controlling invasive carp - fws.gov · smolts occurred on april 14th, with the second re ‐ lease...

9
U.S. Fish & Wildlife Service Abernathy Fish Technology Center Newsletter Volume 7, Number 2: March/April 2015 Malheur Lake, OR, is criƟcal habitat for migratory waterfowl in western North America. Historically, the lake and waters adjacent to the Malheur NaƟonal Wildlife Refuge annually produced over 100,000 ducklings, and was used by 35% of the Pacic Flyway’s canvasback populaƟon. In addiƟon, the lake is also important habitat for redband trout. The highly invasive common carp were introduced into Malheur Lake in the 1950s, having a devastaƟng eect on the lake's habitat and its bird and sh populaƟons. They have destroyed much of the emergent vegetaƟon and reduced water quality, resulƟng in waterfowl producƟon declining to 1020% of historic levels. The objecƟve of our study is to determine if electroshing is a viable method to signicantly reduce recruitment of common carp in Malheur Lake. FerƟ‐ lized eggs and embryos of common carp will be exposed to a variety of electrical elds that vary in wave form and voltage gradient. Survival to hatching will be compared among treatment and control groups. The small size of common carp eggs required us to build a new device capable of generaƟng the strong electrical elds needed to cause high mortality during egg development. Lab tested during a pilot study, we are now conducƟng eld trials with common carp at Malheur Lake. Controlling Invasive Carp In this issue: Invasive Carp 1 Steelhead Spawning 2 Program Highlights 3 Reports 3 PublicaƟon 4 MeeƟngs 5 Ongoing Projects 7 Serving the Pacic and Pacic Southwest Regions Kurt Steinke preparing to test the eects of electricity on invasive common carp eggs at Malheur NWR. Photo credit: D. Peterson.

Upload: nguyenngoc

Post on 30-Apr-2018

216 views

Category:

Documents


2 download

TRANSCRIPT

U.S. Fish & Wildlife Service 

Abernathy Fish Technology Center Newsletter

Volume 7, Number 2: March/April 2015 

Malheur Lake, OR, is cri cal habitat for migratory waterfowl in western North America. Historically, the lake and waters adja‐cent to the Malheur Na onal Wildlife Refuge annually produced over 100,000 ducklings, and was used by 35% of the Pacific Fly‐way’s canvasback popula on.  In addi on, the lake is also im‐portant habitat for redband trout. The highly invasive common carp were introduced into Malheur Lake in the 1950s, having a devasta ng effect on the lake's habitat and its bird and fish pop‐ula ons. They have destroyed much of the emergent vegeta on and reduced water quality, resul ng in waterfowl produc on declining to 10‐20% of historic levels.  The objec ve of our study is to determine if electrofishing is a viable method to significant‐ly reduce recruitment of common carp in Malheur Lake.  Fer ‐lized eggs and embryos of common carp will be exposed to a variety of electrical fields that vary in wave form and voltage gradient.  Survival to hatching will be compared among treat‐ment and control groups. The small size of common carp eggs required us to build a new device capable of genera ng the strong electrical fields needed to cause high mortality during egg development.  Lab tested during a pilot study, we are now conduc ng field trials with common carp at Malheur Lake. 

Controlling Invasive Carp In this issue: 

Invasive Carp    1 

Steelhead Spawning  2 

Program Highlights  3 

Reports       3 

Publica on      4 

Mee ngs      5 

Ongoing Projects    7 

Serving the Pacific and Pacific Southwest Regions 

Kurt Steinke preparing to test the effects of electricity on invasive common carp eggs at Malheur NWR. Photo credit: D. Peterson. 

