1

EVALUACIÓN DIAGNÓSTICA DE LA CASUÍSTICA DE ENFERMEDADES AVIARES

EN TRES LABORATORIOS DEL ICA EN EL PERIODO 2009 - 2011

ALEXANDER SOTO PATARROYO

Trabajo de Investigación para optar al Título de Magíster en Ciencias Pecuarias

con Énfasis en Avicultura

Director

NÉSTOR ALFONSO MOSSOS CAMPOS

Phd. En Microbiología Aviar

Codirector

DIEGO ORTIZ ORTEGA

Phd. En Ciencias Salud Animal y Producción

UNIVERSIDAD DEL TOLIMA

FACULTAD DE MEDICINA VETERINARIA Y ZOOTECNIA

MAESTRÍA EN CIENCIAS PECUARIAS

IBAGUÉ- TOLIMA

2013

2

3

RESUMEN

Con el objeto de sistematizar la información de la casuística aviar contenida en las

tablas de retención documental de los laboratorios de las ciudades de Ibagué, Tuluá y

Bogotá del Instituto Colombiano Agropecuario – ICA, se consolidó dicha información en

una base de datos en formato de hoja de cálculo electrónica y se sometió a procesos

de gestión masiva a través delos software estadísticos XLSTAT; Epidemiológico, EPI-

INFO y de mapeo y análisis de datos geoFiguras, DIVA-GIS. El análisis descriptivo de

la recopilación de información de la vigilancia pasiva arrojó información de frecuencias

y proporciones que indican la imperiosa necesidad de rediseñar y socializar el

diligenciamiento del Formulario Único de recepción de Muestras, haciendo estricta su

elaboración si se instaura el procedimiento virtual.

Los tipos de muestras que se envían al laboratorio son la base para el diagnóstico

concluyente de los casos, por lo tanto la socialización de los protocolos de recolección

y envío debe garantizar que estas lleguen en óptimas condiciones para el sometimiento

a las pruebas. La información recopilada por los laboratorios es muy valiosa y puede

ser procesada fácilmente con potentes sistemas de análisis que permitirían, como lo

sugieren los resultados del presente estudio, el apoyo en la toma de decisiones en

programas de control de las enfermedades de las aves y servir como modelo para las

actividades con otras especies de interés zootécnico.

Palabras Claves: Casuística, epidemiología, vigilancia pasiva.

4

ABSTRACT

In order to systematize all the information collected on the poultry diagnosis kept on

tables of documental retention from the laboratories of the Instituto Colombiano

Agropecuario – ICA, from Ibagué, Tuluá and Bogotá, the information was consolidated

on a electronic data base and in a worksheet format and subjected to mass

management processes of through the statistic software XLSTAT, Epidemiologic; EPI-

INFO, mapping and geographical data analysis, DIVA-GIS. The descriptive analysis of

the collected information yielded the frequencies and the proportions on the passive

surveillance systems that indicate an urgent need to redesign construct and socialize a

new data collection format to replace the Single Form of the Sample Reception

Construction of this tool is necessary to launch the online data filing processing system.

The types of samples that are sent to the laboratories are the most important clue for a

conclusive diagnosis of the cases, hence socializing of the delivery collection protocols

should ensure that they reach optimal conditions to be submitted to analyze. The

information collected by the laboratories is very valuable and can be processed easily

with powerful analysis systems that would allow, as the results of the present study

suggests, the support needed for a of decision´s making in the control programs of

poultry diseases and could be a useful model to be followed with other animal species

of commercial interest.

Key Words: Casuistry, Epidemiology, Passive Surveillance.

5

CONTENIDO

Pág.

INTRODUCCIÓN

15

1. MARCO TEÓRICO 17

1.1 ANTECEDENTES 21

1.2 TÉCNICAS DIAGNOSTICAS DE LABORATORIO 23

1.3 HISTOPATOLOGÍA 27

1.4 CULTIVOS BACTERIOLÓGICOS 28

1.5 ENFERMEDADES AVIARES DE CONTROL OFICIAL COLOMBIANO 28

1.5.1 Newcastle– Enc. 28

1.5.2 Influenza Aviar – I.A. 33

1.5.3 Salmonelosis

37

2. MATERIALES Y MÉTODOS

41

3. RESULTADOS Y DISCUSIÓN. 43

3.1 ESTADÍSTICA DESCRIPTIVA 43

3.1.1 Recepción de casos 43

3.1.2 Fecha de Ingreso 44

3.1.3 Identificación de usuarios 45

3.1.4 Ubicación geográfica 47

3.1.5 Motivo de solicitud 48

3.1.6 Tipo de explotación avícola 50

3.1.7 Síntomas. 51

3.1.8 Necropsias 54

3.1.9 Diagnóstico Presuntivo 56

3.1.10 Vacunas 62

6

Pág.

3.1.11 Muestras 68

3.1.12 Sexo y edad de las muestras. 70

3.1.13 Sueros 70

3.2 TEJIDOS 74

3.3 POLLITO 79

3.4 HISOPO CLOACAL. 81

3.5 HISOPO TRAQUEAL 85

3.6 AVE 92

3.7 HECES 96

3.8 LABORATORIO DE ENVÍO 98

3.9 TRATAMIENTO 99

3.10 POBLACIÓN 99

3.11 PRUEBAS DE LABORATORIO 100

3.12 NEWCASTLE –ENC 101

3.13 BRONQUITIS INFECCIOSA AVIAR – IBV 102

3.14 LARINGOTRAQUEITIS INFECCIOSA AVIAR – ILT 103

3.15 GUMBORO – BURSITIS INFECCIOSA AVIAR – IBD 104

3.16 INFLUENZA AVIAR – IA 105

3.17 MYCOPLASMA 108

3.18 SALMONELLA 109

3.19 PASTEURELLA 111

3.20 AEMOPHILUS GALLINARUM – CORIZA 112

3.21 E. COLI 113

3.22 ASPERGILLUS 115

3.23 ANTIBIOGRAMA 116

3.24 PARASITOLOGÍA 117

3.25 HISTOPATOLOGÍA 118

3.26 ESTADÍSTICA ANALÍTICA 120

3.27 NEWCASTLE – ENC 121

7

Pág.

3.28 BRONQUITIS INFECCIOSA - IBV 127

3.29 GUMBORO 129

3.30 LARINGOTRAQUEITIS INFECCIOSA – ILT

131

4. CONCLUSIONES Y RECOMENDACIONES

145

REFERENCIAS

149

ANEXOS 157

8

LISTA DE TABLAS

Pág.

Tabla 1. Relación del ingreso de casos a los LNDV- ICA 43

Tabla 2. Descripción del ingreso de casos por trimestre a los LND – ICA. 44

Tabla 3. Identificación del tipo de usuarios de los LDV – ICA. 45

Tabla 4. Relación de los departamentos de origen de los casos. 47

Tabla 5. Descripción del motivo de solicitud. 49

Tabla 6. Tipos de explotación que hicieron uso de los LDV – ICA. 50

Tabla 7. Presencia de síntomas de los casos recibidos en los LND – ICA. 51

Tabla 8. Presencia de síntomas por tipo de sistema afectado. 52

Tabla 9. Combinaciones de sintomatología por sistemas. 53

Tabla 10. Realización de necropsias en los casos enviados a los LDV – ICA. 55

Tabla 11. Presencia de lesiones por sistema afectado. 56

Tabla 12. Diagnósticos presuntivos de los casos recibidos en los LDV – ICA. 57

Tabla 13. Reporte de ENC como diagnóstico presuntivo. 61

Tabla 14. Aplicación de vacunas en explotación de engorde. 63

Tabla 15. Descripción del tipo de vacuna para la explotación postura en etapa

de levante.

64

Tabla 16. Descripción del tipo de vacuna para la explotación Postura en

etapa de producción.

65

Tabla 17. Aplicación de vacunas en explotación de reproductoras. 66

Tabla 18. Descripción del tipo de vacuna para el traspatio. 67

Tabla 19. Descripción del tipo de vacuna para otras especies. 67

Tabla 20. Combinaciones de los tipos de muestras enviadas a los LDV – ICA. 68

Tabla 21. Relación del sexo en las muestras de suero sanguíneo. 70

Tabla 22. Descripción de edades en las muestras de sueros. 71

Tabla 23. Intervalos para la edad en días del suero sanguíneo. 73

Tabla 24. Intervalos para la edad en semanas del suero sanguíneo. 74

9

Pág.

Tabla 25. Relación del sexo en las muestras de tejidos. 74

Tabla 26. Descripción de edades en las muestras de sueros. 75

Tabla 27. Intervalos para la edad en días de tejidos. 77

Tabla 28. Intervalos para la edad en semanas de tejidos. 77

Tabla 29. Descripción de edades en las muestras de tejidos. 78

Tabla 30. Relación del sexo en las muestras de pollitos. 79

Tabla 31. Descripción de edades en las muestras de pollito. 80

Tabla 32. Intervalos para la edad en días de pollitos. 80

Tabla 33. Relación del sexo en las muestras de hisopo cloacal. 82

Tabla 34. Descripción de edades en las muestras de hisopos cloacales. 82

Tabla 35. Intervalos para la edad en días de hisopo cloacal. 84

Tabla 36. Descripción de edades en las muestras de hisopos cloacales. 84

Tabla 37. Relación del sexo en las muestras de hisopo traqueal. 85

Tabla 38. Descripción de edades en las muestras de hisopos traqueales. 86

Tabla 39. Intervalos para la edad en semanas de hisopo traqueal. 86

Tabla 40. Descripción de edades en las muestras de hisopos cloacales. 87

Tabla 41. Relación del sexo en las muestras de ave. 89

Tabla 42. Descripción de edades en las muestras de ave. 89

Tabla 43. Intervalos para la edad en días de ave. 91

Tabla 44. Intervalos para la edad en semanas de ave. 91

Tabla 45. Relación del sexo en las muestras de heces. 92

Tabla 46. Descripción de edades en las muestras de heces. 93

Tabla 47. Intervalos para la edad en semanas para heces. 94

Tabla 48. Descripción de edades en las muestras de heces. 95

Tabla 49. Participación de los departamentos en el ingreso de casos a los

LDV – ICA.

96

Tabla 50. Implementación de tratamientos. 98

Tabla 51. Reporte de población total de los lugares de procedencia. 99

Tabla 52. Intervalos de la población total. 100

10

Pág.

Tabla 53. Laboratorios y pruebas realizadas para ENC. 101

Tabla 54. Resultados de las pruebas realizadas para ENC. 102

Tabla 55. Laboratorios y pruebas realizadas para IBV. 103

Tabla 56. Resultados de las pruebas realizadas para IBV. 103

Tabla 57. Laboratorios y pruebas realizadas para ILT. 104

Tabla 58. Resultados de las pruebas realizadas para ILT. 105

Tabla 59. Laboratorios y pruebas realizadas para Gumboro. 106

Tabla 60. Resultados de las pruebas realizadas para Gumboro. 106

Tabla 61. Laboratorios y pruebas realizadas para Influenza. 107

Tabla 62. Resultados de las pruebas realizadas para Influenza. 107

Tabla 63. Laboratorios y pruebas realizadas para Micoplasma. 108

Tabla 64. Resultados de las pruebas realizadas para Micoplasma. 109

Tabla 65. Laboratorios y pruebas realizadas para Salmonella. 110

Tabla 66. Resultados de las pruebas realizadas para Salmonella. 110

Tabla 67. Laboratorios y pruebas realizadas para Pasteurella. 111

Tabla 68. Resultados de las pruebas realizadas para Pasteurella. 112

Tabla 69. Laboratorios y pruebas realizadas para Haemophilus. 112

Tabla 70. Resultados de las pruebas realizadas para Haemophilus. 113

Tabla 71. Laboratorios y pruebas realizadas para E. Coli. 114

Tabla 72. Resultados de las pruebas realizadas para E. Coli. 114

Tabla 73. Laboratorios y pruebas realizadas paraAspergillus. 115

Tabla 74. Resultados de las pruebas realizadas para Aspergillus. 116

Tabla 75. Relación de antibiogramas realizados en los LDV – ICA. 116

Tabla 76. Laboratorios y pruebas realizadas para parasitología. 117

Tabla 77. Resultados de las pruebas realizadas para parasitología. 118

Tabla 78. Realización de estudios de histopatología. 119

Tabla 79. Resumen de valores de las tablas de contingencia para virología

ENC

121

11

Pág.

Tabla 80. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a

las pruebas virológicas para ENC en función de sus resultados

122

Tabla 81. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a

las pruebas virológicas para ENC en función de sus resultados excluyendo el

suero

123

Tabla 82. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas

Moleculares ENC

124

Tabla 83. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a

las pruebas moleculares para ENC en función de sus resultados

125

Tabla 84. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas

Serológicas ENC

126

Tabla 85. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a

las pruebas serológicas para ENC en función de sus resultados.

126

Tabla 86. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas

Moleculares IBV

127

Tabla 87. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas

Serológicas IBV

128

Tabla 88. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a

las pruebas serológicos para IBV en función de sus resultados

129

Tabla 89.Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas

Moleculares Gumboro

130

Tabla 90. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas

Moleculares Gumboro

130

Tabla 91.Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas

Virológicas ILT.

131

Tabla 92. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas

Moleculares ILT.

132

Tabla 93. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas

Serológicas ILT

132

12

Pág.

Tabla 94. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a

las pruebas serológicos para ILT en función de sus resultados.

133

Tabla 95. Resumen de valores de las tablas de contingencia para cultivo

bacteriológico de Salmonella

134

Tabla 96. Resumen de valores de las tablas de contingencia para cultivo

bacteriológico de Salmonella

134

13

LISTA DE FIGURAS

Pág.

Figura 1. Proceso diagnóstico de la enfermedad de Newcastle en LNDV 30

Figura 2. Diagnósticos presuntivos de los casos recibidos en los LDV – ICA 60

Figura 3. Porcentaje de aplicación de vacunas para la explotación de

engorde.

62

Figura 4. Distribución de la edad en semanas días para el suero sanguíneo 72

Figura 5. Distribución de la edad en para el suero sanguíneo 73

Figura 6. Distribución de la edad en semanas días para tejidos. 76

Figura 7. Distribución de la edad en semanas para tejidos 76

Figura 8. Distribución de la edad en semanas para tejidos. 78

Figura 9. Distribución de la edad en semanas para pollito. 81

Figura 10. Distribución de la edad en semanas días para hisopo cloacal 83

Figura 11. Distribución de la edad en para hisopo cloacal. 83

Figura 12. Distribución de la edad en semanas para hisopo cloacal 85

Figura 13. Distribución de la edad en días para hisopo traqueal. 87

Figura 14. Distribución de la edad en semanas para hisopo traqueal 88

Figura 15. Distribución de la edad en días para ave 90

Figura 16. Distribución de la edad en semanas para ave. 90

Figura 17. Distribución de la edad en días para heces. 93

Figura 18. Distribución de la edad en semanas para heces. 94

Figura 19. Distribución de la edad en semanas para heces. 95

Figura 20. Porcentaje de muestras procesadas por LDV – ICA. 97

Figura 21. Distribución de la población total de aves. 99

Figura 22. Lesiones encontradas en la histopatología. 119

Figura 23. Distribución de los Resultados positivos a ENC en las pruebas de

virología, moleculares y serológicas

135

14

Pág.

Figura 24. Distribución de los Resultados positivos a IBV en las pruebas

moleculares y serológicas.

136

Figura 25. Distribución de los Resultados positivos a ILT en las pruebas de

virología, moleculares y serológicas.

137

Figura 26. Distribución de los Resultados positivos a Gumboro en las pruebas

moleculares y serológicas.

138

Figura 27. Distribución de los resultados positivos al cultivo bacteriológico de

Salmonella.

139

Figura 28. Distribución de los resultados positivos al cultivo bacteriológico de

E. Coli.

140

Figura 29. Predicción del riesgo a ENC por pruebas virológicas. 142

Figura 30. Predicción del riesgo a ENC por pruebas moleculares. 143

Figura 31. Predicción del riesgo a ENC por pruebas serológicas. 144

15

INTRODUCCIÓN

El gobierno nacional reestructuró el Instituto Colombiano Agropecuario - ICA en 1994 y

desde entonces le adjudicó la responsabilidad exclusiva de conservar la sanidad animal

y vegetal entre otras funciones específicas Olarte, (2009) como producto de dicha

reestructuración el sistema de información y vigilancia epidemiológica aviar del ICA ha

compartido con las demás especies animales dos subsistemas generales: la vigilancia

epidemiológica activa que se encarga de buscar la presencia o no de enfermedades

declaradas de control oficial a través de muestreo programado y la vigilancia

epidemiológica pasiva que realiza acciones de control de una problemática sanitaria a

través de la notificación de signos clínicos.

Este documento muestra un análisis de los datos epidemiológicos obtenidos durante el

ingreso de muestras para diagnóstico de enfermedades aviares en tres de los

Laboratorios de Diagnóstico Veterinario (LDV) del ICA, que incluyeron los Laboratorios

de Bogotá, Tuluá e Ibagué. Los datos fueron extraídos de los Formularios Únicos de

Recepción de Muestras (FURM) o forma 3-877 (Anexo A).

El ICA cuenta con 25 laboratorios de diagnóstico veterinario, procesa muestras para el

diagnóstico de diversas enfermedades y presta dicho servicio a la comunidad. Aunque

los programas de vigilancia del ICA son coordinados por parte de la oficina de

epidemiologia, el gran volumen de información obtenida a través de la vigilancia pasiva

requiere mayor atención en su análisis y es de gran importancia para obtener índices

del comportamiento de las enfermedades y así establecer un punto de partida que

permita conocer el estado sanitario de las aves y establecer posibles inferencias del

orden nacional. Todo dirigido al establecimiento de nuevas estrategias de control de las

enfermedades de importancia zootécnica y/o de interés público.

A través del procesamiento de datos masivos depositados en bases de datos creadas

en hojas de cálculo por software específico, se obtuvieron resultados de tipo

16

descriptivo, analítico y de mapeo o distribución geográfica. Así, se presentan las cifras

epidemiológicas básicas y se intenta revelar posibles asociaciones entre variables

como el Tipo de Muestra y el Tipo de enfermedad. En esta última categoría fueron

escogidas las variables Newcastle, Bronquitis infecciosa, Laringotraqueitis, Gumboro,

Salmonella y E. Coli.

En varios de los procesos del análisis fue necesario filtrar la base de datos para

obtener datos más confiables para el procesamiento. Se encontró que en el

diligenciamiento del FURM hay ausencia de una gran cantidad de datos valiosos,

necesarios para alimentar el software y para aumentar la significancia estadística en los

resultados de asociación y en la potencia de las conclusiones. Se concluye que la baja

captura de información por parte de los funcionarios en los ítems del formato reduce la

contundencia de los resultados, por lo tanto se sugiere rediseñar el FURM y capacitar a

los responsables del diligenciamiento pues este proceso es rutina laboral de los

laboratorios lo cual constituye el pilar fundamental para dar respuesta a hipótesis o

preguntas científicas y sustentar programas de control sanitario a todo nivel.

17

1. MARCO TEÓRICO

El documento 3468 del Consejo Nacional de Política Económica y Social CONPES,

(2007) describe el panorama sanitario del sector avícola colombiano y deja en

perspectiva la necesidad de conocer el estado real de las enfermedades con o sin

control oficial y el presupuesto con el cual se debe intervenir la cadena avícola. Todos

los gremios vinculados al desarrollo de la avicultura buscan mejores parámetros

sanitarios que permitan proyectar la industria hacia nuevos mercados en el marco de

una estrategia global para el abastecimiento de alimento para la población humana.

Estos parámetros no han sido publicados en algún estudio que indique la verdadera

situación sanitaria aviar del país respecto a los agentes patógenos en general o la

identificación de los factores de riesgo y sus posibles asociaciones con la presencia de

enfermedad, por lo tanto, la cuantificación y priorización permitiría generar estrategias

más efectivas para prevenir o mitigar la presencia de las enfermedades aviares.

La vigilancia y control epidemiológico de las enfermedades aviares por parte del ICA ha

combinado coherentemente planificación y ejecución con recursos financieros

limitados. La meta, lograr los objetivos institucionales en las fechas establecidas

Congreso de la Republica, (2008) obteniendo puntos de referencia con datos confiables

que permitan formular las estrategias efectivas para conseguirlos.

La toma de decisiones para elaborar o re-direccionar los programas de salud animal de

índole nacional debe basarse en datos verídicos. El Plan Estratégico para el Nuevo ICA

2007 – 2012 sugiere en el proyecto 1.1, integrar los LNDV con el sistema de Medidas

Sanitarias y Fitosanitarias para apoyar los programas sanitarios y el comercio

internacional.

En la Resolución 1762 de 15 de Junio de 2012 Instituto Colombiano Agropecuario,

(2012), se fija el plazo para que todos los laboratorios de diagnóstico veterinario

particulares en el país se registren ante el ICA. Con los datos que ellos aporten

18

Resolución 1599, Parágrafo del Artículo 15 se enriquecerá la base de datos para

establecer un perfil de la realidad sanitaria animal colombiana. Una vez procesados y

obtenidas las frecuencias y otros parámetros, se podrán diseñar mapas

epidemiológicos dinámicos e identificar cuáles son los agentes patógenos que afectan

por zonas la distribución pecuaria nacional y establecer posibles inferencias que

permitan un nuevo direccionamiento de las medidas de control de las enfermedades

que resulten de importancia zootécnica o de interés público.

En las resoluciones ICA, 1937 y 3655 se define la ejecución de los

proyectos de erradicación de la enfermedad de Newcastle (ENC) e

incluyen la vigilancia activa para la prevención de la aparición de la

Influenza aviar (IA) y preservar el estatus sanitario de país libre. La

Enfermedad de Newcastle aparece en la lista de la OIE para ser

reportada en su presentación de alta patogenicidad y su diagnóstico es

óptimo (Perozo, 2008, p. 161).

En Colombia se han diagnosticado otras enfermedades aviares de gran impacto

económico como Salmonelosis, Bronquitis Infecciosa, Neumovirus, y Micoplasma.

Reportes de la presencia de Laringotraqueitis Infecciosa en el Valle de Cauca Villate, et

al., (1971) en la década del setenta no ha tenido seguimiento, al menos publicado,

encontrando resultados de laboratorio positivos arrojados por el LNDV del ICA.

Todos los países en América Latina tienen en sus organigramas estatales una entidad

encargada de la sanidad animal, responsable de fijar políticas referentes a vencer las

barreras sanitarias reguladas por la OIE y la Organización mundial del Comercio- OMS

para en última instancia, fortalecer el mercadeo de productos de origen animal. En el

Brasil esta entidad hace parte del Ministerio de Agricultura, Pecuaria y Abastecimiento -

MAPA. Allí se ha elaborado un manual de legislación muy completo en el cual se

fundamenta el programa nacional de salud animal en detalladas normas técnicas de

vigilancia para las enfermedades de Newcastle e Influenza Aviar. Es una impecable

guía digna de emular en los países latinoamericanos teniendo en cuenta los resultados

19

recientes de la industria avícola brasilera que coloca a este país como el primer

exportador mundial de aves comerciales de consumo. Mapa, (2009). Aunque cuenta

con los Laboratorios Nacionales Agropecuarios – LANAGROS, se apoya en una red de

laboratorios de diagnóstico conformada por entidades privadas acreditadas para

realizar pruebas específicas que cada uno de ellos certifica ante el MAPA y son

responsables de expedir resultados oficiales. En el año 2003 este país fue declarado

libre del virus de la enfermedad de Newcastle velogénico en granjas comerciales. Entre

los años 2003 y 2005 se realizó un estudio para verificar el estatus adquirido

determinando el muestreo (por región) utilizando la fórmula:

[ ( )

] ⌈

⌉

Donde C, es el grado de confianza, M es el número de aves (en condición

de riesgo), N es el número de animales infectados y SENS es el grado de

sensibilidad de la prueba escogida que para este estudio fue un kit de

ELISA comercial. Con esta fórmula, los mismos investigadores concluyen

en otro estudio paralelo que determinar la prevalencia de la enfermedad

(entre tres regiones avícolas evaluadas) está condicionado por la

densidad animal, la proximidad de aves de otras especies y sistemas de

producción de escasa bioseguridad. (Orsi & col, 2010, p. 41).

El Servicio Nacional de Sanidad Agraria- SENASA es la oficina del Ministerio de

Agricultura en el Perú, encargada de controlar y difundir la política del sector. En su

página web detallan el sistema de vigilancia epidemiológica donde como estrategia,

habilitan una línea telefónica gratuita para la notificación (vigilancia pasiva) de las

enfermedades y enfocan sus esfuerzos en el control de la movilización de los animales.

Senasa, (2012). Sin embargo, dado el gran número de enfermedades de notificación

obligatoria (19 en aves) y un único laboratorio de diagnóstico, hace difícil la tarea para

garantizar resultados oportunos y por lo tanto un panorama real de su estatus

zoosanitario.

20

En Chile, la enfermedad de Newcastle es considerada exótica según el

programa de vigilancia epidemiológica de ese país ejecutado por la

Secretaria Agrícola y Ganadera - SAG. Ministerio de Agricultura de Chile,

(2006). De su página web, se puede obtener un manual para el manejo

de las enfermedades aviares. El control vacunal para Newcastle es

sugerido pero están prohibidas la vacunas para la Influenza y se puede

observar el gran despliegue informativo para prevenir el ingreso de esta

enfermedad la cual tambien consideran exótica. La Salmonella y el

Micoplasma tienen un programa de control instaurado desde el año 2009

el cual divide en estratos (comercial y reproductoras), la inclusión e

identificación de patotipos definidos. En este país existe una estrategia de

recepción y registro de las muestras que ingresan, por organigrama, al

subdepartmento de laboratorios y estación de cuarentena pecuaria cuyo

objetivo es distribuirlas a las distintas unidades técnicas para su análisis,

asegurando la trazabilidad de la información. Esta dependencia genera

información valiosa para la división de proteción pecuaria. Estudios de

riesgo asociado al aumento de la prevalencia de la enfermedad de

Newcastle por la importacion de avestruces estuvieron apoyados en

pruebas de HI y ELISA para demostrar que los resultados de los análisis

por la sensibilidad de las pruebas, son bajos. El indice de confianza fue

estimado por la combinacion de las pruebas realizadas en distintas

etapas del proceso normal de la importacion de los animales. (Burbano,

Van Schaik, Erns, & Rojas, 2004, p.155)

Al ente ministerial en Mexico se le conoce con el nombre de Secretaría de

Agricultura, Ganaderia, Desarrollo Rural, Pesca y Alimentación –

SAGARPA. A esta dependencia del poder ejecutivo federal esta

subordinada la oficina del Sevicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y

Calidad Agroalimentaria – SENASICA. Las normas oficiales mejicanas

contemplan una amplia gama de procesos en la cadena de la industria

21

avícola, tales como la creación del Sistema de Vigilancia Epidemiológica

– SIVE, una dependencia de la Comisión México-Estados Unidos para la

prevención de la fiebre aftosa y otras enfermedades exóticas de los

animales (CPA), que ejecuta campañas contra las enfermedades

(Newcastle, Influenza y Salmonelosis en aves) y busca decalarar zonas

libres, integrar laboratorios en materia zoosanitaria y el transporte no sólo

de animales, sus productos y subproductos sino de los farmacos,

biológicos, quimicos y alimentos comprometidos en el proceso productivo.

(Sagarpa, 2008, p. 38).

Recientemente México ha puesto en marcha el Dispositivo Nacional de

Emergencia – DINESA para erradicar el brote de Influenza Aviar

diagnosticado del tipo AH7N3 en el estado de Jalisco Senasica, (2012).

Pruebas confirmatorias en 31 granjas predieron la alarma aun cuando

este patotipo no afecta la salud humana, el esfuerzo honesto es la mejor

herramienta para mostrar al mundo un compromiso de respuesta ante la

preocupante amenaza sustentada en la noticia lanzada por la OMS sobre

la creación de cinco mutaciones genéticas del virus AH5N1 en el Centro

Erasmus, Holanda. (Rivera, 2012). La detección temprana de

enfermedades exóticas para prevenir su establecimiento ha hecho la

diferencia para que no se vuelvan endémicas si se comparan los

resultados de USA, Chile, Japon, Corea del sur y Malasia con los de

Vietnam, China e Indonesia. (Jimenez, 2007, p.1)

1.1 ANTECEDENTES

Motivados por identificar los microorganismos y los mecanismos que tienen para

causar trastornos en el equilibrio fisiológico de las especies que atacan, se han

desarrollado técnicas de laboratorio con protocolos estandarizados para su diagnóstico.

