aybu.edu.tr°zyolojİ... · web viewfiziksel aktiviteler altında yatan fizyolojik mekanizmaların...

39
FİZYOLOJİ DOKORA PROGRAMI Ek- 1. AKTS Bilgi Formu YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ FİZYOLOJİ ANABİLİM DALI 2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU Ders Kodu FİZ 601 Ders Adı Bilimsel Araştırma Yöntemleri Yarıyıl Güz Program Fizyoloji Dersin Dili Türkçe Dersin Türü Zorunlu Dersin Düzeyi Doktora Dersin Ön koşulları Temel fizyoloji, insan biyolojisi derslerini almış olmak Ders Süresi Haftada 4 saat Öğretim Eleman(lar)ı Doç. Dr. Sinan Canan Dersin Amacı Bir konunun bilimsel metot kullanılarak araştırılması ev konuyla ilgili çalışma yapılmasının kavratılması Ders İçeriği Fizyolojide bir konunun bilimsel metodu kullanarak derinlemesine araştırılması; temel araştırmalar, laboratuar araştırmaları, bunlarla ilgili teorik bilgi ve uygulamasının yaptırılması, bilimsel bir konunun fark edilmesi, tanımlanması, konu ile ilgili bilgilerin toplanması, hipotezlerin oluşturulması, çözüm yolarının uygulanması, deneysel çalışmaların yapılması, sonuca varılması. Dersin Öğrenme Çıktıları Bir konunun bilimsel metot kullanılarak araştırılması ve konuyla ilgili çalışma yapılmasının öğrenilmesi Haftalık Ders Programı Hafta Konular 1. Fizyolojik araştırma tekniklerine giriş 2. Moleküler teknikler 3. Hücresel araştırma teknikleri 4. Hayvan çalışmaları 5. Davranış çalışmaları 6. Elektrofizyolojik teknikler-1 7. Elektrofizyolojik teknikler-2 8. Dijital veriyi işlemeye giriş 9. Görüntüleme teknikleri-1 10. Görüntüleme teknikleri-2 11. Bilgisayar modellemelerine giriş 12. Doğrusal olmayan davranışların çalışılması

Upload: voduong

Post on 19-Apr-2019

225 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

FİZYOLOJİ DOKORA PROGRAMIEk- 1. AKTS Bilgi Formu

YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

FİZYOLOJİ ANABİLİM DALI2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU

Ders Kodu FİZ 601 Ders Adı Bilimsel Araştırma Yöntemleri

Yarıyıl GüzProgram FizyolojiDersin Dili TürkçeDersin Türü ZorunluDersin Düzeyi DoktoraDersin Ön koşulları Temel fizyoloji, insan biyolojisi derslerini almış olmak

Ders Süresi Haftada 4 saat

Öğretim Eleman(lar)ı Doç. Dr. Sinan CananDersin Amacı Bir konunun bilimsel metot kullanılarak araştırılması ev

konuyla ilgili çalışma yapılmasının kavratılması

Ders İçeriği Fizyolojide bir konunun bilimsel metodu kullanarak derinlemesine araştırılması; temel araştırmalar, laboratuar araştırmaları, bunlarla ilgili teorik bilgi ve uygulamasının yaptırılması, bilimsel bir konunun fark edilmesi, tanımlanması, konu ile ilgili bilgilerin toplanması, hipotezlerin oluşturulması, çözüm yolarının uygulanması, deneysel çalışmaların yapılması, sonuca varılması.

Dersin Öğrenme Çıktıları Bir konunun bilimsel metot kullanılarak araştırılması ve konuyla ilgili çalışma yapılmasının öğrenilmesi

Haftalık Ders Programı

Hafta Konular

1. Fizyolojik araştırma tekniklerine giriş2. Moleküler teknikler3. Hücresel araştırma teknikleri4. Hayvan çalışmaları5. Davranış çalışmaları6. Elektrofizyolojik teknikler-17. Elektrofizyolojik teknikler-28. Dijital veriyi işlemeye giriş9. Görüntüleme teknikleri-110. Görüntüleme teknikleri-211. Bilgisayar modellemelerine giriş12. Doğrusal olmayan davranışların çalışılması13. Veri yönetimi14. Fizyoloji araştırmalarında yeni yaklaşımlarKaynaklar Chow SC.” Design and analysis of clinical trials: concepts and methodologies”.Hoboken:Wiley

Interscience, 2004.Sümbüloğlu V, Sümbüloğlu K.”Sağlık Bilimlerinde Araştırma Yöntemleri”. Hatiboğlu Yayınevi 2 Baskı, 2004.Arlı, M. ve Nazik, H. (2001). Bilimsel araştırmaya giriş. Ankara: Gazi kitabevi.

Öğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer,

ProjeToplam AKTS

3 2 2 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)Ara Sınav 1 30Ödev, Seminer 2 20Uygulama 1 10Final 1 40

Ek- 2. ECTS Information

YILDIRIM BEYAZIT UNIVERSITYINSTITUTE OF HEALTH SCIENCESDEPARTMENT OF PHYSIOLOGY2014-2015 ECTS INFORMATION

Course code: FIZ 601 Name of course: Scientific research methods

Year/ Semester: AutumnProgram: Physiology DoctorateLanguage of instruction: TurkishCategory: RequiredPrerequisites: Taken basic physiology and human biology coursesLength of course: 4 hours per weekResponsible for course: Assoc. Prof. Dr. Sinan Canan

Course objectives: The aim of this course is comprehension of researching a topic by using scientific methods and studying about that

Course contents:

To research a topic by using scientific methods; informing about basic researches, laboratory researches and making laboratory applications; recognizing a scientific topic, gathering information about that, to hypothesize, making experimental studies, resulting

Learning outcomes: Learning to research a topic by using scientific methods and studying about that

Weekly Course Flow

Week Subjects

1. Introduction to physiological research techniques2. Molecular techniques3. Cellular research techniques4. Animal studies5. Behavioral studies6. Electrophysiological techniques-17. Electrophysiological techniques-28. Introduction to digital signal processing9. Imaging techniques-110. Imaging techniques-211. Introduction to computer modelling12. Studying the nonlinear behavior13. Data management14. New approaches in physiological researchReferences Chow SC.” Design and analysis of clinical trials: concepts and methodologies”.Hoboken:Wiley

Interscience, 2004.Sümbüloğlu V, Sümbüloğlu K.”Sağlık Bilimlerinde Araştırma Yöntemleri”. Hatiboğlu Yayınevi 2 Baskı, 2004.Arlı, M. ve Nazik, H. (2001). Bilimsel araştırmaya giriş. Ankara: Gazi kitabevi.

