statisticke metode u biomedicinskim istrazivanjima

75
Doc. dr Zoran Milošević Ass. mr sc. med. Irena Janković Ass. mr sc. med. Miodrag Stojanović Dr sc. med. Dragan Bogdanovic Dr Aleksandra Topalović

Upload: dudapaskas

Post on 25-Jul-2015

896 views

Category:

Documents


3 download

TRANSCRIPT

Page 1: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Doc. dr Zoran MiloševićAss. mr sc. med. Irena Janković

Ass. mr sc. med. Miodrag StojanovićDr sc. med. Dragan Bogdanovic

Dr Aleksandra Topalović

Page 2: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

U biomedicinskim istraživanjima deskriptivnom statistikom se prikazuju osnovni statistički parametri:

1. mere centralne tendencije (aritmetička sredina – Xsr, medijana – Me, modus – Mod)

2. mere varijabilnosti (varijansa – SD2, standardna devijacija – SD, standardna greška – SG, koeficijent varijacije – Cv)

Page 3: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Naučna hipoteza testira se analitičkom statistikom.

Postupak provere hipoteze svodi se na utvrđivanje ZNAČAJNOSTI (signifikantnosti) razlike između pretpostavljene (hipotetičke) vrednosti parametara osnovnog skupa i ocene datog parametra na osnovu informacija iz uzorka.

Page 4: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Test se zasniva na adekvatno odabranoj statističkoj metodologiji, tako da se Ho prihvata za određene vrednosti, a za ostale odbacuje.

Testovi značajnosti mogu biti:

1. parametrijski (kada su vrednosti ispitivanog obeležja date numerički) i

2. neparametrijski (kada su vrednosti ispitivanog obeležja date opisno ili se rangiraju)

Page 5: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Izbor statističkih testova zavisi od:

- vrsta obeležja (numeričko ili atributivno);- broja i veličine uzorka (mali ili veliki uzorci);- vrste rasporeda ( normalan ili ne – za brzu orjentaciju da li je Cv< ili > 30%);- snage i efikasnosti testa (parametrijski testovi imaju veću snagu od neparametrijskih).

Page 6: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Tabela za brzu orjentaciju izbora odgovarajućeg statističkog testa

Page 7: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima
Page 8: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Rezultati istraživanja se sistematizuju i prikazuju

tabelarno i grafički, a za statističku analizu koriste

se razni programski paketi (SPSS, Statcalc, Epi

Info, Edustat...).

Page 9: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Kako formirati bazu podataka?

U Excelu, gde je jedan pacijent u jednom redu, a u prvom redu su nazivi svake od kolona.

Napomena: obratiti pažnju da li je decimne brojeve potrebno odvajati zarezom ili tačkom zbog različitih postavki računara (da bi bili tretirani kao brojevi, a ne kao tekst)

Tako formirane baze podataka mogu se preneti u druge statističke programe.

Page 10: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Primer:

Page 11: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

DESKRIPTIVNA STATISTIKA

mere centralne tendencije (aritmetička sredina – Xsr, medijana – Me, modus - Mod)

mere varijabilnosti (varijansa – SD2, standardna desvijacija – SD, standardna greška – SG, koeficijent varijacije – Cv)

Primer. Izračunati mere centralne tendencije i mere varijabilnosti za bilirubin kod 150 ispitivanih pacijenata Hirurške klinike u Nišu.

Iz menija izaberete: Analyse> Descriptive Statistics> Descriptives

Page 12: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima
Page 13: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

U novom prozoru izaberemo traženu varijablu (šifriranu sa bilirub), (može i više varijabli) koja se nalazi sa leve strane i strelicom prebacimo u prostor za varijable sa desne strane.

Kliknemo na Options i otvori se novi prozor sa ponuđenim opcijama za mere centralne tendencije i varijabilnosti.

Izaberemo (obeležimo) parametre za izračunavanje.

Page 14: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima
Page 15: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Zatim kliknemo na Continue (zatvori se poslednji otvoreni prozor), OK i u Outputu dobijamo izračunate vrednosti.

