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Biomoléculas Proteínas

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BiomoléculasProteínas

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SITIO CATALITICO DE iNOS

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8enzimas

8hormonas

8receptores

8anticuerpos

8transportadores

8proteínas estructurales

8etc…

Función Proteínas

ej: GAPDH, HMGCoAreductasa, DNA polimerasa, FA

ej: oxitocina, insulina, FSH, GH, BMP

ej: EGF-R, IL-3R, acetilcolinaR

ej: IgG, IgA

ej: hemoglobina, GLUT, CFTR

ej: actina, tubulina, citoqueratina, colágeno

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Respecto del tamaño:- péptidos: oligopéptidos (2 - 10 amino ácidos)

polipéptidos (10 - 100 amino ácidos)

- proteínas (100 - 30.000 amino ácidos)(promedio 2.000)

Nomenclatura de proteínas

Respecto de la cantidad de cadenas polipeptidicas:

- monoméricas: 1,

- oligoméricas: 2 o más, unidos no covalentemente

Aspartamo (2 aa)Oxitocina (9 aa)veneno setasantibióticos

Glucagón (29 aa)

Citocromo c

Hb

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Estructura básica de las proteínasAmino ácidos

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Alanina y Glicina

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Valina, Leucina, Isoleucina y Metionina

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Cisteína

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Prolina

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Fenilalanina

Tirosina

Triptofano

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Serina y Treonina

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Lisina

Arginina

Histidina

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Aspartato, Glutamato, Asparagina, Glutamina

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Unidades básicas de las proteínas

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Estado ionización de los amino ácidos

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Formación del enlace peptídico

reacción de condensaciónsustitución nucleofílica

peptidil transferasas

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ESTRUCTURA PRIMARIA: Enlace peptídico

N-terminal C-terminal

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Formación puente disulfuro

2 R-SH R-S-S-R

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Formación puente disulfuroSecuencia de la insulina de bovino

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Estructura de proteínas

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Proteins can be separated for analysis orcharacterization on the basis of :

•size•solubility•charge•binding affinity

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PURIFICACIÓN DE PROTEÍNAS

Cromatografía: separa a los componentes de una mezclapor su afinidad relativa a dos fases, una móvil y otra estacionaria.• Filtración en gel• Cromatografía de intercambio iónico

Electroforesis: separa los componentes en base a sus caraterísticas de carga y/o tamaño

•Electroforesis en geles de poliacrilamida (PAGE)•Isoelectroenfoque (IEF)

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Intercambio Iónico

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Cromatografía deAfinidad

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ELECTROFORESIS

Dodecilsulfato de sodio (SDS)

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Cálculo de masa molecular

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Separación por tamaño:

•Dialisis•Ultrafiltration•Ultracentrifugation

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Métodos de separación por solubilidad

•Precipitación con sulfato de amonio: las proteínas son menos solubles en soluciones con sales presentes (Salting out)Ej: 0.8 M sulfato de amonio precipita fibrinógeno en cambio para precipitaralbúmina plasmática se requiere una solución de 2,4 M de la sal

•Solubilidad diferencial por diferentes solventes

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Methods for structural determinations of proteins•X-ray diffraction (crystallography) -- solid•3-D structure determination•NMR spectroscopy -- liquid•provides structural and functional information aboutparticular atoms in a protein•Circular dichroism spectroscopy -- amount and type ofsecondary structure•Mass spectroscopy -- determination of very small amountsof protein

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Agentes desnaturantes

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ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL

FUNCIÓN

PATOLOGÍA

ESTRUCTURA CANTIDAD

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Concentración

Velocidad de síntesis Velocidad de degradación

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ALTERACIONES EN CANTIDAD

SÍNTESIS: (AUMENTO O DISMINUCIÓN)

MUTACIONES GENÉTICASALTERACIONES TRANSCRIPCIONALESALTERACIONES TRADUCCIONALES

DEGRADACIÓN: (AUMENTO O DISMINUCIÓN)

ACTIVIDAD PROTEOLÍTICA (proteasas)PROTEÓLISIS DEPENDIENTE DE UBIQUITINA

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FUNCIÓN

PATOLOGÍA

ESTRUCTURA CANTIDAD

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Falla en procesamiento de mRNA de beta globina

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FALLAS ESTRUCTURALES

MUTACIONESMODIFICACIONES POSTRADUCCIONALESPROCESAMIENTO (splicing)PROTEÓLISIS

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Hemoglobin S Disorders

Point Mutation of B Globin Gene

Hgb S Gene - 8% in American Blacks- 30% in Some African Populations- Confers Resistance to

plasmodium falciparum Malaria

GLU

VAL

HgA

HgS6th

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Sickle Cell Disease

Deoxygenation

Polymerizationof Hgb S

Sickle cell

O2

↑ Ca↓ K, O2

(or ↓H20, ↓pH)

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PRION

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PROTEÍNAS PLASMÁTICAS

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MOVIMIENTO DE FLUIDOS A TRAVES DE LA PARED CAPILAR

CAPILAR

TEJIDO

PRESION ONCÓTICA

PRESIÓN HIDROSTÁTICA

PHc

Liquido Intersticial

PH-li

PO-c

PO-li

ARTERIA VENA

EDEMA: Desbalance de fluidos

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CAUSAS DE EDEMA

1) Aumento de la Presión Hidrostática2) Obstrucción linfática3) Retención de sodio4) Inflamación5) Hipoproteinemia:

Glomerulopatías (pérdida de proteínas)Cirrosis hepáticaDesnutriciónGastroenteropatía (pérdida de proteínas)

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1. based on the migration of charged proteinparticles in an electric field2. direction and rate of migration depends ontype of charge of protein, size of protein, intensity of the electric field, support medium3. confirms the presence of a gammopathy4. allows classification as either polyclonal ormonoclonal

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Tracing of serum protein electrophoresis -abnormal

Albumin

α1

α2β

γ

M spike

Stained gelimage

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Patrón normal de proteínas plasmáticas

α-1 antitripsina transferrina IgGLDL IgA

α-2 macroglobulina C3 IgMceruloplasmina IgD

IgE

4,0 g%

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Patrón anormal

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PATOLOGÍA FRACCIÓN PLASMÁTICA

Síndrome nefrótico Albúmina α2

Hepatitis aguda α1

Reumatismo α2 γ

Hemorragia digestiva β

Inflamación crónica α1 α2

α1: constituída en un 80-90% por α1-antitripsina, proteasa de fase aguda

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PARAPROTEINEMIAS(Cambios cualitativos:aparición proteína no habitual)

MacroglobulinemiaCrioglobulinemiaMieloma MúltipleFetoproteína (adulto)Proteína C Reactiva

ALTERACIONES DE PROTEINAS PLASMÁTICAS

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DISPROTEINEMIAS(Cambios cuantitativos:ana, hipo o hiper).

AnalbuminemiaAfibrinogemiaAcatalasemiaAgamaglobulinemiaHipogamaglobulinemiaHiperglobulinemia

ALTERACIONES DE PROTEINAS PLASMÁTICAS