caracterización y selección de bacterias-doris zuñiga

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  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

    1/53

    Caracterizacin y seleccin de bacterias promotoras de crecimiento enel cultivo orgnico de maca(Lepidium meyenii Walpers) como herramienta

    Biotecnolgica para mejorar su calidad productivaProyecto Per Biodiverso GTZ - CONCYTEC

    Dra. Doris Ziga Dvila

    Universidad Nacional Agraria La Molina

    Mayo 2010

    Email: [email protected]: www.lamolina.edu.pe/lmt

    Red biofag: www.biofag.org

    mailto:[email protected]://www.lamolina.edu.pe/lmthttp://www.lamolina.edu.pe/lmtmailto:[email protected]
  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    LUGAR DE EJECUCIN:Campesina San Pedro de CajasProvincia de Tarma Departamento de JunnEnsayos de laboratorio: Laboratorio de Ecologa Microbiana y

    Biotecnologa Marino Tabusso, Dpto. Biologa UNALM

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    EQUIPO DE INVESTIGACIN

    Biol. Katty Ogata

    Bach. Minoru MatsubaraBach. Mitsuyo GarcaBach. Jessica TolentinoWendy PrezBach. Luder Ramos

    Colaboradores

    Dr. Carlos Samaniego, Ecoandino S.A.CDr. David Campos, Instituto de Biotecnologa, UNALM

    Institucin Internacional

    Dra. Esperanza martnez, CCG Cuernavaca, UNAM-Mexico

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Lugares de muestreo y condicin del campo

    Lugar Suelo Condicin de campo muestrasGalpn Condorn(MC1) Rizosfrico 1er ao de siembra

    M1M2M3M4Blanco (C1) Sin cultivo M1M2

    Agomachay (MC2) Rizosfrico 2do ao de cosechaM1M2M3M4

    Blanco (C2) Sin cultivo M1M2Condorn (D3) Sin cultivo 10 aos de descanso M1M2

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    METODOLOGA

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Anlisis Microbiolgicos Recuento de bacterias aerobias mesfilas viables (ICMSF,

    1998) Recuento de bacterias aerobias psicrfilas (ICMSF, 1998) Recuento de esporognicos mesfilos aerobios (APHA,

    1992) Recuento de mohos y levaduras (ICMSF, 1998) Recuento de actinomicetos (APHA AWWA WEF 1998) Enumeracin de Pseudomonas (APHA AWWA WEF 1998)

    Enumeracin de bacterias fijadoras de nitrgeno de vidalibre (Burges, 1960)

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Bioqumica: glucosinolatosContenido macronutrientesContenido micronutrientesContenido de metales pesados

    Plantas

    Parmetros de crecimiento, tamao, PFresco, P Seco, tasa de crecimiento

    Suelo

    Caracterizacin fisico quimica de suelos:pH, M.O, CE, Textura.Contenido de macronutrientesContenido de micronutrientes

    Contenido metales pesados

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Preparacin de muestras y diluciones

    10-1

    10-2 10-390 mL

    AP 0.1%

    Muestra

    1 mL

    9 mL

    AP 0.1%

    9 mL

    AP 0.1%

    10 mL/g

    1 mL

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Anlisis Diluciones Medio de cultivo Temperatura y tiempo deincubacinAerobiasmesfilas -4, -5, -6 Agar Plate Count

    28C por 48 horas

    Hongostotales -2, -3, -4OGY* 22C por 3 - 5 das.

