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Family 1A - Alignment

Family 1A - Domain architecture

XAC_RS18005 (Slt)

Slt (ECK4384)

Slt (PA3020)

Slt (Smlt4007)

LtgA (NGO2135)

Lytic transglycosylase, superhelical U-shaped (IPR008939)

Lytic transglycosylase, superhelical linker - SLT_L (IPR012289)

Transglycosylase SLT domain 1 - SLT (IPR008258)

1 100 200 300 400 500 600 657

6001 100 200 300 400 500 645

1 100 200 300 400 500 642

1 100 200 300 400 500 600 661

600

1 100 200 300 400 500 616

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T T RH P SA E SR R Y L YK VN T AQ K SYRRR - - - - -

- - - - - - - - - N K Y - - - PN A V L GAWRN R - WQW R

Family 1B - Alignment

1 50 100 150 200 250 300 327

1 50 100 150 200 250 300 359

1 20 40

XAC_RS12500 (MltC)

MltC (ECK2958)

LtgB (NGO2135)


Murein transglycosylase-C, N-terminal (IPR024570)

60 80 100 120 140 160 180 207

Family 1B - Domain architecture

MA A P - - - - - - - - - - - - - - - - - - V K P PRGP L L G SG L A I A A L A A T CT AGT AW GQET P P PA YQ I A A AQAGV P S A V L Y - - A V A L QE SGT R L RGR Q I - - PWPWT L N V AGA PQRH A T RAD A C L A L R

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QP

- -

Family 1C - Alignment

Family 1C - Domain architecture

1 20 40 60 80 100 120 140 160 180 203XAC_RS11470 (MltE)

MltE (ECK1181)1 20 40 60 80 100 120 140 160 180 203


MK A K - - - - - - - - - - - - - - - - A I L L A SV L L V GCQ ST GN VQQ H AQ S L SA AGQ GEA A K FT SQA RWM- - DDGT S I A PDGD LWA F I GD - - E L KMG I P END R I R EQ KQ- - - - - - - - - - - - - - - - - -

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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K F I A SR SY F D RV VN R SR P Y MYH - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - I AN EV K K RNMPA EA A L L P F I - - E SA FV T K A K SH VG A SG LWQ FMPA

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - H F SRA PA R L ADD AQD V L P L FGY - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V VD E L RK ADMPT E FA L I P FV - - E SG YR PGA RNG SG PAG LWQ F I A T

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Q FAH A P SR L ANQDDD A L V L FGY - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V V E E L RK AD L PT E FA L I P FV - - E SG YR PN A RNG SG PT G LWQ F I A T

DD - T L L QAD P DH L GPA SNGV P EA A RA A T L L NDQRHD FD KM VQYN PA VQAG I RRWL T DMR P A L L T SY EN Y S N L RGVMWP EW QK RG L P - EA L L FG I MA K E SN GK VH A S SRAG A AG LMQ FMPA

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ST T I Y E L T I C L G SMGT RDGY MRA L RN L N PR Y E SDG- - - - - - - - - - W I PAG T V I N A T N R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - I VN L YT R YC VNGPRAD L A R T L I T AD L N SA

ST T I Y E L T I C L G SHGT RDGY MRA L RN L N PR Y EADG- - - - - - - - - - W I PAG T L I N A T T R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - I AG L YQRN C V SGPRAD L A R T L I T AD L N A A

Family 1D - Alignment

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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A SGE I A A VQ ST L V AD - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GQ I AGGA V K P V YQQ L A RQA - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

L H T A SE SV V S I D I DN T PD T Y R SNMPAGT VN V S I A R I QPA A AQT AD I T V A P L PQET V RT E P D P L V R I T E PA L A T A A AQPQT EKQT AMP SET QT A T L AQV I P PNDMQA AD E L MQ L V A RNN L R

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AMV A SA EME T GA A S ST A A P T - - A V A A A A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A EA A T A L V A T T A PV A A A V P T PQV T RT V A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

