Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu
Benjamín Skála
vedoucí práce: Václav Hypša
Endosymbionti hmyzu
• bakterie žijící v tělních buňkách
• primární X sekundární
Moran, 2006
P-endosymbionti
• mutualistický vztah s hostitelem
• vertikální přenos
• redukce genomu
• koevoluce s hostitelem
• Buchnera, Wigglesworthia, Blochmannia
Molekulární fylogenetika
• metodologické problémy:• vysoký obsah AT• potenciální horizontální přenos genů
• příbuzenské vztahy jsou zatím nejasné
groEL Herbeck et al., 2005
Otázky
• Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??
Otázky
• Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??
• Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete.
Flegr, 2005
Otázky
• Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??
• Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete.
• Proč se odhad množství genů získaných prostřednictvím horizontálního přenosu genů (HGT) u různých autorů tak výrazně liší? (nepatrný počet až 60%)
Otázky
• Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??
• Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete.
• Proč se odhad množství genů získaných prostřednictvím HGT u různých autorů tak výrazně liší? (nepatrný počet až 60%)
• Co je to nehomogenní (substituční) model? Vysvětlete.
Otázky
• Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??
• Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete.
• Proč se odhad množství genů získaných prostřednictvím HGT u různých autorů tak výrazně liší? (nepatrný počet až 60%)
• Co je to nehomogenní (substituční) model? Vysvětlete.• Jaké symbiotické „houbovité organismy“ byly nalezeny u mšic?
Xet-Mull, 2004
Některé mšice tribu Cerataphidini obsahují tzv. YLS – yeast-like symbiont
vřeckovýtrusné houby (Ascomycota),Sordariomycetes
Hypomyces lactifluorum