   

 2 

Staff: 

Administra on & Facili es 

Judy Gordon, Center Director 

Pa y Crandell, Deputy Director 

Vince Bocci, Administra ve Officer 

Mark Hack, IT Specialist 

Sco  Gronbach, Facili es Opera ons  Specialist 

Jeff Poole, Water Treatment Plant Operator 

Jim Lowell, Maintenance Worker 

 

Conserva on Gene cs 

Chris an Smith, Regional Gene cist & Program 

Head 

Pat DeHaan, Conserva on Gene cist 

Ma  Smith, Conserva on Gene cist 

Jennifer Von Bargen, Lab Gene cist 

Brice Adams, Fish Gene cist 

 

Physiology & Nutri on 

Kyle Hanson, Regional Physiologist & Program 

Head 

Richard Glenn, Microbiologist 

John Holmes, Fish Biologist 

Ann Gannam, Regional Nutri onist 

Ron Twibell, Fish Nutri onist 

James Barron, Fish Biologist 

Kelli Hawke, Biological Science Technician 

 

Quan ta ve Ecology & Technology 

Doug Peterson, Senior Scien st & Program Head 

Ben Kennedy, Fish Ecologist 

Will Simpson, Fish Ecologist 

Kurt Steinke, Electronics Engineer 

Abernathy Creek Winter  Steelhead Spawning 

AFTC researchers, in collabora on with Bonneville Power Administra on and the Washington Depart‐ment of Fish and Wildlife, con nue their work on the Natural Reproduc ve Success and Demographic Effects of Hatchery‐Origin Steelhead in Abernathy Creek, WA. The objec ve of this 16+ year study is to iden fy differences between hatchery‐origin (HOR) and natural‐origin (NOR) winter steelhead and pro‐vide informa on to help managers minimize these differences. March and April ac vi es for the project included adult capture, spawning, and release of brood year 2014 smolts. The total adult capture at the end of April was 71 NOR (31 female, 40 males), 158 HOR (66 females, 92 males), and 25 out‐of‐basin HOR strays (5 females, 10 males). From these adults 48 NOR (21 females, 27 males) and 20 HOR (10 fe‐males, 10 males) fish were passed upstream to spawn naturally, with 23 NOR (10 females, 13 males) fish used for hatchery brood stock, represen ng 25% of all parents used to produce 2015 juveniles. Richard Glenn con nued collec on of blood, ovarian fluid, and eggs during spawning in addi on to track‐ing growth and development of offspring from this year’s broodstock. In addi on, Richard, Ben Kenne‐dy, and Kyle Hanson collected gill biopsies to deter‐mine seawater preparedness of HOR smolts. The first release of 4600 brood year 2014 steelhead smolts occurred on April 14th, with the second re‐lease on April 28th (4900 smolts). The final 4900 smolts will be released on May 12th.  

Kelli Hawke and John Holmes biosampling adult steel‐

head. Photo credit: J. Strickland. 

 3 

Physiology and Nutri on In March and April, 13 feeds were re‐

ceived from the Na onal Fish Hatcheries 

for fish feed quality control.  As part of 

the rou ne analyses, all feeds were also 

checked for rancidity. Ann Gannam wrote 

the feed memos and contacted the feed 

mills when necessary.  A possible feed 

size issue with starter feeds used at three 

NFHs is being inves gated.   

Final sampling for the lamprey ammo‐

coete ra on level/water quality study 

was completed on March 9th.  Ron Twi‐

bell and James Barron collected final wa‐

ter samples and captured all fish for 

measurement.  Data on lamprey growth 

rates and changes in water quality in rela‐

onship to ra on are currently being ana‐

lyzed. 

 

Ann Gannam, Ron Twibell, and Jeff Poole 

formulated and made feeds for Dr. Jona‐

than Eya at West Virginia State Universi‐

ty.  The four diets will be used in feeding 

trials looking at alterna ve ingredients 

and gene expression in rainbow trout. 

