diversidad genética en poblaciones humanas de sincelejo
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Diversidad genética en poblaciones humanas de
Sincelejo, Sucre-Colombia, determinada mediante
polimorfismos de inserciones Alu.
Genetic diversity in human populations of Sincelejo, Sucre-Colombia
determined usig Alu insertion polymorphisms.
Eder Enrique Conde Vega 1
1Universidad de Córdoba, Facultad de Ciencias Básicas. Departamento
de Biología. Montería, Córdoba.
RESUMEN
Objetivo. Determinar la diversidad genética de la población humana de
Sincelejo, Sucre-Colombia mediante polimorfismo de inserciones Alu.
Materiales y Métodos. Las muestras se obtuvieron de 49 personas no
emparentadas, en cinco localidades del casco urbano de la población de
Sincelejo (Bogotá, Caribe, 20 de enero, Villa country, Cortijo), a las que
se le aplico el protocolo de extracción de ADN descrito en el Manual
Técnico de Wizard® Genomic DNA Purification Kit de Promega; luego se
amplificaron los marcadores Alu (ACE, A25, APO, D1, PV92, TRA25)
mediante una serie de reacciones en cadena de la polimerasa (PCR).
Resultados. Todos los marcadores Alu evaluados en esta investigación
fueron polimórficos, las frecuencias alélicas presentaron un promedio de
0.305 con un valor máximo de 0.551 para el locus TRA25 y un valor
mínimo de 0.064 para el locus APO, se detectó una moderada
heterocigosidad observada en la población, donde los valores presentaron
una fluctuación de un valor mínimo de 0.125 para el locus APO y un valor
máximo de 0.471 para el locus PV92. El marcador D1 presenta ausencia
de equilibrio Hardy-Weinberg para dos subpoblaciones de Sincelejo (Villa
Country y Caribe). Conclusión. Los resultados obtenidos en esta
investigación nos permiten concluir que la población de Sincelejo, Sucre-
Colombia presenta baja diversidad genética debido a que se han
presentado procesos endogámicos a lo largo de la historia de esta
población.
Palabras Claves: inserciones Alu, diversidad genética, polimórficos,
heterocigosidad, población.
ABSTRACT
Objective. The objective of this research was to determine the genetic
diversity of the human population of Sincelejo, Sucre-Colombia through
polymorphism of Alu insertions. Materials and Methods. The samples
were obtained from 49 unrelated people in five localities of this population
(Bogotá, Caribe, 20 de enero, Villa country, Cortijo), to which the DNA
extraction protocol described in the Promega Wizard® Genomic DNA
Purification Kit Technical Manual is applied, and were amplified by a series
of polymerase chain reactions (PCR) using a series of Alu markers (ACE,
A25, APO, D1, PV92, TRA25). Results. All the Alu markers evaluated in
this research were polymorphic, the allelic frequencies presented an
average of 0.305 with a maximum value of 0.551 for the TRA25 locus and
a minimum value of 0.064 for the APO locus, a moderate heterozygosity
observed in the population was detected, where the values presented a
fluctuation of a minimum value of 0.125 for the APO locus and a maximum
value of 0.471 for the PV92 locus. Marker D1 presents an absence of
Hardy-Weinberg equilibrium for two subpopulations of Sincelejo (Villa
Country and Caribe). Conclusion. The results obtained in this research
allow us to conclude that the population of Sincelejo, Sucre-Colombia has
low genetic diversity due to the fact that inbreeding processes have
occurred throughout the history of this population.
KEYWORDS: Alu insertions, genetic diversity, polymorphic,
heterozygosity, population.
INTRODUCCIÓN
Las inserciones Alu polimórficas son marcadores de gran utilidad en los
estudios de evolución humana, porque se conoce su estado ancestral que
es la ausencia de inserción y se producen por un único evento mutacional;
por estos principios son particularmente atractivos para analizar la
heterogeneidad genética de las poblaciones humanas tanto cercanas
como de diferentes continentes [1]. Asimismo, estas inserciones están
ampliamente dispersas por todo el genoma humano y su análisis del
genotipo es relativamente simple [2].
