el sistema circadiari - fisica.upc.edu · proposta final del model. 12 antoni díez noguera...

45
1 Antoni Díez Noguera [email protected] Univ.Barcelona, 2009 U B 1 GRUP DE CRONOBIOLOGIA GRUP DE CRONOBIOLOGIA Modelitzaci Modelització en Cronobiolog en Cronobiología Antoni Díez Noguera Grup de Cronobiologia Facultat de Farmàcia, Universitat de Barcelona Barcelona, 2009 UNIVERSITAT DE BARCELONA Antoni Díez Noguera [email protected] Univ.Barcelona, 2009 U B 2 El sistema circadiari

Upload: others

Post on 19-Sep-2019

0 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

1

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

1

GRUPDECRONOBIOLOGIA

GRUPDECRONOBIOLOGIA

ModelitzaciModelitzacióóen Cronobiologen Cronobiologííaa

Antoni Díez Noguera

Grup de CronobiologiaFacultat de Farmàcia, Universitat de Barcelona

Barcelona, 2009

UNIVERSITAT DE BARCELONA

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

2

El sistema circadiari

2

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

3

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

4

3

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

5

NSQ-H(augmentat)

VIP

3V

QOQO

Sistemes efectors

RafeSerotonina

LIG

CGL

NP Y

Retina

TRH

Glutàmic

NPV-T

NDM-H

NPV-H

Pineal

Medul·la

GSC

Melatonina

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

6

4

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

7

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

8

NSQNSQ

5

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

9

Roda giratòria Feixos IR creuats

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

10

díes

hores

actograma

x 2Actograma: double plot

dades...

24 horesmòdul T

..

.

. . .

polsos

24 h 48 h0 h

6

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

11

• Locomoció• Exploració• Alimentació• Neteja• Tremolor• Gratar-se• Ansietat•...

Locomoció

ExploracióAlimentació

Neteja Tremolor

Gratar-se

Σ= activitat motora

24 hores

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

12

Proposta inicialdel model

7

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

13

Desenvlupament del ritme en rates joves

23 d

60 d

0h 24h

Diez-Noguera A et al., J Interdiscipl Cycle Res 19:65-74, 1988

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

14

23 d

60 d

0h 24h

8

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

15

XX

YY

X, Y = [Na+] [K+] [GLU] Vm

x = f(x,y) = 1 - xy

1 + by = g(x,y) = ay ( x - )

1 + bySelkovBrusselator Kagan-Kepler-EpsteinPavlidisVan der PolRayleighDuffin

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

16

I: Intensitat de l’acoblament

x = x + (Σxi - nx) I / (n-1)

y = y + (Σyi - ny) I / (n-1)

~

~

~

~

XX

YY

Interacció = acoblament

9

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

17

Runge - Kutta de 2º ordre

Interacció = acoblamentImplementació pràctica

I: Intensitat de l’acoblament

x = x + (Σxi - nx) I / (n-1)

y = y + (Σyi - ny) I / (n-1)

~

~

~

~

XX

YY

x = f(x,y) = 1 - xy

1 + by = g(x,y) = ay ( x - )

1 + by

++

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

18

0h0h 24h24h

24.224.324.424.524.624.724.824.9

2525.1

0 200 400 600 800 1000lux

tau

(h)

Efecte tònicde la llum

10

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

19

LLINDAR

SALIDA

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

20

n oscillators

X

YY

X

YY

X

YY

Intensitat de l’acoblament

Intensitat de la llum

11

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

21

tau

tau

Simulacióamb sistemes

multiosciladorsSistemes reals

I: Intensitat de l’acoplament

lux lux

I: Intensitat de l’acoplament

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

22

Proposta finaldel model

12

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

23

LLINDAR

SALIDA

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

24

I

X

Y35

Intensitat de l’acoblament

tau

(h)

030

25

20

150 0.5 1 1.5 2

N d’elements neutres

12

48

16

I

X

Y

13

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

25

0h0h 24h24h

CT 0CT 0

66

1212

1818

Curva de respuestas de fase

-2

-1

0

1

2

3

0 4 8 12 16 20 24tiempo circadiano

cam

bio

de fa

se

Efecte fàsicde la llum

CT 0CT 0

66

1212

1818

CT 0CT 0

66

1212

1818

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

26

Δφ = f( I, a, b,... )

Mecanismeparamètric

S.C.

