wyklad 2
TRANSCRIPT
![Page 1: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/1.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Komórka i jej składniki11
![Page 2: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/2.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Najważniejsze rodzaje komórek stosowanych w biotechnologii przemysłowej
Komórki prokariotyczne:
1. Bakterie gramdodatnie i gramujemne producenci kwasów, alkoholi, aminokwasów, białek
- w tym promieniowce producenci antybiotyków
Komórki eukariotyczne
2. Grzyby
drożdże producenci etanolu i białek
grzyby pleśniowe producenci białek i antybiotyków,i niektórych związków prostych
3. Komórki zwierzęce- komórki owadzie, CHO, BHK producenci białek
![Page 3: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/3.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Komórki bakteryjne
Morfologia komórek bakteryjnych
![Page 4: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/4.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Prokariotyczna komórka bakteryjna
![Page 5: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/5.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Skład i funkcja biologiczna elementów komórki prokariotycznejSkładnik Skład molekularny Funkcja biologiczna
Polisacharydy usieciowane peptydami, otoczone lipopolisacharydami
Biwarstwa lipidowo (40%)-białkowa (60%); mezosomto wpuklenie błony
Zawiera chromatynę -kompleks DNA i białek histonowych
Kompleksy RNA (65%) i białek (35%)
Małe cząsteczki, białka rozpuszczalne, enzymy, sole nieorganiczne
Ściana komórkowa, wici i rzęski
Błona komórkowa, mezosom
Obszar jądrowy
Rybosomy
Cytoplazma
Ochrona przed stresemosmotycznym i mechanicznym,Ruch (wici), adhezja i koniugacja (rzęski)
Selektywnie przepuszczalna barieraumożliwiająca transport składnikówpokarmowych i metabolitów
Genom. Miejsce przechowywaniai powielania informacji genetycznej
Miejsce biosyntezy białek
Miejsce zachodzenia większościreakcji metabolicznych
![Page 6: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/6.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: TECHNOLOGIA CHEMICZNAPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Komórki bakteryjne są otoczone ścianą komórkową
Uproszczone struktury osłon zewnętrznych komórek bakteryjnych
![Page 7: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/7.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Bakteryjna ściana komórkowa i jej biosynteza to miejsca działania ważnych antybiotyków
Antybiotyki beta-laktamowe
WankomycynaPeptydoglikan
Liza komórki bakteryjnej
![Page 8: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/8.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Promieniowce (Actinomycetales)
![Page 9: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/9.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Eukariotyczna komórka zwierzęca
![Page 10: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/10.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Eukariotyczna komórka roślinna
![Page 11: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/11.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Skład i funkcja biologiczna organeli komórki eukariotycznejOrganela Skład molekularny Funkcja biologiczna
Biwarstwa lipidowo (50%)-białkowa (50%);
Zawiera chromatynę -kompleks DNA i białek histonowych + RNA
Zespoły błon lipidowo-białkowych+ rybosomy
j.w. + polisacharydy
Otoczone podwójną błoną, zawierają enzymy, DNA i RNA
Pęcherzyki zawierające enzymy hydrolitycznePęcherzyki zawierające katalazę i inne enzymy utleniające
Otoczone podwójną błoną, zawierają białka, lipidy, chlorofil,RNA, DNA i rybosomy
Małe cząsteczki, białka rozpuszczalne, enzymy, sole nieorganiczne, cytoskeleton
Selektywna bariera transportowa;komunikacja międzykomórkowa
Miejsce przechowywania i powielania informacji genetycznej i transkrypcji
Miejsce biosyntezy białek
Miejsce wydzielania „odpadów”komórkowych i obróbki białek
Miejsce części reakcji katabolicznych i syntezy ATP
Metabolizm materiałów pobranychna drodze endocytozyMiejsce reakcji katabolicznych, w których powstaje H2O2
Miejsce fotosyntezy
Miejsce zachodzenia większościreakcji metabolicznych oraz struktura nadająca kształt komórce
Błona komórkowa
Jądro
Siateczka środplazmatyczna z rybosomami
Aparat Golgiego