    Actinomicetos -1, -2, -3, -4 Agar Almidn casena** 28C por 6 - 7 das.Bacillus(80C) -4, -5 y -6

    AgarTriptona glucosa 28C por 48 horasDiaztrofos devida libre -2, -3, -4, -5, -6, -7, -8 Caldo mineral sinnitrgeno 28C por 7 - 10 das

    Pseudomonas -2, -3, -4, -5, -6, -7 Caldo Asparagina 28C por 7 - 10 das

    Medios de cultivo y condiciones de incubacin para la determinacin de lamicroflora analizada

    *Suplementado con Oxitetraciclina al 0.1%

    **Suplementado con Fluconazol al 0.25%

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Medicin de la actividad microbiana

    Pesar 25g desuelo tamizado

    Adicionar 0.5mLde sol. glucosa

    25%Vial con 3.5mL

    NaOH 1N

    Incubar a 28C por 24 horas

    Trasvasar el contenido del

    vial a un matraz

    Adicionar 3.5mL deBaCl2 + fenoftalena

    HCl0.25N

    Titular el NaOH no combinado (hasta elviraje de rosa grosella a transparente)

    Calcular la tasa de CO2producido: mg CO2/g*h

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Lugar : San Pedro de Cajas (4100 msnm)

    Temperatura registrada durante el muestreo : 9 y 10C

    RESULTADOS Y DISCUSIONES

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Temperatura y Humedad relativa del ambiente

    Campo muestreado Caracterstica LOCALIZACIN T (C) % HGalpn Condorn(C1) Primer ao de siembra 18L0401914 9.42 60.8UTM8755920Agomachay (C2) Segundo ao decosecha 18L0401914 10 53.4UTM8755942

    Condorn (D1) 10 aos de descanso 18L0399212 9.04 65.4UTM8754983Pampa Cima (D2) 4 aos de descanso 18L0398260 10.64 50.4

    UTM8754213Pampa Cima (D3) 1 ao de descanso 18L0398288 10.88 39.2

    UTM8754085

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Caractersticas fisicoqumicas de los suelos y rizsfera

    Parmetros MC1 C1 MC2 C2 D3 D2 D1pH 4.25 4.27 5.08 5.08 5.26 4.59 4.48

    C.E. 0.57 0.26 0.5 1.44 0.48 0.38 0.6CaCO3 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00M.O. 4.84 4.4 6.4 11.94 8.1 5.5 4.7

    P 67.9 60.6 61.6 64.1 61.3 65.2 65.9K 215 176 158 554.4 210 161 231Clase Textural Fr.A. Fr. A. Fr.A. Fr.A. Fr.A. Fr.A. Fr.A.

    CIC 14.9 15.04 27.52 23.68 8.43 8.43 8.43

    PRIMER MUESTREO

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    ParmetrosC1

    1 aoSiem.

    C22 ao

    cosecha

    pH 5.2 5.21

    C.E. 0.51 0.24

    CaCO3 0.00 0.00

    M.O. 7.8 8.0

    P 36.7 56.1

    K 162 196

    Clase Textural Fr. A. Fr.A.

    CIC 18.72 24.00

    Caractersticas fisicoqumicas de los suelos, San Pedro de Cajas

    TERCER MUESTREO

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    PRIMER MUESTREO Bac te r ias m es f i l as Ps ic r f i l os

    Su elo s a er ob io s * B ac il lu s * M oh os * Ac t in omic e to s * D ia z t ro fo s ** P se ud omo na s ** mg CO2/( gs s * h ) aerob iosC 1 6.18 4.74 5.08 5.08 5.30 3.95 0.026 4.903C 2 7.18 4.49 5.46 4.91 6.06 4.93 0.046 7.490

    MC1 5.69 4.49 4.11 4.32 4.95 6.04 0.030 6.591MC2 6.99 4.84 4.88 5.04 6.20 6.25 0.055 7.157D 1 6.41 4.52 5.26 5.78 4.95 5.38 0.034 5.903D 2 5.41 4.81 5.28 4.93 5.18 4.38 0.020 6.121D 3 5.90 4.81 5.32 5.30 5.30 3.38 0.032 6.182

    Poblaciones microbianas del suelo y de la rizsfera de maca Junn

    * Log ufc/g** NMP/g

    Mohos y levaduras

    Esporuladosmesfilos

    aerobios

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Poblaciones microbianas del suelo y rizsfera del cultivo de maca