Efecte tònic

Mecanismeno paramètric

Δφ = f( φt )

S.C

Efecte fàsic

Colin Pittendrigh1918-1996Colin Pittendrigh1918-1996

Jürgen Aschoff1913-1998Jürgen Aschoff1913-1998

14

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

27

μi μj

YY

XX

μi = μj

YY

XX

II

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

28

YY

XX

YY

XX XX

YY

15

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

29

• Sortida• aditiva, llindar,

• Sortida• aditiva, llindar,

Diez-Noguera A, Am J Physiol 267:R1118-R1135, 1994

• Acoblament intern• modulat per la llum (inhibit)• desenvolupament postnatal• feedback

• Acoblament intern• modulat per la llum (inhibit)• desenvolupament postnatal• feedback

• Elements neutres• Elements neutres

• N osciladors• cicle límit• trajectòria asimètrica• velocitats diferents

• N osciladors• cicle límit• trajectòria asimètrica• velocitats diferents

LLINDAR

SORTIDA(efector)

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

30

Drosophila melanogaster

Helfrich-Förster & Díez-Noguera, J Interdiscipl Cycle Res 24:225-, 1993

29

24

19

4 3 2 1 0lux

tau

(h) perl

wtpers

29

24

19

2 6 10 14 18I. acoplamiento

tau

(h) 1 n

2 n14 n

distancia = k I distancia = k I

16

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

31

llindar

SORTIDA(efector)

CCèèll··luleslules glialsglials: : astròcitsastròcits ¿¿??

NeuronesNeurones, clusters , clusters ¿¿??

Modificable, plasticidad Modificable, plasticidad ¿¿??

Welsh DK, Reppert SM. 1996; Brain Res

Welsh DK, et al. 1995; Neuron

Díez-Noguera A, et al. 1992; J Interd Cycle ResDiez-Noguera A, Cambras T, 1988; Physiol Behav

PlasticitatPlasticitat……

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

32

17

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

33

23 d

60 d

0h 24h

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

34

Verificaciódel model

18

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

35

0 6 12 18 24 30

25h

LD 3/1 T=4h

28h22h

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

36

Vilaplana J et al., Am J Physiol 272:R95-R102, 1997

díes 70

0

41

34

39

29

38

70

111

145

184

213

251

24 h

19

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

37

T=22 h T=23 h T=24 h T=25 h T=26 h T=27 h T=28 h

Vilaplana J et al., Chronobiol Int 14:9-18, 1997

Tots els actogrames en mòdul 24 h

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

38

T=22 h T=23 h T=24 h

Tots els actogrames en mòdul 24 h

Vilaplana J et al., Chronobiol Int 14:9-18, 1997

20

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

39

T=22 h T=23 h T=24 h T=25 h T=26 h T=27 hT=21 h

Todos los actogramas en módulo de T

Campuzano A, et al., Physiol Behav 67:791-797, 1999.