Mitochondria
Lizosomy (zwierzęta)
Peroksysomy (zw.) lub glioksysomy (rośliny)
Chloroplasty (rośliny)
Cytoplazma
![Page 12: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/12.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Jądro komórkowe
Obraz komórek HeLa z jądrami komórkowymi zaznaczonymi barwnikiem Hoechst
![Page 13: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/13.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Mitochondrium
Obraz w mikroskopie elektronowymmitochondriów komórek pęcherzyków płucnych
![Page 14: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/14.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Siateczka śródplazmatyczna – retikulum endoplazmatyczne
Obraz w mikroskopie elektronowymretikulum endoplazmatycznego1- jądro; 2 – por jądrowy;
3 – szorstkie RE; 4 – gładkie RE;5 – rybosom; 6 – białko transportowane w RE; 7 – pęcherzyk transportowy;8 – aparat Golgiego (AG); 9 – strona cis AG; 10 – strona trans AG; 11 – cysterna AG
![Page 15: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/15.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Struktura rybosomuKatalityczny rdzeń rybosomuzbudowany jest z rRNA
Rybosomy
Rybosomy prokariotyczne: 30S + 50S → 70SRybosomy eukariotyczne: 40S + 60S → 80S
Wizualizacja struktury rybosomu
![Page 16: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/16.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Grzyby w biotechnologii
Grzyby są organizmami heterotroficznymi – pasożyty lub saprofity
Przykłady ról grzybów w środowisku:
- dekompozycja martwej tkanki biologicznej (np. degradacja składnikówdrewna)
- czynniki chorobotwórcze – rośliny (ponad 5 000 chorób), zwierzęta- Mycorrhizae – symbioza z korzeniami roślin
W biotechnologii - procesy fermentacyjne, wytwarzanie antybiotykówproducenci białek terapeutycznych
![Page 17: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/17.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Drożdże
Budowa komórki drożdżowej
Obraz komórek drożdży w skaningowym mikroskopie elektronowym
Morfologia drożdży
![Page 18: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/18.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
chityna
mannoproteiny
Struktura grzybowej ściany komórkowej
![Page 19: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/19.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych Przedmiot: Podstawy Biotechnologii
GRZYBY
Mucor racemous
Penicillium chrysogenum
Aspergillus fumigatus
Zygomycetes – grzyby pleśniowe,sprzężniaki Grzybnia zbudowana z niepodzielnego mycelium. Rozmnażanie płciowe poprzez zarodniki zwanezygosporami lub bezpłciowe poprzez spory w sporangium.
Ascomycetes – workowceGrzyby jednokomórkowe lub tworzące grzybnię w postaci podzielnych strzępek.Rozmnażanie płciowe poprzez askospory lub bezpłciowe przez konidia. Do tej klasy należą m.in. Neurospra, Penicillium.
![Page 20: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/20.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy BiotechnologiiPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii
Basidomycetes – podstawczaki Grzyby jednokomórkowe lub rozgałęzione. Rozmnażanie płciowe poprzez basidospory lub bezpłciowe poprzez konidia. Do tej klasy należą grzyby kapeluszowe.
Deuteromycetes – grzyby niedoskonałeGrzyby jednokomórkowe lub rozgałęzione. Cecha charakterystyczna – brak rozmnażania płciowego.
Amanita phalloides
Candida albicans
![Page 21: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/21.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Grzyby pleśniowe
Aspergillus nidulans
![Page 22: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/22.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Grzyby - rozmnażanie
![Page 23: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/23.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Drobnoustroje jako biologiczne źródło nowych potencjalnych lekówDrobnoustroje prokariotyczne i eukariotyczne wytwarzają olbrzymią ilość małocząsteczkowych metabolitów wtórnych, z których wielewykazuje selektywną toksyczność wobec innych drobnoustrojów(antybiotyki przeciwdrobnoustrojowe), działanie przeciwnowotworowe(antybiotyki przeciwnowotworowe), ale także obniżające ciśnienie, hamujące biosyntezę cholesterolu, o działaniu przeciwbólowym, immunosupresyjnym i innym.
