oxi/fermpluri – test · 2013-09-04 · oxi/fermpluri – test manuale dei codici indice pag....
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Oxi/FermPluri – Test
Sistema per l’identificazione di batteriGram negativi, ossidasi positivi.
MANUALE DEI CODICIRef. 71708
© Liofilchem® S.r.l. - Microbiology Products
Rev.0/20.12.2012
Oxi/FermPluri – Test
MANUALE DEI CODICI
Indice Pag.
Archivio Biocodici 1
Appendice 1: Elenco delle abbreviazioni usate nell'Archivio Biocodici. 17
Appendice 2: Procedure raccomandate per i test di conferma. 18
Appendice 3: Disponibilità dei terreni e reagenti necessari perl'esecuzione dei test di conferma.
20
Note Importanti
Prima di utilizzare il sistema Oxi/FermPluri-Test, leggere le istruzioni per l'uso.
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© Liofilchem® – Oxi/FermPluri-Test – Codebook – Rev.0/20.12.2012
BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA
00000 Acinetobacter lwoffiiKingella denitrificansEmpedobacter brevisOligella urethralisSphingomonas paucimobilis
LLLL
Cat+-+++
Ypig--+-+
DNA
+
-
00001 Pasteurella multocidaMoraxella spp.Pseudomonas spp.Alcaligenes faecalis
45%42%
*L
Mot
--
+/(-)+
Plumpcocci
-+
00002 Acinetobacter lwoffiiPseudomonas alcaligenes
LMot
-+
00003 Pseudomonas spp.Pseudomonas alcaligenesAlcaligenes faecalis
*LL
Flagellapol/-polperi
00004 Acinetobacter lwoffii
00005 Moraxella spp.Pseudomonas alcaligenesRhizobium (Agrobacterium) radiobacterBordetella bronchisepticaOligella urethralis
44%34%19%
LL
Mot-+++-
DNA-+---
TOBSSRSS
00006 Acinetobacter lwoffiiStenotrophomonas maltophilia
82%16%
Mot-+
00007 Bordetella bronchisepticaMyroides odoratusMoraxella spp.Alcaligenes spp.Delftia acidovoransOchrobactrum anthropi
27%24%18%
LLL
Flagellaperi
--
peripolperi
Ypig-+---
-/(+)
00011 Brevundimonas diminutaBrevundimonas vesicularis
83%13%
Ypig-+
00012 Stenotrophomonas maltophilia
00013 Brevundimonas diminutaFlavobacterium spp.Shewanella putrefaciens
56%34%10%
Mot+-+
DNA-v+
00015 Shewanella putrefaciens
1
© Liofilchem® – Oxi/FermPluri-Test – Codebook – Rev.0/20.12.2012
BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA
00016 Stenotrophomonas maltophilia
00017 Shewanella putrefaciens
00042 Stenotrophomonas maltophilia
00046 Stenotrophomonas maltophilia
00103 Pseudomonas stutzeriAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidansPseudomonas fluorescens
39%25%9%
Cet-++
Gel--+
AKSRS
00107 Sphingobacterium multivorumAchromobacter spp.Myroides odoratus
45%26%13%
Mot-+-
McC-++
DNA--+
00113 Pseudomonas putidaFlavobacterium spp.Brevundimonas diminuta
42%38%19%
Mot+-+
McC+--
DNARRS
00115 Flavobacterium spp.
00117 Pseudomonas putidaFlavobacterium spp.
86%14%
Mot+-
00123 Chryseobacterium meningosepticum
00141 Flavobacterium spp.
00147 Sphingobacterium multivorum
00161 Chryseobacterium meningosepticum
00165 Rhizobium (Agrobacterium) radiobacter
00202 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
00203 Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidansPseudomonas stutzeri
64%31%
Cet--
00207 Achromobacter spp.Ralstonia pickettiiAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans
56%23%20%
Rur+--
Cet--+
PBSRS
00247 Achromobacter spp.Brevundimonas diminuta
89%16%
RUr+-
00301 Pseudomonas stutzeriBrevundimonas diminuta
84%16%
NO3+-
00302 Acinetobacter baumannii/calcoaceticusPseudomonas oryzihabitans L
Ypig-+
2
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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA
00303 Pseudomonas fluorescensPseudomonas putidaAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans
47%25%12%
Gel+--
AKSSR
TOBRSR
00305 Rhizobium (Agrobacterium) radiobacter
00306 Acinetobacter baumannii/calcoaceticusPseudomonas oryzihabitans L
Ypig-+
00307 Ralstonia pickettiiAchromobacter spp.
63%23%
RUr-+
00313 Pseudomonas putida
00317 Pseudomonas putida
00342 Pseudomonas oryzihabitans L
00346 Achromobacter spp.Pseudomonas oryzihabitans L
Ypig-+
00347 Achromobacter spp.Ralstonia pickettiiPseudomonas putida
52%41%7%
RUr+--
Cet--+
AKSRS
00353 Pseudomonas putida
00365 Rhizobium (Agrobacterium) radiobacter
00366 Achromobacter spp.
00401 Flavobacterium spp.
00403 Flavobacterium spp.
00407 Flavobacterium spp.
00411 Flavobacterium spp.
00413 Flavobacterium spp.
00417 Flavobacterium spp.
00421 Chryseobacterium meningosepticum
00441 Flavobacterium spp.
00501 Flavobacterium spp.
00503 Flavobacterium spp.
00541 Chryseobacterium meningosepticum L
00543 Chryseobacterium meningosepticumChryseobacteriumindologenes
54%46%
DNA+1
3
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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA
01001 Brevundimonas vesicularisPasteurella multocida
67%23%
Mot+-
01003 Moraxella spp.
01005 Brevundimonas vesicularis L
01007 Moraxella spp.Sphingobacterium multivorumAchromobacter spp.Comamonas testosteroni/terrigena
79%11%10%
L
Mot--+
Ypig-+-
01011 Brevundimonas diminutaBrevundimonas vesicularis
60%40%
Ypig-+
ßhem--
01201 Brevundimonas vesicularis
01303 Achromobacter spp.
02001 Moraxella spp.Alcaligenes faecalisPseudomonas stutzeri
51%16%15%
Mot-++
Flagella
PeriPol
02003 Pseudomonas stutzeriAlcaligenes spp.
52%35%
FlagellaPolPeri
02005 Shewanella putrefaciensMoraxella spp.Alcaligenes faecalis
46%41%10%
Mot+-+
DNA+--
02007 Myroides odoratusAlcaligenes spp.Pseudomonas spp.
51%36%12%
Mot+-+
02011 Brevundimonas diminuta
02013 Brevundimonas diminutaShewanella putrefaciens
88%12%
DNA-+
02015 Shewanella putrefaciens
02017 Shewanella putrefaciens
02103 Pseudomonas stutzeriAchromobacter xylosoxidans subsp. denitrificans
88%9%
Cet-+
02107 Ralstonia pickettiiMyroides odoratus
83%14%
Mot+-
02141 Pseudomonas stutzeri
4
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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA
02147 Ralstonia pickettiiMyroides odoratus
85%14%
Mot+-
02203 Pseudomonas stutzeriAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans
74%24%
Cet-+
02301 Pseudomonas stutzeri
02303 Pseudomonas stutzeriRalstonia pickettiiAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans
46%40%14%
Cet--+
AKSRR
PBSRS
02307 Ralstonia pickettii
03001 Brevundimonas diminuta
04001 Flavobacterium spp.Pasteurella multocida
LYpig
+-
04002 Stenotrophomonas maltophilia
04003 Flavobacterium spp.
04005 Sphingobacterium multivorumRhizobium (Agrobacterium) radiobacter
54%44%
Mot-+
04006 Stenotrophomonas maltophiliaAchromobacter spp.
83%16%
Ypig+-
04007 Bordetella bronchisepticaSphingobacterium multivorum
69%26%
Mot+-
04042 Stenotrophomonas maltophilia
04046 Stenotrophomonas maltophilia
04102 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
04106 Achromobacter spp.Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
53%47%
Mot+-
04107 Sphingobacterium multivorum
04143 Chryseobacterium meningosepticumAchromobacter spp.
79%21%
Mot-+
04147 Sphingobacterium multivorum
04202 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
04203 Achromobacter spp.
04302 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
5
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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA
04303 Pseudomonas fluorescensAchromobacter spp.
79%21%
RUr+
04306 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
04323 Achromobacter spp.
04365 Rhizobium (Agrobacterium) radiobacter
04401 Pasteurella multocidaFlavobacterium spp.
48%47%
Ypig-+
04501 Flavobacterium spp.
05001 Pasteurella multocidaVibrio alginolyticus
TCBS-+
05002 Achromobacter spp.
05005 Sphingobacterium multivorum
05007 Sphingobacterium multivorumAchromobacter spp.
88%12%
Mot-+
05161 Aeromonas hydrophila
05171 Aeromonas hydrophila
05401 Pasteurella multocida
06003 Pseudomonas stutzeriAlcaligenes spp.
53%44%
FlagellaPolPeri
10000 Acinetobacter lwoffii
10001 Pseudomonas spp.Alcaligenes faecalis
61%23%
FlagellaPolPeri
10002 Stenotrophomonas maltophiliaAcinetobacter lwoffii
85%15%
Mot+-
10003 Delftia acidovoransPseudomonas alcaligenesAchromobacter xylosoxidans subsp. denitrificans
32%20%13%
TOBRS
FlagellaPolPolPeri
10006 Stenotrophomonas maltophilia
10007 Achromobacter xylosoxidans subsp. denitrificansDelftia acidovoransBordetella bronchiseptica
34%26%17%
RUr--+
FlagellaPeriPolPeri
10012 Stenotrophomonas maltophilia
6
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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA
10013 Pseudomonas spp. *
10016 Stenotrophomonas maltophilia
10017 Shewanella putrefaciens
10041 Burkholderia cepaciaBrevundimonas diminuta
59%40%
AKRS
10042 Stenotrophomonas maltophilia
10043 Burkholderia cepaciaStenotrophomonas maltophilia
65%32%
Ypig-+
10046 Stenotrophomonas maltophilia
10047 Stenotrophomonas maltophiliaBurkholderia cepacia
84%15%
Ypig+-
10052 Stenotrophomonas maltophilia
10056 Stenotrophomonas maltophilia
10057 Stenotrophomonas maltophilia
10101 Burkholderia cepacia
10102 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
10103 Burkholderia cepacia
10107 Burkholderia cepaciaPseudomonas mendocinaAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans
37%32%22%
AKRSR
CARRSS
FlagellaPolPolPeri
10123 Burkholderia cepacia
10143 Burkholderia cepacia
10147 Burkholderia cepacia
10203 Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans
10207 Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans
10302 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
10303 Burkholderia cepaciaPseudomonas putidaAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans
30%28%25%
AKRSR
CARRSS
PBRSS
10306 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
10307 Pseudomonas putidaRalstonia pickettiiAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans
32%28%22%
Cet+-+
AKSRR
FlagellaPolPolPeri
10317 Pseudomonas putida
7
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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA
10327 Burkholderia cepacia
10343 Burkholderia cepaciaPseudomonas putida
69%31%
AKRS
10401 Vibrio parahaemolyticus
11101 Brevundimonas diminuta
11763 Vibrio cholerae L serol
12001 Alcaligenes faecalisComamonas testosteroni/terrigenaDelftia acidovorans
63%14%10%
AKvSR
FlagellaPeriPolPol
12003 Alcaligenes faecalis (odorans)Alcaligenes faecalisAchromobacter xylosoxidans subsp. denitrificans
67%17%15%
Cet+--
TOBSSR
12007 Alcaligenes spp.
12013 Brevundimonas diminutaShewanella putrefaciens
81%17%
DNA-+
12017 Shewanella putrefaciens
12101 Pseudomonas stutzeri
12103 Pseudomonas mendocina
12117 Pseudomonas mendocina
12203 Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans
12207 Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidansRalstonia pickettii
80%20%
Cet+-
12301 Pseudomonas stutzeri
12303 Pseudomonas mendocinaAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans
55%37%
AKSR
12307 Ralstonia pickettiiPseudomonas mendocinaAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans
70%20%10%
Cet-++
AKRSR
TESSR
12347 Ralstonia pickettii
12357 Pseudomonas putida
14002 Stenotrophomonas maltophilia
14003 Stenotrophomonas maltophilia
14006 Stenotrophomonas maltophilia
8
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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA
14007 Bordetella bronchisepticaDelftia acidovorans L
FlagellaPeriPol
14012 Stenotrophomonas maltophilia
14042 Stenotrophomonas maltophilia
14046 Stenotrophomonas maltophilia
14047 Stenotrophomonas maltophilia
14102 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
14306 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
14401 Plesiomonas shigelloidesVibrio parahaemolyticus
87%13%
Gel-+
15021 Vibrio alginolyticus
15421 Vibrio alginolyticus
20103 Pseudomonas putidaPseudomonas fluorescensAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans
68%17%11%
Gel-+-
AKSSR
TOBSSR
20107 Pseudomonas putidaPseudomonas fluorescensPseudomonas aeruginosa
70%12%10%
42C--+
TOBSSR
20143 Pseudomonas putida
20203 Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidansPseudomonas putida
82%18%
AKRS
20303 Pseudomonas putidaPseudomonas aeruginosaPseudomonas fluorescens
53%36%11%
42C+--
TOBSSR
20307 Pseudomonas aeruginosaPseudomonas putidaPseudomonas fluorescens
20313 Pseudomonas putida
20323 Pseudomonas aeruginosa
20327 Pseudomonas aeruginosa
22103 Pseudomonas aeruginosaAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans
62%33%
AKSR
22303 Pseudomonas aeruginosa
22307 Pseudomonas aeruginosa
9
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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA
