fibrosi cistica calcolo del rischio in situazioni insolite

Fibrosi cistica

Calcolo del rischio in situazioni “insolite”

Domande:

Intestino iperecogeno:rischio di FC nelle seguenti situazioni

- 2 genitori negativi al pannello standard- 1 genitore negativo al pannello standard- 2 genitori negativi per DGGE- 1 genitore negativo per DGGE- feto Hz al pannello standard- feto Hz per DGGE

Domande:

IRT (immuno reactive tripsinogen):rischio di FC nelle seguenti situazioni

- negativo a pannello standard- Hz a pannello standard- Hz per DGGE

Premesse

1. E’ necessario avere i parametri di base1. Frequenza gene FC (1/50)2. Detection rate per pannello standard

1. La DR dello stesso pannello può essere differente per “origini” differenti

3. Detection rate per DGGE

Resta poi insoluto il quesito se mutazioni non identificate con PS o DGGE siano capaci di essere responsabili di alcuni quadri clinici

( )

Premessa

Bisogna conoscere il calcolo delle probabilità .

Probabilità di estrarre da un mazzo di carte 1 Asso?

4/40 = 1/10

Probabilità di estrarre da un mazzo di carte 1 carta di denari?

10/40 = 1/4

Probabilità di estrarre da un mazzo di carte 1 di denari?

1/40 = ¼ * 1/10

Bisogna conoscere tutte le alternative e le Probabilità a priori [P(Hi)] per ogni alternativa. La somma di [P(Hi)] deve essere eguale a 1.

Si utilizza una (o più) informazione supplementare non inclusa nella probabilità a priori (probabilità condizionale [P(E|Hi)]). Per ciascuna la somma per le varie alternative non deve essere eguale ad 1.In ogni colonna si ottine il prodotto delle probabilità e si ottiene la probabilità congiunta. Si divide quindi ogni probabilità congiunta per la somma si tutte le probabilità congiunte (probabilità finale). La somma delle probabilità finali deve essere eguale a 1.

Es. in una famiglia in cui vi sono due fratelli sani ed uno affetto da FC.Qual è la probabilità per ogni fratello di essere HZ?

Aa Aa

AA Aa Aa aa

Essendo sani, possono solo avere genotipo AA, Aa, Aa, cioè 2/3.

In realtà il calcolo che noi facciamo è:

Alternativa Oz AA Hz Aa Oz aa

P. A priori ¼ ½ ¼ (¼+½+¼)=1

P. Condizionale (no FC) 1 1 0

P. Congiunta ¼ ½ 0

P. Finale ¼/( ¼ + ½ ) ½/( ¼ + ½ )

¼ / ¾ ½ / ¾

1/3 2/3 (1/3+2/3)=1

Probabilià di FC in caso di intestino iperecogeno edHz per mutazione FC (DR = 0.85)

Alternativa FC non FC

P. A priori 3/100 97/100

P. Condizionale (1 mutazione) 25.5/100 3.4/100(.85*.15)*2 1/25*.85

P. Congiunta 76.5/10000 329.8/10000

P. Finale 76.5 (76.5 + 329.8) 329.8 /(76.5 + 329.8)

0.19 0.81

1000 feti con EB

3% con FC 97% senza FC

30 feti affetti da FC 970 sani

85% detection rate

72.2% con 2Mut. Identif.

25.5% con 1Mut.identif.

2.25% con 0Mut.identif.

(4% Hz=38.8) 85% DR

38.8 * 0.85 =33

21.7 7.65 0.65 33

Feti con FC ed 1 m = 7.65/(7.65+33) = 18.8%

Probabilià di FC in caso di intestino iperecogeno edHz per mutazione FC (DR = 0.95)


P. A priori 3/100 97/100

P. Condizionale (1 mutazione) 9.5/100 3.8/100(.95*.05)*2 1/25*.95

P. Congiunta 28.5/10000 368.6/10000

P. Finale

0.07 0.93

Probabilià di FC in caso di intestino iperecogeno ednessuna mutazione FC (DR = 0.85)


P. A priori 3/100 97/100

P. Condizionale (1 mutazione) 2.25/100 1 (.15*.15)

P. Congiunta 6.75/10000 97/100

P. Finale 6.75/9706.75 9700/9706.75

0.0006 0.9994 1/1478 1477/1478

Probabilià di FC in caso di intestino iperecogeno ednessuna mutazione FC (DR = 0.95)


P. A priori 3/100 97/100

P. Condizionale (1 mutazione) 25/10000 1 (.05*.05)

P. Congiunta 0.75/10000 97/100

P. Finale 0.75/9700.75 9700/9700.75

0.00007 0.99993 1/12974 12973/12974

Probabilità di FC in base al genotipo parentale (DR=.85)

AA.96

Aa*0.035

Aa0.005

AA 0.96

AA ½ AA½ Aa* 0.0168

½ AA½ Aa

Aa*0.035

½ AA½ Aa* 0.0168

¼ AA, ½ Aa*,¼ a*a*

¼ AA, ¼ Aa,¼ Aa* 0.00004¼ aa* 0.00004

Aa0.005

½ AA½ Aa

¼ AA, ¼ Aa,¼ Aa*, ¼ aa*

¼ AA, ¼ Aa,¼ Aa, ¼ aa

Probabilità di FC

Probabilità di FC se è identificato Int.Eperecogeno (3/100) e una mutazione (0.0023) sulla probabilità di essere Hz (1/25) sulla probabilità di non avere FC

0.03 * 0.0023 / 0.0004 - 0.03 * 0.0023/0.0004 + 0.97*0.9977/0.9996

0.1725 -0.1725 + 0.9674

15%

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