I V R S S SA - - - - - - - - - - - - - - - - - P E YV P S V A VGD V SQMA - - - - - - GV PT T - - - - V A T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

I K R PT - A - - - - - - - - - - - - - - - - - T SYT G S V A VGGV V PV A D A A A ST SV PT T PV A PV A T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N T P L N SR V YT V R SGD T L S S I A SR L GV S T KD L QQWN K L RG SK L K PGQ S L T I GAG S SAQ - - - - - R L ANN

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ST PA RT R SYK V KNGD S L WQ I A RNNGVD VND L K RWNG L D KH A L K VGQT L K L QGGT QA L A A RKGN A AGK

RQA E ET I SA V I GT PD T V A EH N I S S SPQH T V A ADGK RRA R L ET RV A K A ADG EA ET SP L H A S I H RV V EGD T L FN I A K R YN V S V AD L I V ANN I KGN T I QKGQV L R L AQA A PAQ T - - - - - - - - R

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - SK A ST SPA R T H T V RNGE SA WA I A RR YG I T V T T L L A T NG L D K SA I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A I AD R PR SR RH T V RDGE SA WT I A RR YGMP V K A L L S L NG L SG S SV - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GQPA V A K PK A KQV R SYT I A RGD T L GRV AQK YQC E I K E L A K ANG L K A P SY - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - PR PA - A R PK P - - V R SH K VGRGET L GA I A A K FQCD V PT L A RANG L K A PA Y - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

SD S I T Y - RV R KGD S L S S I A K RHGVN I KD VM RWN SD T AN - L QPGD K L T L FV KNNNMPD S

RD SA T Y YK V K QGD SMY L I A K R FN V EMKH L Q RWN PR SKQA L K PGQT L T L Y L - - - D T A SR

I EK V SY - T A R KGD T FK S I A A R FN I H I DD I R R L N PN L - N T I N PGQRV K L I - - - - - - - G S

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L K PGMV L S F - - - - - - DD SP

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L K PGA V L RV - - - - - - ED - -

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A L K PGQ S I K L AG C - - - - - D R

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S L RHGQT L K L QG C - - - - - D K

Family 1D - Alignment

Family 1D - Domain architecture

1 50 100 150 200 250 300 350 400 450 500 527XAC_RS13860 (MltD2)

1 50 100 150 200 250 300 350 392XAC_RS05550 (MltD1)

1 50 100 150 200 250 300 350 400 452MltD (ECK0211)

1 50 100 150 200 250 300 350 400 450 500 534MltD (PA1812)

1 50 100 150 200 250 300 350 399MltD1 (Smlt0994)

1 50 100 150 200 250 300 350 400 450 500 534MltD2 (Smlt3434)

1 100 200 300 400 500 600 658LtgE (BGO0608)


LysM domain (IPR018392)

Lytic murein transglycosylase D , lipid attachment domain (IPR010511)

M - - - L P - - GM E - - - - - - - - L MGCT G L A - - - - - - - - - - - - - - - - - V PGEVM QH V V R I E S SR N - - - - P YA I G V VGGR L V R E P RG L A EA V A T A KM L EQKGY - N F S L G L GQVN - R YN L QK YG L A

MA R P L PA T GM R FA L V L I L T L L A A PA L A AD E V C ET L A A RAG A EAG I P EG LM EA I A RV E SGR GGRAWPWT L N QGGRGM F F ET R - - A EA V RM L K ST V A SGV SN I D VGCMQ L NW RWH A PA FA SA

T Y EMA FD K C P N L V A A SK I L A ECH SR SGANW GK S F SC Y Y SG N F ET G FKHGY VQK I YA S I RQ SV A S SGA E P I A V V PT RQVQ L K PAN P L RQA A A E L AD - - A I V A RR I QE F SGA SH T A A SP PGP

