Hacia el establecimiento de

una conexión fenotipo-genotipo

en tomate

Irene Villalta1

José María Jiménez2, José Miguel Martínez-Zapater2

Emilio Carbonell1 & María J. Asins1

1. IVIA, Apdo. Oficial, 46113 Moncada (Valencia)

2. CNB-UAM, Cantoblanco, 28049 Madrid

L. pimpinellifolium

L. cheesmanii

(P population)

(C population)L. esculentum var. cerasiforme x

....

F1 self-pollination

F2 self-pollination

RIL1 RIL2 RIL3 RILnRIL3

F7

“The killing tomatoes”

L. esculentum x

L. cheesmanii

C population117 lines

L. esculentum x

L. pimpinellifolium

P population142 lines

VENTAJAS DE LAS POBLACIONES DE RILs

• CADA LÍNEA, UN GENOTIPO QUE SE PUEDE EVALUAR PARA TANTOS CARACTERES, MOLÉCULAS Y CONDICIONES COMO SE NECESITE

• MÍNIMA DISTANCIA ENTRE PUNTOS DE RECOMBINACIÓN (CARTOGRAFÍA FINA)

• HACE POSIBLE ESTUDIOS GXE Y AXA• MÁXIMA INFORMACIÓN DE VARIACIÓN

GENÉTICA (NATURAL) PARA UN MISMO TAMAÑO DE FAMILIA

SSRW9_180SSR13_6000

SSR41_20021

SSRW75_17532

CT167_53053 SSRW26_75054SSRW44_70057 SSR30_30059

P1

SSRW136_1480

SSRW223_8009

SSR41_20023

SSRW75_17530

C1

SSR12_7500SSRW92_1802

CT233_17007

SSR12_1400

SSR9_22012

SSRW26_17521

CT156_87026

SSRW104_90038SSRW66_20041TG30_32044

CT143_42054 SSRW11_515CT283_83055SSR22_95057

SSR12_1400

TG48_3503

SSRW26_17512

SSRW356_28025

P2 C2

CT283_2900

SSR3_22012

SSR19_900SSRW19_40019SSR11_90020CT167_340SSR24_25021SSR6_18023

SSR14_18031SSR10_13033

SSRW11_6500

SSRW70_31510SSRW356_23011SSR6_18013CT211_53014SSRW19_40015

SSR24_250

17

SSR10_13021

SSR14_18023

P3 C3

P4 C4

21

25

37383940414243

C6bCT141_3200

SSR22_2002

SSRW19_7505

SSRW47_2206

SSRW565_3107

SSRW26_950

CT283_7007

SSRW11_490CT167_800

SSR5_220

SSRW306_450CT141_320SSR22_200TG16_380SSRW19_750SSRW47_220CT176_280SSRW47_285CT283_500

SSRW350_298SSRW350_2980

CT206_2905

SSRW26_9515

P6 C6a

SSRW244_550

SSRW45_2800

SSR24_5106

SSRW565_39612

TG35_506SSR33_90031 SSR22_530SSRW356_90032 SSR12_83033

SSRW285_29044

SSRW108_16059

SSR24_7500

SSRW45_28010

SSR16_39617SSRW565_39622

SSR23_39647SSRW19_760SSR41_800SSR1_800TG43_130048SSR20_700SSRW306_340SSR30_52049SSRW26_50050 SSR34_75052SSR22_34461

SSRW285_29072SSRW241_20073

SSRW108_16087

P7 C7 CT149b_2500

SSRW38_25015SSRW594_31016 SSRW63_24017 SSRW92_50019

SSRW344_75028

SSRW47_28045 SSR37_1200SSR26_34446SSR22_325SSR37_530SSR13_46648 SSR13_298SSRW318_50049 SSRW15_192SSRW19_120050CD40_70056SSRW244_22057