Descriptive Statistics

150Valid N (listwise)

.1981.5247721.79987.873777.1748687.1540348.007.50150bilirub

Std. Error

StatisticStatisticStatisticStd. ErrorStatisticStatisticStatisticStatistic

Skewness

VarianceStd.

DeviationMeanMaximumMinimumN

Page 16: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

ANALITIČKA STATISTIKAANALITIČKA STATISTIKA

Page 17: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Primenjuje se kada treba izračunati razliku u prosečnim vrednostima između dva nezavisna uzorka (numeričko obeležje, veliki nezavisni uzorci, >30 jedinica, mali nezavisni uzorci sa Cv<30%)

T test za dva nezavisna uzorka

Primer. Izračunati razliku prosečnih vrednosti bilirubina između muškaraca i žena kod 150 pacijenata.

Napomena: U bazi podataka pol je šifriran sa: 1-muškarci, 2-žene.

Page 18: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Iz menija izaberete: Analyze > Compare Means > Independent-Samples T TestIndependent-Samples T Test dialog box

Izaberemo varijablu sa vrednostima bilirubina. Posebno selektujemo grupnu varijablu, kliknemo na Define Groups da potvrdimo šifre grupa koje poredimo.

Page 19: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Definišete grupe u dialog boxu za numeričke varijable

Kliknete Continue > OK

Page 20: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

U Outputu dobijete rezultate

10.0093977.5324084.0333602.00

9.96191

94.5069489.2344901.00bilirub

Std. Error MeanStd. DeviationMeanNpol

Group Statistics

Independent Samples Test

33.11800-22.715714.121885.20111.713141.643.368 Equal variances not assumed

34.22798-23.825714.688805.20111.724148.354.2341.425Equal variances assumed

bilirub

LowerUpperLowerUpperLowerUpperLowerUpperLower

95% Confidence Interval of the

Difference

Std. Error Differenc

eMean

DifferenceSig. (2-tailed)dftSig.F

t-test for Equality of MeansLevene's Test for

Equality of Variances

Zaključak:

Nije postojala signifikantna razlika u prosečnoj vrednosti bilirubina između muškaraca i žena (t=0,368, p=0,713)(t=0,368, p=0,713).

Page 21: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

T test za dva zavisna uzorka

Primenjuje se kada treba izračunati razliku u prosečnim vrednostima između dva zavisna uzorka, tj. kod jedne iste grupe ispitanika pre i posle merenja (numeričko obeležje, veliki uzorci - >30 jedinica, ili mali uzorci sa Cv<30%)

Primer. Izračunati razliku u prosečnoj vrednosti triglicerida (TG) kod 142 bolesnika pre i posle terapije statinima.

Iz menija izaberete: Analyze > Compare Means > Paired-Samples T Test

Page 22: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Paired-Samples T Test dialog box

Selektujete prvu varijablu (tgpre) i to je Variable1.

Zatim selektujete drugu varijablu (tgposle) i to je Variable 2.

Klinknete na strelicu da prebacite par u listu Paired Variables.

Page 23: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Paired Samples Statistics

Mean N Std. DeviationStd. Error

Mean

Pair 1 tgpre2.2346 142 .50720

.04256

tgposle 2.0880 142 .62692 .05261

Paired Samples Correlations

N Correlation Sig.

Pair 1 tgpre & tgposle142 .559 .000

Zaključak:

Postojala je signifikantna razlika u nivou triglicerida pre i posle terapije statinima 142 bolesnice (P<1x106).

Page 24: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Koristi se za izračunavanje razlika u prosečnim vrednostima između dva nezavisna uzorka (numeričko obeležje, mali nezavisni uzorci sa Cv>30%)

Mann Whithey test

Iz menija izaberete:

Analyze > Nonparametric Tests > 2 Independent Samples

Page 25: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Two-Independent-Samples Tests dialog box

Selektujete jednu ili više numeričkih varijabli.

Selektujete grupnu varijablu, kliknete na Define Groups (kao kod t testa za nezavisne uzorke).

Page 26: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

U outputu dobijate sledeće rezultate:

Upišete šifru za grupu 1 i 2.