22

En 1676 el comerciante holandés Leeuwanhoeck, observó a través de sus

lentespulidos pequeñas estructuras que podían moverse y las llamó animálculos.

Desde esa época, pasando por Pasteur, Koch, Rayer, Hesse y Petri, muchos son los

avances hasta llegar al aislamiento de la penicilina en plena mitad del siglo XX a cargo

de Florey y Chang. Pruebas bioquímicas han sido aplicadas en forma de test a medios

biológicos para identificar directa o indirectamente la presencia de microorganismos

tras interpretar una determinada reacción que generalmente consiste en la activación

de una vía metabólica a partir del uso o no de un sustrato incorporado en el medio de

cultivo.

La primera referencia sobre la existencia de los virus se debe al botánico ruso

Ivanovski (1892). El término virus fue acuñado por el microbiólogo holandés Martinus

Beijerinck. En la década del 30 del siglo pasado, el uso de filtros de tamaño de poro

inferior y las técnicas de cultivo celular in vitro, permitió la obtención de gran variedad

de estos agentes. Con la ultra-centrifugación y finalmente con el microscopio

electrónico y la difracción de rayos X se logra por fin visualizar a los virus. La técnica

más revolucionaria en este campo ha sido sin duda la reacción en cadena de la

polimerasa conocida como PCR por sus siglas en inglés, desarrollada por Mullis (1986)

por la cual le fue otorgado el Nobel de química.

El avance en la identificación y manipulación de microorganismos de alta virulencia y

patogenicidad ha clasificado por bioseguridad los agentes biológicos en cuatro grupos

según su peligrosidad hacia el hombre y de esta manera está referido el nivel de

contención en los laboratorios. El LDV del ICA ubicado en Bogotá cuenta con la

asesoría del National Veterinary Laboratory Services (NVLS) de referencia de la OIE y

el Laboratorio de Virología Aviar de la Universidad de Liverpool para avalar su

categoría de nivel tres.

23

1.2 TÉCNICAS DIAGNOSTICAS DE LABORATORIO

HI = Inhibición de la Hemaglutinación.

El procedimiento de preparación de la prueba requiere de glóbulos rojos de cada

especie. Para ser válidos en las pruebas de la especie gallus gallus se deben obtener

de aves libres de patógenos criadas apropiadamente para este propósito. La muestra

de sangre total debe ser mezclada con anticoagulante luego centrifugada para

descartar el suero y lavar los eritrocitos con solución buffer tipo PBS.

La titulación se obtiene utilizando la fórmula:

= Volumen a tomar de Antígeno.

= Titulo en Unidades Hemaglutinantes

= Volumen a preparar

= Unidades Hemaglutinantes recomendadas por la OIE. El ICA utiliza 8 UH

Con esta titulación se establece que las muestras serológicas analizadas para la

vigilancia activa de Newcastle en Colombia no deben superar la dilución 128 para aves

vacunadas con cepas vivas y de 256 para aquellas vacunadas con oleosas.

Los eritrocitos son aglutinados por los anticuerpos en 2 etapas: En la primera el

anticuerpo se une físicamente al antígeno en los eritrocitos. Proceso denominado

sensibilización. La segunda etapa ocurre cuando los eritrocitos acoplados a los

anticuerpos, aglomeran en una estructura de enrejado que constituye la aglutinación.

En algunas reacciones antígeno-anticuerpo las 2 etapas ocurren casi simultáneamente,

mientras que en otras sólo ocurre la primera etapa de la reacción, es decir, hay

24

sensibilización de los eritrocitos por anticuerpos no aglutinantes. La asociación y

disociación del complejo antígeno-anticuerpo se rige por la ley de acción de masas,

esta es una reacción reversible: definida en la fórmula:

( )

( )

Dónde:

A= Antígeno

Ac = Anticuerpo

K = Constante de equilibrio o afinidad de la reacción

El valor K es directamente proporcional a la formación del complejo A-Ac

e inverso a la velocidad de disociación, Esta constante es afectada por las

concentraciones de A y Ac y por las condiciones físicas de las técnicas

utilizadas durante el desarrollo de la prueba, tales como; pH, temperatura,

fuerza iónica y tiempo de incubación. Se debe tener en cuenta que hay

factores que impiden que la segunda fase de la reacción de aglutinación

tales como; Las características del anticuerpo, localización y número de

sitios antigénicos, fuerzas que mantienen la distancia entre los eritrocitos,

uso de albúmina sérica bovina, uso de enzimas, efecto de dosis y efecto

de moléculas con carga positiva. (Valdés & Bencomo, 2001, p.18).

Con esta prueba se detecta ENC, IA, EDS y con la variante indirecta, BIH.

ELISA. El Ensayo por Inmunoabsorción Ligado a Enzimas por sus siglas en inglés,

es una prueba de alta precisión que combina la especificidad de los anticuerpos con

la sensibilidad enzimática. Los componentes de esta prueba son: El substrato, el

conjugado (Anti-Anticuerpo), la muestra y el cromógeno, quienes a través de un

protocolo estandarizado permite una reacción colorimétrica que es leída por un

25

software especialmente diseñado. Hay cuatro tipos o variantes según el objetivo a

revelar:

• Anticuerpos marcados:

- ELISA Directo

- ELISA Indirecto

- ELISA sándwich

ƒ Doble (DAS)

ƒ Heterólogo (HADAS)

• Antígenos marcados

- ELISA competitivo

Por tener la característica de ser altamente sensible y por lo tanto arrojar falsos

positivos es clasificada como prueba tamiz que debe ser confirmada con pruebas

específicas.

Los kits comerciales ofrecen gran variedad de reactivos para detectar una igual

variedad de agentes patógenos haciendo de esta prueba una de las más populares en

los laboratorios. Muy utilizada en la avicultura entre otras cosas para obtener las líneas

base de los lotes.

AGID. Siglas en inglés que traducen Inmunodifusión en Gel de Agar (Agarosa al

0.9%). Es una prueba catalogada como indirecta pues detecta los anticuerpos en los

sueros y las yemas de los huevos. Es un figurado múltiple en forma de roseta que

enfrenta tres sueros distintos con el antígeno ubicado en el centro. Esta prueba deja

en reaccionar 48 horas a temperatura ambiente y es considerada positiva cuando se

ve una barra o línea entre los dos orificios enfrentados. El lector de estas pruebas

debe ser un profesional experto y calificado para dar fallos. Es la prueba Gold

Estándar para IA.

26

PCR – Reacción en Cadena de la Polimerasa

Por sí sola no es una técnica de diagnóstico. Consiste en amplificar el material genético

a través de un aparato llamado termociclador que resume automáticamente lo que en

sus inicios era una técnica manual que sometía el material genético a cambios de

temperaturas y tiempos determinados para conformar un ciclo utilizando reactivos para

abrir las cadenas del ácido nucleico, alinear los cebadores en un punto específico y

polimerizar (copiar) el segmento. Este proceso se repite por muchos ciclos hasta

obtener la multiplicación suficiente de material que deberá ser identificado por un

método de secuenciación el cual permite conocer base a base el contenido genético de

un fragmento de ADN. Hasta ahora no se puede trabajar sobre ARN con esta técnica

por lo cual se debe aplicar una variante denominada Transcriptasa Reversa para

obtener ADN.

La variante denominada PCR en tiempo real se rotula como qPCR o qRT-PCR para

diferenciarla del convencional. El resultado de esta técnica es más rápido ya que

entrega una lectura realizada por un sensor de fluorescencia que mide la tasa de

generación de uno o más productos específicos tras cada ciclo de amplificación al

interpretar su longitud de onda.

Esta técnica ofrece una respuesta rápida de diagnóstico en la ruta crítica de vigilancia

pasiva para Newcastle identificando el virus a través de Gen de Matriz y el tipo cuando

se hace sobre el Gen de Fusión.

Aislamiento

Esta prueba intenta cultivar un virus vivo para identificarlo. Las muestras utilizadas

pueden ser hisopados de mucosas, macerado de tejidos, fómites, sueros o substrato

con material orgánico. Algunas muestras deben conservar los virus por lo tanto al

medio en el que se transporta se agrega un antibiótico de amplio espectro para eliminar

la competencia conservando la temperatura que debe estar entre 4 y 5 ºC. Luego de

27

centrifugar y microfiltrar se colecta el material. Una forma de asilar virus es utilizar

células blanco específicas donde el virus replica y se manifiesta. Otra es utilizar huevos

fértiles de 9 a 11 días que han sido seleccionados y marcados previamente con ayuda

del ovoscopio para inocularlos. La marca es el sitio donde se debe perforar para

alcanzar la cavidad alantoidea y tener la certeza de depositar el inóculo correctamente.

El orificio es tapado para continuar con el proceso de incubación a 37 ºC durante 6 días

más. Una revisión a las 24 horas determina la viabilidad de los embriones tras la

manipulación descartando las muertes. Se vuelve a revisar cada 24 horas y lo que se

encuentre con síntomas a partir de aquí se refrigera a 4 ºC para extraer el líquido

alantoideo. Una muestra de este líquido para HI puede detectar virus hemaglutinantes

que en avicultura son; ENC, IA y Metaneumovirus.

Esta es la prueba Gold Estándar para la ENC luego de tres pases lo cual suma 15

huevos por prueba de donde el material recolectado servirá para la prueba IPIC.

IPIC = Índice de Patogenicidad Intracerebral

Esta es una técnica invasiva donde se inocula dentro del cerebro el material del

aislamiento en pollos SPF recién nacidos para observar su evolución. Esta prueba es

recomendada por la OIE solo en casos cuyas circunstancias lo requieran. Para

clasificar el tipo de ENC se observa cada 24 horas la evolución de las aves inoculadas

de un día de nacidas y se determina que si no presenta sinología clínica equivale a

cero (0), si presenta es uno (1) y las muertas o agonizantes que deben ser sacrificadas

se puntúan con dos (2). Este proceso dura 8 días y se utilizan diez aves por prueba.

1.3 HISTOPATOLOGÍA

Es el estudio de muestras obtenidas generalmente de necropsias realizadas con o sin

reporte de lesiones. Esta prueba requiere de microscopios de luz compuesta y

soluciones de contraste o tinciones para los cortes de muestras previamente fijadas en

28

placas de vidrio. Esta técnica es una herramienta que sigue vigente a pesar del tiempo

debido principalmente a la rapidez del resultado y que puede emitir un diagnostico

concluyente cuando un agente patógeno se manifiesta particularmente y/o ha inducido

cambios específicos en las estructuras. Cuando las lesiones no son tan evidentes,

estos cambios histológicos observados sólo sugieren presencia de enfermedad.

1.4 CULTIVOS BACTERIOLÓGICOS

Para determinar un tipo de bacteria específica, se elabora una secuencia de cultivos

para todas aquellas que crecen en determinados tipos de medio y se van descartando

según el que colonicen. Generalmente las bacterias son agentes oportunistas

responsables de infecciones secundarias pero hay algunas como la Salmonella que

debe ser plenamente identificada. Por lo tanto el cultivo de este agente patógeno solo

es un paso poco relevante y no concluyente en el caso de las aves ya que son apenas

cuatro patotipos (entre más de dos mil), que presentan interés zootécnico y que deben

ser tipificados por otras técnicas que revelen su identidad.

1.5 ENFERMEDADES AVIARES DE CONTROL OFICIAL COLOMBIANO

1.5.1 Newcastle– Enc. La enfermedad de Newcastle es una enfermedad

contagiosa de distribución mundial que provoca pérdidas económicas en

aves domésticas de corral, especialmente en pollos. Los reportes

universales de la enfermedad son únicamente superados por la fiebre

aftosa Alzamora, (2007). Es causada por el paramixovirus serotipo 1

(APMV-1), que pertenece al género avulavirus de la familia de los

Paramyxoviridae, orden mononegavirales Mayo, (2002). Las cepas de

virus de Newcastle pueden ser clasificadas como altamente virulentas,

intermedias o no virulentas en función de su patogenicidad en las

pruebas con huevos fértiles o en pollos (Alexander, 2003; Asahara, 1978,

p.239).

29

El genoma del virus es una hebra simple de RNA de 15kb con sentido

negativo que contiene 6 genes en el orden 3’-NP-P-M-F-HN-L-5’ los

cuales codifican para 6 proteínas denominadas; nucleoproteína,

fosfoproteína, proteína de la matriz, proteína de fusión, proteína

hemaglutinina-neuraminidasa, proteína-polimerasa respectivamente

(Yussoff & Siang Tan, 2001).

Para que un aislamiento del virus de Newcastle sea considerado virulento

y calificar para ser notificada a la OIE, debe presentar; Índice de

patogenicidad intracerebral (IPIC) mayor a 0.7 la cual está íntimamente

relacionada entre otros factores, con la secuencia de aminoácidos del

sitio de clivaje de la glicoproteína F y al tamaño de la glicoproteína HN y/o

presentar múltiples aminoácidos básicos en el extremo C-terminal de la

proteína F2 y fenilalanina en el residuo 117, que es el extremo N-terminal

de la proteína F1 OIE, (2004). Con base en este criterio existen cepas no

virulentas como las del patotipo lentogénicas y virulentas donde se

incluyen las de los patotipos mesogénico y velogénico, pudiendo estas

últimas ser neurotrópicas o viscerotrópicas. El análisis filogenético de la

secuencia de F permite llevar a cabo los estudios de epidemiología

molecular, predicción del patotipo y genotipificación (Seal, 1995; Aldous,

2003; Wakamatsu, 2006). Estos patotipos surgen de la necesidad de

diferenciar las distintas formas clínicas de la enfermedad causadas por

cepas que son indistinguibles serológicamente (Perozo & Villegas, 2008).

El diagnóstico clínico de ENC es difícil de realizar aun presuntivamente,

sobre todo si es producida por cepas de virus que solo afectan el aparato

respiratorio, sin producir lesiones nerviosas y digestivas, Reynolds,

(1994), debe diferenciarse de otras enfermedades respiratorias como

Bronquitis Infecciosa y Laringotraqueitis. Sin embargo, los signos

característicos y las lesiones asociadas con los patotipos virulentos dará

lugar a la sospecha de la enfermedad Organización Mundial de la Salud,

30

(2004).El diagnóstico diferencial de la enfermedad de Newcastle

altamente patógena comprende otras causas de septicemia, enteritis,

afección respiratoria y/o signos neurológicos. En las aves de corral estas

enfermedades incluyen al cólera aviar, influenza aviar altamente

patógena, laringotraqueitis, la forma diftérica de la viruela aviar,

psitacosis, micoplasmosis, bronquitis infecciosa, aspergilosis, y problemas

de manejo tales como la privación de agua o alimento, y la mala

ventilación. En aves domésticas, las enfermedades a considerar incluyen

la psitacosis, enfermedad de Pacheco, salmonelosis, adenovirus, y las

deficiencias nutricionales, así como otras infecciones por paramixovirus

(Mossos, 2010, p.14).

La enfermedad de Newcastle se diagnostica mediante el aislamiento del virus en

embriones de pollo SPF, por serología mediante la prueba de inhibición de la

hemaglutinación (HI), pruebas moleculares en tiempo real RT-PCR y secuenciación

(Figura 1).

Figura 1. Proceso diagnóstico de la enfermedad de Newcastle en LNDV

Fuente. El autor

31

Los aislamientos de virus de Newcastle se replican en embriones SPF y el tiempo

medio de muerte (TTM) para matar el embrión, varía dependiendo de su virulencia

(Miller P.J., 2010).

La capacidad de los virus de aglutinar los eritrocitos se ha convertido en

una herramienta útil para conocer el nivel de anticuerpos en las muestras

de suero mediante la prueba de HI, los monitoreos serológicos permiten

evaluar la respuesta inmune después de la vacunación y correlacionar los

resultados con cualquier nivel dado de protección, Viamontes, (2003) y

predecir cuál será el resultado clínico de los lotes de aves ante una

exposición viral Angulo, (2009).Al interpretar los resultados de estas

pruebas, se debe enfocar sistemáticamente el problema para que sea una

prueba de ayuda diagnóstica. (Mossos, 2010, p.14).

Panda, (2006) señala que las pruebas moleculares permiten predecir el patotipo de una

cepa sin inocular pollos y la conclusión de presencia y virulencia del agente puede

lograrse técnicamente en menos de tres días.

Villegas y Perozo, (2008) enfatizan como absolutamente necesario para implementar

controles de la enfermedad; el diagnóstico, la caracterización biológica y molecular

(genotipificación).

Otra prueba es el aislamiento del virus de tejidos de animales infectados o

sospechosos de la enfermedad Organización Mundial de Salud Animal-

OIE, 2004 y Kuiken, (1999) en estudios con cormoranes en Canadá,

recomienda utilizar una prueba de tamizaje o screening que no esté

basada o dependa sólo del aislamiento viral con actividad

hemoaglutinante. La técnica de aislamiento fue utilizada en Indonesia

para aislar un virus velogénico y establecer un virus de referencia interior

para el futuro de los estudios epidemiológicos, patológicos y moleculares.

32

También son utilizados los índices de patogenicidad: tiempo medio de

muerte embrionaria e intracerebral (Adi, 2010; De Noguera, 2002, p.60).

La prueba de RT-PCR acompañada de secuenciación de nucleótidos

representa un aporte para la vigilancia epidemiológica de la Enfermedad

de Newcastle Perozo, (2006) y Miller, (2010), afirma que la diversidad

genómica de la enfermedad de Newcastle aumenta la posibilidad de

diagnósticos fallidos y da lugar a infecciones no identificadas. Es

necesaria la vigilancia epidemiológica constante y proactiva, y la

caracterización de las cepas circulantes en el mundo (Fuller, 2009, p.37).

Investigaciones recientes han podido detectar virus mediante el uso del

PCR de la enfermedad de Newcastle obtenido de las placas de tejidos de

casos clínicos para estudio histopatológico. Esta prueba hace posible

utilizar como recurso en algunos casos, contra muestras hasta ahora no

incluidas dentro de los protocolos de diagnóstico para esta patología.

(Wamatsu, King, Seal & Brown, 2007, p. 333)

Debido a los grandes volumenes de información en cuanto a la lectura e

interpretación de los resultados de los aislamientos virales y las fallas en

su detección, se ha incluido a la bioinformática como herramienta para la

alineación filogenética y el análisis comparativo de nucleótidos con el fin

de determinar qué aspectos permiten al virus escapar al diagnóstico en

algunos casos y haciendo que la eficacia de la prueba no sea del 100% .

(Rogeria de Almeida, Pires, Patarroyo, Vidigal, Borem, 2007, p.227).

Una variante hallada para el diagnóstico serológico de la enfermedad de

Newcastle en ratites comerciales (Avestruces y Ñandues) en la prueba de

HI, es la utilización de caolín para eliminar los inhibidores inespecíficos de

la hemaglutinación que estas aves presentan con el objetivo de reducir

los falsos positivos. (Carrasco, et al., 2008, p.13)

33

Para garantizar un resultado en las pruebas serológicas cuando estas no

se pueden correr dentro del tiempo que la muestra a temperatura

ambiente o refrigerada es óptima, se debe recurrir al proceso de inactivar

los sueros con choques térmicos propuesto por Cunningham, (1971.). Sin

embargo, aunque esta técnica es utilizada en muchos laboratorios se

debe tener en cuenta que el congelamiento prolongado en tubos de

ensayo hace que las proteínas se depositen en el fondo y durante la

reconstitución tienden a desnaturalizarse. Para evitar esta perdida, se

sugiere agregar una parte igual de glicerina neutra para evitar el

congelamiento y como efecto agregado, reducir la contaminación

bacteriana. (Camargo y Guimarães. 1980). Otro estudio de conservación

a largo plazo de sueros es la de recolectar en papel filtro y posteriormente

congelar. (Guimaraes, et al., 1986, p. 129).

1.5.2 Influenza Aviar - IA. A IA es una de las enfermedades zoonóticas que genera

muchas inquietudes en la comunidad científica. Esta enfermedad ha recibido muchas

denominaciones por lo cual se recomendó en el primer simposio internacional que

fuera designada como Influenza Aviar Altamente Patógena – IAAP, sin embargo el

término utilizado actualmente por la OIE, (2007) es el de Gripa Aviar Notificable – GAN.

El virus de IA es de tipo RNA de la familia Orthomyxoviridae.

Antigénicamente existen cuatro tipos A, B, C y Thogotovirus. El tipo A

involucra todos los virus que afectan a las aves domésticas, corredoras y

silvestres. Son huéspedes del virus especies de aves de ornato y

canoras. El tipo A también se puede encontrar en humanos, cerdos,

caballos y, ocasionalmente, en otros mamíferos. (Alexander, 1993, p.

287).

Los virus del tipo A están divididos en subtipos, considerando que

cuentan con 2 glicoproteínas de superficie: la hemaglutinina (H) y la

neuraminidasa (N). En el año 2005 se reportó el antígeno H16 Fouchier,

34

et al., (2005). Sumado a los 9N exhibe gran multiplicidad antigénica,

capacidad de mutación y variedad de virulencia puesto que puede

configurar cualquiera de los 16 subtipos H en cualquiera de los 9 subtipos

N. Linzitto, Espinosa, Rodríguez y Rodríguez, (2005). La Hemaglutinina

está asociada a la clasificación de alta patogenicidad en algunos subtipos

de IA H5 y H7 debido a la presencia de proteasas tipo Furina en las aves,

responsables dela proteólisis. Por su parte, el papel principal de la

neuraminidasa es el de favorecer la diseminación viral. (Saif, et al., 2007,

p. 136).

El virus es subtipado en el laboratorio mediante antisueros

monoespecíficos preparados frente a los antígenos aislados de cada uno

de los subtipos de hemaglutinina y de neuraminidasa de los virus tipo A,

los cuales pueden utilizarse en pruebas de inmunodifusión.

Alternativamente, el virus recién aislado puede examinarse mediante

pruebas de inhibición de la hemaglutinación y de la neuraminidasa frente

a una serie de anticuerpos policlonales contra un amplio rango de cepas

de todos los subtipos N. En los últimos años, los métodos empleados

para la determinación de la virulencia de una cepa en las aves han

evolucionado y existe una mayor comprensión de las bases moleculares

de la patogenicidad pero todavía implican la inoculación del virus

infeccioso de un mínimo de ocho gallinas susceptibles de 4-8 semanas de

edad; las cepas se consideran muy virulentas si causan más del 75% de

mortalidad en 10 días o tienen un índice de patogenicidad intravenosa

(IPIV) mayor de 1.2. (OIE. 2007, p. 580).

Los subtipos de virus influenza que han sido confirmados en humanos

productores de pandemia, son: el H1N1, causando la Gripe Española, el

H2N2 la gripe asiática y el H3N2 causando la gripe de Hong Kong. Los

subtipos H5N1, H7N7, H9N2, H7N2, H7N3, han sido asociados

últimamente con infección de gripe aviar en humanos. Hasta el momento

35

no se ha podido sustentar la transmisión del virus de la IA entre humanos,

sin embargo, relatos clínicos de pacientes diagnosticados revelan que no

tuvieron contacto con animales de granja (Vranjac, 2006, p.40).

Al infectar animales que viven cerca a los humanos tenemos una

situación en la cual infecciones dobles con virus humano y no humano

originan un resultado impredecible de nuevas cepas con composiciones

genéticas muy diferentes. Este reordenamiento de genes, puede ser

pequeño y se conoce como “drift antigénico” o mayor al que se le conoce

como "hiftantigénico" (solo identificadas en el tipo A) y puede darse

también entre dos cepas de origen humano. (Gatherer, 2009, p.174).

Las aves infectadas por el virus AH5N1, siendo excretado en grandes cantidades en

las heces, el virus puede sobrevivir allí por lo menos 35 días a 4°C. Puede sobrevivir

por largos períodos en tejidos de aves enfermas y en el agua, puede sobrevivir hasta

cuatro días a 22°C e indefinidamente en congelación.

Las zoonosis emergentes son una preocupación de los gobiernos por que han

estimado graves consecuencias en la salud pública, traduciendo su impacto en factores

socioeconómicos Olea y Andrea, (2005). El boletín Weekly Epidemiological Record-

Releve Epidemiologique Hebdomadaire, publicado en línea por la Organización

Mundial de la Salud, muestra los resultados del primer análisis epidemiológico del total

de casos de infección por H5N1confirmados por diagnóstico de laboratorio durante el

periodo 2003 – 2006. La conclusión más importante, fue la característica estable dela

tasa de letalidad de la enfermedad.

En la Conferencia Hemisférica de Vigilancia y Prevención de la Influenza

Aviar sesionada en Brasilia en 2005, se firmaron alianzas entre el sector

público y privado a nivel global para prevenir el riesgo de aparición de una

pandemia que amenaza catástrofe. El diagnóstico clínico y los hallazgos

patológicos son criterios suficientes para tomar decisiones de cuarentenar

36

un área como medida de control de urgencia antes de ser confirmada por

pruebas de laboratorio. En consecuencia, los gobiernos deben estar

preparados para atender las enfermedades emergentes, producto de los

cambios antropogénicos de la biosfera. Cabello y Cabello, (2008). Los

laboratorios oficiales deben estar en capacidad de realizar las pruebas

serológicas, detección de antígenos y aislamiento viral. Los métodos se

encuentran descritos en el manual de pruebas diagnósticas y vacunas

para los animales terrestres, de la OIE, Capítulo OIE, (2004). El

diagnóstico de IA se puede realizar a través de cuatro métodos. (Berrio,

2004, p.13).

Aislamiento viral (cultivo). Constituye el gold standard o prueba reina para la

notificación a la OIE. Es la inoculación en la cavidad alantoidea de embriones de

pollo específicamente libres de patógenos (por sus siglas en inglés SPF) o

embriones específicamente libres de anticuerpos (por sus siglas en inglés SAN). La

desventaja es el tiempo requerido para ofrecer resultados, lo que limita su

utilidad clínica. Esta técnica además permite reconocer subtipos y evaluar

resistencia a fármacos.

Detección de proteínas virales. Son test de inmunofluorescencia y ensayo

inmunoenzimático (ELISA de captura) fáciles y rápidos. Menos sensibles que el

cultivo, pero el resultado se obtiene en menos de una hora, por lo que permite

iniciar tratamiento. Algunos permiten identificar a ambos géneros de influenza.

Detección de ácido nucleico viral. Se realiza una amplificación del material viral por

medio de la técnica de PCR. También permite identificar subtipos.

Serología. Por ser un virus hemoaglutinante se realiza la detección del ascenso de

anticuerpos. Con técnicas de inmunodifusión en gel de agar – AGID, ELISA e

inhibición de la hemaglutinación Reconoce ambos géneros del virus, pero no es útil

en la tomas de decisiones.

37

La FAO recomienda a los laboratorios nacionales tener la capacidad para:

- Identificar el antígeno Neuraminidasa mediante pruebas de inhibición (IN)

- Prueba de patogenicidad a los aislamientos virales

- PCR en tiempo real

Según la FAO, (2006) además se solicita a los países, a adquirir e implementar la

tecnología necesaria en caso de emergencia cuando el volumen de muestras lo exija y

contar con el apoyo de laboratorios de referencia.

En el año 2005 se crea la OFFLU, Una poderosa red virtual de información creada

conjuntamente por la FAO y la OIE uniendo esfuerzos para prevenir, detectar y

controlar la Influenza en los animales. Involucra grupos de expertos interdisciplinarios

donde la OMS participa como observador de las actividades a las que se puede

acceder en su sitio web, www.ufflu.net.

Desde 1997, en Colombia se han procesado 25 mil sueros con la técnica de

inmunodifusión en agar-gel y han sido negativos, por lo tanto, el país se auto declara

libre de IA ante la OIE.

1.5.3 Salmonelosis. Los microorganismos del género Salmonella son

bacilos gram negativos pertenecientes a la familia Enterobacteriaceae.