Los resultados de numerosos estudios antropogenéticos coinciden en que
la especie humana es genéticamente homogénea, de tal forma que
alrededor del 85-90% de la variabilidad de su actual patrimonio genético
es intrapoblacional, y solamente entre 10-15% se puede atribuir a
diferencias entre grupos continentales y/o étnicos [3,4]. Por ello, cuando
el objetivo de un trabajo es investigar acerca de la heterogeneidad
genética entre poblaciones, es vital seleccionar marcadores que sean
capaces de reflejar ese pequeño porcentaje de variabilidad
interpoblacional de forma correcta [1].
Los marcadores Alu son útiles para evaluar la estructura genética y las
relaciones entre poblaciones humanas dada su capacidad para detectar
las pequeñas variaciones en el genoma, se utilizan ampliamente para
determinar el grado de relación genética entre poblaciones. Esto nos
permite conocer la historia evolutiva de una población humana moderna
en específico [5], de ahí entender el origen de los grupos sociales que hoy
habitan en el territorio nacional, los cuales sufrieron a lo largo del tiempo
diversos fenómenos de migración por parte de europeos y africanos que
favorecieron los procesos de mestizaje [6].
Dentro del grupo de secuencias repetidas dispersas se encuentran los
SINEs (Short Interspesed Elements), donde están agrupadas todas las
inserciones menores de 500pb. Los SINEs más abundantes son las
inserciones Alu. Los elementos Alu fueron descubiertos en el año 1979
como un componente de las curvas de renaturalización del ADN humano.
Su nombre proviene del hecho de que contiene una secuencia diana
tetranucleotídica AGCT para la enzima de restricción Alu I [7]. De esta
manera, Las inserciones Alu componen la mayor familia de elementos
móviles del genoma humano [8].
Los estudios en Colombia de diversidad genética en poblaciones humanas
mediante polimorfismos de inserciones Alu se han realizado en diferentes
municipios y ciudades del país; En la región Caribe Colombiana se
establecieron muchos asentamientos españoles durante la época de la
colonia, donde se presentaron diversos procesos de mestizajes con linajes
africanas y aborígenes [9]. Cabe destacar el estudio realizado por Pérez
et al. [10] en San Pelayo – Córdoba, donde los resultados dicha
investigación mostraron una baja diversidad genética y un alto nivel
polimórfico en la población, además, la población presento ausencia de
equilibrio Hardy-Weinberg.
La ciudad de Sincelejo fue fundada, sustituyendo un caserío indígena
Zenú, el 4 de octubre de 1535 con el nombre de San Francisco de Asís de
Sincelejo, en homenaje al santo Italiano Francisco de Asís [11]. Fue
refundada por el capitán e ingeniero Español Antonio de la Torre y Miranda
donde en el año 1776 lo estableció un corregimiento, siguiendo el
mandato del gobernador de Cartagena Juan de Torres Díaz Pimienta [12].
En la actualidad la ciudad de Sincelejo, capital del departamento de Sucre
presenta un número aproximado de 280.100 habitantes [13].
En el Caribe colombiano hay escasos estudios sobre diversidad genética
en humanos utilizando inserciones Alu. Sincelejo carece de información
científica que permita establecer la estructura de las poblaciones y su
relación con otros grupos humanos, al haber presentado históricamente
diferentes procesos de mestizaje a partir de la conquista española durante
el siglo XV [9].
Este proyecto pretende determinar, mediante el uso de marcadores
moleculares tipo Alu, la diversidad genética en los humanos en la ciudad
de Sincelejo – Sucre Colombia.
MATERIALES Y MÉTODOS.
Fase de campo:
Área de estudio. Este estudio se realizó en cinco barrios la ciudad de
Sincelejo (20 de enero, Bogotá, Caribe, Cortijo, Villa Country) capital del
departamento de Sucre (Figura 1); esta ciudad se encuentra ubicada en
las coordenadas 9°18.2832′ N-75°23.8668′ O, con una altitud de 213
msnm y una temperatura promedio anual de 27.15°C.
Figura 1. Mapa de localización de los barrios: 20 de enero, Bogotá,
Caribe, Cortijo y Villa Country ubicados en la ciudad de Sincelejo – Sucre
– Colombia.
