Sara D’Arienzo, Agenzia Regionale di Sanità della Toscana

Journal Club Farmacoepidemiologia ‐ 30 Marzo 2017 ‐

Il sistema informativo per i dati di antibiotico resistenza in Toscana

Tutti i laboratori dispongono di LIS (Sistemi informatici di gestione del Laboratorio)

Dati  di  sorveglianza  microbiologica  sono fondamentali

‐ per la pratica clinica (terapia antibiotica)‐ per  programmi  di  controllo  delle  ICPA 

(definizione di  linee guida per appropriate procedure operative)

Introduzione

La raccolta dei dati microbiologici dai LIS e la loro elaborazione omogenea permettono di determinare:

‐ Prevalenze di microrganismi

‐ Pattern di Chemiosensibilità

Costruire un sistema informativo, cioè un sistema di trasmissione, elaborazione e reporting diretta (per via telematica) dei dati dai LIS dei 

laboratori a un centro di raccolta stabile nel tempo

Confronto con benchmark nazionali ed europei

Sistema di Sorveglianza Europea EARS‐NEThttp://ecdc.europa.eu/en/Pages/home.aspx

Obiettivi

3. Armonizzazione dei termini in un linguaggio omogeneo

4. Attività di controllo di qualità del dato

Metodi: le fasi del lavoro

2. Incontro con i referenti e invio dei dati per via telematica

1. Censimento dei laboratori, definizione di tracciato record

TRANSCODIFICALIS informatizzato

IDENTIFICATIVO DELLA PERSONA E DELL’EVENTO

DB Amministrativo (SDO)

RisultatoAnalisiEventoPersona

IsolatoChemioresistenza

MaterialeModo e luogo di prelievo

Luogo Data del prelievo

SessoEtàIdentificativo Univoco

Metodi: Modello concettuale

Metodi: il tracciato record

1) Limitare le informazioni da trasmettere in maniera obbligatoria a quelle strettamente necessarie 

2)  Includere fra le informazioni da raccogliere opportune chiavi primarie per il collegamento ad ulteriori banche dati

3)  Mantenere un buon livello di atomizzazione dell’informazione che permetta, in fase di analisi dei dati, di raggiungere il più alto livello analitico ottenibile

4)  Essere per quanto più possibile compatibile con tracciati record o standard analoghi, al fine di permettere una semplice aggregazione e/o comparazione con i risultati ottenuti da studi simili 

5)  Struttura scalabile, per potersi adattare a futuri cambiamenti

[1] Si è definita infezione invasiva il primo isolamento da di un paziente; (2) l’isolamento dello stesso patogeno ottenuto almeno 28 giorni dopo la segnalazione precedente, indipendentemente da eventuali isolamenti occorsi nel frattempo; (3) l’isolamento di un patogeno diverso. [2] La scelta di non indicare la specie ci Acinetobacter è dovuta alle difficoltà che l’identificazione corretta a livello di specie  presenta utilizzando la maggior parte dei sistemi di identificazione utilizzati di routine. 

Isolati microbici consecutivi e non replicati [1] provenienti da sangue (emocoltura) e appartenenti alle seguenti specie:

• Staphylococcus aureus• Streptococcus pneumoniae• Enterococcus faecalis • Enterococcus faecium • Escherichia coli • Klebsiella pneumoniae• Pseudomonas aeruginosa• Acinetobacter spp.[2]

Metodi: Selezione degli isolati e degli episodi

Antibiotico E. coliK.penumoniae

P. aeruginosa

Acinetobacter spp.

Cefotaxime

Ceftriaxone

ESBL screen

Ceftazidime

Amoxicillina/Clavulanato

Piperacillina/Tazobactam

Ampicillina/Sulbactam

Ertapenem

Imipenem

Meropenem

Ciprofloxacina

Levofloxacina

Gentamicina

Amikacina

Cotrimossazolo

Colistina

Tigeciclina

Metodi: Selezione degli antibiotici

Antibiotico S. aureus

E.faeciumE.faecalis

S. pneumoniae

OXA/FOX screen MRSA

OXA screen PRSP

Penicillina G MIC

Ampicillina

Vancomicina

Teicoplanina

Linezolid

HLR streptomicina screen

HLR gentamicina screen

MIC/S‐I‐R/POSITIVO‐NEGATIVO

Batteri Gram‐ Negativi Batteri Gram‐ Positivi

LIS / DB Aziendali

ANALISI DEI DATI

Restituzione dei dati

CONVERSIONEDECODIFICA

Metodi

Un esempio: le tabelle di transcodifica

FASE DI ACQUISIZIONE DEI DATI: Dopo la selezione dei dati, sono stati sottoposti a verifica di ogni referente i criteri utilizzati per l’inclusione nel dataset.