Más de 2300 serovares del género están reconocidos como especies

distintas y dados los mecanismos de recombinaciones genéticas hoy

conocidos, se presume que esta cifra siga multiplicándose en los

próximos años, así como sus transferencias de genes, que entre otros

mecanismos son los responsables de la resistencia a los distintos

antimicrobianos (Flórez, 2005,p.1).

38

Son restrictivos para el comercio internacional y en Colombia, los

serotipos de importancia en salud pública por su toxiinfección alimentaria

se registran entre otros Typhymuriom y Enteritide, y en la avicultura los

serotipos: Pullorum (Pullorosis) y Gallinarum(tifosis). El aumento de la

incidencia de Salmonella spp, es de gran impacto y se ha relacionado con

un incremento de la diseminación de los microorganismos a través de las

cadenas productivas animales (bovinos, cerdos, pollos asaderos y en

especial gallinas ponedoras). Las canales de aves frecuentemente

pueden estar infectadas con el microorganismo; los huevos se pueden

contaminar por transmisión vertical (trans-ovárica), bien puede ser

durante la postura o durante la manipulación o en el almacenamiento

(Uribe, 2006, p.151).

Mucha investigación se ha dirigido hacia la inmunización de gallinas y pavos. La

mayoría de los reportes tienen en común el uso de bacterinas que generan

controversia dentro de la comunidad científica por interferir con su diagnosis a través

de pruebas serológicas; sin embargo, la persistencia por refinar este método es la

respuesta de las aves al recuperarse de la enfermedad sin una posterior reinfección.

Según Pachón, (2009) Salmonella presenta tres antígenos, Flagelar (H), Somática (O)

y de Virulencia o Envoltura o Superficie (Vi) que sirven para su clasificación antigénica

es una equivalencia numérica de la anterior designación por fórmulas del esquema de

Kauffman-White.

En general, es negativa a las pruebas de ureasa, indol, lactosa y

sacarosa y positiva a las pruebas de descarboxilación de lisina y ornitina.

Así mismo, generalmente producen ácido sulfhídrico (H2S), aunque

existen variantes atípicas con reacciones positivas a lactosa o no

descarboxilación de lisina (Velilla, Terzolo & Feingold, 2006, p.98).

39

En las actividades de campo se utiliza la prueba rápida en placa y la confirmación se

hace en cultivos específicos como lo indica el manual de la OIE. Para el proyecto de

vigilancia activa de la Salmonella, el ICA estandarizó la técnica de extracción de ADN

genómico y plasmídico, empleando cepas de referencia para este fin.

El diagnóstico definitivo es la identificación a través de la tipificación y las muestras son

por lo general sangre, higado, vesicula biliar, ovarios, alimento, camas, meconio y

embriones.

Los signos clinicos de S. pullorum son inapetencia, somnolencia y acumulacion de

excretas blancas en la cloaca. En la necropsia de pollos jovenes pueden aparecer

focos blanco amarillentos en corazón, pulmones, higado, estomago, ciego y pancreas.

En los riñones hay congestiion y pueden verse uratos. En los adultos se encuentran

lesiones en los folículos ováricos, impactación del oviductos y peritonitis.

Las lesiones microscopicas aparecen como focos necróticos en el higado con

infiltración linfocitaria, necrosis focal del miocardio y pulmón. Tambien puede

presentarse enteritis catarral.

Se debe hacer un diagnóstico diferencial con Salmonella gallinarum, Salmonella

paratífica, aspergilus, mycolasma sinoviae y bronquitis infecciosa.

Los signos clinicos de S. gallinarum similares a los de S. Pullorum pero el color de la

diarrea sule ser verde o verde amarillenta.

En la necropsia no se observan cambios cuando la infección es hiperaguda. Es común

encontrar hipertrofia en hígado, bazo y riñones. El hígado puede cambiar de color.

Focos miliares blancuzcos en hígado y miocardio. En algunos animales jóvenes

también se observan en pulmones, corazón y molleja. Es posible encontrar peritonitis,

óvulos deformados y hemorrágicos. Al microscopio se observan focos necróticos en

hígado (con infiltración linfocitaria), miocardio y pulmón.

40

El diagnóstico para S. gallinarun y S. Pullorum se hace por cultivo y serología

(aglutinación rápida en placa o lenta en tubo). El primero tiene tres métodos:

a) Medios de enriquecimiento selectivos como selenito F o Caldo tetrationato

b) Medios diferenciales como Agar Mac Conkey

c) Tipificación con Agar TSI (Hierro Triple Azúcar, pos sus siglas en inglés)

41

2. MATERIALES Y MÉTODOS

La base de datos utilizada para el presente estudio fue construida en hoja de cálculo

trascribiendo desde los archivos físicos de los casos ingresados durante el periodo

2009 - 2011 a los laboratorios seleccionados, contenidos en el formato único de

recepción de muestras - FURM el cual es diligenciado en cada laboratorio ya sea con

la información de los diferentes formatos oficiales (3-106, 3-108, etc) utilizados como

parte del protocolo al recoger las muestras y se encuentran en el link DOC MANAGER

de la página web del ICA o en la ventanilla de recepción de cada laboratorio cuando el

usuario solicitante los aporta.

Una vez ingresados los datos se procedió a validar la información con pruebas de

filtrado y revisión de inconsistencias consolidando las variables que en su totalidad

resultaron para el presente trabajo del tipo categórico. Para obtener la descripción

estadística se utilizó la herramienta complementaria de Excel, XLSLAT, programa que

por su integración modular realiza ágil y eficazmente esta labor generando las

diferentes salidas graficas necesarias para la lectura de los resultados extraídas desde

las tablas.

Los análisis de asociación y predicción fueron procesados con el paquete gratuito de

dominio público EPI-INFO (TM) 3.5.4 diseñado para profesionales de la salud pública

que implique manejo de datos epidemiológicos. Con este software se elaboraron las

tablas de contingencia y su desarrollo implícito del análisis de correspondencias

múltiples necesarias estimó el grado de asociación de las diferentes variables que

presentaban interés estadístico.

Las salidas de las tablas de contingencia incluyen los valores marginales y los

intervalos de confianza que ofrecen las bases para el direccionamiento de la

interpretación.

42

La regresión logística de este paquete estadístico arrojó resultados que sugieren el

comportamiento conductual de las variables condicionadas a través de los ajustes o

variantes de las formulas del chi cuadrado que en este caso es el Test Exacto de

Fischer.

Los mapas de distribución se realizaron con DIVA-GIS v 7.5 software gratuito para

aprovechar el potencial de esta herramienta informática y maximizar las ventajas que

brinda la extensa y georeferenciada base de datos. Este software incluye 19 variables

climáticas con información de los últimos 50 años para vincularlos como factores

predictivos en la aparición de las enfermedades según el procesamiento de las

variables.

43

3. RESULTADOS Y DISCUSIÓN.

3.1 ESTADÍSTICA DESCRIPTIVA

La casuística aviar de los tres Laboratorios de Diagnóstico Veterinario del ICA – LDV

escogidos (CEISA-Bogotá, Tuluá e Ibagué), recopilada durante el periodo 2009-2011

fue tabulada en hoja de cálculo ingresando la información del Formato Único de

Recepción de Muestras – FURM (Anexo A) y los resultados de las pruebas de

laboratorios correspondientes solicitadas en cada caso. De esta manera se

consideraron como variables aquellas categorías de datos que se presentan a

continuación:

3.1.1 Recepción de casos. Durante el período comprendido entre los años 2009 y

2011 el total de casos de la vigilancia pasiva ingresados en los tres LDV correspondió a

2204 (Tabla 1). De estos, la mayor concentración estuvo en el laboratorio de Bogotá

(CEISA) con el 60,80% ya que allí son remitidas muestras de todo el territorio nacional

para correr pruebas especiales. En el laboratorio de Tuluá existe una gran

concentración de casos (31,20%) por la dotación de equipos y en Ibagué el porcentaje

fue considerablemente menor (8,00%).

Tabla 1. Relación del ingreso de casos a los LNDV – ICA

OFICINA RECEPTORA

OFICINAS FRECUENCIA PORCENTAJE

CEISA 1340 60,80%

IBAGUE 177 8,00%

TULUA 687 31,20%

Total 2204 100,00%

Fuente. El autor

44

3.1.2 Fecha de Ingreso. El mayor porcentaje de ingreso de casos se presentó en el

año 2010 especialmente durante el tercer trimestre y en el primer trimestre del 2011

(12,11%) y el más bajo el último trimestre de 2011 (4,54%) (Tabla 2).

Tabla 2. Descripción del ingreso de casos por trimestre a los LND – ICA.

FECHA

TRIMESTRES FRECUENCIA PORCENTAJE

1-2009 142 6,44%

2-2009 189 8,58%

3-2009 157 7,12%

4-2009 137 6,22%

1-2010 264 11,98%

2-2010 183 8,30%

3-2010 267 12,11%

4-2010 266 12,07%

1-2011 245 11,12%

2-2011 128 5,81%

3-2011 126 5,72%

4-2011 100 4,54%

Total 2204 100,00%

Fuente. El autor

La tabla muestra que la menor frecuencia de casos que llegaron a los LNDV se

presentó en el año 2011, reflejando la tendencia hacia la disminución en la utilización

de los laboratorios del ICA como medio de diagnóstico en el sector avícola. Se puede

pensar que esta tendencia pudiera estar relacionada con las campañas de

implementación de medidas de bioseguridad en las granjas avícolas que garantizan la

baja incidencia de enfermedades o que algún factor como las condiciones climáticas en

45

este año no favoreció la aparición de las mismas o por alguna característica inherente a

los usuarios.

3.1.3 Identificación de usuarios. La tabla 3 corresponde a la identificación de los

usuarios y muestras de los 2204 casos que llegaron a los laboratorios del ICA durante

los años 2009 – 2011, los cuales fueron solicitados por 882 usuarios, 699 de ellos, es

decir, el 79,25% hicieron uso del servicio una única vez. Las solicitudes que los

usuarios hicieron hasta por 4 veces consolidan el 95,58%del total. Todo lo anterior

indica que la gran mayoría de casos corresponden a usuarios ocasionales. Pueden

identificarse usuarios que utilizaron el servicio de los laboratorios regularmente

teniendo en cuenta el tamaño y tipo de la explotación, de ellos los más relevantes son

Avícola Colombiana S.A., ALAVI S.A. y Nutriavícola Colombiana S.A. con más de 100

solicitudes durante el periodo cada uno de ellos.

Tabla 3. Identificación del tipo de usuarios de los LDV – ICA.

USUARIOS

Usuario No.

Solicitudes

Frecuencia Proporción Prop.

Acumulada

USUARIOS 1 SOLICITUD 1 699 79,25% 79,25%

USUARIOS 2 SOLICITUDES 2 102 11,56% 90,82%

USUARIOS 3 SOLICITUDES 3 26 2,95% 93,76%

USUARIOS 4 SOLICITUDES 4 16 1,81% 95,58%

USUARIOS 5 SOLICITUDES 5 6 0,68% 96,26%

USUARIOS 6 SOLICITUDES 6 3 0,34% 96,60%

USUARIOS 7 SOLICITUDES 7 2 0,23% 96,83%

USUARIOS 8 SOLICITUDES 8 2 0,23% 97,05%

USUARIOS 9 SOLICITUDES 9 3 0,34% 97,39%

GUSTAVO ESPINOZA 10 1 0,11% 97,51%

46

USUARIOS

Usuario No.

Solicitudes

Frecuencia Proporción Prop.

Acumulada

USUARIOS 11 SOLICITUDES 11 3 0,34% 97,85%

USUARIOS 12 SOLICITUDES 12 3 0,34% 98,19%

PURO POLLO S.A. 13 1 0,11% 98,30%

ICA TULUA 15 1 0,11% 98,41%

EDGAR OROZCO 16 1 0,11% 98,53%

INCUBACOL 19 1 0,11% 98,64%

COLAVES 21 1 0,11% 98,75%

AGROAVICOLA SAN

MARINO

25 1 0,11% 98,87%

PAVOS DEL CAMPO S.A. 28 1 0,11% 98,98%

HUEVOS ORO 36 1 0,11% 99,09%

ACODENSA 37 1 0,11% 99,21%

POLLOS BUCANERO 42 1 0,11% 99,32%

VETIPLUS S.A. 48 1 0,11% 99,43%

PRODUCTORA NACIONAL

AVICOLA COLOMBIANA S.A.

56 1 0,11% 99,55%

POLLOS SAVICOL S.A. 76 1 0,11% 99,66%

AVICOLA COLOMBIANA S.A. 106 1 0,11% 99,77%

ALAVI S.A. 179 1 0,11% 99,89%

NUTRIAVICOLA

COLOMBIANA S.A

258 1 0,11% 100,00%

Total 882 100,00% 100,00%

Fuente. El autor

47

3.1.4 Ubicación geográfica. En la tabla 4 se relacionan los departamentos donde se

encuentran los usuarios que enviaron muestras a los LNDV del ICA durante el período

2009 – 2011 para su respectivo procesamiento.

Tabla 4. Relación de los departamentos de origen de los casos.

DEPARTAMENTO

DEPARTAMENTO FRECUENCIA PORCENTAJE

AMAZONAS 1 0,05%

ANTIOQUIA 31 1,41%

ARAUCA 10 0,45%

ATLANTICO 77 3,49%

BOLIVAR 11 0,50%

BOYACA 17 0,77%

CALDAS 25 1,13%

CAQUETA 5 0,23%

CASANARE 34 1,54%

CAUCA 181 8,21%

CESAR 21 0,95%

CHOCO 4 0,18%

CORDOBA 30 1,36%

CUNDINAMARCA 292 13,25%

GUAJIRA 11 0,50%

GUAVIARE 1 0,05%

HUILA 70 3,18%

MAGDALENA 5 0,23%

META 28 1,27%

NARIÑO 26 1,18%

NORTE DE SANTANDER 20 0,91%

48

DEPARTAMENTO

DEPARTAMENTO FRECUENCIA PORCENTAJE

PUTUMAYO 15 0,68%

QUINDIO 53 2,40%

SANTANDER 79 3,58%

SUCRE 6 0,27%

TOLIMA 308 13,97%

VALLE 810 36,75%

VAUPES 1 0,05%

VICHADA 2 0,09%

Total 2204 100,00%

Fuente. El autor

Durante el período 2009 – 2011, 30 de los departamentos de Colombia enviaron

solicitudes a los LNDV del ICA, aunque hay una indiscutible concentración en los

departamentos de mayor desarrollo avícola. El Valle del Cauca con el 36,75%

representado en 810 casos es el departamento que más hace uso del servicio de

laboratorios prestado por el ICA, seguido por Tolima (13,97%), Cundinamarca (13,25%)

y Cauca (8,21%), este último a pesar de no ser un departamento de concentración

avícola, supera lo observado en Santander con sólo 79 solicitudes (3,58%) y sí se

encuentra en una región de importancia avícola (Tabla 4).

3.1.5 Motivo de solicitud. La tabla 5clasifica los motivos por los cuales se solicita el

servicio de los laboratorios del ICA por parte de los distintos tipos de usuarios.

49

Tabla 5. Descripción del motivo de solicitud.

MOTIVO DE SOLICITUD

MOTIVO FRECUENCIA PORCENTAJE

COMPRAVENTA 4 0,18%

CUARENTENA 10 0,45%

DIAG/DIFERENCIAL 126 5,72%

DIAGNOSTICO 1577 71,55%

EXPORTACION 13 0,59%

IMP/CUARENTENA 203 9,21%

MOVILIZACION 33 1,50%

PERFIL 32 1,45%

RESA 206 9,35%

Total 2204 100,00%

Fuente. El autor

El principal motivo de solicitud evidentemente es el diagnóstico abarcando el 71% del

número de casos, seguido con una gran diferencia por el programa Red de Seguridad

Alimentaria-RESA (9,35%), la importación con un valor de 9,21%, el diagnóstico

diferencial tiene el 5,72%, mientras que la movilización y los perfiles vacunales

representan el 1,50% y el 1,45% respectivamente (Figura 5 ). Los motivos por los

cuales se utilizan en menor cantidad los servicios de laboratorio son por compraventa,

cuarentena y exportación de aves. En cuanto al FURM es necesario que la casilla que

corresponde al motivo de solicitud sea más explícita para hacer una mejor

caracterización, es decir, especificar el fin real de la solicitud para discriminar el ítem

diagnóstico que pude ser entre otros: control de calidad, perfiles de anticuerpos

vacunales, comprobar enfermedad sin signos clínicos, etc.

50

3.1.6 Tipo de explotación avícola. Los tipos de explotación que hicieron uso del servicio

de laboratorio prestado por el ICA durante el período en estudio se presentan en la

tabla 6.

Tabla 6. Tipos de explotación que hicieron uso de los LDV – ICA.

Fuente. El autor

El tipo de explotación que tiene mayor representación en el país es la postura en ciclo

completo pues contempla 824 casos de los 2204 en total, es decir, el 37,43%. La

siguiente explotación en importancia es el engorde con 21,42%.El traspatio tuvo una

participación significativa en el uso de los laboratorios correspondiente al 16,92%

gracias a las notificaciones pasivas y al programa RESA. Las solicitudes de

reproductoras fueron el 14,25% con 314 casos, mientras que la categoría otras

especies presentó solamente el 6,17%. La explotación que tiene menor representación

en sector avícola son las aves de postura de levante, pues obtuvieron sólo el 0,41%. Es

de resaltar que el 3,40% de los formularios de solicitud no reporta el tipo de explotación

a la que corresponde, lo que evidencia fallas en el diligenciamiento de estos.

EXPLOTACIÓN

EXPLOTACIÓN FRECUENCIA PORCENTAJE

ENGORDE 471 21,37%

NO REPORTA 75 3,40%

OTRAS ESPECIES 136 6,17%

POSTURA CC 824 37,39%

POSTURA LEV 11 0,50%

REPRODUCTORAS 314 14,25%

TRASPATIO 373 16,92%

Total 2204 100,00%

51

3.1.7 Síntomas. El principal motivo para enviar muestras al laboratorio tras la atención

de la notificación del caso, es la aparición de síntomas. Reportar o no la sinología en el

FURM depende del motivo de la solicitud. Esto quiere decir que no aplica en las

solicitudes remitidas en ausencia de síntomas. Ejemplo de esto son las importaciones o

exportaciones de aves, donde el objetivo del examen de laboratorio es demostrar la

salubridad de un lote asintomático dentro en un modelo de estación cuarentenaria.

Este punto del FURM debe ser re categorizado para poder clasificar la información

eficientemente.

Como lo muestra la tabla 7 se presentaron síntomas en 835 casos, no reportaron

presencia de síntomas en 871 casos y no aplicaba su reporte en 498 del total.

Tabla 7. Presencia de síntomas de los casos recibidos en los LND – ICA.

SÍNTOMAS

FRECUENCIA PORCENTAJE

NO APLICA 498 22,60%

CON SINTOMAS 871 39,52%

SIN SINTOMAS 835 37,89%

Total 2204 100,00%

Fuente. El autor

Que el 37,89% de los casos no presenten síntomas hace pensar que el motivo de

solicitud debe ser discriminado para determinar categorías que revelen la conducta de

los usuarios.

El porcentaje de los casos que presentaron sintomatología y los que no presentaron se

reparte casi en partes iguales donde se espera que sea mayor la presencia de

52

síntomas tal como está planteado el sistema de vigilancia por parte del ICA. El restante

23% corresponde a los casos en que no aplica el reporte de síntomas.

En la tabla 8 se muestran las frecuencias absolutas de los sistemas afectados en los

871 casos que presentaron sintomatología.

Tabla 8. Presencia de síntomas por tipo de sistema afectado.

SINTOMATOLOGÍA

NE

UR

OL

OG

ICO

S

RE

SP

IRA

TO

RIO

S

DIG

ES

TIV

OS

RE

PR

OD

UC

TIV

OS

SIS

TE

MA

OS

EO

ED

EM

A

SI 250 667 311 125 30 12

NO 621 204 560 746 841 859

Total 871 871 871 871 871 871

Fuente. El autor

Se observa que los síntomas respiratorios se presentan en mayor proporción en el

76,58% del total de casos, le siguen los de tipo digestivo con el 35,71% y neurológico

con 28,70%, mientras que los síntomas reproductivos fueron el 14,35%. Los síntomas

que se presentaron con menor frecuencia fueron los que afectan al sistema óseo

(3,44%) y el edema (1,38%).

La tabla 9 discrimina las afectaciones en los diferentes sistemas orgánicos de las aves.

Podemos ver que el 36,62% presentó únicamente síntomas respiratorios, mientras

que en 121 casos (13,89%) hubo combinación de síntomas respiratorios y digestivos.

Los sistemas nervioso y respiratorio se presentaron juntos en un 8,84%. Se

53

presentaron únicamente síntomas neurológicos en el 6,66% de los 871 casos, en tanto

que hubo presencia de síntomas nerviosos, digestivos y respiratorios en 57 casos, es

decir, 6,54%

Todo lo anterior muestra que el sistema respiratorio de las aves constituye el órgano

más comprometido en los casos de diagnóstico de enfermedad solicitado en los tres

laboratorios del ICA. Esta condición puede estar asociada al componente genético,

sistemas de manejo y condiciones climáticas.

Tabla 9. Combinaciones de sintomatología por sistemas.

SINTOMATOLOGÍA

RE

SP

IRA

TO

RIO

S

NE

UR

OL

ÓG

ICO

S

DIG

ES

TIV

OS

RE

PR

OD

UC

TIV

OS

Ó

SE

OS

ED

EM

A

FR

EC

UE

NC

IA

PO

RC

EN

TA

JE

X X X 1 0,11%

X X X 1 0,11%

X X 1 0,11%

X X X 1 0,11%

X X X 1 0,11%

X 1 0,11%

X X 2 0,23%

X X 3 0,34%

X X 3 0,34%

X X X 3 0,34%

X X 3 0,34%

54

Fuente. El autor

3.1.8 Necropsias. Para corroborar la sintomatología observada en las aves durante la

visita de campo se recomienda realizar necropsias que permitan la identificación de las

lesiones macroscópicas que apoyen la presunción diagnóstica. En varios casos se

observó que los propietarios, sobre todo los que poseen aves de traspatio, se negaron

al sacrificio para tal fin. En la tabla 10 se presentan los resultados de la variable

necropsias.

SINTOMATOLOGÍA

RE

SP

IRA

TO

RIO

S NE

UR

OL

ÓG

IC

OS

D

IGE

ST

IVO

S

RE

PR

OD

UC

TI

VO

S

ÓS

EO

S

ED

EM

A

FR

EC

UE

NC

IA

PO

RC

EN

TA

JE

X X X 4 0,46%

X X X 5 0,57%

X X 7 0,80%

X X X X 8 0,92%

X 13 1,49%

X 14 1,61%

X X X 16 1,84%

X X 25 2,87%

X X 28 3,21%

X 47 5,40%

X X 48 5,51%

X X X 57 6,54%

X 58 6,66%

X X 77 8,84%

X X 121 13,89%

X 319 36,62%

55

Tabla 10. Realización de necropsias en los casos enviados a los LDV – ICA.

NECROPSIAS

FRECUENCIA PORCENTAJE

PRESENTA

LESIONES

741 33,62%

SIN LESIONES 88 3,99%

NO APLICA 1126 51,09%

NO SE REALIZÓ 249 11,30%

Total 2204 100,00%

Fuente. El autor

En necesario aclarar que en algunos casos no se practicaron necropsias por estar

condicionadas al motivo de la solicitud para las cuales no aplica este procedimiento

excluyendo así al 51,09% del total. A estos se suman el 11,30% de los casos en que no

se realizó el procedimiento en los cuales debiera reportarse el por qué para buscar una

estrategia que permita esta práctica. Se realizaron 839 necropsias que corresponde al

37,61% de los 2204 casos, de estos, el 33,62% presentaron lesiones y el 3,99%

restante no presentaron.

El análisis de las 741 necropsias que presentaron lesiones, extraídos de la tabla

11donde los resultados presentados, relaciona los sistemas afectados tomando los

datos absolutos de la base de datos, es decir, se contabilizaron las afectaciones

cuando el reporte era único o estuviera(n) involucrado(s) otro(s) sistema(s).

56

Tabla 11. Presencia de lesiones por sistema afectado.

LESIONES A LA NECROPSIA

SISTEMAS AFECTADOS

RE

SP

IRA

TO

RIO

CA

RD

IO

VA

SC

UL

AR

DIG

ES

TIV

O

NE

RV

IOS

O

UR

INA

RIO

RE

PR

OD

UC

TIV

O

PIE

L

ÓS

EO

HE

MA

TO

PO

YE

TIC

O

ED

EM

A

No

presenta

177 673 335 664 647 643 732 720 588 733

Presenta 564 68 406 77 94 98 9 21 153 8

Total 741 741 741 741 741 741 741 741 741 741

Fuente. El autor

El sistema más afectado fue el respiratorio, pues en el 76,11% de los casos en que se

realizó necropsia se hallaron lesiones. Otro sistema que se vio afectado en la gran

mayoría de las necropsias es el digestivo con 54,79%. Los hallazgos menos

representativos estuvieron en el sistema óseo (2,83%), en piel (1,21%) y el edema que

es una lesión comúnmente reportada en aves de corral apenas fue reportada en el

1,08% de los casos. Es posible que el mejoramiento genético haya incidido en su

disminución.

3.1.9 Diagnóstico Presuntivo. El reporte de la sintomatología presentada, apoyada

algunas veces en las lesiones halladas a la necropsia, generó gran variedad de

diagnósticos presuntivos presentados en la tabla 12.

57

Tabla 12. Diagnósticos presuntivos de los casos recibidos en los LDV – ICA.