Obtención de muestras. Se colectaron muestras de saliva de 49
individuos residentes de cinco barrios del casco urbano de la ciudad de
Sincelejo. Las muestras requeridas para el análisis genético se obtuvieron
de adultos voluntarios no emparentados entre sí, residentes estables de
la población del estudio, desde al menos tres generaciones. Se colectó 1
mL de saliva por cada individuo en un tubo eppendorf de 1,5 mL, después
se adicionó 500 μL de solución de lisis celular del kit Wizard Genomic de
Promega (‘Promega); las muestras de saliva fueron tomadas por un
profesional en el área de la salud y los participantes en el estudio firmaron
el respectivo consentimiento informado (Anexo 1). Posteriormente, las
muestras fueron almacenadas en una cava con una temperatura de 4°C
para ser trasladadas hasta el Laboratorio de Genética de la Universidad
de Córdoba.
Aspectos éticos. Este trabajo cuenta con la aprobación del Comité de
Ética para investigación en humanos de la Facultad de Ciencias de la Salud
de la Universidad de Córdoba.
Técnicas de laboratorio:
Extracción de ADN. Para realizar la obtención del ADN presente en las
49 muestra colectada se utilizó el Kit Wizard® Genomic DNA Purification
de Promega (Madison- USA), atendiendo las orientaciones del fabricante.
Asimismo, La integridad del ADN se determinó de manera visual mediante
electroforesis en geles de agarosa al 1%, con un voltaje de 120 V por 2 h
en buffer TBE 1X (Tris-HC1 500 mM, ácido bórico 60 mM y EDTA 83 mM)
y agente de tinción GelRed. El gel se visualizó en un transiluminador Bio-
Imagen System 312 nM, Neve Yamin, Israel.
Amplificación por PCR. Los marcadores Alu utilizados en esta
investigación: A25, ACE, APO, D1, PV92 y TRA25 como se observa en la
Tabla 1, se amplificaron mediante una serie de reacciones en cadena de
la polimerasa PCR [14].
Tabla 1. Características de las inserciones Alu evaluadas en Sincelejo –
Sucre.
LOCUS SECUENCIA DE CEBADORES (5´- 3´) (PB)
A25
F: TATAATATGGCCTGGATTATACCTGTGT
R: CCACAAATAGGCTCATGTAGAACTACA
Alu (+): 960
Alu (-): 660
ACE
F: CTGGAGACCACTCCCATCCTTTCA
R: GATGTGGCCATCACATTCGTCAGAT
Alu (+): 490
Alu (-): 190
APO
F:AAGTGCTGTAGGCCATTTAGATTAG
R:AGTCTTCGATGACAGCGTATACAGA
Alu (+): 433
Alu (-): 122
D1
F:TGCTGATGCCCAGGGTTAGTAAA
R:TTTCTGCTATGCTCTTCCCTCTC
Alu (+): 622
Alu (-): 333
PV92
F:AACTGGGAAAATTTGAAGAGAAAGT
R:TGAGTTCTCAACTCCTGTGTGTTAG
Alu (+): 416
Alu (-): 101
TRA25 F: GTAAGAGTTCCGTAACAGGACAGCT
R: CCCCACCCTAGGAGAACTTCTCTTT
Alu (+): 424
Alu (-): 125
La mezcla de la reacción tuvo un volumen total de 25 μL que contenía
0,25 μL de Taq polimerasa (Bioline, London, UK), 1,25 μL de cada primer
(forward y reverse), 0,5 μL de dNTPs a 10 mM /μL, 2,5 μL de buffer de
reacción a 10X, 1,25 μL de MgCl2, 5 μL de ADN y agua estéril hasta
alcanzar el volumen final. La reacción de PCR se realizó en un
termociclador Bio-rad T100 (Los Ángeles, EEUU) mediante la técnica
PCR Tochdown. El proceso consistió en una desnaturalización inicial
durante 3 min, a 94°C seguido de una fase de anillamiento con una
temperatura de 52°C, posteriormente se realizó una fase de extensión a
72°C durante un minuto y después una extensión final de 5 min a 72°C.
Los ensayos se incluyeron controles positivos (ADN de fragmentos
conocidos) y controles negativos (los cuales contenían todos los reactivos
de la PCR excepto DNA) con el objetivo de controlar la calidad de la
reacción PCR y de la electroforesis.
