1. uvod u metabolizam

Upload: antares986

Post on 16-Oct-2015

166 views

Category:

Documents


1 download

DESCRIPTION

Biokemija 2 - predavanja (PMF Split), prof.dr. sc.Maja Pavela - Vrančić

TRANSCRIPT

  • *Sveuilite u SplituPrirodoslovno-matematiki fakultetOdjel za kemiju

    prof. dr. sc. Maja Pavela-Vrani

  • *Cilj predmeta:prouavanje kako sloene kemijske reakcije podravaju ivot

  • * Energiju koriste za:gibanjeaktivni prijenosbiosintezuamplifikaciju signala

    Kemotrofni organizmi: dobivaju slobodnu energijuoksidacijom hranjivih tvari Fototrofni organizmi:hvatanjem svjetlosne energijeKolibri moe uskladititi dovoljno goriva zaneprekidni let preko Meksikog zaljeva ( 800 km)ivi organizmi trebaju stalan prilivslobodne energije

  • *

    metan metanol formaldehid mravlja ugljikov kiselina dioksidGo (oksidacije) (kJ/mol) - 820- 703 - 523 -285 0

    Masti i ugljikohidrati vaan su izvor stanine energije

    Masne kiseline su bogatije energijom atomi ugljika u masnimkiselinama vie su reducirani od atoma ugljika u ugljikohidratima

    masna kiselina glukozaOksidacija ugljikaide uz oslobaanje energije

  • *

    Autotrofni organizmi (proizvoai) proizvode vlastitu hranu (sloene organske spojeve) iz jednostavnih anorganskih molekula

    Heterotrofni organizmi (potroai) kao izvor ugljika koriste hranjive tvari

    CO2 + H2Oorganskispojevi + O2autotrofniorganizmiheterotrofniorganizmiivi organizmi dijele se s obzirom naoblik ugljika koji koriste za dobivanje energije

  • ivi organizmi dijele se s obzirom na oblik ugljika koji koriste za dobivanje energije

    autotrofni organizmi (proizvoai)proizvode vlastitu hranu (sloeneorganske spojeve) iz jednostavnihanorganskih molekula

    heterotrofni organizmi (potroai)kao izvor ugljika koriste hranjivetvari (organske spojeve autotrofnih iheterotrofnih organizama)

    CO2 + H2O

    organskispojevi + O2

    autotrofniorganizmi

    heterotrofniorganizmi

  • *Lasica - brzi metabolizamLjenivacspori metabolizamuglavnom se hrani biljkamalat. acedia- apatija ili lijenost

    provedu i vie od tjedan dana visei naglavce s istog stabla METABOLIZAMSkup svih pretvorbi tvari i energije koje se dogaajuu stanici ili u organizmu

  • *Opskrba i potronja energije,

    sinteza molekula za izgradnju staninih struktura i molekula potrebnih za rad i funkciju stanice, za rast i razvoj,

    odstranjivanje otpadnih proizvoda.Osnovna uloga metabolizmaCO2energijaO2H2Oglukozaklorofil

  • H2O

    H2O

    hranjivisastojci

    CO2

    O2

    otpadnetvari

    opskrba i potronja energije

    sinteza molekula za izgradnju staninih struktura i molekula potrebnih za rad i funkciju stanice, za rast i razvoj

    odstranjivanje otpadnih proizvoda

    Osnovna uloga metabolizma

  • *

    Biorazgradni metaboliki putovi = katabolizamsloeni metaboliti razgrauju se do jednostavnih produkata

    energija, osloboena oksidacijom gorivih molekula, pohranjuje se u obliku ATP, NADH, FADH2, GTP, NADPH

    razgradnja do zajednikih intermedijera

    Biosintetski metaboliki putovi = anabolizam

    Metabolizam je organiziran umetabolike putoveBIOSINTETSKE PRETEEaminokiseline, eerimasne kiseline, duikove bazeSTANINEMAKROMOLEKULEproteini, polisaharidilipidi, nukleinske kiselineENERGIJOM BOGATEHRANJIVE TVARIugljikohidrati, masti, proteiniENERGIJOM SIROMANIKRAJNJI PROIZVODIH2O, CO2, NH3KATABOLIZAM(oksidacijski,egzergoni)

    ANABOLIZAM(redukcijski,endergoni)

  • Katabolizam

    Anabolizam(biosinteza)

    Hranjive tvari

    CO2

    ATP

    ADP

    NADP+

    NADPH

    Odravanje i rast

    Biosintetski supstrati

  • *Metabolika karta

    Metaboliki putovi sastoje se od niza uzastopnihenzimski-kataliziranih reakcijaPolazita, stanice, odredita, smjerovi, putovi, raskrija?

  • Katabolike reakcije konvergiraju prema zajednikom meuproduktu, dok anabolike reakcije divergiraju od zajednikog meuprodukta *MetabolizamlipidaMetabolizamugljikohidrataMetabolizamsloenih ugljikohidrataMetabolizamkofaktora i vitaminaMetabolizamnukleotidaMetabolizamostalihaminokiselinaMetabolizamaminokiselinaMetabolizamostalih tvariMetabolizamlipidaEnergijskimetabolizam Everything should be made as simple as possible, but not simpler Albert Einstein

    Metaboliki putovi isprepliu se preko zajednikih meuprodukata (intermedijera)