D - EM- I D PV R N T RH A A R F L R E L RA R L G S- W EA A T A A YH SA - - D RGRGA A Y L A K V EA E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - RGG SR L A EA A T D L PD EA T L A A A RVQG L - - - - - - L V L A PQP

M L SQPA PA Y S L P SRV A PV A P A A A P E EN E L Y V V K A T GQGRG V A V PA PGPQA L T PT DQ SV PA SMQRA PQT V P QVD SA FV F - -

MV S L GET QGG L P - RA A SD I P SQGP L E - - - - - - - - - - - - - - - - L RA A A PD L L A EAD - - L PQ R L RA R FH A VQ S FRD L L AMQP

Family 1F - Domain architecture

1 50 100 150 200 250 280

1 50 100 150 200 265SltF (RS)

XAC_RS13315 (MltF)


Family 1F - Alignment

M SD ST I A YQH VDQH SN L Q L G F S SGP SPK RR V RA K R SGCGR RAGAGPQR I L FA A A L A CA A P FA RAD C F E EA AGYQH VN PWV L RA I AWQE SR GRAD A VH RNN - NGT VD YGKM Q I N S I H L RR L

M- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K K I I L S I I L I SN YC YA - SD C F E I T GK A YN I D P L I L K A I AWN E SK CK SG I K SK T N KNGT YD I G I M Q I N S SH L D L L

MR L RA I L L Q- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - FV V PGV L V L T SA RA V A FC YK EA G SK YG I D PTM L Q S I A L T E SA FR PN I E SH - - - - - T AD I G LM G I N R SWL PV L

- S SYG I SRD A LMH P - C I SV Y V A AWR L R EMT N K YGN TWA A V GA YH S- - - ET PGE - - - RD K - - YAH A I H S I - - - L L RRGV I A E

- SK FN I SEDD L L ND A C I N I S V AGY I L A SN I K SRGN TWD A V GA YN AGY FN T PN A V E L RRQ- - YAMK I YK T Y N K L KNN EQ I I D

H K K FG L T GAD VWN P - CT N VH I GAW I L AN SY RQHGK SWEA V GA YN A A CT K L KGRA C YRA RM T YAN K V YQNW K R L K T R S- - - S

Family 1G - Alignment

Family 1G - Domain architecture


1 20 40 60 80 100 120 140 160 187

1 20 40 60 80 100 120 140 152

1 20 40 60 80 100 120 140 153

EtgA (EPEC)

LtgX (NG5004)

XAC_RS02185 (hpaH)

M FK RR YV T L L P L FV L L A A C S SK PK PT ET D T T T GT P SGG F L L E PQ- - - - - - HN VMQMGG- - - - - D FANN P - - - N AQQ F I D K MVN KHG FD RQ Q L QE I L SQA K R L D SV L R LMD NQA PT T SV K P

M- - RRT A L A L P L F L L V SA C S SE PT P P PK PA A K - - PQA RT V I SPR PV RQ SV QP I L P L RG- - - - - D YANN P - - - A AQH F I D R MV SQHG FN RQ Q L HD L FAQT Q R L DWV I R LMD RQA PT YT - - P

MKN AMQV L - - - - - - - - - - - - - - - - - - RTWA A RGVQWVG- - - - - - - - - - - V AGV I G L SGA A QAGD YDG SP - - - QV A E FV SE MT RD YG FAGE Q LMG L FRD VN RKQ S I L D A I S R PA ERV K - - -

M I RRT L T C L L T L G L V - - A CA T QP SP P SP P P A A SA P PA K P P V A PT P PA SA A A EA PA L - - P P V - - D L T PV P F E I A RAN FV RD T SA K YG I D A A Q I EA V L AQAQ FKD A I V T AM S R PA ERV K - - -

M I RRT L A CM L T L G L V - - A CA T QPK SP P S SP QA S ST PRQPA T K AHGPA EA A P EA T A A T A P P V - - D L T PV P F EV A RA R F I AD T A K R YG L K P E Q I S SV L DQAQ V RQP I I A AM S R PA ERV K - - -