Visualización y cuantificación del ADN. Los amplificados de la PCR
fueron sometidos a electroforesis en gel de agarosa al 1.5%, a 100 voltios
durante 60 min, estos resultados fueron visualizados bajo luz ultravioleta
en una cámara de (Cleaver Scientific, Londres, UK). Además, en el gel de
agarosa se añadió un marcador de peso molecular de separación 100 pb,
con el objeto de identificar el tamaño de las bandas de la PCR.
Posteriormente, los resultados de la electroforesis en el gel de agarosa
visualizados en la luz ultravioleta fueron documentados y conservados
con imágenes fotográficas (Figura 2).
Figura 2. Electroforesis de productos PCR de 38 muestras para la
inserción A25 (Pb 960/660). Se observan homocigotos con inserción 960
Pb: muestra 15; heterocigotos: muestras 17, 19, 21, 22, 26, 27, 32, 34;
homocigotos con inserción 660 Pb: muestras 1, 2, 3, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11,
12, 13, 14, 16, 18, 20, 23, 24, 25, 28, 29, 30, 31, 33, 35, 36, 37, 38; sin
amplificar: muestra 4; MP: marcador de peso molecular de separación
100 a 1000 pb:
Análisis de datos. Para la población de la ciudad de Sincelejo se
determinaron las frecuencias alélicas, heterocigosidad observada,
heterocigosidad esperadas, equilibrio de Hardy- Weinberg e índice de
fijación mediante el software GenAIEx 6.503 [15]. Se elaboró un árbol
filogenético a partir de las distancias genéticas de Nei (1978) [16]
estimadas entre la población de Sincelejo (Bogotá, 20 de Enero, Cortijo,
Villa Country, Caribe) Figura 3, y se graficaron mediante el algoritmo
UPGMA con el software MEGA 6.0. Los datos de diversidad genética
obtenidos de los estudios realizados en las poblaciones de Lorica (Lobo,
2019), San Pelayo (Pérez et al., 2019), Sahagún, San Andrés y Chinú
(Moreno, 2019) se utilizaron para comparar que tan cercano o distantes
genéticamente se encuentra la población de Sincelejo con el resto de
poblaciones mencionadas.
RESULTADOS
Diversidad genética
En la Tabla 2 se puede observar las frecuencias alélicas (Fr.+) de los seis
locus empleados en esta investigación, los cuales oscilaron entre 0.064
(APO) y 0.551 (TRA25) con un promedio de 0.305.
Para el índice de Shannon (I) los valores variaron entre 0.196 y 0.680
para los locus APO y TRA25 respectivamente siendo el promedio 0.493.
La heterocigosidad observada (Ho) presentó valores que presentaron una
fluctuación entre 0.125 para el locus APO y 0.471 para el locus PV92.
La heterocigosidad esperada (He) mostro un valor mínimo de 0.110 (APO)
mientras que el valor mayor fue de 0.487 (TRA25) con un promedio de
0.336. Todos los marcadores Alu evaluados en este estudio son
polimórficos.
Tabla 2. Diversidad genética obtenida en la población de Sincelejo-
Sucre.
Locus ACE A25 APO DI PV92 TRA25
Fr. 0.469 0.102 0.064 0.284 0.357 0.551
I 0.625 0.265 0.196 0.560 0.632 0.680
Ho 0.407 0.160 0.125 0.207 0.471 0.451
He 0.437 0.164 0.110 0.377 0.441 0.487
Fr.= frecuencia de la presencia de inserciones Alu (+); I= índice de
Shannon; Ho= Heterocigosidad observada; He= Heterocigosidad
esperada.
Equilibrio de Hardy-Weinberg
En la Tabla 3 podemos apreciar que el locus D1 presento desequilibrio de
Hardy-Weinberg para las subpoblaciones de Villa Country y Caribe con
valores de 0.012 y 0.020 respectivamente. Los cinco locus restantes
(ACE, A25, APO, PV92, TRA25) presentaron equilibrio Hardy-Weinberg en
todas las subpoblaciones estudiadas por esta investigación.
Tabla 3. Parámetros genéticos calculados del equilibrio Hardy-Weinberg
en las subpoblaciones de Sincelejo-Sucre.
