Agus Muji SantosoUniversitas Nusantara PGRI Kediri
[email protected]+62 82333 851 444
Potensi Analisis In Silico dalam Eksplorasi Biodiversitas dan Pengajarannya di Kelas
(Dipresentasikan di Webinar HPPBI Wilayah Maluku Utara)Sabtu, 30 Mei 2020
优品PPT
Agus Muji SANTOSO (33 tahun)
S1 (2009) : S.Pd. Pend Biologi UNP KediriS2 (2012) : M.Si. Biologi Universitas AirlanggaS3 (2017) : Dr. Pend. Biologi Universitas Negeri Malang
ITTEP-STOLS Japan (2017) & Summer Course IPB-Jerman (IGN TRRC) (2012), Beswan PPA (2007-2009), Beswan BCF (2010-2012), Beswan BPPDN RI (2013-2016), nara sumber LSLC Kemendikbud (2018-2019).
Karya Monumental Paten/pun Hak Cipta (7 judul): Formulasi Konsorsium Mikroba Non Simbiotik untuk Peningkatan Produktivitas Ginseng Jawa, MetodeEkstraksi Ginsenoside Umbi Ginseng Jawa, Optimasi Kondisi Kultur Agregat Sel Ginseng Jawa pada MediumKultur Cair, Bahan Ajar Bioinformatika Berbasis Web Offline, Strategi Pembelajaran Inovatif ASICC,Pengembangan Teknik Poliploidi Mawar Tinggi Rendemen Atsiri, ARPE: Model Integrasi Hasil Riset dalamPembelajaran Sains.
78 senyawa, 6 senyawa berpotensi antibakteri mastitis (pa. > 0.9), 2
memiliki aksi multitargeting di dalam sel (Santoso et al., 2018)
ada 103 senyawa, 13 jenis Ginsenoside (antidiabetik, antioksidan, antiviral,
antibakteri, antitrombotik) (Santoso et al.2016, 2017, 2019)
ada 88 senyawa, 5 senyawa penting dalam anticancer (apoptosis) (Izzatur et al., 2020)
ada 116 senyawa, 12 jenis physalin, 4 physalin
sebagai antineoplastis (breast) (Santoso et al.,
2019)
setelah tereksplorasi potensi Biodiversitas tadi,
bagaimana informasi tadi dapat digunakan
untuk menambah pengetahuan menambah
wawasan menambah kesadaran masyarakat
(mahasiswa calon pendidik Biologi)?
tahu
menggunakan
melestarikan
yakin
kuat konsep
CP/kompetensi tercapai
Fossion et al. (2019)
pengetahuan (tahu) diperoleh dari pengamatan objek
yang sebenarnya kompleks (karakteristik sains)
reduksi
modeling
berdimensi
(besaran) &
berskala
rasional
&
inderawi
metodik &
dapat
diulang
Santoso et al. (2017)
bagaimana pembelajaran bagi calon pendidik Biologi
berwawasan masa depan?
karena kompleks yang dikaji, bagaimana sebuah molekul
“berperilaku” cerdas? bagaimana molekul tadi
bekerja dengan sasamanya? Jika masuk dalam sebuah sel
,bagaimana mekanisme aksinya?
analisis in silico (Bioinformatika) membantu kita memfasilitasi sebuah
pemodelan dan analisis data base berbasis komputasi
ARPE
Analyze
Re-
organize
Piloting
Evaluate
1. Analyzeuji kelayakan hasil riset Biodiversitas dan uji
kesesuaikan substansi riset terhadap kurikulum (PL,
CP, kedalaman dan keluasan materi), oleh expert dan
praktisi
2. Re-organizeMengorganiasikan kembali varibel pembelajaran
sesuai rekomendasai tahap analyze (dalam
bentuk lesson plan)
3. PilotingMengujicobakan hasil re-organisasi pembelajaran
pada kelas target
4. EvaluateMenyempurnakan kembali lesson plan
Analyze (1)
Analyze (lanjutan-1)
Analyze (lanjutan-2)
Re-organize
Awal:
TPS
ppt
Video dari Youtube
Hasil Organisasi Ulang
TPS termodifikasi (analisis in silico)
ppt
Hasil pemayaran dengan PyMOL
Lesson Plan
Re-organize
Awal:
TPS
ppt
Video dari Youtube
RPP
Hasil Organisasi Ulang
TPS termodifikasi (analisis in silico)
ppt
Hasil pemayaran dengan PyMOL
Lesson Plan
Piloting
dilaksanakan secara open class
Evaluate
Juga dilakukan perbaikan lesson plan
integrasi analisis in
silico ke beberapa MK
secara embeded
dengan memilih
salah satu atau lebih
alternatif berikut:
untuk menyajikan fakta, konsep, dan
prinsip (visualisasi struktur molekul
kompleks, pathways, molecules
interaction, etc) (Santoso, 2017)
digunakan sebagai tools untuk
mendukung praktikum/uji in vivo-in vitro
(Santoso, 2017)
untuk membantu merumuskan sebuah
hipotesis (Sumitro, 2015)
dampak integrasi
analisis in silico ke
beberapa MK secara
embeded dalam
pembelajaran bagi
calon pendidik
Biologi
meningkatkan pemahaman (CRI rubric)
meningkatkan motivasi belajar dan
motivasi karir
meningkatkan kolaborasi
“ dengan integrasi analisis in silico dalam
pembelajaran, calon pendidik Biologi akan
lebih literat plus (literasi teknologi, data, dan
human sekaligus “
Terima kasih
integrasi analisis in
silico ke beberapa MK
secara embeded
telah dikembangkan
Bahan Ajar
Bioinformatika
Berbasis Web yang
dapat digunakan pada
beberapa MK
Ungsik et al. (2013)
In Silico/Bioinformatika? Ruang kajian tidak hanya penambatan molekul (docking)?
Saponin Biosynthesis was constructed by using KEGGPathways Data Base (Santoso, 2017)
promotor sequence of β-AS gene isolated from T.paniculatum (Santoso et al., 2017)
Ninteraction score =0,96
kontruksi pohon kekerabatan bambu berbasis gen rbcl (Hanifa et al., 2017)
menentukan multitargeting senyawa di dalam sel dan potensi aktivitasnya (Santoso et al., 2018)