MEK RK I L P L A I C L A A L SA C - - - - - - - - T AM EA RT PRAN EA QA PRAD EMK K E SR PA FD A A A V PV SD SG FA A N AN V RR FVDD EVGKGD F SQA EWQD F FD K A A YK AD I V K I MH R P ST S- - - - -

P SGPNGAWL R YRK K F I T PDN VQNGV V FWNQ Y ED A L N RAWQ V YGV P P E I I V G I I GV ET RWG RVMGK T R I L D A L A T L S FN Y P RRA E - - - - - - - - - - - - Y F SG E L ET F L LMA R D EQDD P L N L K

P SGPNGAWL R YRK K FV T PGN VQNGV L FWDQ Y ET D L QRA SR V YGV P P E I I V G I I GV ET RWG RVMGK T R I I D A L ST L S F SY P RRA E - - - - - - - - - - - - F F SG E L EQ F L L QA R K EGT D P L A L R

- - - - - - QWK E YR P I F I SD A R I SRGVD FWN K H A ED L A RA EK E YGV PA E I I V S I I GV ET F FG RN T G SYRVMD A L ST L G FD Y P PRAD - - - - - - - - - - - - F FRK E L R E F L L L A R EQQVD P L S L T

- - - - - - PWN E YR PM F I T QA R I DGGRK F L A E H RA E L SK V EA A T GV PAQV I V A I I GV ET SYG SN AGK YRV L D A L YT L A FR Y P R SGD PA K L ER EV RR E L F FRD E L GQ L FA L GK E EQ L D V T T L I

- - - - - - PWN E YR PM F I SK A R I DGGRA F L A E H RA E L D RVQQ RT GV PA EV I V A I I GV ET SYG KN AG SH RV L D A L YT L A F Y Y P R SGD PA K L ER EV RR E L F FRD E L A K L F E L GR E EK L D I T T L K

- - - - - R PWYV FRT GN SGRA K FHGA RR F YA E N RA V I DD V AQ K YGV PA E L I V A I I G I ET N YG KN T G S FRV AD A L A T L G FD Y P RRAG- - - - - - - - - - - - F FQK E L V E L L K L A K E EGGD V FA FK

G S FAGAMGYG Q FMP S SYKQY A VD F SGDGH I N LW- D PVD A I G SV AN Y F - K A HGWV KGDQV A VMANGQA PG L PN - - - - G FK T - - K Y S I SQ L A A AG L T PQQP L GNHQQA S L L R L D VGT G- YQY

G SYAGAMGYG Q FMP S S FT K Y A VD FDGDGH I D LW- N PRD A I G SV AN Y F - KQ HGWV SGD RV A V PA SGRA P S L ED - - - - G FK T - - L Y P L D V L A SAG L R PQGP L GGH RQA S L L R L DMGRN - YQY

G SYAGAMG L P Q FMP S S FRA Y A VD FDGDGH I N I WSD PT D A I G SV A SY F - KQ HGWV T GE PV V SV A E I ND E SA E SA V T RGVD P - - TM S L GE L R A RGWRT HD A L RDDQK V T AMR FVGD KG- I E Y

G SYAGAMGMG Q FMP S SYRQ F GVDGD ADGK R N L FT D YND V F A S I AN Y FV K K GGWV RGGQV A V PA T L - A AGH E E FN PT DWSP - - V YT L SE L S A RGYH P SA PV V AG ST A T P I S L DD ANG- KQY

G SYAGAMGMG Q FMP S SY L D Y A VDGNGDGRR D L FN SYDD V F S S I AN Y FV K K GGWV RGGQV A V PA T L - A PGR E E FN PT EWMP - - TWS L AD L A QRGYQP ST PV QPGA T A T P I T L EG ST G- KQY