Education and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project Assignment ECTS3 2 2 8Evaluation Criteria: Number Rate(%)Midterm exam 1 30Assignment 2 20ProjectLaboratoryPractice 1 10Final exam 1 40

Ek- 1. AKTS Bilgi Formu

YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

FİZYOLOJİ ANABİLİM DALI2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU

Ders Kodu FİZ 602 Ders Adı İleri Sinir Fizyolojisi

Yarıyıl GüzProgram FizyolojiDersin Dili TürkçeDersin Türü ZorunluDersin Düzeyi DoktoraDersin Ön koşulları Temel fizyoloji, insan biyolojisi derslerini almış olmak

Ders Süresi Haftada 4 saat

Öğretim Eleman(lar)ı Doç. Dr. Sinan CananDersin Amacı Sinir sistemi ve fonksiyonlarının kavratılması

Ders İçeriği Sinir sisteminin ileri düzeyde incelenmesi, integratif sinirbilimi, nörohormonal kontrol sistemleri, davranışsal sinirbilim, sinirbilim alanındaki güncel sorun ve araştırma alanları, beyin-beden etkileşimleri, ileri nörofizyoloji.

Dersin Öğrenme Çıktıları Sinir sistemi ve fonksiyonlarının öğrenilmesiHaftalık Ders Programı

Hafta Konular

1. İnsan sinir sistemi ve nöroanatomisi2. Nöron, glia ve sinyalleşme3. Sinaptik iletişim4. Sinirsel devreler ve şebekeler5. Sinir sisteminde plastisite6. Somatoduyusal işleme7. Göz hareketleri ve denge sistemi8. Ağrı9. Gelişimsel nörobiyoloji10. Sinir sisteminde kaos ve fraktallar11. Nörobiyolojide yeni tekniklere genel bakış12. Beyin-makina arayüzleri13. Nörobiyolojinin büyük sorunlarKaynaklar Berne RM., Levy MN, Physiology, Sixth ed., 2009.

Ganong WF., Review of Medical Physiology, twenty-forth edition, 2012.Silverthorn DU., Human Physiology, sixth edition, 2012. Mark F. Bear, Neuroscience 3.ed. 2006

Öğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer,

ProjeToplam AKTS

3 2 2 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)AraSınav 1 30Ödev, Seminer 2 20Uygulama 1 10Final 1 40

Ek- 2. ECTS Information

YILDIRIM BEYAZIT UNIVERSITYINSTITUTE OF HEALTH SCIENCES

DEPARTMENT OF PHYSIOLOGY2014-2015 ECTS INFORMATION

Course code: FIZ 602 Name of course: Further Physiology of Nervous System

Year/ Semester: AutumnProgram: Physiology DoctorateLanguage of instruction: TurkishCategory: RequiredPrerequisites: Taken basic physiology and human biology coursesLength of course: 4 hours per weekResponsible for course: Assoc. Prof. Dr. Sinan Canan

Course objectives: The aim of this course is comprehension of nervous system and its functions

Course contents: Studying on nervous system in advanced level, integrative neurology, neuro hormonal control systems, behavioral neurology, current problems and research fields in neurology, brain-body interactions, further neurophysiology

Learning outcomes: Learning nervous system and its functionsWeekly Course Flow

Week Subjects

1. Human nervous system and neuro anatomy2. Neuron, glia and signaling3. Synaptic signaling4. Neuronal circuits and networks5. Plasticity in the nervous system6. Somatosensorial processing7. Eye movements and vestibular function8. Pain9. Developmental neurobiology10. Chaos and fractals in neurobiology11. New techniques in neuroscience12. Brain-computer interfaces13. Grand problems of neurobiologyReferences Berne RM., Levy MN, Physiology, Sixth ed., 2009.

Ganong WF., Review of Medical Physiology, twenty-forth edition, 2012.Silverthorn DU., Human Physiology, sixth edition, 2012. Mark F. Bear, Neuroscience 3.ed. 2006

Education and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project Assignment ECTS3 2 2 8Evaluation Criteria: Number Rate(%)Midterm exam 1 30Assignment 2 20ProjectLaboratoryPractice 1 10Final exam 1 40

Ek- 1. AKTS Bilgi Formu

YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

FİZYOLOJİ ANABİLİM DALI

2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU

Ders Kodu FİZ 603 Ders Adı Egzersiz Fizyolojisi

Yarıyıl BaharProgram Fizyoloji DoktoraDersin Dili TürkçeDersin Türü ZorunluDersin Düzeyi DoktoraDersin Ön koşulları Temel fizyoloji, insan biyolojisi derslerini almış olmak

Ders Süresi Haftada 3 saat

Öğretim Eleman(lar)ı Prof. Dr. Fahri BayıroğluDersin Amacı Egzersiz esnesında etkin fizyolojik mekanizmaları,

sonrasında toparlanmayı, fizyolojik sistemlerin egzersize uyumunu ve egzersiz fizyolojisinde kullanılan ölçüm yöntemlerinin kavratılması

Ders İçeriği Fiziksel aktiviteler altında yatan fizyolojik mekanizmaların incelenmesi, fiziksel aktiviteyi; sinir, endokrin, kalp-dolaşım, kas-iskelet sistemlerinin nasıl etkilediği aynı zamanda fiziksel aktivitelerin bu sistemlerden nasıl etkilendiği. Enerji kavramı, farklı egzersizlerin enerji maliyetleri, organizmanın enerji yolları, egzersiz sonrası toparlanma. Farklı fizyolojik sistemlerin akut ve kronik egzersize uyumu, akut ve kronik adaptasyon mekanizmaları, farklı ortamlarda egzersiz. Egzersiz fizyolojisinde ölçüm yöntemleri.