DIAGNÓSTICO PRESUNTIVO

DIAGNÓSTICO FRECUENCIA PORCENTAJE

ASPERGILOSIS 1 0,05%

BRONQUITIS – COLIBACILOSIS 1 0,05%

BRONQUITIS - LARINGOTRAQUEITIS –

MICOPLASMOSIS

1 0,05%

BRONQUITIS - MICOPLASMOSIS 1 0,05%

BRONQUITIS –NEWCASTLE 1 0,05%

CARCINOMA DE ESTOMAGO 1 0,05%

CLOSTRIDIUM PERFRINGENS 1 0,05%

COCCIDIA 1 0,05%

CUERPO EXTRAÑO 1 0,05%

ENCEFALOMIELITIS 1 0,05%

GUMBORO - MAREK - LARINGOTRAQUEITIS -

BRONQUITIS

1 0,05%

LEUCOSIS 1 0,05%

MICOPLASMOSIS - STAPHILOCOCO –

STREPTOCOCO

1 0,05%

NEWCASTLE - BRONQUITIS – COLIBACILOSIS 1 0,05%

NEWCASTLE - BRONQUITIS - LARINGOTRAQUEITIS -

GUMBORO

1 0,05%

NEWCASTLE - BRONQUITIS- GUMBORO 1 0,05%

NEWCASTLE - BRONQUITIS- INFLUENZA 1 0,05%

NEWCASTLE - COLIBACILOSIS 1 0,05%

NEWCASTLE - COLIBACILOSIS - MICOPLASMOSIS 1 0,05%

NEWCASTLE - ENCEFALOMIELITIS 1 0,05%

NEWCASTLE - STAPHILOCOCOS 1 0,05%

58

DIAGNÓSTICO PRESUNTIVO

DIAGNÓSTICO FRECUENCIA PORCENTAJE

NEWCASTLE - GUMBORO – BRONQUITIS 1 0,05%

NEWCASTLE - INFLUENZA – BRONQUITIS 1 0,05%

NEWCASTLE - LARINGOTRAQUEITIS – BRONQUITIS 1 0,05%

NEWCASTLE - LARINGOTRAQUEITIS - BRONQUITIS-

INFLUENZA

1 0,05%

NEWCASTLE - LARINGOTRAQUEITIS - SALMONELLA

– INFLUENZA

1 0,05%

NEWCASTLE– LEUCOSIS 1 0,05%

NEWCASTLE– MAREK 1 0,05%

NEWCASTLE - SALMONELLA – COLIBACILOSIS 1 0,05%

NEWCASTLE -INFLUENZA - BRONQUITIS -

LARINGOTRAQUEITIS

1 0,05%

PASTEURELLA - COLIBACILOSIS 1 0,05%

PASTEURELLA - HAEMOPHILUS – MICOPLASMOSIS 1 0,05%

PASTEURELLA - MICOPLASMOSIS 1 0,05%

PSEUDOMONA 1 0,05%

REOVIRUS 1 0,05%

REOVIRUS-MICOPLASMOSIS 1 0,05%

SALMONELLA - COLIBACILOSIS 1 0,05%

SALMONELLA – GUMBORO 1 0,05%

STAPHILOCOCOS 1 0,05%

STAPHILOCOCOS - PSEUDOMONA 1 0,05%

BRONQUITIS – SALMONELLA 2 0,09%

CORIZA 2 0,09%

DESNUTRICION 2 0,09%

LARINGOTRAQUEITIS - BRONQUITIS 2 0,09%

MICOPLASMOSIS 2 0,09%

59

NEUMOVIRUS – BRONQUITIS 2 0,09%

DIAGNÓSTICO PRESUNTIVO

DIAGNÓSTICO FRECUENCIA PORCENTAJE

NEWCASTLE - BRONQUITIS -GUMBORO 2 0,09%

NEWCASTLE - BRONQUITIS INFECCIOSA –

MICOPLASMOSIS

2 0,09%

NEWCASTLE– CORIZA 2 0,09%

NEWCASTLE– HISTOMONIASIS 2 0,09%

NEWCASTLE - INFLUENZA – SALMONELLA 2 0,09%

VIRUELA 2 0,09%

BRONQUITIS – GUMBORO 3 0,14%

BRONQUITIS - LARINGOTRAQUEITIS 3 0,14%

INFLUENZA 3 0,14%

INTOXICACION 3 0,14%

NEWCASTLE - BRONQUITIS – GUMBORO 3 0,14%

NEWCASTLE - BRONQUITIS – INFLUENZA 3 0,14%

MAREK – VIRUELA 4 0,18%

NEWCASTLE– GUMBORO 4 0,18%

NEWCASTLE- BRONQUITIS 4 0,18%

PASTEURELLA 4 0,18%

NEWCASTLE - LARINGOTRAQUEITIS-

INFLUENZA

5 0,23%

NEWCASTLE - BRONQUITIS – LARINGOTRAQUEITIS 6 0,27%

NEWCASTLE - LARINGOTRAQUEITIS 7 0,32%

SALMONELLA 8 0,36%

NEWCASTLE– SALMONELLA 9 0,41%

COLIBACILOSIS 11 0,50%

GUMBORO 15 0,68%

BRONQUITIS 23 1,04%

60

NEWCASTLE– INFLUENZA 54 2,45%

LARINGOTRAQUEITIS 80 3,63%

DIAGNÓSTICO PRESUNTIVO

DIAGNÓSTICO FRECUENCIA PORCENTAJE

NEWCASTLE– BRONQUITIS 137 6,22%

NO REPORTA 219 9,94%

INCONGRUENTE 298 13,52%

NEWCASTLE 430 19,51%

NO APLICA 804 36,48%

Total 2204 100,00%

Fuente. El autor

Esta variable también depende del motivo de solicitud y son muchos los casos que

llegan a los LDV del ICA en los cuales no aplica su reporte, por esta razón se filtró la

base de datos del estudio y arrojó que estos corresponden al 36,48% del total como lo

muestra el Figura 2.

Figura 2. Diagnósticos presuntivos de los casos recibidos en los LDV – ICA

Fuente. El autor

9,94%

36,48%

13,52%

27,00%

11,30%

1,54%

0,23%

40,06%

Diagnóstico Presuntivo NO REPORTA

NO APLICA

INCONGRUENTES

UNICOS

DOBLES

TRIPLES

CUADRUPLES

61

Se observó que el 13,52% del total de casos corresponde a diagnósticos

incongruentes. Si esta proporción se obtuviera de los casos en los que debían ser

reportados (1400) esta cifra sería del 21.29%. Entre otros están aquellos que no tenían

el nombre de una enfermedad como tal o llevaban escrito el nombre de una prueba.

Sumado a esto, se encontró que del total de los casos el 9,94% (15.64% de los que

debían reportar) de los formularios no reportó ningún diagnóstico presuntivo. Este

punto es crítico si se tiene en cuenta que el análisis de la situación de campo por parte

del profesional es fundamental en la conclusión de un diagnóstico.

Frecuencias de diagnósticos únicos fueron del 27% (incluyendo el de ENC con

19,51%), dobles del 11.30% (incluyendo la asociación ENC-IBV con 6,27%). Con tres

diagnósticos asociados se encontró 1.54% de los casos y el 0,23% con cuatro

diferentes diagnósticos presuntivos.

El 31,26% de los casos la enfermedad de Newcastle estuvo comprometida como

diagnóstico presuntivo, es decir en conteo absoluto. De estos, el 19,51% fue reportada

como único diagnóstico presuntivo, el restante 11,75% hace referencia a Newcastle

asociado a otros posibles diagnósticos (Tabla 13).

Tabla 13. Reporte de ENC como diagnóstico presuntivo.

DIAGNÓSTICO PRESUNTIVO DE ENC

ENC ABSOLUTA 31.26%

ENC REPORTE UNICO 19.51%

ENC ASOCIADA 11.75%

Fuente. El autor

La asociación con Influenza Aviar se reportó en 67 casos y en tres ocasiones como

único diagnóstico presuntivo, siendo el país libre de esta enfermedad.

62

Una enfermedad de importancia por su aparición en nuevas zonas del país es la

Laringotraqueitis y aparece como diagnóstico presuntivo en el 3,63% de los casos.

Estas presunciones deben tenerse en cuenta cuando provienen de zonas donde no se

ha presentado la enfermedad.

3.1.10 Vacunas. Las vacunas son un factor importante a tener en cuenta a la hora de

hacer la interpretación de los resultados de las pruebas serológicas, por lo anterior, es

información primordial que debe ser registrada en los formatos de recepción de

muestras, pero en el período analizado ocurrió lo contrario, pues en los casos

analizados en este estudio el reporte es escaso dentro del FURM. El análisis de esta

variable se realizó por tipo de explotación dado que cada una de ellas tiene un plan de

vacunas particular. Iniciando con las granjas de pollo de engorde consolidada en la

Figura 3observamos que el 55.72% del total casos registrados en el período 2009 -

2011 les fue aplicada la vacuna viva de Newcastle (263 casos) y la vacuna de la cual

se reporta menos uso es la oleosa de esta misma enfermedad, sólo 31 casos (Figura

3).

Figura 3. Porcentaje de aplicación de vacunas para la explotación de engorde.

Fuente. El autor

El uso de vacuna recombinante de Newcastle no es utilizada o al menos no se reporta

su uso en ningún caso. Se debe tener en cuenta que este tipo de vacuna en teoría no

0%

20%

40%

60%

80%

100%

55,72%

6,57%

18,01% 20,13%

44,28%

93,43%

81,99% 79,87%

VACUNAS EN FASE DE ENGORDE

VACUNA

NO VACUNA

63

muestra anticuerpos y por lo tanto no serán detectados en pruebas de este tipo. El uso

de las vacunas de Gumboro y Bronquitis Infecciosa corresponde al 20,13% y 18,01%,

respectivamente mostrando un índice bajo en el manejo de estas enfermedades que

son endémicas y de alta incidencia en nuestro medio.

La aplicación de la vacuna contra ENC está reglamentada por el ICA y se debe

socializar esta resolución en campañas que ayuden a la correcta a la aplicación,

manejo del biológico, registro y control de resultados en las explotaciones que lo

ameriten.

La tabla 14 recoge las conductas de la aplicación general de vacunas en explotaciones

de engorde durante el periodo 2009 – 2011, se presentaron 472 casos de los cuales

200 no tuvieron ninguna vacuna o no fue reportada su aplicación.

En 143 casos fue aplicada sólo la vacuna viva de Newcastle y en 4 casos sólo la

oleosa. Únicamente en 56 de los casos se aplicó la vacuna contra las tres

enfermedades y se hizo uso de los cuatro tipos de vacunas en 9 casos.

Tabla 14. Aplicación de vacunas en explotación de engorde.

VACUNAS EN FASE DE ENGORDE

VIVA ENC OLEOSA ENC IBV GUMBORO FRECUENCIA

X 143

X X 27

X X 14

200

X 1

X 4

X X X 3

64

X X X X 9

VACUNAS EN FASE DE ENGORDE

VIVA ENC OLEOSA ENC IBV GUMBORO FRECUENCIA

X X 11

X X 2

X X X 1

X X 1

Fuente. El autor

En la Tabla 15 se muestran los 834 casos de aves en postura ingresados en los LNDV

del ICA durante el período comprendido entre los años 2009 a 2011. La vacuna que

más se aplicó en la etapa de levante es la de Bronquitis Infecciosa con 229 casos, la

que menos se usa es la vacuna oleosa de Newcastle.

Tabla 15. Descripción del tipo de vacuna para la explotación postura en etapa de

levante.

VACUNAS EN POSTURA LEVANTE

VIV

A E

NC

OL

EO

SA

EN

C

IBV

GU

MB

OR

O

VIR

UE

LA

CO

RIZ

A

CO

LE

RA

EN

CE

FA

L

OM

IEL

ITIS

VACUNA 206 17 229 119 81 83 67 47

NO VACUNA 628 817 605 715 753 751 767 787

Total 834 834 834 834 834 834 834 834

Fuente. El autor

Los casos de aves de postura en levante que no aparecen como vacunadas fueron

557.De ellos sólo 65 reportaban estar vacunadas con vacuna viva contra Newcastle y

65

contra la enfermedad de Bronquitis Infecciosa, en 58 casos hay reporte de vacuna de

IBV y 44 tienen el plan vacunal completo.

En la etapa de producción se aplica la vacuna contra la enfermedad de Newcastle,

principalmente es utilizada la cepa viva, esta fue aplicada en 148 de 834 casos (Tabla

16).

Tabla 16. Descripción del tipo de vacuna para la explotación Postura en etapa de

producción.

VACUNAS EN FASE DE POSTURA - PRODUCCION

VIVA ENC OLEOSA ENC

VACUNA 148 6

NO VACUNA 686 828

Total 834 834

Fuente. El autor

El número total de granjas de reproductoras correspondió a 314 casos, de las cuales

295 no reportan ningún tipo de vacuna, mientras que sólo en 4 casos hay reporte del

plan vacunal completo. En 10 ocasiones fue aplicada la vacuna viva de ENC en

producción (Tabla 17). En este punto es importante resaltar que las granjas de

reproductoras que pertenecen a grandes empresas con estándares rigurosos de

bioseguridad no están reportando la información completa en el FURM, en donde no

aparece un esquema de vacunación, lo que podría llevar a pensar que no se aplican

vacunas o que este formato no es un documento confiable.

66

Tabla 17. Aplicación de vacunas en explotación de reproductoras.

VACUNAS EN REPRODUCTORAS

VIV

A E

NC

LE

V

OL

EO

SA

EN

C L

EV

CO

CC

IDIA

AR

TR

ITIS

GU

MB

OR

O

VIR

UE

LA

IBV

MY

CO

PL

AS

MA

PA

ST

EU

RE

LL

A

SA

LM

ON

EL

LA

EN

CE

FA

LO

MIE

LIT

I

S

AN

EM

IA

VIV

A E

NC

PR

OD

FR

EC

UE

NC

IA

295

X X X X X X X X X X X 1

X 10

X X X X X X 1

X 1

X X X X X X X X X X X X 2

X 1

X X 1

X X X X X X X X X X X X X 2

Total 314

Fuente. El autor

De los 373 casos de traspatio registrados durante el período 2009 – 2011, solamente el

2,68% de las aves de combate fue vacunado con la vacuna viva de la enfermedad de

Newcastle, el 0,27% con la vacuna oleosa y el 0,80% contra Viruela. El 7,51% de las

aves criollas fue vacunada con la vacuna viva de Newcastle y el 0,80% con la oleosa

(Tabla 18).

67

Tabla 18. Descripción del tipo de vacuna para el traspatio.

VACUNAS EN TRASPATIO

EXPLOTACIÓN VARIABLE CATEGORÍAS FRECUENCIAS PORCENTAJE

VACUNAS

COMBATE

VIVA ENC NO VACUNA 363 97,32%

VACUNA 10 2,68%

OLEOSA

ENC

NO VACUNA 372 99,73%

VACUNA 1 0,27%

VIRUELA NO VACUNA 370 99,20%

VACUNA 3 0,80%

VACUNAS

TRASPATIO

VIVA ENC NO VACUNA 345 92,49%

VACUNA 28 7,51%

OLEOSA

ENC

NO VACUNA 370 99,20%

VACUNA 3 0,80%

Fuente. El autor

Los casos de otras especies mostradas en la Tabla 19 que fueron recibidas en los LDV

del ICA durante el período en estudio fueron 136,de los cuales 9 reportaron estar

vacunadas contra la enfermedad de Newcastle y las 127 restantes no fue reportada

otra vacuna.

Tabla19. Descripción del tipo de vacuna para otras especies.

VACUNAS EN OTRAS ESPECIES

FRECUENCIA PORCENTAJE

NO VACUNA 127 93,38%

VACUNA 9 6,62%

Total 136 100,00%

Fuente. El autor

68

El porcentaje de otras especies que fueron vacunadas es de 6,62%, las no vacunadas

corresponden al 93,38%. La variedad de especies de aves generó un gran listado

debido a que no se tiene una guía para la clasificación de las mismas. La sugerencia es

ceñirse a la tabla taxonómica.

3.1.11 Muestras. El siguiente análisis hace referencia a los diferentes tipos de muestras

recibidas en los LDV durante el período 2009 – 2011. En el Figura 6 se consolidan las

muestras de forma absoluta en virtud a que un solo caso puede ingresar una o más

muestras según la solicitud de exámenes requeridos. En este estudio se contabilizaron

2933 muestras ingresadas para los 2204 casos registrados.

La tabla 20 muestra la distribución de las frecuencias de las muestras y sus

combinaciones.

Tabla 20. Combinaciones de los tipos de muestras enviadas a los LDV – ICA.

MUESTRAS

SUERO TEJIDO POLLITO

H.

CLOACAL

H.

TRAQUEAL AVE HECES Frec. %

X X X 1 0.05%

X

X

1 0.05%

X X

X 1 0.05%

X

X

1 0.05%

X

X X 1 0.05%

X X X

1 0.05%

X X

X

X

2 0.09%

X X

X

3 0.14%

X

X

3 0.14%

X

X

7 0.32%

X

X 7 0.32%

X

X

8 0.36%

69

MUESTRAS

SUERO TEJIDO POLLITO

H.

CLOACAL

H.

TRAQUEAL AVE HECES Frec. %

X

X

10 0.45%

X

X X

18 0.82%

X X

X

19 0.86%

X

X

19 0.86%

X X

25 1.13%

X

X X

33 1.50%

X

X

41 1.86%

X X

X X

58 2.63%

X X

X

60 2.72%

X

61 2.77%

X

72 3.27%

X

137 6.22%

X 137 6.22%

X X

153 6.94%

X

219 9.94%

X

488 22.14%

X 618 28.04%

Total 993 856 223 330 232 153 146 2204 100.00%

Gran

Total 2933

Fuente. El autor

En 618 de los casos fue enviada como muestra única el suero sanguíneo, los tejidos en

488 casos y el pollito vivo en 219. Presentaron frecuencias iguales las heces y las aves

con 137 casos cada una de ellas. Los hisopos cloacales fueron enviados en 72 de los

casos y los hisopos traqueales en 61.

70

La combinación (doble) más frecuente es el suero con tejidos en 153 ocasiones. Suero,

tejidos e hisopos se enviaron conjuntamente en 58 casos, el suero junto a los hisopos

en 33 y los 2 tipos de hisopos en 25 ocasiones. Una observación importante es que

algunos casos recopilados de los laboratorios seleccionados no tenían reporte de

muestras y en consecuencia sin resultados, de tal manera que fueron excluidos del

estudio. Este hallazgo sugiere que hubo fallas en el registro o en el archivo de estos

casos.

3.1.12 Sexo y edad de las muestras. Con cada muestra se debe reportar el sexo y la

edad correspondiente. Se expresa en días o semanas dependiendo del tipo de

explotación. Se han separado las categorías por tipo de muestra y se realizó un análisis

descriptivo que contiene la distribución de cada una de acuerdo a el sexo del pollo

(cualitativo) y las distribuciones de las edades (cuantitativo) en las cuales se presentan

las edades mínimas, máximas, medias y desviaciones estándar de cada una, tanto

edades por día como por semana.

3.1.13 Sueros

Tabla 21. Relación del sexo en las muestras de suero sanguíneo.

SUERO SANGUíNEO

SEXO FRECUENCIA PORCENTAJE

HEMBRA 431 43,49%

MACHO 48 4,64%

MIXTO 101 10,19%

NR 413 41,68%

Total 993 100,00%

Fuente. El autor

71

Los resultados de la tabla 21 muestran que los sueros sanguíneos en su gran mayoría

correspondieron a las hembras con 431 casos de los 993 recibidos en los LDV.

También se observa que un gran número de casos (413) no reportó el sexo del cual

provenían.

La relación de las proporciones encontrada entre hembras y machos deja claro que las

explotaciones de postura (huevo fértil y de plato) son las que más muestras envían a

los LDV. Los casos en que los sueros pertenecían a lotes mixtos (10%) corresponden

en su gran mayoría al ingreso de pollito de un día, provenientes de las importaciones,

exportaciones o para el análisis de control de calidad de algunas empresas. Cerca del

42% de los casos no reportaron el sexo al cual pertenecían las muestras de suero y

refleja la escasa gestión del formato.

De los 993 casos de muestra en sueros se presentaron 204, los promedios de las

edades fueron de 32 días y medio y 23 semanas aproximadamente con edades entre

1 y 84 días y 3 y 182 semanas. Aunque las edades en días fueron más homogéneas

comparadas con las reportadas en semanas, se presentaron coeficientes de variación

altos lo que significa que existe variabilidad importante en las edades de los animales

muestreados reflejados en la Tabla 22.

Tabla 22. Descripción de edades en las muestras de sueros.

EDAD EN MUESTRAS DE SUEROS

Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación

típica

Coef.

Variación

DIA 204 1,00 84,00 32,47 15,66 48,22

SEM 549 3 182 28,49 23,07 0,81

Fuente. El autor

72

Al observar la distribución de las edades se puede notar que se comportan de maneras

distintas cuando se miden en días y cuando se miden en semanas como lo muestras

los histogramas (Figuras 7 y 8). En el caso de días las edades se distribuyen de forma

casi simétrica y por esa razón el valor promedio se encuentra centrado en el rango de 2

a 84 días de edad (Tabla 23). Este resultado es importante ya que el promedio de edad

sería un segmento representativo para los análisis y resultados de los estudios

epidemiológicos realizados con estas muestras.

Por otro lado en semanas existe una total asimetría, aproximándose más a un

decaimiento exponencial de las edades. Las muestras de sueros se acumulan en las

edades más jóvenes lo que genera un sesgo de la información. La mayoría de las

edades (71.67%) se encuentran entre 1 y 32 semanas y media (Tabla 24). Esta

variabilidad afecta el análisis ya que el promedio no sería un buen representante de la

media, además el sesgo de la distribución muestra que existen algunos datos que no

son comunes en estos casos de edad (edades muy altas). Esto refleja que la inclusión

de aves de ornato como loros, guacamayas y otros alejan el promedio de edad en

semanas por su longevidad y deben ser recategorizados.

Figura 4. Distribución de la edad en semanas días para el suero sanguíneo

Fuente. El autor

0%

5%

10%

15%

20%

25%

30%

35%

40%

45%

0 20 40 60 80

Frec

uen

cia

rela

tiva

DIA

Edad de sueros en dias

73

Figura 5. Distribución de la edad en para el suero sanguíneo

Fuente. El autor

Tabla 23. Intervalos para la edad en días del suero sanguíneo.

INTERVALOS EDAD EN DÍAS

Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa

1 15 28 0,14

15 29 43 0,21

29 43 88 0,43

43 57 41 0,20

57 71 1 0,00

71 85 3 0,01

Fuente. El autor

0%

10%

20%

30%

40%

50%

60%

70%

80%

0 50 100 150 200

Frec

uen

cia

rela

tiva

SEM

Edad de sueros en semanas

74

Tabla 24. Intervalos para la edad en semanas del suero sanguíneo.

INTERVALOS EDAD EN SEMANAS

Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa

1 32,5 388 0,71

32,5 64 116 0,21

64 95,5 39 0,07

95,5 127 0 0,00

127 158,5 5 0,01

158,5 190 1 0,00

Fuente. El autor

3.2 TEJIDOS

El total de muestras de tejido enviados durante el período en estudio a los LDV del ICA

fue de 853, de las cuales el 39.86% corresponde a casos que no reportaron el sexo al

que pertenecen (Tabla 25).

Tabla 25. Relación del sexo en las muestras de tejidos.

TEJIDOS

SEXO FRECUENCIA PORCENTAJE

HEMBRA 254 29,78

MACHO 66 7,74

MIXTO 193 22,63

NR 340 39,86

Total 853 100,00

Fuente. El autor

75

El porcentaje de muestras de tejidos ingresados provenientes de las hembras

corresponde al 29,78%, luego los denominados mixtos con 22,63% y por último, los

tejidos provenientes de machos con el 7,74% del total.

El número de muestras de tejidos de aves cuya edad fue reportada en días es de 333,

de las cuales la edad mínima correspondió a 1 día y la máxima a 57 días, la edad

promedio es de 20,17 días y la desviación corresponde a 17,35. El coeficiente de

variación es equivalente a 86,01%, lo que nos indica que hay mucha variabilidad entre

las edades (Tabla 26).

Tabla 26. Descripción de edades en las muestras de sueros.

EDAD EN MUESTRAS DE TEJIDOS

Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación

típica

Coef.

variación

DIA 333 1,00 57,00 20,17 17,35 86,01

SEM 361 1 196 23,14 21,15 0,91

Fuente. El autor

En los resultados arrojados en las tablas 27 y 28 representados en los histogramas

(Figuras 9 y 10) las edades se encontraron entre 1 y 57 días, y 1 y 196 semanas con

promedios de 20 días y 23 semanas aproximadamente. Estos promedios se

encuentran sesgados hacia la edad mínima en ambos caso, es decir, lejos de la

máxima edad pero notoriamente hay más sesgo en la edad por semanas que en días.

76

Figura 6. Distribución de la edad en semanas días para tejidos.

Fuente. El autor

Figura 7. Distribución de la edad en semanas para tejidos

Fuente. El autor

0

0,05

0,1

0,15

0,2

0,25

0,3

0,35

0,4

0,45

0 10 20 30 40 50 60 70

Frec

uen

cia

rela

tiva

DIA

Edad de tejido en dias

0

0,1

0,2

0,3

0,4

0,5

0,6

0,7

0,8

0 50 100 150 200 250

Frec

uen

cia

rela

tiva

SEM

Edad de tejido en semanas

77

Tabla 27. Intervalos para la edad en días de tejidos.

INTERVALOS EDAD EN DÍAS

Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa

1 11 143 0,43

11 21 19 0,06

21 31 54 0,16

31 41 64 0,19

41 51 48 0,14

51 61 5 0,02

Fuente. El autor

Tabla 28. Intervalos para la edad en semanas de tejidos.

INTERVALOS EDAD EN SEMANAS

Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa

1 34,2 284 0,78

34,2 67,3 61 0,17

67,3 100,5 13 0,36

100,5 133,7 2 0,05

133,7 166,8 0 0,00

166,8 200 1 0,03

Fuente. El autor

Verificando la tabla de frecuencia para la edad por semanas se encontró que

efectivamente existe una edad entre 166 y 200 semanas que esta “halando” la

distribución de estas.

Se decide extraer dos datos, 160 y 120 semanas correspondientes a un ave de

combate y un criollo respectivamente, buscando así describir de manera más precisa la

78

distribución de la información recolectada. En este punto vuelve a ser evidente que el

FURM al no permitir discriminar las distintas explotaciones y solicitar la información

acorde a estas, hace imposible obtener una clasificación y posterior estudio de las

producciones. Los resultados en la nueva información (sin datos atípicos) se presentan

en la tabla 29.

Tabla 29. Descripción de edades en las muestras de tejidos.

EDAD EN MUESTRAS DE TEJIDOS

Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación

típica

Coeficiente

variación

SEM 359 1 104 22,39 18,43 0,82

Fuente. El autor

Sin los datos atípicos, disminuye un poco la variabilidad de la información Además

como se observa en el histograma (Figura 11), se ve de forma más clara la distribución

de las edades con un comportamiento exponencial decreciente en las frecuencias de

las edades encontradas. El valor promedio disminuyó tan solo en 1 semana.

Figura 8. Distribución de la edad en semanas para tejidos.

Fuente. El autor

0

0,05

0,1

0,15

0,2

0,25

0,3

0,35

0,4

0,45

0,5

0 20 40 60 80 100 120

Frec

uen

cia

rela

tiva

SEM

Edad en semanas (sin datos atipicos)

79

3.3 POLLITO

Cuando se desea llevar control epidemiológico en exportaciones, importaciones, control

de calidad del material genético o se sospecha de algún daño en comunidades

extensas de pollos recién nacidos, es común recibir como muestra los pollitos de

edades muy pequeñas. El número de muestras de pollitos enviados a los LDV durante

el 2009 – 2011 corresponde a 223, de los cuales el 52.02% son catalogados como

mixto representando la mayoría del sexo reportado. Aquí el número de edades no

reportadas disminuye con respecto a otro tipo de muestras anteriormente analizadas

aunque sigue siendo representativa como lo muestra la Tabla 30.

Tabla 30. Relación del sexo en las muestras de pollitos.

POLLITO

SEXO FRECUENCIA PORCENTAJE

HEMBRA 51 22,87%

MACHO 7 3,14%

MIXTO 116 52,02%

NR 49 21,97%

Total 223 100,00%

Fuente. El autor

La Tabla 31 muestra que la edad máxima de las muestras de pollitos fue de 10 días, el

promedio de 1,52 evidencia que hay tendencia de los datos hacia las edades menores

lejos del valor extremo mayor. Esta distancia es producida por algún tipo de datos

atípicos o dispersión muy grande, que es lo que en realidad se espera.

80

Tabla 31. Descripción de edades en las muestras de pollito.

EDAD EN MUESTRAS DE POLLITO

Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación

típica

Coef.

variación

DIA 204 1,00 10,00 1,52 1,50 98,00

Fuente. El autor

La distribución de las edades está concentrada en el primer intervalo (1 – 3 días) y en

los demás la cantidad de datos está repartida en valores muy similares, que se

encuentran entre 5 y 11 días (Tabla 32).

Tabla 32. Intervalos para la edad en días de pollitos.

INTERVALOS EDAD EN DÍAS

Límite

inferior

Límite

superior

Frecuencia Frecuencia

relativa

1 3 175 0,86

3 5 18 0,09

5 7 6 0,03

7 9 2 0,01

9 11 3 0,01

Fuente. El autor

Sin embargo, a pesar de que la dispersión es del 98% existe información apreciada

entre 3 y 10 días, que no se toma como atípico porque es normal esta distribución de

edades en estos casos como lo podemos apreciar en el histograma (Figura 12).

81

Figura 9. Distribución de la edad en semanas para pollito.

Fuente. El autor

3.4 HISOPO CLOACAL.

En las muestras de hisopo cloacal tomadas durante el periodo de estudio se

encontraron 330 reportadas en el FURM (Tabla 33) de los cuales el 50,91%, no

reportaron el sexo. De los que si fueron reportados, 100 son muestras provenientes de

hembras que corresponden al 30% del total. Un pequeño 6,36% reportó que la muestra

provenía de machos y 41 casos (12.42) reportaron sexo mixto.

0%

5%

10%

15%

20%

25%

30%

35%

40%

45%

0 2 4 6 8 10 12

Po

rcen

taje

DIA

POLLITO EDAD EN DÍAS

82

Tabla 33. Relación del sexo en las muestras de hisopo cloacal.

HISOPO CLOACAL

SEXO FRECUENCIA PORCENTAJE

HEMBRA 100 30,30%

MACHO 21 6,36%

MIXTO 41 12,42%

NR 168 50,91%

Total 330 100,00%

Fuente. El autor

Las edades se distribuyeron entre 4 y 48 días y entre 4 y 918 semanas. Este último

puede notarse representa un ave de bastante edad, de lo cual se puede deducir que es

algún tipo de especie exótica (Tabla 34).