Subpoblación Locus
ACE A25 APO D1 PV92 TRA25
Bogotá 0.549ns Mm 0.850ns 0.174ns 0.613ns 0.739ns
20 de enero 0.213ns 0.236ns Mm 0.708ns 0.292ns 0.429ns
Cortijo 0.880ns 0.429ns Mm 1.000ns 0.429ns 0.281ns
Villa Country 0.975ns 0.725ns 0.725ns 0.012* 0.292ns 0.527ns
Caribe 0.975ns Mm 0.577ns 0.020* 0.058ns 0.527ns
ns= No significativo; Mm=Monomórfico; P: Equilibrio de Hardy-Weinberg
(** p < 0.01, *** p < 0.001),
Estructura poblacional de Wright
En la tabla 4 se observa que los valores FIS variaron de -0.132 para el
locus APO a 0.452 para el locus D1 presentando un promedio de 0.070.
FIT mostro un valor mínimo de -0.067 (APO) mientras que el valor mayor
fue de 0.486 (D1) con un promedio de 0.129. El coeficiente de
diferenciación genética (FST) presentó una fluctuación de 0.016 para el
locus TRA25 a 0.122 para el locus ACE con un promedio de 0.064. En el
caso del Nm (número de migrantes por generación) mostro valores de
1.796 (ACE) a 15.219 (TRA25) con un promedio de 5.572.
Tabla 4. Estadísticos F de Wright y número de migrantes para la
población de Sincelejo.
Locus FIS FIT FST Nm
ACE 0.068 0.182 0.122 1.796
A25 0.024 0.111 0.089 2.562
APO -0.132 -0.067 0.058 4.090
D1 0.452 0.486 0.062 3.801
PV92 -0.068 -0.025 0.040 5.965
TRA25 0.074 0.089 0.016 15.219
Promedio 0.070 0.129 0.064 5.572
FIS = Índice de fijación; FIT = Índice de fijación conjunto; FST = coeficiente
de diferenciación genética; Nm = Número de migrantes por generación.
Distancias genéticas
En las distancias genéticas de Nei (Tabla 5), se observa que las
subpoblaciones más cercanas genéticamente son Bogotá y Caribe con un
valor de distancia de 0.024, mientras las subpoblaciones de Bogotá y
Cortijo son las más alejadas con un valor de 0.091. El dendrograma
UPGMA realizado a partir de las distancias de Nei (Figura 3), revela dos
agrupaciones: una formada por las subpoblaciones Cortijo, Villa Country
y 20 de Enero y otra integrada por las subpoblaciones Bogotá y Caribe.
Tabla 5. Distancias genéticas de Nei (1978) de las subpoblaciones
humanas de Sincelejo.
Bogotá 20 de enero Cortijo Villa Country Caribe
Bogotá 0.000
20 de enero 0.042 0.000
Cortijo 0.091 0.034 0.000
Villa Country 0.054 0.039 0.027 0.000
Caribe 0.024 0.039 0.043 0.033 0.000
Figura 3. Árbol UPGMA de distancias genéticas entre las cinco
subpoblaciones estudiadas en la ciudad de Sincelejo – Sucre – Colombia.
El análisis de distancias genéticas de Nei (Tabla 6), muestra que Lorica y
Sahagún son las poblaciones más cercanas en la costa Caribe colombiana,
mientras Sahagún y San Pelayo son las poblaciones más alejadas
genéticamente. En el dendrograma UPGMA (Figura 4) se observan dos
agrupaciones, una integrada por las poblaciones de Sincelejo, Sahagún,
Lorica, San Andrés, Chinú y otra agrupación formada por San Pelayo.
Tabla 6. Distancias genéticas determinadas entre las poblaciones de
Sincelejo, Sahagún, San Andrés, Chinú, Lorica y San Pelayo.
Poblacione
s Sincelejo
San
Pelayo Sahagún Lorica San Andrés Chinú
Sincelejo 0.000
San Pelayo 0.230 0.000
Sahagún 0.210 0.308 0.000
Lorica 0.224 0.273 0.006 0.000
San Andrés 0.236 0.154 0.042 0.020 0.000
Chinú 0.194 0.220 0.242 0.011 0.028 0.000
Figura 4. Árbol UPGMA de distancias genéticas de las poblaciones de
Sahagún, Lorica, San Andrés, Chinú, Sincelejo y San Pelayo, todas
pertenecientes a la costa caribe colombiana.
DISCUSIÓN.