G SYAGAMGMP Q FMP S SYRKW A VD YDGDGH R D I WGN VGD V A A SV AN YM- KQ HGWRT GGKM L V SA T L - A PGA D VQA I I GEK T A L T RT V AD L K A YG I I PGET L ADD EK A V L FK L ET A PGV F E Y

WYG L PN F YT I T R YNH ST H YA MA VWQ L GQA V - - - - - - A L A R VQ

WYG L PN F YV I T R YNH ST H YA MA VWE L GK EV D RV RH R SV V R QD

WVG L PN F YV I T R YN R SAMYA MA V YQ L AGE I A RA RG- - - - - AH

WL G FQN F YA I T R YN I SKMYA MA V FQ L SEA I AGK E - - - - L P PA

WL G FQN Y YA I T R YN L SKMYA MA V FQ L SQA I AGQE - - - - L P PA

Y L G L NN F YT V WQYNH SRMYV T A V RD I AN S L GG- - - - - - - P G L



1 50 100 150 200 250 300 350 379XAC_RS03435 (MltB1)

MltB (ECK2696)

MltB (PA4444)

SltB1 (PA4001)

MltB1 (Smlt4052)

LtgD (NGO0626)

1 50 100 150 200 250 300 361

1 50 100 150 200 250 300 367

1 50 100 150 200 250 300 340

1 50 100 150 200 250 300 350 381

1 50 100 150 200 250 300 363

Transglycosylase SLT domain 2 - SLT_2 (IPR031304)

M I MP SR - - L L R L T - - L GV SV CV A A T SV A A - - - - - - - - - - - - QA I A P ET T A S SA T D AGGQQ QD PA - - - - - - - PT A S F EQWL AD FRQRA L A A G I GA T T L DN A L AGV T PD PA V H E L DQRQP E F

M I MP SR - - L L R L T - - L GV SV CV A A T SV A A - - - - - - - - - - - - QA I A P ET T A S SA T D AGGQQ QD PA - - - - - - - PT S S F EQWL AD FRQRA L A A G I GA T T L DN A L AGV T PD PA V H E L DQRQP E F

MRN P ER SA L L K V SG L L G ST V V AMG L G L S SA CAQKN PT V E Y NQPA A P L QT K A P F SGAGPA A SV PAGA PN EA QPGQ S F EQWR D A FRQQA L AG G I D AQT FD RA FAGVQPD PA V V EAD R SQP E F

MR - - - - - - - - - - S L L L S S L A L L PA L A L AQ- - - - - - - - - - - - - - - - PD A S S F P S- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - C L AG L QK K AQAQ G I SAD SY ER F T SG L QAD L SV L D L L D AQP E F

MP - - - - - - - - - - - - I L T T L G L A A A L A SA - - - - - - - - - - - - - - - - - PT A PA A PAGD I D P - - - - - - - - - - - - - - - - A F SRC L SG L QA T A V T Q G I SPD R FN A I T AG L T PD P SV L G L L D AQP E F

T QY LWD Y L D A RV T P SA I QEG QQ L L I SQH A - L F EK L RQH YG VD PG I L T A I W SME SGYGKQ I GD F YV I R S L A T L AH EGRRT T YGN T Q L L A A L Q I L QT EK S I D R SQ L VG SWAG AMGQT Q F I P S

T QY LWD Y L D A RV T P SA I QEG QQ L L I SQH A - L F EK L RQH YG VD PG I L T A I W SME SGYGKQ I GD F YV I R S L A T L AH EGRRT T YGN T Q L L A A L Q I L QT EK S I D R SQ L VG SWAG AMGQT Q F I P S

T R PVWK Y L EG A L D P L RV RQG QA R L - AQH A R I L GEVD A R YA VD AD A V V A I W GME SN YG SHM GN KN V I R S L A T L A Y EGRR P E FAH AQ L L A A L K I L Q- HGD V P A S FM I G SWAG AMGQT Q F I PT