Tabla 34. Descripción de edades en las muestras de hisopos cloacales.

EDAD EN MUESTRAS DE HISOPOS CLOACALES

Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación

típica

Coef.

variación

DIA 75 4,00 48,00 32,15 12,35 0,38

SEM 196 4 918 38,237 93,162 2,44

Fuente. El autor

El promedio de edades se obtuvo de 32 días y 38 semanas aproximadamente con lo

cual se puede intuir que la edad resaltada anteriormente (918 semanas) se encuentra

muy lejos de la media, siendo así un valor atípico. Esto se puede corroborar

observando las dispersiones ya que en días se tiene una dispersión de 38% sobre 75

individuos mientras que en semanas la dispersión supera el 200%. A continuación se

verán los histogramas correspondientes (Figuras 13 y 14):

83

Figura 10. Distribución de la edad en semanas días para hisopo cloacal

Fuente. El autor

Figura 11. Distribución de la edad en para hisopo cloacal.

Fuente. El autor

Como se afirmó, la edad por semanas presenta un bache de más de 300 semanas

ocasionado por datos muy grandes en comparación al total, mientras que la distribución

de los días es mucho más homogénea. Observemos la tabla de frecuencias de las

edades por días para estudiar esta situación:

0

0,05

0,1

0,15

0,2

0,25

0,3

0,35

0,4

0,45

0,5

0 10 20 30 40 50 60

Frec

uen

cia

rela

tiva

DIA

Edad de hisopo cloacal en dias

0

0,1

0,2

0,3

0,4

0,5

0,6

0,7

0,8

0,9

1

0 200 400 600 800 1000

Frec

uen

cia

rela

tiva

SEM

Edad de hisopo cloacal en semanas

84

Tabla 35. Intervalos para la edad en días de hisopo cloacal.

Fuente. El autor

Las frecuencias encontradas están casi en su totalidad entre 1 y 154 semanas, tan solo

2 entre 154 y 460 y otras 2 con valores muy superiores (Tabla 35).

Revisando los datos originales, se encontraron 3 edades muy superiores a las demás

que fueron de 364, 864 y 918 semanas. Para lograr una descripción más precisa, es

conveniente extraer estos tres puntos y repasar el comportamiento de los otros 193:

Tabla 36. Descripción de edades en las muestras de hisopos cloacales.

EDAD EN MUESTRAS DE HISOPO CLOACAL

Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación típica Coef.

Variación

SEM 193 4 156 27,712 23,834 0,86

Fuente. El autor

Como se predijo, con los 193 datos restantes la edad máxima es de 156 semanas y la

variabilidad es ahora casi aceptable (86%) sobre este conjunto de datos. El histograma

(Figura 15) muestra cómo se distribuyen las edades en este rango disminuyendo las

INTERVALO EDAD EN DÍAS

Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa Densidad

1,00 154,17 192 0,980 0,006

154,17 307,33 1 0,005 0,000

307,33 460,50 1 0,005 0,000

460,50 613,67 0 0,000 0,000

613,67 766,83 0 0,000 0,000

766,83 920,00 2 0,010 0,000

85

frecuencias de manera progresiva lo que nos permite capturar como se encuentran los

datos sobre el total.

Figura 12. Distribución de la edad en semanas para hisopo cloacal

Fuente. El autor

3.5 HISOPO TRAQUEAL

El total de muestras de hisopos traqueales fue de 232, de las cuales

144correspondiente al 62%, no reportaron el sexo del cual provenían, las muestras de

hembras son 49, de mixtos 35 y de machos solamente 4 (Tabla 37).

Tabla 37. Relación del sexo en las muestras de hisopo traqueal.

HISOPO TRAQUEAL

SEXO FRECUENCIA PORCENTAJE

HEMBRA 49 21,12

MACHO 4 1,72

MIXTO 35 15,09

NR 144 62,07

Total 232 100,00

Fuente. El autor

0

0,1

0,2

0,3

0,4

0,5

0,6

0,7

0 50 100 150

Frec

uen

cia

rela

tiva

SEM

Edad de hisopo cloacal por semana (sin datos atipicos)

86

De los 232 casos con muestra de hisopo traqueal, sólo 43 reportan la edad en días, las

edades están entre 3 y 48 días, el promedio corresponde a 31,88 días, la desviación

típica es de 11,41 días y el coeficiente de variación equivale a 35,80%, siendo el valor

más bajo hallado en el análisis de los distintos tipos de muestras, lo que indica que la

muestra de hisopo traqueal en días es la que presenta menor variabilidad en las

edades (Tabla 38).Por el contrario, el reporte por semanas se puede observar un valor

extremo (156) que se encuentra muy distante del valor promedio lo cual genera grana

dispersión (81.30%) de esta información.

Tabla 38. Descripción de edades en las muestras de hisopos traqueales.

EDAD EN MUESTRAS DE HISOPOS TRAQUEALES

Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación

típica

Coef.

Variación

DIA 43 3 48 31,884 11,415 0,358

SEM 146 4 156 25,798 20,981 0,813

Fuente. El autor

Aunque este valor de variabilidad es similar al de hisopo cloacal en semanas, se decide

revisar las frecuencias presentes para los datos en busca de posibles valores atípicos

antes de presentar los histogramas presentados en la tabla 39.

Tabla 39. Intervalos para la edad en semanas de hisopo traqueal.

INTERVALO EDAD EN SEMANAS

Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa Densidad

1 27,5 92 0,630 0,024

27,5 54 41 0,281 0,011

54 80,5 12 0,082 0,003

80,5 107 0 0,000 0,000

107 133,5 0 0,000 0,000

133,5 160 1 0,007 0,000

Fuente. El autor

87

Como se puede observar, existe un vacío de información entre 80 y 133 semanas

generado por un dato atípico que debe ser el valor extremo para esta variable.

Extrayendo el dato y revisando la distribución de la edad en semanas se observa lo

siguiente.

Tabla 40. Descripción de edades en las muestras de hisopos cloacales.

EDAD EN MUESTRAS DE HISOPO TRAQUEAL

Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación

típica

Coef.

Variación

SEM 145 4 80 24,900 18,020 0,724

Fuente. El autor

La máxima edad encontrada es de 80 semanas no muy lejano del promedio (25 sem

aprox) lo que reduce considerablemente la dispersión. Para concluir si el promedio es

un buen representante o no de la variable se puede analizar los Figuras16 y

17(histogramas) de distribución de frecuencias:

Figura 13. Distribución de la edad en días para hisopo traqueal.

Fuente. El autor

0

0,05

0,1

0,15

0,2

0,25

0,3

0,35

0 10 20 30 40 50

Frec

uen

cia

rela

tiva

DIA

Edad de Hisopo Traqueal en dias

88

Figura 14. Distribución de la edad en semanas para hisopo traqueal

Fuente. El autor

A diferencia que las muestras anteriores, las edades por día aumentan su frecuencia a

medida que aumenta la edad de las aves a las cuales se les toman hisopos traqueales.

En cambio, la edad en semanas mantiene su estructura descendente con la diferencia

de que en este caso la disminución no es exponencial sino lineal.

3.6 AVE

El total de casos que contenían como muestra aves completas es de 153. La mayor

representación es de las hembras con que corresponde al 57% de los casos y la menor

cantidad fueron las muestras de mixtos con 20 casos que es el 14% del total. (Tabla

41)

0

0,05

0,1

0,15

0,2

0,25

0,3

0,35

0 20 40 60 80

Frec

uen

cia

rela

tiva

SEM

Edad de Hisopo traqueal en semanas (sin dato atípico)

89

Tabla 41. Relación del sexo en las muestras de ave.

AVE

SEXO FRECUENCIA PORCENTAJE

HEMBRA 87 56,86

MACHO 21 13,73

MIXTO 20 13,07

NR 25 16,34

Total 153 100,00

Fuente. El autor

Tabla 42. Descripción de edades en las muestras de ave.

EDAD EN MUESTRAS DE AVES

Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación

típica

Coeficiente

variación

DIA 44 1,00 98,00 28,95 18,70 64,58

SEM 96 2 82 29,156 18,733 64.20

Fuente. El autor

El promedio de días fue de 29 días y 29 semanas (aprox) sin embargo, no se podría

referenciar el conjunto total de individuos con estos valores ya que existe una

dispersión grande de los datos la cual se puede medir observando el coeficiente de

variación que representa variabilidad del 64% en ambos casos. Con esta información

no es suficiente leer el comportamiento de las edades de estas muestras, por lo cual se

revisaran los histogramas. (Figuras 15 y 16)

90

Figura 15. Distribución de la edad en días para ave

Fuente. El autor

Figura 16. Distribución de la edad en semanas para ave.

Fuente. El autor

0

0,05

0,1

0,15

0,2

0,25

0,3

0,35

0,4

0 20 40 60 80 100 120

Frec

uen

cia

rela

tiva

DIA

Edad de Aves por dia

0

0,05

0,1

0,15

0,2

0,25

0,3

0,35

0,4

0 20 40 60 80

Frec

uen

cia

rela

tiva

SEM

Edad de Aves por semana

91

Tabla 43. Intervalos para la edad en días de ave.

INTERVALOS EDADES EN DÍAS

Límite

inferior

Límite

superior

Frecuencia Frecuencia

relativa

1 18 12 0,27

18 35 17 0,39

35 52 11 0,25

52 69 3 0,07

69 86 0 0,00

86 103 1 0,02

Fuente. El autor

Tabla 44. Intervalos para la edad en semanas de ave.

INTERVALOS EDADES EN SEMANAS

Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa

1,00 14,67 22 0,23

14,67 28,33 37 0,39

28,33 42,00 17 0,18

42,00 55,67 8 0,08

55,67 69,33 7 0,07

69,33 83,00 5 0,05

Fuente. El autor

Ambas mediciones (días y semanas) muestran una fuerte acumulación de edades en

los valores más pequeños, lo que explica la posición de la media respecto a los valores

extremos (sesgo) y los altos coeficientes de variación. Además la disminución de casos

con edades más grandes de forma progresiva (parte derecha del histograma) permite

92

deducir que es normal que las muestras de aves sean más comunes las jóvenes que

de altas edades.

3.7 HECES

Las muestras de heces enviadas a los laboratorios del ICA correspondieron a 146

casos. (El 85,6% hace referencia a las muestras provenientes de las hembras, que

corresponde a 125 casos, el 8,9% pertenece a los casos en los cuales no se reportó el

sexo, el 4,2% corresponde a los 6 casos de mixtos y sólo se presentaron 2 casos de

machos con el 4% (Tabla 45).

Tabla 45. Relación del sexo en las muestras de heces.

HECES

SEXO FRECUENCIA PORCENTAJE

HEMBRA 125 85,62%

MACHO 2 1,37%

MIXTO 6 4,11%

NR 13 8,90%

Total 146 100,00%

Fuente. El autor

Las edades se presentaron entre 1 y 56 días y de 2 a 36 semanas respectivamente y

con promedios de 29,3 días y 8.2 semanas. Pero se puede ver que la dispersión no es

coherente para las semanas. Observando el coeficiente de variación para este caso, es

superior a 1 (100%) que indica una dispersión total de los datos. De esta forma no es

posible tener en cuenta que las muestras son en promedio de 8.2 semanas (Tabla 46).

93

Tabla 46. Descripción de edades en las muestras de heces.

EDAD EN MUESTRAS DE HECES

Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación

típica

Coeficiente

variación

DIA 122 1,00 56,00 29,33 12,02 0,4098

SEM 15 2 36 8,200 8,809 1,074

Fuente. El autor

Como se observa en los histogramas (Figuras 17 y 18), en el caso de semanas tiene

un “bache” lo que puede estar ocasionando la dispersión tan grande que se observa en

el coeficiente. La causa de esto puede ser la existencia de datos atípicos en el conjunto

de edades que, aunque solo son 15, deben presentar este tipo de datos.

Figura 17. Distribución de la edad en días para heces.

Fuente. El autor

0

0,05

0,1

0,15

0,2

0,25

0,3

0,35

0,4

0,45

0 10 20 30 40 50 60 70

Frec

uen

cia

rela

tiva

DIA

Edad de heces por dias

94

Figura 18. Distribución de la edad en semanas para heces.

Fuente. El autor

Observemos la tabla de frecuencia:

Tabla 47. Intervalos para la edad en semanas para heces.

INTERVALOS EDAD EN SEMANAS

Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa Densidad

1 8 11 0,733 0,105

8 15 2 0,133 0,019

15 22 1 0,067 0,010

22 29 0 0,000 0,000

29 36 0 0,000 0,000

36 43 1 0,067 0,010

Fuente. El autor

La tabla muestra que es existe un bache entre 22 y 36 semanas generado por un dato

que se encuentra entre 36 y 43 semanas. El análisis realizado extrayendo dicho dato

del conjunto mejoraría significativamente la descripción de los mismos. A continuación

se presentara el análisis sin este dato.

0

0,1

0,2

0,3

0,4

0,5

0,6

0,7

0,8

0 10 20 30 40 50

Frec

uen

cia

rela

tiva

SEM

Edad de Heces por semana

95

Tabla 48. Descripción de edades en las muestras de heces.

EDAD EN MUESTRAS DE HECES

Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación

típica

Coeficiente

Variación

SEM

14

2

20

6,214

4,458

0,717

Fuente. El autor

Extrayendo un dato correspondiente a 36 semanas se puede observar que los datos,

aun bien dispersos, mejoran considerablemente su distribución. Por esto se decide

describir la variable de esta forma pues existen pocos datos para realizar ajustes más

detallados (extraer más datos).

Figura 19. Distribución de la edad en semanas para heces.

Fuente. El autor

0

0,1

0,2

0,3

0,4

0,5

0,6

0,7

0 5 10 15 20 25 30

Frec

uen

cia

rela

tiva

SEM

Edad de Heces por semanas

96

La nueva media es de 6 semanas aproximadamente con una variabilidad de 71% sobre

los datos (Figura 19).

3.8 LABORATORIO DE ENVÍO

La tabla 49 muestra la participación de los laboratorios en el ingreso de los casos que

se recopilaron para este estudio. Los casos que llegan con remisión al CEISA incluyen

muestras para efectuar pruebas que en los laboratorios regionales no se realizan.

Tabla 49. Participación de los departamentos en el ingreso de casos a los LDV – ICA.

LABORATORIOS DE ENVÍO

LABORATORIO FRECUENCIA PORCENTAJE

La Dorada 1 0,05%

Aguachica 3 0,14%

Sogamoso 6 0,27%

Sincelejo 7 0,32%

Arauca 10 0,45%

Cartagena 11 0,50%

Cúcuta 19 0,86%

Florencia 19 0,86%

Manizales 24 1,09%

Pasto 25 1,13%

Popayán 25 1,13%

Valledupar 27 1,23%

Montería 28 1,27%

Bello 35 1,59%

Villavicencio 36 1,63%

Yopal 36 1,63%

Bucaramanga 46 2,09%

97

LABORATORIOS DE ENVÍO

LABORATORIO FRECUENCIA PORCENTAJE

Barranquilla 47 2,13%

Neiva 71 3,22%

Armenia 75 3,40%

Cali 134 6,08%

Ibagué 239 10,84%

Bogotá 479 21,73%

Tuluá 801 36,34%

Total 2204 100,00%

Fuente. El autor

El caso debe llegar con toda la información manifiesta en el FURM y es foliado de

acuerdo a la gestión de las tablas de retención documental ordenada por la ley.

El laboratorio que recibe la mayor cantidad de muestras es el de Tuluá, ya que recopiló

el 36,34% del total de los casos, le sigue CEISA - Bogotá con 21,73% e Ibagué

10,84%. Los demás laboratorios hicieron un aporte menor al 10% a la casuística en el

período 2009 – 2011.

Figura 20. Porcentaje de muestras procesadas por LDV – ICA.

Fuente. El autor

77,17%

0,18%

22,66%

Pruebas realizadas por laboratorio

CEISA IBAGUE TULUA

98

El laboratorio que procesó mayor cantidad de muestras fue el CEISA con el 77,17%, le

sigue el laboratorio de Tuluá con 22,66% y en tercer lugar está Ibagué con sólo el

0,18% (Figura 20).

3.9 TRATAMIENTO

Los resultados del análisis de la aplicabilidad y la implementación de tratamientos en

las distintas explotaciones aviares durante el período en estudio se aprecian en la tabla

50.

Tabla 50. Implementación de tratamientos.

TRATAMIENTO

FRECUENCIA PORCENTAJE

NO APLICA 501 22,73%

SI 164 7,44%

NO 1539 69,83%

Total 2204 100,00%

Fuente. El autor

Para 501 casos del total (22,73%) no aplica la variable tratamiento por estar ligada al

motivo de solicitud. En el resto de casos que corresponde al77,27% los cuales

presentaban signos clínicos, sólo un 7,44% fueron tratados con medicamentos,

mientras que la mayoría de ellos (69,83%) no tuvieron ningún tipo de tratamiento.

Queda claro que no existe una información completa y veraz en el tema de la

formulación de fármacos. Es posible que sea un fenómeno cultural ligado a que es un

ente de control sanitario quien solicita esta información y los usuarios no admitan el uso

de medicamentos que deben tener registro y tiempo de retiro.

99

3.10 POBLACIÓN

La variable población total de aves de las granjas u otros sitios de donde provienen las

muestras durante los años 2009 – 2011 se muestra en la Tabla 51. De los 2204 casos

incluidos en el estudio solamente 1639 debían reportar el total de la población del lugar

de procedencia y1090 casos correspondientes al 66,50% lo hicieron y los que no, es

decir, el 33,50% aparece en blanco la casilla correspondiente en el FURM.

Tabla 51. Reporte de población total de los lugares de procedencia.

POBLACIÓN

FRECUENCIA PORCENTAJE

REPORTA 1090 66,50%

NO REPORTA 549 33,50%

Total 1639 100,00%

Fuente. El autor

Figura 21. Distribución de la población total de aves.

Fuente. El autor

0

0,000002

0,000004

0,000006

0,000008

0,00001

0,000012

0,000014

0,000016

0 50000 100000 150000 200000 250000 300000 350000

Frec

uen

cias

TOTAL

Poblaciòn de aves

100

Tabla 52. Intervalos de la población total.

INTERVALOS POBLACIÓN TOTAL

Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa

1 55.000 912 0,84

55.000 110.000 127 0,12

110.000 165.000 32 0,03

165.000 220.000 11 0,01

220.000

275.000 2 0,00

275.000 330.000 6 0,01

Fuente. El autor

En el Figura 21 se observa que la mayoría de los datos de la población total se

concentran en el primer intervalo, que corresponde poblaciones entre 1 y 55.000 aves,

el número de casos es de 912 y el porcentaje respectivo es 84% (Tabla 52). Granjas

con población mayor a 50.000 aves son poco comunes como se demuestra con el

análisis.

Este estudio se puede hacer más estricto si se logran separar las granjas registradas,

el tipo de explotación y solicitudes de particulares que tienen aves como mascotas

entre otras.

3.11 PRUEBAS DE LABORATORIO

Las pruebas de laboratorio fueron catalogadas por enfermedad para su análisis. De

esta manera se hallaron las frecuencias, porcentajes y resultados arrojados en cuanto

a si fue identificado el agente o no.

101

3.12 NEWCASTLE -ENC

El examen para la ENC solicitado con mayor frecuencia es la inhibición de la

hemaglutinación (HI) con 1012 casos, le siguen las pruebas moleculares con 725 casos

y por último el aislamiento viral con 700 casos. El número total de pruebas realizadas

para esta enfermedad fue de 2437. El laboratorio que procesó mayor cantidad de

muestras fue CEISA- Bogotá con 2010 casos (Tabla 53).

Tabla 53. Laboratorios y pruebas realizadas para ENC.

PRUEBAS PARA ENC

PRUEBA CEISA TULUÁ TOTAL

FREC.

TOTAL %

FREC. % FREC. %

Molecular 721 29,59% 4 0,16% 725 29,75%

Serología HI 597 24,50% 415 17,03% 1012 41,53%

Virología -

Aislamiento

692 28,40% 8 0,33% 700 28,72%

Total 2010 82,48% 427 17,52% 2437 100,00%

Fuente. El autor

De las 2437 muestras procesadas para ENC el 82,48% se realizó en CEISA- Bogotá y

el 17,52% restante se procesó en el laboratorio de Tuluá. El porcentaje de HI

solicitados fue 41,53%, las pruebas moleculares tuvieron el 39,75% y el aislamiento

28,72%.

Las pruebas realizadas para ENC tuvieron 1885 resultados negativos, de los cuales

919 correspondieron a la serología, 521 a virología y 445 a pruebas moleculares. De

los 552 resultados positivos, 280 son de pruebas moleculares, 179 de aislamiento viral

y 93 de serología HI (Tabla 54).

102

Tabla 54. Resultados de las pruebas realizadas para ENC.

FRECUENCIA DE CASOS DE ENC POR PRUEBA

DIAGNÓSTICA

PRUEBA N P TOTAL

Molecular 445 280 725

Serología HI 919 93 1012

Virología-Aislamiento 521 179 700

Total 1885 552 2437

Fuente. El autor

Con estos resultados vemos que la incidencia de la ENC es baja si observamos que

solo el 22.7% de los resultados de los exámenes son positivos. Esto coincide con los

resultados del estudio de prevalencia realizado por el ICA en este mismo periodo,

demostrando que esta enfermedad está siendo controlada y que son otros los agentes

causantes del síndrome respiratorio.

3.13 BRONQUITIS INFECCIOSA AVIAR – IBV

Para Bronquitis Infecciosa (IBV) se realizaron 490 pruebas en total. La prueba más

realizada fue ELISA con 254 casos, le siguen las pruebas moleculares con 227 casos,

inhibición de la hemaglutinación y el aislamiento viral tuvieron 7 y 2 casos

respectivamente. El laboratorio que más procesó muestras fue el CEISA con 363

pruebas y Tuluá realizó 127 pruebas.

103

Tabla 55. Laboratorios y pruebas realizadas para IBV.

PRUEBAS PARA IBV

PRUEBA CEISA TULUÁ TOTAL

FREC.

TOTAL

% FREC. % FREC. %

Virología - Aislamiento 2 0,41% 0 0,00% 2 0,41%

Molecular 226 46,12% 1 0,20% 227 46,33%

Serología HI 6 1,22% 1 0,20% 7 1,43%

Serología ELISA 129 26,33% 125 25,51% 254 51,84%

Total 363 74,08% 127 25,92% 490 100,00%

Fuente. El autor

El CEISA- Bogotá procesó el 74,08% de las muestras y el laboratorio de Tuluá el

25,92%. El porcentaje de ELISA corresponde al 51,84% de los casos, las pruebas

moleculares son el 46,33%, HI el 1,43% y el aislamiento viral el 0,41% (Tabla 55). Las

pruebas negativas para IBV fueron 165, las que tuvieron resultado positivo

corresponden a 325, de las cuales 238 fueron de ELISA, 82 de pruebas moleculares y

5 de serología HI (Tabla 56).

Tabla 56. Resultados de las pruebas realizadas para IBV.

FRECUENCIA DE CASOS DE IBV POR PRUEBA DIAGNÓSTICA

PRUEBA N P TOTAL

Virología - Aislamiento 2 0 2

Molecular 145 82 227

Serología HI 2 5 7

Serología ELISA 16 238 254

Total 165 325 490

Fuente. El autor

104

El 66.3% de resultados positivos revelan la magnitud de esta enfermedad en Colombia.

Esto es revelador si tenemos en cuenta que muchos de los exámenes provienen de

diagnósticos diferenciales cuyo costo es asumido por los usuarios y muchos de ellos

son pequeños productores (como se vio anteriormente en la variable identificación del

usuario) que no tienen la capacidad económica para solicitar este examen.

3.14 LARINGOTRAQUEITIS INFECCIOSA AVIAR – ILT

Del total de muestras procesadas para ILT el 51,37% fueron serologías, el 30,49%

correspondió a pruebas moleculares y el 18,13% a virología. El 96,43% de las

muestras fueron procesadas en el CEISA- Bogotá y solamente el 3,57% en el

laboratorio de Tuluá (Tabla 57).

Tabla 57. Laboratorios y pruebas realizadas para ILT.

PRUEBAS PARA ILT

PRUEBA CEISA TULUÁ TOTAL

FREC.

TOTAL

% FREC. % FREC. %

Molecular 109 29,95% 2 0,55% 111 30,49%

Serología ELISA 177 48,63% 10 2,75% 187 51,37%

Virología - Aislamiento 65 17,86% 1 0,27% 66 18,13%

Total 351 96,43% 13 3,57% 364 100,00%

Fuente. El autor

Las pruebas para ILT cuyo resultado fue negativo fueron 149 y las positivas 215. Para

ELISA el número de negativas fue 22 y positivas 165, de las pruebas moleculares 66

fueron negativas y 45 positivas, el aislamiento viral dio 61 resultados negativos y 5

positivos (Tabla 58).

105

Tabla 58. Resultados de las pruebas realizadas para ILT.

FRECUENCIADE CASOS DE ILT POR PRUEBA

DIAGNÓSTICA

PRUEBA N P TOTAL

Molecular 66 45 111

Serología ELISA 22 165 187

Virología - Aislamiento 61 5 66

Total 149 215 364

Fuente. El autor

Los resultados positivos fueron el 59% de las muestras examinadas, quiere decir esto

que no es una enfermedad fácilmente identificable y que su sintomatología no

presenta indicios concluyentes que permitan un diagnóstico presuntivo certero.

3.15 GUMBORO – BURSITIS INFECCIOSA AVIAR – IBD

Las pruebas para IBD fueron realizadas únicamente en el CEISA- Bogotá y

corresponden a 110 casos, 62 de ellos son pruebas moleculares, 42 son ELISAs y sólo

se realizó un aislamiento viral. El porcentaje de pruebas moleculares corresponde al

60,91% de los casos, sigue ELISA con 38,18% y por último el aislamiento viral con el

0,91% (Tabla 59).

106

Tabla 59. Laboratorios y pruebas realizadas para Gumboro.

PRUEBAS PARA GUMBORO

PRUEBA CEISA TOTAL FREC. TOTAL %

FREC. %

Virología – Aislamiento 1 0,91% 1 0,91%

Molecular 67 60,91% 67 60,91%

Serología ELISA 42 38,18% 42 38,18%

Total 110 100,00% 110 100,00%

Fuente. El autor

Las pruebas negativas son 37 y las positivas son 73, de estas 38 corresponden a

ELISA y 35 a pruebas moleculares (Tabla 60).

Tabla 60. Resultados de las pruebas realizadas para Gumboro.

FRECUENCIA DE CASOS DE GUMBORO POR PRUEBA DIAGNÓSTICA

PRUEBA N P TOTAL

Virología – Aislamiento 1 0 1

Molecular 32 35 67

Serología ELISA 4 38 42

Total 37 73 110

Fuente. El autor

Esta enfermedad tiene control vacunal y es costumbre entre los productores

suministrarla en las diferentes explotaciones. La prueba de ELISA se usa para

establecer los perfiles de anticuerpos y aunque es la prueba más solicitada su

demanda de servicio al ICA no es tan alta para satisfacer el gran número de usuarios

registrados. Es posible que estos estudios sean realizados en otros laboratorios, dato

que se podrá obtener cuando estos reporten sus resultados.

107

3.16 INFLUENZA AVIAR – IA

El porcentaje correspondiente a las pruebas realizadas en el CEISA - Bogotá es de

80,51% y en Tuluá es de 19,43%. La virología tuvo una participación del 31,93% del

total de las pruebas, ELISA el 28,28%, las pruebas moleculares se realizaron en un

22,32% y HI en el 17,41% (Tabla 61).

Tabla 61. Laboratorios y pruebas realizadas para Influenza.

PRUEBAS PARA INFLUENZA

PRUEBA CEISA TULUÁ TOTAL

FREC.

TOTAL %

FREC. % FREC. %

Molecular 465 22,32% 0 0,00% 465 22,32%

Serología 555 26.65% 398 19.11% 953 45.75%

Virología - Aislamiento 657 31,54% 8 0,38% 665 31,93%

Total 1677 80,51% 406 19,49% 2083 100,00%

Fuente. El autor

El total de las 2083 muestras procesadas para Influenza tuvieron resultado negativo

(Tabla 62).