Kliknete Continue > OK

Zaključak:

Postojala je signifikantna razlika u prosečnoj vrednosti između dve grupe (Z=-2.72, p=0,005)

Page 27: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Wilcoxon-ov test

Koristi se za izračunavanje razlika vrednosti između dva zavisna uzorka (numeričko obeležje, mali zavisni uzorci sa Cv>30%)

Primer.

Ispitivan je nivo masti u serumu kod 27 žena pre i posle dijete. Da li je postojala značajna razlika u nivou masti pre i posle dijete?

Iz menija izaberete:Analyze > Nonparametric Tests >2 Related Samples

Page 28: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Two-Related-Samples Tests dialog box

Selektujete jedan ili više parova varijabli.

Kliknete na svaku od varijabli.

Prva varijabla pojaviće se u Current Selections group kao Variable 1, a druga kao Variable 2.

Kliknete da dugme sa strelicom da pomerite par u Test Pair(s) List.

Možete selektovati više parova varijabli.

Page 29: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

U outputu će se pojaviti rezultati:

NMean Rank

Sum of Ranks

mastposle – mastpre

Negative Ranks

3(a) 8.6726.00

Positive Ranks

9(b) 5.7852.00

Ties15(c)

Total 27

RANKS

a mastposle < mastpreb mastposle > mastprec mastposle = mastpre

mastposle -

mastpre

Z -1.071(a)

Asymp. Sig. (2-tailed) .284

Test Statistics(b)

a Based on negative ranks.b Wilcoxon Signed Ranks Test

Zaključak:

Nije postojala signifikantna razlika u prosečnoj visini masti pre i posle dijete

(z=-1,071, p=0,284)

Page 30: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Χ2 test

Koristimo kada treba ispitati povezanost između učestalosti istraživanih atributivnih obeležja.

Iz menija se izabere:

Analyze > Descriptive Statistics > Crosstabs

Page 31: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Iz menija se izabere:

Analyze > Descriptive Statistics > Crosstabs

Page 32: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Otvoriće se novi prozor

Nakon toga kliknete na opciju Statistics

otvoriće se novi prozor gde čekirate Hi kvadrat test

U novom prozoru selektujete varijable čiju povezanost ispitujete – jednu prebacujete u red, a drugu u kolonu.

Page 33: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Kliknete na Continue > OK,

i dobićete rezultate u Outputu:

Page 34: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

pol * dijamet2 Crosstabulation

dijamet2Total

1.00 2.00 1.00

pol 1.0053 65

118

2.00 42 41 83

Total 95 106 201

Count

Chi-Square Tests

Value dfAsymp. Sig.

(2-sided)

Exact Sig.

(2-sided)Exact Sig. (1-sided)

Pearson Chi-Square .632(b) 1 .427

Continuity Correction(a)

.425 1 .515

Likelihood Ratio .632 1 .427

Fisher's Exact Test .474 .257

Linear-by-Linear Association

.629 1 .428

N of Valid Cases 201 a Computed only for a 2x2 tableb 0 cells (.0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 39.23.

Page 35: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Zaključak:

Nije postojala značajna razlika između ispitivanih obeležja (χ2 = 0,632, p = 0,427).

Ukoliko su uzorci <200 jedinica radi se Mantel Haenszel-ov test sa Yates-ovom korekcijom (u Statcalc Epi Info programu)

Ukoliko jedna od vrednosti u ,,ćeliji” tabela kontigencije <5 jedinica radi se Fisher-ov test (u Statcalc Epi Info programu)

Ako je jedna od vrednosti u ,,ćeliji” tabela kontigencije =0, radi se Kolmogorov Smirnov test ( u SPSS –u za testiranje normalnosti distribucije)

Page 36: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Mc Nemar-ov test

je u stvari χ2 test za dva zavisna uzorka.

Primer.