- wyizolowano i opisano około 20 000 metabolitów wtórnych;- połowa z nich działa antybiotycznie lub cytostatycznie- zastosowanie medyczne – około 150
Potencjalne dalsze możliwości:- z 40 000 gatunków bakterii poznano około 5 000- z 1,5 mln gatunków grzybów poznano około 70 000- bardzo słabo poznane: drobnoustroje morskie, ekstremofilne
![Page 24: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/24.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Biofarmaceutyki białkowe
Systemy ekspresyjne:Komórki ludzkie – gen zmodyfikowany w obszarze promotoraCHO – Chinese hamster ovary (komórki jajnika chomika
chińskiego)BHK – baby hamster kidney (komórki nerki chomika)Komórki owadzie, gen włączony w genom baculowirusaAutographa californicaDrożdże – S. cerevisiae, Pichia pastorisBakterie – E. coli, Bacillus spp. Transgeniczne rośliny i zwierzęta
![Page 25: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/25.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
The purpose of micro-organism is....
...to make another micro-organism
Cel procesu biotechnologicznego:
1) jak najwięcej komórek drobnoustrojów w jak najkrótszym czasie...
lub 2) jak najwięcej pożądanego produktu
Przypadek 2) sprzeczny z życiowym celem drobnoustroju
![Page 26: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/26.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Metabolizm = anabolizm + katabolizm
Procesy anaboliczne – endoergiczne i redukcyjneProcesy kataboliczne – egzoergiczne i utleniające
![Page 27: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/27.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Bilans masowy utleniania glukozy w warunkach tlenowych i beztlenowych
![Page 28: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/28.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Metabolizm
kluczowe cząsteczki
A + B + ATP → AB + ADP + Pi
A + B + ATP → AB + AMP + PPi
A + ATP → A-P + ADP
![Page 29: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/29.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Etapy katabolizmu
![Page 30: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/30.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Katabolizm
Główne szlaki kataboliczne jako źródła prekursorów dla biosyntezy składników biomakromolekuł
![Page 31: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/31.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Cykl CorichMleczan powstający w pracującym mięśniuulega w wątrobie przekształceniu w glukozę
W warunkach beztlenowych w mięśniu pirogronian jestprzekształcany w mleczan
Obecność dodatkowej reakcji umożliwiaregenerację NAD+
![Page 32: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/32.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Przekształcenie pirogronianu w etanol w komórkach drożdży w warunkach fermentacji alkoholowej
![Page 33: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/33.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Produkty metabolizmu beztlenowego w różnych drobnoustrojachReakcje prowadzące do odtworzenia NADH są zaznaczone jako R
![Page 34: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/34.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Regulacja metabolizmu drobnoustrojów
Zasady podstawowe
1. Równowaga pomiędzy procesami wytwarzającymii zużywającymi metabolity pośrednie
2. Energetyczne sprzężenie metabolizmu – bilansowanie zysku reakcji katabolicznych z sumą potrzeb energetycznychkomórki
![Page 35: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/35.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Etapy ekspresji genu
![Page 36: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/36.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Regulacja ekspresji genu przez białka regulatorowe
![Page 37: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/37.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Główne mechanizmy regulacji transkrypcji genówkodujących enzymy metabolizmu podstawowego
Katabolizm:indukcja substratowa
Substrat lub jego metabolit działa jako induktor lub efektor pozytywny aktywatora. Regulacja dotyczy szlaku katabolizmu danego substratu
-represja katabolicznaŁatwiej przyswajalne źródło węgla lub efektor syntezowany w komórce w jegoobecności działa jako korepresor lub efektor negatywny aktywatora.Regulacja dotyczy szlaku katabolizmu trudniej przyswajalnego źródła węgla
-represja azotowaj.w., ale dotyczy szlaku przyswajania źródła azotu. Dotyczy także białek
transportowych