Dersin Öğrenme Çıktıları Egzersiz esnesında etkin fizyolojik mekanizmaları, sonrasında toparlanmayı, fizyolojik sistemlerin egzersize uyumunu ve egzersiz fizyolojisinde kullanılan ölçüm yöntemlerini öğrenmek

Haftalık Ders Programı

Hafta Konular

1. Egzersiz tipleri2. Enerji kaynakları3. Egzersizin sinirsel ve endokrin temelleri4. Egzersize kısa dönemli yanıt (kalp, dolaşım) 5. Egzersize kısa dönemli yanıt (kas, solunum)6. Egzersize uzun dönemli yanıt (kalp, dolaşım) 7. Egzersize uzun dönemli yanıt (kas, solunum)8. Egzersizin psikolojik temelleri9. Egzersize metabolik yanıt ve beslenme10. Değişik koşullarda egzersiz11. Egzersiz ile motor ve fiziki gücün geliştirilmesi12. Egzersiz ile hız ve çabukluğun geliştirilmesi13. Egzersiz ile dayanıklılık (endurans) geliştirilmesi14. Çocuk, ergenler ve yaşlılarda egzersiz yanıtıKaynaklar Ganong WF., Review of Medical Physiology, twenty-forth edition, 2012.

Guyton and Hall,:Textbook of Medical Physiology, 12. ed. 2010Öğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer,

ProjeToplam AKTS

3 - 2 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)Ara Sınav 1 30Ödev, Seminer 2 30UygulamaFinal 1 40

Ek- 2. ECTS Information

YILDIRIM BEYAZIT UNIVERSITYINSTITUTE OF HEALTH SCIENCESDEPARTMENT OF PHYSIOLOGY2014-2015 ECTS INFORMATION

Course code: FIZ 603 Name of course: Physiology of Exercise

Year/ Semester: SpringProgram: Physiology DoctorateLanguage of instruction: TurkishCategory: RequiredPrerequisites: Taken basic physiology and human biology coursesLength of course: 3 hours per weekResponsible for course: Prof. Dr. Fahri Bayıroğlu

Course objectives:

Comprehension of the physiological mechanisms which are active during exercise, recovering after exercise, adaptation of physiological systems to exercise and methods of measurements using in physiology of exercise

Course contents:

Studying on the mechanisms underlying physical activities; researching how neural, endocrine, cardiovascular, musculoskeletal systems influence physical activities and also how physical activities are influenced. Energy notion, energy expenditure of different types of exercises, energy pathways of organism, recovering after exercise. Adaptation of different physiological systems to acute and chronic exercise, acute and chronic adaptation mechanisms, exercise in different environments. Methods of measurements in physiology of exercise

Learning outcomes:

Learning the physiological mechanisms which are active during exercise, recovering after exercise, adaptation of physiological systems to exercise and methods of measurements using in physiology of exercise

Weekly Course Flow

Week Subjects

1. Exercise types2. Energy sources3. Neuronal and hormonal basis of exercise4. Short-term response to exercise (heart, circulation)5. Short-term response to exercise (muscle, respiration)6. Long-term response to exercise (heart, circulation)7. Long -term response to exercise (muscle, respiration)8. Psychological basis of exercise9. Metabolic response to exercise and nutrition10. Exercise at different conditions11. Progress of motor and physical strength by exercise12. Progress of velocity and quickness by exercise13. Progress of endurance by exercise14. Exercise response of children, adults and eldersReferences Ganong WF., Review of Medical Physiology, twenty-forth edition, 2012.

Guyton and Hall,:Textbook of Medical Physiology, 12. ed. 2010Education and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project Assignment ECTS3 - 2 8Evaluation Criteria: Number Rate(%)Midterm exam 1 30Assignment 2 30ProjectLaboratoryPracticeFinal exam 1 40

Ek- 1. AKTS Bilgi Formu

YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

FİZYOLOJİ ANABİLİM DALI2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU

Ders Kodu FİZ 604 Ders Adı İmmün Sistem Fizyolojisi

Yarıyıl BaharProgram FizyolojiDersin Dili TürkçeDersin Türü ZorunluDersin Düzeyi DoktoraDersin Ön koşulları Temel fizyoloji, insan biyolojisi derslerini almış olmak

Ders Süresi Haftada 3 saat

Öğretim Eleman(lar)ı Prof. Dr. Fahri BayıroğluDersin Amacı Bağışıklık sistemi hücreleri ve fonksiyonları,

salgıladıkları maddeler ve fonksiyonları, antijen-antikor kavramları, bağışıklık tipleri, allerji, otoimmünite, immün yetmezlik, immune supresyon tanımlarının kavratılması

Ders İçeriği Bağışıklık sistemi hücreleri ve fonksiyonları, salgıladıkları maddeler ve fonksiyonları, antijen-antikor kavramları, bağışıklık tipleri, allerji, otoimmünite, immün yetmezlik, immune supresyon

Dersin Öğrenme Çıktıları Bağışıklık sistemi hücreleri ve fonksiyonları, salgıladıkları maddeler ve fonksiyonları, antijen-antikor kavramları, bağışıklık tipleri, allerji, otoimmünite, immün yetmezlik, immune supresyon kavramlarının öğrenilmesi

Haftalık Ders Programı

Hafta Konular

1. Lökositler; nötrofil ve makrofajların enfeksiyona direnci2. Monosit – Makrofaj sistemi, inflamasyon3. Doğal immmünite4. Adaptif immünite5. T ve B lenfositlerin işlenmesi6. T hücre tipleri ve fonksiyonları7. Antijen sunumu, Antijen – antikor ilişkisi8. Antikor çeşitliliği9. Kompleman Sistemi10. Tolerans11. Aşılama ve Pasif immünite12. Kan grubu Antijenleri13. Organ Trasplantasyonu14. Alerji ve hipersensitiviteKaynaklar Berne RM., Levy MN, Physiology, Sixth ed., 2009.

