria a 98degC por 15 minutos e armazenada em
frasco escuro previamente autoclavado a 4degC
4314 Soluccedilatildeo de NaCl 085 (pv) em aacutegua destilada
4315 Soluccedilatildeo Tween-80 01 (vv) em aacutegua destilada
4316 Soluccedilatildeo de Tetraciclina 5 (pv) em etanol absoluto Preparou-se a soluccedilatildeo sob
agitaccedilatildeo e estocou-se em frasco escuro a ndash 20degC
4317 Soluccedilatildeo de EDTA 05M em aacutegua destilada O pH foi ajustado para 80
adicionando-se NaOH 1N
4318 Soluccedilatildeo de brometo de etiacutedio 1 (pv) em aacutegua destilada O brometo de etiacutedio
foi dissolvido em aacutegua destilada agitou-se e estocou-se a temperatura ambiente
protegido de luz No momento do uso adicionou-se 3μL desta soluccedilatildeo a 100 mL de
tampatildeo TBE (1X)
41
4319 Tampatildeo TE (Tris-EDTA)
Tris-HCl pH 80 100 mM
EDTA pH 80 10 mM
4320 Tampatildeo de Extraccedilatildeo de DNA Tris-HCl pH 80 2000 mM
EDTA pH 80 250 mM
NaCl 2500 mM
SDS (pv) 1
O tampatildeo de Extraccedilatildeo foi preparado no momento do uso
4321 Tampatildeo da Amostra (6x)
Azul de bromofenol3 1000 mL
Glicerol 1035 mL
Aacutegua destilada p 50 mL
4322 Tampatildeo de corrida TBE 10x
Trizma base 54g
Aacutecido boacuterico 275g
EDTA 465g
Aacutegua Milli-Q p 500mL
A soluccedilatildeo foi autoclavada e estocada a temperatura ambiente No momento do
uso diluiu-se 10 vezes com aacutegua Milli-Q
42
44 Isolamento
A metodologia utilizada para o isolamento dos microrganismos endofiacuteticos foi
descrita por Petrini (1991) modificada por Glienke (1995) Os diferentes oacutergatildeos da
planta temperatura de incubaccedilatildeo nuacutemero de plantas e o de fragmentos plaqueados
estatildeo listados na tabela 3
Isolamento Eacutepoca do ano Oacutergatildeo da
planta Temperatura
de incubaccedilatildeo
Nuacutemero de Plantas
Nuacutemero de fragmentos plaqueados
1 Outubro de 2006 Folha 28deg C 20 360 2 Marccedilo de 2007 Folha 22-23deg C 30 540 3 Julho de 2007 Folha 22-23deg C 20 360 4 Julho de 2007 Peciacuteolo 22-23deg C 20 160
Total de fragmentos plaqueados 1360
FONTE O autor
Os fungos foram isolados de plantas aparentemente sadias com folhas sem
marcas arranhaduras ou ferimentos Apoacutes a coleta as folhas foram colocadas em
sacos plaacutesticos devidamente identificados em seguida as superfiacutecies das folhas foram
lavadas em aacutegua corrente com auxiacutelio de uma esponja para a remoccedilatildeo dos
microrganismos epifiacuteticos e outros contaminantes Os peciacuteolos foram vedados com
parafina derretida para evitar a entrada dos desinfetantes nos seus tecidos internos
desta forma preservando os endoacutefitos a serem isolados As folhas vedadas foram
mergulhadas em frascos com aacutegua destilada autoclavada sendo mantidos por 1
minuto em etanol 70 por 1 minuto em hipoclorito de soacutedio (NaOCl) a 3 por 6
minutos etanol 70 por 30 segundos e por uacuteltimo em aacutegua destilada autoclavada por
6 minutos Devido agrave dificuldade de isolar fungos do gecircnero Phomopsis nos isolamentos
1 e 2 foi reduzido o tempo de tratamento com hipoclorito de soacutedio para 4 minutos nos
isolamentos 3 e 4 (TABELA 3) As folhas foram cortadas em seis fragmentos de 5-7 mm
e os peciacuteolos foram cortados das folhas e oito deles foram transferidos para placas de
TABELA 3 EacutePOCAS DO ANO OacuteRGAtildeOS DA PLANTA CONDICcedilOtildeES DE INCUBACcedilAtildeO E NUacuteMERO DE FRAGMENTOS PLAQUEADOS NAS QUATRO COLETAS DE ENDOacuteFITOS DE ESPINHEIRA-SANTA
43
Petri (90 mm) contendo os meios de cultura BDA adicionados de Tetraciclina (10
mgmL) para impedir o crescimento bacteriano (ARAUJO et al 2002)
Como controle apoacutes o processo de desinfestaccedilatildeo foram inoculados 01 mL da
uacuteltima aacutegua autoclavada utilizada no tratamento em trecircs placas de Petri As placas
permaneceram incubadas nas mesmas condiccedilotildees do isolamento
45 Conservaccedilatildeo dos fungos
Os isolados foram estocados utilizando-se duas metodologias 1) em frascos
contendo meio de cultura BDA inclinado apoacutes sete dias de crescimento a 28degC foram
mantidos a 4degC realizando-se repiques mensalmente 2) em frascos contendo aacutegua
destilada esterilizada com 12 discos de 5 mm meio de cultura BDA contendo miceacutelios
Repetiu-se o procedimento a cada trecircs meses
46 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica
A caracterizaccedilatildeo macromorfoloacutegica dos isolados de Phomopsis foi realizada com
base na forma dos bordos crescimento micelial aspecto da colocircnia e a sua coloraccedilatildeo
no verso e reverso da placa em diferentes meios de cultura Discos de miceacutelio (8 mm)
provenientes de colocircnias de Phomopsis com sete dias de crescimento em meio de
cultura BDA foram inoculados no centro de placas de Petri com diferentes meios de
cultura Batata-dextrose-aacutegar (BDA) aveia-aacutegar (MAV) e extrato de malte-aacutegar (MEA)
Foram incubados durante 14 dias a 22ordmC sob luz contiacutenua Os ensaios foram
realizados em triplicata O diacircmetro das colocircnias foi medido a partir do terceiro dia de
crescimento ateacute o quinto dia quando alguns atingiram completamente as bordas da
placa de Petri
Para anaacutelise da micromorfologia foram avaliados os coniacutedios apoacutes 21 dias de
crescimento Os picniacutedios foram comprimidos entre a lacircmina e a lamiacutenula com uma
gota de lactofenol azul de algodatildeo possibilitando a observaccedilatildeo ao microscoacutepio oacuteptico
44
com aumento de 1000x O comprimento e largura dos coniacutedios foram medidos usando
uma reacutegua na objetiva com escala de 1μM
47 Obtenccedilatildeo de colocircnia monospoacuterica
Apoacutes os isolados terem sido identificados como pertencentes ao gecircnero
Phomopsis colocircnias monospoacutericas foram obtidas cultivando os isolados endofiacuteticos em
placas de Petri com meio BDA a 28degC Observou-se o crescimento da colocircnia e
monitorou-se com observaccedilatildeo em microscopia oacuteptica a produccedilatildeo de esporos Os
picniacutedios foram coletados e macerados em soluccedilatildeo de ldquoTween 80rdquo 01 A suspensatildeo
de esporos foi filtrada com seringas contendo latilde de vidro Em seguida adicionou-se 10
mL de soluccedilatildeo salina Centrifugou-se a soluccedilatildeo filtrada durante 4 minutos a 7000 rpm
Descartou-se o sobrenadante adicionou-se 400 μL de soluccedilatildeo salina para suspender o
precipitado onde ficaram contidos os esporos retirou-se 10 μL desta suspensatildeo sendo
a concentraccedilatildeo estimada em Cacircmara de Neubauer Quando necessaacuterio diluiu-se em
soluccedilatildeo salina para viabilizar a contagem dos esporos Foram semeados 100 μL de
suspensatildeo em uma placa de Petri contendo meio BDA espalhou-se com alccedila de
Drigalsky incubou-se a 28degC Colocircnias isoladas foram selecionadas e repicadas em
tubos com BDA inclinado que apoacutes crescimento por sete dias a 28ordmC foram mantidos a
4degC
48 Caracterizaccedilatildeo Molecular 481 Extraccedilatildeo do DNA (RAEDER e BRODA 1985 modificado por GLIENKE 1995)
O DNA genocircmico foi obtido de acordo com a metodologia descrita por Raeder e
Broda (1985) modificada por Glienke (1995) Os isolados endofiacuteticos de Phomopsis
foram cultivados em meio MEA durante cinco dias a 28degC O miceacutelio obtido a partir da
raspagem da colocircnia com espaacutetula esterilizada foi liofilizado e mantido em freezer ou na
45
sequumlecircncia macerados com adiccedilatildeo de nitrogecircnio liacutequido O material foi pesado e para
cada grama de miceacutelio acrescentou-se 1 mL de Tampatildeo de Extraccedilatildeo Incubou-se a
soluccedilatildeo homogeneizada durante 20 minutos em banho-maria a 70degC Acrescentou-se
um volume de fenol saturado misturaram-se as fases e centrifugou-se durante 15
minutos a 5000 rpm Coletou-se a fase aquosa colocou-se em um novo tubo e
adicionou-se a este um volume de Clorofane Centrifugou-se novamente sob as
mesmas condiccedilotildees anteriores Coletou-se a fase aquosa como na etapa anterior e
adicionou-se um volume de Clorofil repetindo-se o processo de centrifugaccedilatildeo sob as
mesmas condiccedilotildees Coletou-se a fase aquosa em um novo tubo e adicionou-se etanol
absoluto O material foi incubado a ndash 20ordmC durante uma hora Apoacutes este periacuteodo a
suspensatildeo foi centrifugada (10000 rpm por 20 min) desprezou-se o sobrenadante
Acrescentou-se 500 μL de etanol 70 centrifugou-se a 10000 rpm durante 5 minutos
descartou-se o aacutelcool 70 inverteu-se o tubo sobre uma folha de papel absorvente
para secar a borda do tubo e este secou a uma temperatura de 37degC durante 30
minutos Ressuspendeu-se o DNA com 200 μL de aacutegua milli-Q por uma hora
temperatura ambiente As amostras foram tratadas RNAse (30 μgmL) a 37degC por uma
hora
A concentraccedilatildeo de DNA foi estimada por meio de eletroforese em gel de agarose
08 utilizando como padratildeo de peso molecular o DNA do fago λ (Gibco) clivado com
HindIII com concentraccedilatildeo conhecida Apoacutes a eletroforese o gel foi corado com brometo
de etiacutedio observado sobre transiluminador de luz ultravioleta e fotodocumentado
482 RAPD
As soluccedilotildees foram realizadas de acordo com as condiccedilotildees descritas por Glienke-
Blanco et al (2002) onde foram utilizados 50ng de DNA tampatildeo PCR 1x 05U de Taq
polimerase 02mM de oligonucleotideos 02mM de dNTP 3mM de MgCl2 em um
volume final de 25microL Foi realizada uma preacutevia seleccedilatildeo usando-se os oligonucleotiacutedeos
46
da linha OPX11 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) OPX14 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) OPX19 (5rsquo
TCACCACGGT 3rsquo) e OPE 08 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) da Operon Technologiesreg
A amplificaccedilatildeo foi realizada com as condiccedilotildees descritas por Pioli et al (2003)
com modificaccedilotildees sendo cada reaccedilatildeo submetida a 40 ciclos apoacutes a desnaturaccedilatildeo
inicial a 940C por 4 minutos Cada ciclo consiste de 1 minuto a 940C 1 minuto e 30
segundos a 350C e 2 minutos a 720C
4821 Anaacutelise da Variabilidade Geneacutetica
Os produtos de amplificaccedilatildeo foram separados por eletroforese (3 Vcm) em gel
de agarose 15 e posteriormente corados por 20 minutos com soluccedilatildeo de brometo de
etiacutedio Os fragmentos amplificados foram visualizados em um transiluminador de luz
Ultravioleta e a imagem do gel documentada atraveacutes de sistema fotograacutefico Digi-doc it
O marcador de peso molecular utilizado foi o Ladder de 100 pb (Ludwing Biotec)
A anaacutelise da variabilidade geneacutetica foi realizada pelo agrupamento das linhagens
segundo os princiacutepios adotados em taxonomia numeacuterica utilizando o coeficiente de
similaridade de Jaccard que permite calcular similaridades com base em variaacuteveis
binaacuterias (0 para ausecircncia e 1 para presenccedila de banda) As bandas foram consideradas
como variaacuteveis enquanto as linhagens como unidades O coeficiente foi calculado
segundo a foacutermula J=MP onde M eacute o nuacutemero de concordacircncias positivas e P o
nuacutemero total de variaacuteveis menos concordacircncias negativas (SNEATH e SOKAL 1973)
Desta forma o coeficiente de similaridade Jaccard (J) leva em conta apenas as
discordacircncias e as concordacircncias positivas quanto agrave presenccedila ou ausecircncia de bandas
desconsiderando as concordacircncias negativas Quanto maior a semelhanccedila entre duas
linhagens maior eacute o valor de similaridade As unidades foram agrupadas atraveacutes do
meacutetodo UPGMA (Unweighted Pair-Group Method with Arithmetical Average) que eacute um
modelo de agrupamento hieraacuterquico e permite a construccedilatildeo de dendrogramas
(SNEATH e SOKAL 1973) Matrizes e dendrogramas foram elaborados usando o
software NTSYS (Numerical taxonomy system of multivariate programs) (ROHLF
1988)
47
Para verificar a consistecircncia dos agrupamentos verificados foi realizada uma
anaacutelise bootstrap segundo Felsenstein (1985) utilizando o software BOOD (COELHO
2005)
483 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
4831 Amplificaccedilatildeo
A reaccedilatildeo foi realizada com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D (TABELA 4) que
satildeo universais para fungos e permitem amplificar a regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do DNA
Ribossomal
Oligonucleotiacutedeos Sequumlecircncia
LS266 5 TTACGTCCCTGCCCTTTGTA 3
V9D 5GCATTCCCA AA C AACTCGAC 3rsquo
FONTE O autor
As condiccedilotildees da reaccedilatildeo foram realizadas de acordo com a descriccedilatildeo de White et
al (1990) com algumas modificaccedilotildees 50 ng de DNA tampatildeo PCR 1x 15U de Taq
DNA polimerase 08microM de oligonucleotiacutedeos 02mM de dNTP 3mM de MgCl2 para um
volume final de 50microL
A amplificaccedilatildeo foi realizada em um termociclador Eppendorf (Modelo
Mastercycler Gradiente) com desnaturaccedilatildeo inicial a 94degC por 2 minutos 30 ciclos de 30
segundos a 94degC 1 minuto a 56degC 1 minuto a 72degC seguida de extensatildeo final de 3
minutos a 72degC
TABELA 4 SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA AMPLIFICACcedilAtildeO DAREGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL
48
4832 Purificaccedilatildeo da PCR
Foram testadas duas metodologias de purificaccedilatildeo da reaccedilatildeo de PCR
48321 Purificaccedilatildeo com PEG
Aos produtos da amplificaccedilatildeo da PCR com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D
foram acrescentados 50microL de PEG os tubos foram incubados a 37ordmC por 30 minutos
em seguida foram centrifugados por 15 minutos a 14000rpm O sobrenadante foi
descartado com micropipeta Adicionou-se 125microL de Etanol 80 gelado apoacutes 1min os
tubos foram centrifugados por 2 min a 13000 rpm descartou-se o sobrenadante Foram
adicionados 125microL de Etanol 96 (gelado) descartou-se o sobrenadante O Etanol foi
evaporado em speed vac por 10min a 70ordmC O pellet foi ressuspendido em 15 microL de
aacutegua Milli-Q e misturado em seguida ficou agrave temperatura ambiente por pelo menos 2
horas
Para confirmaccedilatildeo da presenccedila do DNA na amostra 1microL foi submetido agrave
eletroforese em gel de agarose 15
48322 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio
Aos produtos da amplificaccedilatildeo da PCR com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D
foram acrescentados 34 microL de acetato de amocircnio (AcNH4) 75M e 100 microL de etanol
96 Os tubos ficaram em temperatura ambiente por 10 minutos e em seguida foram
centrifugados por 15 minutos a 14000rpm Os pellets resultantes foram lavados com
250 microL de etanol 70 (receacutem preparado) centrifugou-se por 15 minutos a 14000rpm e
descartou-se o etanol O pellet foi seco na estufa a 37ordmC por 30 mim e ressuspendidos
em 15microL de aacutegua Milli-Q
Para confirmaccedilatildeo da presenccedila do DNA na amostra 1microL foi submetido a
eletroforese em gel de agarose 15
49
4833 Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento
Foram realizadas trecircs reaccedilotildees de sequumlenciamento a primeira foi realizada
usando o produto tratado com PEG e nas duas posteriores usou-se o produto de PCR
tratado com acetato de amocircnia Para o restante da metodologia natildeo houve alteraccedilatildeo
O sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA foi realizado pelo
meacutetodo de terminaccedilatildeo de cadeia segundo Sanger et al (1977) utilizando a
incorporaccedilatildeo de dideoxinucleotiacutedeos fluorescentes em Sequumlenciador Automaacutetico de
DNA megaBACE
Para a reaccedilatildeo de sequumlenciamento foram utilizados cerca de 50ng da reaccedilatildeo de
PCR purificada 02 microM do oligonucleotiacutedeo ITS1 (TABELA 5) e 4microL de mistura para
sequumlecircnciamento ET (Kit ldquoDYEnamic ET Dye Terminator Cycle Sequencing Kit for
MegaBACErdquo da Amersham Biosciences) completando com aacutegua milli-Q para um
volume final de 10microL As mesmas condiccedilotildees foram aplicadas para o oligonucleotiacutedeo
ITS4 (TABELA 5)
FONTE O autor
A amplificaccedilatildeo foi realizada em um termociclador Eppendorf (Modelo
Mastercycler Gradient) seguindo uma desnaturaccedilatildeo inicial a 96degC por 1 minuto 30
ciclos de 10 segundos a 96degC 1 minuto e 5 segundos a 50degC 4 minutos a 60degC 20 min
a 8degC
Oligonucleotiacutedeos Sequumlecircncia
ITS1 5rsquoTCCGTAGGTGAACCTGCGG3rsquo
ITS4 5rsquoTCCTCCGCTTATTGATATGC3rsquo
TABELA 5 SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA AMPLIFICACcedilAtildeO DAREGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL
50
4834 Purificaccedilatildeo da Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento
Foram testadas trecircs metodologias de purificaccedilatildeo da reaccedilatildeo de sequumlenciamento
48341 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em tubos
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com PEG (item 38321) foram adicionados 40 microL de isopropanol 75
sendo precipitados por um spin down As amostras ficaram agrave temperatura ambiente por
20 minutos em seguida foram centrifugadas por 25 minutos a 13000 rpm e o
isopropanol foi removido por inversatildeo dos tubos Foram adicionados 200 microL de etanol
70 natildeo gelado e centrifugado por 5 minutos a 13000 rpm em seguida o etanol foi
removido com auxiacutelio de uma micropipeta e foi submetido a secagem em speed vac por
45 minutos a 60degC
Apoacutes esse tratamento cada amostra foi ressuspendida em 10 microL Loading
Solution e submetida agrave eletroforese em Sequumlenciador Automaacutetico de DNA modelo
megaBACE da Amersham Biosciences Com os seguintes paracircmetros voltagem de
injeccedilatildeo 2V tempo de injeccedilatildeo 80 segundos voltagem da corrida 8V por 160 minutos
48342 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em placa
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com acetato de amocircnio (item 38322) foram adicionados 40microL de
isopropanol 75 sendo precipitados por um spin down As amostras ficaram agrave
temperatura ambiente por 20 minutos e em seguida foram centrifugadas por 50
minutos a 4000 rpm O isopropanol foi removido por inversatildeo da placa Foram
adicionados 100microL de etanol 70 natildeo gelado e centrifugado por 30 minutos a 4000
rpm em seguida o etanol foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um spin a
300 rpm por 1 minuto Em seguida a placa ficou em estufa a 37degC durante 3 minutos
Apoacutes esse tratamento as amostras foram processadas como no item anterior
51
48343 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com acetato de amocircnio (item 38322) foram adicionados 1 microL de acetato
de amocircnio (AcNH4) 75M e 30 microL de etanol 96 Apoacutes a homogeneizaccedilatildeo por inversatildeo
30 vezes a placa foi centrifugada por 45 minutos a 2500 RCF a 4degC
O sobrenadante foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um spin a 500
RCF com a placa invertida sobre papel toalha O pellet foi lavado com 100 microL de etanol
70 (receacutem preparado natildeo gelado) Seguindo-se uma nova centrifugaccedilatildeo a 2500 RCF
por 45 minutos e o sobrenadante foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um
spin a 750 RCF com a placa invertida sobre papel toalha Em seguida a placa ficou em
estufa a 37degC durante 3 minutos
Apoacutes esse tratamento cada amostra foi ressuspendida e tratada como nos itens
anteriores
Todos os procedimentos desde a reaccedilatildeo de sequumlenciamento foram realizados
sob proteccedilatildeo de luz direta cobrindo a placa com papel alumiacutenio
4835 Ediccedilatildeo e Anaacutelise das Sequumlecircncias
As sequumlecircncias foram entatildeo alinhadas utilizando-se o programa CLUSTAL-W
versatildeo 17 (THOMPSON HIGGINS e GIBSON 1994) sendo realizada posterior
inspeccedilatildeo visual atraveacutes do programa BioEdit 7053 (HALL 1999) Apoacutes a ediccedilatildeo
alinhamento e anaacutelise preacutevia das sequumlecircncias estas foram submetidas ao software
MEGA 31 (KUMAR TAMURA NEI 2004) para obtenccedilatildeo das aacutervores filogeneacuteticas
baseadas em distacircncia A consistecircncia dos noacutes obtidos foi avaliada pelo procedimento
de bootstrap (FELSENSTEIN 1985) com 10000 reamostragens Foram utilizadas como
referecircncias linhagens de Phomopsis sp Diaporthe e Pestalotiopsis vismae (como
grupo externo) depositadas no GenBank (httpwwwncbinlmnihgov) (TABELA 6)
52
TABELA 6 LINHAGENS DE Phomopsis spp E DE Pestalotiopsis vismae UTILIZADAS COMO GRUPO EXTERNO
Espeacutecie Nuacutemero de acesso (GenBank)
Diaporthe Melonis AB105147 D melonis AB105148 Phomopsis longicolla AY857868 P longicolla AF000207 P camptothecae AY622996 D Phaselorum AF001024 D helianthi AJ312348 D helianthi AJ312363 D helianthi AF358441 Phomopsis sp P7 DQ235673 Phomopsis sp P3 DQ235669 P sojae AY050627 P chimonanthi AY622993 Phomopsis sp P4 DQ235670 D conorum AB201443 D conorum DQ116551 P theicola DQ286286 P theicola DQ286287 Phomopsis sp 1 AY485724 Phomopsis sp CBS DQ286285 Phomopsis sp Taxon 3 AF230762 Diaporthe AJ312359 Diaporthe AY745024 Pestalotiopsis vismae EF451801
FONTE O autor
49 Avaliaccedilatildeo da Atividade Antimicrobiana
491 Cultura Pareada
Para avaliar a atividade antimicrobiana dos 49 isolados de Phomopsis sp
endofiacuteticos (TABELA 1) contra o fitopatoacutegeno Guignardia citricarpa foi utilizado a
metodologia de Cultura Pareada (MARIANO1993) Os discos contendo miceacutelio eou
coniacutedios dos isolados endofiacuteticos ou dos fitopatoacutegenos ensaiados foram obtidos de
53
colocircnias crescidas em BDA durante sete dias a 28degC incubadas em estufa BOD e com
fotoperiacuteodo de 12 horas Apoacutes este periacuteodo foram retirados os discos da borda das
colocircnias com auxiacutelio de vazador de rolhas
Em placas de Petri contendo meio de cultura BDA colocou-se um disco (Oslash 8
mm) da cultura do fitopatoacutegeno G citricarpa Apoacutes trecircs dias de crescimento foi
adicionado no lado oposto um disco com o isolado de Phomopsis sp endofiacutetico a ser
avaliado ambos a 10 cm da borda Apoacutes o pareamento as placas foram vedadas com
filme de PVC e mantidas durante 14 dias em estufa BOD com fotoperiacuteodo de 12 h a
28degC Foi realizado um delineamento inteiramente casualizado com cinco repeticcedilotildees O
controle recebeu apenas o fitopatoacutegeno A avaliaccedilatildeo foi realizada mediante mediccedilatildeo do
diacircmetro da colocircnia comparando com o controle e observaccedilatildeo das interaccedilotildees entre as
colocircnias
Para determinar a porcentagem de inibiccedilatildeo do crescimento mediu-se o diacircmetro
das colocircnias do fitopatoacutegeno com 14 dias de crescimento subtraindo-se o diacircmetro do
inoacuteculo original Os caacutelculos foram realizados de acordo com Edginton et al (1971)
pela foacutermula
Onde Dc eacute o diacircmetro meacutedio da colocircnia do fitopatoacutegeno no controle e Dt eacute o
diacircmetro meacutedio da colocircnia do patoacutegeno nos tratamentos testados
492 Avaliaccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
Cobriu-se assepticamente toda a superfiacutecie do meio PDA inclusive nas bordas
com discos de papel celofane (Oslash11 cm) esterilizado A seguir foi inoculado no centro
sobre a superfiacutecie do papel celofane discos de aacutegar (Oslash8 mm) contendo miceacutelio do
isolado endofiacutetico As placas foram incubadas por quatro dias a temperatura de 28degC
as placas controles receberam apenas o fitopatoacutegeno incubados por 7 dias com
Dc -Dt
Dc
Porcentagem de inibiccedilatildeo (PI) = X 100
54
fotoperiacuteodo de 12 horas Mediu-se o diacircmetro da colocircnia e retirou-se o papel celofane
(juntamente com a colocircnia do isolado) Sobre a superfiacutecie de meio PDA inoculou-se um
disco de miceacutelio do fitopatoacutegeno a ser avaliado no centro da placa Foi realizado um
delineamento inteiramente casualizado com cinco repeticcedilotildees As placas foram
incubadas a 28degC com fotoperiacuteodo de 12 horas Apoacutes 7 e 14 dias mediu-se o
crescimento das colocircnias e comparou-se com o controle (ETHUR CEMBRANEL e
SILVA 2001 Adaptado por Figueiredo 2006)
493 Atividade dos Extratos Metanoacutelicos 4931 Obtenccedilatildeo dos extratos
Para avaliaccedilatildeo da atividade dos extratos metanoacutelicos foi utilizada a metodologia
descrita por Rodrigues Hesse e Werner (2000) com algumas modificaccedilotildees No
processo de fermentaccedilatildeo trecircs discos (Oslash 8 mm) dos 49 isolados endofiacuteticos de
Phomopsis (TABELA 1) foram inoculados em Erlenmeyer (250 mL) contendo 100 mL
de caldo extrato de malte Incubou-se durante 7 dias (110 rpm 28degC fotoperiacuteodo de 12
horas)
Apoacutes a fermentaccedilatildeo o miceacutelio foi separado do liacutequido fermentado por filtraccedilatildeo
em papel Whatman ndeg 4 Ao volume do filtrado obtido adicionou-se o mesmo volume
de acetato de etila (EtOAc) (Merck) em um balatildeo de separaccedilatildeo Agitou-se
vigorosamente por trecircs vezes e aguardou-se a formaccedilatildeo de duas camadas uma
aquosa na parte inferior e outra orgacircnica na parte superior Transferiu-se a fase
orgacircnica para um novo recipiente e submeteu-se a fase aquosa a mais uma extraccedilatildeo
com EtOAc Repetiu-se o procedimento por mais duas vezes Adicionou-se agrave fase
orgacircnica 5 de sulfato de soacutedio anidro e filtrou-se novamente com papel Whatman ndeg
4 Obteve-se extrato bruto seco passando a fase orgacircnica em rotaevaporador O extrato
foi pesado e diluiacutedo em metanol (10mgmL)
55
4932 Crescimento micelial
Foram obtidos discos (Oslash 12 mm) de colocircnias com 14 dias de crescimento em
meio completo da cultura do fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396 ou PC3305 Estes
foram inoculados no centro de placas de Petri contendo meio de cultura BDA A 10 cm
da borda em posiccedilatildeo oposta foi colocado um disco de papel filtro esterilizado (Oslash 5 mm)
e sobre este foram inoculados 100μL do extrato metanoacutelico a ser avaliado As placas
foram fechadas com filme de PVC e mantidas a 28degC fotoperiacuteodo de 12 horas em
BOD Avaliou-se o potencial de inibiccedilatildeo medindo-se o diacircmetro das colocircnias apoacutes sete
dias de crescimento comparando-se com o controle negativo onde foi inoculado aacutegua
destilada autoclavada ou metanol Como controle positivo foi utilizado fungicida Derosal reg (10 mgmL) (QUIROGA SAMPIETRO e VATTUONE 2001 adaptado por
FIGUEIREDO 2006)
410 Anaacutelise Estatiacutestica
Todos os experimentos foram realizados com delineamento inteiramente
casualizado (DIC) com 5 repeticcedilotildees As anaacutelises de variacircncia foram realizadas em
todas as etapas do trabalho Sempre que foi encontrado um valor significativo em
relaccedilatildeo ao teste F completou-se a anaacutelise com teste de Tukey para comparaccedilatildeo das
meacutedias utilizando software ASSISTAT (SILVA 1996 e SILVA 2002) ou o teste de Scott
Knott utilizando software SISVAR (FERREIRA 1994)
56
5 Resultados e Discussatildeo
51 Isolamento
Foram isolados 1005 endoacutefitos de folhas e peciacuteolos de 30 plantas de Espinheira
Santa (M ilicifolia) Destes 21 foram identificados a partir de anaacutelise em microscopia
oacuteptica como pertencentes ao gecircnero Phomopsis A tabela 7 compara os resultados
obtidos quanto agrave proporccedilatildeo de isolamento de Phomopsis sobre os diferentes tecidos da
planta nos quatro isolamentos realizados A frequumlecircncia dos isolamentos foi calculada
de acordo com Souza et al (2004)
TABELA 7 PORCENTAGEM DE ISOLAMENTO DE Phomopsis ENDOFIacuteTICOS DE PLANTAS DE ESPINHEIRA SANTA
Isolamento Oacutergatildeo da planta
Nuacutemero de fragmentos plaqueados
Endoacutefitos Nuacutemero ()
Phomopsis Nuacutemero ()
Frequumlecircncia isolamento Phomopsis
1 Folha 360 140 (39) 0 (0) 0
2 Folha 540 310 (57) 2 (064) 037
3 Folha 360 375 (gt100) 3 (08) 083
TOTAL FOLHA
1260 825 (65) 5 (061) 04
4 Peciacuteolo 160 180 (gt100) 16 (89) 100
TOTAL 1420 1005 (71) 21 (209) 15 FONTE O Autor
Observando a tabela 7 percebe-se claramente que a partir de peciacuteolo a
frequumlecircncia de isolamento de Phomopsis (10) foi maior do que em folhas (04) tanto
em relaccedilatildeo ao nuacutemero de fragmentos plaqueados quanto em comparaccedilatildeo ao nuacutemero
total de endoacutefitos isolados (89 contra 061) Provavelmente devido agrave menor
frequumlecircncia de fungos filamentosos de crescimento raacutepido que pudessem sobrepor ao
crescimento de Phomopsis Segundo Souza et al (2004) as folhas dos vegetais
57
hospedeiros satildeo provavelmente as portas de entrada para os microrganismos pois
apresentam tecidos mais fraacutegeis e expostos pela presenccedila de estocircmatos ocorrendo
posterior migraccedilatildeo para outros tecidos da planta O mesmo jaacute foi relatado em espeacutecies
de Citrus para o isolamento de fungos do gecircnero Guignardia sendo o peciacuteolo o tecido
de mais faacutecil isolamento deste gecircnero por apresentar menor colonizaccedilatildeo por
Colletotrichum (BLANCO 1999)
Assim sugere-se que em trabalhos futuros de isolamento de Phomopsis sejam
tambeacutem utilizados os peciacuteolos especialmente em Espinheira Santa
Foram tambeacutem obtidos 18 isolados de Phomopsis de trecircs plantas de S
terebinthifolius (Aroeira Vermelha) representando uma frequumlecircncia de 11 Em Aroeira
a frequumlecircncia do isolamento de Phomopsis em folha foi maior do que em Espinheira
Santa em todos os isolamentos realizados
Fungos do gecircnero Phomopsis Phyllosticta e Colletotrichum satildeo comumente
isolados como endoacutefitos de tecidos de diferentes espeacutecies de plantas em muitos casos
esses fungos estatildeo juntos num mesmo hospedeiro (PANDEY et al 2003 LU et al
2004)
O gecircnero Phomopsis tem sido descrito com grande frequumlecircncia em isolamentos
de diversas plantas (UECKER 1988 BODDY e GRIFFITH 1989) Azevedo et al (2000)
apresentaram algumas plantas hospedeiras de onde jaacute foram isoladas espeacutecies de
Phomopsis entre elas Sabal bermudana Trachycarpus fortunei Cavendishia
pubescens Stylosanthes guianensis Anacardium occidentale e Mangifera indica
Corrado e Rodrigues (2004) isolaram endofiacuteticos de Phomopsis das plantas medicinais
Spondias mombin e Aspidosperma tomentosun
Bussabam et al (2001) isolaram entre outros fungos o gecircnero Phomopsis
endoacutefitos de folhas pseudocaules e rizomas de gengibre (Amomum siamense Criab)
coletadas em dois locais na Tailacircndia Silva et al (2006) isolou Phomopsis como
endoacutefito de graviola (Annona muricata L) e pinha (Annona squamosa L)
Alguns dos relatos citam o gecircnero Phomopsis como fitopatoacutegeno isolado de
diversas espeacutecies de Citrus Mangifera indica (Mangueira) Glycine max (Soja) Ficus
carica (Figueira) e Anacardium occidentale (Cajueiro) entre muitas outras plantas
58
(CENARGEN EMBRAPA 2005) Natildeo haacute relatos de gecircnero Phomopsis como
fitopatoacutegeno das plantas medicinais utilizadas no presente trabalho Aspidosperma
tomentosum Spondias mombin e Maytenus ilicifolia assim como em Aroeira Vermelha
(Schinus terebinthifolius) Entretanto o gecircnero foi relatado por Anjos Charchar e
Guimaratildees (2001) como patoacutegeno em culturas de Aroeira (Myracrodruon urundeuva)
causando sintomas de queimas nas folhas que consiste de uma necrose escura
predominantemente nos bordos dos foliacuteolos
52 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de Phomopsis
A caracterizaccedilatildeo macromorfoloacutegica das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de
Phomopsis sp foi realizada de acordo com a forma dos bordos crescimento micelial
aspecto da colocircnia e a sua coloraccedilatildeo no verso e reverso da placa em diferentes meios
de cultura (FIGURAS 1 a 4 ANEXO 12)
A coloraccedilatildeo das colocircnias dos isolados de Phomopsis apresentaram elevada
variabilidade tanto no verso quanto reverso da placa nos trecircs meios de cultura
ensaiados Em geral variou entre combinaccedilotildees das cores branca preto verde claro e
oliva amarelo marrom marrom avermelhado cinza e bege
Os isolados de Phomopsis apresentaram no verso da placa com meio Aveia (AV)
coloraccedilatildeo branca alguns isolados apresentaram combinaccedilotildees de branco com marrom
verde amarelo e cinza exceto os isolados ESJG1 ES2KF1 ES2WF1 ESPAC22
ES80J ESFB2 ESGF1 A134 A333B que diferiram dos demais por apresentarem
coloraccedilatildeo intensa e o isolado A116 de coloraccedilatildeo marrom e verde (FIGURAS 1 a 4)
Nos meios de cultura MEA e BDA observou-se que a coloraccedilatildeo no verso da
placa foi mais variaacutevel do que no meio Aveia Igualmente o reverso das placas
contendo as colocircnias de Phomopsis mostrou-se bastante variaacutevel entre os isolados e
os trecircs meios de cultura utilizados havendo variaccedilatildeo intra-individual com coloraccedilotildees
branca preto verde claro e oliva amarelo marrom marrom avermelhado cinza e
bege
59
A morfologia micelial nos meios de cultura ensaiados variou de granuloso aeacutereo
a algodonoso Nos meios de cultura MEA e BDA todos os isolados apresentaram
miceacutelio denso poreacutem no meio AV esses dois tipos de miceacutelio variaram de denso a ralo
A maioria dos isolados de Phomopsis analisados possuem miceacutelio granuloso aeacutereo em
todos os meios ensaiados exceto os isolados SM9638 SM9631 e Phomopsis longicolla
PHO1 que apresentam miceacutelio algodonoso Observou-se variaccedilatildeo intra-individual na
morfologia micelial entre os meios de cultura nos isolados A333B e A323 que
apresentaram miceacutelio algodoso no meio AV e granuloso aeacutereo nos meios MEA e BDA
Igualmente os isolados A123 e SM9811 apresentaram-se algodonoso no meio MEA e
granuloso aeacutereo nos meios AV e BDA
O aspecto dos bordos das colocircnias mostrou variaccedilatildeo intra-individual entre os
diferentes meios de cultura para a maioria dos isolados exceto os isolados de
Phomopsis SM9638 ESKD1 ESPAC22 A323 A113 A331 A115 que apresentaram
bordos regulares e os isolados SM9714 ES2WC1 ESJG1 A126 A333A PHO1
(Phomopsis longicolla) e o isolado PHO19 que possuem bordos irregulares em todos os
meios utilizados
FIGURA 1 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis DE Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT 9811 e AT 9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
AV MEA BDA
M
U 0
123
S
M97
13
60
FIGURA 1 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE
Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT9811 e AT9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
SM
9631
SM
9638
AT
9811
A
T990
6
AT9
810
SM
9714
AV MEA BDA
61
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
A32
1
A
132
A21
5A
A
113
A
323
A13
1
AV MEA BDA
62
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
A
135
A11
6
A
115B
A
124
A12
6
A21
6 B
AV MEA BDA
63
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
A
134
A33
3A
A
334
A12
3
A33
3B
AV MEA BDA
64
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
E
S2N
A1
E
SIE1
ES
GA
1
ES8
0J
E
SPA
C22
ES2
WF1
AV MEA BDA
65
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
ESFB
2
ESJ
D1
ESK
D1
E
SJH
1
ESD
F1
E
S2A
B1
AV MEA BDA
66
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
E
S2K
F1
ESJ
E2
ESJ
E1
ESG
F1
ESF
H1
ESF
F1
AV MEA BDA
67
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis E Diaporthe (BA1) ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
ESB
A1
ESI
A1
ES
RD
1
E
S2W
C1
ESS
D1
ES
JG1
AV MEA BDA
68
Na avaliaccedilatildeo do diacircmetro das colocircnias houve diferenccedila significativa entre os
isolados de Phomopsis dentro dos diversos meios de cultura avaliados Entre os meios
de cultura MEA BDA e AV houve diferenccedila significativa de crescimento em geral o
crescimento micelial foi menor no meio AV (ANEXO 1) Portanto os grupos de
Phomopsis formados quando considerada agrave taxa de crescimento foram inferidos para
os meios de cultura separadamente
Na figura 5 observa-se o resultado do diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados
apoacutes 5 dias de crescimento em meio MEA Os isolados foram reunidos em oito grupos
diferentes A A323 SM9631 ESKD1 A134 e ESIE1 B A116 A334 A215A ESSD1
C A321 MU0123 ESGF1 ESRD1 AT9811 SM9713 A123 ESJH1 ESDF1 A131
ESIA1 ESBA1 ESJD1 D A333A A135 ES2NA1 A124 A132 SM9714 ESFB2 E A115B ES2AB1 A216B A113 F PHO1 SM9638 ES2WF1 A126 ESJE1 ESPAC22
ESFF1 ES2KF1 ESJG1 ES80J G ESJE2 ESFH1 AT9906 ESGA1 AT9810
ES2WC1 Os isolados do grupo A apresentaram os maiores valores de crescimento
radial em torno de 70 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) e o grupo H apresentou menor
crescimento micelial em torno de 20 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) (ANEXO 4)
FIGURA 4 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS PATOGEcircNICOS OBTIDOS DE Glycine max EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
PH
O19
P
lon
gico
lla (P
HO
1) AV MEA BDA
69
O diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados apoacutes 5 dias de crescimento em meio
BDA estaacute representado na figura 6 Os isolados foram reunidos em seis grupos
diferentes A ESBA1 A323 A215A ESSD1 SM9713 ESGF1 SM9631 ESJD1
ESKD1 A334 B ESDF1 A132 A123 A333A MU0123 ESJH1 A321 ESRD1 A116
A134 A115B C ESIA1 A131 SM9714 A135 ESIE1 ESFB2 A124 ESPAC22
ES2KF1 A113 ESJE1 D ESJE2 ESFH1 ESJG1 ES2WC1 PHO1 SM9638
ES2NA1 ES2AB1 ESFF1 AT9811 AT9810 ES2WF1 A126 PHO19 A216B ES80J
ESGA1 E AT9906 F A333B Em geral a taxa de crescimento foi maior em meio BDA Os isolados do grupo A
apresentaram as maiores taxas de crescimento em torno de 70 cm (apoacutes 5 dias de
FONTE O autor
000
100
200
300
400
500
600
700
800
EB A F HD G C
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 4) A A323 SM9631 ESKD1 A134 e ESIE1 B A116 A334 A215A ESSD1 C A321 MU0123 ESGF1 ESRD1 AT9811 SM9713 A123 ESJH1 ESDF1 A131 ESIA1 ESBA1 ESJD1 D A333A A135 ES2NA1 A124 A132 SM9714 ESFB2 E A115B ES2AB1 A216B A113 F PHO1 SM9638 ES2WF1 A126 ESJE1 ESPAC22 ESFF1 ES2KF1 ESJG1 ES80J G ESJE2 ESFH1 AT9906 ESGA1 AT9810 ES2WC1
FIGURA 5 DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO MEA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
Diacirc
met
ro e
m c
m
70
crescimento) e o grupo F representado pelo isolado A333B apresentou menor
crescimento micelial (ANEXO 2)
Estudos sobre fisiologia envolvendo o gecircnero Phomopsis satildeo escassos Almeida
(1982) estudando Phomopsis sojae isolados de sementes de soja em seis diferentes
meios de cultura e nos regimes de luminosidade claro contiacutenuo e escuro contiacutenuo
verificou maior crescimento do fungo nos meios de haste de soja extrato de malte
aveia cenoura e BDA natildeo houve efeito da luz sobre o crescimento micelial de nenhum
dos isolados
Gurgel Menezes e Coelho (1997) verificaram maior crescimento micelial de P
anacardii e P mangiferae no meio BDA e uma melhor esporulaccedilatildeo nos meios BDA e V8
(Campbell CO) apoacutes 15 e 30 dias de incubaccedilatildeo No presente trabalho foi verificado
maior crescimento dos isolados de Phomopsis em meio BDA seguido do meio MEA em
meio AV a taxa de crescimento foi inferior
FONTE O autor
000
100
200
300
400
500
600
700
B A FEC D
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 2) A ESBA1 A323 A215A ESSD1 SM9713 ESGF1 SM9631 ESJD1 ESKD1 A334 B ESDF1 A132 A123 A333A MU0123 ESJH1 A321 ESRD1 A116 A134 A115B C ESIA1 A131 SM9714 A135 ESIE1 ESFB2 A124 ESPAC22 ES2KF1 A113 ESJE1 D ESJE2 ESFH1 ESJG1 ES2WC1 PHO1 SM9638 ES2NA1 ES2AB1 ESFF1 AT9811 AT9810 ES2WF1 A126 PHO19 A216B ES80J ESGA1 E AT9906 F A333B
FIGURA 6 DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
Diacirc
met
ro e
m c
m
71
O diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados apoacutes 5 dias de crescimento em meio
AV estaacute representado na figura 7 Os isolados foram reunidos em sete grupos
diferentes A ESKD1 B ESJE2 A123 C ESJE1 SM9638 AT9811 SM9713 PHO1
ESBA1 SM9631 ESFB2 A334 A323 MU0123 D A333A ESJD1 ESGF1 A116 E ESPAC22 ESDF1 A321 A132 ES2KF1 ESJG1 ESRD1 PHO19 A115B A124
ESFF1 A134 ESIE1 A135 A131 A113 ES2WF1 ESSD1 ESIA1 F ESGA1 ESJH1
ESFH1 AT9906 ES2NA1 A216B ES80J A215A G AT9810 A333B ES2AB1
SM9714 ES2WC1 A126 Apenas o isolado ESKD1 representante do grupo A
apresentou taxa de crescimento raacutepida de 70 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) a
maioria dos isolados tiveram crescimento lento (ANEXO 3)
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 3) A ESKD1 B ESJE2 A123 C ESJE1 SM9638 AT9811 SM9713 PHO1 ESBA1 SM9631 ESFB2 A334 A323 0123 D A333A ESJD1 ESGF1 A116 E ESPAC22 ESDF1 A321 A132 ES2KF1 ESJG1 ESRD1 PHO19 A115B A124 ESFF1 A134 ESIE1 A135 A131 A113 ES2WF1 ESSD1 ESIA1 F ESGA1 ESJH1 ESFH1 AT9906 ES2NA1 A216B ES80J A215A G AT9810 A333B ES2AB1 SM9714 ES2WC1 A126
FIGURA 7 AVALIACcedilAtildeO DAS MEacuteDIAS DO DIAcircMETRO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO AV APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
000
100
200
300
400
500
600
700
B A F C GD E
FONTE O autor
Diacirc
met
ro e
m c
m
72
Foi observado que dos 49 endoacutefitos e os 2 isolados patogecircnicos de Phomopsis
spp avaliados (TABELA 1) 27 apresentaram variaccedilatildeo intra-individual quanto ao
crescimento nos diversos meios Por exemplo os isolados A323 e SM9631 em meio
MEA e BDA pertencem ao grupo A e no meio AV ao grupo C Os outros 24 isolados
natildeo apresentaram variaccedilatildeo entre os agrupamentos formados nos diferentes meios
Os isolados que se agrupam baseados no crescimento nos trecircs meios natildeo satildeo
os mesmos quando se considera a cor do verso e reverso da placa assim como natildeo
satildeo semelhantes aos agrupamentos formados quando comparados com os bordos e
aspecto da colocircnia
Gurgel Menezes e Coelho (2002) estudando Phomopsis anacardii e Phomopsis
mangiferae observaram maior produccedilatildeo de picniacutedios nos meios de extrato de malte
aveia haste de soja e cenoura somente quando mantidos sob luz contiacutenua A
produccedilatildeo de picniacutedios foi reduzida em alternacircncia de luz e quase nula no escuro
contiacutenuo No presente trabalho foi observado que a maioria dos isolados formaram
estruturas de reproduccedilatildeo com o uso de luz contiacutenua em baixas temperaturas 22 a 25 degC
e pH 58 nos trecircs meios avaliados apoacutes 14 dias de crescimento
Segundo Cochrane (1959) e Griffin (1994) a luminosidade promove formaccedilatildeo
das estruturas reprodutivas assim como estatildeo diretamente ligadas agrave composiccedilatildeo do
meio de cultura atraveacutes de diferentes reaccedilotildees enzimaacuteticas Leonian (1924) descreve
que o efeito da luz como indutor da reproduccedilatildeo de fungos estaacute associado agraves
modificaccedilotildees que ocorrem no seu metabolismo celular combinados aos elementos que
constituem o meio de cultura
Timnick Lilly e Barnett (1951) detectaram efeito positivo da luz para a formaccedilatildeo
de picniacutedios ao verificarem que o regime escuro contiacutenuo inibia a formaccedilatildeo de picniacutedios
de Diaporthe phaseolorum Resultados semelhantes foram observados por Correcirca
(1995) avaliando Phomopsis sp provenientes de sementes florestais observou uma
melhor esporulaccedilatildeo em meio aveia sob regime de claro contiacutenuo por 12 dias de
incubaccedilatildeo
Na anaacutelise da micromorfologia observou-se que os isolados apresentavam
estruturas de reproduccedilatildeo a partir de 14 dias ateacute 21 dias de crescimento (FIGURA 8)
73
exceto os isolados SM9811 SM9638 e Phomopsis longicolla PHO1 que natildeo formaram
estruturas de reproduccedilatildeo em nenhum dos meios ensaiados Os isolados SM9811 e
SM9638 foram descritos como pertencentes ao gecircnero Phomopsis e depositados na
Coleccedilatildeo de Cultura de Fungos do Departamento de Micologia (IOC) da FIOCRUZ e
foram descritos por Rodrigues e Samules (1999) O isolado PHO1 foi isolado e
identificado pela EMBRAPA (Londrina-PR) como pertencente agrave espeacutecie P longicolla
Os coniacutedios do tipo alfa foram menos frequumlentes do que os do tipo beta Em
meio de cultura BDA apenas 11 isolados apresentaram o tipo de esporo alfa jaacute os beta
coniacutedios filiformes curvos na extremidade ou ligeiramente curvos foram visualizados
em quase todos os isolados de Phomopsis spp
Foi observado que para os isolados que apresentaram os dois tipos de esporos
foram visualizados com 14 dias de crescimento apenas alfa coniacutedios hialinos com
vacuacuteolos nas extremidades de forma ovoacuteide e natildeo foram visualizados beta coniacutedios
Apoacutes 21 dias os dois tipos de esporos foram visualizados nesses isolados (FIGURA 8a
e 8c) Alguns alfa coniacutedios apresentavam mais de dois vacuacuteolos nas extremidades
(FIGURA 8b) Essa variaccedilatildeo intra-individual tambeacutem foi observada em relaccedilatildeo agrave
morfologia do beta coniacutedio em que alguns apresentam curvatura na extremidade
outros ligeiramente curvos (FIGURA 8c)
NOTA A - isolado SM9631 aumento de 400x B- isolado SM9714 aumento de 1000x C- isolado SM9713 aumento de 400x microscopia oacuteptica Setas pretas indicam os alfa coniacutedios e setas vermelhas os beta coniacutedios Escala em 1μM
FONTE O autor
FIGURA 8 FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis EM BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
A B C
74
Alfa coniacutedios do isolado SM9713 provenientes dos meios de cultura AV (FIGURA
9a) e BDA (FIGURA 9e) apresentaram grande variaccedilatildeo morfoloacutegica Na figura 9 no
mesmo conidioacuteforo eacute visiacutevel a diferenccedila morfoloacutegica do alfa coniacutedio Na figura 9e o
conidioacuteforo apresenta alfa coniacutedios com mais de duas gotas nas extremidades (SETA 1)
e alfa coniacutedios com apenas dois vacuacuteolos (SETA 2) Em maior aumento eacute possiacutevel
perceber que existem variaccedilotildees de dois trecircs e ateacute quatro vacuacuteolos no mesmo isolado
(FIGURA 9a 9b e 9c) Tal variaccedilatildeo pode ser decorrente de diferenciados graus de
maturaccedilatildeo destes coniacutedios o que dificulta a caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de espeacutecies do
gecircnero Phomopsis
A medida do comprimento dos beta coniacutedios em meio BDA mostrou que os
isolados apresentam diferenccedilas estatiacutesticas significativas reunindo os isolados em 15
FIGURA 9 FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DO ISOLADO SM9713 EM MEIOS BDA e AV APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
1 2 A
B C D
E
NOTA A - em meio AV aumento de 400x B C e D- em meio BDA aumento de 650x E- em meio BDA aumento de 400x Microscopia oacutetica
FONTE O autor
75
grupos diferentes (ANEXO 5) A (AT9906 AT8010) B (ESFH1) C (ESPAC22 ES2KF1
SM9631) D (ESGA1 PHO19) E (ES80J) F (ESRD1) G (ESJE2 ESFB2 ESJE1) H
(ESJG1) I (A323) J (A333A A135 A124 A126 A132 A131 A134 A115B ESIE1) K
(ES2WC1 ES2WF1) L (SM9713 A334 ESIA1 A333B ESFF1 ESGF1) M (ES2AB1
A123 A113 ESJD1) N (ESKD1 ES2NA1 A215A SM9714) O (ESSD1 ESJH1
MU0123 A321 ESDF1 A216B A116) (FIGURA 10) Os isolados tambeacutem natildeo se
agrupam de acordo com os outros criteacuterios avaliados como a cor do verso e reverso
da placa diacircmetro das colocircnias assim como natildeo satildeo semelhantes aos agrupamentos
formados quando comparados com os bordos e aspecto do miceacutelio
NOTA As letras maiuacutesculas indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo agrave meacutedia do comprimento de beta coniacutedio dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Isolados de cada agrupamento A (AT9906 AT8010) B (ESFH1) C (ESPAC22 ES2KF1 SM9631) D (ESGA1 PHO19) E (ES80J) F (ESRD1) G (ESJE2 ESFB2 ESJE1) H (ESJG1) I (A323) J (A333A A135 A124 A126 A132 A131 A134 A115B ESIE1) K (ES2WC1 ES2WF1) L (SM9713 A334 ESIA1 A333B ESFF1 ESGF1) M (ES2AB1 A123 A113 ESJD1) N (ESKD1 ES2NA1 A215A SM9714) O (ESSD1 ESJH1 MU0123 A321 ESDF1 A216B A116) As meacutedias seguidas pela mesma letra minuacutescula natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 5)
FIGURA 10 COMPRIMENTO DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO EM BDA A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
0
5
10
15
20
25
30
35
40
B C E F MID LJA N H K OG
a
b
c
cd
de
ef
efg
fgh
fghi
ghij
ghil
hil
him
im
m
FONTE O autor
Diacirc
met
ro e
m μ
M
76
Desta forma as caracteriacutesticas macroscoacutepicas (coloraccedilatildeo bordos e tipos de
miceacutelio da colocircnia) e de micromorfologia dos coniacutedios avaliadas isoladamente natildeo
permitiram propor identificaccedilatildeo das espeacutecies dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis
Sendo assim optou-se por realizar uma anaacutelise polifaacutesica agrupando as caracteriacutesticas
morfoloacutegicas analisadas tais como crescimento micelial coloraccedilatildeo e bordos da
colocircnia tipo de miceacutelio comprimento dos coniacutedios e tipos de coniacutedios produzidos em
deferentes meios Essa metodologia foi descrita por Figueiredo et al (2006) para
caracterizar isolados de Pestalotiopsis Para todas estas caracteriacutesticas foram
atribuiacutedas notas de 0 ou 1 onde 0 representou ausecircncia da caracteriacutestica e 1 a
presenccedila (ANEXO 12) Os resultados compuseram uma matriz binaacuteria analisada pelo
software NTSYS (coeficiente Jaccard) com o agrupamento pelo meacutetodo UPGMA
permitindo a construccedilatildeo de um dendrograma de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
De acordo com o dendrograma de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
sugere-se a formaccedilatildeo de seis grupos com elevados valores de bootstrap que conferem
robustez aos agrupamentos No grupo I estatildeo reunidos os isolados MU0123 e
SM9713 no grupo II os isolados AT9810 e AT9906 no grupo III os isolados ESJE1 e
ESJE2 no grupo IV os isolados ESFB2 e ESFF1 no grupo V os isolados ES2KF1 e
ESJG1 e no grupo VI os isolados ES2WF1 e ES80J Os demais agrupamentos
formados natildeo foram considerados pois apresentam baixos valores de bootstrap e ou
baixos valores de similaridade morfoloacutegica
Os dados mostram elevada variabilidade morfoloacutegica dos isolados de Phomopsis
avaliados o que dificulta a delimitaccedilatildeo de espeacutecies apenas com dados morfoloacutegicos
Segundo Parmeter (1958) e Rehner e Uecker (1994) o alto grau de plasticidade das
caracteriacutesticas morfoloacutegicas impossibilita a delimitaccedilatildeo de espeacutecies no gecircnero
Phomopsis Gamboa-Gaitaacuten Laureano e Bayman (2005) estudando isolados de
Phomopsis endofiacuteticos de Guarea guidonia (Meliaceae) de duas regiotildees de Luquillo
(Porto Rico) relataram elevados niacuteveis de variabilidade morfoloacutegica entre os isolados
avaliados Eles observaram uma mistura de diferentes morfotipos em ambas as regiotildees
estudadas
77
Neste trabalho foi observado um elevado niacutevel de variabilidade morfoloacutegica dos
isolados de Phomopsis spp obtidos de seis diferentes espeacutecies de plantas e regiotildees
geograacuteficas Natildeo foi possiacutevel observar estruturaccedilatildeo populacional dos isolados em
funccedilatildeo da espeacutecie hospedeira Na figura 12 os isolados de M ilicifolia encontram-se na
coloraccedilatildeo rosa e distribuiacutedos ao longo dos dois eixos que representam os dois
principais componentes de variaccedilatildeo Igualmente os isolados em preto representam as
linhagens provindas de S terebinthifolius e tambeacutem encontram-se dispersos Tais
resultados natildeo surpreendem pois eacute possiacutevel que a mesma espeacutecie de Phomopsis seja
isolada em diferentes hospedeiros
NOTA I II III IV V VI satildeo grupos formados para inferir sobre a diversidade dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis Os valores a esquerda dos noacutes indicam os valores de bootstrap
COEFICIEcircNTE DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA
FIGURA 11 DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp
FONTE O autor
r = 07577 (P= 00001)
V VI
IV
I II III
78
FONTE O autor FIGURA 12 ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp NOTA Isolados em coloraccedilatildeo rosa obtidos de Maytenus ilicifolia Em preto Schinus terebinthifolius Em azul escuro Myracrodruon urundeuva Em azul claro Aspidosperma tomentosun Em verde Spondias mombin 53 Caracterizaccedilatildeo Molecular de Phomopsis spp 531 RAPD
Os isolados de Phomopsis spp foram avaliados por meio de marcadores
moleculares do tipo RAPD a fim de verificar a magnitude da variabilidade geneacutetica
Foram analisados por esta metodologia 54 isolados Destes 47 Phomopsis spp
endoacutefitos os isolados MU0123 e SM9638 natildeo amplificaram em nenhuma das
condiccedilotildees ensaiadas dois isolados de Phomopsis patoacutegenos de soja e cinco isolados
de Pestalotiopsis Foram utilizados 4 oligonucleotiacutedeos gerando 99 bandas O tamanho
dos fragmentos amplificados variou de 400 a 2600 pb e podem ser visualizados nas
Figuras 13 a 16
79
FIG
UR
A 1
4 P
ER
FIL
DE
AM
PLI
FIC
ACcedil
AtildeO
CO
M O
OLI
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81
A anaacutelise destes marcadores RAPD permitiu a construccedilatildeo de um dendrograma
de similaridade geneacutetica (FIGURA 17) O coeficiente de correlaccedilatildeo das matrizes de
similaridade geneacutetica e cofeneacutetica obtido pelo teste de Mantel foi elevado (r=08157 e
p=00001) indicando que o dendrograma representa de forma adequada a matriz de
similaridade geneacutetica obtida pelos marcadores de RAPD Entretanto os valores de
bootstrap da maioria dos agrupamentos formados foram baixos Desta forma somente
foram considerados na anaacutelise os agrupamentos com bom suporte de bootstrap e
coeficientes de similaridade superiores a 50
Os dados indicam elevada variabilidade geneacutetica dos isolados de Phomopsis
spp avaliados (FIGURAS 17 e 18) com a formaccedilatildeo de sete grupos Os isolados de
Pestalotiopsis utilizados como grupo externo formaram um grupo (boostrap = 100)
isolado (FIGURA 17) sendo relevante para inferir a magnitude da variabilidade geneacutetica
observada entre os isolados de Phomopsis spp
O primeiro agrupamento reuacutene trecircs endoacutefitos de Espinheira Santa ESBA1
ES2AB1 e ESSD1 (49 de similaridade e bootstrap = 64) Esses isolados foram
obtidos do mesmo isolamento e pomar (CNPFEMPRAPA ColomboPR) poreacutem de
tecidos e plantas diferentes Os isolados ESBA1 e ESSD1 foram obtidos de peciacuteolo
enquanto ES2AB1 foi isolado de folha Eacute importante observar que o isolado ESBA1
apresentou estrutura de reproduccedilatildeo sexual sendo classificado como Diaporthe sp e
no entanto apresenta alto valor de similaridade geneacutetica com os isolados de Phomopsis
sp sugerindo assim que pertenccedilam ao mesmo complexo Phomopsis Diaporthe
Esses isolados natildeo se agrupam quanto aos caracteres morfoloacutegicos (FIGURAS 11 e
12)
O segundo agrupamento com 893 de similaridade geneacutetica e com bootstrap
de 100 compreende P longicolla (PHO1) uma linhagem patogecircnica de soja isolada
em Primavera do Leste ndash MT e o isolado SM9713 endoacutefito de Spondias mombin
coletado em Redenccedilatildeo ndash PA Aleacutem de coletados em lugares e hospedeiros totalmente
diferentes esses isolados apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas divergentes pois
natildeo pertencem ao mesmo agrupamento em nenhuma das caracteriacutesticas morfoloacutegicas
analisadas Entretanto a alta similaridade geneacutetica destes isolados sugere que
82
pertenccedilam agrave mesma espeacutecie o que reforccedila as observaccedilotildees anteriores de que a
definiccedilatildeo de espeacutecie do gecircnero Phomopsis natildeo eacute possiacutevel utilizando-se apenas
caracteriacutesticas morfoloacutegicas
FIGURA 17 DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS DE Phomopsis spp POR MEIO DE MARCADORES MOLECULARES RAPD
COEFICIENTE DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA
FONTE O autor
I II
III IV V VI VII
GRUPO EXTERNO
r= 08157 (p=00001)
100
83
O terceiro agrupamento com 75 de similaridade geneacutetica (FIGURA 17)
compreende dois isolados endofiacuteticos de Aspidosperma tomentosun AT9810 e AT9906
Esses isolados apresentaram caracteriacutesticas morfoloacutegicas muito semelhantes
formando o agrupamento II com 81 de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
O quarto agrupamento com 72 de similaridade geneacutetica compreende os
isolados ESFH1 e ESFF1 provenientes do peciacuteolo de Espinheira Santa da mesma
coleta poreacutem novamente eles natildeo se agrupam quanto aos caracteres morfoloacutegicos
observados (FIGURAS 11 e12)
O quinto agrupamento com 85 de similaridade geneacutetica reuacutene os isolados
ESKD1 e ESJH2 e ESJH1 provenientes de peciacuteolo da Espinheira Santa coletados na
mesma data Os isolados ESJH1 e ESJH2 foram obtidos do mesmo peciacuteolo e
apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas mais semelhantes entre si do que quando
comparados ao isolado ESKD1 (FIGURA 11) Entretanto a figura 17 revela que por
meio de marcadores RAPD os isolados ESKD1 e ESJH2 satildeo mais proacuteximos (92 de
similaridade geneacutetica) Sugere-se assim que os 3 isolados pertenccedilam agrave mesma
espeacutecie
O sexto agrupamento com 52 de similaridade (FIGURA 17) compreende os
isolados A321 obtido de Aroeira e ESIA1 obtido de Espinheira Santa Aleacutem de
coletados em lugares e hospedeiros totalmente diferentes esses isolados apresentam
caracteriacutesticas morfoloacutegicas diferentes (FIGURAS 11 e 12) Apesar do valor de
bootstrap atribuir confiabilidade a este agrupamento (77) o valor de similaridade
observado (52) natildeo eacute alto Assim natildeo eacute possiacutevel inferir que pertenccedilam agrave mesma
espeacutecie
O mesmo ocorre com o seacutetimo agrupamento que com 55 de similaridade
compreende os isolados A333A obtido de Aroeira e ESRD1 obtido de Espinheira Santa
Aleacutem de coletados em lugares e hospedeiros totalmente diferentes esses isolados
apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas diferentes natildeo pertencendo ao mesmo
agrupamento quanto aos caracteres morfoloacutegicos (FIGURAS 11 e 12)
Esses resultados mostram que caracteriacutesticas morfoloacutegicas natildeo satildeo suficientes
para inferir espeacutecies neste gecircnero analisadas individualmente ou em anaacutelise polifaacutesica
84
Aleacutem disso natildeo haacute estruturaccedilatildeo populacional quanto ao hospedeiro Esses dados
reforccedilam a necessidade de revisatildeo na classificaccedilatildeo de espeacutecies do gecircnero Phomopsis
Atualmente a anaacutelise polifaacutesica vem sendo realizada em estudos de diversidade
bacteriana utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas bioquiacutemicas fisioloacutegicas e
moleculares (KIM et al 2006 a b NEDASHKOVSKAYA et al 2006) e
esporadicamente na identificaccedilatildeo de leveduras (SAMPAIO et al 1999 VILLA-
CARVAJAL et al 2004) Em fungos filamentosos a anaacutelise polifaacutesica de caracteriacutesticas
morfoloacutegicas foi utilizada com sucesso na taxonomia de Penicillium (FRISVAD e
SAMSON 2004) Aspergillus (FRISVAD et al 2004) e Pestalotiopsis (FIGUEIREDO
2006)
FIGURA 18 ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp
FONTE O autor
85
532 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
Visando elucidar a taxonomia dos isolados de Phomopsis spp utilizados neste
trabalho foi realizado com sucesso o sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 - 58S - ITS2 do
rDNA de 29 isolados Apoacutes o alinhamento e ediccedilatildeo destas sequumlecircncias foi realizada
uma busca no banco de dados de sequumlecircncias (httpwwwncbinlmnihgov) a fim de
identificar sequumlecircncias similares Os isolados estatildeo representados na aacutervore filogeneacutetica
(FIGURA 19)
Os isolados agruparam-se em 16 clados sugerindo que as plantas medicinais
estudadas satildeo colonizadas por pelo menos dezesseis diferentes espeacutecies de
Phomopsis (FIGURA 19) Entretanto a maioria dos isolados natildeo apresentaram
sequumlecircncias ITS com identidade superior a 90 com nenhuma sequumlecircncia depositada no
GenBank e portanto foram identificados como Phomopsis sp S1 a Phomopsis sp
S12
O primeiro clado (suportado com bootstrap de 98) estaacute representado na figura
20 e reuacutene os isolados A113 A131 A133 ESIA1 e A321 que apresentaram identidade
com P chimonanthi e com uma linhagem de Phomopsis sp endofiacutetica de Coffea
robusta (DQ123615) Esta linhagem foi isolada e sequumlenciada por Sette et al (2006) e
apresentou 99 de similaridade com as mesmas espeacutecies P chimonanthi P
michaeliae e Diaporthe helianthi (FIGURAS 19 e 20) A espeacutecie P chimonanthi foi
recentemente proposta por Chang e colaboradores (dados natildeo publicados) para
isolados antes denominados de P michaeliae Como esta espeacutecie foi descrita em 1987
e aceita ateacute o momento no presente trabalho sugere-se que os isolados A113 A131
A133 ESIA1 e A321 sejam classificados como P michaeliae
O isolado ESIA1 foi obtido de Espinheira Santa (Maytenus ilicifolia) enquanto os
demais isolados deste clado foram obtidos de Aroeira Vermelha (Schinus
terebinthifolius) Esses isolados apresentaram baixa similaridade geneacutetica quando
avaliados por RAPD e similaridade parcial quanto agraves caracteriacutesticas morfoloacutegicas uma
vez que fazem parte do mesmo agrupamento no diacircmetro da colocircnia em meio BDA
(Grupo C) e MEA (Grupo E)
86
FONTE O autor FIGURA 19 AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MEacuteTODO DE PARCIMOcircNIA)
ESIA1
A321
A113
A131
AY6229931| Phomopsis
P michaellae
Phomopsis sp S5 A116
ESRD1
ESJE2
ESKD1
Phomopsis sp S1
Phomopsis sp S9 A124
A334
A323Phomopsis sp S8
Phomopsis sp S2 A123
AJ3123481| Diaporthe helianthi
DQ2862851| Phomopsis sp CBS
AY8578681| Phomopsis longicolla
AF000207| Phomopsis longicolla
AF0010242| Diaporthe phaseolorum
DQ2356701| Phomopsis sp P4
Phomopsis sp S10 ESGA1
DQ2356731| Phomopsis sp P7
PHO19
AY0506271| Phomopsis sojae
DQ2356691| Phomopsis sp P3
P sojae
AF3584411 Diaporthe helianthi
AJ3123631| Diaporthe helianthi
SM9713
P longicolla PHO1
MU0123
P longicolla
A126
ESJH1Phomopsis sp S11
Phomopsis sp S12 ESJD1
Phomopsis sp S7 ESDF1
AB1051481| Diaporthe melonis
ES2AB1
ESBA1Phomopsis sp S6
AB1051471| Diaporthe melonis
AY6229961| Phomopsis camptothecae
AJ3123591| Diaporthe
AY7450241| Diaporthe
ES2KF1
ES2WF1
ESPAC22
Phomopsis sp S4
Phomopsis sp S3 ESGF1
AB2014431| Diaporthe conorum
DQ1165511| Diaporthe conorum CBS
SM9638
ESFH1
DQ2862861| Phomopsis theicola
AF230762 Phomopsis sp taxon 3
AY4857241| Phomopsis sp 1
DQ2862871| P theicola CBS
P theicola
Pestalotiopsis vismae
99
99
3599
98
91
7786
78
75
73
2973
5
5
3
2
11
71
70
25
22
33
40
67
63
33
44
65
41
34
29
27
21
21
18
13
12
8
7
5
3
3
0
0
0
19
32
23
31
87
Os isolados ESRD1 ESKD1 e ESJE2 apresentaram homologia quanto as
sequumlecircncias de ITS com suporte de bootstrap de 95 (FIGURA 19) Entretanto a figura
17 revela que por meio de marcadores RAPD os isolados ESKD1 e ESJE2 satildeo mais
proacuteximos apresentando 92 de similaridade geneacutetica (com bootstrap de 65) e 85
de similaridade desses isolados com o ESJE1 Assim sugere-se que estes 3 isolados
pertenccedilam agrave mesma espeacutecie Entretanto as sequumlecircncias ITS natildeo apresentaram
identidade superior a 90 com nenhuma sequumlecircncia depositada no GenBank Assim
esses isolados foram denominados de Phomopsis sp S1
FONTE O autor FIGURA 20 AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA PARCIAL BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MODELO NEIGHBOR-JOINING COM CORRECcedilAtildeO KIMURA DOIS PARAcircMETROS)
O isolado PHO19 (patogecircnico de soja) foi classificado como Phomopsis sojae
formou um clado com um endoacutefito natildeo identificado (P3) e com um isolado da espeacutecie P
sojae (FIGURA 19) O isolado Phomopsis sp P3 foi obtido como endoacutefito de Tectona
grandis por Murali Surynarayanan e Geeta (2006)
A113
DQ1236151| Phomopsis sp CBMAI
ESIA1
AY6229931| Phomopsis chimonanthi
A131
A133
P michae liae
A124
A334
ESGA1
DQ1165521| Diaporthe conorum cbs 199-3990
98
62252719
0005
88
Os isolados MU0123 SM9713 e P longicolla (PHO1) apresentaram alta
homologia das sequumlecircncias (clado suportado com 99 de bootstrap) (FIGURA 19) Os
isolados SM9713 e P longicolla (PHO1) apresentaram 893 de similaridade geneacutetica
(com suporte de bootstrap de 100) utilizando-se marcadores RAPD (FIGURA 17) Na
anaacutelise morfoloacutegica os isolados MU0123 e SM9713 apresentaram mais de 70 de
similaridade poreacutem o isolado P longicolla (PHO1) apresentou caracteriacutesticas
morfoloacutegicas diferentes dos isolados MU0123 e SM9713 (FIGURA 11) O isolado PHO1
foi isolado como patoacutegeno de soja (Glycine max (L) Merr) no Mato Grosso enquanto os
isolados MU0123 e SM9713 foram obtidos como endofiacuteticos de Aroeira (Myracrodruon
urundeuva) e Cajaacute (Spondias mombin) respectivamente ambos no estado do Paraacute Em
funccedilatildeo das similaridades geneacuteticas observadas e por ser o isolado PHO1 utilizado
como referecircncia de P longicolla os isolados endofiacuteticos MU0123 e SM9713 foram
identificados como pertencentes a esta espeacutecie A alta similaridade geneacutetica destes
isolados sugere que pertenccedilam agrave mesma espeacutecie o que reforccedila as observaccedilotildees
anteriores de que a definiccedilatildeo de espeacutecie do gecircnero Phomopsis natildeo eacute possiacutevel
utilizando-se apenas caracteriacutesticas morfoloacutegicas O fato de isolados endofiacuteticos de S
mombin e M urundeuva serem identificados como P longicolla demonstra que
espeacutecies patogecircnicas para um hospedeiro podem colonizar de forma assintomaacutetica
diferentes espeacutecies vegetais Isso jaacute foi observado para outros gecircneros como
Guignardia e Phyllosticta (BAAYEN et al 2002 GLIENKE-BLANCO et al 2002)
Os endoacutefitos ESBA1 e ES2AB1 foram reunidos no mesmo clado sendo
denominados de Phomopsis sp S6 (FIGURA 19) esses isolados fazem parte do
mesmo agrupamento utilizando-se marcadores RAPD (FIGURA 17)
Os isolados A323 e A334 apresentaram grande identidade geneacutetica (suportado
com bootstrap de 70) e seu agrupamento estaacute representado na figura 19 Esses
isolados natildeo apresentaram identidade moderada a nenhuma das sequumlecircncias
depositadas no GenBank e portanto natildeo foi possiacutevel inferir sobre a espeacutecie desses
endoacutefitos Sugere-se que esses isolados de Aroeira pertenccedilam agrave mesma espeacutecie e
portanto foram denominados de Phomopsis sp S8 Os isolados ES2KF1 ES2WF1 e
89
ESPAC22 endoacutefitos de Espinheira Santa foram reunidos num mesmo clado sendo
denominados de Phomopsis sp S4 (FIGURA 19)
Os isolados A126 e ESJH1 foram reunidos no mesmo clado sendo denominados
de Phomopsis sp S11 eles foram isolados de diferentes plantas hospedeiras O
isolado ESJH1 foi obtido de Espinheira Santa (Maytenus ilicifolia) enquanto o isolado
A126 foi obtido de Aroeira Vermelha (Schinus terebinthifolius) Estes resultados
reforccedilam a dificuldade em inferir espeacutecies do gecircnero Phomopsis com base na planta
hospedeira
Os isolados A116 A124 A123 ESGA1 ESJD1 ESDF1 e ESGF1 natildeo
apresentaram identidade com nenhuma sequumlecircncia depositada no GenBank nem
similaridade com outros isolados analisados no presente trabalho Sugere-se que esses
endoacutefitos pertenccedilam a diferentes espeacutecies
No uacuteltimo clado o isolado ESFH1 apresentou homologia com a regiatildeo ITS1-
rDNA 58S - ITS2 da espeacutecie P theicola (DQ286286 e DQ286287) e com o isolado
SM9638 (FIGURA 19) Estes dois isolados foram obtidos de diferentes plantas
hospedeiras O isolado ESFH1 foi obtido em 2006 de M ilicifolia no Paranaacute enquanto o
isolado SM9638 foi obtido em 1996 como endofiacutetico da planta Spondias mombin no
Estado do Paraacute Esses isolados apresentam baixa similaridade morfoloacutegica (FIGURAS
11 e 12) Estes resultados reforccedilam a dificuldade em inferir espeacutecies do gecircnero
Phomopsis especialmente utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas
No presente trabalho observou-se que vaacuterias espeacutecies de Phomopsis foram
isoladas de um mesmo hospedeiro assim como uma mesma espeacutecie foi encontrada
colonizando diferentes hospedeiros Isto jaacute foi relatado no gecircnero Phomopsis por
Brayford (1990) Farr Castlebury e Rossman (2002) e por Rehner e Uecker (1994)
Esses resultados reforccedilam a necessidade de revisatildeo do conceito de espeacutecie para o
gecircnero Phomopsis uma vez que muitas espeacutecies tecircm sido identificadas com base na
planta hospedeira (GAMBOA-GAITAacuteN LAUREANO e BAYMAN 2005 MURALI
SURYANARAYANAN GEETA 2006)
Os dados morfoloacutegicos e de RAPD foram altamente variaacuteveis e a anaacutelise das
sequumlecircncias da regiatildeo ITS1- 58S - ITS2 do rDNA foi informativa para alguns dos
90
isolados analisados Entretanto mais estudos satildeo necessaacuterios para a identificaccedilatildeo
precisa dessas espeacutecies A literatura eacute escassa quanto a trabalhos de taxonomia
morfologia biologia e ecologia de isolados endofiacuteticos do gecircnero Phomopsis Segundo
Phillips (2006) a identificaccedilatildeo das espeacutecies do gecircnero Phomopsis eacute difiacutecil porque as
espeacutecies natildeo estatildeo claramente definidas e existe uma sobreposiccedilatildeo entre os caracteres
morfoloacutegicos que as definem
A maioria das sequumlecircncias depositadas no GenBank satildeo de isolados
provenientes de lesotildees sendo portanto de espeacutecies patogecircnicas No presente trabalho
eacute possiacutevel que os isolados pertencentes a clados que natildeo se agruparam com nenhuma
sequumlecircncia jaacute depositada pertenccedilam a novas espeacutecies ou ainda a espeacutecies de
endoacutefitos ainda natildeo sequumlenciados Murali Surynarayanan e Geeta (2006)
caracterizaram por meio de sequumlenciamento da regiatildeo ITS e dados morfoloacutegicos 11
isolados endofiacuteticos de Phomopsis obtidos de Tectona grandis e Cassia fistula Eles
sugerem que apesar da grande variabilidade encontrada os isolados devem ser
reunidos em apenas dois grupos entretanto natildeo foi possiacutevel a identificaccedilatildeo em niacutevel
de espeacutecie Segundo os autores isto natildeo foi possiacutevel em funccedilatildeo dos fungos deste
gecircnero natildeo terem hospedeiros especiacuteficos e pela necessidade de revisatildeo do conceito
de espeacutecie em Phomopsis
Farr Castlebury e Rossman (2002) caracterizaram por anaacutelise de sequumlecircncias
ITS1 58S ITS2 e por caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de Phomopsis sp
isolados de Vaccinium corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse estudo
verificaram que a maioria dos isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma vez que
as sequumlecircncias agruparam-se com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
Castlebury e Mengistu (2006) avaliaram Phomopsis isolados de soja e outros
hospedeiros combinando dados de sequumlecircncias de ITS do rDNA do gene do fator1 alfa
de elongaccedilatildeo da traduccedilatildeo (ef-1) e genes de actina Foram formados seis grupos de
Phomopsis sendo que trecircs correspondem aos taacutexons P longicolla Diaporthe melonis e
D phaseolorum Os autores concluiacuteram que a ausecircncia de distinccedilatildeo morfoloacutegica e
informaccedilatildeo bioloacutegica tornam problemaacutetica a identificaccedilatildeo de espeacutecies deste gecircnero
91
No presente trabalho com base nos dados de RAPD (FIGURAS 17 e 18) pode-
se sugerir a existecircncia de pelo menos 10 espeacutecies de Phomopsis colonizando de forma
endofiacutetica as plantas de Maytenus ilicifolia analisadas Tais plantas satildeo provenientes de
um uacutenico pomar localizado no CNPFEMPRAPA em ColomboPR Ainda eacute possiacutevel
sugerir a existecircncia de pelo menos seis espeacutecies de Phomopsis colonizando de forma
endofiacutetica a planta de S terebinthifolius analisada neste trabalho Esta planta natildeo
recebeu qualquer tratamento com fungicidas ou outro agrotoacutexico uma vez que se
encontra isolada entre dois blocos do Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas da UFPR (ANEXO
13) Talvez isso justifique a grande diversidade de isolados encontrada Esses dados
demonstram a importacircncia de estudos da comunidade endofiacutetica em plantas medicinais
e apontam para o problema da reduccedilatildeo de diversidade de microrganismos endofiacuteticos
pelo uso continuado de fungicidas
Resultados semelhantes foram obtidos por Gamboa-Gaitaacuten Laureano e Bayman
(2005) estudando isolados de Phomopsis endofiacuteticos da planta medicinal Guarea
guidonia (Meliaceae) Os autores relataram elevados niacuteveis de variabilidade geneacutetica
avaliada pela digestatildeo da regiatildeo ITS e tambeacutem a alta variabilidade morfoloacutegica entre
os isolados avaliados A aacutervore molecular agrupou indiviacuteduos fenotipicamente
diferentes Por outro lado Fernandez e Hanlin (1996) obtiveram resultados
concordantes entre a anaacutelise molecular por RAPD e as caracteriacutesticas morfoculturais
separando os isolados coletados de soja em dois grupos Diaporthe phaseolorum e
Phomopsis longicolla
Pioli et al (2003) caracterizaram por RAPD isolados do complexo
DiaporthePhomopsis coletados de soja na Argentina Eles foram separados em quatro
grupos (i) Diaporthe phaseolorum variedade meridionalis (ii) D phaseolorum variedade
caulivora (iii) D phaseolorum variedade sojae and (iv) Phomopsis longicolla revelando
a existecircncia de variabilidade entre isolados da mesma variedade
92
54 Avaliaccedilatildeo da atividade antimicrobiana 541 Cultura pareada
Os isolados de Phomopsis foram avaliados pela teacutecnica de cultura pareada
contra as linhagens PC1396 e PC3305 do fitopatoacutegeno G citricarpa As interaccedilotildees
foram classificadas em trecircs tipos 1) Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno com
sobreposiccedilatildeo de hifas 2) Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno sem sobreposiccedilatildeo
de hifas e 3) Ausecircncia de inibiccedilatildeo de crescimento Os resultados obtidos estatildeo
apresentados nas Tabelas 9 e 10
Todos os isolados de Phomopsis inibiram significativamente o crescimento das
duas linhagens de Guignardia exceto o isolado ES2WC1 (Phomopsis sp) que
apresentou interaccedilatildeo do tipo 3 em que natildeo houve inibiccedilatildeo significativa do fitopatoacutegeno
apenas 287 e 828 contra PC1396 e PC3305 respectivamente (ANEXO 6 7 8 e
9) Foi observado que as duas linhagens de G citricarpa apresentaram o mesmo tipo
de interaccedilatildeo frente ao mesmo isolado de Phomopsis ou seja natildeo houve variaccedilatildeo
quanto a linhagem do fitopatoacutegeno avaliado Tal observaccedilatildeo reforccedila a importacircncia dos
resultados aqui apresentados
Dos 49 isolados de Phomopsis endoacutefitos de plantas medicinais avaliados 38
inibiram o crescimento das duas linhagens do fitopatoacutegeno G citricarpa com
porcentagem de inibiccedilatildeo superior a 50 Os isolados A333B (Phomopsis sp) ESGF1
(Phomopsis sp S3) SM9638 (P theicola) AT9810 (Phomopsis sp) AT9906
(Phomopsis sp) e ES2WC1 (Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo inferiores
a 50 contra PC1396 e PC3305 os isolados ES80J (Phomopsis sp) e AT9811
(Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo inferiores a 50 apenas contra a
linhagem PC1396 enquanto contra a PC3305 a inibiccedilatildeo foi de 5132 e 5397
respectivamente Por outro lado os isolados de Phomopsis ESFF1 (Phomopsis sp)
SM9714 (Phomopsis sp) e A132 (Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo
inferiores a 50 apenas contra a linhagem PC3305 enquanto contra PC1396 a
inibiccedilatildeo foi de 5017 6215 e 5492 respectivamente
93
A anaacutelise estatiacutestica demonstrou que haacute diferenccedila significativa entre o controle e
os isolados avaliados O fungicida Derosal apresentou inibiccedilatildeo do crescimento do
fitopatoacutegeno em aproximadamente 19 todos os isolados de Phomopsis que
apresentaram inibiccedilatildeo superior ao fungicida com significacircncia no teste estatiacutestico exceto
o isolado ES2WC1 (Phomopsis sp) como citado anteriormente (TABELA 8 e 9 ANEXO
6 7 8 e 9)
As interaccedilotildees do tipo 1 nas quais ocorre agrave sobreposiccedilatildeo de hifas do endoacutefito
sobre o fitopatoacutegeno sugere a ocorrecircncia de parasitismo Esse tipo de interaccedilatildeo entre
os isolados de Phomopsis e as linhagens de G citricarpa ocorreu em 47 dos isolados
Tais isolados apresentam diferenccedila significativa entre o controle destacando-se os
isolados ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) (FIGURA 21) ESJD1
(Phomopsis sp S12) e ESJH1 (Phomopsis sp S11) que inibiram o crescimento de G
citricarpa PC1396 em 7338 6885 6826 e 6792 respectivamente A anaacutelise
estatiacutestica demonstra que haacute diferenccedila significativa entre o controle e estes isolados
poreacutem natildeo haacute diferenccedila significativa entre os mesmos (ANEXO 6 7 e 8)
As interaccedilotildees do tipo 2 nas quais natildeo ocorre sobreposiccedilatildeo de hifas ocorreram
em 51 dos isolados destacando-se os isolados ESSD1 (Phomopsis sp) e SM9713
(P longicolla) que inibiram o crescimento da linhagem PC1396 de G citricarpa em
7324 e 6763 respectivamente A anaacutelise estatiacutestica demonstra que haacute diferenccedila
significativa entre o controle e os isolados ESSD1 (Phomopsis sp) e SM9713 (P
longicolla) os isolados de Phomopsis tambeacutem diferem entre si (TABELA 8) Essas
interaccedilotildees devem ser avaliadas posteriormente em microscopia oacutetica para confirmar se
estaacute ocorrendo parasitismo
FIGURA 21 INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa PC1396 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA
Phomopsis A134
G Citricarpa PC1396
Phomopsis SM9713
G Citricarpa PC1396
G Citricarpa PC1396 Controle
G Citricarpa PC1396
Fungicida Derosal
FONTE O autor
94
Isolados Identificaccedilatildeo Tipo de Interaccedilatildeo Inibiccedilatildeo () Fungicida 19
ESDF1 Phomopsis sp S7 1 7338 ESSD1 Phomopsis sp 2 7324 A134 Phomopsis sp 1 6885
ESJD1 Phomopsis sp S12 1 6826 ESJH1 Phomopsis sp S11 1 6792 SM9713 P longicolla 2 6763 ESIE1 Phomopsis sp 1 6758 ESFB2 Phomopsis sp 1 6724
MU0123 P longicolla 2 6663 ESRD1 Phomopsis sp S1 2 6655 ESJG1 Phomopsis sp 2 6621 ESJE1 Phomopsis sp S1 1 6621
ESPAC22 Phomopsis sp S4 1 6516 A131 P michaeliae 2 6393 A126 Phomopsis sp S11 1 6352 A123 Phomopsis sp S2 1 6270 A113 P michaeliae 1 6270
SM9631 Phomopsis sp 1 6265 ES2AB1 Phomopsis sp S6 1 6246 ESJE2 Phomopsis sp S1 1 6246 A323 Phomopsis sp S8 1 6230
SM9714 Phomopsis sp 1 6215 ES2NA1 Phomopsis sp 1 6212
A334 Phomopsis sp S8 1 6189 ESBA1 Phomopsis sp S6 2 6177 A321 P michaeliae 1 6148
ESKD1 Phomopsis sp S1 1 6109 A216B Phomopsis sp 2 6025
ES2KF1 Phomopsis sp S4 2 5939 ESIA1 P michaeliae 2 5904 A135 Phomopsis sp 2 5902 A124 Phomopsis sp S9 2 5861
A115B Phomopsis sp 1 5861 A116 Phomopsis sp S5 2 5820
A215A Phomopsis sp 1 5656 A132 Phomopsis sp 2 5492
ESFH1 P theicola 2 5427 A333A Phomopsis sp 1 5369 ESGA1 Phomopsis sp S10 2 5324
ES2WF1 Phomopsis sp S4 2 5205 ESFF1 Phomopsis sp 2 5017 AT9811 Phomopsis sp 1 4920 ESGF1 Phomopsis sp S3 2 4642 SM9638 P theicola 1 4522 A333B Phomopsis sp 1 4426 ES80J Phomopsis sp 2 4344 AT9810 Phomopsis sp 2 4173 AT9906 Phomopsis sp 2 3078 ES2WC1 Phomopsis sp 3 287
FONTE O autor
TABELA 8 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC1396
95
A interaccedilatildeo do tipo 1 entre os isolados de Phomopsis e a linhagem PC3305 de
G citricarpa ocorreu em 47 dos isolados a reduccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno
apresentou diferenccedila significativa quando comparados com o controle destacando-se
os isolados A215A (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ESDF1 (Phomopsis sp
S7) ESJD1 (Phomopsis sp S12) A123 (Phomopsis sp S2) que inibiram o crescimento
da linhagem PC3305 de G citricarpa em 7947 7616 7152 7119 e 7119
respectivamente (TABELA 9 FIGURA 22) A anaacutelise estatiacutestica demonstra que haacute
diferenccedila significativa entre o controle e os isolados A215A (Phomopsis sp) A115B
(Phomopsis sp) ESDF1 (Phomopsis sp S7) ESJD1 (Phomopsis sp S12) A123
(Phomopsis sp S2) A215A A115B ESDF1 ESJD1 A123 mas os isolados de
Phomopsis natildeo diferem entre si (ANEXO 9)
Os isolados ESRD1 (Phomopsis sp S1) e A135 (Phomopsis sp) apresentaram
as maiores taxas de inibiccedilatildeo do crescimento da linhagem PC3305 de G citricarpa pela
interaccedilatildeo do tipo 2 6887 e 6623 respectivamente (TABELA 9) A anaacutelise estatiacutestica
demonstra que haacute diferenccedila significativa entre o controle e os isolados ESRD1
(Phomopsis sp S1) e A135 (Phomopsis sp) esses isolados de Phomopsis diferem
entre si (ANEXO 9) Essas interaccedilotildees devem ser avaliadas posteriormente ao
microscoacutepio para confirmar se estaacute ocorrendo parasitismo
O isolado SM9713 (P longicolla) inibiu o crescimento do patoacutegeno G citricarpa e
produziu esporos em volta da colocircnia Segundo Boosalis (1964) a esporulaccedilatildeo pode
ocorrer quando determinados hospedeiros estimulam a reproduccedilatildeo de seus parasitas
Resultados semelhantes foram encontrados por Martins-Corder e Melo (1998) onde
observaram que a maioria dos isolados de Trichoderma spp antagonistas colonizou e
produziu esporos em abundacircncia sobre as colocircnias de Verticillium dahliae
As interaccedilotildees do tipo 2 mostram inibiccedilatildeo mutua na qual o endoacutefito natildeo sobrepotildee
a colocircnia do fitopatoacutegeno apesar de inibir seu crescimento Segundo Bell et al (1982)
os antagonistas selecionados pelo confronto direto satildeo aqueles que apresentam
crescimento sobre o fitopatoacutegeno Poreacutem a relaccedilatildeo entre o tipo de interaccedilatildeo e a
porcentagem de inibiccedilatildeo observada nos resultados natildeo satildeo congruentes uma vez que
96
a porcentagem de inibiccedilatildeo para alguns isolados com interaccedilatildeo do Tipo 2 eacute maior do que
para aqueles com interaccedilatildeo do Tipo 1
Isolados Identificaccedilatildeo Tipo de Interaccedilatildeo
Inibiccedilatildeo ()
Fungicida 1921 A215A Phomopsis sp 1 7947 A115B Phomopsis sp 1 7616 ESDF1 Phomopsis sp S7 1 7152 ESJD1 Phomopsis sp S12 1 7119 A123 Phomopsis sp S2 1 7119
ESFB2 Phomopsis sp 1 7086 ESJE2 Phomopsis sp S1 1 7020 ESJH1 Phomopsis sp S11 1 7020
SM9631 Phomopsis sp 1 6921 ESRD1 Phomopsis sp S1 2 6887 A135 Phomopsis sp 2 6623 A126 Phomopsis sp S11 1 6490
ESPAC22 Phomopsis sp S4 1 6424 A131 P michaeliae 2 6424
ESJE1 Phomopsis sp 1 6358 ES2KF1 Phomopsis sp S4 2 6298
A334 Phomopsis sp S8 1 6291 A124 Phomopsis sp S9 2 6258 ESIA1 P michaeliae 2 6126 ESKD1 Phomopsis sp S1 1 5993 ESSD1 Phomopsis sp L5 2 5960 A134 Phomopsis sp 1 5861 A113 P michaeliae 1 5795
TABELA 9 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 (CONTINUA)
FIGURA 22 INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa 3305 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA
G citricarpa PC3305
Phomopsis ESRD1
Phomopsis ESDF1
G citricarpa PC3305
G citricarpa PC3305 controle
Fungicida Derosal
G citricarpa PC3305
FONTE O autor
97
A333A Phomopsis sp 1 5728 ESIE1 Phomopsis sp 1 5695 ESJG1 Phomopsis sp 2 5662 A323 Phomopsis sp S8 1 5629
ES2AB1 Phomopsis sp S6 1 5596 ESBA1 Phomopsis sp S6 2 5563 A116 Phomopsis sp S5 2 5464
AT9811 Phomopsis sp 1 5397 A216B Phomopsis sp 2 5364 A321 P michaeliae 1 5331
SM9713 P longicolla 2 5298 ES2NA1 Phomopsis sp 1 5265 MU0123 P longicolla 2 5232 ESFH1 Phomopsis sp 2 5132 ES80J Phomopsis sp 2 5132 ESGA1 Phomopsis sp S10 2 5079
ES2WF1 Phomopsis sp S4 2 5033 ESFF1 P theicola 2 4934
SM9714 Phomopsis sp 1 4735 A132 Phomopsis sp 2 4470
A333B Phomopsis sp 1 3775 ESGF1 Phomopsis sp S3 2 3344 SM9638 P theicola 1 2781 AT9810 Phomopsis sp 2 2649 AT9906 Phomopsis sp 2 2583 ES2WC1 Phomopsis sp 3 828
FONTE O autor 542 Teste para detecccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
No teste de metaboacutelitos volaacuteteis observou-se reduccedilatildeo do crescimento da
linhagem PC1396 e PC3305 de G citricarpa apoacutes a retirada do celofane onde
inicialmente foram inoculados os isolados de Phomopsis Todos os isolados testados
inibiram significativamente o crescimento das duas linhagens de G citricarpa Os
isolados A115B (Phomopsis sp) A134 (Phomopsis sp) ESFF1 (Phomopsis sp)
ESFH1 (Phomopsis theicola) A123 (Phomopsis sp S2) e S2WF1 (Phomopsis sp S4)
apresentaram maior inibiccedilatildeo do crescimento das duas linhagens do fitopatoacutegeno
(ANEXO 10 e 11 e FIGURA 23) sugerindo que a interaccedilatildeo entre os isolados de
Phomopsis e o fitopatoacutegeno ocorre devido agrave produccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
TABELA 9 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 (CONTINUACcedilAtildeO)
98
FONTE O autor FIGURA 23 AVALIACcedilAtildeO DO CRESCIMENTO DAS COLOcircNIAS DO FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 e PC3305 INOCULADAS APOacuteS RETIRADA DO PAPEL CELOFANE PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS EM MEIO BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
Nota a Placa com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC3305 inoculado apoacutes retirada do celofane onde previamente foi inoculado o isolado ESFH1 b Placa controle com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC3305 c Placa com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396 inoculado apoacutes retirada do celofane onde previamente foi inoculado o isolado ESFH1 d Placa controle com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396
FIGUEIREDO (2006) utilizou a teacutecnica de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis em
Pestalotiopsis isolados endofiacuteticos de Maytenus ilicifolia e observou uma reduccedilatildeo do
crescimento da linhagem PC1396 de G citricarpa demonstrando que a interaccedilatildeo
ocorre principalmente pela produccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
Os resultados apresentados aqui demonstram o grande potencial que tais
linhagens endofiacuteticas de Phomopsis possuem como agentes de controle da Mancha
Preta dos Citros e o seu potencial na produccedilatildeo de metaboacutelitos
543 Avaliaccedilatildeo da accedilatildeo dos Extratos
Na avaliaccedilatildeo dos extratos quanto agrave inibiccedilatildeo do crescimento das linhagens
PC1396 e PC3305 de G citricarpa os resultados indicam que a maioria dos extratos
metanoacutelicos produzidos a partir dos isolados de Phomopsis reduziram o crescimento
micelial de ambas as linhagens do fitopatoacutegeno da MPC A inibiccedilatildeo ocorreu devido aos
metaboacutelitos secundaacuterios produzidos pelos isolados endofiacuteticos quando comparados
com o crescimento micelial dos controles com metanol (onde o extrato foi diluiacutedo) e
com aacutegua destilada (FIGURA 24 25 e TABELA 10)
a b c d
99
Foi observado que os isolados de Phomopsis que apresentaram as maiores
porcentagens de inibiccedilatildeo pela teacutecnica de cultura pareada tambeacutem inibiram o
crescimento quando foi utilizado o extrato metanoacutelico Entretanto o isolado ES2WC1
(Phomopsis sp) que natildeo inibiu o crescimento pela teacutecnica de cultura pareada
apresentou reduccedilatildeo no crescimento micelial dos dois fitopatoacutegenos avaliados
utilizando-se o seu extrato metanoacutelico Provavelmente essa falta de inibiccedilatildeo pela
teacutecnica de cultura pareada tenha ocorrido pelo fato do isolado ES2WC1 (Phomopsis
sp) apresentar crescimento lento fazendo com que o crescimento do fitopatoacutegeno natildeo
diferisse significativamente do controle
Os isolados ES80J (Phomopsis sp) ESFF1 (Phomopsis sp) A132 (Phomopsis
sp) A333B (Phomopsis sp) e SM9638 (P theicola) natildeo inibiram o crescimento micelial
de nenhum dos fitopatoacutegenos avaliados Para alguns isolados de Phomopsis natildeo foi
possiacutevel determinar o potencial antimicrobiano dos extratos metanoacutelicos pois houve
grande variaccedilatildeo de accedilatildeo entre as repeticcedilotildees do experimento
FONTE O autor
C
D E F
A B
NOTA A Placa controle com aacutegua destilada autoclavada B Placa controle com metanolC Placa controle com fungicida Derosal reg (10 mgmL) D Placa com extrato metanoacutelicodo isolado ES2WC1 E Placa com extrato metanoacutelico do isolado A215A F Placa comextrato metanoacutelico do isolado ESDF1
FIGURA 24 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NOCRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC3305 DE G citricarpa EMMEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
100
Rodrigues-Heerklotz et al (2001) elucidaram a estrutura quiacutemica e a siacutentese
assimeacutetrica de um novo metaboacutelito o aacutecido guignardico produzido pelo fungo endofiacutetico
Guignardia sp isolado de Spondias mombin Silva et al (2005) isolaram dois
metaboacutelitos de Phomopsis cassiae endofiacutetico de Cassia specatabilis 24-diidroxi-56-
dimetil benzoato de etila e phomopsilactona que exibiram forte atividade antifuacutengica
contra fitopatoacutegenos bem como citotoxicidade contra a linhagem celular de tumor
cervical humano (HeLa) Estudos adicionais devem ser realizados para determinar a
estrutura quiacutemica produzida pelos endoacutefitos de Phomopsis estudados
NOTA A Placa controle com aacutegua destilada autoclavada B Placa controle commetanol C Placa controle com fungicida Derosal reg (10 mgmL)D Placa com extratometanoacutelico do isolado ES2WC1 E Placa com extrato metanoacutelico do isolado ESGA1 FPlaca com extrato metanoacutelico do isolado ESSD1
FONTE O autor FIGURA 25 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NOCRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 DE G citricarpa EMMEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
C
D E F
A B
101
Os resultados da tabela 10 revelam que os isolados endofiacuteticos de Phomopsis
spp avaliados satildeo bastante promissores demonstrando um potencial na produccedilatildeo de
metaboacutelitos Resultados semelhantes foram obtidos por Moller Weber e Dreyfuss
(1996) que avaliaram a accedilatildeo de endoacutefitos de plantas tropicais com alta produccedilatildeo de
metaboacutelitos secundaacuterios
Identificaccedilatildeo Isolados Inibiccedilatildeo PC3305 Cultura Pareada
Inibiccedilatildeo PC3305 Extrato
Metanoacutelico
Inibiccedilatildeo () PC1396 Cultura Pareada
Inibiccedilatildeo PC1396 Extrato
Metanoacutelico Derosal Fungicida 1921 I 19 I
P longicolla SM9713 5298 I 6763 I P longicolla MU0123 5232 ND 6663 I P michaeliae A131 6424 I 6393 I P michaeliae ESIA1 6126 I 5904 I Phomopsis sp A333A 5728 I 5369 I P michaeliae A321 5331 I 6148 I P michaeliae A113 5795 ND 627 ND Phomopsis sp S2 A123 7119 ND 627 ND P theicola ESFH1 5132 I 5427 I Phomopsis sp ESFF1 4934 NI 5017 NI P theicola SM9638 2781 NI 4522 NI Phomopsis sp S4 ES2WF1 5033 I 5205 I Phomopsis sp S3 ESGF1 3344 I 4642 I Phomopsis sp S10 ESGA1 5079 I 5324 I Phomopsis sp S1 ESRD1 6887 I 6655 I Phomopsis sp S8 A334 6291 I 6189 I Phomopsis sp S9 A124 6258 I 5861 I Phomopsis sp S7 ESDF1 7152 I 7338 I Phomopsis sp ESSD1 596 I 7324 I Phomopsis sp S6 ES2AB1 5596 I 6246 I Phomopsis sp S6 ESBA1 5563 I 6177 I Phomopsis sp S11 A126 649 ND 6352 ND Phomopsis sp S12 ESJD1 7119 I 6826 I Phomopsis sp S1 ESJE1 6358 I 6621 I Phomopsis sp S1 ESJE2 702 ND 6246 ND Phomopsis sp S1 ESKD1 5993 ND 6109 ND Phomopsis sp A115B 7616 I 5861 I Phomopsis sp ESFB2 7086 I 6724 I Phomopsis sp S11 ESJH1 702 I 6792 I Phomopsis sp A135 6623 I 5902 ND Phomopsis sp A134 5861 I 6885 I Phomopsis sp ESIE1 5695 I 6758 I Phomopsis sp ESJG1 5662 ND 6621 I
TABELA 10 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO CRESCIMENTO MICELIAL DASCOLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTOA 28ordmC (CONTINUA)
102
Phomopsis sp AT9811 5397 I 492 I Phomopsis sp A216B 5364 I 6025 I Phomopsis sp ES2NA1 5265 I 6212 I Phomopsis sp SM9714 4735 I 6215 I Phomopsis sp ES2WC1 828 I 287 I Phomopsis sp SM9631 6921 ND 6265 ND Phomopsis sp S4 ESPAC22 6424 ND 6516 ND Phomopsis sp S4 ES2KF1 6298 ND 5939 ND Phomopsis sp S8 A323 5629 ND 623 ND Phomopsis sp S5 A116 5464 ND 582 ND Phomopsis sp AT9810 2649 ND 4173 ND Phomopsis sp AT9906 2583 ND 3078 ND Phomopsis sp ES80J 5132 NI 4344 NI Phomopsis sp A132 447 NI 5492 NI Phomopsis sp A333B 3775 NI 4426 NI Phomopsis sp A215A 7947 I 5656 I
FONTE O autor
NOTA I- Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno NI- Natildeo ocorreu inibiccedilatildeo do fitopatoacutegeno ND- Natildeo foi determinado a inibiccedilatildeo
No Brasil as plantas Spondias mombin e A tomentosum tecircm sido usadas na
medicina devido as suas propriedades antimicrobianas (AJAO SHONUKAN e FEMI
1984) Os isolados de Phomopsis obtidos como endoacutefitos de S mombin (SM9713 (P
longicolla) SM9638 (P theicola) e SM9714 (Phomopsis sp)) e A tomentosum (AT9810
(Phomopsis sp) AT9811 (Phomopsis sp) e AT9906 (Phomopsis sp)) avaliados no
presente trabalho jaacute haviam sido relatados por Corrado e Rodrigues (2004) como
produtores de compostos bioativos Os autores relatam que os extratos metanoacutelicos
inibiram o crescimento de E coli S aureus P aeruginosa C albicans A niger e F
oxysporum No presente trabalho os isolados de S mombin e A tomentosum inibiram
o crescimento de Guignardia citricarpa confirmando o potencial desses isolados em
produzir substacircncias bioativas mais estudos devem ser realizados para verificar o
potencial antimicrobiano desses extratos contra bacteacuterias patogecircnicas e
fitopatogecircnicas
A planta Schinus terebinthifolius eacute usada no Brasil na medicina alternativa contra
doenccedilas da coacuternea (CORREcircA 1926) doenccedilas reumaacuteticas uacutelceras feridas tumores
linfaacuteticos erisipela e outras moleacutestias provocadas por bacteacuterias que se manifestam em
forma de edema ou eritema (BALBACH 1992) As linhagens de Phomopsis isoladas de
S terebinthifolius avaliadas nesse trabalho A135 (Phomopsis sp) A113 (P michaelae)
TABELA 10 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO CRESCIMENTO MICELIAL DASCOLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DECRESCIMENTO A 28ordmC (CONTINUACcedilAtildeO)
103
A115B (Phomopsis sp) A323 (Phomopsis sp S8) A132 (Phomopsis sp) A134
(Phomopsis sp) A333B (Phomopsis sp) A321 (P michaelae) A126 (Phomopsis sp
S11) A216B (Phomopsis sp) A334 (Phomopsis sp S8) A116 (Phomopsis sp S5)
A215A (Phomopsis sp) A124 (Phomopsis sp S9) A333A (Phomopsis sp) A131 (P
michaeliae) e A123 (Phomopsis sp S2) apresentaram excelentes resultados contra G
citricarpa
Extratos da planta M ilicifolia jaacute foram descritos na literatura apresentando
atividade antitumoral tambeacutem usado como analgeacutesico antinflamatoacuterio e antiaacutecido
(JORGE 2004 DUARTE 2005) Pileggi (2006) isolou microrganismos endofiacuteticos de
plantas de Maytenus ilicifolia do mesmo pomar investigado neste trabalho e avaliou o
potencial farmacoloacutegico dos mesmos Entre os fungos e bacteacuterias testados 15
apresentaram potencial para controle bioloacutegico
Figueiredo (2006) isolou fungos endofiacuteticos de plantas de M ilicifolia do mesmo
pomar investigado neste trabalho especialmente Pestalotiopsis spp e os avaliou quanto
ao potencial antimicrobiano contra bacteacuterias patogecircnicas em humanos e o fitopatoacutegeno
G citricarpa Os extratos metanoacutelicos de dois isolados exibiram accedilatildeo fungistaacutetica na
germinaccedilatildeo e no crescimento micelial das linhagens PC1396 e PC3305 de G
citricarpa Aleacutem disso dois extratos de Pestalotiopsis spp inibiram o crescimento dos
microrganismos-teste (S aureus oxalino resistente Klebsiella pneumoniae
Micrococcus luteus Staphylococcus aureus e Escherichia coli)
No presente trabalho observou-se que as linhagens de Phomopsis spp isolados
de M ilicifolia apresentaram excelentes resultados in vitro contra G citricarpa Pouco se
conhece a respeito da comunidade endofiacutetica existente nessas plantas e os resultados
desse trabalho demostram que abrigam uma grande variabilidade de PC1396 e
PC3305 espeacutecies de Phomopsis com portencial para bioprospecccedilatildeo Isto reforccedila a
importacircncia de estudos de microrganismos endofiacuteticos em plantas medicinais em
especial M ilicifolia e S terebinthifolius Faz-se necessaacuterio tambeacutem o estudo da
composiccedilatildeo quiacutemica dos extratos avaliados
104
6 CONCLUSOtildeES Os resultados obtidos no presente trabalho permitiram as seguintes conclusotildees
bull As espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo podem ser identificadas
apenas por caracteriacutesticas morfoloacutegicas ou marcadores moleculares
RAPD sendo necessaacuteria uma anaacutelise polifaacutesica incluindo
sequumlenciamento de vaacuterias regiotildees do genoma
bull As plantas medicinais analisadas satildeo colonizadas por grande
diversidade de espeacutecies de Phomopsis com grande variabilidade
morfoloacutegica e geneacutetica intra e interespeciacuteficas
bull As plantas de Maytenus ilicifolia analisadas satildeo colonizadas
endofiticamente por pelo menos 10 espeacutecies de Phomopsis sendo
possiacutevel identificar por sequumlecircncias ITS do rDNA isolados de P theicola e
P michaeliae
bull A planta de Schinus terebinthifolius analisada eacute colonizada
endofiticamente por pelo menos 6 espeacutecies de Phomopsis sendo
possiacutevel identificar por sequumlecircncias ITS do rDNA isolados de P
michaeliae
bull As espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo satildeo hospedeiro-especiacuteficas
sendo necessaacuteria a redefiniccedilatildeo do conceito de espeacutecie para este gecircnero
bull Os isolados de Phomopsis spp apresentaram grande potencial no
controle in vitro do fungo G citricarpa Os isolados ESIA1 e A131 (P
michaeliae) ESJE1 ESJE2 ESKD1 e ESRD1 (Phomopsis sp S1) A123
(Phomopsis sp S2) ES2KF1 e ESPAC22 (Phomopsis sp S4) ESDF1
105
(Phomopsis sp S7) A334 (Phomopsis sp S8) A124 (Phomopsis sp
S9) A126 e ESJH1 (Phomopsis sp S11) ESJD1 (Phomopsis sp S12) e
os isolados A134 A135 A115B A215A SM9631 ESFB2 e ESSD1
(Phomopsis sp) foram os mais promissores em inibir o crescimento das
linhagens PC1396 e PC3305 de G citricarpa nas metodologias
avaliadas
106
7 REFEREcircNCIAS BIBLIOGRAacuteFICAS ALBERTS B LEWIS J RALF M ROBERTS K WATSON J D Molecular Biology of the Cell 4ordf ed New York Garland Publishing 2004 ALICE C B SIQUEIRA N C S MENTZ L A SILVA G A A B JOSEacute K F D Plantas medicinais de uso popular Atlas farmacognoacutestico Canoas Editora da ULBRA 1995 ALZATE-MARIN A L BAIacuteA G S FALEIRO F G CARVALHO G A PAULA JR T J MOREIRA M A BARROS E G Anaacutelise da diversidade geneacutetica de raccedilas de Colletotrichum lindemuthianum que ocorrem em algumas regiotildees do Brasil por marcadores RAPD Fitopatologia Brasileira v 22 p 85-88 1997 ALMEIDA A M R Efeito de luz e meios de cultura sobre crescimento micelial formaccedilatildeo e tamanho de picniacutedios e esporulaccedilatildeo de isolados de Phomopsis sojae Leh In SEMINAacuteRIO NACIONAL DE PESQUISA DE SOJA Brasiacutelia 2 1981 Londrina Anais Brasiacutelia EmbrapaSNI 1982 p 216-226 ANCHORENA-MATIENZO P Re-identificaccedilatildeo e caracterizaccedilatildeo geneacutetica de levedura IZ-987 utilizando marcadores moleculares 2002 81p Dissertaccedilatildeo (Mestrado) ndash ESALQ USP Piracicaba Satildeo Paulo 2002 ANJOS J R N CHARCHAR M J A GUIMARAtildeES D P Ocorrecircncia de Queima das Folhas Causada por Phomopsis sp Em Aroeira No Distrito Federal Fitopatologia Brasileira v 26 n 3 p 649-650 2001 ARAUacuteJO J M SILVA A C AZEVEDO J L Isolation of endophytic actinomycetes from roots and leaves of maize (Zea mays L) Brazilian Archives of Biology and Technology v 43 n 4 p 447-451 2000 ARAUacuteJO W L AZEVEDO J L LIMA A O S MARCOM J SOBRAL J L LACAVA P T Manual Isolamentos de fungos endofiacuteticos Escola Superior da Agricultura Luiz de Queiroz Universidade de Satildeo Paulo Piracicaba 2002 ARNOLD E A MEJIacuteA C L KYLLO D ROJAS E I MAYNARD Z ROBBINS N HERRE E A Fungal endophytes limit pathogen damage in a tropical tree PNAS v 100 p 15649-15654 2003 AZEVEDO J L Microrganismos Endofiacuteticos In MELO I S AZEVEDO J L Ecologia Microbiana Editora EMBRAPA Jaguariuacutena-SP p 117-137 1998 AZEVEDO J L JUacuteNIOR W M PEREIRA J O ARAUacuteJO W L Endophytic microganisms a review on insect control and recent advances on tropical plants
107
Environmental Biotechnology v 3 n1 p 40-65 2000 BAAYEN R P BONANTS P J M VERKLEY G CARROL G C VAN DER AA M WEERDT M BROUWERSHAVEN G C SCHUTTE G C MACCHERONI JR W GLIENKE-BLANCO C AZEVEDO J L Nonpathogenic Strains of the Citrus Black Spot Fungus Guignardia citricarpa Identified as a Cosmopolitan Endophyte of Woody Plants Guignardia mangiferae (Phyllosticta capitalensis) Phytopathology v 92 p 464-477 2002 BAKER R E D Studies in the pathogenicity of tropical fungi II The occurrence of latent infections in developing fruits Annals of Botany London v 2 p 919-931 1938 BAO J R LAZAROVITS G Differential colonization of tomato roots by nonpathogenic and pathogenic Fusarium oxysporum strains may influence Fusarium wilt control Phytopathology Lancaster v 91 p 449-456 2001 BELL D K WELLS H D MARKHABELL D K WELLS C R In vitro antagonism ot Trichoderma species against six fungal plant pathogens Phytopathology v 72 p 379-382 1982 BETTIOL W GHINI R Controle Bioloacutegico In Manual de Fitopatologia Bergamin FILHO A AMORIM L e KIMATI H (Eds) 3ordf ed Satildeo Paulo Ceres 1995 919p BILLS G DOMBROWSKY A PELAEZ F POLISHOOK J Recent and future discoveries of pharmacologically active metabolites from tropical fungi Tropical mycology micromycetes v 2 p 165-194 2002 BITTENCOURT J V M Variabilidade geneacutetica em populaccedilotildees naturais de Maytenus ilicifolia por meio de marcadores RAPD Curitiba 2000 58p Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Agronomia ndash Produccedilatildeo Vegetal) Universidade Federal do Paranaacute BITTENCOURT J V M Variabilidade Geneacutetica em Populaccedilotildees Naturais de Maytenus Ilicifolia por Meio de Marcadores RAPD Scientia Agraacuteria v 2 p1-2 2001 BLANCO C G Guignardia citricarpa Kiely Anaacutelise geneacutetica cariotiacutepica e interaccedilatildeo com o hospedeiro Piracicaba 1999 Tese de Doutorado- escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Universidade de Satildeo Paulo BOSSALIS M C Hyperparasitism Annual Review of Phytopathology v 2 p 363-375 1964 BRAYFORD D Vegetative incompatibility in Phomopsis from elm Mycological Research v 94 n 6 p 745-752 1990
108
BODDY L GRIFFITH G S Role of endophytes and latent invasion in the development of decay communities in sapwood of angiospermous trees Sydowia v 41 p 41-73 1989 BUSSABAN B LUMYONG S LUMYONG P McKENZIE E H HYDE K D Endophytic fun i from Amomum siamense Canadian Journal of Microbiology v 47 n 10 p 943-948 2001 CAMPAROTO M L TEIXEIRA R O MANTOVANI M S VICENTINI P Effects of Maytenus ilicifolia Mart and Bauhinia candicans Benth onion root-tip and rat bone-marrow cells Genetics and Molecular Biology v 25 n1 p 85-89 2002 CARDOSO-FILHO J L Efeito de extratos de albedo de laranja (Citrus sinesis) dos indutores de resistecircncia aacutecido salicilico acil-benzolar ndash S- metil e Saccharomyces cerevisiae no controle de Phyllosticta citricarpa (Teleomorfo Guignardia citricarpa) Piracicaba 2003 125f Dissertaccedilatildeo (Doutorado) ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo CARROLL G C CARROLL F E Studies on the incidence of coniferous needle endophytes in the Pacitfic Northwest Canadian Jornal of Botany v 56 p 3034-3043 1978 CARROLL G C The Biology of endophytism in plants with particular reference to woody perennials In FOKKEMA N J HEAVEL J Van Der (Eds) Microbiology of the Phyllosphere Cambridge Cambridge University Press 1986 p 205-222 CASTLEBURY LA MENGISTU A Phylogenetic distinction of DiaporthePhomopsis isolates from soybeans [resumo] Systematic Mycology and Microbiology I v 57 n 4 p 13 2006 CENARGEN Banco de Dados on Line Disponiacutevel em lthttpicewall2cenargenembrapabr84micwebmichtmlfgbd01aspPgt Acesso em Maio de 2005 CERVI A C PACIORNIK E F VIEIRA R F MARQUES L C Espeacutecies vegetais de um remanescente de Floresta de Araucaacuteria (Curitiba-Brasil) estudo preliminar I Acta Bioloacutegica Paranaense Curitiba v18 n1-4 p73-114 1989 CHAREPRASERT S PIAPUKIEW J THIENHIRUN S WHALLEY A J S SIHANONTH P Endophytic fungi of teak leaves Tectona grandis L and rain tree leaves Samanea saman Merr Journal of Microbiology amp Biotechnology v 22 n 5 p 481-486 2006 CHRISTO D Variabilidade Geneacutetica e Diferenciaccedilatildeo Molecular de Isolados Endofiacuteticos e Patogecircnicos de Guignardia spp e Phyllosticta sp Curitiba 2002
109
78 f Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Geneacutetica) ndash Universidade Federal do Paranaacute CLAY K Effects of fungal endophyteson the seed and seedling biology of Lolium perenne and Festuca arundinacea Oecologia (Berlin) Berlin v73 p 358-362 1987 CLAY K Fungi and the food of the goods Nature v 427 p 401-402 2004 COCHRANE VW Physiology of fungi New York John Wiley 1958 524p COCKRUM P A PETTERSON D S EDGAR J A 1994 Identification of novel Phomopsins in Lupin seed extracts In Plant-associated toxins Agricultural phytochemical and ecological aspects DORLING P R p 232-237 Wallingford CAB In-ternational COELHO AG Software Bood v 3 04 2005 COIMBRA R SILVA E D Notas de Fitoterapia 2ordf ed Laboratoacuterio Cliacutenico Silva Arauacutejo SA 1958 CORDEIRO P J M VILEGAS J H Y LANCcedilAS F M HRGC-MS Analysis of Terpenoids from Maytenus ilicifolia and Maytenus aquifolium (ldquoEspinheira Santardquo) Journal of Brazilian Chemistry Society v 10 p 523-526 1999 CORRADO M RODRRIGUES KF Antimicrobial evaluation of fungal extracts produced by endophytic strains of Phomopsis sp Journal Basic Micrrobiol v44 p157-160 2004 CORREcircA RMS Caracterizaccedilatildeo de Phomopsis e Phoma obtidos de sementes de espeacutecies florestais 1995 72p Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Fitopatologia) ndash Universidade Federal de Lavras Lavras 1995 CRONQUIST A An integrated system of classification of flowering plants New York Columbia University Press 1981 CROUS PW WINGFIELD MJ FERREIRA FA ALFENAS A Mycosphaerella parkii and Phyllosticta eucalyptorum two new species from eucaliptus leaves in Brazil Mycological Research Cambridge v97 p 582-584 1993 CRUZ GL Livro Verde VolII 1a Editora Belo Horizonte-Minas Gerais 1965 DALZOTO P R GLIENKE-BLANCO C KAVA-CORDEIRO V ARAUacuteJO W L AZEVEDO J L RAPD analyses of recombinatiom process in the entomopathogenic fungus Beauveria bassiana Mycological Research v 107 p 1069-1074 2003 DJAOUIDA R SORBO G D REGGIO C ZOINA A FIRRAO G Polymorphisms in nuclear rDNA and mtDNA reveal the polyphyletic nature of isolates of Phomopsis
110
pathogenic to sunflower and a tight monophyletic clade of defined geographic origin Mycologia v 108 n 4 p 393-402 2004 DUARTE M R DEBUR M C Stem and leaf morphoanatomy of Maytenus ilicifolia Fitoterapia v 76 p 41-49 2005 EDGINTON L V KNEW K L BARRON G L Fungitoxic spectrum of benzimidazole compounds Phitopathology v 62 n 7 p 42-44 1971 EMBRAPA Fungos Endofiacuteticos Introduccedilatildeo Disponiacutevel em lthttpwwwcnpmaembrapabrprojetosendofiticosintroducaohtm1gt Acesso em Maio de 2005 ERNEST M MENDGEN W K WIRSEL W Endophytic Fungal Mutualists Seed-Borne Stagonospora spp Enhance reed biomass production in axenic microosms Molecular Plant-Microbe Interations v 16 n 7 p 580-587 2003 ESPOacuteSITO E AZEVEDO J L Fungos uma introduccedilatildeo agrave biologia bioquiacutemica e biotecnologia Caxias do Sul Edusc 510p 2004 ETHUR L Z CEMBRANEL C Z SILVA A C F Seleccedilatildeo de Trichoderma spp visando controle de Sclerotinia sclerotiorium in vitro Ciecircncia Rural v 31 n 5 p 885-887 2001 EZRA D STROBEL G A Effects of substrate on the bioactivity of volatile antimicrobials produced by Muscodor albus Plant Science St Paul v165 p913-922 2003 EZRA D CASTILLO U F STROBEL G A HESS W M PORTER H JENSEN J B CONDRON M A M TEPLOW D B SEARS J MARANTA M HUNTER M WEBER B YAVER D Coronamycins peptide antibiotics produced by a verticillate Streptomyces sp (MSU-2110) endophytic on Monstera sp Microbiology v 150 p 785-793 2004 FARR D F CASTLEBURY L A ROSSMAN A Y Morphological and molecular characterization of Phomopsis vaccinii and additional isolates of Phomopsis from blueberry and cranberry in the eastern United States Mycologia v 94 n 3 p 494-504 2002 FELSENTEIN J Conficence limits on phylogenies an approch using the bootstrap International Journal of Organic Evolution Lancaster v 39 p 366-369 1985 FERNANDEZ F A HANLIN R T Morphological and RAPD analyses of Diaporthe phaseolorum from soybean Mycologia v 88 n 3 p 425-440 1996
111
FERREIRA M E Aplicaccedilatildeo de Marcadores Moleculares no Mapeamento Geneacutetico de Plantas In III Curso de Marcadores Moleculares EMBRAPACENARGEN ndash Brasiacutelia DF 1994 FERREIRA D F Anaacutelise estatiacutestica por meio do SISVAR para Windows Versatildeo 40 In REUNIAtildeO ANUAL DA REGIAtildeO BRASILEIRA DA SOCIEDADE INTERNACIONAL DE BIOMETRIA 45 2000 Satildeo Carlos Anais Satildeo Carlos SSPSIB 2000 p 255-268 VAN SOEST P J Nutritional ecology of the ruminant 2 ed Ithaca Cornell University PressConstock Pub-lish1994 476 p FERREIRA MP OLIVEIRA CNOLIVEIRA BA LOPES MJALZAMORA F VIEIRA MAR A lyophilized aqueous extract of Maytenus ilicifolia leaves inhibits histamine-mediated acid secretion in isolated frog gastric mucose Planta v 219 p 319-324 2004 FIALHO M B Efeito in vitro Sacharomyces cerevicea sobre Guignardia citricarpa agente causal da pinta preta dos citros Piracicaba 2004 60f Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo FIGUEIREDO J G Bioprospecccedilatildeo Caracterizaccedilatildeo Morfoloacutegica e Molecular de Endoacutefitos de Maytenus ilicifolia com Ecircnfase EM Pestalotiopsis spp Curitiba 2006 Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade Federal do Paranaacute FRISVAD J C SAMSON R A Polyphasic taxonomy of Penicillium subgenus Penicillium - A guide to identification of food and air-borne terverticillate Penicillia and their mycotoxins Studies in Mycology v 49 p 1-173 2004 FRISVAD J C FRANK J M HOUBRAKEN J A M P KUIJPERS A F A SAMSON R A New ochratoxin A producing species of Aspergillus section Circumdati Studies in Mycology v 50 p 23-43 2004 FUNGARO M H P VIEIRA M L C Aplicaccedilotildees da PCR em ecologia molecular In MELO I S AZEVEDO J L (Eds) Ecologia microbiana Jaguarariuacutena Embrapa-CNPMA 1998 cap8 p205-227 FUNGARO M H P PCR na Micologia Biotecnologia Ciecircncia amp Desenvolvimento Brasiacutelia n14 p12-16 2000 GAMBOA-GAITAacuteN M A LAUREANO S BAYMAN P Endophytic Phomopsis Strains from of Guarea guidonia (Meliaceae) Journal of Science v 41 n 2 p 215-224 2005 GAO X ZHOU H XU D YU C CHEN Y QU L Hi h diversity of endophytic fun i from the pharmaceutical plant Heterosmilax japonica Kunth
112
revealed y cultivation-independent approach FEMS Microbiology Letters v 249 p 255-266 2005 GLIENKE C CHRISTO D MACCHERONI JR W AZEVEDO J L High molecular diversity of the fungus Guignardia citricarpa and Guignardia mangiferae and new primers for the diagnosis of the Citrus Black Spot Brazilian Archives of Biology and Technology Submetido 2007 GLIENKE C Variabilidade geneacutetica no fungo endoacutefito Guignardia citricarpa kiely detectada por RAPD Curitiba 1995 Dissertaccedilatildeo de Mestrado- Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade federal do Paranaacute GLIENKE-BLANCO C AGUILAR-VILDOSO CI VIEIRA MLC BARROSOP A V AZEVEDO JL Genetics variabilityb in the endophytic fungus Guignardia citricarpa isolated from citrus plants Genetics and Molecular Biology v 25 n 2 p 251-255 2002 GOacuteES A Etiologia aspectos epidemioloacutegicos e controle de Guignardia citricarpa agente causal da mancha preta do citros 100 p Relatoacuterio teacutecnico 2005 GONZALEZ M LOMBARDO A VALLARINO A J Plantas de la medicina vulgar del Uruguay Uruguay Talleres Grfificos Cerrito 149 p 1937 GUTHRIE P A I MAGILL C W FREDERIKSEN R A ODVODY G N Random amplified polymorphic DNA markers a systems for identifying and differentiating isolates of Colletotrichum graminicola Phytopathology St Paul v 82 p 832-835 1992 GURGEL LMS MENEZES M COELHO RSB Caracterizaccedilatildeo patogecircnica fisioloacutegica e isoenzimaacutetica de Phomopsis anacardii e Phomopsis mangiferae In CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA 30 1997 Poccedilos de Caldas Resumos Brasiacutelia Sociedade Brasileira de Fitopatologia 1997 p 269 GURGEL LMS MENEZES M COEcircLHO RSB Estudo comparativo de isolados de Phomopsis anacardii e Phomopsis mangiferae atraveacutes da patogenicidade e nutriccedilatildeo de C e N em trecircs regimes de luminosidade Summa Phytopathologica v 28 p 160-166 2002 GRAJAL-MARTIN M J SIMON C J MUEHLBAUER F J Use of Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) to characterize race 2 of Fusarium oxysporum fsp pisi Phytopatology v 83 p 612-14 1993 GRATTAPAGLIA D FERREIRA M E Introduccedilatildeo ao uso de marcadores moleculares em anaacutelise geneacutetica EMBRAPA Brasiacutelia 3 ed 220p 1998
113
GRIFFIN DH Fungal physiology 2ed New York Wiley-Liss 1994 458p HALL T A BioEdit48 Raileigh 1997-2001 1 arquivo (115M) Disponiacutevel em httpwwwmbioncsuedubioedithtml BioEdit a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windons 9598NT HANLIN R T MENEZES M Gecircneros ilustrados de ascomicetos UFRPE Recife-PE 1996 274p HERBERT J A GRECH NM A strain of Guignardia citricarpa the citrus black spot pathogen resistent to benomyl in South Africa Plant Disease St Paul v 69 p 1007 1985 HUANG Y WANG J LI G ZHENG Z SU W Antitumor and antifungal activities in endophytic fungi isolated from pharmaceutical plants taxus mairei Cephalataxus fortunei and Torreya grandis FEMS Immunology and Medical Microbiology v31 n47 p163-167 2001 IBRAHIM G BAYCA B Fungal bacterial and nematological problems of citrus grape and stone fruits in Arab countries Arab Journal of Plant Protection Beirut v7 n2 p190-197 1989 ITOKAWA H SHIROTA O IKUTA H MORITA H TAKEYA K IITAKA Y Triterpenes fom Maytenus ilicifolia Phytochemistry v 30 n 11 p 3713-37161991 ITOKAWA H SHIROTA O IKUTA H MORITA H TAKEYA K IITAKA Y Oligo-nicotinated sesquiterpene polyesters from Maytenus ilicifolia Journal of natural Prodcts v 56 p 1479-14851993 JASALAVICH C OSTROFSKY A JELLISON J Detection and identification of decay fungi in spruce wood by restriction fragment length polymorphism analisis of amplified genes encoding rRNA Applied and Environmental Microbiology Washington v66 n11 p 4725-4734 2000 JOHNSTON P R FULLERTON R A Cryptosporiopsis citri sp Nov cause of a citrus leal spot in the Pacific Islands New Zealand Journal of Experimental Agriculture Wellington v16 p159-163 1988 JORGE R M LEITE J P V OLIVEIRA A B TAGLIATI C A Evaluation of antinociceptive anti-inflammatory and antiulcerogenic activities of Maytenus ilicifolia Journal Ethnopharmacol v 94 n1 p 93-100 2004 KIM K H TEN L N LIU Q M IM W T LEE S T Sphingobacterium daejeonense sp nov isolated from a compost sample International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2031-2036 2006
114
