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CONVITTO NAZIONALE “Vittorio Emanuele II” LICEO CLASSICO EUROPEO - LICEO SCIENTIFICO Progetto Lauree Scientifiche ‘’Bacillus clausii’’

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Page 1: CONVITTO NAZIONALE “Vittorio Emanuele II” LICEO CLASSICO EUROPEO - LICEO SCIENTIFICO Progetto Lauree Scientifiche ‘’Bacillus clausii’’

CONVITTO NAZIONALE“Vittorio Emanuele II”

LICEO CLASSICO EUROPEO - LICEO SCIENTIFICO

Progetto Lauree Scientifiche‘’Bacillus clausii’’

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Modelli matematici

Cos’è un modello matematico?

Il modello matematico è una descrizione semplificata di fenomeni reali espressi in termini matematici.

Trovano la loro applicazione in vari campi come la biologia, la meteorologia, la climatologia e l’economia.

Come si realizza?

• Osservazione di un fenomeno;• Selezione dei parametri

rilevanti;• Formulazione delle equazioni;• Analisi delle equazioni stesse;• Confronto con i dati

sperimentali.

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Prima fase: osservazione del fenomeno

L’osservazione del fenomeno è effettuata attraverso misure, rilevazioni, esperimenti, censimenti…

Nel nostro caso si è osservata la crescita di organismi cellulari effettuata in laboratorio.

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Seconda fase: selezione dei parametri rilevanti

La legge di crescita batterica permette di individuare immediatamente i parametri rilevanti:

•popolazione al tempo (con );• =tempo definito come “salto generazionale”;• velocità media definita come rapporto tra la variazione di popolazione e il tempo in cui avviene

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Terza fase: formulazione dell’equazione

A questo punto si tenta di costruire un modello, ipotizzando che la variazione della popolazione batterica sia proporzionale alla

popolazione stessa al tempo

Detto tasso di crescita:= =

Si ottiene:= (1+ )

Equazione alle differenze che rappresenta un possibile modello che varia in base al tasso di crescita.

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Studiamo il comportamento del modello in base al tasso di crescita. Se il tasso è costante, ovvero:

il modello che otteniamo è:

che viene detto ‘’modello di Malthus’’ o di crescita geometrica.

Terza fase: formulazione dell’equazione

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Se invece il tasso di crescita è dato da

dove rappresenta la ‘’capacità di accoglienza dell’ambiente’’ il modello diventa

Che si può chiamare ‘’logistico’’

Terza fase: formulazione dell’equazione

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Quarta fase: analisi delle equazioni stesse

Formulato il modello, proviamo a studiarlo.

Nel caso del modello di Malthus, utilizzando il principio di induzione, si ottiene:

Il comportamento della popolazione dipende da k.

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Quarta fase: analisi delle equazioni stesse

Osserviamo ora il comportamento dell’equazione al variare di .Dovendo essere per ogni

Deve essere

ma comporta per ogni quindi non si considera;

comporta costantemente “crescita zero”;

popolazione in crescita;

popolazione in diminuzione.

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GRAFICI DI CRESCITA GEOMETRICA

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Nel caso del modello logistico, effettuando opportuni calcoli, si ottiene

I punti della successione si trovano su una curva detta ‘’curva logistica‘’o sigmoide, che descrive una curva ad S di crescita di

alcuni tipi di popolazioni P. All'inizio la crescita è quasi esponenziale, successivamente rallenta, diventando quasi lineare, per raggiungere una posizione asintotica dove la

crescita è molto lenta.

Quarta fase: analisi delle equazioni stesse

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Grafico di una curva logistica

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Quinta fase: confronto con i dati sperimentali

A questo punto si confrontano i dati determinati con le equazioni formulate con i dati ottenuti sperimentalmente.

Troveremo che il nostro modello rientra nel modello logistico, come si vedrà dal grafico ottenuto con le misurazioni effettuate.

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Costruzione della curva di crescita del Bacillus clausii

Scopo: verificare la crescita esponenziale del numero di unità formanti colonie (U.F.C.) in una coltura di un probiotico

Richiami teorici: il B. clausii è un microrganismo Gram-positivo, mobile, sporigeno e aerobio. Esso vive nel suolo e viene utilizzato come probiotico. È a forma di bastoncello e cresce in gruppi o in colonie. È alcalofilo (vive in ambienti alcalini o basici). È capace di produrre alcune proteasi (subtilisine) attive in ambienti alcalini.

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Le spore sono in grado di germinare, generando le forme vegetative, se vengono mantenute per almeno 12 ore a 40 in un brodo di coltura come l'acqua peptonata oppure se vengono poste direttamente su un terreno solido come il Plate Count Agar.

Il tempo medio di generazione del Bacillus clausii è di circa 30 minuti.

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L'intorbidimento dell'acqua peptonata dimostra la germinazione delle spore di B. clausii.

Acqua peptonata pura

Acqua peptonata con batteri

Bagnetto termostatato

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La comparsa di colonie, cremose e di color avorio, leggermente in rilievo, di forma tondeggiante, con margini netti dimostra la germinazione delle spore sul terreno solido utilizzato.

