molekularpathologisches weitere pcr-basierte ... · • mycobacterium tuberculosis komplex (tbc)...
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Mutationsanalysen mittelshochdichter Parallelsequenzierung
Colon Lung Panel
KRAS NRAS AKT1 CTNNB1FGFR1 NOTCH1 ERBB4 STK11EGFR ERBB2 MAP2K1 METFGFR2 FBX7 SMAD4 BRAFPTEN ALK TP53 FGFR3PIK3CA DDR2
Cancer Hot Spot Panel
ABL1 CTNNB1 FLT3 IDH2 NRAS SMO AKT1 EGFR GNA11 KDR PDGFRA SRC ALK ERBB2 GNAS KIT PIK3CA STK11 APC ERBB4 GNAQ KRAS PTEN TP53ATM EZH2 HNF1A MET PTPN11 VHL BRAF FBXW7 HRAS MLH1 RB1 PTENCDH1 FGFR1 IDH1 MPL RET CDKN2A FGFR2 JAK2 NOTCH1 SMAD4 CSF1R FGFR3AK3 NPM1 SMARCB1
BRCA 1/2 Panel
BRCA1 BRCA2
Anforderungen sind auf Einzelgen-, sowie auf Genpanel-Ebene möglich.
Weitere PCR-basierte Tumordiagnostik
• ARMS (alveoläres Rhabdomyosarkom), Translokations-analyse [t(1;13, t(2;13)PAX7 bzw. PAX3-FKHR]
• SYT-SSX (Synovialsarkom), Translokationsanalyse [t(X;18)]
• EWS (Ewing Sarkom), Translokationsanalyse [t(11;22) FLI1-EWS, t (21;22) EWS-ERG, t(12;22) EWS-ATF1]
• EndoPredict, Expressionsmuster in Mammakarzinomen• MSI (Mikrosatelliteninstabilität)
Immunglobulin- und T-Zellrezeptor-Gen- Umlagerungsanalysen
• Immunglobulin-Schwerketten (IgH) Gen-Umlagerung • Immunglobulin-Leichtketten (IgL) Gen-Umlagerung • T-Zellrezeptor-Gamma (TCR-Gamma) Gen-Umlagerung • T-Zellrezeptor-Beta (TCR-Beta) Gen-Umlagerung
PCR-basierte Erregernachweise
Virennachweise• Adenoviren• Enterovirus• Epstein-Barr-Virus(EBV)• Hepatitis-B-Virus(HBV)• Hepatitis-C-Virus(HCV)• humanesHerpes-simplex-Virus(HSV-1und-2)• humanesHerpes-Virus6(HHV-6)• humanesHerpes-Virus8(HHV-8)• humanesPapilloma-Virus(HPV), Nachweis und Typisierung• ParvovirusB19• Polyomavirus(BKV/JCV)• Varicella-Zoster-Virus(VZV)• Zytomegalie-Virus(CMV)
Bakteriennachweise• Bartonellen(henselae/quintana)• Borreliaburgdorferi(Lyme-Borreliose)• Chlamydiatrachomatis• Clostridiumbifermentans• Helicobacterpylori• Listerien• Mycobacteriumconsensus(MOTT)• MycobacteriumtuberculosisKomplex(Tbc)• Pseudomonasaeruginosa• Stenotrophomonasmaltophilia• Treponemapallidum• Tropherymawhipplei• Yersinien
Andere Erreger• Amöben(Entamoebahistolytica)• FungiPCR/Typisierung• Leishmanien• Pneumocystiscarinii(P.jirovecii)• Toxoplasmagondii
FISH-basierte Tumordiagnostik
• ALK, Bruch• BCL2, Bruch• BCL2/IgH, Translokation, t(14;18)• BCL6, Bruch• BCR/ABL,Translokation,t(9;22)• CCND1/IgH, Translokation, t(11;14)• DDIT3 (CHOP), Bruch• EGFR, Amplifikation• ETV6, Bruch• EWSR1, Bruch• FOXO1 (FKHR), Bruch• FUS, Bruch• HER2, Amplifikation• HER2/TOP2A, Amplifikation• IgH, Bruch
MolekularpathologischesLeistungsspektrum
Das Institut bietet folgendemolekularpathologische Routine-Diagnostik an:
• JAZF1, Bruch• MALT1, Bruch• MDM2, Amplifikation• MET, Amplifikation• MYC, Bruch, Amplifikation• MYC/IgH, Translokation, t(8;14• NR4A3, Bruch• N-MYC, Amplifikation• RET, Bruch• ROS1, Bruch• SS18 (SYT), Bruch• Trisomie 8• Trisomie 9• USP6, Bruch• WT1, Bruch• X/Y Chromosomen-Nachweis• 5q Deletion (5q31)• 7q Deletion (7q31)• 13q Deletion (13q14)• 17p Deletion (17p13.1)• 20q Deletion (20q12)
Stand:23.11.2016