    0

    1

    2

    3

    4

    5

    6

    7

    8

    9

    C1 MC1 C2 MC2 D1 D2 D3

    Suelos muestreados

    log(ufc/g) aerobios

    mohos y levaduras

    bacillus

    psicrfilos

    actinomicetos

    Poblaciones microbianas de Pseudomonasy diaztrofos en el

    suelo y rizfera del cultivo de maca

    0

    1

    2

    3

    4

    5

    6

    7

    8

    C1 MC1 C2 MC2 D1 D2 D3

    Suelos muestreados

    log(NMP/g)

    pseudomonas

    Azotobacter

    Poblacin microbiana de suelos de Junn del primer muestreo

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    SEGUNDO MUESTREO

    B ac te ri as m es f i la s B a c t er ia s ps ic r f i l asS ue los a erob io s B ac i l lus A ct ino m ic et os M oho s Diaz t ro fo s P seu do m ona ae ro b io s B ac il lu s M ohos mg CO2 re s p /(g sue lo* h )

    C 1 6.76 5.04 4.13 5.48 5.64 2.89 4.66 4.75 5.20 0.0302C 2 6.43 4.67 3.52 5.64 6.06 4.38 6.22 4.60 5.93 0.0447

    M C 1 6.42 4.86 4.77 5.00 7.12 5.03 6.84 5.01 5.20 0.0354M C 2 6.30 4.69 4.28 5.40 5.94 5.44 6.44 4.97 5.49 0.0446D 3 6.68 4.89 4.29 3.89 6.33 6.03 6.30 5.17 4.88 0.0383

    A c t . M i c r o b i an a

    Poblaciones microbianas del suelo y de la rizsfera de maca - Junn

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Poblaciones microbianas del suelo y rizsfera del cultivo de "maca"

    0

    1

    2

    3

    4

    5

    6

    7

    8

    C1 MC1 C2 MC2 D3

    Suelos muestreados

    log(

    ufc/g)

    Bacillus Psf

    M y L Psf.

    Aerobios Psf

    M y L

    Bacillus

    Aerobios

    Actinomicetos

    Poblaciones Pseudomonas y diaztrofos del cultivo de "maca"

    0

    1

    2

    3

    4

    5

    67

    8

    9

    C1 MC1 C2 MC2 D3

    suelos muestreados

    log(NMP/g)

    Pseudomonas

    Diazotrofos

    Poblacin microbiana de suelos de Junn del segundo muestreo

    Mc1 y Mc2, rizsferasmaca

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Variacin de las Poblaciones microbianas en Galpn Condorn

    0

    1

    2

    3

    4

    5

    6

    7

    8

    0 20 40 60 80 100 120 140

    log(ufc/g)

    tiempo (das)

    log (ufc/g) vs tiempo ( das)Galpn Condorn (C1)

    aerobios

    Bacillus

    mohos

    actinomicetos

    aerobios psf

    0

    1

    2

    3

    4

    5

    6

    0 20 40 60 80 100 120 140

    log(NMP/g)

    tiempo (das)

    log (NMP/g) vs tiempo (das) Ga lpn Condorn (C1)

    diaztrofos

    Pseudomonas

    DVL Pseudomonas

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    0

    1

    2

    3

    4

    5

    6

    7

    8

    0 20 40 60 80 100 120 140

    log(ufc/g)

    tiempo (das)

    log (ufc/g) vs tiempo (das) Agomachay (C2)

    aerobios

    Bacillus

    mohos

    actinomicetos

    aerobios psf

    Variacin de las Poblaciones microbianas en Agomachay

    0

    1

    2

    3

    4

    5

    6

    0 20 40 60 80 100 120 140

    log(poblacNMP/g

    )

    tiempo (das)

    log (NMP/g) vs tiempo (das) Galpn Condorn (C1)

    diaztrofos

    Pseudomonas

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Reaccin oxidativa con el reactivo de Salkowsky

