marie pierre gaub 3 et 4 mai 2013 point de vue des plateformes réunion biomarqueurs grand est

Marie Pierre GAUB

3 et 4 Mai 2013

Point de vue des Plateformes

Les HôpitauxUniversitairesde STRASBOURG

Réunion Biomarqueurs Grand EST

Labellisation INCa

From F Calvo

0

25

50

75

100

Nombre de tests KRAS

Incidence du cancer colorectal

L’activité par région varie entre 16 et 36 tests / 100 000 habitants

On n’observe pas de lien entre l’activité des plateformes et l’incidence

Cancer colorectal 2011

0

10

20

30

40

50

60

70Nombre de tests EGFR

Incidence du cancer du poumon

L’activité par région varie entre 21 et 52 tests / 100 000 habitants

On n’observe pas de lien entre l’activité des plateformes et l’incidence

Cancer du poumon 2011

Évolution des taux de mutations EGFR par laboratoire

0 5 10 15 20 25

2009

0 5 10 15 20 25

2010

0 5 10 15 20 25

2011

INCa :Résultats nationauxEvolution des performances des laboratoires

Biomarqueurs émergents ou validés

EGFR: Résistance aux TKIKRAS: Résistance aux TKIBRAF: Résistance aux TKI

InhibiteursPI3KCA: Inhibiteurs en Phase II HER2: Résistance aux TKI

InhibiteursEML4-ALK: Inhibiteurs

Recherche de mutations à visée théranostique ou prévisionnelle

0

3000

6000

T1 T2 T3 T4 T1 T2

Mut act EGFR

HER2

KRAS

mut res EGFRBRAF

PI3KCA

ALK

INCa: Biomarqueurs émergents Cancer du poumon

Nombre de tests réalisés pour chaque marqueur

2011 2012 3000 patients ont bénéficié d’un test ALK au T2 (IHC et/ou FISH confondus)

Proportion des patients ayant bénéficié d’un test EGFR pour lesquels une mutation de KRAS a aussi été

recherchéeRennesBrest

RouenVillejuif

Curie

Dijon

Strasbourg

Nancy

Besançon

Angers

CaenReims

LilleMarseilleLyonPoitiersBordeaux

Toulouse

Grenoble

Clermont

St Etienne

Nice

AP-HP

Tours

NantesMontpellier

Limoges

Moyenne de toutes les plateformes% de patients EGFR négatifs

Biomarqueurs émergents Cancer du poumon 2012

Rennes BrestRouen

Villejuif

Curie

Dijon

Strasbourg

Nancy

Besançon

Angers

Caen

ReimsLilleMarseilleLyonPoitiers

Bordeaux

Toulouse

Grenoble

Clermont

St Etienne

Nice

AP-HP

Tours

NantesMontpellier

Limoges

Proportion des patients ayant bénéficié d’un test EGFR pour lesquels une mutation de BRAF a aussi été

recherchée

Moyenne de toutes les plateformes% de patients EGFR et KRAS négatifs


Proportion des patients ayant bénéficié d’un test EGFR pour lesquels une mutation de HER2 a aussi été

recherchéeRennesBrest

RouenVillejuif

Curie

Dijon

Strasbourg

Nancy

Besançon

Angers

CaenReims


Toulouse

Grenoble

Clermont

St Etienne

Nice

AP-HP

Tours

NantesMontpellier

Limoges



RennesBrestRouen

Villejuif

Curie

Dijon

Strasbourg

Nancy

Besançon

Angers

CaenReims


Toulouse

Grenoble

Clermont

St Etienne

Nice

AP-HP

Tours

NantesMontpellier

Limoges

Proportion des patients ayant bénéficié d’un test EGFR pour lesquels la translocation de ALK a été recherchée par FISH

et/ou IHC



Pourcentage de résultats non interprétables

Biomarqueurs émergents Cancer du poumon

ADN non amplifiable

Bloc épuisé

% de cellules tumorales < seuil de détection

Les taux de résultats non interprétables on légèrement diminué depuis le début du programme

