©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

MANAGEMENTUL DATELOR ÎN

CERCETAREA MEDICALĂ (MDCM)

# 1

Sorana D. Bolboacă Universistatea de Medicină și Farmacie “Iuliu Hațieganu” Cluj-Napoca

1

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

OBIECTIVE

• Ce presupune managementul datelor în cercetarea medicală?

• De ce managementul datelor medicale e important?

• Identificarea problemelor în managementul datelor cercetării medicale

Changes happening now and in the future

24

-Fe

b-2

01

6

2

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

SCOPUL CERCETĂRII MEDICALE

24

-Fe

b-2

01

6

3

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

3 MOTIVE PENTRU MANAGEMENTUL

ȘI DISPONIBILIZAREA DATELOR

• Beneficiul personal

• Salvează timp și efort

• Publicarea datelor → vizibilitate

• Complianța:

• Cerință a finanțatorului (2011 USA)

• Cerință a comisiei de etică

• Transparență & Integritate:

• Datele pot fi cerute în momentul publicării

24

-Fe

b-2

01

6

4

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

VIZIBILITATE

24

-Fe

b-2

01

6

5

2005: Link la referință

2008: Link la referință

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

DE CE? …

24

-Fe

b-2

01

6

6

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

DE CE? …

24

-Fe

b-2

01

6

7

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

MANAGEMENTUL DATELOR CERCETĂRII

- DE CE?

24

-Fe

b-2

01

6

8

“And yet, data is the currency of science, even if publications are still the currency of tenure. To be able to exchange data, communicate it, mine it, reuse it, and review it is essential to scientific productivity, collaboration, and to discovery itself”.

Gold 2007

"Data richness, and our access to the technologies we need to understand it, are opening up radical new ways of approaching research, innovation and education. A turn toward data and computation as a basis for new kinds of research is underway across all areas of academia, business and public services, promising to transform enquiry, industry and our private lives." - Edinburgh Data Science

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

24

-Fe

b-2

01

6

9

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

24

-Fe

b-2

01

6

10

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

24

-Fe

b-2

01

6

11

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

24

-Fe

b-2

01

6

12

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

CICLUL DE VIAȚĂ AL DATELOR

24

-Fe

b-2

01

6

13

Planificare

Colectare

Descriere (metadata)

Păstrare

Integrare

Analiză

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

#1. RESPONSABILITATE

• Eficientizare (Cine? Ce? Când? ...)

• Plan al datelor de analize paraclinice

• Schimbarea echipei ← plan de management al datelor pentru noii veniți (studenți, Post-Doc, cercetători)

24

-Fe

b-2

01

6

14

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

BUNE PRACTICE #1

1. Definește roluri și atribuie responsabilități

2. Definește planul de gestionare a datelor → identificarea competențelor necesare

3. Atribuie sarcinile relaționat cu competențele personalului disponibil → identificarea sarcinilor pentru care nu există personal și instruirea personalului

4. Dezvoltă un plan de educație pentru a asigura continuitatea cercetării

5. Monitorizează activitatea

24

-Fe

b-2

01

6

15

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

#2. PLANUL DE

MANAGEMENT AL DATELOR

• Tipuri de date

• Proprietatea intelectuală asupra datelor

• Echipamente, metode și tehnici folosite pentru colectarea datelor

• Unde vor fi datele stocate în timpul și după terminarea cercetării?

MDCM_Act1.pdf

24

-Fe

b-2

01

6

16

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

3# ADMINISTRAREA

DATELOR • Etichetare inconsecventă:

• Ale diferitelor versiuni

• În foldere nestructurate

• Stocare

• pe mai multe sisteme

• în mai multe locații

• Formatul

• Hârtie

• Electronic

24

-Fe

b-2

01

6

17

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

BUNE PRACTICE #3

1. Evitați caracterele speciale în denumirea fișierelor (atenție la diacritice)

2. Nu utilizați spații în denumirea fișierelor și a folderelor

3. Utilizați maxim 25 caractere

4. Utilizați documentarea fișierelor și respectiv descrieți metodele utilizate

5. Includeți versiunea (în denumirea fișierului sau în fișier)

24

-Fe

b-2

01

6

18

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

4# METADATA

• Cum va putea cineva să înțeleagă conținutul fișierului (ex. denumirea coloanelor și semnificația valorilor dintr-un fișier Excel?)