KIM B Y WEON H Y LEE K H SEOK S J KWON S W GO S J STACKEBRANDT E Dyella yeojuensis sp nov isolated from greenhouse soil in Korea International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2079-2082 2006 LEE Y H SNOW J P Phenotypic and genetic variations in Diaporte phaseolorum var caulivora the soybean stem canker pathogen Phytopathology v 81 p1205 1992 LEITE J P V RASTRELLI L ROMUSSI G OLIVEIRA A B VILEGAS J H Y VILEGAS W PIZZA C Isolation and HPLC quantitative analysis of flavonoid glycosides from razilian evera es (Maytenus ilici olia and M aqui olium) Journal of Agricultural and Food Chemistry v 49 p 3796-3801 2001 LEONIAN L H A study of the factors promoting pycnidium ndash formation in some Sphaeropsidales American Journal Botanic Columbus v11 p 19-50 1924 LEUCHTMANN A PETRINI O PETRINI LE CARROLL GC Isozyme polymorphism in six endophytic Phyllosticta species Mycological Research Cambridge v96 n 4 p 287-294 1992 LI J Y STROBEL G A Jesterone and hydroxy-jesterone antioomycete cyclohexenone epoxides from the endophytic fungus Pestalotiopsis jesteri Phytochemistry v 57 p 261-265 2001 LIMA O G de COELHO J S de B WEIGERT E DrsquoALBUQUERQUE I L LIMA D de A SOUZA M A de M Substacircncias antimicrobianas de plantas superiores ndash Sobre a presenccedila de maitenina e pristimerina na parte cortical das raiacutezes de Maytenus ilicifolia procedente do Brasil Meridional Revista do Instituto de Antibioacuteticos v 11 n 1 p 35-38 1971 LIU C H ZOU W X LU H TAN R X Antifungal activity of Artemisia annuaendophyte cultures against phytopathogenic fungi Journal of Biotechnology v88 p 277-282 2001 LU H ZOU W X MENG J C HU J TAN R X New bioactive metabolites produced by Colletotrichum sp an endophytic fungus in Artemisia annua Plant Science Oxford v 151 n 1 p 67-73 2000 LU G Z CANNON P F REID A SIMMONS C M Diversity and molecular relationships of endophytic Colletotrichum isolates from the Iwokrama Forest Reserve Guyana Mycological Research v 108 n 1 p 53-63 2004 MAKI C S Diversidade e Potencial Biotecnoloacutegico de Fungos Endofiacuteticos de Cacau Theobroma cacao L Piracicaba 2006 Dissertaccedilatildeo de Doutorado ndash Setor de Agronomia- Geneacutetica e Melhoramento de Plantas Universidade Escola Superior de
115
Agricultura Luiz de Queiroz MANULIS S KOGAN N REUVEN M BEN-YEPHET Y Use of the RAPD technique for identification of Fusarium oxysporum f sp dianthi from carnation Phytopathology v84 p98-101 1993 MARTINS-CORDER M P MELO I S ANTAGONISMO IN VITRO DE Trichoderma spp A Verticillium dahliae KLEB Scientia Agriacutecola v 55 n1 p1-7 1998 MARIANO R L R Meacutetodos de seleccedilatildeo in vitro para o controle microbioloacutegico de patoacutegenos de plantas Revisatildeo Anual de Patologia de Plantas v I p 369-409 1993 McMILLAN JR RT Guignardia citricarpa a cause of black spot on mango foliage in Florida Journal of Phytopathology Berlin v117 p 260-264 1986 McPHERSON M J QUIRKE P TAYLOR G R PCR 1 A pratical approach IRL New York v1 348p 1991 McONIE K C The latent occurrence in citrus and other hosts of a Guignardia easily confused with G citricarpa the citrus black spot pathogen Phytopathology St Paul v 54 p 40-43 1964a McONIE K C Source of inoculum of Guignardia citricarpa the citrus black spot pathogen Phytopathology St Paul v 54 p 64-67 1964b MEIJER G MEGNEGNEAU G LINDERS E G Avariability for isozyme vegetative compatibility and RAPD markers in natural populations of Phomopsis subordinaria Mycological Research v98 n3 p267-276 1994 MEIRA PENNA Dicionaacuterio Brasileiro de Plantas Medicinais 3a Ed Editora Kosmos Rio de Janeiro 1946 MELO I S Agentes microbianos de controle de fungos fitopatogecircnicos In Controle bioloacutegico v I MELO I S e AZEVEDO J L (Eds) Jaguariuacutena SP Embrapa-CNPMA 1998 264p MICHELMORE R W HULBERT S H Molecular markers for genetic analysis of phytopathogenic fungi Annual Review of Phytopathology Palo Alto v 25 p 383-404 1987 MOLLER C WEBER G DREYFUSS M M Intraespecific diversity in the fungal species Chaunopycnis alba implications fo microbial screening programs Journal of industrial microbiology v 17 p 359-372 1996
116
MONTANARI T CARVALHO J E de DOLDER H Effect of Maytenus ilicifolia Martex Reiss on spermatogenesis Contraception v 57 p 335-3391998 MONTANARI T BEVILACQUIA E Effect of Maytenus ilicifolia Mart On pregnant mice Contraception v 65 p 171-1752002 MOSTERT L CROUS P W KANG J PHILLIPS A J L Species of Phomopsis and a Libertella sp occurring on grapevines with specific reference to South Africa morphological cultural molecular and pathological characterization Mycologia v 93 n 1 p 146-167 2001 MULLIS K B F A FALOONA Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction Methods Enzymol v 155 p 335-350 1987 MURALI T S SURYNARAYANAN T S GEETA R Endophytic Phomopsis species Host range and implications for diversity estimates NRC Research Press Canadaacute 2006 NEDASHKOVSKAYA O I VANCANNEYT M KALINOSKAYA N I MIKHAILOV V V SWINGS J Aquimarina intermedia sp nov reclassification of Stanierella latercula (Lewin 1969) as Aquimarina latercula comb nov and Gaetbulimicrobium brevivitae International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2037-2041 2006 NETO P A S AZEVEDO J L ARAUacuteJO W L Microrganismos Endofiacuteticos Interaccedilatildeo com Plantas e Potencial Biotecnoloacutegico Revista Biotecnologia v5 n29 2002 OrsquoDONNELL K GRAY L E Phylogenetc relationships of the soyobean sudden death syndrome pathogen Fusarium solani f sp phaseoli inferred from rDNA sequence data and PCR primers for its identification Molecular Plant Microbe Interact v 8 p 709-716 1995 OKANE I NAKAGIRI A ITO T Endophytic fun i in leaves of ericaceous plants Canadian Journal of Botany v 76 p 657-663 1998 OULLET T SEIFFERT K A Genetic characterization of Fusarium graminearum strains using RAPD e PCR amplification Phytopathology v 83 p 1003-1007 1993 PAAVANEM-HUHTALA S AVIKAINEM H YLI-MATTILA T Development of strain-specific primers for a strain of Gliocladium catenulatum used in bioological control European Journal Plant Pathological Dordrecht v106 n2 p187-198 2000 PANIZZA S Plantas que Curam (Cheiro de Mato) 15deg ed Satildeo Paulo IBRASA 1998 265 p PATEL B N PATEL R C TILVA D G Phyllosticta leaf spot a new disease in Bidi
117
tobacco nursey Tobacco Research Rajahmundry v14 p 1176-1178 1988 PATERSON R R M BRIDGE P D Biochemical techniques for filamentous fungi CAB International 125 p 1994 PARMETER J R An effect of substrate on spore form in Phomopsis Phytopatholog v 48 p 396-397 1958 PENNA E B da S Microrganismos endofiacuteticos de erva-mate (Ilex paraguariensis STHIL) e variabilidade geneacutetica em Phyllosticta sp por RAPD Curitiba 2000 123 f Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Universidade Federal do Paranaacute PETRINI O Taxonomy of endophytic fungi of arial plant tissues In FOKKEMA N J HEUVEL JVAN DEN (Ed) Microbiology of the Phyllosphere Cambrige University Press p 175-87 1986 PETRINI O Fungal endophytes of tree leaves In ANDREWS J H HIRANO S S (Eds) Microbial Ecology of Leaves New York Sprin er-Verla 1991 p 179-197 PETRINI O STONE K CARROLL F E Endophytic fungi in evergreen shrubs in western Oregon a preliminary study Canadian Journal of Botany v 60 p 789-796 1982 PHILLIPS A J L The plant pathogenic genus Phomopsis and its teleomorph (Diaporthe) Development and application of morphological biological and phylogenetic species concepts Disponiacutevel em lthttpwwwcremfctunlptbotryosphaeria_sitepersonal_web_pagehtmgt Acesso em Dezembro de 2006 PILEGGI S A V Isolamento e Caracterizaccedilatildeo de Microrganismos Endofiacuteticosde Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss por Meio de Marcadores RAPD eseu Potencial Farmacoloacutegico Curitiba 2006 Dissertaccedilatildeo de Doutorado - Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade Federal do Paranaacute PIOLI R N MORANDI E N MARTIacuteNEZ M C LUCCA F TOZZINI BISARO V HOPP H E Morphologic molecular and pathogenic characterization of diaporthe phaseolorum variability in the core soybean ndash Producing Aacuterea of Argentina Phytopathology v 93 n2 p136-146 2003 PONTECORVO G ROPER J A HEMMOS LM MAC DONALD K D BUFTON A W J The genetics of Aspergillus nidulans Advances in Genetics v 5 p141-238 1953 PONS N Estudio taxonomico de especies de Phoma y Phyllosticta sobre cantildea de azucar (Saccharum sp) Fitopatologia Venezolana Maracay v 3 p 34-43 1990
118
PROMPUTTHA I JEEWON R LUMYONG S MCKENZIE E H C HYDE K D Ribosomal DNA fingerprinting in the identification of non sporulating endophytes from Magnolia liliifera (Magnoliaceae) Fungal Diversity v 20 p 167-186 2005 QUIROGA E N SAMPIETRO A R VATTUONE M Screening antifungal activitis of selected medicinal plants Journal of Ethnopharmacology v 74 p 89-96 2001 RAEDER U BRODA P Rapid preparation of DNA from filamentous fungi Letters in Applied Microbiology Oxford v1 p17-20 1985 REHNER S A UECKER F A Nuclear ribosomal internal transcribed spacer phylogeny and host diversity in the coelomycete Phomopsis Canadian Journal of Botanic v 72 p1666-1674 1994 RIBEIRO L A de Variabilidade Geneacutetica por RAPD em fungos endoacutefitos de Gecircnero Penicillium provenientes de Zea mays L Curitiba 1995 90 f Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Universidade Federal do Paranaacute RIEDL H WECHTL E Proposal to conserve the name Phomopsis (Sacc) Bubak (1905) against Myxolibertella Hohnel (1903) Taxon v 30 n 4 p 826-828 1981 ROBES C F A mancha preta dos fungos ciacutetricos (Phyllosticta citricarpa) ameaccedila a citricultura paulista Laranja Cordeiroacutepolis v 11 p 75-86 1990 ROBES C F BITTENCUCOURT S M A mancha preta dos frutos um dos fatores limitantes agrave produccedilatildeo citricola do estado do Rio de Janeiro Comunicado Teacutecnico ndash CTAA-EMBRAPA n 19 p 1-5 1995 RODRIGUES K F SAMULES G J Fungal endophytes of Spondias mombin in Brazil a preliminary study Journal of Basic Microbiology v 39 p 131 ndash 135 1999 RODRIGUES KF HESSE M WERNER C Antimicrobial activities of secondary metabolites produced by endophytic fungi from Spondias mombin Journal of Basic Microbiology v 40 n 4 p 261-267 2000 RODRIGUES-HEERKLOTZ KF DRANDAROV K HEERKLOTZ J HESSE M WERNER C Guignardia Acid a Novel Type of Secondary Metabolite Produced by the Endophytic fungus Guignardia sp Isolation Structure Elucidation and Asymmetric Synthesis Helvetica Chimica Acta v 84 p 3766-3772 2001 RODRIGUES K F SIEBER T N GRUumlNIG R C HOLDENRIEDER O Characterization of Guignardia mangiferae isolated from tropical plants based on morphology ISSR-PCR amplifications and ITS1-58S-ITS2 sequences Mycological
119
Research Cambridge v 108 p 45-52 2004 RODRIGUES K F COSTA G L CARVALHO M P EPIFANIO R A Evaluation of extracts produced by some tropical fungi as potential cholinesterase inhibitors Journal of Microbiology and Biotechnology v21 p1617-1621 2005 RODRIGUES M B C Controle de Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta dos Citros Piracicaba 2006 67 p Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo ROHLF F J NTSYS-PC Numerical taxonomy and multivariate analysis system New York Exeter Publishing 1988 RUBINI M R SILVA-RIBEIRO R T POMELLA A W V MAKI C S ARAUacuteJO W L SANTOS D R AZEVEDO J L Diversity of endophytic fungal community of cacao (Theobroma cacao L) and biological control of Crinipellis perniciosa causal agent of Witches Broom Disease International journal of Biological Sciences v 1 n 1 p 24-33 2005 SAIKI R K SCHARF S J FALOONA F MULLIS K B HORN G T ERLICH H A ARNHEIM N Enzymatic amplification of β-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia Science v 230 p1350-1354 1985 SAMPAIO J P FELL J W GADANHO M BAUER R Kurtzmanomyces insolitus sp nov a new anamorphic heterobasidiomycetous yeast species Systematic and Applied Micorbiology v 22 p 619-625 1999 SAMUELES G J SEIFERT K A The impact of molecularcharacters on systematics of filamentous ascomycetes Annual Review of Phytopathogy Palo Alto v 33 p 37-67 1995 SANGER F NICKLEN S COULSON A R DNA Sequencing with chain terminating inhibitors Proceedings of the National Academy of Sciences of the United states of America Washington v 74 p 5463-5467 1977 SANTOS MF Anaacutelise da micoflora associada ao baru (Dipteryx alata Vog) e a caroba (Cybistax antisyphilitica (Mart) Mart) BrasiacuteliaDF 1996 Dissertaccedilatildeo de Mestrado Universidade Nacional de Brasiacutelia SATOKO K MINAKA N KOBAYASHI T KUDO A OHTSU Y Molecular Phylogenetic Analysis of Ribosomal DNA Internal Transcribed Spacer Regions and Comparison of Fertility in Phomopsis Isolates from Fruit Trees Plant Pathology v 66 p 191-210 2000
120
SCHULZ B BOYLE C DRAEGER S ROumlMMERT A KROHN K Endophytic fungi a source of novel biologically active secondary metabolites Mycological Research Cambridge v 106 p 996-1004 2002 SCHULZ B BOYLE C The endophytic continuum Mycological Research Cambridge v 109 p 661-686 2005 SETTE L D PASSARINI M R Z DELARMELINA C SALATI F DUARTE M C T Molecular characterization and antimicrobial activity of endophytic fungi from coffee plants World Journal of Microbiology and Biotechnology v 22 p 1185-1195 2006 SHIROTA O MORITA H TAKEYA K ITOKAWA H ITAKA YCytotoxic aromatic triterpenes from Maytenus ilicifolia and Maytenus chuchuhuasca Journal of Natural Products v 57 p 1675-1681 1994 SHIVAS R G ALLEN J G WILLIAMSON P M Infraspecific variation demonstrated in Phomopsis leptostromiformis using cultural and biochemical techniques Mycological Research Cambridge v 95 p 320-323 1991 SHRESTHA K STROBEL G A PRAKASH S GEWALI M Evidence for paclitaxel from three new endophytic fungi of Himalayan yew of Nepal Planta Medicinal v 67 p 374-376 2001 SILVA C G RECIO R A OLIVEIRA A B de PAIVA R L R Coleta e avaliaccedilatildeo da qualidade fitoquiacutemica de Maytenus ilicifolia M (espinheira-santa) Tribuna Farmacecircutica v 5759 p 46-50 1991 SILVA F A S The ASSISTAT Software statistical assistance In INTERNATIONAL CONFERENCE ON COMPUTERS IN AGRICULTURE 6 Anais Cancun American Society of Agricultural Engineers p 294-298 1996 SILVA F de A S AZEVEDO C A V de Versatildeo do programa computacional Assistat para o sistema operacional Windows Revista Brasileira de Produtos Agroindustriais Campina Grande v 4n 1 p 71-78 2002 SILVA G H TELES H L TREVISAN H C BOLZANI V S YOUNG M C M PFENNING L H EBERLIN M N HADDAD R COSTA-NETO C M ARAUacuteJO A R New Bioactive Metabolites Produced by Phomopsis cassiae an Endophytic Fungus in Cassia spectabilis Journal Brasileiro Chemical Society v16 n6 p 1463-1466 2005 SILVA R L DE O LUZ J S SILVEIRA E B CAVALCANTE T Fungos endofiacuteticos em Annona spp isolamento caracterizaccedilatildeo enzimaacutetica e promoccedilatildeo do crescimento em mudas de pinha (Annona squamosa L) Acta Botanica Brasilica v
121
20 n 3 p 649-655 2006 SILVEIRA EB 2001 Bacteacuterias promotoras de crescimento de plantas e biocontrole de doenccedilas Pp 71-100 In R Barros e SJ Michereff Proteccedilatildeo de plantas na agricultura sustentaacutevel Recife Imprensa Universitaacuteria da UFRPE SIMOtildeES C M O MENTZ L A SCHENKEL E P IRGANG B E STEHMANN J R Plantas da medicina popular no Rio Grande do Sul Porto Alegre Editora da UniversidadeUFRGS 174p 1986 SIVANESAN A The bitunicate ascomycetes and their anamorphs J Cramer Germany 701p 1984 SNEATH P H A SOKAL R R Numerical Taxonomy W H freeman Co San Francisco 1973 SOUZA FORMIGONI M L OLIVEIRA M G MONTEIRO M G DA SILVEIRA FILHO N G BRAZ S CARLINI E A Antiulcerogenic effects of two Maytenus species in laboratory animals Journal of Ethnopharmacology v 34 n 1 p 21-27 1991 SOUZA A Q L SOUZA A D L SPARTACO A F PINHEIRO M L B SARQUIS M I M PEREIRA J O Atividade antimicrobiana de fungos endofiacuteticos isolados de plantas toacutexicas da Amazocircnia Palicourea longiflora (aubl) rich e Strychnos cogens bentham Acta Amazocircnica v 34 n 2 p 185-195 Manaus 2004 SPOacuteSITO MB AMORIM L BASSANEZI RB BERGAMIN FILHO A HAU B Spatial pattern of black spot incidence within citrus trees related to disease severity and pathogen dispersal Plant Pathology p 103-108 2008 STAMFORD T L M ARAUacuteJO J M STAMFORD N P Atividade enzimaacutetica de microrganismos isolados do Jacatupeacute (Pachyrhizus erosus L Urban) Ciecircncia Tecnoloacutegica de Alimentos v 18 p 382-385 1998 STIERLE A STROBEL G STIERLE D GROTHAUS P BIGNAMI G The search for a taxol-producin microor anism amon the endophytic fun i of the Pacific yew Taxus bre i olia Journal of Natural Products v 58 n 9 p 1315-1324 1995 STINSON M ERZA D HESS W M SEARS J STROBEL G An endophytic Gliocladium sp Of Eucryphia cordifolia producing selective volatile antimicrobial compounds Plant Science St Paul v165 p 913-922 2003 STROBEL A G Rainforest Endophytes and Bioactive Products Critical Reviews in Biotechnology Boca Raton v 22 n 4 p 315-333 2002
122
STROBEL G A Endophytes as sources of bioactive products Microbes and Infection v 5 p 535-544 2003 STROBEL G DAISY B Bioprospecting for Microbial Endophytes and their Natural Products Microbiology and Molecular Biology Reviews v 67 n 4 p 491-502 2003 SUGHA SK SINGH BM SHARMA BM Studies on Phyllosticta glumarum causing glume blight of rice (Oryza sativa L) Himachal Journal of Agricultural Research Palampur v 12 n 1 p 11-14 1986 TAYLOR-ROSA S G BARROS I BCaracterizaccedilatildeo das sementes de Maytenus ilicifolia Mart Ex Reiss espinheira - santa e viabilidade de sua propagaccedilatildeo sexuada Porto Alegre 1994106f Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Universidade Federal do Rio Grande do Sul THOMPSON J D HIGGINS D G GIBSON T J Clustal W Improving the sensitiviy of rogressive multiple alignment through sequence weighting positions-specific gap penalties and weight matrix choice Nucleic Acids Research v 22 p 4673-4680 1994 TIMNICK MB LILLY VG BARNETT HL Factors affeting sporulation of Diaporthe phaseolorum var batatatis from soybean Phytopathology St Paul v 41 n 4 p 327-336 1951 UECKER F A A World list of Phomopsis names with notes on nomenclature morphology and biology National Fungus Collection v 13 1988 VAN DER AA H A Studies in Phyllosticta I Studies in Mycology n 5 1973 VAN DER AA H A M E Noordeloos and J de Gruy-ter Species concepts in some larger genera of the Coelomycetes Studies in Mycology v 32 p 3-19 1990 VASCONCELOS MJV ALMEIDA MA HENNING AMR BARROS AA MOREIRA EG Differentiation of Colletotrichum truncatum isolates by random amplified polymorphic DNA Fitopatologia Brasileira Brasiacutelia v 19 p 520-523 1994 VELICHETI R K McCCLARY C LAMISON R D SINCLAIR J B Immunodetection of the Diaporthe and Phomopsis complex of soybeans Phytopathology v 81 p 1212 1991 VIDIC M Variability in Diaporthe phaseolorum var caulivora on soybean in the Vojvodina Providence in Serbia Zastita Bilja v 42 p 183-189 1991
123
VILARINHOS A D PAULA JR T J BARROS E G MOUREIRA M A Characterization of races of Colletotrichum lindemutianum by the random amplified polymorfic DNA technique Fitopatologia Brasileira Brasiacutelia v20 p194-198 1995 VILLA- CARVAJAL M COQUE J J R ALVAREacuteZ-RODRIGUEacuteZ M L URUBURU F BELLOCH C Polyphasic identication of yeasts isolated from bark of cork oak during the manufacturing process of cork stoppers FEMS Yeast Research v 4 p 745-750 2004 VIRET O PETRINI O Colonization of eech leaves (Fagus syl atica) by the endophyte Discula umbrinella (teleomorph Apiognomonia errabunda) Mycological Research v 98 p 423-432 1994 WAGENAAR M CORWIN J STROBEL G A CLARDY J Three new chytochalasins produced by an endophytic fungus in the genus Rhinocladiella Journal Natural Products v 63 p1692-1695 2000 WALKER M R RAPLEY R Guia de rotas na tecnologia do gene Atheneu Satildeo Paulo 1999 334p WANG J Li G LU H ZHENG Z HUANGY SU W Taxol from Tubercularia sp strain TF5 an endophytic fungus of Taxus mairei FEMS Microbiology Letters v 193 p 249-253 2000 WATSON J D GILMAN M WITKOSWSKI J ZOLLER M Recombinant DNA 2 ed New York Freeman and Company 1992 WELSH J McCLELLAND M Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers Nucleic Acid Research Oxford v 18 p 7213-7218 1990 WHITE Jr J MORROW A C Endophyte-host associations in forage grasses XII A fungal endophyte to Trichachne insularis belonging to Psedocercosporella Mycologia Lawrence v 78 n 5 p 846-850 1989 WHITE Jr J F MORROW A C Endophyte-host associations in forage grasses XII A fungal endophyte of Trichachne insularis belonging to Pseudocercosporella Mycologia Lawrence v 82 p 218-226 1990 WHITE Jr J F MORGAN-JONES G MORROW AC Taxonomy life cycle reprodution and detection of Acremonium endophytes Agriculture Ecosystem amp Environment v 44 p13-37 1993 WILLIAMS J G K KUBELIK A R LIVAK K J RAFALSKI J A TINGER S V DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers Nucleic Acids Research v 18 n 22 p 6531-6535 1990
124
WILLIAMS J G K HANAFEY M K RAFALSKI J A TINGEY S V Genetic analysis using random amplifield polymorphic DNA markers Methods in Enzymology San Diego v 218 p 704-740 1993 ZHANG A W RICCIONI L PEDERSENW L KOLLIPARA K P HARTMAN G L Molecular identi-fication and phylogenetic grouping of Diaporthe phaseolorum and Phomopsis longicolla isolates from soybean Phytopathology v 88 p1306 -1314 1998 ZOU W X MENG J C LU H CHEN G X SHI G X ZHANG T Y TAN R X Meta olites of Colletotrichum gloeosporioides an endophytic fun us in Artemisia mongolica Journal of Natural Products v 63 n 11 p 1529-1530 2000 ZOU W X TAN R X Endophytes a rich source of functional metabolites Natural Product Reports v18 p 448-459 2001
125
ANEXOS
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 496671024 9933420 94396 MEIOS DE CULTURA 2 137912854 68956427 655287 INTERACcedilAtildeO A 100 193198257 1931983 18359 INTERACcedilAtildeO b 100 10989107 0109891 1044 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
INTERACcedilAtildeO A INTERACcedilAtildeO ENTRE OS MEIOS DE CULTURA E OS ISOLADOS de Phomopsis INTERACcedilAtildeO B INTERACcedilAtildeO ENTRE AS REPETICcedilOtildeES DOS ISOLADOS DE Phomopsis significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS ENTRE OS MEIOS DE CULTURA
BDA 5169935 a MEA 4973856 b AV 3921569 c
CV = 62
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 1 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM DIFERENTES MEIOS DE CULTURA
126
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 230248366 4604967 43761 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS ESBA1 700 a A323 700 a A215A 700 a ESSD1 700 a SM9713 700 a ESGF1 700 a SM9631 700 a ESJD1 700 a ESKD1 667 a A334 667 a ESDF1 633 b A132 633 b A123 600 b A333A 600 b MU0123 600 b ESJH1 600 b A321 600 b ESRD1 600 b A116 600 b A134 567 b A115B 567 b ESIA1 533 c
ANEXO 2ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO BDA
127
A131 500 c SM9714 500 c A135 500 c ESIE1 500 c ESFB2 500 c A124 500 c ESPAC22 500 c ES2KF1 500 c A113 500 c ESJE1 500 c ESJE2 433 d ESFH1 400 d ESJG1 400 d ES2WC1 400 d PHO1 400 d SM9638 400 d ES2NA1 400 d ES2AB1 400 d ESFF1 400 d AT9811 400 d AT9810 400 d ES2WF1 400 d A126 400 d PHO19 400 d A216B 400 d ES80J 367 d ESGA1 367 d AT9906 300 e A333B 233 f
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
128
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 189058824 3781176 35932 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS ESKD1 700 a ESJE2 600 b A123 600 b ESJE1 533 c SM9638 500 c AT9811 500 c SM9713 500 c PHO1 500 c ESBA1 500 c SM9631 500 c ESFB2 500 c A334 500 c A323 500 c MU0123 500 c A333A 433 d ESJD1 433 d ESGF1 433 d A116 433 d PAC22 400 e ESDF1 400 e A321 400 e A132 400 e ES2KF1 400 e
ANEXO 3ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO AVEIA
129
ESJG1 400 e ESRD1 400 e PHO19 400 e A115B 400 e A124 400 e ESFF1 367 e A134 367 e ESIE1 367 e A135 367 e A131 367 e A113 367 e ES2WF1 367 e SD1 367 e ESIA1 333 e ESGA1 300 f ESJH1 300 f ESFH1 300 f AT9906 300 f ES2NA1 300 f A216B 300 f ES80J 300 f ESA215A 267 f AT9810 200 g A333B 200 g ES2AB1 200 g SM9714 200 g ES2WC1 200 g
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
130
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 270562092 5411242 51423 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS A323 733 a SM9631 700 a ESKD1 700 a A134 700 a ESIE1 700 a A116 667 b A334 667 b A215A 633 b ESSD1 633 b A321 600 c MU0123 600 c ESGF1 600 c ESRD1 600 c AT9811 600 c SM9713 600 c A123 600 c ESJH1 600 c ESDF1 600 c A131 567 c IA1 567 c ESBA1 567 c ESJD1 567 c A333A 533 d A135 500 d
ANEXO 4ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO MEA
131
ES2NA1 500 d A124 500 d A132 500 d SM9714 500 d ESFB2 500 d A115B 467 e ES2AB1 433 e A216B 433 e A113 433 e PHO1 400 f SM9638 400 f ES2WF1 400 f A126 400 f ESJE1 400 f ESPAC22 400 f ESFF1 400 f ES2KF1 400 f ESJG1 367 f ES80J 367 f ESJE2 333 g ESFH1 333 g AT9906 300 g ESGA1 300 g SM9810 300 g ES2WC1 300 g A333B 233 h PHO19 233 h
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
132
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 46 1602192500 34089202 1617590 RESIacuteDUO 432 91040000 210741 Total 478 1693232500
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO AT9906 352 a AT9810 353 a ESFH1 297 b ESPAC22 195 c ES2KF1 194 c SM9631 193 c ESGA1 184 cd PHO19 184 cd ES80J 166 de ESRD1 152 ef ESFB2 143 efg ESJE2 142 efg ESJE1 142 efg ESJG1 131 fgh A323 127 fghi A333A 126 ghij A135 123 ghij A124 123 ghij A126 123 ghij A132 123 ghij A131 123 ghij A134 123 ghij
ANEXO 5 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO DOS ESPOROS BETACONIacuteDIOSDOS ISOLADOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA
133
A115B 123 ghij ESIE1 123 ghij ES2WC1 119 ghil ES2WF1 119 ghil SM9713 116 hil A334 116 hil ESIA1 115 hil A333B 113 hil ESFF1 113 hil ESGF1 111 hil ES2AB1 107 him A123 107 him A113 107 him ESJD1 106 him ESKD1 105 im ES2NA1 104 im A215A 103 im SM9714 102 im ESSD1 101 m ESJH1 97 m MU0123 96 m A321 96 m ESDF1 95 m A216B 95 m A116 85 m
DMS = 259444 CV = 1052904
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
134
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 21 2674219 127344 459861 RESIacuteDUO 88 243688 002769 Total 109 2917907
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 293 a Fungicida Derosal 236 b ESGF1 157 c ESGA1 137 cde ESFH1 134 cdef ESIA1 120 cdefg ES2KF1 119 cdefgh ESFF1 146 cdefgh ES2NA1 111 defgh ES2AB1 110 defgh ESKD1 114 defgh ESJE2 110 defgh ESBA1 112 defgh ESRD1 098 efgh ESJG1 099 efgh ESJE1 099 efgh ESFB2 096 fgh ESJH1 094 gh ESJD1 093 gh ESIE1 095 gh ESSD1 078 h ESDF1 078 h
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 6 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
DMS = 039023 CV = 1340825
135
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 9 974154 108239 225325 RESIacuteDUO 40 192148 004804 Total 49 1166302
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 201 a
fungicida 174 ab AT9906 139 bc AT9810 117 cd AT9811 102 cde SM9638 110 cde SM9714 076 de SM9631 075 de MU0123 067 e SM9713 065 e
DMS = 046460 CV = 1946824
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 7 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
136
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 22 2382133 108279 239352 RESIacuteDUO 92 416192 004524 Total 114 2798325
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 244 a ES2WC1 237 a fungicida 185 b ES80J 138 bc A333B 136 cd ES2WF1 117 cde A333A 113 cde A132 110 cde A215A 106 cde A116 102 cde A124 101 cde A115B 101 cde A135 100 cde A215B 097 cde A321 094 cde A334 093 cde A323 092 cde A123 091 cde A113 091 cde A126 089 de A131 088 e ESPAC22 085 e A134 076 e
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 8 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
DMS = 050157 CV = 1809416
137
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA
FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 6210037 124201 165056 RESIacuteDUO 204 1535052 007525 Total 254 7745089
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 302 a FUNGICIDA Derosal 244 abc ES2WC1 277 ab AT9906 224 bcd AT9810 222 bcde SM9638 218 bcdef ESGF1 201 cdefg A333B 188 cdefgh A132 167 defghi SM9714 159 defghij ESFF1 153 efghil ES2WF1 150 fghil ESGA1 149 fghil ESFH1 147 ghil ES80J 147 ghil MU0123 144 ghil ES2NA1 143 ghil AT9713 142 ghim A321 141 ghim A216B 140 ghim AT9811 139 ghim A116 137 ghim
ANEXO 9 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305
138
ESBA1 134 ghim ES2AB1 133 ghim A323 132 ghin ESJG1 131 ghin ESIE1 130 hin A333A 129 hin A113 127 hin A134 125 hin ESSD1 122 hin ESKD1 121 hin ESIA1 117 in A124 113 in A334 112 in ES2KF1 112 in ESJE1 110 in ESPAC22 108 in A131 108 in A126 106 in A135 102 in ESRD1 094 n SM9631 093 n ESJE2 090 n ESJH1 090 n ESFB2 088 n ESJD1 087 n A123 087 n ESDF1 086 n A115B 072 n A215A 062 n
DMS = 070465 CV = 1983267
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
139
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 28 2145366 076620 407144 RESIacuteDUO 116 218300 001882 Total 144 2363666
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 222 a ESRD1 19 b A131 176 b ESIA1 178 b SM9713 162 bc ESJD1 162 bc A126 154 bcd MU0123 149 bcde A333A 134 cdef ESGA1 134 cdef A113 133 cdef ESGF1 130 cdef A334 130 cdef ESBA1 140 cdef SM9638 127 def ESJH1 119 efg ESDF1 115 fgh ESSD1 112 fgh ESKD1 113 fgh ES2AB1 111 fghi A124 111 fghi
ANEXO 10 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 PARA DETECCcedilAtildeODE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
140
A215A 109 fghi A321 108 fghi A134 089 ghij A115B 082 hij ESFF1 078 ij ESFH1 071 l A123 062 l ES2WF1 042 l
DMS = 033193 CV = 1095343
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
141
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA
FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 28 11264938 402319 481124 RESIacuteDUO 116 970000 008362 Total 144 12234938
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 422 a ESGA1 275 b ESGF1 267 bc ESBA1 265 bc SM9713 261 bc A333A 251 bcd ESSD1 235 bcde MU0123 234 bcde ESKD1 211 bcdef A215A 203 cdef A321 188 defg A131 173 efgh SM9638 167 efgh A124 148 fghi ESJD1 147 fghi A113 130 ghij ESIA1 122 ghij ES2AB1 128 ghij ESDF1 124 ghij A334 112 hij A115B 106 hij
ANEXO 11 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 PARA DETECCcedilAtildeODE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
142
ESRD1 104 hij ES2WF1 086 il A134 083 il A126 080 il ESFF1 075 l A123 065 l ESFH1 025 l ESJH1 017 l
DMS = 069970 CV = 1193907
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
43
ANE
XO
12
ndash M
ATR
IZ D
E D
AD
OS
PA
RA
CA
RA
CTE
RIZ
ACcedil
AtildeO
CR
ITEacuteR
IOS
ME
DID
AS
ME
IOS
DE
C
ULT
UR
A
MU
0123
SM
9631
SM
9638
SM
9713
SM
9714
AT9
810
AT9
811
AT9
906
ES
2AB
1
ES
2KF1
ES2N
A1
ES2W
C1
ES2W
F1
ES
80J
ESBA
1
ESD
F1
ES
FB2
ES
FF1
ESFH
1
ES
GA
1
ESG
F1
ESIA
1
ESIE
1
ESJD
1
ESJE
1
ESJE
2
1 AV 1 0 1 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 MEA 0 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 BDA 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 1 1 0
2 AV 1 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1 1 1 3 AV 0 0 0 0 1 0 0 1 1 1 0 1 0 0 0 1 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 4 AV 1 0 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
MEA 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
5 AV 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
6 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0 BDA 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1
7 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 BDA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0
8 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 0 0 0
9 AV 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 1 BDA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1
10 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 MEA 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1
11 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
12 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
13 AV 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 MEA 0 0 1 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 1 0 1 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0
14 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 1 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 0
44
BDA 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 15 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0
16 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 0
17 AV 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 1 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0
18 AV 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 MEA 0 1 0 0 1 0 1 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 BDA 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1
19 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0
20 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21 AV 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 0 1 0 1 1 1 0 0 1 1 1 1
MEA 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 0 BDA 1 1 0 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0
22 AV 1 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
23 352 a 353μM BDA 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 297 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0
195 a 193 μM BDA 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 184 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 166 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 152 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
143 a 142 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 131 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 127 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
126 a 123 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 119 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
116 a 111 μM BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 107 a 106 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 105 a 102μM BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
97 a 85μM BDA 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24 733 a 700cm MEA 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0
677 a 633 cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 600 a 567 cm MEA 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 533 a 500cm MEA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
45
467 a 433cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 400 a 367cm MEA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 333 a 300cm MEA 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1
233cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 700 a 667cm BDA 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 633 a 567cm BDA 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 433 a 367cm BDA 0 0 1 0 0 1 1 0 1 0 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 1
300cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 233cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 700cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
600cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 533 a 500cm AV 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 433cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 400 a 333cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 300 a 267cm AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 200cm AV 0 0 0 0 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
CR
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1
ES
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1
A131
A126
A123
A323
A113
A334
A321
A216
B
A135
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B
A124
A116
A215
A
A132
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A
A333
B
A134
P l
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PH
O19
1 AV 0 0 1 1 0 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 0 0 MEA 0 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 1 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 BDA 0 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 1 1 0 1 0 1 1 1 0 0 0 0 0
2 AV 0 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 3 AV 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 4 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1
MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 BDA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1
5 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0
6 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 0 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 0 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1
7 AV 1 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0
46
MEA 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 BDA 0 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0
8 AV 0 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 MEA 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1 BDA 0 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1
9 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 MEA 0 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0 BDA 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0
10 AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
11 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
12 MEA 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0
13 AV 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 0 1 1 1 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 1 1
14 AV 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 1 0 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 0 BDA 0 1 0 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0 1 0 1 0 1 0
15 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0
16 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
17 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 MEA 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 BDA 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0
18 AV 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 0 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0 1 1 BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
19 AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 BDA 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0
20 ESP 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 21 AV 1 1 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1
MEA 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1 0 1 1 0 0 1 BDA 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 0
22 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1
47
BDA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 23 352 a 353μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
297 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 195 a 193 μM BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
184 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 166 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 152 μM BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
143 a 142 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 131 μM BDA 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 127 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
126 a 123 μM BDA 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 1 1 0 1 0 0 119 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
116 a 111 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 107 a 106 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 105 a 102μM BDA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0
97 a 85μM BDA 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 24 733 a 700cm MEA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0
677 a 633 cm MEA 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 600 a 567 cm MEA 0 1 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 467 a 433cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 400 a 367cm MEA 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 333 a 300cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
233cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 700 a 667cm BDA 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 633 a 567cm BDA 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 1 1 0 1 0 0 533 a 500cm BDA 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 433 a 367cm BDA 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1
300cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 233cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 700cm AV 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
600cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 433cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 400 a 333cm AV 1 0 0 1 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 1 300 a 267cm AV 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 200cm AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0
Nota - Caracteriacutestica avaliada nos trecircs meios As caracteriacutesticas foram avaliadas seguindo os seguintes criteacuterios
48
1 Bordos da colocircnia regular (1) ou irregular (0) 2 Miceacutelio denso 3 Miceacutelio ralo 4 Miceacutelio granuloso aeacutereo 5 Miceacutelio algodonoso 6 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Branco 7 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Marrom 8 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Cinza 9 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Verde 10 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Amarelo 11 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Bege 12 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Preto 13 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Branco 14 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Marrom 15 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Preto 16 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Cinza 17 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Verde 18 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Amarelo 19 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Bege 20 Esporulaccedilatildeo com esporulaccedilatildeo (1) sem esporulaccedilatildeo (0) 21 Coniacutedio do tipo alfa 22 Coniacutedio do tipo beta 23 Comprimento dos coniacutedios do tipo beta 24 Diacircmetro meacutedio do crescimento das colocircnias
49 ANEXO 13 LOCAL DA COLETA DE FOLHAS DE Schinus terebinthifoliusCENTRO POLITEacuteCNICO ndash CURITIBAPR
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dentro e fora do laboratoacuterio Assim como pelas excelentes ideacuteias que muito contribuiacuteram
neste trabalho
Aos alunos de Poacutes-graduaccedilatildeo do LabGeM Jociney Josiele Josiane em
especial a Danyelle e Juliana pela amizade e cooperaccedilatildeo no desenvolvimento deste
trabalho
Ao doutorando Rafael Noleto do Laboratoacuterio de Citogeneacutetica Animal pelo
auxiacutelio no desenvolvimento deste trabalho
Aos amigos do LabGeM pela agradaacutevel convivecircncia e ajuda nos momentos
mais difiacuteceis Andreacute Carol Andrade Carol Silvano Douglas Flaacutevia Fernanda Larice
Lisiane Lucinir Maysa Patriacutecia Rosana e Taciana
Agrave amiga Izolde Gartner pela ajuda e disponibilidade
Agrave Anilda Gomes da Silva pelo eventual auxiacutelio teacutecnico na SEAD
Agrave Luciana Marques secretaacuteria do Programa de Poacutes-Graduaccedilatildeo em Geneacutetica
pelas orientaccedilotildees e informaccedilotildees
Aos meus pais Gislene Rodrigues Gomes e Raimundo de Andrade Gomes por
terem ensinado a buscar meus ideais e pelo esforccedilo e compreensatildeo em manterem-se
distantes todos esses anos que dediquei aos estudos
Ao meu companheiro Helder Franklin pela compreensatildeo o carinho e pela sua
admiraacutevel placidez sobretudo ao apoio e contribuiccedilatildeo para a realizaccedilatildeo deste ideal
Aos meus amigos e familiares pelo carinho compreensatildeo e incentivo nesse
periacuteodo de ausecircncia Sobretudo pelos exemplos de dedicaccedilatildeo e respeito ao proacuteximo
Agrave minha amiga Hafiza pelos conselhos compreensatildeo incentivo paciecircncia e
apoio
ldquoDe tudo ficaram trecircs coisas
A certeza de que estamos sempre comeccedilando
A certeza de que precisamos continuar
A certeza de que seremos interrompidos antes
de terminar
Portanto devemos
Fazer da interrupccedilatildeo um caminho novo
Da queda um passo de danccedila
Do medo uma escada
Do sonho uma ponte
Da procura um encontrordquo
(Fernando Pessoa)
RESUMO Phomopsis spp ENDOacuteFITOS DE PLANTAS MEDICINAIS DIVERSIDADE GENEacuteTICA E ANTAGONISMO AO FUNGO Guignardia citricarpa Autora Renata Rodrigues Gomes Orientadora Chirlei Glienke Microrganismos endofiacuteticos vivem no interior das plantas sem causar dano ao seu hospedeiro podendo produzir compostos biologicamente ativos antibioacuteticos fungicidas e herbicidas Essa comunidade endofiacutetica pode estar relacionada com a accedilatildeo antimicrobiana de plantas medicinais A planta Maytenus ilicifollia conhecida como espinheira-santa eacute uma planta medicinal muito utilizada no tratamento de uacutelceras gaacutestricas e tratamentos digestivos tiacutepica da Ameacuterica do Sul em especial da regiatildeo Sul do Brasil e atualmente encontra-se ameaccedilada de extinccedilatildeo As plantas medicinais Spondias mombin Myracrodruon urundeuva Schinus terebinthifolius e Aspidosperma tomentosun tecircm sido usadas na medicina devido as suas propriedades antimicrobianas No presente trabalho foram isolados fungos endofiacuteticos do gecircnero Phomopsis e avaliados quanto a sua variabilidade geneacutetica e estrutura populacional por meio de marcadores RAPD Observou-se que as plantas medicinais analisadas satildeo colonizadas por grande diversidade de espeacutecies de Phomopsis com grande variabilidade morfoloacutegica e geneacutetica intra e interespeciacuteficas Os isolados foram identificados por meio de sequumlecircncias das regiotildees ITS1 58S e ITS2 do DNA ribossomal e testados quanto ao potencial antimicrobiano contra as linhagens PC1396 e PC3305 de Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta do Citros Foi possiacutevel identificar nove isolados em niacutevel de espeacutecie por meio de sequumlecircncias ITS do rDNA sendo 4 como P michaeliae 2 como P theicola 2 como P longicolla e 1 como P sojae Foi possiacutevel verificar que as plantas de Maytenus ilicifolia analisadas satildeo colonizadas endofiticamente por pelo menos dez espeacutecies de Phomopsis e as plantas de Schinus terebinthifolius por pelo menos seis espeacutecies deste gecircnero As anaacutelises morfoloacutegicas por meio de marcadores RAPD e sequenciamento de ITS do rDNA permitem sugerir que as espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo satildeo hospedeiro-especiacuteficas sendo necessaacuteria a redefiniccedilatildeo do conceito de espeacutecie para este gecircnero Na anaacutelise antimicrobiana todos os isolados apresentaram grande potencial no controle in vitro do fungo G citricarpa destacando-se os isolados ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ES2AB1 (Phomopsis sp S6) ES2WF1 (Phomopsis sp S4) e ESFH1 (P theicola) que inibiram o crescimento das linhagens PC1396 e PC3305 de G citricarpa em trecircs metodologias avaliadas Desta forma esse estudo indica que os isolados de Phomopsis spp endoacutefitos de plantas medicinais satildeo produtores de substacircncias bioativas que devem ser melhor caracterizadas Palavras chaves Phomopsis spp endoacutefitos plantas medicinais RAPD sequumlecircncias da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
ABSTRACT Phomopsis spp ENDOPHYTES OF MEDICINAL PLANTS GENETIC DIVERSITY AND ANTAGONISM IN THE FUNGUS Guignardia citricarpa Author Renata Rodrigues Gomes Adviser Chirlei Glienke-Blanco Endophytic microorganisms live in plants without causing damage to their host being able to produce active biological compounds antibiotics fungicides and herbicides This endophytic community may be related to the antimicrobial action of medicinal plants The plant Maytenus ilicifolia known as ldquoespinheira santardquo is a medicinal plant greatly used for the treatment of stomach ulcers and digestive problems typical from the South America especially in the southern part of Brazil and currently is in danger of extinction The medicinal plants Spondias mombin Myracrodruon urundeuva Schinus terebinthifolius and Aspidosperma tomentosun have been used in medicine due to their antimicrobial properties In the present work endophytic fungi of the genus Phomopsis were isolated and their genetic variability and population structure assessed using RAPD markers The medicinal plants analyzed are colonized by a great variety of Phomopsis species with a high morphological and genetic variability both intra and interspecific The isolated fungi were identified through sequences of ITS1 58S and ITS2 regions of ribosomal DNA and tested in their antimicrobial potential against the PC1396 and PC3305 lineages of Guignardia citricarpa the responsible for the ldquoblack spot in Citrusrdquo It was possible to identify 9 isolates at the level of species through the analysis of ITS sequences of rDNA and among these isolates 4 were identified as P michaeliae 2 as P theicola 2 as P longicolla and 1 as P sojae It was possible to verify that the Maytenus ilicifolia plants analyzed are endophytically colonized by at least ten Phomopsis species and that Schinus terebinthifolius are colonized by at least six species of this genus The morphological analyses using RAPD markers and sequencing of ITS regions of rDNA make possible to suggest that the analyzed species of Phomopsis are not host-specific being necessary the redefinition of the species concept for this genus For the antimicrobial analysis all the isolates presented a high in vitro control potential of the fungus G citricarpa particularly the isolates ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ES2AB1 (Phomopsis sp S6) ES2WF1 (Phomopsis sp S4) and ESFH1 (P theicola) that inhibited the growth of the PC1396 and PC3305 lineages of G citricarpa in the three methodologies tested Thus this study indicates that the isolates of Phomopsis spp endophytic of medicinal plants are producers of bioactive substances which should be better characterized Key words Phomopsis spp endophytes medicinal plants RAPD ITS1 58S and ITS2 of rDNA sequences
LISTA DE FIGURAS
FIGURA 1- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis DE Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT 9811 e AT 9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 59
FIGURA 2- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE
Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 61
FIGURA 3- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 64
FIGURA 4- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
PATOGEcircNICOS OBTIDOS DE Glycine max EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 68
FIGURA 5- DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp EM MEIO MEA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 69
FIGURA 6- DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 70
FIGURA 7- AVALIACcedilAtildeO DAS MEacuteDIAS DO DIAcircMETRO DAS COLOcircNIAS DOS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO AV APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 71
FIGURA 8- FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis EM BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 73
FIGURA 9- FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DO ISOLADO SM9713 EM
MEIOS BDA e AV APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB
LUZ CONTIacuteNUA 74 FIGURA 10- COMPRIMENTO DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS
DE Phomopsis spp APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO EM BDA A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 75
FIGURA 11- DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE
SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 77
FIGURA 12- ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE
MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 78
FIGURA 13- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX11 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 79
FIGURA 14- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX14 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 79
FIGURA 15- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX19 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 80
FIGURA 16- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO OPE
08 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 80
FIGURA 17- DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE
SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS DE Phomopsis POR MEIO DE MARCADORES MOLECULARES RAPD 82
FIGURA 18- ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE
GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 84 FIGURA 19- AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA
REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MEacuteTODO DE PARCIMOcircMIA) 86
FIGURA 20- AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA PARCIAL BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MODELO NEIGHBOR-JOINING COM CORRECcedilAtildeO KIMURA DOIS PARAcircMETROS) 87
FIGURA 21- INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa PC1396 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA 93
FIGURA 22- INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia
citricarpa 3305 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA 96 FIGURA 23- AVALIACcedilAtildeO DO CRESCIMENTO DAS COLOcircNIAS DO
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 e PC3305 INOCULADAS APOacuteS RETIRADA DO PAPEL CELOFANE PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS EM MEIO BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 98
FIGURA 24- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 99
FIGURA 25- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 100
LISTA DE TABELAS
TABELA 1- ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR 32
TABELA 2- ISOLADOS GRUPO EXTERNO PARA ANAacuteLISE DE
VARIABILIDADE GENEacuteTICA POR RAPD 35 TABELA 3- EacutePOCAS DO ANO OacuteRGAtildeOS DA PLANTA CONDICcedilOtildeES DE
INCUBACcedilAtildeO E Nordm DE FRAGMENTOS PLAQUEADOS NAS QUATRO COLETAS DE ENDOacuteFITOS DE ESPINHEIRA-SANTA 42
TABELA 4- SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA
AMPLIFICACcedilAtildeO DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL 47
TABELA 5- SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA
AMPLIFICACcedilAtildeO DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL 49
TABELA- 6- Linhagens de Phomopsis spp E de Pestalotiopsis vismae utilizadas
como grupo externo 52 TABELA 7- PORCENTAGEM DE ISOLAMENTO DE Phomopsis
ENDOFIacuteTICOS DE PLANTAS DE ESPINHEIRA SANTA 56 TABELA 8- PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE
OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC1396 94
TABELA 9- PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE
OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 96
TABELA 10- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 101
LISTA DE ANEXOS
ANEXO 1- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM DIFERENTES MEIOS DE CULTURA 125
ANEXO 2- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO BDA 126
ANEXO 3- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO AVEIA 128
ANEXO 4- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO MEA 130
ANEXO 5- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO DOS
ESPOROS BETACONIacuteDIOS DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA 132
ANEXO 6- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 134
ANEXO 7- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 135
ANEXO 8- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 136
ANEXO 9- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 137
ANEXO 10- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS 139
ANEXO 11- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
141
ANEXO 12- MATRIZ DE DADOS PARA CARACTERIZACcedilAtildeO 143 ANEXO 13- LOCAL DA COLETA DE FOLHAS DE Schinus terebinthifolius
CENTRO POLITEacuteCNICO ndash CURITIBA PR 149
SUMAacuteRIO 1 INTRODUCcedilAtildeO 1
2 OBJETIVOS 3
3 REVISAtildeO BIBLIOGRAacuteFICA 4
31 Microrganismos Endofiacuteticos 4
32 Ocorrecircncia de endoacutefitos 7
33 Fungos endofiacuteticos de plantas medicinais 9
34 Endoacutefitos Produtores de Substacircncias Antimicrobianas 11
35 Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss 14
351 Componentes quiacutemicos e propriedades terapecircuticas 16
352 Endoacutefitos isolados de Maytenus ilicifolia 18
36 Guignardia citricarpa Kiely e a Mancha preta do citros 18
361 Mancha Preta do Citros 21
37 O Gecircnero Phomopsis sp 22
38 Marcadores Moleculares 25
381 Marcadores RAPD 27
382 Marcadores ITS 29
4 MATERIAL E MEacuteTODOS 32
41 Material Bioloacutegico 32
411 Fungos endofiacuteticos 32
412 Microrganismos usados para teste de antagonismo 35
413 Fungos endofiacuteticos utilizados para anaacutelise de variabilidade geneacutetica 35
42 Meios de Cultura 35
421 Caldo MEB (Extrato de Malte) 35
422 Meio AV (Aveia-Aacutegar) 36
423 Meio BDA (Meio Batata-Dextrose-Aacutegar) 36
424 Meio MC (Meio Completo) PONTECORVO et al 1953 37
425 Meio MEA (Extrato de Malte) PATERSON e BRIDGE 1994 37
43 Soluccedilotildees e Reagentes 38
431 Clorofane 38
432 Clorofil 38
433 Derozal Bayerreg 38
434 Dodecil Sulfato de Soacutedio (SDS) 10 38
435 Fenol Saturado 38
436 Gel de Agarose (08) 38
437 Gel de Agarose (15) 38
438 Lactofenol azul 38
439 Marcador de peso molecular (DNA de fago lambda clivado com Hind III
Gibco) 39
4310 Marcador de peso molecular (DNA Ladder 100pb Ludwing Biotec) 39
4311 Oligonucleotiacutedeos (Invitrogen) 39
4312 RNAse (invitrogen) 39
4313 Soluccedilatildeo de Vitaminas 40
4314 Soluccedilatildeo salina (pv) 40
4315 Soluccedilatildeo Tween-80 01 (vv) 40
4316 Soluccedilatildeo de Tetraciclina 40
4317 Soluccedilatildeo de EDTA 05M 40
4318 Soluccedilatildeo de brometo de etiacutedio 40
4319 Tampatildeo TE (Tris-EDTA) 41
4320 Tampatildeo de Extraccedilatildeo de DNA 41
4321 Tampatildeo da Amostra (6x) 41
4322 Tampatildeo de corrida TBE 10x 41
44 Isolamento 42
45 Conservaccedilatildeo dos fungos 43
46 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica 43
47 Obtenccedilatildeo de colocircnia monospoacuterica 44
48 Caracterizaccedilatildeo Molecular 44
481 Extraccedilatildeo do DNA (RAEDER e BRODA 1985 modificado por GLIENKE
1995) 44
482 RAPD 45
4821 Anaacutelise da Variabilidade Geneacutetica 46
483 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA 47
4831 Amplificaccedilatildeo 47
4832 Purificaccedilatildeo da PCR 48
48321 Purificaccedilatildeo com PEG 48
48322 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio 48
4833 Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento 49
4834 Purificaccedilatildeo da Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento 50
48341 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em tubos 50
48342 Purificaccedilatildeo com Purificaccedilatildeo com Isopropanol em placa 50
48343 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio 51
4835 Ediccedilatildeo e Anaacutelise das Sequumlecircncia 51
49 Avaliaccedilatildeo da Atividade Antimicrobiana 52
491 Cultura Pareada 52
492 Avaliaccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis 53
493 Atividade dos Extratos metanoacutelicos 54
4931 Obtenccedilatildeo dos extratos 54
4932 Crescimento micelial 55
410 Anaacutelise Estatiacutestica 55
5 RESULTADOS E DISCUSSAtildeO 56
51 Isolamento 56
52 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de Phomopsis 58
53 Caracterizaccedilatildeo Molecular de Phomopsis spp 78
531 RAPD 78
532 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA 85
54 Avaliaccedilatildeo da atividade antimicrobiana 92
541 Cultura pareada 92
542 Teste para detecccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis 97
543 Avaliaccedilatildeo da accedilatildeo dos Extratos 98
6 CONCLUSOtildeES 104
7 REFEREcircNCIAS BIBLIOGRAacuteFICAS 106
ANEXOS 125
1
1 INTRODUCcedilAtildeO
A bioprospecccedilatildeo visa identificar plantas e microrganismos dentre a diversidade
de vida existente em determinado local que possam servir como fonte de substacircncias
bioativas que em uacuteltima instacircncia sejam uacuteteis para o desenvolvimento de novas
drogas Neste contexto os fungos endofiacuteticos satildeo considerados de grande importacircncia
pois representam uma fonte potencial de novos compostos quiacutemicos e bioloacutegicos
podendo ser utilizados natildeo somente na Medicina mas tambeacutem na Fitopatologia e
Veterinaacuteria (STROBEL 2002 STROBEL 2003) O potencial de aplicaccedilatildeo de
microrganismos endofiacuteticos no controle bioloacutegico tambeacutem vem sendo explorado
Os microrganismos endofiacuteticos vivem no interior das plantas interagindo com
diferentes espeacutecies sem causar dano ao seu hospedeiro Esses microrganismos
podem influenciar vaacuterias caracteriacutesticas das plantas e conferir certos benefiacutecios a este
vegetal como por exemplo produccedilatildeo de antibioacuteticos Haacute alguns anos natildeo se conhecia
a grande potencialidade dos endofiacuteticos entretanto este interesse vem aumentando
com a descoberta recente de caracteriacutesticas como a produccedilatildeo de compostos
biologicamente ativos antibioacuteticos fungicidas e herbicidas
Plantas medicinais com propriedades antimicrobianas tambeacutem satildeo habitadas por
microrganismos endofiacuteticos sugerindo que a accedilatildeo antibacteriana ou antifuacutengica poderia
estar no endoacutefito e natildeo na planta ou provavelmente na sua interaccedilatildeo No Brasil vaacuterios
autores mostraram a produccedilatildeo de faacutermacos por endoacutefitos como Xylaria sp Fusarium
moniliforme Colletotrichum sp Guignardia sp e tambeacutem Phomopsis sp
Fungos do gecircnero Phomopsis satildeo encontrados como endoacutefitos nos espaccedilos
intercelulares de tecidos de diversos vegetais entre eles a espinheira-santa (Maytenus
ilicifolia Mart Reiss) planta pertencente agrave famiacutelia Celastraceae Essa planta medicinal
encontrada principalmente no sul do Brasil foi acrescentada agrave lista das espeacutecies
consideradas em extinccedilatildeo no Paranaacute pelo governo do Estado em 1995 Tendo em
vista que pouco se conhece a respeito da comunidade endofiacutetica existente nessa
planta sua diversidade e seu potencial antimicrobiano tornam-se relevantes estudos
de diversidade e bioprospecccedilatildeo
2
Pileggi (2006) demonstrou existir alta diversidade de isolados do gecircnero
Colletotrichum dentre outros fungos filamentosos bacteacuterias e actinomicetos em plantas
de Maytenus ilicifolia do pomar do Centro Nacional de Pesquisa de Florestas (CNPF)
da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaacuteria (EMBRAPAPR) Alguns desses
isolados apresentaram potencial antimicrobiano inibindo o crescimento de Fusarium
sp Guignardia citricarpa e Micrococcus luteus
Endoacutefitos com atividade antagonista contra o fungo Guignardia citricarpa agente
causal da Mancha Preta dos Citros (MPC) poderiam ser utilizados no controle bioloacutegico
desta doenccedila uma vez que o emprego sucessivo de fungicidas como controle de
doenccedilas de plantas apresenta dentre outros problemas a seleccedilatildeo de linhagens
resistentes do patoacutegeno
O gecircnero Phomopsis representa uma fonte potencial de novos compostos
quiacutemicos e bioloacutegicos como vem sendo relatado em diversos trabalhos Oito dos
isolados que foram estudados nesse trabalho jaacute haviam sido avaliados no
IOCFIOCRUZRJ e possuem potencial antimicrobiano (RODRIGUES et al 2004)
Poreacutem tais isolados ainda natildeo haviam sido caracterizados geneticamente nem
identificados em niacutevel de espeacutecie A identificaccedilatildeo e a caracterizaccedilatildeo molecular dos
microrganismos endofiacuteticos satildeo uacuteteis pois o gecircnero Phomopsis eacute de difiacutecil identificaccedilatildeo
em niacutevel de espeacutecie utilizando-se apenas caracteriacutesticas morfoloacutegicas
Estudos moleculares satildeo realizados na busca de padrotildees geneacuteticos nestes
organismos complementando sua caracterizaccedilatildeo O polimorfismo do DNA amplificado
ao acaso (RAPD) propicia uma forma raacutepida para avaliar a diversidade geneacutetica
existente nestes organismos a estruturaccedilatildeo populacional e para auxiliar na
identificaccedilatildeo ao niacutevel de espeacutecie comparando-as com linhagens referecircncia Outra
estrateacutegia importante nessa caracterizaccedilatildeo baseia-se em marcadores de Sequumlecircncias
Internas Transcritas do DNA Ribossocircmico (ITS) para identificaccedilatildeo taxonocircmica dos
isolados
3
2 OBJETIVOS
1 Isolar linhagens endofiacuteticas de Phomopsis spp de plantas sadias de Maytenus
ilicifolia e Identificar os isolados utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas
2 Caracterizaccedilatildeo de Phomopsis spp endofiacuteticos das plantas medicinais Schinus
terebinthifolius Myracrodruon urundeuva Spondias mombin Aspidosperma
tomentosum pertencentes agrave coleccedilatildeo do LABGEM
3 Avaliar a variabilidade geneacutetica e estrutura populacional das linhagens de
Phomopsis spp por meio de marcadores RAPD (Polimorfismo do DNA
Amplificado ao Acaso)
4 Identificar as linhagens por meio de sequumlecircncias da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do
DNA ribossomal
5 Testar a atividade antimicrobiana de linhagens do fungo Phomopsis spp contra
linhagens do fitopatoacutegeno Guignardia citricarpa
4
3 REVISAtildeO BIBLIOGRAacuteFICA
31 Microrganismos Endofiacuteticos
Microrganismos endofiacuteticos satildeo aqueles que vivem no interior das plantas
interagindo com outras espeacutecies de microrganismos sem causar dano ou prejuiacutezo ao
seu hospedeiro Esses microrganismos podem influenciar em vaacuterias caracteriacutesticas
expressas pelas plantas Segundo Neto Azevedo e Araujo (2002) os endoacutefitos podem
desempenhar relevante funccedilatildeo para a sanidade vegetal jaacute que atuam como agentes
controladores de microrganismos fitopatogecircnicos no controle de insetos e ateacute na
proteccedilatildeo da planta contra herbiacutevoros Todas as plantas jaacute estudadas satildeo habitadas por
microrganismos endofiacuteticos principalmente fungos e bacteacuterias
A comunidade endofiacutetica cuja composiccedilatildeo varia em funccedilatildeo do hospedeiro e das
condiccedilotildees ambientais tem indiviacuteduos que se inter-relacionam dentro da planta em um
equiliacutebrio harmocircnico O desequiliacutebrio dessa harmonia afeta o comportamento de todos
os integrantes da comunidade dando condiccedilotildees para que fungos oportunistas
manifestem seu potencial patoloacutegico contra hospedeiro (MAKI 2006)
A distinccedilatildeo entre endofiacuteticos fitopatogecircnicos e oportunistas eacute puramente
didaacutetica Haacute um gradiente tecircnue que os separa e assim agrave distacircncia entre um e outro
pode ser muito pequena sendo difiacutecil impor limites para separar cada categoria Assim
um microrganismo pode ser considerado endofiacutetico mas com a reduccedilatildeo dos
mecanismos de defesa da planta pode se comportar como um patoacutegeno (AZEVEDO et
al 2000)
A ocorrecircncia de microrganismos endofiacuteticos nos vegetais resulta da penetraccedilatildeo
atraveacutes de feridas ocasionadas nas raiacutezes pela abrasatildeo destas com o solo aberturas
naturais como hidatoacutedios e estocircmatos aberturas artificiais sofridas pela accedilatildeo de
pragas animais e o homem ou agressotildees abioacuteticas (RIBEIRO 1995) ou ainda atraveacutes
da secreccedilatildeo de enzimas hidroliacuteticas (ESPOacuteSITO e AZEVEDO 2004) A penetraccedilatildeo
pode ocorrer por meio de esporos levados pelo vento ou hifas que invadem os tecidos
Muitos endoacutefitos produzem massas de coniacutedios delgados caracteriacutestica associada com
5
a dispersatildeo por chuvas (RIBEIRO 1995) Outra forma de propagaccedilatildeo se daacute pela
transmissatildeo vertical por meio de sementes (WHITE MORGAN-JONES E MORROW
1993 CLAY 2004)
Viret e Petrini (1994) usando microscopia eletrocircnica de varredura e transmissatildeo
detectaram a presenccedila de fungos no interior dos hospedeiros Clay (1987) verificou a
presenccedila de hifas dos fungos Acremonium lolli e A coenophialum no espaccedilo
intercelular da regiatildeo meristemaacutetica no mesofilo das folhas no cerne da inflorescecircncia
na semente
Os endoacutefitos apresentam uma relaccedilatildeo mutualiacutestica antagoniacutestica ou neutra com
o hospedeiro A interaccedilatildeo de um fungo com seu hospedeiro vegetal variam e depende
do modo pelo qual o fungo infecta a planta e tambeacutem da extensatildeo da resposta de
defesa desta A colonizaccedilatildeo pode ser sistecircmica ou local inter ou intracelular (ARAUacuteJO
SILVA E AZEVEDO 2000)
Os fungos endofiacuteticos atuam no controle bioloacutegico de fitopatoacutegenos por
ocuparem o mesmo nicho ecoloacutegico destes (ARAUacuteJO SILVA E AZEVEDO 2000)
Segundo Schulz e Boyle (2005) aproximadamente 80 dos fungos endofiacuteticos
produzem compostos biologicamente ativos como antibioacuteticos fungicidas e herbicidas
Esses microrganismos endofiacuteticos podem ser utilizados como fontes de
metaboacutelitos primaacuterios (STAMFORD ARAUacuteJO E STAMFORD 1998) e secundaacuterios que
inibem o desenvolvimento de patoacutegenos (LI et al 2001 LI e STROBEL 2001 ZOU e
TAN 2001) Como exemplo pode-se citar o taxol uma droga quimioterapecircutica usada
no tratamento de cacircncer de mama e ovaacuterio (WANG et al 2000 e STROBEL et al
2003) O aacutecido coletoacutetrico um metaboacutelico do fungo endofiacutetico Colletotrichum
gloeosporioides isolado da Artemisia mongoacutelica apresenta atividade antimicrobiana
contra Bacillus subtilis Staphylococcus aureus Sarcina lutea e contra o fungo
patogecircnico Helminthosporium sativum (ZOU et al 2000) Lu et al (2000) identificaram
trecircs novos metaboacutelitos do fungo endofiacutetico Colletotrichum sp isolado de Artemisia
annua com propriedades antimicrobianas Diversos autores relatam agrave accedilatildeo
antimicrobiana de substacircncias produzidas por fungos endofiacuteticos como Rodrigues
6
Hesse e Werner (2000) Liu et al (2001) Stinson et al (2003) Bao e Lazarivits (2001)
Huang et al (2001) Strobel (2003) Rodrigues (2004) Chareprasert et al (2006)
Os microrganismos endofiacuteticos satildeo tambeacutem capazes de produzirem anti-
helmiacutenticos e inseticidas (AZEVEDO et al 2000 ESPOacuteSITO e AZEVEDO 2004)
apresentando grande potencial que pode ser explorado na agricultura (ZOU e TAN
2001)
Schulz et al (2002) isolaram mais de seis mil e quinhentos fungos endofiacuteticos de
aacutervores e herbaacuteceas na busca de novos metaboacutelitos com potencial para novos
produtos industriais e sugerem que a associaccedilatildeo entre fungos endofiacuteticos e seus
hospedeiros conduza agrave produccedilatildeo de metaboacutelitos secundaacuterios com atividade
antimicrobiana e anti-herbicida
Autores sugerem que certos fungos endofiacuteticos produzem compostos igualmente
presentes em suas plantas hospedeiras como o taxol utilizado para o tratamento de
cacircncer presente tanto na planta medicinal Taxus brevifolia como no fungo endofiacutetico
Taxomyces andreanae (STIERLE et al 1995) Outros exemplos satildeo algumas enzimas
(celulases e lignases) em Xylaria sp fatores de crescimento como giberelina em
Fuzarium moniliforme Indicando uma possiacutevel transposiccedilatildeo de genes entre plantas e
fungos em uma verdadeira engenharia geneacutetica in vivo Se esses casos forem
confirmados ficaraacute evidente que vegetais e fungos transgecircnicos podem ocorrer
naturalmente pela transferecircncia de genes entre espeacutecies pertencentes a diferentes
reinos (AZEVEDO 1998)
Rodrigues Hesse e Werner (2000) pesquisaram a atividade bioativa de extratos
de fungos endofiacuteticos isolados da planta Spondias mombin L (cajazeiro) Estes extratos
incluindo o de Phomopsis sp foram testados contra determinados microrganismos O
fungo apresentou atividade contra actinomicetos Cladosporium elatum Mycotypha sp
e S cerevisae
Aleacutem da produccedilatildeo de antimicrobianos fungos endofiacuteticos podem excluir
patoacutegenos que ocupem o mesmo nicho ecoloacutegico por competiccedilatildeo como relatado por
Bao e Lazarovits (2001) com Fusarium oxysporum f sp Lycopersici patogecircnico e
Fusarium oxysporum natildeo patogecircnico
7
Os fungos endofiacuteticos satildeo de grande importacircncia pois representam uma fonte
potencial de novos compostos quiacutemicos e bioloacutegicos podendo ser utilizados natildeo
somente na Medicina mas tambeacutem na Fitopatologia e Veterinaacuteria (STROBEL 2002
STROBEL 2003) Tendo em vista essa importacircncia vaacuterios trabalhos vecircm sendo
recentemente publicados envolvendo a capacidade de endofiacuteticos antagonizarem
fitopatoacutegenos assim como satildeo descobertos e descritos metaboacutelitos e outras
substacircncias de interesses produzidos por endofiacuteticos
3 2 Ocorrecircncia de endoacutefitos Uma diversidade de microrganismos endofiacuteticos estaacute presente no interior de
plantas aparentemente saudaacuteveis com potencial para serem estudadas A composiccedilatildeo
das espeacutecies pode variar de acordo com o hospedeiro distribuiccedilatildeo geograacutefica idade da
planta condiccedilotildees ecoloacutegicas e sazonais incluindo altitude e precipitaccedilatildeo Uma ou duas
espeacutecies satildeo predominantes como endofiacuteticas em um dado hospedeiro enquanto
outros isolados satildeo pouco frequumlentes (CARROLL 1978 ARNOLD 2003)
Petrini Stone e Carroll (1982) verificaram um padratildeo de dominacircncia de espeacutecies
em que o endoacutefito encontrado com maior frequumlecircncia em uma determinada espeacutecie
vegetal era isolado menos frequentemente de outros hospedeiros Por outro lado os
endoacutefitos encontrados com menor frequumlecircncia em uma planta pareciam ser menos
especiacuteficos pois eram isolados em um amplo espectro de hospedeiros mas com baixa
frequumlecircncia
A colonizaccedilatildeo do fungo endofiacutetico Stagonospora sp no hospedeiro Phragmites
australis ocorre de forma diferenciada no decorrer do ano Na primavera o endoacutefito eacute
encontrado somente na raiz enquanto no outono ele eacute encontrado em todo o vegetal
(ERNEST MENDGEN e WIRSEL 2003) Gao et al (2005) constataram uma flutuaccedilatildeo
sazonal para os endoacutefitos isolados de Heterosmilax japonica Kunth os autores
verificaram maior abundancia de populaccedilotildees endofiacuteticas em amostras coletadas na
primavera do que no veratildeo
8
Tanto a planta hospedeira como a regiatildeo onde os endofiacuteticos satildeo isolados pode
influenciar a produccedilatildeo de metaboacutelitos secundaacuterios De acordo com dados estatiacutesticos
Bills et al (2002) compararam a produccedilatildeo de metaboacutelitos de endofiacuteticos provenientes
de regiotildees tropicais e de regiotildees temperadas Os dados revelaram que regiotildees tropicais
satildeo mais ricas na produccedilatildeo tanto de endoacutefitos como dos metaboacutelitos secundaacuterios
A presenccedila de endoacutefitos em plantas pode variar dentro de espeacutecies de um
mesmo hospedeiro Nestes hospedeiros tambeacutem eacute encontrada uma grande variedade
geneacutetica entre isolados endofiacuteticos da mesma espeacutecie Tal variabilidade foi encontrada
em isolados do fungo Guignardia citricarpa obtidos de citros (GLIENKE 1995) em
duas espeacutecies de Colletotrichum sp isoladas de Maytenus ilicifolia (PILEGGI 2006) e
tambeacutem Pestalotiopsis sp isolados de Maytenus ilicifolia (FIGUEIREDO 2006)
O gecircnero Phomopsis tem sido frequentemente isolado como endoacutefito em uma
grande variedade de plantas
Azevedo et al (2000) apresentaram algumas plantas hospedeiras de onde jaacute
foram isoladas espeacutecies de Phomopsis entre elas Sabal bermudana Trachycarpus
fortunei Cavendishia pubescens Stylosanthes guianensis Anacardium occidentale e
Mangifera indica Corrado e Rodrigues (2004) isolaram endofiacuteticos de Phomopsis das
plantas medicinais Spondias mombin e Aspidosperma tomentosun
Bussabam et al (2001) isolaram predominantemente Phomopsis sp
Colletotrichum gloeosporiodes Glomerella sp e Xylaria sp endoacutefitos de folhas
pseudocaules e rizomas de gengibre (Amomum siamense Criab) coletadas em dois
locais na Tailacircndia
Em plantas de cacau (Theobroma cacao L) resistentes e suscetiacuteveis ao agente
causal da vassoura da bruxa endoacutefitos foram identificados por caracteriacutesticas
morfoloacutegicas e sequumlenciamento de rDNA como pertencentes aos gecircneros
Acremonium Blastomyces Botryosphaeria Cladosporium Colletotrichum
Cordyceps Diaporthe Fusarium Geotrichum Gibberella Gliocladium Lasiodiplodia
Monilochoetes Nectria Pestalotiopsis Phomopsis Pleurotus Pseudofusarium
Rhizopycnis Syncephalastrum Trichoderma Verticillium e Xylaria Os autores
identificaram ainda alguns endoacutefitos potencialmente antagonistas destacando-se
9
Gliocladium catenulatum que reduziu em 70 a incidecircncia da vassoura da bruxa in
vivo em placircntulas de cacaueiro (RUBINI et al 2005)
O gecircnero Phomopsis foi isolado como endoacutefito de graviola (Annona muricata L)
e pinha (Annona squamosa L) dois isolados promoveram eficientemente o crescimento
vegetal mostrando-se promissores para agricultura uma vez que satildeo capazes de
aumentar a produccedilatildeo dessas culturas (SILVA et al 2006) A capacidade de estimular o
crescimento vegetal apresentada por esses organismos tem sido atribuiacuteda a
mecanismos diretos tais como a fixaccedilatildeo do nitrogecircnio produccedilatildeo de fitohormocircnios e
indiretos como antagonismo em relaccedilatildeo a patoacutegenos levando consequumlentemente ao
aumento na taxa de germinaccedilatildeo crescimento das raiacutezes e parte aeacuterea nuacutemero de
folhas e flores aacuterea foliar e rendimento de culturas (SILVEIRA 2001)
Alguns dos relatos citam o gecircnero Phomopsis como fitopatoacutegeno isolado de
Citrus aurantium (Laranjeira) Citrus nobilis (Tangerineira) Citrus paradisi (Pomelo)
Citrus australis (Laranja) Citrus sinensis (Laranja da China) Citrus sp (Citros)
Mangifera indica (Mangueira) Glycine max (Soja) Ficus carica (Figueira) e Anacardium
occidentale (Cajueiro) entre muitas outras plantas (CENARGEN EMBRAPA 2005) Foi
descrito como agente causal da mancha foliar em Myracrodruon urundeuva (ANJOS
CHARCHAR e GUIMARAtildeES 2001) O fungo Phomopsis sp tambeacutem eacute encontrado
associado a sementes de Dipteryx alata e Cybistax antisyphilitica espeacutecies comuns nos
Cerrados (SANTOS 1996)
33 Fungos endofiacuteticos de plantas medicinais Os microrganismos endofiacuteticos satildeo encontrados em muitas espeacutecies de plantas
medicinais A accedilatildeo antimicrobiana de algumas dessas plantas poderiam estar
relacionadas agrave sua comunidade endofiacutetica sugere-se entatildeo que o princiacutepio ativo
antimicrobiano pode ser produzido pelo microrganismo e natildeo propriamente pelo
vegetal ou provavelmente pela interaccedilatildeo planta-hospedeiro
As plantas Aspidosperma tomentosum e Spondias mombin satildeo utilizada no
Brasil devido as suas propriedades antimicrobianas A avaliaccedilatildeo dos metaboacutelitos
10
secundaacuterios produzidos pelo fungo endofiacutetico Phomopsis sp isolado dessas plantas
demonstraram excelentes resultados na inibiccedilatildeo de bacteacuterias fungos filamentosos e
leveduras (CORRADO e RODRIGUES 2004)
Rodrigues Hesse e Werner (2000) avaliaram metaboacutelitos produzidos por fungos
endofiticos isolados de Spondias mombin Guignardia sp apresentaram atividade
contra Escherichia coli Staphylococcus aureus Saccharomyces cerevisiae Geotrichum
sp e Penicillium canadesis Metaboacutelitos de Pestalotiopsis guepinii apresentaram
atividade contra S cerevisiae Os metaboacutelitos produzidos por Phomopsis sp foram
eficientes contra Cladosporium elantum Mycotypha sp e S cerevisiae
Heterosmilax japonica Kunth eacute uma planta medicinal conhecida na China por
seus efeitos diureacuteticos Gao et al (2005) avaliaram a comunidade de fungos endofiacuteticos
e observaram uma grande variedade de fungos colonizando o interior das plantas entre
eles Phomopsis Mycospharella Aureobasidium Cladosporium Glomerella
Botryosphaeria e Guignardia
Plantas do gecircnero Taxus demonstraram atividade anticanceriacutegena assim como
isolados endofiacuteticos dessas plantas O paclitaxel e alguns de seus derivados utilizados
no tratamento de cacircncer satildeo produzidos pelo fungo endofiacutetico Taxus andreanae
isolado da planta medicinal T brevifolia (STROBEL et al 1993 STIERLE et al 1995) e
pelos fungos endofiacuteticos Sporormia minima e Trichothecium sp isolados da planta
medicinal T wallichiana (SHRESTHA et al 2001) A planta medicinal T marei de onde
foi isolado o fungo Tubercularia sp tambeacutem demonstrou atividade anticanceriacutegena
(WANG et al 2000)
O fungo Colletotrichum sp foi isolado como endoacutefito da planta medicinal
Artemisia annua utilizada pelos chineses como uma droga antimalaacuterica produziu
atividade antimicrobiana contra patoacutegenos humanos e de plantas (LU et al 2000) O
fungo endofiacutetico C gloeosporioides da espeacutecie A mongoacutelica sintetiza aacutecido coletoacutetrico
que apresenta atividade antimicrobiana (ZOU et al 2000)
11
34 Endoacutefitos Produtores de Substacircncias Antimicrobianas
A antibiose eacute definida como a interaccedilatildeo entre organismos na qual um ou mais
metaboacutelitos produzidos por um organismo tecircm efeito danoso sobre o outro (BETTIOL e
GHINI 1995) Segundo Melo (1998) muitos fungos e bacteacuterias inibem fitopatoacutegenos
competindo por nutrientes parasitando eou produzindo metaboacutelitos secundaacuterios como
enzimas liacuteticas e antibioacuteticos O resultado dessas interaccedilotildees antagocircnicas tais como
antibiose competiccedilatildeo induccedilatildeo de defesa e parasitismo leva ao controle bioloacutegico de
doenccedilas de plantas assim como pode desenvolver um papel muito importante na
medicina com a descoberta de novos faacutermacos
RODRIGUES HESSE e WERNER (2000) pesquisaram a atividade
antimicrobiana de metaboacutelitos secundaacuterios produzidos por fungos endofiacuteticos de
Spondias mombin (Anacardiaceae) contra actinomicetos bacteacuterias Gram-positivas e
Gram-negativas leveduras e fungos filamentosos e verificaram que os extratos de
Guignardia sp Phomopsis sp e Pestalotiopsis guepinii inibiram o crescimento de
actinomicetos Os extratos de Guignardia sp tambeacutem apresentaram atividade
antimicrobiana contra Escherichia coli Staphylococcus aureus Saccharomyces
cerevisiae Geotrichum sp e Penicillium canadensis Metaboacutelitos de P guepinii foram
ativos contra S cerevisae e os isolados de Phomopsis sp mostraram accedilatildeo antifuacutengica
contra Cladosporium elatum Mycotypha sp e S cerevisae
Liu et al (2001) estudaram a atividade antifuacutengica de fungos endofiacuteticos isolados
de Artemisia annua sobre os fitopatoacutegenos Gaeumannomyces graminis Fusarium
graminearum Rhizoctnia cerealis Phytophthora capsici helminthosporium sativum e
Gerlachia nivalis encontrando isolados com accedilatildeo inibitoacuteria para todos os patoacutegenos Lu
et al (2000) estudando a mesma planta constataram atividade de trecircs novos
metaboacutelitos produzidos pelo fungo Colletotrichum sp apresentando atividade
antifuacutengica contra Bacillus subtilis Sataphylococcus aureus Sarcina lutea
Pseudomonas sp Candida albicans Aspergillus niger e inibiccedilatildeo de crescimento dos
fungos patogecircnicos Gaeumannomyces graminis var tritici Rhizoctonia cerealis
Helminthosporium sativum e Phytophora capisici
12
A Cinnamomum zeylnicum (canela) eacute uma planta utilizada no tratamento de
uacutelceras estomacais hipertensatildeo arterial resfriados e dores abdominais Ezra e Strobel
(2003) isolaram dessa planta o fungo Muscodor albus que apresenta accedilatildeo fungicida
fungistaacutetica bactericida e bacteriostaacutetica por emissatildeo de compostos orgacircnicos volaacuteteis
O mesmo foi relatado para o fungo Gliocladium sp da planta Eucryphia cordifolia
inibindo o crescimento dos fungos fitopatogecircnicos Pythium ultimum e Verticillum dahliae
(STINSON et al 2003)
Citocalasinas satildeo metaboacutelitos fuacutengicos relacionados pela estrutura e atividade
bioloacutegica com capacidade antitumoral e atividade antibioacutetica Estas substacircncias
apresentam efeitos que incluem a inibiccedilatildeo da divisatildeo do citoplasma e dos movimentos
celulares induccedilatildeo do deslocamento nuclear retraccedilatildeo de coaacutegulos e agregaccedilatildeo de
plaquetas transporte de glucose e secreccedilatildeo da tireoacuteide Recentemente trecircs novas
citocalasinas foram relatadas como provenientes do fungo endofiacutetico Rhinocladiella sp
de Tripterygium wilfordii (WAGENAAR et al 2000)
Li e Strobel (2001) purificaram duas ciclohexenonas produzidas pelo fungo
endofiacutetico Pestalotiopsis jesteri isolado da planta Fragraea bodenii (Gentianaceae) a
jesterona e a hidroxil-jesterona das quais a primeira apresentou atividade antifuacutengica
contra o patoacutegeno Pythium ultimum Outro metaboacutelito isoldado de P microspora
isolado endofiticamente da planta Terminalia morobensis a isopestacina
(isobenzofuranona) tambeacutem se mostrou ativo contra Pythium ultimum entre outros
fungos como Sclerotinia sclerotiorum e Rhizoctonia (STROBEL et al 2002)
Adicionalmente a isopestacina apresentou atividade antioxidante contra uma variedade
de radicais livres testados
A Monstera sp eacute uma planta que cresce sobre o tronco de aacutervores dela foi
isolado o endoacutefito Streptomyces sp MSU-2110 na Amazocircnia Peruana Este
actinomiceto produz um peptiacutedeo denominado coronamicina com atividade
antimicrobiana contra o fungo patogecircnico Cryptococcus neoformans e agrave bacteacuteria
Streptococcus pneumoniae mas a melhor atividade foi a demonstrada contra
protozoaacuterio Plasmodium falciparum sugerindo potencialidade como uma droga
13
antimalaacuterica Aleacutem da coronamicina este endoacutefito tambeacutem produz outros compostos
com atividades antifuacutengicas (EZRA et al 2004)
Castillo et al (2002) isolaram e caracterizaram um antibioacutetico de largo espectro
a munumbicina produzida por uma outra linhagem endofiacutetica de Streptomyces
denominada NRRL 30562 isolada da planta medicinal Kennedia nigriscans nativa do
Norte da Austraacutelia O extrato do endoacutefito obtido com solvente orgacircnico foi purificado e
submetido a HPLC (Cromatografia Liacutequida de Alta Eficiecircncia) Os quatro componentes
principais resultantes foram denominados munumbicinas A B C e D Estes compostos
demonstraram em geral atividade contra bacteacuterias Gram positivas como Bacillus
anthracis e Mycobacterium tuberculosis multi-resistente A munumbicina B inibiu
Staphylococcus aureus resistente a meticilina (MRSA) enquanto a munumbicina D
apresentou atividade contra o parasita da malaacuteria Plasmodium falciparum O extrato da
linhagem de Streptomyces foi testado ainda contra vaacuterios patoacutegenos de plantas
apresentando atividade contra Pythium ultimum Phytophthora infestans Sclerotinia
sclerotiorum Erwinia carotovora Cochliobolus carbonum e Penicillium sp mostrando o
grande potencial destas novas substacircncias para a medicina e agricultura
O aacutecido coletotricum produzido pelo fungo Colletotrichum gloeosporioides
(Penz) Penz amp Sacc isolado da planta medicinal Artemiacutesia mongolica apresentou
inibiccedilatildeo do crescimento de Bacillus subtilis Staphylococcus aureus e Sarcina lutea e
atividade antifuacutengica contra o patoacutegeno Helminthosporium sativum (ZOU et al 2000)
Corrado e Rodrigues (2004) observaram a atividade bactericida de linhagens do
fungo endofiacutetico Phomopsis sp isolado das folhas de Aspidosperma tomentosum e
peciacuteolos da planta medicinal Spondias mombin Todos os extratos avaliados inibiram o
crescimento de bacteacuterias fungos filamentosos e leveduras testadas mostrando o
grande potencial deste fungo como fonte de produtos bioativos
Chareprasert et al (2006) isolaram fungos endofiacuteticos de Tectona grandis e de
Samanea saman e testaram sua capacidade antimicrobiana Dentre os isolados
testados Phomopsis foi o gecircnero dominante produzindo substacircncias inibidoras contra
Bacillus subtilis S aureus E coli e Candida albicans
14
Aleacutem da capacidade antimicrobiana fungos endofiacuteticos mostram-se importantes
com um grande potencial antitumoral e com habilidade em inibir enzimas sugerindo
que podem representar uma estimada fonte para uso terapecircutico
Rodrigues et al (2005) verificaram que fungos endofiacuteticos possuem a
capacidade de inibir colinesterase dentre eles linhagens de Phomopsis sp Entretanto
o melhor resultado foi obtido com extratos de Penicillium indicando que estes podem
ter aplicaccedilotildees farmacecircuticas
Huang et al (2001) testaram agrave accedilatildeo de fungos endofiacuteticos isolados de plantas
medicinais frente a outros fungos e tumores Os resultados indicaram que esses fungos
satildeo importantes em medicina como agentes antimicrobianos e antitumorais
Silva et al (2005) isolaram dois novos metaboacutelitos de Phomopsis cassiae
endofiacutetico de Cassia specatabilis as substacircncias 24-diidroxi-56-dimetil benzoato de
etila e phomopsilactona que exibiram forte atividade antifuacutengica contra fitopatoacutegenos
bem como citotoxicidade contra a linhagem celular de tumor cervical humano (HeLa)
Outros fungos como o Gliocladium sp da planta Eucryphia cordifolia tambeacutem possuem
atividade contra fungos fitopatogecircnicos (STINSON et al 2003 STROBEL 2003)
Em 2001 Rodrigues-Heerklotz et al elucidaram a estrutura quiacutemica e a siacutentese
assimeacutetrica de um novo metaboacutelito o aacutecido guignardico produzido pelo fungo endofiacutetico
Guignardia sp isolados de Spondias mombin
Satildeo vaacuterios os relatos de fungos endofiticos produtores de substacircncias
antimicrobianas inclusive isolados de plantas medicinais Esses microrganismos tem
se mostrado como uma fonte promissora de agentes bioativos antitumorais e
antifuacutengicos
35 Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss
A planta Maytenus ilicifolia Mart Ex Reiss pertence agrave classe Magnoliopsida
ordem Celastrales e famiacutelia Celastraceae a qual compreende 50 gecircneros e cerca de
800 espeacutecies (CRONQUIST 1981) Conhecida popularmente nos diferentes paiacuteses da
Ameacuterica do Sul pode receber diferentes denominaccedilotildees congorosa quebrachillo e
15
capororoca na Argentina (GONZALEZ LOMBARDO e VALLARINO 1937) espinheira-
divina cancorosa cancerosa cancrosa sombra-de-touro no Uruguai (SIMOtildeES et al
1986 ALICE et al 1995) coromilho-do-campo e salva-vidas (CARLINI e BRAZ 1988)
espinheira santa espinheira-divina erva-cancrosa e erva-santa (CARVALHO-OKANO
1992) cancorosa-de-Deus limatildeozinho maiteno marteno pau-joseacute salva-vidas
sombra-de-touro no Brasil (BITTENCOURT 2000)
Eacute descrita como uma aacutervore perene de porte arboacutereo-arbustivo encontrada na
mata de clima subtropical e temperado presente em sub-bosques das florestas de
Araucaacuteria nas margens de rios e em regiotildees de estepes Pode se propagar usualmente
por sementes (TAYLOR-ROSA e BARROS 1994) ou estacas de galho Preferindo
climas mais amenos ocorrendo espontaneamente ou por meio de cultivo A colheita
das folhas pode ser feita em qualquer eacutepoca do ano (PANIZZA 1998) Eacute nativa da
Ameacuterica do Sul encontrada no leste da Argentina Paraguai Boliacutevia com menor
intensidade no Chile e Uruguai No Brasil eacute predominante nos estados do Sul
(CARVALHO-OKANO 1992)
Maytenus ilicifolia eacute um arbusto de ocorrecircncia natural da Floresta Ombroacutefila Mista
(Floresta com Araucaacuteria) (BITTENCOURT 2001) Muitas vezes essa planta eacute
encontrada em ambientes ciliares e nos agrupamentos arboacutereos (capotildees) na regiatildeo de
predomiacutenio das estepes (CERVI et al 1989)
Esta planta eacute descrita como um subarbusto ou aacutervore ramificado desde a base
medindo ateacute 50 m de altura Ramos novos glabros angulosos tetra ou multicarenados
Peciacuteolo com 02-05 cm de comprimento A folha apresenta a margem inteira ou com
espinhos em nuacutemero de um a vaacuterios distribuiacutedos regular e irregularmente no bordo
geralmente concentrados na metade apical de um ou de ambos os semilimbos o limbo
com aproximadamente 22 a 89 cm de comprimento e 11 a 30 cm de largura e
nervuras na face abaxial Fruto caacutepsula bivalvar orbicular pericarpo maduro de
coloraccedilatildeo vermelho-alaranjada A presenccedila de disco nectariacutefero eacute um recurso a mais
para atrair os pequenos polinizadores como himenoacutepteros e formigas formando um
conjunto neacutectar-poacutelen interessante para a polinizaccedilatildeo uma vez que as flores satildeo
pequenas brancas e pouco vistosas O florescimento ocorre entre os meses de
16
setembro a outubro enquanto os frutos surgem entre outubro e fevereiro (CARVALHO-
OKANO 1992 RAMDOMSKI 1998 BITTENCOURT 2000)
A fragmentaccedilatildeo da Floresta com araucaacuterias nas uacuteltimas deacutecadas juntamente
com a comprovaccedilatildeo terapecircutica contra males gaacutestricos e o uso em larga escala
causaram grande devastaccedilatildeo de populaccedilotildees naturais de Maytenus ilicifolia
(BITTENCOURT 2001)
351 Componentes quiacutemicos e propriedades terapecircuticas Plantas sempre foram usadas como fonte terapecircutica na medicina tanto em
remeacutedios tradicionais quanto em produtos industrializados A planta Maytenus ilicifolia
Mart eacute geralmente utilizada na medicina popular brasileira As folhas secas desta
planta satildeo usadas como uma infusatildeo para aliviar dores de estocircmago e naacuteuseas e no
tratamento de uacutelceras e gastrites (CAMPAROTO et al 2002) Vaacuterios compostos
isolados de M ilicifolia foram descritos apresentando accedilatildeo antitumoral tambeacutem usado
como analgeacutesico antinflamatoacuterio e antiaacutecido (JORGE 2004)
Esta espeacutecie tem uso popular em comunidades tradicionais e povos indiacutegenas no
Brasil (BITTENCOURT 2001) No Paraguai e Boliacutevia tribos indiacutegenas e populaccedilotildees
rurais a utilizam como substacircncia controladora da fertilidade (CORDEIRO VILEGAS e
LANCcedilAS 1999) e no Paraguai e Argentina eacute usada como contraceptiva e abortiva
(MONTANARI CARVALHO e DOLDER 1998) Citada tambeacutem com uso no tratamento
de febres palustres (MEIRA PENNA 1946) afecccedilotildees pruriginosas cutacircneas
(COIMBRA 1958) dispepsias (CRUZ 1965) Inflamaccedilotildees ulceras e gaacutestricas (JORGE
2004)
As propriedades terapecircuticas de Maytenus ilicifolia foram atribuiacutedas agrave produccedilatildeo
de compostos terpecircnicos como maitenina e pristimerina tanto pelas raiacutezes (LIMA et al
1971 ITOKAWA et al 1991) como em ramos de folhas (JORGE et al 2004) Assim
como fenoacuteis taninos gaacutelicos (CAMPAROTO et al 2002) flavonoacuteides e outros
compostos (SILVA et al 1991 LEITE et al 2001)
17
Jorge et al (2004) avaliaram a eficaacutecia de extratos de M ilicifolia como
antinflamatoacuterio na proteccedilatildeo contra lesotildees gaacutestricas incluindo a cicatrizaccedilatildeo e
citoproteccedilatildeo sugerindo que os extratos de Maytenus ilicifolia podem representar uma
importante alternativa cliacutenica em antinflamatoacuterios e antiulcerogecircnico
Souza-Formigoni et al (1991) avaliaram a potencialidade dos efeitos
antiulcerogecircnicos das folhas de espinheira santa em experimentos realizados em ratos
com ulceras O uso de chaacute tanto por via oral como intraperitoneal mostrou resultados
semelhantes agrave droga cicatrizante cimetidina M ilicifolia assim como outras espeacutecies da
famiacutelia Celastraceae foram investigadas quanto aos seus constituintes de accedilatildeo
citotoacutexica sendo isolados triterpenos aromaacuteticos de accedilatildeo antitumoral Segundo Itokawa
et al (1991 1993) e Shirota et al (1994) os triterpenos satildeo capazes de estimular
fatores atuantes na proteccedilatildeo da mucosa gaacutestrica como a produccedilatildeo de muco e
prostaglandinas
A cimetidina eacute um potente agente na supressatildeo de aacutecido gaacutestrico e pepsina ela
age como antagonista competitivo da histamina nos receptores H2 das ceacutelulas parietais
gaacutestricas produtoras de aacutecido dessa forma bloqueia a secreccedilatildeo aacutecida (SOUZA-
FORMIGONI et al 1991) Ferreira et al (2004) investigaram o efeito e possiacutevel
mecanismo de accedilatildeo do extrato aquoso liofilizado de M ilicifolia sobre a secreccedilatildeo de
aacutecidos em mucosa gaacutestrica de sapos Foi observada uma reduccedilatildeo de 16 da secreccedilatildeo
aacutecida sugerindo os autores que essa reduccedilatildeo ocorra devido a uma atividade
antagoniacutestica dos extratos nos receptores de H2 de histidina
Montanari Carvalho e Dolder (1998) analisaram os efeitos de extratos
etanoacutelicos de M ilicifolia na espermatogecircnese de camundongos e natildeo encontraram
qualquer defeito ou distuacuterbio Poreacutem Montanari e Bevilacqua (2002) em estudos com
fecircmeas de ratos constataram uma diminuiccedilatildeo significativa na implantaccedilatildeo dos embriotildees
com a utilizaccedilatildeo de extrato liofilizado das folhas
18
352 Endoacutefitos isolados de Maytenus ilicifolia
Pileggi (2006) isolou microrganismos endofiacuteticos de folhas peciacuteolos e sementes
de Maytenus ilicifolia e investigou o potencial farmacoloacutegico dos mesmos Foram
isolados em maior frequumlecircncia os fungos Alternaria sp Colletotricum sp Bipolaris sp
Phyllosticta sp e Cladosporium sp Entre os fungos e bacteacuterias testados 15
apresentaram potencial para o controle bioloacutegico Na anaacutelise de caracterizaccedilatildeo
morfoloacutegica por RAPD foi sugerida a presenccedila de duas espeacutecies de Coletotricum
isolados de Maytenus ilicifolia
Figueiredo (2006) isolou de Maytenus ilicifolia fungos endofiacuteticos e os avaliou
quanto ao potencial antimicrobiano contra bacteacuterias patogecircnicas em humanos e o fungo
fitopatogecircnico Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta do Citros Os
extratos metanoacutelicos de dois isolados exibiram accedilatildeo fungistaacutetica na germinaccedilatildeo e no
crescimento micelial de G citricarpa Dois extratos de Pestalotiopsis sp inibiram o
crescimento dos microrganismos-teste (S aureus oxalino resistente Klebsiella
pneumoniae Micrococcus luteus Staphylococcus aureus e Escherichia coli)
Bacteacuterias com potencial anti-leucemico foram isoladas de Maytenus essas
bacteacuterias interagem com as plantas na produccedilatildeo de alguns metaboacutelitos como a
maytensina substancia que tambeacutem apresenta propriedades antifuacutengicas
Azevedo et al (2000) relataram a presenccedila de bacteacuterias endofiacuteticas em folhas de
Maytenus aquifolium Foram isolados vinte gecircneros os mais frequumlentes foram Bacillus
Clavibacter e Streptomyces aleacutem de actinomicetos Testes preliminares mostraram que
algumas das bacteacuterias podem produzir ansamacroliacutedeos que tambeacutem satildeo produzidos
pela planta hospedeira
36 Guignardia citricarpa Kiely e a Mancha preta do citros
O gecircnero Guignardia foi descrito em 1982 por Viala e Ravaz e compreende as
formas teleomoacuterficas de espeacutecies de Phyllosticta e de alguns outros gecircneros
19
relacionados de fungos imperfeitos geralmente saproacutefitas ou semiparasitas de folhas
(SIVANESAN 1984)
Diversos autores isolaram espeacutecies de Phyllosticta de plantas aparentemente
sadias descrevendo-as como endofiacuteticas (CARROLL e CARROLL 1978 PETRINI
1986 LEUCHTMANN et al 1992 GLIENKE 1995 PENNA 2000) No entanto existe
um grande nuacutemero de relatos citando este gecircnero como fitopatogecircnico de diversas
culturas com grande importacircncia econocircmica como arroz (SUGHA SINGH E SHARMA
1986) cana-de-accediluacutecar (PONS 1990) tabaco (PATEL et al 1988) e eucalipto (CROUS
et al 1993) e tambeacutem frutiacuteferas como abacate e tomate (BAKER 1938) manga e
mamatildeo (McMILLAN JR 1986) uva (IBRAHIM e BAYCA 1989) e principalmente em
citros (McONIE 1964a 1964b HERBERT e GRECH 1985 JOHNSTON e
FULLERTON 1988)
O fungo Guignardia citricarpa Kiely (anamorfo Phyllosticta citricarpa (McALP)
Van Der Aa) eacute um Ascomiceto da ordem Dothideales famiacutelia Dothideaceae Possui
estroma plectenquimatoso pseudoteacutecio globoso a subgloboso medindo 125 a 360 μm
de diacircmetro contendo um poro de 14 a 16 μm e paredes espessas com 20 a 22 μm
Seu asco apresenta forma de clava arredondado na extremidade superior e eacute
bitunicado Conteacutem oito ascoacutesporos unicelulares hialinos ligeiramente cinzentos
romboacuteides contendo gracircnulos e um grande vacuacuteolo central Os ascoacutesporos satildeo
cobertos com um quepe gelatinoso nas extremidades Segundo Sivanesam (1984)
pseudoparaacutefises satildeo encontradas em pseudoteacutecios maduros De acordo com Johnston
e Fullerton (1988) as formas anamorfas e teleomorfa geralmente satildeo encontradas
associadas
As estruturas de frutificaccedilatildeo satildeo os picniacutedios que macroscopicamente satildeo
pequenos globosos pretos e semi-eruptivos A fase sexuada corresponde agrave produccedilatildeo
de ascoacutesporos os quais se encontram em nuacutemero de oito no interior dos ascos Estes
apresentam forma de clava satildeo arredondados na extremidade superior e bitunicados
Os ascoacutesporos satildeo unicelulares hialinos levemente acinzentados romboacuteides
contendo gracircnulos e um grande vacuacuteolo central cobertos com um quepe gelatinoso nas
extremidades (SIVANESAN 1984)
20
Fialho (2004) avaliou in vitro o potencial de linhagens de S cerevisiae como
agentes no controle bioloacutegico contra G citricarpa nos frutos poacutes-colheita Rodrigues
(2006) avaliou o efeito dos principais fungicidas utilizados no campo para o controle da
doenccedila Tambeacutem avaliou 96 linhagens de fungos para a seleccedilatildeo de potenciais agentes
no controle bioloacutegico demonstrando que algumas espeacutecies de Trichoderma satildeo
capazes de atuar in vitro como biocontroladores do fitopatoacutegeno G citricarpa
Cardoso-Filho (2003) avaliou o uso de indutores de resistecircncia Saccharomyces
cerevisiae Bionreg e aacutecido saliciacutelico ao fitopatoacutegeno G citricarpa O autor destaca que os
compostos presentes no albedo (mesocarpo) da laranja como a celulose carboidratos
soluacuteveis pectinas compostos fenoacutelicos (flavonoacuteides) aminoaacutecidos e vitaminas podem
exibir a accedilatildeo antimicrobiana para o controle da MPC Neste contexto ele avaliou os
extratos produzidos pelo albedo da laranja e comprovou accedilatildeo fungicida ou fungistaacutetica
inibindo a germinaccedilatildeo esporulaccedilatildeo e crescimento micelial in vitro de G citricarpa
Blanco (1999) e Christo (2002) observaram esta variabilidade entre linhagens
isoladas de lesatildeo de Mancha Preta de Citros (MPC) ou seja linhagens de G citricarpa
utilizando dados de RAPD Esta variabilidade tambeacutem foi evidenciada em linhagens
isoladas em plantas assintomaacuteticas atualmente descritas como Guignardia mangiferae
(GLIENKE-BLANCO et al 2002 CHRISTO 2002 BAAYEN et al 2002 OKANI
NAKAGIRI e ITO 2001 RODRIGUES et al 2004)
Em 1999 Glienke-Blanco comparou geneticamente por meio de marcadores de
RAPD linhagens de populaccedilotildees patogecircnicas e endofiacuteticas de Guignardia sp de
diversas regiotildees e hospedeiros constatando a existecircncia de trecircs populaccedilotildees de
Guignardia geneticamente muito diferentes coexistindo em citros sendo duas
endofiacuteticas e uma patogecircnica sugerindo que talvez estas trecircs populaccedilotildees pudessem
pertencer a espeacutecies distintas O desenvolvimento de um par de oligonucleotiacutedeos
capaz de amplificar um fragmento de 370 pb especiacutefico para linhagens patogecircnicas de
G citricarpa veio a corroborar para distinccedilatildeo geneacutetica entre estes grupos (GLIENKE et
al 2007)
21
361 Mancha Preta do Citros
A doenccedila mancha preta dos citros (MPC) foi descrita na Austraacutelia em 1985 por
Kiely posteriormente na Aacutefrica do Sul como consequumlecircncia da importaccedilatildeo de mudas da
Austraacutelia Atualmente estaacute distribuiacuteda em regiotildees subtropicais do mundo entre elas o
Brasil (GOacuteES et al 2005)
O ciclo da doenccedila (MPC) inicia-se com a disseminaccedilatildeo dos coniacutedios ou
picnidioacutesporos (esporos assexuais) e ascoacutesporos (esporos sexuais) do fungo
Guignardia citricarpa Os coniacutedios (picnidioacutesporos) satildeo responsaacuteveis pelas infecccedilotildees agrave
curta distacircncia e estatildeo localizados no interior dos picniacutedios oriundos dos frutos
infectados Um agregado de coniacutedios emerge atraveacutes da abertura do picniacutedio (ostiacuteolo)
dissolve-se na aacutegua da chuva orvalho ou irrigaccedilatildeo e cai sobre os pequenos frutos
susceptiacuteveis que se formam apoacutes as floradas Jaacute os ascoacutesporos satildeo responsaacuteveis pela
disseminaccedilatildeo agrave curta e longa distacircncia pois satildeo lanccedilados dos periteacutecios que se
formam em folhas caiacutedas ao solo e satildeo levados por correntes aeacutereas infectando
pequenos frutos susceptiacuteveis (ROBES 1990)
Em estudo epidemioloacutegico da MPC Spoacutesito et al (2008) analisou 27270 frutos
colhidos de 303 aacutervores quanto agrave incidecircncia da doenccedila (porcentagem de frutos doentes
por aacutervore) e quanto agrave severidade da doenccedila (aacuterea com sintoma do fruto) O autor
encontrou frutos doentes em 251 aacutervores das 303 analisadas (83) com diferentes
niacuteveis de incidecircncia Algumas aacutervores tinham a maioria das frutas com lesotildees
agregadas e de alta gravidade enquanto outras tinham a maioria das frutas com
poucas lesotildees e baixa gravidade Segundo os autores quando o agente patogecircnico eacute
disperso pela aacutegua da chuva esta pode transportar muitos esporos de uma vez
formando uma lesatildeo O padratildeo de sintomas resultantes a partir deste tipo de dispersatildeo
eacute tipicamente agregada Os autores concluiacuteram que os ascoacutesporos satildeo os mais
importantes inoacuteculos de G citricarpa
A MPC caracteriza-se por apresentar lesotildees com bordas salientes e com
depressatildeo no centro onde se observam pequenos pontos pretos os picniacutedios As
lesotildees podem atingir os frutos maduros ou no iniacutecio de maturaccedilatildeo podendo aparecer
22
apoacutes a colheita no transporte e armazenamento (ROBES et al 1995) A MPC afeta
apenas a casca do fruto e o flavedo (epicarpo) sem causar dano internamente limitado
pelo albedo (mesocarpo) Poreacutem sua comercializaccedilatildeo no mercado de frutas eacute
prejudicada assim como a sua exportaccedilatildeo devido agrave barreira fitossanitaacuteria existente na
Uniatildeo Europeacuteia por ser uma doenccedila quarentenaacuteria A1 Nos casos em que a doenccedila
atinge o pedicelo do fruto pode ocorrer agrave queda prematura do fruto aumentando as
perdas na produccedilatildeo e ateacute limitando seriamente a citricultura em vaacuterios estados
brasileiros (GOacuteES et al 2005 ROBES et al 1995)
Em funccedilatildeo dos prejuiacutezos causados por G citricarpa na comercializaccedilatildeo de
frutos in natura principalmente no mercado externo satildeo crescentes os estudos que
datildeo ecircnfase ao controle bioloacutegico da doenccedila
37 O Gecircnero Phomopsis sp
O gecircnero Phomopsis descrito em 1905 por (Sacc) Bubak (RIEDL 1981) forma
picniacutedios escuros com ostiacuteolo normalmente em forma de pecircra conidioacuteforos simples
alfa coniacutedios hialinos com gotas nas extremidades predominantemente elipsoacuteides sem
septos unicelulares de forma ovoacuteide Apresenta tambeacutem beta coniacutedios hialinos sem
gotas filiformes a maioria curvos em uma das extremidades sem septos (HANLIN e
MENEZES 1996)
Outra caracteriacutestica dos fungos do gecircnero Phomopsis eacute a formaccedilatildeo de linhas
negras estreitas em tecidos de plantas contaminadas assim como no meio de cultura
em que satildeo repicados (BRAYFORD 1990)
O gecircnero Phomopsis pertence ao filo Ascomycota subfilo Pezizomycotin classe
Sordariomycetes subclasse Sordariomycetidae ordem Diaporthales famiacutelia Valsaceae
mitosporic Valsaceae Apresenta-se na forma anamoacuterfica o seu teleomorfo eacute o
Diaporthe cujo habitat eacute o caule de plantas lenhosas e herbaacuteceas (HANLIN e
MENEZES 1996)
Espeacutecies de Phomopsis satildeo comumente encontradas como patoacutegenos e
endoacutefitos de plantas (BODDY e GRIFFITH 1989) Tradicionalmente o gecircnero tem sido
23
considerado altamente patogecircnico (REHNER e UECKER 1994) mas algumas
espeacutecies de Phomopsis satildeo entretanto endoacutefitos mutualiacutesticos (WEBBER e GIBBS
1984 CARROLL 1986)
Espeacutecie de Phomopsis e Diaporthe tecircm sido tradicionalmente descritos com
base na espeacutecie hospedeira Poreacutem algumas espeacutecies e isolados podem infectar mais
de um hospedeiro (BRAYFORD 1990 FARR CASTLEBURY e ROSSMAN 2002) tal
estrateacutegia tem sido frequentemente questionada (REHNER e UECKER 1994)
Trabalhos incluindo estudos de cruzamentos mostraram que esse criteacuterio natildeo eacute
suficiente para classificaccedilatildeo ao niacutevel de espeacutecie Aleacutem disso isolados de Phomopsis
provenientes do mesmo hospedeiro natildeo necessariamente pertencem agrave mesma espeacutecie
assim como uma mesma espeacutecie de Phomopsis pode infectar diferentes hospedeiros
(REHNER e UECKER 1994)
Foram descritas mais de 1000 espeacutecies do gecircnero Phomopsis baseado
principalmente na associaccedilatildeo com o hospedeiro (UECKER 1988) Embora o
hospedeiro seja atualmente considerado menos importante na definiccedilatildeo de espeacutecies
nenhuma revisatildeo do gecircnero foi realizada A fase teleomoacuterfica (Diaporthe) foi descrita
apenas para aproximadamente 20 das espeacutecies do gecircnero Phomopsis (PHILLIPS
2006) Essa ausecircncia da fase teleomorfica (Diaporthe) em meio de cultura
(principalmente quando isolado endofiticamente) torna a identificaccedilatildeo ao niacutevel de
espeacutecie neste gecircnero muito difiacutecil (REHNER e UECKER 1994)
Wehmeyer (1933) elaborou uma revisatildeo do gecircnero Diaporthe o autor
considerou a associaccedilatildeo com o hospedeiro uma caracteriacutestica de menor importacircncia
tendo reduzido de 650 para 70 o nuacutemero de espeacutecies no gecircnero No entanto este
estudo baseou-se unicamente em caracteriacutesticas morfoloacutegicas do teleomorfo natildeo tendo
sido consideradas as caracteriacutesticas do anamorfo
A delimitaccedilatildeo de espeacutecies de Phomopsis baseado apenas em caracteriacutesticas
morfoloacutegicas demonstrou-se inadequada (VAN DER AA 1990) Em adiccedilatildeo as
caracteriacutesticas de morfologia do coniacutedio e caracteriacutesticas da colocircnia usadas para
identificar espeacutecies alguns autores tecircm utilizado caracteres alternativos que incluem
virulecircncia (VIDIC 1991) proteiacutenas e sorologia (LEE e SNOW 1992 VELICHETI et al
24
1991) sequumlecircncias ITS (ZHANG et al 1998) e enzimas e metaboacutelitos secundaacuterios
(SHIVAS ALLEN e WILLIAMSON 1991) Infelizmente nenhum caraacuteter foi aplicaacutevel
para distinguir todos os grupos de isolados (REHNER e UECKER 1994)
O entendimento sobre o gecircnero expandiu-se por meio de estudos de sequumlecircncias
ITS nos quais alguns dos isolados agruparam-se por regiotildees geograacuteficas (REHNER e
UECKER 1994) Alguns trabalhos tecircm comparado dados morfoloacutegicos com dados
moleculares principalmente o uso de sequumlecircncias da regiatildeo ITS do DNA ribossomal
Zhang et al (1998) destingiu cinco taacutexons de Phomopsis isolados de Soja (Glycine
max) utilizando sequumlecircncias da regiatildeo ITS do DNA ribossomal poreacutem natildeo foram
capazes de diferenciar-los com base nas caracteriacutesticas morfoloacutegicas Farr et al (2002)
caracterizaram por anaacutelise molecular com o uso de sequumlecircncias ITS1 58S ITS2 e por
caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de Phomopsis sp isolados de Vaccinium
corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse estudo verificaram que a maioria dos
isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma vez que as sequumlecircncias agruparam-se
com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
Castlebury e Mengistu (2006) avaliaram Phomopsis isolados de soja e outros
hospedeiros combinando dados de sequumlecircncias de ITS do DNA ribossomal o
sequumlenciamento do gene EF1-alpha e genes de actina seis grupos de Phomopsis
foram formados desses trecircs correspondem aos taacutexons P longicolla Diaporthe
melonis e D phaseolorum Os autores concluiacuteram entatildeo que agrave ausecircncia de distinccedilatildeo
morfoloacutegica e informaccedilatildeo bioloacutegica torna problemaacutetica a identificaccedilatildeo de espeacutecies aos
grupos de isolados geneticamente distintos Aleacutem disso natildeo estaacute esclarecida a
importacircncia bioloacutegica e geneacutetica dos diferentes grupos e trabalhos adicionais quanto
aos hospedeiros patogenicidade e morfologia satildeo necessaacuterios para resolver a distinccedilatildeo
de espeacutecies neste gecircnero
O gecircnero Phomopsis eacute um importante grupo de fungos com potencial
biotecnoloacutegico devido agrave produccedilatildeo de importantes metaboacutelitos secundaacuterios entre os
quais se incluem o micotoxinas que afeta o sistema nervoso de vertebrados (BILLS et
al 2002) alcaloacuteides com capacidades farmacoloacutegicas tais como phomopsins
(COCKRUM PETTERSON e EDGAR 1994) e 24-diidroxi-56-dimetil benzoato de etila
25
e phomopsilactona produzidos por Phomopsis cassiae endofiacutetico de Cassia
specatabilis (SILVA et al 2005)
38 Marcadores Moleculares
A variabilidade geneacutetica em microrganismos pode ser detectada por teacutecnicas
claacutessicas ou moleculares As teacutecnicas claacutessicas baseiam-se na anaacutelise de fenoacutetipos a
partir da caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica (produccedilatildeo de coniacutedios crescimento radial da
colocircnia) ou bioquiacutemica (produccedilatildeo de substacircncias auxotrofias) restringindo a
possibilidade de se conduzir estudos populacionais e muitas vezes de sistemaacutetica As
teacutecnicas moleculares por sua vez fornecem ferramentas para evidenciar e entender
melhor diversos aspectos relacionados direta ou indiretamente com o DNA Desta
forma a anaacutelise dos aacutecidos nucleacuteicos vem sendo amplamente utilizada na diferenciaccedilatildeo
de organismos e no esclarecimento taxonocircmico e filogeneacutetico dos organismos
estudados
Os diversos meacutetodos de detecccedilatildeo de polimorfismo geneacutetico diretamente ao niacutevel
de aacutecidos nucleacuteicos tecircm permitido a anaacutelise molecular da variabilidade do DNA
determinando pontos de referecircncia nos cromossomos tecnicamente denominados
ldquomarcadores molecularesrdquo Por marcador molecular define-se todo e qualquer fenoacutetipo
molecular oriundo de um gene expresso ou de um segmento especiacutefico de DNA
(GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Os dados moleculares frequumlentemente complementam e corroboram hipoacuteteses
baseadas em estudos morfoloacutegicos embora algumas vezes os resultados obtidos da