22323 Pseudomonas aeruginosa
22327 Pseudomonas aeruginosa
24107 Pseudomonas fluorescens
24303 Pseudomonas fluorescens
24307 Pseudomonas fluorescens
30003 Achromobacter xylosoxidans subsp. denitrificans L
30007 Pseudomonas putidaBordetella bronchisepticaAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans
LL
AKSSR
FlagellaPolPeriPeri
30103 Pseudomonas mendocinaPseudomonas putidaBurkholderia cepacia
47%24%20%
AKSSR
CARSRR
30107 Pseudomonas mendocinaPseudomonas putida
57%29%
42C+-
30141 Burkholderia cepacia L
30203 Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans L
30303 Pseudomonas putidaPseudomonas aeruginosaPseudomonas fluorescens
65%21%8%
42C-+-
TOBSSR
30307 Pseudomonas putidaPseudomonas aeruginosa
52%40%
42C-+
30313 Pseudomonas putida
30317 Pseudomonas putidaPseudomonas aeruginosa
89%9%
42C-+
30323 Pseudomonas aeruginosa
30327 Pseudomonas aeruginosa
32007 Achromobacter xylosoxidans subsp. denitrificansAlcaligenes spp.
67%28%
32103 Pseudomonas mendocina
32107 Pseudomonas mendocina
32113 Pseudomonas mendocina
32137 Pseudomonas aeruginosa
32143 Burkholderia pseudomallei serol
32147 Burkholderia pseudomallei serol
10
© Liofilchem® – Oxi/FermPluri-Test – Codebook – Rev.0/20.12.2012
BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA
32163 Burkholderia pseudomallei serol
32203 Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans
32217 Pseudomonas aeruginosa
32303 Pseudomonas aeruginosa
32307 Pseudomonas aeruginosa
32313 Pseudomonas aeruginosa
32317 Pseudomonas aeruginosa
32323 Pseudomonas aeruginosa
32327 Pseudomonas aeruginosa
32333 Pseudomonas aeruginosa
32337 Pseudomonas aeruginosa
33307 Pseudomonas aeruginosa
34307 Pseudomonas mendocinaPseudomonas fluorescens
66%34%
42C+-
34401 Plesiomonas shigelloides
34501 Plesiomonas shigelloides
34541 Plesiomonas shigelloides
36103 Pseudomonas mendocina
40001 Brevundimonas vesicularisSphingomonas paucimobilis
50%35%
40003 Sphingomonas paucimobilisFlavobacterium spp.
59%36%
Mot+-
40007 Achromobacter spp.
40011 Brevundimonas diminutaBrevundimonas vesicularisFlavobacterium spp.
56%37%7%
Mot++-
Ypig-++
40101 Flavobacterium spp.
40103 Pseudomonas fluorescensPseudomonas putida
72%16%
Gel+-
40141 Chryseobacterium meningosepticum
40201 Brevundimonas vesicularis
40302 Acinetobacter baumannii/calcoaceticusAcinetobacter haemolyticus L
ßhem-+
11
© Liofilchem® – Oxi/FermPluri-Test – Codebook – Rev.0/20.12.2012
BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA
40303 Pseudomonas fluorescensPseudomonas putida
89%11%
Gel+-
40306 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
40313 Pseudomonas putida
40347 Achromobacter spp.Pseudomonas putida
75%25%
RUr+-
40401 Flavobacterium spp.
40403 Chryseobacterium indologenes
40421 Chryseobacterium meningosepticumChryseobacterium indologenes
86%10%
DNA+-
40423 Flavobacterium spp.
40501 Flavobacterium spp.
40521 Chryseobacterium meningosepticumVibrio parahaemolyticusChryseobacterium indologenes
71%15%14%
Mot-+-
DNA+
-
40567 Chryseobacterium indologenes
41347 Achromobacter spp.
41541 Chryseobacterium indologenes
44046 Achromobacter spp.
44102 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
44107 Achromobacter spp.
44302 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
44303 Pseudomonas fluorescens
44306 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
44326 Achromobacter spp.
44347 Achromobacter spp.
44523 Chryseobacterium meningosepticum
44561 Flavobacterium spp.
44571 Vibrio parahaemolyticus
45141 Aeromonas hydrophila
45161 Aeromonas hydrophila
45163 Aeromonas hydrophilaAeromonas caviae
ßhem+-
45373 Aeromonas hydrophila
12
© Liofilchem® – Oxi/FermPluri-Test – Codebook – Rev.0/20.12.2012
BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA
45173 Aeromonas hydrophila
45563 Aeromonas hydrophila
45571 Aeromonas hydrophila
45573 Aeromonas hydrophila
45575 Aeromonas hydrophila
50101 Burkholderia cepacia
50103 Burkholderia cepacia
50107 Burkholderia cepaciaPseudomonas mendocinaPseudomonas putida
68%14%10%
AKRSS
CARRSR
50143 Burkholderia cepacia
50302 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
50303 Pseudomonas fluorescensBurkholderia cepaciaPseudomonas putida
50%25%24%
AKSRS
TOBRRS
50306 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
50307 Pseudomonas fluorescensPseudomonas putida
55%39%
Gel+-
50323 Burkholderia cepacia
50343 Burkholderia cepaciaPseudomonas putida
68%32%
AKRS
50347 Pseudomonas putidaBurkholderia cepacia
78%22%
AKSR
50501 Vibrio parahaemolyticus
50541 Vibrio parahaemolyticus
50543 Vibrio vulnificusVibrio cholerae
LL
Sali+- serol
50560 Vibrio parahaemolyticus
50561 Vibrio parahaemolyticus
51563 Vibrio choleraeVibrio mimicus
LL
VPvar-
PBvarS
serol
52571 Vibrio parahaemolyticus
