détermination structurale de la cassiicoline, la toxine ... · 1 - centre de biochimie...

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Corynespora cassiicola est un champignon phytopathogène nécrotrophe capable d'infecter plus de 70 plantes hôtes, parmi lesquelles, la tomate, le concombre, le coton, le soja ou l'hévéa. Dans le cas de l'hévéa, la pathologie induite par C. cassiicola se manifeste par des défoliations massives générant des pertes de productions importantes. Cette infection est en constante progression dans toutes les zones de production. Nous avons isolé et purifié le facteur déterminant de la pathogénicité du champignon 1 : la cassiicoline, une protéine de 2885 Da constituée de 27 résidus dont 6 cystéines, toutes impliquées en pont disulfure (réaction dEllman). Cependant, la séquence obtenue par Edman était encore partielle lorsque létude RMN de la cassiicoline en solution a débuté. Détermination structurale de la cassiicoline, la toxine glycosylée de Corynespora cassiicola. Philippe Barthe 1 , Valérie Pujade-Renaud 2 , Marie- Pierre Duviau 3 , Frédéric de Lamotte 3 , Christian Roumestand 1 . 1 - Centre de Biochimie Structurale, 29 rue de Navacelles, 34090 Montpellier, France. 2 - CIRAD, TA 80/03, avenue Agropolis, 34398 Montpellier Cedex 5, France. 3 - INRA, Bat. 21, 2 place Viala, 34060 Montpellier Cedex 1, France. La RMN a permis dobtenir la séquence complète de la protéine en levant les ambiguïtés qui persistaient suite au séquençage dEdman. Les expériences RMN du 13 C ont démontré la O- glycosylation de la Thr2 par un α-mannose O-méthylé en C3. Finalement, la structure tri- dimensionnelle de cette toxine a été déterminée avec une grande précision 2 . Elle est constituée dun feuillet β dont les 3 brins β anti-parallèles sont stabilisés par 3 ponts-disulfures. (1) de Lamotte F. et al., Purification and characterization of cassiicolin, the toxin produced by Corynespora cassiicola, causal agent of the leaf fall disease of rubber tree. J. Chromatogr. B (2007) sous-presse. (2) Barthe P. et al., Structural Analysis of Cassiicolin, a Host-selective Protein Toxin from Corynespora cassiicola., J. Mol. Biol. (2007) 367, 89–101. Essais biologiques sur des feuilles dhévéa. Léchantillon et sa dilution au dixième ont été placés respectivement à gauche et à droite de chaque feuille, après scarification. Feuille de gauche, fraction purifiée du milieu de culture de C. cassiicola Feuille de droite, contrôle négatif (Tris-HCl 10 mM, pH 7.5). La cassiicoline est O-glycosylée sur la Thréonine 2. (a) Superposition des spectres [ 1 H- 13 C]-HSQC (rouge) et [ 1 H- 13 C]-HSQC- TOCSY (noir) de la cassiicoline. Les carbones du sucre sont anotés . (b) et (c) Bandelettes extraites du spectre ge-HMBC montrant les connections entre le proton anomérique du sucre et le Cβ de la Thr2 (b) et la méthylation du C3 du mannose (c). ω ij = 1/ N exp 0.5 r ij n r 0 ( ) 2 / s 2 ( ) ( ) n =1 N ω p = Πω ij Identification des ponts disulfures par analyse statistique des distances Cβ-Cβ des 6 cystéines. (a) ω ij est le poids pour les 15 ponts disulfures possibles calculé à partir de 20 conformères de cassiicoline avec le paramètre de dispersion s=1 (barre blanche) et s=2 (barre noire). (b) ω p est la probabilité pour chacune des 15 combinaisons (de 3 ponts disulfures) possibles. Attribution de la cassiicoline. (a) Spectre TOCSY (80 ms) de la cassiicoline (1 mM) à 20°C, pH 3.3, montrant les connections NH- aliphatiques. (b) Spectre [ 1 H- 15 N]- HSQC de la cassiicoline enregistré en abondance naturelle. b) a) Structure 3D de la cassiicoline. (a) Superposition des 20 meilleures structures. (b) Représentation en ruban du squelette de la cassiicoline. Les chaînes latérales sont représentées en bâtonnet, avec les résidus polaires en orange, les hydrophobes en vert et lacide en rouge. Lenveloppe de la toxine est matérialisée en gris clair. a) b) 20ème Congrès du GERM (Groupe d'Etude de Résonance Magnétique), 2007/03/25-30, Alénya, France.