anaacutelise de DNA sejam conflitantes com dados de anaacutelise exclusivamente feneacuteticas
Esta contradiccedilatildeo pode ser observada principalmente na classificaccedilatildeo taxonocircmica de
microrganismos (SAMUELES e SEIFERT 1995)
Algumas teacutecnicas moleculares utilizadas principalmente em fungos para a
detecccedilatildeo do polimorfismo geneacutetico de sequumlecircncias de DNA satildeo Eletroforese em Campo
Pulsado (PFGE) Polimorfismos dos fragmentos de Restriccedilatildeo (RFLPs) Polimorfismos
26
do DNA Amplificados ao Acaso (RAPDs) Sequumlenciamento das Regiotildees Internas
Transcritas (ITS1 e ITS2) do DNA ribossocircmico (rDNA)
Aleacutem de avaliarem a variabilidade geneacutetica estes marcadores moleculares
podem determinar relaccedilotildees filogeneacuteticas como tambeacutem colaborar na identificaccedilatildeo de
um determinado isolado Tais marcadores podem ser gerados independentemente do
fenoacutetipo e revelar polimorfismos altamente informativos em sequumlecircncias de DNA
A teacutecnica de RFLP surgiu a partir da descoberta de que os siacutetios para enzimas
de restriccedilatildeo poderiam ser polimoacuterficos ou seja alteraccedilotildees em um uacutenico par de bases
que muitas vezes satildeo neutras poderiam ser detectadas pela presenccedila ou ausecircncia
destes siacutetios para endonucleases Esta teacutecnica propiciou a introduccedilatildeo de um elevado
nuacutemero de marcadores moleculares nas anaacutelises de variabilidade geneacutetica (ALBERTS
et al 2004) Dentre as inuacutemeras aplicaccedilotildees dos marcadores RFLP pode-se citar o
estudo da evoluccedilatildeo dos genomas a identificaccedilatildeo de genes especiacuteficos o estudo de
geneacutetica de populaccedilotildees a taxonomia e obtenccedilatildeo de mapas geneacuteticos (MICHELEMORE
e HULBERT 1987) Entretanto seu uso torna-se limitado pois eacute necessaacuterio DNA de
alta qualidade e em grande quantidade (GLIENKE 1995)
O uso do DNA ribossomal (rDNA) como marcador molecular tambeacutem pode ser
empregado na anaacutelise da variabilidade geneacutetica para uma ampla faixa de niacuteveis
taxonocircmicos As sequumlecircncias codificantes do rDNA evoluem muito lentamente e satildeo
altamente conservadas possibilitando a sua utilizaccedilatildeo em estudos com organismos
pouco relacionados taxonomicamente Ao contraacuterio do rDNA as regiotildees espaccediladoras
internas destes genes conhecidas como ITS evoluem rapidamente apresentando alto
polimorfismo e sendo desta forma de grande interesse nos estudos filogeneacuteticos de
gecircneros espeacutecies e populaccedilotildees (WHITE e MORROW 1990)
A reaccedilatildeo em cadeia da polimerase (PCR) tornou-se uma das mais importantes e
utilizadas teacutecnicas em Biologia Molecular por apresentar rapidez baixo custo e
capacidade de amplificaccedilatildeo de pequenas quantidades de DNA (MULLIS e FALOONA
1987 WHITE e MORROW 1989)
Concebida por KARY MULLIS em meados da deacutecada de 80 a teacutecnica baseia-se
em amplificar fragmentos de sequumlecircncias de DNA com alta especificidade e fidelidade
27
utilizando oligonucleotiacutedeos especiacuteficos ou natildeo Tais oligonucleotiacutedeos delimitam a
sequumlecircncia de DNA gerando um sinal molecular que pode ser amplificado (MULLIS e
FALOONA 1987 WHITE e MORROW 1989 McPHERSON QUIRKE e TAYLOR
1991 GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
A PCR consiste em uma teacutecnica in vitro capaz de produzir muacuteltiplas coacutepias de
sequumlecircncias especificas de DNA Alterando-se as condiccedilotildees de reaccedilatildeo pode-se
amplificar cadeias simples de DNA detectar e distinguir entre genes portadores de
mutaccedilatildeo em uma uacutenica base ou proporcionar quantidades suficientes de DNA para
anaacutelise eou manipulaccedilatildeo subsequumlente (WALKER e RAPLEY 1999)
Uma das limitaccedilotildees da teacutecnica PCR eacute a necessidade do conhecimento preacutevio da
sequumlecircncia que flanqueia o segmento a ser amplificado para que os oligonucleotiacutedeos
possam ser construiacutedos (WATSON et al 1992 ALBERTS et al 2004) A teacutecnica de
RAPD entretanto natildeo apresenta este obstaacuteculo pois segundo Williams et al (1990)
esta teacutecnica baseia-se na amplificaccedilatildeo de segmentos de DNA por um uacutenico
oligonucleotiacutedeo de sequumlecircncia arbitraacuteria que amplifica vaacuterias regiotildees simultaneamente
381 Marcadores RAPD
O RAPD (polimorfismo do DNA amplificado ao acaso) envolve a utilizaccedilatildeo de
oligonucleotiacutedeos de sequumlecircncia arbitraacuteria que amplificam vaacuterias regiotildees do genoma
simultaneamente (WILLIAMS et al 1990 WELSH E MCCLELLAND 1990
VILARINHOS et al 1995 FUNGARO et al 1996 ALZATE-MARIN et al 1997
ABBASI et al 1999 PAAVANEM-HUHTALA AVIKAINEM e YLI-MATTILA 2000)
Dessa forma natildeo eacute necessaacuterio o desenvolvimento preacutevio de uma biblioteca de sondas
especiacuteficas para o organismo de interesse
A teacutecnica de RAPD utiliza o mesmo princiacutepio da PCR (SAIKI et al 1985) A
principal diferenccedila entre a PCR usual e o RAPD estaacute na reaccedilatildeo de amplificaccedilatildeo que
utiliza apenas um uacutenico oligonucleotiacutedeo com sequumlecircncia arbitraacuteria de 10 a 15 bases A
amplificaccedilatildeo somente ocorre se este oligonucleotiacutedeo for complementar a um siacutetio em
uma das fitas e complementar a um mesmo siacutetio (orientaccedilatildeo invertida) na outra fita de
28
DNA (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998) Segundo Williams et al (1993) o tamanho
ideal do oligonucleotiacutedeo para amplificaccedilatildeo de RAPD eacute em torno de dez bases
devendo seu conteuacutedo GC ser em torno de 50 a 70 e no miacutenimo de 40 Aleacutem disso
os oligonucleotiacutedeos natildeo devem conter sequumlecircncias palindrocircmicas a fim de evitar o
autopareamento
Os marcadores RAPD tecircm sido amplamente utilizados para o estudo de diversos
grupos de seres vivos A partir dos marcadores moleculares clonados e sequumlenciados
haacute a possibilidade de sintetizar oligonucleotiacutedeos especiacuteficos aumentando o seu poder
de resoluccedilatildeo (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Esses marcadores permitem caracterizar e avaliar o grau de similaridade
geneacutetica entre genoacutetipos em niacuteveis inter e intraespeciacuteficos sendo altamente sensiacuteveis
quanto diferenccedilas de ateacute um uacutenico nucleotiacutedeo entre o oligonucleotiacutedeo e o DNA molde
Permitem ainda analisar a estrutura geneacutetica de populaccedilotildees naturais populaccedilotildees de
melhoramento e bancos de germoplasma a construccedilatildeo de mapas geneacuteticos de alta
cobertura genocircmica a localizaccedilatildeo de genes de interesse econocircmico e ainda a
obtenccedilatildeo de novos marcadores para diagnoacutesticos via PCR (FUNGARO e VIEIRA 1998
FUNGARO 2000 GLIENKE-BLANCO et al 2002 ANCHORENA-MATIENZO 2002)
Diferentes niacuteveis taxonocircmicos podem ser inferidos atraveacutes de marcadores
RAPD cujos padrotildees podem apresentar-se como variaacuteveis quando polimoacuterficos e
constantes quando natildeo-polimoacuterficos
Avaliando a variabilidade geneacutetica de organismos geneticamente relacionados
diversos autores confrontaram resultados obtidos a partir de anaacutelises moleculares ao
niacutevel de proteiacutenas com os dados obtidos a partir de marcadores moleculares de DNA
Meijer Megnegneau e Linders (1994) estudando linhagens de Phomopsis subordinaria
isoladas de 23 localidades diferentes chegaram a resultados conflitantes obtidos por
RAPD e isoenzimas Os marcadores de RAPD mostraram alta similaridade entre 47
linhagens de P subordinaria isoladas de oito localidades diferentes enquanto a anaacutelise
por isoenzimas sugeriu que todas as linhagens eram idecircnticas
Jaacute Pioli et al (2003) caracterizaram por RAPD isolados do complexo
DiaporthePhomopsis coletados de soja na Argentina Eles foram separados em quatro
29
grupos (i) Diaporthe phaseolorum variedade meridionalis (ii) D phaseolorum variedade
caulivora (iii) D phaseolorum variedade sojae and (iv) Phomopsis longicolla revelando
a existecircncia de variabilidade entre isolados da mesma variedade
Fernandez e Hanlin (1996) obtiveram resultados concordantes entre a anaacutelise
molecular por RAPD e as caracteriacutesticas morfoculturais separando os isolados
coletados de soja em dois grupos Diaporthe phaseolorum e Phomopsis longicolla
Os marcadores de RAPD tambeacutem podem ser usados na anaacutelise de
recombinantes obtidos por parameiose em Beauveria bassiana (DALZOTO et al 2003)
A teacutecnica RAPD tambeacutem eacute utilizada como um meacutetodo eficiente na diferenciaccedilatildeo
de microrganismos patogecircnicos e natildeo patogecircnicos Guthirie et al (1992) e Vasconcelos
(1994) caracterizaram diferentes espeacutecies do gecircnero Colletotrichum diferenciando-as
quanto agrave sua patogenicidade
Grajal-Martin Simon e Muehlbauer (1993) conseguiram diferenciar o tipo 2 de
Fusarium oxysporum f sp pisi de trecircs outros grupos por marcadores RAPDs Da
mesma maneira isolados patogecircnicos de Fusarium oxysporum f sp dianthi que
atacam cravos puderam ser distinguidas de vaacuterios natildeo patogecircnicos por marcadores
RAPD (MANULIS et al 1993)
Blanco (1999) utilizando seis oligonucleotiacutedeos de RAPD confirmou a existecircncia
de trecircs populaccedilotildees distintas de Guignardia citricarpa coexistindo em citros sendo duas
endofiacuteticas e uma patogecircnica responsaacutevel pelas lesotildees da mancha preta nos citros
Glienke-Blanco et al (2002) utilizando sete oligonucleotiacutedeos de RAPD encontraram
alta variabilidade geneacutetica em linhagens endofiacuteticas de Guignardia citricarpa isoladas
de plantas assintomaacuteticas de citros
382 Marcadores ITS
O DNA ribossocircmico contido nas regiotildees organizadoras de nucleacuteolos (NOR) tem
sido objeto de um grande nuacutemero de estudos com diversas aplicaccedilotildees em geneacutetica
evoluccedilatildeo e melhoramento Tal interesse estaacute diretamente relacionado agrave estrutura
destas regiotildees que se encontram em locais especiacuteficos do genoma e repetidos em
30
sequumlecircncia inuacutemeras vezes A funccedilatildeo do rDNA eacute codificar as diferentes moleacuteculas de
RNA ribossocircmico (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Segundo White et al (1990) as regiotildees espaccediladoras internas do DNA
ribossomal (ITS) evoluem rapidamente apresentando alto polimorfismo ao contraacuterio
do rDNA e sendo assim essas regiotildees satildeo de grande interesse nos estudos
filogeneacuteticos em niacuteveis de gecircnero espeacutecies e populaccedilotildees Esta caracteriacutestica permite
ainda a sua utilizaccedilatildeo na obtenccedilatildeo de polimorfismos de comprimento de fragmentos
(RFLP) nos loci de rDNA O nuacutemero de coacutepias de uma determinada sequumlecircncia de
rDNA e variaccedilotildees de nucleotiacutedeos nestas sequumlecircncias tambeacutem tecircm sido utilizados em
tais estudos (FERREIRA 1994)
Orsquodonnell e Gray (1995) avaliaram a relaccedilatildeo filogeneacutetica e a variaccedilatildeo geneacutetica
dentro de 24 isolados do complexo Fusarium solani por meio da sequecircncia de rDNA e
marcador RFLP e concluiacuteram que esta espeacutecie eacute formada por espeacutecies filogeneacuteticas
distintas Utilizando a mesma teacutecnica Ouellet e Seiffert (1993) diferenciaram F
graminearum de outras 11 espeacutecies que atacam trigo aleacutem de terem permitido a
identificaccedilatildeo de diversas raccedilas desta espeacutecie provenientes de isolados
morfologicamente semelhantes
Jasalavich Ostrofskf e Jellison (2000) utilizaram os oligonucleotiacutedeos ITS1 e
ITS4 (especiacutefico para basidiomicetos) na identificaccedilatildeo de microrganismos A
amplificaccedilatildeo da regiatildeo ITS1-58S-ITS2 detectou a presenccedila de basidiomicetos em
diferentes amostras Testes complementares foram realizados no produto da
amplificaccedilatildeo por meio da teacutecnica de RFLP permitindo a identificaccedilatildeo de espeacutecie
Satoko et al (2000) e Promputtha et al (2005) utilizaram a regiatildeo ITS1 58S e
ITS2 do rDNA para identificar fungos endofiacuteticos que natildeo esporularam sendo relatados
como Phomopsis e Diaporthe (anamoacuterfico Phomopsis)
Farr Castlebury e Rossman (2002) caracterizaram por anaacutelise molecular com o
uso de sequumlecircncias ITS1 58S ITS2 e por caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de
Phomopsis sp isolados de Vaccinium corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse
estudo verificaram que a maioria dos isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma
vez que as sequumlecircncias agruparam-se com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
31
Mostert et al (2001) tambeacutem usaram anaacutelise filogeneacutetica das regiotildees 58S ITS1
e ITS2 e DNA mitocondrial para elucidar a taxonomia de espeacutecies de Phomopsis
obtidas de vinhedos Eles observaram que os fungos endofiacuteticos tratavam-se de
Diaporthe perjuncta e Phomopsis sp taacutexon 1 Jaacute os isolados patogecircnicos e com alta
virulecircncia pertenciam a espeacutecie Phomopsis viticola assim como os isolados descritos
em estudos anteriores como Phomopsis taacutexon 2 Eles tambeacutem puderam elucidar que
os isolados descritos na Austraacutelia como Phomopsis taacutexon 4 tratavam-se de Libertella
sp excluindo-o do complexo P viticola
Djaouida et al (2004) sequenciaram as regiotildees ITS1 58S e ITS2 e do gene
mitocondrial atp6 para avaliar a diversidade molecular de linhagens patogecircnicas contra
o girassol de Diaporthe helianthi (anamoacuterfico Phomopsis helianthi) isolados de
diferentes origens geograacuteficas
32
4 MATERIAL E MEacuteTODOS 41 Material Bioloacutegico 411 Fungos endofiacuteticos
Quarenta e oito isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp e um de Diaporthe sp
foram utilizados neste estudo (TABELA 1) Destes oito foram cedidos cordialmente pela
Dra Kaacutetia Rodriguez e foram isolados de Spondias mombin (Cajazeiro) Myracrodruon
urundeuva (Aroeira) e Aspidosperma tomentosum (Peroba-de-campos) e dois isolados
de Maytenus ilicifolia (Espinheira Santa) cedidos gentilmente pela Dra Socircnia Pileggi
Dezessete isolados foram obtidos de amostras de folhas de Schinus terebinthifolius
(Aroeira Vermelha) coletados em 2007 pelo MsC Jocinei Lima e fazem parte do banco
bioloacutegico do Laboratoacuterio de Geneacutetica de Microrganismos (LABGEM) da Universidade
Federal do Paranaacute Curitiba Paranaacute Vinte e um isolados de Phomopsis sp e um
isolado de Diaporthe sp foram obtidos como endoacutefitos de folhas e peciacuteolos de M
ilicifolia (espinheira santa) em quatro coletas de outubro de 2006 a julho de 2007 no
Centro Nacional de Pesquisa de Floresta (CNPF) da EMBRAPA (Empresa Brasileira de
Pesquisa Agropecuaacuteria) localizada no municiacutepio de Colombo Paranaacute Dois isolados de
Phomopsis patoacutegenos de soja foram utilizados como linhagens referecircncia (TABELA 1)
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUA)
Coacutedigo Hospedeiro Procedecircncia Isolados por SM9631 Spondias mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9713 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9638 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9714 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)MU0123 Myracrodruon urundeuva Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)AT9810 Aspidosperma Jardim Botacircnico do Dra Kaacutetia Rodriguez do
33
tomentosum Rio de JaneiroRJ IOC (FIOCRUZRJ)AT9811 A tomentosum Jardim Botacircnico do
Rio de JaneiroRJ Dra Kaacutetia Rodriguez do IOC (FIOCRUZRJ)
AT9906 A tomentosum Jardim Botacircnico do Rio de JaneiroRJ
Dra Kaacutetia Rodriguez do IOC (FIOCRUZRJ)
ES80J Maytenus ilicifolia ColomboPR Dra Socircnia A V Pileggi no LABGEMPR
ESPAC22 Maytenus ilicifolia ColomboPR Dra Socircnia A V Pileggi no LABGEMPR
A135 Schinus terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A113 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A115B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A323 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A123 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A131 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A216B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A126 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A333B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A134 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A132 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A333A S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A124 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A215A S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A116 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A334 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A321 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
ES2WF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2WC1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2KF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2NA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUACcedilAtildeO)
34
ES2AB1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESBA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESDF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFH1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFB2 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESGA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESGF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESIE1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESIA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJH1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJG1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJE1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJE2 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESKD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESRD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESSD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
PHO1 (Phomopsis longicolla)
Glycine max (L) Merr Mato Grosso Dr Aacutelvaro Almeida EMBRAPALondrina-PR
PHO19 Glycine max (L) Merr Roraima Dr Aacutelvaro Almeida EMBRAPALondrina-PR
FONTE O autor
NOTA patoacutegenos de soja
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUACcedilAtildeO)
35
412 Microrganismos usados para teste de antagonismo
Para determinar a atividade antimicrobiana dos isolados foram utilizadas as
seguintes linhagens teste G citricarpa linhagens PC1396 e PC3305 pertencentes ao
banco bioloacutegico do Laboratoacuterio de Geneacutetica de Microrganismos da Universidade
Federal do Paranaacute
413 Fungos endofiacuteticos utilizados para anaacutelise de variabilidade geneacutetica
Como grupo externo para anaacutelise de variabilidade geneacutetica por RAPD foram
utilizadas cinco linhagens de Pestalotiopsis sp (TABELA 2)
TABELA 2 ISOLADOS GRUPO EXTERNO PARA ANAacuteLISE DE VARIABILIDADE GENEacuteTICA POR RAPD
Coacutedigo Hospedeiro Procedecircncia Pestalotiopsis phothiniae Gustavia cf eliacuteptica Amazonia Pestalotiopsis neglecta voucher Muraya paniculata Amazonia Pestalotiopsis vismeae Maytenus ilicifolia Paranaacute Pestalotiopsis sp 3 Maytenus ilicifolia Paranaacute Pestalotiopsis sp 11 Maytenus ilicifolia Paranaacute FONTE O autor NOTA Isolado cedidos pelo Profordm Dr Joseacute Odair Pereira da Universidade Federal do Amazonas Isolados por Josiane Gomes Figueiredo no LABGEMPR 42 Meios de Cultura 421 Caldo MEB (Extrato de Malte)
Extrato de Malte 20g
Glicose 20g
Peptona 1g
Aacutegua destilada p1000mL
36
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
422 Meio AV (Aveia-Aacutegar) Aveia 300 g
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
A aveia foi fervida durante 30 minutos com metade do volume da aacutegua A
suspensatildeo foi filtrada com gaze Adicionou-se aacutegua para completar o volume O pH foi
ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a necessidade
Acrescentou-se o aacutegar
423 Meio BDA (Meio Batata-Dextrose-Aacutegar)
Batata 2000g
Dextrose 100g
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
As batatas foram cozidas em 500 mL de aacutegua destilada durante 20 minutos Em
seguida foram filtradas com gaze adicionou-se a dextrose ao caldo e completou-se
com aacutegua destilada para 1000 mL O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N
eou HCl 1N conforme a necessidade Acrescentou-se o aacutegar
37
424 Meio MC (Meio Completo) PONTECORVO et al 1953
NaNO3 60g
KH2PO4 15g
KCl 05g
MgSO47H2O 05g
FeSO4 002g
ZnSO4 002g
Glicose 100g
Peptona 20g
Extrato de levedura 20g
Caseiacutena hidrolisada 15g
Soluccedilatildeo de vitaminas 10mL
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
425 Meio MEA (Extrato de Malte) PATERSON e BRIDGE 1994
Extrato de Malte 20g
Glicose 20g
Peptona 1g
Agar 15g
Aacutegua destilada p1000mL
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
38
OBS Todos os meios de cultura foram autoclavados durante 20 minutos a 1 atm e
armazenados em temperatura ambiente
43 Soluccedilotildees e Reagentes 431 Clorofane ndash FenolClorofoacutermio (11)
432 Clorofil ndash ClorofoacutermioAacutelcool Isoamiacutelico (241)
433 Derozal Bayerreg - 1mg de carbendazim em 1mL de aacutegua destilada
434 Dodecil Sulfato de Soacutedio (SDS) 10 (pv) em aacutegua destilada
435 Fenol Saturado
Um volume de fenol cristalizado foi dissolvido em banho-maria a 60degC e
acrescentado um volume de tampatildeo Tris-HCl 02 M pH 80 Apoacutes agitaccedilatildeo por 30
minutos a fase aquosa foi retirada e entatildeo acrescentado um volume de tampatildeo Tris-
HCl 02 M pH 80 Este processo foi repetido ateacute atingir o pH desejado (pH 80) Em
seguida foi adicionado um volume final de 110 do tampatildeo Tris-HCl 02 M pH 80 e
estocado em frasco escuro a uma temperatura de 4degC usado apoacutes 48 horas
(SAMBROOK E MANIATS 1989)
436 Gel de Agarose 08 (pv) em Tampatildeo TBE 1x
437 Gel de Agarose15 (pv) em em Tampatildeo TBE 1x
438 Lactofenol azul Aacutecido laacutetico 200 g
Cristais de fenol 200 g
Glicerina 200 g
39
Azul de algodatildeo (Metyl Blue Difco) 005 g
Aacutegua destilada 200 mL
Os cristais de fenol foram derretidos em banho-maria Adicionaram-se os demais
componentes Depois de 24 horas filtrou-se e armazenou-se em frasco escuro
439 Marcador de peso molecular (DNA de fago lambda clivado com Hind III Gibco)
O marcador de peso molecular do DNA foi fornecido concentrado e no momento
do uso diluiu-se na proporccedilatildeo de 1 μL do marcador 1 μL do tampatildeo da amostra 4 μL
de aacutegua Milli-Q esterilizada Na corrida eletroforeacutetica foi utilizado 6 μL do marcador
4310 Marcador de peso molecular (DNA Ladder 100pb Ludwing Biotec)
O marcador de peso molecular foi fornecido concentrado e no momento do uso
diluiu-se na proporccedilatildeo de 1 μL do marcador 2 μL do tampatildeo da amostra 7 μL de aacutegua
Milli-Q autoclavada Na corrida eletroforeacutetica foram utilizados 15 μL do marcador
4311 Oligonucleotiacutedeos (Invitrogen)
Foi adicionado Tris-HCl 10 mM pH70 aos oligonucleotiacutedeos para obter uma
soluccedilatildeo estoque com 50 μM No momento do uso a soluccedilatildeo estoque foi diluiacuteda para
concentraccedilatildeo final de 4μM
4312 RNAse (invitrogen)
A soluccedilatildeo foi preparada na concentraccedilatildeo de 10 mM de Tris-HCl pH 75 e 15 mM
de NaCl Aqueceu-se a 100degC por 15 minutos e estocou-se a ndash 20degC
40
4313 Soluccedilatildeo de Vitaminas Aacutecido Nicotiacutenico 1000 mg
Aacutecido para Aminobenzoacuteico 100 mg
Biotina 02 mg
Piridoxina 500 mg
Riboflavina 1000 mg
Tiamina 500 mg
Aacutegua destilada esterilizada p 1000 mL
A soluccedilatildeo foi aquecida em banho-maria a 98degC por 15 minutos e armazenada em
frasco escuro previamente autoclavado a 4degC
4314 Soluccedilatildeo de NaCl 085 (pv) em aacutegua destilada
4315 Soluccedilatildeo Tween-80 01 (vv) em aacutegua destilada
4316 Soluccedilatildeo de Tetraciclina 5 (pv) em etanol absoluto Preparou-se a soluccedilatildeo sob
agitaccedilatildeo e estocou-se em frasco escuro a ndash 20degC
4317 Soluccedilatildeo de EDTA 05M em aacutegua destilada O pH foi ajustado para 80
adicionando-se NaOH 1N
4318 Soluccedilatildeo de brometo de etiacutedio 1 (pv) em aacutegua destilada O brometo de etiacutedio
foi dissolvido em aacutegua destilada agitou-se e estocou-se a temperatura ambiente
protegido de luz No momento do uso adicionou-se 3μL desta soluccedilatildeo a 100 mL de
tampatildeo TBE (1X)
41
4319 Tampatildeo TE (Tris-EDTA)
Tris-HCl pH 80 100 mM
EDTA pH 80 10 mM
4320 Tampatildeo de Extraccedilatildeo de DNA Tris-HCl pH 80 2000 mM
EDTA pH 80 250 mM
NaCl 2500 mM
SDS (pv) 1
O tampatildeo de Extraccedilatildeo foi preparado no momento do uso
4321 Tampatildeo da Amostra (6x)
Azul de bromofenol3 1000 mL
Glicerol 1035 mL
Aacutegua destilada p 50 mL
4322 Tampatildeo de corrida TBE 10x
Trizma base 54g
Aacutecido boacuterico 275g
EDTA 465g
Aacutegua Milli-Q p 500mL
A soluccedilatildeo foi autoclavada e estocada a temperatura ambiente No momento do
uso diluiu-se 10 vezes com aacutegua Milli-Q
42
44 Isolamento
A metodologia utilizada para o isolamento dos microrganismos endofiacuteticos foi
descrita por Petrini (1991) modificada por Glienke (1995) Os diferentes oacutergatildeos da
planta temperatura de incubaccedilatildeo nuacutemero de plantas e o de fragmentos plaqueados
estatildeo listados na tabela 3
Isolamento Eacutepoca do ano Oacutergatildeo da
planta Temperatura
de incubaccedilatildeo
Nuacutemero de Plantas
Nuacutemero de fragmentos plaqueados
1 Outubro de 2006 Folha 28deg C 20 360 2 Marccedilo de 2007 Folha 22-23deg C 30 540 3 Julho de 2007 Folha 22-23deg C 20 360 4 Julho de 2007 Peciacuteolo 22-23deg C 20 160
Total de fragmentos plaqueados 1360
FONTE O autor
Os fungos foram isolados de plantas aparentemente sadias com folhas sem
marcas arranhaduras ou ferimentos Apoacutes a coleta as folhas foram colocadas em
sacos plaacutesticos devidamente identificados em seguida as superfiacutecies das folhas foram
lavadas em aacutegua corrente com auxiacutelio de uma esponja para a remoccedilatildeo dos
microrganismos epifiacuteticos e outros contaminantes Os peciacuteolos foram vedados com
parafina derretida para evitar a entrada dos desinfetantes nos seus tecidos internos
desta forma preservando os endoacutefitos a serem isolados As folhas vedadas foram
mergulhadas em frascos com aacutegua destilada autoclavada sendo mantidos por 1
minuto em etanol 70 por 1 minuto em hipoclorito de soacutedio (NaOCl) a 3 por 6
minutos etanol 70 por 30 segundos e por uacuteltimo em aacutegua destilada autoclavada por
6 minutos Devido agrave dificuldade de isolar fungos do gecircnero Phomopsis nos isolamentos
1 e 2 foi reduzido o tempo de tratamento com hipoclorito de soacutedio para 4 minutos nos
isolamentos 3 e 4 (TABELA 3) As folhas foram cortadas em seis fragmentos de 5-7 mm
e os peciacuteolos foram cortados das folhas e oito deles foram transferidos para placas de
TABELA 3 EacutePOCAS DO ANO OacuteRGAtildeOS DA PLANTA CONDICcedilOtildeES DE INCUBACcedilAtildeO E NUacuteMERO DE FRAGMENTOS PLAQUEADOS NAS QUATRO COLETAS DE ENDOacuteFITOS DE ESPINHEIRA-SANTA
43
Petri (90 mm) contendo os meios de cultura BDA adicionados de Tetraciclina (10
mgmL) para impedir o crescimento bacteriano (ARAUJO et al 2002)
Como controle apoacutes o processo de desinfestaccedilatildeo foram inoculados 01 mL da
uacuteltima aacutegua autoclavada utilizada no tratamento em trecircs placas de Petri As placas
permaneceram incubadas nas mesmas condiccedilotildees do isolamento
45 Conservaccedilatildeo dos fungos
Os isolados foram estocados utilizando-se duas metodologias 1) em frascos
contendo meio de cultura BDA inclinado apoacutes sete dias de crescimento a 28degC foram
mantidos a 4degC realizando-se repiques mensalmente 2) em frascos contendo aacutegua
destilada esterilizada com 12 discos de 5 mm meio de cultura BDA contendo miceacutelios
Repetiu-se o procedimento a cada trecircs meses
46 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica
A caracterizaccedilatildeo macromorfoloacutegica dos isolados de Phomopsis foi realizada com
base na forma dos bordos crescimento micelial aspecto da colocircnia e a sua coloraccedilatildeo
no verso e reverso da placa em diferentes meios de cultura Discos de miceacutelio (8 mm)
provenientes de colocircnias de Phomopsis com sete dias de crescimento em meio de
cultura BDA foram inoculados no centro de placas de Petri com diferentes meios de
cultura Batata-dextrose-aacutegar (BDA) aveia-aacutegar (MAV) e extrato de malte-aacutegar (MEA)
Foram incubados durante 14 dias a 22ordmC sob luz contiacutenua Os ensaios foram
realizados em triplicata O diacircmetro das colocircnias foi medido a partir do terceiro dia de
crescimento ateacute o quinto dia quando alguns atingiram completamente as bordas da
placa de Petri
Para anaacutelise da micromorfologia foram avaliados os coniacutedios apoacutes 21 dias de
crescimento Os picniacutedios foram comprimidos entre a lacircmina e a lamiacutenula com uma
gota de lactofenol azul de algodatildeo possibilitando a observaccedilatildeo ao microscoacutepio oacuteptico
44
com aumento de 1000x O comprimento e largura dos coniacutedios foram medidos usando
uma reacutegua na objetiva com escala de 1μM
47 Obtenccedilatildeo de colocircnia monospoacuterica
Apoacutes os isolados terem sido identificados como pertencentes ao gecircnero
Phomopsis colocircnias monospoacutericas foram obtidas cultivando os isolados endofiacuteticos em
placas de Petri com meio BDA a 28degC Observou-se o crescimento da colocircnia e
monitorou-se com observaccedilatildeo em microscopia oacuteptica a produccedilatildeo de esporos Os
picniacutedios foram coletados e macerados em soluccedilatildeo de ldquoTween 80rdquo 01 A suspensatildeo
de esporos foi filtrada com seringas contendo latilde de vidro Em seguida adicionou-se 10
mL de soluccedilatildeo salina Centrifugou-se a soluccedilatildeo filtrada durante 4 minutos a 7000 rpm
Descartou-se o sobrenadante adicionou-se 400 μL de soluccedilatildeo salina para suspender o
precipitado onde ficaram contidos os esporos retirou-se 10 μL desta suspensatildeo sendo
a concentraccedilatildeo estimada em Cacircmara de Neubauer Quando necessaacuterio diluiu-se em
soluccedilatildeo salina para viabilizar a contagem dos esporos Foram semeados 100 μL de
suspensatildeo em uma placa de Petri contendo meio BDA espalhou-se com alccedila de
Drigalsky incubou-se a 28degC Colocircnias isoladas foram selecionadas e repicadas em
tubos com BDA inclinado que apoacutes crescimento por sete dias a 28ordmC foram mantidos a
4degC
48 Caracterizaccedilatildeo Molecular 481 Extraccedilatildeo do DNA (RAEDER e BRODA 1985 modificado por GLIENKE 1995)
O DNA genocircmico foi obtido de acordo com a metodologia descrita por Raeder e
Broda (1985) modificada por Glienke (1995) Os isolados endofiacuteticos de Phomopsis
foram cultivados em meio MEA durante cinco dias a 28degC O miceacutelio obtido a partir da
raspagem da colocircnia com espaacutetula esterilizada foi liofilizado e mantido em freezer ou na
45
sequumlecircncia macerados com adiccedilatildeo de nitrogecircnio liacutequido O material foi pesado e para
cada grama de miceacutelio acrescentou-se 1 mL de Tampatildeo de Extraccedilatildeo Incubou-se a
soluccedilatildeo homogeneizada durante 20 minutos em banho-maria a 70degC Acrescentou-se
um volume de fenol saturado misturaram-se as fases e centrifugou-se durante 15
minutos a 5000 rpm Coletou-se a fase aquosa colocou-se em um novo tubo e
adicionou-se a este um volume de Clorofane Centrifugou-se novamente sob as
mesmas condiccedilotildees anteriores Coletou-se a fase aquosa como na etapa anterior e
adicionou-se um volume de Clorofil repetindo-se o processo de centrifugaccedilatildeo sob as
mesmas condiccedilotildees Coletou-se a fase aquosa em um novo tubo e adicionou-se etanol
absoluto O material foi incubado a ndash 20ordmC durante uma hora Apoacutes este periacuteodo a
suspensatildeo foi centrifugada (10000 rpm por 20 min) desprezou-se o sobrenadante
Acrescentou-se 500 μL de etanol 70 centrifugou-se a 10000 rpm durante 5 minutos
descartou-se o aacutelcool 70 inverteu-se o tubo sobre uma folha de papel absorvente
para secar a borda do tubo e este secou a uma temperatura de 37degC durante 30
minutos Ressuspendeu-se o DNA com 200 μL de aacutegua milli-Q por uma hora
temperatura ambiente As amostras foram tratadas RNAse (30 μgmL) a 37degC por uma
hora
A concentraccedilatildeo de DNA foi estimada por meio de eletroforese em gel de agarose
08 utilizando como padratildeo de peso molecular o DNA do fago λ (Gibco) clivado com
HindIII com concentraccedilatildeo conhecida Apoacutes a eletroforese o gel foi corado com brometo
de etiacutedio observado sobre transiluminador de luz ultravioleta e fotodocumentado
482 RAPD
As soluccedilotildees foram realizadas de acordo com as condiccedilotildees descritas por Glienke-
Blanco et al (2002) onde foram utilizados 50ng de DNA tampatildeo PCR 1x 05U de Taq
polimerase 02mM de oligonucleotideos 02mM de dNTP 3mM de MgCl2 em um
volume final de 25microL Foi realizada uma preacutevia seleccedilatildeo usando-se os oligonucleotiacutedeos
46
da linha OPX11 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) OPX14 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) OPX19 (5rsquo
TCACCACGGT 3rsquo) e OPE 08 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) da Operon Technologiesreg
A amplificaccedilatildeo foi realizada com as condiccedilotildees descritas por Pioli et al (2003)
com modificaccedilotildees sendo cada reaccedilatildeo submetida a 40 ciclos apoacutes a desnaturaccedilatildeo
inicial a 940C por 4 minutos Cada ciclo consiste de 1 minuto a 940C 1 minuto e 30
segundos a 350C e 2 minutos a 720C
4821 Anaacutelise da Variabilidade Geneacutetica
Os produtos de amplificaccedilatildeo foram separados por eletroforese (3 Vcm) em gel
de agarose 15 e posteriormente corados por 20 minutos com soluccedilatildeo de brometo de
etiacutedio Os fragmentos amplificados foram visualizados em um transiluminador de luz
Ultravioleta e a imagem do gel documentada atraveacutes de sistema fotograacutefico Digi-doc it
O marcador de peso molecular utilizado foi o Ladder de 100 pb (Ludwing Biotec)
A anaacutelise da variabilidade geneacutetica foi realizada pelo agrupamento das linhagens
segundo os princiacutepios adotados em taxonomia numeacuterica utilizando o coeficiente de
similaridade de Jaccard que permite calcular similaridades com base em variaacuteveis
binaacuterias (0 para ausecircncia e 1 para presenccedila de banda) As bandas foram consideradas
como variaacuteveis enquanto as linhagens como unidades O coeficiente foi calculado
segundo a foacutermula J=MP onde M eacute o nuacutemero de concordacircncias positivas e P o
nuacutemero total de variaacuteveis menos concordacircncias negativas (SNEATH e SOKAL 1973)
Desta forma o coeficiente de similaridade Jaccard (J) leva em conta apenas as
discordacircncias e as concordacircncias positivas quanto agrave presenccedila ou ausecircncia de bandas
desconsiderando as concordacircncias negativas Quanto maior a semelhanccedila entre duas
linhagens maior eacute o valor de similaridade As unidades foram agrupadas atraveacutes do
meacutetodo UPGMA (Unweighted Pair-Group Method with Arithmetical Average) que eacute um
modelo de agrupamento hieraacuterquico e permite a construccedilatildeo de dendrogramas
(SNEATH e SOKAL 1973) Matrizes e dendrogramas foram elaborados usando o
software NTSYS (Numerical taxonomy system of multivariate programs) (ROHLF
1988)
47
Para verificar a consistecircncia dos agrupamentos verificados foi realizada uma
anaacutelise bootstrap segundo Felsenstein (1985) utilizando o software BOOD (COELHO
2005)
483 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
4831 Amplificaccedilatildeo
A reaccedilatildeo foi realizada com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D (TABELA 4) que
satildeo universais para fungos e permitem amplificar a regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do DNA
Ribossomal
Oligonucleotiacutedeos Sequumlecircncia
LS266 5 TTACGTCCCTGCCCTTTGTA 3
V9D 5GCATTCCCA AA C AACTCGAC 3rsquo
FONTE O autor
As condiccedilotildees da reaccedilatildeo foram realizadas de acordo com a descriccedilatildeo de White et
al (1990) com algumas modificaccedilotildees 50 ng de DNA tampatildeo PCR 1x 15U de Taq
DNA polimerase 08microM de oligonucleotiacutedeos 02mM de dNTP 3mM de MgCl2 para um
volume final de 50microL
A amplificaccedilatildeo foi realizada em um termociclador Eppendorf (Modelo
Mastercycler Gradiente) com desnaturaccedilatildeo inicial a 94degC por 2 minutos 30 ciclos de 30
segundos a 94degC 1 minuto a 56degC 1 minuto a 72degC seguida de extensatildeo final de 3
minutos a 72degC
TABELA 4 SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA AMPLIFICACcedilAtildeO DAREGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL
48
4832 Purificaccedilatildeo da PCR
Foram testadas duas metodologias de purificaccedilatildeo da reaccedilatildeo de PCR
48321 Purificaccedilatildeo com PEG
Aos produtos da amplificaccedilatildeo da PCR com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D
foram acrescentados 50microL de PEG os tubos foram incubados a 37ordmC por 30 minutos
em seguida foram centrifugados por 15 minutos a 14000rpm O sobrenadante foi
descartado com micropipeta Adicionou-se 125microL de Etanol 80 gelado apoacutes 1min os
tubos foram centrifugados por 2 min a 13000 rpm descartou-se o sobrenadante Foram
adicionados 125microL de Etanol 96 (gelado) descartou-se o sobrenadante O Etanol foi
evaporado em speed vac por 10min a 70ordmC O pellet foi ressuspendido em 15 microL de
aacutegua Milli-Q e misturado em seguida ficou agrave temperatura ambiente por pelo menos 2
horas
Para confirmaccedilatildeo da presenccedila do DNA na amostra 1microL foi submetido agrave
eletroforese em gel de agarose 15
48322 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio
Aos produtos da amplificaccedilatildeo da PCR com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D
foram acrescentados 34 microL de acetato de amocircnio (AcNH4) 75M e 100 microL de etanol
96 Os tubos ficaram em temperatura ambiente por 10 minutos e em seguida foram
centrifugados por 15 minutos a 14000rpm Os pellets resultantes foram lavados com
250 microL de etanol 70 (receacutem preparado) centrifugou-se por 15 minutos a 14000rpm e
descartou-se o etanol O pellet foi seco na estufa a 37ordmC por 30 mim e ressuspendidos
em 15microL de aacutegua Milli-Q
Para confirmaccedilatildeo da presenccedila do DNA na amostra 1microL foi submetido a
eletroforese em gel de agarose 15
49
4833 Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento
Foram realizadas trecircs reaccedilotildees de sequumlenciamento a primeira foi realizada
usando o produto tratado com PEG e nas duas posteriores usou-se o produto de PCR
tratado com acetato de amocircnia Para o restante da metodologia natildeo houve alteraccedilatildeo
O sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA foi realizado pelo
meacutetodo de terminaccedilatildeo de cadeia segundo Sanger et al (1977) utilizando a
incorporaccedilatildeo de dideoxinucleotiacutedeos fluorescentes em Sequumlenciador Automaacutetico de
DNA megaBACE
Para a reaccedilatildeo de sequumlenciamento foram utilizados cerca de 50ng da reaccedilatildeo de
PCR purificada 02 microM do oligonucleotiacutedeo ITS1 (TABELA 5) e 4microL de mistura para
sequumlecircnciamento ET (Kit ldquoDYEnamic ET Dye Terminator Cycle Sequencing Kit for
MegaBACErdquo da Amersham Biosciences) completando com aacutegua milli-Q para um
volume final de 10microL As mesmas condiccedilotildees foram aplicadas para o oligonucleotiacutedeo
ITS4 (TABELA 5)
FONTE O autor
A amplificaccedilatildeo foi realizada em um termociclador Eppendorf (Modelo
Mastercycler Gradient) seguindo uma desnaturaccedilatildeo inicial a 96degC por 1 minuto 30
ciclos de 10 segundos a 96degC 1 minuto e 5 segundos a 50degC 4 minutos a 60degC 20 min
a 8degC
Oligonucleotiacutedeos Sequumlecircncia
ITS1 5rsquoTCCGTAGGTGAACCTGCGG3rsquo
ITS4 5rsquoTCCTCCGCTTATTGATATGC3rsquo
TABELA 5 SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA AMPLIFICACcedilAtildeO DAREGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL
50
4834 Purificaccedilatildeo da Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento
Foram testadas trecircs metodologias de purificaccedilatildeo da reaccedilatildeo de sequumlenciamento
48341 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em tubos
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com PEG (item 38321) foram adicionados 40 microL de isopropanol 75
sendo precipitados por um spin down As amostras ficaram agrave temperatura ambiente por
20 minutos em seguida foram centrifugadas por 25 minutos a 13000 rpm e o
isopropanol foi removido por inversatildeo dos tubos Foram adicionados 200 microL de etanol
70 natildeo gelado e centrifugado por 5 minutos a 13000 rpm em seguida o etanol foi
removido com auxiacutelio de uma micropipeta e foi submetido a secagem em speed vac por
45 minutos a 60degC
Apoacutes esse tratamento cada amostra foi ressuspendida em 10 microL Loading
Solution e submetida agrave eletroforese em Sequumlenciador Automaacutetico de DNA modelo
megaBACE da Amersham Biosciences Com os seguintes paracircmetros voltagem de
injeccedilatildeo 2V tempo de injeccedilatildeo 80 segundos voltagem da corrida 8V por 160 minutos
48342 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em placa
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com acetato de amocircnio (item 38322) foram adicionados 40microL de
isopropanol 75 sendo precipitados por um spin down As amostras ficaram agrave
temperatura ambiente por 20 minutos e em seguida foram centrifugadas por 50
minutos a 4000 rpm O isopropanol foi removido por inversatildeo da placa Foram
adicionados 100microL de etanol 70 natildeo gelado e centrifugado por 30 minutos a 4000
rpm em seguida o etanol foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um spin a
300 rpm por 1 minuto Em seguida a placa ficou em estufa a 37degC durante 3 minutos
Apoacutes esse tratamento as amostras foram processadas como no item anterior
51
48343 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com acetato de amocircnio (item 38322) foram adicionados 1 microL de acetato
de amocircnio (AcNH4) 75M e 30 microL de etanol 96 Apoacutes a homogeneizaccedilatildeo por inversatildeo
30 vezes a placa foi centrifugada por 45 minutos a 2500 RCF a 4degC
O sobrenadante foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um spin a 500
RCF com a placa invertida sobre papel toalha O pellet foi lavado com 100 microL de etanol
70 (receacutem preparado natildeo gelado) Seguindo-se uma nova centrifugaccedilatildeo a 2500 RCF
por 45 minutos e o sobrenadante foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um
spin a 750 RCF com a placa invertida sobre papel toalha Em seguida a placa ficou em
estufa a 37degC durante 3 minutos
Apoacutes esse tratamento cada amostra foi ressuspendida e tratada como nos itens
anteriores
Todos os procedimentos desde a reaccedilatildeo de sequumlenciamento foram realizados
sob proteccedilatildeo de luz direta cobrindo a placa com papel alumiacutenio
4835 Ediccedilatildeo e Anaacutelise das Sequumlecircncias
As sequumlecircncias foram entatildeo alinhadas utilizando-se o programa CLUSTAL-W
versatildeo 17 (THOMPSON HIGGINS e GIBSON 1994) sendo realizada posterior
inspeccedilatildeo visual atraveacutes do programa BioEdit 7053 (HALL 1999) Apoacutes a ediccedilatildeo
alinhamento e anaacutelise preacutevia das sequumlecircncias estas foram submetidas ao software
MEGA 31 (KUMAR TAMURA NEI 2004) para obtenccedilatildeo das aacutervores filogeneacuteticas
baseadas em distacircncia A consistecircncia dos noacutes obtidos foi avaliada pelo procedimento
de bootstrap (FELSENSTEIN 1985) com 10000 reamostragens Foram utilizadas como
referecircncias linhagens de Phomopsis sp Diaporthe e Pestalotiopsis vismae (como
grupo externo) depositadas no GenBank (httpwwwncbinlmnihgov) (TABELA 6)
52
TABELA 6 LINHAGENS DE Phomopsis spp E DE Pestalotiopsis vismae UTILIZADAS COMO GRUPO EXTERNO
Espeacutecie Nuacutemero de acesso (GenBank)
Diaporthe Melonis AB105147 D melonis AB105148 Phomopsis longicolla AY857868 P longicolla AF000207 P camptothecae AY622996 D Phaselorum AF001024 D helianthi AJ312348 D helianthi AJ312363 D helianthi AF358441 Phomopsis sp P7 DQ235673 Phomopsis sp P3 DQ235669 P sojae AY050627 P chimonanthi AY622993 Phomopsis sp P4 DQ235670 D conorum AB201443 D conorum DQ116551 P theicola DQ286286 P theicola DQ286287 Phomopsis sp 1 AY485724 Phomopsis sp CBS DQ286285 Phomopsis sp Taxon 3 AF230762 Diaporthe AJ312359 Diaporthe AY745024 Pestalotiopsis vismae EF451801
FONTE O autor
49 Avaliaccedilatildeo da Atividade Antimicrobiana
491 Cultura Pareada
Para avaliar a atividade antimicrobiana dos 49 isolados de Phomopsis sp
endofiacuteticos (TABELA 1) contra o fitopatoacutegeno Guignardia citricarpa foi utilizado a
metodologia de Cultura Pareada (MARIANO1993) Os discos contendo miceacutelio eou
coniacutedios dos isolados endofiacuteticos ou dos fitopatoacutegenos ensaiados foram obtidos de
53
colocircnias crescidas em BDA durante sete dias a 28degC incubadas em estufa BOD e com
fotoperiacuteodo de 12 horas Apoacutes este periacuteodo foram retirados os discos da borda das
colocircnias com auxiacutelio de vazador de rolhas
Em placas de Petri contendo meio de cultura BDA colocou-se um disco (Oslash 8
mm) da cultura do fitopatoacutegeno G citricarpa Apoacutes trecircs dias de crescimento foi
adicionado no lado oposto um disco com o isolado de Phomopsis sp endofiacutetico a ser
avaliado ambos a 10 cm da borda Apoacutes o pareamento as placas foram vedadas com
filme de PVC e mantidas durante 14 dias em estufa BOD com fotoperiacuteodo de 12 h a
28degC Foi realizado um delineamento inteiramente casualizado com cinco repeticcedilotildees O
controle recebeu apenas o fitopatoacutegeno A avaliaccedilatildeo foi realizada mediante mediccedilatildeo do
diacircmetro da colocircnia comparando com o controle e observaccedilatildeo das interaccedilotildees entre as
colocircnias
Para determinar a porcentagem de inibiccedilatildeo do crescimento mediu-se o diacircmetro
das colocircnias do fitopatoacutegeno com 14 dias de crescimento subtraindo-se o diacircmetro do
inoacuteculo original Os caacutelculos foram realizados de acordo com Edginton et al (1971)
pela foacutermula
Onde Dc eacute o diacircmetro meacutedio da colocircnia do fitopatoacutegeno no controle e Dt eacute o
diacircmetro meacutedio da colocircnia do patoacutegeno nos tratamentos testados
492 Avaliaccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
Cobriu-se assepticamente toda a superfiacutecie do meio PDA inclusive nas bordas
com discos de papel celofane (Oslash11 cm) esterilizado A seguir foi inoculado no centro
sobre a superfiacutecie do papel celofane discos de aacutegar (Oslash8 mm) contendo miceacutelio do
isolado endofiacutetico As placas foram incubadas por quatro dias a temperatura de 28degC
as placas controles receberam apenas o fitopatoacutegeno incubados por 7 dias com
Dc -Dt
Dc
Porcentagem de inibiccedilatildeo (PI) = X 100
54
fotoperiacuteodo de 12 horas Mediu-se o diacircmetro da colocircnia e retirou-se o papel celofane
(juntamente com a colocircnia do isolado) Sobre a superfiacutecie de meio PDA inoculou-se um
disco de miceacutelio do fitopatoacutegeno a ser avaliado no centro da placa Foi realizado um
delineamento inteiramente casualizado com cinco repeticcedilotildees As placas foram
incubadas a 28degC com fotoperiacuteodo de 12 horas Apoacutes 7 e 14 dias mediu-se o
crescimento das colocircnias e comparou-se com o controle (ETHUR CEMBRANEL e
SILVA 2001 Adaptado por Figueiredo 2006)
493 Atividade dos Extratos Metanoacutelicos 4931 Obtenccedilatildeo dos extratos
Para avaliaccedilatildeo da atividade dos extratos metanoacutelicos foi utilizada a metodologia
descrita por Rodrigues Hesse e Werner (2000) com algumas modificaccedilotildees No
processo de fermentaccedilatildeo trecircs discos (Oslash 8 mm) dos 49 isolados endofiacuteticos de
Phomopsis (TABELA 1) foram inoculados em Erlenmeyer (250 mL) contendo 100 mL
de caldo extrato de malte Incubou-se durante 7 dias (110 rpm 28degC fotoperiacuteodo de 12
horas)
Apoacutes a fermentaccedilatildeo o miceacutelio foi separado do liacutequido fermentado por filtraccedilatildeo
em papel Whatman ndeg 4 Ao volume do filtrado obtido adicionou-se o mesmo volume
de acetato de etila (EtOAc) (Merck) em um balatildeo de separaccedilatildeo Agitou-se
vigorosamente por trecircs vezes e aguardou-se a formaccedilatildeo de duas camadas uma
aquosa na parte inferior e outra orgacircnica na parte superior Transferiu-se a fase
orgacircnica para um novo recipiente e submeteu-se a fase aquosa a mais uma extraccedilatildeo
com EtOAc Repetiu-se o procedimento por mais duas vezes Adicionou-se agrave fase
orgacircnica 5 de sulfato de soacutedio anidro e filtrou-se novamente com papel Whatman ndeg
4 Obteve-se extrato bruto seco passando a fase orgacircnica em rotaevaporador O extrato
foi pesado e diluiacutedo em metanol (10mgmL)
55
4932 Crescimento micelial
Foram obtidos discos (Oslash 12 mm) de colocircnias com 14 dias de crescimento em
meio completo da cultura do fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396 ou PC3305 Estes
foram inoculados no centro de placas de Petri contendo meio de cultura BDA A 10 cm
da borda em posiccedilatildeo oposta foi colocado um disco de papel filtro esterilizado (Oslash 5 mm)
e sobre este foram inoculados 100μL do extrato metanoacutelico a ser avaliado As placas
foram fechadas com filme de PVC e mantidas a 28degC fotoperiacuteodo de 12 horas em
BOD Avaliou-se o potencial de inibiccedilatildeo medindo-se o diacircmetro das colocircnias apoacutes sete
dias de crescimento comparando-se com o controle negativo onde foi inoculado aacutegua
destilada autoclavada ou metanol Como controle positivo foi utilizado fungicida Derosal reg (10 mgmL) (QUIROGA SAMPIETRO e VATTUONE 2001 adaptado por
FIGUEIREDO 2006)
410 Anaacutelise Estatiacutestica
Todos os experimentos foram realizados com delineamento inteiramente
casualizado (DIC) com 5 repeticcedilotildees As anaacutelises de variacircncia foram realizadas em
todas as etapas do trabalho Sempre que foi encontrado um valor significativo em
relaccedilatildeo ao teste F completou-se a anaacutelise com teste de Tukey para comparaccedilatildeo das
meacutedias utilizando software ASSISTAT (SILVA 1996 e SILVA 2002) ou o teste de Scott
Knott utilizando software SISVAR (FERREIRA 1994)
56
5 Resultados e Discussatildeo
51 Isolamento
Foram isolados 1005 endoacutefitos de folhas e peciacuteolos de 30 plantas de Espinheira
Santa (M ilicifolia) Destes 21 foram identificados a partir de anaacutelise em microscopia
oacuteptica como pertencentes ao gecircnero Phomopsis A tabela 7 compara os resultados
obtidos quanto agrave proporccedilatildeo de isolamento de Phomopsis sobre os diferentes tecidos da
planta nos quatro isolamentos realizados A frequumlecircncia dos isolamentos foi calculada
de acordo com Souza et al (2004)
TABELA 7 PORCENTAGEM DE ISOLAMENTO DE Phomopsis ENDOFIacuteTICOS DE PLANTAS DE ESPINHEIRA SANTA
Isolamento Oacutergatildeo da planta
Nuacutemero de fragmentos plaqueados
Endoacutefitos Nuacutemero ()
Phomopsis Nuacutemero ()
Frequumlecircncia isolamento Phomopsis
1 Folha 360 140 (39) 0 (0) 0
2 Folha 540 310 (57) 2 (064) 037
3 Folha 360 375 (gt100) 3 (08) 083
TOTAL FOLHA
1260 825 (65) 5 (061) 04
4 Peciacuteolo 160 180 (gt100) 16 (89) 100
TOTAL 1420 1005 (71) 21 (209) 15 FONTE O Autor
Observando a tabela 7 percebe-se claramente que a partir de peciacuteolo a
frequumlecircncia de isolamento de Phomopsis (10) foi maior do que em folhas (04) tanto
em relaccedilatildeo ao nuacutemero de fragmentos plaqueados quanto em comparaccedilatildeo ao nuacutemero
total de endoacutefitos isolados (89 contra 061) Provavelmente devido agrave menor
frequumlecircncia de fungos filamentosos de crescimento raacutepido que pudessem sobrepor ao
crescimento de Phomopsis Segundo Souza et al (2004) as folhas dos vegetais
57
hospedeiros satildeo provavelmente as portas de entrada para os microrganismos pois
apresentam tecidos mais fraacutegeis e expostos pela presenccedila de estocircmatos ocorrendo
posterior migraccedilatildeo para outros tecidos da planta O mesmo jaacute foi relatado em espeacutecies
de Citrus para o isolamento de fungos do gecircnero Guignardia sendo o peciacuteolo o tecido
de mais faacutecil isolamento deste gecircnero por apresentar menor colonizaccedilatildeo por
Colletotrichum (BLANCO 1999)
Assim sugere-se que em trabalhos futuros de isolamento de Phomopsis sejam
tambeacutem utilizados os peciacuteolos especialmente em Espinheira Santa
Foram tambeacutem obtidos 18 isolados de Phomopsis de trecircs plantas de S
terebinthifolius (Aroeira Vermelha) representando uma frequumlecircncia de 11 Em Aroeira
a frequumlecircncia do isolamento de Phomopsis em folha foi maior do que em Espinheira
Santa em todos os isolamentos realizados
Fungos do gecircnero Phomopsis Phyllosticta e Colletotrichum satildeo comumente
isolados como endoacutefitos de tecidos de diferentes espeacutecies de plantas em muitos casos
esses fungos estatildeo juntos num mesmo hospedeiro (PANDEY et al 2003 LU et al
2004)
O gecircnero Phomopsis tem sido descrito com grande frequumlecircncia em isolamentos
de diversas plantas (UECKER 1988 BODDY e GRIFFITH 1989) Azevedo et al (2000)
apresentaram algumas plantas hospedeiras de onde jaacute foram isoladas espeacutecies de
Phomopsis entre elas Sabal bermudana Trachycarpus fortunei Cavendishia
pubescens Stylosanthes guianensis Anacardium occidentale e Mangifera indica
Corrado e Rodrigues (2004) isolaram endofiacuteticos de Phomopsis das plantas medicinais
Spondias mombin e Aspidosperma tomentosun
Bussabam et al (2001) isolaram entre outros fungos o gecircnero Phomopsis
endoacutefitos de folhas pseudocaules e rizomas de gengibre (Amomum siamense Criab)
coletadas em dois locais na Tailacircndia Silva et al (2006) isolou Phomopsis como
endoacutefito de graviola (Annona muricata L) e pinha (Annona squamosa L)
Alguns dos relatos citam o gecircnero Phomopsis como fitopatoacutegeno isolado de
diversas espeacutecies de Citrus Mangifera indica (Mangueira) Glycine max (Soja) Ficus
carica (Figueira) e Anacardium occidentale (Cajueiro) entre muitas outras plantas
58
(CENARGEN EMBRAPA 2005) Natildeo haacute relatos de gecircnero Phomopsis como
fitopatoacutegeno das plantas medicinais utilizadas no presente trabalho Aspidosperma
tomentosum Spondias mombin e Maytenus ilicifolia assim como em Aroeira Vermelha
(Schinus terebinthifolius) Entretanto o gecircnero foi relatado por Anjos Charchar e
Guimaratildees (2001) como patoacutegeno em culturas de Aroeira (Myracrodruon urundeuva)
causando sintomas de queimas nas folhas que consiste de uma necrose escura
predominantemente nos bordos dos foliacuteolos
52 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de Phomopsis
A caracterizaccedilatildeo macromorfoloacutegica das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de
Phomopsis sp foi realizada de acordo com a forma dos bordos crescimento micelial
aspecto da colocircnia e a sua coloraccedilatildeo no verso e reverso da placa em diferentes meios
de cultura (FIGURAS 1 a 4 ANEXO 12)
A coloraccedilatildeo das colocircnias dos isolados de Phomopsis apresentaram elevada
variabilidade tanto no verso quanto reverso da placa nos trecircs meios de cultura
ensaiados Em geral variou entre combinaccedilotildees das cores branca preto verde claro e
oliva amarelo marrom marrom avermelhado cinza e bege
Os isolados de Phomopsis apresentaram no verso da placa com meio Aveia (AV)
coloraccedilatildeo branca alguns isolados apresentaram combinaccedilotildees de branco com marrom
verde amarelo e cinza exceto os isolados ESJG1 ES2KF1 ES2WF1 ESPAC22
ES80J ESFB2 ESGF1 A134 A333B que diferiram dos demais por apresentarem
coloraccedilatildeo intensa e o isolado A116 de coloraccedilatildeo marrom e verde (FIGURAS 1 a 4)
Nos meios de cultura MEA e BDA observou-se que a coloraccedilatildeo no verso da
placa foi mais variaacutevel do que no meio Aveia Igualmente o reverso das placas
contendo as colocircnias de Phomopsis mostrou-se bastante variaacutevel entre os isolados e
os trecircs meios de cultura utilizados havendo variaccedilatildeo intra-individual com coloraccedilotildees
branca preto verde claro e oliva amarelo marrom marrom avermelhado cinza e
bege
59
A morfologia micelial nos meios de cultura ensaiados variou de granuloso aeacutereo
a algodonoso Nos meios de cultura MEA e BDA todos os isolados apresentaram
miceacutelio denso poreacutem no meio AV esses dois tipos de miceacutelio variaram de denso a ralo
A maioria dos isolados de Phomopsis analisados possuem miceacutelio granuloso aeacutereo em
todos os meios ensaiados exceto os isolados SM9638 SM9631 e Phomopsis longicolla
PHO1 que apresentam miceacutelio algodonoso Observou-se variaccedilatildeo intra-individual na
morfologia micelial entre os meios de cultura nos isolados A333B e A323 que
apresentaram miceacutelio algodoso no meio AV e granuloso aeacutereo nos meios MEA e BDA
Igualmente os isolados A123 e SM9811 apresentaram-se algodonoso no meio MEA e
granuloso aeacutereo nos meios AV e BDA
O aspecto dos bordos das colocircnias mostrou variaccedilatildeo intra-individual entre os
diferentes meios de cultura para a maioria dos isolados exceto os isolados de
Phomopsis SM9638 ESKD1 ESPAC22 A323 A113 A331 A115 que apresentaram
bordos regulares e os isolados SM9714 ES2WC1 ESJG1 A126 A333A PHO1
(Phomopsis longicolla) e o isolado PHO19 que possuem bordos irregulares em todos os
meios utilizados
FIGURA 1 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis DE Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT 9811 e AT 9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
AV MEA BDA
M
U 0
123
S
M97
13
60
FIGURA 1 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE
Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT9811 e AT9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
SM
9631
SM
9638
AT
9811
A
T990
6
AT9
810
SM
9714
AV MEA BDA
61
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
A32
1
A
132
A21
5A
A
113
A
323
A13
1
AV MEA BDA
62
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
A
135
A11
6
A
115B
A
124
A12
6
A21
6 B
AV MEA BDA
63
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
A
134
A33
3A
A
334
A12
3
A33
3B
AV MEA BDA
64
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
E
S2N
A1
E
SIE1
ES
GA
1
ES8
0J
E
SPA
C22
ES2
WF1
AV MEA BDA
65
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
ESFB
2
ESJ
D1
ESK
D1
E
SJH
1
ESD
F1
E
S2A
B1
AV MEA BDA
66
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
E
S2K
F1
ESJ
E2
ESJ
E1
ESG
F1
ESF
H1
ESF
F1
AV MEA BDA
67
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis E Diaporthe (BA1) ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
ESB
A1
ESI
A1
ES
RD
1
E
S2W
C1
ESS
D1
ES
JG1
AV MEA BDA
68
Na avaliaccedilatildeo do diacircmetro das colocircnias houve diferenccedila significativa entre os
isolados de Phomopsis dentro dos diversos meios de cultura avaliados Entre os meios
de cultura MEA BDA e AV houve diferenccedila significativa de crescimento em geral o
crescimento micelial foi menor no meio AV (ANEXO 1) Portanto os grupos de
Phomopsis formados quando considerada agrave taxa de crescimento foram inferidos para
os meios de cultura separadamente
Na figura 5 observa-se o resultado do diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados
apoacutes 5 dias de crescimento em meio MEA Os isolados foram reunidos em oito grupos
diferentes A A323 SM9631 ESKD1 A134 e ESIE1 B A116 A334 A215A ESSD1
C A321 MU0123 ESGF1 ESRD1 AT9811 SM9713 A123 ESJH1 ESDF1 A131
ESIA1 ESBA1 ESJD1 D A333A A135 ES2NA1 A124 A132 SM9714 ESFB2 E A115B ES2AB1 A216B A113 F PHO1 SM9638 ES2WF1 A126 ESJE1 ESPAC22
ESFF1 ES2KF1 ESJG1 ES80J G ESJE2 ESFH1 AT9906 ESGA1 AT9810
ES2WC1 Os isolados do grupo A apresentaram os maiores valores de crescimento
radial em torno de 70 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) e o grupo H apresentou menor
crescimento micelial em torno de 20 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) (ANEXO 4)
FIGURA 4 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS PATOGEcircNICOS OBTIDOS DE Glycine max EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
PH
O19
P
lon
gico
lla (P
HO
1) AV MEA BDA
69
O diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados apoacutes 5 dias de crescimento em meio
BDA estaacute representado na figura 6 Os isolados foram reunidos em seis grupos
diferentes A ESBA1 A323 A215A ESSD1 SM9713 ESGF1 SM9631 ESJD1
ESKD1 A334 B ESDF1 A132 A123 A333A MU0123 ESJH1 A321 ESRD1 A116
A134 A115B C ESIA1 A131 SM9714 A135 ESIE1 ESFB2 A124 ESPAC22
ES2KF1 A113 ESJE1 D ESJE2 ESFH1 ESJG1 ES2WC1 PHO1 SM9638
ES2NA1 ES2AB1 ESFF1 AT9811 AT9810 ES2WF1 A126 PHO19 A216B ES80J
ESGA1 E AT9906 F A333B Em geral a taxa de crescimento foi maior em meio BDA Os isolados do grupo A
apresentaram as maiores taxas de crescimento em torno de 70 cm (apoacutes 5 dias de
FONTE O autor
000
100
200
300
400
500
600
700
800
EB A F HD G C
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 4) A A323 SM9631 ESKD1 A134 e ESIE1 B A116 A334 A215A ESSD1 C A321 MU0123 ESGF1 ESRD1 AT9811 SM9713 A123 ESJH1 ESDF1 A131 ESIA1 ESBA1 ESJD1 D A333A A135 ES2NA1 A124 A132 SM9714 ESFB2 E A115B ES2AB1 A216B A113 F PHO1 SM9638 ES2WF1 A126 ESJE1 ESPAC22 ESFF1 ES2KF1 ESJG1 ES80J G ESJE2 ESFH1 AT9906 ESGA1 AT9810 ES2WC1
FIGURA 5 DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO MEA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
Diacirc
met
ro e
m c
m
70
crescimento) e o grupo F representado pelo isolado A333B apresentou menor
crescimento micelial (ANEXO 2)
Estudos sobre fisiologia envolvendo o gecircnero Phomopsis satildeo escassos Almeida
(1982) estudando Phomopsis sojae isolados de sementes de soja em seis diferentes
meios de cultura e nos regimes de luminosidade claro contiacutenuo e escuro contiacutenuo
verificou maior crescimento do fungo nos meios de haste de soja extrato de malte
aveia cenoura e BDA natildeo houve efeito da luz sobre o crescimento micelial de nenhum
dos isolados
Gurgel Menezes e Coelho (1997) verificaram maior crescimento micelial de P
anacardii e P mangiferae no meio BDA e uma melhor esporulaccedilatildeo nos meios BDA e V8
(Campbell CO) apoacutes 15 e 30 dias de incubaccedilatildeo No presente trabalho foi verificado
maior crescimento dos isolados de Phomopsis em meio BDA seguido do meio MEA em
meio AV a taxa de crescimento foi inferior
FONTE O autor
000
100
200
300
400
500
600
700
B A FEC D
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 2) A ESBA1 A323 A215A ESSD1 SM9713 ESGF1 SM9631 ESJD1 ESKD1 A334 B ESDF1 A132 A123 A333A MU0123 ESJH1 A321 ESRD1 A116 A134 A115B C ESIA1 A131 SM9714 A135 ESIE1 ESFB2 A124 ESPAC22 ES2KF1 A113 ESJE1 D ESJE2 ESFH1 ESJG1 ES2WC1 PHO1 SM9638 ES2NA1 ES2AB1 ESFF1 AT9811 AT9810 ES2WF1 A126 PHO19 A216B ES80J ESGA1 E AT9906 F A333B
FIGURA 6 DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
Diacirc
met
ro e
m c
m
71
O diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados apoacutes 5 dias de crescimento em meio
AV estaacute representado na figura 7 Os isolados foram reunidos em sete grupos
diferentes A ESKD1 B ESJE2 A123 C ESJE1 SM9638 AT9811 SM9713 PHO1
ESBA1 SM9631 ESFB2 A334 A323 MU0123 D A333A ESJD1 ESGF1 A116 E ESPAC22 ESDF1 A321 A132 ES2KF1 ESJG1 ESRD1 PHO19 A115B A124
ESFF1 A134 ESIE1 A135 A131 A113 ES2WF1 ESSD1 ESIA1 F ESGA1 ESJH1
ESFH1 AT9906 ES2NA1 A216B ES80J A215A G AT9810 A333B ES2AB1
SM9714 ES2WC1 A126 Apenas o isolado ESKD1 representante do grupo A
apresentou taxa de crescimento raacutepida de 70 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) a
maioria dos isolados tiveram crescimento lento (ANEXO 3)
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 3) A ESKD1 B ESJE2 A123 C ESJE1 SM9638 AT9811 SM9713 PHO1 ESBA1 SM9631 ESFB2 A334 A323 0123 D A333A ESJD1 ESGF1 A116 E ESPAC22 ESDF1 A321 A132 ES2KF1 ESJG1 ESRD1 PHO19 A115B A124 ESFF1 A134 ESIE1 A135 A131 A113 ES2WF1 ESSD1 ESIA1 F ESGA1 ESJH1 ESFH1 AT9906 ES2NA1 A216B ES80J A215A G AT9810 A333B ES2AB1 SM9714 ES2WC1 A126
FIGURA 7 AVALIACcedilAtildeO DAS MEacuteDIAS DO DIAcircMETRO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO AV APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
000
100
200
300
400
500
600
700
B A F C GD E
FONTE O autor
Diacirc
met
ro e
m c
m
72
Foi observado que dos 49 endoacutefitos e os 2 isolados patogecircnicos de Phomopsis
spp avaliados (TABELA 1) 27 apresentaram variaccedilatildeo intra-individual quanto ao
crescimento nos diversos meios Por exemplo os isolados A323 e SM9631 em meio
MEA e BDA pertencem ao grupo A e no meio AV ao grupo C Os outros 24 isolados
natildeo apresentaram variaccedilatildeo entre os agrupamentos formados nos diferentes meios
Os isolados que se agrupam baseados no crescimento nos trecircs meios natildeo satildeo
os mesmos quando se considera a cor do verso e reverso da placa assim como natildeo
satildeo semelhantes aos agrupamentos formados quando comparados com os bordos e
aspecto da colocircnia
Gurgel Menezes e Coelho (2002) estudando Phomopsis anacardii e Phomopsis
mangiferae observaram maior produccedilatildeo de picniacutedios nos meios de extrato de malte
aveia haste de soja e cenoura somente quando mantidos sob luz contiacutenua A
produccedilatildeo de picniacutedios foi reduzida em alternacircncia de luz e quase nula no escuro
contiacutenuo No presente trabalho foi observado que a maioria dos isolados formaram
estruturas de reproduccedilatildeo com o uso de luz contiacutenua em baixas temperaturas 22 a 25 degC
e pH 58 nos trecircs meios avaliados apoacutes 14 dias de crescimento
Segundo Cochrane (1959) e Griffin (1994) a luminosidade promove formaccedilatildeo
das estruturas reprodutivas assim como estatildeo diretamente ligadas agrave composiccedilatildeo do
meio de cultura atraveacutes de diferentes reaccedilotildees enzimaacuteticas Leonian (1924) descreve
que o efeito da luz como indutor da reproduccedilatildeo de fungos estaacute associado agraves
modificaccedilotildees que ocorrem no seu metabolismo celular combinados aos elementos que
constituem o meio de cultura
Timnick Lilly e Barnett (1951) detectaram efeito positivo da luz para a formaccedilatildeo
de picniacutedios ao verificarem que o regime escuro contiacutenuo inibia a formaccedilatildeo de picniacutedios
de Diaporthe phaseolorum Resultados semelhantes foram observados por Correcirca
(1995) avaliando Phomopsis sp provenientes de sementes florestais observou uma
melhor esporulaccedilatildeo em meio aveia sob regime de claro contiacutenuo por 12 dias de
incubaccedilatildeo
Na anaacutelise da micromorfologia observou-se que os isolados apresentavam
estruturas de reproduccedilatildeo a partir de 14 dias ateacute 21 dias de crescimento (FIGURA 8)
73
exceto os isolados SM9811 SM9638 e Phomopsis longicolla PHO1 que natildeo formaram
estruturas de reproduccedilatildeo em nenhum dos meios ensaiados Os isolados SM9811 e
SM9638 foram descritos como pertencentes ao gecircnero Phomopsis e depositados na
Coleccedilatildeo de Cultura de Fungos do Departamento de Micologia (IOC) da FIOCRUZ e
foram descritos por Rodrigues e Samules (1999) O isolado PHO1 foi isolado e
identificado pela EMBRAPA (Londrina-PR) como pertencente agrave espeacutecie P longicolla
Os coniacutedios do tipo alfa foram menos frequumlentes do que os do tipo beta Em
meio de cultura BDA apenas 11 isolados apresentaram o tipo de esporo alfa jaacute os beta
coniacutedios filiformes curvos na extremidade ou ligeiramente curvos foram visualizados
em quase todos os isolados de Phomopsis spp
Foi observado que para os isolados que apresentaram os dois tipos de esporos
foram visualizados com 14 dias de crescimento apenas alfa coniacutedios hialinos com
vacuacuteolos nas extremidades de forma ovoacuteide e natildeo foram visualizados beta coniacutedios
Apoacutes 21 dias os dois tipos de esporos foram visualizados nesses isolados (FIGURA 8a
e 8c) Alguns alfa coniacutedios apresentavam mais de dois vacuacuteolos nas extremidades
(FIGURA 8b) Essa variaccedilatildeo intra-individual tambeacutem foi observada em relaccedilatildeo agrave
morfologia do beta coniacutedio em que alguns apresentam curvatura na extremidade
outros ligeiramente curvos (FIGURA 8c)
NOTA A - isolado SM9631 aumento de 400x B- isolado SM9714 aumento de 1000x C- isolado SM9713 aumento de 400x microscopia oacuteptica Setas pretas indicam os alfa coniacutedios e setas vermelhas os beta coniacutedios Escala em 1μM
FONTE O autor
FIGURA 8 FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis EM BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
A B C
74
Alfa coniacutedios do isolado SM9713 provenientes dos meios de cultura AV (FIGURA
9a) e BDA (FIGURA 9e) apresentaram grande variaccedilatildeo morfoloacutegica Na figura 9 no
mesmo conidioacuteforo eacute visiacutevel a diferenccedila morfoloacutegica do alfa coniacutedio Na figura 9e o
conidioacuteforo apresenta alfa coniacutedios com mais de duas gotas nas extremidades (SETA 1)
e alfa coniacutedios com apenas dois vacuacuteolos (SETA 2) Em maior aumento eacute possiacutevel
perceber que existem variaccedilotildees de dois trecircs e ateacute quatro vacuacuteolos no mesmo isolado
(FIGURA 9a 9b e 9c) Tal variaccedilatildeo pode ser decorrente de diferenciados graus de
maturaccedilatildeo destes coniacutedios o que dificulta a caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de espeacutecies do
gecircnero Phomopsis
A medida do comprimento dos beta coniacutedios em meio BDA mostrou que os
isolados apresentam diferenccedilas estatiacutesticas significativas reunindo os isolados em 15
FIGURA 9 FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DO ISOLADO SM9713 EM MEIOS BDA e AV APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
1 2 A
B C D
E
NOTA A - em meio AV aumento de 400x B C e D- em meio BDA aumento de 650x E- em meio BDA aumento de 400x Microscopia oacutetica
FONTE O autor
75
grupos diferentes (ANEXO 5) A (AT9906 AT8010) B (ESFH1) C (ESPAC22 ES2KF1
SM9631) D (ESGA1 PHO19) E (ES80J) F (ESRD1) G (ESJE2 ESFB2 ESJE1) H
(ESJG1) I (A323) J (A333A A135 A124 A126 A132 A131 A134 A115B ESIE1) K
(ES2WC1 ES2WF1) L (SM9713 A334 ESIA1 A333B ESFF1 ESGF1) M (ES2AB1
A123 A113 ESJD1) N (ESKD1 ES2NA1 A215A SM9714) O (ESSD1 ESJH1
MU0123 A321 ESDF1 A216B A116) (FIGURA 10) Os isolados tambeacutem natildeo se
agrupam de acordo com os outros criteacuterios avaliados como a cor do verso e reverso
da placa diacircmetro das colocircnias assim como natildeo satildeo semelhantes aos agrupamentos
formados quando comparados com os bordos e aspecto do miceacutelio
NOTA As letras maiuacutesculas indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo agrave meacutedia do comprimento de beta coniacutedio dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Isolados de cada agrupamento A (AT9906 AT8010) B (ESFH1) C (ESPAC22 ES2KF1 SM9631) D (ESGA1 PHO19) E (ES80J) F (ESRD1) G (ESJE2 ESFB2 ESJE1) H (ESJG1) I (A323) J (A333A A135 A124 A126 A132 A131 A134 A115B ESIE1) K (ES2WC1 ES2WF1) L (SM9713 A334 ESIA1 A333B ESFF1 ESGF1) M (ES2AB1 A123 A113 ESJD1) N (ESKD1 ES2NA1 A215A SM9714) O (ESSD1 ESJH1 MU0123 A321 ESDF1 A216B A116) As meacutedias seguidas pela mesma letra minuacutescula natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 5)
FIGURA 10 COMPRIMENTO DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO EM BDA A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
0
5
10
15
20
25
30
35
40
B C E F MID LJA N H K OG
a
b
c
cd
de
ef
efg
fgh
fghi
ghij
ghil
hil
him
im
m
FONTE O autor
Diacirc
met
ro e
m μ
M
76
Desta forma as caracteriacutesticas macroscoacutepicas (coloraccedilatildeo bordos e tipos de
miceacutelio da colocircnia) e de micromorfologia dos coniacutedios avaliadas isoladamente natildeo
permitiram propor identificaccedilatildeo das espeacutecies dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis
Sendo assim optou-se por realizar uma anaacutelise polifaacutesica agrupando as caracteriacutesticas
morfoloacutegicas analisadas tais como crescimento micelial coloraccedilatildeo e bordos da
colocircnia tipo de miceacutelio comprimento dos coniacutedios e tipos de coniacutedios produzidos em
deferentes meios Essa metodologia foi descrita por Figueiredo et al (2006) para
caracterizar isolados de Pestalotiopsis Para todas estas caracteriacutesticas foram
atribuiacutedas notas de 0 ou 1 onde 0 representou ausecircncia da caracteriacutestica e 1 a
presenccedila (ANEXO 12) Os resultados compuseram uma matriz binaacuteria analisada pelo
software NTSYS (coeficiente Jaccard) com o agrupamento pelo meacutetodo UPGMA
permitindo a construccedilatildeo de um dendrograma de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
De acordo com o dendrograma de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
sugere-se a formaccedilatildeo de seis grupos com elevados valores de bootstrap que conferem
robustez aos agrupamentos No grupo I estatildeo reunidos os isolados MU0123 e
SM9713 no grupo II os isolados AT9810 e AT9906 no grupo III os isolados ESJE1 e
ESJE2 no grupo IV os isolados ESFB2 e ESFF1 no grupo V os isolados ES2KF1 e
ESJG1 e no grupo VI os isolados ES2WF1 e ES80J Os demais agrupamentos
formados natildeo foram considerados pois apresentam baixos valores de bootstrap e ou
baixos valores de similaridade morfoloacutegica
Os dados mostram elevada variabilidade morfoloacutegica dos isolados de Phomopsis
avaliados o que dificulta a delimitaccedilatildeo de espeacutecies apenas com dados morfoloacutegicos
Segundo Parmeter (1958) e Rehner e Uecker (1994) o alto grau de plasticidade das
caracteriacutesticas morfoloacutegicas impossibilita a delimitaccedilatildeo de espeacutecies no gecircnero
Phomopsis Gamboa-Gaitaacuten Laureano e Bayman (2005) estudando isolados de
Phomopsis endofiacuteticos de Guarea guidonia (Meliaceae) de duas regiotildees de Luquillo
(Porto Rico) relataram elevados niacuteveis de variabilidade morfoloacutegica entre os isolados
avaliados Eles observaram uma mistura de diferentes morfotipos em ambas as regiotildees
estudadas
77
Neste trabalho foi observado um elevado niacutevel de variabilidade morfoloacutegica dos
isolados de Phomopsis spp obtidos de seis diferentes espeacutecies de plantas e regiotildees
geograacuteficas Natildeo foi possiacutevel observar estruturaccedilatildeo populacional dos isolados em
funccedilatildeo da espeacutecie hospedeira Na figura 12 os isolados de M ilicifolia encontram-se na
coloraccedilatildeo rosa e distribuiacutedos ao longo dos dois eixos que representam os dois
principais componentes de variaccedilatildeo Igualmente os isolados em preto representam as
linhagens provindas de S terebinthifolius e tambeacutem encontram-se dispersos Tais
resultados natildeo surpreendem pois eacute possiacutevel que a mesma espeacutecie de Phomopsis seja
isolada em diferentes hospedeiros
NOTA I II III IV V VI satildeo grupos formados para inferir sobre a diversidade dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis Os valores a esquerda dos noacutes indicam os valores de bootstrap
COEFICIEcircNTE DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA
FIGURA 11 DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp
FONTE O autor
r = 07577 (P= 00001)
V VI
IV
I II III
78
FONTE O autor FIGURA 12 ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp NOTA Isolados em coloraccedilatildeo rosa obtidos de Maytenus ilicifolia Em preto Schinus terebinthifolius Em azul escuro Myracrodruon urundeuva Em azul claro Aspidosperma tomentosun Em verde Spondias mombin 53 Caracterizaccedilatildeo Molecular de Phomopsis spp 531 RAPD
Os isolados de Phomopsis spp foram avaliados por meio de marcadores
moleculares do tipo RAPD a fim de verificar a magnitude da variabilidade geneacutetica
Foram analisados por esta metodologia 54 isolados Destes 47 Phomopsis spp
endoacutefitos os isolados MU0123 e SM9638 natildeo amplificaram em nenhuma das
condiccedilotildees ensaiadas dois isolados de Phomopsis patoacutegenos de soja e cinco isolados
de Pestalotiopsis Foram utilizados 4 oligonucleotiacutedeos gerando 99 bandas O tamanho
dos fragmentos amplificados variou de 400 a 2600 pb e podem ser visualizados nas
Figuras 13 a 16
79
FIG
UR
A 1
4 P
ER
FIL
DE
AM
PLI
FIC
ACcedil
AtildeO
CO
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OLI
GO
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S D
E P
hom
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s sp
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O E
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esta
lotio
psis
FIG
UR
A 1
3 P
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CO
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RN
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lotio
psis
80
FIG
UR
A 1
5 P
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PLI
FIC
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OLI
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NU
CLE
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19 D
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CO
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esta
lotio
psis
FIG
UR
A 1
6 P
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FIL
DE
AM
PLI
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AtildeO
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M O
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NU
CLE
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08 D
OS
ISO
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CO
S D
E P
hom
opsi
s sp
E
GR
UP
O E
XTE
RN
O P
esta
lotio
psis
81
A anaacutelise destes marcadores RAPD permitiu a construccedilatildeo de um dendrograma
de similaridade geneacutetica (FIGURA 17) O coeficiente de correlaccedilatildeo das matrizes de
similaridade geneacutetica e cofeneacutetica obtido pelo teste de Mantel foi elevado (r=08157 e
p=00001) indicando que o dendrograma representa de forma adequada a matriz de
similaridade geneacutetica obtida pelos marcadores de RAPD Entretanto os valores de
bootstrap da maioria dos agrupamentos formados foram baixos Desta forma somente
foram considerados na anaacutelise os agrupamentos com bom suporte de bootstrap e
coeficientes de similaridade superiores a 50
Os dados indicam elevada variabilidade geneacutetica dos isolados de Phomopsis
spp avaliados (FIGURAS 17 e 18) com a formaccedilatildeo de sete grupos Os isolados de
Pestalotiopsis utilizados como grupo externo formaram um grupo (boostrap = 100)
isolado (FIGURA 17) sendo relevante para inferir a magnitude da variabilidade geneacutetica
observada entre os isolados de Phomopsis spp
O primeiro agrupamento reuacutene trecircs endoacutefitos de Espinheira Santa ESBA1
ES2AB1 e ESSD1 (49 de similaridade e bootstrap = 64) Esses isolados foram
obtidos do mesmo isolamento e pomar (CNPFEMPRAPA ColomboPR) poreacutem de
tecidos e plantas diferentes Os isolados ESBA1 e ESSD1 foram obtidos de peciacuteolo
enquanto ES2AB1 foi isolado de folha Eacute importante observar que o isolado ESBA1
apresentou estrutura de reproduccedilatildeo sexual sendo classificado como Diaporthe sp e
no entanto apresenta alto valor de similaridade geneacutetica com os isolados de Phomopsis
sp sugerindo assim que pertenccedilam ao mesmo complexo Phomopsis Diaporthe
Esses isolados natildeo se agrupam quanto aos caracteres morfoloacutegicos (FIGURAS 11 e
12)
O segundo agrupamento com 893 de similaridade geneacutetica e com bootstrap
de 100 compreende P longicolla (PHO1) uma linhagem patogecircnica de soja isolada
em Primavera do Leste ndash MT e o isolado SM9713 endoacutefito de Spondias mombin
coletado em Redenccedilatildeo ndash PA Aleacutem de coletados em lugares e hospedeiros totalmente
diferentes esses isolados apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas divergentes pois
natildeo pertencem ao mesmo agrupamento em nenhuma das caracteriacutesticas morfoloacutegicas
analisadas Entretanto a alta similaridade geneacutetica destes isolados sugere que
82
pertenccedilam agrave mesma espeacutecie o que reforccedila as observaccedilotildees anteriores de que a
definiccedilatildeo de espeacutecie do gecircnero Phomopsis natildeo eacute possiacutevel utilizando-se apenas
caracteriacutesticas morfoloacutegicas
FIGURA 17 DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS DE Phomopsis spp POR MEIO DE MARCADORES MOLECULARES RAPD
COEFICIENTE DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA
FONTE O autor
I II
III IV V VI VII
GRUPO EXTERNO
r= 08157 (p=00001)
100
83
O terceiro agrupamento com 75 de similaridade geneacutetica (FIGURA 17)
compreende dois isolados endofiacuteticos de Aspidosperma tomentosun AT9810 e AT9906
Esses isolados apresentaram caracteriacutesticas morfoloacutegicas muito semelhantes
formando o agrupamento II com 81 de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
O quarto agrupamento com 72 de similaridade geneacutetica compreende os
isolados ESFH1 e ESFF1 provenientes do peciacuteolo de Espinheira Santa da mesma
coleta poreacutem novamente eles natildeo se agrupam quanto aos caracteres morfoloacutegicos
observados (FIGURAS 11 e12)
O quinto agrupamento com 85 de similaridade geneacutetica reuacutene os isolados
ESKD1 e ESJH2 e ESJH1 provenientes de peciacuteolo da Espinheira Santa coletados na
mesma data Os isolados ESJH1 e ESJH2 foram obtidos do mesmo peciacuteolo e
apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas mais semelhantes entre si do que quando
comparados ao isolado ESKD1 (FIGURA 11) Entretanto a figura 17 revela que por
meio de marcadores RAPD os isolados ESKD1 e ESJH2 satildeo mais proacuteximos (92 de
similaridade geneacutetica) Sugere-se assim que os 3 isolados pertenccedilam agrave mesma
espeacutecie
O sexto agrupamento com 52 de similaridade (FIGURA 17) compreende os
isolados A321 obtido de Aroeira e ESIA1 obtido de Espinheira Santa Aleacutem de
coletados em lugares e hospedeiros totalmente diferentes esses isolados apresentam
caracteriacutesticas morfoloacutegicas diferentes (FIGURAS 11 e 12) Apesar do valor de
bootstrap atribuir confiabilidade a este agrupamento (77) o valor de similaridade
observado (52) natildeo eacute alto Assim natildeo eacute possiacutevel inferir que pertenccedilam agrave mesma
espeacutecie
O mesmo ocorre com o seacutetimo agrupamento que com 55 de similaridade
compreende os isolados A333A obtido de Aroeira e ESRD1 obtido de Espinheira Santa
Aleacutem de coletados em lugares e hospedeiros totalmente diferentes esses isolados
apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas diferentes natildeo pertencendo ao mesmo
agrupamento quanto aos caracteres morfoloacutegicos (FIGURAS 11 e 12)
Esses resultados mostram que caracteriacutesticas morfoloacutegicas natildeo satildeo suficientes
para inferir espeacutecies neste gecircnero analisadas individualmente ou em anaacutelise polifaacutesica
84
Aleacutem disso natildeo haacute estruturaccedilatildeo populacional quanto ao hospedeiro Esses dados
reforccedilam a necessidade de revisatildeo na classificaccedilatildeo de espeacutecies do gecircnero Phomopsis
Atualmente a anaacutelise polifaacutesica vem sendo realizada em estudos de diversidade
bacteriana utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas bioquiacutemicas fisioloacutegicas e
moleculares (KIM et al 2006 a b NEDASHKOVSKAYA et al 2006) e
esporadicamente na identificaccedilatildeo de leveduras (SAMPAIO et al 1999 VILLA-
CARVAJAL et al 2004) Em fungos filamentosos a anaacutelise polifaacutesica de caracteriacutesticas
morfoloacutegicas foi utilizada com sucesso na taxonomia de Penicillium (FRISVAD e
SAMSON 2004) Aspergillus (FRISVAD et al 2004) e Pestalotiopsis (FIGUEIREDO
2006)
FIGURA 18 ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp
FONTE O autor
85
532 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
Visando elucidar a taxonomia dos isolados de Phomopsis spp utilizados neste
trabalho foi realizado com sucesso o sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 - 58S - ITS2 do
rDNA de 29 isolados Apoacutes o alinhamento e ediccedilatildeo destas sequumlecircncias foi realizada
uma busca no banco de dados de sequumlecircncias (httpwwwncbinlmnihgov) a fim de
identificar sequumlecircncias similares Os isolados estatildeo representados na aacutervore filogeneacutetica
(FIGURA 19)
Os isolados agruparam-se em 16 clados sugerindo que as plantas medicinais
estudadas satildeo colonizadas por pelo menos dezesseis diferentes espeacutecies de
Phomopsis (FIGURA 19) Entretanto a maioria dos isolados natildeo apresentaram
sequumlecircncias ITS com identidade superior a 90 com nenhuma sequumlecircncia depositada no
GenBank e portanto foram identificados como Phomopsis sp S1 a Phomopsis sp
S12
O primeiro clado (suportado com bootstrap de 98) estaacute representado na figura
20 e reuacutene os isolados A113 A131 A133 ESIA1 e A321 que apresentaram identidade
com P chimonanthi e com uma linhagem de Phomopsis sp endofiacutetica de Coffea
robusta (DQ123615) Esta linhagem foi isolada e sequumlenciada por Sette et al (2006) e
apresentou 99 de similaridade com as mesmas espeacutecies P chimonanthi P
michaeliae e Diaporthe helianthi (FIGURAS 19 e 20) A espeacutecie P chimonanthi foi
recentemente proposta por Chang e colaboradores (dados natildeo publicados) para
isolados antes denominados de P michaeliae Como esta espeacutecie foi descrita em 1987
e aceita ateacute o momento no presente trabalho sugere-se que os isolados A113 A131
A133 ESIA1 e A321 sejam classificados como P michaeliae
O isolado ESIA1 foi obtido de Espinheira Santa (Maytenus ilicifolia) enquanto os
demais isolados deste clado foram obtidos de Aroeira Vermelha (Schinus
terebinthifolius) Esses isolados apresentaram baixa similaridade geneacutetica quando
avaliados por RAPD e similaridade parcial quanto agraves caracteriacutesticas morfoloacutegicas uma
vez que fazem parte do mesmo agrupamento no diacircmetro da colocircnia em meio BDA
(Grupo C) e MEA (Grupo E)
86
FONTE O autor FIGURA 19 AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MEacuteTODO DE PARCIMOcircNIA)
ESIA1
A321
A113
A131
AY6229931| Phomopsis
P michaellae
Phomopsis sp S5 A116
ESRD1
ESJE2
ESKD1
Phomopsis sp S1
Phomopsis sp S9 A124
A334
A323Phomopsis sp S8
Phomopsis sp S2 A123
AJ3123481| Diaporthe helianthi
DQ2862851| Phomopsis sp CBS
AY8578681| Phomopsis longicolla
AF000207| Phomopsis longicolla
AF0010242| Diaporthe phaseolorum
DQ2356701| Phomopsis sp P4
Phomopsis sp S10 ESGA1
DQ2356731| Phomopsis sp P7
PHO19
AY0506271| Phomopsis sojae
DQ2356691| Phomopsis sp P3
P sojae
AF3584411 Diaporthe helianthi
AJ3123631| Diaporthe helianthi
SM9713
P longicolla PHO1
MU0123
P longicolla
A126
ESJH1Phomopsis sp S11
Phomopsis sp S12 ESJD1
Phomopsis sp S7 ESDF1
AB1051481| Diaporthe melonis
ES2AB1
ESBA1Phomopsis sp S6
AB1051471| Diaporthe melonis
AY6229961| Phomopsis camptothecae
AJ3123591| Diaporthe
AY7450241| Diaporthe
ES2KF1
ES2WF1
ESPAC22
Phomopsis sp S4
Phomopsis sp S3 ESGF1
AB2014431| Diaporthe conorum
DQ1165511| Diaporthe conorum CBS
SM9638
ESFH1
DQ2862861| Phomopsis theicola
AF230762 Phomopsis sp taxon 3
AY4857241| Phomopsis sp 1
DQ2862871| P theicola CBS
P theicola
Pestalotiopsis vismae
99
99
3599
98
91
7786
78
75
73
2973
5
5
3
2
11
71
70
25
22
33
40
67
63
33
44
65
41
34
29
27
21
21
18
13
12
8
7
5
3
3
0
0
0
19
32
23
31
87
Os isolados ESRD1 ESKD1 e ESJE2 apresentaram homologia quanto as
sequumlecircncias de ITS com suporte de bootstrap de 95 (FIGURA 19) Entretanto a figura
17 revela que por meio de marcadores RAPD os isolados ESKD1 e ESJE2 satildeo mais
proacuteximos apresentando 92 de similaridade geneacutetica (com bootstrap de 65) e 85
de similaridade desses isolados com o ESJE1 Assim sugere-se que estes 3 isolados
pertenccedilam agrave mesma espeacutecie Entretanto as sequumlecircncias ITS natildeo apresentaram
identidade superior a 90 com nenhuma sequumlecircncia depositada no GenBank Assim
esses isolados foram denominados de Phomopsis sp S1
FONTE O autor FIGURA 20 AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA PARCIAL BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MODELO NEIGHBOR-JOINING COM CORRECcedilAtildeO KIMURA DOIS PARAcircMETROS)
O isolado PHO19 (patogecircnico de soja) foi classificado como Phomopsis sojae
formou um clado com um endoacutefito natildeo identificado (P3) e com um isolado da espeacutecie P
sojae (FIGURA 19) O isolado Phomopsis sp P3 foi obtido como endoacutefito de Tectona
grandis por Murali Surynarayanan e Geeta (2006)
A113
DQ1236151| Phomopsis sp CBMAI
ESIA1
AY6229931| Phomopsis chimonanthi
A131
A133
P michae liae
A124
A334
ESGA1
DQ1165521| Diaporthe conorum cbs 199-3990
98
62252719
0005
88
Os isolados MU0123 SM9713 e P longicolla (PHO1) apresentaram alta
homologia das sequumlecircncias (clado suportado com 99 de bootstrap) (FIGURA 19) Os
isolados SM9713 e P longicolla (PHO1) apresentaram 893 de similaridade geneacutetica
(com suporte de bootstrap de 100) utilizando-se marcadores RAPD (FIGURA 17) Na
anaacutelise morfoloacutegica os isolados MU0123 e SM9713 apresentaram mais de 70 de
similaridade poreacutem o isolado P longicolla (PHO1) apresentou caracteriacutesticas
morfoloacutegicas diferentes dos isolados MU0123 e SM9713 (FIGURA 11) O isolado PHO1
foi isolado como patoacutegeno de soja (Glycine max (L) Merr) no Mato Grosso enquanto os
isolados MU0123 e SM9713 foram obtidos como endofiacuteticos de Aroeira (Myracrodruon
urundeuva) e Cajaacute (Spondias mombin) respectivamente ambos no estado do Paraacute Em
funccedilatildeo das similaridades geneacuteticas observadas e por ser o isolado PHO1 utilizado
como referecircncia de P longicolla os isolados endofiacuteticos MU0123 e SM9713 foram
identificados como pertencentes a esta espeacutecie A alta similaridade geneacutetica destes
isolados sugere que pertenccedilam agrave mesma espeacutecie o que reforccedila as observaccedilotildees
anteriores de que a definiccedilatildeo de espeacutecie do gecircnero Phomopsis natildeo eacute possiacutevel
utilizando-se apenas caracteriacutesticas morfoloacutegicas O fato de isolados endofiacuteticos de S
mombin e M urundeuva serem identificados como P longicolla demonstra que
espeacutecies patogecircnicas para um hospedeiro podem colonizar de forma assintomaacutetica
diferentes espeacutecies vegetais Isso jaacute foi observado para outros gecircneros como
Guignardia e Phyllosticta (BAAYEN et al 2002 GLIENKE-BLANCO et al 2002)
Os endoacutefitos ESBA1 e ES2AB1 foram reunidos no mesmo clado sendo
denominados de Phomopsis sp S6 (FIGURA 19) esses isolados fazem parte do
mesmo agrupamento utilizando-se marcadores RAPD (FIGURA 17)
Os isolados A323 e A334 apresentaram grande identidade geneacutetica (suportado
com bootstrap de 70) e seu agrupamento estaacute representado na figura 19 Esses
isolados natildeo apresentaram identidade moderada a nenhuma das sequumlecircncias
depositadas no GenBank e portanto natildeo foi possiacutevel inferir sobre a espeacutecie desses
endoacutefitos Sugere-se que esses isolados de Aroeira pertenccedilam agrave mesma espeacutecie e
portanto foram denominados de Phomopsis sp S8 Os isolados ES2KF1 ES2WF1 e
89
ESPAC22 endoacutefitos de Espinheira Santa foram reunidos num mesmo clado sendo
denominados de Phomopsis sp S4 (FIGURA 19)
Os isolados A126 e ESJH1 foram reunidos no mesmo clado sendo denominados
de Phomopsis sp S11 eles foram isolados de diferentes plantas hospedeiras O
isolado ESJH1 foi obtido de Espinheira Santa (Maytenus ilicifolia) enquanto o isolado
A126 foi obtido de Aroeira Vermelha (Schinus terebinthifolius) Estes resultados
reforccedilam a dificuldade em inferir espeacutecies do gecircnero Phomopsis com base na planta
hospedeira
Os isolados A116 A124 A123 ESGA1 ESJD1 ESDF1 e ESGF1 natildeo
apresentaram identidade com nenhuma sequumlecircncia depositada no GenBank nem
similaridade com outros isolados analisados no presente trabalho Sugere-se que esses
endoacutefitos pertenccedilam a diferentes espeacutecies
No uacuteltimo clado o isolado ESFH1 apresentou homologia com a regiatildeo ITS1-
rDNA 58S - ITS2 da espeacutecie P theicola (DQ286286 e DQ286287) e com o isolado
SM9638 (FIGURA 19) Estes dois isolados foram obtidos de diferentes plantas
hospedeiras O isolado ESFH1 foi obtido em 2006 de M ilicifolia no Paranaacute enquanto o
isolado SM9638 foi obtido em 1996 como endofiacutetico da planta Spondias mombin no
Estado do Paraacute Esses isolados apresentam baixa similaridade morfoloacutegica (FIGURAS
11 e 12) Estes resultados reforccedilam a dificuldade em inferir espeacutecies do gecircnero
Phomopsis especialmente utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas
No presente trabalho observou-se que vaacuterias espeacutecies de Phomopsis foram
isoladas de um mesmo hospedeiro assim como uma mesma espeacutecie foi encontrada
colonizando diferentes hospedeiros Isto jaacute foi relatado no gecircnero Phomopsis por
Brayford (1990) Farr Castlebury e Rossman (2002) e por Rehner e Uecker (1994)
Esses resultados reforccedilam a necessidade de revisatildeo do conceito de espeacutecie para o
gecircnero Phomopsis uma vez que muitas espeacutecies tecircm sido identificadas com base na
planta hospedeira (GAMBOA-GAITAacuteN LAUREANO e BAYMAN 2005 MURALI
SURYANARAYANAN GEETA 2006)
Os dados morfoloacutegicos e de RAPD foram altamente variaacuteveis e a anaacutelise das
sequumlecircncias da regiatildeo ITS1- 58S - ITS2 do rDNA foi informativa para alguns dos
90
isolados analisados Entretanto mais estudos satildeo necessaacuterios para a identificaccedilatildeo
precisa dessas espeacutecies A literatura eacute escassa quanto a trabalhos de taxonomia
morfologia biologia e ecologia de isolados endofiacuteticos do gecircnero Phomopsis Segundo
Phillips (2006) a identificaccedilatildeo das espeacutecies do gecircnero Phomopsis eacute difiacutecil porque as
espeacutecies natildeo estatildeo claramente definidas e existe uma sobreposiccedilatildeo entre os caracteres
morfoloacutegicos que as definem
A maioria das sequumlecircncias depositadas no GenBank satildeo de isolados
provenientes de lesotildees sendo portanto de espeacutecies patogecircnicas No presente trabalho
eacute possiacutevel que os isolados pertencentes a clados que natildeo se agruparam com nenhuma
sequumlecircncia jaacute depositada pertenccedilam a novas espeacutecies ou ainda a espeacutecies de
endoacutefitos ainda natildeo sequumlenciados Murali Surynarayanan e Geeta (2006)
caracterizaram por meio de sequumlenciamento da regiatildeo ITS e dados morfoloacutegicos 11
isolados endofiacuteticos de Phomopsis obtidos de Tectona grandis e Cassia fistula Eles
sugerem que apesar da grande variabilidade encontrada os isolados devem ser
reunidos em apenas dois grupos entretanto natildeo foi possiacutevel a identificaccedilatildeo em niacutevel
de espeacutecie Segundo os autores isto natildeo foi possiacutevel em funccedilatildeo dos fungos deste
gecircnero natildeo terem hospedeiros especiacuteficos e pela necessidade de revisatildeo do conceito
de espeacutecie em Phomopsis
Farr Castlebury e Rossman (2002) caracterizaram por anaacutelise de sequumlecircncias
ITS1 58S ITS2 e por caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de Phomopsis sp
isolados de Vaccinium corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse estudo
verificaram que a maioria dos isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma vez que
as sequumlecircncias agruparam-se com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
Castlebury e Mengistu (2006) avaliaram Phomopsis isolados de soja e outros
hospedeiros combinando dados de sequumlecircncias de ITS do rDNA do gene do fator1 alfa
de elongaccedilatildeo da traduccedilatildeo (ef-1) e genes de actina Foram formados seis grupos de
Phomopsis sendo que trecircs correspondem aos taacutexons P longicolla Diaporthe melonis e
D phaseolorum Os autores concluiacuteram que a ausecircncia de distinccedilatildeo morfoloacutegica e
informaccedilatildeo bioloacutegica tornam problemaacutetica a identificaccedilatildeo de espeacutecies deste gecircnero
91
No presente trabalho com base nos dados de RAPD (FIGURAS 17 e 18) pode-
se sugerir a existecircncia de pelo menos 10 espeacutecies de Phomopsis colonizando de forma
endofiacutetica as plantas de Maytenus ilicifolia analisadas Tais plantas satildeo provenientes de
um uacutenico pomar localizado no CNPFEMPRAPA em ColomboPR Ainda eacute possiacutevel
sugerir a existecircncia de pelo menos seis espeacutecies de Phomopsis colonizando de forma
endofiacutetica a planta de S terebinthifolius analisada neste trabalho Esta planta natildeo
recebeu qualquer tratamento com fungicidas ou outro agrotoacutexico uma vez que se
encontra isolada entre dois blocos do Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas da UFPR (ANEXO
13) Talvez isso justifique a grande diversidade de isolados encontrada Esses dados
demonstram a importacircncia de estudos da comunidade endofiacutetica em plantas medicinais
e apontam para o problema da reduccedilatildeo de diversidade de microrganismos endofiacuteticos
pelo uso continuado de fungicidas
Resultados semelhantes foram obtidos por Gamboa-Gaitaacuten Laureano e Bayman
(2005) estudando isolados de Phomopsis endofiacuteticos da planta medicinal Guarea
guidonia (Meliaceae) Os autores relataram elevados niacuteveis de variabilidade geneacutetica
avaliada pela digestatildeo da regiatildeo ITS e tambeacutem a alta variabilidade morfoloacutegica entre
os isolados avaliados A aacutervore molecular agrupou indiviacuteduos fenotipicamente
diferentes Por outro lado Fernandez e Hanlin (1996) obtiveram resultados
concordantes entre a anaacutelise molecular por RAPD e as caracteriacutesticas morfoculturais
separando os isolados coletados de soja em dois grupos Diaporthe phaseolorum e
Phomopsis longicolla
Pioli et al (2003) caracterizaram por RAPD isolados do complexo
DiaporthePhomopsis coletados de soja na Argentina Eles foram separados em quatro
grupos (i) Diaporthe phaseolorum variedade meridionalis (ii) D phaseolorum variedade
caulivora (iii) D phaseolorum variedade sojae and (iv) Phomopsis longicolla revelando
a existecircncia de variabilidade entre isolados da mesma variedade
92
54 Avaliaccedilatildeo da atividade antimicrobiana 541 Cultura pareada
Os isolados de Phomopsis foram avaliados pela teacutecnica de cultura pareada
contra as linhagens PC1396 e PC3305 do fitopatoacutegeno G citricarpa As interaccedilotildees
foram classificadas em trecircs tipos 1) Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno com
sobreposiccedilatildeo de hifas 2) Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno sem sobreposiccedilatildeo
de hifas e 3) Ausecircncia de inibiccedilatildeo de crescimento Os resultados obtidos estatildeo
apresentados nas Tabelas 9 e 10
Todos os isolados de Phomopsis inibiram significativamente o crescimento das
duas linhagens de Guignardia exceto o isolado ES2WC1 (Phomopsis sp) que
apresentou interaccedilatildeo do tipo 3 em que natildeo houve inibiccedilatildeo significativa do fitopatoacutegeno
apenas 287 e 828 contra PC1396 e PC3305 respectivamente (ANEXO 6 7 8 e
9) Foi observado que as duas linhagens de G citricarpa apresentaram o mesmo tipo
de interaccedilatildeo frente ao mesmo isolado de Phomopsis ou seja natildeo houve variaccedilatildeo
quanto a linhagem do fitopatoacutegeno avaliado Tal observaccedilatildeo reforccedila a importacircncia dos
resultados aqui apresentados
Dos 49 isolados de Phomopsis endoacutefitos de plantas medicinais avaliados 38
inibiram o crescimento das duas linhagens do fitopatoacutegeno G citricarpa com
porcentagem de inibiccedilatildeo superior a 50 Os isolados A333B (Phomopsis sp) ESGF1
(Phomopsis sp S3) SM9638 (P theicola) AT9810 (Phomopsis sp) AT9906
(Phomopsis sp) e ES2WC1 (Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo inferiores
a 50 contra PC1396 e PC3305 os isolados ES80J (Phomopsis sp) e AT9811
(Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo inferiores a 50 apenas contra a
linhagem PC1396 enquanto contra a PC3305 a inibiccedilatildeo foi de 5132 e 5397
respectivamente Por outro lado os isolados de Phomopsis ESFF1 (Phomopsis sp)
SM9714 (Phomopsis sp) e A132 (Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo
inferiores a 50 apenas contra a linhagem PC3305 enquanto contra PC1396 a
inibiccedilatildeo foi de 5017 6215 e 5492 respectivamente
93
A anaacutelise estatiacutestica demonstrou que haacute diferenccedila significativa entre o controle e
os isolados avaliados O fungicida Derosal apresentou inibiccedilatildeo do crescimento do
fitopatoacutegeno em aproximadamente 19 todos os isolados de Phomopsis que
apresentaram inibiccedilatildeo superior ao fungicida com significacircncia no teste estatiacutestico exceto
o isolado ES2WC1 (Phomopsis sp) como citado anteriormente (TABELA 8 e 9 ANEXO
6 7 8 e 9)
As interaccedilotildees do tipo 1 nas quais ocorre agrave sobreposiccedilatildeo de hifas do endoacutefito
sobre o fitopatoacutegeno sugere a ocorrecircncia de parasitismo Esse tipo de interaccedilatildeo entre
os isolados de Phomopsis e as linhagens de G citricarpa ocorreu em 47 dos isolados
Tais isolados apresentam diferenccedila significativa entre o controle destacando-se os
isolados ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) (FIGURA 21) ESJD1
(Phomopsis sp S12) e ESJH1 (Phomopsis sp S11) que inibiram o crescimento de G
citricarpa PC1396 em 7338 6885 6826 e 6792 respectivamente A anaacutelise
estatiacutestica demonstra que haacute diferenccedila significativa entre o controle e estes isolados
poreacutem natildeo haacute diferenccedila significativa entre os mesmos (ANEXO 6 7 e 8)
As interaccedilotildees do tipo 2 nas quais natildeo ocorre sobreposiccedilatildeo de hifas ocorreram
em 51 dos isolados destacando-se os isolados ESSD1 (Phomopsis sp) e SM9713
(P longicolla) que inibiram o crescimento da linhagem PC1396 de G citricarpa em
7324 e 6763 respectivamente A anaacutelise estatiacutestica demonstra que haacute diferenccedila
significativa entre o controle e os isolados ESSD1 (Phomopsis sp) e SM9713 (P
longicolla) os isolados de Phomopsis tambeacutem diferem entre si (TABELA 8) Essas
interaccedilotildees devem ser avaliadas posteriormente em microscopia oacutetica para confirmar se
estaacute ocorrendo parasitismo
FIGURA 21 INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa PC1396 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA
Phomopsis A134
G Citricarpa PC1396
Phomopsis SM9713
G Citricarpa PC1396
G Citricarpa PC1396 Controle
G Citricarpa PC1396
Fungicida Derosal
FONTE O autor
94
Isolados Identificaccedilatildeo Tipo de Interaccedilatildeo Inibiccedilatildeo () Fungicida 19
ESDF1 Phomopsis sp S7 1 7338 ESSD1 Phomopsis sp 2 7324 A134 Phomopsis sp 1 6885
ESJD1 Phomopsis sp S12 1 6826 ESJH1 Phomopsis sp S11 1 6792 SM9713 P longicolla 2 6763 ESIE1 Phomopsis sp 1 6758 ESFB2 Phomopsis sp 1 6724
MU0123 P longicolla 2 6663 ESRD1 Phomopsis sp S1 2 6655 ESJG1 Phomopsis sp 2 6621 ESJE1 Phomopsis sp S1 1 6621
ESPAC22 Phomopsis sp S4 1 6516 A131 P michaeliae 2 6393 A126 Phomopsis sp S11 1 6352 A123 Phomopsis sp S2 1 6270 A113 P michaeliae 1 6270
SM9631 Phomopsis sp 1 6265 ES2AB1 Phomopsis sp S6 1 6246 ESJE2 Phomopsis sp S1 1 6246 A323 Phomopsis sp S8 1 6230
SM9714 Phomopsis sp 1 6215 ES2NA1 Phomopsis sp 1 6212
A334 Phomopsis sp S8 1 6189 ESBA1 Phomopsis sp S6 2 6177 A321 P michaeliae 1 6148
ESKD1 Phomopsis sp S1 1 6109 A216B Phomopsis sp 2 6025
ES2KF1 Phomopsis sp S4 2 5939 ESIA1 P michaeliae 2 5904 A135 Phomopsis sp 2 5902 A124 Phomopsis sp S9 2 5861
A115B Phomopsis sp 1 5861 A116 Phomopsis sp S5 2 5820
A215A Phomopsis sp 1 5656 A132 Phomopsis sp 2 5492
ESFH1 P theicola 2 5427 A333A Phomopsis sp 1 5369 ESGA1 Phomopsis sp S10 2 5324
ES2WF1 Phomopsis sp S4 2 5205 ESFF1 Phomopsis sp 2 5017 AT9811 Phomopsis sp 1 4920 ESGF1 Phomopsis sp S3 2 4642 SM9638 P theicola 1 4522 A333B Phomopsis sp 1 4426 ES80J Phomopsis sp 2 4344 AT9810 Phomopsis sp 2 4173 AT9906 Phomopsis sp 2 3078 ES2WC1 Phomopsis sp 3 287
FONTE O autor
TABELA 8 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC1396
95
A interaccedilatildeo do tipo 1 entre os isolados de Phomopsis e a linhagem PC3305 de
G citricarpa ocorreu em 47 dos isolados a reduccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno
apresentou diferenccedila significativa quando comparados com o controle destacando-se
os isolados A215A (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ESDF1 (Phomopsis sp
S7) ESJD1 (Phomopsis sp S12) A123 (Phomopsis sp S2) que inibiram o crescimento
da linhagem PC3305 de G citricarpa em 7947 7616 7152 7119 e 7119
respectivamente (TABELA 9 FIGURA 22) A anaacutelise estatiacutestica demonstra que haacute
diferenccedila significativa entre o controle e os isolados A215A (Phomopsis sp) A115B
(Phomopsis sp) ESDF1 (Phomopsis sp S7) ESJD1 (Phomopsis sp S12) A123
(Phomopsis sp S2) A215A A115B ESDF1 ESJD1 A123 mas os isolados de
Phomopsis natildeo diferem entre si (ANEXO 9)
Os isolados ESRD1 (Phomopsis sp S1) e A135 (Phomopsis sp) apresentaram
as maiores taxas de inibiccedilatildeo do crescimento da linhagem PC3305 de G citricarpa pela
interaccedilatildeo do tipo 2 6887 e 6623 respectivamente (TABELA 9) A anaacutelise estatiacutestica
demonstra que haacute diferenccedila significativa entre o controle e os isolados ESRD1
(Phomopsis sp S1) e A135 (Phomopsis sp) esses isolados de Phomopsis diferem
entre si (ANEXO 9) Essas interaccedilotildees devem ser avaliadas posteriormente ao
microscoacutepio para confirmar se estaacute ocorrendo parasitismo
O isolado SM9713 (P longicolla) inibiu o crescimento do patoacutegeno G citricarpa e
produziu esporos em volta da colocircnia Segundo Boosalis (1964) a esporulaccedilatildeo pode
ocorrer quando determinados hospedeiros estimulam a reproduccedilatildeo de seus parasitas
Resultados semelhantes foram encontrados por Martins-Corder e Melo (1998) onde
observaram que a maioria dos isolados de Trichoderma spp antagonistas colonizou e
produziu esporos em abundacircncia sobre as colocircnias de Verticillium dahliae
As interaccedilotildees do tipo 2 mostram inibiccedilatildeo mutua na qual o endoacutefito natildeo sobrepotildee
a colocircnia do fitopatoacutegeno apesar de inibir seu crescimento Segundo Bell et al (1982)
os antagonistas selecionados pelo confronto direto satildeo aqueles que apresentam
crescimento sobre o fitopatoacutegeno Poreacutem a relaccedilatildeo entre o tipo de interaccedilatildeo e a
porcentagem de inibiccedilatildeo observada nos resultados natildeo satildeo congruentes uma vez que
96
a porcentagem de inibiccedilatildeo para alguns isolados com interaccedilatildeo do Tipo 2 eacute maior do que
para aqueles com interaccedilatildeo do Tipo 1
Isolados Identificaccedilatildeo Tipo de Interaccedilatildeo
Inibiccedilatildeo ()
Fungicida 1921 A215A Phomopsis sp 1 7947 A115B Phomopsis sp 1 7616 ESDF1 Phomopsis sp S7 1 7152 ESJD1 Phomopsis sp S12 1 7119 A123 Phomopsis sp S2 1 7119
ESFB2 Phomopsis sp 1 7086 ESJE2 Phomopsis sp S1 1 7020 ESJH1 Phomopsis sp S11 1 7020
SM9631 Phomopsis sp 1 6921 ESRD1 Phomopsis sp S1 2 6887 A135 Phomopsis sp 2 6623 A126 Phomopsis sp S11 1 6490
ESPAC22 Phomopsis sp S4 1 6424 A131 P michaeliae 2 6424
ESJE1 Phomopsis sp 1 6358 ES2KF1 Phomopsis sp S4 2 6298
A334 Phomopsis sp S8 1 6291 A124 Phomopsis sp S9 2 6258 ESIA1 P michaeliae 2 6126 ESKD1 Phomopsis sp S1 1 5993 ESSD1 Phomopsis sp L5 2 5960 A134 Phomopsis sp 1 5861 A113 P michaeliae 1 5795
TABELA 9 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 (CONTINUA)
FIGURA 22 INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa 3305 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA
G citricarpa PC3305
Phomopsis ESRD1
Phomopsis ESDF1
G citricarpa PC3305
G citricarpa PC3305 controle
Fungicida Derosal
G citricarpa PC3305
FONTE O autor
97
A333A Phomopsis sp 1 5728 ESIE1 Phomopsis sp 1 5695 ESJG1 Phomopsis sp 2 5662 A323 Phomopsis sp S8 1 5629
ES2AB1 Phomopsis sp S6 1 5596 ESBA1 Phomopsis sp S6 2 5563 A116 Phomopsis sp S5 2 5464
AT9811 Phomopsis sp 1 5397 A216B Phomopsis sp 2 5364 A321 P michaeliae 1 5331
SM9713 P longicolla 2 5298 ES2NA1 Phomopsis sp 1 5265 MU0123 P longicolla 2 5232 ESFH1 Phomopsis sp 2 5132 ES80J Phomopsis sp 2 5132 ESGA1 Phomopsis sp S10 2 5079
ES2WF1 Phomopsis sp S4 2 5033 ESFF1 P theicola 2 4934
SM9714 Phomopsis sp 1 4735 A132 Phomopsis sp 2 4470
A333B Phomopsis sp 1 3775 ESGF1 Phomopsis sp S3 2 3344 SM9638 P theicola 1 2781 AT9810 Phomopsis sp 2 2649 AT9906 Phomopsis sp 2 2583 ES2WC1 Phomopsis sp 3 828
FONTE O autor 542 Teste para detecccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
No teste de metaboacutelitos volaacuteteis observou-se reduccedilatildeo do crescimento da
linhagem PC1396 e PC3305 de G citricarpa apoacutes a retirada do celofane onde
inicialmente foram inoculados os isolados de Phomopsis Todos os isolados testados
inibiram significativamente o crescimento das duas linhagens de G citricarpa Os
isolados A115B (Phomopsis sp) A134 (Phomopsis sp) ESFF1 (Phomopsis sp)
ESFH1 (Phomopsis theicola) A123 (Phomopsis sp S2) e S2WF1 (Phomopsis sp S4)
apresentaram maior inibiccedilatildeo do crescimento das duas linhagens do fitopatoacutegeno
(ANEXO 10 e 11 e FIGURA 23) sugerindo que a interaccedilatildeo entre os isolados de
Phomopsis e o fitopatoacutegeno ocorre devido agrave produccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
TABELA 9 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 (CONTINUACcedilAtildeO)
98
FONTE O autor FIGURA 23 AVALIACcedilAtildeO DO CRESCIMENTO DAS COLOcircNIAS DO FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 e PC3305 INOCULADAS APOacuteS RETIRADA DO PAPEL CELOFANE PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS EM MEIO BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
Nota a Placa com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC3305 inoculado apoacutes retirada do celofane onde previamente foi inoculado o isolado ESFH1 b Placa controle com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC3305 c Placa com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396 inoculado apoacutes retirada do celofane onde previamente foi inoculado o isolado ESFH1 d Placa controle com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396
FIGUEIREDO (2006) utilizou a teacutecnica de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis em
Pestalotiopsis isolados endofiacuteticos de Maytenus ilicifolia e observou uma reduccedilatildeo do
crescimento da linhagem PC1396 de G citricarpa demonstrando que a interaccedilatildeo
ocorre principalmente pela produccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
Os resultados apresentados aqui demonstram o grande potencial que tais
linhagens endofiacuteticas de Phomopsis possuem como agentes de controle da Mancha
Preta dos Citros e o seu potencial na produccedilatildeo de metaboacutelitos
543 Avaliaccedilatildeo da accedilatildeo dos Extratos
Na avaliaccedilatildeo dos extratos quanto agrave inibiccedilatildeo do crescimento das linhagens
PC1396 e PC3305 de G citricarpa os resultados indicam que a maioria dos extratos
metanoacutelicos produzidos a partir dos isolados de Phomopsis reduziram o crescimento
micelial de ambas as linhagens do fitopatoacutegeno da MPC A inibiccedilatildeo ocorreu devido aos
metaboacutelitos secundaacuterios produzidos pelos isolados endofiacuteticos quando comparados
com o crescimento micelial dos controles com metanol (onde o extrato foi diluiacutedo) e
com aacutegua destilada (FIGURA 24 25 e TABELA 10)
a b c d
99
Foi observado que os isolados de Phomopsis que apresentaram as maiores
porcentagens de inibiccedilatildeo pela teacutecnica de cultura pareada tambeacutem inibiram o
crescimento quando foi utilizado o extrato metanoacutelico Entretanto o isolado ES2WC1
(Phomopsis sp) que natildeo inibiu o crescimento pela teacutecnica de cultura pareada
apresentou reduccedilatildeo no crescimento micelial dos dois fitopatoacutegenos avaliados
utilizando-se o seu extrato metanoacutelico Provavelmente essa falta de inibiccedilatildeo pela
teacutecnica de cultura pareada tenha ocorrido pelo fato do isolado ES2WC1 (Phomopsis
sp) apresentar crescimento lento fazendo com que o crescimento do fitopatoacutegeno natildeo
diferisse significativamente do controle
Os isolados ES80J (Phomopsis sp) ESFF1 (Phomopsis sp) A132 (Phomopsis
sp) A333B (Phomopsis sp) e SM9638 (P theicola) natildeo inibiram o crescimento micelial
de nenhum dos fitopatoacutegenos avaliados Para alguns isolados de Phomopsis natildeo foi
possiacutevel determinar o potencial antimicrobiano dos extratos metanoacutelicos pois houve
grande variaccedilatildeo de accedilatildeo entre as repeticcedilotildees do experimento
FONTE O autor
C
D E F
A B
NOTA A Placa controle com aacutegua destilada autoclavada B Placa controle com metanolC Placa controle com fungicida Derosal reg (10 mgmL) D Placa com extrato metanoacutelicodo isolado ES2WC1 E Placa com extrato metanoacutelico do isolado A215A F Placa comextrato metanoacutelico do isolado ESDF1
FIGURA 24 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NOCRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC3305 DE G citricarpa EMMEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
100
Rodrigues-Heerklotz et al (2001) elucidaram a estrutura quiacutemica e a siacutentese
assimeacutetrica de um novo metaboacutelito o aacutecido guignardico produzido pelo fungo endofiacutetico
Guignardia sp isolado de Spondias mombin Silva et al (2005) isolaram dois
metaboacutelitos de Phomopsis cassiae endofiacutetico de Cassia specatabilis 24-diidroxi-56-
dimetil benzoato de etila e phomopsilactona que exibiram forte atividade antifuacutengica
contra fitopatoacutegenos bem como citotoxicidade contra a linhagem celular de tumor
cervical humano (HeLa) Estudos adicionais devem ser realizados para determinar a
estrutura quiacutemica produzida pelos endoacutefitos de Phomopsis estudados
NOTA A Placa controle com aacutegua destilada autoclavada B Placa controle commetanol C Placa controle com fungicida Derosal reg (10 mgmL)D Placa com extratometanoacutelico do isolado ES2WC1 E Placa com extrato metanoacutelico do isolado ESGA1 FPlaca com extrato metanoacutelico do isolado ESSD1
FONTE O autor FIGURA 25 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NOCRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 DE G citricarpa EMMEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
C
D E F
A B
101
Os resultados da tabela 10 revelam que os isolados endofiacuteticos de Phomopsis
spp avaliados satildeo bastante promissores demonstrando um potencial na produccedilatildeo de
metaboacutelitos Resultados semelhantes foram obtidos por Moller Weber e Dreyfuss
(1996) que avaliaram a accedilatildeo de endoacutefitos de plantas tropicais com alta produccedilatildeo de
metaboacutelitos secundaacuterios
Identificaccedilatildeo Isolados Inibiccedilatildeo PC3305 Cultura Pareada
Inibiccedilatildeo PC3305 Extrato