 

Final sampling for the coho recircula ng 

aquaculture system (RAS) study occurred 

April 28th.  Ron Twibell, James Barron, 

Ann Gannam and Kyle Hanson collected 

blood and gill samples for further analy‐

sis.  Lengths, weights, and fin length 

were measured on a subsample of the 

popula on in each tank.  Ron con nues 

to collect and analyze data for a similar 

steelhead RAS study that was complet‐

ed at the Hagerman NFH.  Ron analyzed 

lipid, moisture, and ash content of the 

steelhead that were raised in the RAS 

circular tanks and in the raceways at 

Hagerman NFH.  

Conserva on Gene cs Jennifer Von Bargen conducted Rapid 

Response analysis on 101 Chinook 

salmon trapped as poten al broodstock 

for Livingston Stone NFH during 5 cap‐

ture events. 

 

Jennifer Von Bargen tested a new Sex 

ID fragment for bull trout in a large 

known sex data set.  She found the 

marker to be 96% accurate, sugges ng 

this might be a useful tool. 

 

Jennifer Von Bargen genotyped 983 bull 

trout as part of a collabora ve study 

with the Oregon Department of Fish & 

Wildlife. 

 

Kieslana Wing genotyped 1,060 bull 

trout as part of an on‐going study to 

assist with bull trout conserva on and 

upstream passage in the Lake Pend  

Reports: 

Adams, B., P. DeHaan 

and C. Smith. 2015. 

Gene c Determina on 

of Stock of Origin for 

Oncorhynchus mykiss 

Collected in the Upper 

Deschutes River Basin. 

AFTC Final Report 

FY2015. 

DeHaan, P., J. Von 

Bargen, M. Meeuwig, 

and S. Clements. 2015. 

Great Basin Redband 

Trout Gene c Status 

Assessment. AFTC Final 

Report:74. 

Smith, C. T., B. Adams, 

K. Wing, J. Von Bargen, 

M. Smith, L. Earley, 

and M. Brown. 2015. 

Use of gene c data for 

life‐history and moni‐

toring analysis of Chi‐

nook salmon in Clear 

Creek and Ba le Creek. 

AFTC Final Report. 

Smith, M., and J. Von 

Bargen. 2015. Gene c 

informa on needs as‐

sessment for Lost River 

suckers (Del stes lux‐

atus) and shortnose 

suckers (Chasmistes 

brevirostris) of the Kla‐

math River basin. AFTC 

Final Report.  

AFTC Program Highlights 

James Barron assists Ron Twibell and  

Kelli Hawke with sampling for RAS 

study. Photo credit: A. Gannam. Ann Gannam explains opera on of fish feed 

produc on equipment. Photo credit: J. Strick‐

land. 

Oreille and Clark Fork River system, ID 

and MT.  

 

Brice Adams and Jennifer Von Bargen 

conducted Rapid Response analysis on 55 

bull trout captured in the Clark Fork Riv‐

er, MT in 5 capture events.  

 

Quan ta ve Ecology and Technology 

Kurt Steinke and Ben Kennedy replaced 

the destroyed antennas under the Aber‐

nathy Creek bridge with a new system.  

Instead of six rigid antennas housed in 

PVC, there are two flexible antennas that 

each span the en re stream and use Bi‐

omark’s new IS1001 transceiver unit.   

 

Will Simpson, Kurt Steinke, and Doug Pe‐

terson concluded a series of pilot studies 

to determine which electrical waveform 

causes the greatest mortality in fer lized 

eggs and newly emerged fry obtained 

from stray hatchery steelhead.   

 

As part of AFTC’s steelhead reproduc ve 

success study, two hatchery releases of 

steelhead smolts were conducted in 

April.  A total of 1,000 of these fish had 

been implanted with PIT tags, so that 

their migra on out of Abernathy Creek 

could be monitoring using sta onary PIT 

interroga on sta ons. 

 

Will Simpson and Kurt Steinke traveled to 

Hermiston, OR, to turn on PIT tag interro‐

ga on systems on irriga on diversions 

and bypass channels on the Uma lla Riv‐

er system.  