Tabla 62. Resultados de las pruebas realizadas para Influenza.

FRECUENCIA DE CASOS DE INFLUENZA POR PRUEBA DIAGNÓSTICA

PRUEBA N TOTAL

Molecular 465 465

Serología ELISA 589 589

Serología HI 364 364

Virología - Aislamiento 665 665

Total 2083 2083

Fuente. El autor

108

Aunque fue diagnosticada presuntivamente en unos cuantos casos (70), la gran

cantidad de pruebas reportadas en este estudio corresponde a políticas de control

oficial ligadas a la estricta vigilancia de esta enfermedad. Cuando ingresa una serología

asociada a ENC se corre paralela la prueba de IA para aprovechar la muestra y el

recurso de laboratorio.

3.17 MYCOPLASMA

El número de pruebas realizadas para Micoplasma fue 93, de las cuales 87 fueron

pruebas moleculares y sólo 6 cultivos. El total de muestras se procesaron en el CEISA-

Bogotá (Tabla 63).El porcentaje de pruebas moleculares realizadas para el diagnóstico

de Micoplasma fue 93,55% y los cultivos corresponden al 6,45%

Tabla 63. Laboratorios y pruebas realizadas para Micoplasma.

PRUEBAS PARA MICOPLASMA

PRUEBA CEISA TOTAL FREC. TOTAL %

FREC. %

Cultivo 6 6,45% 6 6,45%

Molecular 87 93,55% 87 93,55%

Total 93 100,00% 93 100,00%

Fuente. El autor

Los resultados negativos para Micoplasma fueron 83, de estos 6 corresponden a

cultivos y 77 a pruebas moleculares, los 10 resultados positivos fueron de pruebas

moleculares (Tabla 64).

109

Tabla 64. Resultados de las pruebas realizadas para Micoplasma.

FRECUENCIA DE CASOS DE MICOPLASMA POR

PRUEBA DIAGNÓSTICA

PRUEBA N P TOTAL

CULTIVO 6 0 6

MOLECULAR 77 10 87

Total 83 10 93

Fuente. El autor

La frecuencia positiva de este patógeno es baja. Este agente no es muy común

encontrarlo como causa primaria de enfermedad y su efecto no es de alta

patogenicidad, estas razones influyen en las pocas solicitudes de identificación por los

usuarios corrientes. Sin embargo, para las importaciones de material genético y las

exportaciones de productos avícolas es un requisito y aquí se ve reflejada esa

actividad.

3.18 SALMONELLA

El total de muestras procesadas para Salmonella es de 315, de ellas 312 corresponden

a cultivos y sólo 3 a tipificación. El CEISA – Bogotá fue el laboratorio que más recibió

muestras para su procesamiento, 224 fue el número correspondiente, mientras que el

laboratorio de Tuluá sólo procesó 91 (Tabla 65).

110

Tabla 65. Laboratorios y pruebas realizadas para Salmonella.

PRUEBAS PARA SALMONELLA

PRUEBA CEISA TULUÁ TOTAL

FREC.

TOTAL %

FREC. % FREC. %

Cultivos 222 70,48% 90 28,57% 312 99,05%

Tipificación 2 0,63% 1 0,32% 3 0,95%

Total 224 71,11% 91 28,89% 315 100,00%

Fuente. El autor

El porcentaje de cultivos realizados para Salmonella fue 99,05%, mientras que la

tipificación fue solamente el 0,95%. Las pruebas realizadas en el CEISA- Bogotá

corresponden al 77,11% y las realizadas en Tuluá al 28,89% (Tabla 65).

Los resultados negativos para Salmonella fueron 304, de estos 303 corresponden a los

cultivos y sólo 1 a tipificación, los resultados positivos fueron solamente 11, de los

cuales 9 eran de cultivos y 2 de tipificación (Tabla 66).

Tabla 66. Resultados de las pruebas realizadas para Salmonella.

FRECUENCIA DE CASOS DE SALMONELLA POR PRUEBA DIAGNÓSTICA

PRUEBA N P TOTAL

CULTIVOS 303 9 312

TIPIFICACIÓN 1 2 3

Total 304 11 315

Fuente. El autor

111

Aunque las pruebas de identificación de salmonella son comunes y se deberían realizar

en todos los LDV por su importancia en la salud pública, se ven pocos casos que estén

por fuera de los controles a que son sometidos los procesos de importaciones y

exportaciones, al igual que toda la gama de explotaciones de genética.

3.19 PASTEURELLA

Para Pasteurella únicamente se realizaron 68 cultivos, de ellos 48 se realizaron en el

CEISA - Bogotá, 19 en el laboratorio de Tuluá y en Ibagué se realizó un solo cultivo

(Tabla 67).

Tabla 67. Laboratorios y pruebas realizadas para Pasteurella.

PRUEBAS PARA PASTEURELLA

PRUEBA CEISA IBAGUÉ TULUÁ TOTAL

FREC.

TOTAL

% FREC. % FREC. % FREC. %

Cultivos 48 70,59% 1 1,47% 19 27,94% 68 100,00%

Total 48 70,59% 1 1,47% 19 27,94% 68 100,00%

Fuente. El autor

El porcentaje correspondiente a cada laboratorio es de 70,59% para el CEISA, 27,94%

para Tuluá y el 1,47% para Ibagué (Tabla 67).

De los 68 cultivos realizados para Pasteurella tuvieron resultado negativo 58 casos y

positivo en 10 casos (Tabla 68).

112

Tabla 68. Resultados de las pruebas realizadas para Pasteurella.

FRECUENCIA DE CASOS DE PASTEURELLA POR PRUEBA DIAGNÓSTICA

PRUEBA N P TOTAL

CULTIVOS 58 10 68

Total 58 10 68

Fuente. El autor

Se realizaron 22 cultivos para Haemophilus, de estos 10 se efectuaron en el CEISA y

12 en Tuluá (Tabla 68).

Estas pruebas son económicas y ayudan a identificar la asociación del patógeno en el

síndrome respiratorio. La baja positividad en los resultados revela que no es tan

incidente y por su condición de bacteria puede ser controlada con antibióticos

3.20 AEMOPHILUS GALLINARUM – CORIZA

El 54,55% de los cultivos para Haemophilus se practicaron en el laboratorio de Tuluá y

el 45,45% en el CEISA (Tabla 69).

Tabla 69. Laboratorios y pruebas realizadas para Haemophilus.

PRUEBAS PARA HAEMOPHILUS

PRUEBA CEISA TULUÁ TOTAL

FREC.

TOTAL %

FREC. % FREC. %

Cultivos 10 45,45% 12 54,55% 22 100,00%

Total 10 45,45% 12 54,55% 22 100,00%

Fuente. El autor

113

Los cultivos dieron resultado negativo en 21 casos y positivo en sólo un caso (Tabla

70).

Tabla 70. Resultados de las pruebas realizadas para Haemophilus.

FRECUENCIA DE CASOS DE HAEMOPHILUS POR

PRUEBA DIAGNÓSTICA

PRUEBA N P TOTAL

CULTIVOS 21 1 22

Total 21 1 22

Fuente. El autor

Esta enfermedad tiene varios subtipos y existe vacuna para el caso de H Sinoviae que

en las explotaciones de reproductoras son de obligada administración dentro del plan

de manejo. Estos resultados reflejan que no es del usuario común solicitar este

examen.

3.21 E. COLI

Para la identificación de E. Coli se realizaron en total 268 pruebas, de estas 266

corresponden a cultivos y 2 a tipificación. La mayor cantidad de pruebas se hizo en el

CEISA con 198, le sigue Tuluá con 69 y por último está Ibagué con un solo caso.

(Tabla 71).

114

Tabla 71. Laboratorios y pruebas realizadas para E. Coli.

PRUEBAS PARA E. COLI

PRUEBA CEISA IBAGUÉ TULUÁ TOTAL

FREC.

TOTAL

% FREC. % FREC. % FREC. %

CULTIVOS 197 73,51% 1 0,37% 68 25,37% 266 99,25%

TIPIFICACIÓN 1 0,37% 0 0,00% 1 0,37% 2 0,75%

Total 198 73,88% 1 0,37% 69 25,75% 268 100,00%

Fuente. El autor

El porcentaje de cultivos para E. Coli es de 99,25% y de tipificación el 0,75%. El

73,88% de las pruebas se realizaron en el CEISA, el 25,75% en Tuluá y el restante

0,37% en Ibagué (Tabla 71).

Los resultados negativos para E. Coli son 76 y los resultados positivos son 192 (Tabla

72).

Tabla 72. Resultados de las pruebas realizadas para E. Coli.

FRECUENCIA DE CASOS DE E. COLI POR

PRUEBA DIAGNÓSTICA

PRUEBA N P TOTAL

CULTIVOS 75 191 266

TIPIFICACIÓN 1 1 2

Total 76 192 268

Fuente. El autor

Generalmente la E. Coli está asociada a otros agentes y se considera oportunista de

las infecciones primarias. Por lo tanto es común encontrar diagnósticos de esta bacteria

sin que su presencia diga mucho respecto al verdadero agente causal.

115

3.22 ASPERGILLUS

El total de pruebas realizadas para Aspergillus es 197, de las cuales en 196 casos

corresponden a cultivos y en un solo caso a tipificación. En el CEISA se procesaron

140 pruebas, en Tuluá 52 y en Ibagué 5 pruebas (Tabla 73).

Tabla 73. Laboratorios y pruebas realizadas paraAspergillus.

PRUEBAS PARA ASPERGILLUS

PRUEBA CEISA IBAGUÉ TULUÁ TOTAL

FREC.

TOTAL

% FREC. % FREC. % FREC. %

Cultivos 139 70,56% 5 2,54% 52 26,40% 196 99,49%

Tipificación 1 0,51% 0 0,00% 0 0,00% 1 0,51%

Total 140 71,07% 5 2,54% 52 26,40% 197 100,00%

Fuente. El autor

El porcentaje de cultivos es del 99,49% y de tipificación es el 0,51%. El porcentaje de

pruebas realizadas en el CEISA es 71,07%, en Tuluá el 26,40% y en Ibagué el 2,54%

(Tabla 73). De las 197 pruebas realizadas para Aspergillus 173 fueron negativos y 24

positivos (Tabla 74).

Tabla 74. Resultados de las pruebas realizadas para Aspergillus.

FRECUENCIA DE CASOS DE ASPERGILLUS POR

PRUEBA DIAGNÓSTICA

PRUEBA N P TOTAL

CULTIVOS 172 24 196

TIPIFICACIÓN 1 0 1

Fuente. El autor

116

3.23 ANTIBIOGRAMA

Se realizaron 61 antibiogramas de los cuales 39 se practicaron en Tuluá, 21 en el

CEISA y uno en el laboratorio de Ibagué (Tabla 74).

El porcentaje correspondiente de antibiogramas realizados en Tuluá es del 63,93%, en

el CEISA fue 34,43% y en Ibagué 1,64% (Tabla 75).

Tabla 75. Relación de antibiogramas realizados en los LDV – ICA.

LABORATORIO ANTIBIOGRAMA

PRUEBA CEISA IBAGUÉ TULUÁ TOTAL

FREC.

TOTAL

% FREC. % FREC. % FREC. %

CULTIVOS 21 34,43% 1 1,64% 39 63,93% 61 100,00%

Total 21 34,43% 1 1,64% 39 63,93% 61 100,00%

Fuente. El autor

Los antibiogramas son un recurso importante en la elección de los antibióticos efectivos

para el control de las infecciones, sobre todo cuando en una explotación se ha

formulado reiteradamente una base activa o que el agente a atacar presente

resistencia. La baja frecuencia en las solicitudes del CEISA-Bogotá e Ibagué denota la

baja cultura de los profesionales y usuarios a utilizar este recurso.

117

3.24 PARASITOLOGÍA

Se realizaron en total 307 pruebas para parasitología, de las cuales 152 corresponden

a parásitos gastrointestinales (PGI) y 155 a Eimeria. El laboratorio donde se procesaron

mayor cantidad de muestras es Tuluá con 289, le sigue el CEISA con 14 muestras y

por último fue Ibagué con sólo 4 muestras.

El porcentaje correspondiente a las pruebas realizadas en Tuluá es 94,13%, en CEISA

4,56% y en Ibagué 1,28%. Las pruebas de PGI fueron el 59,51% y de Eimeria el

50,49% (Tabla 76).

Tabla 76. Laboratorios y pruebas realizadas para parasitología.

PRUEBAS PARA PARASITOLOGÍA

PRUEBA CEISA IBAGUÉ TULUÁ TOTAL

FREC.

TOTAL

% FREC. % FREC. % FREC. %

PGI 7 2,28% 2 0,64% 143 46,57% 152 49,51%

EIMERIA 7 2,28% 2 0,64% 146 47,56% 155 50,49%

Total 14 4,56% 4 1,28% 289 94,13% 307 100,00%

Fuente. El autor

De las 307 pruebas realizadas para parasitología dieron resultado negativo 160 y

positivo 147, de ellas 7 muestras corresponden a PGI y 140 a Eimeria (Tabla 77).

118

Tabla 77. Resultados de las pruebas realizadas para parasitología.

FRECUENCIA RESULTADOS PRUEBAS PARA PARASITOLOGÍA

N P TOTAL

PGI 145 7 152

EIMERIA 15 140 155

Total 160 147 307

Fuente. El autor

Los resultados revelan la incidencia de coccidia como una de las enfermedades de baja

manifestación clínica que tiende a ser crónica en detrimento económico de las

explotaciones. Aunque la vacunación está en proceso evaluativo, se debe actuar sobre

el manejo de la implementación de las buenas prácticas avícolas sobre la base de su

carácter zoonótico y que el apoyo farmacológico está a disposición en el balance costo-

beneficio.

3.25 HISTOPATOLOGÍA

El número de casos en donde no aplica la realización de estudios histopatológicos

corresponde a 1503 casos pues esta variable depende del motivo de la solicitud, el

total de casos donde se observan lesiones es de 536 y donde no se observan lesiones

165 casos (Tabla 78).

119

Tabla 78. Realización de estudios de histopatología.

HISTOPATOLOGÍA

CATEGORÍA FRECUENCIA PORCENTAJE

NO APLICA 1503 68,19%

NO SE OBSERVA LESIONES 165 7,49%

SE OBSERVA LESIONES 536 24,32%

Total 2204 100,00%

Fuente. El autor

El porcentaje correspondiente de los casos en donde no aplica la histopatología es de

68%, del restante 32% en donde se realizó este estudio, se observó lesiones en el 24%

y no se observaron en el 8%.

El Figura 22 muestra los tipos de lesiones encontradas en los tejidos enviados a los

LNDV durante el período 2009 – 2011 para su respectivo procesamiento.

Figura 22. Lesiones encontradas en la histopatología.

Fuente. El autor

75,56 7,65

52,80 22,20

6,34

2,43

1,68 0,37

27,05

0,37

24,44 92,35

47,20 77,80

93,66

97,57

98,32

99,63

72,95

99,63

SISTEMA RESPIRATORIO

SISTEMA CARDIOVASCULAR

SISTEMA DIGESTIVO

SISTEMA NERVIOSO

SISTEMA URINARIO

SISTEMA REPRODUCTIVO

PIEL

SISTEMA OSEO

SISTEMA HEMATOPOYETICO

EDEMA

Histopatología

SIN LESION CON LESION

120

Las lesiones más frecuentes son las del sistema respiratorio (75,56%), sistema

digestivo (52,80%), sistema hematopoyético (27,05%) y sistema nervioso (22,20%). En

menor proporción se encontraron lesiones en los sistemas cardiovascular, urinario y

reproductivo con 7,65%, 6,34% y 1,68%, respectivamente. Las lesiones menos

encontradas fueron en piel con 1,68%, las óseas y el edema con 0,37% igualmente

(Figura 25).

La histopatología es una herramienta que sigue estando vigente a pesar del tiempo de

instauración como técnica de ayuda diagnostica dentro de la patología clínica. Se

deben aprovechar la gran cantidad de tejidos enviados al laboratorio (que son en

volumen el segundo lugar de muestras enviadas) para su tradicional proceso que

entrega un resultado rápido y económico, o también utilizar las placas una vez leídas y

archivadas para correr novedosas pruebas moleculares como técnica de respaldo en

casos que lo ameriten.

3.26 ESTADÍSTICA ANALÍTICA

El uso de la estadística cualitativa basada en la comparación permite determinar los

modelos que explican estadísticamente cuál de las metodologías de diagnóstico es

más eficiente. Para lograr este objetivo se elaboraron tablas de contingencia y pruebas

estadísticas de riesgo a partir de las cuales se generaron los modelos de regresión

logística con el fin de establecer la asociación de variables cualitativas y determinar su

inferencia referidas al valor P. Sin embargo, cuando las valores de las casillas cruzadas

de las tablas de contingencia, no superan más de cinco unidades como valor

consolidado el software sugiere tomar el valor del test exacto de Fisher para interpretar

la respuesta.

Los resultados del análisis de asociación provienen de la comparación de los

resultados a los que fueron sometidas muestras enviadas al laboratorio; ENC, IBV,

GUMBORO, ILT, SALMONELLA Y COLI, en cada uno de los niveles diagnósticos. En

121

el caso de la variable INFLUENZA AVIAR no se encontraron resultados positivos por lo

cual es imposible establecer comparaciones y utilizarlas en este análisis.

Las tablas que representan las salidas arrojadas por el software utilizado en este

estudio, están contenidas en el Anexo 2 y son el soporte de los valores P. resumidos

en tablas presentadas a continuación por tipo de enfermedad.

3.27 NEWCASTLE – ENC

Virología. Al consolidar los valores P en la Tabla 79, vemos que hay asociación entre

las muestras; sueros, hisopos cloacales y tejidos con el resultado de las pruebas

virológicas realizadas para diagnóstico de ENC.

Tabla 79. Resumen de valores de las tablas de contingencia para virología ENC

Fuente. El autor

VIROLOGÍA VS ENC

VARIABLES VALOR P

Suero 0.0162753880

Ave 0.0879842018

Hisopo Cloacal 0.0242463355

Hisopo Traqueal 0.0800627198

Tejidos 0.0001373424

Pollito 0.1252185663*

*Valor Test exacto de Fisher

122

Para explicar el modelo de probabilidad de estimar cuál es la mejor muestra para las

pruebas virológicas de Newcastle se ejecuta el análisis de regresión logística para

variables categóricas.

Tabla 80. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a las

pruebas virológicas para ENC en función de sus resultados

Fuente. El autor

El resultado obtenido como valor P en la tabla 80, indica que la muestra suero no

explica el modelo probabilístico y debe ser excluida, por lo tanto se volverá correr para

una nueva observación.

Término Odds

Ratio 95% I.C. Coeficiente S. E. Valor de z Valor p

Mhclocal

(Yes/No) 1.5294 1.0618 2.2029 0.4249 0.1862 2.2822 0.0225

Msuero

(Yes/No) 1.2547 0.8801 1.7889 0.2269 0.1810 1.2540 0.2098

Mtejido

(Yes/No) 2.1804 1.4338 3.3158 0.7795 0.2139 3.6447 0.0003

CONSTANT * * * -1.9029 0.2141 -8.8867 0.0000

123

Tabla 81. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a las

pruebas virológicas para ENC en función de sus resultados excluyendo el suero

Fuente. El autor

Con los nuevos resultados estadísticos de esta prueba se observa en la tabla 81 que

para obtener certeza en las pruebas virológicas en el diagnóstico de la enfermedad de

Newcastle las muestras más recomendadas son los hisopos cloacales y los tejidos con

valores P= 0.0093 y 0.0001 respectivamente.

Molecular. Al consolidar los valores P en la Tabla 82, vemos que hay asociación

entre los sueros, hisopos traqueales y tejidos con el resultado de las pruebas

moleculares.

Término Odds

Ratio 95% I.C. Coeficiente S. E. Valor de z Valor p

Mhclocal

(Yes/No) 1.6059 1.1237 2.2950 0.4737 0.1822 2.6003 0.0093

Mtejido

(Yes/No) 2.2643 1.4942 3.4312 0.8173 0.2121 3.8535 0.0001

CONSTANT * * * -1.8472 0.2092 -8.8291 0.0000

124

Tabla 82. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas

Moleculares ENC

Fuente. El autor

Con estos datos procedemos a la ejecución de análisis de regresión logística para

estas variables y explicar el modelo de probabilidad para establecer cuál es la mejor

muestra para las pruebas moleculares en el diagnóstico de Newcastle.

MOLECULARES VS ENC

VARIABLES VALOR P

Suero 0.0181767069

Ave 0.2925808183

Hisopo Cloacal 0.0705228781

Hisopo Traqueal 0.0108570536

Tejidos 0.0227024514

Pollito 0.1201882944*

*Valor Test exacto de Fisher

125

Tabla 83. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a las

pruebas moleculares para ENC en función de sus resultados

Fuente. El autor

El resultado estadístico mostrado en la Tabla 83 determina que la muestra más

recomendada para optimizar el diagnóstico de la prueba molecular para ENC son los

hisopos traqueales con un valor P = 0.0372.

Serología. Al consolidar los valores P de las tablas de contingencia aplicadas a

las muestras respecto a las pruebas serológicas, procedemos a la ejecución de

análisis de regresión logística para variables categóricas de las muestras suero y

pollito por estar en el rango de asociación e intentar explicar el modelo de

probabilidad de cuál es mejor muestra para las pruebas serológicas en el

diagnóstico de Newcastle. (Tabla 84)

Término Odds

Ratio 95% I.C. Coeficiente S. E. Valor de z Valor p

Mhtraq

(Yes/No) 1.4967 1.0243 2.1869 0.4033 0.1935 2.0841 0.0372

Msuero

(Yes/No) 1.2286 0.8959 1.6848 0.2059 0.1611 1.2777 0.2014

Mtejido

(Yes/No) 1.3883 0.9937 1.9395 0.3281 0.1706 1.9230 0.0545

CONSTANT * * * -0.8622 0.1546 -5.5771 0.0000

126

Tabla 84. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas Serológicas

ENC

Fuente. El autor

Tabla 85. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a las

pruebas serológicas para ENC en función de sus resultados.

Fuente. El autor

Los resultados de las pruebas estadísticas reflejados en la tabla 85 indican que los

sueros son las muestras indicadas para explicar el modelo de predicción, sin embargo,

el valor P está muy cerca del límite de aceptación de la aseveración por lo tanto, la

construcción de mapeos probabilísticos sobre posible presentación de ENC contarán

SEROLOGÍA VS ENC

VARIABLES VALOR P

Suero 0.0024601773

Ave 0.1700340936

Pollito 0.0026738664

Término Odds

Ratio 95% I.C. Coeficiente S. E. Valor de z Valor p

Mave (SI/NO) 0.4661 0.1635 1.3285 -0.7634 0.5344 -1.4285 0.1532

Mpolllito

(SI/NO) 1.1617 0.5762 2.3423 0.1499 0.3578 0.4189 0.6753

Msuero (SI/NO) 0.5223 0.2760 0.9885 -0.6494 0.3254 -1.9955 0.0460

CONSTANT * * * -1.8824 0.2935 -6.4129 0.0000

127

con pocas bases de confiabilidad si se toma como referencia esta variable. Puede

tenerse en cuenta como apoyo para generalizar y ajustar los resultados arrojados por

las variables que se asocian a las pruebas gold estándar encontradas en los anteriores

ítems de este capítulo.

3.28 BRONQUITIS INFECCIOSA - IBV

Molecular. Los datos utilizados para el presente estudio son la filtración de la base

de datos de los resultados de las pruebas moleculares enfrentados a las muestras

enviadas al laboratorio. Se excluyen la Heces por no ser componente para estas

pruebas.

Los resultados consolidados en la tabla 86 no muestran asociación por métodos

estadísticos convencionales utilizados, la razón es que esta enfermedad se diagnostica

por método diferencial y las solicitudes directas son escasas. Es decir que los datos no

están ligados como tal a la búsqueda directa del agente viral.

Tabla 86.Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas Moleculares

IBV

Fuente. El autor

BRONQUITIS VS MOLECULAR

VARIABLES VALOR P

Suero 0.0851658297

Ave 0.2873059467

Hisopo Cloacal 0.2201196799

Hisopo Traqueal 0.1349816862

Tejidos 0.3458174009

Pollito 0.6387665198*

*Valor Test exacto de Fisher

128

Serología. Los resultados de la asociación serológica de las variables involucradas

se obtienen de filtrar en la base de datos los resultados del laboratorio para las

pruebas que en serología comprenden la inmunofluorescencia y la prueba de

ELISA.

Los resultados obtenidos y consolidados en la tabla 87 muestran la asociación de las

muestras de tejidos y los sueros sanguíneos como las muestras que determinan la

eficacia de las pruebas para el diagnóstico de la bronquitis infecciosa.

Tabla 87. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas Serológicas

IBV

Fuente. El autor

A continuación se presenta el resultado de la regresión logística ejecutado para el

cruce de las variables Muestra tejido y Muestra suero involucradas con los resultados

de las pruebas serológicas para detectar el IBV.

BRONQUITIS VS SEROLOGÍA

VARIABLES VALOR P

Suero 0.0080359170*

Ave 0.5642472124*

Hisopo Cloacal 0.3580028148*

Hisopo Traqueal 0.4830226292*

Tejidos 0.0006817670

Pollito 0.1297071990*

*Valor Test exacto de Fisher

129

Tabla 88. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a las

pruebas serológicos para IBV en función de sus resultados

Fuente. El autor

Los resultados de la Tabla 88 muestran la íntima relación de las muestras de suero y

tejidos en el diagnóstico de la bronquitis infecciosa con valores P muy por debajo de

0.05 aun cuando las pruebas no están dirigidas a la identificación directa del agente

viral.

3.29 GUMBORO

Molecular. Las pruebas virológicas para este agente infeccioso solo arrojan

resultados negativos. Por lo tanto no se puede correr una prueba comparativa a este

nivel que determine algún tipo de asociación con validez estadística. Se establecen

entonces las pruebas moleculares y serológicas para este análisis bajo la

advertencia de que por la razón expuesta en el encabezado del presente párrafo los

resultados no tendrán la fuerza para apoyar hipótesis las cuales se muestran a

continuación.

Los valores P consolidados en la Tabla 89 muestran que ninguna muestra puede

ofrecer garantías de éxito en el diagnóstico de la enfermedad de Gumboro.

Término Odds

Ratio 95% I.C. Coeficiente S. E. Valor de z Valor p

Msuero

(Yes/No) 3.8134 1.2389 11.7376 1.3385 0.5736 2.3335 0.0196

Mtejido

(Yes/No) 0.1978 0.0701 0.5581 -1.6204 0.5292 -3.0621 0.0022

CONSTANT * * * 1.9411 0.5421 3.5810 0.0003

130

Tabla 89.Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas Moleculares

Gumboro

Fuente. El autor

Serología. Los resultados consolidados en la tabla 90 muestran que no hay

asociación en una prueba tan rutinaria como es la ELISA. Esto demuestra que la

falta de datos es de crucial importancia en estudios de este tipo.

Tabla 90.Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas Moleculares

Gumboro

Fuente. El autor

MOLECULAR

VARIABLES VALOR MEDIO

Suero 0.0588758197

Ave 0.7308909995*

Hisopo Cloacal 0.2454668968

Hisopo Traqueal 0.2207411415

Tejidos 0.0683122847*

*Valor Test exacto de Fisher

SEROLOGÍA

VARIABLES VALOR MEDIO

Suero 0.3405253283*

Ave 0.9047619048*

Hisopo Cloacal 0.2651567944*

Hisopo Traqueal 0.8164924506*

Tejidos 0.3634146341*

131

3.30 LARINGOTRAQUEITIS INFECCIOSA – ILT

Virología. Los resultados de las pruebas virológicas para ILT arrojan datos con

valores menor a cinco en casi todas las variables por lo tanto se toma el dato del test

exacto de Fischer para su análisis.

Los resultados consolidados en la Tabla 91, indican que ninguna muestra está

asociada con el diagnostico por pruebas virológicas. Este resultado puede deberse a

los escasos datos reportados y de ninguna manera puede ser concluyente.