Uzorak od 50 bolesnika lečen je standardnom, a zatim novom terapijom. Rezultati lečenja sa obe terapije prikazani su u tabeli:

Nova terapijaNova terapija

Standardna terapijaStandardna terapija ukupnoukupno

stanjestanje poboljšanopoboljšano nepromenjenonepromenjeno

poboljšanopoboljšano 2020 1515 3535

nepromenjenonepromenjeno 55 1010 1515

ukupnoukupno 2525 2525 5050

Iz menija izaberete:Analyze > Nonparametric Tests >2 Related Samples

Page 37: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Two-Related-Samples Tests dialog box

Selektujete jedan ili više parova varijabli. Kliknete na svaku od varijabli.

Prva varijabla pojaviće se u Current Selections group kao Variable 1, a druga kao Variable 2.

Kliknete da dugme sa strelicom da pomerite par u Test Pair(s) List.

Zaključak: Utvrđena je statistički značajna razlika između rezultata lečenja standardnom i novom terapijom, pa možemo tvrditi da postoji povezanost između primenjene terapije i ishoda lečenja bolesnika (χ2 = 4,05, p<0,05).

Page 38: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

ANOVA

Koristimo kada treba uporediti prosečne vrednosti između više od dva nezavisna uzorka.

U meniju izaberete: Analyze > Compare Means > One-Way ANOVA...

Page 39: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

One-Way ANOVA dialog box

U Dependent list ubacujete zavisnu varijablu koju ispitujete (npr. Telesnu težinu bolesnika svih ispitivanih grupa), a u Factor ubacujete varijablu sa šiframa grupa koje ispitujete (npr. Varijablu u kojoj su 1, 2, 3 i 4, a označavaju broj ispitivane grupe)

Page 40: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

ANOVA nam ukazuje samo da li se grupe ponašaju kao da potiču iz istog osnovnog skupa ili ne. Da bi utvrdili da li između vrednosti po grupama postoji značajna razlika, a ako postoji i između kojih grupa se javlja, radi se post hock (sledbena) analiza. Ako je kod ANOVA-e izračunato p bilo <0,05, čekira se neki od testova u Equal variances not assumed. Ako je kod ANOVA-e p bilo >0,05, čekira se neki od testova u Equal variances assumed. U Outputu su značajne razlike obeležene sa *.Izbor post hoc testova je veliki i prvenstveno zavisi od oblasti medicine kojom se bavite (KONSULTUJ NAUČNU LITERATURU!).

Page 41: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Friedman- ov test

Kada treba izračunati da li postoji značajna promena vrednosti numeričkog obeležja jedne grupe u različitim vremenskim intervalima – dva i više merenja (znači više zavisnih grupa) koristimo ovaj test.

Primer.

Da li je signifikantna promena vrednosti obima struka 142 bolesnice na početku ispitivanja, posle šest meseci i posle godinu dana?

U meniju izaberete:

Analyze > Nonparametrics tests > K Related samples

Page 42: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

U meniju izaberete:

Analyze > Nonparametrics tests > K Related samples

Pojaviće se novi prozor.

U njemu ćete čekirati Friedmanov test, a varijable u posmatranim merenjima prebaciti u desni okvir.

Page 43: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Kliknete na OK I dobićete rezultate u outputu..

1.70obimg

2.08obims

2.22obim

Mean Rank

.000Asymp. Sig.

2df

63.955Chi-Square

142N

Ranks Test Statistics(a)

a Friedman Test

Page 44: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Da bi se ispitalo između koja dva merenja je postojala

signifikantna razlika, radi se post hock analiza – t test ili

Wilkoksonov test.

(ne postoji gotova opcija u SPSS-u za post hock analizu kod Friedmanovog

testa kao kod ANOVA-e, već morate sami da radite odgovarajući test)

Zaključak:

U ispitivanom periodu od godinu dana postojala je značajna promena obima struka ispitanica (χ2Friedman = 63,955, p<1x10-6).

Page 45: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

ANOVA for repeated measures linear model

Indikacija: kada treba ispitati razliku u prosečnim vrednostima dve i više grupa u više ponovljenih merenja sa jednom zavisnom promenljivom

U prvu kolonu unosi se subjektivni faktor (u ovom slučaju obeležen sa C I I), a svaka naredna kolona je vrednost u merenjima u različitim vremenskim intervalima.