Administra on 

Roy Elicker (Pacific Region ARD – Fish‐

eries), Julie Collins (Pacific Region Dep‐

uty ARD – Fisheries), and Jennifer 

Strickland (Southeast Region, External 

Affairs, Team Lead ‐ Digital Communi‐

ca ons and Strategy) visited Aber‐

nathy FTC on March 24, 2015.  During 

Roy’s first visit he was given a tour of 

the facili es, demonstra ons/

explana on of ongoing research, and 

all our visitors enjoyed a salad themed 

luncheon provided by the staff. 

 

Jim Lowell assisted Dan Willis (Warm 

Springs NFH), Steve Money (Hagerman 

NFH), Vern Tolliver (Makah NFH), and 

Jeff Blaisdell (Carson NFH) in the in‐

stalla on of pneuma c valves for 

Warm Springs NFH’s sand filter sys‐

tem. 

 

Jim Lowell and Jeff Poole provided as‐

sistance to Eagle Creek NFH with gen‐

eral maintenance ac vi es and tree 

removal around a shed to be renovat‐

ed by students from Mt Hood Commu‐

nity College. 

 

Kelli Hawke completed Heavy Equip‐

ment Training, to cer fy her to oper‐

ate AFTC’s forkli  and backhoe. 

 

Kelli also par cipated in outreach ac‐

vi es at the USFWS’ annual Klineline 

Park hun ng and fishing event in Van‐

couver, WA.  

 4 

Look for our latest publica on:  Kovach, R. P., C. C. Muhlfeld, A. A. Wade, B. K. Hand, D. C. Whited, P. W. DeHaan, R. Al‐Chokhachy, and G. Luikart. 2015. Gene c diversity is related to clima c varia on and vulnerability in threatened bull trout. Glob Chang Biol.  Online early. 

AFTC Program Highlights— con nued 

Equipment used to iden fy different 

wave forms to be used to control 

invasive common carp at Malheur 

NWR. Photo credit: W. Simpson. 

Jim Lowell and Steve Money 

(Hagerman NFH) assis ng in repairs 

at Warm Springs NFH. Photo credit: 

D.  Willis. 

ARD Roy Elicker gets a descrip on of 

facility features from Judy Gordon 

during his first site visit. Photo   

credit: J. Strickland. 

Vince Bocci and Ann Gannam completed 

the Pacific Region’s COTR Refresher 

Training in Portland, OR. 

 

March Safety Training on electric fish bar‐

rier safety was provided by John Holmes. 

 

April Safety Training on Lockout/Tagout 

was provided by Ann Gannam. 

 

As part of her Advanced Leadership De‐

velopment Program 60‐Day Detail, Joan‐

na Webb (Na onal Friends and Partner‐

ship Coordinator) visited AFTC during a 

tour of field sta ons.  During her detail as 

Pacific Region, Ac ng Deputy ARD, Budg‐

et and Administra on (BA), Joanna visited 

several field sta ons to get a field sta on 

perspec ve on the support services pro‐

vided by BA (Informa on Technology, 

Contrac ng and General Services, Human 

Resources, and Engineering). 

 

Judy Gordon par cipated in a selec on 

panel, led by Gary Blefgen (Regional Engi‐

neer), for the posi on of Design and Con‐

struc on Branch Chief in the Division of 

Engineering. 

 

Judy Gordon, Pa y Crandell, and Vince 

Bocci met with Brian Lawler (Regional 

Recruiter) and Debra Lewis (Voca onal 

Rehabilita on Specialist, Department of 

Veterans Affairs) to discuss AFTC’s Ad‐

ministra ve Assistant vacancy as a Veter‐

ans Recruitment Authority hire. 

 

JoAnn Ehrmantrout, Co‐Troop Leader for 

the Castle Rock Girl Scout Super Troup 

and Judy Gordon met to discuss plans for 

the Troup to plan and plant a pollinator 

garden at AFTC.  