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Page 1: Détermination structurale de la cassiicoline, la toxine ... · 1 - Centre de Biochimie Structurale, 29 rue de Navacelles, 34090 Montpellier, France. 2 - CIRAD, TA 80/03, avenue Agropolis,

Corynespora cassiicola est un champignon phytopathogène nécrotrophe capabled'infecter plus de 70 plantes hôtes, parmi lesquelles, la tomate, le concombre, lecoton, le soja ou l'hévéa. Dans le cas de l'hévéa, la pathologie induite parC. cassiicola se manifeste par des défoliations massives générant des pertes deproductions importantes. Cette infection est en constante progression dans toutesles zones de production.Nous avons isolé et purifié le facteur déterminant de la pathogénicité  duchampignon1 : la cassiicoline, une protéine de 2885 Da constituée de 27 résidusdont 6 cystéines, toutes impliquées en pont disulfure (réaction d’Ellman).Cependant, la séquence obtenue par Edman était encore partielle lorsque l’étudeRMN de la cassiicoline en solution a débuté.

Détermination structurale de la cassiicoline, la toxineglycosylée de Corynespora cassiicola.

Philippe Barthe1, ValériePujade-Renaud2, Marie-

Pierre Duviau3, Frédéric deLamotte3, Christian

Roumestand1.

1 - Centre de Biochimie Structurale, 29 ruede Navacelles, 34090 Montpellier, France.2 - CIRAD, TA 80/03, avenue Agropolis,

34398 Montpellier Cedex 5, France.3 - INRA, Bat. 21, 2 place Viala, 34060

Montpellier Cedex 1, France.

La RMN a permis d’obtenir la séquence complète de la protéine en levant les ambiguïtés quipersistaient suite au séquençage d’Edman. Les expériences RMN du 13C ont démontré la O-glycosylation de la Thr2 par un α-mannose O-méthylé en C3. Finalement, la structure tri-dimensionnelle de cette toxine a été déterminée avec une grande précision2. Elle estconstituée d’un feuillet β dont les 3 brins β anti-parallèles sont stabilisés par 3 ponts-disulfures.(1) de Lamotte F. et al., Purification and characterization of cassiicolin, the toxin produced by Corynespora cassiicola, causal agent of the leaf fall disease of rubber tree. J. Chromatogr. B (2007) sous-presse.(2) Barthe P. et al., Structural Analysis of Cassiicolin, a Host-selective Protein Toxin from Corynespora cassiicola., J. Mol. Biol. (2007) 367, 89–101.

Essais biologiques sur des feuillesd’hévéa. L’échantillon et sa dilution audixième ont été placés respectivement àgauche et à droite de chaque feuille, aprèsscarification. Feuille de gauche, fractionpurifiée du milieu de culture de C. cassiicolaFeuille de droite, contrôle négatif (Tris-HCl10 mM, pH 7.5).

La cassiicoline est O-glycosylée sur laThréonine 2. (a) Superposition des spectres[1H-13C]-HSQC (rouge) et [1H-13C]-HSQC-TOCSY (noir) de la cassiicoline. Lescarbones du sucre sont anotés . (b) et (c)Bandelettes extraites du spectre ge-HMBCmontrant les connections entre le protonanomérique du sucre et le Cβ de la Thr2 (b)et la méthylation du C3 du mannose (c).

ω ij =1/N exp − 0.5 rijn − r0( )2 /s2( )( )

n=1

N

ω p =Πω ij

Identification des ponts disulfures paranalyse statistique des distances Cβ-Cβdes 6 cystéines. (a) ωij est le poids pour les15 ponts disulfures possibles calculé àpartir de 20 conformères de cassiicolineavec le paramètre de dispersion s=1 (barreblanche) et s=2 (barre noire). (b) ωp est laprobabilité pour chacune des 15combinaisons (de 3 ponts disulfures)possibles.

Attribution de la cassiicoline.(a) Spectre TOCSY (80 ms) de lacassiicoline (1 mM) à 20°C, pH3.3, montrant les connections NH-aliphatiques. (b) Spectre [1H-15N]-HSQC de la cassiicoline enregistréen abondance naturelle.

b)

a)

Structure 3D de la cassiicoline. (a) Superpositiondes 20 meilleures structures. (b) Représentation enruban du squelette de la cassiicoline. Les chaîneslatérales sont représentées en bâtonnet, avec lesrésidus polaires en orange, les hydrophobes en vertet l’acide en rouge. L’enveloppe de la toxine estmatérialisée en gris clair.

a)

b)

20ème Congrès du GERM (Groupe d'Etude de Résonance Magnétique), 2007/03/25-30, Alénya, France.