Page 46: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Tada selektujete u meniju:

Analyze -> General Linear Models -> Repeated Measures

Page 47: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

U sledećem dijalog boxu definišete broj merenja:

Page 48: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

U sledećem dijalog boxu obeležite i prebacite varijable u različitim nivoima merenja, a u between-subjects factors(s) ubacite varijablu sa kodovima (C i I):

Pritisnete OK i rezultati će biti prikazani.

Page 49: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Kruskal-Walis-ov test(ANOVA za atributivna obeležja ili rangove)

Indikacija: kada treba izračunati da li postoji značajna razlika između više od dve nezavisne grupe, a obeležja su data atributivno ili rangirana

U meniju selektujete:Analyze > Nonparametric Tests >K Independent Samples...

Page 50: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Tests for Several Independent Samples dialog box

Selektujete grupnu varijablu (koja sadrži šifre različitih ispitivanih grupa, npr. 1, 2 i 3)

Zatim definišete rangove grupne varijable

Selektujete grupnu varijablu i kliknete Define Range da obeležite minimum i maximum vrednosti grupne varijable - dobićete sledeće rezultate u outputu

Page 51: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Zaključak:

Postojala je značajna razlika u satima… između tri grupe (χ2KW =25,061, p<1x10-6)

Page 52: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

KOHRANOV TESTIndikacija: kada imamo više od dva zavisna uzorka, tj. rangirane vrednosti posmatramo u više različitih vremenskih intervala

U SPSS-u se radi isto kao Friedman-ov test, samo što se čekira Cohran-ov test

U meniju izaberete: Analyze > Nonparametrics tests > K Related samples

Page 53: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

KORELACIONA ANALIZA

Koristi se kada treba ispitati da li postoji korelacija između zavisno i nezavisno promenljive, tj. da li porastom vrednosti jedne druga raste (pozitivna korelacija) ili pada (negativna korelacija)

Izaberete u meniju: Analyse > Correlate > Bivariate

Page 54: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Izaberete u meniju:Analyse > Correlate > Bivariate

Dobijate novi prozor gde čekirate Pirsonov koeficijent i prebacite u desni okvir dve varijable čiju korelaciju ispitujete (može i više varijabli)

Page 55: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Kliknete na OK i dobijete rezultate u outputu.

Correlations bmd tskor

bmd Pearson Correlation1

.956(**)

Sig. (2-tailed) .000

N 142 142

tskor Pearson Correlation.956(**)

1

Sig. (2-tailed).000

N 142 142

** Correlation is significant at the 0.01 level (2-tailed).

Zaključak:

Postoji pozitivna korelacija

između BMD i tscor-a

(r=0,956, p>1X10-6).

Page 56: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

SPEARMAN-OV KOEFICIJENT RANGA KORELACIJE

Koristimo kada je potrebno izračunati jačinu korelacije između zavisno I nezavisno promenljive koje se rangiraju (operacije se ne izvode iz numeričkih vrednosti)

Ima manju moć od Pirsonovog koeficijenta proste linearne korelacije

U SPSS-u se izvodi na isti način kao Pirsonov, samo što se obeleži Spirmanov koeficijent u Dialog boxu.

Page 57: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

LOGISTIČKA REGRESIONA ANALIZA

Koristimo kada imamo jednu zavisno promenljivu koja je dihotomna (najčešće: bolestan-zdrav) i nezavisno promenljive koje utiču na rizik javljanja nepovoljnog modaliteta zavisno promenljive.

Izračunavaju se vrednosti aproksimativnog relativnog rizika (Odd ratio – OR) i granice njihovih 95% intervala poverenja.

Kada su obe vrednosti granica 95%IP veće od 1, rizik za pojavu nepovoljnog modaliteta je značajan.

Kada su obe vrednosti granica 95%IP manje od 1, nezavisno promenljiva predstavlja značajan protektivni faktor.

Kada je donja granica manja od 1, a gornja veća, nezavisno promenljiva nije statistički značajan faktor.