    Produccin de cido Indolacticos

    Bacterias diaztrofasmostraron altos niveles de AIA

    y de solubilizacin de fosfatosen comparacin a los otrosgrupos bacterianos

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    a

    b

    Solubilizacin de Fosfato biclcico y triclcico

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    0 cm 0.05 a 0.45 cm 0.5 a 1.8 cm 0 cm .05 a 0.45 cm 0.5 a 1.8 cm

    421 241 (57.24%) 102 (24.23%) 78 (18.53%) 204 (48.46%) 160 (38%) 57 (13.54%)

    Solubilizacin de fosfato biclcico Solubilizacin de fosfato triclcicoTotal de Bacterias

    < 20 a 70 g/ml 0 g/ml 20 a 70 g/ml

    421 246 (58.43%) 43 (10.21%) 132 (31.36%)

    Produccin AIATotal de bacterias

    Bacteria Cultivos

    Pantoea agglomerans trigoRahnella aquatilis trigo, maz

    Stenetrophomonas rhizophila papa, colza

    Total de bacterias que solubilizaron fosfato bi y triclcico

    Total de bacterias que produjeron cido indolactico

    Bacterias relacionadas a la rizsfera de diferentes cultivos

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Produccin de AIA Solubilizcin de fosfatos

    20 a 70 g/ml

    Biclcico

    (0.5 a 1.8 cm)

    Triclcico

    (0.5 a 2 cm)

    Cepas

    Bacillus 19 (4.51%) 0 (0%) 0 (0%)

    Actinomicetos 23 (5.46%) 1 (0.24%) 1 (0.24%)

    Pseudomonas 54 (12.83%) 32 (7.6%) 29 (6.89%)

    diaztrofos 36 (8.55%) 35 (8.31%) 29 (6.89%)