Metanoacutelico
Inibiccedilatildeo () PC1396 Cultura Pareada
Inibiccedilatildeo PC1396 Extrato
Metanoacutelico Derosal Fungicida 1921 I 19 I
P longicolla SM9713 5298 I 6763 I P longicolla MU0123 5232 ND 6663 I P michaeliae A131 6424 I 6393 I P michaeliae ESIA1 6126 I 5904 I Phomopsis sp A333A 5728 I 5369 I P michaeliae A321 5331 I 6148 I P michaeliae A113 5795 ND 627 ND Phomopsis sp S2 A123 7119 ND 627 ND P theicola ESFH1 5132 I 5427 I Phomopsis sp ESFF1 4934 NI 5017 NI P theicola SM9638 2781 NI 4522 NI Phomopsis sp S4 ES2WF1 5033 I 5205 I Phomopsis sp S3 ESGF1 3344 I 4642 I Phomopsis sp S10 ESGA1 5079 I 5324 I Phomopsis sp S1 ESRD1 6887 I 6655 I Phomopsis sp S8 A334 6291 I 6189 I Phomopsis sp S9 A124 6258 I 5861 I Phomopsis sp S7 ESDF1 7152 I 7338 I Phomopsis sp ESSD1 596 I 7324 I Phomopsis sp S6 ES2AB1 5596 I 6246 I Phomopsis sp S6 ESBA1 5563 I 6177 I Phomopsis sp S11 A126 649 ND 6352 ND Phomopsis sp S12 ESJD1 7119 I 6826 I Phomopsis sp S1 ESJE1 6358 I 6621 I Phomopsis sp S1 ESJE2 702 ND 6246 ND Phomopsis sp S1 ESKD1 5993 ND 6109 ND Phomopsis sp A115B 7616 I 5861 I Phomopsis sp ESFB2 7086 I 6724 I Phomopsis sp S11 ESJH1 702 I 6792 I Phomopsis sp A135 6623 I 5902 ND Phomopsis sp A134 5861 I 6885 I Phomopsis sp ESIE1 5695 I 6758 I Phomopsis sp ESJG1 5662 ND 6621 I
TABELA 10 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO CRESCIMENTO MICELIAL DASCOLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTOA 28ordmC (CONTINUA)
102
Phomopsis sp AT9811 5397 I 492 I Phomopsis sp A216B 5364 I 6025 I Phomopsis sp ES2NA1 5265 I 6212 I Phomopsis sp SM9714 4735 I 6215 I Phomopsis sp ES2WC1 828 I 287 I Phomopsis sp SM9631 6921 ND 6265 ND Phomopsis sp S4 ESPAC22 6424 ND 6516 ND Phomopsis sp S4 ES2KF1 6298 ND 5939 ND Phomopsis sp S8 A323 5629 ND 623 ND Phomopsis sp S5 A116 5464 ND 582 ND Phomopsis sp AT9810 2649 ND 4173 ND Phomopsis sp AT9906 2583 ND 3078 ND Phomopsis sp ES80J 5132 NI 4344 NI Phomopsis sp A132 447 NI 5492 NI Phomopsis sp A333B 3775 NI 4426 NI Phomopsis sp A215A 7947 I 5656 I
FONTE O autor
NOTA I- Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno NI- Natildeo ocorreu inibiccedilatildeo do fitopatoacutegeno ND- Natildeo foi determinado a inibiccedilatildeo
No Brasil as plantas Spondias mombin e A tomentosum tecircm sido usadas na
medicina devido as suas propriedades antimicrobianas (AJAO SHONUKAN e FEMI
1984) Os isolados de Phomopsis obtidos como endoacutefitos de S mombin (SM9713 (P
longicolla) SM9638 (P theicola) e SM9714 (Phomopsis sp)) e A tomentosum (AT9810
(Phomopsis sp) AT9811 (Phomopsis sp) e AT9906 (Phomopsis sp)) avaliados no
presente trabalho jaacute haviam sido relatados por Corrado e Rodrigues (2004) como
produtores de compostos bioativos Os autores relatam que os extratos metanoacutelicos
inibiram o crescimento de E coli S aureus P aeruginosa C albicans A niger e F
oxysporum No presente trabalho os isolados de S mombin e A tomentosum inibiram
o crescimento de Guignardia citricarpa confirmando o potencial desses isolados em
produzir substacircncias bioativas mais estudos devem ser realizados para verificar o
potencial antimicrobiano desses extratos contra bacteacuterias patogecircnicas e
fitopatogecircnicas
A planta Schinus terebinthifolius eacute usada no Brasil na medicina alternativa contra
doenccedilas da coacuternea (CORREcircA 1926) doenccedilas reumaacuteticas uacutelceras feridas tumores
linfaacuteticos erisipela e outras moleacutestias provocadas por bacteacuterias que se manifestam em
forma de edema ou eritema (BALBACH 1992) As linhagens de Phomopsis isoladas de
S terebinthifolius avaliadas nesse trabalho A135 (Phomopsis sp) A113 (P michaelae)
TABELA 10 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO CRESCIMENTO MICELIAL DASCOLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DECRESCIMENTO A 28ordmC (CONTINUACcedilAtildeO)
103
A115B (Phomopsis sp) A323 (Phomopsis sp S8) A132 (Phomopsis sp) A134
(Phomopsis sp) A333B (Phomopsis sp) A321 (P michaelae) A126 (Phomopsis sp
S11) A216B (Phomopsis sp) A334 (Phomopsis sp S8) A116 (Phomopsis sp S5)
A215A (Phomopsis sp) A124 (Phomopsis sp S9) A333A (Phomopsis sp) A131 (P
michaeliae) e A123 (Phomopsis sp S2) apresentaram excelentes resultados contra G
citricarpa
Extratos da planta M ilicifolia jaacute foram descritos na literatura apresentando
atividade antitumoral tambeacutem usado como analgeacutesico antinflamatoacuterio e antiaacutecido
(JORGE 2004 DUARTE 2005) Pileggi (2006) isolou microrganismos endofiacuteticos de
plantas de Maytenus ilicifolia do mesmo pomar investigado neste trabalho e avaliou o
potencial farmacoloacutegico dos mesmos Entre os fungos e bacteacuterias testados 15
apresentaram potencial para controle bioloacutegico
Figueiredo (2006) isolou fungos endofiacuteticos de plantas de M ilicifolia do mesmo
pomar investigado neste trabalho especialmente Pestalotiopsis spp e os avaliou quanto
ao potencial antimicrobiano contra bacteacuterias patogecircnicas em humanos e o fitopatoacutegeno
G citricarpa Os extratos metanoacutelicos de dois isolados exibiram accedilatildeo fungistaacutetica na
germinaccedilatildeo e no crescimento micelial das linhagens PC1396 e PC3305 de G
citricarpa Aleacutem disso dois extratos de Pestalotiopsis spp inibiram o crescimento dos
microrganismos-teste (S aureus oxalino resistente Klebsiella pneumoniae
Micrococcus luteus Staphylococcus aureus e Escherichia coli)
No presente trabalho observou-se que as linhagens de Phomopsis spp isolados
de M ilicifolia apresentaram excelentes resultados in vitro contra G citricarpa Pouco se
conhece a respeito da comunidade endofiacutetica existente nessas plantas e os resultados
desse trabalho demostram que abrigam uma grande variabilidade de PC1396 e
PC3305 espeacutecies de Phomopsis com portencial para bioprospecccedilatildeo Isto reforccedila a
importacircncia de estudos de microrganismos endofiacuteticos em plantas medicinais em
especial M ilicifolia e S terebinthifolius Faz-se necessaacuterio tambeacutem o estudo da
composiccedilatildeo quiacutemica dos extratos avaliados
104
6 CONCLUSOtildeES Os resultados obtidos no presente trabalho permitiram as seguintes conclusotildees
bull As espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo podem ser identificadas
apenas por caracteriacutesticas morfoloacutegicas ou marcadores moleculares
RAPD sendo necessaacuteria uma anaacutelise polifaacutesica incluindo
sequumlenciamento de vaacuterias regiotildees do genoma
bull As plantas medicinais analisadas satildeo colonizadas por grande
diversidade de espeacutecies de Phomopsis com grande variabilidade
morfoloacutegica e geneacutetica intra e interespeciacuteficas
bull As plantas de Maytenus ilicifolia analisadas satildeo colonizadas
endofiticamente por pelo menos 10 espeacutecies de Phomopsis sendo
possiacutevel identificar por sequumlecircncias ITS do rDNA isolados de P theicola e
P michaeliae
bull A planta de Schinus terebinthifolius analisada eacute colonizada
endofiticamente por pelo menos 6 espeacutecies de Phomopsis sendo
possiacutevel identificar por sequumlecircncias ITS do rDNA isolados de P
michaeliae
bull As espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo satildeo hospedeiro-especiacuteficas
sendo necessaacuteria a redefiniccedilatildeo do conceito de espeacutecie para este gecircnero
bull Os isolados de Phomopsis spp apresentaram grande potencial no
controle in vitro do fungo G citricarpa Os isolados ESIA1 e A131 (P
michaeliae) ESJE1 ESJE2 ESKD1 e ESRD1 (Phomopsis sp S1) A123
(Phomopsis sp S2) ES2KF1 e ESPAC22 (Phomopsis sp S4) ESDF1
105
(Phomopsis sp S7) A334 (Phomopsis sp S8) A124 (Phomopsis sp
S9) A126 e ESJH1 (Phomopsis sp S11) ESJD1 (Phomopsis sp S12) e
os isolados A134 A135 A115B A215A SM9631 ESFB2 e ESSD1
(Phomopsis sp) foram os mais promissores em inibir o crescimento das
linhagens PC1396 e PC3305 de G citricarpa nas metodologias
avaliadas
106
7 REFEREcircNCIAS BIBLIOGRAacuteFICAS ALBERTS B LEWIS J RALF M ROBERTS K WATSON J D Molecular Biology of the Cell 4ordf ed New York Garland Publishing 2004 ALICE C B SIQUEIRA N C S MENTZ L A SILVA G A A B JOSEacute K F D Plantas medicinais de uso popular Atlas farmacognoacutestico Canoas Editora da ULBRA 1995 ALZATE-MARIN A L BAIacuteA G S FALEIRO F G CARVALHO G A PAULA JR T J MOREIRA M A BARROS E G Anaacutelise da diversidade geneacutetica de raccedilas de Colletotrichum lindemuthianum que ocorrem em algumas regiotildees do Brasil por marcadores RAPD Fitopatologia Brasileira v 22 p 85-88 1997 ALMEIDA A M R Efeito de luz e meios de cultura sobre crescimento micelial formaccedilatildeo e tamanho de picniacutedios e esporulaccedilatildeo de isolados de Phomopsis sojae Leh In SEMINAacuteRIO NACIONAL DE PESQUISA DE SOJA Brasiacutelia 2 1981 Londrina Anais Brasiacutelia EmbrapaSNI 1982 p 216-226 ANCHORENA-MATIENZO P Re-identificaccedilatildeo e caracterizaccedilatildeo geneacutetica de levedura IZ-987 utilizando marcadores moleculares 2002 81p Dissertaccedilatildeo (Mestrado) ndash ESALQ USP Piracicaba Satildeo Paulo 2002 ANJOS J R N CHARCHAR M J A GUIMARAtildeES D P Ocorrecircncia de Queima das Folhas Causada por Phomopsis sp Em Aroeira No Distrito Federal Fitopatologia Brasileira v 26 n 3 p 649-650 2001 ARAUacuteJO J M SILVA A C AZEVEDO J L Isolation of endophytic actinomycetes from roots and leaves of maize (Zea mays L) Brazilian Archives of Biology and Technology v 43 n 4 p 447-451 2000 ARAUacuteJO W L AZEVEDO J L LIMA A O S MARCOM J SOBRAL J L LACAVA P T Manual Isolamentos de fungos endofiacuteticos Escola Superior da Agricultura Luiz de Queiroz Universidade de Satildeo Paulo Piracicaba 2002 ARNOLD E A MEJIacuteA C L KYLLO D ROJAS E I MAYNARD Z ROBBINS N HERRE E A Fungal endophytes limit pathogen damage in a tropical tree PNAS v 100 p 15649-15654 2003 AZEVEDO J L Microrganismos Endofiacuteticos In MELO I S AZEVEDO J L Ecologia Microbiana Editora EMBRAPA Jaguariuacutena-SP p 117-137 1998 AZEVEDO J L JUacuteNIOR W M PEREIRA J O ARAUacuteJO W L Endophytic microganisms a review on insect control and recent advances on tropical plants
107
Environmental Biotechnology v 3 n1 p 40-65 2000 BAAYEN R P BONANTS P J M VERKLEY G CARROL G C VAN DER AA M WEERDT M BROUWERSHAVEN G C SCHUTTE G C MACCHERONI JR W GLIENKE-BLANCO C AZEVEDO J L Nonpathogenic Strains of the Citrus Black Spot Fungus Guignardia citricarpa Identified as a Cosmopolitan Endophyte of Woody Plants Guignardia mangiferae (Phyllosticta capitalensis) Phytopathology v 92 p 464-477 2002 BAKER R E D Studies in the pathogenicity of tropical fungi II The occurrence of latent infections in developing fruits Annals of Botany London v 2 p 919-931 1938 BAO J R LAZAROVITS G Differential colonization of tomato roots by nonpathogenic and pathogenic Fusarium oxysporum strains may influence Fusarium wilt control Phytopathology Lancaster v 91 p 449-456 2001 BELL D K WELLS H D MARKHABELL D K WELLS C R In vitro antagonism ot Trichoderma species against six fungal plant pathogens Phytopathology v 72 p 379-382 1982 BETTIOL W GHINI R Controle Bioloacutegico In Manual de Fitopatologia Bergamin FILHO A AMORIM L e KIMATI H (Eds) 3ordf ed Satildeo Paulo Ceres 1995 919p BILLS G DOMBROWSKY A PELAEZ F POLISHOOK J Recent and future discoveries of pharmacologically active metabolites from tropical fungi Tropical mycology micromycetes v 2 p 165-194 2002 BITTENCOURT J V M Variabilidade geneacutetica em populaccedilotildees naturais de Maytenus ilicifolia por meio de marcadores RAPD Curitiba 2000 58p Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Agronomia ndash Produccedilatildeo Vegetal) Universidade Federal do Paranaacute BITTENCOURT J V M Variabilidade Geneacutetica em Populaccedilotildees Naturais de Maytenus Ilicifolia por Meio de Marcadores RAPD Scientia Agraacuteria v 2 p1-2 2001 BLANCO C G Guignardia citricarpa Kiely Anaacutelise geneacutetica cariotiacutepica e interaccedilatildeo com o hospedeiro Piracicaba 1999 Tese de Doutorado- escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Universidade de Satildeo Paulo BOSSALIS M C Hyperparasitism Annual Review of Phytopathology v 2 p 363-375 1964 BRAYFORD D Vegetative incompatibility in Phomopsis from elm Mycological Research v 94 n 6 p 745-752 1990
108
BODDY L GRIFFITH G S Role of endophytes and latent invasion in the development of decay communities in sapwood of angiospermous trees Sydowia v 41 p 41-73 1989 BUSSABAN B LUMYONG S LUMYONG P McKENZIE E H HYDE K D Endophytic fun i from Amomum siamense Canadian Journal of Microbiology v 47 n 10 p 943-948 2001 CAMPAROTO M L TEIXEIRA R O MANTOVANI M S VICENTINI P Effects of Maytenus ilicifolia Mart and Bauhinia candicans Benth onion root-tip and rat bone-marrow cells Genetics and Molecular Biology v 25 n1 p 85-89 2002 CARDOSO-FILHO J L Efeito de extratos de albedo de laranja (Citrus sinesis) dos indutores de resistecircncia aacutecido salicilico acil-benzolar ndash S- metil e Saccharomyces cerevisiae no controle de Phyllosticta citricarpa (Teleomorfo Guignardia citricarpa) Piracicaba 2003 125f Dissertaccedilatildeo (Doutorado) ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo CARROLL G C CARROLL F E Studies on the incidence of coniferous needle endophytes in the Pacitfic Northwest Canadian Jornal of Botany v 56 p 3034-3043 1978 CARROLL G C The Biology of endophytism in plants with particular reference to woody perennials In FOKKEMA N J HEAVEL J Van Der (Eds) Microbiology of the Phyllosphere Cambridge Cambridge University Press 1986 p 205-222 CASTLEBURY LA MENGISTU A Phylogenetic distinction of DiaporthePhomopsis isolates from soybeans [resumo] Systematic Mycology and Microbiology I v 57 n 4 p 13 2006 CENARGEN Banco de Dados on Line Disponiacutevel em lthttpicewall2cenargenembrapabr84micwebmichtmlfgbd01aspPgt Acesso em Maio de 2005 CERVI A C PACIORNIK E F VIEIRA R F MARQUES L C Espeacutecies vegetais de um remanescente de Floresta de Araucaacuteria (Curitiba-Brasil) estudo preliminar I Acta Bioloacutegica Paranaense Curitiba v18 n1-4 p73-114 1989 CHAREPRASERT S PIAPUKIEW J THIENHIRUN S WHALLEY A J S SIHANONTH P Endophytic fungi of teak leaves Tectona grandis L and rain tree leaves Samanea saman Merr Journal of Microbiology amp Biotechnology v 22 n 5 p 481-486 2006 CHRISTO D Variabilidade Geneacutetica e Diferenciaccedilatildeo Molecular de Isolados Endofiacuteticos e Patogecircnicos de Guignardia spp e Phyllosticta sp Curitiba 2002
109
78 f Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Geneacutetica) ndash Universidade Federal do Paranaacute CLAY K Effects of fungal endophyteson the seed and seedling biology of Lolium perenne and Festuca arundinacea Oecologia (Berlin) Berlin v73 p 358-362 1987 CLAY K Fungi and the food of the goods Nature v 427 p 401-402 2004 COCHRANE VW Physiology of fungi New York John Wiley 1958 524p COCKRUM P A PETTERSON D S EDGAR J A 1994 Identification of novel Phomopsins in Lupin seed extracts In Plant-associated toxins Agricultural phytochemical and ecological aspects DORLING P R p 232-237 Wallingford CAB In-ternational COELHO AG Software Bood v 3 04 2005 COIMBRA R SILVA E D Notas de Fitoterapia 2ordf ed Laboratoacuterio Cliacutenico Silva Arauacutejo SA 1958 CORDEIRO P J M VILEGAS J H Y LANCcedilAS F M HRGC-MS Analysis of Terpenoids from Maytenus ilicifolia and Maytenus aquifolium (ldquoEspinheira Santardquo) Journal of Brazilian Chemistry Society v 10 p 523-526 1999 CORRADO M RODRRIGUES KF Antimicrobial evaluation of fungal extracts produced by endophytic strains of Phomopsis sp Journal Basic Micrrobiol v44 p157-160 2004 CORREcircA RMS Caracterizaccedilatildeo de Phomopsis e Phoma obtidos de sementes de espeacutecies florestais 1995 72p Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Fitopatologia) ndash Universidade Federal de Lavras Lavras 1995 CRONQUIST A An integrated system of classification of flowering plants New York Columbia University Press 1981 CROUS PW WINGFIELD MJ FERREIRA FA ALFENAS A Mycosphaerella parkii and Phyllosticta eucalyptorum two new species from eucaliptus leaves in Brazil Mycological Research Cambridge v97 p 582-584 1993 CRUZ GL Livro Verde VolII 1a Editora Belo Horizonte-Minas Gerais 1965 DALZOTO P R GLIENKE-BLANCO C KAVA-CORDEIRO V ARAUacuteJO W L AZEVEDO J L RAPD analyses of recombinatiom process in the entomopathogenic fungus Beauveria bassiana Mycological Research v 107 p 1069-1074 2003 DJAOUIDA R SORBO G D REGGIO C ZOINA A FIRRAO G Polymorphisms in nuclear rDNA and mtDNA reveal the polyphyletic nature of isolates of Phomopsis
110
pathogenic to sunflower and a tight monophyletic clade of defined geographic origin Mycologia v 108 n 4 p 393-402 2004 DUARTE M R DEBUR M C Stem and leaf morphoanatomy of Maytenus ilicifolia Fitoterapia v 76 p 41-49 2005 EDGINTON L V KNEW K L BARRON G L Fungitoxic spectrum of benzimidazole compounds Phitopathology v 62 n 7 p 42-44 1971 EMBRAPA Fungos Endofiacuteticos Introduccedilatildeo Disponiacutevel em lthttpwwwcnpmaembrapabrprojetosendofiticosintroducaohtm1gt Acesso em Maio de 2005 ERNEST M MENDGEN W K WIRSEL W Endophytic Fungal Mutualists Seed-Borne Stagonospora spp Enhance reed biomass production in axenic microosms Molecular Plant-Microbe Interations v 16 n 7 p 580-587 2003 ESPOacuteSITO E AZEVEDO J L Fungos uma introduccedilatildeo agrave biologia bioquiacutemica e biotecnologia Caxias do Sul Edusc 510p 2004 ETHUR L Z CEMBRANEL C Z SILVA A C F Seleccedilatildeo de Trichoderma spp visando controle de Sclerotinia sclerotiorium in vitro Ciecircncia Rural v 31 n 5 p 885-887 2001 EZRA D STROBEL G A Effects of substrate on the bioactivity of volatile antimicrobials produced by Muscodor albus Plant Science St Paul v165 p913-922 2003 EZRA D CASTILLO U F STROBEL G A HESS W M PORTER H JENSEN J B CONDRON M A M TEPLOW D B SEARS J MARANTA M HUNTER M WEBER B YAVER D Coronamycins peptide antibiotics produced by a verticillate Streptomyces sp (MSU-2110) endophytic on Monstera sp Microbiology v 150 p 785-793 2004 FARR D F CASTLEBURY L A ROSSMAN A Y Morphological and molecular characterization of Phomopsis vaccinii and additional isolates of Phomopsis from blueberry and cranberry in the eastern United States Mycologia v 94 n 3 p 494-504 2002 FELSENTEIN J Conficence limits on phylogenies an approch using the bootstrap International Journal of Organic Evolution Lancaster v 39 p 366-369 1985 FERNANDEZ F A HANLIN R T Morphological and RAPD analyses of Diaporthe phaseolorum from soybean Mycologia v 88 n 3 p 425-440 1996
111
FERREIRA M E Aplicaccedilatildeo de Marcadores Moleculares no Mapeamento Geneacutetico de Plantas In III Curso de Marcadores Moleculares EMBRAPACENARGEN ndash Brasiacutelia DF 1994 FERREIRA D F Anaacutelise estatiacutestica por meio do SISVAR para Windows Versatildeo 40 In REUNIAtildeO ANUAL DA REGIAtildeO BRASILEIRA DA SOCIEDADE INTERNACIONAL DE BIOMETRIA 45 2000 Satildeo Carlos Anais Satildeo Carlos SSPSIB 2000 p 255-268 VAN SOEST P J Nutritional ecology of the ruminant 2 ed Ithaca Cornell University PressConstock Pub-lish1994 476 p FERREIRA MP OLIVEIRA CNOLIVEIRA BA LOPES MJALZAMORA F VIEIRA MAR A lyophilized aqueous extract of Maytenus ilicifolia leaves inhibits histamine-mediated acid secretion in isolated frog gastric mucose Planta v 219 p 319-324 2004 FIALHO M B Efeito in vitro Sacharomyces cerevicea sobre Guignardia citricarpa agente causal da pinta preta dos citros Piracicaba 2004 60f Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo FIGUEIREDO J G Bioprospecccedilatildeo Caracterizaccedilatildeo Morfoloacutegica e Molecular de Endoacutefitos de Maytenus ilicifolia com Ecircnfase EM Pestalotiopsis spp Curitiba 2006 Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade Federal do Paranaacute FRISVAD J C SAMSON R A Polyphasic taxonomy of Penicillium subgenus Penicillium - A guide to identification of food and air-borne terverticillate Penicillia and their mycotoxins Studies in Mycology v 49 p 1-173 2004 FRISVAD J C FRANK J M HOUBRAKEN J A M P KUIJPERS A F A SAMSON R A New ochratoxin A producing species of Aspergillus section Circumdati Studies in Mycology v 50 p 23-43 2004 FUNGARO M H P VIEIRA M L C Aplicaccedilotildees da PCR em ecologia molecular In MELO I S AZEVEDO J L (Eds) Ecologia microbiana Jaguarariuacutena Embrapa-CNPMA 1998 cap8 p205-227 FUNGARO M H P PCR na Micologia Biotecnologia Ciecircncia amp Desenvolvimento Brasiacutelia n14 p12-16 2000 GAMBOA-GAITAacuteN M A LAUREANO S BAYMAN P Endophytic Phomopsis Strains from of Guarea guidonia (Meliaceae) Journal of Science v 41 n 2 p 215-224 2005 GAO X ZHOU H XU D YU C CHEN Y QU L Hi h diversity of endophytic fun i from the pharmaceutical plant Heterosmilax japonica Kunth
112
revealed y cultivation-independent approach FEMS Microbiology Letters v 249 p 255-266 2005 GLIENKE C CHRISTO D MACCHERONI JR W AZEVEDO J L High molecular diversity of the fungus Guignardia citricarpa and Guignardia mangiferae and new primers for the diagnosis of the Citrus Black Spot Brazilian Archives of Biology and Technology Submetido 2007 GLIENKE C Variabilidade geneacutetica no fungo endoacutefito Guignardia citricarpa kiely detectada por RAPD Curitiba 1995 Dissertaccedilatildeo de Mestrado- Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade federal do Paranaacute GLIENKE-BLANCO C AGUILAR-VILDOSO CI VIEIRA MLC BARROSOP A V AZEVEDO JL Genetics variabilityb in the endophytic fungus Guignardia citricarpa isolated from citrus plants Genetics and Molecular Biology v 25 n 2 p 251-255 2002 GOacuteES A Etiologia aspectos epidemioloacutegicos e controle de Guignardia citricarpa agente causal da mancha preta do citros 100 p Relatoacuterio teacutecnico 2005 GONZALEZ M LOMBARDO A VALLARINO A J Plantas de la medicina vulgar del Uruguay Uruguay Talleres Grfificos Cerrito 149 p 1937 GUTHRIE P A I MAGILL C W FREDERIKSEN R A ODVODY G N Random amplified polymorphic DNA markers a systems for identifying and differentiating isolates of Colletotrichum graminicola Phytopathology St Paul v 82 p 832-835 1992 GURGEL LMS MENEZES M COELHO RSB Caracterizaccedilatildeo patogecircnica fisioloacutegica e isoenzimaacutetica de Phomopsis anacardii e Phomopsis mangiferae In CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA 30 1997 Poccedilos de Caldas Resumos Brasiacutelia Sociedade Brasileira de Fitopatologia 1997 p 269 GURGEL LMS MENEZES M COEcircLHO RSB Estudo comparativo de isolados de Phomopsis anacardii e Phomopsis mangiferae atraveacutes da patogenicidade e nutriccedilatildeo de C e N em trecircs regimes de luminosidade Summa Phytopathologica v 28 p 160-166 2002 GRAJAL-MARTIN M J SIMON C J MUEHLBAUER F J Use of Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) to characterize race 2 of Fusarium oxysporum fsp pisi Phytopatology v 83 p 612-14 1993 GRATTAPAGLIA D FERREIRA M E Introduccedilatildeo ao uso de marcadores moleculares em anaacutelise geneacutetica EMBRAPA Brasiacutelia 3 ed 220p 1998
113
GRIFFIN DH Fungal physiology 2ed New York Wiley-Liss 1994 458p HALL T A BioEdit48 Raileigh 1997-2001 1 arquivo (115M) Disponiacutevel em httpwwwmbioncsuedubioedithtml BioEdit a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windons 9598NT HANLIN R T MENEZES M Gecircneros ilustrados de ascomicetos UFRPE Recife-PE 1996 274p HERBERT J A GRECH NM A strain of Guignardia citricarpa the citrus black spot pathogen resistent to benomyl in South Africa Plant Disease St Paul v 69 p 1007 1985 HUANG Y WANG J LI G ZHENG Z SU W Antitumor and antifungal activities in endophytic fungi isolated from pharmaceutical plants taxus mairei Cephalataxus fortunei and Torreya grandis FEMS Immunology and Medical Microbiology v31 n47 p163-167 2001 IBRAHIM G BAYCA B Fungal bacterial and nematological problems of citrus grape and stone fruits in Arab countries Arab Journal of Plant Protection Beirut v7 n2 p190-197 1989 ITOKAWA H SHIROTA O IKUTA H MORITA H TAKEYA K IITAKA Y Triterpenes fom Maytenus ilicifolia Phytochemistry v 30 n 11 p 3713-37161991 ITOKAWA H SHIROTA O IKUTA H MORITA H TAKEYA K IITAKA Y Oligo-nicotinated sesquiterpene polyesters from Maytenus ilicifolia Journal of natural Prodcts v 56 p 1479-14851993 JASALAVICH C OSTROFSKY A JELLISON J Detection and identification of decay fungi in spruce wood by restriction fragment length polymorphism analisis of amplified genes encoding rRNA Applied and Environmental Microbiology Washington v66 n11 p 4725-4734 2000 JOHNSTON P R FULLERTON R A Cryptosporiopsis citri sp Nov cause of a citrus leal spot in the Pacific Islands New Zealand Journal of Experimental Agriculture Wellington v16 p159-163 1988 JORGE R M LEITE J P V OLIVEIRA A B TAGLIATI C A Evaluation of antinociceptive anti-inflammatory and antiulcerogenic activities of Maytenus ilicifolia Journal Ethnopharmacol v 94 n1 p 93-100 2004 KIM K H TEN L N LIU Q M IM W T LEE S T Sphingobacterium daejeonense sp nov isolated from a compost sample International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2031-2036 2006
114
KIM B Y WEON H Y LEE K H SEOK S J KWON S W GO S J STACKEBRANDT E Dyella yeojuensis sp nov isolated from greenhouse soil in Korea International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2079-2082 2006 LEE Y H SNOW J P Phenotypic and genetic variations in Diaporte phaseolorum var caulivora the soybean stem canker pathogen Phytopathology v 81 p1205 1992 LEITE J P V RASTRELLI L ROMUSSI G OLIVEIRA A B VILEGAS J H Y VILEGAS W PIZZA C Isolation and HPLC quantitative analysis of flavonoid glycosides from razilian evera es (Maytenus ilici olia and M aqui olium) Journal of Agricultural and Food Chemistry v 49 p 3796-3801 2001 LEONIAN L H A study of the factors promoting pycnidium ndash formation in some Sphaeropsidales American Journal Botanic Columbus v11 p 19-50 1924 LEUCHTMANN A PETRINI O PETRINI LE CARROLL GC Isozyme polymorphism in six endophytic Phyllosticta species Mycological Research Cambridge v96 n 4 p 287-294 1992 LI J Y STROBEL G A Jesterone and hydroxy-jesterone antioomycete cyclohexenone epoxides from the endophytic fungus Pestalotiopsis jesteri Phytochemistry v 57 p 261-265 2001 LIMA O G de COELHO J S de B WEIGERT E DrsquoALBUQUERQUE I L LIMA D de A SOUZA M A de M Substacircncias antimicrobianas de plantas superiores ndash Sobre a presenccedila de maitenina e pristimerina na parte cortical das raiacutezes de Maytenus ilicifolia procedente do Brasil Meridional Revista do Instituto de Antibioacuteticos v 11 n 1 p 35-38 1971 LIU C H ZOU W X LU H TAN R X Antifungal activity of Artemisia annuaendophyte cultures against phytopathogenic fungi Journal of Biotechnology v88 p 277-282 2001 LU H ZOU W X MENG J C HU J TAN R X New bioactive metabolites produced by Colletotrichum sp an endophytic fungus in Artemisia annua Plant Science Oxford v 151 n 1 p 67-73 2000 LU G Z CANNON P F REID A SIMMONS C M Diversity and molecular relationships of endophytic Colletotrichum isolates from the Iwokrama Forest Reserve Guyana Mycological Research v 108 n 1 p 53-63 2004 MAKI C S Diversidade e Potencial Biotecnoloacutegico de Fungos Endofiacuteticos de Cacau Theobroma cacao L Piracicaba 2006 Dissertaccedilatildeo de Doutorado ndash Setor de Agronomia- Geneacutetica e Melhoramento de Plantas Universidade Escola Superior de
115
Agricultura Luiz de Queiroz MANULIS S KOGAN N REUVEN M BEN-YEPHET Y Use of the RAPD technique for identification of Fusarium oxysporum f sp dianthi from carnation Phytopathology v84 p98-101 1993 MARTINS-CORDER M P MELO I S ANTAGONISMO IN VITRO DE Trichoderma spp A Verticillium dahliae KLEB Scientia Agriacutecola v 55 n1 p1-7 1998 MARIANO R L R Meacutetodos de seleccedilatildeo in vitro para o controle microbioloacutegico de patoacutegenos de plantas Revisatildeo Anual de Patologia de Plantas v I p 369-409 1993 McMILLAN JR RT Guignardia citricarpa a cause of black spot on mango foliage in Florida Journal of Phytopathology Berlin v117 p 260-264 1986 McPHERSON M J QUIRKE P TAYLOR G R PCR 1 A pratical approach IRL New York v1 348p 1991 McONIE K C The latent occurrence in citrus and other hosts of a Guignardia easily confused with G citricarpa the citrus black spot pathogen Phytopathology St Paul v 54 p 40-43 1964a McONIE K C Source of inoculum of Guignardia citricarpa the citrus black spot pathogen Phytopathology St Paul v 54 p 64-67 1964b MEIJER G MEGNEGNEAU G LINDERS E G Avariability for isozyme vegetative compatibility and RAPD markers in natural populations of Phomopsis subordinaria Mycological Research v98 n3 p267-276 1994 MEIRA PENNA Dicionaacuterio Brasileiro de Plantas Medicinais 3a Ed Editora Kosmos Rio de Janeiro 1946 MELO I S Agentes microbianos de controle de fungos fitopatogecircnicos In Controle bioloacutegico v I MELO I S e AZEVEDO J L (Eds) Jaguariuacutena SP Embrapa-CNPMA 1998 264p MICHELMORE R W HULBERT S H Molecular markers for genetic analysis of phytopathogenic fungi Annual Review of Phytopathology Palo Alto v 25 p 383-404 1987 MOLLER C WEBER G DREYFUSS M M Intraespecific diversity in the fungal species Chaunopycnis alba implications fo microbial screening programs Journal of industrial microbiology v 17 p 359-372 1996
116
MONTANARI T CARVALHO J E de DOLDER H Effect of Maytenus ilicifolia Martex Reiss on spermatogenesis Contraception v 57 p 335-3391998 MONTANARI T BEVILACQUIA E Effect of Maytenus ilicifolia Mart On pregnant mice Contraception v 65 p 171-1752002 MOSTERT L CROUS P W KANG J PHILLIPS A J L Species of Phomopsis and a Libertella sp occurring on grapevines with specific reference to South Africa morphological cultural molecular and pathological characterization Mycologia v 93 n 1 p 146-167 2001 MULLIS K B F A FALOONA Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction Methods Enzymol v 155 p 335-350 1987 MURALI T S SURYNARAYANAN T S GEETA R Endophytic Phomopsis species Host range and implications for diversity estimates NRC Research Press Canadaacute 2006 NEDASHKOVSKAYA O I VANCANNEYT M KALINOSKAYA N I MIKHAILOV V V SWINGS J Aquimarina intermedia sp nov reclassification of Stanierella latercula (Lewin 1969) as Aquimarina latercula comb nov and Gaetbulimicrobium brevivitae International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2037-2041 2006 NETO P A S AZEVEDO J L ARAUacuteJO W L Microrganismos Endofiacuteticos Interaccedilatildeo com Plantas e Potencial Biotecnoloacutegico Revista Biotecnologia v5 n29 2002 OrsquoDONNELL K GRAY L E Phylogenetc relationships of the soyobean sudden death syndrome pathogen Fusarium solani f sp phaseoli inferred from rDNA sequence data and PCR primers for its identification Molecular Plant Microbe Interact v 8 p 709-716 1995 OKANE I NAKAGIRI A ITO T Endophytic fun i in leaves of ericaceous plants Canadian Journal of Botany v 76 p 657-663 1998 OULLET T SEIFFERT K A Genetic characterization of Fusarium graminearum strains using RAPD e PCR amplification Phytopathology v 83 p 1003-1007 1993 PAAVANEM-HUHTALA S AVIKAINEM H YLI-MATTILA T Development of strain-specific primers for a strain of Gliocladium catenulatum used in bioological control European Journal Plant Pathological Dordrecht v106 n2 p187-198 2000 PANIZZA S Plantas que Curam (Cheiro de Mato) 15deg ed Satildeo Paulo IBRASA 1998 265 p PATEL B N PATEL R C TILVA D G Phyllosticta leaf spot a new disease in Bidi
117
tobacco nursey Tobacco Research Rajahmundry v14 p 1176-1178 1988 PATERSON R R M BRIDGE P D Biochemical techniques for filamentous fungi CAB International 125 p 1994 PARMETER J R An effect of substrate on spore form in Phomopsis Phytopatholog v 48 p 396-397 1958 PENNA E B da S Microrganismos endofiacuteticos de erva-mate (Ilex paraguariensis STHIL) e variabilidade geneacutetica em Phyllosticta sp por RAPD Curitiba 2000 123 f Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Universidade Federal do Paranaacute PETRINI O Taxonomy of endophytic fungi of arial plant tissues In FOKKEMA N J HEUVEL JVAN DEN (Ed) Microbiology of the Phyllosphere Cambrige University Press p 175-87 1986 PETRINI O Fungal endophytes of tree leaves In ANDREWS J H HIRANO S S (Eds) Microbial Ecology of Leaves New York Sprin er-Verla 1991 p 179-197 PETRINI O STONE K CARROLL F E Endophytic fungi in evergreen shrubs in western Oregon a preliminary study Canadian Journal of Botany v 60 p 789-796 1982 PHILLIPS A J L The plant pathogenic genus Phomopsis and its teleomorph (Diaporthe) Development and application of morphological biological and phylogenetic species concepts Disponiacutevel em lthttpwwwcremfctunlptbotryosphaeria_sitepersonal_web_pagehtmgt Acesso em Dezembro de 2006 PILEGGI S A V Isolamento e Caracterizaccedilatildeo de Microrganismos Endofiacuteticosde Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss por Meio de Marcadores RAPD eseu Potencial Farmacoloacutegico Curitiba 2006 Dissertaccedilatildeo de Doutorado - Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade Federal do Paranaacute PIOLI R N MORANDI E N MARTIacuteNEZ M C LUCCA F TOZZINI BISARO V HOPP H E Morphologic molecular and pathogenic characterization of diaporthe phaseolorum variability in the core soybean ndash Producing Aacuterea of Argentina Phytopathology v 93 n2 p136-146 2003 PONTECORVO G ROPER J A HEMMOS LM MAC DONALD K D BUFTON A W J The genetics of Aspergillus nidulans Advances in Genetics v 5 p141-238 1953 PONS N Estudio taxonomico de especies de Phoma y Phyllosticta sobre cantildea de azucar (Saccharum sp) Fitopatologia Venezolana Maracay v 3 p 34-43 1990
118
PROMPUTTHA I JEEWON R LUMYONG S MCKENZIE E H C HYDE K D Ribosomal DNA fingerprinting in the identification of non sporulating endophytes from Magnolia liliifera (Magnoliaceae) Fungal Diversity v 20 p 167-186 2005 QUIROGA E N SAMPIETRO A R VATTUONE M Screening antifungal activitis of selected medicinal plants Journal of Ethnopharmacology v 74 p 89-96 2001 RAEDER U BRODA P Rapid preparation of DNA from filamentous fungi Letters in Applied Microbiology Oxford v1 p17-20 1985 REHNER S A UECKER F A Nuclear ribosomal internal transcribed spacer phylogeny and host diversity in the coelomycete Phomopsis Canadian Journal of Botanic v 72 p1666-1674 1994 RIBEIRO L A de Variabilidade Geneacutetica por RAPD em fungos endoacutefitos de Gecircnero Penicillium provenientes de Zea mays L Curitiba 1995 90 f Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Universidade Federal do Paranaacute RIEDL H WECHTL E Proposal to conserve the name Phomopsis (Sacc) Bubak (1905) against Myxolibertella Hohnel (1903) Taxon v 30 n 4 p 826-828 1981 ROBES C F A mancha preta dos fungos ciacutetricos (Phyllosticta citricarpa) ameaccedila a citricultura paulista Laranja Cordeiroacutepolis v 11 p 75-86 1990 ROBES C F BITTENCUCOURT S M A mancha preta dos frutos um dos fatores limitantes agrave produccedilatildeo citricola do estado do Rio de Janeiro Comunicado Teacutecnico ndash CTAA-EMBRAPA n 19 p 1-5 1995 RODRIGUES K F SAMULES G J Fungal endophytes of Spondias mombin in Brazil a preliminary study Journal of Basic Microbiology v 39 p 131 ndash 135 1999 RODRIGUES KF HESSE M WERNER C Antimicrobial activities of secondary metabolites produced by endophytic fungi from Spondias mombin Journal of Basic Microbiology v 40 n 4 p 261-267 2000 RODRIGUES-HEERKLOTZ KF DRANDAROV K HEERKLOTZ J HESSE M WERNER C Guignardia Acid a Novel Type of Secondary Metabolite Produced by the Endophytic fungus Guignardia sp Isolation Structure Elucidation and Asymmetric Synthesis Helvetica Chimica Acta v 84 p 3766-3772 2001 RODRIGUES K F SIEBER T N GRUumlNIG R C HOLDENRIEDER O Characterization of Guignardia mangiferae isolated from tropical plants based on morphology ISSR-PCR amplifications and ITS1-58S-ITS2 sequences Mycological
119
Research Cambridge v 108 p 45-52 2004 RODRIGUES K F COSTA G L CARVALHO M P EPIFANIO R A Evaluation of extracts produced by some tropical fungi as potential cholinesterase inhibitors Journal of Microbiology and Biotechnology v21 p1617-1621 2005 RODRIGUES M B C Controle de Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta dos Citros Piracicaba 2006 67 p Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo ROHLF F J NTSYS-PC Numerical taxonomy and multivariate analysis system New York Exeter Publishing 1988 RUBINI M R SILVA-RIBEIRO R T POMELLA A W V MAKI C S ARAUacuteJO W L SANTOS D R AZEVEDO J L Diversity of endophytic fungal community of cacao (Theobroma cacao L) and biological control of Crinipellis perniciosa causal agent of Witches Broom Disease International journal of Biological Sciences v 1 n 1 p 24-33 2005 SAIKI R K SCHARF S J FALOONA F MULLIS K B HORN G T ERLICH H A ARNHEIM N Enzymatic amplification of β-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia Science v 230 p1350-1354 1985 SAMPAIO J P FELL J W GADANHO M BAUER R Kurtzmanomyces insolitus sp nov a new anamorphic heterobasidiomycetous yeast species Systematic and Applied Micorbiology v 22 p 619-625 1999 SAMUELES G J SEIFERT K A The impact of molecularcharacters on systematics of filamentous ascomycetes Annual Review of Phytopathogy Palo Alto v 33 p 37-67 1995 SANGER F NICKLEN S COULSON A R DNA Sequencing with chain terminating inhibitors Proceedings of the National Academy of Sciences of the United states of America Washington v 74 p 5463-5467 1977 SANTOS MF Anaacutelise da micoflora associada ao baru (Dipteryx alata Vog) e a caroba (Cybistax antisyphilitica (Mart) Mart) BrasiacuteliaDF 1996 Dissertaccedilatildeo de Mestrado Universidade Nacional de Brasiacutelia SATOKO K MINAKA N KOBAYASHI T KUDO A OHTSU Y Molecular Phylogenetic Analysis of Ribosomal DNA Internal Transcribed Spacer Regions and Comparison of Fertility in Phomopsis Isolates from Fruit Trees Plant Pathology v 66 p 191-210 2000
120
SCHULZ B BOYLE C DRAEGER S ROumlMMERT A KROHN K Endophytic fungi a source of novel biologically active secondary metabolites Mycological Research Cambridge v 106 p 996-1004 2002 SCHULZ B BOYLE C The endophytic continuum Mycological Research Cambridge v 109 p 661-686 2005 SETTE L D PASSARINI M R Z DELARMELINA C SALATI F DUARTE M C T Molecular characterization and antimicrobial activity of endophytic fungi from coffee plants World Journal of Microbiology and Biotechnology v 22 p 1185-1195 2006 SHIROTA O MORITA H TAKEYA K ITOKAWA H ITAKA YCytotoxic aromatic triterpenes from Maytenus ilicifolia and Maytenus chuchuhuasca Journal of Natural Products v 57 p 1675-1681 1994 SHIVAS R G ALLEN J G WILLIAMSON P M Infraspecific variation demonstrated in Phomopsis leptostromiformis using cultural and biochemical techniques Mycological Research Cambridge v 95 p 320-323 1991 SHRESTHA K STROBEL G A PRAKASH S GEWALI M Evidence for paclitaxel from three new endophytic fungi of Himalayan yew of Nepal Planta Medicinal v 67 p 374-376 2001 SILVA C G RECIO R A OLIVEIRA A B de PAIVA R L R Coleta e avaliaccedilatildeo da qualidade fitoquiacutemica de Maytenus ilicifolia M (espinheira-santa) Tribuna Farmacecircutica v 5759 p 46-50 1991 SILVA F A S The ASSISTAT Software statistical assistance In INTERNATIONAL CONFERENCE ON COMPUTERS IN AGRICULTURE 6 Anais Cancun American Society of Agricultural Engineers p 294-298 1996 SILVA F de A S AZEVEDO C A V de Versatildeo do programa computacional Assistat para o sistema operacional Windows Revista Brasileira de Produtos Agroindustriais Campina Grande v 4n 1 p 71-78 2002 SILVA G H TELES H L TREVISAN H C BOLZANI V S YOUNG M C M PFENNING L H EBERLIN M N HADDAD R COSTA-NETO C M ARAUacuteJO A R New Bioactive Metabolites Produced by Phomopsis cassiae an Endophytic Fungus in Cassia spectabilis Journal Brasileiro Chemical Society v16 n6 p 1463-1466 2005 SILVA R L DE O LUZ J S SILVEIRA E B CAVALCANTE T Fungos endofiacuteticos em Annona spp isolamento caracterizaccedilatildeo enzimaacutetica e promoccedilatildeo do crescimento em mudas de pinha (Annona squamosa L) Acta Botanica Brasilica v
121
20 n 3 p 649-655 2006 SILVEIRA EB 2001 Bacteacuterias promotoras de crescimento de plantas e biocontrole de doenccedilas Pp 71-100 In R Barros e SJ Michereff Proteccedilatildeo de plantas na agricultura sustentaacutevel Recife Imprensa Universitaacuteria da UFRPE SIMOtildeES C M O MENTZ L A SCHENKEL E P IRGANG B E STEHMANN J R Plantas da medicina popular no Rio Grande do Sul Porto Alegre Editora da UniversidadeUFRGS 174p 1986 SIVANESAN A The bitunicate ascomycetes and their anamorphs J Cramer Germany 701p 1984 SNEATH P H A SOKAL R R Numerical Taxonomy W H freeman Co San Francisco 1973 SOUZA FORMIGONI M L OLIVEIRA M G MONTEIRO M G DA SILVEIRA FILHO N G BRAZ S CARLINI E A Antiulcerogenic effects of two Maytenus species in laboratory animals Journal of Ethnopharmacology v 34 n 1 p 21-27 1991 SOUZA A Q L SOUZA A D L SPARTACO A F PINHEIRO M L B SARQUIS M I M PEREIRA J O Atividade antimicrobiana de fungos endofiacuteticos isolados de plantas toacutexicas da Amazocircnia Palicourea longiflora (aubl) rich e Strychnos cogens bentham Acta Amazocircnica v 34 n 2 p 185-195 Manaus 2004 SPOacuteSITO MB AMORIM L BASSANEZI RB BERGAMIN FILHO A HAU B Spatial pattern of black spot incidence within citrus trees related to disease severity and pathogen dispersal Plant Pathology p 103-108 2008 STAMFORD T L M ARAUacuteJO J M STAMFORD N P Atividade enzimaacutetica de microrganismos isolados do Jacatupeacute (Pachyrhizus erosus L Urban) Ciecircncia Tecnoloacutegica de Alimentos v 18 p 382-385 1998 STIERLE A STROBEL G STIERLE D GROTHAUS P BIGNAMI G The search for a taxol-producin microor anism amon the endophytic fun i of the Pacific yew Taxus bre i olia Journal of Natural Products v 58 n 9 p 1315-1324 1995 STINSON M ERZA D HESS W M SEARS J STROBEL G An endophytic Gliocladium sp Of Eucryphia cordifolia producing selective volatile antimicrobial compounds Plant Science St Paul v165 p 913-922 2003 STROBEL A G Rainforest Endophytes and Bioactive Products Critical Reviews in Biotechnology Boca Raton v 22 n 4 p 315-333 2002
122
STROBEL G A Endophytes as sources of bioactive products Microbes and Infection v 5 p 535-544 2003 STROBEL G DAISY B Bioprospecting for Microbial Endophytes and their Natural Products Microbiology and Molecular Biology Reviews v 67 n 4 p 491-502 2003 SUGHA SK SINGH BM SHARMA BM Studies on Phyllosticta glumarum causing glume blight of rice (Oryza sativa L) Himachal Journal of Agricultural Research Palampur v 12 n 1 p 11-14 1986 TAYLOR-ROSA S G BARROS I BCaracterizaccedilatildeo das sementes de Maytenus ilicifolia Mart Ex Reiss espinheira - santa e viabilidade de sua propagaccedilatildeo sexuada Porto Alegre 1994106f Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Universidade Federal do Rio Grande do Sul THOMPSON J D HIGGINS D G GIBSON T J Clustal W Improving the sensitiviy of rogressive multiple alignment through sequence weighting positions-specific gap penalties and weight matrix choice Nucleic Acids Research v 22 p 4673-4680 1994 TIMNICK MB LILLY VG BARNETT HL Factors affeting sporulation of Diaporthe phaseolorum var batatatis from soybean Phytopathology St Paul v 41 n 4 p 327-336 1951 UECKER F A A World list of Phomopsis names with notes on nomenclature morphology and biology National Fungus Collection v 13 1988 VAN DER AA H A Studies in Phyllosticta I Studies in Mycology n 5 1973 VAN DER AA H A M E Noordeloos and J de Gruy-ter Species concepts in some larger genera of the Coelomycetes Studies in Mycology v 32 p 3-19 1990 VASCONCELOS MJV ALMEIDA MA HENNING AMR BARROS AA MOREIRA EG Differentiation of Colletotrichum truncatum isolates by random amplified polymorphic DNA Fitopatologia Brasileira Brasiacutelia v 19 p 520-523 1994 VELICHETI R K McCCLARY C LAMISON R D SINCLAIR J B Immunodetection of the Diaporthe and Phomopsis complex of soybeans Phytopathology v 81 p 1212 1991 VIDIC M Variability in Diaporthe phaseolorum var caulivora on soybean in the Vojvodina Providence in Serbia Zastita Bilja v 42 p 183-189 1991
123
VILARINHOS A D PAULA JR T J BARROS E G MOUREIRA M A Characterization of races of Colletotrichum lindemutianum by the random amplified polymorfic DNA technique Fitopatologia Brasileira Brasiacutelia v20 p194-198 1995 VILLA- CARVAJAL M COQUE J J R ALVAREacuteZ-RODRIGUEacuteZ M L URUBURU F BELLOCH C Polyphasic identication of yeasts isolated from bark of cork oak during the manufacturing process of cork stoppers FEMS Yeast Research v 4 p 745-750 2004 VIRET O PETRINI O Colonization of eech leaves (Fagus syl atica) by the endophyte Discula umbrinella (teleomorph Apiognomonia errabunda) Mycological Research v 98 p 423-432 1994 WAGENAAR M CORWIN J STROBEL G A CLARDY J Three new chytochalasins produced by an endophytic fungus in the genus Rhinocladiella Journal Natural Products v 63 p1692-1695 2000 WALKER M R RAPLEY R Guia de rotas na tecnologia do gene Atheneu Satildeo Paulo 1999 334p WANG J Li G LU H ZHENG Z HUANGY SU W Taxol from Tubercularia sp strain TF5 an endophytic fungus of Taxus mairei FEMS Microbiology Letters v 193 p 249-253 2000 WATSON J D GILMAN M WITKOSWSKI J ZOLLER M Recombinant DNA 2 ed New York Freeman and Company 1992 WELSH J McCLELLAND M Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers Nucleic Acid Research Oxford v 18 p 7213-7218 1990 WHITE Jr J MORROW A C Endophyte-host associations in forage grasses XII A fungal endophyte to Trichachne insularis belonging to Psedocercosporella Mycologia Lawrence v 78 n 5 p 846-850 1989 WHITE Jr J F MORROW A C Endophyte-host associations in forage grasses XII A fungal endophyte of Trichachne insularis belonging to Pseudocercosporella Mycologia Lawrence v 82 p 218-226 1990 WHITE Jr J F MORGAN-JONES G MORROW AC Taxonomy life cycle reprodution and detection of Acremonium endophytes Agriculture Ecosystem amp Environment v 44 p13-37 1993 WILLIAMS J G K KUBELIK A R LIVAK K J RAFALSKI J A TINGER S V DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers Nucleic Acids Research v 18 n 22 p 6531-6535 1990
124
WILLIAMS J G K HANAFEY M K RAFALSKI J A TINGEY S V Genetic analysis using random amplifield polymorphic DNA markers Methods in Enzymology San Diego v 218 p 704-740 1993 ZHANG A W RICCIONI L PEDERSENW L KOLLIPARA K P HARTMAN G L Molecular identi-fication and phylogenetic grouping of Diaporthe phaseolorum and Phomopsis longicolla isolates from soybean Phytopathology v 88 p1306 -1314 1998 ZOU W X MENG J C LU H CHEN G X SHI G X ZHANG T Y TAN R X Meta olites of Colletotrichum gloeosporioides an endophytic fun us in Artemisia mongolica Journal of Natural Products v 63 n 11 p 1529-1530 2000 ZOU W X TAN R X Endophytes a rich source of functional metabolites Natural Product Reports v18 p 448-459 2001
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ANEXOS
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 496671024 9933420 94396 MEIOS DE CULTURA 2 137912854 68956427 655287 INTERACcedilAtildeO A 100 193198257 1931983 18359 INTERACcedilAtildeO b 100 10989107 0109891 1044 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
INTERACcedilAtildeO A INTERACcedilAtildeO ENTRE OS MEIOS DE CULTURA E OS ISOLADOS de Phomopsis INTERACcedilAtildeO B INTERACcedilAtildeO ENTRE AS REPETICcedilOtildeES DOS ISOLADOS DE Phomopsis significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS ENTRE OS MEIOS DE CULTURA
BDA 5169935 a MEA 4973856 b AV 3921569 c
CV = 62
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 1 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM DIFERENTES MEIOS DE CULTURA
126
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 230248366 4604967 43761 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS ESBA1 700 a A323 700 a A215A 700 a ESSD1 700 a SM9713 700 a ESGF1 700 a SM9631 700 a ESJD1 700 a ESKD1 667 a A334 667 a ESDF1 633 b A132 633 b A123 600 b A333A 600 b MU0123 600 b ESJH1 600 b A321 600 b ESRD1 600 b A116 600 b A134 567 b A115B 567 b ESIA1 533 c
ANEXO 2ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO BDA
127
A131 500 c SM9714 500 c A135 500 c ESIE1 500 c ESFB2 500 c A124 500 c ESPAC22 500 c ES2KF1 500 c A113 500 c ESJE1 500 c ESJE2 433 d ESFH1 400 d ESJG1 400 d ES2WC1 400 d PHO1 400 d SM9638 400 d ES2NA1 400 d ES2AB1 400 d ESFF1 400 d AT9811 400 d AT9810 400 d ES2WF1 400 d A126 400 d PHO19 400 d A216B 400 d ES80J 367 d ESGA1 367 d AT9906 300 e A333B 233 f
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
128
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 189058824 3781176 35932 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS ESKD1 700 a ESJE2 600 b A123 600 b ESJE1 533 c SM9638 500 c AT9811 500 c SM9713 500 c PHO1 500 c ESBA1 500 c SM9631 500 c ESFB2 500 c A334 500 c A323 500 c MU0123 500 c A333A 433 d ESJD1 433 d ESGF1 433 d A116 433 d PAC22 400 e ESDF1 400 e A321 400 e A132 400 e ES2KF1 400 e
ANEXO 3ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO AVEIA
129
ESJG1 400 e ESRD1 400 e PHO19 400 e A115B 400 e A124 400 e ESFF1 367 e A134 367 e ESIE1 367 e A135 367 e A131 367 e A113 367 e ES2WF1 367 e SD1 367 e ESIA1 333 e ESGA1 300 f ESJH1 300 f ESFH1 300 f AT9906 300 f ES2NA1 300 f A216B 300 f ES80J 300 f ESA215A 267 f AT9810 200 g A333B 200 g ES2AB1 200 g SM9714 200 g ES2WC1 200 g
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
130
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 270562092 5411242 51423 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS A323 733 a SM9631 700 a ESKD1 700 a A134 700 a ESIE1 700 a A116 667 b A334 667 b A215A 633 b ESSD1 633 b A321 600 c MU0123 600 c ESGF1 600 c ESRD1 600 c AT9811 600 c SM9713 600 c A123 600 c ESJH1 600 c ESDF1 600 c A131 567 c IA1 567 c ESBA1 567 c ESJD1 567 c A333A 533 d A135 500 d
ANEXO 4ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO MEA
131
ES2NA1 500 d A124 500 d A132 500 d SM9714 500 d ESFB2 500 d A115B 467 e ES2AB1 433 e A216B 433 e A113 433 e PHO1 400 f SM9638 400 f ES2WF1 400 f A126 400 f ESJE1 400 f ESPAC22 400 f ESFF1 400 f ES2KF1 400 f ESJG1 367 f ES80J 367 f ESJE2 333 g ESFH1 333 g AT9906 300 g ESGA1 300 g SM9810 300 g ES2WC1 300 g A333B 233 h PHO19 233 h
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
132
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 46 1602192500 34089202 1617590 RESIacuteDUO 432 91040000 210741 Total 478 1693232500
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO AT9906 352 a AT9810 353 a ESFH1 297 b ESPAC22 195 c ES2KF1 194 c SM9631 193 c ESGA1 184 cd PHO19 184 cd ES80J 166 de ESRD1 152 ef ESFB2 143 efg ESJE2 142 efg ESJE1 142 efg ESJG1 131 fgh A323 127 fghi A333A 126 ghij A135 123 ghij A124 123 ghij A126 123 ghij A132 123 ghij A131 123 ghij A134 123 ghij
ANEXO 5 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO DOS ESPOROS BETACONIacuteDIOSDOS ISOLADOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA
133
A115B 123 ghij ESIE1 123 ghij ES2WC1 119 ghil ES2WF1 119 ghil SM9713 116 hil A334 116 hil ESIA1 115 hil A333B 113 hil ESFF1 113 hil ESGF1 111 hil ES2AB1 107 him A123 107 him A113 107 him ESJD1 106 him ESKD1 105 im ES2NA1 104 im A215A 103 im SM9714 102 im ESSD1 101 m ESJH1 97 m MU0123 96 m A321 96 m ESDF1 95 m A216B 95 m A116 85 m
DMS = 259444 CV = 1052904
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
134
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 21 2674219 127344 459861 RESIacuteDUO 88 243688 002769 Total 109 2917907
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 293 a Fungicida Derosal 236 b ESGF1 157 c ESGA1 137 cde ESFH1 134 cdef ESIA1 120 cdefg ES2KF1 119 cdefgh ESFF1 146 cdefgh ES2NA1 111 defgh ES2AB1 110 defgh ESKD1 114 defgh ESJE2 110 defgh ESBA1 112 defgh ESRD1 098 efgh ESJG1 099 efgh ESJE1 099 efgh ESFB2 096 fgh ESJH1 094 gh ESJD1 093 gh ESIE1 095 gh ESSD1 078 h ESDF1 078 h
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 6 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
DMS = 039023 CV = 1340825
135
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 9 974154 108239 225325 RESIacuteDUO 40 192148 004804 Total 49 1166302
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 201 a
fungicida 174 ab AT9906 139 bc AT9810 117 cd AT9811 102 cde SM9638 110 cde SM9714 076 de SM9631 075 de MU0123 067 e SM9713 065 e
DMS = 046460 CV = 1946824
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 7 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
136
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 22 2382133 108279 239352 RESIacuteDUO 92 416192 004524 Total 114 2798325
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 244 a ES2WC1 237 a fungicida 185 b ES80J 138 bc A333B 136 cd ES2WF1 117 cde A333A 113 cde A132 110 cde A215A 106 cde A116 102 cde A124 101 cde A115B 101 cde A135 100 cde A215B 097 cde A321 094 cde A334 093 cde A323 092 cde A123 091 cde A113 091 cde A126 089 de A131 088 e ESPAC22 085 e A134 076 e
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 8 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
DMS = 050157 CV = 1809416
137
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA
FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 6210037 124201 165056 RESIacuteDUO 204 1535052 007525 Total 254 7745089
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 302 a FUNGICIDA Derosal 244 abc ES2WC1 277 ab AT9906 224 bcd AT9810 222 bcde SM9638 218 bcdef ESGF1 201 cdefg A333B 188 cdefgh A132 167 defghi SM9714 159 defghij ESFF1 153 efghil ES2WF1 150 fghil ESGA1 149 fghil ESFH1 147 ghil ES80J 147 ghil MU0123 144 ghil ES2NA1 143 ghil AT9713 142 ghim A321 141 ghim A216B 140 ghim AT9811 139 ghim A116 137 ghim
ANEXO 9 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305
138
ESBA1 134 ghim ES2AB1 133 ghim A323 132 ghin ESJG1 131 ghin ESIE1 130 hin A333A 129 hin A113 127 hin A134 125 hin ESSD1 122 hin ESKD1 121 hin ESIA1 117 in A124 113 in A334 112 in ES2KF1 112 in ESJE1 110 in ESPAC22 108 in A131 108 in A126 106 in A135 102 in ESRD1 094 n SM9631 093 n ESJE2 090 n ESJH1 090 n ESFB2 088 n ESJD1 087 n A123 087 n ESDF1 086 n A115B 072 n A215A 062 n
DMS = 070465 CV = 1983267
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
139
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 28 2145366 076620 407144 RESIacuteDUO 116 218300 001882 Total 144 2363666
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 222 a ESRD1 19 b A131 176 b ESIA1 178 b SM9713 162 bc ESJD1 162 bc A126 154 bcd MU0123 149 bcde A333A 134 cdef ESGA1 134 cdef A113 133 cdef ESGF1 130 cdef A334 130 cdef ESBA1 140 cdef SM9638 127 def ESJH1 119 efg ESDF1 115 fgh ESSD1 112 fgh ESKD1 113 fgh ES2AB1 111 fghi A124 111 fghi
ANEXO 10 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 PARA DETECCcedilAtildeODE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
140
A215A 109 fghi A321 108 fghi A134 089 ghij A115B 082 hij ESFF1 078 ij ESFH1 071 l A123 062 l ES2WF1 042 l
DMS = 033193 CV = 1095343
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
141
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA
FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 28 11264938 402319 481124 RESIacuteDUO 116 970000 008362 Total 144 12234938
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 422 a ESGA1 275 b ESGF1 267 bc ESBA1 265 bc SM9713 261 bc A333A 251 bcd ESSD1 235 bcde MU0123 234 bcde ESKD1 211 bcdef A215A 203 cdef A321 188 defg A131 173 efgh SM9638 167 efgh A124 148 fghi ESJD1 147 fghi A113 130 ghij ESIA1 122 ghij ES2AB1 128 ghij ESDF1 124 ghij A334 112 hij A115B 106 hij
ANEXO 11 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 PARA DETECCcedilAtildeODE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
142
ESRD1 104 hij ES2WF1 086 il A134 083 il A126 080 il ESFF1 075 l A123 065 l ESFH1 025 l ESJH1 017 l
DMS = 069970 CV = 1193907
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
43
ANE
XO
12
ndash M
ATR
IZ D
E D
AD
OS
PA
RA
CA
RA
CTE
RIZ
ACcedil
AtildeO
CR
ITEacuteR
IOS
ME
DID
AS
ME
IOS
DE
C
ULT
UR
A
MU
0123
SM
9631
SM
9638
SM
9713
SM
9714
AT9
810
AT9
811
AT9
906
ES
2AB
1
ES
2KF1
ES2N
A1
ES2W
C1
ES2W
F1
ES
80J
ESBA
1
ESD
F1
ES
FB2
ES
FF1
ESFH
1
ES
GA
1
ESG
F1
ESIA
1
ESIE
1
ESJD
1
ESJE
1
ESJE
2
1 AV 1 0 1 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 MEA 0 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 BDA 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 1 1 0
2 AV 1 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1 1 1 3 AV 0 0 0 0 1 0 0 1 1 1 0 1 0 0 0 1 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 4 AV 1 0 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
MEA 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
5 AV 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
6 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0 BDA 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1
7 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 BDA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0
8 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 0 0 0
9 AV 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 1 BDA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1
10 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 MEA 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1
11 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
12 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
13 AV 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 MEA 0 0 1 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 1 0 1 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0
14 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 1 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 0
44
BDA 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 15 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0
16 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 0
17 AV 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 1 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0
18 AV 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 MEA 0 1 0 0 1 0 1 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 BDA 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1
19 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0
20 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21 AV 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 0 1 0 1 1 1 0 0 1 1 1 1
MEA 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 0 BDA 1 1 0 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0
22 AV 1 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
23 352 a 353μM BDA 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 297 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0
195 a 193 μM BDA 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 184 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 166 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 152 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
143 a 142 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 131 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 127 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
126 a 123 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 119 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
116 a 111 μM BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 107 a 106 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 105 a 102μM BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
97 a 85μM BDA 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24 733 a 700cm MEA 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0
677 a 633 cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 600 a 567 cm MEA 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 533 a 500cm MEA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
45
467 a 433cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 400 a 367cm MEA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 333 a 300cm MEA 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1
233cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 700 a 667cm BDA 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 633 a 567cm BDA 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 433 a 367cm BDA 0 0 1 0 0 1 1 0 1 0 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 1
300cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 233cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 700cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
600cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 533 a 500cm AV 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 433cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 400 a 333cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 300 a 267cm AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 200cm AV 0 0 0 0 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
CR
ITEacuteR
IOS
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DE
C
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A
ES
JG1
ES
JH2
ES
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1
ES
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C22
ES
RD
1
ES
SD
1
A131
A126
A123
A323
A113
A334
A321
A216
B
A135
A115
B
A124
A116
A215
A
A132
A333
A
A333
B
A134
P l
ongi
colla
PH
O19
1 AV 0 0 1 1 0 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 0 0 MEA 0 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 1 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 BDA 0 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 1 1 0 1 0 1 1 1 0 0 0 0 0
2 AV 0 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 3 AV 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 4 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1
MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 BDA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1
5 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0
6 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 0 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 0 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1
7 AV 1 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0
46
MEA 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 BDA 0 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0
8 AV 0 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 MEA 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1 BDA 0 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1
9 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 MEA 0 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0 BDA 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0
10 AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
11 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
12 MEA 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0
13 AV 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 0 1 1 1 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 1 1
14 AV 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 1 0 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 0 BDA 0 1 0 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0 1 0 1 0 1 0
15 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0
16 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
17 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 MEA 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 BDA 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0
18 AV 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 0 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0 1 1 BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
19 AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 BDA 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0
20 ESP 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 21 AV 1 1 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1
MEA 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1 0 1 1 0 0 1 BDA 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 0
22 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1
47
BDA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 23 352 a 353μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
297 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 195 a 193 μM BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
184 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 166 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 152 μM BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
143 a 142 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 131 μM BDA 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 127 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
126 a 123 μM BDA 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 1 1 0 1 0 0 119 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
116 a 111 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 107 a 106 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 105 a 102μM BDA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0
97 a 85μM BDA 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 24 733 a 700cm MEA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0
677 a 633 cm MEA 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 600 a 567 cm MEA 0 1 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 467 a 433cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 400 a 367cm MEA 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 333 a 300cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
233cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 700 a 667cm BDA 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 633 a 567cm BDA 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 1 1 0 1 0 0 533 a 500cm BDA 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 433 a 367cm BDA 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1
300cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 233cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 700cm AV 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
600cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 433cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 400 a 333cm AV 1 0 0 1 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 1 300 a 267cm AV 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 200cm AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0
Nota - Caracteriacutestica avaliada nos trecircs meios As caracteriacutesticas foram avaliadas seguindo os seguintes criteacuterios
48
1 Bordos da colocircnia regular (1) ou irregular (0) 2 Miceacutelio denso 3 Miceacutelio ralo 4 Miceacutelio granuloso aeacutereo 5 Miceacutelio algodonoso 6 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Branco 7 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Marrom 8 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Cinza 9 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Verde 10 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Amarelo 11 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Bege 12 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Preto 13 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Branco 14 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Marrom 15 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Preto 16 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Cinza 17 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Verde 18 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Amarelo 19 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Bege 20 Esporulaccedilatildeo com esporulaccedilatildeo (1) sem esporulaccedilatildeo (0) 21 Coniacutedio do tipo alfa 22 Coniacutedio do tipo beta 23 Comprimento dos coniacutedios do tipo beta 24 Diacircmetro meacutedio do crescimento das colocircnias
49 ANEXO 13 LOCAL DA COLETA DE FOLHAS DE Schinus terebinthifoliusCENTRO POLITEacuteCNICO ndash CURITIBAPR
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ldquoDe tudo ficaram trecircs coisas
A certeza de que estamos sempre comeccedilando
A certeza de que precisamos continuar
A certeza de que seremos interrompidos antes
de terminar
Portanto devemos
Fazer da interrupccedilatildeo um caminho novo
Da queda um passo de danccedila
Do medo uma escada
Do sonho uma ponte
Da procura um encontrordquo
(Fernando Pessoa)
RESUMO Phomopsis spp ENDOacuteFITOS DE PLANTAS MEDICINAIS DIVERSIDADE GENEacuteTICA E ANTAGONISMO AO FUNGO Guignardia citricarpa Autora Renata Rodrigues Gomes Orientadora Chirlei Glienke Microrganismos endofiacuteticos vivem no interior das plantas sem causar dano ao seu hospedeiro podendo produzir compostos biologicamente ativos antibioacuteticos fungicidas e herbicidas Essa comunidade endofiacutetica pode estar relacionada com a accedilatildeo antimicrobiana de plantas medicinais A planta Maytenus ilicifollia conhecida como espinheira-santa eacute uma planta medicinal muito utilizada no tratamento de uacutelceras gaacutestricas e tratamentos digestivos tiacutepica da Ameacuterica do Sul em especial da regiatildeo Sul do Brasil e atualmente encontra-se ameaccedilada de extinccedilatildeo As plantas medicinais Spondias mombin Myracrodruon urundeuva Schinus terebinthifolius e Aspidosperma tomentosun tecircm sido usadas na medicina devido as suas propriedades antimicrobianas No presente trabalho foram isolados fungos endofiacuteticos do gecircnero Phomopsis e avaliados quanto a sua variabilidade geneacutetica e estrutura populacional por meio de marcadores RAPD Observou-se que as plantas medicinais analisadas satildeo colonizadas por grande diversidade de espeacutecies de Phomopsis com grande variabilidade morfoloacutegica e geneacutetica intra e interespeciacuteficas Os isolados foram identificados por meio de sequumlecircncias das regiotildees ITS1 58S e ITS2 do DNA ribossomal e testados quanto ao potencial antimicrobiano contra as linhagens PC1396 e PC3305 de Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta do Citros Foi possiacutevel identificar nove isolados em niacutevel de espeacutecie por meio de sequumlecircncias ITS do rDNA sendo 4 como P michaeliae 2 como P theicola 2 como P longicolla e 1 como P sojae Foi possiacutevel verificar que as plantas de Maytenus ilicifolia analisadas satildeo colonizadas endofiticamente por pelo menos dez espeacutecies de Phomopsis e as plantas de Schinus terebinthifolius por pelo menos seis espeacutecies deste gecircnero As anaacutelises morfoloacutegicas por meio de marcadores RAPD e sequenciamento de ITS do rDNA permitem sugerir que as espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo satildeo hospedeiro-especiacuteficas sendo necessaacuteria a redefiniccedilatildeo do conceito de espeacutecie para este gecircnero Na anaacutelise antimicrobiana todos os isolados apresentaram grande potencial no controle in vitro do fungo G citricarpa destacando-se os isolados ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ES2AB1 (Phomopsis sp S6) ES2WF1 (Phomopsis sp S4) e ESFH1 (P theicola) que inibiram o crescimento das linhagens PC1396 e PC3305 de G citricarpa em trecircs metodologias avaliadas Desta forma esse estudo indica que os isolados de Phomopsis spp endoacutefitos de plantas medicinais satildeo produtores de substacircncias bioativas que devem ser melhor caracterizadas Palavras chaves Phomopsis spp endoacutefitos plantas medicinais RAPD sequumlecircncias da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
ABSTRACT Phomopsis spp ENDOPHYTES OF MEDICINAL PLANTS GENETIC DIVERSITY AND ANTAGONISM IN THE FUNGUS Guignardia citricarpa Author Renata Rodrigues Gomes Adviser Chirlei Glienke-Blanco Endophytic microorganisms live in plants without causing damage to their host being able to produce active biological compounds antibiotics fungicides and herbicides This endophytic community may be related to the antimicrobial action of medicinal plants The plant Maytenus ilicifolia known as ldquoespinheira santardquo is a medicinal plant greatly used for the treatment of stomach ulcers and digestive problems typical from the South America especially in the southern part of Brazil and currently is in danger of extinction The medicinal plants Spondias mombin Myracrodruon urundeuva Schinus terebinthifolius and Aspidosperma tomentosun have been used in medicine due to their antimicrobial properties In the present work endophytic fungi of the genus Phomopsis were isolated and their genetic variability and population structure assessed using RAPD markers The medicinal plants analyzed are colonized by a great variety of Phomopsis species with a high morphological and genetic variability both intra and interspecific The isolated fungi were identified through sequences of ITS1 58S and ITS2 regions of ribosomal DNA and tested in their antimicrobial potential against the PC1396 and PC3305 lineages of Guignardia citricarpa the responsible for the ldquoblack spot in Citrusrdquo It was possible to identify 9 isolates at the level of species through the analysis of ITS sequences of rDNA and among these isolates 4 were identified as P michaeliae 2 as P theicola 2 as P longicolla and 1 as P sojae It was possible to verify that the Maytenus ilicifolia plants analyzed are endophytically colonized by at least ten Phomopsis species and that Schinus terebinthifolius are colonized by at least six species of this genus The morphological analyses using RAPD markers and sequencing of ITS regions of rDNA make possible to suggest that the analyzed species of Phomopsis are not host-specific being necessary the redefinition of the species concept for this genus For the antimicrobial analysis all the isolates presented a high in vitro control potential of the fungus G citricarpa particularly the isolates ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ES2AB1 (Phomopsis sp S6) ES2WF1 (Phomopsis sp S4) and ESFH1 (P theicola) that inhibited the growth of the PC1396 and PC3305 lineages of G citricarpa in the three methodologies tested Thus this study indicates that the isolates of Phomopsis spp endophytic of medicinal plants are producers of bioactive substances which should be better characterized Key words Phomopsis spp endophytes medicinal plants RAPD ITS1 58S and ITS2 of rDNA sequences
LISTA DE FIGURAS
FIGURA 1- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis DE Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT 9811 e AT 9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 59
FIGURA 2- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE
Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 61
FIGURA 3- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 64
FIGURA 4- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
PATOGEcircNICOS OBTIDOS DE Glycine max EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 68
FIGURA 5- DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp EM MEIO MEA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 69
FIGURA 6- DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 70
FIGURA 7- AVALIACcedilAtildeO DAS MEacuteDIAS DO DIAcircMETRO DAS COLOcircNIAS DOS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO AV APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 71
FIGURA 8- FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis EM BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 73
FIGURA 9- FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DO ISOLADO SM9713 EM
MEIOS BDA e AV APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB
LUZ CONTIacuteNUA 74 FIGURA 10- COMPRIMENTO DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS
DE Phomopsis spp APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO EM BDA A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 75
FIGURA 11- DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE
SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 77
FIGURA 12- ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE
MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 78
FIGURA 13- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX11 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 79
FIGURA 14- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX14 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 79
FIGURA 15- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX19 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 80
FIGURA 16- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO OPE
08 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 80
FIGURA 17- DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE
SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS DE Phomopsis POR MEIO DE MARCADORES MOLECULARES RAPD 82
FIGURA 18- ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE
GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 84 FIGURA 19- AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA
REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MEacuteTODO DE PARCIMOcircMIA) 86
FIGURA 20- AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA PARCIAL BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MODELO NEIGHBOR-JOINING COM CORRECcedilAtildeO KIMURA DOIS PARAcircMETROS) 87
FIGURA 21- INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa PC1396 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA 93
FIGURA 22- INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia
citricarpa 3305 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA 96 FIGURA 23- AVALIACcedilAtildeO DO CRESCIMENTO DAS COLOcircNIAS DO
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 e PC3305 INOCULADAS APOacuteS RETIRADA DO PAPEL CELOFANE PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS EM MEIO BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 98
FIGURA 24- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 99
FIGURA 25- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 100
LISTA DE TABELAS
TABELA 1- ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR 32
TABELA 2- ISOLADOS GRUPO EXTERNO PARA ANAacuteLISE DE
VARIABILIDADE GENEacuteTICA POR RAPD 35 TABELA 3- EacutePOCAS DO ANO OacuteRGAtildeOS DA PLANTA CONDICcedilOtildeES DE
INCUBACcedilAtildeO E Nordm DE FRAGMENTOS PLAQUEADOS NAS QUATRO COLETAS DE ENDOacuteFITOS DE ESPINHEIRA-SANTA 42
TABELA 4- SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA
AMPLIFICACcedilAtildeO DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL 47
TABELA 5- SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA
AMPLIFICACcedilAtildeO DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL 49
TABELA- 6- Linhagens de Phomopsis spp E de Pestalotiopsis vismae utilizadas
como grupo externo 52 TABELA 7- PORCENTAGEM DE ISOLAMENTO DE Phomopsis
ENDOFIacuteTICOS DE PLANTAS DE ESPINHEIRA SANTA 56 TABELA 8- PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE
OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC1396 94
TABELA 9- PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE
OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 96
TABELA 10- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 101
LISTA DE ANEXOS
ANEXO 1- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM DIFERENTES MEIOS DE CULTURA 125
ANEXO 2- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO BDA 126
ANEXO 3- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO AVEIA 128
ANEXO 4- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO MEA 130
ANEXO 5- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO DOS
ESPOROS BETACONIacuteDIOS DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA 132
ANEXO 6- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 134
ANEXO 7- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 135
ANEXO 8- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 136
ANEXO 9- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 137
ANEXO 10- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS 139
ANEXO 11- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
141
ANEXO 12- MATRIZ DE DADOS PARA CARACTERIZACcedilAtildeO 143 ANEXO 13- LOCAL DA COLETA DE FOLHAS DE Schinus terebinthifolius
CENTRO POLITEacuteCNICO ndash CURITIBA PR 149
SUMAacuteRIO 1 INTRODUCcedilAtildeO 1
2 OBJETIVOS 3
3 REVISAtildeO BIBLIOGRAacuteFICA 4
31 Microrganismos Endofiacuteticos 4
32 Ocorrecircncia de endoacutefitos 7
33 Fungos endofiacuteticos de plantas medicinais 9
34 Endoacutefitos Produtores de Substacircncias Antimicrobianas 11
35 Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss 14
351 Componentes quiacutemicos e propriedades terapecircuticas 16
352 Endoacutefitos isolados de Maytenus ilicifolia 18
36 Guignardia citricarpa Kiely e a Mancha preta do citros 18
361 Mancha Preta do Citros 21
37 O Gecircnero Phomopsis sp 22
38 Marcadores Moleculares 25
381 Marcadores RAPD 27
382 Marcadores ITS 29
4 MATERIAL E MEacuteTODOS 32
41 Material Bioloacutegico 32
411 Fungos endofiacuteticos 32
412 Microrganismos usados para teste de antagonismo 35
413 Fungos endofiacuteticos utilizados para anaacutelise de variabilidade geneacutetica 35
42 Meios de Cultura 35
421 Caldo MEB (Extrato de Malte) 35
422 Meio AV (Aveia-Aacutegar) 36
423 Meio BDA (Meio Batata-Dextrose-Aacutegar) 36
424 Meio MC (Meio Completo) PONTECORVO et al 1953 37
425 Meio MEA (Extrato de Malte) PATERSON e BRIDGE 1994 37
43 Soluccedilotildees e Reagentes 38
431 Clorofane 38
432 Clorofil 38
433 Derozal Bayerreg 38
434 Dodecil Sulfato de Soacutedio (SDS) 10 38
435 Fenol Saturado 38
436 Gel de Agarose (08) 38
437 Gel de Agarose (15) 38
438 Lactofenol azul 38
439 Marcador de peso molecular (DNA de fago lambda clivado com Hind III
Gibco) 39
4310 Marcador de peso molecular (DNA Ladder 100pb Ludwing Biotec) 39
4311 Oligonucleotiacutedeos (Invitrogen) 39
4312 RNAse (invitrogen) 39
4313 Soluccedilatildeo de Vitaminas 40
4314 Soluccedilatildeo salina (pv) 40
4315 Soluccedilatildeo Tween-80 01 (vv) 40
4316 Soluccedilatildeo de Tetraciclina 40
4317 Soluccedilatildeo de EDTA 05M 40
4318 Soluccedilatildeo de brometo de etiacutedio 40
4319 Tampatildeo TE (Tris-EDTA) 41
4320 Tampatildeo de Extraccedilatildeo de DNA 41
4321 Tampatildeo da Amostra (6x) 41
4322 Tampatildeo de corrida TBE 10x 41
44 Isolamento 42
45 Conservaccedilatildeo dos fungos 43
46 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica 43
47 Obtenccedilatildeo de colocircnia monospoacuterica 44
48 Caracterizaccedilatildeo Molecular 44
481 Extraccedilatildeo do DNA (RAEDER e BRODA 1985 modificado por GLIENKE
1995) 44
482 RAPD 45
4821 Anaacutelise da Variabilidade Geneacutetica 46
483 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA 47
4831 Amplificaccedilatildeo 47
4832 Purificaccedilatildeo da PCR 48
48321 Purificaccedilatildeo com PEG 48
48322 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio 48
4833 Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento 49
4834 Purificaccedilatildeo da Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento 50
48341 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em tubos 50
48342 Purificaccedilatildeo com Purificaccedilatildeo com Isopropanol em placa 50
48343 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio 51
4835 Ediccedilatildeo e Anaacutelise das Sequumlecircncia 51
49 Avaliaccedilatildeo da Atividade Antimicrobiana 52
491 Cultura Pareada 52
492 Avaliaccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis 53
493 Atividade dos Extratos metanoacutelicos 54
4931 Obtenccedilatildeo dos extratos 54
4932 Crescimento micelial 55
410 Anaacutelise Estatiacutestica 55
5 RESULTADOS E DISCUSSAtildeO 56
51 Isolamento 56
52 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de Phomopsis 58
53 Caracterizaccedilatildeo Molecular de Phomopsis spp 78
531 RAPD 78
532 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA 85
54 Avaliaccedilatildeo da atividade antimicrobiana 92
541 Cultura pareada 92
542 Teste para detecccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis 97
543 Avaliaccedilatildeo da accedilatildeo dos Extratos 98
6 CONCLUSOtildeES 104
7 REFEREcircNCIAS BIBLIOGRAacuteFICAS 106
ANEXOS 125
1
1 INTRODUCcedilAtildeO
A bioprospecccedilatildeo visa identificar plantas e microrganismos dentre a diversidade
de vida existente em determinado local que possam servir como fonte de substacircncias
bioativas que em uacuteltima instacircncia sejam uacuteteis para o desenvolvimento de novas
drogas Neste contexto os fungos endofiacuteticos satildeo considerados de grande importacircncia
pois representam uma fonte potencial de novos compostos quiacutemicos e bioloacutegicos
podendo ser utilizados natildeo somente na Medicina mas tambeacutem na Fitopatologia e
Veterinaacuteria (STROBEL 2002 STROBEL 2003) O potencial de aplicaccedilatildeo de
microrganismos endofiacuteticos no controle bioloacutegico tambeacutem vem sendo explorado
Os microrganismos endofiacuteticos vivem no interior das plantas interagindo com
diferentes espeacutecies sem causar dano ao seu hospedeiro Esses microrganismos
podem influenciar vaacuterias caracteriacutesticas das plantas e conferir certos benefiacutecios a este
vegetal como por exemplo produccedilatildeo de antibioacuteticos Haacute alguns anos natildeo se conhecia
a grande potencialidade dos endofiacuteticos entretanto este interesse vem aumentando
com a descoberta recente de caracteriacutesticas como a produccedilatildeo de compostos
biologicamente ativos antibioacuteticos fungicidas e herbicidas
Plantas medicinais com propriedades antimicrobianas tambeacutem satildeo habitadas por
microrganismos endofiacuteticos sugerindo que a accedilatildeo antibacteriana ou antifuacutengica poderia
estar no endoacutefito e natildeo na planta ou provavelmente na sua interaccedilatildeo No Brasil vaacuterios
autores mostraram a produccedilatildeo de faacutermacos por endoacutefitos como Xylaria sp Fusarium
moniliforme Colletotrichum sp Guignardia sp e tambeacutem Phomopsis sp
Fungos do gecircnero Phomopsis satildeo encontrados como endoacutefitos nos espaccedilos
intercelulares de tecidos de diversos vegetais entre eles a espinheira-santa (Maytenus
ilicifolia Mart Reiss) planta pertencente agrave famiacutelia Celastraceae Essa planta medicinal
encontrada principalmente no sul do Brasil foi acrescentada agrave lista das espeacutecies
consideradas em extinccedilatildeo no Paranaacute pelo governo do Estado em 1995 Tendo em
vista que pouco se conhece a respeito da comunidade endofiacutetica existente nessa
planta sua diversidade e seu potencial antimicrobiano tornam-se relevantes estudos
de diversidade e bioprospecccedilatildeo
2
Pileggi (2006) demonstrou existir alta diversidade de isolados do gecircnero
Colletotrichum dentre outros fungos filamentosos bacteacuterias e actinomicetos em plantas
de Maytenus ilicifolia do pomar do Centro Nacional de Pesquisa de Florestas (CNPF)
da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaacuteria (EMBRAPAPR) Alguns desses
isolados apresentaram potencial antimicrobiano inibindo o crescimento de Fusarium
sp Guignardia citricarpa e Micrococcus luteus
Endoacutefitos com atividade antagonista contra o fungo Guignardia citricarpa agente
causal da Mancha Preta dos Citros (MPC) poderiam ser utilizados no controle bioloacutegico
desta doenccedila uma vez que o emprego sucessivo de fungicidas como controle de
doenccedilas de plantas apresenta dentre outros problemas a seleccedilatildeo de linhagens
resistentes do patoacutegeno
O gecircnero Phomopsis representa uma fonte potencial de novos compostos
quiacutemicos e bioloacutegicos como vem sendo relatado em diversos trabalhos Oito dos
isolados que foram estudados nesse trabalho jaacute haviam sido avaliados no
IOCFIOCRUZRJ e possuem potencial antimicrobiano (RODRIGUES et al 2004)
Poreacutem tais isolados ainda natildeo haviam sido caracterizados geneticamente nem
identificados em niacutevel de espeacutecie A identificaccedilatildeo e a caracterizaccedilatildeo molecular dos
microrganismos endofiacuteticos satildeo uacuteteis pois o gecircnero Phomopsis eacute de difiacutecil identificaccedilatildeo
em niacutevel de espeacutecie utilizando-se apenas caracteriacutesticas morfoloacutegicas
Estudos moleculares satildeo realizados na busca de padrotildees geneacuteticos nestes
organismos complementando sua caracterizaccedilatildeo O polimorfismo do DNA amplificado
ao acaso (RAPD) propicia uma forma raacutepida para avaliar a diversidade geneacutetica
existente nestes organismos a estruturaccedilatildeo populacional e para auxiliar na
identificaccedilatildeo ao niacutevel de espeacutecie comparando-as com linhagens referecircncia Outra
estrateacutegia importante nessa caracterizaccedilatildeo baseia-se em marcadores de Sequumlecircncias
Internas Transcritas do DNA Ribossocircmico (ITS) para identificaccedilatildeo taxonocircmica dos
isolados
3
2 OBJETIVOS
1 Isolar linhagens endofiacuteticas de Phomopsis spp de plantas sadias de Maytenus
ilicifolia e Identificar os isolados utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas
2 Caracterizaccedilatildeo de Phomopsis spp endofiacuteticos das plantas medicinais Schinus
terebinthifolius Myracrodruon urundeuva Spondias mombin Aspidosperma
tomentosum pertencentes agrave coleccedilatildeo do LABGEM
3 Avaliar a variabilidade geneacutetica e estrutura populacional das linhagens de
Phomopsis spp por meio de marcadores RAPD (Polimorfismo do DNA
Amplificado ao Acaso)
4 Identificar as linhagens por meio de sequumlecircncias da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do
DNA ribossomal
5 Testar a atividade antimicrobiana de linhagens do fungo Phomopsis spp contra
linhagens do fitopatoacutegeno Guignardia citricarpa
4
3 REVISAtildeO BIBLIOGRAacuteFICA
31 Microrganismos Endofiacuteticos
Microrganismos endofiacuteticos satildeo aqueles que vivem no interior das plantas
interagindo com outras espeacutecies de microrganismos sem causar dano ou prejuiacutezo ao
seu hospedeiro Esses microrganismos podem influenciar em vaacuterias caracteriacutesticas
expressas pelas plantas Segundo Neto Azevedo e Araujo (2002) os endoacutefitos podem
desempenhar relevante funccedilatildeo para a sanidade vegetal jaacute que atuam como agentes
controladores de microrganismos fitopatogecircnicos no controle de insetos e ateacute na
proteccedilatildeo da planta contra herbiacutevoros Todas as plantas jaacute estudadas satildeo habitadas por
microrganismos endofiacuteticos principalmente fungos e bacteacuterias
A comunidade endofiacutetica cuja composiccedilatildeo varia em funccedilatildeo do hospedeiro e das
condiccedilotildees ambientais tem indiviacuteduos que se inter-relacionam dentro da planta em um
equiliacutebrio harmocircnico O desequiliacutebrio dessa harmonia afeta o comportamento de todos
os integrantes da comunidade dando condiccedilotildees para que fungos oportunistas
manifestem seu potencial patoloacutegico contra hospedeiro (MAKI 2006)
A distinccedilatildeo entre endofiacuteticos fitopatogecircnicos e oportunistas eacute puramente
didaacutetica Haacute um gradiente tecircnue que os separa e assim agrave distacircncia entre um e outro
pode ser muito pequena sendo difiacutecil impor limites para separar cada categoria Assim
um microrganismo pode ser considerado endofiacutetico mas com a reduccedilatildeo dos
mecanismos de defesa da planta pode se comportar como um patoacutegeno (AZEVEDO et
al 2000)
A ocorrecircncia de microrganismos endofiacuteticos nos vegetais resulta da penetraccedilatildeo
atraveacutes de feridas ocasionadas nas raiacutezes pela abrasatildeo destas com o solo aberturas
naturais como hidatoacutedios e estocircmatos aberturas artificiais sofridas pela accedilatildeo de
pragas animais e o homem ou agressotildees abioacuteticas (RIBEIRO 1995) ou ainda atraveacutes
da secreccedilatildeo de enzimas hidroliacuteticas (ESPOacuteSITO e AZEVEDO 2004) A penetraccedilatildeo
pode ocorrer por meio de esporos levados pelo vento ou hifas que invadem os tecidos
Muitos endoacutefitos produzem massas de coniacutedios delgados caracteriacutestica associada com
5
a dispersatildeo por chuvas (RIBEIRO 1995) Outra forma de propagaccedilatildeo se daacute pela
transmissatildeo vertical por meio de sementes (WHITE MORGAN-JONES E MORROW
1993 CLAY 2004)
Viret e Petrini (1994) usando microscopia eletrocircnica de varredura e transmissatildeo
detectaram a presenccedila de fungos no interior dos hospedeiros Clay (1987) verificou a
presenccedila de hifas dos fungos Acremonium lolli e A coenophialum no espaccedilo
intercelular da regiatildeo meristemaacutetica no mesofilo das folhas no cerne da inflorescecircncia
na semente
Os endoacutefitos apresentam uma relaccedilatildeo mutualiacutestica antagoniacutestica ou neutra com
o hospedeiro A interaccedilatildeo de um fungo com seu hospedeiro vegetal variam e depende
do modo pelo qual o fungo infecta a planta e tambeacutem da extensatildeo da resposta de
defesa desta A colonizaccedilatildeo pode ser sistecircmica ou local inter ou intracelular (ARAUacuteJO
SILVA E AZEVEDO 2000)
Os fungos endofiacuteticos atuam no controle bioloacutegico de fitopatoacutegenos por
ocuparem o mesmo nicho ecoloacutegico destes (ARAUacuteJO SILVA E AZEVEDO 2000)
Segundo Schulz e Boyle (2005) aproximadamente 80 dos fungos endofiacuteticos
produzem compostos biologicamente ativos como antibioacuteticos fungicidas e herbicidas
Esses microrganismos endofiacuteticos podem ser utilizados como fontes de
metaboacutelitos primaacuterios (STAMFORD ARAUacuteJO E STAMFORD 1998) e secundaacuterios que
inibem o desenvolvimento de patoacutegenos (LI et al 2001 LI e STROBEL 2001 ZOU e
TAN 2001) Como exemplo pode-se citar o taxol uma droga quimioterapecircutica usada
no tratamento de cacircncer de mama e ovaacuterio (WANG et al 2000 e STROBEL et al
2003) O aacutecido coletoacutetrico um metaboacutelico do fungo endofiacutetico Colletotrichum
gloeosporioides isolado da Artemisia mongoacutelica apresenta atividade antimicrobiana
contra Bacillus subtilis Staphylococcus aureus Sarcina lutea e contra o fungo
patogecircnico Helminthosporium sativum (ZOU et al 2000) Lu et al (2000) identificaram
trecircs novos metaboacutelitos do fungo endofiacutetico Colletotrichum sp isolado de Artemisia
annua com propriedades antimicrobianas Diversos autores relatam agrave accedilatildeo
antimicrobiana de substacircncias produzidas por fungos endofiacuteticos como Rodrigues
6
Hesse e Werner (2000) Liu et al (2001) Stinson et al (2003) Bao e Lazarivits (2001)
Huang et al (2001) Strobel (2003) Rodrigues (2004) Chareprasert et al (2006)
Os microrganismos endofiacuteticos satildeo tambeacutem capazes de produzirem anti-
helmiacutenticos e inseticidas (AZEVEDO et al 2000 ESPOacuteSITO e AZEVEDO 2004)
apresentando grande potencial que pode ser explorado na agricultura (ZOU e TAN
2001)
Schulz et al (2002) isolaram mais de seis mil e quinhentos fungos endofiacuteticos de
aacutervores e herbaacuteceas na busca de novos metaboacutelitos com potencial para novos
produtos industriais e sugerem que a associaccedilatildeo entre fungos endofiacuteticos e seus
hospedeiros conduza agrave produccedilatildeo de metaboacutelitos secundaacuterios com atividade
antimicrobiana e anti-herbicida
Autores sugerem que certos fungos endofiacuteticos produzem compostos igualmente
presentes em suas plantas hospedeiras como o taxol utilizado para o tratamento de
cacircncer presente tanto na planta medicinal Taxus brevifolia como no fungo endofiacutetico
Taxomyces andreanae (STIERLE et al 1995) Outros exemplos satildeo algumas enzimas
(celulases e lignases) em Xylaria sp fatores de crescimento como giberelina em
Fuzarium moniliforme Indicando uma possiacutevel transposiccedilatildeo de genes entre plantas e
fungos em uma verdadeira engenharia geneacutetica in vivo Se esses casos forem
confirmados ficaraacute evidente que vegetais e fungos transgecircnicos podem ocorrer
naturalmente pela transferecircncia de genes entre espeacutecies pertencentes a diferentes
reinos (AZEVEDO 1998)
Rodrigues Hesse e Werner (2000) pesquisaram a atividade bioativa de extratos
de fungos endofiacuteticos isolados da planta Spondias mombin L (cajazeiro) Estes extratos
incluindo o de Phomopsis sp foram testados contra determinados microrganismos O
fungo apresentou atividade contra actinomicetos Cladosporium elatum Mycotypha sp
e S cerevisae
Aleacutem da produccedilatildeo de antimicrobianos fungos endofiacuteticos podem excluir
patoacutegenos que ocupem o mesmo nicho ecoloacutegico por competiccedilatildeo como relatado por
Bao e Lazarovits (2001) com Fusarium oxysporum f sp Lycopersici patogecircnico e
Fusarium oxysporum natildeo patogecircnico
7
Os fungos endofiacuteticos satildeo de grande importacircncia pois representam uma fonte
potencial de novos compostos quiacutemicos e bioloacutegicos podendo ser utilizados natildeo
somente na Medicina mas tambeacutem na Fitopatologia e Veterinaacuteria (STROBEL 2002
STROBEL 2003) Tendo em vista essa importacircncia vaacuterios trabalhos vecircm sendo
recentemente publicados envolvendo a capacidade de endofiacuteticos antagonizarem
fitopatoacutegenos assim como satildeo descobertos e descritos metaboacutelitos e outras
substacircncias de interesses produzidos por endofiacuteticos
3 2 Ocorrecircncia de endoacutefitos Uma diversidade de microrganismos endofiacuteticos estaacute presente no interior de
plantas aparentemente saudaacuteveis com potencial para serem estudadas A composiccedilatildeo
das espeacutecies pode variar de acordo com o hospedeiro distribuiccedilatildeo geograacutefica idade da
planta condiccedilotildees ecoloacutegicas e sazonais incluindo altitude e precipitaccedilatildeo Uma ou duas
espeacutecies satildeo predominantes como endofiacuteticas em um dado hospedeiro enquanto
outros isolados satildeo pouco frequumlentes (CARROLL 1978 ARNOLD 2003)
Petrini Stone e Carroll (1982) verificaram um padratildeo de dominacircncia de espeacutecies
em que o endoacutefito encontrado com maior frequumlecircncia em uma determinada espeacutecie
vegetal era isolado menos frequentemente de outros hospedeiros Por outro lado os
endoacutefitos encontrados com menor frequumlecircncia em uma planta pareciam ser menos
especiacuteficos pois eram isolados em um amplo espectro de hospedeiros mas com baixa
frequumlecircncia
A colonizaccedilatildeo do fungo endofiacutetico Stagonospora sp no hospedeiro Phragmites
australis ocorre de forma diferenciada no decorrer do ano Na primavera o endoacutefito eacute
encontrado somente na raiz enquanto no outono ele eacute encontrado em todo o vegetal
(ERNEST MENDGEN e WIRSEL 2003) Gao et al (2005) constataram uma flutuaccedilatildeo
sazonal para os endoacutefitos isolados de Heterosmilax japonica Kunth os autores
verificaram maior abundancia de populaccedilotildees endofiacuteticas em amostras coletadas na
primavera do que no veratildeo
8
Tanto a planta hospedeira como a regiatildeo onde os endofiacuteticos satildeo isolados pode
influenciar a produccedilatildeo de metaboacutelitos secundaacuterios De acordo com dados estatiacutesticos
Bills et al (2002) compararam a produccedilatildeo de metaboacutelitos de endofiacuteticos provenientes
de regiotildees tropicais e de regiotildees temperadas Os dados revelaram que regiotildees tropicais
satildeo mais ricas na produccedilatildeo tanto de endoacutefitos como dos metaboacutelitos secundaacuterios
A presenccedila de endoacutefitos em plantas pode variar dentro de espeacutecies de um
mesmo hospedeiro Nestes hospedeiros tambeacutem eacute encontrada uma grande variedade
geneacutetica entre isolados endofiacuteticos da mesma espeacutecie Tal variabilidade foi encontrada
em isolados do fungo Guignardia citricarpa obtidos de citros (GLIENKE 1995) em
duas espeacutecies de Colletotrichum sp isoladas de Maytenus ilicifolia (PILEGGI 2006) e
tambeacutem Pestalotiopsis sp isolados de Maytenus ilicifolia (FIGUEIREDO 2006)
O gecircnero Phomopsis tem sido frequentemente isolado como endoacutefito em uma
grande variedade de plantas
Azevedo et al (2000) apresentaram algumas plantas hospedeiras de onde jaacute
foram isoladas espeacutecies de Phomopsis entre elas Sabal bermudana Trachycarpus
fortunei Cavendishia pubescens Stylosanthes guianensis Anacardium occidentale e
Mangifera indica Corrado e Rodrigues (2004) isolaram endofiacuteticos de Phomopsis das
plantas medicinais Spondias mombin e Aspidosperma tomentosun
Bussabam et al (2001) isolaram predominantemente Phomopsis sp
Colletotrichum gloeosporiodes Glomerella sp e Xylaria sp endoacutefitos de folhas
pseudocaules e rizomas de gengibre (Amomum siamense Criab) coletadas em dois
locais na Tailacircndia
Em plantas de cacau (Theobroma cacao L) resistentes e suscetiacuteveis ao agente
causal da vassoura da bruxa endoacutefitos foram identificados por caracteriacutesticas
morfoloacutegicas e sequumlenciamento de rDNA como pertencentes aos gecircneros
Acremonium Blastomyces Botryosphaeria Cladosporium Colletotrichum
Cordyceps Diaporthe Fusarium Geotrichum Gibberella Gliocladium Lasiodiplodia
Monilochoetes Nectria Pestalotiopsis Phomopsis Pleurotus Pseudofusarium
Rhizopycnis Syncephalastrum Trichoderma Verticillium e Xylaria Os autores
identificaram ainda alguns endoacutefitos potencialmente antagonistas destacando-se
9
Gliocladium catenulatum que reduziu em 70 a incidecircncia da vassoura da bruxa in
vivo em placircntulas de cacaueiro (RUBINI et al 2005)
O gecircnero Phomopsis foi isolado como endoacutefito de graviola (Annona muricata L)
e pinha (Annona squamosa L) dois isolados promoveram eficientemente o crescimento
vegetal mostrando-se promissores para agricultura uma vez que satildeo capazes de
aumentar a produccedilatildeo dessas culturas (SILVA et al 2006) A capacidade de estimular o
crescimento vegetal apresentada por esses organismos tem sido atribuiacuteda a
mecanismos diretos tais como a fixaccedilatildeo do nitrogecircnio produccedilatildeo de fitohormocircnios e
indiretos como antagonismo em relaccedilatildeo a patoacutegenos levando consequumlentemente ao
aumento na taxa de germinaccedilatildeo crescimento das raiacutezes e parte aeacuterea nuacutemero de
folhas e flores aacuterea foliar e rendimento de culturas (SILVEIRA 2001)
Alguns dos relatos citam o gecircnero Phomopsis como fitopatoacutegeno isolado de
Citrus aurantium (Laranjeira) Citrus nobilis (Tangerineira) Citrus paradisi (Pomelo)
Citrus australis (Laranja) Citrus sinensis (Laranja da China) Citrus sp (Citros)
Mangifera indica (Mangueira) Glycine max (Soja) Ficus carica (Figueira) e Anacardium
occidentale (Cajueiro) entre muitas outras plantas (CENARGEN EMBRAPA 2005) Foi
descrito como agente causal da mancha foliar em Myracrodruon urundeuva (ANJOS
CHARCHAR e GUIMARAtildeES 2001) O fungo Phomopsis sp tambeacutem eacute encontrado
associado a sementes de Dipteryx alata e Cybistax antisyphilitica espeacutecies comuns nos
Cerrados (SANTOS 1996)
33 Fungos endofiacuteticos de plantas medicinais Os microrganismos endofiacuteticos satildeo encontrados em muitas espeacutecies de plantas
medicinais A accedilatildeo antimicrobiana de algumas dessas plantas poderiam estar
relacionadas agrave sua comunidade endofiacutetica sugere-se entatildeo que o princiacutepio ativo
antimicrobiano pode ser produzido pelo microrganismo e natildeo propriamente pelo
vegetal ou provavelmente pela interaccedilatildeo planta-hospedeiro
As plantas Aspidosperma tomentosum e Spondias mombin satildeo utilizada no
Brasil devido as suas propriedades antimicrobianas A avaliaccedilatildeo dos metaboacutelitos
10
secundaacuterios produzidos pelo fungo endofiacutetico Phomopsis sp isolado dessas plantas
demonstraram excelentes resultados na inibiccedilatildeo de bacteacuterias fungos filamentosos e
leveduras (CORRADO e RODRIGUES 2004)
Rodrigues Hesse e Werner (2000) avaliaram metaboacutelitos produzidos por fungos
endofiticos isolados de Spondias mombin Guignardia sp apresentaram atividade
contra Escherichia coli Staphylococcus aureus Saccharomyces cerevisiae Geotrichum
sp e Penicillium canadesis Metaboacutelitos de Pestalotiopsis guepinii apresentaram
atividade contra S cerevisiae Os metaboacutelitos produzidos por Phomopsis sp foram
eficientes contra Cladosporium elantum Mycotypha sp e S cerevisiae
Heterosmilax japonica Kunth eacute uma planta medicinal conhecida na China por
seus efeitos diureacuteticos Gao et al (2005) avaliaram a comunidade de fungos endofiacuteticos
e observaram uma grande variedade de fungos colonizando o interior das plantas entre
eles Phomopsis Mycospharella Aureobasidium Cladosporium Glomerella
Botryosphaeria e Guignardia
Plantas do gecircnero Taxus demonstraram atividade anticanceriacutegena assim como
isolados endofiacuteticos dessas plantas O paclitaxel e alguns de seus derivados utilizados
no tratamento de cacircncer satildeo produzidos pelo fungo endofiacutetico Taxus andreanae
isolado da planta medicinal T brevifolia (STROBEL et al 1993 STIERLE et al 1995) e
pelos fungos endofiacuteticos Sporormia minima e Trichothecium sp isolados da planta
medicinal T wallichiana (SHRESTHA et al 2001) A planta medicinal T marei de onde
foi isolado o fungo Tubercularia sp tambeacutem demonstrou atividade anticanceriacutegena
(WANG et al 2000)
O fungo Colletotrichum sp foi isolado como endoacutefito da planta medicinal
Artemisia annua utilizada pelos chineses como uma droga antimalaacuterica produziu
atividade antimicrobiana contra patoacutegenos humanos e de plantas (LU et al 2000) O
fungo endofiacutetico C gloeosporioides da espeacutecie A mongoacutelica sintetiza aacutecido coletoacutetrico
que apresenta atividade antimicrobiana (ZOU et al 2000)
11
34 Endoacutefitos Produtores de Substacircncias Antimicrobianas
A antibiose eacute definida como a interaccedilatildeo entre organismos na qual um ou mais
metaboacutelitos produzidos por um organismo tecircm efeito danoso sobre o outro (BETTIOL e
GHINI 1995) Segundo Melo (1998) muitos fungos e bacteacuterias inibem fitopatoacutegenos
competindo por nutrientes parasitando eou produzindo metaboacutelitos secundaacuterios como
enzimas liacuteticas e antibioacuteticos O resultado dessas interaccedilotildees antagocircnicas tais como
antibiose competiccedilatildeo induccedilatildeo de defesa e parasitismo leva ao controle bioloacutegico de
doenccedilas de plantas assim como pode desenvolver um papel muito importante na
medicina com a descoberta de novos faacutermacos
RODRIGUES HESSE e WERNER (2000) pesquisaram a atividade
antimicrobiana de metaboacutelitos secundaacuterios produzidos por fungos endofiacuteticos de
Spondias mombin (Anacardiaceae) contra actinomicetos bacteacuterias Gram-positivas e
Gram-negativas leveduras e fungos filamentosos e verificaram que os extratos de
Guignardia sp Phomopsis sp e Pestalotiopsis guepinii inibiram o crescimento de
actinomicetos Os extratos de Guignardia sp tambeacutem apresentaram atividade
antimicrobiana contra Escherichia coli Staphylococcus aureus Saccharomyces
cerevisiae Geotrichum sp e Penicillium canadensis Metaboacutelitos de P guepinii foram
ativos contra S cerevisae e os isolados de Phomopsis sp mostraram accedilatildeo antifuacutengica
contra Cladosporium elatum Mycotypha sp e S cerevisae
Liu et al (2001) estudaram a atividade antifuacutengica de fungos endofiacuteticos isolados
de Artemisia annua sobre os fitopatoacutegenos Gaeumannomyces graminis Fusarium
graminearum Rhizoctnia cerealis Phytophthora capsici helminthosporium sativum e
Gerlachia nivalis encontrando isolados com accedilatildeo inibitoacuteria para todos os patoacutegenos Lu
et al (2000) estudando a mesma planta constataram atividade de trecircs novos
metaboacutelitos produzidos pelo fungo Colletotrichum sp apresentando atividade
antifuacutengica contra Bacillus subtilis Sataphylococcus aureus Sarcina lutea
Pseudomonas sp Candida albicans Aspergillus niger e inibiccedilatildeo de crescimento dos
fungos patogecircnicos Gaeumannomyces graminis var tritici Rhizoctonia cerealis
Helminthosporium sativum e Phytophora capisici
12
A Cinnamomum zeylnicum (canela) eacute uma planta utilizada no tratamento de
uacutelceras estomacais hipertensatildeo arterial resfriados e dores abdominais Ezra e Strobel
(2003) isolaram dessa planta o fungo Muscodor albus que apresenta accedilatildeo fungicida
fungistaacutetica bactericida e bacteriostaacutetica por emissatildeo de compostos orgacircnicos volaacuteteis
O mesmo foi relatado para o fungo Gliocladium sp da planta Eucryphia cordifolia
inibindo o crescimento dos fungos fitopatogecircnicos Pythium ultimum e Verticillum dahliae
(STINSON et al 2003)
Citocalasinas satildeo metaboacutelitos fuacutengicos relacionados pela estrutura e atividade
bioloacutegica com capacidade antitumoral e atividade antibioacutetica Estas substacircncias
apresentam efeitos que incluem a inibiccedilatildeo da divisatildeo do citoplasma e dos movimentos
celulares induccedilatildeo do deslocamento nuclear retraccedilatildeo de coaacutegulos e agregaccedilatildeo de
plaquetas transporte de glucose e secreccedilatildeo da tireoacuteide Recentemente trecircs novas
citocalasinas foram relatadas como provenientes do fungo endofiacutetico Rhinocladiella sp
de Tripterygium wilfordii (WAGENAAR et al 2000)
Li e Strobel (2001) purificaram duas ciclohexenonas produzidas pelo fungo
endofiacutetico Pestalotiopsis jesteri isolado da planta Fragraea bodenii (Gentianaceae) a
jesterona e a hidroxil-jesterona das quais a primeira apresentou atividade antifuacutengica
contra o patoacutegeno Pythium ultimum Outro metaboacutelito isoldado de P microspora
isolado endofiticamente da planta Terminalia morobensis a isopestacina
(isobenzofuranona) tambeacutem se mostrou ativo contra Pythium ultimum entre outros
fungos como Sclerotinia sclerotiorum e Rhizoctonia (STROBEL et al 2002)
Adicionalmente a isopestacina apresentou atividade antioxidante contra uma variedade
de radicais livres testados
A Monstera sp eacute uma planta que cresce sobre o tronco de aacutervores dela foi
isolado o endoacutefito Streptomyces sp MSU-2110 na Amazocircnia Peruana Este
actinomiceto produz um peptiacutedeo denominado coronamicina com atividade
antimicrobiana contra o fungo patogecircnico Cryptococcus neoformans e agrave bacteacuteria
Streptococcus pneumoniae mas a melhor atividade foi a demonstrada contra
protozoaacuterio Plasmodium falciparum sugerindo potencialidade como uma droga
13
antimalaacuterica Aleacutem da coronamicina este endoacutefito tambeacutem produz outros compostos
com atividades antifuacutengicas (EZRA et al 2004)
Castillo et al (2002) isolaram e caracterizaram um antibioacutetico de largo espectro
a munumbicina produzida por uma outra linhagem endofiacutetica de Streptomyces
denominada NRRL 30562 isolada da planta medicinal Kennedia nigriscans nativa do
Norte da Austraacutelia O extrato do endoacutefito obtido com solvente orgacircnico foi purificado e
submetido a HPLC (Cromatografia Liacutequida de Alta Eficiecircncia) Os quatro componentes
principais resultantes foram denominados munumbicinas A B C e D Estes compostos
demonstraram em geral atividade contra bacteacuterias Gram positivas como Bacillus
anthracis e Mycobacterium tuberculosis multi-resistente A munumbicina B inibiu
Staphylococcus aureus resistente a meticilina (MRSA) enquanto a munumbicina D
apresentou atividade contra o parasita da malaacuteria Plasmodium falciparum O extrato da
linhagem de Streptomyces foi testado ainda contra vaacuterios patoacutegenos de plantas
apresentando atividade contra Pythium ultimum Phytophthora infestans Sclerotinia
sclerotiorum Erwinia carotovora Cochliobolus carbonum e Penicillium sp mostrando o
grande potencial destas novas substacircncias para a medicina e agricultura
O aacutecido coletotricum produzido pelo fungo Colletotrichum gloeosporioides
(Penz) Penz amp Sacc isolado da planta medicinal Artemiacutesia mongolica apresentou
inibiccedilatildeo do crescimento de Bacillus subtilis Staphylococcus aureus e Sarcina lutea e
atividade antifuacutengica contra o patoacutegeno Helminthosporium sativum (ZOU et al 2000)
Corrado e Rodrigues (2004) observaram a atividade bactericida de linhagens do
fungo endofiacutetico Phomopsis sp isolado das folhas de Aspidosperma tomentosum e
peciacuteolos da planta medicinal Spondias mombin Todos os extratos avaliados inibiram o
crescimento de bacteacuterias fungos filamentosos e leveduras testadas mostrando o
grande potencial deste fungo como fonte de produtos bioativos
Chareprasert et al (2006) isolaram fungos endofiacuteticos de Tectona grandis e de
Samanea saman e testaram sua capacidade antimicrobiana Dentre os isolados
testados Phomopsis foi o gecircnero dominante produzindo substacircncias inibidoras contra
Bacillus subtilis S aureus E coli e Candida albicans
14
Aleacutem da capacidade antimicrobiana fungos endofiacuteticos mostram-se importantes
com um grande potencial antitumoral e com habilidade em inibir enzimas sugerindo
que podem representar uma estimada fonte para uso terapecircutico
Rodrigues et al (2005) verificaram que fungos endofiacuteticos possuem a
capacidade de inibir colinesterase dentre eles linhagens de Phomopsis sp Entretanto
o melhor resultado foi obtido com extratos de Penicillium indicando que estes podem
ter aplicaccedilotildees farmacecircuticas
Huang et al (2001) testaram agrave accedilatildeo de fungos endofiacuteticos isolados de plantas
medicinais frente a outros fungos e tumores Os resultados indicaram que esses fungos
satildeo importantes em medicina como agentes antimicrobianos e antitumorais
Silva et al (2005) isolaram dois novos metaboacutelitos de Phomopsis cassiae
endofiacutetico de Cassia specatabilis as substacircncias 24-diidroxi-56-dimetil benzoato de
etila e phomopsilactona que exibiram forte atividade antifuacutengica contra fitopatoacutegenos
bem como citotoxicidade contra a linhagem celular de tumor cervical humano (HeLa)
Outros fungos como o Gliocladium sp da planta Eucryphia cordifolia tambeacutem possuem
atividade contra fungos fitopatogecircnicos (STINSON et al 2003 STROBEL 2003)
Em 2001 Rodrigues-Heerklotz et al elucidaram a estrutura quiacutemica e a siacutentese
assimeacutetrica de um novo metaboacutelito o aacutecido guignardico produzido pelo fungo endofiacutetico
Guignardia sp isolados de Spondias mombin
Satildeo vaacuterios os relatos de fungos endofiticos produtores de substacircncias
antimicrobianas inclusive isolados de plantas medicinais Esses microrganismos tem
se mostrado como uma fonte promissora de agentes bioativos antitumorais e
antifuacutengicos
35 Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss
A planta Maytenus ilicifolia Mart Ex Reiss pertence agrave classe Magnoliopsida
ordem Celastrales e famiacutelia Celastraceae a qual compreende 50 gecircneros e cerca de
800 espeacutecies (CRONQUIST 1981) Conhecida popularmente nos diferentes paiacuteses da
Ameacuterica do Sul pode receber diferentes denominaccedilotildees congorosa quebrachillo e
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capororoca na Argentina (GONZALEZ LOMBARDO e VALLARINO 1937) espinheira-
divina cancorosa cancerosa cancrosa sombra-de-touro no Uruguai (SIMOtildeES et al
1986 ALICE et al 1995) coromilho-do-campo e salva-vidas (CARLINI e BRAZ 1988)
espinheira santa espinheira-divina erva-cancrosa e erva-santa (CARVALHO-OKANO
1992) cancorosa-de-Deus limatildeozinho maiteno marteno pau-joseacute salva-vidas
sombra-de-touro no Brasil (BITTENCOURT 2000)
Eacute descrita como uma aacutervore perene de porte arboacutereo-arbustivo encontrada na
mata de clima subtropical e temperado presente em sub-bosques das florestas de
Araucaacuteria nas margens de rios e em regiotildees de estepes Pode se propagar usualmente
por sementes (TAYLOR-ROSA e BARROS 1994) ou estacas de galho Preferindo
climas mais amenos ocorrendo espontaneamente ou por meio de cultivo A colheita
das folhas pode ser feita em qualquer eacutepoca do ano (PANIZZA 1998) Eacute nativa da
Ameacuterica do Sul encontrada no leste da Argentina Paraguai Boliacutevia com menor
intensidade no Chile e Uruguai No Brasil eacute predominante nos estados do Sul
(CARVALHO-OKANO 1992)
Maytenus ilicifolia eacute um arbusto de ocorrecircncia natural da Floresta Ombroacutefila Mista
(Floresta com Araucaacuteria) (BITTENCOURT 2001) Muitas vezes essa planta eacute
encontrada em ambientes ciliares e nos agrupamentos arboacutereos (capotildees) na regiatildeo de