Page 58: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Multivarijantna logistička regresiona analiza se sprovodi

nakon univarijantne, a u model se uključuju samo oni faktori

koji su se u univarijantnoj analizi pokazali kao značajni.

U meniju se izabere: Analyse > Regression > Binary logistic

Univarijantna logistička regresija (jedna nezavisno promenljiva) se može se izračunavati u Statcalc Epi Info programu (preko χ2 testa), kada je nezavisno promenljiva takođe dihotomna, kao i zavisno promenljiva.

Kada je nezavisno promenljiva kontinuirana numerička varijabla ili kada je atributivna, ali sa više od dva modaliteta, koristimo SPSS program i to opciju Binary logistic regression.

Page 59: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

U meniju se izabere: Analyse > Regression > Binary logistic

Page 60: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

U Dependent se unosi zavisno promenljiva koja mora biti dihotoma. U Covariates se unose nezavisno promenljive koje mogu biti numeričke ili atributivne.

Kod Method-a se izabere tip modela. Enter metod je bezuslovan, odnosno u modelu zadržava sve nezavisno promenljive. Backward metod u modelu zadržava samo značajne faktore.

Ukoliko je nezavisno promenljiva atributivna, ulazimo u opciju Categorical i tu promenljivu prebacujemo u desni prozor. Potrebno je definisati i modalitet tog obeležja u odnosu na koji se procenjuje rizik (First ili Last).

Page 61: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima
Page 62: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Nakon izabiranja Options i otvaranja novog prozora, treba čekirati CI for Exp (B) 95%, At last step i Include constant in model

Kliknete na OK dobijete rezultate koji pokazuju koliko koji factor utiče na pojavu bolesti. U Outputu Exp B predstavlja Odss ratio.

Page 63: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Npr. Rezultati univarijantne logističke regresione analize

varijable Odds ratio 95% CI Odds ratio

p

pol 1.130 0.540 – 2.390 0.860

holecistitis 3.060 0.910 – 11.260 0.044*

holangitis 12.500 4.880 – 32.000 1x106***

pankreatitis 1.420 0.390 – 5.640 0.773

dispepsija 1.200 0.550 – 2.640 0.756

ikterus 147.000 20.010 – 3010.850

1x106***

dijametar 506.560 82.770 – 4188.180

1x106***

starost 1.930 0.910 – 4.070 0.089

UZ verifikovana choledocholitiaza

- - 0.052

Opasna kalkuloza 367.000 64.140 – 2966.46

1x106***

bilirubin 21.360 6.610 – 76.470 1x106***

ALP 24.570 8.910 – 70.750 1x106***

AST 16.630 6.390 – 44.740 1x106***

ALT 49.610 15.770 – 165.940

1x106***

LDH 3.210 0.820 – 14.580 0.107

GGH 3.040 1.410 – 6.580 0.003**

Zatim se izdvajaju signifikantni prediktori i radi se multivarijantna logistička regresija.

Ako ima više od 7 faktora (nezavisno promenljivih) svrstavaju se u klinički logične blokove

Page 64: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Prema rezultatima univarijantne logističke regresije, kao nezavisni

faktori rizika za pojavu choledocholitiaze definisani su holecistitis,

holangitis, ikterus, dijametar, opasna kalkuloza, bilirubin, ALP,

AST, ALT i GGT.

Formiramo dva klinički logična bloka:

U prvi blok uključimo: holecistitis, holangitis, ikterus, dijametar i

opasnu kalkulozu,

A u drugi blok uključimo: bilirubin, ALP, AST, ALT i GGT.

Page 65: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Prema rezultatima multivarijantne logističke regresije, kao najvažniji faktori rizika za pojavu choledocholitiaze iz ovog bloka izdvojili su se dijametar i opasna kalkuloza.

Povećanje dijametra žučne kesice za jednu mernu jedinicu (cm) povećava rizik nastanka choledocholitiaze 5.307 (1.078-26.122) puta.

Pacijentkinje sa kalkulozom žučne kese imaju 10.712 (1.606-71.478) puta veći rizik za nastanak kalkuloze u holedokusu.