Program Highlights 

— con nued 

Mee ngs and Conferences  

Ann Gannam and Vince Bocci took the Contrac ng Officer’s Representa‐

ve refresher class. 

Ron Twibell and Ann Gannam had a conference call with Josh Rasmus‐

sen at the Klamath Basin Fish and Wildlife Office about addi onal Kla‐

math Basin sucker nutri on research.  

Kyle Hanson and Chris an Smith a ended the Lower Snake River Com‐

pensa on Plan annual mee ng in Clarkston, WA. 

Kyle Hanson and Pa y Crandell a ended Environmental Compliance 

training hosted by Bonneville Power Administra on. 

Richard Glenn and James Barron a ended the NCTC Field Data Manage‐

ment Using MS Access class at the Columbia River Fish Program Office . 

Ann Gannam and Kyle Hanson had a conference call with Jonathan Eya, 

David Huber and Dayan Perera WVSU; Wendy Trzyna Marshall Universi‐

ty; Beth Cleveland and Brian Peterson USDA to discuss the prepara on 

of a grant proposal that focuses on the interac ve effects of diet and 

temperature on the fish gut microbiome. 

Ann Gannam a ended the Columbia Gorge Fisheries and Watershed 

Science Conference in The Dalles, OR. 

Kyle Hanson and Ann Gannam had a conference call with Ralph Lamp‐

man, Bob Rose (Yakama Na on), Mary Moser (NOAA) and Aaron Jack‐

son (Confederated Tribes of the Uma lla Indian Reserva on) to discuss 

the lamprey rearing proposal submi ed to the Chelan Public U li es 

District.  James Barron, Ann Gannam, and Kyle Hanson had a follow‐up 

call with this lamprey group and a representa ve from the PUD . 

Ann Gannam set‐up and manned the AFTC Earth Day booth at the 

Longview Earth Day celebra on on April 18th.  The booth was visited by 

over 300 kids with their parents.  

 5 

Ann Gannam once again staffed the AFTC Booth at Longview, WA’s annual 

Earth Day Celebra on. Photo credit: A. Gannam. 

Mee ngs and Conferences  ‐ con nued 

Pat DeHaan met with biologists at ODFW to discuss gene c monitoring of Oregon Chub. 

Jennifer Von Bargen completed work for an online course called Wri ng with Clarity. 

Ma  Smith and Chris an Smith par cipated in a mee ng between USFWS, US Geological Survey, the State of Ore‐gon and The Klamath Tribe, the aim of which was to coordinate conserva on efforts for endangered shortnose suckers and Lost River suckers in the Klamath Basin. 

Brice Adams presented the results of a gene c analysis of Oncorhynchus mykiss from the upper Deschutes Basin to our partners at US Forest Service, Portland General Electric, and the State of Oregon at the annual Pelton Round Bu e Fish Commi ee Mee ng.  

Ma  Smith and Javier Linares (Pacific Southwest Region Fisheries) met with researchers at the University of Cali‐fornia at Davis to discuss a collabora ve project to develop single nucleo de polymorphism (SNP) markers for endangered Devil’s Hole Pupfish.  

Ben Kennedy, Regional Data Steward for AFTC, a ended the Regional Data Management Workshop in Portland, OR. 

Doug Peterson a ended a por on of the Regional Aqua c Conserva on Team (ACT) mee ng held at the Columbia River FRO, in Vancouver, WA. 

QET hosted a visit from biologists with NOAA‐Fisheries, from Jones Beach, OR, who tested a mobile antenna sys‐tem using the PIT‐tagged smolts released from AFTC’s experimental hatchery program. 

Judy Gordon and Pa y Crandell par cipated in the March and April Pacific Region Fisheries Resources Project Leaders conference calls. 

A second mee ng was held to con nue coordina on with the Washington Department of Fish and Wildlife on the Abernathy Creek Winter Steelhead Reproduc ve Success Study. In a endance from WDFW were Cindy LeFleur, Bryce Glaser, and Mara Zimmerman. 