    Total cepas aisladas 421

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

    25/53

    5Aa 53Aa 66Aa B29a Ps 31a

    Crec Halo Crec Halo Crec Halo Crec Halo Crec Halo

    5Ab 0.85 ++ - 0.8 + - 0,75 + - 0.8 + - 0.8 + -

    53Ab 0.8 + - 0.8 + - 0,85 + - 0.9 ++ - 0.85 ++ -

    66Ab 0.9 ++ - 0.8 + - 0,75 + - 0.95 ++ - 0.85 ++ -

    B29b 0.95 ++ - 1.1 +++ 1.1 1 +++ - 0.95 ++ - 0.95 +++ -

    Ps 31b 0.8 + - 0.9 ++ 0.9 1 +++ 1 0.85 + 0.85 0.9 ++ 0.9

    Ps 42b 1.55 +++ - 1.05 +++ 1.05 1,6 +++ - 1.05 +++ 1.05 1 +++ 1

    Ps 88b 0.95 ++ 0.95 1.1 +++ 1.1 0,9 ++ 0.9 0.8 + 0.8 0.95 +++ 0.95

    12 Actc 0.9 ++ - 0.9 ++ - 0,85 + - 0.75 + 1.4 0.8 + -

    5 Actc 0.9 ++ - 0.95 +++ - 0,85 + - 0.9 ++ 1.5 0.85 ++ -

    Interacciones microbianas in vitro de cepas con potencial PGPR

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

    26/53

    Ps 42a Ps 88a 12 Acta 5 Acta

    Crec. Halo Crec. Halo Crec. Halo Crec. Halo

    5Ab 0.75 + - 0.85 ++ - 0.8 + - 1.05 +++ -

    53Ab 0.75 + - 0.8 + - 0.8 + - 0.85 + -

    66Ab 0.8 + - 0.9 ++ - 0.7 + - 0.8 + -

    B29b 0.8 + - 0.9 ++ - 0.75 + - 0.85 + -

    Ps 31b 0.85 ++ - 0.8 + - 0.7 + 0.7 0.9 ++ 0.9

    Ps 42b 0.8 + 0.8 0.8 + - 0.7 + - 0.9 ++ 0.9

    Ps 88b 0.9 ++ 0.9 0.9 ++ 0.9 0.75 + 1.3 0.9 ++ 0.9

    12 Actc 0.7 + - 0.8 + - 0.8 + - 0.9 ++ 2

    5 Actc 0.65 + - 0.8 + - 0.75 + 0.75 0.9 ++ -

    Interacciones microbianas in vitro de cepas con potencial PGPR

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

    27/53

    Porcentaje de germinacin in vitro a los 8 das

    0

    20

    40

    60

    80

    100

    120

    Tratamientos

    Porcentajedegerminaci

    n

    46 56 48 44 66 45 58 87 40

    A3M2 pf pp A16M2 B4 B15 st5 P2N3 H2O

    B15 Ps42 Control 14A B11 6A B2 P2N3 Ps31 5AAct. M2/-

    4

    40 72 29 33 22 43 50 62 59 71 70

    0

    10

    20

    30

    40

    50

    6070

    80

    90

    100

    Porcentajedegermin

    acin

    Tratamiento

    Porcentaje de germinacin in vitro a los 2 das

    Pruebas de germinacin en maca

    Germinacin usando bacteriasaisladas de otros cultivosaltoandinos (8 a 10C)

    Germinacin usandobacterias aisladas delcultivo de maca (15 a 18C)

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

    28/53

    ActM2/-4 Control

    Pruebas de germinacin con microorganismos

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

    29/53

    0

    10

    20

    30

    40

    50

    60

    70

    80

    90

    100

    Porcentajedegerminacin

    Cepas probadas

    Porcentaje de germinacin in vitro a los 2 dias

    Porcentaje de germinacin interacciones bacterianas

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

    30/53

    N+ A3M2 pf pp A16M2 B4 B15 st5 N- P2N3 H2O

    25.00 20.00 25.00 16.67 22.50 25.00 23.33 30.00 27.50 67.50 12.50

    0

    1020

    30

    40

    50

    60

    7080

    90

    100

    Porc

    entajedeemergen

    cia

    Tratamientos

    Porcentaje de emergencia de "maca" a los 15 das

    Emergencia de maca usando bacterias aisladas de otroscultivos altoandinos (8 a 10C)

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

    31/53

    Peso seco areo de plantas de maca de 3 mesesCondiciones de laboratorio (15 a 18C)

    00.0050.01

    0.0150.02

    0.0250.030.035

    0.040.0450.05

    Peso seco areo

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    a b

    c

    Sistemas a. Jarras leonard modificadas b. bandejas c. tapers

    Plntulas de maca al mes de sembradas 19C

    arena Tierra de Junn

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Perfiles BOX - PCR de las cepas probadas como PGPRs

    M. Marcador de ADN 1 Kb (Axygen),B. Blanco, 1. B2, 2. B11, 3. B15,4. Ps31, 5. Ps42, 6. Ps 46, 7. 5A,8: 6A, 9. 14A

    M. Marcador de ADN 1 Kb (Axygen),B. Blanco, 1. Ps31, 2. Ps61, 3 Ps80,4. Ps87, 5. Ps88, 6. 13Bac, 7. 4Bac,8. 29Bac, 9. 25Bac, 10. 50A, 11. 53A,

    12. 66A, 13. 64A

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    rbol filogentico de secuencias del gen 16S rDNA. El mtodo de reconstruccin filogentica fueNeighbour-joining (NJ) y las distancias fueron calculadas de acuerdo al mtodo de Kimura-2parmetros. Los valores en los puntos de ramificacin indican un soporte de bootstrapmayor al 60%(1000 pseudo-replicas). Los aislados de rizsfera de maca se muestran en negrita.