13
© Liofilchem® – Oxi/FermPluri-Test – Codebook – Rev.0/20.12.2012
BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA
54103 Pseudomonas mendocinaPseudomonas fluorescens
68%14%
42C+-
54107 Pseudomonas mendocinaPseudomonas fluorescens
90%10%
42C+-
54160 Vibrio alginolyticus
54161 Vibrio alginolyticus
54306 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus
54401 Plesiomonas shigelloidesVibrio parahaemolyticus
82%18%
Gel-+
54441 Plesiomonas shigelloidesVibrio parahaemolyticus
79%21%
Gel-+
54501 Plesiomonas shigelloidesVibrio parahaemolyticus
72%28%
Gel-+
54523 Vibrio alginolyticus
54541 Plesiomonas shigelloidesVibrio parahaemolyticus
68%32%
Gel-+
54543 Vibrio vulnificus L
54560 Vibrio parahaemolyticus L
54561 Vibrio parahaemolyticusVibrio alginolyticus
87%13%
54563 Vibrio alginolyticus
55131 Vibrio alginolyticus
55161 Vibrio alginolyticusAeromonas hydrophila
74%26%
NOSR
55163 Aeromonas hydrophilaVibrio alginolyticus
52%48%
NORS
55167 Aeromonas hydrophila
55173 Aeromonas hydrophilaVibrio alginolyticus
86%14%
NORS
55523 Vibrio alginolyticus
55543 Vibrio cholerae L serol
14
© Liofilchem® – Oxi/FermPluri-Test – Codebook – Rev.0/20.12.2012
BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA
55561 Vibrio alginolyticusAeromonas hydrophila
56%44%
NOSR
55563 Aeromonas hydrophilaVibrio alginolyticusVibrio choleraeVibrio mimicusAeromonas veronii bv. veronii
71%29%
LLL
NORS
serol
ONPG+-+
+
VP PB + + +/- - R/S + S
55573 Aeromonas hydrophila
55761 Vibrio parahaemolyticus L
56571 Vibrio parahaemolyticus
60103 Pseudomonas fluorescensPseudomonas putida
52%48%
Gel+-
60303 Pseudomonas fluorescensPseudomonas putida
66%34%
Gel+-
60307 Pseudomonas fluorescensPseudomonas putida
57%43%
Gel+-
60313 Pseudomonas putida
60517 Pseudomonas putida
62303 Pseudomonas putida
62307 Pseudomonas putida
64101 Chromobacterium violaceum LCol
violet
65161 Aeromonas caviae L
65163 Aeromonas hydrophila
65167 Aeromonas hydrophila L
65561 Aeromonas hydrophilaAeromonas veronii bv. veronii bv. sobria L
Sali+-
65563 Aeromonas hydrophila
65571 Aeromonas hydrophila
65573 Aeromonas hydrophila
65575 Aeromonas hydrophila L
70143 Burkholderia pseudomalleiBurkholderia cepacia
88%8%
TESR
serol
70167 Burkholderia pseudomallei serol
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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA
70303 Pseudomonas putidaPseudomonas fluorescens
65%33%
Gel-+
70307 Pseudomonas putidaPseudomonas fluorescens
74%25%
Gel-+
70313 Pseudomonas putida
70317 Pseudomonas putida
70323 Burkholderia cepacia
70347 Pseudomonas putida
72003 Pseudomonas putida
72103 Pseudomonas mendocina
72303 Pseudomonas mendocinaPseudomonas putida
78%22%
42C+-
72307 Pseudomonas mendocinaPseudomonas putida
78%22%
42C+-
74541 Plesiomonas shigelloides
75163 Aeromonas hydrophila
75171 Aeromonas hydrophila
75366 Burkholderia cepacia L
75563 Aeromonas hydrophila
75766 Burkholderia cepacia L
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Appendice 1. Elenco delle abbreviazioni usate nell'Archivio Biocodici.
Abbreviazione Spiegazione
% Probabilità in %
42C Crescita a 42°C
AK Amicacina, test mediante disco-diffusione su Mueller Hinton II Agar
CAR Carbeniccilina, test mediante disco-diffusione su Mueller Hinton II Agar
Cat Test catalasi con H2O2, Catalase/Oxy Test
Cet Cetrimide, crescita su Pseudomonas (Cetrimide) Agar
CF Tests Test di conferma
Col Colorazione delle colonie (pigmento non diffusibile) su Tryptic Soy Agar dopo 2-3giorni di incubazione a temperatura ottimale per la crescita
DNA Test DNasi, DNase Test Agar
Flagella Tipo di distribuzione dei flagelli: pol (polare) o peri (peritrica)
Gel Gelatinasi, Nutrient Gelatin
L Numero di un profilo determinato solo con un numero limitato di ceppi
McC Crescita su MacConkey II Agar
Mot Motilità
NO3 Riduzione di nitrato a nitrito, Nitrate Test
NO Novobiocina, test mediante disco-diffusione su Mueller Hinton II Agar
ONPG Reazione ONPG, 2-nitrofenil-ß-D-galattopiranoside con ONPG supplement81032
PB Polimixina B, test mediante disco-diffusione su Mueller Hinton II Agar
R Resistente
RUr Ureasi rapida, 18-24 ore di incubazione
S Sensibile
Sali Formazione di acido da salicina, Salicin Test
Serol Confermare l'identificazione con test sierologici
ßhem Beta emolisi su Columbia Agar (Sheep Blood 5%)
TCBS Crescita su TCBS Agar
TE Tetraciclina, test mediante disco-diffusione su Mueller Hinton II Agar
TOB Tobramicina, test mediante disco-diffusione su Mueller Hinton II Agar
Var Possibile risultato variabile (+ o -, R o S)
VP Reazione di Voges-Proskauer, VP Test Kit
Ypig Pigmento giallo su Tryptic Soy Agar
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Appendice 2. Procedure raccomandate per i test di conferma.