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

40

QO

33VV

NSQ

TRH

de la Iglesia H et al., Curr Biol 14:796-800, 2004

21

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

41

Relació de fases entre components ultradiarisRatolins encarrilats a LD T=21h

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

42

-1 ,5

-1

-0 ,5

0

0 ,5

1

1 ,5

2

0 4 8 12 1 6 20 2 4

Temps circadiari

Incr

emen

t de

fase

PRCCRF per Gallus domesticus

-3

-2

-1

0

1

2

3

4

5

6

7

0 4 8 12 16 20 24Temps circadiari

Incr

emen

t de

fase

CRF per Paramecium bursaria

-6

-4

-2

0

2

4

6

0 4 8 1 2 16 20 2 4Temps circadiari

Incr

emen

t de

fase

CRF per Passer domesticus

-3

-2

-1

0

1

2

3

4

0 4 8 12 16 2 0 2 4Temps circadiari

Incr

emen

t de

fase

Gallus domesticus Taphozous melanopogon

Paramecium bursaria Passer domesticus

22

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

43

CRF amb 64 oscil.ladors tipus Selkov

-1 ,5

-1

-0 ,5

0

0,5

1

1,5

0 5 1 0 1 5 20 2 5

Pseudo temps circadiari

Incr

emen

t de

fase

CRF amb 64 oscil.ladors tipus Brusellator

-0 ,7

-0 ,6

-0 ,5

-0 ,4

-0 ,3

-0 ,2

-0 ,1

0

0 ,1

0 ,2

0 ,3

0 4 8 1 2 1 6 2 0 24

Pseudo temps circadiari

Incr

emen

t de

fase

Selkov Brusselator

Low coupling ( L ) High coupling ( D )

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

44

CRF amb 64 oscil.ladors tipus Pavlidis

-1 ,6

-1 ,4

-1 ,2

-1

-0 ,8

-0 ,6

-0 ,4

-0 ,2

0

0 ,2

0 ,4

0 4 8 1 2 16 20 24

Pseudo temps circadiari

Incr

emen

t de

fase

CRF amb 64 oscil.ladors tipus glicolisi

-4

-3

-2

-1

0

1

2

0 4 8 1 2 1 6 20 24

Pseudo temps circadiari

Incr

emen

t de

fase

Pavlidis Glycololysis

Low coupling ( L ) High coupling ( D )

23

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

45

CRF amb 64 oscil.ladors tipus Kagan-Kepler-Epstein

-0 ,5

-0 ,4

-0 ,3

-0 ,2

-0 ,1

0

0 ,1

0 ,2

0 ,3

0 ,4

0 ,5

0 4 8 1 2 16 20 24

Pseudo temps circadiari

Incr

emen

t de

fase

CFR amb 64 oscil.ladors tipus Wilson-Lowan

-0 ,2

-0 ,1 5

-0 ,1

-0 ,0 5

0

0 ,0 5

0 4 8 12 16 20 2 4

Pseudo temps circadiari

Incr

emen

t de

fase

Kagan-Kepler-Epstein Wilson-Lowan

Low coupling ( L ) High coupling ( D )

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

46

x = f(x,y) = 1 - xy

1 + by = g(x,y) = ay ( x - )

1 + by

x = f(x,y) = 1 - xy

1 + by = g(x,y) = ay ( x - )

1 + by

SelkovBrusselatorKagan-Kepler-EpsteinPavlidis

SelkovBrusselatorKagan-Kepler-EpsteinPavlidis

24

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

47

PRC PRC

On és la PRC ?PRC PRC

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

48

Complexitatexterna

25

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

49

LD

H%

AMAliment

Aigua

Aislament

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

50

26

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

51

LD

lux

lux

lux

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

52Rang d’encarrilament

Boulos et al., J Biol Rhytm 2002

27

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

53

tiempo

fase

tiempo

fase

Encarrilament fàsic versus tònic

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

54

Irradiància solar

28

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

55

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

56

29

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

57

Olores (3 diferentes)Ventiladores

Movimiento externo 2

SonidoMovimiento externo 1

Movimiento jaula

Calefactor (8-10º)

