rを研究でどう使うか: 迷信の伝播と人類学から (kashiwa.r#1)
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第1回Kashiwa.R発表スライド。TRANSCRIPT
第1回 Kashiwa.R
Rを研究でどう使うか?~迷信の伝播と人類学から~
2011.11.11田村光平
2011年11月14日月曜日
自己紹介
•名前:田村光平•所属:理学系研究科人類学大講座•住処:本郷キャンパス理学部2号館
2011年11月14日月曜日
2つの人類学
文化人類学 自然人類学
2011年11月14日月曜日
2つの人類学
文化人類学 自然人類学
こちら
2011年11月14日月曜日
生物学の立場からヒトを研究する
2011年11月14日月曜日
文化的適応ヒトの特性・拡散の要因
http://world-heritages.com/wh14/ryuukyuu.html
2011年11月14日月曜日
生物学の立場から文化を研究する
2011年11月14日月曜日
「受け継がれるモノ」は遺伝子だけじゃない
“Beyond DNA: integrating inclusive inheritance into an extended theory of evolution”
Danchin et al. 2011. Nature Reviews Genetics
2011年11月14日月曜日
文化進化
Boyd & Richerson (1985)
Cavalli-Sforza & Feldman (1981)
2011年11月14日月曜日
(生物)進化
t
集団中の遺伝的構成の時間変化2011年11月14日月曜日
文化進化
t
集団中の文化的構成の時間変化2011年11月14日月曜日
文化進化Boyd & Richerson
(1985)Cavalli-Sforza & Feldman
(1981)集団遺伝学の理論を文化に適用
2011年11月14日月曜日
例えばこんなトピックが
•遺伝子と文化の共進化
• 乳糖分解酵素と酪農文化
• セロトニン関連遺伝子と社会の志向
•言語系統学
• 言語の分岐年代から移住過程などを推測
•文化進化実験
• 伝言ゲームによってランダムな記号列に構造が
2011年11月14日月曜日
生物学の立場からみても文化は面白い!
2011年11月14日月曜日
文化的適応ヒトの特性・拡散の要因
http://world-heritages.com/wh14/ryuukyuu.html
2011年11月14日月曜日
文化的「非適応」非適応的行動が文化によって引き起こされる
http://www.telegraph.co.uk/news/worldnews/australiaandthepacific/papuanewguinea/4159654/Woman-burned-at-stake-after-being-accused-of-witchcraft.html
2011年11月14日月曜日
非適応的文化
• 儀式、呪術、迷信、人口転換...etc
• Boyd and Richerson (1985)、Richerson and Boyd (2005)、Ihara and Feldman (2004)、Ihara (2008)
2011年11月14日月曜日
なぜ非適応的文化を研究するのか?
•進化生物学の問題→なぜ自らの適応度を下げるのか?
•文化伝達の心理バイアスの理解
2011年11月14日月曜日
ヒツジとヤギも「育ての親」を好む
“Mothers determine sexual preferences”
Kendrick et al. 1998. Nature
2011年11月14日月曜日
丙午の迷信「丙午の女は夫を食い殺す」
http://jp.123rf.com/photo_7927160_the-vampire-women-bites-the-man.html2011年11月14日月曜日
丙午の迷信• ??? 丙午の年には火事が多い
• 1682? 八百屋お七事件(江戸)
• 1686 井原西鶴『好色五人女』(大阪)
• 1704 紀海音『八百屋お七』(大阪)
• 1726 丙午の男女共に相手を殺す→人工流産の報告
• 1726~1786? 丙午の女は夫を食い殺す
2011年11月14日月曜日
丙午の出生減少
• 60年に一度の出生減少
• 1846年 13%(0~30%)
• 1906年 7%(0~15%)
• 1966年 25%(19~36%)
2011年11月14日月曜日
丙午出生減少の地域差
出生減少大
2011年11月14日月曜日
この地域差の要因は何か?
2011年11月14日月曜日
今日のメインはRなのであんまり詳しくやりません
2011年11月14日月曜日
仮説: 丙午の出生減少と方言の距離に関係がある?