T T P LWD Y L AG L VD EQRV SDG K AM L - AQHD K L L DQV A A R YG VD K YT V V A VW GV E SD YGR I F GK R P L L T S L S T L SC YGRRQ S F FQGE F L A T L K L L Q- AGD I R D AG I T G SWAG A FGH T Q FMP S

T T P I WD Y L A A L VD RQRV ADG RA L L - QQH RD L L D RV SAQYG VD PA T I V A VW GV E SD YGRV F GK R P L L Q S L A T L SCAGRRQP F FRGE L L A L L K L I D - RGD L Q AQG L T G SWAG A FGH T Q FMP S

T YRD YA VD ED GDQK RD VWN S K AD A L G SA AN Y L KQNNWT SA V PWGQEVQ L S AG FD YAQAD L T I K K T V A EWQ R L GV A PRR - - P I A PA - - L AQ Q L A SV L L PT G YRGPA F L V FD N FR S I L R YNN

T YRD YA VD ED GDQK RD VWN S K AD A L G SA AN Y L KQNNWT SA V PWGQEVQ L S AG FD YAQAD L T I K K T V A EWQ R L GV A PRR - - P I A PA - - L AQ Q L A SV L L PT G YRGPA F L V FD N FR S I L R YNN

T HNQYA VD FD GDGK RD I WG S PGD A L A ST AN Y L K A SGW I AG QPWG F EV R L P AG FD Y S L A E L T I RK P L GEWQ GMGVQGVNGG P L P SG- - L SG EQA S L L L PAG H RGPA F L V L H N FRA I L K YNN

T YA R I A VD FD GDGRRD L VG S V PD A L G ST AN Y L K K AGWRT G QPWGY EV K V P AD F PA S L AGR GK RQP L SAWV A RGV RRVDGQ P L - PGG- - - D EK A A I L L PAG AQGPA F L V YR N YD A I Y SYN A

T YA R I A VDGD GDGRRD L VG S I PD A L A ST AN Y L K RAGWR SG E PWGMEV RV P AG FN A SQAGR T QRRA L ADWR AQGV T A L DG S V L A PAN L PAD A RA A L L L PAG N KGPA L L V FR N YD A I Y SYN A

ST A YA L A VG L L ADGYAGRAG V KQPWPKDD P P L N ST AQ I T E L QQR L T D KG F D VGG I DGV L G AQT RQG I RA F QR SQQ L - PQD GYA ST S L L A R L R - - - - - - - - - - - - - - - - A A

ST A YA L A VG L L ADGYAGRAG V KQPWPKDD P P L N ST AQ I T E L QQR L T D KG F D VGG I DGV L G AQT RQG I RA F QR SQQ L - PQD GYA ST S L L A R L R - - - - - - - - - - - - - - - - A P

S SA YA L A VG L L AD S FKGGGR I VGAWP L ED V P L SR SQR I - E L QRQ L A A RGH D PGA VDG I I G AN T RK A I RA C QQE FGW- PAD GY PT PA L L D R L R - - - - - - - - - - - - - - - - T P

A E SYA L A I A L L SD R L RGG SG L V A SWPT DD P G I SR L ER - KQ L QK A L L A RGY D I GEADG L I G T ST RK A I QA E QK R L G L T PAD GRAGRK I L EA L KG- - - - - - - - - - - - - - AQP

A E SYA L A I A T L ADQ L RGGNG L A T AWPT DD P G L GRD ER - RQ L QT L L L A RGH D I GA ADGM I G T A T RRA I QA E QQR L GWSEVD GRAGQR I L RT L QE EA T A I A P AGQK A L PA A R

Family 3B - Alignment

Family 3B - Domain architecture

XAC_RS16355 (MltB2)

XAC_RS22275 (MltB2)

SltB2 (PA1171)

SltB3 (PA3992)

MltB2 (Smlt4650)

1 50 100 150 200 250 300 350 400 425

1 50 100 150 200 250 300 350 400 425

1 50 100 150 200 250 300 350 398

1 50 100 150 200 250 300 350 400 448

1 50 100 150 200 250 300 350 422


Peptidoglycan binding-like (IPR002477)