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

58

85 dies, T=1455

30

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

59

Complexitatinterna

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

60

TopologicalSpatial structure, interconnections

PopulationalDifferences between the oscillators

IntrinsicCharacterisctics of each oscillator

31

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

61

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

62

32

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

63

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

64

Selkov Rösler

16

18

20

22

24

26

28

30

32

0,01 0,1 1I

T

16

18

20

22

24

26

28

30

32

0,01 0,1 1

I

T

33

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

65

Selkov

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

66

Rösler YZ

34

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

67

Contrast L/D (nivells d’acoblament)

Foscor D

LlumL

Chiesa JJ et al., J Biol Rhythms 21:45-57, 2009

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

68

Contrast L/D (nivells d’acoblament)

Chiesa JJ et al., J Biol Rhythms 21:45-57, 2009

35

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

69

Chiesa JJ et al., J Biol Rhythms 21:45-57, 2009

Transició amb T=22, LD:300/0 > LD:300/0,1

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

70

The “Barcelona-Model” of the Activity/Rest (Motor) Cycle in Rats

Colin Pittendrigh, Barcelona, març de 1994

36

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

71

Mari SansPD

Trini CambrasPTU

Montse AnglésBRD

Ágata CarpentieriBFC

Toni Díez NogueraCU Juan Chiesa

BFPU

GrupGrup de Cronobiologiade Cronobiologia

M Merçè CanalPA

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

72

Moltes gràciesMoltes gràcies

37

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

73

Muchas gracias

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

74

Muchas gracias

38

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

75

Muchas gracias

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

76

Campuzano A, et al. Campuzano A, et al. PhysiolPhysiol BehavBehav 63:17163:171--176, 1998176, 1998

2020

4040

CELCEL

CNELCNEL

%VE%VE

6060

2121 2222 2323 T(hT(h))

25.025.0

25.425.4

2121 2222 2323 T(hT(h))

CNELCNEL

T=21T=21 T=22T=22 T=23T=23

Todos los Todos los actogramasactogramas en men móódulo de Tdulo de T

39

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

77Pavlidis

y1

yb

ax)y(1

xyy

ax)y(1

xy0.06cx

+−

++=

++−= ⎟

⎠⎞

⎜⎝⎛

y2

xbxy

y2

xb)x(1ax

−=

++−=

Brusselator

( )ya

xyby

axy1x

−=

−=

Glycolysis (metabolic)

⎟⎠⎞

⎜⎝⎛

+

+−=

−=

by1

b1xayy

xy1x

Selkov Kagan-Keppler-Epstein

2y1

xycyay

2y1

xyybx

+−−=

+−= ⎟

⎠⎞

⎜⎝⎛

ybxy

y3

x1)x(ax

−=

−−+=

Wilson-Lowan

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

78

T=21T=21 T=22T=22 T=23T=23

TT=21=21

nntautau

periodperiodoo TT=22=22

nntautau

periodperiodoo TT=23=23

nntautau

periodperiodoo

40

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

79

T=21 h T=21.5 h T=22 h T=22.5 h T=23.5 h

Tots els actogrames en mòdul T

Campuzano A, et al., Physiol Behav 63:171-176, 1998

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

80

50 minAnant ràpid

41

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

81

¿ Qué es un entorno complejo ?

¿ Qué es un entorno complejo ?

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

82

A+a+A+a+

42

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

83

M.C. Escher, Day and Night, 1938

““Entre el dia i la nit, no hi ha paret ni Entre el dia i la nit, no hi ha paret ni tabictabic””

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

84

Muchas gracias

43

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

85

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

86

44

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

87

M.C. Escher, Day and Night, 1938

““Entre el dia i la nit, no hi ha paret ni Entre el dia i la nit, no hi ha paret ni tabictabic””

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

88

45

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

89

LuzLuz

SonidosSonidos

TemperaturaTemperatura

Contacto socialContacto social

Proceso BProceso B

Proceso Proceso AA

EntornoEntorno

OrganismoOrganismo

Antoni Díez [email protected], 2009

U

B

90

Competidors

Predadors

Simbiosi

Disponibilitatd’aliment