Judy Gordon, Pa y Crandell, and Denise Hawkins (Washington Fish and Wildlife Office) par cipated in a mee ng between Regional Office staff and employees of Smith‐Root, inc. to discuss the Pacific Region’s use of electric fish barriers. One result of this discussion was a follow up site visit to AFTC to view and inspect the facility’s electric fish barrier. 

  Judy Gordon par cipated in a selec on panel, led by Gary Blefgen (Regional Engineer), for the posi on of Design 

and Construc on Branch Chief in the Division of Engineering.   Judy Gordon, Pa y Crandell, and Vince Bocci met with Brian Lawler (Regional Recruiter) and Debra Lewis 

(Voca onal Rehabilita on Specialist, Department of Veterans Affairs) to discuss AFTC’s Administra ve Assistant vacancy as a Veterans Recruitment Authority hire. 

  JoAnn Ehrmantrout, Co‐Troop Leader for the Castle Rock , WA, Girl Scout Super Troup and Judy Gordon met to 

discuss plans for the Troup to plan and plant a pollinator garden at AFTC.    AFTC staff par cipated in the all‐employee mee ng featuring USFWS Director Dan Ashe.  

Judy Gordon par cipated in a mee ng of members of the North Pacific Landscape Conserva on Coopera ve’s 

Science/Tradi onal Ecological Knowledge Subcommi ee to develop performance measures for discussion by the 

whole group and Steering Commi ee Leadership Team. 

 6 

 

Ongoing Projects 

Water Velocity Effects on Salmon as Reared in Recircu‐

la ng Systems.  Management Need:  Determine the 

effects of water velocity on composi on, growth, condi‐

on, and performance of juvenile PNW salmon as ap‐

plied to recircula ng systems in support of hatcheries in 

the Pacific Region considering the use of recircula ng 

systems.  Partners: Pacific Region Na onal Fish Hatcher‐

ies, Fishery Resources Program via Fisheries Opera ons 

and Need System (FONS). 

Diet development for Lost River and short nose suckers 

in the Klamath River Basin. Management Need: Deter‐

mine dietary needs of listed popula ons to assist in re‐

covery. Partners: Klamath Tribes, Klamath Falls FWO, 

California/Nevada FHC. 

Development of diets and rearing techniques for the 

culture of Pacific lamprey, Entosphenus tridentatus.  

Management Need: Assist Tribal partners in developing 

methods for the ar ficial propaga on of Pacific lamprey, 

a species of concern. Partners: Yakama Na on; Fishery 

Resources Program via FONS. 

Assessing the effects of mul ple tagging methods on 

Pacific lamprey ammocoetes. Management Need: Assist 

Tribal partners in developing methods for the monitor‐

ing and evalua on of this species of concern. Partners: 

Yakama Na on; Fishery Resources Program via FONS. 

The physiological response of white sturgeon to han‐

dling stress in cap vity. Management Need: Determine 

if the stress from catch and release angling is detri‐

mental to survival of white sturgeon, a species of con‐

cern. Partners: Dalhousie University; Carleton Universi‐

ty. 

Pacific Region’s Fish Feed Quality Control (FFQC) Pro‐

gram. The FFQC Program, the only one of its kind in the 

FWS, provides quarterly monitoring of the quality of the 

commercially produced fish feeds used at Pacific and 

Pacific Southwest Regions’ NFHs.  Informa on is com‐

piled on an annual basis and used in the development of 

the Pacific Region fish feed contract. Management 

Need: Conduct quality assurance/quality control of com‐

mercially produced fish feeds used at Pacific and Pacific 

Southwest Regions’ NFHs. Partners: Pacific and Pa‐

cific Southwest Region’s NFHs, Oregon, Washington, 

Idaho, and Tribal fish hatcheries. 