El análisis de polimorfismos de inserciones Alu que constituye la primera
investigación para la caracterización genética de la población urbana de
la ciudad de Sincelejo-Sucre, Colombia. Todos los marcadores evaluados
en dicha población fueron polimórficos (Tabla 2). El valor promedio de las
frecuencias alélicas (0.305) fue menor, respecto al obtenido por Díaz et
al. [17], en una población humana del Valle de Traslasierra-Argentina,
con un valor promedio de 0.447.
La heterocigosidad observada promedio (Ho = 0.303) fue muy similar a
las reportada por Zainab et al., en 2020 [18] en una población de Jordania
con una heterocigosidad observada promedio (Ho = 0.355). La
heterocigosidad esperada (He) presentó un valor promedio de He = 0.336,
resultado similar al obtenido por Laybourn, et al., en 2016 [19] en dos
poblaciones de la India (Chenyu con He = 0.348 y Koya con He = 0.386).
La moderada diversidad encontrada en Sincelejo puede deberse a eventos
recientes de cruzamientos consanguíneos dentro de la población y poca
interacción génica con otros grupos poblacionales lo cual conlleva a una
reducción de la variabilidad.
La heterocigosidad observada en los marcadores ACE (Ho = 0.407), D1
(Ho = 0.201) y TRA25 (Ho = 0.451) de la población urbana de Sincelejo
fueron menores a los reportados por Parolin et al., en 2017 [20] en las
poblaciones de Comodoro Rivadavia (ACE-Ho = 0.420; D1-Ho = 0.457;
TRA25-Ho = 0.500) y Puerto Madryn (ACE-Ho = 0.449; D1-Ho = 0.250;
TRA25-Ho = 0.620) de la Patagonia Argentina, y al mismo tiempo la
heterocigosidad observada en el marcador A25 (Ho = 0.160 ) en Sincelejo
fue similar a la población de Esquel (A25-Ho = 0.165), evaluada en dicho
estudio. En estas poblaciones el locus APO presentó el valor más bajo de
heterocigosidad, lo cual concuerda con los resultados obtenidos en las
poblaciones de Sincelejo en donde esta inserción presentó los niveles más
bajos de polimorfismo (Tabla 2).
Respecto a poblaciones del Caribe colombiano, la diversidad obtenida en
la población de Sincelejo fue mayor a la reportadas por Pérez et al., en
2019 [10], en la población de San Pelayo Córdoba (Ho = 0.0042; He =
0.405), y también fue mayor a la obtenida por Lobo et al., [21] en la
población de Lorica - Córdoba (Ho = 0.066) (He = 0.334), estos resultados
pueden deberse a eventos de migración de habitantes de Cartagena
alrededor de 1776 promovida por el comercio, lo que pudo contribuir a
aumentar los niveles de diversidad genética en la población, [11] y
recientemente en la población de Sincelejo ha habido un porcentaje alto
de personas migrantes debido a la ganadería y agricultura [22].
El locus D1 presentó ausencia de equilibrio Hardy-Weinberg en dos
subpoblaciones evaluadas (Villa Country y Caribe), esto puede deberse a
eventos como la migración, suceso que hace variar las frecuencias alélicas
en una población debido a la incorporación de nuevas características
genéticas en esta, ayudando a que se mantenga un alto números de
heterocigotos en una población; lo mencionado anteriormente se puede
relacionar con las migraciones de personas hacia la ciudad de Sincelejo
tanto de la costa como del interior de Colombia debido a la ganadería y
agricultura[22]. Parolin et al. [20], reportaron desviaciones en el
equilibrio de Hardy-Weinberg en este marcador en dos poblaciones de la
Patagonia Argentina. Por otra parte, la presencia de equilibrio en los
demás marcadores muestra una fijación en las frecuencias alélicas, lo cual
según Badache et al., en 2019 es producto de la acumulación de
homocigosis por eventos de endogamia a lo largo de las generaciones
[23].
El índice de fijación (FIS = 0.070) obtenido para la población de Sincelejo
mostró valores menores a los reportados por Nasidze, et al., [24], el cual
reportó valores de 0.113 en poblaciones del Cáucaso, Gómez et al., [6]
quienes encontraron para las poblaciones afrocolombianas valores de
0.242; valores bajos de FIS según Gómez et al., [25] indican una relación
de equilibrio entre los homocigotos y los heterocigotos en una población.
