péptidos y proteínas[1]

Péptidos y Proteínas

Enlace peptidico

• Péptidos cadenas de amino ácidos

Deshidratación

Residuo

• Proteínas simples• Proteínas

conjugadas– Grupo prostético

Estructura de proteínas4 niveles

Secuencia Patrones estructurales

Plegamientos 3D

Subunidades polipeptidicas

Estructura primaria• E. coli = 3000 proteínas• H. sapiens = 25000 -30000• Secuencia de amino ácidos única• Fundamental para la estructura 3D• Secuencias señal

Enlace peptídico

Deshidratación

Estructura secundaria

• Proteínas nativas: proteínas en cualquiera de sus conformaciones funcionales y de plegamiento.

• Conformación proteína– Interacciones débiles

Estructura secundaria

Entropía • Cadena polipeptidica:

múltiples conformaciones debido a un alto grado de entropía conformacional.

Contrarrestan• Puentes disulfuro• Interacciones débiles (no

covalentes)– Puentes de hidrogeno– Hidrofobicas– Ionicas

Estructuras especificas 2D y 3D

• La conformación de la proteína con mas baja energía libre (la más estable) es la que la que presenta el mayor numero de interacciones débiles.

• Solvente: Agua– Hidrofobica: interior de la proteína– Puentes de hidrogeno (cooperativos)

Cα---C --N---Cα. Coplanar

Punto de rotación

Rígido

Estructura secundaria

• Conformación local de alguna parte del polipeptido.

• Patrones de plegamiento• α-helice• Conformación β

α-Hélice

L- o D- amino ácidos

α-Helice

α-Hélice

α-Hélice

• Repulsión electrostática entre residuos de amino ácidos sucesivos con grupos R cargados

• Tipos de grupos R adyacentes• Interacciones entre grupos R espaciados 3 o 4

residuos • Presencia de Pro y Gly• Interacción entre residuos de amino ácidos en los

extremos de la hélice y el dipolo eléctrico.

Conformaciones β

Conformaciones β

Giros β

Giros β

Estructura terciaria

• Organización tridimensional • Residuos productores de giros: Pro, Thr, Ser y

Gly.• Segmentos de interacción entre cadenas

polipeptidicas son mantenidas su posiciones terciarias por diferentes clases de interacciones de unión débiles (o S-S)

Estructura terciaria

Estructura terciaria

Estructura cuaternaria

• Algunas proteínas tienen dos o más cadenas polipeptidicas separadas o subunidades.

• La organización de las subunidades en complejos 3-D

Clases de proteínas

• Proteínas fibrosas: cadenas polipeptidicas organizadas en largas hebras u hojas.– Soporte– Forma– Protección

• Proteínas globulares: cadenas polipeptidicas plegadas en forma globular.– Enzimas – Proteínas regulatorias

α-Queratina• Derecha individual• Izquierda las dos• 2 hebras en paralelo• Amplifica la fuerza de la estructura• Ala, Val, Leu, Ile, Met, and Phe

Miosina

Colágeno• Izquierda individual• Derecha las tres• 3 hebras en

paralelo• Amplifica la fuerza

de la estructura• 35% Gly, 11% Ala,

and 21% Pro y 4-Hyp

• Gly–X–Y, donde X es frecuentemente, Pro, Y 4-Hyp

Purificación de proteínas

Cromatografía de exclusión por tamaño

Cromatografía de afinidad

Purificación de proteínas

Cromatografía de intercambio cationico

Electroforesis

Separación basada en la migración de proteínas cargadas en un campo eléctrico (pI, p.m)

Electroforesis

Isoelectroenfoque

• Para determinar pI de una proteína

• Gradiente de pH, distribuidos en un campo eléctrico generado a través del gel.