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Scale‐up ‐ Scale‐down : vers une meilleure intégration industrielle des
biotechnologies blanches
Frank Delvigne (Ulg‐GxABT)
Agro-Bio Tech
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Exploitation industrielle des micro‐organismes : biotechnologies
Définition formelle des biotechnologies :
Les biotechnologies sont l’ensemble des méthodes et des techniques qui utilisent comme outils des organismes vivants (cellules animales et végétales, micro‐organismes…) ou des parties de ceux‐ci (gènes, enzymes, …) pour des applications environnementales, agro‐alimentaires ou biomédicale
Biotechnologies blanches : emploi de systèmes biologiques pour la production industrielle en remplacement des voies chimiques actuellement empruntées
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Micro‐organismes : organismes microscopiques dont les espèces unicellulaires peuvent être cultivées à des concentrations de 1010 cellules/mLConcept de la microbial cell factory – usine microscopiques cellulaire
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Fermentation naturelle par des micro‐organismes (acétique, alcoolique ou lactique)
Production de métabolites primaires (acides, alcools,…)
Production de métabolites secondaires (antibiotiques, polysaccharides, arômes,…)
Production d’enzymes (amylases, cellulases, lipases,…)
Production de protéines recombinantes (fragments d’anticorps, insuline humaine,…)
Evolution des technologies de fermentation
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Bactéries à Gram négatif Bactéries à Gram positif
Levures Moisissures
Micro‐algues
Cellules animales, végétales, insectes
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1m 1 cm 1mm 100µm 10µm 1µm 100nm 10nm 1nm
1m 1 cm 1mm 100µm 10µm 1µm 100nm 10nm 1nm
Maîtriser la biologie…
… dans des systèmes de culture industriels
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Principe de fonctionnement des bioréacteursPrincipes de fonctionnement d’un bioréacteur
‐ Epuration des eaux‐ Biogaz‐ Biocarburant‐ Acides organiques‐ Alcools‐ Acides aminés‐ Enzymes‐ Polymères‐ Arômes‐ Antibiotiques‐ Protéines recombinantes
Prix de revient
Volume du réacteur
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Quelques exemples
Bioéthanol
Production d’enzymes
Epuration des eaux Biogaz
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Bioréacteur de type cuve mécaniquement agitée
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‐ Transfert de masse‐ Transfert de chaleur‐ Transfert de quantité de mouvement
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Paramètres à contrôler :
‐ Agitation‐ Température‐ pH
‐ Oxygène dissous‐ Concentration en substrat‐ Potentiel rédox‐ Apport de lumière
Besoin d’un système senseur‐actuateur
Le développement des bioréacteurs va de pair avec le développement de capteurs adéquats
Si pas de rétro-action par un senseur, boucle de régulation ouverte
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Développement des bioprocédés : scale‐up and scale‐downDéveloppement des bioprocédés : scale‐up et scale‐down
Echelle du laboratoire –screening primaire
Reactor dimension (D)
Echelle laboratoire – screening secondaire
Echelle pilote et industrielle
Capacité de transfert d’oxygène limitéePas de capteurs et de régulation
Diminution des performances de mélange
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Scale‐up ou extrapolation des bioprocédés
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Gradient de substrat dans les procédés fed‐batch
Enfors et al. [2001] Journal of biotechnology
Gradient en oxygène dissous dans les procédés aérobies
Schütze et al. [2006] 12th European Conference on Mixing
Problèmes associés au scale‐up
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Problème associé au scale‐up
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Scale‐down : miniaturisation et parallélisation
Tendance actuelle : trouver des souches microbiennes mieux adaptées aux conditions de procédés (sans avoir recours au génie génétique)
Besoins en développement de bioréacteurs de petite dimension permettant d’effectuer des culture en parallèle
→ Scale‐down : principes permettant de reproduire un procédé (microbien) à petite échelle en considérant les contraintes rencontrées à l’échelle industrielle
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1m 1 cm 1mm 100µm 10µm 1µm
On démarre avec des outils bien connu (ou que l’on pense connaître)
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Enregistrement de la pO2 (système Presens)
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OXY‐mini4 channels
IO converter
Orbital incubator(T° and shaking frequency
controls)
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Fiole « classique »
Fiole « mini‐réacteur »
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Profil obtenu à partir d’un bioréacteur mécaniquement agité
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Cuve agitée miniature (VL = 18 ml)
Colonne à bulles miniature (VL = 2 ml)
Betz and Baganz [2006] 26
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1m 1 cm 1mm 100µm 10µm 1µm 100nm 10nm 1nm
1m 1 cm 1mm 100µm 10µm 1µm 100nm 10nm 1nm
Micro‐réacteurs?
Mini‐réacteurs
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Système dropsot :
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‐ La maîtrise des bioprocédés à toujours fait appel à une approche multidisciplinaire mêlant biologie avec les sciences de l’ingénieur
‐ Plus que jamais, cette approche disciplinaire est de mise (sciences des matériaux, des interfaces, microélectronique, mécanique des fluides,….)
Les tendances actuelles sont à l’ « ultra scale‐down », c’est‐à‐dire à l’élaboration d’outils permettant de manipuler les micro‐organismes à l’échelle micro (techniques « single cell ») et nano (détection d’une seule molécule à la surface des membranes cellulaires, …)
Ces techniques permettront d’aboutir à des procédés de biotechnologies blanches réellement efficient avec une maîtrise quasi parfaite des systèmes biologiques
Conclusion