predomiacutenio das estepes (CERVI et al 1989)
Esta planta eacute descrita como um subarbusto ou aacutervore ramificado desde a base
medindo ateacute 50 m de altura Ramos novos glabros angulosos tetra ou multicarenados
Peciacuteolo com 02-05 cm de comprimento A folha apresenta a margem inteira ou com
espinhos em nuacutemero de um a vaacuterios distribuiacutedos regular e irregularmente no bordo
geralmente concentrados na metade apical de um ou de ambos os semilimbos o limbo
com aproximadamente 22 a 89 cm de comprimento e 11 a 30 cm de largura e
nervuras na face abaxial Fruto caacutepsula bivalvar orbicular pericarpo maduro de
coloraccedilatildeo vermelho-alaranjada A presenccedila de disco nectariacutefero eacute um recurso a mais
para atrair os pequenos polinizadores como himenoacutepteros e formigas formando um
conjunto neacutectar-poacutelen interessante para a polinizaccedilatildeo uma vez que as flores satildeo
pequenas brancas e pouco vistosas O florescimento ocorre entre os meses de
16
setembro a outubro enquanto os frutos surgem entre outubro e fevereiro (CARVALHO-
OKANO 1992 RAMDOMSKI 1998 BITTENCOURT 2000)
A fragmentaccedilatildeo da Floresta com araucaacuterias nas uacuteltimas deacutecadas juntamente
com a comprovaccedilatildeo terapecircutica contra males gaacutestricos e o uso em larga escala
causaram grande devastaccedilatildeo de populaccedilotildees naturais de Maytenus ilicifolia
(BITTENCOURT 2001)
351 Componentes quiacutemicos e propriedades terapecircuticas Plantas sempre foram usadas como fonte terapecircutica na medicina tanto em
remeacutedios tradicionais quanto em produtos industrializados A planta Maytenus ilicifolia
Mart eacute geralmente utilizada na medicina popular brasileira As folhas secas desta
planta satildeo usadas como uma infusatildeo para aliviar dores de estocircmago e naacuteuseas e no
tratamento de uacutelceras e gastrites (CAMPAROTO et al 2002) Vaacuterios compostos
isolados de M ilicifolia foram descritos apresentando accedilatildeo antitumoral tambeacutem usado
como analgeacutesico antinflamatoacuterio e antiaacutecido (JORGE 2004)
Esta espeacutecie tem uso popular em comunidades tradicionais e povos indiacutegenas no
Brasil (BITTENCOURT 2001) No Paraguai e Boliacutevia tribos indiacutegenas e populaccedilotildees
rurais a utilizam como substacircncia controladora da fertilidade (CORDEIRO VILEGAS e
LANCcedilAS 1999) e no Paraguai e Argentina eacute usada como contraceptiva e abortiva
(MONTANARI CARVALHO e DOLDER 1998) Citada tambeacutem com uso no tratamento
de febres palustres (MEIRA PENNA 1946) afecccedilotildees pruriginosas cutacircneas
(COIMBRA 1958) dispepsias (CRUZ 1965) Inflamaccedilotildees ulceras e gaacutestricas (JORGE
2004)
As propriedades terapecircuticas de Maytenus ilicifolia foram atribuiacutedas agrave produccedilatildeo
de compostos terpecircnicos como maitenina e pristimerina tanto pelas raiacutezes (LIMA et al
1971 ITOKAWA et al 1991) como em ramos de folhas (JORGE et al 2004) Assim
como fenoacuteis taninos gaacutelicos (CAMPAROTO et al 2002) flavonoacuteides e outros
compostos (SILVA et al 1991 LEITE et al 2001)
17
Jorge et al (2004) avaliaram a eficaacutecia de extratos de M ilicifolia como
antinflamatoacuterio na proteccedilatildeo contra lesotildees gaacutestricas incluindo a cicatrizaccedilatildeo e
citoproteccedilatildeo sugerindo que os extratos de Maytenus ilicifolia podem representar uma
importante alternativa cliacutenica em antinflamatoacuterios e antiulcerogecircnico
Souza-Formigoni et al (1991) avaliaram a potencialidade dos efeitos
antiulcerogecircnicos das folhas de espinheira santa em experimentos realizados em ratos
com ulceras O uso de chaacute tanto por via oral como intraperitoneal mostrou resultados
semelhantes agrave droga cicatrizante cimetidina M ilicifolia assim como outras espeacutecies da
famiacutelia Celastraceae foram investigadas quanto aos seus constituintes de accedilatildeo
citotoacutexica sendo isolados triterpenos aromaacuteticos de accedilatildeo antitumoral Segundo Itokawa
et al (1991 1993) e Shirota et al (1994) os triterpenos satildeo capazes de estimular
fatores atuantes na proteccedilatildeo da mucosa gaacutestrica como a produccedilatildeo de muco e
prostaglandinas
A cimetidina eacute um potente agente na supressatildeo de aacutecido gaacutestrico e pepsina ela
age como antagonista competitivo da histamina nos receptores H2 das ceacutelulas parietais
gaacutestricas produtoras de aacutecido dessa forma bloqueia a secreccedilatildeo aacutecida (SOUZA-
FORMIGONI et al 1991) Ferreira et al (2004) investigaram o efeito e possiacutevel
mecanismo de accedilatildeo do extrato aquoso liofilizado de M ilicifolia sobre a secreccedilatildeo de
aacutecidos em mucosa gaacutestrica de sapos Foi observada uma reduccedilatildeo de 16 da secreccedilatildeo
aacutecida sugerindo os autores que essa reduccedilatildeo ocorra devido a uma atividade
antagoniacutestica dos extratos nos receptores de H2 de histidina
Montanari Carvalho e Dolder (1998) analisaram os efeitos de extratos
etanoacutelicos de M ilicifolia na espermatogecircnese de camundongos e natildeo encontraram
qualquer defeito ou distuacuterbio Poreacutem Montanari e Bevilacqua (2002) em estudos com
fecircmeas de ratos constataram uma diminuiccedilatildeo significativa na implantaccedilatildeo dos embriotildees
com a utilizaccedilatildeo de extrato liofilizado das folhas
18
352 Endoacutefitos isolados de Maytenus ilicifolia
Pileggi (2006) isolou microrganismos endofiacuteticos de folhas peciacuteolos e sementes
de Maytenus ilicifolia e investigou o potencial farmacoloacutegico dos mesmos Foram
isolados em maior frequumlecircncia os fungos Alternaria sp Colletotricum sp Bipolaris sp
Phyllosticta sp e Cladosporium sp Entre os fungos e bacteacuterias testados 15
apresentaram potencial para o controle bioloacutegico Na anaacutelise de caracterizaccedilatildeo
morfoloacutegica por RAPD foi sugerida a presenccedila de duas espeacutecies de Coletotricum
isolados de Maytenus ilicifolia
Figueiredo (2006) isolou de Maytenus ilicifolia fungos endofiacuteticos e os avaliou
quanto ao potencial antimicrobiano contra bacteacuterias patogecircnicas em humanos e o fungo
fitopatogecircnico Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta do Citros Os
extratos metanoacutelicos de dois isolados exibiram accedilatildeo fungistaacutetica na germinaccedilatildeo e no
crescimento micelial de G citricarpa Dois extratos de Pestalotiopsis sp inibiram o
crescimento dos microrganismos-teste (S aureus oxalino resistente Klebsiella
pneumoniae Micrococcus luteus Staphylococcus aureus e Escherichia coli)
Bacteacuterias com potencial anti-leucemico foram isoladas de Maytenus essas
bacteacuterias interagem com as plantas na produccedilatildeo de alguns metaboacutelitos como a
maytensina substancia que tambeacutem apresenta propriedades antifuacutengicas
Azevedo et al (2000) relataram a presenccedila de bacteacuterias endofiacuteticas em folhas de
Maytenus aquifolium Foram isolados vinte gecircneros os mais frequumlentes foram Bacillus
Clavibacter e Streptomyces aleacutem de actinomicetos Testes preliminares mostraram que
algumas das bacteacuterias podem produzir ansamacroliacutedeos que tambeacutem satildeo produzidos
pela planta hospedeira
36 Guignardia citricarpa Kiely e a Mancha preta do citros
O gecircnero Guignardia foi descrito em 1982 por Viala e Ravaz e compreende as
formas teleomoacuterficas de espeacutecies de Phyllosticta e de alguns outros gecircneros
19
relacionados de fungos imperfeitos geralmente saproacutefitas ou semiparasitas de folhas
(SIVANESAN 1984)
Diversos autores isolaram espeacutecies de Phyllosticta de plantas aparentemente
sadias descrevendo-as como endofiacuteticas (CARROLL e CARROLL 1978 PETRINI
1986 LEUCHTMANN et al 1992 GLIENKE 1995 PENNA 2000) No entanto existe
um grande nuacutemero de relatos citando este gecircnero como fitopatogecircnico de diversas
culturas com grande importacircncia econocircmica como arroz (SUGHA SINGH E SHARMA
1986) cana-de-accediluacutecar (PONS 1990) tabaco (PATEL et al 1988) e eucalipto (CROUS
et al 1993) e tambeacutem frutiacuteferas como abacate e tomate (BAKER 1938) manga e
mamatildeo (McMILLAN JR 1986) uva (IBRAHIM e BAYCA 1989) e principalmente em
citros (McONIE 1964a 1964b HERBERT e GRECH 1985 JOHNSTON e
FULLERTON 1988)
O fungo Guignardia citricarpa Kiely (anamorfo Phyllosticta citricarpa (McALP)
Van Der Aa) eacute um Ascomiceto da ordem Dothideales famiacutelia Dothideaceae Possui
estroma plectenquimatoso pseudoteacutecio globoso a subgloboso medindo 125 a 360 μm
de diacircmetro contendo um poro de 14 a 16 μm e paredes espessas com 20 a 22 μm
Seu asco apresenta forma de clava arredondado na extremidade superior e eacute
bitunicado Conteacutem oito ascoacutesporos unicelulares hialinos ligeiramente cinzentos
romboacuteides contendo gracircnulos e um grande vacuacuteolo central Os ascoacutesporos satildeo
cobertos com um quepe gelatinoso nas extremidades Segundo Sivanesam (1984)
pseudoparaacutefises satildeo encontradas em pseudoteacutecios maduros De acordo com Johnston
e Fullerton (1988) as formas anamorfas e teleomorfa geralmente satildeo encontradas
associadas
As estruturas de frutificaccedilatildeo satildeo os picniacutedios que macroscopicamente satildeo
pequenos globosos pretos e semi-eruptivos A fase sexuada corresponde agrave produccedilatildeo
de ascoacutesporos os quais se encontram em nuacutemero de oito no interior dos ascos Estes
apresentam forma de clava satildeo arredondados na extremidade superior e bitunicados
Os ascoacutesporos satildeo unicelulares hialinos levemente acinzentados romboacuteides
contendo gracircnulos e um grande vacuacuteolo central cobertos com um quepe gelatinoso nas
extremidades (SIVANESAN 1984)
20
Fialho (2004) avaliou in vitro o potencial de linhagens de S cerevisiae como
agentes no controle bioloacutegico contra G citricarpa nos frutos poacutes-colheita Rodrigues
(2006) avaliou o efeito dos principais fungicidas utilizados no campo para o controle da
doenccedila Tambeacutem avaliou 96 linhagens de fungos para a seleccedilatildeo de potenciais agentes
no controle bioloacutegico demonstrando que algumas espeacutecies de Trichoderma satildeo
capazes de atuar in vitro como biocontroladores do fitopatoacutegeno G citricarpa
Cardoso-Filho (2003) avaliou o uso de indutores de resistecircncia Saccharomyces
cerevisiae Bionreg e aacutecido saliciacutelico ao fitopatoacutegeno G citricarpa O autor destaca que os
compostos presentes no albedo (mesocarpo) da laranja como a celulose carboidratos
soluacuteveis pectinas compostos fenoacutelicos (flavonoacuteides) aminoaacutecidos e vitaminas podem
exibir a accedilatildeo antimicrobiana para o controle da MPC Neste contexto ele avaliou os
extratos produzidos pelo albedo da laranja e comprovou accedilatildeo fungicida ou fungistaacutetica
inibindo a germinaccedilatildeo esporulaccedilatildeo e crescimento micelial in vitro de G citricarpa
Blanco (1999) e Christo (2002) observaram esta variabilidade entre linhagens
isoladas de lesatildeo de Mancha Preta de Citros (MPC) ou seja linhagens de G citricarpa
utilizando dados de RAPD Esta variabilidade tambeacutem foi evidenciada em linhagens
isoladas em plantas assintomaacuteticas atualmente descritas como Guignardia mangiferae
(GLIENKE-BLANCO et al 2002 CHRISTO 2002 BAAYEN et al 2002 OKANI
NAKAGIRI e ITO 2001 RODRIGUES et al 2004)
Em 1999 Glienke-Blanco comparou geneticamente por meio de marcadores de
RAPD linhagens de populaccedilotildees patogecircnicas e endofiacuteticas de Guignardia sp de
diversas regiotildees e hospedeiros constatando a existecircncia de trecircs populaccedilotildees de
Guignardia geneticamente muito diferentes coexistindo em citros sendo duas
endofiacuteticas e uma patogecircnica sugerindo que talvez estas trecircs populaccedilotildees pudessem
pertencer a espeacutecies distintas O desenvolvimento de um par de oligonucleotiacutedeos
capaz de amplificar um fragmento de 370 pb especiacutefico para linhagens patogecircnicas de
G citricarpa veio a corroborar para distinccedilatildeo geneacutetica entre estes grupos (GLIENKE et
al 2007)
21
361 Mancha Preta do Citros
A doenccedila mancha preta dos citros (MPC) foi descrita na Austraacutelia em 1985 por
Kiely posteriormente na Aacutefrica do Sul como consequumlecircncia da importaccedilatildeo de mudas da
Austraacutelia Atualmente estaacute distribuiacuteda em regiotildees subtropicais do mundo entre elas o
Brasil (GOacuteES et al 2005)
O ciclo da doenccedila (MPC) inicia-se com a disseminaccedilatildeo dos coniacutedios ou
picnidioacutesporos (esporos assexuais) e ascoacutesporos (esporos sexuais) do fungo
Guignardia citricarpa Os coniacutedios (picnidioacutesporos) satildeo responsaacuteveis pelas infecccedilotildees agrave
curta distacircncia e estatildeo localizados no interior dos picniacutedios oriundos dos frutos
infectados Um agregado de coniacutedios emerge atraveacutes da abertura do picniacutedio (ostiacuteolo)
dissolve-se na aacutegua da chuva orvalho ou irrigaccedilatildeo e cai sobre os pequenos frutos
susceptiacuteveis que se formam apoacutes as floradas Jaacute os ascoacutesporos satildeo responsaacuteveis pela
disseminaccedilatildeo agrave curta e longa distacircncia pois satildeo lanccedilados dos periteacutecios que se
formam em folhas caiacutedas ao solo e satildeo levados por correntes aeacutereas infectando
pequenos frutos susceptiacuteveis (ROBES 1990)
Em estudo epidemioloacutegico da MPC Spoacutesito et al (2008) analisou 27270 frutos
colhidos de 303 aacutervores quanto agrave incidecircncia da doenccedila (porcentagem de frutos doentes
por aacutervore) e quanto agrave severidade da doenccedila (aacuterea com sintoma do fruto) O autor
encontrou frutos doentes em 251 aacutervores das 303 analisadas (83) com diferentes
niacuteveis de incidecircncia Algumas aacutervores tinham a maioria das frutas com lesotildees
agregadas e de alta gravidade enquanto outras tinham a maioria das frutas com
poucas lesotildees e baixa gravidade Segundo os autores quando o agente patogecircnico eacute
disperso pela aacutegua da chuva esta pode transportar muitos esporos de uma vez
formando uma lesatildeo O padratildeo de sintomas resultantes a partir deste tipo de dispersatildeo
eacute tipicamente agregada Os autores concluiacuteram que os ascoacutesporos satildeo os mais
importantes inoacuteculos de G citricarpa
A MPC caracteriza-se por apresentar lesotildees com bordas salientes e com
depressatildeo no centro onde se observam pequenos pontos pretos os picniacutedios As
lesotildees podem atingir os frutos maduros ou no iniacutecio de maturaccedilatildeo podendo aparecer
22
apoacutes a colheita no transporte e armazenamento (ROBES et al 1995) A MPC afeta
apenas a casca do fruto e o flavedo (epicarpo) sem causar dano internamente limitado
pelo albedo (mesocarpo) Poreacutem sua comercializaccedilatildeo no mercado de frutas eacute
prejudicada assim como a sua exportaccedilatildeo devido agrave barreira fitossanitaacuteria existente na
Uniatildeo Europeacuteia por ser uma doenccedila quarentenaacuteria A1 Nos casos em que a doenccedila
atinge o pedicelo do fruto pode ocorrer agrave queda prematura do fruto aumentando as
perdas na produccedilatildeo e ateacute limitando seriamente a citricultura em vaacuterios estados
brasileiros (GOacuteES et al 2005 ROBES et al 1995)
Em funccedilatildeo dos prejuiacutezos causados por G citricarpa na comercializaccedilatildeo de
frutos in natura principalmente no mercado externo satildeo crescentes os estudos que
datildeo ecircnfase ao controle bioloacutegico da doenccedila
37 O Gecircnero Phomopsis sp
O gecircnero Phomopsis descrito em 1905 por (Sacc) Bubak (RIEDL 1981) forma
picniacutedios escuros com ostiacuteolo normalmente em forma de pecircra conidioacuteforos simples
alfa coniacutedios hialinos com gotas nas extremidades predominantemente elipsoacuteides sem
septos unicelulares de forma ovoacuteide Apresenta tambeacutem beta coniacutedios hialinos sem
gotas filiformes a maioria curvos em uma das extremidades sem septos (HANLIN e
MENEZES 1996)
Outra caracteriacutestica dos fungos do gecircnero Phomopsis eacute a formaccedilatildeo de linhas
negras estreitas em tecidos de plantas contaminadas assim como no meio de cultura
em que satildeo repicados (BRAYFORD 1990)
O gecircnero Phomopsis pertence ao filo Ascomycota subfilo Pezizomycotin classe
Sordariomycetes subclasse Sordariomycetidae ordem Diaporthales famiacutelia Valsaceae
mitosporic Valsaceae Apresenta-se na forma anamoacuterfica o seu teleomorfo eacute o
Diaporthe cujo habitat eacute o caule de plantas lenhosas e herbaacuteceas (HANLIN e
MENEZES 1996)
Espeacutecies de Phomopsis satildeo comumente encontradas como patoacutegenos e
endoacutefitos de plantas (BODDY e GRIFFITH 1989) Tradicionalmente o gecircnero tem sido
23
considerado altamente patogecircnico (REHNER e UECKER 1994) mas algumas
espeacutecies de Phomopsis satildeo entretanto endoacutefitos mutualiacutesticos (WEBBER e GIBBS
1984 CARROLL 1986)
Espeacutecie de Phomopsis e Diaporthe tecircm sido tradicionalmente descritos com
base na espeacutecie hospedeira Poreacutem algumas espeacutecies e isolados podem infectar mais
de um hospedeiro (BRAYFORD 1990 FARR CASTLEBURY e ROSSMAN 2002) tal
estrateacutegia tem sido frequentemente questionada (REHNER e UECKER 1994)
Trabalhos incluindo estudos de cruzamentos mostraram que esse criteacuterio natildeo eacute
suficiente para classificaccedilatildeo ao niacutevel de espeacutecie Aleacutem disso isolados de Phomopsis
provenientes do mesmo hospedeiro natildeo necessariamente pertencem agrave mesma espeacutecie
assim como uma mesma espeacutecie de Phomopsis pode infectar diferentes hospedeiros
(REHNER e UECKER 1994)
Foram descritas mais de 1000 espeacutecies do gecircnero Phomopsis baseado
principalmente na associaccedilatildeo com o hospedeiro (UECKER 1988) Embora o
hospedeiro seja atualmente considerado menos importante na definiccedilatildeo de espeacutecies
nenhuma revisatildeo do gecircnero foi realizada A fase teleomoacuterfica (Diaporthe) foi descrita
apenas para aproximadamente 20 das espeacutecies do gecircnero Phomopsis (PHILLIPS
2006) Essa ausecircncia da fase teleomorfica (Diaporthe) em meio de cultura
(principalmente quando isolado endofiticamente) torna a identificaccedilatildeo ao niacutevel de
espeacutecie neste gecircnero muito difiacutecil (REHNER e UECKER 1994)
Wehmeyer (1933) elaborou uma revisatildeo do gecircnero Diaporthe o autor
considerou a associaccedilatildeo com o hospedeiro uma caracteriacutestica de menor importacircncia
tendo reduzido de 650 para 70 o nuacutemero de espeacutecies no gecircnero No entanto este
estudo baseou-se unicamente em caracteriacutesticas morfoloacutegicas do teleomorfo natildeo tendo
sido consideradas as caracteriacutesticas do anamorfo
A delimitaccedilatildeo de espeacutecies de Phomopsis baseado apenas em caracteriacutesticas
morfoloacutegicas demonstrou-se inadequada (VAN DER AA 1990) Em adiccedilatildeo as
caracteriacutesticas de morfologia do coniacutedio e caracteriacutesticas da colocircnia usadas para
identificar espeacutecies alguns autores tecircm utilizado caracteres alternativos que incluem
virulecircncia (VIDIC 1991) proteiacutenas e sorologia (LEE e SNOW 1992 VELICHETI et al
24
1991) sequumlecircncias ITS (ZHANG et al 1998) e enzimas e metaboacutelitos secundaacuterios
(SHIVAS ALLEN e WILLIAMSON 1991) Infelizmente nenhum caraacuteter foi aplicaacutevel
para distinguir todos os grupos de isolados (REHNER e UECKER 1994)
O entendimento sobre o gecircnero expandiu-se por meio de estudos de sequumlecircncias
ITS nos quais alguns dos isolados agruparam-se por regiotildees geograacuteficas (REHNER e
UECKER 1994) Alguns trabalhos tecircm comparado dados morfoloacutegicos com dados
moleculares principalmente o uso de sequumlecircncias da regiatildeo ITS do DNA ribossomal
Zhang et al (1998) destingiu cinco taacutexons de Phomopsis isolados de Soja (Glycine
max) utilizando sequumlecircncias da regiatildeo ITS do DNA ribossomal poreacutem natildeo foram
capazes de diferenciar-los com base nas caracteriacutesticas morfoloacutegicas Farr et al (2002)
caracterizaram por anaacutelise molecular com o uso de sequumlecircncias ITS1 58S ITS2 e por
caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de Phomopsis sp isolados de Vaccinium
corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse estudo verificaram que a maioria dos
isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma vez que as sequumlecircncias agruparam-se
com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
Castlebury e Mengistu (2006) avaliaram Phomopsis isolados de soja e outros
hospedeiros combinando dados de sequumlecircncias de ITS do DNA ribossomal o
sequumlenciamento do gene EF1-alpha e genes de actina seis grupos de Phomopsis
foram formados desses trecircs correspondem aos taacutexons P longicolla Diaporthe
melonis e D phaseolorum Os autores concluiacuteram entatildeo que agrave ausecircncia de distinccedilatildeo
morfoloacutegica e informaccedilatildeo bioloacutegica torna problemaacutetica a identificaccedilatildeo de espeacutecies aos
grupos de isolados geneticamente distintos Aleacutem disso natildeo estaacute esclarecida a
importacircncia bioloacutegica e geneacutetica dos diferentes grupos e trabalhos adicionais quanto
aos hospedeiros patogenicidade e morfologia satildeo necessaacuterios para resolver a distinccedilatildeo
de espeacutecies neste gecircnero
O gecircnero Phomopsis eacute um importante grupo de fungos com potencial
biotecnoloacutegico devido agrave produccedilatildeo de importantes metaboacutelitos secundaacuterios entre os
quais se incluem o micotoxinas que afeta o sistema nervoso de vertebrados (BILLS et
al 2002) alcaloacuteides com capacidades farmacoloacutegicas tais como phomopsins
(COCKRUM PETTERSON e EDGAR 1994) e 24-diidroxi-56-dimetil benzoato de etila
25
e phomopsilactona produzidos por Phomopsis cassiae endofiacutetico de Cassia
specatabilis (SILVA et al 2005)
38 Marcadores Moleculares
A variabilidade geneacutetica em microrganismos pode ser detectada por teacutecnicas
claacutessicas ou moleculares As teacutecnicas claacutessicas baseiam-se na anaacutelise de fenoacutetipos a
partir da caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica (produccedilatildeo de coniacutedios crescimento radial da
colocircnia) ou bioquiacutemica (produccedilatildeo de substacircncias auxotrofias) restringindo a
possibilidade de se conduzir estudos populacionais e muitas vezes de sistemaacutetica As
teacutecnicas moleculares por sua vez fornecem ferramentas para evidenciar e entender
melhor diversos aspectos relacionados direta ou indiretamente com o DNA Desta
forma a anaacutelise dos aacutecidos nucleacuteicos vem sendo amplamente utilizada na diferenciaccedilatildeo
de organismos e no esclarecimento taxonocircmico e filogeneacutetico dos organismos
estudados
Os diversos meacutetodos de detecccedilatildeo de polimorfismo geneacutetico diretamente ao niacutevel
de aacutecidos nucleacuteicos tecircm permitido a anaacutelise molecular da variabilidade do DNA
determinando pontos de referecircncia nos cromossomos tecnicamente denominados
ldquomarcadores molecularesrdquo Por marcador molecular define-se todo e qualquer fenoacutetipo
molecular oriundo de um gene expresso ou de um segmento especiacutefico de DNA
(GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Os dados moleculares frequumlentemente complementam e corroboram hipoacuteteses
baseadas em estudos morfoloacutegicos embora algumas vezes os resultados obtidos da
anaacutelise de DNA sejam conflitantes com dados de anaacutelise exclusivamente feneacuteticas
Esta contradiccedilatildeo pode ser observada principalmente na classificaccedilatildeo taxonocircmica de
microrganismos (SAMUELES e SEIFERT 1995)
Algumas teacutecnicas moleculares utilizadas principalmente em fungos para a
detecccedilatildeo do polimorfismo geneacutetico de sequumlecircncias de DNA satildeo Eletroforese em Campo
Pulsado (PFGE) Polimorfismos dos fragmentos de Restriccedilatildeo (RFLPs) Polimorfismos
26
do DNA Amplificados ao Acaso (RAPDs) Sequumlenciamento das Regiotildees Internas
Transcritas (ITS1 e ITS2) do DNA ribossocircmico (rDNA)
Aleacutem de avaliarem a variabilidade geneacutetica estes marcadores moleculares
podem determinar relaccedilotildees filogeneacuteticas como tambeacutem colaborar na identificaccedilatildeo de
um determinado isolado Tais marcadores podem ser gerados independentemente do
fenoacutetipo e revelar polimorfismos altamente informativos em sequumlecircncias de DNA
A teacutecnica de RFLP surgiu a partir da descoberta de que os siacutetios para enzimas
de restriccedilatildeo poderiam ser polimoacuterficos ou seja alteraccedilotildees em um uacutenico par de bases
que muitas vezes satildeo neutras poderiam ser detectadas pela presenccedila ou ausecircncia
destes siacutetios para endonucleases Esta teacutecnica propiciou a introduccedilatildeo de um elevado
nuacutemero de marcadores moleculares nas anaacutelises de variabilidade geneacutetica (ALBERTS
et al 2004) Dentre as inuacutemeras aplicaccedilotildees dos marcadores RFLP pode-se citar o
estudo da evoluccedilatildeo dos genomas a identificaccedilatildeo de genes especiacuteficos o estudo de
geneacutetica de populaccedilotildees a taxonomia e obtenccedilatildeo de mapas geneacuteticos (MICHELEMORE
e HULBERT 1987) Entretanto seu uso torna-se limitado pois eacute necessaacuterio DNA de
alta qualidade e em grande quantidade (GLIENKE 1995)
O uso do DNA ribossomal (rDNA) como marcador molecular tambeacutem pode ser
empregado na anaacutelise da variabilidade geneacutetica para uma ampla faixa de niacuteveis
taxonocircmicos As sequumlecircncias codificantes do rDNA evoluem muito lentamente e satildeo
altamente conservadas possibilitando a sua utilizaccedilatildeo em estudos com organismos
pouco relacionados taxonomicamente Ao contraacuterio do rDNA as regiotildees espaccediladoras
internas destes genes conhecidas como ITS evoluem rapidamente apresentando alto
polimorfismo e sendo desta forma de grande interesse nos estudos filogeneacuteticos de
gecircneros espeacutecies e populaccedilotildees (WHITE e MORROW 1990)
A reaccedilatildeo em cadeia da polimerase (PCR) tornou-se uma das mais importantes e
utilizadas teacutecnicas em Biologia Molecular por apresentar rapidez baixo custo e
capacidade de amplificaccedilatildeo de pequenas quantidades de DNA (MULLIS e FALOONA
1987 WHITE e MORROW 1989)
Concebida por KARY MULLIS em meados da deacutecada de 80 a teacutecnica baseia-se
em amplificar fragmentos de sequumlecircncias de DNA com alta especificidade e fidelidade
27
utilizando oligonucleotiacutedeos especiacuteficos ou natildeo Tais oligonucleotiacutedeos delimitam a
sequumlecircncia de DNA gerando um sinal molecular que pode ser amplificado (MULLIS e
FALOONA 1987 WHITE e MORROW 1989 McPHERSON QUIRKE e TAYLOR
1991 GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
A PCR consiste em uma teacutecnica in vitro capaz de produzir muacuteltiplas coacutepias de
sequumlecircncias especificas de DNA Alterando-se as condiccedilotildees de reaccedilatildeo pode-se
amplificar cadeias simples de DNA detectar e distinguir entre genes portadores de
mutaccedilatildeo em uma uacutenica base ou proporcionar quantidades suficientes de DNA para
anaacutelise eou manipulaccedilatildeo subsequumlente (WALKER e RAPLEY 1999)
Uma das limitaccedilotildees da teacutecnica PCR eacute a necessidade do conhecimento preacutevio da
sequumlecircncia que flanqueia o segmento a ser amplificado para que os oligonucleotiacutedeos
possam ser construiacutedos (WATSON et al 1992 ALBERTS et al 2004) A teacutecnica de
RAPD entretanto natildeo apresenta este obstaacuteculo pois segundo Williams et al (1990)
esta teacutecnica baseia-se na amplificaccedilatildeo de segmentos de DNA por um uacutenico
oligonucleotiacutedeo de sequumlecircncia arbitraacuteria que amplifica vaacuterias regiotildees simultaneamente
381 Marcadores RAPD
O RAPD (polimorfismo do DNA amplificado ao acaso) envolve a utilizaccedilatildeo de
oligonucleotiacutedeos de sequumlecircncia arbitraacuteria que amplificam vaacuterias regiotildees do genoma
simultaneamente (WILLIAMS et al 1990 WELSH E MCCLELLAND 1990
VILARINHOS et al 1995 FUNGARO et al 1996 ALZATE-MARIN et al 1997
ABBASI et al 1999 PAAVANEM-HUHTALA AVIKAINEM e YLI-MATTILA 2000)
Dessa forma natildeo eacute necessaacuterio o desenvolvimento preacutevio de uma biblioteca de sondas
especiacuteficas para o organismo de interesse
A teacutecnica de RAPD utiliza o mesmo princiacutepio da PCR (SAIKI et al 1985) A
principal diferenccedila entre a PCR usual e o RAPD estaacute na reaccedilatildeo de amplificaccedilatildeo que
utiliza apenas um uacutenico oligonucleotiacutedeo com sequumlecircncia arbitraacuteria de 10 a 15 bases A
amplificaccedilatildeo somente ocorre se este oligonucleotiacutedeo for complementar a um siacutetio em
uma das fitas e complementar a um mesmo siacutetio (orientaccedilatildeo invertida) na outra fita de
28
DNA (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998) Segundo Williams et al (1993) o tamanho
ideal do oligonucleotiacutedeo para amplificaccedilatildeo de RAPD eacute em torno de dez bases
devendo seu conteuacutedo GC ser em torno de 50 a 70 e no miacutenimo de 40 Aleacutem disso
os oligonucleotiacutedeos natildeo devem conter sequumlecircncias palindrocircmicas a fim de evitar o
autopareamento
Os marcadores RAPD tecircm sido amplamente utilizados para o estudo de diversos
grupos de seres vivos A partir dos marcadores moleculares clonados e sequumlenciados
haacute a possibilidade de sintetizar oligonucleotiacutedeos especiacuteficos aumentando o seu poder
de resoluccedilatildeo (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Esses marcadores permitem caracterizar e avaliar o grau de similaridade
geneacutetica entre genoacutetipos em niacuteveis inter e intraespeciacuteficos sendo altamente sensiacuteveis
quanto diferenccedilas de ateacute um uacutenico nucleotiacutedeo entre o oligonucleotiacutedeo e o DNA molde
Permitem ainda analisar a estrutura geneacutetica de populaccedilotildees naturais populaccedilotildees de
melhoramento e bancos de germoplasma a construccedilatildeo de mapas geneacuteticos de alta
cobertura genocircmica a localizaccedilatildeo de genes de interesse econocircmico e ainda a
obtenccedilatildeo de novos marcadores para diagnoacutesticos via PCR (FUNGARO e VIEIRA 1998
FUNGARO 2000 GLIENKE-BLANCO et al 2002 ANCHORENA-MATIENZO 2002)
Diferentes niacuteveis taxonocircmicos podem ser inferidos atraveacutes de marcadores
RAPD cujos padrotildees podem apresentar-se como variaacuteveis quando polimoacuterficos e
constantes quando natildeo-polimoacuterficos
Avaliando a variabilidade geneacutetica de organismos geneticamente relacionados
diversos autores confrontaram resultados obtidos a partir de anaacutelises moleculares ao
niacutevel de proteiacutenas com os dados obtidos a partir de marcadores moleculares de DNA
Meijer Megnegneau e Linders (1994) estudando linhagens de Phomopsis subordinaria
isoladas de 23 localidades diferentes chegaram a resultados conflitantes obtidos por
RAPD e isoenzimas Os marcadores de RAPD mostraram alta similaridade entre 47
linhagens de P subordinaria isoladas de oito localidades diferentes enquanto a anaacutelise
por isoenzimas sugeriu que todas as linhagens eram idecircnticas
Jaacute Pioli et al (2003) caracterizaram por RAPD isolados do complexo
DiaporthePhomopsis coletados de soja na Argentina Eles foram separados em quatro
29
grupos (i) Diaporthe phaseolorum variedade meridionalis (ii) D phaseolorum variedade
caulivora (iii) D phaseolorum variedade sojae and (iv) Phomopsis longicolla revelando
a existecircncia de variabilidade entre isolados da mesma variedade
Fernandez e Hanlin (1996) obtiveram resultados concordantes entre a anaacutelise
molecular por RAPD e as caracteriacutesticas morfoculturais separando os isolados
coletados de soja em dois grupos Diaporthe phaseolorum e Phomopsis longicolla
Os marcadores de RAPD tambeacutem podem ser usados na anaacutelise de
recombinantes obtidos por parameiose em Beauveria bassiana (DALZOTO et al 2003)
A teacutecnica RAPD tambeacutem eacute utilizada como um meacutetodo eficiente na diferenciaccedilatildeo
de microrganismos patogecircnicos e natildeo patogecircnicos Guthirie et al (1992) e Vasconcelos
(1994) caracterizaram diferentes espeacutecies do gecircnero Colletotrichum diferenciando-as
quanto agrave sua patogenicidade
Grajal-Martin Simon e Muehlbauer (1993) conseguiram diferenciar o tipo 2 de
Fusarium oxysporum f sp pisi de trecircs outros grupos por marcadores RAPDs Da
mesma maneira isolados patogecircnicos de Fusarium oxysporum f sp dianthi que
atacam cravos puderam ser distinguidas de vaacuterios natildeo patogecircnicos por marcadores
RAPD (MANULIS et al 1993)
Blanco (1999) utilizando seis oligonucleotiacutedeos de RAPD confirmou a existecircncia
de trecircs populaccedilotildees distintas de Guignardia citricarpa coexistindo em citros sendo duas
endofiacuteticas e uma patogecircnica responsaacutevel pelas lesotildees da mancha preta nos citros
Glienke-Blanco et al (2002) utilizando sete oligonucleotiacutedeos de RAPD encontraram
alta variabilidade geneacutetica em linhagens endofiacuteticas de Guignardia citricarpa isoladas
de plantas assintomaacuteticas de citros
382 Marcadores ITS
O DNA ribossocircmico contido nas regiotildees organizadoras de nucleacuteolos (NOR) tem
sido objeto de um grande nuacutemero de estudos com diversas aplicaccedilotildees em geneacutetica
evoluccedilatildeo e melhoramento Tal interesse estaacute diretamente relacionado agrave estrutura
destas regiotildees que se encontram em locais especiacuteficos do genoma e repetidos em
30
sequumlecircncia inuacutemeras vezes A funccedilatildeo do rDNA eacute codificar as diferentes moleacuteculas de
RNA ribossocircmico (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Segundo White et al (1990) as regiotildees espaccediladoras internas do DNA
ribossomal (ITS) evoluem rapidamente apresentando alto polimorfismo ao contraacuterio
do rDNA e sendo assim essas regiotildees satildeo de grande interesse nos estudos
filogeneacuteticos em niacuteveis de gecircnero espeacutecies e populaccedilotildees Esta caracteriacutestica permite
ainda a sua utilizaccedilatildeo na obtenccedilatildeo de polimorfismos de comprimento de fragmentos
(RFLP) nos loci de rDNA O nuacutemero de coacutepias de uma determinada sequumlecircncia de
rDNA e variaccedilotildees de nucleotiacutedeos nestas sequumlecircncias tambeacutem tecircm sido utilizados em
tais estudos (FERREIRA 1994)
Orsquodonnell e Gray (1995) avaliaram a relaccedilatildeo filogeneacutetica e a variaccedilatildeo geneacutetica
dentro de 24 isolados do complexo Fusarium solani por meio da sequecircncia de rDNA e
marcador RFLP e concluiacuteram que esta espeacutecie eacute formada por espeacutecies filogeneacuteticas
distintas Utilizando a mesma teacutecnica Ouellet e Seiffert (1993) diferenciaram F
graminearum de outras 11 espeacutecies que atacam trigo aleacutem de terem permitido a
identificaccedilatildeo de diversas raccedilas desta espeacutecie provenientes de isolados
morfologicamente semelhantes
Jasalavich Ostrofskf e Jellison (2000) utilizaram os oligonucleotiacutedeos ITS1 e
ITS4 (especiacutefico para basidiomicetos) na identificaccedilatildeo de microrganismos A
amplificaccedilatildeo da regiatildeo ITS1-58S-ITS2 detectou a presenccedila de basidiomicetos em
diferentes amostras Testes complementares foram realizados no produto da
amplificaccedilatildeo por meio da teacutecnica de RFLP permitindo a identificaccedilatildeo de espeacutecie
Satoko et al (2000) e Promputtha et al (2005) utilizaram a regiatildeo ITS1 58S e
ITS2 do rDNA para identificar fungos endofiacuteticos que natildeo esporularam sendo relatados
como Phomopsis e Diaporthe (anamoacuterfico Phomopsis)
Farr Castlebury e Rossman (2002) caracterizaram por anaacutelise molecular com o
uso de sequumlecircncias ITS1 58S ITS2 e por caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de
Phomopsis sp isolados de Vaccinium corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse
estudo verificaram que a maioria dos isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma
vez que as sequumlecircncias agruparam-se com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
31
Mostert et al (2001) tambeacutem usaram anaacutelise filogeneacutetica das regiotildees 58S ITS1
e ITS2 e DNA mitocondrial para elucidar a taxonomia de espeacutecies de Phomopsis
obtidas de vinhedos Eles observaram que os fungos endofiacuteticos tratavam-se de
Diaporthe perjuncta e Phomopsis sp taacutexon 1 Jaacute os isolados patogecircnicos e com alta
virulecircncia pertenciam a espeacutecie Phomopsis viticola assim como os isolados descritos
em estudos anteriores como Phomopsis taacutexon 2 Eles tambeacutem puderam elucidar que
os isolados descritos na Austraacutelia como Phomopsis taacutexon 4 tratavam-se de Libertella
sp excluindo-o do complexo P viticola
Djaouida et al (2004) sequenciaram as regiotildees ITS1 58S e ITS2 e do gene
mitocondrial atp6 para avaliar a diversidade molecular de linhagens patogecircnicas contra
o girassol de Diaporthe helianthi (anamoacuterfico Phomopsis helianthi) isolados de
diferentes origens geograacuteficas
32
4 MATERIAL E MEacuteTODOS 41 Material Bioloacutegico 411 Fungos endofiacuteticos
Quarenta e oito isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp e um de Diaporthe sp
foram utilizados neste estudo (TABELA 1) Destes oito foram cedidos cordialmente pela
Dra Kaacutetia Rodriguez e foram isolados de Spondias mombin (Cajazeiro) Myracrodruon
urundeuva (Aroeira) e Aspidosperma tomentosum (Peroba-de-campos) e dois isolados
de Maytenus ilicifolia (Espinheira Santa) cedidos gentilmente pela Dra Socircnia Pileggi
Dezessete isolados foram obtidos de amostras de folhas de Schinus terebinthifolius
(Aroeira Vermelha) coletados em 2007 pelo MsC Jocinei Lima e fazem parte do banco
bioloacutegico do Laboratoacuterio de Geneacutetica de Microrganismos (LABGEM) da Universidade
Federal do Paranaacute Curitiba Paranaacute Vinte e um isolados de Phomopsis sp e um
isolado de Diaporthe sp foram obtidos como endoacutefitos de folhas e peciacuteolos de M
ilicifolia (espinheira santa) em quatro coletas de outubro de 2006 a julho de 2007 no
Centro Nacional de Pesquisa de Floresta (CNPF) da EMBRAPA (Empresa Brasileira de
Pesquisa Agropecuaacuteria) localizada no municiacutepio de Colombo Paranaacute Dois isolados de
Phomopsis patoacutegenos de soja foram utilizados como linhagens referecircncia (TABELA 1)
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUA)
Coacutedigo Hospedeiro Procedecircncia Isolados por SM9631 Spondias mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9713 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9638 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9714 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)MU0123 Myracrodruon urundeuva Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)AT9810 Aspidosperma Jardim Botacircnico do Dra Kaacutetia Rodriguez do
33
tomentosum Rio de JaneiroRJ IOC (FIOCRUZRJ)AT9811 A tomentosum Jardim Botacircnico do
Rio de JaneiroRJ Dra Kaacutetia Rodriguez do IOC (FIOCRUZRJ)
AT9906 A tomentosum Jardim Botacircnico do Rio de JaneiroRJ
Dra Kaacutetia Rodriguez do IOC (FIOCRUZRJ)
ES80J Maytenus ilicifolia ColomboPR Dra Socircnia A V Pileggi no LABGEMPR
ESPAC22 Maytenus ilicifolia ColomboPR Dra Socircnia A V Pileggi no LABGEMPR
A135 Schinus terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A113 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A115B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A323 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A123 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A131 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A216B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A126 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A333B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A134 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A132 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A333A S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A124 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A215A S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A116 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A334 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A321 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
ES2WF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2WC1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2KF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2NA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUACcedilAtildeO)
34
ES2AB1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESBA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESDF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFH1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFB2 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESGA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESGF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESIE1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESIA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJH1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJG1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJE1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJE2 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESKD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESRD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESSD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
PHO1 (Phomopsis longicolla)
Glycine max (L) Merr Mato Grosso Dr Aacutelvaro Almeida EMBRAPALondrina-PR
PHO19 Glycine max (L) Merr Roraima Dr Aacutelvaro Almeida EMBRAPALondrina-PR
FONTE O autor
NOTA patoacutegenos de soja
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUACcedilAtildeO)
35
412 Microrganismos usados para teste de antagonismo
Para determinar a atividade antimicrobiana dos isolados foram utilizadas as
seguintes linhagens teste G citricarpa linhagens PC1396 e PC3305 pertencentes ao
banco bioloacutegico do Laboratoacuterio de Geneacutetica de Microrganismos da Universidade
Federal do Paranaacute
413 Fungos endofiacuteticos utilizados para anaacutelise de variabilidade geneacutetica
Como grupo externo para anaacutelise de variabilidade geneacutetica por RAPD foram
utilizadas cinco linhagens de Pestalotiopsis sp (TABELA 2)
TABELA 2 ISOLADOS GRUPO EXTERNO PARA ANAacuteLISE DE VARIABILIDADE GENEacuteTICA POR RAPD
Coacutedigo Hospedeiro Procedecircncia Pestalotiopsis phothiniae Gustavia cf eliacuteptica Amazonia Pestalotiopsis neglecta voucher Muraya paniculata Amazonia Pestalotiopsis vismeae Maytenus ilicifolia Paranaacute Pestalotiopsis sp 3 Maytenus ilicifolia Paranaacute Pestalotiopsis sp 11 Maytenus ilicifolia Paranaacute FONTE O autor NOTA Isolado cedidos pelo Profordm Dr Joseacute Odair Pereira da Universidade Federal do Amazonas Isolados por Josiane Gomes Figueiredo no LABGEMPR 42 Meios de Cultura 421 Caldo MEB (Extrato de Malte)
Extrato de Malte 20g
Glicose 20g
Peptona 1g
Aacutegua destilada p1000mL
36
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
422 Meio AV (Aveia-Aacutegar) Aveia 300 g
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
A aveia foi fervida durante 30 minutos com metade do volume da aacutegua A
suspensatildeo foi filtrada com gaze Adicionou-se aacutegua para completar o volume O pH foi
ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a necessidade
Acrescentou-se o aacutegar
423 Meio BDA (Meio Batata-Dextrose-Aacutegar)
Batata 2000g
Dextrose 100g
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
As batatas foram cozidas em 500 mL de aacutegua destilada durante 20 minutos Em
seguida foram filtradas com gaze adicionou-se a dextrose ao caldo e completou-se
com aacutegua destilada para 1000 mL O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N
eou HCl 1N conforme a necessidade Acrescentou-se o aacutegar
37
424 Meio MC (Meio Completo) PONTECORVO et al 1953
NaNO3 60g
KH2PO4 15g
KCl 05g
MgSO47H2O 05g
FeSO4 002g
ZnSO4 002g
Glicose 100g
Peptona 20g
Extrato de levedura 20g
Caseiacutena hidrolisada 15g
Soluccedilatildeo de vitaminas 10mL
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
425 Meio MEA (Extrato de Malte) PATERSON e BRIDGE 1994
Extrato de Malte 20g
Glicose 20g
Peptona 1g
Agar 15g
Aacutegua destilada p1000mL
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
38
OBS Todos os meios de cultura foram autoclavados durante 20 minutos a 1 atm e
armazenados em temperatura ambiente
43 Soluccedilotildees e Reagentes 431 Clorofane ndash FenolClorofoacutermio (11)
432 Clorofil ndash ClorofoacutermioAacutelcool Isoamiacutelico (241)
433 Derozal Bayerreg - 1mg de carbendazim em 1mL de aacutegua destilada
434 Dodecil Sulfato de Soacutedio (SDS) 10 (pv) em aacutegua destilada
435 Fenol Saturado
Um volume de fenol cristalizado foi dissolvido em banho-maria a 60degC e
acrescentado um volume de tampatildeo Tris-HCl 02 M pH 80 Apoacutes agitaccedilatildeo por 30
minutos a fase aquosa foi retirada e entatildeo acrescentado um volume de tampatildeo Tris-
HCl 02 M pH 80 Este processo foi repetido ateacute atingir o pH desejado (pH 80) Em
seguida foi adicionado um volume final de 110 do tampatildeo Tris-HCl 02 M pH 80 e
estocado em frasco escuro a uma temperatura de 4degC usado apoacutes 48 horas
(SAMBROOK E MANIATS 1989)
436 Gel de Agarose 08 (pv) em Tampatildeo TBE 1x
437 Gel de Agarose15 (pv) em em Tampatildeo TBE 1x
438 Lactofenol azul Aacutecido laacutetico 200 g
Cristais de fenol 200 g
Glicerina 200 g
39
Azul de algodatildeo (Metyl Blue Difco) 005 g
Aacutegua destilada 200 mL
Os cristais de fenol foram derretidos em banho-maria Adicionaram-se os demais
componentes Depois de 24 horas filtrou-se e armazenou-se em frasco escuro
439 Marcador de peso molecular (DNA de fago lambda clivado com Hind III Gibco)
O marcador de peso molecular do DNA foi fornecido concentrado e no momento
do uso diluiu-se na proporccedilatildeo de 1 μL do marcador 1 μL do tampatildeo da amostra 4 μL
de aacutegua Milli-Q esterilizada Na corrida eletroforeacutetica foi utilizado 6 μL do marcador
4310 Marcador de peso molecular (DNA Ladder 100pb Ludwing Biotec)
O marcador de peso molecular foi fornecido concentrado e no momento do uso
diluiu-se na proporccedilatildeo de 1 μL do marcador 2 μL do tampatildeo da amostra 7 μL de aacutegua
Milli-Q autoclavada Na corrida eletroforeacutetica foram utilizados 15 μL do marcador
4311 Oligonucleotiacutedeos (Invitrogen)
Foi adicionado Tris-HCl 10 mM pH70 aos oligonucleotiacutedeos para obter uma
soluccedilatildeo estoque com 50 μM No momento do uso a soluccedilatildeo estoque foi diluiacuteda para
concentraccedilatildeo final de 4μM
4312 RNAse (invitrogen)
A soluccedilatildeo foi preparada na concentraccedilatildeo de 10 mM de Tris-HCl pH 75 e 15 mM
de NaCl Aqueceu-se a 100degC por 15 minutos e estocou-se a ndash 20degC
40
4313 Soluccedilatildeo de Vitaminas Aacutecido Nicotiacutenico 1000 mg
Aacutecido para Aminobenzoacuteico 100 mg
Biotina 02 mg
Piridoxina 500 mg
Riboflavina 1000 mg
Tiamina 500 mg
Aacutegua destilada esterilizada p 1000 mL
A soluccedilatildeo foi aquecida em banho-maria a 98degC por 15 minutos e armazenada em
frasco escuro previamente autoclavado a 4degC
4314 Soluccedilatildeo de NaCl 085 (pv) em aacutegua destilada
4315 Soluccedilatildeo Tween-80 01 (vv) em aacutegua destilada
4316 Soluccedilatildeo de Tetraciclina 5 (pv) em etanol absoluto Preparou-se a soluccedilatildeo sob
agitaccedilatildeo e estocou-se em frasco escuro a ndash 20degC
4317 Soluccedilatildeo de EDTA 05M em aacutegua destilada O pH foi ajustado para 80
adicionando-se NaOH 1N
4318 Soluccedilatildeo de brometo de etiacutedio 1 (pv) em aacutegua destilada O brometo de etiacutedio
foi dissolvido em aacutegua destilada agitou-se e estocou-se a temperatura ambiente
protegido de luz No momento do uso adicionou-se 3μL desta soluccedilatildeo a 100 mL de
tampatildeo TBE (1X)
41
4319 Tampatildeo TE (Tris-EDTA)
Tris-HCl pH 80 100 mM
EDTA pH 80 10 mM
4320 Tampatildeo de Extraccedilatildeo de DNA Tris-HCl pH 80 2000 mM
EDTA pH 80 250 mM
NaCl 2500 mM
SDS (pv) 1
O tampatildeo de Extraccedilatildeo foi preparado no momento do uso
4321 Tampatildeo da Amostra (6x)
Azul de bromofenol3 1000 mL
Glicerol 1035 mL
Aacutegua destilada p 50 mL
4322 Tampatildeo de corrida TBE 10x
Trizma base 54g
Aacutecido boacuterico 275g
EDTA 465g
Aacutegua Milli-Q p 500mL
A soluccedilatildeo foi autoclavada e estocada a temperatura ambiente No momento do
uso diluiu-se 10 vezes com aacutegua Milli-Q
42
44 Isolamento
A metodologia utilizada para o isolamento dos microrganismos endofiacuteticos foi
descrita por Petrini (1991) modificada por Glienke (1995) Os diferentes oacutergatildeos da
planta temperatura de incubaccedilatildeo nuacutemero de plantas e o de fragmentos plaqueados
estatildeo listados na tabela 3
Isolamento Eacutepoca do ano Oacutergatildeo da
planta Temperatura
de incubaccedilatildeo
Nuacutemero de Plantas
Nuacutemero de fragmentos plaqueados
1 Outubro de 2006 Folha 28deg C 20 360 2 Marccedilo de 2007 Folha 22-23deg C 30 540 3 Julho de 2007 Folha 22-23deg C 20 360 4 Julho de 2007 Peciacuteolo 22-23deg C 20 160
Total de fragmentos plaqueados 1360
FONTE O autor
Os fungos foram isolados de plantas aparentemente sadias com folhas sem
marcas arranhaduras ou ferimentos Apoacutes a coleta as folhas foram colocadas em
sacos plaacutesticos devidamente identificados em seguida as superfiacutecies das folhas foram
lavadas em aacutegua corrente com auxiacutelio de uma esponja para a remoccedilatildeo dos
microrganismos epifiacuteticos e outros contaminantes Os peciacuteolos foram vedados com
parafina derretida para evitar a entrada dos desinfetantes nos seus tecidos internos
desta forma preservando os endoacutefitos a serem isolados As folhas vedadas foram
mergulhadas em frascos com aacutegua destilada autoclavada sendo mantidos por 1
minuto em etanol 70 por 1 minuto em hipoclorito de soacutedio (NaOCl) a 3 por 6
minutos etanol 70 por 30 segundos e por uacuteltimo em aacutegua destilada autoclavada por
6 minutos Devido agrave dificuldade de isolar fungos do gecircnero Phomopsis nos isolamentos
1 e 2 foi reduzido o tempo de tratamento com hipoclorito de soacutedio para 4 minutos nos
isolamentos 3 e 4 (TABELA 3) As folhas foram cortadas em seis fragmentos de 5-7 mm
e os peciacuteolos foram cortados das folhas e oito deles foram transferidos para placas de
TABELA 3 EacutePOCAS DO ANO OacuteRGAtildeOS DA PLANTA CONDICcedilOtildeES DE INCUBACcedilAtildeO E NUacuteMERO DE FRAGMENTOS PLAQUEADOS NAS QUATRO COLETAS DE ENDOacuteFITOS DE ESPINHEIRA-SANTA
43
Petri (90 mm) contendo os meios de cultura BDA adicionados de Tetraciclina (10
mgmL) para impedir o crescimento bacteriano (ARAUJO et al 2002)
Como controle apoacutes o processo de desinfestaccedilatildeo foram inoculados 01 mL da
uacuteltima aacutegua autoclavada utilizada no tratamento em trecircs placas de Petri As placas
permaneceram incubadas nas mesmas condiccedilotildees do isolamento
45 Conservaccedilatildeo dos fungos
Os isolados foram estocados utilizando-se duas metodologias 1) em frascos
contendo meio de cultura BDA inclinado apoacutes sete dias de crescimento a 28degC foram
mantidos a 4degC realizando-se repiques mensalmente 2) em frascos contendo aacutegua
destilada esterilizada com 12 discos de 5 mm meio de cultura BDA contendo miceacutelios
Repetiu-se o procedimento a cada trecircs meses
46 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica
A caracterizaccedilatildeo macromorfoloacutegica dos isolados de Phomopsis foi realizada com
base na forma dos bordos crescimento micelial aspecto da colocircnia e a sua coloraccedilatildeo
no verso e reverso da placa em diferentes meios de cultura Discos de miceacutelio (8 mm)
provenientes de colocircnias de Phomopsis com sete dias de crescimento em meio de
cultura BDA foram inoculados no centro de placas de Petri com diferentes meios de
cultura Batata-dextrose-aacutegar (BDA) aveia-aacutegar (MAV) e extrato de malte-aacutegar (MEA)
Foram incubados durante 14 dias a 22ordmC sob luz contiacutenua Os ensaios foram
realizados em triplicata O diacircmetro das colocircnias foi medido a partir do terceiro dia de
crescimento ateacute o quinto dia quando alguns atingiram completamente as bordas da
placa de Petri
Para anaacutelise da micromorfologia foram avaliados os coniacutedios apoacutes 21 dias de
crescimento Os picniacutedios foram comprimidos entre a lacircmina e a lamiacutenula com uma
gota de lactofenol azul de algodatildeo possibilitando a observaccedilatildeo ao microscoacutepio oacuteptico
44
com aumento de 1000x O comprimento e largura dos coniacutedios foram medidos usando
uma reacutegua na objetiva com escala de 1μM
47 Obtenccedilatildeo de colocircnia monospoacuterica
Apoacutes os isolados terem sido identificados como pertencentes ao gecircnero
Phomopsis colocircnias monospoacutericas foram obtidas cultivando os isolados endofiacuteticos em
placas de Petri com meio BDA a 28degC Observou-se o crescimento da colocircnia e
monitorou-se com observaccedilatildeo em microscopia oacuteptica a produccedilatildeo de esporos Os
picniacutedios foram coletados e macerados em soluccedilatildeo de ldquoTween 80rdquo 01 A suspensatildeo
de esporos foi filtrada com seringas contendo latilde de vidro Em seguida adicionou-se 10
mL de soluccedilatildeo salina Centrifugou-se a soluccedilatildeo filtrada durante 4 minutos a 7000 rpm
Descartou-se o sobrenadante adicionou-se 400 μL de soluccedilatildeo salina para suspender o
precipitado onde ficaram contidos os esporos retirou-se 10 μL desta suspensatildeo sendo
a concentraccedilatildeo estimada em Cacircmara de Neubauer Quando necessaacuterio diluiu-se em
soluccedilatildeo salina para viabilizar a contagem dos esporos Foram semeados 100 μL de
suspensatildeo em uma placa de Petri contendo meio BDA espalhou-se com alccedila de
Drigalsky incubou-se a 28degC Colocircnias isoladas foram selecionadas e repicadas em
tubos com BDA inclinado que apoacutes crescimento por sete dias a 28ordmC foram mantidos a
4degC
48 Caracterizaccedilatildeo Molecular 481 Extraccedilatildeo do DNA (RAEDER e BRODA 1985 modificado por GLIENKE 1995)
O DNA genocircmico foi obtido de acordo com a metodologia descrita por Raeder e
Broda (1985) modificada por Glienke (1995) Os isolados endofiacuteticos de Phomopsis
foram cultivados em meio MEA durante cinco dias a 28degC O miceacutelio obtido a partir da
raspagem da colocircnia com espaacutetula esterilizada foi liofilizado e mantido em freezer ou na
45
sequumlecircncia macerados com adiccedilatildeo de nitrogecircnio liacutequido O material foi pesado e para
cada grama de miceacutelio acrescentou-se 1 mL de Tampatildeo de Extraccedilatildeo Incubou-se a
soluccedilatildeo homogeneizada durante 20 minutos em banho-maria a 70degC Acrescentou-se
um volume de fenol saturado misturaram-se as fases e centrifugou-se durante 15
minutos a 5000 rpm Coletou-se a fase aquosa colocou-se em um novo tubo e
adicionou-se a este um volume de Clorofane Centrifugou-se novamente sob as
mesmas condiccedilotildees anteriores Coletou-se a fase aquosa como na etapa anterior e
adicionou-se um volume de Clorofil repetindo-se o processo de centrifugaccedilatildeo sob as
mesmas condiccedilotildees Coletou-se a fase aquosa em um novo tubo e adicionou-se etanol
absoluto O material foi incubado a ndash 20ordmC durante uma hora Apoacutes este periacuteodo a
suspensatildeo foi centrifugada (10000 rpm por 20 min) desprezou-se o sobrenadante
Acrescentou-se 500 μL de etanol 70 centrifugou-se a 10000 rpm durante 5 minutos
descartou-se o aacutelcool 70 inverteu-se o tubo sobre uma folha de papel absorvente
para secar a borda do tubo e este secou a uma temperatura de 37degC durante 30
minutos Ressuspendeu-se o DNA com 200 μL de aacutegua milli-Q por uma hora
temperatura ambiente As amostras foram tratadas RNAse (30 μgmL) a 37degC por uma
hora
A concentraccedilatildeo de DNA foi estimada por meio de eletroforese em gel de agarose
08 utilizando como padratildeo de peso molecular o DNA do fago λ (Gibco) clivado com
HindIII com concentraccedilatildeo conhecida Apoacutes a eletroforese o gel foi corado com brometo
de etiacutedio observado sobre transiluminador de luz ultravioleta e fotodocumentado
482 RAPD
As soluccedilotildees foram realizadas de acordo com as condiccedilotildees descritas por Glienke-
Blanco et al (2002) onde foram utilizados 50ng de DNA tampatildeo PCR 1x 05U de Taq
polimerase 02mM de oligonucleotideos 02mM de dNTP 3mM de MgCl2 em um
volume final de 25microL Foi realizada uma preacutevia seleccedilatildeo usando-se os oligonucleotiacutedeos
46
da linha OPX11 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) OPX14 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) OPX19 (5rsquo
TCACCACGGT 3rsquo) e OPE 08 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) da Operon Technologiesreg
A amplificaccedilatildeo foi realizada com as condiccedilotildees descritas por Pioli et al (2003)
com modificaccedilotildees sendo cada reaccedilatildeo submetida a 40 ciclos apoacutes a desnaturaccedilatildeo
inicial a 940C por 4 minutos Cada ciclo consiste de 1 minuto a 940C 1 minuto e 30
segundos a 350C e 2 minutos a 720C
4821 Anaacutelise da Variabilidade Geneacutetica
Os produtos de amplificaccedilatildeo foram separados por eletroforese (3 Vcm) em gel
de agarose 15 e posteriormente corados por 20 minutos com soluccedilatildeo de brometo de
etiacutedio Os fragmentos amplificados foram visualizados em um transiluminador de luz
Ultravioleta e a imagem do gel documentada atraveacutes de sistema fotograacutefico Digi-doc it
O marcador de peso molecular utilizado foi o Ladder de 100 pb (Ludwing Biotec)
A anaacutelise da variabilidade geneacutetica foi realizada pelo agrupamento das linhagens
segundo os princiacutepios adotados em taxonomia numeacuterica utilizando o coeficiente de
similaridade de Jaccard que permite calcular similaridades com base em variaacuteveis
binaacuterias (0 para ausecircncia e 1 para presenccedila de banda) As bandas foram consideradas
como variaacuteveis enquanto as linhagens como unidades O coeficiente foi calculado
segundo a foacutermula J=MP onde M eacute o nuacutemero de concordacircncias positivas e P o
nuacutemero total de variaacuteveis menos concordacircncias negativas (SNEATH e SOKAL 1973)
Desta forma o coeficiente de similaridade Jaccard (J) leva em conta apenas as
discordacircncias e as concordacircncias positivas quanto agrave presenccedila ou ausecircncia de bandas
desconsiderando as concordacircncias negativas Quanto maior a semelhanccedila entre duas
linhagens maior eacute o valor de similaridade As unidades foram agrupadas atraveacutes do
meacutetodo UPGMA (Unweighted Pair-Group Method with Arithmetical Average) que eacute um
modelo de agrupamento hieraacuterquico e permite a construccedilatildeo de dendrogramas
(SNEATH e SOKAL 1973) Matrizes e dendrogramas foram elaborados usando o
software NTSYS (Numerical taxonomy system of multivariate programs) (ROHLF
1988)
47
Para verificar a consistecircncia dos agrupamentos verificados foi realizada uma
anaacutelise bootstrap segundo Felsenstein (1985) utilizando o software BOOD (COELHO
2005)
483 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
4831 Amplificaccedilatildeo
A reaccedilatildeo foi realizada com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D (TABELA 4) que
satildeo universais para fungos e permitem amplificar a regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do DNA
Ribossomal
Oligonucleotiacutedeos Sequumlecircncia
LS266 5 TTACGTCCCTGCCCTTTGTA 3
V9D 5GCATTCCCA AA C AACTCGAC 3rsquo
FONTE O autor
As condiccedilotildees da reaccedilatildeo foram realizadas de acordo com a descriccedilatildeo de White et
al (1990) com algumas modificaccedilotildees 50 ng de DNA tampatildeo PCR 1x 15U de Taq
DNA polimerase 08microM de oligonucleotiacutedeos 02mM de dNTP 3mM de MgCl2 para um
volume final de 50microL
A amplificaccedilatildeo foi realizada em um termociclador Eppendorf (Modelo
Mastercycler Gradiente) com desnaturaccedilatildeo inicial a 94degC por 2 minutos 30 ciclos de 30
segundos a 94degC 1 minuto a 56degC 1 minuto a 72degC seguida de extensatildeo final de 3
minutos a 72degC
TABELA 4 SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA AMPLIFICACcedilAtildeO DAREGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL
48
4832 Purificaccedilatildeo da PCR
Foram testadas duas metodologias de purificaccedilatildeo da reaccedilatildeo de PCR
48321 Purificaccedilatildeo com PEG
Aos produtos da amplificaccedilatildeo da PCR com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D
foram acrescentados 50microL de PEG os tubos foram incubados a 37ordmC por 30 minutos
em seguida foram centrifugados por 15 minutos a 14000rpm O sobrenadante foi
descartado com micropipeta Adicionou-se 125microL de Etanol 80 gelado apoacutes 1min os
tubos foram centrifugados por 2 min a 13000 rpm descartou-se o sobrenadante Foram
adicionados 125microL de Etanol 96 (gelado) descartou-se o sobrenadante O Etanol foi
evaporado em speed vac por 10min a 70ordmC O pellet foi ressuspendido em 15 microL de
aacutegua Milli-Q e misturado em seguida ficou agrave temperatura ambiente por pelo menos 2
horas
Para confirmaccedilatildeo da presenccedila do DNA na amostra 1microL foi submetido agrave
eletroforese em gel de agarose 15
48322 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio
Aos produtos da amplificaccedilatildeo da PCR com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D
foram acrescentados 34 microL de acetato de amocircnio (AcNH4) 75M e 100 microL de etanol
96 Os tubos ficaram em temperatura ambiente por 10 minutos e em seguida foram
centrifugados por 15 minutos a 14000rpm Os pellets resultantes foram lavados com
250 microL de etanol 70 (receacutem preparado) centrifugou-se por 15 minutos a 14000rpm e
descartou-se o etanol O pellet foi seco na estufa a 37ordmC por 30 mim e ressuspendidos
em 15microL de aacutegua Milli-Q
Para confirmaccedilatildeo da presenccedila do DNA na amostra 1microL foi submetido a
eletroforese em gel de agarose 15
49
4833 Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento
Foram realizadas trecircs reaccedilotildees de sequumlenciamento a primeira foi realizada
usando o produto tratado com PEG e nas duas posteriores usou-se o produto de PCR
tratado com acetato de amocircnia Para o restante da metodologia natildeo houve alteraccedilatildeo
O sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA foi realizado pelo
meacutetodo de terminaccedilatildeo de cadeia segundo Sanger et al (1977) utilizando a
incorporaccedilatildeo de dideoxinucleotiacutedeos fluorescentes em Sequumlenciador Automaacutetico de
DNA megaBACE
Para a reaccedilatildeo de sequumlenciamento foram utilizados cerca de 50ng da reaccedilatildeo de
PCR purificada 02 microM do oligonucleotiacutedeo ITS1 (TABELA 5) e 4microL de mistura para
sequumlecircnciamento ET (Kit ldquoDYEnamic ET Dye Terminator Cycle Sequencing Kit for
MegaBACErdquo da Amersham Biosciences) completando com aacutegua milli-Q para um
volume final de 10microL As mesmas condiccedilotildees foram aplicadas para o oligonucleotiacutedeo
ITS4 (TABELA 5)
FONTE O autor
A amplificaccedilatildeo foi realizada em um termociclador Eppendorf (Modelo
Mastercycler Gradient) seguindo uma desnaturaccedilatildeo inicial a 96degC por 1 minuto 30
ciclos de 10 segundos a 96degC 1 minuto e 5 segundos a 50degC 4 minutos a 60degC 20 min
a 8degC
Oligonucleotiacutedeos Sequumlecircncia
ITS1 5rsquoTCCGTAGGTGAACCTGCGG3rsquo
ITS4 5rsquoTCCTCCGCTTATTGATATGC3rsquo
TABELA 5 SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA AMPLIFICACcedilAtildeO DAREGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL
50
4834 Purificaccedilatildeo da Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento
Foram testadas trecircs metodologias de purificaccedilatildeo da reaccedilatildeo de sequumlenciamento
48341 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em tubos
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com PEG (item 38321) foram adicionados 40 microL de isopropanol 75
sendo precipitados por um spin down As amostras ficaram agrave temperatura ambiente por
20 minutos em seguida foram centrifugadas por 25 minutos a 13000 rpm e o
isopropanol foi removido por inversatildeo dos tubos Foram adicionados 200 microL de etanol
70 natildeo gelado e centrifugado por 5 minutos a 13000 rpm em seguida o etanol foi
removido com auxiacutelio de uma micropipeta e foi submetido a secagem em speed vac por
45 minutos a 60degC
Apoacutes esse tratamento cada amostra foi ressuspendida em 10 microL Loading
Solution e submetida agrave eletroforese em Sequumlenciador Automaacutetico de DNA modelo
megaBACE da Amersham Biosciences Com os seguintes paracircmetros voltagem de
injeccedilatildeo 2V tempo de injeccedilatildeo 80 segundos voltagem da corrida 8V por 160 minutos
48342 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em placa
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com acetato de amocircnio (item 38322) foram adicionados 40microL de
isopropanol 75 sendo precipitados por um spin down As amostras ficaram agrave
temperatura ambiente por 20 minutos e em seguida foram centrifugadas por 50
minutos a 4000 rpm O isopropanol foi removido por inversatildeo da placa Foram
adicionados 100microL de etanol 70 natildeo gelado e centrifugado por 30 minutos a 4000
rpm em seguida o etanol foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um spin a
300 rpm por 1 minuto Em seguida a placa ficou em estufa a 37degC durante 3 minutos
Apoacutes esse tratamento as amostras foram processadas como no item anterior
51
48343 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com acetato de amocircnio (item 38322) foram adicionados 1 microL de acetato
de amocircnio (AcNH4) 75M e 30 microL de etanol 96 Apoacutes a homogeneizaccedilatildeo por inversatildeo
30 vezes a placa foi centrifugada por 45 minutos a 2500 RCF a 4degC
O sobrenadante foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um spin a 500
RCF com a placa invertida sobre papel toalha O pellet foi lavado com 100 microL de etanol
70 (receacutem preparado natildeo gelado) Seguindo-se uma nova centrifugaccedilatildeo a 2500 RCF
por 45 minutos e o sobrenadante foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um
spin a 750 RCF com a placa invertida sobre papel toalha Em seguida a placa ficou em
estufa a 37degC durante 3 minutos
Apoacutes esse tratamento cada amostra foi ressuspendida e tratada como nos itens
anteriores
Todos os procedimentos desde a reaccedilatildeo de sequumlenciamento foram realizados
sob proteccedilatildeo de luz direta cobrindo a placa com papel alumiacutenio
4835 Ediccedilatildeo e Anaacutelise das Sequumlecircncias
As sequumlecircncias foram entatildeo alinhadas utilizando-se o programa CLUSTAL-W
versatildeo 17 (THOMPSON HIGGINS e GIBSON 1994) sendo realizada posterior
inspeccedilatildeo visual atraveacutes do programa BioEdit 7053 (HALL 1999) Apoacutes a ediccedilatildeo
alinhamento e anaacutelise preacutevia das sequumlecircncias estas foram submetidas ao software
MEGA 31 (KUMAR TAMURA NEI 2004) para obtenccedilatildeo das aacutervores filogeneacuteticas
baseadas em distacircncia A consistecircncia dos noacutes obtidos foi avaliada pelo procedimento
de bootstrap (FELSENSTEIN 1985) com 10000 reamostragens Foram utilizadas como
referecircncias linhagens de Phomopsis sp Diaporthe e Pestalotiopsis vismae (como
grupo externo) depositadas no GenBank (httpwwwncbinlmnihgov) (TABELA 6)
52
TABELA 6 LINHAGENS DE Phomopsis spp E DE Pestalotiopsis vismae UTILIZADAS COMO GRUPO EXTERNO
Espeacutecie Nuacutemero de acesso (GenBank)
Diaporthe Melonis AB105147 D melonis AB105148 Phomopsis longicolla AY857868 P longicolla AF000207 P camptothecae AY622996 D Phaselorum AF001024 D helianthi AJ312348 D helianthi AJ312363 D helianthi AF358441 Phomopsis sp P7 DQ235673 Phomopsis sp P3 DQ235669 P sojae AY050627 P chimonanthi AY622993 Phomopsis sp P4 DQ235670 D conorum AB201443 D conorum DQ116551 P theicola DQ286286 P theicola DQ286287 Phomopsis sp 1 AY485724 Phomopsis sp CBS DQ286285 Phomopsis sp Taxon 3 AF230762 Diaporthe AJ312359 Diaporthe AY745024 Pestalotiopsis vismae EF451801
FONTE O autor
49 Avaliaccedilatildeo da Atividade Antimicrobiana
491 Cultura Pareada
Para avaliar a atividade antimicrobiana dos 49 isolados de Phomopsis sp
endofiacuteticos (TABELA 1) contra o fitopatoacutegeno Guignardia citricarpa foi utilizado a
metodologia de Cultura Pareada (MARIANO1993) Os discos contendo miceacutelio eou
coniacutedios dos isolados endofiacuteticos ou dos fitopatoacutegenos ensaiados foram obtidos de
53
colocircnias crescidas em BDA durante sete dias a 28degC incubadas em estufa BOD e com
fotoperiacuteodo de 12 horas Apoacutes este periacuteodo foram retirados os discos da borda das
colocircnias com auxiacutelio de vazador de rolhas
Em placas de Petri contendo meio de cultura BDA colocou-se um disco (Oslash 8
mm) da cultura do fitopatoacutegeno G citricarpa Apoacutes trecircs dias de crescimento foi
adicionado no lado oposto um disco com o isolado de Phomopsis sp endofiacutetico a ser
avaliado ambos a 10 cm da borda Apoacutes o pareamento as placas foram vedadas com
filme de PVC e mantidas durante 14 dias em estufa BOD com fotoperiacuteodo de 12 h a
28degC Foi realizado um delineamento inteiramente casualizado com cinco repeticcedilotildees O
controle recebeu apenas o fitopatoacutegeno A avaliaccedilatildeo foi realizada mediante mediccedilatildeo do
diacircmetro da colocircnia comparando com o controle e observaccedilatildeo das interaccedilotildees entre as
colocircnias
Para determinar a porcentagem de inibiccedilatildeo do crescimento mediu-se o diacircmetro
das colocircnias do fitopatoacutegeno com 14 dias de crescimento subtraindo-se o diacircmetro do
inoacuteculo original Os caacutelculos foram realizados de acordo com Edginton et al (1971)
pela foacutermula
Onde Dc eacute o diacircmetro meacutedio da colocircnia do fitopatoacutegeno no controle e Dt eacute o
diacircmetro meacutedio da colocircnia do patoacutegeno nos tratamentos testados
492 Avaliaccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
Cobriu-se assepticamente toda a superfiacutecie do meio PDA inclusive nas bordas
com discos de papel celofane (Oslash11 cm) esterilizado A seguir foi inoculado no centro
sobre a superfiacutecie do papel celofane discos de aacutegar (Oslash8 mm) contendo miceacutelio do
isolado endofiacutetico As placas foram incubadas por quatro dias a temperatura de 28degC
as placas controles receberam apenas o fitopatoacutegeno incubados por 7 dias com
Dc -Dt
Dc
Porcentagem de inibiccedilatildeo (PI) = X 100
54
fotoperiacuteodo de 12 horas Mediu-se o diacircmetro da colocircnia e retirou-se o papel celofane
(juntamente com a colocircnia do isolado) Sobre a superfiacutecie de meio PDA inoculou-se um
disco de miceacutelio do fitopatoacutegeno a ser avaliado no centro da placa Foi realizado um
delineamento inteiramente casualizado com cinco repeticcedilotildees As placas foram
incubadas a 28degC com fotoperiacuteodo de 12 horas Apoacutes 7 e 14 dias mediu-se o
crescimento das colocircnias e comparou-se com o controle (ETHUR CEMBRANEL e
SILVA 2001 Adaptado por Figueiredo 2006)
493 Atividade dos Extratos Metanoacutelicos 4931 Obtenccedilatildeo dos extratos
Para avaliaccedilatildeo da atividade dos extratos metanoacutelicos foi utilizada a metodologia
descrita por Rodrigues Hesse e Werner (2000) com algumas modificaccedilotildees No
processo de fermentaccedilatildeo trecircs discos (Oslash 8 mm) dos 49 isolados endofiacuteticos de
Phomopsis (TABELA 1) foram inoculados em Erlenmeyer (250 mL) contendo 100 mL
de caldo extrato de malte Incubou-se durante 7 dias (110 rpm 28degC fotoperiacuteodo de 12
horas)
Apoacutes a fermentaccedilatildeo o miceacutelio foi separado do liacutequido fermentado por filtraccedilatildeo
em papel Whatman ndeg 4 Ao volume do filtrado obtido adicionou-se o mesmo volume
de acetato de etila (EtOAc) (Merck) em um balatildeo de separaccedilatildeo Agitou-se
vigorosamente por trecircs vezes e aguardou-se a formaccedilatildeo de duas camadas uma
aquosa na parte inferior e outra orgacircnica na parte superior Transferiu-se a fase
orgacircnica para um novo recipiente e submeteu-se a fase aquosa a mais uma extraccedilatildeo
com EtOAc Repetiu-se o procedimento por mais duas vezes Adicionou-se agrave fase
orgacircnica 5 de sulfato de soacutedio anidro e filtrou-se novamente com papel Whatman ndeg
4 Obteve-se extrato bruto seco passando a fase orgacircnica em rotaevaporador O extrato
foi pesado e diluiacutedo em metanol (10mgmL)
55
4932 Crescimento micelial
Foram obtidos discos (Oslash 12 mm) de colocircnias com 14 dias de crescimento em
meio completo da cultura do fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396 ou PC3305 Estes
foram inoculados no centro de placas de Petri contendo meio de cultura BDA A 10 cm
da borda em posiccedilatildeo oposta foi colocado um disco de papel filtro esterilizado (Oslash 5 mm)
e sobre este foram inoculados 100μL do extrato metanoacutelico a ser avaliado As placas
foram fechadas com filme de PVC e mantidas a 28degC fotoperiacuteodo de 12 horas em
BOD Avaliou-se o potencial de inibiccedilatildeo medindo-se o diacircmetro das colocircnias apoacutes sete
dias de crescimento comparando-se com o controle negativo onde foi inoculado aacutegua
destilada autoclavada ou metanol Como controle positivo foi utilizado fungicida Derosal reg (10 mgmL) (QUIROGA SAMPIETRO e VATTUONE 2001 adaptado por
FIGUEIREDO 2006)
410 Anaacutelise Estatiacutestica
Todos os experimentos foram realizados com delineamento inteiramente
casualizado (DIC) com 5 repeticcedilotildees As anaacutelises de variacircncia foram realizadas em
todas as etapas do trabalho Sempre que foi encontrado um valor significativo em
relaccedilatildeo ao teste F completou-se a anaacutelise com teste de Tukey para comparaccedilatildeo das
meacutedias utilizando software ASSISTAT (SILVA 1996 e SILVA 2002) ou o teste de Scott
Knott utilizando software SISVAR (FERREIRA 1994)
56
5 Resultados e Discussatildeo
51 Isolamento
Foram isolados 1005 endoacutefitos de folhas e peciacuteolos de 30 plantas de Espinheira
Santa (M ilicifolia) Destes 21 foram identificados a partir de anaacutelise em microscopia
oacuteptica como pertencentes ao gecircnero Phomopsis A tabela 7 compara os resultados
obtidos quanto agrave proporccedilatildeo de isolamento de Phomopsis sobre os diferentes tecidos da
planta nos quatro isolamentos realizados A frequumlecircncia dos isolamentos foi calculada
de acordo com Souza et al (2004)
TABELA 7 PORCENTAGEM DE ISOLAMENTO DE Phomopsis ENDOFIacuteTICOS DE PLANTAS DE ESPINHEIRA SANTA
Isolamento Oacutergatildeo da planta
Nuacutemero de fragmentos plaqueados
Endoacutefitos Nuacutemero ()
Phomopsis Nuacutemero ()
Frequumlecircncia isolamento Phomopsis
1 Folha 360 140 (39) 0 (0) 0
2 Folha 540 310 (57) 2 (064) 037
3 Folha 360 375 (gt100) 3 (08) 083
TOTAL FOLHA
1260 825 (65) 5 (061) 04
4 Peciacuteolo 160 180 (gt100) 16 (89) 100
TOTAL 1420 1005 (71) 21 (209) 15 FONTE O Autor
Observando a tabela 7 percebe-se claramente que a partir de peciacuteolo a
frequumlecircncia de isolamento de Phomopsis (10) foi maior do que em folhas (04) tanto
em relaccedilatildeo ao nuacutemero de fragmentos plaqueados quanto em comparaccedilatildeo ao nuacutemero
total de endoacutefitos isolados (89 contra 061) Provavelmente devido agrave menor
frequumlecircncia de fungos filamentosos de crescimento raacutepido que pudessem sobrepor ao
crescimento de Phomopsis Segundo Souza et al (2004) as folhas dos vegetais
57
hospedeiros satildeo provavelmente as portas de entrada para os microrganismos pois
apresentam tecidos mais fraacutegeis e expostos pela presenccedila de estocircmatos ocorrendo
posterior migraccedilatildeo para outros tecidos da planta O mesmo jaacute foi relatado em espeacutecies
de Citrus para o isolamento de fungos do gecircnero Guignardia sendo o peciacuteolo o tecido
de mais faacutecil isolamento deste gecircnero por apresentar menor colonizaccedilatildeo por
Colletotrichum (BLANCO 1999)
Assim sugere-se que em trabalhos futuros de isolamento de Phomopsis sejam
tambeacutem utilizados os peciacuteolos especialmente em Espinheira Santa
Foram tambeacutem obtidos 18 isolados de Phomopsis de trecircs plantas de S
terebinthifolius (Aroeira Vermelha) representando uma frequumlecircncia de 11 Em Aroeira
a frequumlecircncia do isolamento de Phomopsis em folha foi maior do que em Espinheira
Santa em todos os isolamentos realizados
Fungos do gecircnero Phomopsis Phyllosticta e Colletotrichum satildeo comumente
isolados como endoacutefitos de tecidos de diferentes espeacutecies de plantas em muitos casos
esses fungos estatildeo juntos num mesmo hospedeiro (PANDEY et al 2003 LU et al
2004)
O gecircnero Phomopsis tem sido descrito com grande frequumlecircncia em isolamentos
de diversas plantas (UECKER 1988 BODDY e GRIFFITH 1989) Azevedo et al (2000)
apresentaram algumas plantas hospedeiras de onde jaacute foram isoladas espeacutecies de
Phomopsis entre elas Sabal bermudana Trachycarpus fortunei Cavendishia
pubescens Stylosanthes guianensis Anacardium occidentale e Mangifera indica
Corrado e Rodrigues (2004) isolaram endofiacuteticos de Phomopsis das plantas medicinais
Spondias mombin e Aspidosperma tomentosun
Bussabam et al (2001) isolaram entre outros fungos o gecircnero Phomopsis
endoacutefitos de folhas pseudocaules e rizomas de gengibre (Amomum siamense Criab)
coletadas em dois locais na Tailacircndia Silva et al (2006) isolou Phomopsis como
endoacutefito de graviola (Annona muricata L) e pinha (Annona squamosa L)
Alguns dos relatos citam o gecircnero Phomopsis como fitopatoacutegeno isolado de
diversas espeacutecies de Citrus Mangifera indica (Mangueira) Glycine max (Soja) Ficus
carica (Figueira) e Anacardium occidentale (Cajueiro) entre muitas outras plantas
58
(CENARGEN EMBRAPA 2005) Natildeo haacute relatos de gecircnero Phomopsis como
fitopatoacutegeno das plantas medicinais utilizadas no presente trabalho Aspidosperma
tomentosum Spondias mombin e Maytenus ilicifolia assim como em Aroeira Vermelha
(Schinus terebinthifolius) Entretanto o gecircnero foi relatado por Anjos Charchar e
Guimaratildees (2001) como patoacutegeno em culturas de Aroeira (Myracrodruon urundeuva)
causando sintomas de queimas nas folhas que consiste de uma necrose escura
predominantemente nos bordos dos foliacuteolos
52 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de Phomopsis
A caracterizaccedilatildeo macromorfoloacutegica das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de
Phomopsis sp foi realizada de acordo com a forma dos bordos crescimento micelial
aspecto da colocircnia e a sua coloraccedilatildeo no verso e reverso da placa em diferentes meios
de cultura (FIGURAS 1 a 4 ANEXO 12)
A coloraccedilatildeo das colocircnias dos isolados de Phomopsis apresentaram elevada
variabilidade tanto no verso quanto reverso da placa nos trecircs meios de cultura
ensaiados Em geral variou entre combinaccedilotildees das cores branca preto verde claro e
oliva amarelo marrom marrom avermelhado cinza e bege
Os isolados de Phomopsis apresentaram no verso da placa com meio Aveia (AV)
coloraccedilatildeo branca alguns isolados apresentaram combinaccedilotildees de branco com marrom
verde amarelo e cinza exceto os isolados ESJG1 ES2KF1 ES2WF1 ESPAC22
ES80J ESFB2 ESGF1 A134 A333B que diferiram dos demais por apresentarem
coloraccedilatildeo intensa e o isolado A116 de coloraccedilatildeo marrom e verde (FIGURAS 1 a 4)
Nos meios de cultura MEA e BDA observou-se que a coloraccedilatildeo no verso da
placa foi mais variaacutevel do que no meio Aveia Igualmente o reverso das placas
contendo as colocircnias de Phomopsis mostrou-se bastante variaacutevel entre os isolados e
os trecircs meios de cultura utilizados havendo variaccedilatildeo intra-individual com coloraccedilotildees
branca preto verde claro e oliva amarelo marrom marrom avermelhado cinza e
bege
59
A morfologia micelial nos meios de cultura ensaiados variou de granuloso aeacutereo
a algodonoso Nos meios de cultura MEA e BDA todos os isolados apresentaram
miceacutelio denso poreacutem no meio AV esses dois tipos de miceacutelio variaram de denso a ralo
A maioria dos isolados de Phomopsis analisados possuem miceacutelio granuloso aeacutereo em
todos os meios ensaiados exceto os isolados SM9638 SM9631 e Phomopsis longicolla
PHO1 que apresentam miceacutelio algodonoso Observou-se variaccedilatildeo intra-individual na
morfologia micelial entre os meios de cultura nos isolados A333B e A323 que
apresentaram miceacutelio algodoso no meio AV e granuloso aeacutereo nos meios MEA e BDA
Igualmente os isolados A123 e SM9811 apresentaram-se algodonoso no meio MEA e
granuloso aeacutereo nos meios AV e BDA
O aspecto dos bordos das colocircnias mostrou variaccedilatildeo intra-individual entre os
diferentes meios de cultura para a maioria dos isolados exceto os isolados de
Phomopsis SM9638 ESKD1 ESPAC22 A323 A113 A331 A115 que apresentaram
bordos regulares e os isolados SM9714 ES2WC1 ESJG1 A126 A333A PHO1
(Phomopsis longicolla) e o isolado PHO19 que possuem bordos irregulares em todos os
meios utilizados
FIGURA 1 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis DE Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT 9811 e AT 9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
AV MEA BDA
M
U 0
123
S
M97
13
60
FIGURA 1 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE
Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT9811 e AT9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
SM
9631
SM
9638
AT
9811
A
T990
6
AT9
810
SM
9714
AV MEA BDA
61
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
A32
1
A
132
A21
5A
A
113
A
323
A13
1
AV MEA BDA
62
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
A
135
A11
6
A
115B
A
124
A12
6
A21
6 B
AV MEA BDA
63
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
A
134
A33
3A
A
334
A12
3
A33
3B
AV MEA BDA
64
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
E
S2N
A1
E
SIE1
ES
GA
1
ES8
0J
E
SPA
C22
ES2
WF1
AV MEA BDA
65
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
ESFB
2
ESJ
D1
ESK
D1
E
SJH
1
ESD
F1
E
S2A
B1
AV MEA BDA
66
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
E
S2K
F1
ESJ
E2
ESJ
E1
ESG
F1
ESF
H1
ESF
F1
AV MEA BDA
67
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis E Diaporthe (BA1) ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
ESB
A1
ESI
A1
ES
RD
1
E
S2W
C1
ESS
D1
ES
JG1
AV MEA BDA
68
Na avaliaccedilatildeo do diacircmetro das colocircnias houve diferenccedila significativa entre os
isolados de Phomopsis dentro dos diversos meios de cultura avaliados Entre os meios
de cultura MEA BDA e AV houve diferenccedila significativa de crescimento em geral o
crescimento micelial foi menor no meio AV (ANEXO 1) Portanto os grupos de
Phomopsis formados quando considerada agrave taxa de crescimento foram inferidos para
os meios de cultura separadamente
Na figura 5 observa-se o resultado do diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados
apoacutes 5 dias de crescimento em meio MEA Os isolados foram reunidos em oito grupos
diferentes A A323 SM9631 ESKD1 A134 e ESIE1 B A116 A334 A215A ESSD1
C A321 MU0123 ESGF1 ESRD1 AT9811 SM9713 A123 ESJH1 ESDF1 A131
ESIA1 ESBA1 ESJD1 D A333A A135 ES2NA1 A124 A132 SM9714 ESFB2 E A115B ES2AB1 A216B A113 F PHO1 SM9638 ES2WF1 A126 ESJE1 ESPAC22
ESFF1 ES2KF1 ESJG1 ES80J G ESJE2 ESFH1 AT9906 ESGA1 AT9810
ES2WC1 Os isolados do grupo A apresentaram os maiores valores de crescimento
radial em torno de 70 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) e o grupo H apresentou menor
crescimento micelial em torno de 20 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) (ANEXO 4)
FIGURA 4 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS PATOGEcircNICOS OBTIDOS DE Glycine max EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
PH
O19
P
lon
gico
lla (P
HO
1) AV MEA BDA
69
O diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados apoacutes 5 dias de crescimento em meio
BDA estaacute representado na figura 6 Os isolados foram reunidos em seis grupos
diferentes A ESBA1 A323 A215A ESSD1 SM9713 ESGF1 SM9631 ESJD1
ESKD1 A334 B ESDF1 A132 A123 A333A MU0123 ESJH1 A321 ESRD1 A116
A134 A115B C ESIA1 A131 SM9714 A135 ESIE1 ESFB2 A124 ESPAC22
ES2KF1 A113 ESJE1 D ESJE2 ESFH1 ESJG1 ES2WC1 PHO1 SM9638
ES2NA1 ES2AB1 ESFF1 AT9811 AT9810 ES2WF1 A126 PHO19 A216B ES80J
ESGA1 E AT9906 F A333B Em geral a taxa de crescimento foi maior em meio BDA Os isolados do grupo A
apresentaram as maiores taxas de crescimento em torno de 70 cm (apoacutes 5 dias de
FONTE O autor
000
100
200
300
400
500
600
700
800
EB A F HD G C
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 4) A A323 SM9631 ESKD1 A134 e ESIE1 B A116 A334 A215A ESSD1 C A321 MU0123 ESGF1 ESRD1 AT9811 SM9713 A123 ESJH1 ESDF1 A131 ESIA1 ESBA1 ESJD1 D A333A A135 ES2NA1 A124 A132 SM9714 ESFB2 E A115B ES2AB1 A216B A113 F PHO1 SM9638 ES2WF1 A126 ESJE1 ESPAC22 ESFF1 ES2KF1 ESJG1 ES80J G ESJE2 ESFH1 AT9906 ESGA1 AT9810 ES2WC1
FIGURA 5 DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO MEA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
Diacirc
met
ro e
m c
m
70
crescimento) e o grupo F representado pelo isolado A333B apresentou menor
crescimento micelial (ANEXO 2)
Estudos sobre fisiologia envolvendo o gecircnero Phomopsis satildeo escassos Almeida
(1982) estudando Phomopsis sojae isolados de sementes de soja em seis diferentes
meios de cultura e nos regimes de luminosidade claro contiacutenuo e escuro contiacutenuo
verificou maior crescimento do fungo nos meios de haste de soja extrato de malte
aveia cenoura e BDA natildeo houve efeito da luz sobre o crescimento micelial de nenhum
dos isolados
Gurgel Menezes e Coelho (1997) verificaram maior crescimento micelial de P
anacardii e P mangiferae no meio BDA e uma melhor esporulaccedilatildeo nos meios BDA e V8
(Campbell CO) apoacutes 15 e 30 dias de incubaccedilatildeo No presente trabalho foi verificado
maior crescimento dos isolados de Phomopsis em meio BDA seguido do meio MEA em
meio AV a taxa de crescimento foi inferior
FONTE O autor
000
100
200
300
400
500
600
700
B A FEC D
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 2) A ESBA1 A323 A215A ESSD1 SM9713 ESGF1 SM9631 ESJD1 ESKD1 A334 B ESDF1 A132 A123 A333A MU0123 ESJH1 A321 ESRD1 A116 A134 A115B C ESIA1 A131 SM9714 A135 ESIE1 ESFB2 A124 ESPAC22 ES2KF1 A113 ESJE1 D ESJE2 ESFH1 ESJG1 ES2WC1 PHO1 SM9638 ES2NA1 ES2AB1 ESFF1 AT9811 AT9810 ES2WF1 A126 PHO19 A216B ES80J ESGA1 E AT9906 F A333B
FIGURA 6 DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
Diacirc
met
ro e
m c
m
71
O diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados apoacutes 5 dias de crescimento em meio
AV estaacute representado na figura 7 Os isolados foram reunidos em sete grupos
diferentes A ESKD1 B ESJE2 A123 C ESJE1 SM9638 AT9811 SM9713 PHO1
ESBA1 SM9631 ESFB2 A334 A323 MU0123 D A333A ESJD1 ESGF1 A116 E ESPAC22 ESDF1 A321 A132 ES2KF1 ESJG1 ESRD1 PHO19 A115B A124
ESFF1 A134 ESIE1 A135 A131 A113 ES2WF1 ESSD1 ESIA1 F ESGA1 ESJH1
ESFH1 AT9906 ES2NA1 A216B ES80J A215A G AT9810 A333B ES2AB1
SM9714 ES2WC1 A126 Apenas o isolado ESKD1 representante do grupo A
apresentou taxa de crescimento raacutepida de 70 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) a
maioria dos isolados tiveram crescimento lento (ANEXO 3)
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 3) A ESKD1 B ESJE2 A123 C ESJE1 SM9638 AT9811 SM9713 PHO1 ESBA1 SM9631 ESFB2 A334 A323 0123 D A333A ESJD1 ESGF1 A116 E ESPAC22 ESDF1 A321 A132 ES2KF1 ESJG1 ESRD1 PHO19 A115B A124 ESFF1 A134 ESIE1 A135 A131 A113 ES2WF1 ESSD1 ESIA1 F ESGA1 ESJH1 ESFH1 AT9906 ES2NA1 A216B ES80J A215A G AT9810 A333B ES2AB1 SM9714 ES2WC1 A126
FIGURA 7 AVALIACcedilAtildeO DAS MEacuteDIAS DO DIAcircMETRO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO AV APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
000
100
200
300
400
500
600
700
B A F C GD E
FONTE O autor
Diacirc
met
ro e
m c
m
72
Foi observado que dos 49 endoacutefitos e os 2 isolados patogecircnicos de Phomopsis
spp avaliados (TABELA 1) 27 apresentaram variaccedilatildeo intra-individual quanto ao
crescimento nos diversos meios Por exemplo os isolados A323 e SM9631 em meio
MEA e BDA pertencem ao grupo A e no meio AV ao grupo C Os outros 24 isolados
natildeo apresentaram variaccedilatildeo entre os agrupamentos formados nos diferentes meios
Os isolados que se agrupam baseados no crescimento nos trecircs meios natildeo satildeo
os mesmos quando se considera a cor do verso e reverso da placa assim como natildeo
satildeo semelhantes aos agrupamentos formados quando comparados com os bordos e
aspecto da colocircnia
Gurgel Menezes e Coelho (2002) estudando Phomopsis anacardii e Phomopsis
mangiferae observaram maior produccedilatildeo de picniacutedios nos meios de extrato de malte
aveia haste de soja e cenoura somente quando mantidos sob luz contiacutenua A
produccedilatildeo de picniacutedios foi reduzida em alternacircncia de luz e quase nula no escuro
contiacutenuo No presente trabalho foi observado que a maioria dos isolados formaram
estruturas de reproduccedilatildeo com o uso de luz contiacutenua em baixas temperaturas 22 a 25 degC
e pH 58 nos trecircs meios avaliados apoacutes 14 dias de crescimento
Segundo Cochrane (1959) e Griffin (1994) a luminosidade promove formaccedilatildeo
das estruturas reprodutivas assim como estatildeo diretamente ligadas agrave composiccedilatildeo do
meio de cultura atraveacutes de diferentes reaccedilotildees enzimaacuteticas Leonian (1924) descreve
que o efeito da luz como indutor da reproduccedilatildeo de fungos estaacute associado agraves
modificaccedilotildees que ocorrem no seu metabolismo celular combinados aos elementos que
constituem o meio de cultura
Timnick Lilly e Barnett (1951) detectaram efeito positivo da luz para a formaccedilatildeo
de picniacutedios ao verificarem que o regime escuro contiacutenuo inibia a formaccedilatildeo de picniacutedios
de Diaporthe phaseolorum Resultados semelhantes foram observados por Correcirca
(1995) avaliando Phomopsis sp provenientes de sementes florestais observou uma
melhor esporulaccedilatildeo em meio aveia sob regime de claro contiacutenuo por 12 dias de
incubaccedilatildeo
Na anaacutelise da micromorfologia observou-se que os isolados apresentavam
estruturas de reproduccedilatildeo a partir de 14 dias ateacute 21 dias de crescimento (FIGURA 8)
73
exceto os isolados SM9811 SM9638 e Phomopsis longicolla PHO1 que natildeo formaram
estruturas de reproduccedilatildeo em nenhum dos meios ensaiados Os isolados SM9811 e
SM9638 foram descritos como pertencentes ao gecircnero Phomopsis e depositados na
Coleccedilatildeo de Cultura de Fungos do Departamento de Micologia (IOC) da FIOCRUZ e
foram descritos por Rodrigues e Samules (1999) O isolado PHO1 foi isolado e
identificado pela EMBRAPA (Londrina-PR) como pertencente agrave espeacutecie P longicolla
Os coniacutedios do tipo alfa foram menos frequumlentes do que os do tipo beta Em
meio de cultura BDA apenas 11 isolados apresentaram o tipo de esporo alfa jaacute os beta
coniacutedios filiformes curvos na extremidade ou ligeiramente curvos foram visualizados
em quase todos os isolados de Phomopsis spp
Foi observado que para os isolados que apresentaram os dois tipos de esporos
foram visualizados com 14 dias de crescimento apenas alfa coniacutedios hialinos com
vacuacuteolos nas extremidades de forma ovoacuteide e natildeo foram visualizados beta coniacutedios
Apoacutes 21 dias os dois tipos de esporos foram visualizados nesses isolados (FIGURA 8a
e 8c) Alguns alfa coniacutedios apresentavam mais de dois vacuacuteolos nas extremidades
(FIGURA 8b) Essa variaccedilatildeo intra-individual tambeacutem foi observada em relaccedilatildeo agrave
morfologia do beta coniacutedio em que alguns apresentam curvatura na extremidade
outros ligeiramente curvos (FIGURA 8c)
NOTA A - isolado SM9631 aumento de 400x B- isolado SM9714 aumento de 1000x C- isolado SM9713 aumento de 400x microscopia oacuteptica Setas pretas indicam os alfa coniacutedios e setas vermelhas os beta coniacutedios Escala em 1μM
FONTE O autor
FIGURA 8 FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis EM BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
A B C
74
Alfa coniacutedios do isolado SM9713 provenientes dos meios de cultura AV (FIGURA
9a) e BDA (FIGURA 9e) apresentaram grande variaccedilatildeo morfoloacutegica Na figura 9 no
mesmo conidioacuteforo eacute visiacutevel a diferenccedila morfoloacutegica do alfa coniacutedio Na figura 9e o
conidioacuteforo apresenta alfa coniacutedios com mais de duas gotas nas extremidades (SETA 1)
e alfa coniacutedios com apenas dois vacuacuteolos (SETA 2) Em maior aumento eacute possiacutevel
perceber que existem variaccedilotildees de dois trecircs e ateacute quatro vacuacuteolos no mesmo isolado
(FIGURA 9a 9b e 9c) Tal variaccedilatildeo pode ser decorrente de diferenciados graus de
maturaccedilatildeo destes coniacutedios o que dificulta a caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de espeacutecies do
gecircnero Phomopsis
A medida do comprimento dos beta coniacutedios em meio BDA mostrou que os
isolados apresentam diferenccedilas estatiacutesticas significativas reunindo os isolados em 15
FIGURA 9 FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DO ISOLADO SM9713 EM MEIOS BDA e AV APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
1 2 A
B C D
E
NOTA A - em meio AV aumento de 400x B C e D- em meio BDA aumento de 650x E- em meio BDA aumento de 400x Microscopia oacutetica
FONTE O autor
75
grupos diferentes (ANEXO 5) A (AT9906 AT8010) B (ESFH1) C (ESPAC22 ES2KF1
SM9631) D (ESGA1 PHO19) E (ES80J) F (ESRD1) G (ESJE2 ESFB2 ESJE1) H
(ESJG1) I (A323) J (A333A A135 A124 A126 A132 A131 A134 A115B ESIE1) K
(ES2WC1 ES2WF1) L (SM9713 A334 ESIA1 A333B ESFF1 ESGF1) M (ES2AB1
A123 A113 ESJD1) N (ESKD1 ES2NA1 A215A SM9714) O (ESSD1 ESJH1
MU0123 A321 ESDF1 A216B A116) (FIGURA 10) Os isolados tambeacutem natildeo se
agrupam de acordo com os outros criteacuterios avaliados como a cor do verso e reverso
da placa diacircmetro das colocircnias assim como natildeo satildeo semelhantes aos agrupamentos
formados quando comparados com os bordos e aspecto do miceacutelio
NOTA As letras maiuacutesculas indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo agrave meacutedia do comprimento de beta coniacutedio dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Isolados de cada agrupamento A (AT9906 AT8010) B (ESFH1) C (ESPAC22 ES2KF1 SM9631) D (ESGA1 PHO19) E (ES80J) F (ESRD1) G (ESJE2 ESFB2 ESJE1) H (ESJG1) I (A323) J (A333A A135 A124 A126 A132 A131 A134 A115B ESIE1) K (ES2WC1 ES2WF1) L (SM9713 A334 ESIA1 A333B ESFF1 ESGF1) M (ES2AB1 A123 A113 ESJD1) N (ESKD1 ES2NA1 A215A SM9714) O (ESSD1 ESJH1 MU0123 A321 ESDF1 A216B A116) As meacutedias seguidas pela mesma letra minuacutescula natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 5)
FIGURA 10 COMPRIMENTO DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO EM BDA A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
0
5
10
15
20
25
30
35
40
B C E F MID LJA N H K OG
a
b
c
cd
de
ef
efg
fgh
fghi
ghij
ghil
hil
him
im
m
FONTE O autor
Diacirc
met
ro e
m μ
M
76
Desta forma as caracteriacutesticas macroscoacutepicas (coloraccedilatildeo bordos e tipos de
miceacutelio da colocircnia) e de micromorfologia dos coniacutedios avaliadas isoladamente natildeo
permitiram propor identificaccedilatildeo das espeacutecies dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis
Sendo assim optou-se por realizar uma anaacutelise polifaacutesica agrupando as caracteriacutesticas
morfoloacutegicas analisadas tais como crescimento micelial coloraccedilatildeo e bordos da
colocircnia tipo de miceacutelio comprimento dos coniacutedios e tipos de coniacutedios produzidos em
deferentes meios Essa metodologia foi descrita por Figueiredo et al (2006) para
caracterizar isolados de Pestalotiopsis Para todas estas caracteriacutesticas foram
atribuiacutedas notas de 0 ou 1 onde 0 representou ausecircncia da caracteriacutestica e 1 a
presenccedila (ANEXO 12) Os resultados compuseram uma matriz binaacuteria analisada pelo
software NTSYS (coeficiente Jaccard) com o agrupamento pelo meacutetodo UPGMA
permitindo a construccedilatildeo de um dendrograma de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
De acordo com o dendrograma de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
sugere-se a formaccedilatildeo de seis grupos com elevados valores de bootstrap que conferem
robustez aos agrupamentos No grupo I estatildeo reunidos os isolados MU0123 e
SM9713 no grupo II os isolados AT9810 e AT9906 no grupo III os isolados ESJE1 e
ESJE2 no grupo IV os isolados ESFB2 e ESFF1 no grupo V os isolados ES2KF1 e
ESJG1 e no grupo VI os isolados ES2WF1 e ES80J Os demais agrupamentos
formados natildeo foram considerados pois apresentam baixos valores de bootstrap e ou
baixos valores de similaridade morfoloacutegica
Os dados mostram elevada variabilidade morfoloacutegica dos isolados de Phomopsis
avaliados o que dificulta a delimitaccedilatildeo de espeacutecies apenas com dados morfoloacutegicos
Segundo Parmeter (1958) e Rehner e Uecker (1994) o alto grau de plasticidade das
caracteriacutesticas morfoloacutegicas impossibilita a delimitaccedilatildeo de espeacutecies no gecircnero
Phomopsis Gamboa-Gaitaacuten Laureano e Bayman (2005) estudando isolados de
Phomopsis endofiacuteticos de Guarea guidonia (Meliaceae) de duas regiotildees de Luquillo
(Porto Rico) relataram elevados niacuteveis de variabilidade morfoloacutegica entre os isolados
avaliados Eles observaram uma mistura de diferentes morfotipos em ambas as regiotildees
estudadas
77
Neste trabalho foi observado um elevado niacutevel de variabilidade morfoloacutegica dos
isolados de Phomopsis spp obtidos de seis diferentes espeacutecies de plantas e regiotildees
geograacuteficas Natildeo foi possiacutevel observar estruturaccedilatildeo populacional dos isolados em
funccedilatildeo da espeacutecie hospedeira Na figura 12 os isolados de M ilicifolia encontram-se na
coloraccedilatildeo rosa e distribuiacutedos ao longo dos dois eixos que representam os dois
principais componentes de variaccedilatildeo Igualmente os isolados em preto representam as
linhagens provindas de S terebinthifolius e tambeacutem encontram-se dispersos Tais
resultados natildeo surpreendem pois eacute possiacutevel que a mesma espeacutecie de Phomopsis seja
isolada em diferentes hospedeiros
NOTA I II III IV V VI satildeo grupos formados para inferir sobre a diversidade dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis Os valores a esquerda dos noacutes indicam os valores de bootstrap
COEFICIEcircNTE DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA
FIGURA 11 DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp
FONTE O autor
r = 07577 (P= 00001)
V VI
IV
I II III
78
FONTE O autor FIGURA 12 ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp NOTA Isolados em coloraccedilatildeo rosa obtidos de Maytenus ilicifolia Em preto Schinus terebinthifolius Em azul escuro Myracrodruon urundeuva Em azul claro Aspidosperma tomentosun Em verde Spondias mombin 53 Caracterizaccedilatildeo Molecular de Phomopsis spp 531 RAPD
Os isolados de Phomopsis spp foram avaliados por meio de marcadores
moleculares do tipo RAPD a fim de verificar a magnitude da variabilidade geneacutetica
Foram analisados por esta metodologia 54 isolados Destes 47 Phomopsis spp
endoacutefitos os isolados MU0123 e SM9638 natildeo amplificaram em nenhuma das
condiccedilotildees ensaiadas dois isolados de Phomopsis patoacutegenos de soja e cinco isolados
de Pestalotiopsis Foram utilizados 4 oligonucleotiacutedeos gerando 99 bandas O tamanho
dos fragmentos amplificados variou de 400 a 2600 pb e podem ser visualizados nas
Figuras 13 a 16
79
FIG
UR
A 1
4 P
ER
FIL
DE
AM
PLI
FIC
ACcedil
AtildeO
CO
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OLI
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s sp
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O E
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lotio
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FIG
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A 1
3 P
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psis
80
FIG
UR
A 1
5 P
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FIG
UR
A 1
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DE
AM
PLI
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08 D
OS
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CO
S D
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hom
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s sp
E
GR
UP
O E
XTE
RN
O P
esta
lotio
psis
81
A anaacutelise destes marcadores RAPD permitiu a construccedilatildeo de um dendrograma
de similaridade geneacutetica (FIGURA 17) O coeficiente de correlaccedilatildeo das matrizes de
similaridade geneacutetica e cofeneacutetica obtido pelo teste de Mantel foi elevado (r=08157 e
p=00001) indicando que o dendrograma representa de forma adequada a matriz de
similaridade geneacutetica obtida pelos marcadores de RAPD Entretanto os valores de
bootstrap da maioria dos agrupamentos formados foram baixos Desta forma somente
foram considerados na anaacutelise os agrupamentos com bom suporte de bootstrap e
coeficientes de similaridade superiores a 50
Os dados indicam elevada variabilidade geneacutetica dos isolados de Phomopsis
spp avaliados (FIGURAS 17 e 18) com a formaccedilatildeo de sete grupos Os isolados de
Pestalotiopsis utilizados como grupo externo formaram um grupo (boostrap = 100)
isolado (FIGURA 17) sendo relevante para inferir a magnitude da variabilidade geneacutetica
observada entre os isolados de Phomopsis spp
O primeiro agrupamento reuacutene trecircs endoacutefitos de Espinheira Santa ESBA1
ES2AB1 e ESSD1 (49 de similaridade e bootstrap = 64) Esses isolados foram
obtidos do mesmo isolamento e pomar (CNPFEMPRAPA ColomboPR) poreacutem de
tecidos e plantas diferentes Os isolados ESBA1 e ESSD1 foram obtidos de peciacuteolo
enquanto ES2AB1 foi isolado de folha Eacute importante observar que o isolado ESBA1
apresentou estrutura de reproduccedilatildeo sexual sendo classificado como Diaporthe sp e
no entanto apresenta alto valor de similaridade geneacutetica com os isolados de Phomopsis
sp sugerindo assim que pertenccedilam ao mesmo complexo Phomopsis Diaporthe
Esses isolados natildeo se agrupam quanto aos caracteres morfoloacutegicos (FIGURAS 11 e
12)
O segundo agrupamento com 893 de similaridade geneacutetica e com bootstrap
de 100 compreende P longicolla (PHO1) uma linhagem patogecircnica de soja isolada
em Primavera do Leste ndash MT e o isolado SM9713 endoacutefito de Spondias mombin
coletado em Redenccedilatildeo ndash PA Aleacutem de coletados em lugares e hospedeiros totalmente
diferentes esses isolados apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas divergentes pois
natildeo pertencem ao mesmo agrupamento em nenhuma das caracteriacutesticas morfoloacutegicas
analisadas Entretanto a alta similaridade geneacutetica destes isolados sugere que
82
pertenccedilam agrave mesma espeacutecie o que reforccedila as observaccedilotildees anteriores de que a
definiccedilatildeo de espeacutecie do gecircnero Phomopsis natildeo eacute possiacutevel utilizando-se apenas
caracteriacutesticas morfoloacutegicas
FIGURA 17 DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS DE Phomopsis spp POR MEIO DE MARCADORES MOLECULARES RAPD
COEFICIENTE DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA
FONTE O autor
I II
III IV V VI VII
GRUPO EXTERNO
r= 08157 (p=00001)
100
83
O terceiro agrupamento com 75 de similaridade geneacutetica (FIGURA 17)
compreende dois isolados endofiacuteticos de Aspidosperma tomentosun AT9810 e AT9906
Esses isolados apresentaram caracteriacutesticas morfoloacutegicas muito semelhantes
formando o agrupamento II com 81 de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
O quarto agrupamento com 72 de similaridade geneacutetica compreende os
isolados ESFH1 e ESFF1 provenientes do peciacuteolo de Espinheira Santa da mesma
coleta poreacutem novamente eles natildeo se agrupam quanto aos caracteres morfoloacutegicos
observados (FIGURAS 11 e12)
O quinto agrupamento com 85 de similaridade geneacutetica reuacutene os isolados
ESKD1 e ESJH2 e ESJH1 provenientes de peciacuteolo da Espinheira Santa coletados na
mesma data Os isolados ESJH1 e ESJH2 foram obtidos do mesmo peciacuteolo e
apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas mais semelhantes entre si do que quando
comparados ao isolado ESKD1 (FIGURA 11) Entretanto a figura 17 revela que por
meio de marcadores RAPD os isolados ESKD1 e ESJH2 satildeo mais proacuteximos (92 de
similaridade geneacutetica) Sugere-se assim que os 3 isolados pertenccedilam agrave mesma
espeacutecie
O sexto agrupamento com 52 de similaridade (FIGURA 17) compreende os
isolados A321 obtido de Aroeira e ESIA1 obtido de Espinheira Santa Aleacutem de
coletados em lugares e hospedeiros totalmente diferentes esses isolados apresentam
caracteriacutesticas morfoloacutegicas diferentes (FIGURAS 11 e 12) Apesar do valor de
bootstrap atribuir confiabilidade a este agrupamento (77) o valor de similaridade
observado (52) natildeo eacute alto Assim natildeo eacute possiacutevel inferir que pertenccedilam agrave mesma
espeacutecie
O mesmo ocorre com o seacutetimo agrupamento que com 55 de similaridade
compreende os isolados A333A obtido de Aroeira e ESRD1 obtido de Espinheira Santa
Aleacutem de coletados em lugares e hospedeiros totalmente diferentes esses isolados
apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas diferentes natildeo pertencendo ao mesmo
agrupamento quanto aos caracteres morfoloacutegicos (FIGURAS 11 e 12)
Esses resultados mostram que caracteriacutesticas morfoloacutegicas natildeo satildeo suficientes
para inferir espeacutecies neste gecircnero analisadas individualmente ou em anaacutelise polifaacutesica
84
Aleacutem disso natildeo haacute estruturaccedilatildeo populacional quanto ao hospedeiro Esses dados
reforccedilam a necessidade de revisatildeo na classificaccedilatildeo de espeacutecies do gecircnero Phomopsis
Atualmente a anaacutelise polifaacutesica vem sendo realizada em estudos de diversidade
bacteriana utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas bioquiacutemicas fisioloacutegicas e
moleculares (KIM et al 2006 a b NEDASHKOVSKAYA et al 2006) e
esporadicamente na identificaccedilatildeo de leveduras (SAMPAIO et al 1999 VILLA-
CARVAJAL et al 2004) Em fungos filamentosos a anaacutelise polifaacutesica de caracteriacutesticas
morfoloacutegicas foi utilizada com sucesso na taxonomia de Penicillium (FRISVAD e
SAMSON 2004) Aspergillus (FRISVAD et al 2004) e Pestalotiopsis (FIGUEIREDO
2006)
FIGURA 18 ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp
FONTE O autor
85
532 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
Visando elucidar a taxonomia dos isolados de Phomopsis spp utilizados neste
trabalho foi realizado com sucesso o sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 - 58S - ITS2 do
rDNA de 29 isolados Apoacutes o alinhamento e ediccedilatildeo destas sequumlecircncias foi realizada
uma busca no banco de dados de sequumlecircncias (httpwwwncbinlmnihgov) a fim de
identificar sequumlecircncias similares Os isolados estatildeo representados na aacutervore filogeneacutetica
(FIGURA 19)
Os isolados agruparam-se em 16 clados sugerindo que as plantas medicinais
estudadas satildeo colonizadas por pelo menos dezesseis diferentes espeacutecies de
Phomopsis (FIGURA 19) Entretanto a maioria dos isolados natildeo apresentaram
sequumlecircncias ITS com identidade superior a 90 com nenhuma sequumlecircncia depositada no
GenBank e portanto foram identificados como Phomopsis sp S1 a Phomopsis sp
S12
O primeiro clado (suportado com bootstrap de 98) estaacute representado na figura
20 e reuacutene os isolados A113 A131 A133 ESIA1 e A321 que apresentaram identidade
com P chimonanthi e com uma linhagem de Phomopsis sp endofiacutetica de Coffea
robusta (DQ123615) Esta linhagem foi isolada e sequumlenciada por Sette et al (2006) e
apresentou 99 de similaridade com as mesmas espeacutecies P chimonanthi P
michaeliae e Diaporthe helianthi (FIGURAS 19 e 20) A espeacutecie P chimonanthi foi
recentemente proposta por Chang e colaboradores (dados natildeo publicados) para
isolados antes denominados de P michaeliae Como esta espeacutecie foi descrita em 1987
e aceita ateacute o momento no presente trabalho sugere-se que os isolados A113 A131
A133 ESIA1 e A321 sejam classificados como P michaeliae
O isolado ESIA1 foi obtido de Espinheira Santa (Maytenus ilicifolia) enquanto os
demais isolados deste clado foram obtidos de Aroeira Vermelha (Schinus
terebinthifolius) Esses isolados apresentaram baixa similaridade geneacutetica quando
avaliados por RAPD e similaridade parcial quanto agraves caracteriacutesticas morfoloacutegicas uma
vez que fazem parte do mesmo agrupamento no diacircmetro da colocircnia em meio BDA
(Grupo C) e MEA (Grupo E)
86
FONTE O autor FIGURA 19 AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MEacuteTODO DE PARCIMOcircNIA)
ESIA1
A321
A113
A131
AY6229931| Phomopsis
P michaellae
Phomopsis sp S5 A116
ESRD1
ESJE2
ESKD1
Phomopsis sp S1
Phomopsis sp S9 A124
A334
A323Phomopsis sp S8
Phomopsis sp S2 A123
AJ3123481| Diaporthe helianthi
DQ2862851| Phomopsis sp CBS
AY8578681| Phomopsis longicolla
AF000207| Phomopsis longicolla
AF0010242| Diaporthe phaseolorum
DQ2356701| Phomopsis sp P4
Phomopsis sp S10 ESGA1
DQ2356731| Phomopsis sp P7
PHO19
AY0506271| Phomopsis sojae
DQ2356691| Phomopsis sp P3
P sojae
AF3584411 Diaporthe helianthi
AJ3123631| Diaporthe helianthi
SM9713
P longicolla PHO1
MU0123
P longicolla
A126
ESJH1Phomopsis sp S11
Phomopsis sp S12 ESJD1
Phomopsis sp S7 ESDF1
AB1051481| Diaporthe melonis
ES2AB1
ESBA1Phomopsis sp S6
AB1051471| Diaporthe melonis
AY6229961| Phomopsis camptothecae
AJ3123591| Diaporthe
AY7450241| Diaporthe
ES2KF1
ES2WF1
ESPAC22
Phomopsis sp S4
Phomopsis sp S3 ESGF1
AB2014431| Diaporthe conorum
DQ1165511| Diaporthe conorum CBS
SM9638
ESFH1
DQ2862861| Phomopsis theicola
AF230762 Phomopsis sp taxon 3
AY4857241| Phomopsis sp 1
DQ2862871| P theicola CBS
P theicola
Pestalotiopsis vismae
99
99
3599
98
91
7786
78
75
73
2973
5
5
3
2
11
71
70
25
22
33
40
67
63
33
44
65
41
34
29
27
21
21
18
13
12
8
7
5
3
3
0
0
0
19
32
23
31
87
Os isolados ESRD1 ESKD1 e ESJE2 apresentaram homologia quanto as
sequumlecircncias de ITS com suporte de bootstrap de 95 (FIGURA 19) Entretanto a figura
17 revela que por meio de marcadores RAPD os isolados ESKD1 e ESJE2 satildeo mais
proacuteximos apresentando 92 de similaridade geneacutetica (com bootstrap de 65) e 85
de similaridade desses isolados com o ESJE1 Assim sugere-se que estes 3 isolados
pertenccedilam agrave mesma espeacutecie Entretanto as sequumlecircncias ITS natildeo apresentaram
identidade superior a 90 com nenhuma sequumlecircncia depositada no GenBank Assim
esses isolados foram denominados de Phomopsis sp S1
FONTE O autor FIGURA 20 AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA PARCIAL BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MODELO NEIGHBOR-JOINING COM CORRECcedilAtildeO KIMURA DOIS PARAcircMETROS)
O isolado PHO19 (patogecircnico de soja) foi classificado como Phomopsis sojae
formou um clado com um endoacutefito natildeo identificado (P3) e com um isolado da espeacutecie P
sojae (FIGURA 19) O isolado Phomopsis sp P3 foi obtido como endoacutefito de Tectona
grandis por Murali Surynarayanan e Geeta (2006)
A113
DQ1236151| Phomopsis sp CBMAI
ESIA1
AY6229931| Phomopsis chimonanthi
A131
A133
P michae liae
A124
A334
ESGA1
DQ1165521| Diaporthe conorum cbs 199-3990
98
62252719
0005
88
Os isolados MU0123 SM9713 e P longicolla (PHO1) apresentaram alta
homologia das sequumlecircncias (clado suportado com 99 de bootstrap) (FIGURA 19) Os
isolados SM9713 e P longicolla (PHO1) apresentaram 893 de similaridade geneacutetica
(com suporte de bootstrap de 100) utilizando-se marcadores RAPD (FIGURA 17) Na
anaacutelise morfoloacutegica os isolados MU0123 e SM9713 apresentaram mais de 70 de
similaridade poreacutem o isolado P longicolla (PHO1) apresentou caracteriacutesticas
morfoloacutegicas diferentes dos isolados MU0123 e SM9713 (FIGURA 11) O isolado PHO1
foi isolado como patoacutegeno de soja (Glycine max (L) Merr) no Mato Grosso enquanto os
isolados MU0123 e SM9713 foram obtidos como endofiacuteticos de Aroeira (Myracrodruon
urundeuva) e Cajaacute (Spondias mombin) respectivamente ambos no estado do Paraacute Em
funccedilatildeo das similaridades geneacuteticas observadas e por ser o isolado PHO1 utilizado
como referecircncia de P longicolla os isolados endofiacuteticos MU0123 e SM9713 foram
identificados como pertencentes a esta espeacutecie A alta similaridade geneacutetica destes
isolados sugere que pertenccedilam agrave mesma espeacutecie o que reforccedila as observaccedilotildees
anteriores de que a definiccedilatildeo de espeacutecie do gecircnero Phomopsis natildeo eacute possiacutevel
utilizando-se apenas caracteriacutesticas morfoloacutegicas O fato de isolados endofiacuteticos de S
mombin e M urundeuva serem identificados como P longicolla demonstra que
espeacutecies patogecircnicas para um hospedeiro podem colonizar de forma assintomaacutetica
diferentes espeacutecies vegetais Isso jaacute foi observado para outros gecircneros como
Guignardia e Phyllosticta (BAAYEN et al 2002 GLIENKE-BLANCO et al 2002)
Os endoacutefitos ESBA1 e ES2AB1 foram reunidos no mesmo clado sendo
denominados de Phomopsis sp S6 (FIGURA 19) esses isolados fazem parte do
mesmo agrupamento utilizando-se marcadores RAPD (FIGURA 17)
Os isolados A323 e A334 apresentaram grande identidade geneacutetica (suportado
com bootstrap de 70) e seu agrupamento estaacute representado na figura 19 Esses
isolados natildeo apresentaram identidade moderada a nenhuma das sequumlecircncias
depositadas no GenBank e portanto natildeo foi possiacutevel inferir sobre a espeacutecie desses
endoacutefitos Sugere-se que esses isolados de Aroeira pertenccedilam agrave mesma espeacutecie e
portanto foram denominados de Phomopsis sp S8 Os isolados ES2KF1 ES2WF1 e
89
ESPAC22 endoacutefitos de Espinheira Santa foram reunidos num mesmo clado sendo
denominados de Phomopsis sp S4 (FIGURA 19)
Os isolados A126 e ESJH1 foram reunidos no mesmo clado sendo denominados
de Phomopsis sp S11 eles foram isolados de diferentes plantas hospedeiras O
isolado ESJH1 foi obtido de Espinheira Santa (Maytenus ilicifolia) enquanto o isolado
A126 foi obtido de Aroeira Vermelha (Schinus terebinthifolius) Estes resultados
reforccedilam a dificuldade em inferir espeacutecies do gecircnero Phomopsis com base na planta
hospedeira
Os isolados A116 A124 A123 ESGA1 ESJD1 ESDF1 e ESGF1 natildeo
apresentaram identidade com nenhuma sequumlecircncia depositada no GenBank nem