Ganong WF., Review of Medical Physiology, twenty-forth edition, 2012.Guyton and Hall,:Textbook of Medical Physiology, 12. ed. 2010F. Broere, S. G. Apasov, M. V. Sitkovsky, and W. van Eden, “T cell subsets and T cell mediated immunity,” in Principles of Immunopharmacology, F. P. Nijkamp and M. J. Parnham, Eds., Birkhäuser, Basel, Switzerland, 2011

Öğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer,

ProjeToplam AKTS

3 - 2 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)Ara Sınav 1 30Ödev, Seminer 2 30UygulamaFinal 1 40

Ek- 2. ECTS Information

YILDIRIM BEYAZIT UNIVERSITYINSTITUTE OF HEALTH SCIENCESDEPARTMENT OF PHYSIOLOGY2014-2015 ECTS INFORMATION

Course code: FIZ 604 Name of course: Physiology of Immune System

Year/ Semester: Spring

Program: Physiology DoctorateLanguage of instruction: TurkishCategory: RequiredPrerequisites: Taken basic physiology and human biology coursesLength of course: 3 hours per weekResponsible for course: Prof. Dr. Fahri Bayıroğlu

Course objectives:

The aim of this course is comprehension of immune cells and their functions, released matters and their functions, antigen-antibody notions, types of immunity, allergy, autoimmunity, immune deficiency, immune suppression notions

Course contents:

Immune cells and their functions, released matters and their functions, antigen-antibody notions, types of immunity, allergy, autoimmunity, immune deficiency, immune suppression

Learning outcomes:

Learning basic rules of Immune cells and their functions, released matters and their functions, antigen-antibody notions, types of immunity, allergy, autoimmunity, immune deficiency, immune suppression notions

Weekly Course Flow

Week Subjects

1. Leukocytes; neutrophils and macrophages defend against infection2. Monocyte - Macrophage system, inflammation3. Innate immunity4. Adaptive immunity5. Processing of T and B lymphocytes6. Types and functions of T cells7. Antigen presentation, Antigen -antibody relation8. Diversity of antibody9. Complement System10. Immunotolerance11. Vaccination and Passive immunity12. Blood Types13. Organ Transplantation14. Allergy ve hypersensitivityReferences Berne RM., Levy MN, Physiology, Sixth ed., 2009.

Ganong WF., Review of Medical Physiology, twenty-forth edition, 2012.Guyton and Hall,:Textbook of Medical Physiology, 12. ed. 2010F. Broere, S. G. Apasov, M. V. Sitkovsky, and W. van Eden, “T cell subsets and T cell mediated immunity,” in Principles of Immunopharmacology, F. P. Nijkamp and M. J. Parnham, Eds., Birkhäuser, Basel, Switzerland, 2011

Education and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project Assignment ECTS3 - 2 8Evaluation Criteria: Number Rate(%)Midterm exam 1 30Assignment 2 30ProjectLaboratoryPracticeFinal exam 1 40

Ek- 1. AKTS Bilgi Formu

YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

FİZYOLOJİ ANABİLİM DALI2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU

Ders Kodu FİZ 605 Ders Adı Kardiyopulmoner Sistem Fizyolojisi

Yarıyıl GüzProgram Fizyoloji

Dersin Dili TürkçeDersin Türü ZorunluDersin Düzeyi DoktoraDersin Ön koşulları Temel fizyoloji, insan biyolojisi derslerini almış olmak

Ders Süresi Haftada 3 saat

Öğretim Eleman(lar)ı Doç. Dr. Fatih EkiciDersin Amacı Kardiyopulmoner fonksiyonlar ve kalp patolojilerinin

kavratılması

Ders İçeriği Kalbin işlevleri, Kalp ve akciğer arasında kanın sirkülasyonu, akciğer alveollerinde gaz değişimi, pulmoner arter, pulmoner ven, hiper ve hipo tansiyon, iskemi, reperfüzyon, miyokard infarktüsü, flatter, fibrilasyon.

Dersin Öğrenme Çıktıları Kardiyopulmoner fonksiyonlar ve kalp patolojilerinin öğrenilmesi

Haftalık Ders Programı

Hafta Konular

1. Kalbin elektriksel aktivitesi2. Pompa olarak kalp ve düzenlenmesi3. Kalp debisi4. Kalp çalışmasının düzenlenmesi5. Kalp kasının metabolizması ve enerji kaynakları6. Normal EKG, EKG yorumu ve vektör analizi7. Aritmiler ve kalp yetmezliği8. Koroner dolaşım ve iskemik kalp hastalığı9. Dolaşım şok’u ve fizyolojik tedavisi10. Solunum sistemi yapısı ve fonksiyonları11. Ventilasyon ve Diffüzyon12. Ventilasyon perfüzyon ilişkisi13. Kanın akımı ve metabolizması, Kanda gaz taşınımı14. Solunumun kontrolü, Solunum Fonksiyon testleriKaynaklar Berne RM., Levy MN, Physiology, Sixth ed., 2009.

Ganong WF., Review of Medical Physiology, twenty-forth edition, 2012.Guyton and Hall,:Textbook of Medical Physiology, 12. ed. 2010

Öğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer,

ProjeToplam AKTS

3 - 2 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)Ara Sınav 1 30Ödev, Seminer 2 30UygulamaFinal 1 40

Ek- 2. ECTS Information

YILDIRIM BEYAZIT UNIVERSITYINSTITUTE OF HEALTH SCIENCESDEPARTMENT OF PHYSIOLOGY2014-2015 ECTS INFORMATION

Course code: FIZ 605 Name of course: Physiology of Cardiopulmonary System

Year/ Semester: AutumnProgram: Physiology DoctorateLanguage of instruction: TurkishCategory: RequiredPrerequisites: Taken basic physiology and human biology coursesLength of course: 3 hours per week

Responsible for course: Assoc. Prof. Dr. Fatih Ekici

Course objectives: The aim of this course is comprehension of cardiopulmonary functions and pathologies of the heart

Course contents:

Functions of the heart, circulation of blood between heart and lungs, gas exchange in alveolus, pulmonary artery, pulmonary vein, hypo-hypertension, ischemia, reperfusion, myocardial infarction, flatter, fibrillation.