1. Crescita a 42°C (42C)Preparare una sospensione leggera in un terreno liquido adatto (es., Tryptic Soy Broth) con non più di 1colonia dell’isolato e incubare a 42°C (preferibilmente a bagnomaria) per 18–24 h. La crescita èindicata da un aumento della torbidità del terreno.2. Test antibiotici mediante disco-diffusioneOsservare le procedure convenzionali di disco-diffusione e i limiti dimensionali delle zonegeneralmente in uso (usare piastre Mueller Hinton II Agar). A questo scopo, considerare come sensibili(S) sia le zone “intermedie“ che quelle “sensibili“.Vengono utilizzati i seguenti dischi:Abbreviazione Antibiotico ConcentrazioneAK Amicacina 30 µgCAR Carbenicillina 100 µgNO Novobiocina 30 µgPB Polimixina B 300 UITE Tetraciclina 30 µgTOB Tobramicina 10 µg
3. Test Catalasi (Cat)Applicare su un vetrino una goccia di perossido di idrogeno (H2O2) al 3% preparato di fresco. Conun’ansa, prelevare da una piastra di 24–48 h una colonia dell’isolato e mescolarla con la goccia diperossido di idrogeno. Lo sviluppo di bolle e schiuma indica una reazione positiva. In alternativa, èpossibile applicare una goccia di perossido di idrogeno al 3% alle colonie in crescita su Tryptic SoyAgar. Non applicare il perossido di idrogeno su agar sangue in quanto potrebbe verificarsi una reazionefalsa positiva.In alternativa utilizzare Catalase Oxy/Test secondo la procedura riportata nel foglio istruzioni. 4. Cetrimide (Cet)Strisciare l’isolato su Pseudomonas (Cetrimide) Agar. Incubare per 18–24 h alla temperatura ottimale perl’isolato. La crescita su questo terreno indica una reazione positiva.5. Colorazione delle colonie (Col)Strisciare l’isolato su Trypticase Soy Agar e incubare per 2–3 giorni alla temperatura ottimale. Esaminarela colorazione delle colonie (le colonie normali, non pigmentate si presentano di colore bianco, grigioo giallo chiaro. A seconda delle specie, le colonie pigmentate si presentano di colore giallo-brunastro ovioletto.6. Attività DNasi (DNA)Strisciare l’isolato su DNase Test Agar. Incubare per 2 giorni a 36±1°C. Irrorare la piastra con 1 N HCl easpettare circa 1 min. Attorno alle colonie DNasi positive si sviluppa una zona trasparente mentrequando il terreno è uniformemente torbido significa che la reazione è DNasi negativa.7. Colorazione di flagelliSvariati metodi sono descritti nella letteratura pertinente e tutti richiedono una certa esperienza.8. Gelatinasi (Gel)Inoculare in profondità con un inoculo di rilevante entità una provetta di Nutrient Gelatin ed incubare atemperatura ambiente. La liquefazione del terreno sulla superficie entro 18–48 h indica che il test èpositivo. Reazione negativa: nessuna liquefazione.9. Crescita su agar MacConkey II (McC)Preparare una sospensione leggera di isolato in soluzione fisiologica o in Tryptic Soy Broth e inoculareimmediatamente una piastra di MacConkey II Agar con un’ansa di questa sospensione. Incubare36±1°C per 20–24 h. Se il ceppo evidenzia una crescita scarsa su una piastra di sangue incubata a36±1°C, incubare la piastra di MacConkey II Agar ad una temperatura inferiore, ma per non oltre 48 h.