FASE DI TRANSCODIFICA: Con l’utilizzo di tabelle standard condivise con i referenti dei laboratori sono stati armonizzati i concetti, consentendo così di aggregare i dati dei singoli laboratori in un dataset comune

FASE DI ANALISI DEI DATI:Eliminazione di eventuali dati parziali o incongruentiRisultati preliminari delle resistenze inviati ai laboratori perché verificassero la robustezza dei risultati e comunicassero possibili errori o discordanze.

Metodi: Controllo di qualità dei dati

Tutti i 14 laboratori di microbiologia, 

aderendo al progetto hanno consentito il raggiungimento 

delldell’’intera  copertura intera  copertura regionaleregionale

Risultati: La copertura regionale

SMART 2016SMART 2016I dati raccolti: pazienti episodi e isolatiI dati raccolti: pazienti episodi e isolati

SMART 2016SMART 2016I dati raccolti, differenze 2014I dati raccolti, differenze 2014‐‐20152015

Staphylococcus aureusStaphylococcus aureus

Staphylococcus aureus, MRSAStaphylococcus aureus, MRSA

Enterococcus faecalisEnterococcus faecalis

Enterococcus faeciumEnterococcus faecium

E. Faecium E. Faecium VancomicinoVancomicino‐‐resistenteresistente

Streptococcus pneumoniaeStreptococcus pneumoniae

Escherichia coliEscherichia coli

Escherichia coli, Escherichia coli, multiresistentemultiresistente

Escherichia coli, FluorochinoloniEscherichia coli, Fluorochinoloni

Escherichia coli, Cefalosporine III Escherichia coli, Cefalosporine III GenerazioneGenerazione

Klebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniae

Klebsiella pneumoniae multi resistentiKlebsiella pneumoniae multi resistenti

Klebsiella pneumoniae, FluorochinoloniKlebsiella pneumoniae, Fluorochinoloni

Klebsiella pneumoniae, Cefalosporine III Klebsiella pneumoniae, Cefalosporine III GenerazioneGenerazione

Klebsiella pneumoniae, CarbapenemiKlebsiella pneumoniae, Carbapenemi

Klebsiella pneumoniae, ColistinaKlebsiella pneumoniae, Colistina

Pseudomonas aeruginosaPseudomonas aeruginosa

Pseudomonas aeruginosa,Pseudomonas aeruginosa, multi resistentemulti resistente

Pseudomonas aeruginosa, CarbapenemiPseudomonas aeruginosa, Carbapenemi

Acinetobacter Acinetobacter sppspp..

Acinetobacter spp., CarbapenemiAcinetobacter spp., Carbapenemi

Candida Candida sppspp..

Ad oggi solo l’Emilia Romagna, la Toscana e la Campania dispongono di sistemi di monitoraggio dell’antibiotico resistenza. 

Il  quadro che emerge dai questi dati mette in luce come in Toscana si assumano dimensioni preoccupanti rispetto al contesto europeo, soprattutto con riferimento ai patogeni maggiormente causa delle infezioni correlate all’assistenza.

Disporre di questi dati, in maniera sistematica, consente quindi un primo passo per il contrasto a questo grave problema di sanità pubblica.

Conclusioni

Sviluppo futuri

Introduzione di nuovi materiali

Introduzione di nuovi patogeni

Confronto a livello nazionale ed europeo

Miglioramento della qualità dei dati per permettere il linkage con i flussi amministrativi presenti nei database dell’Agenzia

MIglioramento della qualità di trasmissione dei dati in modo da avere invii multipli nel corso dell’anno

Ricostruire la storia clinica del paziente

Maggiore tempestività di riposta

Per consultare il Documento ARS: “https://www.ars.toscana.it/it/pubblicazioni/collana‐documenti‐ars/pubblicazioni‐2016/3601‐l‐utilizzo‐di‐

antibiotici‐e‐l‐antibiotico‐resistenza‐in‐toscana‐report‐della‐rete‐di‐sorveglianza‐microbiologica‐e‐dell‐antibiotico‐

resistenza‐in‐toscana‐smart‐2016.html