similaridade com outros isolados analisados no presente trabalho Sugere-se que esses
endoacutefitos pertenccedilam a diferentes espeacutecies
No uacuteltimo clado o isolado ESFH1 apresentou homologia com a regiatildeo ITS1-
rDNA 58S - ITS2 da espeacutecie P theicola (DQ286286 e DQ286287) e com o isolado
SM9638 (FIGURA 19) Estes dois isolados foram obtidos de diferentes plantas
hospedeiras O isolado ESFH1 foi obtido em 2006 de M ilicifolia no Paranaacute enquanto o
isolado SM9638 foi obtido em 1996 como endofiacutetico da planta Spondias mombin no
Estado do Paraacute Esses isolados apresentam baixa similaridade morfoloacutegica (FIGURAS
11 e 12) Estes resultados reforccedilam a dificuldade em inferir espeacutecies do gecircnero
Phomopsis especialmente utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas
No presente trabalho observou-se que vaacuterias espeacutecies de Phomopsis foram
isoladas de um mesmo hospedeiro assim como uma mesma espeacutecie foi encontrada
colonizando diferentes hospedeiros Isto jaacute foi relatado no gecircnero Phomopsis por
Brayford (1990) Farr Castlebury e Rossman (2002) e por Rehner e Uecker (1994)
Esses resultados reforccedilam a necessidade de revisatildeo do conceito de espeacutecie para o
gecircnero Phomopsis uma vez que muitas espeacutecies tecircm sido identificadas com base na
planta hospedeira (GAMBOA-GAITAacuteN LAUREANO e BAYMAN 2005 MURALI
SURYANARAYANAN GEETA 2006)
Os dados morfoloacutegicos e de RAPD foram altamente variaacuteveis e a anaacutelise das
sequumlecircncias da regiatildeo ITS1- 58S - ITS2 do rDNA foi informativa para alguns dos
90
isolados analisados Entretanto mais estudos satildeo necessaacuterios para a identificaccedilatildeo
precisa dessas espeacutecies A literatura eacute escassa quanto a trabalhos de taxonomia
morfologia biologia e ecologia de isolados endofiacuteticos do gecircnero Phomopsis Segundo
Phillips (2006) a identificaccedilatildeo das espeacutecies do gecircnero Phomopsis eacute difiacutecil porque as
espeacutecies natildeo estatildeo claramente definidas e existe uma sobreposiccedilatildeo entre os caracteres
morfoloacutegicos que as definem
A maioria das sequumlecircncias depositadas no GenBank satildeo de isolados
provenientes de lesotildees sendo portanto de espeacutecies patogecircnicas No presente trabalho
eacute possiacutevel que os isolados pertencentes a clados que natildeo se agruparam com nenhuma
sequumlecircncia jaacute depositada pertenccedilam a novas espeacutecies ou ainda a espeacutecies de
endoacutefitos ainda natildeo sequumlenciados Murali Surynarayanan e Geeta (2006)
caracterizaram por meio de sequumlenciamento da regiatildeo ITS e dados morfoloacutegicos 11
isolados endofiacuteticos de Phomopsis obtidos de Tectona grandis e Cassia fistula Eles
sugerem que apesar da grande variabilidade encontrada os isolados devem ser
reunidos em apenas dois grupos entretanto natildeo foi possiacutevel a identificaccedilatildeo em niacutevel
de espeacutecie Segundo os autores isto natildeo foi possiacutevel em funccedilatildeo dos fungos deste
gecircnero natildeo terem hospedeiros especiacuteficos e pela necessidade de revisatildeo do conceito
de espeacutecie em Phomopsis
Farr Castlebury e Rossman (2002) caracterizaram por anaacutelise de sequumlecircncias
ITS1 58S ITS2 e por caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de Phomopsis sp
isolados de Vaccinium corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse estudo
verificaram que a maioria dos isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma vez que
as sequumlecircncias agruparam-se com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
Castlebury e Mengistu (2006) avaliaram Phomopsis isolados de soja e outros
hospedeiros combinando dados de sequumlecircncias de ITS do rDNA do gene do fator1 alfa
de elongaccedilatildeo da traduccedilatildeo (ef-1) e genes de actina Foram formados seis grupos de
Phomopsis sendo que trecircs correspondem aos taacutexons P longicolla Diaporthe melonis e
D phaseolorum Os autores concluiacuteram que a ausecircncia de distinccedilatildeo morfoloacutegica e
informaccedilatildeo bioloacutegica tornam problemaacutetica a identificaccedilatildeo de espeacutecies deste gecircnero
91
No presente trabalho com base nos dados de RAPD (FIGURAS 17 e 18) pode-
se sugerir a existecircncia de pelo menos 10 espeacutecies de Phomopsis colonizando de forma
endofiacutetica as plantas de Maytenus ilicifolia analisadas Tais plantas satildeo provenientes de
um uacutenico pomar localizado no CNPFEMPRAPA em ColomboPR Ainda eacute possiacutevel
sugerir a existecircncia de pelo menos seis espeacutecies de Phomopsis colonizando de forma
endofiacutetica a planta de S terebinthifolius analisada neste trabalho Esta planta natildeo
recebeu qualquer tratamento com fungicidas ou outro agrotoacutexico uma vez que se
encontra isolada entre dois blocos do Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas da UFPR (ANEXO
13) Talvez isso justifique a grande diversidade de isolados encontrada Esses dados
demonstram a importacircncia de estudos da comunidade endofiacutetica em plantas medicinais
e apontam para o problema da reduccedilatildeo de diversidade de microrganismos endofiacuteticos
pelo uso continuado de fungicidas
Resultados semelhantes foram obtidos por Gamboa-Gaitaacuten Laureano e Bayman
(2005) estudando isolados de Phomopsis endofiacuteticos da planta medicinal Guarea
guidonia (Meliaceae) Os autores relataram elevados niacuteveis de variabilidade geneacutetica
avaliada pela digestatildeo da regiatildeo ITS e tambeacutem a alta variabilidade morfoloacutegica entre
os isolados avaliados A aacutervore molecular agrupou indiviacuteduos fenotipicamente
diferentes Por outro lado Fernandez e Hanlin (1996) obtiveram resultados
concordantes entre a anaacutelise molecular por RAPD e as caracteriacutesticas morfoculturais
separando os isolados coletados de soja em dois grupos Diaporthe phaseolorum e
Phomopsis longicolla
Pioli et al (2003) caracterizaram por RAPD isolados do complexo
DiaporthePhomopsis coletados de soja na Argentina Eles foram separados em quatro
grupos (i) Diaporthe phaseolorum variedade meridionalis (ii) D phaseolorum variedade
caulivora (iii) D phaseolorum variedade sojae and (iv) Phomopsis longicolla revelando
a existecircncia de variabilidade entre isolados da mesma variedade
92
54 Avaliaccedilatildeo da atividade antimicrobiana 541 Cultura pareada
Os isolados de Phomopsis foram avaliados pela teacutecnica de cultura pareada
contra as linhagens PC1396 e PC3305 do fitopatoacutegeno G citricarpa As interaccedilotildees
foram classificadas em trecircs tipos 1) Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno com
sobreposiccedilatildeo de hifas 2) Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno sem sobreposiccedilatildeo
de hifas e 3) Ausecircncia de inibiccedilatildeo de crescimento Os resultados obtidos estatildeo
apresentados nas Tabelas 9 e 10
Todos os isolados de Phomopsis inibiram significativamente o crescimento das
duas linhagens de Guignardia exceto o isolado ES2WC1 (Phomopsis sp) que
apresentou interaccedilatildeo do tipo 3 em que natildeo houve inibiccedilatildeo significativa do fitopatoacutegeno
apenas 287 e 828 contra PC1396 e PC3305 respectivamente (ANEXO 6 7 8 e
9) Foi observado que as duas linhagens de G citricarpa apresentaram o mesmo tipo
de interaccedilatildeo frente ao mesmo isolado de Phomopsis ou seja natildeo houve variaccedilatildeo
quanto a linhagem do fitopatoacutegeno avaliado Tal observaccedilatildeo reforccedila a importacircncia dos
resultados aqui apresentados
Dos 49 isolados de Phomopsis endoacutefitos de plantas medicinais avaliados 38
inibiram o crescimento das duas linhagens do fitopatoacutegeno G citricarpa com
porcentagem de inibiccedilatildeo superior a 50 Os isolados A333B (Phomopsis sp) ESGF1
(Phomopsis sp S3) SM9638 (P theicola) AT9810 (Phomopsis sp) AT9906
(Phomopsis sp) e ES2WC1 (Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo inferiores
a 50 contra PC1396 e PC3305 os isolados ES80J (Phomopsis sp) e AT9811
(Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo inferiores a 50 apenas contra a
linhagem PC1396 enquanto contra a PC3305 a inibiccedilatildeo foi de 5132 e 5397
respectivamente Por outro lado os isolados de Phomopsis ESFF1 (Phomopsis sp)
SM9714 (Phomopsis sp) e A132 (Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo
inferiores a 50 apenas contra a linhagem PC3305 enquanto contra PC1396 a
inibiccedilatildeo foi de 5017 6215 e 5492 respectivamente
93
A anaacutelise estatiacutestica demonstrou que haacute diferenccedila significativa entre o controle e
os isolados avaliados O fungicida Derosal apresentou inibiccedilatildeo do crescimento do
fitopatoacutegeno em aproximadamente 19 todos os isolados de Phomopsis que
apresentaram inibiccedilatildeo superior ao fungicida com significacircncia no teste estatiacutestico exceto
o isolado ES2WC1 (Phomopsis sp) como citado anteriormente (TABELA 8 e 9 ANEXO
6 7 8 e 9)
As interaccedilotildees do tipo 1 nas quais ocorre agrave sobreposiccedilatildeo de hifas do endoacutefito
sobre o fitopatoacutegeno sugere a ocorrecircncia de parasitismo Esse tipo de interaccedilatildeo entre
os isolados de Phomopsis e as linhagens de G citricarpa ocorreu em 47 dos isolados
Tais isolados apresentam diferenccedila significativa entre o controle destacando-se os
isolados ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) (FIGURA 21) ESJD1
(Phomopsis sp S12) e ESJH1 (Phomopsis sp S11) que inibiram o crescimento de G
citricarpa PC1396 em 7338 6885 6826 e 6792 respectivamente A anaacutelise
estatiacutestica demonstra que haacute diferenccedila significativa entre o controle e estes isolados
poreacutem natildeo haacute diferenccedila significativa entre os mesmos (ANEXO 6 7 e 8)
As interaccedilotildees do tipo 2 nas quais natildeo ocorre sobreposiccedilatildeo de hifas ocorreram
em 51 dos isolados destacando-se os isolados ESSD1 (Phomopsis sp) e SM9713
(P longicolla) que inibiram o crescimento da linhagem PC1396 de G citricarpa em
7324 e 6763 respectivamente A anaacutelise estatiacutestica demonstra que haacute diferenccedila
significativa entre o controle e os isolados ESSD1 (Phomopsis sp) e SM9713 (P
longicolla) os isolados de Phomopsis tambeacutem diferem entre si (TABELA 8) Essas
interaccedilotildees devem ser avaliadas posteriormente em microscopia oacutetica para confirmar se
estaacute ocorrendo parasitismo
FIGURA 21 INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa PC1396 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA
Phomopsis A134
G Citricarpa PC1396
Phomopsis SM9713
G Citricarpa PC1396
G Citricarpa PC1396 Controle
G Citricarpa PC1396
Fungicida Derosal
FONTE O autor
94
Isolados Identificaccedilatildeo Tipo de Interaccedilatildeo Inibiccedilatildeo () Fungicida 19
ESDF1 Phomopsis sp S7 1 7338 ESSD1 Phomopsis sp 2 7324 A134 Phomopsis sp 1 6885
ESJD1 Phomopsis sp S12 1 6826 ESJH1 Phomopsis sp S11 1 6792 SM9713 P longicolla 2 6763 ESIE1 Phomopsis sp 1 6758 ESFB2 Phomopsis sp 1 6724
MU0123 P longicolla 2 6663 ESRD1 Phomopsis sp S1 2 6655 ESJG1 Phomopsis sp 2 6621 ESJE1 Phomopsis sp S1 1 6621
ESPAC22 Phomopsis sp S4 1 6516 A131 P michaeliae 2 6393 A126 Phomopsis sp S11 1 6352 A123 Phomopsis sp S2 1 6270 A113 P michaeliae 1 6270
SM9631 Phomopsis sp 1 6265 ES2AB1 Phomopsis sp S6 1 6246 ESJE2 Phomopsis sp S1 1 6246 A323 Phomopsis sp S8 1 6230
SM9714 Phomopsis sp 1 6215 ES2NA1 Phomopsis sp 1 6212
A334 Phomopsis sp S8 1 6189 ESBA1 Phomopsis sp S6 2 6177 A321 P michaeliae 1 6148
ESKD1 Phomopsis sp S1 1 6109 A216B Phomopsis sp 2 6025
ES2KF1 Phomopsis sp S4 2 5939 ESIA1 P michaeliae 2 5904 A135 Phomopsis sp 2 5902 A124 Phomopsis sp S9 2 5861
A115B Phomopsis sp 1 5861 A116 Phomopsis sp S5 2 5820
A215A Phomopsis sp 1 5656 A132 Phomopsis sp 2 5492
ESFH1 P theicola 2 5427 A333A Phomopsis sp 1 5369 ESGA1 Phomopsis sp S10 2 5324
ES2WF1 Phomopsis sp S4 2 5205 ESFF1 Phomopsis sp 2 5017 AT9811 Phomopsis sp 1 4920 ESGF1 Phomopsis sp S3 2 4642 SM9638 P theicola 1 4522 A333B Phomopsis sp 1 4426 ES80J Phomopsis sp 2 4344 AT9810 Phomopsis sp 2 4173 AT9906 Phomopsis sp 2 3078 ES2WC1 Phomopsis sp 3 287
FONTE O autor
TABELA 8 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC1396
95
A interaccedilatildeo do tipo 1 entre os isolados de Phomopsis e a linhagem PC3305 de
G citricarpa ocorreu em 47 dos isolados a reduccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno
apresentou diferenccedila significativa quando comparados com o controle destacando-se
os isolados A215A (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ESDF1 (Phomopsis sp
S7) ESJD1 (Phomopsis sp S12) A123 (Phomopsis sp S2) que inibiram o crescimento
da linhagem PC3305 de G citricarpa em 7947 7616 7152 7119 e 7119
respectivamente (TABELA 9 FIGURA 22) A anaacutelise estatiacutestica demonstra que haacute
diferenccedila significativa entre o controle e os isolados A215A (Phomopsis sp) A115B
(Phomopsis sp) ESDF1 (Phomopsis sp S7) ESJD1 (Phomopsis sp S12) A123
(Phomopsis sp S2) A215A A115B ESDF1 ESJD1 A123 mas os isolados de
Phomopsis natildeo diferem entre si (ANEXO 9)
Os isolados ESRD1 (Phomopsis sp S1) e A135 (Phomopsis sp) apresentaram
as maiores taxas de inibiccedilatildeo do crescimento da linhagem PC3305 de G citricarpa pela
interaccedilatildeo do tipo 2 6887 e 6623 respectivamente (TABELA 9) A anaacutelise estatiacutestica
demonstra que haacute diferenccedila significativa entre o controle e os isolados ESRD1
(Phomopsis sp S1) e A135 (Phomopsis sp) esses isolados de Phomopsis diferem
entre si (ANEXO 9) Essas interaccedilotildees devem ser avaliadas posteriormente ao
microscoacutepio para confirmar se estaacute ocorrendo parasitismo
O isolado SM9713 (P longicolla) inibiu o crescimento do patoacutegeno G citricarpa e
produziu esporos em volta da colocircnia Segundo Boosalis (1964) a esporulaccedilatildeo pode
ocorrer quando determinados hospedeiros estimulam a reproduccedilatildeo de seus parasitas
Resultados semelhantes foram encontrados por Martins-Corder e Melo (1998) onde
observaram que a maioria dos isolados de Trichoderma spp antagonistas colonizou e
produziu esporos em abundacircncia sobre as colocircnias de Verticillium dahliae
As interaccedilotildees do tipo 2 mostram inibiccedilatildeo mutua na qual o endoacutefito natildeo sobrepotildee
a colocircnia do fitopatoacutegeno apesar de inibir seu crescimento Segundo Bell et al (1982)
os antagonistas selecionados pelo confronto direto satildeo aqueles que apresentam
crescimento sobre o fitopatoacutegeno Poreacutem a relaccedilatildeo entre o tipo de interaccedilatildeo e a
porcentagem de inibiccedilatildeo observada nos resultados natildeo satildeo congruentes uma vez que
96
a porcentagem de inibiccedilatildeo para alguns isolados com interaccedilatildeo do Tipo 2 eacute maior do que
para aqueles com interaccedilatildeo do Tipo 1
Isolados Identificaccedilatildeo Tipo de Interaccedilatildeo
Inibiccedilatildeo ()
Fungicida 1921 A215A Phomopsis sp 1 7947 A115B Phomopsis sp 1 7616 ESDF1 Phomopsis sp S7 1 7152 ESJD1 Phomopsis sp S12 1 7119 A123 Phomopsis sp S2 1 7119
ESFB2 Phomopsis sp 1 7086 ESJE2 Phomopsis sp S1 1 7020 ESJH1 Phomopsis sp S11 1 7020
SM9631 Phomopsis sp 1 6921 ESRD1 Phomopsis sp S1 2 6887 A135 Phomopsis sp 2 6623 A126 Phomopsis sp S11 1 6490
ESPAC22 Phomopsis sp S4 1 6424 A131 P michaeliae 2 6424
ESJE1 Phomopsis sp 1 6358 ES2KF1 Phomopsis sp S4 2 6298
A334 Phomopsis sp S8 1 6291 A124 Phomopsis sp S9 2 6258 ESIA1 P michaeliae 2 6126 ESKD1 Phomopsis sp S1 1 5993 ESSD1 Phomopsis sp L5 2 5960 A134 Phomopsis sp 1 5861 A113 P michaeliae 1 5795
TABELA 9 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 (CONTINUA)
FIGURA 22 INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa 3305 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA
G citricarpa PC3305
Phomopsis ESRD1
Phomopsis ESDF1
G citricarpa PC3305
G citricarpa PC3305 controle
Fungicida Derosal
G citricarpa PC3305
FONTE O autor
97
A333A Phomopsis sp 1 5728 ESIE1 Phomopsis sp 1 5695 ESJG1 Phomopsis sp 2 5662 A323 Phomopsis sp S8 1 5629
ES2AB1 Phomopsis sp S6 1 5596 ESBA1 Phomopsis sp S6 2 5563 A116 Phomopsis sp S5 2 5464
AT9811 Phomopsis sp 1 5397 A216B Phomopsis sp 2 5364 A321 P michaeliae 1 5331
SM9713 P longicolla 2 5298 ES2NA1 Phomopsis sp 1 5265 MU0123 P longicolla 2 5232 ESFH1 Phomopsis sp 2 5132 ES80J Phomopsis sp 2 5132 ESGA1 Phomopsis sp S10 2 5079
ES2WF1 Phomopsis sp S4 2 5033 ESFF1 P theicola 2 4934
SM9714 Phomopsis sp 1 4735 A132 Phomopsis sp 2 4470
A333B Phomopsis sp 1 3775 ESGF1 Phomopsis sp S3 2 3344 SM9638 P theicola 1 2781 AT9810 Phomopsis sp 2 2649 AT9906 Phomopsis sp 2 2583 ES2WC1 Phomopsis sp 3 828
FONTE O autor 542 Teste para detecccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
No teste de metaboacutelitos volaacuteteis observou-se reduccedilatildeo do crescimento da
linhagem PC1396 e PC3305 de G citricarpa apoacutes a retirada do celofane onde
inicialmente foram inoculados os isolados de Phomopsis Todos os isolados testados
inibiram significativamente o crescimento das duas linhagens de G citricarpa Os
isolados A115B (Phomopsis sp) A134 (Phomopsis sp) ESFF1 (Phomopsis sp)
ESFH1 (Phomopsis theicola) A123 (Phomopsis sp S2) e S2WF1 (Phomopsis sp S4)
apresentaram maior inibiccedilatildeo do crescimento das duas linhagens do fitopatoacutegeno
(ANEXO 10 e 11 e FIGURA 23) sugerindo que a interaccedilatildeo entre os isolados de
Phomopsis e o fitopatoacutegeno ocorre devido agrave produccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
TABELA 9 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 (CONTINUACcedilAtildeO)
98
FONTE O autor FIGURA 23 AVALIACcedilAtildeO DO CRESCIMENTO DAS COLOcircNIAS DO FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 e PC3305 INOCULADAS APOacuteS RETIRADA DO PAPEL CELOFANE PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS EM MEIO BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
Nota a Placa com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC3305 inoculado apoacutes retirada do celofane onde previamente foi inoculado o isolado ESFH1 b Placa controle com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC3305 c Placa com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396 inoculado apoacutes retirada do celofane onde previamente foi inoculado o isolado ESFH1 d Placa controle com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396
FIGUEIREDO (2006) utilizou a teacutecnica de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis em
Pestalotiopsis isolados endofiacuteticos de Maytenus ilicifolia e observou uma reduccedilatildeo do
crescimento da linhagem PC1396 de G citricarpa demonstrando que a interaccedilatildeo
ocorre principalmente pela produccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
Os resultados apresentados aqui demonstram o grande potencial que tais
linhagens endofiacuteticas de Phomopsis possuem como agentes de controle da Mancha
Preta dos Citros e o seu potencial na produccedilatildeo de metaboacutelitos
543 Avaliaccedilatildeo da accedilatildeo dos Extratos
Na avaliaccedilatildeo dos extratos quanto agrave inibiccedilatildeo do crescimento das linhagens
PC1396 e PC3305 de G citricarpa os resultados indicam que a maioria dos extratos
metanoacutelicos produzidos a partir dos isolados de Phomopsis reduziram o crescimento
micelial de ambas as linhagens do fitopatoacutegeno da MPC A inibiccedilatildeo ocorreu devido aos
metaboacutelitos secundaacuterios produzidos pelos isolados endofiacuteticos quando comparados
com o crescimento micelial dos controles com metanol (onde o extrato foi diluiacutedo) e
com aacutegua destilada (FIGURA 24 25 e TABELA 10)
a b c d
99
Foi observado que os isolados de Phomopsis que apresentaram as maiores
porcentagens de inibiccedilatildeo pela teacutecnica de cultura pareada tambeacutem inibiram o
crescimento quando foi utilizado o extrato metanoacutelico Entretanto o isolado ES2WC1
(Phomopsis sp) que natildeo inibiu o crescimento pela teacutecnica de cultura pareada
apresentou reduccedilatildeo no crescimento micelial dos dois fitopatoacutegenos avaliados
utilizando-se o seu extrato metanoacutelico Provavelmente essa falta de inibiccedilatildeo pela
teacutecnica de cultura pareada tenha ocorrido pelo fato do isolado ES2WC1 (Phomopsis
sp) apresentar crescimento lento fazendo com que o crescimento do fitopatoacutegeno natildeo
diferisse significativamente do controle
Os isolados ES80J (Phomopsis sp) ESFF1 (Phomopsis sp) A132 (Phomopsis
sp) A333B (Phomopsis sp) e SM9638 (P theicola) natildeo inibiram o crescimento micelial
de nenhum dos fitopatoacutegenos avaliados Para alguns isolados de Phomopsis natildeo foi
possiacutevel determinar o potencial antimicrobiano dos extratos metanoacutelicos pois houve
grande variaccedilatildeo de accedilatildeo entre as repeticcedilotildees do experimento
FONTE O autor
C
D E F
A B
NOTA A Placa controle com aacutegua destilada autoclavada B Placa controle com metanolC Placa controle com fungicida Derosal reg (10 mgmL) D Placa com extrato metanoacutelicodo isolado ES2WC1 E Placa com extrato metanoacutelico do isolado A215A F Placa comextrato metanoacutelico do isolado ESDF1
FIGURA 24 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NOCRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC3305 DE G citricarpa EMMEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
100
Rodrigues-Heerklotz et al (2001) elucidaram a estrutura quiacutemica e a siacutentese
assimeacutetrica de um novo metaboacutelito o aacutecido guignardico produzido pelo fungo endofiacutetico
Guignardia sp isolado de Spondias mombin Silva et al (2005) isolaram dois
metaboacutelitos de Phomopsis cassiae endofiacutetico de Cassia specatabilis 24-diidroxi-56-
dimetil benzoato de etila e phomopsilactona que exibiram forte atividade antifuacutengica
contra fitopatoacutegenos bem como citotoxicidade contra a linhagem celular de tumor
cervical humano (HeLa) Estudos adicionais devem ser realizados para determinar a
estrutura quiacutemica produzida pelos endoacutefitos de Phomopsis estudados
NOTA A Placa controle com aacutegua destilada autoclavada B Placa controle commetanol C Placa controle com fungicida Derosal reg (10 mgmL)D Placa com extratometanoacutelico do isolado ES2WC1 E Placa com extrato metanoacutelico do isolado ESGA1 FPlaca com extrato metanoacutelico do isolado ESSD1
FONTE O autor FIGURA 25 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NOCRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 DE G citricarpa EMMEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
C
D E F
A B
101
Os resultados da tabela 10 revelam que os isolados endofiacuteticos de Phomopsis
spp avaliados satildeo bastante promissores demonstrando um potencial na produccedilatildeo de
metaboacutelitos Resultados semelhantes foram obtidos por Moller Weber e Dreyfuss
(1996) que avaliaram a accedilatildeo de endoacutefitos de plantas tropicais com alta produccedilatildeo de
metaboacutelitos secundaacuterios
Identificaccedilatildeo Isolados Inibiccedilatildeo PC3305 Cultura Pareada
Inibiccedilatildeo PC3305 Extrato
Metanoacutelico
Inibiccedilatildeo () PC1396 Cultura Pareada
Inibiccedilatildeo PC1396 Extrato
Metanoacutelico Derosal Fungicida 1921 I 19 I
P longicolla SM9713 5298 I 6763 I P longicolla MU0123 5232 ND 6663 I P michaeliae A131 6424 I 6393 I P michaeliae ESIA1 6126 I 5904 I Phomopsis sp A333A 5728 I 5369 I P michaeliae A321 5331 I 6148 I P michaeliae A113 5795 ND 627 ND Phomopsis sp S2 A123 7119 ND 627 ND P theicola ESFH1 5132 I 5427 I Phomopsis sp ESFF1 4934 NI 5017 NI P theicola SM9638 2781 NI 4522 NI Phomopsis sp S4 ES2WF1 5033 I 5205 I Phomopsis sp S3 ESGF1 3344 I 4642 I Phomopsis sp S10 ESGA1 5079 I 5324 I Phomopsis sp S1 ESRD1 6887 I 6655 I Phomopsis sp S8 A334 6291 I 6189 I Phomopsis sp S9 A124 6258 I 5861 I Phomopsis sp S7 ESDF1 7152 I 7338 I Phomopsis sp ESSD1 596 I 7324 I Phomopsis sp S6 ES2AB1 5596 I 6246 I Phomopsis sp S6 ESBA1 5563 I 6177 I Phomopsis sp S11 A126 649 ND 6352 ND Phomopsis sp S12 ESJD1 7119 I 6826 I Phomopsis sp S1 ESJE1 6358 I 6621 I Phomopsis sp S1 ESJE2 702 ND 6246 ND Phomopsis sp S1 ESKD1 5993 ND 6109 ND Phomopsis sp A115B 7616 I 5861 I Phomopsis sp ESFB2 7086 I 6724 I Phomopsis sp S11 ESJH1 702 I 6792 I Phomopsis sp A135 6623 I 5902 ND Phomopsis sp A134 5861 I 6885 I Phomopsis sp ESIE1 5695 I 6758 I Phomopsis sp ESJG1 5662 ND 6621 I
TABELA 10 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO CRESCIMENTO MICELIAL DASCOLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTOA 28ordmC (CONTINUA)
102
Phomopsis sp AT9811 5397 I 492 I Phomopsis sp A216B 5364 I 6025 I Phomopsis sp ES2NA1 5265 I 6212 I Phomopsis sp SM9714 4735 I 6215 I Phomopsis sp ES2WC1 828 I 287 I Phomopsis sp SM9631 6921 ND 6265 ND Phomopsis sp S4 ESPAC22 6424 ND 6516 ND Phomopsis sp S4 ES2KF1 6298 ND 5939 ND Phomopsis sp S8 A323 5629 ND 623 ND Phomopsis sp S5 A116 5464 ND 582 ND Phomopsis sp AT9810 2649 ND 4173 ND Phomopsis sp AT9906 2583 ND 3078 ND Phomopsis sp ES80J 5132 NI 4344 NI Phomopsis sp A132 447 NI 5492 NI Phomopsis sp A333B 3775 NI 4426 NI Phomopsis sp A215A 7947 I 5656 I
FONTE O autor
NOTA I- Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno NI- Natildeo ocorreu inibiccedilatildeo do fitopatoacutegeno ND- Natildeo foi determinado a inibiccedilatildeo
No Brasil as plantas Spondias mombin e A tomentosum tecircm sido usadas na
medicina devido as suas propriedades antimicrobianas (AJAO SHONUKAN e FEMI
1984) Os isolados de Phomopsis obtidos como endoacutefitos de S mombin (SM9713 (P
longicolla) SM9638 (P theicola) e SM9714 (Phomopsis sp)) e A tomentosum (AT9810
(Phomopsis sp) AT9811 (Phomopsis sp) e AT9906 (Phomopsis sp)) avaliados no
presente trabalho jaacute haviam sido relatados por Corrado e Rodrigues (2004) como
produtores de compostos bioativos Os autores relatam que os extratos metanoacutelicos
inibiram o crescimento de E coli S aureus P aeruginosa C albicans A niger e F
oxysporum No presente trabalho os isolados de S mombin e A tomentosum inibiram
o crescimento de Guignardia citricarpa confirmando o potencial desses isolados em
produzir substacircncias bioativas mais estudos devem ser realizados para verificar o
potencial antimicrobiano desses extratos contra bacteacuterias patogecircnicas e
fitopatogecircnicas
A planta Schinus terebinthifolius eacute usada no Brasil na medicina alternativa contra
doenccedilas da coacuternea (CORREcircA 1926) doenccedilas reumaacuteticas uacutelceras feridas tumores
linfaacuteticos erisipela e outras moleacutestias provocadas por bacteacuterias que se manifestam em
forma de edema ou eritema (BALBACH 1992) As linhagens de Phomopsis isoladas de
S terebinthifolius avaliadas nesse trabalho A135 (Phomopsis sp) A113 (P michaelae)
TABELA 10 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO CRESCIMENTO MICELIAL DASCOLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DECRESCIMENTO A 28ordmC (CONTINUACcedilAtildeO)
103
A115B (Phomopsis sp) A323 (Phomopsis sp S8) A132 (Phomopsis sp) A134
(Phomopsis sp) A333B (Phomopsis sp) A321 (P michaelae) A126 (Phomopsis sp
S11) A216B (Phomopsis sp) A334 (Phomopsis sp S8) A116 (Phomopsis sp S5)
A215A (Phomopsis sp) A124 (Phomopsis sp S9) A333A (Phomopsis sp) A131 (P
michaeliae) e A123 (Phomopsis sp S2) apresentaram excelentes resultados contra G
citricarpa
Extratos da planta M ilicifolia jaacute foram descritos na literatura apresentando
atividade antitumoral tambeacutem usado como analgeacutesico antinflamatoacuterio e antiaacutecido
(JORGE 2004 DUARTE 2005) Pileggi (2006) isolou microrganismos endofiacuteticos de
plantas de Maytenus ilicifolia do mesmo pomar investigado neste trabalho e avaliou o
potencial farmacoloacutegico dos mesmos Entre os fungos e bacteacuterias testados 15
apresentaram potencial para controle bioloacutegico
Figueiredo (2006) isolou fungos endofiacuteticos de plantas de M ilicifolia do mesmo
pomar investigado neste trabalho especialmente Pestalotiopsis spp e os avaliou quanto
ao potencial antimicrobiano contra bacteacuterias patogecircnicas em humanos e o fitopatoacutegeno
G citricarpa Os extratos metanoacutelicos de dois isolados exibiram accedilatildeo fungistaacutetica na
germinaccedilatildeo e no crescimento micelial das linhagens PC1396 e PC3305 de G
citricarpa Aleacutem disso dois extratos de Pestalotiopsis spp inibiram o crescimento dos
microrganismos-teste (S aureus oxalino resistente Klebsiella pneumoniae
Micrococcus luteus Staphylococcus aureus e Escherichia coli)
No presente trabalho observou-se que as linhagens de Phomopsis spp isolados
de M ilicifolia apresentaram excelentes resultados in vitro contra G citricarpa Pouco se
conhece a respeito da comunidade endofiacutetica existente nessas plantas e os resultados
desse trabalho demostram que abrigam uma grande variabilidade de PC1396 e
PC3305 espeacutecies de Phomopsis com portencial para bioprospecccedilatildeo Isto reforccedila a
importacircncia de estudos de microrganismos endofiacuteticos em plantas medicinais em
especial M ilicifolia e S terebinthifolius Faz-se necessaacuterio tambeacutem o estudo da
composiccedilatildeo quiacutemica dos extratos avaliados
104
6 CONCLUSOtildeES Os resultados obtidos no presente trabalho permitiram as seguintes conclusotildees
bull As espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo podem ser identificadas
apenas por caracteriacutesticas morfoloacutegicas ou marcadores moleculares
RAPD sendo necessaacuteria uma anaacutelise polifaacutesica incluindo
sequumlenciamento de vaacuterias regiotildees do genoma
bull As plantas medicinais analisadas satildeo colonizadas por grande
diversidade de espeacutecies de Phomopsis com grande variabilidade
morfoloacutegica e geneacutetica intra e interespeciacuteficas
bull As plantas de Maytenus ilicifolia analisadas satildeo colonizadas
endofiticamente por pelo menos 10 espeacutecies de Phomopsis sendo
possiacutevel identificar por sequumlecircncias ITS do rDNA isolados de P theicola e
P michaeliae
bull A planta de Schinus terebinthifolius analisada eacute colonizada
endofiticamente por pelo menos 6 espeacutecies de Phomopsis sendo
possiacutevel identificar por sequumlecircncias ITS do rDNA isolados de P
michaeliae
bull As espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo satildeo hospedeiro-especiacuteficas
sendo necessaacuteria a redefiniccedilatildeo do conceito de espeacutecie para este gecircnero
bull Os isolados de Phomopsis spp apresentaram grande potencial no
controle in vitro do fungo G citricarpa Os isolados ESIA1 e A131 (P
michaeliae) ESJE1 ESJE2 ESKD1 e ESRD1 (Phomopsis sp S1) A123
(Phomopsis sp S2) ES2KF1 e ESPAC22 (Phomopsis sp S4) ESDF1
105
(Phomopsis sp S7) A334 (Phomopsis sp S8) A124 (Phomopsis sp
S9) A126 e ESJH1 (Phomopsis sp S11) ESJD1 (Phomopsis sp S12) e
os isolados A134 A135 A115B A215A SM9631 ESFB2 e ESSD1
(Phomopsis sp) foram os mais promissores em inibir o crescimento das
linhagens PC1396 e PC3305 de G citricarpa nas metodologias
avaliadas
106
7 REFEREcircNCIAS BIBLIOGRAacuteFICAS ALBERTS B LEWIS J RALF M ROBERTS K WATSON J D Molecular Biology of the Cell 4ordf ed New York Garland Publishing 2004 ALICE C B SIQUEIRA N C S MENTZ L A SILVA G A A B JOSEacute K F D Plantas medicinais de uso popular Atlas farmacognoacutestico Canoas Editora da ULBRA 1995 ALZATE-MARIN A L BAIacuteA G S FALEIRO F G CARVALHO G A PAULA JR T J MOREIRA M A BARROS E G Anaacutelise da diversidade geneacutetica de raccedilas de Colletotrichum lindemuthianum que ocorrem em algumas regiotildees do Brasil por marcadores RAPD Fitopatologia Brasileira v 22 p 85-88 1997 ALMEIDA A M R Efeito de luz e meios de cultura sobre crescimento micelial formaccedilatildeo e tamanho de picniacutedios e esporulaccedilatildeo de isolados de Phomopsis sojae Leh In SEMINAacuteRIO NACIONAL DE PESQUISA DE SOJA Brasiacutelia 2 1981 Londrina Anais Brasiacutelia EmbrapaSNI 1982 p 216-226 ANCHORENA-MATIENZO P Re-identificaccedilatildeo e caracterizaccedilatildeo geneacutetica de levedura IZ-987 utilizando marcadores moleculares 2002 81p Dissertaccedilatildeo (Mestrado) ndash ESALQ USP Piracicaba Satildeo Paulo 2002 ANJOS J R N CHARCHAR M J A GUIMARAtildeES D P Ocorrecircncia de Queima das Folhas Causada por Phomopsis sp Em Aroeira No Distrito Federal Fitopatologia Brasileira v 26 n 3 p 649-650 2001 ARAUacuteJO J M SILVA A C AZEVEDO J L Isolation of endophytic actinomycetes from roots and leaves of maize (Zea mays L) Brazilian Archives of Biology and Technology v 43 n 4 p 447-451 2000 ARAUacuteJO W L AZEVEDO J L LIMA A O S MARCOM J SOBRAL J L LACAVA P T Manual Isolamentos de fungos endofiacuteticos Escola Superior da Agricultura Luiz de Queiroz Universidade de Satildeo Paulo Piracicaba 2002 ARNOLD E A MEJIacuteA C L KYLLO D ROJAS E I MAYNARD Z ROBBINS N HERRE E A Fungal endophytes limit pathogen damage in a tropical tree PNAS v 100 p 15649-15654 2003 AZEVEDO J L Microrganismos Endofiacuteticos In MELO I S AZEVEDO J L Ecologia Microbiana Editora EMBRAPA Jaguariuacutena-SP p 117-137 1998 AZEVEDO J L JUacuteNIOR W M PEREIRA J O ARAUacuteJO W L Endophytic microganisms a review on insect control and recent advances on tropical plants
107
Environmental Biotechnology v 3 n1 p 40-65 2000 BAAYEN R P BONANTS P J M VERKLEY G CARROL G C VAN DER AA M WEERDT M BROUWERSHAVEN G C SCHUTTE G C MACCHERONI JR W GLIENKE-BLANCO C AZEVEDO J L Nonpathogenic Strains of the Citrus Black Spot Fungus Guignardia citricarpa Identified as a Cosmopolitan Endophyte of Woody Plants Guignardia mangiferae (Phyllosticta capitalensis) Phytopathology v 92 p 464-477 2002 BAKER R E D Studies in the pathogenicity of tropical fungi II The occurrence of latent infections in developing fruits Annals of Botany London v 2 p 919-931 1938 BAO J R LAZAROVITS G Differential colonization of tomato roots by nonpathogenic and pathogenic Fusarium oxysporum strains may influence Fusarium wilt control Phytopathology Lancaster v 91 p 449-456 2001 BELL D K WELLS H D MARKHABELL D K WELLS C R In vitro antagonism ot Trichoderma species against six fungal plant pathogens Phytopathology v 72 p 379-382 1982 BETTIOL W GHINI R Controle Bioloacutegico In Manual de Fitopatologia Bergamin FILHO A AMORIM L e KIMATI H (Eds) 3ordf ed Satildeo Paulo Ceres 1995 919p BILLS G DOMBROWSKY A PELAEZ F POLISHOOK J Recent and future discoveries of pharmacologically active metabolites from tropical fungi Tropical mycology micromycetes v 2 p 165-194 2002 BITTENCOURT J V M Variabilidade geneacutetica em populaccedilotildees naturais de Maytenus ilicifolia por meio de marcadores RAPD Curitiba 2000 58p Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Agronomia ndash Produccedilatildeo Vegetal) Universidade Federal do Paranaacute BITTENCOURT J V M Variabilidade Geneacutetica em Populaccedilotildees Naturais de Maytenus Ilicifolia por Meio de Marcadores RAPD Scientia Agraacuteria v 2 p1-2 2001 BLANCO C G Guignardia citricarpa Kiely Anaacutelise geneacutetica cariotiacutepica e interaccedilatildeo com o hospedeiro Piracicaba 1999 Tese de Doutorado- escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Universidade de Satildeo Paulo BOSSALIS M C Hyperparasitism Annual Review of Phytopathology v 2 p 363-375 1964 BRAYFORD D Vegetative incompatibility in Phomopsis from elm Mycological Research v 94 n 6 p 745-752 1990
108
BODDY L GRIFFITH G S Role of endophytes and latent invasion in the development of decay communities in sapwood of angiospermous trees Sydowia v 41 p 41-73 1989 BUSSABAN B LUMYONG S LUMYONG P McKENZIE E H HYDE K D Endophytic fun i from Amomum siamense Canadian Journal of Microbiology v 47 n 10 p 943-948 2001 CAMPAROTO M L TEIXEIRA R O MANTOVANI M S VICENTINI P Effects of Maytenus ilicifolia Mart and Bauhinia candicans Benth onion root-tip and rat bone-marrow cells Genetics and Molecular Biology v 25 n1 p 85-89 2002 CARDOSO-FILHO J L Efeito de extratos de albedo de laranja (Citrus sinesis) dos indutores de resistecircncia aacutecido salicilico acil-benzolar ndash S- metil e Saccharomyces cerevisiae no controle de Phyllosticta citricarpa (Teleomorfo Guignardia citricarpa) Piracicaba 2003 125f Dissertaccedilatildeo (Doutorado) ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo CARROLL G C CARROLL F E Studies on the incidence of coniferous needle endophytes in the Pacitfic Northwest Canadian Jornal of Botany v 56 p 3034-3043 1978 CARROLL G C The Biology of endophytism in plants with particular reference to woody perennials In FOKKEMA N J HEAVEL J Van Der (Eds) Microbiology of the Phyllosphere Cambridge Cambridge University Press 1986 p 205-222 CASTLEBURY LA MENGISTU A Phylogenetic distinction of DiaporthePhomopsis isolates from soybeans [resumo] Systematic Mycology and Microbiology I v 57 n 4 p 13 2006 CENARGEN Banco de Dados on Line Disponiacutevel em lthttpicewall2cenargenembrapabr84micwebmichtmlfgbd01aspPgt Acesso em Maio de 2005 CERVI A C PACIORNIK E F VIEIRA R F MARQUES L C Espeacutecies vegetais de um remanescente de Floresta de Araucaacuteria (Curitiba-Brasil) estudo preliminar I Acta Bioloacutegica Paranaense Curitiba v18 n1-4 p73-114 1989 CHAREPRASERT S PIAPUKIEW J THIENHIRUN S WHALLEY A J S SIHANONTH P Endophytic fungi of teak leaves Tectona grandis L and rain tree leaves Samanea saman Merr Journal of Microbiology amp Biotechnology v 22 n 5 p 481-486 2006 CHRISTO D Variabilidade Geneacutetica e Diferenciaccedilatildeo Molecular de Isolados Endofiacuteticos e Patogecircnicos de Guignardia spp e Phyllosticta sp Curitiba 2002
109
78 f Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Geneacutetica) ndash Universidade Federal do Paranaacute CLAY K Effects of fungal endophyteson the seed and seedling biology of Lolium perenne and Festuca arundinacea Oecologia (Berlin) Berlin v73 p 358-362 1987 CLAY K Fungi and the food of the goods Nature v 427 p 401-402 2004 COCHRANE VW Physiology of fungi New York John Wiley 1958 524p COCKRUM P A PETTERSON D S EDGAR J A 1994 Identification of novel Phomopsins in Lupin seed extracts In Plant-associated toxins Agricultural phytochemical and ecological aspects DORLING P R p 232-237 Wallingford CAB In-ternational COELHO AG Software Bood v 3 04 2005 COIMBRA R SILVA E D Notas de Fitoterapia 2ordf ed Laboratoacuterio Cliacutenico Silva Arauacutejo SA 1958 CORDEIRO P J M VILEGAS J H Y LANCcedilAS F M HRGC-MS Analysis of Terpenoids from Maytenus ilicifolia and Maytenus aquifolium (ldquoEspinheira Santardquo) Journal of Brazilian Chemistry Society v 10 p 523-526 1999 CORRADO M RODRRIGUES KF Antimicrobial evaluation of fungal extracts produced by endophytic strains of Phomopsis sp Journal Basic Micrrobiol v44 p157-160 2004 CORREcircA RMS Caracterizaccedilatildeo de Phomopsis e Phoma obtidos de sementes de espeacutecies florestais 1995 72p Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Fitopatologia) ndash Universidade Federal de Lavras Lavras 1995 CRONQUIST A An integrated system of classification of flowering plants New York Columbia University Press 1981 CROUS PW WINGFIELD MJ FERREIRA FA ALFENAS A Mycosphaerella parkii and Phyllosticta eucalyptorum two new species from eucaliptus leaves in Brazil Mycological Research Cambridge v97 p 582-584 1993 CRUZ GL Livro Verde VolII 1a Editora Belo Horizonte-Minas Gerais 1965 DALZOTO P R GLIENKE-BLANCO C KAVA-CORDEIRO V ARAUacuteJO W L AZEVEDO J L RAPD analyses of recombinatiom process in the entomopathogenic fungus Beauveria bassiana Mycological Research v 107 p 1069-1074 2003 DJAOUIDA R SORBO G D REGGIO C ZOINA A FIRRAO G Polymorphisms in nuclear rDNA and mtDNA reveal the polyphyletic nature of isolates of Phomopsis
110
pathogenic to sunflower and a tight monophyletic clade of defined geographic origin Mycologia v 108 n 4 p 393-402 2004 DUARTE M R DEBUR M C Stem and leaf morphoanatomy of Maytenus ilicifolia Fitoterapia v 76 p 41-49 2005 EDGINTON L V KNEW K L BARRON G L Fungitoxic spectrum of benzimidazole compounds Phitopathology v 62 n 7 p 42-44 1971 EMBRAPA Fungos Endofiacuteticos Introduccedilatildeo Disponiacutevel em lthttpwwwcnpmaembrapabrprojetosendofiticosintroducaohtm1gt Acesso em Maio de 2005 ERNEST M MENDGEN W K WIRSEL W Endophytic Fungal Mutualists Seed-Borne Stagonospora spp Enhance reed biomass production in axenic microosms Molecular Plant-Microbe Interations v 16 n 7 p 580-587 2003 ESPOacuteSITO E AZEVEDO J L Fungos uma introduccedilatildeo agrave biologia bioquiacutemica e biotecnologia Caxias do Sul Edusc 510p 2004 ETHUR L Z CEMBRANEL C Z SILVA A C F Seleccedilatildeo de Trichoderma spp visando controle de Sclerotinia sclerotiorium in vitro Ciecircncia Rural v 31 n 5 p 885-887 2001 EZRA D STROBEL G A Effects of substrate on the bioactivity of volatile antimicrobials produced by Muscodor albus Plant Science St Paul v165 p913-922 2003 EZRA D CASTILLO U F STROBEL G A HESS W M PORTER H JENSEN J B CONDRON M A M TEPLOW D B SEARS J MARANTA M HUNTER M WEBER B YAVER D Coronamycins peptide antibiotics produced by a verticillate Streptomyces sp (MSU-2110) endophytic on Monstera sp Microbiology v 150 p 785-793 2004 FARR D F CASTLEBURY L A ROSSMAN A Y Morphological and molecular characterization of Phomopsis vaccinii and additional isolates of Phomopsis from blueberry and cranberry in the eastern United States Mycologia v 94 n 3 p 494-504 2002 FELSENTEIN J Conficence limits on phylogenies an approch using the bootstrap International Journal of Organic Evolution Lancaster v 39 p 366-369 1985 FERNANDEZ F A HANLIN R T Morphological and RAPD analyses of Diaporthe phaseolorum from soybean Mycologia v 88 n 3 p 425-440 1996
111
FERREIRA M E Aplicaccedilatildeo de Marcadores Moleculares no Mapeamento Geneacutetico de Plantas In III Curso de Marcadores Moleculares EMBRAPACENARGEN ndash Brasiacutelia DF 1994 FERREIRA D F Anaacutelise estatiacutestica por meio do SISVAR para Windows Versatildeo 40 In REUNIAtildeO ANUAL DA REGIAtildeO BRASILEIRA DA SOCIEDADE INTERNACIONAL DE BIOMETRIA 45 2000 Satildeo Carlos Anais Satildeo Carlos SSPSIB 2000 p 255-268 VAN SOEST P J Nutritional ecology of the ruminant 2 ed Ithaca Cornell University PressConstock Pub-lish1994 476 p FERREIRA MP OLIVEIRA CNOLIVEIRA BA LOPES MJALZAMORA F VIEIRA MAR A lyophilized aqueous extract of Maytenus ilicifolia leaves inhibits histamine-mediated acid secretion in isolated frog gastric mucose Planta v 219 p 319-324 2004 FIALHO M B Efeito in vitro Sacharomyces cerevicea sobre Guignardia citricarpa agente causal da pinta preta dos citros Piracicaba 2004 60f Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo FIGUEIREDO J G Bioprospecccedilatildeo Caracterizaccedilatildeo Morfoloacutegica e Molecular de Endoacutefitos de Maytenus ilicifolia com Ecircnfase EM Pestalotiopsis spp Curitiba 2006 Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade Federal do Paranaacute FRISVAD J C SAMSON R A Polyphasic taxonomy of Penicillium subgenus Penicillium - A guide to identification of food and air-borne terverticillate Penicillia and their mycotoxins Studies in Mycology v 49 p 1-173 2004 FRISVAD J C FRANK J M HOUBRAKEN J A M P KUIJPERS A F A SAMSON R A New ochratoxin A producing species of Aspergillus section Circumdati Studies in Mycology v 50 p 23-43 2004 FUNGARO M H P VIEIRA M L C Aplicaccedilotildees da PCR em ecologia molecular In MELO I S AZEVEDO J L (Eds) Ecologia microbiana Jaguarariuacutena Embrapa-CNPMA 1998 cap8 p205-227 FUNGARO M H P PCR na Micologia Biotecnologia Ciecircncia amp Desenvolvimento Brasiacutelia n14 p12-16 2000 GAMBOA-GAITAacuteN M A LAUREANO S BAYMAN P Endophytic Phomopsis Strains from of Guarea guidonia (Meliaceae) Journal of Science v 41 n 2 p 215-224 2005 GAO X ZHOU H XU D YU C CHEN Y QU L Hi h diversity of endophytic fun i from the pharmaceutical plant Heterosmilax japonica Kunth
112
revealed y cultivation-independent approach FEMS Microbiology Letters v 249 p 255-266 2005 GLIENKE C CHRISTO D MACCHERONI JR W AZEVEDO J L High molecular diversity of the fungus Guignardia citricarpa and Guignardia mangiferae and new primers for the diagnosis of the Citrus Black Spot Brazilian Archives of Biology and Technology Submetido 2007 GLIENKE C Variabilidade geneacutetica no fungo endoacutefito Guignardia citricarpa kiely detectada por RAPD Curitiba 1995 Dissertaccedilatildeo de Mestrado- Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade federal do Paranaacute GLIENKE-BLANCO C AGUILAR-VILDOSO CI VIEIRA MLC BARROSOP A V AZEVEDO JL Genetics variabilityb in the endophytic fungus Guignardia citricarpa isolated from citrus plants Genetics and Molecular Biology v 25 n 2 p 251-255 2002 GOacuteES A Etiologia aspectos epidemioloacutegicos e controle de Guignardia citricarpa agente causal da mancha preta do citros 100 p Relatoacuterio teacutecnico 2005 GONZALEZ M LOMBARDO A VALLARINO A J Plantas de la medicina vulgar del Uruguay Uruguay Talleres Grfificos Cerrito 149 p 1937 GUTHRIE P A I MAGILL C W FREDERIKSEN R A ODVODY G N Random amplified polymorphic DNA markers a systems for identifying and differentiating isolates of Colletotrichum graminicola Phytopathology St Paul v 82 p 832-835 1992 GURGEL LMS MENEZES M COELHO RSB Caracterizaccedilatildeo patogecircnica fisioloacutegica e isoenzimaacutetica de Phomopsis anacardii e Phomopsis mangiferae In CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA 30 1997 Poccedilos de Caldas Resumos Brasiacutelia Sociedade Brasileira de Fitopatologia 1997 p 269 GURGEL LMS MENEZES M COEcircLHO RSB Estudo comparativo de isolados de Phomopsis anacardii e Phomopsis mangiferae atraveacutes da patogenicidade e nutriccedilatildeo de C e N em trecircs regimes de luminosidade Summa Phytopathologica v 28 p 160-166 2002 GRAJAL-MARTIN M J SIMON C J MUEHLBAUER F J Use of Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) to characterize race 2 of Fusarium oxysporum fsp pisi Phytopatology v 83 p 612-14 1993 GRATTAPAGLIA D FERREIRA M E Introduccedilatildeo ao uso de marcadores moleculares em anaacutelise geneacutetica EMBRAPA Brasiacutelia 3 ed 220p 1998
113
GRIFFIN DH Fungal physiology 2ed New York Wiley-Liss 1994 458p HALL T A BioEdit48 Raileigh 1997-2001 1 arquivo (115M) Disponiacutevel em httpwwwmbioncsuedubioedithtml BioEdit a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windons 9598NT HANLIN R T MENEZES M Gecircneros ilustrados de ascomicetos UFRPE Recife-PE 1996 274p HERBERT J A GRECH NM A strain of Guignardia citricarpa the citrus black spot pathogen resistent to benomyl in South Africa Plant Disease St Paul v 69 p 1007 1985 HUANG Y WANG J LI G ZHENG Z SU W Antitumor and antifungal activities in endophytic fungi isolated from pharmaceutical plants taxus mairei Cephalataxus fortunei and Torreya grandis FEMS Immunology and Medical Microbiology v31 n47 p163-167 2001 IBRAHIM G BAYCA B Fungal bacterial and nematological problems of citrus grape and stone fruits in Arab countries Arab Journal of Plant Protection Beirut v7 n2 p190-197 1989 ITOKAWA H SHIROTA O IKUTA H MORITA H TAKEYA K IITAKA Y Triterpenes fom Maytenus ilicifolia Phytochemistry v 30 n 11 p 3713-37161991 ITOKAWA H SHIROTA O IKUTA H MORITA H TAKEYA K IITAKA Y Oligo-nicotinated sesquiterpene polyesters from Maytenus ilicifolia Journal of natural Prodcts v 56 p 1479-14851993 JASALAVICH C OSTROFSKY A JELLISON J Detection and identification of decay fungi in spruce wood by restriction fragment length polymorphism analisis of amplified genes encoding rRNA Applied and Environmental Microbiology Washington v66 n11 p 4725-4734 2000 JOHNSTON P R FULLERTON R A Cryptosporiopsis citri sp Nov cause of a citrus leal spot in the Pacific Islands New Zealand Journal of Experimental Agriculture Wellington v16 p159-163 1988 JORGE R M LEITE J P V OLIVEIRA A B TAGLIATI C A Evaluation of antinociceptive anti-inflammatory and antiulcerogenic activities of Maytenus ilicifolia Journal Ethnopharmacol v 94 n1 p 93-100 2004 KIM K H TEN L N LIU Q M IM W T LEE S T Sphingobacterium daejeonense sp nov isolated from a compost sample International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2031-2036 2006
114
KIM B Y WEON H Y LEE K H SEOK S J KWON S W GO S J STACKEBRANDT E Dyella yeojuensis sp nov isolated from greenhouse soil in Korea International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2079-2082 2006 LEE Y H SNOW J P Phenotypic and genetic variations in Diaporte phaseolorum var caulivora the soybean stem canker pathogen Phytopathology v 81 p1205 1992 LEITE J P V RASTRELLI L ROMUSSI G OLIVEIRA A B VILEGAS J H Y VILEGAS W PIZZA C Isolation and HPLC quantitative analysis of flavonoid glycosides from razilian evera es (Maytenus ilici olia and M aqui olium) Journal of Agricultural and Food Chemistry v 49 p 3796-3801 2001 LEONIAN L H A study of the factors promoting pycnidium ndash formation in some Sphaeropsidales American Journal Botanic Columbus v11 p 19-50 1924 LEUCHTMANN A PETRINI O PETRINI LE CARROLL GC Isozyme polymorphism in six endophytic Phyllosticta species Mycological Research Cambridge v96 n 4 p 287-294 1992 LI J Y STROBEL G A Jesterone and hydroxy-jesterone antioomycete cyclohexenone epoxides from the endophytic fungus Pestalotiopsis jesteri Phytochemistry v 57 p 261-265 2001 LIMA O G de COELHO J S de B WEIGERT E DrsquoALBUQUERQUE I L LIMA D de A SOUZA M A de M Substacircncias antimicrobianas de plantas superiores ndash Sobre a presenccedila de maitenina e pristimerina na parte cortical das raiacutezes de Maytenus ilicifolia procedente do Brasil Meridional Revista do Instituto de Antibioacuteticos v 11 n 1 p 35-38 1971 LIU C H ZOU W X LU H TAN R X Antifungal activity of Artemisia annuaendophyte cultures against phytopathogenic fungi Journal of Biotechnology v88 p 277-282 2001 LU H ZOU W X MENG J C HU J TAN R X New bioactive metabolites produced by Colletotrichum sp an endophytic fungus in Artemisia annua Plant Science Oxford v 151 n 1 p 67-73 2000 LU G Z CANNON P F REID A SIMMONS C M Diversity and molecular relationships of endophytic Colletotrichum isolates from the Iwokrama Forest Reserve Guyana Mycological Research v 108 n 1 p 53-63 2004 MAKI C S Diversidade e Potencial Biotecnoloacutegico de Fungos Endofiacuteticos de Cacau Theobroma cacao L Piracicaba 2006 Dissertaccedilatildeo de Doutorado ndash Setor de Agronomia- Geneacutetica e Melhoramento de Plantas Universidade Escola Superior de
115
Agricultura Luiz de Queiroz MANULIS S KOGAN N REUVEN M BEN-YEPHET Y Use of the RAPD technique for identification of Fusarium oxysporum f sp dianthi from carnation Phytopathology v84 p98-101 1993 MARTINS-CORDER M P MELO I S ANTAGONISMO IN VITRO DE Trichoderma spp A Verticillium dahliae KLEB Scientia Agriacutecola v 55 n1 p1-7 1998 MARIANO R L R Meacutetodos de seleccedilatildeo in vitro para o controle microbioloacutegico de patoacutegenos de plantas Revisatildeo Anual de Patologia de Plantas v I p 369-409 1993 McMILLAN JR RT Guignardia citricarpa a cause of black spot on mango foliage in Florida Journal of Phytopathology Berlin v117 p 260-264 1986 McPHERSON M J QUIRKE P TAYLOR G R PCR 1 A pratical approach IRL New York v1 348p 1991 McONIE K C The latent occurrence in citrus and other hosts of a Guignardia easily confused with G citricarpa the citrus black spot pathogen Phytopathology St Paul v 54 p 40-43 1964a McONIE K C Source of inoculum of Guignardia citricarpa the citrus black spot pathogen Phytopathology St Paul v 54 p 64-67 1964b MEIJER G MEGNEGNEAU G LINDERS E G Avariability for isozyme vegetative compatibility and RAPD markers in natural populations of Phomopsis subordinaria Mycological Research v98 n3 p267-276 1994 MEIRA PENNA Dicionaacuterio Brasileiro de Plantas Medicinais 3a Ed Editora Kosmos Rio de Janeiro 1946 MELO I S Agentes microbianos de controle de fungos fitopatogecircnicos In Controle bioloacutegico v I MELO I S e AZEVEDO J L (Eds) Jaguariuacutena SP Embrapa-CNPMA 1998 264p MICHELMORE R W HULBERT S H Molecular markers for genetic analysis of phytopathogenic fungi Annual Review of Phytopathology Palo Alto v 25 p 383-404 1987 MOLLER C WEBER G DREYFUSS M M Intraespecific diversity in the fungal species Chaunopycnis alba implications fo microbial screening programs Journal of industrial microbiology v 17 p 359-372 1996
116
MONTANARI T CARVALHO J E de DOLDER H Effect of Maytenus ilicifolia Martex Reiss on spermatogenesis Contraception v 57 p 335-3391998 MONTANARI T BEVILACQUIA E Effect of Maytenus ilicifolia Mart On pregnant mice Contraception v 65 p 171-1752002 MOSTERT L CROUS P W KANG J PHILLIPS A J L Species of Phomopsis and a Libertella sp occurring on grapevines with specific reference to South Africa morphological cultural molecular and pathological characterization Mycologia v 93 n 1 p 146-167 2001 MULLIS K B F A FALOONA Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction Methods Enzymol v 155 p 335-350 1987 MURALI T S SURYNARAYANAN T S GEETA R Endophytic Phomopsis species Host range and implications for diversity estimates NRC Research Press Canadaacute 2006 NEDASHKOVSKAYA O I VANCANNEYT M KALINOSKAYA N I MIKHAILOV V V SWINGS J Aquimarina intermedia sp nov reclassification of Stanierella latercula (Lewin 1969) as Aquimarina latercula comb nov and Gaetbulimicrobium brevivitae International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2037-2041 2006 NETO P A S AZEVEDO J L ARAUacuteJO W L Microrganismos Endofiacuteticos Interaccedilatildeo com Plantas e Potencial Biotecnoloacutegico Revista Biotecnologia v5 n29 2002 OrsquoDONNELL K GRAY L E Phylogenetc relationships of the soyobean sudden death syndrome pathogen Fusarium solani f sp phaseoli inferred from rDNA sequence data and PCR primers for its identification Molecular Plant Microbe Interact v 8 p 709-716 1995 OKANE I NAKAGIRI A ITO T Endophytic fun i in leaves of ericaceous plants Canadian Journal of Botany v 76 p 657-663 1998 OULLET T SEIFFERT K A Genetic characterization of Fusarium graminearum strains using RAPD e PCR amplification Phytopathology v 83 p 1003-1007 1993 PAAVANEM-HUHTALA S AVIKAINEM H YLI-MATTILA T Development of strain-specific primers for a strain of Gliocladium catenulatum used in bioological control European Journal Plant Pathological Dordrecht v106 n2 p187-198 2000 PANIZZA S Plantas que Curam (Cheiro de Mato) 15deg ed Satildeo Paulo IBRASA 1998 265 p PATEL B N PATEL R C TILVA D G Phyllosticta leaf spot a new disease in Bidi
117
tobacco nursey Tobacco Research Rajahmundry v14 p 1176-1178 1988 PATERSON R R M BRIDGE P D Biochemical techniques for filamentous fungi CAB International 125 p 1994 PARMETER J R An effect of substrate on spore form in Phomopsis Phytopatholog v 48 p 396-397 1958 PENNA E B da S Microrganismos endofiacuteticos de erva-mate (Ilex paraguariensis STHIL) e variabilidade geneacutetica em Phyllosticta sp por RAPD Curitiba 2000 123 f Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Universidade Federal do Paranaacute PETRINI O Taxonomy of endophytic fungi of arial plant tissues In FOKKEMA N J HEUVEL JVAN DEN (Ed) Microbiology of the Phyllosphere Cambrige University Press p 175-87 1986 PETRINI O Fungal endophytes of tree leaves In ANDREWS J H HIRANO S S (Eds) Microbial Ecology of Leaves New York Sprin er-Verla 1991 p 179-197 PETRINI O STONE K CARROLL F E Endophytic fungi in evergreen shrubs in western Oregon a preliminary study Canadian Journal of Botany v 60 p 789-796 1982 PHILLIPS A J L The plant pathogenic genus Phomopsis and its teleomorph (Diaporthe) Development and application of morphological biological and phylogenetic species concepts Disponiacutevel em lthttpwwwcremfctunlptbotryosphaeria_sitepersonal_web_pagehtmgt Acesso em Dezembro de 2006 PILEGGI S A V Isolamento e Caracterizaccedilatildeo de Microrganismos Endofiacuteticosde Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss por Meio de Marcadores RAPD eseu Potencial Farmacoloacutegico Curitiba 2006 Dissertaccedilatildeo de Doutorado - Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade Federal do Paranaacute PIOLI R N MORANDI E N MARTIacuteNEZ M C LUCCA F TOZZINI BISARO V HOPP H E Morphologic molecular and pathogenic characterization of diaporthe phaseolorum variability in the core soybean ndash Producing Aacuterea of Argentina Phytopathology v 93 n2 p136-146 2003 PONTECORVO G ROPER J A HEMMOS LM MAC DONALD K D BUFTON A W J The genetics of Aspergillus nidulans Advances in Genetics v 5 p141-238 1953 PONS N Estudio taxonomico de especies de Phoma y Phyllosticta sobre cantildea de azucar (Saccharum sp) Fitopatologia Venezolana Maracay v 3 p 34-43 1990
118
PROMPUTTHA I JEEWON R LUMYONG S MCKENZIE E H C HYDE K D Ribosomal DNA fingerprinting in the identification of non sporulating endophytes from Magnolia liliifera (Magnoliaceae) Fungal Diversity v 20 p 167-186 2005 QUIROGA E N SAMPIETRO A R VATTUONE M Screening antifungal activitis of selected medicinal plants Journal of Ethnopharmacology v 74 p 89-96 2001 RAEDER U BRODA P Rapid preparation of DNA from filamentous fungi Letters in Applied Microbiology Oxford v1 p17-20 1985 REHNER S A UECKER F A Nuclear ribosomal internal transcribed spacer phylogeny and host diversity in the coelomycete Phomopsis Canadian Journal of Botanic v 72 p1666-1674 1994 RIBEIRO L A de Variabilidade Geneacutetica por RAPD em fungos endoacutefitos de Gecircnero Penicillium provenientes de Zea mays L Curitiba 1995 90 f Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Universidade Federal do Paranaacute RIEDL H WECHTL E Proposal to conserve the name Phomopsis (Sacc) Bubak (1905) against Myxolibertella Hohnel (1903) Taxon v 30 n 4 p 826-828 1981 ROBES C F A mancha preta dos fungos ciacutetricos (Phyllosticta citricarpa) ameaccedila a citricultura paulista Laranja Cordeiroacutepolis v 11 p 75-86 1990 ROBES C F BITTENCUCOURT S M A mancha preta dos frutos um dos fatores limitantes agrave produccedilatildeo citricola do estado do Rio de Janeiro Comunicado Teacutecnico ndash CTAA-EMBRAPA n 19 p 1-5 1995 RODRIGUES K F SAMULES G J Fungal endophytes of Spondias mombin in Brazil a preliminary study Journal of Basic Microbiology v 39 p 131 ndash 135 1999 RODRIGUES KF HESSE M WERNER C Antimicrobial activities of secondary metabolites produced by endophytic fungi from Spondias mombin Journal of Basic Microbiology v 40 n 4 p 261-267 2000 RODRIGUES-HEERKLOTZ KF DRANDAROV K HEERKLOTZ J HESSE M WERNER C Guignardia Acid a Novel Type of Secondary Metabolite Produced by the Endophytic fungus Guignardia sp Isolation Structure Elucidation and Asymmetric Synthesis Helvetica Chimica Acta v 84 p 3766-3772 2001 RODRIGUES K F SIEBER T N GRUumlNIG R C HOLDENRIEDER O Characterization of Guignardia mangiferae isolated from tropical plants based on morphology ISSR-PCR amplifications and ITS1-58S-ITS2 sequences Mycological
119
Research Cambridge v 108 p 45-52 2004 RODRIGUES K F COSTA G L CARVALHO M P EPIFANIO R A Evaluation of extracts produced by some tropical fungi as potential cholinesterase inhibitors Journal of Microbiology and Biotechnology v21 p1617-1621 2005 RODRIGUES M B C Controle de Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta dos Citros Piracicaba 2006 67 p Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo ROHLF F J NTSYS-PC Numerical taxonomy and multivariate analysis system New York Exeter Publishing 1988 RUBINI M R SILVA-RIBEIRO R T POMELLA A W V MAKI C S ARAUacuteJO W L SANTOS D R AZEVEDO J L Diversity of endophytic fungal community of cacao (Theobroma cacao L) and biological control of Crinipellis perniciosa causal agent of Witches Broom Disease International journal of Biological Sciences v 1 n 1 p 24-33 2005 SAIKI R K SCHARF S J FALOONA F MULLIS K B HORN G T ERLICH H A ARNHEIM N Enzymatic amplification of β-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia Science v 230 p1350-1354 1985 SAMPAIO J P FELL J W GADANHO M BAUER R Kurtzmanomyces insolitus sp nov a new anamorphic heterobasidiomycetous yeast species Systematic and Applied Micorbiology v 22 p 619-625 1999 SAMUELES G J SEIFERT K A The impact of molecularcharacters on systematics of filamentous ascomycetes Annual Review of Phytopathogy Palo Alto v 33 p 37-67 1995 SANGER F NICKLEN S COULSON A R DNA Sequencing with chain terminating inhibitors Proceedings of the National Academy of Sciences of the United states of America Washington v 74 p 5463-5467 1977 SANTOS MF Anaacutelise da micoflora associada ao baru (Dipteryx alata Vog) e a caroba (Cybistax antisyphilitica (Mart) Mart) BrasiacuteliaDF 1996 Dissertaccedilatildeo de Mestrado Universidade Nacional de Brasiacutelia SATOKO K MINAKA N KOBAYASHI T KUDO A OHTSU Y Molecular Phylogenetic Analysis of Ribosomal DNA Internal Transcribed Spacer Regions and Comparison of Fertility in Phomopsis Isolates from Fruit Trees Plant Pathology v 66 p 191-210 2000
120
SCHULZ B BOYLE C DRAEGER S ROumlMMERT A KROHN K Endophytic fungi a source of novel biologically active secondary metabolites Mycological Research Cambridge v 106 p 996-1004 2002 SCHULZ B BOYLE C The endophytic continuum Mycological Research Cambridge v 109 p 661-686 2005 SETTE L D PASSARINI M R Z DELARMELINA C SALATI F DUARTE M C T Molecular characterization and antimicrobial activity of endophytic fungi from coffee plants World Journal of Microbiology and Biotechnology v 22 p 1185-1195 2006 SHIROTA O MORITA H TAKEYA K ITOKAWA H ITAKA YCytotoxic aromatic triterpenes from Maytenus ilicifolia and Maytenus chuchuhuasca Journal of Natural Products v 57 p 1675-1681 1994 SHIVAS R G ALLEN J G WILLIAMSON P M Infraspecific variation demonstrated in Phomopsis leptostromiformis using cultural and biochemical techniques Mycological Research Cambridge v 95 p 320-323 1991 SHRESTHA K STROBEL G A PRAKASH S GEWALI M Evidence for paclitaxel from three new endophytic fungi of Himalayan yew of Nepal Planta Medicinal v 67 p 374-376 2001 SILVA C G RECIO R A OLIVEIRA A B de PAIVA R L R Coleta e avaliaccedilatildeo da qualidade fitoquiacutemica de Maytenus ilicifolia M (espinheira-santa) Tribuna Farmacecircutica v 5759 p 46-50 1991 SILVA F A S The ASSISTAT Software statistical assistance In INTERNATIONAL CONFERENCE ON COMPUTERS IN AGRICULTURE 6 Anais Cancun American Society of Agricultural Engineers p 294-298 1996 SILVA F de A S AZEVEDO C A V de Versatildeo do programa computacional Assistat para o sistema operacional Windows Revista Brasileira de Produtos Agroindustriais Campina Grande v 4n 1 p 71-78 2002 SILVA G H TELES H L TREVISAN H C BOLZANI V S YOUNG M C M PFENNING L H EBERLIN M N HADDAD R COSTA-NETO C M ARAUacuteJO A R New Bioactive Metabolites Produced by Phomopsis cassiae an Endophytic Fungus in Cassia spectabilis Journal Brasileiro Chemical Society v16 n6 p 1463-1466 2005 SILVA R L DE O LUZ J S SILVEIRA E B CAVALCANTE T Fungos endofiacuteticos em Annona spp isolamento caracterizaccedilatildeo enzimaacutetica e promoccedilatildeo do crescimento em mudas de pinha (Annona squamosa L) Acta Botanica Brasilica v
121
20 n 3 p 649-655 2006 SILVEIRA EB 2001 Bacteacuterias promotoras de crescimento de plantas e biocontrole de doenccedilas Pp 71-100 In R Barros e SJ Michereff Proteccedilatildeo de plantas na agricultura sustentaacutevel Recife Imprensa Universitaacuteria da UFRPE SIMOtildeES C M O MENTZ L A SCHENKEL E P IRGANG B E STEHMANN J R Plantas da medicina popular no Rio Grande do Sul Porto Alegre Editora da UniversidadeUFRGS 174p 1986 SIVANESAN A The bitunicate ascomycetes and their anamorphs J Cramer Germany 701p 1984 SNEATH P H A SOKAL R R Numerical Taxonomy W H freeman Co San Francisco 1973 SOUZA FORMIGONI M L OLIVEIRA M G MONTEIRO M G DA SILVEIRA FILHO N G BRAZ S CARLINI E A Antiulcerogenic effects of two Maytenus species in laboratory animals Journal of Ethnopharmacology v 34 n 1 p 21-27 1991 SOUZA A Q L SOUZA A D L SPARTACO A F PINHEIRO M L B SARQUIS M I M PEREIRA J O Atividade antimicrobiana de fungos endofiacuteticos isolados de plantas toacutexicas da Amazocircnia Palicourea longiflora (aubl) rich e Strychnos cogens bentham Acta Amazocircnica v 34 n 2 p 185-195 Manaus 2004 SPOacuteSITO MB AMORIM L BASSANEZI RB BERGAMIN FILHO A HAU B Spatial pattern of black spot incidence within citrus trees related to disease severity and pathogen dispersal Plant Pathology p 103-108 2008 STAMFORD T L M ARAUacuteJO J M STAMFORD N P Atividade enzimaacutetica de microrganismos isolados do Jacatupeacute (Pachyrhizus erosus L Urban) Ciecircncia Tecnoloacutegica de Alimentos v 18 p 382-385 1998 STIERLE A STROBEL G STIERLE D GROTHAUS P BIGNAMI G The search for a taxol-producin microor anism amon the endophytic fun i of the Pacific yew Taxus bre i olia Journal of Natural Products v 58 n 9 p 1315-1324 1995 STINSON M ERZA D HESS W M SEARS J STROBEL G An endophytic Gliocladium sp Of Eucryphia cordifolia producing selective volatile antimicrobial compounds Plant Science St Paul v165 p 913-922 2003 STROBEL A G Rainforest Endophytes and Bioactive Products Critical Reviews in Biotechnology Boca Raton v 22 n 4 p 315-333 2002
122
STROBEL G A Endophytes as sources of bioactive products Microbes and Infection v 5 p 535-544 2003 STROBEL G DAISY B Bioprospecting for Microbial Endophytes and their Natural Products Microbiology and Molecular Biology Reviews v 67 n 4 p 491-502 2003 SUGHA SK SINGH BM SHARMA BM Studies on Phyllosticta glumarum causing glume blight of rice (Oryza sativa L) Himachal Journal of Agricultural Research Palampur v 12 n 1 p 11-14 1986 TAYLOR-ROSA S G BARROS I BCaracterizaccedilatildeo das sementes de Maytenus ilicifolia Mart Ex Reiss espinheira - santa e viabilidade de sua propagaccedilatildeo sexuada Porto Alegre 1994106f Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Universidade Federal do Rio Grande do Sul THOMPSON J D HIGGINS D G GIBSON T J Clustal W Improving the sensitiviy of rogressive multiple alignment through sequence weighting positions-specific gap penalties and weight matrix choice Nucleic Acids Research v 22 p 4673-4680 1994 TIMNICK MB LILLY VG BARNETT HL Factors affeting sporulation of Diaporthe phaseolorum var batatatis from soybean Phytopathology St Paul v 41 n 4 p 327-336 1951 UECKER F A A World list of Phomopsis names with notes on nomenclature morphology and biology National Fungus Collection v 13 1988 VAN DER AA H A Studies in Phyllosticta I Studies in Mycology n 5 1973 VAN DER AA H A M E Noordeloos and J de Gruy-ter Species concepts in some larger genera of the Coelomycetes Studies in Mycology v 32 p 3-19 1990 VASCONCELOS MJV ALMEIDA MA HENNING AMR BARROS AA MOREIRA EG Differentiation of Colletotrichum truncatum isolates by random amplified polymorphic DNA Fitopatologia Brasileira Brasiacutelia v 19 p 520-523 1994 VELICHETI R K McCCLARY C LAMISON R D SINCLAIR J B Immunodetection of the Diaporthe and Phomopsis complex of soybeans Phytopathology v 81 p 1212 1991 VIDIC M Variability in Diaporthe phaseolorum var caulivora on soybean in the Vojvodina Providence in Serbia Zastita Bilja v 42 p 183-189 1991
123
VILARINHOS A D PAULA JR T J BARROS E G MOUREIRA M A Characterization of races of Colletotrichum lindemutianum by the random amplified polymorfic DNA technique Fitopatologia Brasileira Brasiacutelia v20 p194-198 1995 VILLA- CARVAJAL M COQUE J J R ALVAREacuteZ-RODRIGUEacuteZ M L URUBURU F BELLOCH C Polyphasic identication of yeasts isolated from bark of cork oak during the manufacturing process of cork stoppers FEMS Yeast Research v 4 p 745-750 2004 VIRET O PETRINI O Colonization of eech leaves (Fagus syl atica) by the endophyte Discula umbrinella (teleomorph Apiognomonia errabunda) Mycological Research v 98 p 423-432 1994 WAGENAAR M CORWIN J STROBEL G A CLARDY J Three new chytochalasins produced by an endophytic fungus in the genus Rhinocladiella Journal Natural Products v 63 p1692-1695 2000 WALKER M R RAPLEY R Guia de rotas na tecnologia do gene Atheneu Satildeo Paulo 1999 334p WANG J Li G LU H ZHENG Z HUANGY SU W Taxol from Tubercularia sp strain TF5 an endophytic fungus of Taxus mairei FEMS Microbiology Letters v 193 p 249-253 2000 WATSON J D GILMAN M WITKOSWSKI J ZOLLER M Recombinant DNA 2 ed New York Freeman and Company 1992 WELSH J McCLELLAND M Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers Nucleic Acid Research Oxford v 18 p 7213-7218 1990 WHITE Jr J MORROW A C Endophyte-host associations in forage grasses XII A fungal endophyte to Trichachne insularis belonging to Psedocercosporella Mycologia Lawrence v 78 n 5 p 846-850 1989 WHITE Jr J F MORROW A C Endophyte-host associations in forage grasses XII A fungal endophyte of Trichachne insularis belonging to Pseudocercosporella Mycologia Lawrence v 82 p 218-226 1990 WHITE Jr J F MORGAN-JONES G MORROW AC Taxonomy life cycle reprodution and detection of Acremonium endophytes Agriculture Ecosystem amp Environment v 44 p13-37 1993 WILLIAMS J G K KUBELIK A R LIVAK K J RAFALSKI J A TINGER S V DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers Nucleic Acids Research v 18 n 22 p 6531-6535 1990
124
WILLIAMS J G K HANAFEY M K RAFALSKI J A TINGEY S V Genetic analysis using random amplifield polymorphic DNA markers Methods in Enzymology San Diego v 218 p 704-740 1993 ZHANG A W RICCIONI L PEDERSENW L KOLLIPARA K P HARTMAN G L Molecular identi-fication and phylogenetic grouping of Diaporthe phaseolorum and Phomopsis longicolla isolates from soybean Phytopathology v 88 p1306 -1314 1998 ZOU W X MENG J C LU H CHEN G X SHI G X ZHANG T Y TAN R X Meta olites of Colletotrichum gloeosporioides an endophytic fun us in Artemisia mongolica Journal of Natural Products v 63 n 11 p 1529-1530 2000 ZOU W X TAN R X Endophytes a rich source of functional metabolites Natural Product Reports v18 p 448-459 2001
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ANEXOS
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 496671024 9933420 94396 MEIOS DE CULTURA 2 137912854 68956427 655287 INTERACcedilAtildeO A 100 193198257 1931983 18359 INTERACcedilAtildeO b 100 10989107 0109891 1044 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
INTERACcedilAtildeO A INTERACcedilAtildeO ENTRE OS MEIOS DE CULTURA E OS ISOLADOS de Phomopsis INTERACcedilAtildeO B INTERACcedilAtildeO ENTRE AS REPETICcedilOtildeES DOS ISOLADOS DE Phomopsis significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS ENTRE OS MEIOS DE CULTURA
BDA 5169935 a MEA 4973856 b AV 3921569 c
CV = 62
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 1 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM DIFERENTES MEIOS DE CULTURA
126
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 230248366 4604967 43761 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS ESBA1 700 a A323 700 a A215A 700 a ESSD1 700 a SM9713 700 a ESGF1 700 a SM9631 700 a ESJD1 700 a ESKD1 667 a A334 667 a ESDF1 633 b A132 633 b A123 600 b A333A 600 b MU0123 600 b ESJH1 600 b A321 600 b ESRD1 600 b A116 600 b A134 567 b A115B 567 b ESIA1 533 c
ANEXO 2ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO BDA
127
A131 500 c SM9714 500 c A135 500 c ESIE1 500 c ESFB2 500 c A124 500 c ESPAC22 500 c ES2KF1 500 c A113 500 c ESJE1 500 c ESJE2 433 d ESFH1 400 d ESJG1 400 d ES2WC1 400 d PHO1 400 d SM9638 400 d ES2NA1 400 d ES2AB1 400 d ESFF1 400 d AT9811 400 d AT9810 400 d ES2WF1 400 d A126 400 d PHO19 400 d A216B 400 d ES80J 367 d ESGA1 367 d AT9906 300 e A333B 233 f
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
128
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 189058824 3781176 35932 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS ESKD1 700 a ESJE2 600 b A123 600 b ESJE1 533 c SM9638 500 c AT9811 500 c SM9713 500 c PHO1 500 c ESBA1 500 c SM9631 500 c ESFB2 500 c A334 500 c A323 500 c MU0123 500 c A333A 433 d ESJD1 433 d ESGF1 433 d A116 433 d PAC22 400 e ESDF1 400 e A321 400 e A132 400 e ES2KF1 400 e
ANEXO 3ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO AVEIA
129
ESJG1 400 e ESRD1 400 e PHO19 400 e A115B 400 e A124 400 e ESFF1 367 e A134 367 e ESIE1 367 e A135 367 e A131 367 e A113 367 e ES2WF1 367 e SD1 367 e ESIA1 333 e ESGA1 300 f ESJH1 300 f ESFH1 300 f AT9906 300 f ES2NA1 300 f A216B 300 f ES80J 300 f ESA215A 267 f AT9810 200 g A333B 200 g ES2AB1 200 g SM9714 200 g ES2WC1 200 g
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
130
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 270562092 5411242 51423 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS A323 733 a SM9631 700 a ESKD1 700 a A134 700 a ESIE1 700 a A116 667 b A334 667 b A215A 633 b ESSD1 633 b A321 600 c MU0123 600 c ESGF1 600 c ESRD1 600 c AT9811 600 c SM9713 600 c A123 600 c ESJH1 600 c ESDF1 600 c A131 567 c IA1 567 c ESBA1 567 c ESJD1 567 c A333A 533 d A135 500 d
ANEXO 4ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO MEA
131
ES2NA1 500 d A124 500 d A132 500 d SM9714 500 d ESFB2 500 d A115B 467 e ES2AB1 433 e A216B 433 e A113 433 e PHO1 400 f SM9638 400 f ES2WF1 400 f A126 400 f ESJE1 400 f ESPAC22 400 f ESFF1 400 f ES2KF1 400 f ESJG1 367 f ES80J 367 f ESJE2 333 g ESFH1 333 g AT9906 300 g ESGA1 300 g SM9810 300 g ES2WC1 300 g A333B 233 h PHO19 233 h
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
132
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 46 1602192500 34089202 1617590 RESIacuteDUO 432 91040000 210741 Total 478 1693232500
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO AT9906 352 a AT9810 353 a ESFH1 297 b ESPAC22 195 c ES2KF1 194 c SM9631 193 c ESGA1 184 cd PHO19 184 cd ES80J 166 de ESRD1 152 ef ESFB2 143 efg ESJE2 142 efg ESJE1 142 efg ESJG1 131 fgh A323 127 fghi A333A 126 ghij A135 123 ghij A124 123 ghij A126 123 ghij A132 123 ghij A131 123 ghij A134 123 ghij
ANEXO 5 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO DOS ESPOROS BETACONIacuteDIOSDOS ISOLADOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA
133
A115B 123 ghij ESIE1 123 ghij ES2WC1 119 ghil ES2WF1 119 ghil SM9713 116 hil A334 116 hil ESIA1 115 hil A333B 113 hil ESFF1 113 hil ESGF1 111 hil ES2AB1 107 him A123 107 him A113 107 him ESJD1 106 him ESKD1 105 im ES2NA1 104 im A215A 103 im SM9714 102 im ESSD1 101 m ESJH1 97 m MU0123 96 m A321 96 m ESDF1 95 m A216B 95 m A116 85 m
DMS = 259444 CV = 1052904
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
134
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 21 2674219 127344 459861 RESIacuteDUO 88 243688 002769 Total 109 2917907
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 293 a Fungicida Derosal 236 b ESGF1 157 c ESGA1 137 cde ESFH1 134 cdef ESIA1 120 cdefg ES2KF1 119 cdefgh ESFF1 146 cdefgh ES2NA1 111 defgh ES2AB1 110 defgh ESKD1 114 defgh ESJE2 110 defgh ESBA1 112 defgh ESRD1 098 efgh ESJG1 099 efgh ESJE1 099 efgh ESFB2 096 fgh ESJH1 094 gh ESJD1 093 gh ESIE1 095 gh ESSD1 078 h ESDF1 078 h
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 6 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
DMS = 039023 CV = 1340825
135
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 9 974154 108239 225325 RESIacuteDUO 40 192148 004804 Total 49 1166302
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 201 a
fungicida 174 ab AT9906 139 bc AT9810 117 cd AT9811 102 cde SM9638 110 cde SM9714 076 de SM9631 075 de MU0123 067 e SM9713 065 e
DMS = 046460 CV = 1946824
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 7 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
136
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 22 2382133 108279 239352 RESIacuteDUO 92 416192 004524 Total 114 2798325
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 244 a ES2WC1 237 a fungicida 185 b ES80J 138 bc A333B 136 cd ES2WF1 117 cde A333A 113 cde A132 110 cde A215A 106 cde A116 102 cde A124 101 cde A115B 101 cde A135 100 cde A215B 097 cde A321 094 cde A334 093 cde A323 092 cde A123 091 cde A113 091 cde A126 089 de A131 088 e ESPAC22 085 e A134 076 e
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 8 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
DMS = 050157 CV = 1809416
137
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA
FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 6210037 124201 165056 RESIacuteDUO 204 1535052 007525 Total 254 7745089
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 302 a FUNGICIDA Derosal 244 abc ES2WC1 277 ab AT9906 224 bcd AT9810 222 bcde SM9638 218 bcdef ESGF1 201 cdefg A333B 188 cdefgh A132 167 defghi SM9714 159 defghij ESFF1 153 efghil ES2WF1 150 fghil ESGA1 149 fghil ESFH1 147 ghil ES80J 147 ghil MU0123 144 ghil ES2NA1 143 ghil AT9713 142 ghim A321 141 ghim A216B 140 ghim AT9811 139 ghim A116 137 ghim
ANEXO 9 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305
138
ESBA1 134 ghim ES2AB1 133 ghim A323 132 ghin ESJG1 131 ghin ESIE1 130 hin A333A 129 hin A113 127 hin A134 125 hin ESSD1 122 hin ESKD1 121 hin ESIA1 117 in A124 113 in A334 112 in ES2KF1 112 in ESJE1 110 in ESPAC22 108 in A131 108 in A126 106 in A135 102 in ESRD1 094 n SM9631 093 n ESJE2 090 n ESJH1 090 n ESFB2 088 n ESJD1 087 n A123 087 n ESDF1 086 n A115B 072 n A215A 062 n
DMS = 070465 CV = 1983267
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
139
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 28 2145366 076620 407144 RESIacuteDUO 116 218300 001882 Total 144 2363666
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 222 a ESRD1 19 b A131 176 b ESIA1 178 b SM9713 162 bc ESJD1 162 bc A126 154 bcd MU0123 149 bcde A333A 134 cdef ESGA1 134 cdef A113 133 cdef ESGF1 130 cdef A334 130 cdef ESBA1 140 cdef SM9638 127 def ESJH1 119 efg ESDF1 115 fgh ESSD1 112 fgh ESKD1 113 fgh ES2AB1 111 fghi A124 111 fghi
ANEXO 10 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 PARA DETECCcedilAtildeODE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
140
A215A 109 fghi A321 108 fghi A134 089 ghij A115B 082 hij ESFF1 078 ij ESFH1 071 l A123 062 l ES2WF1 042 l
DMS = 033193 CV = 1095343
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
141
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA
FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 28 11264938 402319 481124 RESIacuteDUO 116 970000 008362 Total 144 12234938
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 422 a ESGA1 275 b ESGF1 267 bc ESBA1 265 bc SM9713 261 bc A333A 251 bcd ESSD1 235 bcde MU0123 234 bcde ESKD1 211 bcdef A215A 203 cdef A321 188 defg A131 173 efgh SM9638 167 efgh A124 148 fghi ESJD1 147 fghi A113 130 ghij ESIA1 122 ghij ES2AB1 128 ghij ESDF1 124 ghij A334 112 hij A115B 106 hij
ANEXO 11 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 PARA DETECCcedilAtildeODE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
142
ESRD1 104 hij ES2WF1 086 il A134 083 il A126 080 il ESFF1 075 l A123 065 l ESFH1 025 l ESJH1 017 l
DMS = 069970 CV = 1193907
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
43
ANE
XO
12
ndash M
ATR
IZ D
E D
AD
OS
PA
RA
CA
RA
CTE
RIZ
ACcedil
AtildeO
CR
ITEacuteR
IOS
ME
DID
AS
ME
IOS
DE
C
ULT
UR
A
MU
0123
SM
9631
SM
9638
SM
9713
SM
9714
AT9
810
AT9
811
AT9
906
ES
2AB
1
ES
2KF1
ES2N
A1
ES2W
C1
ES2W
F1
ES
80J
ESBA
1
ESD
F1
ES
FB2
ES
FF1
ESFH
1
ES
GA
1
ESG
F1
ESIA
1
ESIE
1
ESJD
1
ESJE
1
ESJE
2
1 AV 1 0 1 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 MEA 0 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 BDA 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 1 1 0
2 AV 1 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1 1 1 3 AV 0 0 0 0 1 0 0 1 1 1 0 1 0 0 0 1 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 4 AV 1 0 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
MEA 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
5 AV 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
6 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0 BDA 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1
7 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 BDA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0
8 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 0 0 0
9 AV 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 1 BDA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1
10 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 MEA 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1
11 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
12 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
13 AV 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 MEA 0 0 1 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 1 0 1 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0
14 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 1 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 0
44
BDA 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 15 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0
16 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 0
17 AV 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 1 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0
18 AV 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 MEA 0 1 0 0 1 0 1 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 BDA 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1
19 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0
20 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21 AV 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 0 1 0 1 1 1 0 0 1 1 1 1
MEA 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 0 BDA 1 1 0 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0
22 AV 1 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
23 352 a 353μM BDA 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 297 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0
195 a 193 μM BDA 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 184 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 166 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 152 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
143 a 142 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 131 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 127 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
126 a 123 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 119 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
116 a 111 μM BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 107 a 106 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 105 a 102μM BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
97 a 85μM BDA 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24 733 a 700cm MEA 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0
677 a 633 cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 600 a 567 cm MEA 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 533 a 500cm MEA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
45
467 a 433cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 400 a 367cm MEA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 333 a 300cm MEA 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1
233cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 700 a 667cm BDA 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 633 a 567cm BDA 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 433 a 367cm BDA 0 0 1 0 0 1 1 0 1 0 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 1
300cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 233cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 700cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
600cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 533 a 500cm AV 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 433cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 400 a 333cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 300 a 267cm AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 200cm AV 0 0 0 0 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
CR
ITEacuteR
IOS
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DE
C
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A
ES
JG1
ES
JH2
ES
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1
ES
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C22
ES
RD
1
ES
SD
1
A131
A126
A123
A323
A113
A334
A321
A216
B
A135
A115
B
A124
A116
A215
A
A132
A333
A
A333
B
A134
P l
ongi
colla
PH
O19
1 AV 0 0 1 1 0 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 0 0 MEA 0 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 1 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 BDA 0 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 1 1 0 1 0 1 1 1 0 0 0 0 0
2 AV 0 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 3 AV 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 4 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1
MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 BDA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1
5 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0
6 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 0 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 0 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1
7 AV 1 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0
46
MEA 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 BDA 0 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0
8 AV 0 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 MEA 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1 BDA 0 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1
9 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 MEA 0 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0 BDA 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0
10 AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
11 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
12 MEA 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0
13 AV 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 0 1 1 1 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 1 1
14 AV 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 1 0 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 0 BDA 0 1 0 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0 1 0 1 0 1 0
15 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0
16 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
17 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 MEA 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 BDA 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0
18 AV 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 0 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0 1 1 BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
19 AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 BDA 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0
20 ESP 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 21 AV 1 1 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1
MEA 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1 0 1 1 0 0 1 BDA 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 0
22 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1
47
BDA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 23 352 a 353μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
297 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 195 a 193 μM BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
184 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 166 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 152 μM BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
143 a 142 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 131 μM BDA 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 127 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
126 a 123 μM BDA 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 1 1 0 1 0 0 119 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
116 a 111 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 107 a 106 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 105 a 102μM BDA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0
97 a 85μM BDA 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 24 733 a 700cm MEA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0
677 a 633 cm MEA 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 600 a 567 cm MEA 0 1 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 467 a 433cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 400 a 367cm MEA 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 333 a 300cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
233cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 700 a 667cm BDA 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 633 a 567cm BDA 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 1 1 0 1 0 0 533 a 500cm BDA 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 433 a 367cm BDA 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1
300cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 233cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 700cm AV 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
600cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 433cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 400 a 333cm AV 1 0 0 1 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 1 300 a 267cm AV 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 200cm AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0
Nota - Caracteriacutestica avaliada nos trecircs meios As caracteriacutesticas foram avaliadas seguindo os seguintes criteacuterios
48
1 Bordos da colocircnia regular (1) ou irregular (0) 2 Miceacutelio denso 3 Miceacutelio ralo 4 Miceacutelio granuloso aeacutereo 5 Miceacutelio algodonoso 6 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Branco 7 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Marrom 8 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Cinza 9 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Verde 10 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Amarelo 11 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Bege 12 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Preto 13 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Branco 14 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Marrom 15 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Preto 16 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Cinza 17 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Verde 18 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Amarelo 19 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Bege 20 Esporulaccedilatildeo com esporulaccedilatildeo (1) sem esporulaccedilatildeo (0) 21 Coniacutedio do tipo alfa 22 Coniacutedio do tipo beta 23 Comprimento dos coniacutedios do tipo beta 24 Diacircmetro meacutedio do crescimento das colocircnias
49 ANEXO 13 LOCAL DA COLETA DE FOLHAS DE Schinus terebinthifoliusCENTRO POLITEacuteCNICO ndash CURITIBAPR
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RESUMO Phomopsis spp ENDOacuteFITOS DE PLANTAS MEDICINAIS DIVERSIDADE GENEacuteTICA E ANTAGONISMO AO FUNGO Guignardia citricarpa Autora Renata Rodrigues Gomes Orientadora Chirlei Glienke Microrganismos endofiacuteticos vivem no interior das plantas sem causar dano ao seu hospedeiro podendo produzir compostos biologicamente ativos antibioacuteticos fungicidas e herbicidas Essa comunidade endofiacutetica pode estar relacionada com a accedilatildeo antimicrobiana de plantas medicinais A planta Maytenus ilicifollia conhecida como espinheira-santa eacute uma planta medicinal muito utilizada no tratamento de uacutelceras gaacutestricas e tratamentos digestivos tiacutepica da Ameacuterica do Sul em especial da regiatildeo Sul do Brasil e atualmente encontra-se ameaccedilada de extinccedilatildeo As plantas medicinais Spondias mombin Myracrodruon urundeuva Schinus terebinthifolius e Aspidosperma tomentosun tecircm sido usadas na medicina devido as suas propriedades antimicrobianas No presente trabalho foram isolados fungos endofiacuteticos do gecircnero Phomopsis e avaliados quanto a sua variabilidade geneacutetica e estrutura populacional por meio de marcadores RAPD Observou-se que as plantas medicinais analisadas satildeo colonizadas por grande diversidade de espeacutecies de Phomopsis com grande variabilidade morfoloacutegica e geneacutetica intra e interespeciacuteficas Os isolados foram identificados por meio de sequumlecircncias das regiotildees ITS1 58S e ITS2 do DNA ribossomal e testados quanto ao potencial antimicrobiano contra as linhagens PC1396 e PC3305 de Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta do Citros Foi possiacutevel identificar nove isolados em niacutevel de espeacutecie por meio de sequumlecircncias ITS do rDNA sendo 4 como P michaeliae 2 como P theicola 2 como P longicolla e 1 como P sojae Foi possiacutevel verificar que as plantas de Maytenus ilicifolia analisadas satildeo colonizadas endofiticamente por pelo menos dez espeacutecies de Phomopsis e as plantas de Schinus terebinthifolius por pelo menos seis espeacutecies deste gecircnero As anaacutelises morfoloacutegicas por meio de marcadores RAPD e sequenciamento de ITS do rDNA permitem sugerir que as espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo satildeo hospedeiro-especiacuteficas sendo necessaacuteria a redefiniccedilatildeo do conceito de espeacutecie para este gecircnero Na anaacutelise antimicrobiana todos os isolados apresentaram grande potencial no controle in vitro do fungo G citricarpa destacando-se os isolados ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ES2AB1 (Phomopsis sp S6) ES2WF1 (Phomopsis sp S4) e ESFH1 (P theicola) que inibiram o crescimento das linhagens PC1396 e PC3305 de G citricarpa em trecircs metodologias avaliadas Desta forma esse estudo indica que os isolados de Phomopsis spp endoacutefitos de plantas medicinais satildeo produtores de substacircncias bioativas que devem ser melhor caracterizadas Palavras chaves Phomopsis spp endoacutefitos plantas medicinais RAPD sequumlecircncias da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
ABSTRACT Phomopsis spp ENDOPHYTES OF MEDICINAL PLANTS GENETIC DIVERSITY AND ANTAGONISM IN THE FUNGUS Guignardia citricarpa Author Renata Rodrigues Gomes Adviser Chirlei Glienke-Blanco Endophytic microorganisms live in plants without causing damage to their host being able to produce active biological compounds antibiotics fungicides and herbicides This endophytic community may be related to the antimicrobial action of medicinal plants The plant Maytenus ilicifolia known as ldquoespinheira santardquo is a medicinal plant greatly used for the treatment of stomach ulcers and digestive problems typical from the South America especially in the southern part of Brazil and currently is in danger of extinction The medicinal plants Spondias mombin Myracrodruon urundeuva Schinus terebinthifolius and Aspidosperma tomentosun have been used in medicine due to their antimicrobial properties In the present work endophytic fungi of the genus Phomopsis were isolated and their genetic variability and population structure assessed using RAPD markers The medicinal plants analyzed are colonized by a great variety of Phomopsis species with a high morphological and genetic variability both intra and interspecific The isolated fungi were identified through sequences of ITS1 58S and ITS2 regions of ribosomal DNA and tested in their antimicrobial potential against the PC1396 and PC3305 lineages of Guignardia citricarpa the responsible for the ldquoblack spot in Citrusrdquo It was possible to identify 9 isolates at the level of species through the analysis of ITS sequences of rDNA and among these isolates 4 were identified as P michaeliae 2 as P theicola 2 as P longicolla and 1 as P sojae It was possible to verify that the Maytenus ilicifolia plants analyzed are endophytically colonized by at least ten Phomopsis species and that Schinus terebinthifolius are colonized by at least six species of this genus The morphological analyses using RAPD markers and sequencing of ITS regions of rDNA make possible to suggest that the analyzed species of Phomopsis are not host-specific being necessary the redefinition of the species concept for this genus For the antimicrobial analysis all the isolates presented a high in vitro control potential of the fungus G citricarpa particularly the isolates ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ES2AB1 (Phomopsis sp S6) ES2WF1 (Phomopsis sp S4) and ESFH1 (P theicola) that inhibited the growth of the PC1396 and PC3305 lineages of G citricarpa in the three methodologies tested Thus this study indicates that the isolates of Phomopsis spp endophytic of medicinal plants are producers of bioactive substances which should be better characterized Key words Phomopsis spp endophytes medicinal plants RAPD ITS1 58S and ITS2 of rDNA sequences
LISTA DE FIGURAS
FIGURA 1- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis DE Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT 9811 e AT 9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 59
FIGURA 2- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE
Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 61
FIGURA 3- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 64
FIGURA 4- MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
PATOGEcircNICOS OBTIDOS DE Glycine max EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 68
FIGURA 5- DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp EM MEIO MEA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 69
FIGURA 6- DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 70
FIGURA 7- AVALIACcedilAtildeO DAS MEacuteDIAS DO DIAcircMETRO DAS COLOcircNIAS DOS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO AV APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 71
FIGURA 8- FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS
ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis EM BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 73
FIGURA 9- FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DO ISOLADO SM9713 EM
MEIOS BDA e AV APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB
LUZ CONTIacuteNUA 74 FIGURA 10- COMPRIMENTO DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS
DE Phomopsis spp APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO EM BDA A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA 75
FIGURA 11- DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE
SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 77
FIGURA 12- ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE
MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 78
FIGURA 13- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX11 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 79
FIGURA 14- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX14 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 79
FIGURA 15- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO
OPX19 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 80
FIGURA 16- PERFIL DE AMPLIFICACcedilAtildeO COM O OLIGONUCLEOTIacuteDEO OPE
08 DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis sp E GRUPO EXTERNO Pestalotiopsis 80
FIGURA 17- DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE
SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS DE Phomopsis POR MEIO DE MARCADORES MOLECULARES RAPD 82
FIGURA 18- ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE
GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis 84 FIGURA 19- AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA
REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MEacuteTODO DE PARCIMOcircMIA) 86
FIGURA 20- AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA PARCIAL BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MODELO NEIGHBOR-JOINING COM CORRECcedilAtildeO KIMURA DOIS PARAcircMETROS) 87
FIGURA 21- INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa PC1396 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA 93
FIGURA 22- INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia
citricarpa 3305 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA 96 FIGURA 23- AVALIACcedilAtildeO DO CRESCIMENTO DAS COLOcircNIAS DO
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 e PC3305 INOCULADAS APOacuteS RETIRADA DO PAPEL CELOFANE PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS EM MEIO BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 98
FIGURA 24- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 99
FIGURA 25- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 100
LISTA DE TABELAS
TABELA 1- ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR 32
TABELA 2- ISOLADOS GRUPO EXTERNO PARA ANAacuteLISE DE
VARIABILIDADE GENEacuteTICA POR RAPD 35 TABELA 3- EacutePOCAS DO ANO OacuteRGAtildeOS DA PLANTA CONDICcedilOtildeES DE
INCUBACcedilAtildeO E Nordm DE FRAGMENTOS PLAQUEADOS NAS QUATRO COLETAS DE ENDOacuteFITOS DE ESPINHEIRA-SANTA 42
TABELA 4- SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA
AMPLIFICACcedilAtildeO DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL 47
TABELA 5- SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA
AMPLIFICACcedilAtildeO DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL 49
TABELA- 6- Linhagens de Phomopsis spp E de Pestalotiopsis vismae utilizadas
como grupo externo 52 TABELA 7- PORCENTAGEM DE ISOLAMENTO DE Phomopsis
ENDOFIacuteTICOS DE PLANTAS DE ESPINHEIRA SANTA 56 TABELA 8- PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE
OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC1396 94
TABELA 9- PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE
OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 96
TABELA 10- AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO
CRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC 101
LISTA DE ANEXOS
ANEXO 1- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM DIFERENTES MEIOS DE CULTURA 125
ANEXO 2- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO BDA 126
ANEXO 3- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO AVEIA 128
ANEXO 4- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL
DOS ISOLADOS EM DOS ISOLADOS DE Phomopsis EM MEIO MEA 130
ANEXO 5- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO DOS
ESPOROS BETACONIacuteDIOS DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA 132
ANEXO 6- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 134
ANEXO 7- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 135
ANEXO 8- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 136
ANEXO 9- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 137
ANEXO 10- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS 139
ANEXO 11- ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS
ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
141
ANEXO 12- MATRIZ DE DADOS PARA CARACTERIZACcedilAtildeO 143 ANEXO 13- LOCAL DA COLETA DE FOLHAS DE Schinus terebinthifolius
CENTRO POLITEacuteCNICO ndash CURITIBA PR 149
SUMAacuteRIO 1 INTRODUCcedilAtildeO 1
2 OBJETIVOS 3
3 REVISAtildeO BIBLIOGRAacuteFICA 4
31 Microrganismos Endofiacuteticos 4
32 Ocorrecircncia de endoacutefitos 7
33 Fungos endofiacuteticos de plantas medicinais 9
34 Endoacutefitos Produtores de Substacircncias Antimicrobianas 11
35 Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss 14
351 Componentes quiacutemicos e propriedades terapecircuticas 16
352 Endoacutefitos isolados de Maytenus ilicifolia 18
36 Guignardia citricarpa Kiely e a Mancha preta do citros 18
361 Mancha Preta do Citros 21
37 O Gecircnero Phomopsis sp 22
38 Marcadores Moleculares 25
381 Marcadores RAPD 27
382 Marcadores ITS 29
4 MATERIAL E MEacuteTODOS 32
41 Material Bioloacutegico 32
411 Fungos endofiacuteticos 32
412 Microrganismos usados para teste de antagonismo 35
413 Fungos endofiacuteticos utilizados para anaacutelise de variabilidade geneacutetica 35
42 Meios de Cultura 35
421 Caldo MEB (Extrato de Malte) 35
422 Meio AV (Aveia-Aacutegar) 36
423 Meio BDA (Meio Batata-Dextrose-Aacutegar) 36
424 Meio MC (Meio Completo) PONTECORVO et al 1953 37
425 Meio MEA (Extrato de Malte) PATERSON e BRIDGE 1994 37
43 Soluccedilotildees e Reagentes 38
431 Clorofane 38
432 Clorofil 38
433 Derozal Bayerreg 38
434 Dodecil Sulfato de Soacutedio (SDS) 10 38
435 Fenol Saturado 38
436 Gel de Agarose (08) 38
437 Gel de Agarose (15) 38
438 Lactofenol azul 38
439 Marcador de peso molecular (DNA de fago lambda clivado com Hind III
Gibco) 39
4310 Marcador de peso molecular (DNA Ladder 100pb Ludwing Biotec) 39
4311 Oligonucleotiacutedeos (Invitrogen) 39
4312 RNAse (invitrogen) 39
4313 Soluccedilatildeo de Vitaminas 40
4314 Soluccedilatildeo salina (pv) 40
4315 Soluccedilatildeo Tween-80 01 (vv) 40
4316 Soluccedilatildeo de Tetraciclina 40
4317 Soluccedilatildeo de EDTA 05M 40
4318 Soluccedilatildeo de brometo de etiacutedio 40
4319 Tampatildeo TE (Tris-EDTA) 41
4320 Tampatildeo de Extraccedilatildeo de DNA 41
4321 Tampatildeo da Amostra (6x) 41
4322 Tampatildeo de corrida TBE 10x 41
44 Isolamento 42
45 Conservaccedilatildeo dos fungos 43
46 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica 43
47 Obtenccedilatildeo de colocircnia monospoacuterica 44
48 Caracterizaccedilatildeo Molecular 44
481 Extraccedilatildeo do DNA (RAEDER e BRODA 1985 modificado por GLIENKE
1995) 44
482 RAPD 45
4821 Anaacutelise da Variabilidade Geneacutetica 46
483 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA 47
4831 Amplificaccedilatildeo 47
4832 Purificaccedilatildeo da PCR 48
48321 Purificaccedilatildeo com PEG 48
48322 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio 48
4833 Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento 49
4834 Purificaccedilatildeo da Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento 50
48341 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em tubos 50
48342 Purificaccedilatildeo com Purificaccedilatildeo com Isopropanol em placa 50
48343 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio 51
4835 Ediccedilatildeo e Anaacutelise das Sequumlecircncia 51
49 Avaliaccedilatildeo da Atividade Antimicrobiana 52
491 Cultura Pareada 52
492 Avaliaccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis 53
493 Atividade dos Extratos metanoacutelicos 54
4931 Obtenccedilatildeo dos extratos 54
4932 Crescimento micelial 55
410 Anaacutelise Estatiacutestica 55
5 RESULTADOS E DISCUSSAtildeO 56
51 Isolamento 56
52 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de Phomopsis 58
53 Caracterizaccedilatildeo Molecular de Phomopsis spp 78
531 RAPD 78
532 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA 85
54 Avaliaccedilatildeo da atividade antimicrobiana 92
541 Cultura pareada 92
542 Teste para detecccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis 97
543 Avaliaccedilatildeo da accedilatildeo dos Extratos 98
6 CONCLUSOtildeES 104
7 REFEREcircNCIAS BIBLIOGRAacuteFICAS 106
ANEXOS 125
1
1 INTRODUCcedilAtildeO
A bioprospecccedilatildeo visa identificar plantas e microrganismos dentre a diversidade
de vida existente em determinado local que possam servir como fonte de substacircncias
bioativas que em uacuteltima instacircncia sejam uacuteteis para o desenvolvimento de novas
drogas Neste contexto os fungos endofiacuteticos satildeo considerados de grande importacircncia
pois representam uma fonte potencial de novos compostos quiacutemicos e bioloacutegicos
podendo ser utilizados natildeo somente na Medicina mas tambeacutem na Fitopatologia e
Veterinaacuteria (STROBEL 2002 STROBEL 2003) O potencial de aplicaccedilatildeo de
microrganismos endofiacuteticos no controle bioloacutegico tambeacutem vem sendo explorado
Os microrganismos endofiacuteticos vivem no interior das plantas interagindo com
diferentes espeacutecies sem causar dano ao seu hospedeiro Esses microrganismos
podem influenciar vaacuterias caracteriacutesticas das plantas e conferir certos benefiacutecios a este
vegetal como por exemplo produccedilatildeo de antibioacuteticos Haacute alguns anos natildeo se conhecia
a grande potencialidade dos endofiacuteticos entretanto este interesse vem aumentando
com a descoberta recente de caracteriacutesticas como a produccedilatildeo de compostos
biologicamente ativos antibioacuteticos fungicidas e herbicidas
Plantas medicinais com propriedades antimicrobianas tambeacutem satildeo habitadas por
microrganismos endofiacuteticos sugerindo que a accedilatildeo antibacteriana ou antifuacutengica poderia
estar no endoacutefito e natildeo na planta ou provavelmente na sua interaccedilatildeo No Brasil vaacuterios
autores mostraram a produccedilatildeo de faacutermacos por endoacutefitos como Xylaria sp Fusarium
moniliforme Colletotrichum sp Guignardia sp e tambeacutem Phomopsis sp
Fungos do gecircnero Phomopsis satildeo encontrados como endoacutefitos nos espaccedilos
intercelulares de tecidos de diversos vegetais entre eles a espinheira-santa (Maytenus
ilicifolia Mart Reiss) planta pertencente agrave famiacutelia Celastraceae Essa planta medicinal
encontrada principalmente no sul do Brasil foi acrescentada agrave lista das espeacutecies
consideradas em extinccedilatildeo no Paranaacute pelo governo do Estado em 1995 Tendo em
vista que pouco se conhece a respeito da comunidade endofiacutetica existente nessa
planta sua diversidade e seu potencial antimicrobiano tornam-se relevantes estudos
de diversidade e bioprospecccedilatildeo
2
Pileggi (2006) demonstrou existir alta diversidade de isolados do gecircnero
Colletotrichum dentre outros fungos filamentosos bacteacuterias e actinomicetos em plantas
de Maytenus ilicifolia do pomar do Centro Nacional de Pesquisa de Florestas (CNPF)
da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaacuteria (EMBRAPAPR) Alguns desses
isolados apresentaram potencial antimicrobiano inibindo o crescimento de Fusarium
sp Guignardia citricarpa e Micrococcus luteus
Endoacutefitos com atividade antagonista contra o fungo Guignardia citricarpa agente
causal da Mancha Preta dos Citros (MPC) poderiam ser utilizados no controle bioloacutegico
desta doenccedila uma vez que o emprego sucessivo de fungicidas como controle de
doenccedilas de plantas apresenta dentre outros problemas a seleccedilatildeo de linhagens
resistentes do patoacutegeno
O gecircnero Phomopsis representa uma fonte potencial de novos compostos
quiacutemicos e bioloacutegicos como vem sendo relatado em diversos trabalhos Oito dos
isolados que foram estudados nesse trabalho jaacute haviam sido avaliados no
IOCFIOCRUZRJ e possuem potencial antimicrobiano (RODRIGUES et al 2004)
Poreacutem tais isolados ainda natildeo haviam sido caracterizados geneticamente nem
identificados em niacutevel de espeacutecie A identificaccedilatildeo e a caracterizaccedilatildeo molecular dos
microrganismos endofiacuteticos satildeo uacuteteis pois o gecircnero Phomopsis eacute de difiacutecil identificaccedilatildeo
em niacutevel de espeacutecie utilizando-se apenas caracteriacutesticas morfoloacutegicas
Estudos moleculares satildeo realizados na busca de padrotildees geneacuteticos nestes
organismos complementando sua caracterizaccedilatildeo O polimorfismo do DNA amplificado
ao acaso (RAPD) propicia uma forma raacutepida para avaliar a diversidade geneacutetica
existente nestes organismos a estruturaccedilatildeo populacional e para auxiliar na
identificaccedilatildeo ao niacutevel de espeacutecie comparando-as com linhagens referecircncia Outra
estrateacutegia importante nessa caracterizaccedilatildeo baseia-se em marcadores de Sequumlecircncias
Internas Transcritas do DNA Ribossocircmico (ITS) para identificaccedilatildeo taxonocircmica dos
isolados
3
2 OBJETIVOS
1 Isolar linhagens endofiacuteticas de Phomopsis spp de plantas sadias de Maytenus
ilicifolia e Identificar os isolados utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas
2 Caracterizaccedilatildeo de Phomopsis spp endofiacuteticos das plantas medicinais Schinus
terebinthifolius Myracrodruon urundeuva Spondias mombin Aspidosperma
tomentosum pertencentes agrave coleccedilatildeo do LABGEM
3 Avaliar a variabilidade geneacutetica e estrutura populacional das linhagens de
Phomopsis spp por meio de marcadores RAPD (Polimorfismo do DNA
Amplificado ao Acaso)
4 Identificar as linhagens por meio de sequumlecircncias da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do
DNA ribossomal
5 Testar a atividade antimicrobiana de linhagens do fungo Phomopsis spp contra
linhagens do fitopatoacutegeno Guignardia citricarpa
4
3 REVISAtildeO BIBLIOGRAacuteFICA
31 Microrganismos Endofiacuteticos
Microrganismos endofiacuteticos satildeo aqueles que vivem no interior das plantas
interagindo com outras espeacutecies de microrganismos sem causar dano ou prejuiacutezo ao
seu hospedeiro Esses microrganismos podem influenciar em vaacuterias caracteriacutesticas
expressas pelas plantas Segundo Neto Azevedo e Araujo (2002) os endoacutefitos podem
desempenhar relevante funccedilatildeo para a sanidade vegetal jaacute que atuam como agentes
controladores de microrganismos fitopatogecircnicos no controle de insetos e ateacute na
proteccedilatildeo da planta contra herbiacutevoros Todas as plantas jaacute estudadas satildeo habitadas por
microrganismos endofiacuteticos principalmente fungos e bacteacuterias
A comunidade endofiacutetica cuja composiccedilatildeo varia em funccedilatildeo do hospedeiro e das
condiccedilotildees ambientais tem indiviacuteduos que se inter-relacionam dentro da planta em um
equiliacutebrio harmocircnico O desequiliacutebrio dessa harmonia afeta o comportamento de todos
os integrantes da comunidade dando condiccedilotildees para que fungos oportunistas
manifestem seu potencial patoloacutegico contra hospedeiro (MAKI 2006)
A distinccedilatildeo entre endofiacuteticos fitopatogecircnicos e oportunistas eacute puramente
didaacutetica Haacute um gradiente tecircnue que os separa e assim agrave distacircncia entre um e outro
pode ser muito pequena sendo difiacutecil impor limites para separar cada categoria Assim
um microrganismo pode ser considerado endofiacutetico mas com a reduccedilatildeo dos
mecanismos de defesa da planta pode se comportar como um patoacutegeno (AZEVEDO et
al 2000)
A ocorrecircncia de microrganismos endofiacuteticos nos vegetais resulta da penetraccedilatildeo
atraveacutes de feridas ocasionadas nas raiacutezes pela abrasatildeo destas com o solo aberturas
naturais como hidatoacutedios e estocircmatos aberturas artificiais sofridas pela accedilatildeo de
pragas animais e o homem ou agressotildees abioacuteticas (RIBEIRO 1995) ou ainda atraveacutes
da secreccedilatildeo de enzimas hidroliacuteticas (ESPOacuteSITO e AZEVEDO 2004) A penetraccedilatildeo
pode ocorrer por meio de esporos levados pelo vento ou hifas que invadem os tecidos
Muitos endoacutefitos produzem massas de coniacutedios delgados caracteriacutestica associada com
5
a dispersatildeo por chuvas (RIBEIRO 1995) Outra forma de propagaccedilatildeo se daacute pela
transmissatildeo vertical por meio de sementes (WHITE MORGAN-JONES E MORROW
1993 CLAY 2004)
Viret e Petrini (1994) usando microscopia eletrocircnica de varredura e transmissatildeo
detectaram a presenccedila de fungos no interior dos hospedeiros Clay (1987) verificou a
presenccedila de hifas dos fungos Acremonium lolli e A coenophialum no espaccedilo
intercelular da regiatildeo meristemaacutetica no mesofilo das folhas no cerne da inflorescecircncia
na semente
Os endoacutefitos apresentam uma relaccedilatildeo mutualiacutestica antagoniacutestica ou neutra com
o hospedeiro A interaccedilatildeo de um fungo com seu hospedeiro vegetal variam e depende
do modo pelo qual o fungo infecta a planta e tambeacutem da extensatildeo da resposta de
defesa desta A colonizaccedilatildeo pode ser sistecircmica ou local inter ou intracelular (ARAUacuteJO
SILVA E AZEVEDO 2000)
Os fungos endofiacuteticos atuam no controle bioloacutegico de fitopatoacutegenos por
ocuparem o mesmo nicho ecoloacutegico destes (ARAUacuteJO SILVA E AZEVEDO 2000)
Segundo Schulz e Boyle (2005) aproximadamente 80 dos fungos endofiacuteticos
produzem compostos biologicamente ativos como antibioacuteticos fungicidas e herbicidas