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Strumenti e materiali adoperatiSTRUMENTI

Pipette Pasteur Provette Becher Termometro Capsule di Petri Spatola Bagnetto termostatato Stufa termostatata Distillatore Becco di Bunzen Spargifiamma Contacolonie Piastra riscaldante Imbuto Bilancia analitica

MATERIALI Spore di Bacillus clausii Soluzione fisiologica Acqua distillata Acqua peptonata Plate Count Agar Trypton Soy Agar Corrente elettrica

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Procedimento operativoPREPARAZIONE DEL BRODO DI COLTURA

Distillare 150 ml di acqua (fig. 1)

Pesare sulla bilancia analitica 2,25 grammi di acqua peptonata liofilizzata (fig. 2)

Sciogliere la polvere pesata in 150 ml di acqua distillata (fig. 3)

Riscaldare leggermente agitando di frequente e sterilizzare mediante pastorizzazione (fig. 4)

Versare nelle provette (fig. 5)

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Fig. 1

Fig. 3 Fig. 4Fig. 5

Fig. 2

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PREPARAZIONE DEL TERRENO DI COLTURA

Distillare 150 ml di acqua (fig. 6)

Pesare sulla bilancia analitica 3,525 g di Plate Count Agar liofilizzato (fig. 7)

Sciogliere la polvere pesata in 150 ml di acqua distillata (fig. 8)

Riscaldare agitando frequentemente (fig. 9)

Lasciar bollire per un minuto per sterilizzare mediante pastorizzazione (fig. 10)

Versare nelle capsule di Petri (fig. 11)

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Fig. 6

Fig. 8

Fig. 10 Fig. 11

Fig. 7

Fig. 9

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DILUIZIONE

Per ottenere colonie singole facilmente contabili è necessario sottoporre il campione di partenza a diluizioni successive in modo da ridurre la concentrazione delle cellule.

Preparare le diluizioni decimali a scalare in questo modo: miscelare il campione in esame per distribuire uniformemente i microrganismi e trasferire, con pipetta sterile, 1 ml del campione nella prima di una serie di provette contenenti 9 ml di soluzione fisiologica, omogeneizzando il campione nel diluente (fig. 12). Si ottiene in tal modo la diluizione 1:10.

Procedere analogamente fino ad ottenere la diluizione .

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Fig. 12

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PIASTRATURA (PER INCLUSIONE)

Prelevare 1 ml dall'ultima diluizione e versarlo in una capsula di Petri

Versare l'Agar mantenuto fuso a 45 , nella capsula di Petri (fig. 13)

Ruotare delicatamente la piastra per miscelare il terreno

Aspettare la solidificazione del terreno Capovolgerlo e incubarlo nella stufa termostata a

40 (fig. 14) Dopo la fase di latenza durata circa 7 ore, si iniziano

a contare le U.F.C ad intervalli regolari di 30 minuti

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Fig. 13

Fig. 14

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CONTEGGIO IN PIASTRA Il metodo della conta in piastra presenta un elevato

grado di sensibilità permettendo di rilevare un numero piccolo di organismi presenti nella sospensione. La

possibilità di registrare un numero di microrganismi il più vicino possibile al numero reale dipende da una

serie di fattori soprattutto di tipo operativo. La crescita in piastra richiede tempi di attesa

piuttosto lunghi determinati dalla durata dell'incubazione necessaria per evidenziare colonie

visibili. Il numero di microrganismi viene determinato

moltiplicando il numero di colonie per l’inverso del fattore di diluizione.

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Conteggio in piastra

Visuale del contacolonie

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RISULTATI CONTEGGIO

I primi risultati ottenuti sono stati i seguenti: U.F.C./1 ml U.F.C./1 mlU.F.C./1 ml

U.F.C./1 ml U.F.C./1 ml

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Rieseguiamo le diluizioni, la piastratura e il conteggio una seconda volta.

Otteniamo i seguenti risultati:

FASE DI LATENZA (7 ORE) : 40 U.F.C./1 ml: 1760 U.F.C./1 ml: 3530 U.F.C./1 ml: 7020 U.F.C./1 ml

: 14060 U.F.C./1 ml: 28160 U.F.C./1 ml: 56500 U.F.C./1 ml

: 112600 U.F.C./1 ml: 225270 U.F.C./1 ml: 275560 U.F.C./1 ml: 285060 U.F.C./1 ml

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CONCLUSIONI

Utilizzando i valori di U.F.C. nel tempo si ottiene il grafico seguente: si evidenzia una lunga fase di latenza dovuta,

probabilmente, alla germinazione delle spore e all'adattamento delle cellule batteriche al terreno di coltura; alla fase di latenza segue una fase di crescita in cui il numero

di U.F.C. aumenta rapidamente nel tempo.Gli ultimi due punti del grafico evidenziano un numero molto

simile di U.F.C. Il numero delle colonie non aumenta, poiché è stato raggiunto

un equilibrio tra le colonie che sopravvivono e quelle che muoiono. Se avessimo proseguito nel contare le colonie, avremmo notato una diminuzione nel numero di U.F.C.

dovuta all’aumento del numero di colonie morte a scapito di quelle vive.

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Curva di crescita di Bacillus clausii

1 (LAT.)

2 (LAT.)

3 (LAT.)

4 (LAT.)

5 (LAT.)

6 (LAT.)

7 (LAT.)

t0 t1 t2 t3 t4 t5 t6 t7 t8 t90

50000

100000

150000

200000

250000

300000

40 40 40 40 40 40 40 1760 3530 702014060

28160

56500

112600

225270

275560285060

TEMPO (ORE)

Nu

me

ro d

i U.F

.C.

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CONVITTO NAZIONALE“Vittorio Emanuele II”

LICEO CLASSICO EUROPEO - LICEO SCIENTIFICO

Prof.ssa Annamaria SalveminiA cura di:Giulia Andreucci

Maria Cristina D’AlessandroGiulio Cristian D’Anna

Flavia MartinelliFilomena Pellino

Anna Maria PetroneRamona Raiola

Maria Sofia TroiseHanno collaborato realizzando l’esperimento gli allievi della

classe III LS e la prof.ssa Maria Pia Di Grado.Realizzazione grafica e stesura della sezione scientifica a

cura di Emanuele Rossitto