Evalua on of the thermal exposure of adult Chi‐

nook salmon during the migra on to Warm Springs 

NFH. Management Need: Determine if Chinook 

salmon migra ng to Warm Springs Na onal Fish 

Hatchery experience thermal stress. Partners: Warm 

Springs Na onal Fish Hatchery, Lower Columbia Fish 

Health Center, Confederated Tribes of Warm 

Springs. 

Natural reproduc ve success and demographic 

effects of hatchery‐origin steelhead in Abernathy 

Creek, WA. Management Need: Provide informa on 

to help managers minimize differences between 

NOR and HOR fish. Partners: Bonneville Power Ad‐

ministra on; Washington Department of Fish and 

Wildlife.  

Climate change vulnerability assessments of Pacific 

Region Na onal Fish Hatcheries. Management 

Need: An understanding of the an cipated habitat 

changes under different climate change scenarios 

provides managers with informa on to proac vely 

respond to these condi ons and their impact on 

NFHs. Partners: Pacific Region NFHs; Mid‐Columbia 

River FRO; Fishery Resources Program via FONS. 

Development of gene c markers associated with 

smol fica on in steelhead and salmon. Manage‐

ment Need: Iden fy gene c markers associated 

with downstream migra on to provide managers 

with informa on to proac vely manage early onset 

smol ng levels. Partners: Fishery Resources Pro‐

gram via FONS.  

Range‐wide conserva on and monitoring tools for 

bull trout: a method for determining threats and 

monitoring outcomes of conserva on ac ons.  

Management need:  Evaluate the influence of sam‐

ple size and spa al distribu on of sample sites on 

es mates of gene c diversity in ESA listed popula‐

ons. Partners: Oregon Department of Fish and 

Wildlife. 

Watermark: Adult winter steelhead. Photo credit: J. Strickland 

 7 

Ongoing Projects—con nued 

 8 

Inves ga on of the Rela ve Reproduc ve Success of 

Hatchery and Wild Steelhead in the Deschutes Basin.  

Management need:  Evaluate impacts of stray hatchery 

fish on naturally spawning popula ons of steelhead. Part‐

ners: Oregon Department of Fish and Wildlife. 

Gene c Determina on of Stock of Origin for Oncorhyn‐

chus mykiss Collected above Pelton Dam.  Management 

need:  Assess the impact of hatchery releases of steel‐

head on naturally‐spawning popula ons of redband 

trout.  Partners: U.S. Forest Service, Oregon Department 

of Fish and Wildlife. 

Tes ng gene c monitoring tools proposed by California 

Hatchery Review. Management need: Evaluate the use of 

gene c methods to evaluate USFWS hatchery programs 

in the upper Sacramento River.  Partners: Red Bluff Fish 

and Wildlife Office. 

Gene c characteriza on of salmonids colonizing re‐

stored streams in Portland, OR.  Management need: de‐

termine the species and popula on of origin of salmonids 

captured in urban streams.  Partner: Columbia River Fish‐

eries Program Office. 

Gene c sex assignment of juvenile Chinook salmon used 

as poten al broodstock for reintroduc on of Sacramen‐

to River Winter Run Chinook salmon.  Management 

need:  Op mal rearing of Chinook salmon to reproduc ve 

maturity requires knowledge of which individuals are 

males and which are females.  Partner: Coleman NFH. 

Use of restric on‐associated DNA sequence data for sin‐

gle nucleo de polymorphism detec on in listed Devil’s 

Hole pupfish. Management Need: Develop gene c mark‐

ers to monitor gene c diversity of a listed popula on 

held in refugia. Partners: Sacramento FWO; University of 

California, Davis. 

Popula on gene c structure of Spalding’s catchfly: a 

terrestrial plant. Management Need: Develop gene c 

markers and monitor gene c diversity of popula ons to 

iden fy management units and inform conserva on plan‐

ning. Partners: Idaho FWO; University of Montana. 

Gene c needs assessment for endangered Lost River 

and shortnose suckers of the Klamath River Basin, OR. 