Cox&Snell-ov i Nagelkerke-ov koeficijent determinacije određuju procenat sa kojim model objašnjava uticaj nezavisno promenljivih na zavisno promenljivu

Npr. Tabela. Rezultati multivarijantne logističke regresione analize bloka koji čine holecistitis, holangitis, ikterus, dijametar i opasna kalkuloza

varijable Odds ratio 95% CI Odds ratio p

dijametar 5.307 1.078 – 26.122 0.040*

Opasna kalkuloza 10.712 1.606 – 71.478 0.014*

Page 66: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

MULTINOMINALNA LOGISTIČKA REGRESIONA ANALIZA

Indikacija: Kada imamo jednu zavisno promenljivu i više nezavisnih (prediktora) u čijem prisustvu je rizik za pojavu bolesti veći onoliko puta kolika je vrednost Odd ratio.

U meniju se izabere: Analyse > Regression > Multinomal logistic

Page 67: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

U meniju se izabere: Analyse > Regression > Multinomal logistic

postupak je sličan kao kod binarne logističke regresione analize

Page 68: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

KLASTER ANALIZA

Metod multivarijacione analize koji se koristi za grupisanje objekata u grupe, tako da su objekti unutar grupa slični među sobom, dok se između grupa znatno razlikuju.

Page 69: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

ANALIZE PREŽIVLJAVANJAKaplan Meier i logrank test

Analiziraju vreme koje će proteći pre nego što negi događaj nastupi. Ovaj događaj može biti smrt ili smrt od neke određene bolesti i zbog toga se analize ovakvih podataka nazivaju analize preživljavanja.

Kaplan Majerov test ispituje verovatnoću preživljavanja (nastupanja nekog događaja) u određenom vremenskom periodu. Logrank test ispituje da li je značajna razlika u preživljavanju između te dve grupe.

Kako uneti podatke u bazu?U prvu kolonu uneti koja je grupa, u drugu vreme, a u treću ishod, npr. 0-mrtav, 1-živ

Page 70: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

SENZITIVNOST I SPECIFIČNOST

SENZITIVNOST = tačno pozitivni/tačno pozitivni+lažno negativni

SPEČIFIČNOST = tačno negativni/lažno pozitivni+tačno negativni

+PV = tačno pozitivni/ tačno pozitivni +lažno pozitivni

-PV = tačno negativni/ lažno negativni+ tačno negativni

Osetljivost – ako je pacijent bolestan, osetljivost pokazuje verovatnoću da će ta metoda da pokaže da je pacijent stvarno bolestanSpecifičnost – Pokazuje koliko je metoda sposobna da dijagnostifikuje tu bolest+PV – prediktivna vrednost pozitivnog testa – ako je pacijent testiran nekim testom i pozitivan je i +PV je 95%, to znači da je šansa da je stvarno + 95 a da je – je 5%.- PV - -prediktivna vrednost negativnog testa – ako je pacijent negativan na testu i –PV je 95% znači da je sansa da je on stvarni – 95%, a 5% da je mozda i +

Page 71: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Sa zlatnim pravilom kao tačnim poredimo neku metodu

U SPSS-u se kriva crta kao ROC

Iz menija se izabere: Analyze > ROC Curve...

Page 72: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

ROC Curve dialog box

Page 73: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

ROC Curve Options dialog box

Page 74: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

META ANALIZE

Integrisanje svih objavljenih rezultata istraživanja

nekog problema i stvaranje zaključaka iz ukupnih

rezultata.

Ranije je takva integrativna studija ponekada ukazivala

na neku zakonitost koja nije mogla biti ustanovljena u

pojedinačnim istraživanjima.

Page 75: Statisticke Metode u Biomedicinskim Istrazivanjima

Danas meta analize služe za utvrđivanje:

1. razlike među studijama - Hadžisov g (kada želimo

saznati koja studija ima značajniji učinak)

Kod dve studije sa različitim uzorcima i različitim t

vrednostima možemo pomoću obrasca za Hadžisov g

pokazati značajnost razlike

2. podudarnosti među studijama (možemo proveriti da li

dve studije doprinose objašnjenju iste pojave ili deluju

opozitno)