Tabla 91.Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas Virológicas

ILT.

Fuente. El autor

Molecular. Los resultados consolidados en la tabla 92 muestran que la única

asociación estadísticamente significativa está entre los hisopos cloacales y los

resultados de las pruebas diagnósticas moleculares. Esto permite hacer una

observación importante respecto a que las muestras fundamentales para efectos de

detección del ILT deberían ser los hisopos traqueales. Este resultado inesperado

puede atribuirse entre otros factores al grado de dificultad en la ejecución de

acceder a la tráquea de las aves.

LARINGOTRAQUEITIS VS VIROLOGÍA

VARIABLES TEST EXACTO FISHER

Suero 0.1909562212

Ave 0.7240745366

Hisopo Cloacal 0.3177118580

Hisopo Traqueal 0.2214861751

Tejidos 0.4274193548

132

Tabla 92. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas

Moleculares ILT.

Fuente. El autor

Serología. El análisis de resultados consolidados en la tabla 93 indica asociación

entre las muestras, pollito, suero y los hisopos traqueales en las pruebas

serológicas.

Tabla 93. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas Serológicas

ILT

Fuente. El autor

LARINGOTRAQUEITIS VS MOLECULAR

VARIABLES VALOR P

Suero 0.1395226694

Ave 0.5337926842*

Hisopo Cloacal 0.0056173363

Hisopo Traqueal 0.1401341821

Tejidos 0.3744250132

*Valor Test exacto de Fisher

LARINGOTRAQUEITIS VS SEROLOGÍA

VARIABLES VALOR P

Suero 0.0158520662

Ave 0.4690408672

Hisopo Cloacal 0.3331513361*

Hisopo Traqueal 0.0489089693*

Tejidos 0.5318106071*

Pollito 0.0257558373

*Valor Test exacto de Fisher

133

Para establecer si la conexión de estas muestras está relacionada con el resultado de

la prueba se corre una prueba de regresión logística cuyo resultado es el siguiente.

Tabla 94. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a las

pruebas serológicos para ILT en función de sus resultados.

Fuente. El autor

Los resultados presentados en la Tabla 94 indican que la única muestra que explica el

modelo para el resultado valedero son los hisopos traqueales.

Salmonella. Estadísticamente no se encuentra asociación entre las variables

confrontadas como lo muestra el consolidado de la Tabla 95. Buena parte de este

resultado puede estar soportada en el escaso aporte de datos si se tiene en cuenta

que la determinación de la salmonella en la vigilancia pasiva por parte del ICA utiliza

muestras diferentes a la vigilancia activa.

Término Odds

Ratio 95% I.C. Coeficiente S. E. Valor de z Valor p

Mhtraq

(Yes/No) 0.1185 0.0235 0.5968 -2.1329 0.8248 -2.5858 0.0097

MPolllito

(Yes/No) 0.6437 0.1118 3.7078 -0.4405 0.8934 -0.4931 0.6220

Msuero

(Yes/No) 2.3757 0.4127 13.6752 0.8653 0.8930 0.9690 0.3326

CONSTANT * * * 1.8927 0.8282 2.2854 0.0223

134

Tabla 95. Resumen de valores de las tablas de contingencia para cultivo bacteriológico

de Salmonella

Fuente. El autor

E. Coli. El consolidado de la tabla 96 muestra que la única muestra asociada con el

diagnóstico acertado para E. COLI es la muestra POLLITO. Este resultado es

ongruente al motivo de solicitud que aportan las importaciones de aves y al control

de calidad de las plantas de incubación.

Tabla 96. Resumen de valores de las tablas de contingencia para cultivo bacteriológico

de Salmonella

Fuente. El autor

SALMONELLA

VARIABLES VALOR P

Hisopo Cloacal 0.1779535839*

Heces 0.8890008280*

Pollito 0.0618238556*

*Valor Test exacto de Fisher

E. COLI

VARIABLES VALOR P

Hisopo Cloacal 0.4519043018 *

Heces 0.7180451128 *

Pollito 0.0302729310 *

*Valor Test exacto de Fisher

135

Distribución Geográfica. Los resultados positivos obtenidos en las pruebas de

laboratorio analizadas en este estudio fueron ubicados en mapas del territorio

nacional para observar su distribución espacial y definir cómo se distribuyen cada

una de las enfermedades seleccionadas comparándolas regionalmente.

A continuación se presentarán los mapas que representan la distribución de la

casuística de enfermedades de origen viral y bacteriano diagnosticada en los

laboratorios del ICA durante los años 2009, 2010 y 2011.

Newcastle. Resultados positivos a las pruebas de virología, moleculares y

serológicas.

Figura 23. Distribución de los Resultados positivos a ENC en las pruebas de virología,

moleculares y serológicas.

Fuente. El autor

136

El mapa muestra la presencia de esta enfermedad en casi todas las regiones y no

puede descartarse que en la zona de los llanos orientales, orinoquia y amazonia exista

dado que los laboratorios que cubren estas sedes no son de alto impacto avícola y las

notificaciones pudieran no tener la atención por falta de recurso humano. Lo relevante

del Figura es que si hay confirmación por pruebas virologías de la prevalencia de la

enfermedad en variadas condiciones topoFiguras donde las condiciones climáticas

varían ostensiblemente.

Bronquitis Infecciosa. Resultados positivos a las pruebas moleculares y serológicas.

Figura 24. Distribución de los Resultados positivos a IBV en las pruebas moleculares y

serológicas.

Fuente. El autor

137

A esta enfermedad no se le corren pruebas virológicas y por lo tanto no hay resultados

para mostrar, sin embargo, las pruebas moleculares determinadas por el diagnóstico

diferencial con ENC indican la alta incidencia respecto al número de casos y las

escasas pruebas en relación a la alta tasa de vacunación y el reporte de estudios sobre

este virus en Colombia.

Laringotraqueitis Infecciosa. Resultados positivos a las pruebas de virología,

moleculares y serológicas.

Figura 25. Distribución de los Resultados positivos a ILT en las pruebas de virología,

moleculares y serológicas.

Fuente. El autor

138

Esta enfermedad si representa un problema de evidente esparcimiento. El ICA solo

autoriza la vacunación para el departamento del Valle del Cauca y como muestra el

mapa, va colonizando regiones de alta concentración de aves comerciales como son

Cundinamarca y Santander que aunque no hay resultados de pruebas virológicas, el

hallazgo de anticuerpos por serología es suficiente factor de riesgo que propone mayor

investigación epidemiológica.

Gumboro. Resultados positivos a las pruebas moleculares y serológicas.

Figura 26. Distribución de los Resultados positivos a Gumboro en las pruebas

moleculares y serológicas.

Fuente. El autor

139

Para esta enfermedad las pruebas son muy específicas dado que el control vacunal es

rutinario en todo tipo de granjas comerciales y por supuesto en el material genético. Lo

que muestra el mapa es interesante desde el punto de vista geoFigura pues es en

Nariño y Magdalena los departamentos donde hubo mayor resultado positivo a las

pruebas moleculares.

Salmonella. Resultados positivos al cultivo bacteriológico.

Figura 27. Distribución de los resultados positivos al cultivo bacteriológico de

Salmonella.

Fuente. El autor

140

El solo cultivo no dice mucho de esta enfermedad, pero si los escasos resultados. Se

debe poner mucha atención y mayor recurso en la recolección de muestras para la

identificación de Salmonella dado que es una enfermedad de control oficial cuyo

impacto en la salud humana es de interés global.

E. Coli. Resultados positivos al cultivo bacteriológico.

Figura 28. Distribución de los resultados positivos al cultivo bacteriológico de E. Coli.

Fuente. El autor

Es de esperar que este agente oportunista y además normal dentro de la flora

bacteriana y ambientes de confinamiento de los animales este presente. Sin embargo

la distribución geográfica está muy ligada a las altas concentraciones avícolas del país.

141

Mapas Predictivos. El valor de la informática aplicada a la dinámica de la salud

pública ha tenido altísima relevancia pues alimentados los programas con nutridas

bases de datos, las cuales, son el eslabón débil en las comunidades que

culturalmente no registran actividades rutinarias o cuando se limitan a acumular

archivos. La predicción del clima y su pertinencia en la toma de decisiones son

ejemplos de la importancia a la que una consolidada y validada base de datos es la

herramienta eficaz para identificar la dirección correcta hacia donde se deben dirigir

los esfuerzos para la escogencia de estrategias y aplicación de programas de

acción.

Los factores de riesgo son las variables que se deben identificar para controlar, reducir

y finalmente conducir a la erradicación de una enfermedad determinada. A continuación

se presentan mapas predictivos que DIVA-GIS ofrece como salida al procesar las

variables ENFERMEDADES relacionando los resultados positivos de los niveles de

pruebas diagnósticas. La manera cómo interpreta las convenciones este software es

colorimétrica. De tal manera que los verdes van de intenso a claro representando

zonas de baja hacia moderada probabilidad, los armarillos y naranjas las zonas de

media y alta probabilidad. El rojo representa las zonas de mayor riesgo y el gris

ninguno.

142

Mapa predictivo de aparición de ENC en el diagnostico positivo por pruebas de

virología.

Figura 29. Predicción del riesgo a ENC por pruebas virológicas.

Fuente. El autor

143

Mapa predictivo de aparición de ENC en el diagnostico positivo por pruebas

moleculares.

Figura 30. Predicción del riesgo a ENC por pruebas moleculares.

Fuente. El autor

144

Mapa predictivo de aparición de ENC en el diagnostico positivo por pruebas

serológicas.

Figura 31. Predicción del riesgo a ENC por pruebas serológicas.

Fuente. El autor

145

4. CONCLUSIONES Y RECOMENDACIONES

El diseño del FURM limita la clasificación de variables y su diligenciamiento es el

resultado de una transcripción manual realizada en cada recepción donde se

identifican varios motivos por lo cual se presenta pérdida de información valiosa. La

alta proporción de errores (23%), en la calidad del diligenciamiento de los datos

reafirma la urgencia en el cambio del FURM, Es imperante la recolección de

muestras en tiempo real buscando adoptar recursos tecnológicos modernos para

garantizar el consecuente diagnóstico oportuno y veraz. Por lo tanto, la base de

datos utilizada en el presente estudio no es óptima para respaldar conclusiones de

este tipo debido a que hace falta información en casillas claves para que los

valores arrojados por los aplicativos que procesan estos algoritmos, certifiquen su

confianza. Para lograrlo, hay que recurrir a La información existente, incluyendo la

sancionada en la resolución 1599 la cual se debe incorporar a una matriz uniforme

en todos los centros de recepción de muestras veterinarias de ICA y reprocesar

con aplicativos adecuados.

Los diagnósticos están centralizados en el LNDV CEISA Bogotá. Esto condiciona la

calidad de las muestras por el tiempo del recorrido al laboratorio, condiciones de

temperatura y gestión para garantizar resultados óptimos y oportunos de las

pruebas.

La gran mayoría de los usuarios que utilizan el servicio de los laboratorios de ICA

hacen solicitud única y su distribución geográfica abarca el territorio nacional. Esto

quiere decir que cualquier ciudadano en cualquier parte del país puede contactar

los servicios de diagnóstico veterinario como apoyo a sus explotaciones pecuarias

sin importar el tamaño de estas.

El mayor motivo de solicitud del servicio es el diagnóstico. Esta casilla del

formulario limita la amplia gama de propósitos que se deben especificar al

146

momento de la recepción de la muestra dado que los antecedentes son variables

que afectan el enfoque del análisis en la interpretación de los resultados.

Los síntomas reportados con mayor frecuencia comprometen al sistema

respiratorio como objeto de diagnóstico de la problemática sanitaria. El resultado

está ligado a la campaña de control oficial de Newcastle y la gratuidad de las

pruebas es un factor que favorece esta conducta.

El reporte de necropsias es bajo y esta es una herramienta que aporta información

valiosa para lograr en congruencia con el diagnóstico presuntivo una conclusión y

cerrar los casos de manera satisfactoria.

Los planes vacunales tienen poco reporte en este formato al igual que los datos

poblacionales. Se deben corregir estos aspectos porque la base del control y

erradicación de enfermedades como Newcastle y el aumento en la incidencia de la

Laringotraqueitis están soportados en la estrategia de aplicación de biológicos. El

FURM no contempla el reporte de vacunas recombinantes que ya son una realidad

en el país.

En el FURM es imposible clasificar el sexo de las aves en las granjas de engorde y

en las de material genético, por lo tanto en este estudio se tomó como mixto para la

base de datos cuando la información provenía de estas granjas. El resultado fue

una tercera categoría que dificultó el procesamiento de datos en el software

utilizado y no se logró lanzar respuestas solidas a las preguntas de investigación

proyectadas. Otro ejemplo de esto es la variable otras especies que constituyó una

categoría inmanejable por el tamaño y la dispersión de los datos en cuanto a la

clasificación etaria y la identificación del sexo.

El reporte de tratamientos con antimicrobianos es de escasa factura, la mayoría de

los datos provienen del traspatio. Este dato es valioso para estimar el correcto uso

de antimicrobianos en el tema de resistencia que presentan los gérmenes.

147

La magnitud del Newcastle respecto a la relación del diagnóstico presuntivo y los

resultados no es dramática según los índices obtenidos en este estudio. El

complejo respiratorio aviar es de amplio repertorio causal y aunque el ICA

establece el análisis diferencial para Bronquitis de los resultados negativos de

Newcastle e Influenza, no es posible lanzar una conclusión respecto a cuál de

todos estos agentes involucrados es el mayor responsable de la sinología en los

predios avícolas.

Laringotrateitis es una enfermedad emergente que se está distribuyendo en nuevas

áreas de la geografía nacional donde tradicionalmente no se reportaban casos.

Según los resultados obtenidos no es fácil de diagnosticar y no se tiene una

estrategia clara para su contingencia aparte del control sobre la vacunación en las

aves en el departamento del valle de cauca.

Salmonella fue tipificada en solo un caso, pero es preocupante porque no refleja la

realidad si tenemos en cuenta el número de solicitudes, envío de muestras y los

diagnósticos presuntivos contra los resultados de las pruebas.

La histopatología es una herramienta que sigue estando vigente a pesar del tiempo

de instauración como técnica de ayuda diagnostica dentro de la patología clínica.

Sin embargo las pruebas gold standard son como algunos otros datos, muy

importantes en el análisis que deben estratificarse en el rediseño del FURM.

la variable muestras se constituye como el referente del presente estudio para

procesar el análisis estadístico del cual se obtuvo resultados que confirman la alta

asociación entre los hisopos cloacales y los tejidos con los resultados en las

pruebas virológicas para el diagnóstico concluyente de Newcastle. Al momento de

instaurar un programa de acción que involucre la identificación de la Bronquitis

Infecciosa, se deben tener en cuenta los resultados de este estudio para ajustar el

protocolo pues no hubo ningún tipo de muestra que presentará asociación para las

pruebas diagnósticas del laboratorio.

148

Se pueden solicitar diferentes Figuras a los aplicativos que procesan bases de

datos geo referenciadas, ubicando espacialmente mapeos de puntos como

herramienta de análisis epidemiológico que respalden hipótesis para decidir incluir

o descartar variables como factores de riesgo en la presentación y diseminación de

enfermedades.

149

REFERENCIAS

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from a natural case in indonesia. Journal Veterinary Medicine Science. Recuperado de:

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157

ANEXOS

158

Anexo A. Formato único de recepción de muestras

159

160

Anexo B. Newcastle – Enc

VIROLOGÍA

Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas de

virología

Tabla 1. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las pruebas

de virología ENC.

RVIRENC

Msuero NO YES TOTAL

Yes

% Fila

% Columna

211

70.3

40.5

89

29.7

49.7

300

100.0

42.9

No

% Fila

% Columna

310

77.5

59.5

90

22.5

50.3

400

100.0

57.1

TOTAL

% Fila

% Columna

521

74.4

100.0

179

25.6

100.0

700

100.0

100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 4.6262

0.0314886469

Chi-square - Mantel-Haenszel 4.6196

0.0316101907

Chi-square - corrected (Yates) 4.2573

0.0390831870

P-media exacta

0.0162753880

Test exacto de Fisher

0.0197675507

161

Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas de

virología.

Tabla 2. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas de

virología ENC.

RVIRENC

Mave NO YES TOTAL

Yes

% Fila

% Columna

56

81.2

10.7

13

18.8

7.3

69

100.0

9.9

No

% Fila

% Columna

465

73.7

89.3

166

26.3

92.7

631

100.0

90.1

TOTAL

% Fila

% Columna

521

74.4

100.0

179

25.6

100.0

700

100.0

100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 1.8221 0.1770691769

Chi-square - Mantel-Haenszel 1.8195 0.1773788300

Chi-square - corrected (Yates) 1.4509 0.2283915610

P-media exacta 0.0879842018

Test exacto de Fisher 0.1122010860

162

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las

pruebas de virología

Tabla 3. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de las

pruebas de

RVIRENC

Mhclocal NO YES TOTAL

Yes

% Fila

% Columna

178

70.1

34.2

76

29.9

42.5

254

100.0

36.3

No

% Fila

% Columna

343

76.9

65.8

103

23.1

57.5

446

100.0

63.7

TOTAL

% Fila

% Columna

521

74.4

100.0

179

25.6

100.0

700

100.0

100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 3.9632 0.0465060660

Chi-square - Mantel-Haenszel 3.9575 0.0466627430

Chi-square - corrected (Yates) 3.6126 0.0573438728

P-media exacta 0.0242463355

Test exacto de Fisher 0.0292559471

163

Virología ENC. Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los

resultados de las pruebas de virología

Tabla 4. Tabla de contingencia para la muestra H. TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas de Virología ENC.

RVIRENC

Mhtraq NO YES TOTAL

Yes

% Fila

% Columna

102

69.9

19.6

44

30.1

24.6

146

100.0

20.9

No

% Fila

% Columna

419

75.6

80.4

135

24.4

75.4

554

100.0

79.1

TOTAL

% Fila

% Columna

521

74.4

100.0

179

25.6

100.0

700

100.0

100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 2.0204 0.1552007756

Chi-square - Mantel-Haenszel 2.0175 0.1554960843

Chi-square - corrected (Yates) 1.7287 0.1885841081

P-media exacta 0.0800627198

Test exacto de Fisher 0.0953871423

164

Prueba de asociación entre la muestra TEJIDOS y los resultados de las pruebas de

virología

Tabla 5. Tabla de contingencia para la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas

de Virología ENC.

RVIRENC

Mtejido NO YES TOTAL

Yes

% Fila

% Columna

342

70.5

65.6

143

29.5

79.9

485

100.0

69.3

No

% Fila

% Columna

179

83.3

34.4

36

16.7

20.1

215

100.0

30.7

TOTAL

% Fila

% Columna

521

74.4

100.0

179

25.6

100.0

700

100.0

100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 12.7043 0.0003659876

Chi-square - Mantel-Haenszel 12.6861 0.0003695456

Chi-square - corrected (Yates) 12.0437 0.0005208456

P-media exacta 0.0001373424

Test exacto de Fisher 0.0001882603

165

Prueba de asociación entre la muestra POLLITO y los resultados de las pruebas de

virología.

Tabla 6. Tabla de contingencia para la muestra POLLITO y los resultados de las

pruebas de Virología ENC.

RVIRENC

Mpolllito NO YES TOTAL

Yes

% Fila

% Columna

7

100.0

1.3

0

0.0

0.0

7

100.0

1.0

No

% Fila

% Columna

514

74.2

98.7

179

25.8

100.0

693

100.0

99.0

TOTAL

% Fila

% Columna

521

74.4

100.0

179

25.6

100.0

700

100.0

100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 2.4293 0.1190883696

Chi-square - Mantel-Haenszel 2.4258 0.1193523492

Chi-square - corrected (Yates) 1.2617 0.2613329336

P-media exacta 0.0626092832

Test exacto de Fisher 0.1252185663

166

MOLECULAR

Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas

Moleculares.

Tabla 7. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas

moleculares. ENC.

RMOLENC

Mave NO YES TOTAL

NO

% Fila

% Columna

398

61.0

89.4

254

39.0

90.7

652

100.0

89.9

SI

% Fila

% Columna

47

64.4

10.6

26

35.6

9.3

73

100.0

10.1

TOTAL

% Fila

% Columna

445

61.4

100.0

280

38.6

100.0

725

100.0

100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi

cuadrado

p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.3091 0.5782576550

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.3086 0.5785198823

Chi-square - corrected (Yates) 0.1842 0.6677877497

P-media exacta 0.2925808183

Test exacto de Fisher 0.3363274835

167

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las

pruebas Moleculares.

Tabla 8. Tabla de contingencia para la muestra H CLOACAL y los resultados de las

pruebas Moleculares ENC.

RMOLENC

Mhclocal NO YES TOTAL

NO

% Fila

% Columna

285

63.5

64.0

164

36.5

58.6

449

100.0

61.9

SI

% Fila

% Columna

160

58.0

36.0

116

42.0

41.4

276

100.0

38.1

TOTAL

% Fila

% Columna

445

61.4

100.0

280

38.6

100.0

725

100.0

100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 2.1839 0.1394614290

Chi-square - Mantel-Haenszel 2.1809 0.1397346013

Chi-square - corrected (Yates) 1.9579 0.1617376848

P-media exacta 0.0705228781

Test exacto de Fisher 0.0810379804

168

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas Moleculares

Tabla 9. Tabla de contingencia para la muestra H TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas Moleculares ENC.

RMOLENC

Mhtraq NO YES TOTAL

NO

% Fila

% Columna

367

63.5

82.5

211

36.5

75.4

578

100.0

79.7

SI

% Fila

% Columna

78

53.1

17.5

69

46.9

24.6

147

100.0

20.3

TOTAL

% Fila

% Columna

445

61.4

100.0

280

38.6

100.0

725

100.0

100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 5.3819 0.0203483376

Chi-square - Mantel-Haenszel 5.3744 0.0204351013

Chi-square - corrected (Yates) 4.9507 0.0260809941

P-media exacta 0.0108570536

Test exacto de Fisher 0.0134914748

169

Prueba de asociación entre la muestra POLLITO y los resultados de las pruebas

Moleculares.

Tabla 10. Tabla de contingencia para la muestra POLLITO y los resultados de las

pruebas Moleculares ENC.

RMOLENC

Mpolllito NO YES TOTAL

NO % Fila % Columna

438 61.1 98.4

279 38.9 99.6

717 100.0 98.9

SI % Fila % Columna

7 87.5 1.6

1 12.5 0.4

8 100.0

1.1

TOTAL % Fila % Columna

445 61.4 100.0

280 38.6 100.0

725 100.0 100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 2.3283 0.1270428185

Chi-square - Mantel-Haenszel 2.3251 0.1273052449

Chi-square - corrected (Yates) 1.3474 0.2457361437

P-media exacta 0.0699228389

Test exacto de Fisher 0.1201882944

170

Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas

Moleculares

Tabla 11. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las

pruebas Moleculares ENC.

RMOLENC

Msuero NO YES TOTAL

NO % Fila % Columna

272 64.6 61.1

149 35.4 53.2

421 100.0 58.1

SI % Fila % Columna

173 56.9 38.9

131 43.1 46.8

304 100.0 41.9

TOTAL % Fila % Columna

445 61.4 100.0

280 38.6

100.0

725 100.0 100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 4.4155 0.0356154658

Chi-square - Mantel-Haenszel 4.4094 0.0357428347

Chi-square - corrected (Yates) 4.0966 0.0429701968

P-media exacta 0.0181767069

Test exacto de Fisher 0.0215865556

171

Prueba de asociación entre la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas

Moleculares

Tabla 12. Tabla de contingencia para la muestra TEJIDO y los resultados de las

pruebas Moleculares ENC.

RMOLENC

Mtejido NO YES TOTAL

NO % Fila % Columna

154 66.7 34.6

77 33.3 27.5

231 100.0 31.9

SI % Fila % Columna

291 58.9 65.4

203 41.1 72.5

494 100.0 68.1

TOTAL % Fila % Columna

445 61.4 100.0

280 38.6

100.0

725 100.0 100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 3.9981 0.0455515788

Chi-square - Mantel-Haenszel 3.9926 0.0457008802

Chi-square - corrected (Yates) 3.6775 0.0551527408

P-media exacta 0.0227024514

Test exacto de Fisher 0.0271198738

172

SEROLOGÍA

Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas

serológicas

Tabla 13. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas

Serológicas ENC.

RSERHIENC

Mave Yes No TOTAL

NO

% Fila

% Columna

88

9.4

94.6

845

90.6

91.7

933

100.0

92.0

SI

% Fila

% Columna

5

6.2

5.4

76

93.8

8.3

81

100.0

8.0

TOTAL

% Fila

% Columna

93

9.2

100.0

921

90.8

100.0

1014

100.0

100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.9503 0.3296455078

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.9494 0.3298840997

Chi-square - corrected (Yates) 0.5993 0.4388342224

P-media exacta 0.1700340936

Test exacto de Fisher 0.2251026565

173

Prueba de asociación entre la muestra POLLITO y los resultados de las pruebas

serológicas

Tabla 14. Tabla de contingencia para la muestra POLLITO y los resultados de las

pruebas Serológicas ENC.

RSERHIENC

Mpolllito Yes No TOTAL

NO % Fila % Columna

66 7.9

71.0

767 92.1 83.3

833 100.0 82.1

SI % Fila % Columna

27 14.9 29.0

154 85.1 16.7

181 100.0 17.9

TOTAL % Fila % Columna

93 9.2

100.0

921 90.8

100.0

1014 100.0 100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 8.7310 0.0031295805

Chi-square - Mantel-Haenszel 8.7224 0.0031443896

Chi-square - corrected (Yates) 7.9116 0.0049129522

P-media exacta 0.0026738664

Test exacto de Fisher 0.0036806740

174

Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas

SEROLÓGICAS

Tabla 15. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las

pruebas Serológicas ENC.

RSERHIENC

Msuero Yes No TOTAL

NO % Fila % Columna

44 12.8 47.3

299 87.2 32.5

343 100.0 33.8

SI % Fila % Columna

49 7.3

52.7

622 92.7 67.5

671 100.0 66.2

TOTAL % Fila % Columna

93 9.2

100.0

921 90.8

100.0

1014 100.0 100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 8.3186 0.0039253695

Chi-square - Mantel-Haenszel 8.3104 0.0039431335

Chi-square - corrected (Yates) 7.6685 0.0056204976

P-media exacta 0.0024601773

Test exacto de Fisher 0.0032784699

175

BRONQUITIS INFECCIOSA - IBV

MOLECULAR

Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas

moleculares

Tabla 16. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas

moleculares IBV.

RMOLIBV

Mave Yes No TOTAL

NO

% Fila

% Columna

74

35.6

90.2

134

64.4

92.4

208

100.0

91.6

SI

% Fila

% Columna

8

42.1

9.8

11

57.9

7.6

19

100.0

8.4

TOTAL

% Fila

% Columna

82

36.1

100.0

145

63.9

100.0

227

100.0

100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.3216 0.5706701714

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.3201 0.5715199843

Chi-square - corrected (Yates) 0.1009 0.7507881736

P-media exacta 0.2873059467

Test exacto de Fisher 0.3691498286

176

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las

pruebas moleculares

Tabla 17. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de las

pruebas Moleculares IBV

RMOLIBV

Mhclocal Yes No TOTAL

NO

% Fila

% Columna

46

34.1

56.1

89

65.9

61.4

135

100.0

59.5

SI

% Fila

% Columna

36

39.1

43.9

56

60.9

38.6

92

100.0

40.5

TOTAL

% Fila

% Columna

82

36.1

100.0

145

63.9

100.0

227

100.0

100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.6062 0.4362092268

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.6036 0.4372215782

Chi-square - corrected (Yates) 0.4069 0.5235450908

P-media exacta 0.2201196799

Test exacto de Fisher 0.2613600762

177

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas moleculares.

