分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - kanazawa...

37
1 北国新聞会館20階ホール、728日、2007金沢大学理学部物理学科(自然科学研究科) CREST 日本科学技術振興機構) 安藤 敏夫 Myosin V, 240 nm, 30 ms/ frame Myosin V, 240 nm, 30 ms/ frame 日本海イノベーション会議 第1回フォーラム 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発

Upload: others

Post on 13-Oct-2020

0 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

1

北国新聞会館20階ホール、7月28日、2007年

金沢大学理学部物理学科(自然科学研究科)

CREST (日本科学技術振興機構)

安藤 敏夫

Myosin V, 240 nm, 30 ms/ frameMyosin V, 240 nm, 30 ms/ frame

日本海イノベーション会議 第1回フォーラム 

分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発

Page 2: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

2

様 々 な 生 命 現 象① 個体発生 ② 好中球の貧食

③ 細胞内タンパク質の動態 ④ アクチン線維の滑り運動

Page 3: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

3

大きさのスケール

m mm μm nm pm

細胞 ウィルス

タンパク質

原子

Page 4: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

4

タンパク質とはアミノ酸からでできた物質

Page 5: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

5

生物分子機械生物分子機械

モータ蛋白質、モータ蛋白質、AAA AAA 蛋白質蛋白質,,  DNADNA結合蛋白質結合蛋白質

Myosin VI

Actin

Kinesin Dynein

Microtubules

TubulinKataninFtsH

Microtubules

Holliday-Junction DNA

Myosin V

Page 6: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

6

タンパク質の動的振舞いの情報を得る手段

水中水中

高空間分解能高空間分解能

1分子を対象1分子を対象

高時間分解能高時間分解能

X線結晶構造解析X線結晶構造解析

電子顕微鏡電子顕微鏡

NMRNMR

スペクトロスコピースペクトロスコピー

光学顕微鏡光学顕微鏡

原子間力顕微鏡原子間力顕微鏡

3

2

3

2

2

1

Binnig (1986)

Page 7: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

7

原子間力顕微鏡(原子間力顕微鏡(AFMAFM))の原理の原理

Page 8: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

8

フィードバック制御の遅れフィードバック制御の遅れ

c

cfπQ

s

sfπQ

cf21

1.2 MHz in water, 200 pN/nm

L=6 μm, w=2 μm, d=90 nm

Active Damping

Page 9: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

9

振幅

位相

周波数

機械を思いどおりに高速に動かすのは難しい

Page 10: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

10

入力 出力

力 変位

G(ω)

機械を思いどおりに高速に動かす工夫

G(ω)G(ω)1

G(ω)

H(ω)

+

フィードフォワード型補償 フィードバック型補償

Page 11: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

11

振動抑制補償の効果

入 力入 力 出 力出 力

補償前

補償後

補償前補償前

補償後補償後

X-スキャナー

Z-スキャナー

100 kHz

500 kHz

Page 12: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

12

80 ms/frame

針で試料に「やさしく」触ることは難しい

タンパク質はとてもデリケート

Page 13: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

13

60 ms/frameMyosin VActo-myosin V

Head

AFMが捉えたタンパク質のダイナミックな動作

Dynein C GroEL

Page 14: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

14

ミオシンV: 細胞内の物質輸送を担うタンパク質

T. Sakamoto et al. BBRC. 272:586-590 (2000)

蛍光顕微鏡像

AFM像

Page 15: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

15

ATP ADP + Pi

化学エネルギー 力学的エネルギー

ATP分解反応ATP分解反応

構造変化構造変化

Actinとの結合Actinとの結合

カップリング

力学的仕事力学的仕事

共 役

Page 16: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

16

アクチンアクチン--ミオシンVミオシンV 相互作用相互作用

低イオン強度

矢じり構造

Page 17: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

17

30nm

ATPがないときATPがないとき

Imaging Rate: 100 ms/frame

イオン強度

マイナス端

プラス端

矢じり構造矢じり構造

In ADP

Page 18: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

18

In 50uM AMPIn 50uM AMP・・PNPPNP

両足の結合両足の結合

30nmイオン強度

前足-AMP・PNP後ろ足

AMP・PNPなし

プラス端マイナス端

Page 19: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

19

In ATP: In ATP: ミオシンVの歩行運動ミオシンVの歩行運動

20 20 uMuM ATP, 300 ATP, 300 mMmM NaClNaCl 30nm

Imaging Rate: 100ms/frame

Page 20: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

20

前前 足足 のの 屈屈 曲曲With 8uM ATPWith 8uM ATP

With 20uM ATPWith 20uM ATP30nm

前足の屈曲が前方への力を生む前足の屈曲が前方への力を生む

M・ADP・Pi M・ADP

Page 21: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

21

なぜ後ろ足しかアクチンに結合できないか?