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Ps88

    Ps61

    Ps87

    Pseudomonas costantiniiCFBP 5705T

    P. azotoformans IAM1603T

    P. poae LMG 21465T

    P. extremorientalis KMM 3447T

    P. salomoniiCFBP 2022T

    P. proteolytica CMS 64T

    P. fluorescens IAM 12022T

    P. Antarctica CMS 35T

    P. putida IAM 1236TP. rhizosphaerae IH5T

    P. reinekeiMT1T

    P. vancouverensis DhA-51T

    Ps42

    Ps46

    P. aeruginosa DSM 50071T.

    Stenotrophomonas maltophilia LMG 981T

    S. acidaminiphila AMX 19T

    S. maltophilia IAM 12423T

    Ps31S. rhizophila e-p10T

    Rhizobium tropici CIAT 899T

    97

    88

    67

    62

    98

    100

    100

    88

    100

    0.01

    Ps0

    rbol filogentico de secuencias del gen 16S rDNA. El mtodo de reconstruccin filogentica fueNeighbour-joining (NJ) y las distancias fueron calculadas de acuerdo al mtodo de Kimura-2parmetros. Los valores en los puntos de ramificacin indican un soporte de bootstrapmayor al 60%

    (1000 pseudo-replicas). Los aislados de pseudomonaceae de rizsfera de maca se muestran en negrita.

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Bacillus drentensis (T) type strain: ...

    Bacillus b ataviensis (T) type strain:...

    Bacillus soli (T) type strain: LMG 21...

    Bacillus vireti (T) LMG 21834.

    Bacillus novalis (T) type strain: LMG...

    Bacillus niacini (T) IFO15566.

    Bacillus pocheonensis (T) Gsoil 420.

    Bacillus foraminis (T) type strain: C...

    Bacillus siralis (T) 171544.

    Bacillus circulans (T).

    Bacillus asahii (T) MA001.

    Bacillus psychrosaccharolyticus (T) A...

    Bacillus sp. LMG 20238 (T).

    Brevibacterium frigoritolerans (T) ty...

    Bacillus simplex (T) DSM 1321T.

    Bacillus butanolivorans (T) K9.

    Bac29

    Bac25

    B.megaterium IAM1341I8 D16273

    Bacillus litoralis (T) SW-211.

    Bacillus halmapa lus (T) DSM 8723.

    Bacillus horikoshii (T) DSM8719.

    Bacillus luciferensis (T) LMG 18422.Bacillus cereus ATCC 14579 (T).

    Bacillus subtilis sub sp. subtilis (T)...

    Bacillus marisflavi (T) TF-11.

    Bacillus aquimaris (T) TF-12.

    Bacillus vietnamensis (T) 15-1.

    Paenibacillu s polymyxa IAM13419(t)

    97

    99

    93

    90

    87

    76

    89

    73

    95

    61

    68

    77

    98

    79

    78

    98

    0.01

    rbol filogentico de

    secuencias del gen 16SrDNA. El mtodo dereconstruccin filogenticafue Neighbour-joining (NJ)y las distancias fueroncalculadas de acuerdo almtodo de Kimura-2parmetros. Los valores en

    los puntos de ramificacinindican un soporte debootstrap mayor al 60%(1000 pseudo-replicas).Los aislados de Bacillusderizsfera de maca semuestran en negrita.

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Muestra N P K Ca Mg S Na Zn Cu Mn Fe B Mo Pb Cd CrC1 P9 3.7 0.2 1.5 1.79 0.165 0.33 0.2 77 6.5 102 582 239 3.05 17 0.5 0

    C1 P12 4.5 0.2 1.8 1.85 0.17 0.39 0.1 97 10.5 119 861 149 4.88 42 0 0

    C2 P2-P14 4.3 0.3 1.8 2.35 0.245 0.46 0.2 92 13 130 1133 177 2.35 21 0.8 0

    C2 P15-P16 4.4 0.3 2 2.39 0.25 0.45 0.2 63 10 129 797 197 1.9 20 0 0

    Contenido de nutrientes y metales pesados (parte area de la maca)