Los valores obtenidos en Sincelejo para el estadístico FIS de 0.070, se
puede relacionar con el elevado flujo genético obtenido (Nm = 5.572), lo
cual conlleva a que la población de Sincelejo se mantenga en un equilibrio
de Hardy-Weinberg. Por otra parte, el índice de fijación total (FIT = 0.129)
indica un moderado exceso de homocigotos respecto a la población
general, lo cual se pudo dar como consecuencia de apareamientos
consanguíneos dentro la misma población, lo que puede conllevar a un
proceso endogámico a lo largo del tiempo, estos resultados son similares
a los reportados por Cotrim et al., [26] en 2004 en seis poblaciones
brasileñas (FIT = 0.151). El coeficiente de diferenciación genética (FST =
0.064) mostró una baja diferenciación entre las subpoblaciones
estudiadas, esto se le puede atribuir al alto grado se cruzamientos que se
presentan en estas cinco subpoblaciones, de tal manera que se consideran
un solo grupo poblacional, estos resultados son similares a los reportados
por Saini et al., [27] en 2012 en cinco grupos étnicos del noroeste de la
India (FST = 0.013). Asimismo, el alto número de migrantes (Nm = 5.572)
produce en las subpoblaciones un elevado flujo de genes (Tabla 4).
Las distancias genéticas de Nei muestra que Cortijo, Villa Country y 20 de
enero, son las subpoblaciones más cercanas genéticamente, esta cercanía
genética que presentan estas tres subpoblaciones se puede atribuir a que
se encuentran geográficamente muy cercanas, de tal manera que se
presenta un flujo de genes muy alto entre estas subpoblaciones de
Sincelejo [11]. Por otra parte, la mínima distancia genética que presentan
las subpoblaciones de Bogotá y Caribe con el resto de las demás
subpoblaciones, pueda que se deba a que estas son unas de las
subpoblaciones más antiguas de Sincelejo, de tal manera pueda que aun
en la actualidad se mantengan esas características genéticas de aquellas
primeras personas que habitaron esta ciudad.
El dendrograma (Figura 4) muestra que las poblaciones de Sahagún y
Lorica son las más cercanas genéticamente, lo cual puede deberse a que
ambas poblaciones comparten la misma historia desde su fundación por
parte de los españoles, y a su vez, en estas poblaciones se presentó un
alto número de personas inmigrantes de Turquía, Siria y El Líbano,
introduciendo así nuevas características genéticas en estas poblaciones
[28, 29], asimismo la cercanía genética entre las poblaciones de Chinú y
San Andrés, pudo deberse a que estas poblaciones exhiben una fuerte
influencia de genes indígenas Zenúes [30, 31] y la asociación de Sincelejo
con las poblaciones de Sahagún, Lorica, Chinú y San Andrés se pudo
presentar por incremento del flujo genético humano, que desde
comienzos de 1940, se ha dado, desde estas poblaciones hacia Sincelejo,
ocasionado especialmente por el importante desarrollo de esta población
en los campos comercial, transporte, educación, servicios públicos y salud
[32, 33]. Por otra parte, la diferenciación genética que presenta San
Pelayo con las restantes poblaciones del Caribe colombiano estudiadas,
pudo ocurrir, porque desde su fundación por parte de los españoles que
llegaron vía fluvial a finales del siglo XVIII, ha predominado un
entrecruzamiento entre las familias fundadoras, para así poder mantener
su abolengo en las siguientes generaciones [34].
CONCLUSIÓN
Los seis marcadores evaluados en esta investigación resultaron ser
polimórficos. La diversidad genética que presento la población de
Sincelejo fue mayor a otras poblaciones de la costa Caribe colombiana. El
marcador D1 presento ausencia de equilibrio Hardy-Weinberg en dos
subpoblaciones de Sincelejo (Villa Country y Caribe). También se encontró
un alto flujo génico entre las subpoblaciones de Sincelejo y muy poco
diferenciación genética entre estas. Las distancias genéticas de Nei
revelaron la cercanía genética que existe entre la población de Sincelejo
con las poblaciones de Sahagún, Lorica, Chinú y San Andrés.
AGRADECIMIENTOS
Agradezco a todas las personas nativas de Sincelejo que contribuyeron al
desarrollo de esta investigación; también al grupo de investigación Genes
de la Universidad de Córdoba por la financiación de este proyecto. De
igual manera al doctor Enrique Pardo Pérez, a la profesora Teodora
Cavadía Martínez y a los Biólogos Mauricio Begambre Hernández y José
Coronado González, por sus contribuciones y consejos.