Learning outcomes: Learning cardiopulmonary functions and pathologies of the heart

Weekly Course Flow

Week Subjects

1. Electrical activity of the heart2. Heart as a pump and its regulation3. Cardiac output4. Regulation of heart action5. Metabolism of heart muscle and energy sources6. Normal ECG, ECG and vector analysis7. Arrhythmias and heart failure8. Coronary circulation and ischemic heart diseases9. Circulation shock and physiological treatment10. Respiratory system structure and functions11. Ventilation and diffusion12. Connection of ventilation and perfusion13. Blood stream and metabolism, gas transport in blood14. Respiration control, respiratory function testsReferences Berne RM., Levy MN, Physiology, Sixth ed., 2009.

Ganong WF., Review of Medical Physiology, twenty-forth edition, 2012.Guyton and Hall,:Textbook of Medical Physiology, 12. ed. 2010

Education and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project Assignment ECTS3 - 2 8Evaluation Criteria: Number Rate(%)Midterm exam 1 30Assignment 2 30ProjectLaboratoryPracticeFinal exam 1 40

Ek- 1. AKTS Bilgi Formu

YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

FİZYOLOJİ ANABİLİM DALI2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU

Ders Kodu FİZ 606 Ders Adı İleri Beslenme Fizyolojisi

Yarıyıl GüzProgram FizyolojiDersin Dili TürkçeDersin Türü ZorunluDersin Düzeyi DoktoraDersin Ön koşulları Temel fizyoloji, insan biyolojisi derslerini almış olmak

Ders Süresi Haftada 3 saat

Öğretim Eleman(lar)ı Prof. Dr. Fahri BayıroğluDersin Amacı Sindirim ve emilim mekanizmalarının, gastrointestinal

hastalıkların kavratılması

Ders İçeriği Besin alımı, çiğneme ve yutma; mideden besinlerin geçişi, mide fonksiyonları; barsaklarda sindirim, ince barsak hareketleri; pankreas salgıları ve etkileri, düzenlenmesi; karaciğer ve safra salgısının düzenlenmesi, kalın barsaklarda sindirim ve dışkılama; emilim mekanizması ve emilim. Besinlerin sindirilmesinde rol oynayan enzimler. Gastrointestinal sistemi oluşturan organlarda meydana gelen hastalılar(enterokolit, tümörler, enterohemorraji, barsak delinmesi vs.)

Dersin Öğrenme Çıktıları Sindirim ve emilim mekanizmalarının, gastrointestinal hastalıkların öğrenilmesi

Haftalık Ders Programı

Hafta Konular

1. Besinlerin enerji değerleri2. Metabolik ve bazal metabolik hız3. Protein metabolizması4. Protein ve aminoasidler5. Karbonhidrat metabolizması6. Plazma glikoz seviyesinin düzenlenmesi7. Yağ metabolizması8. Plazma lipidleri ve kolesterol9. Glisemik indeks ve yük10. Organizmanın ısı regülasyonu11. Beslenme ilkeleri12. İştah mekanizması ve bu mekanizmada rol alan maddeler13. Vitamin ve mineraller14. Su ve elektrolit dengesi Kaynaklar Becker, KL., Principles and Practice of Endocrinology and Metabolism, 2002

Berne R., Levy M., Koeppen BM.,Stanton,BA.,Physiology,6th Ed. 2009Ganong WF., Review of Medical Physiology, twenty-forth edition, 2012.Guyton and Hall,:Textbook of Medical Physiology, 12. ed. 2010

Öğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer,

ProjeToplam AKTS

3 - 2 8DeğerlendirmeYöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)Ara Sınav 1 30Ödev, Seminer 2 30UygulamaFinal 1 40

Ek- 2. ECTS Information

YILDIRIM BEYAZIT UNIVERSITYINSTITUTE OF HEALTH SCIENCESDEPARTMENT OF PHYSIOLOGY2014-2015 ECTS INFORMATION

Course code: FIZ 606 Name of course: Further Physiology of Nutrition

Year/ Semester: AutumnProgram: Physiology DoctorateLanguage of instruction: TurkishCategory: RequiredPrerequisites: Taken basic physiology and human biology coursesLength of course: 3 hours per weekResponsible for course: Prof. Dr. Fahri BayıroğluCourse objectives: The aim of this course is comprehension of digestion and

absorption mechanisms, gastrointestinal diseases

Course contents:

Nutrient intake, chewing, swallowing; passing of nutrients in the stomach, functions of stomach; digestion in intestine, intestinal motions; secretions of pancreas, their effects and regulation; regulation of secretions of liver and gall bladder; digestion in bowel and defecation; mechanism of absorption and absorption; digestive enzymes; diseases of gastrointestinal system (enterocolitis, tumors, enterohemorrhage, intestinal perforation, etc.)

Learning outcomes: Learning digestion and absorption mechanisms, gastrointestinal diseases

Weekly Course Flow

Week Subjects

1. Energy values of nutrients2. Metabolic and basal metabolic rate3. Protein metabolism4. Proteins and amino acids5. Carbohydrate metabolism6. Regulation of plasma glucose level7. Lipid metabolism8. Plasma lipids and cholesterol9. Glycemic index and load10. Heat regulation of organism11. Principles of nutrition12. Appetite mechanism and factors that affect this13. Vitamin and minerals14. Balance of water and electrolytesReferences Becker, KL., Principles and Practice of Endocrinology and Metabolism, 2002

Berne R., Levy M., Koeppen BM.,Stanton,BA.,Physiology,6th Ed. 2009Ganong WF., Review of Medical Physiology, twenty-forth edition, 2012.Guyton and Hall,:Textbook of Medical Physiology, 12. ed. 2010

Education and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project Assignment ECTS3 - 2 8Evaluation Criteria: Number Rate(%)Midterm exam 1 30Assignment 2 30ProjectLaboratoryPracticeFinal exam 1 40

Ek- 1. AKTS Bilgi Formu

YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

FİZYOLOJİ ANABİLİM DALI2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU

Ders Kodu FİZ 607 Ders Adı Endokrin Sistem Fizyopatolojisi

Yarıyıl BaharProgram FizyolojiDersin Dili TürkçeDersin Türü ZorunluDersin Düzeyi DoktoraDersin Ön koşulları

Ders Süresi Haftada 3 saat

Öğretim Eleman(lar)ı Yrd. Doç. Dr. Zeynep Seçkin AkkılıkDersin Amacı

Ders İçeriği Endokrin bezler ve hormonlar, hormon reseptörleri, hormon yapımının düzenlenmesi, yiyecek arama ve bilişsel aktivitelerde adrenal kostikosteroidlerin yönlendirici etkisi, gelişimsel olayların aracıları olarak hormonlar, beyinde cinsiyet farklılıkları, insan beyni ve davranışında cinsiyet farklılıkları, vazopressin ve fizyolojik düzenlenmesi, oksitosin ve fizyolojik düzenlenmesi, hipotalamusun nöroendokrinolojideki yeri, hipotalamik hormonlar, hipofiz bezi ve hormonları. Endokrin bezlerin tümörleri, endokrin bezlerin yetersiz ve aşırı çalışmalarına bağlı olarak ortaya çıkan hastalıklar(guatr,gigantizm, moonface vs.).

