tipos de intrones gu-ag au-ac grupo i grupo ii grupo iii intrones gemelos pre-trna arqueales...
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Tipos De intrones
• GU-AG• AU-AC• Grupo I• Grupo II• Grupo III• Intrones
gemelos• pre-tRNA• Arqueales
• pre-mRNA nuclear eucariote• pre-mRNA nuclear eucariote• pre-rRNA nuclear eucariote• RNAs de organelos• RNAs de organelos• RNAs de organelos
• pre-tRNA nuclear eucariote• varios RNAs
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Problema: Definición de los sitios de splicing
Solución: Secuencias consenso del mRNA en la fronterasentre exón/intrón. Acción de snRNA medianteel apareamiento Watson Crick a sitios crucialesdel mRNA. Complejos RNA-proteína (snRNP´s).
Ocurrencia: Co-transcripcional. Pol II CTD recluta los factores de splicing.
Factores: 5 snRNA: U1 (165 nts), U2 (185), U4 (145), U5 (106), U6 (116).100 proteínas (organizadas como U1 snRNP, U2 snRNP, etc.). Abundancia 2.5 105 – 1 x 106
Catálisis: Transesterificación del RNA
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Tres problemas topológicos
• ¿Cómo identificar sitios de splicing distantes varias kb entre ellos?
• ¿Cómo identificar los sitios de splicing correctos sin saltarse alguno?
• ¿Cómo evitar la utilización de sitios crípticos ó espurios?
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¿Cuáles son los puntos de regulación
del splicing?
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Complejo de definición del exón
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¿Se remueven los intrones en algún orden específico?
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Procesamiento de un exón extra-largo
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Intrones del grupo I Intrones del grupo II (III)
tamaño 400-3000 bases 400-2500 bases
ocurrencia ampliamente distribuidos en mitocondrias de hongos y plantas, en virus, cloropastos y rRNA nuclear en eucariotes simples
raros, algunos mRNA en mitocondrias y cloroplastos de hongos y plantas
nucleófilo GTP-3´OH, Ex-3´OH pAp-2´OH, Ex-3´OH
tipo de reacción doble transesterificación doble transesterificación
ORFs endonucleasas, madurasas
endonucleasas, transcriptasa reversa
función biológica movilidad del intrón movilidad del intrón
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Resumen: procesamiento de intrones de los grupos I y II
Intron del grupo IIIntron del grupo I
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¿Cómo Se Especifican Los Sitios Del Autoprocesamiento?
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intrón del rRNA de Tetrahymena
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Procesamiento por corte especifico - RNAs no codificantes
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Procesamiento por modificación química de pre r-RNAs y pre t-RNAs
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Un pre rRNA humano sufre 106 metilaciones y 95 pseudouridilaciones de manera específica y con un patrón
extremadamente conservado
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Edicion de RNAs
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¿Que sucede cuando hay intrones múltiples
en un gene?
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Ejemplos de splicing alternativo
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Transporte del mRNA procesado
Factores de especificidad para el procesamiento y la poliadenilación
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Histonas 100/minOtras proteínas 100/minProteínas ribosomales 150/min
Subunidades ribosomales 5/minmRNA 1/min
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Control de la estabilidad del RNA y su degradación
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Señales que identifican al mRNA procesado
(a)
(b)
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Remoción de señales durante la primera ronda de traducción de un mensajero silvestre
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Circularización del mRNA después de la primera ronda de traducción
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Activación de los factores de liberación por codones de terminación prematuros
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La formación de complejos de RF, SC y marcadores del sitio de procesamiento activan a la enzima que
remueve el cap