Esses microrganismos endofiacuteticos podem ser utilizados como fontes de
metaboacutelitos primaacuterios (STAMFORD ARAUacuteJO E STAMFORD 1998) e secundaacuterios que
inibem o desenvolvimento de patoacutegenos (LI et al 2001 LI e STROBEL 2001 ZOU e
TAN 2001) Como exemplo pode-se citar o taxol uma droga quimioterapecircutica usada
no tratamento de cacircncer de mama e ovaacuterio (WANG et al 2000 e STROBEL et al
2003) O aacutecido coletoacutetrico um metaboacutelico do fungo endofiacutetico Colletotrichum
gloeosporioides isolado da Artemisia mongoacutelica apresenta atividade antimicrobiana
contra Bacillus subtilis Staphylococcus aureus Sarcina lutea e contra o fungo
patogecircnico Helminthosporium sativum (ZOU et al 2000) Lu et al (2000) identificaram
trecircs novos metaboacutelitos do fungo endofiacutetico Colletotrichum sp isolado de Artemisia
annua com propriedades antimicrobianas Diversos autores relatam agrave accedilatildeo
antimicrobiana de substacircncias produzidas por fungos endofiacuteticos como Rodrigues
6
Hesse e Werner (2000) Liu et al (2001) Stinson et al (2003) Bao e Lazarivits (2001)
Huang et al (2001) Strobel (2003) Rodrigues (2004) Chareprasert et al (2006)
Os microrganismos endofiacuteticos satildeo tambeacutem capazes de produzirem anti-
helmiacutenticos e inseticidas (AZEVEDO et al 2000 ESPOacuteSITO e AZEVEDO 2004)
apresentando grande potencial que pode ser explorado na agricultura (ZOU e TAN
2001)
Schulz et al (2002) isolaram mais de seis mil e quinhentos fungos endofiacuteticos de
aacutervores e herbaacuteceas na busca de novos metaboacutelitos com potencial para novos
produtos industriais e sugerem que a associaccedilatildeo entre fungos endofiacuteticos e seus
hospedeiros conduza agrave produccedilatildeo de metaboacutelitos secundaacuterios com atividade
antimicrobiana e anti-herbicida
Autores sugerem que certos fungos endofiacuteticos produzem compostos igualmente
presentes em suas plantas hospedeiras como o taxol utilizado para o tratamento de
cacircncer presente tanto na planta medicinal Taxus brevifolia como no fungo endofiacutetico
Taxomyces andreanae (STIERLE et al 1995) Outros exemplos satildeo algumas enzimas
(celulases e lignases) em Xylaria sp fatores de crescimento como giberelina em
Fuzarium moniliforme Indicando uma possiacutevel transposiccedilatildeo de genes entre plantas e
fungos em uma verdadeira engenharia geneacutetica in vivo Se esses casos forem
confirmados ficaraacute evidente que vegetais e fungos transgecircnicos podem ocorrer
naturalmente pela transferecircncia de genes entre espeacutecies pertencentes a diferentes
reinos (AZEVEDO 1998)
Rodrigues Hesse e Werner (2000) pesquisaram a atividade bioativa de extratos
de fungos endofiacuteticos isolados da planta Spondias mombin L (cajazeiro) Estes extratos
incluindo o de Phomopsis sp foram testados contra determinados microrganismos O
fungo apresentou atividade contra actinomicetos Cladosporium elatum Mycotypha sp
e S cerevisae
Aleacutem da produccedilatildeo de antimicrobianos fungos endofiacuteticos podem excluir
patoacutegenos que ocupem o mesmo nicho ecoloacutegico por competiccedilatildeo como relatado por
Bao e Lazarovits (2001) com Fusarium oxysporum f sp Lycopersici patogecircnico e
Fusarium oxysporum natildeo patogecircnico
7
Os fungos endofiacuteticos satildeo de grande importacircncia pois representam uma fonte
potencial de novos compostos quiacutemicos e bioloacutegicos podendo ser utilizados natildeo
somente na Medicina mas tambeacutem na Fitopatologia e Veterinaacuteria (STROBEL 2002
STROBEL 2003) Tendo em vista essa importacircncia vaacuterios trabalhos vecircm sendo
recentemente publicados envolvendo a capacidade de endofiacuteticos antagonizarem
fitopatoacutegenos assim como satildeo descobertos e descritos metaboacutelitos e outras
substacircncias de interesses produzidos por endofiacuteticos
3 2 Ocorrecircncia de endoacutefitos Uma diversidade de microrganismos endofiacuteticos estaacute presente no interior de
plantas aparentemente saudaacuteveis com potencial para serem estudadas A composiccedilatildeo
das espeacutecies pode variar de acordo com o hospedeiro distribuiccedilatildeo geograacutefica idade da
planta condiccedilotildees ecoloacutegicas e sazonais incluindo altitude e precipitaccedilatildeo Uma ou duas
espeacutecies satildeo predominantes como endofiacuteticas em um dado hospedeiro enquanto
outros isolados satildeo pouco frequumlentes (CARROLL 1978 ARNOLD 2003)
Petrini Stone e Carroll (1982) verificaram um padratildeo de dominacircncia de espeacutecies
em que o endoacutefito encontrado com maior frequumlecircncia em uma determinada espeacutecie
vegetal era isolado menos frequentemente de outros hospedeiros Por outro lado os
endoacutefitos encontrados com menor frequumlecircncia em uma planta pareciam ser menos
especiacuteficos pois eram isolados em um amplo espectro de hospedeiros mas com baixa
frequumlecircncia
A colonizaccedilatildeo do fungo endofiacutetico Stagonospora sp no hospedeiro Phragmites
australis ocorre de forma diferenciada no decorrer do ano Na primavera o endoacutefito eacute
encontrado somente na raiz enquanto no outono ele eacute encontrado em todo o vegetal
(ERNEST MENDGEN e WIRSEL 2003) Gao et al (2005) constataram uma flutuaccedilatildeo
sazonal para os endoacutefitos isolados de Heterosmilax japonica Kunth os autores
verificaram maior abundancia de populaccedilotildees endofiacuteticas em amostras coletadas na
primavera do que no veratildeo
8
Tanto a planta hospedeira como a regiatildeo onde os endofiacuteticos satildeo isolados pode
influenciar a produccedilatildeo de metaboacutelitos secundaacuterios De acordo com dados estatiacutesticos
Bills et al (2002) compararam a produccedilatildeo de metaboacutelitos de endofiacuteticos provenientes
de regiotildees tropicais e de regiotildees temperadas Os dados revelaram que regiotildees tropicais
satildeo mais ricas na produccedilatildeo tanto de endoacutefitos como dos metaboacutelitos secundaacuterios
A presenccedila de endoacutefitos em plantas pode variar dentro de espeacutecies de um
mesmo hospedeiro Nestes hospedeiros tambeacutem eacute encontrada uma grande variedade
geneacutetica entre isolados endofiacuteticos da mesma espeacutecie Tal variabilidade foi encontrada
em isolados do fungo Guignardia citricarpa obtidos de citros (GLIENKE 1995) em
duas espeacutecies de Colletotrichum sp isoladas de Maytenus ilicifolia (PILEGGI 2006) e
tambeacutem Pestalotiopsis sp isolados de Maytenus ilicifolia (FIGUEIREDO 2006)
O gecircnero Phomopsis tem sido frequentemente isolado como endoacutefito em uma
grande variedade de plantas
Azevedo et al (2000) apresentaram algumas plantas hospedeiras de onde jaacute
foram isoladas espeacutecies de Phomopsis entre elas Sabal bermudana Trachycarpus
fortunei Cavendishia pubescens Stylosanthes guianensis Anacardium occidentale e
Mangifera indica Corrado e Rodrigues (2004) isolaram endofiacuteticos de Phomopsis das
plantas medicinais Spondias mombin e Aspidosperma tomentosun
Bussabam et al (2001) isolaram predominantemente Phomopsis sp
Colletotrichum gloeosporiodes Glomerella sp e Xylaria sp endoacutefitos de folhas
pseudocaules e rizomas de gengibre (Amomum siamense Criab) coletadas em dois
locais na Tailacircndia
Em plantas de cacau (Theobroma cacao L) resistentes e suscetiacuteveis ao agente
causal da vassoura da bruxa endoacutefitos foram identificados por caracteriacutesticas
morfoloacutegicas e sequumlenciamento de rDNA como pertencentes aos gecircneros
Acremonium Blastomyces Botryosphaeria Cladosporium Colletotrichum
Cordyceps Diaporthe Fusarium Geotrichum Gibberella Gliocladium Lasiodiplodia
Monilochoetes Nectria Pestalotiopsis Phomopsis Pleurotus Pseudofusarium
Rhizopycnis Syncephalastrum Trichoderma Verticillium e Xylaria Os autores
identificaram ainda alguns endoacutefitos potencialmente antagonistas destacando-se
9
Gliocladium catenulatum que reduziu em 70 a incidecircncia da vassoura da bruxa in
vivo em placircntulas de cacaueiro (RUBINI et al 2005)
O gecircnero Phomopsis foi isolado como endoacutefito de graviola (Annona muricata L)
e pinha (Annona squamosa L) dois isolados promoveram eficientemente o crescimento
vegetal mostrando-se promissores para agricultura uma vez que satildeo capazes de
aumentar a produccedilatildeo dessas culturas (SILVA et al 2006) A capacidade de estimular o
crescimento vegetal apresentada por esses organismos tem sido atribuiacuteda a
mecanismos diretos tais como a fixaccedilatildeo do nitrogecircnio produccedilatildeo de fitohormocircnios e
indiretos como antagonismo em relaccedilatildeo a patoacutegenos levando consequumlentemente ao
aumento na taxa de germinaccedilatildeo crescimento das raiacutezes e parte aeacuterea nuacutemero de
folhas e flores aacuterea foliar e rendimento de culturas (SILVEIRA 2001)
Alguns dos relatos citam o gecircnero Phomopsis como fitopatoacutegeno isolado de
Citrus aurantium (Laranjeira) Citrus nobilis (Tangerineira) Citrus paradisi (Pomelo)
Citrus australis (Laranja) Citrus sinensis (Laranja da China) Citrus sp (Citros)
Mangifera indica (Mangueira) Glycine max (Soja) Ficus carica (Figueira) e Anacardium
occidentale (Cajueiro) entre muitas outras plantas (CENARGEN EMBRAPA 2005) Foi
descrito como agente causal da mancha foliar em Myracrodruon urundeuva (ANJOS
CHARCHAR e GUIMARAtildeES 2001) O fungo Phomopsis sp tambeacutem eacute encontrado
associado a sementes de Dipteryx alata e Cybistax antisyphilitica espeacutecies comuns nos
Cerrados (SANTOS 1996)
33 Fungos endofiacuteticos de plantas medicinais Os microrganismos endofiacuteticos satildeo encontrados em muitas espeacutecies de plantas
medicinais A accedilatildeo antimicrobiana de algumas dessas plantas poderiam estar
relacionadas agrave sua comunidade endofiacutetica sugere-se entatildeo que o princiacutepio ativo
antimicrobiano pode ser produzido pelo microrganismo e natildeo propriamente pelo
vegetal ou provavelmente pela interaccedilatildeo planta-hospedeiro
As plantas Aspidosperma tomentosum e Spondias mombin satildeo utilizada no
Brasil devido as suas propriedades antimicrobianas A avaliaccedilatildeo dos metaboacutelitos
10
secundaacuterios produzidos pelo fungo endofiacutetico Phomopsis sp isolado dessas plantas
demonstraram excelentes resultados na inibiccedilatildeo de bacteacuterias fungos filamentosos e
leveduras (CORRADO e RODRIGUES 2004)
Rodrigues Hesse e Werner (2000) avaliaram metaboacutelitos produzidos por fungos
endofiticos isolados de Spondias mombin Guignardia sp apresentaram atividade
contra Escherichia coli Staphylococcus aureus Saccharomyces cerevisiae Geotrichum
sp e Penicillium canadesis Metaboacutelitos de Pestalotiopsis guepinii apresentaram
atividade contra S cerevisiae Os metaboacutelitos produzidos por Phomopsis sp foram
eficientes contra Cladosporium elantum Mycotypha sp e S cerevisiae
Heterosmilax japonica Kunth eacute uma planta medicinal conhecida na China por
seus efeitos diureacuteticos Gao et al (2005) avaliaram a comunidade de fungos endofiacuteticos
e observaram uma grande variedade de fungos colonizando o interior das plantas entre
eles Phomopsis Mycospharella Aureobasidium Cladosporium Glomerella
Botryosphaeria e Guignardia
Plantas do gecircnero Taxus demonstraram atividade anticanceriacutegena assim como
isolados endofiacuteticos dessas plantas O paclitaxel e alguns de seus derivados utilizados
no tratamento de cacircncer satildeo produzidos pelo fungo endofiacutetico Taxus andreanae
isolado da planta medicinal T brevifolia (STROBEL et al 1993 STIERLE et al 1995) e
pelos fungos endofiacuteticos Sporormia minima e Trichothecium sp isolados da planta
medicinal T wallichiana (SHRESTHA et al 2001) A planta medicinal T marei de onde
foi isolado o fungo Tubercularia sp tambeacutem demonstrou atividade anticanceriacutegena
(WANG et al 2000)
O fungo Colletotrichum sp foi isolado como endoacutefito da planta medicinal
Artemisia annua utilizada pelos chineses como uma droga antimalaacuterica produziu
atividade antimicrobiana contra patoacutegenos humanos e de plantas (LU et al 2000) O
fungo endofiacutetico C gloeosporioides da espeacutecie A mongoacutelica sintetiza aacutecido coletoacutetrico
que apresenta atividade antimicrobiana (ZOU et al 2000)
11
34 Endoacutefitos Produtores de Substacircncias Antimicrobianas
A antibiose eacute definida como a interaccedilatildeo entre organismos na qual um ou mais
metaboacutelitos produzidos por um organismo tecircm efeito danoso sobre o outro (BETTIOL e
GHINI 1995) Segundo Melo (1998) muitos fungos e bacteacuterias inibem fitopatoacutegenos
competindo por nutrientes parasitando eou produzindo metaboacutelitos secundaacuterios como
enzimas liacuteticas e antibioacuteticos O resultado dessas interaccedilotildees antagocircnicas tais como
antibiose competiccedilatildeo induccedilatildeo de defesa e parasitismo leva ao controle bioloacutegico de
doenccedilas de plantas assim como pode desenvolver um papel muito importante na
medicina com a descoberta de novos faacutermacos
RODRIGUES HESSE e WERNER (2000) pesquisaram a atividade
antimicrobiana de metaboacutelitos secundaacuterios produzidos por fungos endofiacuteticos de
Spondias mombin (Anacardiaceae) contra actinomicetos bacteacuterias Gram-positivas e
Gram-negativas leveduras e fungos filamentosos e verificaram que os extratos de
Guignardia sp Phomopsis sp e Pestalotiopsis guepinii inibiram o crescimento de
actinomicetos Os extratos de Guignardia sp tambeacutem apresentaram atividade
antimicrobiana contra Escherichia coli Staphylococcus aureus Saccharomyces
cerevisiae Geotrichum sp e Penicillium canadensis Metaboacutelitos de P guepinii foram
ativos contra S cerevisae e os isolados de Phomopsis sp mostraram accedilatildeo antifuacutengica
contra Cladosporium elatum Mycotypha sp e S cerevisae
Liu et al (2001) estudaram a atividade antifuacutengica de fungos endofiacuteticos isolados
de Artemisia annua sobre os fitopatoacutegenos Gaeumannomyces graminis Fusarium
graminearum Rhizoctnia cerealis Phytophthora capsici helminthosporium sativum e
Gerlachia nivalis encontrando isolados com accedilatildeo inibitoacuteria para todos os patoacutegenos Lu
et al (2000) estudando a mesma planta constataram atividade de trecircs novos
metaboacutelitos produzidos pelo fungo Colletotrichum sp apresentando atividade
antifuacutengica contra Bacillus subtilis Sataphylococcus aureus Sarcina lutea
Pseudomonas sp Candida albicans Aspergillus niger e inibiccedilatildeo de crescimento dos
fungos patogecircnicos Gaeumannomyces graminis var tritici Rhizoctonia cerealis
Helminthosporium sativum e Phytophora capisici
12
A Cinnamomum zeylnicum (canela) eacute uma planta utilizada no tratamento de
uacutelceras estomacais hipertensatildeo arterial resfriados e dores abdominais Ezra e Strobel
(2003) isolaram dessa planta o fungo Muscodor albus que apresenta accedilatildeo fungicida
fungistaacutetica bactericida e bacteriostaacutetica por emissatildeo de compostos orgacircnicos volaacuteteis
O mesmo foi relatado para o fungo Gliocladium sp da planta Eucryphia cordifolia
inibindo o crescimento dos fungos fitopatogecircnicos Pythium ultimum e Verticillum dahliae
(STINSON et al 2003)
Citocalasinas satildeo metaboacutelitos fuacutengicos relacionados pela estrutura e atividade
bioloacutegica com capacidade antitumoral e atividade antibioacutetica Estas substacircncias
apresentam efeitos que incluem a inibiccedilatildeo da divisatildeo do citoplasma e dos movimentos
celulares induccedilatildeo do deslocamento nuclear retraccedilatildeo de coaacutegulos e agregaccedilatildeo de
plaquetas transporte de glucose e secreccedilatildeo da tireoacuteide Recentemente trecircs novas
citocalasinas foram relatadas como provenientes do fungo endofiacutetico Rhinocladiella sp
de Tripterygium wilfordii (WAGENAAR et al 2000)
Li e Strobel (2001) purificaram duas ciclohexenonas produzidas pelo fungo
endofiacutetico Pestalotiopsis jesteri isolado da planta Fragraea bodenii (Gentianaceae) a
jesterona e a hidroxil-jesterona das quais a primeira apresentou atividade antifuacutengica
contra o patoacutegeno Pythium ultimum Outro metaboacutelito isoldado de P microspora
isolado endofiticamente da planta Terminalia morobensis a isopestacina
(isobenzofuranona) tambeacutem se mostrou ativo contra Pythium ultimum entre outros
fungos como Sclerotinia sclerotiorum e Rhizoctonia (STROBEL et al 2002)
Adicionalmente a isopestacina apresentou atividade antioxidante contra uma variedade
de radicais livres testados
A Monstera sp eacute uma planta que cresce sobre o tronco de aacutervores dela foi
isolado o endoacutefito Streptomyces sp MSU-2110 na Amazocircnia Peruana Este
actinomiceto produz um peptiacutedeo denominado coronamicina com atividade
antimicrobiana contra o fungo patogecircnico Cryptococcus neoformans e agrave bacteacuteria
Streptococcus pneumoniae mas a melhor atividade foi a demonstrada contra
protozoaacuterio Plasmodium falciparum sugerindo potencialidade como uma droga
13
antimalaacuterica Aleacutem da coronamicina este endoacutefito tambeacutem produz outros compostos
com atividades antifuacutengicas (EZRA et al 2004)
Castillo et al (2002) isolaram e caracterizaram um antibioacutetico de largo espectro
a munumbicina produzida por uma outra linhagem endofiacutetica de Streptomyces
denominada NRRL 30562 isolada da planta medicinal Kennedia nigriscans nativa do
Norte da Austraacutelia O extrato do endoacutefito obtido com solvente orgacircnico foi purificado e
submetido a HPLC (Cromatografia Liacutequida de Alta Eficiecircncia) Os quatro componentes
principais resultantes foram denominados munumbicinas A B C e D Estes compostos
demonstraram em geral atividade contra bacteacuterias Gram positivas como Bacillus
anthracis e Mycobacterium tuberculosis multi-resistente A munumbicina B inibiu
Staphylococcus aureus resistente a meticilina (MRSA) enquanto a munumbicina D
apresentou atividade contra o parasita da malaacuteria Plasmodium falciparum O extrato da
linhagem de Streptomyces foi testado ainda contra vaacuterios patoacutegenos de plantas
apresentando atividade contra Pythium ultimum Phytophthora infestans Sclerotinia
sclerotiorum Erwinia carotovora Cochliobolus carbonum e Penicillium sp mostrando o
grande potencial destas novas substacircncias para a medicina e agricultura
O aacutecido coletotricum produzido pelo fungo Colletotrichum gloeosporioides
(Penz) Penz amp Sacc isolado da planta medicinal Artemiacutesia mongolica apresentou
inibiccedilatildeo do crescimento de Bacillus subtilis Staphylococcus aureus e Sarcina lutea e
atividade antifuacutengica contra o patoacutegeno Helminthosporium sativum (ZOU et al 2000)
Corrado e Rodrigues (2004) observaram a atividade bactericida de linhagens do
fungo endofiacutetico Phomopsis sp isolado das folhas de Aspidosperma tomentosum e
peciacuteolos da planta medicinal Spondias mombin Todos os extratos avaliados inibiram o
crescimento de bacteacuterias fungos filamentosos e leveduras testadas mostrando o
grande potencial deste fungo como fonte de produtos bioativos
Chareprasert et al (2006) isolaram fungos endofiacuteticos de Tectona grandis e de
Samanea saman e testaram sua capacidade antimicrobiana Dentre os isolados
testados Phomopsis foi o gecircnero dominante produzindo substacircncias inibidoras contra
Bacillus subtilis S aureus E coli e Candida albicans
14
Aleacutem da capacidade antimicrobiana fungos endofiacuteticos mostram-se importantes
com um grande potencial antitumoral e com habilidade em inibir enzimas sugerindo
que podem representar uma estimada fonte para uso terapecircutico
Rodrigues et al (2005) verificaram que fungos endofiacuteticos possuem a
capacidade de inibir colinesterase dentre eles linhagens de Phomopsis sp Entretanto
o melhor resultado foi obtido com extratos de Penicillium indicando que estes podem
ter aplicaccedilotildees farmacecircuticas
Huang et al (2001) testaram agrave accedilatildeo de fungos endofiacuteticos isolados de plantas
medicinais frente a outros fungos e tumores Os resultados indicaram que esses fungos
satildeo importantes em medicina como agentes antimicrobianos e antitumorais
Silva et al (2005) isolaram dois novos metaboacutelitos de Phomopsis cassiae
endofiacutetico de Cassia specatabilis as substacircncias 24-diidroxi-56-dimetil benzoato de
etila e phomopsilactona que exibiram forte atividade antifuacutengica contra fitopatoacutegenos
bem como citotoxicidade contra a linhagem celular de tumor cervical humano (HeLa)
Outros fungos como o Gliocladium sp da planta Eucryphia cordifolia tambeacutem possuem
atividade contra fungos fitopatogecircnicos (STINSON et al 2003 STROBEL 2003)
Em 2001 Rodrigues-Heerklotz et al elucidaram a estrutura quiacutemica e a siacutentese
assimeacutetrica de um novo metaboacutelito o aacutecido guignardico produzido pelo fungo endofiacutetico
Guignardia sp isolados de Spondias mombin
Satildeo vaacuterios os relatos de fungos endofiticos produtores de substacircncias
antimicrobianas inclusive isolados de plantas medicinais Esses microrganismos tem
se mostrado como uma fonte promissora de agentes bioativos antitumorais e
antifuacutengicos
35 Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss
A planta Maytenus ilicifolia Mart Ex Reiss pertence agrave classe Magnoliopsida
ordem Celastrales e famiacutelia Celastraceae a qual compreende 50 gecircneros e cerca de
800 espeacutecies (CRONQUIST 1981) Conhecida popularmente nos diferentes paiacuteses da
Ameacuterica do Sul pode receber diferentes denominaccedilotildees congorosa quebrachillo e
15
capororoca na Argentina (GONZALEZ LOMBARDO e VALLARINO 1937) espinheira-
divina cancorosa cancerosa cancrosa sombra-de-touro no Uruguai (SIMOtildeES et al
1986 ALICE et al 1995) coromilho-do-campo e salva-vidas (CARLINI e BRAZ 1988)
espinheira santa espinheira-divina erva-cancrosa e erva-santa (CARVALHO-OKANO
1992) cancorosa-de-Deus limatildeozinho maiteno marteno pau-joseacute salva-vidas
sombra-de-touro no Brasil (BITTENCOURT 2000)
Eacute descrita como uma aacutervore perene de porte arboacutereo-arbustivo encontrada na
mata de clima subtropical e temperado presente em sub-bosques das florestas de
Araucaacuteria nas margens de rios e em regiotildees de estepes Pode se propagar usualmente
por sementes (TAYLOR-ROSA e BARROS 1994) ou estacas de galho Preferindo
climas mais amenos ocorrendo espontaneamente ou por meio de cultivo A colheita
das folhas pode ser feita em qualquer eacutepoca do ano (PANIZZA 1998) Eacute nativa da
Ameacuterica do Sul encontrada no leste da Argentina Paraguai Boliacutevia com menor
intensidade no Chile e Uruguai No Brasil eacute predominante nos estados do Sul
(CARVALHO-OKANO 1992)
Maytenus ilicifolia eacute um arbusto de ocorrecircncia natural da Floresta Ombroacutefila Mista
(Floresta com Araucaacuteria) (BITTENCOURT 2001) Muitas vezes essa planta eacute
encontrada em ambientes ciliares e nos agrupamentos arboacutereos (capotildees) na regiatildeo de
predomiacutenio das estepes (CERVI et al 1989)
Esta planta eacute descrita como um subarbusto ou aacutervore ramificado desde a base
medindo ateacute 50 m de altura Ramos novos glabros angulosos tetra ou multicarenados
Peciacuteolo com 02-05 cm de comprimento A folha apresenta a margem inteira ou com
espinhos em nuacutemero de um a vaacuterios distribuiacutedos regular e irregularmente no bordo
geralmente concentrados na metade apical de um ou de ambos os semilimbos o limbo
com aproximadamente 22 a 89 cm de comprimento e 11 a 30 cm de largura e
nervuras na face abaxial Fruto caacutepsula bivalvar orbicular pericarpo maduro de
coloraccedilatildeo vermelho-alaranjada A presenccedila de disco nectariacutefero eacute um recurso a mais
para atrair os pequenos polinizadores como himenoacutepteros e formigas formando um
conjunto neacutectar-poacutelen interessante para a polinizaccedilatildeo uma vez que as flores satildeo
pequenas brancas e pouco vistosas O florescimento ocorre entre os meses de
16
setembro a outubro enquanto os frutos surgem entre outubro e fevereiro (CARVALHO-
OKANO 1992 RAMDOMSKI 1998 BITTENCOURT 2000)
A fragmentaccedilatildeo da Floresta com araucaacuterias nas uacuteltimas deacutecadas juntamente
com a comprovaccedilatildeo terapecircutica contra males gaacutestricos e o uso em larga escala
causaram grande devastaccedilatildeo de populaccedilotildees naturais de Maytenus ilicifolia
(BITTENCOURT 2001)
351 Componentes quiacutemicos e propriedades terapecircuticas Plantas sempre foram usadas como fonte terapecircutica na medicina tanto em
remeacutedios tradicionais quanto em produtos industrializados A planta Maytenus ilicifolia
Mart eacute geralmente utilizada na medicina popular brasileira As folhas secas desta
planta satildeo usadas como uma infusatildeo para aliviar dores de estocircmago e naacuteuseas e no
tratamento de uacutelceras e gastrites (CAMPAROTO et al 2002) Vaacuterios compostos
isolados de M ilicifolia foram descritos apresentando accedilatildeo antitumoral tambeacutem usado
como analgeacutesico antinflamatoacuterio e antiaacutecido (JORGE 2004)
Esta espeacutecie tem uso popular em comunidades tradicionais e povos indiacutegenas no
Brasil (BITTENCOURT 2001) No Paraguai e Boliacutevia tribos indiacutegenas e populaccedilotildees
rurais a utilizam como substacircncia controladora da fertilidade (CORDEIRO VILEGAS e
LANCcedilAS 1999) e no Paraguai e Argentina eacute usada como contraceptiva e abortiva
(MONTANARI CARVALHO e DOLDER 1998) Citada tambeacutem com uso no tratamento
de febres palustres (MEIRA PENNA 1946) afecccedilotildees pruriginosas cutacircneas
(COIMBRA 1958) dispepsias (CRUZ 1965) Inflamaccedilotildees ulceras e gaacutestricas (JORGE
2004)
As propriedades terapecircuticas de Maytenus ilicifolia foram atribuiacutedas agrave produccedilatildeo
de compostos terpecircnicos como maitenina e pristimerina tanto pelas raiacutezes (LIMA et al
1971 ITOKAWA et al 1991) como em ramos de folhas (JORGE et al 2004) Assim
como fenoacuteis taninos gaacutelicos (CAMPAROTO et al 2002) flavonoacuteides e outros
compostos (SILVA et al 1991 LEITE et al 2001)
17
Jorge et al (2004) avaliaram a eficaacutecia de extratos de M ilicifolia como
antinflamatoacuterio na proteccedilatildeo contra lesotildees gaacutestricas incluindo a cicatrizaccedilatildeo e
citoproteccedilatildeo sugerindo que os extratos de Maytenus ilicifolia podem representar uma
importante alternativa cliacutenica em antinflamatoacuterios e antiulcerogecircnico
Souza-Formigoni et al (1991) avaliaram a potencialidade dos efeitos
antiulcerogecircnicos das folhas de espinheira santa em experimentos realizados em ratos
com ulceras O uso de chaacute tanto por via oral como intraperitoneal mostrou resultados
semelhantes agrave droga cicatrizante cimetidina M ilicifolia assim como outras espeacutecies da
famiacutelia Celastraceae foram investigadas quanto aos seus constituintes de accedilatildeo
citotoacutexica sendo isolados triterpenos aromaacuteticos de accedilatildeo antitumoral Segundo Itokawa
et al (1991 1993) e Shirota et al (1994) os triterpenos satildeo capazes de estimular
fatores atuantes na proteccedilatildeo da mucosa gaacutestrica como a produccedilatildeo de muco e
prostaglandinas
A cimetidina eacute um potente agente na supressatildeo de aacutecido gaacutestrico e pepsina ela
age como antagonista competitivo da histamina nos receptores H2 das ceacutelulas parietais
gaacutestricas produtoras de aacutecido dessa forma bloqueia a secreccedilatildeo aacutecida (SOUZA-
FORMIGONI et al 1991) Ferreira et al (2004) investigaram o efeito e possiacutevel
mecanismo de accedilatildeo do extrato aquoso liofilizado de M ilicifolia sobre a secreccedilatildeo de
aacutecidos em mucosa gaacutestrica de sapos Foi observada uma reduccedilatildeo de 16 da secreccedilatildeo
aacutecida sugerindo os autores que essa reduccedilatildeo ocorra devido a uma atividade
antagoniacutestica dos extratos nos receptores de H2 de histidina
Montanari Carvalho e Dolder (1998) analisaram os efeitos de extratos
etanoacutelicos de M ilicifolia na espermatogecircnese de camundongos e natildeo encontraram
qualquer defeito ou distuacuterbio Poreacutem Montanari e Bevilacqua (2002) em estudos com
fecircmeas de ratos constataram uma diminuiccedilatildeo significativa na implantaccedilatildeo dos embriotildees
com a utilizaccedilatildeo de extrato liofilizado das folhas
18
352 Endoacutefitos isolados de Maytenus ilicifolia
Pileggi (2006) isolou microrganismos endofiacuteticos de folhas peciacuteolos e sementes
de Maytenus ilicifolia e investigou o potencial farmacoloacutegico dos mesmos Foram
isolados em maior frequumlecircncia os fungos Alternaria sp Colletotricum sp Bipolaris sp
Phyllosticta sp e Cladosporium sp Entre os fungos e bacteacuterias testados 15
apresentaram potencial para o controle bioloacutegico Na anaacutelise de caracterizaccedilatildeo
morfoloacutegica por RAPD foi sugerida a presenccedila de duas espeacutecies de Coletotricum
isolados de Maytenus ilicifolia
Figueiredo (2006) isolou de Maytenus ilicifolia fungos endofiacuteticos e os avaliou
quanto ao potencial antimicrobiano contra bacteacuterias patogecircnicas em humanos e o fungo
fitopatogecircnico Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta do Citros Os
extratos metanoacutelicos de dois isolados exibiram accedilatildeo fungistaacutetica na germinaccedilatildeo e no
crescimento micelial de G citricarpa Dois extratos de Pestalotiopsis sp inibiram o
crescimento dos microrganismos-teste (S aureus oxalino resistente Klebsiella
pneumoniae Micrococcus luteus Staphylococcus aureus e Escherichia coli)
Bacteacuterias com potencial anti-leucemico foram isoladas de Maytenus essas
bacteacuterias interagem com as plantas na produccedilatildeo de alguns metaboacutelitos como a
maytensina substancia que tambeacutem apresenta propriedades antifuacutengicas
Azevedo et al (2000) relataram a presenccedila de bacteacuterias endofiacuteticas em folhas de
Maytenus aquifolium Foram isolados vinte gecircneros os mais frequumlentes foram Bacillus
Clavibacter e Streptomyces aleacutem de actinomicetos Testes preliminares mostraram que
algumas das bacteacuterias podem produzir ansamacroliacutedeos que tambeacutem satildeo produzidos
pela planta hospedeira
36 Guignardia citricarpa Kiely e a Mancha preta do citros
O gecircnero Guignardia foi descrito em 1982 por Viala e Ravaz e compreende as
formas teleomoacuterficas de espeacutecies de Phyllosticta e de alguns outros gecircneros
19
relacionados de fungos imperfeitos geralmente saproacutefitas ou semiparasitas de folhas
(SIVANESAN 1984)
Diversos autores isolaram espeacutecies de Phyllosticta de plantas aparentemente
sadias descrevendo-as como endofiacuteticas (CARROLL e CARROLL 1978 PETRINI
1986 LEUCHTMANN et al 1992 GLIENKE 1995 PENNA 2000) No entanto existe
um grande nuacutemero de relatos citando este gecircnero como fitopatogecircnico de diversas
culturas com grande importacircncia econocircmica como arroz (SUGHA SINGH E SHARMA
1986) cana-de-accediluacutecar (PONS 1990) tabaco (PATEL et al 1988) e eucalipto (CROUS
et al 1993) e tambeacutem frutiacuteferas como abacate e tomate (BAKER 1938) manga e
mamatildeo (McMILLAN JR 1986) uva (IBRAHIM e BAYCA 1989) e principalmente em
citros (McONIE 1964a 1964b HERBERT e GRECH 1985 JOHNSTON e
FULLERTON 1988)
O fungo Guignardia citricarpa Kiely (anamorfo Phyllosticta citricarpa (McALP)
Van Der Aa) eacute um Ascomiceto da ordem Dothideales famiacutelia Dothideaceae Possui
estroma plectenquimatoso pseudoteacutecio globoso a subgloboso medindo 125 a 360 μm
de diacircmetro contendo um poro de 14 a 16 μm e paredes espessas com 20 a 22 μm
Seu asco apresenta forma de clava arredondado na extremidade superior e eacute
bitunicado Conteacutem oito ascoacutesporos unicelulares hialinos ligeiramente cinzentos
romboacuteides contendo gracircnulos e um grande vacuacuteolo central Os ascoacutesporos satildeo
cobertos com um quepe gelatinoso nas extremidades Segundo Sivanesam (1984)
pseudoparaacutefises satildeo encontradas em pseudoteacutecios maduros De acordo com Johnston
e Fullerton (1988) as formas anamorfas e teleomorfa geralmente satildeo encontradas
associadas
As estruturas de frutificaccedilatildeo satildeo os picniacutedios que macroscopicamente satildeo
pequenos globosos pretos e semi-eruptivos A fase sexuada corresponde agrave produccedilatildeo
de ascoacutesporos os quais se encontram em nuacutemero de oito no interior dos ascos Estes
apresentam forma de clava satildeo arredondados na extremidade superior e bitunicados
Os ascoacutesporos satildeo unicelulares hialinos levemente acinzentados romboacuteides
contendo gracircnulos e um grande vacuacuteolo central cobertos com um quepe gelatinoso nas
extremidades (SIVANESAN 1984)
20
Fialho (2004) avaliou in vitro o potencial de linhagens de S cerevisiae como
agentes no controle bioloacutegico contra G citricarpa nos frutos poacutes-colheita Rodrigues
(2006) avaliou o efeito dos principais fungicidas utilizados no campo para o controle da
doenccedila Tambeacutem avaliou 96 linhagens de fungos para a seleccedilatildeo de potenciais agentes
no controle bioloacutegico demonstrando que algumas espeacutecies de Trichoderma satildeo
capazes de atuar in vitro como biocontroladores do fitopatoacutegeno G citricarpa
Cardoso-Filho (2003) avaliou o uso de indutores de resistecircncia Saccharomyces
cerevisiae Bionreg e aacutecido saliciacutelico ao fitopatoacutegeno G citricarpa O autor destaca que os
compostos presentes no albedo (mesocarpo) da laranja como a celulose carboidratos
soluacuteveis pectinas compostos fenoacutelicos (flavonoacuteides) aminoaacutecidos e vitaminas podem
exibir a accedilatildeo antimicrobiana para o controle da MPC Neste contexto ele avaliou os
extratos produzidos pelo albedo da laranja e comprovou accedilatildeo fungicida ou fungistaacutetica
inibindo a germinaccedilatildeo esporulaccedilatildeo e crescimento micelial in vitro de G citricarpa
Blanco (1999) e Christo (2002) observaram esta variabilidade entre linhagens
isoladas de lesatildeo de Mancha Preta de Citros (MPC) ou seja linhagens de G citricarpa
utilizando dados de RAPD Esta variabilidade tambeacutem foi evidenciada em linhagens
isoladas em plantas assintomaacuteticas atualmente descritas como Guignardia mangiferae
(GLIENKE-BLANCO et al 2002 CHRISTO 2002 BAAYEN et al 2002 OKANI
NAKAGIRI e ITO 2001 RODRIGUES et al 2004)
Em 1999 Glienke-Blanco comparou geneticamente por meio de marcadores de
RAPD linhagens de populaccedilotildees patogecircnicas e endofiacuteticas de Guignardia sp de
diversas regiotildees e hospedeiros constatando a existecircncia de trecircs populaccedilotildees de
Guignardia geneticamente muito diferentes coexistindo em citros sendo duas
endofiacuteticas e uma patogecircnica sugerindo que talvez estas trecircs populaccedilotildees pudessem
pertencer a espeacutecies distintas O desenvolvimento de um par de oligonucleotiacutedeos
capaz de amplificar um fragmento de 370 pb especiacutefico para linhagens patogecircnicas de
G citricarpa veio a corroborar para distinccedilatildeo geneacutetica entre estes grupos (GLIENKE et
al 2007)
21
361 Mancha Preta do Citros
A doenccedila mancha preta dos citros (MPC) foi descrita na Austraacutelia em 1985 por
Kiely posteriormente na Aacutefrica do Sul como consequumlecircncia da importaccedilatildeo de mudas da
Austraacutelia Atualmente estaacute distribuiacuteda em regiotildees subtropicais do mundo entre elas o
Brasil (GOacuteES et al 2005)
O ciclo da doenccedila (MPC) inicia-se com a disseminaccedilatildeo dos coniacutedios ou
picnidioacutesporos (esporos assexuais) e ascoacutesporos (esporos sexuais) do fungo
Guignardia citricarpa Os coniacutedios (picnidioacutesporos) satildeo responsaacuteveis pelas infecccedilotildees agrave
curta distacircncia e estatildeo localizados no interior dos picniacutedios oriundos dos frutos
infectados Um agregado de coniacutedios emerge atraveacutes da abertura do picniacutedio (ostiacuteolo)
dissolve-se na aacutegua da chuva orvalho ou irrigaccedilatildeo e cai sobre os pequenos frutos
susceptiacuteveis que se formam apoacutes as floradas Jaacute os ascoacutesporos satildeo responsaacuteveis pela
disseminaccedilatildeo agrave curta e longa distacircncia pois satildeo lanccedilados dos periteacutecios que se
formam em folhas caiacutedas ao solo e satildeo levados por correntes aeacutereas infectando
pequenos frutos susceptiacuteveis (ROBES 1990)
Em estudo epidemioloacutegico da MPC Spoacutesito et al (2008) analisou 27270 frutos
colhidos de 303 aacutervores quanto agrave incidecircncia da doenccedila (porcentagem de frutos doentes
por aacutervore) e quanto agrave severidade da doenccedila (aacuterea com sintoma do fruto) O autor
encontrou frutos doentes em 251 aacutervores das 303 analisadas (83) com diferentes
niacuteveis de incidecircncia Algumas aacutervores tinham a maioria das frutas com lesotildees
agregadas e de alta gravidade enquanto outras tinham a maioria das frutas com
poucas lesotildees e baixa gravidade Segundo os autores quando o agente patogecircnico eacute
disperso pela aacutegua da chuva esta pode transportar muitos esporos de uma vez
formando uma lesatildeo O padratildeo de sintomas resultantes a partir deste tipo de dispersatildeo
eacute tipicamente agregada Os autores concluiacuteram que os ascoacutesporos satildeo os mais
importantes inoacuteculos de G citricarpa
A MPC caracteriza-se por apresentar lesotildees com bordas salientes e com
depressatildeo no centro onde se observam pequenos pontos pretos os picniacutedios As
lesotildees podem atingir os frutos maduros ou no iniacutecio de maturaccedilatildeo podendo aparecer
22
apoacutes a colheita no transporte e armazenamento (ROBES et al 1995) A MPC afeta
apenas a casca do fruto e o flavedo (epicarpo) sem causar dano internamente limitado
pelo albedo (mesocarpo) Poreacutem sua comercializaccedilatildeo no mercado de frutas eacute
prejudicada assim como a sua exportaccedilatildeo devido agrave barreira fitossanitaacuteria existente na
Uniatildeo Europeacuteia por ser uma doenccedila quarentenaacuteria A1 Nos casos em que a doenccedila
atinge o pedicelo do fruto pode ocorrer agrave queda prematura do fruto aumentando as
perdas na produccedilatildeo e ateacute limitando seriamente a citricultura em vaacuterios estados
brasileiros (GOacuteES et al 2005 ROBES et al 1995)
Em funccedilatildeo dos prejuiacutezos causados por G citricarpa na comercializaccedilatildeo de
frutos in natura principalmente no mercado externo satildeo crescentes os estudos que
datildeo ecircnfase ao controle bioloacutegico da doenccedila
37 O Gecircnero Phomopsis sp
O gecircnero Phomopsis descrito em 1905 por (Sacc) Bubak (RIEDL 1981) forma
picniacutedios escuros com ostiacuteolo normalmente em forma de pecircra conidioacuteforos simples
alfa coniacutedios hialinos com gotas nas extremidades predominantemente elipsoacuteides sem
septos unicelulares de forma ovoacuteide Apresenta tambeacutem beta coniacutedios hialinos sem
gotas filiformes a maioria curvos em uma das extremidades sem septos (HANLIN e
MENEZES 1996)
Outra caracteriacutestica dos fungos do gecircnero Phomopsis eacute a formaccedilatildeo de linhas
negras estreitas em tecidos de plantas contaminadas assim como no meio de cultura
em que satildeo repicados (BRAYFORD 1990)
O gecircnero Phomopsis pertence ao filo Ascomycota subfilo Pezizomycotin classe
Sordariomycetes subclasse Sordariomycetidae ordem Diaporthales famiacutelia Valsaceae
mitosporic Valsaceae Apresenta-se na forma anamoacuterfica o seu teleomorfo eacute o
Diaporthe cujo habitat eacute o caule de plantas lenhosas e herbaacuteceas (HANLIN e
MENEZES 1996)
Espeacutecies de Phomopsis satildeo comumente encontradas como patoacutegenos e
endoacutefitos de plantas (BODDY e GRIFFITH 1989) Tradicionalmente o gecircnero tem sido
23
considerado altamente patogecircnico (REHNER e UECKER 1994) mas algumas
espeacutecies de Phomopsis satildeo entretanto endoacutefitos mutualiacutesticos (WEBBER e GIBBS
1984 CARROLL 1986)
Espeacutecie de Phomopsis e Diaporthe tecircm sido tradicionalmente descritos com
base na espeacutecie hospedeira Poreacutem algumas espeacutecies e isolados podem infectar mais
de um hospedeiro (BRAYFORD 1990 FARR CASTLEBURY e ROSSMAN 2002) tal
estrateacutegia tem sido frequentemente questionada (REHNER e UECKER 1994)
Trabalhos incluindo estudos de cruzamentos mostraram que esse criteacuterio natildeo eacute
suficiente para classificaccedilatildeo ao niacutevel de espeacutecie Aleacutem disso isolados de Phomopsis
provenientes do mesmo hospedeiro natildeo necessariamente pertencem agrave mesma espeacutecie
assim como uma mesma espeacutecie de Phomopsis pode infectar diferentes hospedeiros
(REHNER e UECKER 1994)
Foram descritas mais de 1000 espeacutecies do gecircnero Phomopsis baseado
principalmente na associaccedilatildeo com o hospedeiro (UECKER 1988) Embora o
hospedeiro seja atualmente considerado menos importante na definiccedilatildeo de espeacutecies
nenhuma revisatildeo do gecircnero foi realizada A fase teleomoacuterfica (Diaporthe) foi descrita
apenas para aproximadamente 20 das espeacutecies do gecircnero Phomopsis (PHILLIPS
2006) Essa ausecircncia da fase teleomorfica (Diaporthe) em meio de cultura
(principalmente quando isolado endofiticamente) torna a identificaccedilatildeo ao niacutevel de
espeacutecie neste gecircnero muito difiacutecil (REHNER e UECKER 1994)
Wehmeyer (1933) elaborou uma revisatildeo do gecircnero Diaporthe o autor
considerou a associaccedilatildeo com o hospedeiro uma caracteriacutestica de menor importacircncia
tendo reduzido de 650 para 70 o nuacutemero de espeacutecies no gecircnero No entanto este
estudo baseou-se unicamente em caracteriacutesticas morfoloacutegicas do teleomorfo natildeo tendo
sido consideradas as caracteriacutesticas do anamorfo
A delimitaccedilatildeo de espeacutecies de Phomopsis baseado apenas em caracteriacutesticas
morfoloacutegicas demonstrou-se inadequada (VAN DER AA 1990) Em adiccedilatildeo as
caracteriacutesticas de morfologia do coniacutedio e caracteriacutesticas da colocircnia usadas para
identificar espeacutecies alguns autores tecircm utilizado caracteres alternativos que incluem
virulecircncia (VIDIC 1991) proteiacutenas e sorologia (LEE e SNOW 1992 VELICHETI et al
24
1991) sequumlecircncias ITS (ZHANG et al 1998) e enzimas e metaboacutelitos secundaacuterios
(SHIVAS ALLEN e WILLIAMSON 1991) Infelizmente nenhum caraacuteter foi aplicaacutevel
para distinguir todos os grupos de isolados (REHNER e UECKER 1994)
O entendimento sobre o gecircnero expandiu-se por meio de estudos de sequumlecircncias
ITS nos quais alguns dos isolados agruparam-se por regiotildees geograacuteficas (REHNER e
UECKER 1994) Alguns trabalhos tecircm comparado dados morfoloacutegicos com dados
moleculares principalmente o uso de sequumlecircncias da regiatildeo ITS do DNA ribossomal
Zhang et al (1998) destingiu cinco taacutexons de Phomopsis isolados de Soja (Glycine
max) utilizando sequumlecircncias da regiatildeo ITS do DNA ribossomal poreacutem natildeo foram
capazes de diferenciar-los com base nas caracteriacutesticas morfoloacutegicas Farr et al (2002)
caracterizaram por anaacutelise molecular com o uso de sequumlecircncias ITS1 58S ITS2 e por
caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de Phomopsis sp isolados de Vaccinium
corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse estudo verificaram que a maioria dos
isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma vez que as sequumlecircncias agruparam-se
com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
Castlebury e Mengistu (2006) avaliaram Phomopsis isolados de soja e outros
hospedeiros combinando dados de sequumlecircncias de ITS do DNA ribossomal o
sequumlenciamento do gene EF1-alpha e genes de actina seis grupos de Phomopsis
foram formados desses trecircs correspondem aos taacutexons P longicolla Diaporthe
melonis e D phaseolorum Os autores concluiacuteram entatildeo que agrave ausecircncia de distinccedilatildeo
morfoloacutegica e informaccedilatildeo bioloacutegica torna problemaacutetica a identificaccedilatildeo de espeacutecies aos
grupos de isolados geneticamente distintos Aleacutem disso natildeo estaacute esclarecida a
importacircncia bioloacutegica e geneacutetica dos diferentes grupos e trabalhos adicionais quanto
aos hospedeiros patogenicidade e morfologia satildeo necessaacuterios para resolver a distinccedilatildeo
de espeacutecies neste gecircnero
O gecircnero Phomopsis eacute um importante grupo de fungos com potencial
biotecnoloacutegico devido agrave produccedilatildeo de importantes metaboacutelitos secundaacuterios entre os
quais se incluem o micotoxinas que afeta o sistema nervoso de vertebrados (BILLS et
al 2002) alcaloacuteides com capacidades farmacoloacutegicas tais como phomopsins
(COCKRUM PETTERSON e EDGAR 1994) e 24-diidroxi-56-dimetil benzoato de etila
25
e phomopsilactona produzidos por Phomopsis cassiae endofiacutetico de Cassia
specatabilis (SILVA et al 2005)
38 Marcadores Moleculares
A variabilidade geneacutetica em microrganismos pode ser detectada por teacutecnicas
claacutessicas ou moleculares As teacutecnicas claacutessicas baseiam-se na anaacutelise de fenoacutetipos a
partir da caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica (produccedilatildeo de coniacutedios crescimento radial da
colocircnia) ou bioquiacutemica (produccedilatildeo de substacircncias auxotrofias) restringindo a
possibilidade de se conduzir estudos populacionais e muitas vezes de sistemaacutetica As
teacutecnicas moleculares por sua vez fornecem ferramentas para evidenciar e entender
melhor diversos aspectos relacionados direta ou indiretamente com o DNA Desta
forma a anaacutelise dos aacutecidos nucleacuteicos vem sendo amplamente utilizada na diferenciaccedilatildeo
de organismos e no esclarecimento taxonocircmico e filogeneacutetico dos organismos
estudados
Os diversos meacutetodos de detecccedilatildeo de polimorfismo geneacutetico diretamente ao niacutevel
de aacutecidos nucleacuteicos tecircm permitido a anaacutelise molecular da variabilidade do DNA
determinando pontos de referecircncia nos cromossomos tecnicamente denominados
ldquomarcadores molecularesrdquo Por marcador molecular define-se todo e qualquer fenoacutetipo
molecular oriundo de um gene expresso ou de um segmento especiacutefico de DNA
(GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Os dados moleculares frequumlentemente complementam e corroboram hipoacuteteses
baseadas em estudos morfoloacutegicos embora algumas vezes os resultados obtidos da
anaacutelise de DNA sejam conflitantes com dados de anaacutelise exclusivamente feneacuteticas
Esta contradiccedilatildeo pode ser observada principalmente na classificaccedilatildeo taxonocircmica de
microrganismos (SAMUELES e SEIFERT 1995)
Algumas teacutecnicas moleculares utilizadas principalmente em fungos para a
detecccedilatildeo do polimorfismo geneacutetico de sequumlecircncias de DNA satildeo Eletroforese em Campo
Pulsado (PFGE) Polimorfismos dos fragmentos de Restriccedilatildeo (RFLPs) Polimorfismos
26
do DNA Amplificados ao Acaso (RAPDs) Sequumlenciamento das Regiotildees Internas
Transcritas (ITS1 e ITS2) do DNA ribossocircmico (rDNA)
Aleacutem de avaliarem a variabilidade geneacutetica estes marcadores moleculares
podem determinar relaccedilotildees filogeneacuteticas como tambeacutem colaborar na identificaccedilatildeo de
um determinado isolado Tais marcadores podem ser gerados independentemente do
fenoacutetipo e revelar polimorfismos altamente informativos em sequumlecircncias de DNA
A teacutecnica de RFLP surgiu a partir da descoberta de que os siacutetios para enzimas
de restriccedilatildeo poderiam ser polimoacuterficos ou seja alteraccedilotildees em um uacutenico par de bases
que muitas vezes satildeo neutras poderiam ser detectadas pela presenccedila ou ausecircncia
destes siacutetios para endonucleases Esta teacutecnica propiciou a introduccedilatildeo de um elevado
nuacutemero de marcadores moleculares nas anaacutelises de variabilidade geneacutetica (ALBERTS
et al 2004) Dentre as inuacutemeras aplicaccedilotildees dos marcadores RFLP pode-se citar o
estudo da evoluccedilatildeo dos genomas a identificaccedilatildeo de genes especiacuteficos o estudo de
geneacutetica de populaccedilotildees a taxonomia e obtenccedilatildeo de mapas geneacuteticos (MICHELEMORE
e HULBERT 1987) Entretanto seu uso torna-se limitado pois eacute necessaacuterio DNA de
alta qualidade e em grande quantidade (GLIENKE 1995)
O uso do DNA ribossomal (rDNA) como marcador molecular tambeacutem pode ser
empregado na anaacutelise da variabilidade geneacutetica para uma ampla faixa de niacuteveis
taxonocircmicos As sequumlecircncias codificantes do rDNA evoluem muito lentamente e satildeo
altamente conservadas possibilitando a sua utilizaccedilatildeo em estudos com organismos
pouco relacionados taxonomicamente Ao contraacuterio do rDNA as regiotildees espaccediladoras
internas destes genes conhecidas como ITS evoluem rapidamente apresentando alto
polimorfismo e sendo desta forma de grande interesse nos estudos filogeneacuteticos de
gecircneros espeacutecies e populaccedilotildees (WHITE e MORROW 1990)
A reaccedilatildeo em cadeia da polimerase (PCR) tornou-se uma das mais importantes e
utilizadas teacutecnicas em Biologia Molecular por apresentar rapidez baixo custo e
capacidade de amplificaccedilatildeo de pequenas quantidades de DNA (MULLIS e FALOONA
1987 WHITE e MORROW 1989)
Concebida por KARY MULLIS em meados da deacutecada de 80 a teacutecnica baseia-se
em amplificar fragmentos de sequumlecircncias de DNA com alta especificidade e fidelidade
27
utilizando oligonucleotiacutedeos especiacuteficos ou natildeo Tais oligonucleotiacutedeos delimitam a
sequumlecircncia de DNA gerando um sinal molecular que pode ser amplificado (MULLIS e
FALOONA 1987 WHITE e MORROW 1989 McPHERSON QUIRKE e TAYLOR
1991 GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
A PCR consiste em uma teacutecnica in vitro capaz de produzir muacuteltiplas coacutepias de
sequumlecircncias especificas de DNA Alterando-se as condiccedilotildees de reaccedilatildeo pode-se
amplificar cadeias simples de DNA detectar e distinguir entre genes portadores de
mutaccedilatildeo em uma uacutenica base ou proporcionar quantidades suficientes de DNA para
anaacutelise eou manipulaccedilatildeo subsequumlente (WALKER e RAPLEY 1999)
Uma das limitaccedilotildees da teacutecnica PCR eacute a necessidade do conhecimento preacutevio da
sequumlecircncia que flanqueia o segmento a ser amplificado para que os oligonucleotiacutedeos
possam ser construiacutedos (WATSON et al 1992 ALBERTS et al 2004) A teacutecnica de
RAPD entretanto natildeo apresenta este obstaacuteculo pois segundo Williams et al (1990)
esta teacutecnica baseia-se na amplificaccedilatildeo de segmentos de DNA por um uacutenico
oligonucleotiacutedeo de sequumlecircncia arbitraacuteria que amplifica vaacuterias regiotildees simultaneamente
381 Marcadores RAPD
O RAPD (polimorfismo do DNA amplificado ao acaso) envolve a utilizaccedilatildeo de
oligonucleotiacutedeos de sequumlecircncia arbitraacuteria que amplificam vaacuterias regiotildees do genoma
simultaneamente (WILLIAMS et al 1990 WELSH E MCCLELLAND 1990
VILARINHOS et al 1995 FUNGARO et al 1996 ALZATE-MARIN et al 1997
ABBASI et al 1999 PAAVANEM-HUHTALA AVIKAINEM e YLI-MATTILA 2000)
Dessa forma natildeo eacute necessaacuterio o desenvolvimento preacutevio de uma biblioteca de sondas
especiacuteficas para o organismo de interesse
A teacutecnica de RAPD utiliza o mesmo princiacutepio da PCR (SAIKI et al 1985) A
principal diferenccedila entre a PCR usual e o RAPD estaacute na reaccedilatildeo de amplificaccedilatildeo que
utiliza apenas um uacutenico oligonucleotiacutedeo com sequumlecircncia arbitraacuteria de 10 a 15 bases A
amplificaccedilatildeo somente ocorre se este oligonucleotiacutedeo for complementar a um siacutetio em
uma das fitas e complementar a um mesmo siacutetio (orientaccedilatildeo invertida) na outra fita de
28
DNA (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998) Segundo Williams et al (1993) o tamanho
ideal do oligonucleotiacutedeo para amplificaccedilatildeo de RAPD eacute em torno de dez bases
devendo seu conteuacutedo GC ser em torno de 50 a 70 e no miacutenimo de 40 Aleacutem disso
os oligonucleotiacutedeos natildeo devem conter sequumlecircncias palindrocircmicas a fim de evitar o
autopareamento
Os marcadores RAPD tecircm sido amplamente utilizados para o estudo de diversos
grupos de seres vivos A partir dos marcadores moleculares clonados e sequumlenciados
haacute a possibilidade de sintetizar oligonucleotiacutedeos especiacuteficos aumentando o seu poder
de resoluccedilatildeo (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Esses marcadores permitem caracterizar e avaliar o grau de similaridade
geneacutetica entre genoacutetipos em niacuteveis inter e intraespeciacuteficos sendo altamente sensiacuteveis
quanto diferenccedilas de ateacute um uacutenico nucleotiacutedeo entre o oligonucleotiacutedeo e o DNA molde
Permitem ainda analisar a estrutura geneacutetica de populaccedilotildees naturais populaccedilotildees de
melhoramento e bancos de germoplasma a construccedilatildeo de mapas geneacuteticos de alta
cobertura genocircmica a localizaccedilatildeo de genes de interesse econocircmico e ainda a
obtenccedilatildeo de novos marcadores para diagnoacutesticos via PCR (FUNGARO e VIEIRA 1998
FUNGARO 2000 GLIENKE-BLANCO et al 2002 ANCHORENA-MATIENZO 2002)
Diferentes niacuteveis taxonocircmicos podem ser inferidos atraveacutes de marcadores
RAPD cujos padrotildees podem apresentar-se como variaacuteveis quando polimoacuterficos e
constantes quando natildeo-polimoacuterficos
Avaliando a variabilidade geneacutetica de organismos geneticamente relacionados
diversos autores confrontaram resultados obtidos a partir de anaacutelises moleculares ao
niacutevel de proteiacutenas com os dados obtidos a partir de marcadores moleculares de DNA
Meijer Megnegneau e Linders (1994) estudando linhagens de Phomopsis subordinaria
isoladas de 23 localidades diferentes chegaram a resultados conflitantes obtidos por
RAPD e isoenzimas Os marcadores de RAPD mostraram alta similaridade entre 47
linhagens de P subordinaria isoladas de oito localidades diferentes enquanto a anaacutelise
por isoenzimas sugeriu que todas as linhagens eram idecircnticas
Jaacute Pioli et al (2003) caracterizaram por RAPD isolados do complexo
DiaporthePhomopsis coletados de soja na Argentina Eles foram separados em quatro
29
grupos (i) Diaporthe phaseolorum variedade meridionalis (ii) D phaseolorum variedade
caulivora (iii) D phaseolorum variedade sojae and (iv) Phomopsis longicolla revelando
a existecircncia de variabilidade entre isolados da mesma variedade
Fernandez e Hanlin (1996) obtiveram resultados concordantes entre a anaacutelise
molecular por RAPD e as caracteriacutesticas morfoculturais separando os isolados
coletados de soja em dois grupos Diaporthe phaseolorum e Phomopsis longicolla
Os marcadores de RAPD tambeacutem podem ser usados na anaacutelise de
recombinantes obtidos por parameiose em Beauveria bassiana (DALZOTO et al 2003)
A teacutecnica RAPD tambeacutem eacute utilizada como um meacutetodo eficiente na diferenciaccedilatildeo
de microrganismos patogecircnicos e natildeo patogecircnicos Guthirie et al (1992) e Vasconcelos
(1994) caracterizaram diferentes espeacutecies do gecircnero Colletotrichum diferenciando-as
quanto agrave sua patogenicidade
Grajal-Martin Simon e Muehlbauer (1993) conseguiram diferenciar o tipo 2 de
Fusarium oxysporum f sp pisi de trecircs outros grupos por marcadores RAPDs Da
mesma maneira isolados patogecircnicos de Fusarium oxysporum f sp dianthi que
atacam cravos puderam ser distinguidas de vaacuterios natildeo patogecircnicos por marcadores
RAPD (MANULIS et al 1993)
Blanco (1999) utilizando seis oligonucleotiacutedeos de RAPD confirmou a existecircncia
de trecircs populaccedilotildees distintas de Guignardia citricarpa coexistindo em citros sendo duas
endofiacuteticas e uma patogecircnica responsaacutevel pelas lesotildees da mancha preta nos citros
Glienke-Blanco et al (2002) utilizando sete oligonucleotiacutedeos de RAPD encontraram
alta variabilidade geneacutetica em linhagens endofiacuteticas de Guignardia citricarpa isoladas
de plantas assintomaacuteticas de citros
382 Marcadores ITS
O DNA ribossocircmico contido nas regiotildees organizadoras de nucleacuteolos (NOR) tem
sido objeto de um grande nuacutemero de estudos com diversas aplicaccedilotildees em geneacutetica
evoluccedilatildeo e melhoramento Tal interesse estaacute diretamente relacionado agrave estrutura
destas regiotildees que se encontram em locais especiacuteficos do genoma e repetidos em
30
sequumlecircncia inuacutemeras vezes A funccedilatildeo do rDNA eacute codificar as diferentes moleacuteculas de
RNA ribossocircmico (GRATTAPAGLIA e FERREIRA 1998)
Segundo White et al (1990) as regiotildees espaccediladoras internas do DNA
ribossomal (ITS) evoluem rapidamente apresentando alto polimorfismo ao contraacuterio
do rDNA e sendo assim essas regiotildees satildeo de grande interesse nos estudos
filogeneacuteticos em niacuteveis de gecircnero espeacutecies e populaccedilotildees Esta caracteriacutestica permite
ainda a sua utilizaccedilatildeo na obtenccedilatildeo de polimorfismos de comprimento de fragmentos
(RFLP) nos loci de rDNA O nuacutemero de coacutepias de uma determinada sequumlecircncia de
rDNA e variaccedilotildees de nucleotiacutedeos nestas sequumlecircncias tambeacutem tecircm sido utilizados em
tais estudos (FERREIRA 1994)
Orsquodonnell e Gray (1995) avaliaram a relaccedilatildeo filogeneacutetica e a variaccedilatildeo geneacutetica
dentro de 24 isolados do complexo Fusarium solani por meio da sequecircncia de rDNA e
marcador RFLP e concluiacuteram que esta espeacutecie eacute formada por espeacutecies filogeneacuteticas
distintas Utilizando a mesma teacutecnica Ouellet e Seiffert (1993) diferenciaram F
graminearum de outras 11 espeacutecies que atacam trigo aleacutem de terem permitido a
identificaccedilatildeo de diversas raccedilas desta espeacutecie provenientes de isolados
morfologicamente semelhantes
Jasalavich Ostrofskf e Jellison (2000) utilizaram os oligonucleotiacutedeos ITS1 e
ITS4 (especiacutefico para basidiomicetos) na identificaccedilatildeo de microrganismos A
amplificaccedilatildeo da regiatildeo ITS1-58S-ITS2 detectou a presenccedila de basidiomicetos em
diferentes amostras Testes complementares foram realizados no produto da
amplificaccedilatildeo por meio da teacutecnica de RFLP permitindo a identificaccedilatildeo de espeacutecie
Satoko et al (2000) e Promputtha et al (2005) utilizaram a regiatildeo ITS1 58S e
ITS2 do rDNA para identificar fungos endofiacuteticos que natildeo esporularam sendo relatados
como Phomopsis e Diaporthe (anamoacuterfico Phomopsis)
Farr Castlebury e Rossman (2002) caracterizaram por anaacutelise molecular com o
uso de sequumlecircncias ITS1 58S ITS2 e por caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de
Phomopsis sp isolados de Vaccinium corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse
estudo verificaram que a maioria dos isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma
vez que as sequumlecircncias agruparam-se com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
31
Mostert et al (2001) tambeacutem usaram anaacutelise filogeneacutetica das regiotildees 58S ITS1
e ITS2 e DNA mitocondrial para elucidar a taxonomia de espeacutecies de Phomopsis
obtidas de vinhedos Eles observaram que os fungos endofiacuteticos tratavam-se de
Diaporthe perjuncta e Phomopsis sp taacutexon 1 Jaacute os isolados patogecircnicos e com alta
virulecircncia pertenciam a espeacutecie Phomopsis viticola assim como os isolados descritos
em estudos anteriores como Phomopsis taacutexon 2 Eles tambeacutem puderam elucidar que
os isolados descritos na Austraacutelia como Phomopsis taacutexon 4 tratavam-se de Libertella
sp excluindo-o do complexo P viticola
Djaouida et al (2004) sequenciaram as regiotildees ITS1 58S e ITS2 e do gene
mitocondrial atp6 para avaliar a diversidade molecular de linhagens patogecircnicas contra
o girassol de Diaporthe helianthi (anamoacuterfico Phomopsis helianthi) isolados de
diferentes origens geograacuteficas
32
4 MATERIAL E MEacuteTODOS 41 Material Bioloacutegico 411 Fungos endofiacuteticos
Quarenta e oito isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp e um de Diaporthe sp
foram utilizados neste estudo (TABELA 1) Destes oito foram cedidos cordialmente pela
Dra Kaacutetia Rodriguez e foram isolados de Spondias mombin (Cajazeiro) Myracrodruon
urundeuva (Aroeira) e Aspidosperma tomentosum (Peroba-de-campos) e dois isolados
de Maytenus ilicifolia (Espinheira Santa) cedidos gentilmente pela Dra Socircnia Pileggi
Dezessete isolados foram obtidos de amostras de folhas de Schinus terebinthifolius
(Aroeira Vermelha) coletados em 2007 pelo MsC Jocinei Lima e fazem parte do banco
bioloacutegico do Laboratoacuterio de Geneacutetica de Microrganismos (LABGEM) da Universidade
Federal do Paranaacute Curitiba Paranaacute Vinte e um isolados de Phomopsis sp e um
isolado de Diaporthe sp foram obtidos como endoacutefitos de folhas e peciacuteolos de M
ilicifolia (espinheira santa) em quatro coletas de outubro de 2006 a julho de 2007 no
Centro Nacional de Pesquisa de Floresta (CNPF) da EMBRAPA (Empresa Brasileira de
Pesquisa Agropecuaacuteria) localizada no municiacutepio de Colombo Paranaacute Dois isolados de
Phomopsis patoacutegenos de soja foram utilizados como linhagens referecircncia (TABELA 1)
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUA)
Coacutedigo Hospedeiro Procedecircncia Isolados por SM9631 Spondias mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9713 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9638 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)SM9714 S mombin Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)MU0123 Myracrodruon urundeuva Redenccedilatildeo ndash Paraacute Dra Kaacutetia Rodriguez do
IOC (FIOCRUZRJ)AT9810 Aspidosperma Jardim Botacircnico do Dra Kaacutetia Rodriguez do
33
tomentosum Rio de JaneiroRJ IOC (FIOCRUZRJ)AT9811 A tomentosum Jardim Botacircnico do
Rio de JaneiroRJ Dra Kaacutetia Rodriguez do IOC (FIOCRUZRJ)
AT9906 A tomentosum Jardim Botacircnico do Rio de JaneiroRJ
Dra Kaacutetia Rodriguez do IOC (FIOCRUZRJ)
ES80J Maytenus ilicifolia ColomboPR Dra Socircnia A V Pileggi no LABGEMPR
ESPAC22 Maytenus ilicifolia ColomboPR Dra Socircnia A V Pileggi no LABGEMPR
A135 Schinus terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A113 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A115B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A323 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A123 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A131 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A216B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A126 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A333B S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A134 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A132 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A333A S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A124 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A215A S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A116 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A334 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
A321 S terebinthifolius CuritibaPR MsC Jocinei Lima no LABGEMPR
ES2WF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2WC1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2KF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ES2NA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUACcedilAtildeO)
34
ES2AB1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESBA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESDF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFH1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESFB2 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESGA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESGF1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESIE1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESIA1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJH1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJG1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJE1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESJE2 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESKD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESRD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
ESSD1 Maytenus ilicifolia ColomboPR O autor
PHO1 (Phomopsis longicolla)
Glycine max (L) Merr Mato Grosso Dr Aacutelvaro Almeida EMBRAPALondrina-PR
PHO19 Glycine max (L) Merr Roraima Dr Aacutelvaro Almeida EMBRAPALondrina-PR
FONTE O autor
NOTA patoacutegenos de soja
TABELA 1 ISOLADOS DE Phomopsis spp PERTENCENTES Agrave COLECcedilAtildeO DO LABGEMUFPR (CONTINUACcedilAtildeO)
35
412 Microrganismos usados para teste de antagonismo
Para determinar a atividade antimicrobiana dos isolados foram utilizadas as
seguintes linhagens teste G citricarpa linhagens PC1396 e PC3305 pertencentes ao
banco bioloacutegico do Laboratoacuterio de Geneacutetica de Microrganismos da Universidade
Federal do Paranaacute
413 Fungos endofiacuteticos utilizados para anaacutelise de variabilidade geneacutetica
Como grupo externo para anaacutelise de variabilidade geneacutetica por RAPD foram
utilizadas cinco linhagens de Pestalotiopsis sp (TABELA 2)
TABELA 2 ISOLADOS GRUPO EXTERNO PARA ANAacuteLISE DE VARIABILIDADE GENEacuteTICA POR RAPD
Coacutedigo Hospedeiro Procedecircncia Pestalotiopsis phothiniae Gustavia cf eliacuteptica Amazonia Pestalotiopsis neglecta voucher Muraya paniculata Amazonia Pestalotiopsis vismeae Maytenus ilicifolia Paranaacute Pestalotiopsis sp 3 Maytenus ilicifolia Paranaacute Pestalotiopsis sp 11 Maytenus ilicifolia Paranaacute FONTE O autor NOTA Isolado cedidos pelo Profordm Dr Joseacute Odair Pereira da Universidade Federal do Amazonas Isolados por Josiane Gomes Figueiredo no LABGEMPR 42 Meios de Cultura 421 Caldo MEB (Extrato de Malte)
Extrato de Malte 20g
Glicose 20g
Peptona 1g
Aacutegua destilada p1000mL
36
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
422 Meio AV (Aveia-Aacutegar) Aveia 300 g
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
A aveia foi fervida durante 30 minutos com metade do volume da aacutegua A
suspensatildeo foi filtrada com gaze Adicionou-se aacutegua para completar o volume O pH foi
ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a necessidade
Acrescentou-se o aacutegar
423 Meio BDA (Meio Batata-Dextrose-Aacutegar)
Batata 2000g
Dextrose 100g
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
As batatas foram cozidas em 500 mL de aacutegua destilada durante 20 minutos Em
seguida foram filtradas com gaze adicionou-se a dextrose ao caldo e completou-se
com aacutegua destilada para 1000 mL O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N
eou HCl 1N conforme a necessidade Acrescentou-se o aacutegar
37
424 Meio MC (Meio Completo) PONTECORVO et al 1953
NaNO3 60g
KH2PO4 15g
KCl 05g
MgSO47H2O 05g
FeSO4 002g
ZnSO4 002g
Glicose 100g
Peptona 20g
Extrato de levedura 20g
Caseiacutena hidrolisada 15g
Soluccedilatildeo de vitaminas 10mL
Aacutegar 150g
Aacutegua destilada p1000mL
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
425 Meio MEA (Extrato de Malte) PATERSON e BRIDGE 1994
Extrato de Malte 20g
Glicose 20g
Peptona 1g
Agar 15g
Aacutegua destilada p1000mL
O pH foi ajustado para 58 adicionando-se NaOH 1N eou HCl 1N conforme a
necessidade Adicionou-se o aacutegar
38
OBS Todos os meios de cultura foram autoclavados durante 20 minutos a 1 atm e
armazenados em temperatura ambiente
43 Soluccedilotildees e Reagentes 431 Clorofane ndash FenolClorofoacutermio (11)
432 Clorofil ndash ClorofoacutermioAacutelcool Isoamiacutelico (241)
433 Derozal Bayerreg - 1mg de carbendazim em 1mL de aacutegua destilada
434 Dodecil Sulfato de Soacutedio (SDS) 10 (pv) em aacutegua destilada
435 Fenol Saturado
Um volume de fenol cristalizado foi dissolvido em banho-maria a 60degC e
acrescentado um volume de tampatildeo Tris-HCl 02 M pH 80 Apoacutes agitaccedilatildeo por 30
minutos a fase aquosa foi retirada e entatildeo acrescentado um volume de tampatildeo Tris-
HCl 02 M pH 80 Este processo foi repetido ateacute atingir o pH desejado (pH 80) Em
seguida foi adicionado um volume final de 110 do tampatildeo Tris-HCl 02 M pH 80 e
estocado em frasco escuro a uma temperatura de 4degC usado apoacutes 48 horas
(SAMBROOK E MANIATS 1989)
436 Gel de Agarose 08 (pv) em Tampatildeo TBE 1x
437 Gel de Agarose15 (pv) em em Tampatildeo TBE 1x
438 Lactofenol azul Aacutecido laacutetico 200 g
Cristais de fenol 200 g
Glicerina 200 g
39
Azul de algodatildeo (Metyl Blue Difco) 005 g
Aacutegua destilada 200 mL
Os cristais de fenol foram derretidos em banho-maria Adicionaram-se os demais
componentes Depois de 24 horas filtrou-se e armazenou-se em frasco escuro
439 Marcador de peso molecular (DNA de fago lambda clivado com Hind III Gibco)
O marcador de peso molecular do DNA foi fornecido concentrado e no momento
do uso diluiu-se na proporccedilatildeo de 1 μL do marcador 1 μL do tampatildeo da amostra 4 μL
de aacutegua Milli-Q esterilizada Na corrida eletroforeacutetica foi utilizado 6 μL do marcador
4310 Marcador de peso molecular (DNA Ladder 100pb Ludwing Biotec)
O marcador de peso molecular foi fornecido concentrado e no momento do uso
diluiu-se na proporccedilatildeo de 1 μL do marcador 2 μL do tampatildeo da amostra 7 μL de aacutegua
Milli-Q autoclavada Na corrida eletroforeacutetica foram utilizados 15 μL do marcador
4311 Oligonucleotiacutedeos (Invitrogen)
Foi adicionado Tris-HCl 10 mM pH70 aos oligonucleotiacutedeos para obter uma
soluccedilatildeo estoque com 50 μM No momento do uso a soluccedilatildeo estoque foi diluiacuteda para
concentraccedilatildeo final de 4μM
4312 RNAse (invitrogen)
A soluccedilatildeo foi preparada na concentraccedilatildeo de 10 mM de Tris-HCl pH 75 e 15 mM
de NaCl Aqueceu-se a 100degC por 15 minutos e estocou-se a ndash 20degC
40
4313 Soluccedilatildeo de Vitaminas Aacutecido Nicotiacutenico 1000 mg
Aacutecido para Aminobenzoacuteico 100 mg
Biotina 02 mg
Piridoxina 500 mg
Riboflavina 1000 mg
Tiamina 500 mg
Aacutegua destilada esterilizada p 1000 mL
A soluccedilatildeo foi aquecida em banho-maria a 98degC por 15 minutos e armazenada em
frasco escuro previamente autoclavado a 4degC
4314 Soluccedilatildeo de NaCl 085 (pv) em aacutegua destilada
4315 Soluccedilatildeo Tween-80 01 (vv) em aacutegua destilada
4316 Soluccedilatildeo de Tetraciclina 5 (pv) em etanol absoluto Preparou-se a soluccedilatildeo sob
agitaccedilatildeo e estocou-se em frasco escuro a ndash 20degC
4317 Soluccedilatildeo de EDTA 05M em aacutegua destilada O pH foi ajustado para 80
adicionando-se NaOH 1N
4318 Soluccedilatildeo de brometo de etiacutedio 1 (pv) em aacutegua destilada O brometo de etiacutedio
foi dissolvido em aacutegua destilada agitou-se e estocou-se a temperatura ambiente
protegido de luz No momento do uso adicionou-se 3μL desta soluccedilatildeo a 100 mL de
tampatildeo TBE (1X)
41
4319 Tampatildeo TE (Tris-EDTA)
Tris-HCl pH 80 100 mM
EDTA pH 80 10 mM
4320 Tampatildeo de Extraccedilatildeo de DNA Tris-HCl pH 80 2000 mM
EDTA pH 80 250 mM
NaCl 2500 mM
SDS (pv) 1
O tampatildeo de Extraccedilatildeo foi preparado no momento do uso
4321 Tampatildeo da Amostra (6x)
Azul de bromofenol3 1000 mL
Glicerol 1035 mL
Aacutegua destilada p 50 mL
4322 Tampatildeo de corrida TBE 10x
Trizma base 54g
Aacutecido boacuterico 275g
EDTA 465g
Aacutegua Milli-Q p 500mL
A soluccedilatildeo foi autoclavada e estocada a temperatura ambiente No momento do
uso diluiu-se 10 vezes com aacutegua Milli-Q
42
44 Isolamento
A metodologia utilizada para o isolamento dos microrganismos endofiacuteticos foi
descrita por Petrini (1991) modificada por Glienke (1995) Os diferentes oacutergatildeos da
planta temperatura de incubaccedilatildeo nuacutemero de plantas e o de fragmentos plaqueados
estatildeo listados na tabela 3
Isolamento Eacutepoca do ano Oacutergatildeo da
planta Temperatura
de incubaccedilatildeo
Nuacutemero de Plantas
Nuacutemero de fragmentos plaqueados
1 Outubro de 2006 Folha 28deg C 20 360 2 Marccedilo de 2007 Folha 22-23deg C 30 540 3 Julho de 2007 Folha 22-23deg C 20 360 4 Julho de 2007 Peciacuteolo 22-23deg C 20 160
Total de fragmentos plaqueados 1360
FONTE O autor
Os fungos foram isolados de plantas aparentemente sadias com folhas sem
marcas arranhaduras ou ferimentos Apoacutes a coleta as folhas foram colocadas em
sacos plaacutesticos devidamente identificados em seguida as superfiacutecies das folhas foram
lavadas em aacutegua corrente com auxiacutelio de uma esponja para a remoccedilatildeo dos
microrganismos epifiacuteticos e outros contaminantes Os peciacuteolos foram vedados com
parafina derretida para evitar a entrada dos desinfetantes nos seus tecidos internos
desta forma preservando os endoacutefitos a serem isolados As folhas vedadas foram
mergulhadas em frascos com aacutegua destilada autoclavada sendo mantidos por 1
minuto em etanol 70 por 1 minuto em hipoclorito de soacutedio (NaOCl) a 3 por 6
minutos etanol 70 por 30 segundos e por uacuteltimo em aacutegua destilada autoclavada por
6 minutos Devido agrave dificuldade de isolar fungos do gecircnero Phomopsis nos isolamentos
1 e 2 foi reduzido o tempo de tratamento com hipoclorito de soacutedio para 4 minutos nos
isolamentos 3 e 4 (TABELA 3) As folhas foram cortadas em seis fragmentos de 5-7 mm
e os peciacuteolos foram cortados das folhas e oito deles foram transferidos para placas de
TABELA 3 EacutePOCAS DO ANO OacuteRGAtildeOS DA PLANTA CONDICcedilOtildeES DE INCUBACcedilAtildeO E NUacuteMERO DE FRAGMENTOS PLAQUEADOS NAS QUATRO COLETAS DE ENDOacuteFITOS DE ESPINHEIRA-SANTA
43
Petri (90 mm) contendo os meios de cultura BDA adicionados de Tetraciclina (10
mgmL) para impedir o crescimento bacteriano (ARAUJO et al 2002)
Como controle apoacutes o processo de desinfestaccedilatildeo foram inoculados 01 mL da
uacuteltima aacutegua autoclavada utilizada no tratamento em trecircs placas de Petri As placas
permaneceram incubadas nas mesmas condiccedilotildees do isolamento
45 Conservaccedilatildeo dos fungos
Os isolados foram estocados utilizando-se duas metodologias 1) em frascos
contendo meio de cultura BDA inclinado apoacutes sete dias de crescimento a 28degC foram
mantidos a 4degC realizando-se repiques mensalmente 2) em frascos contendo aacutegua
destilada esterilizada com 12 discos de 5 mm meio de cultura BDA contendo miceacutelios
Repetiu-se o procedimento a cada trecircs meses
46 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica
A caracterizaccedilatildeo macromorfoloacutegica dos isolados de Phomopsis foi realizada com
base na forma dos bordos crescimento micelial aspecto da colocircnia e a sua coloraccedilatildeo
no verso e reverso da placa em diferentes meios de cultura Discos de miceacutelio (8 mm)
provenientes de colocircnias de Phomopsis com sete dias de crescimento em meio de
cultura BDA foram inoculados no centro de placas de Petri com diferentes meios de
cultura Batata-dextrose-aacutegar (BDA) aveia-aacutegar (MAV) e extrato de malte-aacutegar (MEA)
Foram incubados durante 14 dias a 22ordmC sob luz contiacutenua Os ensaios foram
realizados em triplicata O diacircmetro das colocircnias foi medido a partir do terceiro dia de
crescimento ateacute o quinto dia quando alguns atingiram completamente as bordas da
placa de Petri
Para anaacutelise da micromorfologia foram avaliados os coniacutedios apoacutes 21 dias de
crescimento Os picniacutedios foram comprimidos entre a lacircmina e a lamiacutenula com uma
gota de lactofenol azul de algodatildeo possibilitando a observaccedilatildeo ao microscoacutepio oacuteptico
44
com aumento de 1000x O comprimento e largura dos coniacutedios foram medidos usando
uma reacutegua na objetiva com escala de 1μM
47 Obtenccedilatildeo de colocircnia monospoacuterica
Apoacutes os isolados terem sido identificados como pertencentes ao gecircnero
Phomopsis colocircnias monospoacutericas foram obtidas cultivando os isolados endofiacuteticos em
placas de Petri com meio BDA a 28degC Observou-se o crescimento da colocircnia e
monitorou-se com observaccedilatildeo em microscopia oacuteptica a produccedilatildeo de esporos Os
picniacutedios foram coletados e macerados em soluccedilatildeo de ldquoTween 80rdquo 01 A suspensatildeo
de esporos foi filtrada com seringas contendo latilde de vidro Em seguida adicionou-se 10
mL de soluccedilatildeo salina Centrifugou-se a soluccedilatildeo filtrada durante 4 minutos a 7000 rpm
Descartou-se o sobrenadante adicionou-se 400 μL de soluccedilatildeo salina para suspender o
precipitado onde ficaram contidos os esporos retirou-se 10 μL desta suspensatildeo sendo
a concentraccedilatildeo estimada em Cacircmara de Neubauer Quando necessaacuterio diluiu-se em
soluccedilatildeo salina para viabilizar a contagem dos esporos Foram semeados 100 μL de
suspensatildeo em uma placa de Petri contendo meio BDA espalhou-se com alccedila de
Drigalsky incubou-se a 28degC Colocircnias isoladas foram selecionadas e repicadas em
tubos com BDA inclinado que apoacutes crescimento por sete dias a 28ordmC foram mantidos a
4degC
48 Caracterizaccedilatildeo Molecular 481 Extraccedilatildeo do DNA (RAEDER e BRODA 1985 modificado por GLIENKE 1995)
O DNA genocircmico foi obtido de acordo com a metodologia descrita por Raeder e
Broda (1985) modificada por Glienke (1995) Os isolados endofiacuteticos de Phomopsis
foram cultivados em meio MEA durante cinco dias a 28degC O miceacutelio obtido a partir da
raspagem da colocircnia com espaacutetula esterilizada foi liofilizado e mantido em freezer ou na
45
sequumlecircncia macerados com adiccedilatildeo de nitrogecircnio liacutequido O material foi pesado e para
cada grama de miceacutelio acrescentou-se 1 mL de Tampatildeo de Extraccedilatildeo Incubou-se a
soluccedilatildeo homogeneizada durante 20 minutos em banho-maria a 70degC Acrescentou-se
um volume de fenol saturado misturaram-se as fases e centrifugou-se durante 15
minutos a 5000 rpm Coletou-se a fase aquosa colocou-se em um novo tubo e
adicionou-se a este um volume de Clorofane Centrifugou-se novamente sob as
mesmas condiccedilotildees anteriores Coletou-se a fase aquosa como na etapa anterior e
adicionou-se um volume de Clorofil repetindo-se o processo de centrifugaccedilatildeo sob as
mesmas condiccedilotildees Coletou-se a fase aquosa em um novo tubo e adicionou-se etanol
absoluto O material foi incubado a ndash 20ordmC durante uma hora Apoacutes este periacuteodo a
suspensatildeo foi centrifugada (10000 rpm por 20 min) desprezou-se o sobrenadante
Acrescentou-se 500 μL de etanol 70 centrifugou-se a 10000 rpm durante 5 minutos
descartou-se o aacutelcool 70 inverteu-se o tubo sobre uma folha de papel absorvente
para secar a borda do tubo e este secou a uma temperatura de 37degC durante 30
minutos Ressuspendeu-se o DNA com 200 μL de aacutegua milli-Q por uma hora
temperatura ambiente As amostras foram tratadas RNAse (30 μgmL) a 37degC por uma
hora
A concentraccedilatildeo de DNA foi estimada por meio de eletroforese em gel de agarose
08 utilizando como padratildeo de peso molecular o DNA do fago λ (Gibco) clivado com
HindIII com concentraccedilatildeo conhecida Apoacutes a eletroforese o gel foi corado com brometo
de etiacutedio observado sobre transiluminador de luz ultravioleta e fotodocumentado
482 RAPD
As soluccedilotildees foram realizadas de acordo com as condiccedilotildees descritas por Glienke-
Blanco et al (2002) onde foram utilizados 50ng de DNA tampatildeo PCR 1x 05U de Taq
polimerase 02mM de oligonucleotideos 02mM de dNTP 3mM de MgCl2 em um
volume final de 25microL Foi realizada uma preacutevia seleccedilatildeo usando-se os oligonucleotiacutedeos
46
da linha OPX11 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) OPX14 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) OPX19 (5rsquo
TCACCACGGT 3rsquo) e OPE 08 (5rsquo TCACCACGGT 3rsquo) da Operon Technologiesreg
A amplificaccedilatildeo foi realizada com as condiccedilotildees descritas por Pioli et al (2003)
com modificaccedilotildees sendo cada reaccedilatildeo submetida a 40 ciclos apoacutes a desnaturaccedilatildeo
inicial a 940C por 4 minutos Cada ciclo consiste de 1 minuto a 940C 1 minuto e 30
segundos a 350C e 2 minutos a 720C
4821 Anaacutelise da Variabilidade Geneacutetica
Os produtos de amplificaccedilatildeo foram separados por eletroforese (3 Vcm) em gel
de agarose 15 e posteriormente corados por 20 minutos com soluccedilatildeo de brometo de
etiacutedio Os fragmentos amplificados foram visualizados em um transiluminador de luz
Ultravioleta e a imagem do gel documentada atraveacutes de sistema fotograacutefico Digi-doc it
O marcador de peso molecular utilizado foi o Ladder de 100 pb (Ludwing Biotec)
A anaacutelise da variabilidade geneacutetica foi realizada pelo agrupamento das linhagens
segundo os princiacutepios adotados em taxonomia numeacuterica utilizando o coeficiente de
similaridade de Jaccard que permite calcular similaridades com base em variaacuteveis
binaacuterias (0 para ausecircncia e 1 para presenccedila de banda) As bandas foram consideradas
como variaacuteveis enquanto as linhagens como unidades O coeficiente foi calculado
segundo a foacutermula J=MP onde M eacute o nuacutemero de concordacircncias positivas e P o
nuacutemero total de variaacuteveis menos concordacircncias negativas (SNEATH e SOKAL 1973)
Desta forma o coeficiente de similaridade Jaccard (J) leva em conta apenas as
discordacircncias e as concordacircncias positivas quanto agrave presenccedila ou ausecircncia de bandas
desconsiderando as concordacircncias negativas Quanto maior a semelhanccedila entre duas
linhagens maior eacute o valor de similaridade As unidades foram agrupadas atraveacutes do
meacutetodo UPGMA (Unweighted Pair-Group Method with Arithmetical Average) que eacute um
modelo de agrupamento hieraacuterquico e permite a construccedilatildeo de dendrogramas
(SNEATH e SOKAL 1973) Matrizes e dendrogramas foram elaborados usando o
software NTSYS (Numerical taxonomy system of multivariate programs) (ROHLF
1988)
47
Para verificar a consistecircncia dos agrupamentos verificados foi realizada uma
anaacutelise bootstrap segundo Felsenstein (1985) utilizando o software BOOD (COELHO
2005)
483 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
4831 Amplificaccedilatildeo
A reaccedilatildeo foi realizada com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D (TABELA 4) que
satildeo universais para fungos e permitem amplificar a regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do DNA
Ribossomal
Oligonucleotiacutedeos Sequumlecircncia
LS266 5 TTACGTCCCTGCCCTTTGTA 3
V9D 5GCATTCCCA AA C AACTCGAC 3rsquo
FONTE O autor
As condiccedilotildees da reaccedilatildeo foram realizadas de acordo com a descriccedilatildeo de White et
al (1990) com algumas modificaccedilotildees 50 ng de DNA tampatildeo PCR 1x 15U de Taq
DNA polimerase 08microM de oligonucleotiacutedeos 02mM de dNTP 3mM de MgCl2 para um
volume final de 50microL
A amplificaccedilatildeo foi realizada em um termociclador Eppendorf (Modelo
Mastercycler Gradiente) com desnaturaccedilatildeo inicial a 94degC por 2 minutos 30 ciclos de 30
segundos a 94degC 1 minuto a 56degC 1 minuto a 72degC seguida de extensatildeo final de 3
minutos a 72degC
TABELA 4 SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA AMPLIFICACcedilAtildeO DAREGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL
48
4832 Purificaccedilatildeo da PCR
Foram testadas duas metodologias de purificaccedilatildeo da reaccedilatildeo de PCR
48321 Purificaccedilatildeo com PEG
Aos produtos da amplificaccedilatildeo da PCR com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D
foram acrescentados 50microL de PEG os tubos foram incubados a 37ordmC por 30 minutos
em seguida foram centrifugados por 15 minutos a 14000rpm O sobrenadante foi
descartado com micropipeta Adicionou-se 125microL de Etanol 80 gelado apoacutes 1min os
tubos foram centrifugados por 2 min a 13000 rpm descartou-se o sobrenadante Foram
adicionados 125microL de Etanol 96 (gelado) descartou-se o sobrenadante O Etanol foi
evaporado em speed vac por 10min a 70ordmC O pellet foi ressuspendido em 15 microL de
aacutegua Milli-Q e misturado em seguida ficou agrave temperatura ambiente por pelo menos 2
horas
Para confirmaccedilatildeo da presenccedila do DNA na amostra 1microL foi submetido agrave
eletroforese em gel de agarose 15
48322 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio
Aos produtos da amplificaccedilatildeo da PCR com os oligonucleotiacutedeos LS266 e V9D
foram acrescentados 34 microL de acetato de amocircnio (AcNH4) 75M e 100 microL de etanol
96 Os tubos ficaram em temperatura ambiente por 10 minutos e em seguida foram
centrifugados por 15 minutos a 14000rpm Os pellets resultantes foram lavados com
250 microL de etanol 70 (receacutem preparado) centrifugou-se por 15 minutos a 14000rpm e
descartou-se o etanol O pellet foi seco na estufa a 37ordmC por 30 mim e ressuspendidos
em 15microL de aacutegua Milli-Q
Para confirmaccedilatildeo da presenccedila do DNA na amostra 1microL foi submetido a
eletroforese em gel de agarose 15
49
4833 Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento
Foram realizadas trecircs reaccedilotildees de sequumlenciamento a primeira foi realizada
usando o produto tratado com PEG e nas duas posteriores usou-se o produto de PCR
tratado com acetato de amocircnia Para o restante da metodologia natildeo houve alteraccedilatildeo
O sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA foi realizado pelo
meacutetodo de terminaccedilatildeo de cadeia segundo Sanger et al (1977) utilizando a
incorporaccedilatildeo de dideoxinucleotiacutedeos fluorescentes em Sequumlenciador Automaacutetico de
DNA megaBACE
Para a reaccedilatildeo de sequumlenciamento foram utilizados cerca de 50ng da reaccedilatildeo de
PCR purificada 02 microM do oligonucleotiacutedeo ITS1 (TABELA 5) e 4microL de mistura para
sequumlecircnciamento ET (Kit ldquoDYEnamic ET Dye Terminator Cycle Sequencing Kit for
MegaBACErdquo da Amersham Biosciences) completando com aacutegua milli-Q para um
volume final de 10microL As mesmas condiccedilotildees foram aplicadas para o oligonucleotiacutedeo
ITS4 (TABELA 5)
FONTE O autor
A amplificaccedilatildeo foi realizada em um termociclador Eppendorf (Modelo
Mastercycler Gradient) seguindo uma desnaturaccedilatildeo inicial a 96degC por 1 minuto 30
ciclos de 10 segundos a 96degC 1 minuto e 5 segundos a 50degC 4 minutos a 60degC 20 min
a 8degC
Oligonucleotiacutedeos Sequumlecircncia
ITS1 5rsquoTCCGTAGGTGAACCTGCGG3rsquo
ITS4 5rsquoTCCTCCGCTTATTGATATGC3rsquo
TABELA 5 SEQUumlEcircNCIAS DOS OLIGONUCLEOTIacuteDEOS UTILIZADOS NA AMPLIFICACcedilAtildeO DAREGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO DNA RIBOSSOMAL
50
4834 Purificaccedilatildeo da Reaccedilatildeo de Sequumlenciamento
Foram testadas trecircs metodologias de purificaccedilatildeo da reaccedilatildeo de sequumlenciamento
48341 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em tubos
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com PEG (item 38321) foram adicionados 40 microL de isopropanol 75
sendo precipitados por um spin down As amostras ficaram agrave temperatura ambiente por
20 minutos em seguida foram centrifugadas por 25 minutos a 13000 rpm e o
isopropanol foi removido por inversatildeo dos tubos Foram adicionados 200 microL de etanol
70 natildeo gelado e centrifugado por 5 minutos a 13000 rpm em seguida o etanol foi
removido com auxiacutelio de uma micropipeta e foi submetido a secagem em speed vac por
45 minutos a 60degC
Apoacutes esse tratamento cada amostra foi ressuspendida em 10 microL Loading
Solution e submetida agrave eletroforese em Sequumlenciador Automaacutetico de DNA modelo
megaBACE da Amersham Biosciences Com os seguintes paracircmetros voltagem de
injeccedilatildeo 2V tempo de injeccedilatildeo 80 segundos voltagem da corrida 8V por 160 minutos
48342 Purificaccedilatildeo com Isopropanol em placa
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com acetato de amocircnio (item 38322) foram adicionados 40microL de
isopropanol 75 sendo precipitados por um spin down As amostras ficaram agrave
temperatura ambiente por 20 minutos e em seguida foram centrifugadas por 50
minutos a 4000 rpm O isopropanol foi removido por inversatildeo da placa Foram
adicionados 100microL de etanol 70 natildeo gelado e centrifugado por 30 minutos a 4000
rpm em seguida o etanol foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um spin a
300 rpm por 1 minuto Em seguida a placa ficou em estufa a 37degC durante 3 minutos
Apoacutes esse tratamento as amostras foram processadas como no item anterior
51
48343 Purificaccedilatildeo com Acetato de Amocircnio
Ao produto da reaccedilatildeo de sequumlenciamento realizado com produto de PCR
purificado com acetato de amocircnio (item 38322) foram adicionados 1 microL de acetato
de amocircnio (AcNH4) 75M e 30 microL de etanol 96 Apoacutes a homogeneizaccedilatildeo por inversatildeo
30 vezes a placa foi centrifugada por 45 minutos a 2500 RCF a 4degC
O sobrenadante foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um spin a 500
RCF com a placa invertida sobre papel toalha O pellet foi lavado com 100 microL de etanol
70 (receacutem preparado natildeo gelado) Seguindo-se uma nova centrifugaccedilatildeo a 2500 RCF
por 45 minutos e o sobrenadante foi descartado por inversatildeo da placa seguido de um
spin a 750 RCF com a placa invertida sobre papel toalha Em seguida a placa ficou em
estufa a 37degC durante 3 minutos
Apoacutes esse tratamento cada amostra foi ressuspendida e tratada como nos itens
anteriores
Todos os procedimentos desde a reaccedilatildeo de sequumlenciamento foram realizados
sob proteccedilatildeo de luz direta cobrindo a placa com papel alumiacutenio
4835 Ediccedilatildeo e Anaacutelise das Sequumlecircncias
As sequumlecircncias foram entatildeo alinhadas utilizando-se o programa CLUSTAL-W
versatildeo 17 (THOMPSON HIGGINS e GIBSON 1994) sendo realizada posterior
inspeccedilatildeo visual atraveacutes do programa BioEdit 7053 (HALL 1999) Apoacutes a ediccedilatildeo
alinhamento e anaacutelise preacutevia das sequumlecircncias estas foram submetidas ao software
MEGA 31 (KUMAR TAMURA NEI 2004) para obtenccedilatildeo das aacutervores filogeneacuteticas
baseadas em distacircncia A consistecircncia dos noacutes obtidos foi avaliada pelo procedimento
de bootstrap (FELSENSTEIN 1985) com 10000 reamostragens Foram utilizadas como
referecircncias linhagens de Phomopsis sp Diaporthe e Pestalotiopsis vismae (como
grupo externo) depositadas no GenBank (httpwwwncbinlmnihgov) (TABELA 6)
52
TABELA 6 LINHAGENS DE Phomopsis spp E DE Pestalotiopsis vismae UTILIZADAS COMO GRUPO EXTERNO
Espeacutecie Nuacutemero de acesso (GenBank)
Diaporthe Melonis AB105147 D melonis AB105148 Phomopsis longicolla AY857868 P longicolla AF000207 P camptothecae AY622996 D Phaselorum AF001024 D helianthi AJ312348 D helianthi AJ312363 D helianthi AF358441 Phomopsis sp P7 DQ235673 Phomopsis sp P3 DQ235669 P sojae AY050627 P chimonanthi AY622993 Phomopsis sp P4 DQ235670 D conorum AB201443 D conorum DQ116551 P theicola DQ286286 P theicola DQ286287 Phomopsis sp 1 AY485724 Phomopsis sp CBS DQ286285 Phomopsis sp Taxon 3 AF230762 Diaporthe AJ312359 Diaporthe AY745024 Pestalotiopsis vismae EF451801
FONTE O autor
49 Avaliaccedilatildeo da Atividade Antimicrobiana
491 Cultura Pareada
Para avaliar a atividade antimicrobiana dos 49 isolados de Phomopsis sp
endofiacuteticos (TABELA 1) contra o fitopatoacutegeno Guignardia citricarpa foi utilizado a
metodologia de Cultura Pareada (MARIANO1993) Os discos contendo miceacutelio eou
coniacutedios dos isolados endofiacuteticos ou dos fitopatoacutegenos ensaiados foram obtidos de
53
colocircnias crescidas em BDA durante sete dias a 28degC incubadas em estufa BOD e com
fotoperiacuteodo de 12 horas Apoacutes este periacuteodo foram retirados os discos da borda das
colocircnias com auxiacutelio de vazador de rolhas
Em placas de Petri contendo meio de cultura BDA colocou-se um disco (Oslash 8
mm) da cultura do fitopatoacutegeno G citricarpa Apoacutes trecircs dias de crescimento foi
adicionado no lado oposto um disco com o isolado de Phomopsis sp endofiacutetico a ser
avaliado ambos a 10 cm da borda Apoacutes o pareamento as placas foram vedadas com
filme de PVC e mantidas durante 14 dias em estufa BOD com fotoperiacuteodo de 12 h a
28degC Foi realizado um delineamento inteiramente casualizado com cinco repeticcedilotildees O
controle recebeu apenas o fitopatoacutegeno A avaliaccedilatildeo foi realizada mediante mediccedilatildeo do
diacircmetro da colocircnia comparando com o controle e observaccedilatildeo das interaccedilotildees entre as
colocircnias
Para determinar a porcentagem de inibiccedilatildeo do crescimento mediu-se o diacircmetro
das colocircnias do fitopatoacutegeno com 14 dias de crescimento subtraindo-se o diacircmetro do
inoacuteculo original Os caacutelculos foram realizados de acordo com Edginton et al (1971)
pela foacutermula
Onde Dc eacute o diacircmetro meacutedio da colocircnia do fitopatoacutegeno no controle e Dt eacute o
diacircmetro meacutedio da colocircnia do patoacutegeno nos tratamentos testados
492 Avaliaccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
Cobriu-se assepticamente toda a superfiacutecie do meio PDA inclusive nas bordas
com discos de papel celofane (Oslash11 cm) esterilizado A seguir foi inoculado no centro
sobre a superfiacutecie do papel celofane discos de aacutegar (Oslash8 mm) contendo miceacutelio do
isolado endofiacutetico As placas foram incubadas por quatro dias a temperatura de 28degC
as placas controles receberam apenas o fitopatoacutegeno incubados por 7 dias com
Dc -Dt
Dc
Porcentagem de inibiccedilatildeo (PI) = X 100
54
fotoperiacuteodo de 12 horas Mediu-se o diacircmetro da colocircnia e retirou-se o papel celofane
(juntamente com a colocircnia do isolado) Sobre a superfiacutecie de meio PDA inoculou-se um
disco de miceacutelio do fitopatoacutegeno a ser avaliado no centro da placa Foi realizado um
delineamento inteiramente casualizado com cinco repeticcedilotildees As placas foram
incubadas a 28degC com fotoperiacuteodo de 12 horas Apoacutes 7 e 14 dias mediu-se o
crescimento das colocircnias e comparou-se com o controle (ETHUR CEMBRANEL e
SILVA 2001 Adaptado por Figueiredo 2006)
493 Atividade dos Extratos Metanoacutelicos 4931 Obtenccedilatildeo dos extratos
Para avaliaccedilatildeo da atividade dos extratos metanoacutelicos foi utilizada a metodologia
descrita por Rodrigues Hesse e Werner (2000) com algumas modificaccedilotildees No
processo de fermentaccedilatildeo trecircs discos (Oslash 8 mm) dos 49 isolados endofiacuteticos de
Phomopsis (TABELA 1) foram inoculados em Erlenmeyer (250 mL) contendo 100 mL
de caldo extrato de malte Incubou-se durante 7 dias (110 rpm 28degC fotoperiacuteodo de 12
horas)
Apoacutes a fermentaccedilatildeo o miceacutelio foi separado do liacutequido fermentado por filtraccedilatildeo
em papel Whatman ndeg 4 Ao volume do filtrado obtido adicionou-se o mesmo volume
de acetato de etila (EtOAc) (Merck) em um balatildeo de separaccedilatildeo Agitou-se
vigorosamente por trecircs vezes e aguardou-se a formaccedilatildeo de duas camadas uma
aquosa na parte inferior e outra orgacircnica na parte superior Transferiu-se a fase
orgacircnica para um novo recipiente e submeteu-se a fase aquosa a mais uma extraccedilatildeo
com EtOAc Repetiu-se o procedimento por mais duas vezes Adicionou-se agrave fase
orgacircnica 5 de sulfato de soacutedio anidro e filtrou-se novamente com papel Whatman ndeg
4 Obteve-se extrato bruto seco passando a fase orgacircnica em rotaevaporador O extrato
foi pesado e diluiacutedo em metanol (10mgmL)
55
4932 Crescimento micelial
Foram obtidos discos (Oslash 12 mm) de colocircnias com 14 dias de crescimento em
meio completo da cultura do fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396 ou PC3305 Estes
foram inoculados no centro de placas de Petri contendo meio de cultura BDA A 10 cm
da borda em posiccedilatildeo oposta foi colocado um disco de papel filtro esterilizado (Oslash 5 mm)
e sobre este foram inoculados 100μL do extrato metanoacutelico a ser avaliado As placas
foram fechadas com filme de PVC e mantidas a 28degC fotoperiacuteodo de 12 horas em
BOD Avaliou-se o potencial de inibiccedilatildeo medindo-se o diacircmetro das colocircnias apoacutes sete
dias de crescimento comparando-se com o controle negativo onde foi inoculado aacutegua
destilada autoclavada ou metanol Como controle positivo foi utilizado fungicida Derosal reg (10 mgmL) (QUIROGA SAMPIETRO e VATTUONE 2001 adaptado por
FIGUEIREDO 2006)
410 Anaacutelise Estatiacutestica
Todos os experimentos foram realizados com delineamento inteiramente
casualizado (DIC) com 5 repeticcedilotildees As anaacutelises de variacircncia foram realizadas em
todas as etapas do trabalho Sempre que foi encontrado um valor significativo em
relaccedilatildeo ao teste F completou-se a anaacutelise com teste de Tukey para comparaccedilatildeo das
meacutedias utilizando software ASSISTAT (SILVA 1996 e SILVA 2002) ou o teste de Scott
Knott utilizando software SISVAR (FERREIRA 1994)
56
5 Resultados e Discussatildeo
51 Isolamento
Foram isolados 1005 endoacutefitos de folhas e peciacuteolos de 30 plantas de Espinheira
Santa (M ilicifolia) Destes 21 foram identificados a partir de anaacutelise em microscopia
oacuteptica como pertencentes ao gecircnero Phomopsis A tabela 7 compara os resultados
obtidos quanto agrave proporccedilatildeo de isolamento de Phomopsis sobre os diferentes tecidos da
planta nos quatro isolamentos realizados A frequumlecircncia dos isolamentos foi calculada
de acordo com Souza et al (2004)
TABELA 7 PORCENTAGEM DE ISOLAMENTO DE Phomopsis ENDOFIacuteTICOS DE PLANTAS DE ESPINHEIRA SANTA
Isolamento Oacutergatildeo da planta
Nuacutemero de fragmentos plaqueados
Endoacutefitos Nuacutemero ()
Phomopsis Nuacutemero ()
Frequumlecircncia isolamento Phomopsis
1 Folha 360 140 (39) 0 (0) 0
2 Folha 540 310 (57) 2 (064) 037
3 Folha 360 375 (gt100) 3 (08) 083
TOTAL FOLHA
1260 825 (65) 5 (061) 04
4 Peciacuteolo 160 180 (gt100) 16 (89) 100
TOTAL 1420 1005 (71) 21 (209) 15 FONTE O Autor
Observando a tabela 7 percebe-se claramente que a partir de peciacuteolo a
frequumlecircncia de isolamento de Phomopsis (10) foi maior do que em folhas (04) tanto
em relaccedilatildeo ao nuacutemero de fragmentos plaqueados quanto em comparaccedilatildeo ao nuacutemero
total de endoacutefitos isolados (89 contra 061) Provavelmente devido agrave menor
frequumlecircncia de fungos filamentosos de crescimento raacutepido que pudessem sobrepor ao
crescimento de Phomopsis Segundo Souza et al (2004) as folhas dos vegetais
57
hospedeiros satildeo provavelmente as portas de entrada para os microrganismos pois
apresentam tecidos mais fraacutegeis e expostos pela presenccedila de estocircmatos ocorrendo
posterior migraccedilatildeo para outros tecidos da planta O mesmo jaacute foi relatado em espeacutecies
de Citrus para o isolamento de fungos do gecircnero Guignardia sendo o peciacuteolo o tecido
de mais faacutecil isolamento deste gecircnero por apresentar menor colonizaccedilatildeo por
Colletotrichum (BLANCO 1999)
Assim sugere-se que em trabalhos futuros de isolamento de Phomopsis sejam
tambeacutem utilizados os peciacuteolos especialmente em Espinheira Santa
Foram tambeacutem obtidos 18 isolados de Phomopsis de trecircs plantas de S
terebinthifolius (Aroeira Vermelha) representando uma frequumlecircncia de 11 Em Aroeira
a frequumlecircncia do isolamento de Phomopsis em folha foi maior do que em Espinheira
Santa em todos os isolamentos realizados
Fungos do gecircnero Phomopsis Phyllosticta e Colletotrichum satildeo comumente
isolados como endoacutefitos de tecidos de diferentes espeacutecies de plantas em muitos casos
esses fungos estatildeo juntos num mesmo hospedeiro (PANDEY et al 2003 LU et al
2004)
O gecircnero Phomopsis tem sido descrito com grande frequumlecircncia em isolamentos
de diversas plantas (UECKER 1988 BODDY e GRIFFITH 1989) Azevedo et al (2000)
apresentaram algumas plantas hospedeiras de onde jaacute foram isoladas espeacutecies de
Phomopsis entre elas Sabal bermudana Trachycarpus fortunei Cavendishia
pubescens Stylosanthes guianensis Anacardium occidentale e Mangifera indica
Corrado e Rodrigues (2004) isolaram endofiacuteticos de Phomopsis das plantas medicinais
Spondias mombin e Aspidosperma tomentosun
Bussabam et al (2001) isolaram entre outros fungos o gecircnero Phomopsis
endoacutefitos de folhas pseudocaules e rizomas de gengibre (Amomum siamense Criab)
coletadas em dois locais na Tailacircndia Silva et al (2006) isolou Phomopsis como
endoacutefito de graviola (Annona muricata L) e pinha (Annona squamosa L)
Alguns dos relatos citam o gecircnero Phomopsis como fitopatoacutegeno isolado de
diversas espeacutecies de Citrus Mangifera indica (Mangueira) Glycine max (Soja) Ficus
carica (Figueira) e Anacardium occidentale (Cajueiro) entre muitas outras plantas
58
(CENARGEN EMBRAPA 2005) Natildeo haacute relatos de gecircnero Phomopsis como
fitopatoacutegeno das plantas medicinais utilizadas no presente trabalho Aspidosperma
tomentosum Spondias mombin e Maytenus ilicifolia assim como em Aroeira Vermelha
(Schinus terebinthifolius) Entretanto o gecircnero foi relatado por Anjos Charchar e
Guimaratildees (2001) como patoacutegeno em culturas de Aroeira (Myracrodruon urundeuva)
causando sintomas de queimas nas folhas que consiste de uma necrose escura
predominantemente nos bordos dos foliacuteolos
52 Caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de Phomopsis
A caracterizaccedilatildeo macromorfoloacutegica das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de
Phomopsis sp foi realizada de acordo com a forma dos bordos crescimento micelial
aspecto da colocircnia e a sua coloraccedilatildeo no verso e reverso da placa em diferentes meios
de cultura (FIGURAS 1 a 4 ANEXO 12)
A coloraccedilatildeo das colocircnias dos isolados de Phomopsis apresentaram elevada
variabilidade tanto no verso quanto reverso da placa nos trecircs meios de cultura
ensaiados Em geral variou entre combinaccedilotildees das cores branca preto verde claro e
oliva amarelo marrom marrom avermelhado cinza e bege
Os isolados de Phomopsis apresentaram no verso da placa com meio Aveia (AV)
coloraccedilatildeo branca alguns isolados apresentaram combinaccedilotildees de branco com marrom
verde amarelo e cinza exceto os isolados ESJG1 ES2KF1 ES2WF1 ESPAC22
ES80J ESFB2 ESGF1 A134 A333B que diferiram dos demais por apresentarem
coloraccedilatildeo intensa e o isolado A116 de coloraccedilatildeo marrom e verde (FIGURAS 1 a 4)
Nos meios de cultura MEA e BDA observou-se que a coloraccedilatildeo no verso da
placa foi mais variaacutevel do que no meio Aveia Igualmente o reverso das placas
contendo as colocircnias de Phomopsis mostrou-se bastante variaacutevel entre os isolados e
os trecircs meios de cultura utilizados havendo variaccedilatildeo intra-individual com coloraccedilotildees
branca preto verde claro e oliva amarelo marrom marrom avermelhado cinza e
bege
59
A morfologia micelial nos meios de cultura ensaiados variou de granuloso aeacutereo
a algodonoso Nos meios de cultura MEA e BDA todos os isolados apresentaram
miceacutelio denso poreacutem no meio AV esses dois tipos de miceacutelio variaram de denso a ralo
A maioria dos isolados de Phomopsis analisados possuem miceacutelio granuloso aeacutereo em
todos os meios ensaiados exceto os isolados SM9638 SM9631 e Phomopsis longicolla
PHO1 que apresentam miceacutelio algodonoso Observou-se variaccedilatildeo intra-individual na
morfologia micelial entre os meios de cultura nos isolados A333B e A323 que
apresentaram miceacutelio algodoso no meio AV e granuloso aeacutereo nos meios MEA e BDA
Igualmente os isolados A123 e SM9811 apresentaram-se algodonoso no meio MEA e
granuloso aeacutereo nos meios AV e BDA
O aspecto dos bordos das colocircnias mostrou variaccedilatildeo intra-individual entre os
diferentes meios de cultura para a maioria dos isolados exceto os isolados de
Phomopsis SM9638 ESKD1 ESPAC22 A323 A113 A331 A115 que apresentaram
bordos regulares e os isolados SM9714 ES2WC1 ESJG1 A126 A333A PHO1
(Phomopsis longicolla) e o isolado PHO19 que possuem bordos irregulares em todos os
meios utilizados
FIGURA 1 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis DE Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT 9811 e AT 9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
AV MEA BDA
M
U 0
123
S
M97
13
60
FIGURA 1 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE
Spondias mombin (SM9713 SM9638 SM9714 SM9631) Myracrodruon urundeuva (MU0123) Aspidosperma tomentosun (AT9810 AT9811 e AT9906) EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
SM
9631
SM
9638
AT
9811
A
T990
6
AT9
810
SM
9714
AV MEA BDA
61
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
A32
1
A
132
A21
5A
A
113
A
323
A13
1
AV MEA BDA
62
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
A
135
A11
6
A
115B
A
124
A12
6
A21
6 B
AV MEA BDA
63
FIGURA 2 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE AROEIRA (Schinus terebinthifolius) EM TREcircS MEIOS DE CULTURAAPOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
A
134
A33
3A
A
334
A12
3
A33
3B
AV MEA BDA
64
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUA)
E
S2N
A1
E
SIE1
ES
GA
1
ES8
0J
E
SPA
C22
ES2
WF1
AV MEA BDA
65
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
ESFB
2
ESJ
D1
ESK
D1
E
SJH
1
ESD
F1
E
S2A
B1
AV MEA BDA
66
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
E
S2K
F1
ESJ
E2
ESJ
E1
ESG
F1
ESF
H1
ESF
F1
AV MEA BDA
67
FIGURA 3 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOacuteFITOS DE Phomopsis E Diaporthe (BA1) ISOLADOS DE Maytenus ilicifolia EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA (CONTINUACcedilAtildeO)
ESB
A1
ESI
A1
ES
RD
1
E
S2W
C1
ESS
D1
ES
JG1
AV MEA BDA
68
Na avaliaccedilatildeo do diacircmetro das colocircnias houve diferenccedila significativa entre os
isolados de Phomopsis dentro dos diversos meios de cultura avaliados Entre os meios
de cultura MEA BDA e AV houve diferenccedila significativa de crescimento em geral o
crescimento micelial foi menor no meio AV (ANEXO 1) Portanto os grupos de
Phomopsis formados quando considerada agrave taxa de crescimento foram inferidos para
os meios de cultura separadamente
Na figura 5 observa-se o resultado do diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados
apoacutes 5 dias de crescimento em meio MEA Os isolados foram reunidos em oito grupos
diferentes A A323 SM9631 ESKD1 A134 e ESIE1 B A116 A334 A215A ESSD1
C A321 MU0123 ESGF1 ESRD1 AT9811 SM9713 A123 ESJH1 ESDF1 A131
ESIA1 ESBA1 ESJD1 D A333A A135 ES2NA1 A124 A132 SM9714 ESFB2 E A115B ES2AB1 A216B A113 F PHO1 SM9638 ES2WF1 A126 ESJE1 ESPAC22
ESFF1 ES2KF1 ESJG1 ES80J G ESJE2 ESFH1 AT9906 ESGA1 AT9810
ES2WC1 Os isolados do grupo A apresentaram os maiores valores de crescimento
radial em torno de 70 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) e o grupo H apresentou menor
crescimento micelial em torno de 20 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) (ANEXO 4)
FIGURA 4 MACROMORFOLOGIA DE COLOcircNIAS DOS ISOLADOS PATOGEcircNICOS OBTIDOS DE Glycine max EM TREcircS MEIOS DE CULTURA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
PH
O19
P
lon
gico
lla (P
HO
1) AV MEA BDA
69
O diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados apoacutes 5 dias de crescimento em meio
BDA estaacute representado na figura 6 Os isolados foram reunidos em seis grupos
diferentes A ESBA1 A323 A215A ESSD1 SM9713 ESGF1 SM9631 ESJD1
ESKD1 A334 B ESDF1 A132 A123 A333A MU0123 ESJH1 A321 ESRD1 A116
A134 A115B C ESIA1 A131 SM9714 A135 ESIE1 ESFB2 A124 ESPAC22
ES2KF1 A113 ESJE1 D ESJE2 ESFH1 ESJG1 ES2WC1 PHO1 SM9638
ES2NA1 ES2AB1 ESFF1 AT9811 AT9810 ES2WF1 A126 PHO19 A216B ES80J
ESGA1 E AT9906 F A333B Em geral a taxa de crescimento foi maior em meio BDA Os isolados do grupo A
apresentaram as maiores taxas de crescimento em torno de 70 cm (apoacutes 5 dias de
FONTE O autor
000
100
200
300
400
500
600
700
800
EB A F HD G C
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 4) A A323 SM9631 ESKD1 A134 e ESIE1 B A116 A334 A215A ESSD1 C A321 MU0123 ESGF1 ESRD1 AT9811 SM9713 A123 ESJH1 ESDF1 A131 ESIA1 ESBA1 ESJD1 D A333A A135 ES2NA1 A124 A132 SM9714 ESFB2 E A115B ES2AB1 A216B A113 F PHO1 SM9638 ES2WF1 A126 ESJE1 ESPAC22 ESFF1 ES2KF1 ESJG1 ES80J G ESJE2 ESFH1 AT9906 ESGA1 AT9810 ES2WC1
FIGURA 5 DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO MEA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
Diacirc
met
ro e
m c
m
70
crescimento) e o grupo F representado pelo isolado A333B apresentou menor
crescimento micelial (ANEXO 2)
Estudos sobre fisiologia envolvendo o gecircnero Phomopsis satildeo escassos Almeida
(1982) estudando Phomopsis sojae isolados de sementes de soja em seis diferentes
meios de cultura e nos regimes de luminosidade claro contiacutenuo e escuro contiacutenuo
verificou maior crescimento do fungo nos meios de haste de soja extrato de malte
aveia cenoura e BDA natildeo houve efeito da luz sobre o crescimento micelial de nenhum
dos isolados
Gurgel Menezes e Coelho (1997) verificaram maior crescimento micelial de P
anacardii e P mangiferae no meio BDA e uma melhor esporulaccedilatildeo nos meios BDA e V8
(Campbell CO) apoacutes 15 e 30 dias de incubaccedilatildeo No presente trabalho foi verificado
maior crescimento dos isolados de Phomopsis em meio BDA seguido do meio MEA em
meio AV a taxa de crescimento foi inferior
FONTE O autor
000
100
200
300
400
500
600
700
B A FEC D
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 2) A ESBA1 A323 A215A ESSD1 SM9713 ESGF1 SM9631 ESJD1 ESKD1 A334 B ESDF1 A132 A123 A333A MU0123 ESJH1 A321 ESRD1 A116 A134 A115B C ESIA1 A131 SM9714 A135 ESIE1 ESFB2 A124 ESPAC22 ES2KF1 A113 ESJE1 D ESJE2 ESFH1 ESJG1 ES2WC1 PHO1 SM9638 ES2NA1 ES2AB1 ESFF1 AT9811 AT9810 ES2WF1 A126 PHO19 A216B ES80J ESGA1 E AT9906 F A333B
FIGURA 6 DIAcircMETRO MEacuteDIO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
Diacirc
met
ro e
m c
m
71
O diacircmetro meacutedio das culturas dos isolados apoacutes 5 dias de crescimento em meio
AV estaacute representado na figura 7 Os isolados foram reunidos em sete grupos
diferentes A ESKD1 B ESJE2 A123 C ESJE1 SM9638 AT9811 SM9713 PHO1
ESBA1 SM9631 ESFB2 A334 A323 MU0123 D A333A ESJD1 ESGF1 A116 E ESPAC22 ESDF1 A321 A132 ES2KF1 ESJG1 ESRD1 PHO19 A115B A124
ESFF1 A134 ESIE1 A135 A131 A113 ES2WF1 ESSD1 ESIA1 F ESGA1 ESJH1
ESFH1 AT9906 ES2NA1 A216B ES80J A215A G AT9810 A333B ES2AB1
SM9714 ES2WC1 A126 Apenas o isolado ESKD1 representante do grupo A
apresentou taxa de crescimento raacutepida de 70 cm (apoacutes 5 dias de crescimento) a
maioria dos isolados tiveram crescimento lento (ANEXO 3)
NOTA As letras indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo ao diacircmetro meacutedio das colocircnias dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Os isolados seguidos pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Scott Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 3) A ESKD1 B ESJE2 A123 C ESJE1 SM9638 AT9811 SM9713 PHO1 ESBA1 SM9631 ESFB2 A334 A323 0123 D A333A ESJD1 ESGF1 A116 E ESPAC22 ESDF1 A321 A132 ES2KF1 ESJG1 ESRD1 PHO19 A115B A124 ESFF1 A134 ESIE1 A135 A131 A113 ES2WF1 ESSD1 ESIA1 F ESGA1 ESJH1 ESFH1 AT9906 ES2NA1 A216B ES80J A215A G AT9810 A333B ES2AB1 SM9714 ES2WC1 A126
FIGURA 7 AVALIACcedilAtildeO DAS MEacuteDIAS DO DIAcircMETRO DAS COLOcircNIAS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp EM MEIO AV APOacuteS 5 DIAS DE CRESCIMENTO A 22 ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
000
100
200
300
400
500
600
700
B A F C GD E
FONTE O autor
Diacirc
met
ro e
m c
m
72
Foi observado que dos 49 endoacutefitos e os 2 isolados patogecircnicos de Phomopsis
spp avaliados (TABELA 1) 27 apresentaram variaccedilatildeo intra-individual quanto ao
crescimento nos diversos meios Por exemplo os isolados A323 e SM9631 em meio
MEA e BDA pertencem ao grupo A e no meio AV ao grupo C Os outros 24 isolados
natildeo apresentaram variaccedilatildeo entre os agrupamentos formados nos diferentes meios
Os isolados que se agrupam baseados no crescimento nos trecircs meios natildeo satildeo
os mesmos quando se considera a cor do verso e reverso da placa assim como natildeo
satildeo semelhantes aos agrupamentos formados quando comparados com os bordos e
aspecto da colocircnia
Gurgel Menezes e Coelho (2002) estudando Phomopsis anacardii e Phomopsis
mangiferae observaram maior produccedilatildeo de picniacutedios nos meios de extrato de malte
aveia haste de soja e cenoura somente quando mantidos sob luz contiacutenua A
produccedilatildeo de picniacutedios foi reduzida em alternacircncia de luz e quase nula no escuro
contiacutenuo No presente trabalho foi observado que a maioria dos isolados formaram
estruturas de reproduccedilatildeo com o uso de luz contiacutenua em baixas temperaturas 22 a 25 degC
e pH 58 nos trecircs meios avaliados apoacutes 14 dias de crescimento
Segundo Cochrane (1959) e Griffin (1994) a luminosidade promove formaccedilatildeo
das estruturas reprodutivas assim como estatildeo diretamente ligadas agrave composiccedilatildeo do
meio de cultura atraveacutes de diferentes reaccedilotildees enzimaacuteticas Leonian (1924) descreve
que o efeito da luz como indutor da reproduccedilatildeo de fungos estaacute associado agraves
modificaccedilotildees que ocorrem no seu metabolismo celular combinados aos elementos que
constituem o meio de cultura
Timnick Lilly e Barnett (1951) detectaram efeito positivo da luz para a formaccedilatildeo
de picniacutedios ao verificarem que o regime escuro contiacutenuo inibia a formaccedilatildeo de picniacutedios
de Diaporthe phaseolorum Resultados semelhantes foram observados por Correcirca
(1995) avaliando Phomopsis sp provenientes de sementes florestais observou uma
melhor esporulaccedilatildeo em meio aveia sob regime de claro contiacutenuo por 12 dias de
incubaccedilatildeo
Na anaacutelise da micromorfologia observou-se que os isolados apresentavam
estruturas de reproduccedilatildeo a partir de 14 dias ateacute 21 dias de crescimento (FIGURA 8)
73
exceto os isolados SM9811 SM9638 e Phomopsis longicolla PHO1 que natildeo formaram
estruturas de reproduccedilatildeo em nenhum dos meios ensaiados Os isolados SM9811 e
SM9638 foram descritos como pertencentes ao gecircnero Phomopsis e depositados na
Coleccedilatildeo de Cultura de Fungos do Departamento de Micologia (IOC) da FIOCRUZ e
foram descritos por Rodrigues e Samules (1999) O isolado PHO1 foi isolado e
identificado pela EMBRAPA (Londrina-PR) como pertencente agrave espeacutecie P longicolla
Os coniacutedios do tipo alfa foram menos frequumlentes do que os do tipo beta Em
meio de cultura BDA apenas 11 isolados apresentaram o tipo de esporo alfa jaacute os beta