Dersin Öğrenme Çıktıları Endokrin bezler ve hormonların fonksiyonlarını, endokrin patolojileri öğrenmek

Haftalık Ders Programı

Hafta Konular

1. Endokrin sisteme giriş2. Hormon reseptörleri3. Hormon yapımının düzenlenmesi4. Yiyecek arama ve bilişsel aktivitelerde adrenal kostikosteroidlerin yönlendirici etkisi5. Gelişimsel olayların aracıları olarak hormonlar6. Beyinde cinsiyet farklılıkları, 7. İnsan beyni ve davranışında cinsiyet farklılıkları8. Oksitosin ve fizyolojik düzenlenmesi9. Vazopressin ve fizyolojik düzenlenmesi10. Hipotalamusun nöroendokrinolojideki yeri11. Hipofiz bezi ve hormonları12. Hipotalamik hormonlar13. Endokrin bezlerin yetersiz ve aşırı çalışmalarına bağlı olarak ortaya çıkan hastalıklar14. Endokrin bezlerin tümörleriKaynaklar Guyton, Ganong

Öğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer,

ProjeToplam AKTS

3 - 2 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)Ara Sınav 1 30Ödev, Seminer 2 30UygulamaFinal 1 40

Ek- 2. ECTS Information

YILDIRIM BEYAZIT UNIVERSITYINSTITUTE OF HEALTH SCIENCESDEPARTMENT OF PHYSIOLOGY2014-2015 ECTS INFORMATION

Course code: FIZ 607 Name of course: Physiopathology of Endocrine System

Year/ Semester: SpringProgram: Physiology DoctorateLanguage of instruction: TurkishCategory: RequiredPrerequisites: -Length of course: 3 hours per weekResponsible for course: Assistant Professor Dr. Zeynep Seçkin AkkılıkCourse objectives: -

Course contents: Endocrine glands and hormones; hormone receptors; regulation of hormone production; leader effect of adrenal

corticosteroids in searching for food and cognitive activities; hormones as mediators of progressional activities; sexual variations of brain; sexual variations of human brain and behaviors; vasopressin and its physiological regulation; oxytocin and its physiological regulation; place of hypothalamus in physiology, hypothalamic hormones; pituitary gland and its hormones. Tumors of endocrine glands, diseases developed because of insufficiently or excessively working of endocrine glands (goiter, gigantism, moon face, etc.)

Learning outcomes: Learning endocrine glands and hormones, their functions and endocrine pathologies

Weekly Course Flow

Week Subjects

1. Introduction to Endocrine System2. Hormone receptors3. Regulation of hormone production4. Leader effect of adrenal corticosteroids in searching for food and 5. cognitive activities6. hormones as mediators of progressional activities7. Sexual variations of brain8. Sexual variations of human brain and behaviors9. Oxytocin and its physiological regulation10. Vasopressin and its physiological regulation11. Place of hypothalamus in physiology12. Pituitary gland and its hormones13. Hypothalamic hormones14. Diseases developed because of insufficiently or excessively working of endocrine glands (goiter,

gigantism, moon face, etc.)References Ganong, Guyton

Education and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project Assignment ECTS3 - 2 8Evaluation Criteria: Number Rate(%)Midterm exam 1 30Assignment 2 30ProjectLaboratoryPracticeFinal exam 1 40

Ek- 1. AKTS Bilgi Formu

YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

FİZYOLOJİ ANABİLİM DALI2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU

Ders Kodu FİZ 701 Ders Adı İleri Hücre Fizyolojisi

Yarıyıl GüzProgram FizyolojiDersin Dili TürkçeDersin Türü SeçmeliDersin Düzeyi DoktoraDersin Ön koşulları Temel fizyoloji, insan biyolojisi derslerini almış olmak

Ders Süresi Haftada 3 saat

Öğretim Eleman(lar)ı Doç. Dr. Fatih EkiciDersin Amacı Bu dersin amacı; hücre zarı ve fonksiyonları, hücre içi

ve hücrelerarası iletişimin kavratılması

Ders İçeriği Hücre zarının düzenlenişi, üzerinde bulunan moleküllerin fizyolojik fonksiyonu, hücre-hücre bağlantıları, sinyal transdüksiyon mekanizmasında rol alan moleküller, organeller arasındaki iletişim, gen ekspresyonu, post transkripsiyonel modifikasyon, programlı hücre ölümü konularının moleküler düzeyde incelenmesi.

DersinÖğrenmeÇıktıları Hücre zarı ve fonksiyonları, hücre içi ve hücrelerarası iletişimin moleküler düzeyde incelenerek öğrenilmesi

Haftalık Ders Programı

Hafta Konular

1. Vücudun organizasyonu2. Vücut sıvıları ve ölçülmesi3. Hücre hacminin regülasyonu4. Hücrenin fonksiyonel morfolojisi5. Hücre membranı6. Hücre organelleri7. Motor moleküller, hücre adezyon molekülleri, hücreler arası bağlantılar8. Nükleus ve DNA ve RNA’nın yapı ve fonksiyonları9. Gen ekspresyonunun regülasyonu, protein sentezi, apoptozis10. Hücre membranından transport11. İyon kanalları ve Na+ - K+ ATPaz aktivitesinin regülasyonu12. Uyarılabilen hücrelerde istirahat membran potansiyellerinin oluşumu13. Uyarılabilen hücrelerde aksiyon potansiyelleri ve impuls iletimi14. Hücreler arası sinyal iletimi. Reseptör ve G protein hastalıklarıKaynaklar Berne RM., Levy MN, Physiology, Sixth ed., 2009.