Anabolizm:- represja końcowym produktem szlakukońcowy produkt szlaku działa jako korepresor lub efektor negatywny aktywatora. Dotyczy szlaku biosyntezy -atenuacjamechanizm specyficzny dla drobnoustrojów prokariotycznych
![Page 38: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/38.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Diauksja – dwufazowość wzrostu drobnoustrojóww obecności dwóch źródeł węgla
Produkcja penicyliny przez Penicillum chrysogenum
![Page 39: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/39.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot: Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
Inne mechanizmy regulacji metabolizmu podstawowego
Regulacja aktywności enzymów
1. Enzymy regulatorowe – regulacja allosteryczna
2. Kowalencyjna modyfikacja enzymów
3. Kompleksy wieloenzymowe
Regulacja transportu metabolitów
1. Transport białek przez błony
2. Regulacja ilości i aktywności białek transportowych(permeaz)
![Page 40: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/40.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Grupy specyficznych produktów metabolizmu drobnoustrojów
alkaloidy fenazyny pirydynyaminocukry flawonoidy piroleaminoglikozydy fosfoglikolipidy pironyaminokwasy ftalaldehydy poliacetylenyantocyjaniny glikozydy polienyansamycyny hydroksyloaminy polieteryantrachinony laktony polikwasyantracykliny makrolidy polipeptydychinoliny naftochinony polisacharydychinolinony nitryle salicylanychinony nukleozydy steroidydepsipeptydy peptydy tetracykliny
![Page 41: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/41.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Przemiany peryferyjne a przemiany centralne
![Page 42: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/42.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Idiolity są syntezowane w idiofazie
![Page 43: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/43.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Koncepcje wyjaśniające przyczyny biosyntezy idiolitów 1. Uzyskanie przewagi w danym środowisku
2. Przystosowanie się do zmieniających się warunkówśrodowiska dzięki dodatkowym szlakom metabolicznym
3. Utrzymanie stanu równowagi ze otoczeniem, gdy normalny wzrost nie jest możliwy
4. Wynik rozregulowania metabolizmu. Nadprodukcja idiolitów rodzajem „wentyla” dla niezbilansowanych przemian
5. Obszar „wolnej gry” ewolucyjnej poza zakresem ścisłychreguł selekcji eliminujących zmiany niekorzystne dla organizmu. Niektóre z idiolitów znajdują w końcu zastosowanie w metabolizmie producenta
![Page 44: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/44.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Szlaki biosyntezy metabolitów wtórnych
1. Szlak poliketydowy2. Polimeryzacja jednostek izoprenoidowych3. Nierybosomalna synteza peptydów4. Mieszana biosynteza poliketydów i peptydów5. Biosynteza aminoglikozydów oraz amino- i peptydylonukleozydów
Fazy biosyntezy metabolitów wtórnych
1. Biosynteza i aktywacja prekursorów2. Oligomeryzacja3. Modyfikacja4. Kondensacja składników5. Modyfikacje końcowe6. Ukierunkowany eksport
![Page 45: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/45.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Szlak poliketydowy – biogeneza niektórych antybiotyków
![Page 46: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/46.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Regulacja biosyntezy idiolitów
MECHANIZMY KONTROLI BIOSYNTEZY IDIOLITÓW
- indukcja substratowa; - indukcja powodowana przez regulatory metaboliczne;- represja i hamowanie kataboliczne;- regulacja związkami azotu;- regulacja fosforanowa i energetyczna;- hamowanie w sprzężeniu zwrotnym – zarówno
przez metabolity podstawowe jak i specyficzne;- regulacja z udziałem pierwiastków śladowych;- regulacja tlenowa;- regulacja innymi czynnikami, takimi jak temperatura lub pH
![Page 47: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/47.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Regulacja biosyntezy idiolitów
Indukcja substratowa
1. Biosynteza cefalosporyny C w C. acremonium – obecność w podłożu DL-cysteiny lub DL-norleucyny
2. Biosynteza alkaloidów sporyszu przez grzyby Clavicepsis– DL-tryptofan
Warunek – induktor dodawany w fazie wzrostu, a nie w fazie produkcji
![Page 48: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/48.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych Podstawy Biotechnologii TECHNOLOGIA CHEMICZNA
Regulacja biosyntezy idiolitówRegulacja fosforanowa
Zasada ogólna – niskie stężenie fosforanu stymuluje biosyntezę idiolitów