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Muestra N P K Ca Mg S Na Zn Cu Mn Fe B Mo Pb Cd Cr

    C1 P9 2.44 0.21 1.23 0.64 0.08 0.33 0.17 45 7 62 2338 126 1.90 5.25 0.50 0.50

    C1 P12 2.17 0.24 1.29 0.59 0.08 0.40 0.16 53 7 35 1395 137 2.28 2.00 0.00 0.00

    C2 P2-P14 2.52 0.28 1.28 0.65 0.10 0.42 0.16 48 10 52 1470 165 2.10 6.25 0.00 0.25

    C2 P15-P16 2.50 0.30 1.49 0.51 0.09 0.35 0.18 29 6 27 708 146 1.05 2.00 0.00 0.00

    Contenido de nutrientes y metales pesados (sistema radicular maca)

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Cuantificacin glucosinolatos siete meses despus de la siembra

    Muestra Ecotipo Concentracin de glucosinolatosmol equi. de sinigrin/g ms

    RC1P3 amarilla 9.89 0.43RC1P13 amarilla 16.99 0.51RC1P10 blanca 35.17 3.39RC2P1 morada 43.07 0.51RC2P9 morada 39.49 3.81

    RC2P13

    RC2P10

    Morada

    blanca

    25.49 4.1038.69 5.49

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Cuantificacin de Glucosinolatos

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Morfotipos de plantas de maca muestreados

    Galpn Condorn Agomachay

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Determinacin taxonmica de la planta: Lepidium meyeniiWalpers

    Flores de maca semillas de maca

    Planta de maca

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    CAPACITACIN Y DIFUSIN

    1.- Taller biofertilizantes para la agricultura de Iberoamrica en el siglo XXI

    Ziga, D. 2009. Presente y futuro de los biofertilizantes en Iberoamrica:Per. Taller de Biofertilizantes para la Agricultura de Iberoamrica en el sigo XXI.Red Biofag-CYTED. 4 mayo. La Habana, Cuba.

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    2.- Presentacin de resmenes y psters

    Katty Ogata*, Carlos Garca, Wendy Prez, Mitsuyo Garca, Jessica Tolentino, Carlos Soto & Doris

    Ziga. 2009. MICROFLORA Y ACTIVIDAD MICROBIANA DE LA RIZSFERA DEL CULTIVO DEMACA(Lepidium meyenii Walpers)EN LA MESETA DEL BOMBN JUNN. XXIV RELAR IIBEMPA. LaHabana, Cuba. 4-8 Mayo.

    Katty Ogata, Csar La Torre, Wendy Prez & Doris Ziga. 2009. EFECTODE DIFERENTES BACTERIAS PROMOTORAS DE CRECIMIENTO (PGPR) EN

    LA GERMINACIN Y EMERGENCIA DE PLANTULAS DE MACA (Lepidiummeyenii Walpers). XXIV RELAR IIBEMPA. La Habana, Cuba. 4-8 Mayo.

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Capacitacin de asistentes de investigacin de LEMYB en la XXIVRELAR y I IBEMPA, La Habana Cuba.

    Grupo peruano con investigadores de otros pases

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Taller: Importancia de las PGPR en los cultivos orgnicos nativos

    Katty Ogata y Carlos Garca con losagricultores

    Junn, 2009

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    CONCLUSIONES

    Los contenidos de Cd, Cr estn por debajo de los valores permitidosmientras que si presenta problemas de contaminacin por Pb.

    Conforme la temperatura del ambiente baja, las poblaciones depseudomonas, actinomicetos y psicrfilos se incrementaron.

    Los suelos de Junn son franco arenosos, con alto contenido de materia

    orgnica, pH cidos, con disponibilidad de P y K, sin problemas decarbonatos y CIC variable.