Ganong WF., Review of Medical Physiology, twenty-forth edition, 2012.Silverthorn DU., Human Physiology, sixth edition, 2012. Mark F. Bear, Neuroscience 3.ed. 2006

Öğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer,

ProjeToplam AKTS

2 2 2 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)Ara Sınav 1 30Ödev, Seminer 2 20Uygulama 1 10Final 1 40

Ek- 2. ECTS Information

YILDIRIM BEYAZIT UNIVERSITYINSTITUTE OF HEALTH SCIENCESDEPARTMENT OF PHYSIOLOGY2014-2015 ECTS INFORMATION

Course code: FIZ 701 Name of course: Further Physiology of The Cell

Year/ Semester: AutumnProgram: Physiology DoctorateLanguage of instruction: TurkishCategory: ElectivePrerequisites: Taken basic physiology and human biology coursesLength of course: 3 hours per weekResponsible for course: Assoc. Prof. Dr. Fatih Ekici

Course objectives: The aim of this course is comprehension of cell membrane and its functions, intracellular and intercellular communication

Course contents: Studying regulation of cell membrane, physiological functions of molecules placed on the cell membrane, intercellular junctions, molecules that take part in signal transducing mechanism, communication between the

organelles, gene expression, posttranscriptional modification, programmed cell death subjects in molecular level

Learning outcomes: Learning cell membrane and its functions, intracellular and intercellular communication by studying in molecular level

Weekly Course Flow

Week Subjects

1. Organization of the body2. Body fluids and measurement of them3. Regulation of cell volume4. Functional morphology of the cell5. Cell membrane6. Cell organelles7. Motor molecules, cell adhesion molecules, intercellular junctions8. Nucleus and structure and functions of DNA and RNA9. Regulation of gene expression, protein synthesis, apoptosis10. Transport through cell membrane11. Ion channels and regulation of Na+-K+ ATPase activity12. Formation of resting membrane potential in excitable cells13. Action potentials and impulse transduction in excitable cells14. Intracellular signal transduction. Receptor and G protein diseasesReferences Berne RM., Levy MN, Physiology, Sixth ed., 2009.

Ganong WF., Review of Medical Physiology, twenty-forth edition, 2012.Silverthorn DU., Human Physiology, sixth edition, 2012. Mark F. Bear, Neuroscience 3.ed. 2006

Education and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project Assignment ECTS2 2 2 8Evaluation Criteria: Number Rate(%)Midterm exam 1 30Assignment 2 20ProjectLaboratoryPractice 1 10Final exam 1 40

Ek- 1. AKTS Bilgi Formu

YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

FİZYOLOJİ ANABİLİM DALI2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU

Ders Kodu FİZ 702 Ders Adı Sistemlerin Kontrol Mekanizmaları

Yarıyıl GüzProgram FizyolojiDersin Dili TürkçeDersin Türü SeçmeliDersin Düzeyi DoktoraDersin Ön koşulları Temel fizyoloji, insan biyolojisi derslerini almış olmak

Ders Süresi Haftada 2 saat

Öğretim Eleman(lar)ı Doç. Dr. Fatih EkiciDersin Amacı Hücre ve fizyolojik sistemlerin sinirsel ve hormonal

düzenlenmesinin kavratılması

Ders İçeriği Hücre, sinir, kas, kardiyovasküler, sindirim, boşaltım, solunum, üreme sistemlerinin; sinirsel, hormonal düzenlenmesi, bu düzenleme mekanizmasında rol

oynayan moleküller, karşılıklı etkileşimler.DersinÖğrenmeÇıktıları Hücre ve fizyolojik sistemlerin sinirsel ve hormonal

düzenlenmesinin öğrenilmesiHaftalık Ders Programı

Hafta Konular

1. Hücre üzerinde etkin sinirsel ve hormonal düzenlemeler2. Santral sinir sisteminin düzenlenmesi3. Periferik sinir sisteminin düzenlenmesi4. Kalp çalışmasının sinirsel ve hormonal düzenlenmesi5. Damarlar üzerinde etkin sinirsel ve hormonal düzenlemeler6. Solunum sisteminin sinirsel ve hormonal düzenlenmesi7. Midede sindirimin sinirsel ve hormonal düzenlenmesi8. Karaciğer ve safra kesesi fonksiyonlarının sinirsel ve hormonal düzenlenmesi9. İnce barsak ve pankreasın sinirsel ve hormonal düzenlenmesi10. Kalın barsakların sinirsel ve hormonal düzenlenmesi11. Böbrekler üzerinde etkili sinirsel ve hormonal düzenlemeler12. Endokrin sistem üzerinde etkili sinirsel düzenlemeler13. Genital sistemin sinirsel ve hormonal düzenlenmesi14. TartışmaKaynaklar Berne RM., Levy MN, Physiology, Sixth ed., 2009.

Ganong WF., Review of Medical Physiology, twenty-forth edition, 2012.Guyton and Hall,:Textbook of Medical Physiology, 12. ed. 2010

Öğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer,

ProjeToplam AKTS

2 - 2 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)Ara Sınav 1 30Ödev, Seminer 2 30UygulamaFinal 1 40

Ek- 2. ECTS Information

YILDIRIM BEYAZIT UNIVERSITYINSTITUTE OF HEALTH SCIENCESDEPARTMENT OF PHYSIOLOGY2014-2015 ECTS INFORMATION

Course code: FIZ 702 Name of course: Control Mechanisms of the Systems

Year/ Semester: AutumnProgram: Physiology DoctorateLanguage of instruction: TurkishCategory: ElectivePrerequisites: Taken basic physiology and human biology coursesLength of course: 2 hours per weekResponsible for course: Assoc. Prof. Dr. Fatih Ekici

Course objectives: The aim of this course is comprehension of neural and hormonal regulation of the cell and physiological systems

Course contents:

Neural and hormonal regulation of cell, neural, muscular, cardiovascular, gastrointestinal, urinary, respiratory, genital systems; the molecules that take part in these regulating mechanisms; mutual interactions

Learning outcomes: Learning neural and hormonal regulation of the cell and physiological systems

Weekly Course Flow

Week Subjects

1. Neural and hormonal regulation of the cell2. Regulation of central nervous system3. Regulation of peripheric nervous system4. Neural and hormonal regulation of heart action5. Neural and hormonal regulation of vessels6. Neural and hormonal regulation of respiratory system7. Neural and hormonal regulation of gastric digestion8. Neural and hormonal regulation of liver and gall bladder9. Neural and hormonal regulation of intestines and pancreas10. Neural and hormonal regulation of bowel11. Neural and hormonal regulation of kidneys12. Neural regulation of endocrine system13. Neural and hormonal regulation of genital system14. DiscussionReferences Berne RM., Levy MN, Physiology, Sixth ed., 2009.