coniacutedios filiformes curvos na extremidade ou ligeiramente curvos foram visualizados
em quase todos os isolados de Phomopsis spp
Foi observado que para os isolados que apresentaram os dois tipos de esporos
foram visualizados com 14 dias de crescimento apenas alfa coniacutedios hialinos com
vacuacuteolos nas extremidades de forma ovoacuteide e natildeo foram visualizados beta coniacutedios
Apoacutes 21 dias os dois tipos de esporos foram visualizados nesses isolados (FIGURA 8a
e 8c) Alguns alfa coniacutedios apresentavam mais de dois vacuacuteolos nas extremidades
(FIGURA 8b) Essa variaccedilatildeo intra-individual tambeacutem foi observada em relaccedilatildeo agrave
morfologia do beta coniacutedio em que alguns apresentam curvatura na extremidade
outros ligeiramente curvos (FIGURA 8c)
NOTA A - isolado SM9631 aumento de 400x B- isolado SM9714 aumento de 1000x C- isolado SM9713 aumento de 400x microscopia oacuteptica Setas pretas indicam os alfa coniacutedios e setas vermelhas os beta coniacutedios Escala em 1μM
FONTE O autor
FIGURA 8 FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis EM BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
A B C
74
Alfa coniacutedios do isolado SM9713 provenientes dos meios de cultura AV (FIGURA
9a) e BDA (FIGURA 9e) apresentaram grande variaccedilatildeo morfoloacutegica Na figura 9 no
mesmo conidioacuteforo eacute visiacutevel a diferenccedila morfoloacutegica do alfa coniacutedio Na figura 9e o
conidioacuteforo apresenta alfa coniacutedios com mais de duas gotas nas extremidades (SETA 1)
e alfa coniacutedios com apenas dois vacuacuteolos (SETA 2) Em maior aumento eacute possiacutevel
perceber que existem variaccedilotildees de dois trecircs e ateacute quatro vacuacuteolos no mesmo isolado
(FIGURA 9a 9b e 9c) Tal variaccedilatildeo pode ser decorrente de diferenciados graus de
maturaccedilatildeo destes coniacutedios o que dificulta a caracterizaccedilatildeo morfoloacutegica de espeacutecies do
gecircnero Phomopsis
A medida do comprimento dos beta coniacutedios em meio BDA mostrou que os
isolados apresentam diferenccedilas estatiacutesticas significativas reunindo os isolados em 15
FIGURA 9 FOTOMICROGRAFIA DOS CONIacuteDIOS DO ISOLADO SM9713 EM MEIOS BDA e AV APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
1 2 A
B C D
E
NOTA A - em meio AV aumento de 400x B C e D- em meio BDA aumento de 650x E- em meio BDA aumento de 400x Microscopia oacutetica
FONTE O autor
75
grupos diferentes (ANEXO 5) A (AT9906 AT8010) B (ESFH1) C (ESPAC22 ES2KF1
SM9631) D (ESGA1 PHO19) E (ES80J) F (ESRD1) G (ESJE2 ESFB2 ESJE1) H
(ESJG1) I (A323) J (A333A A135 A124 A126 A132 A131 A134 A115B ESIE1) K
(ES2WC1 ES2WF1) L (SM9713 A334 ESIA1 A333B ESFF1 ESGF1) M (ES2AB1
A123 A113 ESJD1) N (ESKD1 ES2NA1 A215A SM9714) O (ESSD1 ESJH1
MU0123 A321 ESDF1 A216B A116) (FIGURA 10) Os isolados tambeacutem natildeo se
agrupam de acordo com os outros criteacuterios avaliados como a cor do verso e reverso
da placa diacircmetro das colocircnias assim como natildeo satildeo semelhantes aos agrupamentos
formados quando comparados com os bordos e aspecto do miceacutelio
NOTA As letras maiuacutesculas indicam os diferentes agrupamentos formados em relaccedilatildeo agrave meacutedia do comprimento de beta coniacutedio dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis spp Isolados de cada agrupamento A (AT9906 AT8010) B (ESFH1) C (ESPAC22 ES2KF1 SM9631) D (ESGA1 PHO19) E (ES80J) F (ESRD1) G (ESJE2 ESFB2 ESJE1) H (ESJG1) I (A323) J (A333A A135 A124 A126 A132 A131 A134 A115B ESIE1) K (ES2WC1 ES2WF1) L (SM9713 A334 ESIA1 A333B ESFF1 ESGF1) M (ES2AB1 A123 A113 ESJD1) N (ESKD1 ES2NA1 A215A SM9714) O (ESSD1 ESJH1 MU0123 A321 ESDF1 A216B A116) As meacutedias seguidas pela mesma letra minuacutescula natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade (ANEXO 5)
FIGURA 10 COMPRIMENTO DOS CONIacuteDIOS DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO EM BDA A 22ordmC SOB LUZ CONTIacuteNUA
0
5
10
15
20
25
30
35
40
B C E F MID LJA N H K OG
a
b
c
cd
de
ef
efg
fgh
fghi
ghij
ghil
hil
him
im
m
FONTE O autor
Diacirc
met
ro e
m μ
M
76
Desta forma as caracteriacutesticas macroscoacutepicas (coloraccedilatildeo bordos e tipos de
miceacutelio da colocircnia) e de micromorfologia dos coniacutedios avaliadas isoladamente natildeo
permitiram propor identificaccedilatildeo das espeacutecies dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis
Sendo assim optou-se por realizar uma anaacutelise polifaacutesica agrupando as caracteriacutesticas
morfoloacutegicas analisadas tais como crescimento micelial coloraccedilatildeo e bordos da
colocircnia tipo de miceacutelio comprimento dos coniacutedios e tipos de coniacutedios produzidos em
deferentes meios Essa metodologia foi descrita por Figueiredo et al (2006) para
caracterizar isolados de Pestalotiopsis Para todas estas caracteriacutesticas foram
atribuiacutedas notas de 0 ou 1 onde 0 representou ausecircncia da caracteriacutestica e 1 a
presenccedila (ANEXO 12) Os resultados compuseram uma matriz binaacuteria analisada pelo
software NTSYS (coeficiente Jaccard) com o agrupamento pelo meacutetodo UPGMA
permitindo a construccedilatildeo de um dendrograma de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
De acordo com o dendrograma de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
sugere-se a formaccedilatildeo de seis grupos com elevados valores de bootstrap que conferem
robustez aos agrupamentos No grupo I estatildeo reunidos os isolados MU0123 e
SM9713 no grupo II os isolados AT9810 e AT9906 no grupo III os isolados ESJE1 e
ESJE2 no grupo IV os isolados ESFB2 e ESFF1 no grupo V os isolados ES2KF1 e
ESJG1 e no grupo VI os isolados ES2WF1 e ES80J Os demais agrupamentos
formados natildeo foram considerados pois apresentam baixos valores de bootstrap e ou
baixos valores de similaridade morfoloacutegica
Os dados mostram elevada variabilidade morfoloacutegica dos isolados de Phomopsis
avaliados o que dificulta a delimitaccedilatildeo de espeacutecies apenas com dados morfoloacutegicos
Segundo Parmeter (1958) e Rehner e Uecker (1994) o alto grau de plasticidade das
caracteriacutesticas morfoloacutegicas impossibilita a delimitaccedilatildeo de espeacutecies no gecircnero
Phomopsis Gamboa-Gaitaacuten Laureano e Bayman (2005) estudando isolados de
Phomopsis endofiacuteticos de Guarea guidonia (Meliaceae) de duas regiotildees de Luquillo
(Porto Rico) relataram elevados niacuteveis de variabilidade morfoloacutegica entre os isolados
avaliados Eles observaram uma mistura de diferentes morfotipos em ambas as regiotildees
estudadas
77
Neste trabalho foi observado um elevado niacutevel de variabilidade morfoloacutegica dos
isolados de Phomopsis spp obtidos de seis diferentes espeacutecies de plantas e regiotildees
geograacuteficas Natildeo foi possiacutevel observar estruturaccedilatildeo populacional dos isolados em
funccedilatildeo da espeacutecie hospedeira Na figura 12 os isolados de M ilicifolia encontram-se na
coloraccedilatildeo rosa e distribuiacutedos ao longo dos dois eixos que representam os dois
principais componentes de variaccedilatildeo Igualmente os isolados em preto representam as
linhagens provindas de S terebinthifolius e tambeacutem encontram-se dispersos Tais
resultados natildeo surpreendem pois eacute possiacutevel que a mesma espeacutecie de Phomopsis seja
isolada em diferentes hospedeiros
NOTA I II III IV V VI satildeo grupos formados para inferir sobre a diversidade dos isolados endofiacuteticos de Phomopsis Os valores a esquerda dos noacutes indicam os valores de bootstrap
COEFICIEcircNTE DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA
FIGURA 11 DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA DOS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp
FONTE O autor
r = 07577 (P= 00001)
V VI
IV
I II III
78
FONTE O autor FIGURA 12 ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE MORFOLOacuteGICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp NOTA Isolados em coloraccedilatildeo rosa obtidos de Maytenus ilicifolia Em preto Schinus terebinthifolius Em azul escuro Myracrodruon urundeuva Em azul claro Aspidosperma tomentosun Em verde Spondias mombin 53 Caracterizaccedilatildeo Molecular de Phomopsis spp 531 RAPD
Os isolados de Phomopsis spp foram avaliados por meio de marcadores
moleculares do tipo RAPD a fim de verificar a magnitude da variabilidade geneacutetica
Foram analisados por esta metodologia 54 isolados Destes 47 Phomopsis spp
endoacutefitos os isolados MU0123 e SM9638 natildeo amplificaram em nenhuma das
condiccedilotildees ensaiadas dois isolados de Phomopsis patoacutegenos de soja e cinco isolados
de Pestalotiopsis Foram utilizados 4 oligonucleotiacutedeos gerando 99 bandas O tamanho
dos fragmentos amplificados variou de 400 a 2600 pb e podem ser visualizados nas
Figuras 13 a 16
79
FIG
UR
A 1
4 P
ER
FIL
DE
AM
PLI
FIC
ACcedil
AtildeO
CO
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OLI
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s sp
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O E
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lotio
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FIG
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A 1
3 P
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psis
80
FIG
UR
A 1
5 P
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FIG
UR
A 1
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DE
AM
PLI
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08 D
OS
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CO
S D
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hom
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s sp
E
GR
UP
O E
XTE
RN
O P
esta
lotio
psis
81
A anaacutelise destes marcadores RAPD permitiu a construccedilatildeo de um dendrograma
de similaridade geneacutetica (FIGURA 17) O coeficiente de correlaccedilatildeo das matrizes de
similaridade geneacutetica e cofeneacutetica obtido pelo teste de Mantel foi elevado (r=08157 e
p=00001) indicando que o dendrograma representa de forma adequada a matriz de
similaridade geneacutetica obtida pelos marcadores de RAPD Entretanto os valores de
bootstrap da maioria dos agrupamentos formados foram baixos Desta forma somente
foram considerados na anaacutelise os agrupamentos com bom suporte de bootstrap e
coeficientes de similaridade superiores a 50
Os dados indicam elevada variabilidade geneacutetica dos isolados de Phomopsis
spp avaliados (FIGURAS 17 e 18) com a formaccedilatildeo de sete grupos Os isolados de
Pestalotiopsis utilizados como grupo externo formaram um grupo (boostrap = 100)
isolado (FIGURA 17) sendo relevante para inferir a magnitude da variabilidade geneacutetica
observada entre os isolados de Phomopsis spp
O primeiro agrupamento reuacutene trecircs endoacutefitos de Espinheira Santa ESBA1
ES2AB1 e ESSD1 (49 de similaridade e bootstrap = 64) Esses isolados foram
obtidos do mesmo isolamento e pomar (CNPFEMPRAPA ColomboPR) poreacutem de
tecidos e plantas diferentes Os isolados ESBA1 e ESSD1 foram obtidos de peciacuteolo
enquanto ES2AB1 foi isolado de folha Eacute importante observar que o isolado ESBA1
apresentou estrutura de reproduccedilatildeo sexual sendo classificado como Diaporthe sp e
no entanto apresenta alto valor de similaridade geneacutetica com os isolados de Phomopsis
sp sugerindo assim que pertenccedilam ao mesmo complexo Phomopsis Diaporthe
Esses isolados natildeo se agrupam quanto aos caracteres morfoloacutegicos (FIGURAS 11 e
12)
O segundo agrupamento com 893 de similaridade geneacutetica e com bootstrap
de 100 compreende P longicolla (PHO1) uma linhagem patogecircnica de soja isolada
em Primavera do Leste ndash MT e o isolado SM9713 endoacutefito de Spondias mombin
coletado em Redenccedilatildeo ndash PA Aleacutem de coletados em lugares e hospedeiros totalmente
diferentes esses isolados apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas divergentes pois
natildeo pertencem ao mesmo agrupamento em nenhuma das caracteriacutesticas morfoloacutegicas
analisadas Entretanto a alta similaridade geneacutetica destes isolados sugere que
82
pertenccedilam agrave mesma espeacutecie o que reforccedila as observaccedilotildees anteriores de que a
definiccedilatildeo de espeacutecie do gecircnero Phomopsis natildeo eacute possiacutevel utilizando-se apenas
caracteriacutesticas morfoloacutegicas
FIGURA 17 DENDROGRAMA GERADO A PARTIR DOS DADOS DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS DE Phomopsis spp POR MEIO DE MARCADORES MOLECULARES RAPD
COEFICIENTE DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA
FONTE O autor
I II
III IV V VI VII
GRUPO EXTERNO
r= 08157 (p=00001)
100
83
O terceiro agrupamento com 75 de similaridade geneacutetica (FIGURA 17)
compreende dois isolados endofiacuteticos de Aspidosperma tomentosun AT9810 e AT9906
Esses isolados apresentaram caracteriacutesticas morfoloacutegicas muito semelhantes
formando o agrupamento II com 81 de similaridade morfoloacutegica (FIGURA 11)
O quarto agrupamento com 72 de similaridade geneacutetica compreende os
isolados ESFH1 e ESFF1 provenientes do peciacuteolo de Espinheira Santa da mesma
coleta poreacutem novamente eles natildeo se agrupam quanto aos caracteres morfoloacutegicos
observados (FIGURAS 11 e12)
O quinto agrupamento com 85 de similaridade geneacutetica reuacutene os isolados
ESKD1 e ESJH2 e ESJH1 provenientes de peciacuteolo da Espinheira Santa coletados na
mesma data Os isolados ESJH1 e ESJH2 foram obtidos do mesmo peciacuteolo e
apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas mais semelhantes entre si do que quando
comparados ao isolado ESKD1 (FIGURA 11) Entretanto a figura 17 revela que por
meio de marcadores RAPD os isolados ESKD1 e ESJH2 satildeo mais proacuteximos (92 de
similaridade geneacutetica) Sugere-se assim que os 3 isolados pertenccedilam agrave mesma
espeacutecie
O sexto agrupamento com 52 de similaridade (FIGURA 17) compreende os
isolados A321 obtido de Aroeira e ESIA1 obtido de Espinheira Santa Aleacutem de
coletados em lugares e hospedeiros totalmente diferentes esses isolados apresentam
caracteriacutesticas morfoloacutegicas diferentes (FIGURAS 11 e 12) Apesar do valor de
bootstrap atribuir confiabilidade a este agrupamento (77) o valor de similaridade
observado (52) natildeo eacute alto Assim natildeo eacute possiacutevel inferir que pertenccedilam agrave mesma
espeacutecie
O mesmo ocorre com o seacutetimo agrupamento que com 55 de similaridade
compreende os isolados A333A obtido de Aroeira e ESRD1 obtido de Espinheira Santa
Aleacutem de coletados em lugares e hospedeiros totalmente diferentes esses isolados
apresentam caracteriacutesticas morfoloacutegicas diferentes natildeo pertencendo ao mesmo
agrupamento quanto aos caracteres morfoloacutegicos (FIGURAS 11 e 12)
Esses resultados mostram que caracteriacutesticas morfoloacutegicas natildeo satildeo suficientes
para inferir espeacutecies neste gecircnero analisadas individualmente ou em anaacutelise polifaacutesica
84
Aleacutem disso natildeo haacute estruturaccedilatildeo populacional quanto ao hospedeiro Esses dados
reforccedilam a necessidade de revisatildeo na classificaccedilatildeo de espeacutecies do gecircnero Phomopsis
Atualmente a anaacutelise polifaacutesica vem sendo realizada em estudos de diversidade
bacteriana utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas bioquiacutemicas fisioloacutegicas e
moleculares (KIM et al 2006 a b NEDASHKOVSKAYA et al 2006) e
esporadicamente na identificaccedilatildeo de leveduras (SAMPAIO et al 1999 VILLA-
CARVAJAL et al 2004) Em fungos filamentosos a anaacutelise polifaacutesica de caracteriacutesticas
morfoloacutegicas foi utilizada com sucesso na taxonomia de Penicillium (FRISVAD e
SAMSON 2004) Aspergillus (FRISVAD et al 2004) e Pestalotiopsis (FIGUEIREDO
2006)
FIGURA 18 ANAacuteLISE DE COMPONENTES PRINCIPAIS DE SIMILARIDADE GENEacuteTICA ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis spp
FONTE O autor
85
532 Sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 58S e ITS2 do rDNA
Visando elucidar a taxonomia dos isolados de Phomopsis spp utilizados neste
trabalho foi realizado com sucesso o sequumlenciamento da regiatildeo ITS1 - 58S - ITS2 do
rDNA de 29 isolados Apoacutes o alinhamento e ediccedilatildeo destas sequumlecircncias foi realizada
uma busca no banco de dados de sequumlecircncias (httpwwwncbinlmnihgov) a fim de
identificar sequumlecircncias similares Os isolados estatildeo representados na aacutervore filogeneacutetica
(FIGURA 19)
Os isolados agruparam-se em 16 clados sugerindo que as plantas medicinais
estudadas satildeo colonizadas por pelo menos dezesseis diferentes espeacutecies de
Phomopsis (FIGURA 19) Entretanto a maioria dos isolados natildeo apresentaram
sequumlecircncias ITS com identidade superior a 90 com nenhuma sequumlecircncia depositada no
GenBank e portanto foram identificados como Phomopsis sp S1 a Phomopsis sp
S12
O primeiro clado (suportado com bootstrap de 98) estaacute representado na figura
20 e reuacutene os isolados A113 A131 A133 ESIA1 e A321 que apresentaram identidade
com P chimonanthi e com uma linhagem de Phomopsis sp endofiacutetica de Coffea
robusta (DQ123615) Esta linhagem foi isolada e sequumlenciada por Sette et al (2006) e
apresentou 99 de similaridade com as mesmas espeacutecies P chimonanthi P
michaeliae e Diaporthe helianthi (FIGURAS 19 e 20) A espeacutecie P chimonanthi foi
recentemente proposta por Chang e colaboradores (dados natildeo publicados) para
isolados antes denominados de P michaeliae Como esta espeacutecie foi descrita em 1987
e aceita ateacute o momento no presente trabalho sugere-se que os isolados A113 A131
A133 ESIA1 e A321 sejam classificados como P michaeliae
O isolado ESIA1 foi obtido de Espinheira Santa (Maytenus ilicifolia) enquanto os
demais isolados deste clado foram obtidos de Aroeira Vermelha (Schinus
terebinthifolius) Esses isolados apresentaram baixa similaridade geneacutetica quando
avaliados por RAPD e similaridade parcial quanto agraves caracteriacutesticas morfoloacutegicas uma
vez que fazem parte do mesmo agrupamento no diacircmetro da colocircnia em meio BDA
(Grupo C) e MEA (Grupo E)
86
FONTE O autor FIGURA 19 AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MEacuteTODO DE PARCIMOcircNIA)
ESIA1
A321
A113
A131
AY6229931| Phomopsis
P michaellae
Phomopsis sp S5 A116
ESRD1
ESJE2
ESKD1
Phomopsis sp S1
Phomopsis sp S9 A124
A334
A323Phomopsis sp S8
Phomopsis sp S2 A123
AJ3123481| Diaporthe helianthi
DQ2862851| Phomopsis sp CBS
AY8578681| Phomopsis longicolla
AF000207| Phomopsis longicolla
AF0010242| Diaporthe phaseolorum
DQ2356701| Phomopsis sp P4
Phomopsis sp S10 ESGA1
DQ2356731| Phomopsis sp P7
PHO19
AY0506271| Phomopsis sojae
DQ2356691| Phomopsis sp P3
P sojae
AF3584411 Diaporthe helianthi
AJ3123631| Diaporthe helianthi
SM9713
P longicolla PHO1
MU0123
P longicolla
A126
ESJH1Phomopsis sp S11
Phomopsis sp S12 ESJD1
Phomopsis sp S7 ESDF1
AB1051481| Diaporthe melonis
ES2AB1
ESBA1Phomopsis sp S6
AB1051471| Diaporthe melonis
AY6229961| Phomopsis camptothecae
AJ3123591| Diaporthe
AY7450241| Diaporthe
ES2KF1
ES2WF1
ESPAC22
Phomopsis sp S4
Phomopsis sp S3 ESGF1
AB2014431| Diaporthe conorum
DQ1165511| Diaporthe conorum CBS
SM9638
ESFH1
DQ2862861| Phomopsis theicola
AF230762 Phomopsis sp taxon 3
AY4857241| Phomopsis sp 1
DQ2862871| P theicola CBS
P theicola
Pestalotiopsis vismae
99
99
3599
98
91
7786
78
75
73
2973
5
5
3
2
11
71
70
25
22
33
40
67
63
33
44
65
41
34
29
27
21
21
18
13
12
8
7
5
3
3
0
0
0
19
32
23
31
87
Os isolados ESRD1 ESKD1 e ESJE2 apresentaram homologia quanto as
sequumlecircncias de ITS com suporte de bootstrap de 95 (FIGURA 19) Entretanto a figura
17 revela que por meio de marcadores RAPD os isolados ESKD1 e ESJE2 satildeo mais
proacuteximos apresentando 92 de similaridade geneacutetica (com bootstrap de 65) e 85
de similaridade desses isolados com o ESJE1 Assim sugere-se que estes 3 isolados
pertenccedilam agrave mesma espeacutecie Entretanto as sequumlecircncias ITS natildeo apresentaram
identidade superior a 90 com nenhuma sequumlecircncia depositada no GenBank Assim
esses isolados foram denominados de Phomopsis sp S1
FONTE O autor FIGURA 20 AacuteRVORE FILOGENEacuteTICA PARCIAL BASEADA NA SEQUumlEcircNCIA DA REGIAtildeO ITS1 58S E ITS2 DO rDNA DOS ISOLADOS DE Phomopsis spp (MODELO NEIGHBOR-JOINING COM CORRECcedilAtildeO KIMURA DOIS PARAcircMETROS)
O isolado PHO19 (patogecircnico de soja) foi classificado como Phomopsis sojae
formou um clado com um endoacutefito natildeo identificado (P3) e com um isolado da espeacutecie P
sojae (FIGURA 19) O isolado Phomopsis sp P3 foi obtido como endoacutefito de Tectona
grandis por Murali Surynarayanan e Geeta (2006)
A113
DQ1236151| Phomopsis sp CBMAI
ESIA1
AY6229931| Phomopsis chimonanthi
A131
A133
P michae liae
A124
A334
ESGA1
DQ1165521| Diaporthe conorum cbs 199-3990
98
62252719
0005
88
Os isolados MU0123 SM9713 e P longicolla (PHO1) apresentaram alta
homologia das sequumlecircncias (clado suportado com 99 de bootstrap) (FIGURA 19) Os
isolados SM9713 e P longicolla (PHO1) apresentaram 893 de similaridade geneacutetica
(com suporte de bootstrap de 100) utilizando-se marcadores RAPD (FIGURA 17) Na
anaacutelise morfoloacutegica os isolados MU0123 e SM9713 apresentaram mais de 70 de
similaridade poreacutem o isolado P longicolla (PHO1) apresentou caracteriacutesticas
morfoloacutegicas diferentes dos isolados MU0123 e SM9713 (FIGURA 11) O isolado PHO1
foi isolado como patoacutegeno de soja (Glycine max (L) Merr) no Mato Grosso enquanto os
isolados MU0123 e SM9713 foram obtidos como endofiacuteticos de Aroeira (Myracrodruon
urundeuva) e Cajaacute (Spondias mombin) respectivamente ambos no estado do Paraacute Em
funccedilatildeo das similaridades geneacuteticas observadas e por ser o isolado PHO1 utilizado
como referecircncia de P longicolla os isolados endofiacuteticos MU0123 e SM9713 foram
identificados como pertencentes a esta espeacutecie A alta similaridade geneacutetica destes
isolados sugere que pertenccedilam agrave mesma espeacutecie o que reforccedila as observaccedilotildees
anteriores de que a definiccedilatildeo de espeacutecie do gecircnero Phomopsis natildeo eacute possiacutevel
utilizando-se apenas caracteriacutesticas morfoloacutegicas O fato de isolados endofiacuteticos de S
mombin e M urundeuva serem identificados como P longicolla demonstra que
espeacutecies patogecircnicas para um hospedeiro podem colonizar de forma assintomaacutetica
diferentes espeacutecies vegetais Isso jaacute foi observado para outros gecircneros como
Guignardia e Phyllosticta (BAAYEN et al 2002 GLIENKE-BLANCO et al 2002)
Os endoacutefitos ESBA1 e ES2AB1 foram reunidos no mesmo clado sendo
denominados de Phomopsis sp S6 (FIGURA 19) esses isolados fazem parte do
mesmo agrupamento utilizando-se marcadores RAPD (FIGURA 17)
Os isolados A323 e A334 apresentaram grande identidade geneacutetica (suportado
com bootstrap de 70) e seu agrupamento estaacute representado na figura 19 Esses
isolados natildeo apresentaram identidade moderada a nenhuma das sequumlecircncias
depositadas no GenBank e portanto natildeo foi possiacutevel inferir sobre a espeacutecie desses
endoacutefitos Sugere-se que esses isolados de Aroeira pertenccedilam agrave mesma espeacutecie e
portanto foram denominados de Phomopsis sp S8 Os isolados ES2KF1 ES2WF1 e
89
ESPAC22 endoacutefitos de Espinheira Santa foram reunidos num mesmo clado sendo
denominados de Phomopsis sp S4 (FIGURA 19)
Os isolados A126 e ESJH1 foram reunidos no mesmo clado sendo denominados
de Phomopsis sp S11 eles foram isolados de diferentes plantas hospedeiras O
isolado ESJH1 foi obtido de Espinheira Santa (Maytenus ilicifolia) enquanto o isolado
A126 foi obtido de Aroeira Vermelha (Schinus terebinthifolius) Estes resultados
reforccedilam a dificuldade em inferir espeacutecies do gecircnero Phomopsis com base na planta
hospedeira
Os isolados A116 A124 A123 ESGA1 ESJD1 ESDF1 e ESGF1 natildeo
apresentaram identidade com nenhuma sequumlecircncia depositada no GenBank nem
similaridade com outros isolados analisados no presente trabalho Sugere-se que esses
endoacutefitos pertenccedilam a diferentes espeacutecies
No uacuteltimo clado o isolado ESFH1 apresentou homologia com a regiatildeo ITS1-
rDNA 58S - ITS2 da espeacutecie P theicola (DQ286286 e DQ286287) e com o isolado
SM9638 (FIGURA 19) Estes dois isolados foram obtidos de diferentes plantas
hospedeiras O isolado ESFH1 foi obtido em 2006 de M ilicifolia no Paranaacute enquanto o
isolado SM9638 foi obtido em 1996 como endofiacutetico da planta Spondias mombin no
Estado do Paraacute Esses isolados apresentam baixa similaridade morfoloacutegica (FIGURAS
11 e 12) Estes resultados reforccedilam a dificuldade em inferir espeacutecies do gecircnero
Phomopsis especialmente utilizando-se caracteriacutesticas morfoloacutegicas
No presente trabalho observou-se que vaacuterias espeacutecies de Phomopsis foram
isoladas de um mesmo hospedeiro assim como uma mesma espeacutecie foi encontrada
colonizando diferentes hospedeiros Isto jaacute foi relatado no gecircnero Phomopsis por
Brayford (1990) Farr Castlebury e Rossman (2002) e por Rehner e Uecker (1994)
Esses resultados reforccedilam a necessidade de revisatildeo do conceito de espeacutecie para o
gecircnero Phomopsis uma vez que muitas espeacutecies tecircm sido identificadas com base na
planta hospedeira (GAMBOA-GAITAacuteN LAUREANO e BAYMAN 2005 MURALI
SURYANARAYANAN GEETA 2006)
Os dados morfoloacutegicos e de RAPD foram altamente variaacuteveis e a anaacutelise das
sequumlecircncias da regiatildeo ITS1- 58S - ITS2 do rDNA foi informativa para alguns dos
90
isolados analisados Entretanto mais estudos satildeo necessaacuterios para a identificaccedilatildeo
precisa dessas espeacutecies A literatura eacute escassa quanto a trabalhos de taxonomia
morfologia biologia e ecologia de isolados endofiacuteticos do gecircnero Phomopsis Segundo
Phillips (2006) a identificaccedilatildeo das espeacutecies do gecircnero Phomopsis eacute difiacutecil porque as
espeacutecies natildeo estatildeo claramente definidas e existe uma sobreposiccedilatildeo entre os caracteres
morfoloacutegicos que as definem
A maioria das sequumlecircncias depositadas no GenBank satildeo de isolados
provenientes de lesotildees sendo portanto de espeacutecies patogecircnicas No presente trabalho
eacute possiacutevel que os isolados pertencentes a clados que natildeo se agruparam com nenhuma
sequumlecircncia jaacute depositada pertenccedilam a novas espeacutecies ou ainda a espeacutecies de
endoacutefitos ainda natildeo sequumlenciados Murali Surynarayanan e Geeta (2006)
caracterizaram por meio de sequumlenciamento da regiatildeo ITS e dados morfoloacutegicos 11
isolados endofiacuteticos de Phomopsis obtidos de Tectona grandis e Cassia fistula Eles
sugerem que apesar da grande variabilidade encontrada os isolados devem ser
reunidos em apenas dois grupos entretanto natildeo foi possiacutevel a identificaccedilatildeo em niacutevel
de espeacutecie Segundo os autores isto natildeo foi possiacutevel em funccedilatildeo dos fungos deste
gecircnero natildeo terem hospedeiros especiacuteficos e pela necessidade de revisatildeo do conceito
de espeacutecie em Phomopsis
Farr Castlebury e Rossman (2002) caracterizaram por anaacutelise de sequumlecircncias
ITS1 58S ITS2 e por caracteriacutesticas morfoloacutegicas linhagens de Phomopsis sp
isolados de Vaccinium corymbosum e V macrocarpon Baseados nesse estudo
verificaram que a maioria dos isolados tratava-se de Phomopsis vaccinii uma vez que
as sequumlecircncias agruparam-se com uma cultura referecircncia dessa espeacutecie
Castlebury e Mengistu (2006) avaliaram Phomopsis isolados de soja e outros
hospedeiros combinando dados de sequumlecircncias de ITS do rDNA do gene do fator1 alfa
de elongaccedilatildeo da traduccedilatildeo (ef-1) e genes de actina Foram formados seis grupos de
Phomopsis sendo que trecircs correspondem aos taacutexons P longicolla Diaporthe melonis e
D phaseolorum Os autores concluiacuteram que a ausecircncia de distinccedilatildeo morfoloacutegica e
informaccedilatildeo bioloacutegica tornam problemaacutetica a identificaccedilatildeo de espeacutecies deste gecircnero
91
No presente trabalho com base nos dados de RAPD (FIGURAS 17 e 18) pode-
se sugerir a existecircncia de pelo menos 10 espeacutecies de Phomopsis colonizando de forma
endofiacutetica as plantas de Maytenus ilicifolia analisadas Tais plantas satildeo provenientes de
um uacutenico pomar localizado no CNPFEMPRAPA em ColomboPR Ainda eacute possiacutevel
sugerir a existecircncia de pelo menos seis espeacutecies de Phomopsis colonizando de forma
endofiacutetica a planta de S terebinthifolius analisada neste trabalho Esta planta natildeo
recebeu qualquer tratamento com fungicidas ou outro agrotoacutexico uma vez que se
encontra isolada entre dois blocos do Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas da UFPR (ANEXO
13) Talvez isso justifique a grande diversidade de isolados encontrada Esses dados
demonstram a importacircncia de estudos da comunidade endofiacutetica em plantas medicinais
e apontam para o problema da reduccedilatildeo de diversidade de microrganismos endofiacuteticos
pelo uso continuado de fungicidas
Resultados semelhantes foram obtidos por Gamboa-Gaitaacuten Laureano e Bayman
(2005) estudando isolados de Phomopsis endofiacuteticos da planta medicinal Guarea
guidonia (Meliaceae) Os autores relataram elevados niacuteveis de variabilidade geneacutetica
avaliada pela digestatildeo da regiatildeo ITS e tambeacutem a alta variabilidade morfoloacutegica entre
os isolados avaliados A aacutervore molecular agrupou indiviacuteduos fenotipicamente
diferentes Por outro lado Fernandez e Hanlin (1996) obtiveram resultados
concordantes entre a anaacutelise molecular por RAPD e as caracteriacutesticas morfoculturais
separando os isolados coletados de soja em dois grupos Diaporthe phaseolorum e
Phomopsis longicolla
Pioli et al (2003) caracterizaram por RAPD isolados do complexo
DiaporthePhomopsis coletados de soja na Argentina Eles foram separados em quatro
grupos (i) Diaporthe phaseolorum variedade meridionalis (ii) D phaseolorum variedade
caulivora (iii) D phaseolorum variedade sojae and (iv) Phomopsis longicolla revelando
a existecircncia de variabilidade entre isolados da mesma variedade
92
54 Avaliaccedilatildeo da atividade antimicrobiana 541 Cultura pareada
Os isolados de Phomopsis foram avaliados pela teacutecnica de cultura pareada
contra as linhagens PC1396 e PC3305 do fitopatoacutegeno G citricarpa As interaccedilotildees
foram classificadas em trecircs tipos 1) Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno com
sobreposiccedilatildeo de hifas 2) Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno sem sobreposiccedilatildeo
de hifas e 3) Ausecircncia de inibiccedilatildeo de crescimento Os resultados obtidos estatildeo
apresentados nas Tabelas 9 e 10
Todos os isolados de Phomopsis inibiram significativamente o crescimento das
duas linhagens de Guignardia exceto o isolado ES2WC1 (Phomopsis sp) que
apresentou interaccedilatildeo do tipo 3 em que natildeo houve inibiccedilatildeo significativa do fitopatoacutegeno
apenas 287 e 828 contra PC1396 e PC3305 respectivamente (ANEXO 6 7 8 e
9) Foi observado que as duas linhagens de G citricarpa apresentaram o mesmo tipo
de interaccedilatildeo frente ao mesmo isolado de Phomopsis ou seja natildeo houve variaccedilatildeo
quanto a linhagem do fitopatoacutegeno avaliado Tal observaccedilatildeo reforccedila a importacircncia dos
resultados aqui apresentados
Dos 49 isolados de Phomopsis endoacutefitos de plantas medicinais avaliados 38
inibiram o crescimento das duas linhagens do fitopatoacutegeno G citricarpa com
porcentagem de inibiccedilatildeo superior a 50 Os isolados A333B (Phomopsis sp) ESGF1
(Phomopsis sp S3) SM9638 (P theicola) AT9810 (Phomopsis sp) AT9906
(Phomopsis sp) e ES2WC1 (Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo inferiores
a 50 contra PC1396 e PC3305 os isolados ES80J (Phomopsis sp) e AT9811
(Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo inferiores a 50 apenas contra a
linhagem PC1396 enquanto contra a PC3305 a inibiccedilatildeo foi de 5132 e 5397
respectivamente Por outro lado os isolados de Phomopsis ESFF1 (Phomopsis sp)
SM9714 (Phomopsis sp) e A132 (Phomopsis sp) apresentaram taxas de inibiccedilatildeo
inferiores a 50 apenas contra a linhagem PC3305 enquanto contra PC1396 a
inibiccedilatildeo foi de 5017 6215 e 5492 respectivamente
93
A anaacutelise estatiacutestica demonstrou que haacute diferenccedila significativa entre o controle e
os isolados avaliados O fungicida Derosal apresentou inibiccedilatildeo do crescimento do
fitopatoacutegeno em aproximadamente 19 todos os isolados de Phomopsis que
apresentaram inibiccedilatildeo superior ao fungicida com significacircncia no teste estatiacutestico exceto
o isolado ES2WC1 (Phomopsis sp) como citado anteriormente (TABELA 8 e 9 ANEXO
6 7 8 e 9)
As interaccedilotildees do tipo 1 nas quais ocorre agrave sobreposiccedilatildeo de hifas do endoacutefito
sobre o fitopatoacutegeno sugere a ocorrecircncia de parasitismo Esse tipo de interaccedilatildeo entre
os isolados de Phomopsis e as linhagens de G citricarpa ocorreu em 47 dos isolados
Tais isolados apresentam diferenccedila significativa entre o controle destacando-se os
isolados ESDF1 (Phomopsis sp S7) A134 (Phomopsis sp) (FIGURA 21) ESJD1
(Phomopsis sp S12) e ESJH1 (Phomopsis sp S11) que inibiram o crescimento de G
citricarpa PC1396 em 7338 6885 6826 e 6792 respectivamente A anaacutelise
estatiacutestica demonstra que haacute diferenccedila significativa entre o controle e estes isolados
poreacutem natildeo haacute diferenccedila significativa entre os mesmos (ANEXO 6 7 e 8)
As interaccedilotildees do tipo 2 nas quais natildeo ocorre sobreposiccedilatildeo de hifas ocorreram
em 51 dos isolados destacando-se os isolados ESSD1 (Phomopsis sp) e SM9713
(P longicolla) que inibiram o crescimento da linhagem PC1396 de G citricarpa em
7324 e 6763 respectivamente A anaacutelise estatiacutestica demonstra que haacute diferenccedila
significativa entre o controle e os isolados ESSD1 (Phomopsis sp) e SM9713 (P
longicolla) os isolados de Phomopsis tambeacutem diferem entre si (TABELA 8) Essas
interaccedilotildees devem ser avaliadas posteriormente em microscopia oacutetica para confirmar se
estaacute ocorrendo parasitismo
FIGURA 21 INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa PC1396 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA
Phomopsis A134
G Citricarpa PC1396
Phomopsis SM9713
G Citricarpa PC1396
G Citricarpa PC1396 Controle
G Citricarpa PC1396
Fungicida Derosal
FONTE O autor
94
Isolados Identificaccedilatildeo Tipo de Interaccedilatildeo Inibiccedilatildeo () Fungicida 19
ESDF1 Phomopsis sp S7 1 7338 ESSD1 Phomopsis sp 2 7324 A134 Phomopsis sp 1 6885
ESJD1 Phomopsis sp S12 1 6826 ESJH1 Phomopsis sp S11 1 6792 SM9713 P longicolla 2 6763 ESIE1 Phomopsis sp 1 6758 ESFB2 Phomopsis sp 1 6724
MU0123 P longicolla 2 6663 ESRD1 Phomopsis sp S1 2 6655 ESJG1 Phomopsis sp 2 6621 ESJE1 Phomopsis sp S1 1 6621
ESPAC22 Phomopsis sp S4 1 6516 A131 P michaeliae 2 6393 A126 Phomopsis sp S11 1 6352 A123 Phomopsis sp S2 1 6270 A113 P michaeliae 1 6270
SM9631 Phomopsis sp 1 6265 ES2AB1 Phomopsis sp S6 1 6246 ESJE2 Phomopsis sp S1 1 6246 A323 Phomopsis sp S8 1 6230
SM9714 Phomopsis sp 1 6215 ES2NA1 Phomopsis sp 1 6212
A334 Phomopsis sp S8 1 6189 ESBA1 Phomopsis sp S6 2 6177 A321 P michaeliae 1 6148
ESKD1 Phomopsis sp S1 1 6109 A216B Phomopsis sp 2 6025
ES2KF1 Phomopsis sp S4 2 5939 ESIA1 P michaeliae 2 5904 A135 Phomopsis sp 2 5902 A124 Phomopsis sp S9 2 5861
A115B Phomopsis sp 1 5861 A116 Phomopsis sp S5 2 5820
A215A Phomopsis sp 1 5656 A132 Phomopsis sp 2 5492
ESFH1 P theicola 2 5427 A333A Phomopsis sp 1 5369 ESGA1 Phomopsis sp S10 2 5324
ES2WF1 Phomopsis sp S4 2 5205 ESFF1 Phomopsis sp 2 5017 AT9811 Phomopsis sp 1 4920 ESGF1 Phomopsis sp S3 2 4642 SM9638 P theicola 1 4522 A333B Phomopsis sp 1 4426 ES80J Phomopsis sp 2 4344 AT9810 Phomopsis sp 2 4173 AT9906 Phomopsis sp 2 3078 ES2WC1 Phomopsis sp 3 287
FONTE O autor
TABELA 8 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC1396
95
A interaccedilatildeo do tipo 1 entre os isolados de Phomopsis e a linhagem PC3305 de
G citricarpa ocorreu em 47 dos isolados a reduccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno
apresentou diferenccedila significativa quando comparados com o controle destacando-se
os isolados A215A (Phomopsis sp) A115B (Phomopsis sp) ESDF1 (Phomopsis sp
S7) ESJD1 (Phomopsis sp S12) A123 (Phomopsis sp S2) que inibiram o crescimento
da linhagem PC3305 de G citricarpa em 7947 7616 7152 7119 e 7119
respectivamente (TABELA 9 FIGURA 22) A anaacutelise estatiacutestica demonstra que haacute
diferenccedila significativa entre o controle e os isolados A215A (Phomopsis sp) A115B
(Phomopsis sp) ESDF1 (Phomopsis sp S7) ESJD1 (Phomopsis sp S12) A123
(Phomopsis sp S2) A215A A115B ESDF1 ESJD1 A123 mas os isolados de
Phomopsis natildeo diferem entre si (ANEXO 9)
Os isolados ESRD1 (Phomopsis sp S1) e A135 (Phomopsis sp) apresentaram
as maiores taxas de inibiccedilatildeo do crescimento da linhagem PC3305 de G citricarpa pela
interaccedilatildeo do tipo 2 6887 e 6623 respectivamente (TABELA 9) A anaacutelise estatiacutestica
demonstra que haacute diferenccedila significativa entre o controle e os isolados ESRD1
(Phomopsis sp S1) e A135 (Phomopsis sp) esses isolados de Phomopsis diferem
entre si (ANEXO 9) Essas interaccedilotildees devem ser avaliadas posteriormente ao
microscoacutepio para confirmar se estaacute ocorrendo parasitismo
O isolado SM9713 (P longicolla) inibiu o crescimento do patoacutegeno G citricarpa e
produziu esporos em volta da colocircnia Segundo Boosalis (1964) a esporulaccedilatildeo pode
ocorrer quando determinados hospedeiros estimulam a reproduccedilatildeo de seus parasitas
Resultados semelhantes foram encontrados por Martins-Corder e Melo (1998) onde
observaram que a maioria dos isolados de Trichoderma spp antagonistas colonizou e
produziu esporos em abundacircncia sobre as colocircnias de Verticillium dahliae
As interaccedilotildees do tipo 2 mostram inibiccedilatildeo mutua na qual o endoacutefito natildeo sobrepotildee
a colocircnia do fitopatoacutegeno apesar de inibir seu crescimento Segundo Bell et al (1982)
os antagonistas selecionados pelo confronto direto satildeo aqueles que apresentam
crescimento sobre o fitopatoacutegeno Poreacutem a relaccedilatildeo entre o tipo de interaccedilatildeo e a
porcentagem de inibiccedilatildeo observada nos resultados natildeo satildeo congruentes uma vez que
96
a porcentagem de inibiccedilatildeo para alguns isolados com interaccedilatildeo do Tipo 2 eacute maior do que
para aqueles com interaccedilatildeo do Tipo 1
Isolados Identificaccedilatildeo Tipo de Interaccedilatildeo
Inibiccedilatildeo ()
Fungicida 1921 A215A Phomopsis sp 1 7947 A115B Phomopsis sp 1 7616 ESDF1 Phomopsis sp S7 1 7152 ESJD1 Phomopsis sp S12 1 7119 A123 Phomopsis sp S2 1 7119
ESFB2 Phomopsis sp 1 7086 ESJE2 Phomopsis sp S1 1 7020 ESJH1 Phomopsis sp S11 1 7020
SM9631 Phomopsis sp 1 6921 ESRD1 Phomopsis sp S1 2 6887 A135 Phomopsis sp 2 6623 A126 Phomopsis sp S11 1 6490
ESPAC22 Phomopsis sp S4 1 6424 A131 P michaeliae 2 6424
ESJE1 Phomopsis sp 1 6358 ES2KF1 Phomopsis sp S4 2 6298
A334 Phomopsis sp S8 1 6291 A124 Phomopsis sp S9 2 6258 ESIA1 P michaeliae 2 6126 ESKD1 Phomopsis sp S1 1 5993 ESSD1 Phomopsis sp L5 2 5960 A134 Phomopsis sp 1 5861 A113 P michaeliae 1 5795
TABELA 9 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 (CONTINUA)
FIGURA 22 INTERACcedilAtildeO DOS ISOLADOS DE Phomopsis CONTRA Guignardia citricarpa 3305 PELA TEacuteCNICA DE CULTURA PAREADA
G citricarpa PC3305
Phomopsis ESRD1
Phomopsis ESDF1
G citricarpa PC3305
G citricarpa PC3305 controle
Fungicida Derosal
G citricarpa PC3305
FONTE O autor
97
A333A Phomopsis sp 1 5728 ESIE1 Phomopsis sp 1 5695 ESJG1 Phomopsis sp 2 5662 A323 Phomopsis sp S8 1 5629
ES2AB1 Phomopsis sp S6 1 5596 ESBA1 Phomopsis sp S6 2 5563 A116 Phomopsis sp S5 2 5464
AT9811 Phomopsis sp 1 5397 A216B Phomopsis sp 2 5364 A321 P michaeliae 1 5331
SM9713 P longicolla 2 5298 ES2NA1 Phomopsis sp 1 5265 MU0123 P longicolla 2 5232 ESFH1 Phomopsis sp 2 5132 ES80J Phomopsis sp 2 5132 ESGA1 Phomopsis sp S10 2 5079
ES2WF1 Phomopsis sp S4 2 5033 ESFF1 P theicola 2 4934
SM9714 Phomopsis sp 1 4735 A132 Phomopsis sp 2 4470
A333B Phomopsis sp 1 3775 ESGF1 Phomopsis sp S3 2 3344 SM9638 P theicola 1 2781 AT9810 Phomopsis sp 2 2649 AT9906 Phomopsis sp 2 2583 ES2WC1 Phomopsis sp 3 828
FONTE O autor 542 Teste para detecccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
No teste de metaboacutelitos volaacuteteis observou-se reduccedilatildeo do crescimento da
linhagem PC1396 e PC3305 de G citricarpa apoacutes a retirada do celofane onde
inicialmente foram inoculados os isolados de Phomopsis Todos os isolados testados
inibiram significativamente o crescimento das duas linhagens de G citricarpa Os
isolados A115B (Phomopsis sp) A134 (Phomopsis sp) ESFF1 (Phomopsis sp)
ESFH1 (Phomopsis theicola) A123 (Phomopsis sp S2) e S2WF1 (Phomopsis sp S4)
apresentaram maior inibiccedilatildeo do crescimento das duas linhagens do fitopatoacutegeno
(ANEXO 10 e 11 e FIGURA 23) sugerindo que a interaccedilatildeo entre os isolados de
Phomopsis e o fitopatoacutegeno ocorre devido agrave produccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
TABELA 9 PORCENTAGEM DE INIBICcedilAtildeO E TIPOS DE INTERACcedilAtildeO ENTRE OS ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis E Guignardia citricarpa ndash PC3305 (CONTINUACcedilAtildeO)
98
FONTE O autor FIGURA 23 AVALIACcedilAtildeO DO CRESCIMENTO DAS COLOcircNIAS DO FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 e PC3305 INOCULADAS APOacuteS RETIRADA DO PAPEL CELOFANE PARA DETECCcedilAtildeO DE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS EM MEIO BDA APOacuteS 21 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
Nota a Placa com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC3305 inoculado apoacutes retirada do celofane onde previamente foi inoculado o isolado ESFH1 b Placa controle com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC3305 c Placa com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396 inoculado apoacutes retirada do celofane onde previamente foi inoculado o isolado ESFH1 d Placa controle com o fitopatoacutegeno G citricarpa PC1396
FIGUEIREDO (2006) utilizou a teacutecnica de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis em
Pestalotiopsis isolados endofiacuteticos de Maytenus ilicifolia e observou uma reduccedilatildeo do
crescimento da linhagem PC1396 de G citricarpa demonstrando que a interaccedilatildeo
ocorre principalmente pela produccedilatildeo de metaboacutelitos natildeo volaacuteteis
Os resultados apresentados aqui demonstram o grande potencial que tais
linhagens endofiacuteticas de Phomopsis possuem como agentes de controle da Mancha
Preta dos Citros e o seu potencial na produccedilatildeo de metaboacutelitos
543 Avaliaccedilatildeo da accedilatildeo dos Extratos
Na avaliaccedilatildeo dos extratos quanto agrave inibiccedilatildeo do crescimento das linhagens
PC1396 e PC3305 de G citricarpa os resultados indicam que a maioria dos extratos
metanoacutelicos produzidos a partir dos isolados de Phomopsis reduziram o crescimento
micelial de ambas as linhagens do fitopatoacutegeno da MPC A inibiccedilatildeo ocorreu devido aos
metaboacutelitos secundaacuterios produzidos pelos isolados endofiacuteticos quando comparados
com o crescimento micelial dos controles com metanol (onde o extrato foi diluiacutedo) e
com aacutegua destilada (FIGURA 24 25 e TABELA 10)
a b c d
99
Foi observado que os isolados de Phomopsis que apresentaram as maiores
porcentagens de inibiccedilatildeo pela teacutecnica de cultura pareada tambeacutem inibiram o
crescimento quando foi utilizado o extrato metanoacutelico Entretanto o isolado ES2WC1
(Phomopsis sp) que natildeo inibiu o crescimento pela teacutecnica de cultura pareada
apresentou reduccedilatildeo no crescimento micelial dos dois fitopatoacutegenos avaliados
utilizando-se o seu extrato metanoacutelico Provavelmente essa falta de inibiccedilatildeo pela
teacutecnica de cultura pareada tenha ocorrido pelo fato do isolado ES2WC1 (Phomopsis
sp) apresentar crescimento lento fazendo com que o crescimento do fitopatoacutegeno natildeo
diferisse significativamente do controle
Os isolados ES80J (Phomopsis sp) ESFF1 (Phomopsis sp) A132 (Phomopsis
sp) A333B (Phomopsis sp) e SM9638 (P theicola) natildeo inibiram o crescimento micelial
de nenhum dos fitopatoacutegenos avaliados Para alguns isolados de Phomopsis natildeo foi
possiacutevel determinar o potencial antimicrobiano dos extratos metanoacutelicos pois houve
grande variaccedilatildeo de accedilatildeo entre as repeticcedilotildees do experimento
FONTE O autor
C
D E F
A B
NOTA A Placa controle com aacutegua destilada autoclavada B Placa controle com metanolC Placa controle com fungicida Derosal reg (10 mgmL) D Placa com extrato metanoacutelicodo isolado ES2WC1 E Placa com extrato metanoacutelico do isolado A215A F Placa comextrato metanoacutelico do isolado ESDF1
FIGURA 24 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NOCRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC3305 DE G citricarpa EMMEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
100
Rodrigues-Heerklotz et al (2001) elucidaram a estrutura quiacutemica e a siacutentese
assimeacutetrica de um novo metaboacutelito o aacutecido guignardico produzido pelo fungo endofiacutetico
Guignardia sp isolado de Spondias mombin Silva et al (2005) isolaram dois
metaboacutelitos de Phomopsis cassiae endofiacutetico de Cassia specatabilis 24-diidroxi-56-
dimetil benzoato de etila e phomopsilactona que exibiram forte atividade antifuacutengica
contra fitopatoacutegenos bem como citotoxicidade contra a linhagem celular de tumor
cervical humano (HeLa) Estudos adicionais devem ser realizados para determinar a
estrutura quiacutemica produzida pelos endoacutefitos de Phomopsis estudados
NOTA A Placa controle com aacutegua destilada autoclavada B Placa controle commetanol C Placa controle com fungicida Derosal reg (10 mgmL)D Placa com extratometanoacutelico do isolado ES2WC1 E Placa com extrato metanoacutelico do isolado ESGA1 FPlaca com extrato metanoacutelico do isolado ESSD1
FONTE O autor FIGURA 25 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NOCRESCIMENTO MICELIAL DAS COLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 DE G citricarpa EMMEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTO A 28ordmC
C
D E F
A B
101
Os resultados da tabela 10 revelam que os isolados endofiacuteticos de Phomopsis
spp avaliados satildeo bastante promissores demonstrando um potencial na produccedilatildeo de
metaboacutelitos Resultados semelhantes foram obtidos por Moller Weber e Dreyfuss
(1996) que avaliaram a accedilatildeo de endoacutefitos de plantas tropicais com alta produccedilatildeo de
metaboacutelitos secundaacuterios
Identificaccedilatildeo Isolados Inibiccedilatildeo PC3305 Cultura Pareada
Inibiccedilatildeo PC3305 Extrato
Metanoacutelico
Inibiccedilatildeo () PC1396 Cultura Pareada
Inibiccedilatildeo PC1396 Extrato
Metanoacutelico Derosal Fungicida 1921 I 19 I
P longicolla SM9713 5298 I 6763 I P longicolla MU0123 5232 ND 6663 I P michaeliae A131 6424 I 6393 I P michaeliae ESIA1 6126 I 5904 I Phomopsis sp A333A 5728 I 5369 I P michaeliae A321 5331 I 6148 I P michaeliae A113 5795 ND 627 ND Phomopsis sp S2 A123 7119 ND 627 ND P theicola ESFH1 5132 I 5427 I Phomopsis sp ESFF1 4934 NI 5017 NI P theicola SM9638 2781 NI 4522 NI Phomopsis sp S4 ES2WF1 5033 I 5205 I Phomopsis sp S3 ESGF1 3344 I 4642 I Phomopsis sp S10 ESGA1 5079 I 5324 I Phomopsis sp S1 ESRD1 6887 I 6655 I Phomopsis sp S8 A334 6291 I 6189 I Phomopsis sp S9 A124 6258 I 5861 I Phomopsis sp S7 ESDF1 7152 I 7338 I Phomopsis sp ESSD1 596 I 7324 I Phomopsis sp S6 ES2AB1 5596 I 6246 I Phomopsis sp S6 ESBA1 5563 I 6177 I Phomopsis sp S11 A126 649 ND 6352 ND Phomopsis sp S12 ESJD1 7119 I 6826 I Phomopsis sp S1 ESJE1 6358 I 6621 I Phomopsis sp S1 ESJE2 702 ND 6246 ND Phomopsis sp S1 ESKD1 5993 ND 6109 ND Phomopsis sp A115B 7616 I 5861 I Phomopsis sp ESFB2 7086 I 6724 I Phomopsis sp S11 ESJH1 702 I 6792 I Phomopsis sp A135 6623 I 5902 ND Phomopsis sp A134 5861 I 6885 I Phomopsis sp ESIE1 5695 I 6758 I Phomopsis sp ESJG1 5662 ND 6621 I
TABELA 10 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO CRESCIMENTO MICELIAL DASCOLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DE CRESCIMENTOA 28ordmC (CONTINUA)
102
Phomopsis sp AT9811 5397 I 492 I Phomopsis sp A216B 5364 I 6025 I Phomopsis sp ES2NA1 5265 I 6212 I Phomopsis sp SM9714 4735 I 6215 I Phomopsis sp ES2WC1 828 I 287 I Phomopsis sp SM9631 6921 ND 6265 ND Phomopsis sp S4 ESPAC22 6424 ND 6516 ND Phomopsis sp S4 ES2KF1 6298 ND 5939 ND Phomopsis sp S8 A323 5629 ND 623 ND Phomopsis sp S5 A116 5464 ND 582 ND Phomopsis sp AT9810 2649 ND 4173 ND Phomopsis sp AT9906 2583 ND 3078 ND Phomopsis sp ES80J 5132 NI 4344 NI Phomopsis sp A132 447 NI 5492 NI Phomopsis sp A333B 3775 NI 4426 NI Phomopsis sp A215A 7947 I 5656 I
FONTE O autor
NOTA I- Inibiccedilatildeo do crescimento do fitopatoacutegeno NI- Natildeo ocorreu inibiccedilatildeo do fitopatoacutegeno ND- Natildeo foi determinado a inibiccedilatildeo
No Brasil as plantas Spondias mombin e A tomentosum tecircm sido usadas na
medicina devido as suas propriedades antimicrobianas (AJAO SHONUKAN e FEMI
1984) Os isolados de Phomopsis obtidos como endoacutefitos de S mombin (SM9713 (P
longicolla) SM9638 (P theicola) e SM9714 (Phomopsis sp)) e A tomentosum (AT9810
(Phomopsis sp) AT9811 (Phomopsis sp) e AT9906 (Phomopsis sp)) avaliados no
presente trabalho jaacute haviam sido relatados por Corrado e Rodrigues (2004) como
produtores de compostos bioativos Os autores relatam que os extratos metanoacutelicos
inibiram o crescimento de E coli S aureus P aeruginosa C albicans A niger e F
oxysporum No presente trabalho os isolados de S mombin e A tomentosum inibiram
o crescimento de Guignardia citricarpa confirmando o potencial desses isolados em
produzir substacircncias bioativas mais estudos devem ser realizados para verificar o
potencial antimicrobiano desses extratos contra bacteacuterias patogecircnicas e
fitopatogecircnicas
A planta Schinus terebinthifolius eacute usada no Brasil na medicina alternativa contra
doenccedilas da coacuternea (CORREcircA 1926) doenccedilas reumaacuteticas uacutelceras feridas tumores
linfaacuteticos erisipela e outras moleacutestias provocadas por bacteacuterias que se manifestam em
forma de edema ou eritema (BALBACH 1992) As linhagens de Phomopsis isoladas de
S terebinthifolius avaliadas nesse trabalho A135 (Phomopsis sp) A113 (P michaelae)
TABELA 10 AVALIACcedilAtildeO DA ACcedilAtildeO DOS EXTRATOS METANOacuteLICOS NO CRESCIMENTO MICELIAL DASCOLOcircNIAS DA LINHAGEM PC1396 E PC3305 DE G citricarpa EM MEIO BDA APOacuteS 14 DIAS DECRESCIMENTO A 28ordmC (CONTINUACcedilAtildeO)
103
A115B (Phomopsis sp) A323 (Phomopsis sp S8) A132 (Phomopsis sp) A134
(Phomopsis sp) A333B (Phomopsis sp) A321 (P michaelae) A126 (Phomopsis sp
S11) A216B (Phomopsis sp) A334 (Phomopsis sp S8) A116 (Phomopsis sp S5)
A215A (Phomopsis sp) A124 (Phomopsis sp S9) A333A (Phomopsis sp) A131 (P
michaeliae) e A123 (Phomopsis sp S2) apresentaram excelentes resultados contra G
citricarpa
Extratos da planta M ilicifolia jaacute foram descritos na literatura apresentando
atividade antitumoral tambeacutem usado como analgeacutesico antinflamatoacuterio e antiaacutecido
(JORGE 2004 DUARTE 2005) Pileggi (2006) isolou microrganismos endofiacuteticos de
plantas de Maytenus ilicifolia do mesmo pomar investigado neste trabalho e avaliou o
potencial farmacoloacutegico dos mesmos Entre os fungos e bacteacuterias testados 15
apresentaram potencial para controle bioloacutegico
Figueiredo (2006) isolou fungos endofiacuteticos de plantas de M ilicifolia do mesmo
pomar investigado neste trabalho especialmente Pestalotiopsis spp e os avaliou quanto
ao potencial antimicrobiano contra bacteacuterias patogecircnicas em humanos e o fitopatoacutegeno
G citricarpa Os extratos metanoacutelicos de dois isolados exibiram accedilatildeo fungistaacutetica na
germinaccedilatildeo e no crescimento micelial das linhagens PC1396 e PC3305 de G
citricarpa Aleacutem disso dois extratos de Pestalotiopsis spp inibiram o crescimento dos
microrganismos-teste (S aureus oxalino resistente Klebsiella pneumoniae
Micrococcus luteus Staphylococcus aureus e Escherichia coli)
No presente trabalho observou-se que as linhagens de Phomopsis spp isolados
de M ilicifolia apresentaram excelentes resultados in vitro contra G citricarpa Pouco se
conhece a respeito da comunidade endofiacutetica existente nessas plantas e os resultados
desse trabalho demostram que abrigam uma grande variabilidade de PC1396 e
PC3305 espeacutecies de Phomopsis com portencial para bioprospecccedilatildeo Isto reforccedila a
importacircncia de estudos de microrganismos endofiacuteticos em plantas medicinais em
especial M ilicifolia e S terebinthifolius Faz-se necessaacuterio tambeacutem o estudo da
composiccedilatildeo quiacutemica dos extratos avaliados
104
6 CONCLUSOtildeES Os resultados obtidos no presente trabalho permitiram as seguintes conclusotildees
bull As espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo podem ser identificadas
apenas por caracteriacutesticas morfoloacutegicas ou marcadores moleculares
RAPD sendo necessaacuteria uma anaacutelise polifaacutesica incluindo
sequumlenciamento de vaacuterias regiotildees do genoma
bull As plantas medicinais analisadas satildeo colonizadas por grande
diversidade de espeacutecies de Phomopsis com grande variabilidade
morfoloacutegica e geneacutetica intra e interespeciacuteficas
bull As plantas de Maytenus ilicifolia analisadas satildeo colonizadas
endofiticamente por pelo menos 10 espeacutecies de Phomopsis sendo
possiacutevel identificar por sequumlecircncias ITS do rDNA isolados de P theicola e
P michaeliae
bull A planta de Schinus terebinthifolius analisada eacute colonizada
endofiticamente por pelo menos 6 espeacutecies de Phomopsis sendo
possiacutevel identificar por sequumlecircncias ITS do rDNA isolados de P
michaeliae
bull As espeacutecies de Phomopsis analisadas natildeo satildeo hospedeiro-especiacuteficas
sendo necessaacuteria a redefiniccedilatildeo do conceito de espeacutecie para este gecircnero
bull Os isolados de Phomopsis spp apresentaram grande potencial no
controle in vitro do fungo G citricarpa Os isolados ESIA1 e A131 (P
michaeliae) ESJE1 ESJE2 ESKD1 e ESRD1 (Phomopsis sp S1) A123
(Phomopsis sp S2) ES2KF1 e ESPAC22 (Phomopsis sp S4) ESDF1
105
(Phomopsis sp S7) A334 (Phomopsis sp S8) A124 (Phomopsis sp
S9) A126 e ESJH1 (Phomopsis sp S11) ESJD1 (Phomopsis sp S12) e
os isolados A134 A135 A115B A215A SM9631 ESFB2 e ESSD1
(Phomopsis sp) foram os mais promissores em inibir o crescimento das
linhagens PC1396 e PC3305 de G citricarpa nas metodologias
avaliadas
106
7 REFEREcircNCIAS BIBLIOGRAacuteFICAS ALBERTS B LEWIS J RALF M ROBERTS K WATSON J D Molecular Biology of the Cell 4ordf ed New York Garland Publishing 2004 ALICE C B SIQUEIRA N C S MENTZ L A SILVA G A A B JOSEacute K F D Plantas medicinais de uso popular Atlas farmacognoacutestico Canoas Editora da ULBRA 1995 ALZATE-MARIN A L BAIacuteA G S FALEIRO F G CARVALHO G A PAULA JR T J MOREIRA M A BARROS E G Anaacutelise da diversidade geneacutetica de raccedilas de Colletotrichum lindemuthianum que ocorrem em algumas regiotildees do Brasil por marcadores RAPD Fitopatologia Brasileira v 22 p 85-88 1997 ALMEIDA A M R Efeito de luz e meios de cultura sobre crescimento micelial formaccedilatildeo e tamanho de picniacutedios e esporulaccedilatildeo de isolados de Phomopsis sojae Leh In SEMINAacuteRIO NACIONAL DE PESQUISA DE SOJA Brasiacutelia 2 1981 Londrina Anais Brasiacutelia EmbrapaSNI 1982 p 216-226 ANCHORENA-MATIENZO P Re-identificaccedilatildeo e caracterizaccedilatildeo geneacutetica de levedura IZ-987 utilizando marcadores moleculares 2002 81p Dissertaccedilatildeo (Mestrado) ndash ESALQ USP Piracicaba Satildeo Paulo 2002 ANJOS J R N CHARCHAR M J A GUIMARAtildeES D P Ocorrecircncia de Queima das Folhas Causada por Phomopsis sp Em Aroeira No Distrito Federal Fitopatologia Brasileira v 26 n 3 p 649-650 2001 ARAUacuteJO J M SILVA A C AZEVEDO J L Isolation of endophytic actinomycetes from roots and leaves of maize (Zea mays L) Brazilian Archives of Biology and Technology v 43 n 4 p 447-451 2000 ARAUacuteJO W L AZEVEDO J L LIMA A O S MARCOM J SOBRAL J L LACAVA P T Manual Isolamentos de fungos endofiacuteticos Escola Superior da Agricultura Luiz de Queiroz Universidade de Satildeo Paulo Piracicaba 2002 ARNOLD E A MEJIacuteA C L KYLLO D ROJAS E I MAYNARD Z ROBBINS N HERRE E A Fungal endophytes limit pathogen damage in a tropical tree PNAS v 100 p 15649-15654 2003 AZEVEDO J L Microrganismos Endofiacuteticos In MELO I S AZEVEDO J L Ecologia Microbiana Editora EMBRAPA Jaguariuacutena-SP p 117-137 1998 AZEVEDO J L JUacuteNIOR W M PEREIRA J O ARAUacuteJO W L Endophytic microganisms a review on insect control and recent advances on tropical plants
107
Environmental Biotechnology v 3 n1 p 40-65 2000 BAAYEN R P BONANTS P J M VERKLEY G CARROL G C VAN DER AA M WEERDT M BROUWERSHAVEN G C SCHUTTE G C MACCHERONI JR W GLIENKE-BLANCO C AZEVEDO J L Nonpathogenic Strains of the Citrus Black Spot Fungus Guignardia citricarpa Identified as a Cosmopolitan Endophyte of Woody Plants Guignardia mangiferae (Phyllosticta capitalensis) Phytopathology v 92 p 464-477 2002 BAKER R E D Studies in the pathogenicity of tropical fungi II The occurrence of latent infections in developing fruits Annals of Botany London v 2 p 919-931 1938 BAO J R LAZAROVITS G Differential colonization of tomato roots by nonpathogenic and pathogenic Fusarium oxysporum strains may influence Fusarium wilt control Phytopathology Lancaster v 91 p 449-456 2001 BELL D K WELLS H D MARKHABELL D K WELLS C R In vitro antagonism ot Trichoderma species against six fungal plant pathogens Phytopathology v 72 p 379-382 1982 BETTIOL W GHINI R Controle Bioloacutegico In Manual de Fitopatologia Bergamin FILHO A AMORIM L e KIMATI H (Eds) 3ordf ed Satildeo Paulo Ceres 1995 919p BILLS G DOMBROWSKY A PELAEZ F POLISHOOK J Recent and future discoveries of pharmacologically active metabolites from tropical fungi Tropical mycology micromycetes v 2 p 165-194 2002 BITTENCOURT J V M Variabilidade geneacutetica em populaccedilotildees naturais de Maytenus ilicifolia por meio de marcadores RAPD Curitiba 2000 58p Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Agronomia ndash Produccedilatildeo Vegetal) Universidade Federal do Paranaacute BITTENCOURT J V M Variabilidade Geneacutetica em Populaccedilotildees Naturais de Maytenus Ilicifolia por Meio de Marcadores RAPD Scientia Agraacuteria v 2 p1-2 2001 BLANCO C G Guignardia citricarpa Kiely Anaacutelise geneacutetica cariotiacutepica e interaccedilatildeo com o hospedeiro Piracicaba 1999 Tese de Doutorado- escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Universidade de Satildeo Paulo BOSSALIS M C Hyperparasitism Annual Review of Phytopathology v 2 p 363-375 1964 BRAYFORD D Vegetative incompatibility in Phomopsis from elm Mycological Research v 94 n 6 p 745-752 1990
108
BODDY L GRIFFITH G S Role of endophytes and latent invasion in the development of decay communities in sapwood of angiospermous trees Sydowia v 41 p 41-73 1989 BUSSABAN B LUMYONG S LUMYONG P McKENZIE E H HYDE K D Endophytic fun i from Amomum siamense Canadian Journal of Microbiology v 47 n 10 p 943-948 2001 CAMPAROTO M L TEIXEIRA R O MANTOVANI M S VICENTINI P Effects of Maytenus ilicifolia Mart and Bauhinia candicans Benth onion root-tip and rat bone-marrow cells Genetics and Molecular Biology v 25 n1 p 85-89 2002 CARDOSO-FILHO J L Efeito de extratos de albedo de laranja (Citrus sinesis) dos indutores de resistecircncia aacutecido salicilico acil-benzolar ndash S- metil e Saccharomyces cerevisiae no controle de Phyllosticta citricarpa (Teleomorfo Guignardia citricarpa) Piracicaba 2003 125f Dissertaccedilatildeo (Doutorado) ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo CARROLL G C CARROLL F E Studies on the incidence of coniferous needle endophytes in the Pacitfic Northwest Canadian Jornal of Botany v 56 p 3034-3043 1978 CARROLL G C The Biology of endophytism in plants with particular reference to woody perennials In FOKKEMA N J HEAVEL J Van Der (Eds) Microbiology of the Phyllosphere Cambridge Cambridge University Press 1986 p 205-222 CASTLEBURY LA MENGISTU A Phylogenetic distinction of DiaporthePhomopsis isolates from soybeans [resumo] Systematic Mycology and Microbiology I v 57 n 4 p 13 2006 CENARGEN Banco de Dados on Line Disponiacutevel em lthttpicewall2cenargenembrapabr84micwebmichtmlfgbd01aspPgt Acesso em Maio de 2005 CERVI A C PACIORNIK E F VIEIRA R F MARQUES L C Espeacutecies vegetais de um remanescente de Floresta de Araucaacuteria (Curitiba-Brasil) estudo preliminar I Acta Bioloacutegica Paranaense Curitiba v18 n1-4 p73-114 1989 CHAREPRASERT S PIAPUKIEW J THIENHIRUN S WHALLEY A J S SIHANONTH P Endophytic fungi of teak leaves Tectona grandis L and rain tree leaves Samanea saman Merr Journal of Microbiology amp Biotechnology v 22 n 5 p 481-486 2006 CHRISTO D Variabilidade Geneacutetica e Diferenciaccedilatildeo Molecular de Isolados Endofiacuteticos e Patogecircnicos de Guignardia spp e Phyllosticta sp Curitiba 2002
109
78 f Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Geneacutetica) ndash Universidade Federal do Paranaacute CLAY K Effects of fungal endophyteson the seed and seedling biology of Lolium perenne and Festuca arundinacea Oecologia (Berlin) Berlin v73 p 358-362 1987 CLAY K Fungi and the food of the goods Nature v 427 p 401-402 2004 COCHRANE VW Physiology of fungi New York John Wiley 1958 524p COCKRUM P A PETTERSON D S EDGAR J A 1994 Identification of novel Phomopsins in Lupin seed extracts In Plant-associated toxins Agricultural phytochemical and ecological aspects DORLING P R p 232-237 Wallingford CAB In-ternational COELHO AG Software Bood v 3 04 2005 COIMBRA R SILVA E D Notas de Fitoterapia 2ordf ed Laboratoacuterio Cliacutenico Silva Arauacutejo SA 1958 CORDEIRO P J M VILEGAS J H Y LANCcedilAS F M HRGC-MS Analysis of Terpenoids from Maytenus ilicifolia and Maytenus aquifolium (ldquoEspinheira Santardquo) Journal of Brazilian Chemistry Society v 10 p 523-526 1999 CORRADO M RODRRIGUES KF Antimicrobial evaluation of fungal extracts produced by endophytic strains of Phomopsis sp Journal Basic Micrrobiol v44 p157-160 2004 CORREcircA RMS Caracterizaccedilatildeo de Phomopsis e Phoma obtidos de sementes de espeacutecies florestais 1995 72p Dissertaccedilatildeo (Mestrado em Fitopatologia) ndash Universidade Federal de Lavras Lavras 1995 CRONQUIST A An integrated system of classification of flowering plants New York Columbia University Press 1981 CROUS PW WINGFIELD MJ FERREIRA FA ALFENAS A Mycosphaerella parkii and Phyllosticta eucalyptorum two new species from eucaliptus leaves in Brazil Mycological Research Cambridge v97 p 582-584 1993 CRUZ GL Livro Verde VolII 1a Editora Belo Horizonte-Minas Gerais 1965 DALZOTO P R GLIENKE-BLANCO C KAVA-CORDEIRO V ARAUacuteJO W L AZEVEDO J L RAPD analyses of recombinatiom process in the entomopathogenic fungus Beauveria bassiana Mycological Research v 107 p 1069-1074 2003 DJAOUIDA R SORBO G D REGGIO C ZOINA A FIRRAO G Polymorphisms in nuclear rDNA and mtDNA reveal the polyphyletic nature of isolates of Phomopsis
110
pathogenic to sunflower and a tight monophyletic clade of defined geographic origin Mycologia v 108 n 4 p 393-402 2004 DUARTE M R DEBUR M C Stem and leaf morphoanatomy of Maytenus ilicifolia Fitoterapia v 76 p 41-49 2005 EDGINTON L V KNEW K L BARRON G L Fungitoxic spectrum of benzimidazole compounds Phitopathology v 62 n 7 p 42-44 1971 EMBRAPA Fungos Endofiacuteticos Introduccedilatildeo Disponiacutevel em lthttpwwwcnpmaembrapabrprojetosendofiticosintroducaohtm1gt Acesso em Maio de 2005 ERNEST M MENDGEN W K WIRSEL W Endophytic Fungal Mutualists Seed-Borne Stagonospora spp Enhance reed biomass production in axenic microosms Molecular Plant-Microbe Interations v 16 n 7 p 580-587 2003 ESPOacuteSITO E AZEVEDO J L Fungos uma introduccedilatildeo agrave biologia bioquiacutemica e biotecnologia Caxias do Sul Edusc 510p 2004 ETHUR L Z CEMBRANEL C Z SILVA A C F Seleccedilatildeo de Trichoderma spp visando controle de Sclerotinia sclerotiorium in vitro Ciecircncia Rural v 31 n 5 p 885-887 2001 EZRA D STROBEL G A Effects of substrate on the bioactivity of volatile antimicrobials produced by Muscodor albus Plant Science St Paul v165 p913-922 2003 EZRA D CASTILLO U F STROBEL G A HESS W M PORTER H JENSEN J B CONDRON M A M TEPLOW D B SEARS J MARANTA M HUNTER M WEBER B YAVER D Coronamycins peptide antibiotics produced by a verticillate Streptomyces sp (MSU-2110) endophytic on Monstera sp Microbiology v 150 p 785-793 2004 FARR D F CASTLEBURY L A ROSSMAN A Y Morphological and molecular characterization of Phomopsis vaccinii and additional isolates of Phomopsis from blueberry and cranberry in the eastern United States Mycologia v 94 n 3 p 494-504 2002 FELSENTEIN J Conficence limits on phylogenies an approch using the bootstrap International Journal of Organic Evolution Lancaster v 39 p 366-369 1985 FERNANDEZ F A HANLIN R T Morphological and RAPD analyses of Diaporthe phaseolorum from soybean Mycologia v 88 n 3 p 425-440 1996
111
FERREIRA M E Aplicaccedilatildeo de Marcadores Moleculares no Mapeamento Geneacutetico de Plantas In III Curso de Marcadores Moleculares EMBRAPACENARGEN ndash Brasiacutelia DF 1994 FERREIRA D F Anaacutelise estatiacutestica por meio do SISVAR para Windows Versatildeo 40 In REUNIAtildeO ANUAL DA REGIAtildeO BRASILEIRA DA SOCIEDADE INTERNACIONAL DE BIOMETRIA 45 2000 Satildeo Carlos Anais Satildeo Carlos SSPSIB 2000 p 255-268 VAN SOEST P J Nutritional ecology of the ruminant 2 ed Ithaca Cornell University PressConstock Pub-lish1994 476 p FERREIRA MP OLIVEIRA CNOLIVEIRA BA LOPES MJALZAMORA F VIEIRA MAR A lyophilized aqueous extract of Maytenus ilicifolia leaves inhibits histamine-mediated acid secretion in isolated frog gastric mucose Planta v 219 p 319-324 2004 FIALHO M B Efeito in vitro Sacharomyces cerevicea sobre Guignardia citricarpa agente causal da pinta preta dos citros Piracicaba 2004 60f Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo FIGUEIREDO J G Bioprospecccedilatildeo Caracterizaccedilatildeo Morfoloacutegica e Molecular de Endoacutefitos de Maytenus ilicifolia com Ecircnfase EM Pestalotiopsis spp Curitiba 2006 Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade Federal do Paranaacute FRISVAD J C SAMSON R A Polyphasic taxonomy of Penicillium subgenus Penicillium - A guide to identification of food and air-borne terverticillate Penicillia and their mycotoxins Studies in Mycology v 49 p 1-173 2004 FRISVAD J C FRANK J M HOUBRAKEN J A M P KUIJPERS A F A SAMSON R A New ochratoxin A producing species of Aspergillus section Circumdati Studies in Mycology v 50 p 23-43 2004 FUNGARO M H P VIEIRA M L C Aplicaccedilotildees da PCR em ecologia molecular In MELO I S AZEVEDO J L (Eds) Ecologia microbiana Jaguarariuacutena Embrapa-CNPMA 1998 cap8 p205-227 FUNGARO M H P PCR na Micologia Biotecnologia Ciecircncia amp Desenvolvimento Brasiacutelia n14 p12-16 2000 GAMBOA-GAITAacuteN M A LAUREANO S BAYMAN P Endophytic Phomopsis Strains from of Guarea guidonia (Meliaceae) Journal of Science v 41 n 2 p 215-224 2005 GAO X ZHOU H XU D YU C CHEN Y QU L Hi h diversity of endophytic fun i from the pharmaceutical plant Heterosmilax japonica Kunth
112
revealed y cultivation-independent approach FEMS Microbiology Letters v 249 p 255-266 2005 GLIENKE C CHRISTO D MACCHERONI JR W AZEVEDO J L High molecular diversity of the fungus Guignardia citricarpa and Guignardia mangiferae and new primers for the diagnosis of the Citrus Black Spot Brazilian Archives of Biology and Technology Submetido 2007 GLIENKE C Variabilidade geneacutetica no fungo endoacutefito Guignardia citricarpa kiely detectada por RAPD Curitiba 1995 Dissertaccedilatildeo de Mestrado- Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade federal do Paranaacute GLIENKE-BLANCO C AGUILAR-VILDOSO CI VIEIRA MLC BARROSOP A V AZEVEDO JL Genetics variabilityb in the endophytic fungus Guignardia citricarpa isolated from citrus plants Genetics and Molecular Biology v 25 n 2 p 251-255 2002 GOacuteES A Etiologia aspectos epidemioloacutegicos e controle de Guignardia citricarpa agente causal da mancha preta do citros 100 p Relatoacuterio teacutecnico 2005 GONZALEZ M LOMBARDO A VALLARINO A J Plantas de la medicina vulgar del Uruguay Uruguay Talleres Grfificos Cerrito 149 p 1937 GUTHRIE P A I MAGILL C W FREDERIKSEN R A ODVODY G N Random amplified polymorphic DNA markers a systems for identifying and differentiating isolates of Colletotrichum graminicola Phytopathology St Paul v 82 p 832-835 1992 GURGEL LMS MENEZES M COELHO RSB Caracterizaccedilatildeo patogecircnica fisioloacutegica e isoenzimaacutetica de Phomopsis anacardii e Phomopsis mangiferae In CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA 30 1997 Poccedilos de Caldas Resumos Brasiacutelia Sociedade Brasileira de Fitopatologia 1997 p 269 GURGEL LMS MENEZES M COEcircLHO RSB Estudo comparativo de isolados de Phomopsis anacardii e Phomopsis mangiferae atraveacutes da patogenicidade e nutriccedilatildeo de C e N em trecircs regimes de luminosidade Summa Phytopathologica v 28 p 160-166 2002 GRAJAL-MARTIN M J SIMON C J MUEHLBAUER F J Use of Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) to characterize race 2 of Fusarium oxysporum fsp pisi Phytopatology v 83 p 612-14 1993 GRATTAPAGLIA D FERREIRA M E Introduccedilatildeo ao uso de marcadores moleculares em anaacutelise geneacutetica EMBRAPA Brasiacutelia 3 ed 220p 1998
113
GRIFFIN DH Fungal physiology 2ed New York Wiley-Liss 1994 458p HALL T A BioEdit48 Raileigh 1997-2001 1 arquivo (115M) Disponiacutevel em httpwwwmbioncsuedubioedithtml BioEdit a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windons 9598NT HANLIN R T MENEZES M Gecircneros ilustrados de ascomicetos UFRPE Recife-PE 1996 274p HERBERT J A GRECH NM A strain of Guignardia citricarpa the citrus black spot pathogen resistent to benomyl in South Africa Plant Disease St Paul v 69 p 1007 1985 HUANG Y WANG J LI G ZHENG Z SU W Antitumor and antifungal activities in endophytic fungi isolated from pharmaceutical plants taxus mairei Cephalataxus fortunei and Torreya grandis FEMS Immunology and Medical Microbiology v31 n47 p163-167 2001 IBRAHIM G BAYCA B Fungal bacterial and nematological problems of citrus grape and stone fruits in Arab countries Arab Journal of Plant Protection Beirut v7 n2 p190-197 1989 ITOKAWA H SHIROTA O IKUTA H MORITA H TAKEYA K IITAKA Y Triterpenes fom Maytenus ilicifolia Phytochemistry v 30 n 11 p 3713-37161991 ITOKAWA H SHIROTA O IKUTA H MORITA H TAKEYA K IITAKA Y Oligo-nicotinated sesquiterpene polyesters from Maytenus ilicifolia Journal of natural Prodcts v 56 p 1479-14851993 JASALAVICH C OSTROFSKY A JELLISON J Detection and identification of decay fungi in spruce wood by restriction fragment length polymorphism analisis of amplified genes encoding rRNA Applied and Environmental Microbiology Washington v66 n11 p 4725-4734 2000 JOHNSTON P R FULLERTON R A Cryptosporiopsis citri sp Nov cause of a citrus leal spot in the Pacific Islands New Zealand Journal of Experimental Agriculture Wellington v16 p159-163 1988 JORGE R M LEITE J P V OLIVEIRA A B TAGLIATI C A Evaluation of antinociceptive anti-inflammatory and antiulcerogenic activities of Maytenus ilicifolia Journal Ethnopharmacol v 94 n1 p 93-100 2004 KIM K H TEN L N LIU Q M IM W T LEE S T Sphingobacterium daejeonense sp nov isolated from a compost sample International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2031-2036 2006
114
KIM B Y WEON H Y LEE K H SEOK S J KWON S W GO S J STACKEBRANDT E Dyella yeojuensis sp nov isolated from greenhouse soil in Korea International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2079-2082 2006 LEE Y H SNOW J P Phenotypic and genetic variations in Diaporte phaseolorum var caulivora the soybean stem canker pathogen Phytopathology v 81 p1205 1992 LEITE J P V RASTRELLI L ROMUSSI G OLIVEIRA A B VILEGAS J H Y VILEGAS W PIZZA C Isolation and HPLC quantitative analysis of flavonoid glycosides from razilian evera es (Maytenus ilici olia and M aqui olium) Journal of Agricultural and Food Chemistry v 49 p 3796-3801 2001 LEONIAN L H A study of the factors promoting pycnidium ndash formation in some Sphaeropsidales American Journal Botanic Columbus v11 p 19-50 1924 LEUCHTMANN A PETRINI O PETRINI LE CARROLL GC Isozyme polymorphism in six endophytic Phyllosticta species Mycological Research Cambridge v96 n 4 p 287-294 1992 LI J Y STROBEL G A Jesterone and hydroxy-jesterone antioomycete cyclohexenone epoxides from the endophytic fungus Pestalotiopsis jesteri Phytochemistry v 57 p 261-265 2001 LIMA O G de COELHO J S de B WEIGERT E DrsquoALBUQUERQUE I L LIMA D de A SOUZA M A de M Substacircncias antimicrobianas de plantas superiores ndash Sobre a presenccedila de maitenina e pristimerina na parte cortical das raiacutezes de Maytenus ilicifolia procedente do Brasil Meridional Revista do Instituto de Antibioacuteticos v 11 n 1 p 35-38 1971 LIU C H ZOU W X LU H TAN R X Antifungal activity of Artemisia annuaendophyte cultures against phytopathogenic fungi Journal of Biotechnology v88 p 277-282 2001 LU H ZOU W X MENG J C HU J TAN R X New bioactive metabolites produced by Colletotrichum sp an endophytic fungus in Artemisia annua Plant Science Oxford v 151 n 1 p 67-73 2000 LU G Z CANNON P F REID A SIMMONS C M Diversity and molecular relationships of endophytic Colletotrichum isolates from the Iwokrama Forest Reserve Guyana Mycological Research v 108 n 1 p 53-63 2004 MAKI C S Diversidade e Potencial Biotecnoloacutegico de Fungos Endofiacuteticos de Cacau Theobroma cacao L Piracicaba 2006 Dissertaccedilatildeo de Doutorado ndash Setor de Agronomia- Geneacutetica e Melhoramento de Plantas Universidade Escola Superior de
115
Agricultura Luiz de Queiroz MANULIS S KOGAN N REUVEN M BEN-YEPHET Y Use of the RAPD technique for identification of Fusarium oxysporum f sp dianthi from carnation Phytopathology v84 p98-101 1993 MARTINS-CORDER M P MELO I S ANTAGONISMO IN VITRO DE Trichoderma spp A Verticillium dahliae KLEB Scientia Agriacutecola v 55 n1 p1-7 1998 MARIANO R L R Meacutetodos de seleccedilatildeo in vitro para o controle microbioloacutegico de patoacutegenos de plantas Revisatildeo Anual de Patologia de Plantas v I p 369-409 1993 McMILLAN JR RT Guignardia citricarpa a cause of black spot on mango foliage in Florida Journal of Phytopathology Berlin v117 p 260-264 1986 McPHERSON M J QUIRKE P TAYLOR G R PCR 1 A pratical approach IRL New York v1 348p 1991 McONIE K C The latent occurrence in citrus and other hosts of a Guignardia easily confused with G citricarpa the citrus black spot pathogen Phytopathology St Paul v 54 p 40-43 1964a McONIE K C Source of inoculum of Guignardia citricarpa the citrus black spot pathogen Phytopathology St Paul v 54 p 64-67 1964b MEIJER G MEGNEGNEAU G LINDERS E G Avariability for isozyme vegetative compatibility and RAPD markers in natural populations of Phomopsis subordinaria Mycological Research v98 n3 p267-276 1994 MEIRA PENNA Dicionaacuterio Brasileiro de Plantas Medicinais 3a Ed Editora Kosmos Rio de Janeiro 1946 MELO I S Agentes microbianos de controle de fungos fitopatogecircnicos In Controle bioloacutegico v I MELO I S e AZEVEDO J L (Eds) Jaguariuacutena SP Embrapa-CNPMA 1998 264p MICHELMORE R W HULBERT S H Molecular markers for genetic analysis of phytopathogenic fungi Annual Review of Phytopathology Palo Alto v 25 p 383-404 1987 MOLLER C WEBER G DREYFUSS M M Intraespecific diversity in the fungal species Chaunopycnis alba implications fo microbial screening programs Journal of industrial microbiology v 17 p 359-372 1996
116
MONTANARI T CARVALHO J E de DOLDER H Effect of Maytenus ilicifolia Martex Reiss on spermatogenesis Contraception v 57 p 335-3391998 MONTANARI T BEVILACQUIA E Effect of Maytenus ilicifolia Mart On pregnant mice Contraception v 65 p 171-1752002 MOSTERT L CROUS P W KANG J PHILLIPS A J L Species of Phomopsis and a Libertella sp occurring on grapevines with specific reference to South Africa morphological cultural molecular and pathological characterization Mycologia v 93 n 1 p 146-167 2001 MULLIS K B F A FALOONA Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction Methods Enzymol v 155 p 335-350 1987 MURALI T S SURYNARAYANAN T S GEETA R Endophytic Phomopsis species Host range and implications for diversity estimates NRC Research Press Canadaacute 2006 NEDASHKOVSKAYA O I VANCANNEYT M KALINOSKAYA N I MIKHAILOV V V SWINGS J Aquimarina intermedia sp nov reclassification of Stanierella latercula (Lewin 1969) as Aquimarina latercula comb nov and Gaetbulimicrobium brevivitae International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology v 56 p 2037-2041 2006 NETO P A S AZEVEDO J L ARAUacuteJO W L Microrganismos Endofiacuteticos Interaccedilatildeo com Plantas e Potencial Biotecnoloacutegico Revista Biotecnologia v5 n29 2002 OrsquoDONNELL K GRAY L E Phylogenetc relationships of the soyobean sudden death syndrome pathogen Fusarium solani f sp phaseoli inferred from rDNA sequence data and PCR primers for its identification Molecular Plant Microbe Interact v 8 p 709-716 1995 OKANE I NAKAGIRI A ITO T Endophytic fun i in leaves of ericaceous plants Canadian Journal of Botany v 76 p 657-663 1998 OULLET T SEIFFERT K A Genetic characterization of Fusarium graminearum strains using RAPD e PCR amplification Phytopathology v 83 p 1003-1007 1993 PAAVANEM-HUHTALA S AVIKAINEM H YLI-MATTILA T Development of strain-specific primers for a strain of Gliocladium catenulatum used in bioological control European Journal Plant Pathological Dordrecht v106 n2 p187-198 2000 PANIZZA S Plantas que Curam (Cheiro de Mato) 15deg ed Satildeo Paulo IBRASA 1998 265 p PATEL B N PATEL R C TILVA D G Phyllosticta leaf spot a new disease in Bidi
117
tobacco nursey Tobacco Research Rajahmundry v14 p 1176-1178 1988 PATERSON R R M BRIDGE P D Biochemical techniques for filamentous fungi CAB International 125 p 1994 PARMETER J R An effect of substrate on spore form in Phomopsis Phytopatholog v 48 p 396-397 1958 PENNA E B da S Microrganismos endofiacuteticos de erva-mate (Ilex paraguariensis STHIL) e variabilidade geneacutetica em Phyllosticta sp por RAPD Curitiba 2000 123 f Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Universidade Federal do Paranaacute PETRINI O Taxonomy of endophytic fungi of arial plant tissues In FOKKEMA N J HEUVEL JVAN DEN (Ed) Microbiology of the Phyllosphere Cambrige University Press p 175-87 1986 PETRINI O Fungal endophytes of tree leaves In ANDREWS J H HIRANO S S (Eds) Microbial Ecology of Leaves New York Sprin er-Verla 1991 p 179-197 PETRINI O STONE K CARROLL F E Endophytic fungi in evergreen shrubs in western Oregon a preliminary study Canadian Journal of Botany v 60 p 789-796 1982 PHILLIPS A J L The plant pathogenic genus Phomopsis and its teleomorph (Diaporthe) Development and application of morphological biological and phylogenetic species concepts Disponiacutevel em lthttpwwwcremfctunlptbotryosphaeria_sitepersonal_web_pagehtmgt Acesso em Dezembro de 2006 PILEGGI S A V Isolamento e Caracterizaccedilatildeo de Microrganismos Endofiacuteticosde Maytenus ilicifolia Mart ex Reiss por Meio de Marcadores RAPD eseu Potencial Farmacoloacutegico Curitiba 2006 Dissertaccedilatildeo de Doutorado - Setor de Ciecircncias Bioloacutegicas Universidade Federal do Paranaacute PIOLI R N MORANDI E N MARTIacuteNEZ M C LUCCA F TOZZINI BISARO V HOPP H E Morphologic molecular and pathogenic characterization of diaporthe phaseolorum variability in the core soybean ndash Producing Aacuterea of Argentina Phytopathology v 93 n2 p136-146 2003 PONTECORVO G ROPER J A HEMMOS LM MAC DONALD K D BUFTON A W J The genetics of Aspergillus nidulans Advances in Genetics v 5 p141-238 1953 PONS N Estudio taxonomico de especies de Phoma y Phyllosticta sobre cantildea de azucar (Saccharum sp) Fitopatologia Venezolana Maracay v 3 p 34-43 1990
118
PROMPUTTHA I JEEWON R LUMYONG S MCKENZIE E H C HYDE K D Ribosomal DNA fingerprinting in the identification of non sporulating endophytes from Magnolia liliifera (Magnoliaceae) Fungal Diversity v 20 p 167-186 2005 QUIROGA E N SAMPIETRO A R VATTUONE M Screening antifungal activitis of selected medicinal plants Journal of Ethnopharmacology v 74 p 89-96 2001 RAEDER U BRODA P Rapid preparation of DNA from filamentous fungi Letters in Applied Microbiology Oxford v1 p17-20 1985 REHNER S A UECKER F A Nuclear ribosomal internal transcribed spacer phylogeny and host diversity in the coelomycete Phomopsis Canadian Journal of Botanic v 72 p1666-1674 1994 RIBEIRO L A de Variabilidade Geneacutetica por RAPD em fungos endoacutefitos de Gecircnero Penicillium provenientes de Zea mays L Curitiba 1995 90 f Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Universidade Federal do Paranaacute RIEDL H WECHTL E Proposal to conserve the name Phomopsis (Sacc) Bubak (1905) against Myxolibertella Hohnel (1903) Taxon v 30 n 4 p 826-828 1981 ROBES C F A mancha preta dos fungos ciacutetricos (Phyllosticta citricarpa) ameaccedila a citricultura paulista Laranja Cordeiroacutepolis v 11 p 75-86 1990 ROBES C F BITTENCUCOURT S M A mancha preta dos frutos um dos fatores limitantes agrave produccedilatildeo citricola do estado do Rio de Janeiro Comunicado Teacutecnico ndash CTAA-EMBRAPA n 19 p 1-5 1995 RODRIGUES K F SAMULES G J Fungal endophytes of Spondias mombin in Brazil a preliminary study Journal of Basic Microbiology v 39 p 131 ndash 135 1999 RODRIGUES KF HESSE M WERNER C Antimicrobial activities of secondary metabolites produced by endophytic fungi from Spondias mombin Journal of Basic Microbiology v 40 n 4 p 261-267 2000 RODRIGUES-HEERKLOTZ KF DRANDAROV K HEERKLOTZ J HESSE M WERNER C Guignardia Acid a Novel Type of Secondary Metabolite Produced by the Endophytic fungus Guignardia sp Isolation Structure Elucidation and Asymmetric Synthesis Helvetica Chimica Acta v 84 p 3766-3772 2001 RODRIGUES K F SIEBER T N GRUumlNIG R C HOLDENRIEDER O Characterization of Guignardia mangiferae isolated from tropical plants based on morphology ISSR-PCR amplifications and ITS1-58S-ITS2 sequences Mycological
119
Research Cambridge v 108 p 45-52 2004 RODRIGUES K F COSTA G L CARVALHO M P EPIFANIO R A Evaluation of extracts produced by some tropical fungi as potential cholinesterase inhibitors Journal of Microbiology and Biotechnology v21 p1617-1621 2005 RODRIGUES M B C Controle de Guignardia citricarpa agente causal da Mancha Preta dos Citros Piracicaba 2006 67 p Dissertaccedilatildeo de Mestrado ndash Escola Superior da Agricultura ldquoLuiz de Queirozrdquo Universidade de Satildeo Paulo ROHLF F J NTSYS-PC Numerical taxonomy and multivariate analysis system New York Exeter Publishing 1988 RUBINI M R SILVA-RIBEIRO R T POMELLA A W V MAKI C S ARAUacuteJO W L SANTOS D R AZEVEDO J L Diversity of endophytic fungal community of cacao (Theobroma cacao L) and biological control of Crinipellis perniciosa causal agent of Witches Broom Disease International journal of Biological Sciences v 1 n 1 p 24-33 2005 SAIKI R K SCHARF S J FALOONA F MULLIS K B HORN G T ERLICH H A ARNHEIM N Enzymatic amplification of β-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia Science v 230 p1350-1354 1985 SAMPAIO J P FELL J W GADANHO M BAUER R Kurtzmanomyces insolitus sp nov a new anamorphic heterobasidiomycetous yeast species Systematic and Applied Micorbiology v 22 p 619-625 1999 SAMUELES G J SEIFERT K A The impact of molecularcharacters on systematics of filamentous ascomycetes Annual Review of Phytopathogy Palo Alto v 33 p 37-67 1995 SANGER F NICKLEN S COULSON A R DNA Sequencing with chain terminating inhibitors Proceedings of the National Academy of Sciences of the United states of America Washington v 74 p 5463-5467 1977 SANTOS MF Anaacutelise da micoflora associada ao baru (Dipteryx alata Vog) e a caroba (Cybistax antisyphilitica (Mart) Mart) BrasiacuteliaDF 1996 Dissertaccedilatildeo de Mestrado Universidade Nacional de Brasiacutelia SATOKO K MINAKA N KOBAYASHI T KUDO A OHTSU Y Molecular Phylogenetic Analysis of Ribosomal DNA Internal Transcribed Spacer Regions and Comparison of Fertility in Phomopsis Isolates from Fruit Trees Plant Pathology v 66 p 191-210 2000
120
SCHULZ B BOYLE C DRAEGER S ROumlMMERT A KROHN K Endophytic fungi a source of novel biologically active secondary metabolites Mycological Research Cambridge v 106 p 996-1004 2002 SCHULZ B BOYLE C The endophytic continuum Mycological Research Cambridge v 109 p 661-686 2005 SETTE L D PASSARINI M R Z DELARMELINA C SALATI F DUARTE M C T Molecular characterization and antimicrobial activity of endophytic fungi from coffee plants World Journal of Microbiology and Biotechnology v 22 p 1185-1195 2006 SHIROTA O MORITA H TAKEYA K ITOKAWA H ITAKA YCytotoxic aromatic triterpenes from Maytenus ilicifolia and Maytenus chuchuhuasca Journal of Natural Products v 57 p 1675-1681 1994 SHIVAS R G ALLEN J G WILLIAMSON P M Infraspecific variation demonstrated in Phomopsis leptostromiformis using cultural and biochemical techniques Mycological Research Cambridge v 95 p 320-323 1991 SHRESTHA K STROBEL G A PRAKASH S GEWALI M Evidence for paclitaxel from three new endophytic fungi of Himalayan yew of Nepal Planta Medicinal v 67 p 374-376 2001 SILVA C G RECIO R A OLIVEIRA A B de PAIVA R L R Coleta e avaliaccedilatildeo da qualidade fitoquiacutemica de Maytenus ilicifolia M (espinheira-santa) Tribuna Farmacecircutica v 5759 p 46-50 1991 SILVA F A S The ASSISTAT Software statistical assistance In INTERNATIONAL CONFERENCE ON COMPUTERS IN AGRICULTURE 6 Anais Cancun American Society of Agricultural Engineers p 294-298 1996 SILVA F de A S AZEVEDO C A V de Versatildeo do programa computacional Assistat para o sistema operacional Windows Revista Brasileira de Produtos Agroindustriais Campina Grande v 4n 1 p 71-78 2002 SILVA G H TELES H L TREVISAN H C BOLZANI V S YOUNG M C M PFENNING L H EBERLIN M N HADDAD R COSTA-NETO C M ARAUacuteJO A R New Bioactive Metabolites Produced by Phomopsis cassiae an Endophytic Fungus in Cassia spectabilis Journal Brasileiro Chemical Society v16 n6 p 1463-1466 2005 SILVA R L DE O LUZ J S SILVEIRA E B CAVALCANTE T Fungos endofiacuteticos em Annona spp isolamento caracterizaccedilatildeo enzimaacutetica e promoccedilatildeo do crescimento em mudas de pinha (Annona squamosa L) Acta Botanica Brasilica v
121
20 n 3 p 649-655 2006 SILVEIRA EB 2001 Bacteacuterias promotoras de crescimento de plantas e biocontrole de doenccedilas Pp 71-100 In R Barros e SJ Michereff Proteccedilatildeo de plantas na agricultura sustentaacutevel Recife Imprensa Universitaacuteria da UFRPE SIMOtildeES C M O MENTZ L A SCHENKEL E P IRGANG B E STEHMANN J R Plantas da medicina popular no Rio Grande do Sul Porto Alegre Editora da UniversidadeUFRGS 174p 1986 SIVANESAN A The bitunicate ascomycetes and their anamorphs J Cramer Germany 701p 1984 SNEATH P H A SOKAL R R Numerical Taxonomy W H freeman Co San Francisco 1973 SOUZA FORMIGONI M L OLIVEIRA M G MONTEIRO M G DA SILVEIRA FILHO N G BRAZ S CARLINI E A Antiulcerogenic effects of two Maytenus species in laboratory animals Journal of Ethnopharmacology v 34 n 1 p 21-27 1991 SOUZA A Q L SOUZA A D L SPARTACO A F PINHEIRO M L B SARQUIS M I M PEREIRA J O Atividade antimicrobiana de fungos endofiacuteticos isolados de plantas toacutexicas da Amazocircnia Palicourea longiflora (aubl) rich e Strychnos cogens bentham Acta Amazocircnica v 34 n 2 p 185-195 Manaus 2004 SPOacuteSITO MB AMORIM L BASSANEZI RB BERGAMIN FILHO A HAU B Spatial pattern of black spot incidence within citrus trees related to disease severity and pathogen dispersal Plant Pathology p 103-108 2008 STAMFORD T L M ARAUacuteJO J M STAMFORD N P Atividade enzimaacutetica de microrganismos isolados do Jacatupeacute (Pachyrhizus erosus L Urban) Ciecircncia Tecnoloacutegica de Alimentos v 18 p 382-385 1998 STIERLE A STROBEL G STIERLE D GROTHAUS P BIGNAMI G The search for a taxol-producin microor anism amon the endophytic fun i of the Pacific yew Taxus bre i olia Journal of Natural Products v 58 n 9 p 1315-1324 1995 STINSON M ERZA D HESS W M SEARS J STROBEL G An endophytic Gliocladium sp Of Eucryphia cordifolia producing selective volatile antimicrobial compounds Plant Science St Paul v165 p 913-922 2003 STROBEL A G Rainforest Endophytes and Bioactive Products Critical Reviews in Biotechnology Boca Raton v 22 n 4 p 315-333 2002
122
STROBEL G A Endophytes as sources of bioactive products Microbes and Infection v 5 p 535-544 2003 STROBEL G DAISY B Bioprospecting for Microbial Endophytes and their Natural Products Microbiology and Molecular Biology Reviews v 67 n 4 p 491-502 2003 SUGHA SK SINGH BM SHARMA BM Studies on Phyllosticta glumarum causing glume blight of rice (Oryza sativa L) Himachal Journal of Agricultural Research Palampur v 12 n 1 p 11-14 1986 TAYLOR-ROSA S G BARROS I BCaracterizaccedilatildeo das sementes de Maytenus ilicifolia Mart Ex Reiss espinheira - santa e viabilidade de sua propagaccedilatildeo sexuada Porto Alegre 1994106f Dissertaccedilatildeo de Mestrado - Universidade Federal do Rio Grande do Sul THOMPSON J D HIGGINS D G GIBSON T J Clustal W Improving the sensitiviy of rogressive multiple alignment through sequence weighting positions-specific gap penalties and weight matrix choice Nucleic Acids Research v 22 p 4673-4680 1994 TIMNICK MB LILLY VG BARNETT HL Factors affeting sporulation of Diaporthe phaseolorum var batatatis from soybean Phytopathology St Paul v 41 n 4 p 327-336 1951 UECKER F A A World list of Phomopsis names with notes on nomenclature morphology and biology National Fungus Collection v 13 1988 VAN DER AA H A Studies in Phyllosticta I Studies in Mycology n 5 1973 VAN DER AA H A M E Noordeloos and J de Gruy-ter Species concepts in some larger genera of the Coelomycetes Studies in Mycology v 32 p 3-19 1990 VASCONCELOS MJV ALMEIDA MA HENNING AMR BARROS AA MOREIRA EG Differentiation of Colletotrichum truncatum isolates by random amplified polymorphic DNA Fitopatologia Brasileira Brasiacutelia v 19 p 520-523 1994 VELICHETI R K McCCLARY C LAMISON R D SINCLAIR J B Immunodetection of the Diaporthe and Phomopsis complex of soybeans Phytopathology v 81 p 1212 1991 VIDIC M Variability in Diaporthe phaseolorum var caulivora on soybean in the Vojvodina Providence in Serbia Zastita Bilja v 42 p 183-189 1991
123
VILARINHOS A D PAULA JR T J BARROS E G MOUREIRA M A Characterization of races of Colletotrichum lindemutianum by the random amplified polymorfic DNA technique Fitopatologia Brasileira Brasiacutelia v20 p194-198 1995 VILLA- CARVAJAL M COQUE J J R ALVAREacuteZ-RODRIGUEacuteZ M L URUBURU F BELLOCH C Polyphasic identication of yeasts isolated from bark of cork oak during the manufacturing process of cork stoppers FEMS Yeast Research v 4 p 745-750 2004 VIRET O PETRINI O Colonization of eech leaves (Fagus syl atica) by the endophyte Discula umbrinella (teleomorph Apiognomonia errabunda) Mycological Research v 98 p 423-432 1994 WAGENAAR M CORWIN J STROBEL G A CLARDY J Three new chytochalasins produced by an endophytic fungus in the genus Rhinocladiella Journal Natural Products v 63 p1692-1695 2000 WALKER M R RAPLEY R Guia de rotas na tecnologia do gene Atheneu Satildeo Paulo 1999 334p WANG J Li G LU H ZHENG Z HUANGY SU W Taxol from Tubercularia sp strain TF5 an endophytic fungus of Taxus mairei FEMS Microbiology Letters v 193 p 249-253 2000 WATSON J D GILMAN M WITKOSWSKI J ZOLLER M Recombinant DNA 2 ed New York Freeman and Company 1992 WELSH J McCLELLAND M Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers Nucleic Acid Research Oxford v 18 p 7213-7218 1990 WHITE Jr J MORROW A C Endophyte-host associations in forage grasses XII A fungal endophyte to Trichachne insularis belonging to Psedocercosporella Mycologia Lawrence v 78 n 5 p 846-850 1989 WHITE Jr J F MORROW A C Endophyte-host associations in forage grasses XII A fungal endophyte of Trichachne insularis belonging to Pseudocercosporella Mycologia Lawrence v 82 p 218-226 1990 WHITE Jr J F MORGAN-JONES G MORROW AC Taxonomy life cycle reprodution and detection of Acremonium endophytes Agriculture Ecosystem amp Environment v 44 p13-37 1993 WILLIAMS J G K KUBELIK A R LIVAK K J RAFALSKI J A TINGER S V DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers Nucleic Acids Research v 18 n 22 p 6531-6535 1990
124
WILLIAMS J G K HANAFEY M K RAFALSKI J A TINGEY S V Genetic analysis using random amplifield polymorphic DNA markers Methods in Enzymology San Diego v 218 p 704-740 1993 ZHANG A W RICCIONI L PEDERSENW L KOLLIPARA K P HARTMAN G L Molecular identi-fication and phylogenetic grouping of Diaporthe phaseolorum and Phomopsis longicolla isolates from soybean Phytopathology v 88 p1306 -1314 1998 ZOU W X MENG J C LU H CHEN G X SHI G X ZHANG T Y TAN R X Meta olites of Colletotrichum gloeosporioides an endophytic fun us in Artemisia mongolica Journal of Natural Products v 63 n 11 p 1529-1530 2000 ZOU W X TAN R X Endophytes a rich source of functional metabolites Natural Product Reports v18 p 448-459 2001
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ANEXOS
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 496671024 9933420 94396 MEIOS DE CULTURA 2 137912854 68956427 655287 INTERACcedilAtildeO A 100 193198257 1931983 18359 INTERACcedilAtildeO b 100 10989107 0109891 1044 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
INTERACcedilAtildeO A INTERACcedilAtildeO ENTRE OS MEIOS DE CULTURA E OS ISOLADOS de Phomopsis INTERACcedilAtildeO B INTERACcedilAtildeO ENTRE AS REPETICcedilOtildeES DOS ISOLADOS DE Phomopsis significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS ENTRE OS MEIOS DE CULTURA
BDA 5169935 a MEA 4973856 b AV 3921569 c
CV = 62
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 1 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM DIFERENTES MEIOS DE CULTURA
126
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 230248366 4604967 43761 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS ESBA1 700 a A323 700 a A215A 700 a ESSD1 700 a SM9713 700 a ESGF1 700 a SM9631 700 a ESJD1 700 a ESKD1 667 a A334 667 a ESDF1 633 b A132 633 b A123 600 b A333A 600 b MU0123 600 b ESJH1 600 b A321 600 b ESRD1 600 b A116 600 b A134 567 b A115B 567 b ESIA1 533 c
ANEXO 2ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO BDA
127
A131 500 c SM9714 500 c A135 500 c ESIE1 500 c ESFB2 500 c A124 500 c ESPAC22 500 c ES2KF1 500 c A113 500 c ESJE1 500 c ESJE2 433 d ESFH1 400 d ESJG1 400 d ES2WC1 400 d PHO1 400 d SM9638 400 d ES2NA1 400 d ES2AB1 400 d ESFF1 400 d AT9811 400 d AT9810 400 d ES2WF1 400 d A126 400 d PHO19 400 d A216B 400 d ES80J 367 d ESGA1 367 d AT9906 300 e A333B 233 f
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
128
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 189058824 3781176 35932 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS ESKD1 700 a ESJE2 600 b A123 600 b ESJE1 533 c SM9638 500 c AT9811 500 c SM9713 500 c PHO1 500 c ESBA1 500 c SM9631 500 c ESFB2 500 c A334 500 c A323 500 c MU0123 500 c A333A 433 d ESJD1 433 d ESGF1 433 d A116 433 d PAC22 400 e ESDF1 400 e A321 400 e A132 400 e ES2KF1 400 e
ANEXO 3ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO AVEIA
129
ESJG1 400 e ESRD1 400 e PHO19 400 e A115B 400 e A124 400 e ESFF1 367 e A134 367 e ESIE1 367 e A135 367 e A131 367 e A113 367 e ES2WF1 367 e SD1 367 e ESIA1 333 e ESGA1 300 f ESJH1 300 f ESFH1 300 f AT9906 300 f ES2NA1 300 f A216B 300 f ES80J 300 f ESA215A 267 f AT9810 200 g A333B 200 g ES2AB1 200 g SM9714 200 g ES2WC1 200 g
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
130
EXPERIMENTO FATORIAL
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 270562092 5411242 51423 RESIacuteDUO 206 21677560 0105231 Total 458 860448802
significativo ao niacutevel de 5 de probabilidade (p lt 005)
TESTE DAS MEacuteDIAS A323 733 a SM9631 700 a ESKD1 700 a A134 700 a ESIE1 700 a A116 667 b A334 667 b A215A 633 b ESSD1 633 b A321 600 c MU0123 600 c ESGF1 600 c ESRD1 600 c AT9811 600 c SM9713 600 c A123 600 c ESJH1 600 c ESDF1 600 c A131 567 c IA1 567 c ESBA1 567 c ESJD1 567 c A333A 533 d A135 500 d
ANEXO 4ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO CRESCIMENTO MICELIAL DOS ISOLADOS DEPhomopsis EM MEIO MEA
131
ES2NA1 500 d A124 500 d A132 500 d SM9714 500 d ESFB2 500 d A115B 467 e ES2AB1 433 e A216B 433 e A113 433 e PHO1 400 f SM9638 400 f ES2WF1 400 f A126 400 f ESJE1 400 f ESPAC22 400 f ESFF1 400 f ES2KF1 400 f ESJG1 367 f ES80J 367 f ESJE2 333 g ESFH1 333 g AT9906 300 g ESGA1 300 g SM9810 300 g ES2WC1 300 g A333B 233 h PHO19 233 h
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Scott-Knott ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
132
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 46 1602192500 34089202 1617590 RESIacuteDUO 432 91040000 210741 Total 478 1693232500
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO AT9906 352 a AT9810 353 a ESFH1 297 b ESPAC22 195 c ES2KF1 194 c SM9631 193 c ESGA1 184 cd PHO19 184 cd ES80J 166 de ESRD1 152 ef ESFB2 143 efg ESJE2 142 efg ESJE1 142 efg ESJG1 131 fgh A323 127 fghi A333A 126 ghij A135 123 ghij A124 123 ghij A126 123 ghij A132 123 ghij A131 123 ghij A134 123 ghij
ANEXO 5 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DO COMPRIMENTO DOS ESPOROS BETACONIacuteDIOSDOS ISOLADOS DE Phomopsis spp EM MEIO BDA
133
A115B 123 ghij ESIE1 123 ghij ES2WC1 119 ghil ES2WF1 119 ghil SM9713 116 hil A334 116 hil ESIA1 115 hil A333B 113 hil ESFF1 113 hil ESGF1 111 hil ES2AB1 107 him A123 107 him A113 107 him ESJD1 106 him ESKD1 105 im ES2NA1 104 im A215A 103 im SM9714 102 im ESSD1 101 m ESJH1 97 m MU0123 96 m A321 96 m ESDF1 95 m A216B 95 m A116 85 m
DMS = 259444 CV = 1052904
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
134
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 21 2674219 127344 459861 RESIacuteDUO 88 243688 002769 Total 109 2917907
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 293 a Fungicida Derosal 236 b ESGF1 157 c ESGA1 137 cde ESFH1 134 cdef ESIA1 120 cdefg ES2KF1 119 cdefgh ESFF1 146 cdefgh ES2NA1 111 defgh ES2AB1 110 defgh ESKD1 114 defgh ESJE2 110 defgh ESBA1 112 defgh ESRD1 098 efgh ESJG1 099 efgh ESJE1 099 efgh ESFB2 096 fgh ESJH1 094 gh ESJD1 093 gh ESIE1 095 gh ESSD1 078 h ESDF1 078 h
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 6 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
DMS = 039023 CV = 1340825
135
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 9 974154 108239 225325 RESIacuteDUO 40 192148 004804 Total 49 1166302
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 201 a
fungicida 174 ab AT9906 139 bc AT9810 117 cd AT9811 102 cde SM9638 110 cde SM9714 076 de SM9631 075 de MU0123 067 e SM9713 065 e
DMS = 046460 CV = 1946824
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 7 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
136
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 22 2382133 108279 239352 RESIacuteDUO 92 416192 004524 Total 114 2798325
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES
FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 244 a ES2WC1 237 a fungicida 185 b ES80J 138 bc A333B 136 cd ES2WF1 117 cde A333A 113 cde A132 110 cde A215A 106 cde A116 102 cde A124 101 cde A115B 101 cde A135 100 cde A215B 097 cde A321 094 cde A334 093 cde A323 092 cde A123 091 cde A113 091 cde A126 089 de A131 088 e ESPAC22 085 e A134 076 e
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
ANEXO 8 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396
DMS = 050157 CV = 1809416
137
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA
FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 50 6210037 124201 165056 RESIacuteDUO 204 1535052 007525 Total 254 7745089
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 302 a FUNGICIDA Derosal 244 abc ES2WC1 277 ab AT9906 224 bcd AT9810 222 bcde SM9638 218 bcdef ESGF1 201 cdefg A333B 188 cdefgh A132 167 defghi SM9714 159 defghij ESFF1 153 efghil ES2WF1 150 fghil ESGA1 149 fghil ESFH1 147 ghil ES80J 147 ghil MU0123 144 ghil ES2NA1 143 ghil AT9713 142 ghim A321 141 ghim A216B 140 ghim AT9811 139 ghim A116 137 ghim
ANEXO 9 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305
138
ESBA1 134 ghim ES2AB1 133 ghim A323 132 ghin ESJG1 131 ghin ESIE1 130 hin A333A 129 hin A113 127 hin A134 125 hin ESSD1 122 hin ESKD1 121 hin ESIA1 117 in A124 113 in A334 112 in ES2KF1 112 in ESJE1 110 in ESPAC22 108 in A131 108 in A126 106 in A135 102 in ESRD1 094 n SM9631 093 n ESJE2 090 n ESJH1 090 n ESFB2 088 n ESJD1 087 n A123 087 n ESDF1 086 n A115B 072 n A215A 062 n
DMS = 070465 CV = 1983267
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
139
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 28 2145366 076620 407144 RESIacuteDUO 116 218300 001882 Total 144 2363666
significativo ao niacutevel de 1 de probabilidade (p lt 01)
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 222 a ESRD1 19 b A131 176 b ESIA1 178 b SM9713 162 bc ESJD1 162 bc A126 154 bcd MU0123 149 bcde A333A 134 cdef ESGA1 134 cdef A113 133 cdef ESGF1 130 cdef A334 130 cdef ESBA1 140 cdef SM9638 127 def ESJH1 119 efg ESDF1 115 fgh ESSD1 112 fgh ESKD1 113 fgh ES2AB1 111 fghi A124 111 fghi
ANEXO 10 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC3305 PARA DETECCcedilAtildeODE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
140
A215A 109 fghi A321 108 fghi A134 089 ghij A115B 082 hij ESFF1 078 ij ESFH1 071 l A123 062 l ES2WF1 042 l
DMS = 033193 CV = 1095343
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
141
EXPERIMENTO INTEIRAMENTE CASUALIZADO
ANOVA
FV GL SQ QM F ISOLADOS ENDOFIacuteTICOS 28 11264938 402319 481124 RESIacuteDUO 116 970000 008362 Total 144 12234938
TESTE DAS MEacuteDIAS
MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 422 a ESGA1 275 b ESGF1 267 bc ESBA1 265 bc SM9713 261 bc A333A 251 bcd ESSD1 235 bcde MU0123 234 bcde ESKD1 211 bcdef A215A 203 cdef A321 188 defg A131 173 efgh SM9638 167 efgh A124 148 fghi ESJD1 147 fghi A113 130 ghij ESIA1 122 ghij ES2AB1 128 ghij ESDF1 124 ghij A334 112 hij A115B 106 hij
ANEXO 11 ndash ANOVA E TESTE DE MEacuteDIAS DAS INTERACcedilOtildeES ENTRE OS ISOLADOSENDOFIacuteTICOS DE Phomopsis CONTRA O FITOPATOacuteGENO G citricarpa PC1396 PARA DETECCcedilAtildeODE METABOacuteLITOS NAtildeO VOLAacuteTEIS
142
ESRD1 104 hij ES2WF1 086 il A134 083 il A126 080 il ESFF1 075 l A123 065 l ESFH1 025 l ESJH1 017 l
DMS = 069970 CV = 1193907
As meacutedias seguidas pela mesma letra natildeo diferem estatisticamente entre si Foi aplicado o Teste de Tukey ao niacutevel de 5 de probabilidade
TESTE DAS MEacuteDIAS (CONTINUACcedilAtildeO)
43
ANE
XO
12
ndash M
ATR
IZ D
E D
AD
OS
PA
RA
CA
RA
CTE
RIZ
ACcedil
AtildeO
CR
ITEacuteR
IOS
ME
DID
AS
ME
IOS
DE
C
ULT
UR
A
MU
0123
SM
9631
SM
9638
SM
9713
SM
9714
AT9
810
AT9
811
AT9
906
ES
2AB
1
ES
2KF1
ES2N
A1
ES2W
C1
ES2W
F1
ES
80J
ESBA
1
ESD
F1
ES
FB2
ES
FF1
ESFH
1
ES
GA
1
ESG
F1
ESIA
1
ESIE
1
ESJD
1
ESJE
1
ESJE
2
1 AV 1 0 1 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 MEA 0 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 BDA 1 1 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 1 1 0
2 AV 1 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1 1 1 3 AV 0 0 0 0 1 0 0 1 1 1 0 1 0 0 0 1 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 4 AV 1 0 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
MEA 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
5 AV 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
6 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0 BDA 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1
7 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 BDA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0
8 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 0 0 0
9 AV 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 1 BDA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1
10 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 MEA 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1
11 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
12 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
13 AV 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 MEA 0 0 1 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 1 0 1 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0
14 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 1 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 0
44
BDA 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 15 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0
16 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 0
17 AV 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 1 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0
18 AV 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 MEA 0 1 0 0 1 0 1 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 BDA 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1
19 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0
20 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21 AV 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 0 1 0 1 1 1 0 0 1 1 1 1
MEA 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 0 BDA 1 1 0 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0
22 AV 1 1 0 1 1 1 0 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
23 352 a 353μM BDA 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 297 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0
195 a 193 μM BDA 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 184 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 166 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 152 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
143 a 142 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 131 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 127 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
126 a 123 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 119 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
116 a 111 μM BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 107 a 106 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 105 a 102μM BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
97 a 85μM BDA 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24 733 a 700cm MEA 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0
677 a 633 cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 600 a 567 cm MEA 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 533 a 500cm MEA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
45
467 a 433cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 400 a 367cm MEA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 333 a 300cm MEA 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1
233cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 700 a 667cm BDA 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 633 a 567cm BDA 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 433 a 367cm BDA 0 0 1 0 0 1 1 0 1 0 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 1
300cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 233cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 700cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
600cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 533 a 500cm AV 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 433cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 400 a 333cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 300 a 267cm AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 200cm AV 0 0 0 0 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
CR
ITEacuteR
IOS
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DE
C
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A
ES
JG1
ES
JH2
ES
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1
ES
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C22
ES
RD
1
ES
SD
1
A131
A126
A123
A323
A113
A334
A321
A216
B
A135
A115
B
A124
A116
A215
A
A132
A333
A
A333
B
A134
P l
ongi
colla
PH
O19
1 AV 0 0 1 1 0 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 1 0 0 MEA 0 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 1 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 BDA 0 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 1 1 0 1 0 1 1 1 0 0 0 0 0
2 AV 0 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 3 AV 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 4 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1
MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 BDA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1
5 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0
6 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 MEA 1 1 0 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 BDA 1 0 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1
7 AV 1 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0
46
MEA 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 BDA 0 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0
8 AV 0 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 MEA 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1 BDA 0 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1
9 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 MEA 0 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0 BDA 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 0
10 AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
11 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
12 MEA 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0
13 AV 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 0 1 1 1 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 1 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 1 1
14 AV 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 MEA 1 1 0 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 0 BDA 0 1 0 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0 1 0 1 0 1 0
15 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0
16 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
17 AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 MEA 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 BDA 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0
18 AV 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 MEA 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 0 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0 1 1 BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
19 AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 MEA 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 BDA 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0
20 ESP 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 21 AV 1 1 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1
MEA 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1 0 1 1 0 0 1 BDA 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 0
22 AV 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 MEA 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1
47
BDA 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 23 352 a 353μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
297 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 195 a 193 μM BDA 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
184 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 166 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 152 μM BDA 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
143 a 142 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 131 μM BDA 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 127 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
126 a 123 μM BDA 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 1 1 0 1 0 0 119 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
116 a 111 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 107 a 106 μM BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 105 a 102μM BDA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0
97 a 85μM BDA 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 24 733 a 700cm MEA 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0
677 a 633 cm MEA 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 600 a 567 cm MEA 0 1 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 467 a 433cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 400 a 367cm MEA 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 333 a 300cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
233cm MEA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 700 a 667cm BDA 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 633 a 567cm BDA 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 1 1 0 1 0 0 533 a 500cm BDA 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 433 a 367cm BDA 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1
300cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 233cm BDA 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 700cm AV 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
600cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 533 a 500cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 433cm AV 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 400 a 333cm AV 1 0 0 1 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 1 1 1 0 0 1 0 0 1 0 1 300 a 267cm AV 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 200cm AV 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0
Nota - Caracteriacutestica avaliada nos trecircs meios As caracteriacutesticas foram avaliadas seguindo os seguintes criteacuterios
48
1 Bordos da colocircnia regular (1) ou irregular (0) 2 Miceacutelio denso 3 Miceacutelio ralo 4 Miceacutelio granuloso aeacutereo 5 Miceacutelio algodonoso 6 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Branco 7 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Marrom 8 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Cinza 9 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Verde 10 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Amarelo 11 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Bege 12 Coloraccedilatildeo do miceacutelio Preto 13 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Branco 14 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Marrom 15 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Preto 16 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Cinza 17 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Verde 18 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Amarelo 19 Coloraccedilatildeo do reverso da placa de Petri Bege 20 Esporulaccedilatildeo com esporulaccedilatildeo (1) sem esporulaccedilatildeo (0) 21 Coniacutedio do tipo alfa 22 Coniacutedio do tipo beta 23 Comprimento dos coniacutedios do tipo beta 24 Diacircmetro meacutedio do crescimento das colocircnias
49 ANEXO 13 LOCAL DA COLETA DE FOLHAS DE Schinus terebinthifoliusCENTRO POLITEacuteCNICO ndash CURITIBAPR
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