    Las poblaciones de bacterias psicrfilas fueron mayores en la rizsfera de

    maca que en los suelos sin cultivo.Los valores mnimos de las poblaciones aerobias estuvieron en elorden 106, diaztrofos 106, hongos 104, Bacillus 104, actinomicetos103 y los psicrfilos aerobio104.

    De 120 de cepas bacterianas (diaztrofos, pseudomonas,actinomicetos y bacillus), todas produjeron AIA en diferentes niveles. Sinembargo, 6 cepas de diaztrofos destacaron por sus niveles de mayorproduccin.

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Cinco cepas aisladas de rizsfera de maca (bacillus, pseudomona,

    actinomicetos y diaztrofos) (de 11 seleccionadas) incrementaronsignificativamente el % G semillas de maca.

    Dos cepas de rizobios y un Bacillus (aisladas de tara, haba y papa)incrementaron significativamente los porcentajes de germinacin desemillas de maca. Cuando se prob la emergencia slo la cepa de rizobio

    P2N3 increment significativamente la emergencia de este cultivo.

    De un total de 421 cepas aisladas se encontr que 132 (31%) produjeron de20 a 70 g/ml de AIA.

    En la prueba de solubilizacin de fosfatos 68 cepas de las 421 cepasaisladas presentaron halos de 0.5 a 1.8 cm cuando se utiliz el medio NBRIP biclcico y 59 cepas presentaron halos de solubilizacin entre 0.5 y 2 cm elNBRIP triclcico

    Las cepas de pseudomona Ps42, actinomiceto 5Act y las interaccionesactino-diaztrofo: 5Act+5A, diaztrofo-pseudomona 5A+Ps42 presentarondiferencias significativas respecto al control.

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    El contenido de nitrgeno, potasio, calcio y magnesio en la parte area fuemayor que en la parte radicular. En cuanto al contenido de metales

    pesados, la parte area tiene casi cinco veces ms de contenido de plomoque la parte radicular; mientras que el contenido de cromo fue mayor en laparte radicular.

    No se observ ninguna influencia del tipo de suelo en la concentracin deglucosinolatos obtenidos. Por otro lado, se encontr que las macas

    moradas presentaron una mayor cantidad de este principio activo encomparacin con las macas amarillas.

    Se encontr que una de las cepas (Ps31) corresponde a unaStenotrophomonas rhizophila. Las dems pseudomonas caracterizadaspertenecen al grupo de P. fluorescensy P. putida

    Se encontraron tambin bacterias relacionadas con Rahnella aquatilis yPantoea agglomerans; y dos cepas de Bacillus emparentadas con B.butanolivorans

    De los glucosinolatos analizados se encontr un mayor contenido deGlucotropaeolin (benzylglucosinolato) lo que corresponde a lo encontradoen la bibliografa tanto en hipocotilo como en hojas.

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    Se presentaron 3 resmenes y 2 psters a la XXIV RELAR - I IBEMPA. La

    Habana Cuba. 2009.Una ponencia en Conference 16 of the FAO Biotechnoloogy Forum,Entitled Learning from the past: Successes and failures with agriculturalbiotechnologies in developing countries over the last 20 years. 8 junio-8Julio 2009.

    Existe un gran inters por parte de los agricultores y de la empresa deadquirir los conocimientos en lo que es agricultura orgnica, Utilizar lasbacterias promotoras de Crecimiento vegetal y poner en prctica lainoculacin con estos microorganismos en los cultivos nativosAltoandinos.

    De todos los sistemas probados, substratos y temperaturas ambientales,las jarras leonard, el suelo de Junn y condiciones de temperaturas frasresultaron mejor en la emergencia, crecimiento y desarrollo de plntulas

    de maca.

    Respecto a la difusin y capacitacin

  • 8/3/2019 Caracterizacin y seleccin de bacterias-Doris Zuiga

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    MUCHAS GRACIAS !!