    Metabolizam je skup metabolikih sustavaATP

  • steroidni fosfolipidi hormoni izopentenil triacilgliceroli masne pirofosfat kolesterol une kiseline soli

    krob alanin fenil- mevalonat vitamin K esterificirani alanin kolesterol ACETATglikogen glukoza piruvat (acetil-CoA) acetoacetil-CoA

    saharoza serin leucin masne kiselinetriacilgliceroli

    izoleucin CDP-diacilglicerol fosfolipidi

    CLK

  • *Enzimski katalizirane reakcijeNekatalizirana reakcija- visoka energija aktivacije

    Dio slobodne energijepohranjuje se u oblikuaktiviranih nosaa(ATP, NADH) Sva slobodna energija seoslobaa u obliku topline;ne skladiti se !Postupna oksidacija eera u staniciIzravno sagorijevanje eeraeereerSlobodna energijaPostupna oksidacija koja se odvija u stanici omoguava visoko iskoritenje energije pohranjene u hrani

  • *

    Adenozin-trifosfat (ATP)

    ATP je univerzalna valuta slobodne energije u biolokim sustavima

    ATP je glavni neposredni izvor slobodne energije

    ATP nije skladini oblik slobodne energije

    adeninanhidridne vezeGohidrolize = -30,5 kJ/mol

    ribozaEnergija gorivih molekula ne predaje se izravnoendergonim metabolikim procesimaesterska vezaGo hidrolize= -14 kJ/mol

    ATP + H2O ADP + Pi

    ATP + H2O AMP + PPiPPi + H2O 2Pi

  • aA + bB cC + dD

    G ovisi o prirodi reaktanata i njihovoj koncentraciji

    [C]c [D]d G = Go + RT ln [A]a [B]b

    Go = standardna promjena slobodne energije kod pH 7

    Standardno stanje biokemijskih reakcijapH = 7, t = 25 oC, aktivitet H+ iona (pH 7) = 1

    Go hidrolize ATP = - 30,5 kJ/mol

    U stanici: G hidrolize ATP - 50 kJ/mol

    *Gje promjena slobodne energije pri uvjetimakoji vladaju u stanici

  • *

    (1) A B + CG1o = +10 kJ/mol(2) CD G2o = -30 kJ/mol

    (3) A B + D G3o = G1o + G2o = -20 kJ/mol

    Sprega termodinamski nepovoljne reakcije s termodinamski povoljnom reakcijom moe tu reakciju uiniti spontanom

    Skup reakcija koji ini metaboliki put mora bititermodinamski povoljan (negativna promjena slobodne energije)

  • *hranjive tvari + O2CO2 + H2O+PiproduktireaktantiendergonereakcijeegzergonereakcijeATP-ADP ciklus:glavni oblik energetske razmjene ubiolokim sustavima

  • Bazalni metabolizamBazalni metabolizam: najmanja koliina energije potrebna za odravanje osnovnih ivotnih funkcija u stanju mirovanja pri vanjskoj temperaturi od 20 oC

    BMR (basal metabolic rate)

    eneBMR u kcal/dan = 655 + (9,6 x teina u kg) + (1,8 x visina u cm) - (4,7 x starost u god)

    MukarciBMR u kcal/dan = 66 + (13,7 x teina u kg) + (5 x visina u cm) - (6,8 x starost u godinama)

    Stvarno potrebna koliina energije:bez fizike aktivnosti: BMR x 1,2lagana fizika aktivnost: BMR x 1,37umjerena fizika aktivnost: BMR x 1,55 fizika aktivnost: BMR x 1,73trening: BMR x 1,9

    *

  • *Energija gorivih molekula oslobaa seu tri stupnjaHidroliza sloenih molekulana graevne podjedinice

    Razgradnja dojednostavnih metabolita

    Oksidacija acetil-CoA putem CLK,prijenos elektrona na NAD+ i FAD,oksidacijska fosforilacija do ATPI. stupanjII. stupanjIII. stupanjgliceraldehid-3-fosfatCikluslimunskekiselinepentozeheksoze

  • *linearni putprodukt reakcije je supstrat slijedee reakcije A B C D E

    cikliki putintermedijeri se obnavljaju

    spiralni putisti skup enzima djelujeviekratnoABCDEVrste metabolikih putova

  • *Obiljeja metabolikih reakcijaest osnovnih skupina kemijskih reakcijarelativno jednostavni reakcijski mehanizmi

    1. Oksido-redukcijske reakcijepiruvatlaktat2e- + 2H+2e- + 2H+

  • *2. Reakcije u kojima nastaje kovalentna veza (na pr. C-C veza)

    aldozaketozapiruvatoksaloacetat3. Izomerizacija

  • *4. Prijenos skupine5. Hidroliza6. Adicija na dvostruku vezu, eliminacijaglukozaglukoza-6-fosfatgalaktoza glukozalaktoza

  • *Biosintetski i razgradni putovi gotovo uvijeksu razdvojeniodvijaju se u specifinim staninimodjeljcimameusobna pretvorba metabolita odvija serazliitim putovima i katalizirana je razliitim enzimima

    Nezavisna kontrola brzine reakcije: inhibicija enzima E1 ne utjee na enzim E2

    Usporavanje reakcije AX,usporava i reakciju XAMetaboliki putovi regulirani su preko enzima koji kataliziraju kljune ireverzibilne korake

  • *Mnoge metabolike reakcije regulirane su energijskim nabojem stanice

    ATP + ADP Energijski naboj = __________________________ ATP + ADP + AMP

    U fiziolokim uvjetima zbrojATP + ADP + AMPje konstantan

    Vrijednost energijskog naboja:0 (samo AMP) - 1 (samo ATP)

  • *CILJ

    *