Taux de NI élevé pour le test ALK en FISH (14%)

0,0%

2,0%

4,0%

6,0%

8,0%

10,0%

12,0%

14,0%

16,0%

EGFR act EGFR res KRAS BRAF PI3KCA HER2 ALK (FISH)

PGMCABilan activités 2012

Augmentation importante du nombre d’analyses naturelle ( meilleure survie (LMC)) Meilleur suivi des recommandations

nationales ou locales (référentiels) Meilleure couverture des patients du privé

885 en 2011 à 1646 en 2012 aux HUS

Activités Plateformes en 2012

Groupe contrôle de qualité Grand ESTTumeurs solides (EGFR puis KRAS puis….

Impliquant les plateformes INCaNancy, Dijon, Reims, Besançon, Strasbourg

3ème contrôle: Mars 2012 EGFR, KRAS Dijon 4ème contrôle: Oct. 2012 EGFR, KRAS, BRAF Reims5ème contrôle : Avril 2013 EGFR, KRAS, BRAF Besançon

Préanalytique en prévision

Président du groupe: Dr Jean Luc Pretet, Besançon

Conclusions

Recherche exhaustive encore difficile-équipement technique des plateformes ,

-inflation des contraintes de secrétariat pour la gestion des résultats

Mais permet Une prise en charge d’un plus grand nombre de patients Développement des interactions entre secteur institutionnel

et libéral et entre cliniciens et biologistes L’évolution et la qualité des tests sur chaque plateforme

PGMCAPlateforme de génétique moléculaire des cancers d’Alsace

Plusieurs laboratoires HUS

LBBM (UF6442) ( Prof JM Lessinger) Labo d’hématologie et de cytogénétique (Prof L Mauvieux) Département de Pathologie (Profs JP Bellocq et MP Chenard)

CLCC Paul Strauss: Département de biologie et pathologie (Drs JP Ghnassia et J Abecassis)

Centre Hospitalier de Mulhouse: Service d’hématologie (Dr B Drenou) Service de cytogénétique ( Dr E Jeandidier) Département de Pathologie (Dr Fricker et Dr Lindner)

Hôpitaux Civils de Colmar: Laboratoire de Biologie (Dr D de Briel, Dr R Heller)

Kras colon

EGFR Poumon

BRAF Colon

Kras Poumon

BRAF poumon

EML4-ALK Poumon

PI3K poumon

BRAF Melanome MSI

JAK2 SMP

BCRABL LMC Suivi

2007 150 59 5202008 236 85 5672009 377 154 8 5632010 458 470 51 428 399 610

2011 420 530 77 530 139 247 68 243 582 8462012 454 694 454 691 656 110 (719 IHC) 613 112 233 633 931

Activités Plateforme ALSACE2012

Augmentation 2012/2011Poumon EGFR/KRAS 31%BCRABL: 10%JAK2 : 9%Mélanome 64,7%BRAF/PI3K /HER2(poumon): >100%

ALSACEEGFR et Biomarqueurs

Nb. de patientsanalysables

Nb. de patients avec mutation

EGFR

Nb. de résultats non interprétable

69473

(10,5%)15

(2,2%)

Délais moyens de rendu des résultats à partir du moment où le résultat arrive au laboratoire: 10,5 jours

Résultat EGFR seul : 3 à 6j mais problème de secrétariat si envoyé indépendammentA discuter comment raccourcir les délais en amont?

2011: 10,7% 6,6%

Activités LBBM (HUS)

Prescriptions INCa hémato solides total %CHU 780 63,1 1837 41% 45,7%

CLCC 11 0,9 156 3% 2,9%

Colmar 110 8,9 609 14% 12,5%

Mulhouse 149 12,1 701 16% 14,8%

CH 9 0,7 440 10% 7,8%

Privés 176 14,2 751 17% 16,2%

autres 1 0,1 0 0% 0,02%

1236 4494 5730

marie pierre gaub 3 et 4 mai 2013 point de vue des plateformes réunion biomarqueurs grand est

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