MGV A V T GK RG C L A V L GT V V L L V A L L A I A A V V AWRH Y - - L H FAD T PV PA SA P SV V - I A PGD S L K A T L RK L R A AG L AQGT E L - EWQ L L A RQV D A AGK - L K VG E YA L SPA L SP R E L L T RMRQG

MAGA - - - K RG C L FV V T L V V V L GA V - - V AGV GAWF F YQQT R FAD A P I T PT A E SMV - I A SGD GMN SV L RK L R D AGVD EGQD T - QWQ L L A RQ L D A AGK - L K VG E YA L SGD L T P R E L L L RMRAG

M- - - - - - - RK L L V L L E SG L L FVG L - - CVG L A AW- - - QQQR A L EQP L Q L T E ER L L D V S SG S T PGGM L A R L E QEK V L HGA F - - - WL R L YWR F N L PGQA L H SG E YR L L PGMKG AD L L E LWR EG

M- - - - - - K K V L L I I L - - - L L L V V L G I A AGV GVW- - - K V RH L AD SK L L I K E ET I FT L K PGT GR L A L GEQ L Y AD K I I N R PRV FQWL L - - - R I E PD L SH FK AG T YR FT PQMT V R EM L K L L E SG

RV I QYR FT I V EGWN FRQ L RA A L A T A T P L QH S I D A L DD A A L MA R L GV A R - Q H P EGR F L P ET YV YQRGD SD I D V L K RAH A AM D K A L AQAWEQ RA PN L P L A SP EQA L I L A S I I EK ET A L A SER

K V L QH RV T I V EGWN I RQ L RA A L K RA E P L L H T T DN L DD A A L MQR L G FGG- Q H P EGR F L P ET YV YQRGD SD L D V L K RAH A AM EK A L D EAWE S RA PD L P I N T P Y E L L TMA S I I EK ET A L A SER

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K EAQ F P L R L V EGMR L SD Y L K Q L R EA P Y I KH T L SDD K YA T V AQA L E L EN P E W I EGWFWPD T WMYT AN T T D V A L L K RAH K KM V K A VD SAWEG RADG L P YKD K NQ L V TMA S I I EK ET A V A SER

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Endolytic murein transglycosylase (IPR003770) / YceG (PF02618)

MltG (ECK1083)

MltG (PA2963)

MltG (Smlt1034)

1 50 100 150 200 250 300 340

1 50 100 150 200 250 300 349

1 50 100 150 200 250 300 353

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XAC_RS03440 (RlpA)

RlpA (ECK0626)

RlpA (PA4000)

RlpA (Smlt4051)

RlpA (NGO1728)

1 50 100 150 200 250 300 350 400 450 475

1 50 100 150 200 250 300 362

1 50 100 150 200 250 300 342

1 50 100 150 200 250 300 350 422

1 50 100 150 200 228

Sporulation-like domain - SPOR (IPR007730)

Lytic transglycosylase MltA, domain B (IPR005300) / DPBB_1 (PF03330)

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XAC_RS21660 (unknown) - Alignment against Family 3B

XAC_RS21660 - Domain architecture

1 100 200 300 400 500 600 720XAC_RS21660

related to Family 3B


Peptidoglycan binding-like (IPR002477) Glycoside hydrolase-type carbohydrate-binding (IPR014718)

Excluding Xanthomonadales

OnlyXanthomonadales

XAC_RS15470 (MtgA)

XAC_RS15470 (MtgA)1 50 100 150 200 246

Biosynthetic peptidoglycan transglycosylase (IPR011812)

UniProt Reviewed - Q8PI51 - Peptidoglycan polymerase that catalyzes glycan chain elongation from lipid-linked precursors.

family 1a - alignment · 2018. 12. 18. · d srwqyfear - laektgaaa aaqpl yraaa qs- pt fhgf l...

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