2011年11月14日月曜日
方言間距離• 方言間の単語の共有度から計算• 各県について、ある単語を使っていれば1,いなければ0をコードし
てビット列を作成
• ハミング距離(文字列の違い)を計算
• データはLi and Hasegawa (2011)から(調査は1950~1970年代)
2011年11月14日月曜日
1966年丙午の出生減少と東京からの方言間距離の相関
※「とりあえず回帰」は良い習慣ではありません
2011年11月14日月曜日
とりあえず散布図> plot(x,y)
2011年11月14日月曜日
2011年11月14日月曜日
線とか引いてみる> abline(lm(y~x))
2011年11月14日月曜日
2011年11月14日月曜日
相関係数を求めてみる> cor.test(x,y)
2011年11月14日月曜日
出力
2011年11月14日月曜日
出生減少と方言間距離の相関
•相関係数: -0.497
• p値<0.001 → 偶然では起こりそうにない
2011年11月14日月曜日
単に距離が近いところに伝達しやすいだけでは?
2011年11月14日月曜日
東京からの地理的距離との相関をみてみる
2011年11月14日月曜日
出生減少と地理的距離の相関
•相関係数: -0.382
• p値<0.0089 → 偶然では起こりそうにない
…が、文化的距離との相関のほうがスコアが良い
2011年11月14日月曜日
単に値の大小以外で議論できないか?
2011年11月14日月曜日
モデル選択> stepAIC(lm(y~x1+x2))
2011年11月14日月曜日
出力
2011年11月14日月曜日
もう少し詳しく解析したい
2011年11月14日月曜日
因果関係を推測すると
•地理的な分布で方言のパターンが形成
•方言間の距離が出生減少に影響
地理的距離 方言間距離 出生減少
2011年11月14日月曜日
因果関係を推測すると
•地理的な分布で方言のパターンが形成
•方言間の距離が出生減少に影響
地理的距離 方言間距離 出生減少
これを統計的に表現したい
2011年11月14日月曜日
パス解析> library(sem)
2011年11月14日月曜日
入力
2011年11月14日月曜日
出力
2011年11月14日月曜日
よくわからん
2011年11月14日月曜日
結果をGraphvizにつっこむ
> path.diagram(ans, "data", ignore.double=FALSE, edge.labels="values", digits=3)
2011年11月14日月曜日
パス図
2011年11月14日月曜日
空間構造を取り入れたい
2011年11月14日月曜日
空間統計> library(spdep)
2011年11月14日月曜日
空間同時自己回帰ラグモデル
• Y = ρWY + βX + e
•隣接県の出生減少の仕方が似ている
2011年11月14日月曜日
空間統計
> result<-lagsarlm(y~x,listw=W) > summary(result)aaaaaaaaaaa
2011年11月14日月曜日
2011年11月14日月曜日
空間統計結果
•隣接県で出生減少の下がり方は似ている
•空間効果を入れても方言間距離の効果は有意
•空間効果をいれたモデルのほうが良い
2011年11月14日月曜日
シミュレーション
•出生減少と距離との相関→どのような伝達ネットワークでできやすい?
2011年11月14日月曜日
2つの文化伝達モデル完全グラフモデル 星型モデル
各県が文化伝達 東京が文化伝達
伝達確率が距離に依存2011年11月14日月曜日
2つの文化伝達モデル完全グラフモデル 星型モデル
各県が文化伝達 東京が文化伝達
申し訳ありませんが時間の関係上詳細は省略させて下さいm(_ _)m
2011年11月14日月曜日
結果:相関係数の分布完全グラフモデル 星型モデル
ggplot2で作図2011年11月14日月曜日
結果:相関係数の分布完全グラフモデル 星型モデル
ggplot2で作図
こんな感じでシミュレーション終了と同時にグラフが出ます
2011年11月14日月曜日
シミュレーションまとめ•相関係数が初期状態より大きくなるのは星型モデルのみ→伝達には中心地があった?
•シミュレーションもできる、ということが伝われば…
•データ出力→統計解析→グラフ作成まで一気にできて便利
2011年11月14日月曜日
まとめ:丙午編
•出生減少と方言間の距離に相関
•説明変数同士にも関係がありそう
•隣接県で出生減少が似ている
•伝達の中心地があった可能性
2011年11月14日月曜日
まとめ:R編•相関係数(cor.test())
•モデル選択(stepAIC())
•パス解析(library(sem))
•空間統計(library(spdep))
•シミュレーション
2011年11月14日月曜日
Rの良い所•なんでもできる•統計解析
•シミュレーション
•グラフ
•勉強用の資料が豊富
2011年11月14日月曜日
やりたいこと
どうやってやるか?
勉強
ここが一番大変
2011年11月14日月曜日
やりたいこと
どうやってやるか?
勉強
ここが一番大変ここのコストを削減していけると嬉しい
2011年11月14日月曜日
ご清聴ありがとうございました
2011年11月14日月曜日