+-

ATPなし、ADP結合状態

ATPなし、ADP結合状態では、マイナス端を指すよう

な矢じり構造でしかアクチンに結合できない

ATPなし、ADP結合状態では、マイナス端を指すよう

な矢じり構造でしかアクチンに結合できない

Page 22: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

22

ATP分解反応の進行と歩行運動とのカップリング

Page 23: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

23

ミオシンVの歩行運動の機序

Page 24: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

24

シャペロニン GroEL-GroES の結合・解離のダイナミクス

試料のセットアップGroEL

Page 25: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

25

0.25 s/frame

シャペロニン GroEL-GroES の結合・解離のダイナミクス

Page 26: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

26

スイッチング

主要中間体

Page 27: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

27

ストレプトアビジン基板ストレプトアビジン基板ビオチン化タンパク質

His-タグ タンパク質

800nm × 800nmz scale: 4nm

300nm × 300nmz scale: 2nm

100nm × 100nmz scale: 2nm

タンパク質の選択的固定を可能に

ストレプトアビジンの2次元結晶

Page 28: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

28

脂質で作る平面2重層膜

リン脂質

リポソーム

基板に支えられた平面2重層膜

Page 29: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

29

Speed: ×20

1 s/frame,

800×800 nm

脂質平面2重層膜の形成過程

Page 30: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

30

脂質平面2重層膜の流動性の脂質依存性

DPPC-(DOPC-Biotin) DPPC-(DPPC-Biotin)

不飽和炭化水素 飽和炭化水素

Page 31: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

31

バクテリオロドプシンの紫膜

光のエネルギーでプロトンを排出

35 ×35 nm2

35 nm

Page 32: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

32

Cyt

opla

smic

site

Extr

acel

lula

rsite

40 nm

40 nm

10 nm

10 nm

(a) (b)

(c) (d)

バクテリオロドプシン

40 ms/frame

15 ms/frame

Page 33: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

33

探針・試料間相互作用力の更なる低減化

イメージング速度の更なる高速化

将来の展望

カンチレバーが主要な制限因子

cf ckor

唯一の解 非接触高速AFM

Page 34: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

34

非接触高速AFMは可能か?非接触高速AFMは可能か?

G. Shekhawat and V.P. Dravid (2005)

Scanning Near-field Ultrasound Holography (SNFUH)

音波は試料表面に沿っている?

Page 35: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

35

探針は非接触でも表面を感じる!!

Page 36: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

36

■■ ナノメータ世界の高速観察ナノメータ世界の高速観察

高速AFMの大きな波及効果

新しいナノサイエンス・ナノテクノロジーの創成

■■ 表面の迅速評価装置表面の迅速評価装置

■■ 大表面へのナノ構造の形成大表面へのナノ構造の形成

Page 37: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足

37

Kanazawa UniversityKanazawa University

Kansai Advanced Research CenterKansai Advanced Research Center

大岩和弘

OlympusOlympus

戸田明敏

内橋貴之(准教授) FF-control, Photo-thermal, Phase Imaging

古寺哲幸(PD) Dynamic PID, Active damping, Myosin V

山下隼人(D1) Photo-thermal, membrane imaging

宮城 篤(D3) Dynein C, Nucleosome Imaging

中北 諒(卒業生) Scanner, Active damping

坂下 満(卒業生) Drift Compensation, Software

山本大輔(PD) Lipid Bilayers, GroEL-ES Imaging

北沢正志 榊原 斉

谷口雅昭(PD) GroEL Mutation, RuvAB Imaging

Cantilevers Dynein C Prep.

高橋尚久(M2) Phase Imaging, nc-AFM