![Page 49: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/49.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Inżynieria metaboliczna szczepów przemysłowych
Producenci metabolitów pierwotnych:
- wprowadzenie zmian umożliwiających nadprodukcję- maksymalizacja nadprodukcji- zmiany umożliwiające pozakomórkowe wydzielanie produktu
Producenci metabolitów wtórnych:
- maksymalizacja wydajności produktu- możliwość wytwarzania produktów innych niż naturalny
![Page 50: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/50.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Cechy szczepu wysokowydajnego
maksymalna wydajność pożądanego produktu
minimalizacja wytwarzania niepożądanych produktów ubocznych
stabilność genetyczna
odporność na zakażenia wirusowe
![Page 51: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/51.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Klasyczne metody otrzymywania i hodowli szczepów wysokowydajnych
nieukierunkowane zmiany genetyczne - mutageneza
wytwarzanie, fuzja i odnawianie protoplastów
optymalizacja warunków wzrostu
![Page 52: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/52.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Mutanty szczególnie przydatne dla otrzymywania wysokowydajnych producentów metabolitów pierwotnych
MUTANTY AUKSOTROFICZNE (ŻYWIENIOWE)
Komórki pozbawione aktywności co najmniej jednegoenzymu katalizującego reakcję szlaku biosyntetycznego
MUTANTY REGULATOROWE
-mutacja w genie regulatorowym lub w obszarze promotorowympowodująca stałą derepresję biosyntezy;
-mutacja w genie strukturalnym, w efekcie której produkt genuma niezmienioną aktywność katalityczną, ale traci wrażliwośćna działanie inhibitora allosterycznego
![Page 53: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/53.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Możliwość osiągnięcia celu:
Mutant auksotroficzny wobec związku F
Cel – uzyskanie nadprodukcji związku G
![Page 54: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/54.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Biosynteza kwasu cytrynowego
Cykl Krebsa
![Page 55: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/55.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Nadprodukcja kwasu cytrynowego w Aspergillus niger
Aktywność fosfofruktokinazy I, kluczowego enzymu regulatorowegoglikolizy jest hamowana przez ATPi cytrynian
Efekt Pasteura
U drobnoustrojów względnie anaerobowych, wydajność biomasy jest dużo większa w obecności tlenu, który hamuje fermentację alkoholową.Mechanizm: hamowanie glikolizy przez ATP i cytrynian
Efekt Crabtree
W hodowlach tlenowych następuje częściowe hamowanie oddychania przy bardzo dużych stężeniach glukozy
![Page 56: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/56.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Nadprodukcja kwasu cytrynowego w Aspergillus niger
Droga alternatywna funkcjonuje w warunkach niskiego stężenia fosforanówI silnego napowietrzania
![Page 57: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/57.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Jakie warunki należy spełnić, aby możliwa była wysoko wydajna produkcja kwasu cytrynowego?
1. Wysoko wydajny szczep Aspergillus niger- obecność alternatywnego łańcucha oddechowego- mutant regulatorowy – PFK-I niewrażliwa na hamowanie przez cytrynian
2. Odpowiednie warunki hodowli- skład pożywki: wysokie stężenie cukru; niskie stężenie jonów Fe(II) i Mn(II; niskie pH, około 2);
niskie stężenie fosforanów- bardzo intensywne napowietrzanie
![Page 58: Wyklad 2](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081404/558c40d2d8b42a8d4f8b4680/html5/thumbnails/58.jpg)
Politechnika Gdańska, Inżynieria BiomedycznaPrzedmiot:
Wykład 2 – Biologiczne podstawy procesów biotechnologicznych
TECHNOLOGIA CHEMICZNAPodstawy Biotechnologii
Hybrydyzacja – fuzja protoplastów
Przykłady zastosowania:
• Praktycznie wszystkie szczepy przemysłowe używane do produkcji antybiotyków w wiodących firmach farmaceutycznych są rekombinantami otrzymanymi w wyniku fuzji protoplastów;
• Szczepy zawierające wiele kopii genów odpowiedzialnych za biosyntezęantybiotyku (np. Penicillium chrysogenum zaw. 20 zestawów genów kodujących wytwarzanie penicyliny G);
• Fuzja protoplastów dwóch szczepów Cephalosporium acremoniumwytwarzających cefalosporynę C: wysokowydajnego, ale wolno rosnącego i nie wytwarzającego spor oraz drugiego o cechach odwrotnych. Rekombinant posiadał kombinację cech korzystnych; wydajnośćo 40% lepsza niż wydajniejszy ze szczepów rodzicielskich.