L’ADN de les oliveres monumentals

Clara Romero Santiveri

Tutora: Coia Charles

IES Domènech i Montaner

Introducció. Definició

• Olivera monumental:– Més de 3,5 m de perímetre a 1,3 m d’alçada

> 3,5 m

1,3 m

Introducció. Localització i quantitat

1234

Total = 4.157 oliveres938

300

1115

86 73Montsià

Baix Maestrat

Objectius

1. Descriure els treballs de l’IRTA de recerca en oliveres monumentals al territori del Sénia

2. Descriure tècniques d’anàlisi d’ADN aplicables a l’estudi d’oliveres monumentals

3. Descripció morfològica de 5 oliveres monumentals

4. Descripció d’ADN d’aquestes oliveres

Línies IRTA en oliveres monumentals

1. Estudiar l’ADN per saber si són d’una única varietat o no

2. Calcular l’edat de les oliveres

3. Per què s’han conservat tants anys? Tenen algun avantatge d’adaptació al medi?

4. Caracteritzar els olis d’aquestes oliveres

5. Desenvolupar el sector dels olis d’oliveres monumentals, donat que són un producte exclussiu

Tècniques d’anàlisi de l’ADN

Tècnica d’anàlisi Què analitzen?

Isoenzims Proteínes

RFLP (Restriction Fragment Lenght Polymorphism) Fragments d’ADN

RAPD (Random Amplification of Polymorphic DNA) Amplifica fragments anònims d’ADN

SSR (Simple Sequence Repeat) Amplifica microsatèl·lits de l’ADN

AFLP (Amplified Fragment Lenght Polymorphism) Amplifica fragments selectius d’ADN

SNP (Single Nucleotide Polymorphism) Substitucions d’una sola base entre seqüències de l’ADN

SCAR (Sequence Characterized Amplified Region) Amplifica fragments específics d’ADN

Les proteïnes o l’ADN s’extreuen de fulles joves dels arbres

Tècnica SSR. Etapes

extensió

nou cicle de la PCR

ANÀLISI

restricció

separació

encebador específic

Seqüencia conegudaADN

Part experimental

Metodologia. Localització en camp

Olivera 1879

Olivera 1535

Olivera 1547

Olivera 1536

Olivera 1878

Metodologia. Descripció morfològica

Metodologia. Descripció morfològica

Metodologia. Descripció morfològica

Metodologia. Anàlisi d’ADN

• Tècnica SSR• Laboratoris IRTA• A partir de fulles joves• Càlcul de distàncies genètiques

RESULTATS

Resultats. Morfologia

187918781547 15351536

Resultats. ADN (SSR)1536 1547 1878 1535

SSR al·lel 1 al·lel 2 al·lel 1 al·lel 2 al·lel 1 al·lel 2 al·lel 1 al·lel 2

DCA3 -- -- 243 249 243 249 243 249

DCA4 144 192 170 192 170 192 170 192

DCA7 150 170 154 156 154 154 154 154

DCA8 141 141 135 167 128 135 128 135

DCA9 179 200 179 192 179 192 179 192

DCA10 113 158 145 160 145 160 145 160

DCA11 137 164 128 143 129 143 129 143

DCA16 124 152 122 150 124 151 124 151

DCA17 114 114 126 126 127 127 127 127

DCA18 179 179 165 169 165 169 165 169

Resultats. ADN (SSR)

1536 1547 1878 1535

SSR al·lel 1 al·lel 2 al·lel 1 al·lel 2 al·lel 1 al·lel 2 al·lel 1 al·lel 2

DCA3 -- -- 243 249 243 249 243 249

DCA4 144 192 170 192 170 192 170 192

DCA7 150 170 154 156 154 154 154 154

DCA8 141 141 135 167 128 135 128 135

DCA9 179 200 179 192 179 192 179 192

DCA10 113 158 145 160 145 160 145 160

DCA11 137 164 128 143 129 143 129 143

DCA16 124 152 122 150 124 151 124 151

DCA17 114 114 126 126 127 127 127 127

DCA18 179 179 165 169 165 169 165 169

Resultats. Càlcul de distància genètica entre individus

• Coeficient de dissimilitud (D):

yx

xy

nn

ND

21

nxy= núm. d ’al·lels que comparteixen els 2 genotips que comparem nx= núm. d’al·lels en el genotip-x ny= núm. d’al·lels en el genotip-y

Resultats. ADN agrupacions

1536 1547 1878 1535

1536 --

1547 0,889 --

1878 0,833 0,333 --

1535 0,833 0,333 0 --

1536 1547 1878 - 1535

1536 --

1547 --

1878 -1535 --

Coeficients de dissimilitud (distància genètica)

0,8890,833 + 0,833

2= 0,833 0,833

0,330+ 0,3332

= 0,333 0,333

Resultats. ADN agrupacions

1536 1547- 1878 - 1535

1536 --

1547-1878 -1535 --

Coeficients de dissimilitud (distància genètica)

0,852

1536 1547 1878 1535

1536 --

1547 0,889 --

1878 0,833 0,333 --

1535 0,833 0,333 0 --

0,889 + 0,833 + 0,8333

= 0,852

Resultats. ADN dendogrames

Distància genètica (coeficient de dissimilitud)Mètode promig

0,852

0,333

1547

Resultats. Morfologia i ADN

1547

153618781535FormaCurvaturaL/ALluïssorColor del revés

PesPos. màximL/AFormaSimetria

PesL/ASuperfície

CONCLUSIONS

Conclusions

1. S’han descrit el treballs IRTA en oliveres monumentals al Sénia

2. S’han descrit les tècniques d’anàlisi d’ADN aplicables a l’estudi d’oliveres monumentals

3. Paràmetres morfològics que classifiquen igual que l’ADN:

Fulla: forma, curvatura, L/A i lluïssorFruit: pes, posició màxim, forma, simetria i L/APinyol: pes, superfície, L/A

4. Les diferències d’ADN observades signifiquen que hi ha diversitat genètica dins la població d’oliveres monumentals

999 Gràcies per la vostra atenció.