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10. Motilità (Mot)Dispensare su una piastra una goccia di brodocoltura dell’isolato che è stato incubato per 6–8 h a 25°C.Applicare un vetrino coprioggetti sulla piastra e osservare con un microscopio a contrasto di fase(immersione in olio) alla ricerca di batteri mobili. Nei casi in cui è possibile scurire il campomicroscopico, si può usare anche un regolare obiettivo ad immersione in olio. La motilità effettiva èevidenziata da un rapido cambiamento di posizione delle cellule batteriche individuali in relazione allealtre cellule.11. Riduzione del nitrato (NO3)Inoculare una provetta di Nitrate Broth con un’ansata di microrganismi prelevati da una coltura pura.Incubare a 32–36°C per 18–48 h, con il tappo leggermente allentato. Valutare il test aggiungendo 0,5mL di ciascuno dei due reagenti nitrati per individuare la formazione di nitrito dal nitrato (colorazionerossa). Se la reazione è negativa (incolore), aggiungere della polvere di zinco per rilevare il nitrato nonutilizzato. Se il colore vira al rosso dopo l'aggiunta di polvere di zinco, significa che il nitrato non èstato utilizzato (la reazione è negativa); se invece il contenuto della provetta resta incolore, significa cheil nitrato è stato ridotto a nitrito (denitrificazione ovvero reazione positiva).In alternativa utilizzare Nitrate Test secondo la procedura riportata nel foglio istruzioni.12. ONPGPer testare l’idrolisi di ONGP (2-nitrofenil-beta-D-galattopiranoside) è possibile utilizzare un ONPGDisc. Lo sviluppo di una colorazione gialla indica una reazione positiva.13. Ureasi rapida (RUr)Una forte reazione positiva nel settore Urea dell'Oxi/FermPluri-Test dopo 18–24 h di incubazione,evidenziata da una colorazione rosa intensa è indice di positività.14. Formazione di acido da salicina (Sali)Alcuni batteri producono acidi dalla salicina Per questo test, usare CTA Medium with Salicin e seguirele istruzioni fornite per questo terreno.In alternativa utilizzare Salicin Test secondo la procedura riportata nel foglio istruzioni.15. Sierologia (serol)L’identificazione dei risultati di Vibrio cholerae e Pseudomonas pseudomallei deve essere confermatamediante test sierologici. 16. Beta-emolisi (ßhem)Strisciare l’isolato su una piastra di Columbia Agar (Sheep Blood 5%). Incubare alla temperaturaottimale per l’isolato, per non oltre 48 h. La comparsa di zone trasparenti attorno alle colonie è indicedi beta-emolisi.17. Crescita su TCBS Agar (TCBS)Strisciare l’isolato su una piastra di TCBS Agar. La temperatura ottimale per l'incubazione è 30–36°C.TCBS Agar è un terreno selettivo e differenziale per Vibrio spp.18. Reazione di Voges-Proskauer (VP)Alcune specie batteriche producono acetoina (acetilmetilcarbinolo) dal glucosio. È possibile eseguire iltest utilizzando il VP Test Kit e seguendo le istruzioni riportate nel foglio istruzioni.
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Appendice 3. Disponibilità dei terreni e reagenti necessari per l’esecuzione dei test di conferma.
Numero della procedura come per Appendice 2 Nome del terreno o del reagente Ref.
1, 9 Tryptic Soy Broth 24444
2 Mueller Hinton II Agar 10031
2 AK 30 9004
2 CAR 100 9009
2 NO 30 9063
2 PB 300 9120
2 TE 30 9043
2 TOB 10 9044
3 Catalase Oxy/Test 88023
3, 5 Tryptic Soy Agar 10037
4 Pseudomonas (Cetrimide) Agar 10033
6 DNase Test Agar 10013
8 Nutrient Gelatin 24153
9 MacConkey II Agar 10603
11 Nitrate Broth 610322
11 Nitrate Test 88009
12 ONPG Disc 88105
14 Salicin Test 88217
16 Columbia Agar (Sheep Blood 5%) 10025
17 TCBS Agar 11195
18 VP Test Kit 88035
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