SSRW344_29866

SSRW38_2500

SSRW63_2403

SSRW344_7509

SSR33_160016SSRW70_500SSRW28_37019CT156_770SSR27_101520 CT211_65021TG15_90022CD40_70024SSRW244_22025

SSRW344_29839

P8 C8 SSRW70_1200

SSRW69_1304

SSRW104_29013 SSRW28_175

15 TG16_50716 SSR20_34017 SSR27_600CT167_65018SSR13_29019 SSRW19_22020CT206_87021 SSRW19_19022

SSR42_18049

P9 C9SSR38_1540

SSRW69_13012

SSRW19_220SSRW104_290SSR19_19024 SSR30_450SSRW565_98025

SSRW383_27037

SSR42_18055

CT156_8500

SSRW11_6003

SSRW248_2706

CD40_5309SSR24_85010

SSR29_25019

12

SSR16_6000SSRW450_490CT156_850TG16_1000CT156_3441

SSRW248_2702

SSR24_8507

SSR29_250

SSRW223_230SSRW74_2400

SSRW74_2400

SSRW223_2301

P10 C10 SSRW76_2300

SSR35_420SSRW244_310 15SSRW63_530SSR1_175 16CT234_320TG16_80017SSR20_52018

SSRW20_7200

TG30_32019

SSRW104_56031

SSRW344_46039SSRW104_55042

SSR1_17548TG16_80050 TG35_51452

SSRW46_34057SSRW46_27560

P11 C11

SSRW43_4500SSRW43_2401

TG43_60010CT206_40011CT156_36512TG43_75013SSR31_13014SSRW306_31015SSRW565_30016

SSRW94_19019

TG15_48025

TG43_7500

SSR31_130SSRW450_310SSRW306_3101

CT118_3300

TG69_62010

SSRW43_460SSRW344_430

12

SSR21_90015

SSR35_29817

SSR27_4800

SSRW344_430TG69_6004 SSR21_9005SSR17_3206SSR35_2988

SSR27_31026

SSRW115_24038

SSR36_3200

SSRW223_37017SSR22_1018TG69_950CT167_650SSRW44_25019 CT156_1200SSRW94_45020CT176_29621

TG16_53023

P12C12

TG16_4400

TG48_5102

SSR30_3754

TG48_3406

C13CT206_16360

SSRW223_7009

C14

SSRW20_1600

CT156_12001

TG69_6002

SSR33_3963

SSRW44_2504

SSR22_517TG69_9505

SSR22_1018SSRW28_4406

TG16_5309

CT118_470

P5 C5

0

1

2

3

4

5

SSRW350_298

SSRW26_95

CT283_700

SSRW11_490

CT167_800

SSR5_220

SSRW306_450

CT141_320

SSR22_200

TG16_380

SSRW19_750

SSRW47_220

CT176_280

SSRW47_285

CT283_500

Map (cM)

0

1

2

3

4

5

6

SSR12_140

SSR9_220

SSRW26_175

CT156_870

SSRW104_900

SSRW66_200

TG30_320

CT143_420

SSRW11_515

CT283_830

SSR22_950

Map (cM)

0

1

2

3

4

5

SSR12_140

SSR9_220

SSRW26_175

CT156_870

SSRW104_900

SSRW66_200

TG30_320

CT143_420

SSRW11_515

CT283_830

SSR22_950

Map (cM)

GENES CANDIDATOS ASOCIADOS CON TIEMPO DE FLORACIÓN

Control

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 390

5

10

15

20

25

30

Salinity

0

5

10

15

20

B5 B1

B8

SALINIDAD CONTROL

Menos días hasta floración más frutos

GC GC2

GC1 (B5)

SALINIDAD CONTROL

GC6 (B1)GC2aGC3a (B8)

EPISTASIAS ENTRE GENES CANDIDATOS PARA TIEMPO DE

FLORACIÓN EN CONTROLSALINIDAD

SL

GC1GC2aGC3a

GC5b

GC4GC3b

GC5a

GC2aGC3a GC2b

GC5b

GC2c

GC4GC3b

GC5a

FW FW

FW

SLFW

SLFW

FN FNGC6

GXERW

¿Y A CONTINUACIÓN QUÉ?

• CLONACIÓN Y SECUENCIACIÓN DE POLIMORFISMOS RELEVANTES

• MISMO ESTUDIO EN POBLACION P (COMPROBACIÓN EN MUESTRA INDEPENDIENTE)

• ANÁLISIS DE EXPRESIÓN DE SECUENCIAS CONCRETAS

• ...

AGRADECIMIENTOS• JESÚS CUARTERO Y M. CARMEN

BOLARÍN DEL CSIC

• PERSONAL DEL LAB E INVERNADERO (PLACI, PEPE, JAIME)

• SERVICIO DE SECUENCIACIÓN DEL IBMCP (EUGENIO GRAU)

• GUILLERMO BERNET

VENTAJAS DE LAS POBLACIONES DE RILs