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Anexo 1.
INFORME DE CONSENTIMIENTO
Título del proyecto: “VARIABILIDAD GENÉTICA EN POBLACIONES
HUMANAS MEDIANTE POLIMORFISMOS DE INSERCIÓN ALU HUMANO EN
POBLACIONES DEL CARIBE COLOMBIANO.”
Investigadores: Enrique Pardo Pérez PhD.; Teodora I. Cavadía Martínez
MSc.; Mauricio Begambre Hernández Biol.
Institución: Universidad de Córdoba, Facultad de Ciencias Básicas,
Departamento de Biología, Área de Genética. Laboratorio de Genética.
Carrera 6 No. 76-103
La Universidad de Córdoba a través del Laboratorio de Genética, está
desarrollando un estudio genético sobre la variabilidad genética en
poblaciones humanas mediante polimorfismos de inserción Alu en
poblaciones del Caribe colombiano.
En la basta información contenida en nuestro ADN se hallan mutaciones
neutrales que se caracterizan por ser fragmentos de ADN móviles que se
insertan que el genoma (Alu), estas inserciones son acontecimientos
únicos y estables lográndose detectar con facilidad la mutación, muchos
de ellos son recientes en distintas poblaciones humanas permitiendo
desarrollar estudios de diversidad genética, migración, deriva y mestizaje.
Este proyecto pretende usando polimorfismos de inserciones de Alu
humano y aplicando la genética de poblaciones, estudiar y describir la
variabilidad existente en la composición genética de poblaciones humanas
en el Caribe colombiano desde una perspectiva evolutiva, formular
hipótesis de dicha variabilidad y establecer una base de datos para la
investigación en disciplinas como la Antropogénica, la Genética Médica o
la Genética Forense.
La participación consiste en donar una muestra de saliva (2 ml) para el
análisis genético molecular pertinente. La muestra de saliva será tomada
con todas las normas asépticas que implica el procedimiento. La
manipulación, procesamiento y almacenamiento temporal de las
muestras, serán responsabilidad de los investigadores del Laboratorio de
Genética de la Universidad de Córdoba, el manejo de las muestras se
realizará cumpliendo todas las normas de bioseguridad y sanitarias
apropiadas. Al finalizar el estudio las muestras serán desechadas.
La donación de saliva no implica ningún riesgo para su salud, psicológica
o fisiológica, tampoco tendrá contradicciones de ningún tipo, ni afectará
ningún tratamiento al que este siendo sometido. Las muestras serán
rotuladas mediante códigos que solo conocerán los investigadores. En
ningún momento y bajo ninguna circunstancia se podrán revelar los
resultados de los participantes a terceros, como tampoco se utilizarán los
nombres de los participantes en ninguna publicación que genere el
proyecto. Los folders con los códigos de las muestras serán mantenidos
bajo llave por el investigador principal (Dr. Enrique Pardo Pérez)
Usted tiene derecho a conocer los datos genéticos que se obtengan a
partir de su muestra, si así lo solicitase. No obstante, los resultados que
se van a obtener se consideran exploratorios. Por tanto, en un principio y
de forma habitual, sus datos no se le enviarán a usted.
La participación en el estudio es voluntaria. Si usted no quiere participar,
o decide retirarse del estudio, no le representará ninguna penalidad.
Esta donación es altruista, justamente, por mi participación en el presente
proyecto no recibiré un beneficio directo de forma inmediata y no recibiré
ningún beneficio económico a futuro.
Habiendo escuchado la anterior información, acepto participar como
voluntario en el estudio, bajo las condiciones expuestas, reservándome el
derecho a retirarme en cualquier momento, sin justa causa y sin previo
aviso.
NOMBRE:__________________________________CC#___________
_____________________
FIRMA: ___________________________________HUELLA
DACTILAR
LUGAR Y FECHA: ______________________________
TESTIGO 1
FIRMA: ___________________________________HUELLA
DACTILAR
LUGAR Y FECHA: ______________________________
TESTIGO 2
FIRMA: ___________________________________HUELLA
DACTILAR
LUGAR Y FECHA: ______________________________