Management Need: Develop gene c markers to monitor 

gene c diversity of listed popula ons. Partners: Klamath 

Falls FWO; U.S. Geological Survey. 

Rapid response gene c analysis of threatened bull 

trout collected below dams in the Clark Fork River, 

MT. Management Need: Provide data to inform up‐

stream fish passage decisions for listed bull trout. Part‐

ners: Avista Corpora on; Confederated Salish Kootenai 

Tribes; Idaho Fish and Game; Kalispel Tribe of Indians; 

Montana Fish Wildlife & Parks; Montana Ecological Ser‐

vices Field Office; Pend Oreille Public U lity District; 

Pennsylvania Power & Light, MT. 

Gene c iden fica on of endangered winter‐run Chi‐

nook salmon in the Sacramento River, CA. Manage‐

ment Need: Rapid response broodstock iden fica on 

for spawning of listed species. Partners: Livingston 

Stone NFH; Red Bluff FWO; NOAA Fisheries. 

Strategic modeling of bull trout conserva on ac ons 

in the lower Clark Fork River, MT.  Management Need:  

Determine impacts of hydroelectric facili es on listed 

bull trout popula ons and priori ze conserva on ac‐

ons. Partners: Avista Corpora on; Montana Fish Wild‐

life & Parks; Montana Ecological Services Field Office; 

Idaho Fish and Game. 

Movement pa erns of Oregon chub. Management 

Need: Determine movement pa erns and gene flow 

among popula ons of a recently delisted species using 

gene c data. Partners: Oregon Department of Fish & 

Wildlife, U.S. Army Corps of Engineers. 

Suppression of common carp in Malheur Lake using 

electrofishing to target eggs and embryos. Manage‐

ment Need: Determine the feasibility of using electro‐

fishing to kill eggs and embryos for control of invasive 

common carp in Malheur Lake.  Partner: Malheur NWR. 

Westslope cu hroat trout from the Clark Fork River in MT. Photo credit: P. DeHaan. 

Projects—con nued 

Antenna design for the Biomark IS1001 PIT tag reader. 

Management Need: Provide expert level engineering and 

technical assistance to partners monitoring species of 

interest using new technologies while reducing biologist 

me spent in design and troubleshoo ng. Partner: NOAA 

Fisheries, USFWS Green Bay 

Entrainment and bypass of ESA‐listed salmon at irriga‐

on diversions on the Uma lla River.  Management 

need:  Determine what environmental factors influence 

the magnitude of fish entrainment into irriga on canals 

and if captured fish are successfully screened and re‐

turned to the Uma lla River using PIT tag technology.  

Partner: Bureau of Reclama on 

Aqua c organism passage (AOP) at remediated stream 

road crossings. Management Need:  Assess the efficacy 

of gene c, direct capture, and remote sensing methods 

to verify fish passage through remediated culverts.  Part‐

ners:  US Forest Service, Trout Unlimited. 

Mekong River fish ecology and sustainable develop‐

ment.  Management Need:  Assess the scien fic capacity 

and data needs for resource managers in Laos and Cam‐

bodia to address hydroelectric development on the main‐

stem Mekong River.  Partners:  USGS, US DOI Interna on‐

al Technical Assistance Program (ITAP)  

Effec veness of transi oning to a locally‐sourced steel‐

head broodstock at Winthrop NFH.  Management Need: 

Determine if hatchery improvement programs and ac‐

ons are achieving the expected biological performance 

objec ves. Partners: USFWS Mid‐Columbia FRO and    

NOAA Fisheries.  

Kyle Hanson and Chris an Smith collect samples from Aber‐nathy Creek winter Steelhead for their research into gene expression. Photo credit: J. Gordon. 

Linda Beck, Fish Biologist at Malheur NWR, and Will Simpson prepare to go out to sample invasive common carp. Photo credit: D. Peterson 

 9