Tabla 18. Tabla de contingencia para la muestra H. TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas Moleculares IBV

RMOLIBV

Mhtraq Yes No TOTAL

NO

% Fila

% Columna

56

33.9

68.3

109

66.1

75.2

165

100.0

72.7

SI

% Fila

% Columna

26

41.9

31.7

36

58.1

24.8

62

100.0

27.3

TOTAL

% Fila

% Columna

82

36.1

100.0

145

63.9

100.0

227

100.0

100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 1.2487

0.2637925043

Chi-square - Mantel-Haenszel 1.2432

0.2648469777

Chi-square - corrected (Yates) 0.9263

0.3358388442

P-media exacta

0.1349816862

Test exacto de Fisher

0.1677955308

178

Prueba de asociación entre la muestra POLLITO y los resultados de las pruebas

moleculares

Tabla 19. Tabla de contingencia para la muestra POLLITO y los resultados de las

pruebas Moleculares IBV

RMOLIBV

Mpolllito Yes No TOTAL

NO

% Fila

Columna

82

36.3

100.0

144

63.7

99.3

226

100.0

99.6

SI

% Fila

% Columna

0

0.0

0.0

1

100.0

0.7

1

100.0

0.4

TOTAL

% Fila

% Columna

82

36.1

100.0

145

63.9

100.0

227

100.0

100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.5680

0.4510476193

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.5655

0.4520464051

Chi-square - corrected (Yates) 0.0838

0.7721838632

P-media exacta

0.3193832599

Test exacto de Fisher

0.6387665198

179

Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas

moleculares.

Tabla 20. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las

pruebas Moleculares IBV

RMOLIBV

Msuero Yes No TOTAL

NO

% Fila

% Columna

42

32.3

51.2

88

67.7

60.7

130

100.0

57.3

SI

% Fila

% Columna

40

41.2

48.8

57

58.8

39.3

97

100.0

42.7

TOTAL

% Fila

% Columna

82

36.1

100.0

145

63.9

100.0

227

100.0

100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 1.9196

0.1659041968

Chi-square - Mantel-Haenszel 1.9111

0.1668397176

Chi-square - corrected (Yates) 1.5521

0.2128269909

P-media exacta

0.0851658297

Test exacto de Fisher

0.1065386325

180

Prueba de asociación entre la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas

moleculares.

Tabla 21. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de las

pruebas Moleculares IBV

2 RMOLIBV

Mtejido Yes No TOTAL

NO % Fila % Columna

25 34.2 30.5

48 65.8 33.1

73 100.0 32.2

SI % Fila % Columna

57 37.0 69.5

97 63.0 66.9

154 100.0 67.8

TOTAL % Fila % Columna

82 36.1

100.0

145 63.9

100.0

227 100.0 100.0

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.1643

0.6852683514

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.1635

0.6859253044

Chi-square - corrected (Yates) 0.0662

0.7968891025

P-media exacta

0.3458174009

Test exacto de Fisher

0.4002928078

181

SEROLOGÍA

Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas

serológicas.

Tabla 22. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas

Serológicas. IBV

SER_IBV

Mave N P TOTAL

NO

% Fila

% Columna

17

7.1

94.4

223

92.9

91.8

240

100.0

92.0

SI

% Fila

% Columna

1

4.8

5.6

20

95.2

8.2

21

100.0

8.0

TOTAL

% Fila

% Columna

18

6.9

100.0

243

93.1

100.0

261

100.0

100.0

182

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las

pruebas serológicas.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.1621

0.6872580940

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.1614

0.6878261765

Chi-square - corrected (Yates) 0.0022

0.9629504653

P-media exacta

0.3868050774

Test exacto de Fisher

0.5642472124

SER_IBV

Mhclocal N P TOTAL

NO % Fila % Columna

18 7.3

100.0

229 92.7 94.2

247 100.0 94.6

SI % Fila % Columna

0 0.0 0.0

14 100.0

5.8

14 100.0

5.4

TOTAL % Fila % Columna

18 6.9

100.0

243 93.1

100.0

261 100.0 100.0

183

Tabla 23. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de las

pruebas Serológicas. IBV

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas serológicas.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 1.0958

0.2951868763

Chi-square - Mantel-Haenszel 1.0916

0.2961138280

Chi-square - corrected (Yates) 0.2547

0.6137607527

P-media exacta

0.1790014074

Test exacto de Fisher

0.3580028148

SER_IBV

Mhtraq N P TOTAL

NO

% Fila

% Columna

18

7.2

100.0

233

92.8

95.9

251

100.0

96.2

SI

% Fila

% Columna

0

0.0

0.0

10

100.0

4.1

10

100.0

3.8

TOTAL

% Fila

% Columna

18

6.9

100.0

243

93.1

100.0

261

100.0

100.0

184

Tabla 24. Tabla de contingencia para la muestra H. TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas Serológicas. IBV

Prueba de asociación entre la muestra POLLITO y los resultados de las pruebas

serológicas.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.7703

0.3801397300

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.7673

0.3810539791

Chi-square - corrected (Yates) 0.0583

0.8092832666

P-media exacta

0.2415113146

Test exacto de Fisher

0.4830226292

SER_IBV

Mpolllito N P TOTAL

NO

% Fila

% Columna

16

6.2

88.9

242

93.8

99.6

258

100.0

98.9

SI

% Fila

% Columna

2

66.7

11.1

1

33.3

0.4

3

100.0

1.1

TOTAL

% Fila

% Columna

18

6.9

100.0

243

93.1

100.0

261

100.0

100.0

185

Tabla 25. Tabla de contingencia para la muestra POLLITO y los resultados de las

pruebas Serológicas. IBV

Prueba de asociación entre la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas

serológicas.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 16.8854

0.0000408741

Chi-square - Mantel-Haenszel 16.8207

0.0000422508

Chi-square - corrected (Yates) 8.7815

0.0030441873

P-media exacta

0.0066246428

Test exacto de Fisher

0.1297071990

SER_IBV

Mtejido N P TOTAL

NO

% Fila

% Columna

10

4.5

55.6

214

95.5

88.1

224

100.0

85.8

SI

% Fila

% Columna

8

21.6

44.4

29

78.4

11.9

37

100.0

14.2

TOTAL

% Fila

% Columna

18

6.9

100.0

243

93.1

100.0

261

100.0

100.0

186

Tabla 26. Tabla de contingencia para la muestra TEJIDO y los resultados de las

pruebas Serológicas. IBV

Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas

serológicas.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 14.5583

0.0001370565

Chi-square - Mantel-Haenszel 14.5025

0.0001411399

Chi-square - corrected (Yates) 12.0088

0.0005306586

P-media exacta

0.0006817670

Test exacto de Fisher

0.0011912677

SER_IBV

Msuero N P TOTAL

NO

% Fila

% Columna

6

20.7

33.3

23

79.3

9.5

29

100.0

11.1

SI

% Fila

% Columna

12

5.2

66.7

220

94.8

90.5

232

100.0

88.9

TOTAL

% Fila

% Columna

18

6.9

100.0

243

93.1

100.0

261

100.0

100.0

187

27. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las pruebas

Serológicas. IBV

GUMBORO

MOLECULAR

Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas

moleculares.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 9.6667

0.0018775816

Chi-square - Mantel-Haenszel 9.6296

0.0019157992

Chi-square - corrected (Yates) 7.4010

0.0065197736

P-media exacta

0.0047028432

Test exacto de Fisher

0.0080359170

RMOLGUM

Mave Yes No TOTAL

Yes

% Fila

% Columna

1

50.0

2.9

1

50.0

3.1

2

100.0

3.0

No

% Fila

% Columna

34

52.3

97.1

31

47.7

96.9

65

100.0

97.0

TOTAL

% Fila

% Columna

35

52.2

100.0

32

47.8

100.0

67

100.0

100.0

188

Tabla 28. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas

Moleculares GUMBORO

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las

pruebas moleculares.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.0041

0.9486881309

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.0041

0.9490719705

Chi-square - corrected (Yates) 0.4281

0.5129388802

P-media exacta

0.4776119403

Test exacto de Fisher

0.7308909995

RMOLGUM

Mhclocal Yes No TOTAL

Yes

% Fila

% Columna

15

57.7

42.9

11

42.3

34.4

26

100.0

38.8

No

% Fila

% Columna

20

48.8

57.1

21

51.2

65.6

41

100.0

61.2

TOTAL

% Fila

% Columna

35

52.2

100.0

32

47.8

100.0

67

100.0

100.0

189

Tabla 29. Tabla de contingencia para la muestra H CLOACAL y los resultados de las

pruebas Moleculares GUMBORO

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas moleculares.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.5065

0.4766751056

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.4989

0.4799832389

Chi-square - corrected (Yates) 0.2123

0.6450091769

P-media exacta

0.2454668968

Test exacto de Fisher

0.3229754270

RMOLGUM

Mhtraq Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

5 41.7 14.3

7 58.3 21.9

12 100.0 17.9

No % Fila % Columna

30 54.5 85.7

25 45.5 78.1

55 100.0 82.1

TOTAL % Fila % Columna

35 52.2 100.0

32 47.8 100.0

67 100.0 100.0

190

Tabla 30. Tabla de contingencia para la muestra H. TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas Moleculares GUMBORO

Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas

moleculares.

Tabla 31. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las

pruebas Moleculares GUMBORO

Prueba de asociación entre la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas

moleculares

RMOLGUM

Msuero Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

20 62.5 57.1

12 37.5 37.5

32 100.0 47.8

No % Fila % Columna

15 42.9 42.9

20 57.1 62.5

35 100.0 52.2

TOTAL % Fila % Columna

35 52.2 100.0

32 47.8 100.0

67 100.0 100.0

RMOLGUM

Mtejido Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

31 49.2 88.6

32 50.8

100.0

63 100.0 94.0

No % Fila % Columna

4 100.0 11.4

0 0.0 0.0

4 100.0 6.0

TOTAL % Fila % Columna

35 52.2

100.0

32 47.8

100.0

67 100.0 100.0

191

Tabla 32. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas

Moleculare GUMBORO

SEROLOGÍA

Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas serológicas

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 3.8893

0.0485945592

Chi-square - Mantel-Haenszel 3.8313

0.0503052375

Chi-square - corrected (Yates) 2.1199

0.1453949598

P-media exacta

0.0341561424

Test exacto de Fisher

0.0683122847

RSERELIGUMB

Mave Yes No TOTAL

Yes

% Fila

% Columna

1

100.0

2.6

0

0.0

0.0

1

100.0

2.4

No

% Fila

% Columna

37

90.2

97.4

4

9.8

100.0

41

100.0

97.6

TOTAL

% Fila

% Columna

38

90.5

100.0

4

9.5

100.0

42

100.0

100.0

192

Tabla 33. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas

Serológicas GUMBORO

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las

pruebas serológicas

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.1078

0.7426279704

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.1053

0.7456030864

Chi-square - corrected (Yates) 1.9477

0.1628370425

P-media exacta

0.4523809524

Test exacto de Fisher

0.9047619048

RSERELIGUMB

Mhclocal Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

2 66.7 5.3

1 33.3 25.0

3 100.0

7.1

No % Fila % Columna

36 92.3 94.7

3 7.7

75.0

39 100.0 92.9

TOTAL % Fila % Columna

38 90.5

100.0

4 9.5

100.0

42 100.0 100.0

193

Tabla 34. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de las

pruebas Serológicas GUMBORO

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas serológicas

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 2.1255

0.1448659259

Chi-square - Mantel-Haenszel 2.0749

0.1497408673

Chi-square - corrected (Yates) 0.1913

0.6618409212

P-media exacta

0.1426829268

Test exacto de Fisher

0.2651567944

RSERELIGUMB

Mhtraq Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

2 100.0

5.3

0 0.0 0.0

2 100.0

4.8

No % Fila % Columna

36 90.0 94.7

4 10.0

100.0

40 100.0 95.2

TOTAL % Fila % Columna

38 90.5

100.0

4 9.5

100.0

42 100.0 100.0

194

Tabla 35. Tabla de contingencia para la muestra H. TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas Serológicas GUMBORO

Prueba de asociación entre la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas

serológicas.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.2211

0.6382394568

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.2158

0.6422674463

Chi-square - corrected (Yates) 0.5837

0.4448596607

P-media exacta

0.4082462253

Test exacto de Fisher

0.8164924506

RSERELIGUMB

Mtejido Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

11 84.6 28.9

2 15.4 50.0

13 100.0 31.0

No % Fila % Columna

27 93.1 71.1

2 6.9

50.0

29 100.0 69.0

TOTAL % Fila % Columna

38 90.5

100.0

4 9.5

100.0

42 100.0 100.0

195

Tabla 36. Tabla de contingencia para la muestra TEJIDO y los resultados de las

pruebas Serológicas GUMBORO

Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas

serológicas.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.7505

0.3863112483

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.7327

0.3920250122

Chi-square - corrected (Yates) 0.0887

0.7658560005

P-media exacta

0.2219512195

Test exacto de Fisher

0.3634146341

RSERELIGUMB

Msuero Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

35 92.1 92.1

3 7.9 75.0

38 100.0 90.5

No % Fila % Columna

3 75.0 7.9

1 25.0 25.0

4 100.0 9.5

TOTAL % Fila % Columna

38 90.5 100.0

4 9.5 100.0

42 100.0 100.0

196

Tabla 37. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las

pruebas Serológicas GUMBORO.

LARINGOTRAQUEITIS INFECCIOSA – ILT

VIROLOGÍA

Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas

virológicas.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 1.2289

0.2676261853

Chi-square - Mantel-Haenszel 1.1996

0.2733986683

Chi-square - corrected (Yates) 0.0454

0.8311850022

P-media exacta

0.1897882605

Test exacto de Fisher

0.3405253283

RVIRILT

Msuero Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

2 18.2 40.0

9 81.8 14.8

11 100.0 16.7

No % Fila % Columna

3 5.5

60.0

52 94.5 85.2

55 100.0 83.3

TOTAL % Fila % Columna

5 7.6

100.0

61 92.4

100.0

66 100.0 100.0

197

Tabla 38. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las

pruebas Virológicas ILT

Prueba de asociación entre la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas

virológicas

.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 2.1207

0.1453253112

Chi-square - Mantel-Haenszel 2.0885

0.1484103338

Chi-square - corrected (Yates) 0.6925

0.4053299307

P-media exacta

0.1102279777

Test exacto de Fisher

0.1909562212

RVIRILT

Mtejido Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

5 8.9 100.0

51 91.1 83.6

56 100.0 84.8

No % Fila % Columna

0 0.0 0.0

10 100.0 16.4

10 100.0 15.2

TOTAL % Fila % Columna

5 7.6 100.0

61 92.4 100.0

66 100.0 100.0

198

Tabla 39. Tabla de contingencia para la muestra TEJIDO y los resultados de las

pruebas Virológicas ILT

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las

pruebas virológicas.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.9660

0.3256700301

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.9514

0.3293626698

Chi-square - corrected (Yates) 0.1117

0.7382460724

P-media exacta

0.2137096774

Test exacto de Fisher

0.4274193548

RVIRILT

Mhclocal Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

2 13.3 40.0

13 86.7 21.3

15 100.0 22.7

No % Fila % Columna

3 5.9

60.0

48 94.1 78.7

51 100.0 77.3

TOTAL % Fila % Columna

5 7.6

100.0

61 92.4

100.0

66 100.0 100.0

199

Tabla 40. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de las

pruebas Virológicas ILT

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas virológicas.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.9190

0.3377290730

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.9051

0.3414157484

Chi-square - corrected (Yates) 0.1629

0.6864721089

P-media exacta

0.1953753572

Test exacto de Fisher

0.3177118580

RVIRILT

Mhtraq Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

2 16.7 40.0

10 83.3 16.4

12 100.0 18.2

No % Fila % Columna

3 5.6

60.0

51 94.4 83.6

54 100.0 81.8

TOTAL % Fila % Columna

5 7.6

100.0

61 92.4

100.0

66 100.0 100.0

200

Tabla 41. Tabla de contingencia para la muestra H. TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas Virológicas ILT

Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas virológicas.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 1.7311

0.1882653614

Chi-square - Mantel-Haenszel 1.7049

0.1916470048

Chi-square - corrected (Yates) 0.5079

0.4760397552

P-media exacta

0.1298963134

Test exacto de Fisher

0.2214861751

RVIRILT

Mave Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

0 0.0 0.0

4 100.0 6.6

4 100.0

6.1

No % Fila % Columna

5 8.1

100.0

57 91.9 93.4

62 100.0 93.9

TOTAL % Fila % Columna

5 7.6

100.0

61 92.4 100.0

66 100.0 100.0

201

Tabla 42. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas

Virológicas ILT

MOLECULAR

Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas

moleculares.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.3490

0.5546679761

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.3437

0.5576825937

Chi-square - corrected (Yates) 0.1475

0.7009733344

P-media exacta

0.3620372683

Test exacto de Fisher

0.7240745366

RMOLILT

Msuero Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

10 32.3 22.2

21 67.7 31.8

31 100.0 27.9

No % Fila % Columna

35 43.8 77.8

45 56.3 68.2

80 100.0 72.1

TOTAL % Fila % Columna

45 40.5 100.0

66 59.5 100.0

111 100.0 100.0

202

Tabla 43. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las

pruebas Moleculares ILT

Prueba de asociación entre la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas

moleculares.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 1.2241

0.2685651736

Chi-square - Mantel-Haenszel 1.2130

0.2707322125

Chi-square - corrected (Yates) 0.7937

0.3729712759

P-media exacta

0.1395226694

Test exacto de Fisher

0.1869483387

RMOLILT

Mtejido Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

35 39.8 77.8

53 60.2 80.3

88 100.0 79.3

No % Fila % Columna

10 43.5 22.2

13 56.5 19.7

23 100.0 20.7

TOTAL % Fila % Columna

45 40.5

100.0

66 59.5

100.0

111 100.0 100.0

203

Tabla 44. Tabla de contingencia para la muestra TEJIDO y los resultados de las

pruebas Moleculares ILT

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las

pruebas moleculares

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.1039

0.7472375515

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.1029

0.7483399903

Chi-square - corrected (Yates) 0.0070

0.9332203427

P-media exacta

0.3744250132

Test exacto de Fisher

0.4631432444

RMOLILT

Mhclocal Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

5 19.2 11.1

21 80.8 31.8

26 100.0 23.4

No % Fila % Columna

40 47.1 88.9

45 52.9 68.2

85 100.0 76.6

TOTAL % Fila % Columna

45 40.5 100.0

66 59.5 100.0

111 100.0 100.0

204

Tabla 45. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de las

pruebas Moleculares ILT

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas moleculares

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 6.3962

0.0114374130

Chi-square - Mantel-Haenszel 6.3386

0.0118148821

Chi-square - corrected (Yates) 5.2939

0.0214015814

P-media exacta

0.0056173363

Test exacto de Fisher

0.0091236863

RMOLILT

Mhtraq Yes No TOTAL

Yes

% Fila

% Columna

7

30.4

15.6

16

69.6

24.2

23

100.0

20.7

No

% Fila

% Columna

38

43.2

84.4

50

56.8

75.8

88

100.0

79.3

TOTAL

% Fila

% Columna

45

40.5

100.0

66

59.5

100.0

111

100.0

100.0

205

Tabla 46. Tabla de contingencia para la muestra H. TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas Moleculares ILT

Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas

moleculares

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 1.2291

0.2675784698

Chi-square - Mantel-Haenszel 1.2181

0.2697445212

Chi-square - corrected (Yates) 0.7572

0.3842093976

P-media exacta

0.1401341821

Test exacto de Fisher

0.1929261269

RMOLILT

Mave Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

4 44.4 8.9

5 55.6 7.6

9 100.0 8.1

No % Fila % Columna

41 40.2 91.1

61 59.8 92.4

102 100.0 91.9

TOTAL % Fila % Columna

45 40.5

100.0

66 59.5

100.0

111 100.0 100.0

206

Tabla 47. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas

Moleculares ILT

SEROLOGÍA

Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas

serológicas.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.0619

0.8034819689

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.0614

0.8043511469

Chi-square - corrected (Yates) 0.0111

0.9161537320

P-media exacta

0.4020345102

Test exacto de Fisher

0.5337926842

RSERELIILT

Msuero Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

108 92.3 65.5

9 7.7

40.9

117 100.0 62.6

No % Fila % Columna

57 81.4 34.5

13 18.6 59.1

70 100.0 37.4

TOTAL % Fila % Columna

165 88.2

100.0

22 11.8

100.0

187 100.0 100.0

207

Tabla 48. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las

pruebas Serológicas. ILT

Prueba de asociación entre la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas

serológicas.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 4.9935

0.0254435941

Chi-square - Mantel-Haenszel 4.9668

0.0258393510

Chi-square - corrected (Yates) 4.0005

0.0454883348

P-media exacta

0.0158520662

Test exacto de Fisher

0.0241857268

RSERELIILT

Mtejido Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

12 92.3 7.3

1 7.7 4.5

13 100.0 7.0

No % Fila % Columna

153 87.9 92.7

21 12.1 95.5

174 100.0 93.0

TOTAL % Fila % Columna

165 88.2 100.0

22 11.8 100.0

187 100.0 100.0

208

Tabla 49. Tabla de contingencia para la muestra TEJIDO y los resultados de las

pruebas Serológicas. ILT

Prueba de asociación entre la muestra POLLITO y los resultados de las pruebas

serológicas

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.2232

0.6366056347

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.2220

0.6375085904

Chi-square - corrected (Yates) 0.0007

0.9790601498

P-media exacta

0.3585784503

Test exacto de Fisher

0.5318106071

RSERELIILT

MPolllito Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

47 81.0 28.5

11 19.0 50.0

58 100.0 31.0

No % Fila % Columna

118 91.5 71.5

11 8.5 50.0

129 100.0 69.0

TOTAL % Fila % Columna

165 88.2 100.0

22 11.8 100.0

187 100.0 100.0

209

Tabla 50. Tabla de contingencia para la muestra POLLITO y los resultados de las

pruebas Serológicas. ILT

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las

pruebas serológicas.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 4.1997

0.0404320050

Chi-square - Mantel-Haenszel 4.1773

0.0409711997

Chi-square - corrected (Yates) 3.2543

0.0712357739

P-media exacta

0.0257558373

Test exacto de Fisher

0.0386326776

RSERELIILT

Mhclocal Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

8 80.0 4.8

2 20.0 9.1

10 100.0 5.3

No % Fila % Columna

157 88.7 95.2

20 11.3 90.9

177 100.0 94.7

TOTAL % Fila % Columna

165 88.2 100.0

22 11.8 100.0

187 100.0 100.0

210

Tabla 51. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de las

pruebas Serológicas. ILT

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas serológicas

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.6902

0.4060818149

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.6866

0.4073397770

Chi-square - corrected (Yates) 0.1065

0.7441299496

P-media exacta

0.2157253322

Test exacto de Fisher

0.3331513361

RSERELIILT

Mhtraq Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

5 62.5 3.0

3 37.5 13.6

8 100.0

4.3

No % Fila % Columna

160 89.4 97.0

19 10.6 86.4

179 100.0 95.7

TOTAL % Fila % Columna

165 88.2

100.0

22 11.8

100.0

187 100.0 100.0

211

Tabla 52. Tabla de contingencia para la muestra H. TRAQUEAL y los resultados de las

pruebas Serológicas. ILT

Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas

serológicas.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 5.3323

0.0209350571

Chi-square - Mantel-Haenszel 5.3038

0.0212804524

Chi-square - corrected (Yates) 3.0568

0.0804002223

P-media exacta

0.0306420316

Test exacto de Fisher

0.0489089693

RSERELIILT

Mave Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

4 80.0 2.4

1 20.0 4.5

5 100.0 2.7

No % Fila % Columna

161 88.5 97.6

21 11.5 95.5

182 100.0 97.3

TOTAL % Fila % Columna

165 88.2

100.0

22 11.8

100.0

187 100.0 100.0

212

Tabla 53. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas

Serológicas. ILT.

SALMONELLA

Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de cultivo

bacteriológico.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.3356

0.5623566882

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.3338

0.5634035725

Chi-square - corrected (Yates) 0.0154

0.9012002435

P-media exacta

0.2876573125

Test exacto de Fisher

0.4690408672

RBACCULTSALM

Mhclocal Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

2 7.4

22.2

25 92.6 8.3

27 100.0

8.7

No % Fila % Columna

7 2.5

77.8

278 97.5 91.7

285 100.0 91.3

TOTAL % Fila % Columna

9 2.9

100.0

303 97.1 100.0

312 100.0 100.0

213

Tabla 54. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de

Cultivos bacteriológicos

SALMONELLA

Prueba de asociación entre la muestra HECES y los resultados de cultivo

bacteriológico

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 2.1583

0.1418029716

Chi-square - Mantel-Haenszel 2.1514

0.1424430637

Chi-square - corrected (Yates) 0.7527

0.3856212955

P-media exacta

0.1060984476

Test exacto de Fisher

0.1779535839

RBACCULTSALM

Mheces Yes No TOTAL

Yes % Fila % Columna

0 0.0 0.0

4 100.0 1.3

4 100.0 1.3

No % Fila % Columna

9 2.9 100.0

299 97.1 98.7

308 100.0 98.7

TOTAL % Fila % Columna

9 2.9 100.0

303 97.1 100.0

312 100.0 100.0

214

Tabla 55. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de

Cultivos bacteriológicos

SALMONELLA

Prueba de asociación entre la muestra HECES y los resultados de cultivo

bacteriológico

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.1204

0.7286502155

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.1200

0.7290682791

Chi-square - corrected (Yates) 1.3373

0.2475156994

P-media exacta

0.4445004140

Test exacto de Fisher

0.8890008280

RBACCULTSALM

Mpolllito Yes No TOTAL

NO % Fila % Columna

7 4.8

77.8

140 95.2 46.2

147 100.0 47.1

SI % Fila % Columna

2 1.2

22.2

163 98.8 53.8

165 100.0 52.9

TOTAL % Fila % Columna

9 2.9

100.0

303 97.1 100.0

312 100.0 100.0

215

Tabla 56. Tabla de contingencia para la muestra POLLITO y los resultados de Cultivos

bacteriológicos

SALMONELLA

E. Coli. Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de

cultivo bacteriológico

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 3.4968

0.0614875263

Chi-square - Mantel-Haenszel 3.4856

0.0619051946

Chi-square - corrected (Yates) 2.3445

0.1257285848

P-media exacta

0.0367612985

Test exacto de Fisher

0.0618238556

RBACCULTCOLI

Mhclocal N P TOTAL

NO % Fila % Columna

71 28.0 94.7

183 72.0 95.8

254 100.0 95.5

SI % Fila % Columna

4 33.3 5.3

8 66.7 4.2

12 100.0 4.5

TOTAL % Fila % Columna

75 28.2 100.0

191 71.8 100.0

266 100.0 100.0

216

Tabla 57. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de

Cultivos bacteriológicos COLI

Prueba de asociación entre la muestra HECES y los resultados de cultivo

bacteriológico.

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.1639

0.6856321827

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.1632

0.6861921373

Chi-square - corrected (Yates) 0.0059

0.9390092932

P-media exacta

0.3389145135

Test exacto de Fisher

0.4519043018

RBACCULTCOLI

Mheces N P TOTAL

NO % Fila % Columna

75 28.3

100.0

190 71.7 99.5

265 100.0 99.6

SI % Fila % Columna

0 0.0 0.0

1 100.0

0.5

1 100.0 0.4

TOTAL % Fila % Columna

75 28.2

100.0

191 71.8

100.0

266 100.0 100.0

217

Tabla 58.Tabla de contingencia para la muestra HECES y los resultados de Cultivos

bacteriológicos E. COLI

Prueba de asociación entre la muestra POLLITO y los resultados de cultivo

bacteriológico

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 0.3942

0.5301255539

Chi-square - Mantel-Haenszel 0.3927

0.5308997312

Chi-square - corrected (Yates) 0.2357

0.6273147553

P-media exacta

0.3590225564

Test exacto de Fisher

0.7180451128

RBACCULTCOLI

Mpolllito N P TOTAL

NO % Fila % Columna

30 22.9 40.0

101 77.1 52.9

131 100.0 49.2

SI % Fila % Columna

45 33.3 60.0

90 66.7 47.1

135 100.0 50.8

TOTAL % Fila % Columna

75 28.2

100.0

191 71.8

100.0

266 100.0 100.0

218

Tabla 154. Tabla de contingencia para la muestra POLLITO y los resultados de

Cultivos bacteriológico E. COLI

(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)

TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas

Chi-square - uncorrected 3.5742

0.0586860216

Chi-square - Mantel-Haenszel 3.5607

0.0591628520

Chi-square - corrected (Yates) 3.0774

0.0793865099

P-media exacta

0.0302729310

Test exacto de Fisher

0.0394502378