• Standarde în etichetarea datelor

• Prezentarea unui set de date pentru a putea fi folosit ulterior

24

-Fe

b-2

01

6

19

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

BUNE PRACTICE #4

1. Descrieți conținutul fișierului

2. Definiți abrevierile și unitățile de măsură

3. Definiți codificările

4. Definiți codificarea pentru datele lipsă

24

-Fe

b-2

01

6

20

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

5# BACK-UP ȘI SECURITATEA

DATELOR

• Cât de efrecvent se face back-up datelor?

• Câte copii ale datelor e indicat să avem?

• Unde stochez datele?

• Care este spațiul de stocare de care am nevoie?

24

-Fe

b-2

01

6

21

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

24

-Fe

b-2

01

6

22

Link to reference

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

BUNE PRACTICE #5 1. 3 exemplare: original + extern(local) + extern

(distanță)

2. În locații diferite

3. Hard extern / Sistemul de back-up al calculatorului

4. Cloud (Amazon S3, Elephant Drive, Disk Jungle, Mozy, Carbonite, SDCS Cloud, Google Cloud Platform, etc.)

5. Varianta necodată pentru a putea fi folosită în viitor

6. Păstrați parolele pe hârtie (2 exemplare) ± în fișiere incriptate

7. De preferință necomprimate

24

-Fe

b-2

01

6

23

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

BUNE PRACTICE #5 - CLOUD

24

-Fe

b-2

01

6

24

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

6# DREPTUL DE PROPRIETATE ȘI

PĂSTRAREA

• Dreptul de proprietate intelectuală

• Politica Comisiei de Etică

• Politica finanțatorului cu privire la păstrarea datelor

• Politica editurilor cu privire la păstrarea datelor

• Reguli și legi internaționale și naționale

24

-Fe

b-2

01

6

25

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

24

-Fe

b-2

01

6

26

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

BUNE PRACTICE #6

1. IRB OHRP Requirements - 45 CFR 46 (USA):

3 ani

2. HIPAA (informație medicală identificabilă):

6 ani

3. FDA Requirements 21 CFR 312.62.c (USA):

2 ani

4. Proprietatea intelectual:

patent – toată viața acestuia

24

-Fe

b-2

01

6

27

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

BUNE PRACTICE #6

24

-Fe

b-2

01

6

28

Link to reference

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

24

-Fe

b-2

01

6

29

Link to reference

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

7# PLANIFICAREA PE TERMEN LUNG

• Ce se va întâmpla cu datele după terminarea proiectului?

• Cum pot evalua valoarea datelor mele?

• Care sunt opțiunile de arhivare și păstrare a datelor?

• Care sunt opțiunile de publicarea a datelor?

24

-Fe

b-2

01

6

30

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

BUNE PRACTICE #7

1. Tipul de fișier: sursă deschisă / închisă?

2. E necesar un program special pentru a vizualiza datele? Dacă da, puneți la dispoziție denumirea programului, versiunea și sistemul de operare în momentul în care creați metadata acestuia.

3. Structura de fișiere de date cuprinde mai multe fișiere? Dacă da specificați în metadata.

4. Formatul fișierului trebuie să fie cel care cu ceam mai mare probabilitate va putea fi citit și în viitor.

5. Fișier deschis, documentat standard, neîncriptat și necomprimat

24

-Fe

b-2

01

6

31

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

24

-Fe

b-2

01

6

32

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

PLANUL DE MANAGEMNT AL

DATELOR

24

-Fe

b-2

01

6

33

Link

©2

01

5 S

ora

na

D. B

olb

oac

ă

24

-Fe

b-2

01

6

34