Ganong WF., Review of Medical Physiology, twenty-forth edition, 2012.Guyton and Hall,:Textbook of Medical Physiology, 12. ed. 2010

Education and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project Assignment ECTS2 - 2 8Evaluation Criteria: Number Rate(%)Midterm exam 1 30Assignment 2 30ProjectLaboratoryPracticeFinal exam 1 40

Ek- 1. AKTS Bilgi Formu

YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

FİZYOLOJİ ANABİLİM DALI2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU

DersKoduFİZ703 DersAdıTemel Stereoloji ve Nörostereoloji

Yarıyıl BaharProgram FizyolojiDersinDili TürkçeDersinTürü SeçmeliDersinDüzeyi DoktoraDersinÖnkoşulları

DersSüresi Haftada 3saat

ÖğretimEleman(lar)ı Doç. Dr. SinanCananDersinAmacı Stereolojitekniklerivelaboratuvaruygulamalarınınkavrat

ılması

Dersİçeriği Biyolojikdokulardaneldeedileceksayı, alan, hacim, uzunlukveyoğunlukgibiniceliksel (sayısal) verilerineldeedilmesindekullanılantemelyöntemler; modern tasarımtabanlı (design-based) stereolojinintemellerisistematikrasgeleörnekleme, disector, fractionator, rotator, nucleatorvbteknikleri; stereolojiyeilişkintemellaboratuvarbecerileri,

stereolojininsıklıklakullanıldığısinirbilimselçalışmalar, laboratuvaruygulamalarınagiriş.

DersinÖğrenmeÇıktıları Stereolojitekniklerivelaboratuvaruygulamalarınınöğrenilmesi

HaftalıkDersProgramı

Hafta Konular

1. Morfometriyegiriş – Stereolojidetemelkavramlar2. Kesitkavramı; kesitvebiçimilişkisi3. Kesitlerdenobjesayılarınınhesaplanmasındakisorunlar4. Morfometrideörneklemeninönemi5. Morfometrikçalışmalardakihatakaynakları6. Biyolojikdukolardahacimölçmeyöntemleri: Cavalieriprensibi7. Sayıhesaplama: Disektörtekniği8. Parçalama (fractionator) tekniğiveuygulamaları9. Uzunlukhesaplama: OrientatorveIsector10. Vertikalveizotropikkesitteknikleri11. Yüzeyalanıhesaplamateknikleri12. Bilgisayardesteklistereoloji13. Diğeryöntemler14. LiteratürörnekleriKaynaklar C.V. Howard & M.G. Reed, (2010) Unbiased Stereology Three Dimensional Measurement in

Microscopy. 2nd Ed.

ÖğretimYöntemVeTeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer,

ProjeToplam AKTS

2 2 2 8DeğerlendirmeYöntemivegeçmekriterleri Sayısı Katkısı(%)

AraSınav 1 40Ödev, Seminer 1 10Uygulama 1Final 1 50

Ek- 2. ECTS Information

YILDIRIM BEYAZIT UNIVERSITYINSTITUTE OF HEALTH SCIENCESDEPARTMENT OF PHYSIOLOGY2014-2015 ECTS INFORMATION

Course code: FIZ 703 Name of course: Basic Stereology and Neurostereology

Year/ Semester: SpringProgram: Physiology DoctorateLanguage of instruction: TurkishCategory: ElectivePrerequisites:Length of course: 3 hours perweekResponsible for course: Assoc. Prof. Dr. SinanCanan

Course objectives: The aim of this course is comprehension of stereology tecnics and laboratory applications

Course contents:

Basic methods used for getting digital data which will be obtained from biological tissues, as number, area, volume, length, density; basics of design-based stereology: systematic random sampling, disector, fractionator, rotator, nucleatoretc. tecnics; basic laboratory skills related stereology; neurological studies frequently used by stereology; introduction to laboratory applications

Learning outcomes: Learning stereology techniques and laboratory applicationsWeekly Course Flow

Week Subjects

1. Introduction to morphometry; Basic Concepts in stereology2. Concept of section; Section-form relationship3. Problems with number estimation using sections4. Importance of sampling in morphometry5. Error sources in morphometric studies6. Volume estimation techniques: Cavalieri’sprinciple7. Number estimation: The Disector8. TheFractionator:Technique and applications9. Length estimation: OrientatorveIsector10. Vertical and isotropicsectioning11. Surface area estimation techniques12. Computer assisted stereology13. Other methods14. Literature examplesReferences

Education and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project Assignment ECTS2 2 8Evaluation Criteria: Number Rate(%)Midterm exam 1 40Assignment 1 10ProjectLaboratoryPracticeFinal exam 1 50

Ek- 1. AKTS Bilgi Formu

YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

FİZYOLOJİ ANABİLİM DALI2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU

Ders Kodu FİZ 703 Ders Adı Temel Stereoloji ve Nörostereoloji

Yarıyıl BaharProgram FizyolojiDersin Dili TürkçeDersin Türü SeçmeliDersin Düzeyi DoktoraDersin Ön koşulları Temel fizyoloji, insan biyolojisi derslerini almış olmak

Ders Süresi Haftada 4 saat

Öğretim Eleman(lar)ı Doç. Dr. Sinan CananDersin Amacı Stereoloji teknikleri ve laboratuvar uygulamalarının

kavratılması

Ders İçeriği Biyolojik dokulardan elde edilecek sayı, alan, hacim, uzunluk ve yoğunluk gibi niceliksel (sayısal) verilerin elde edilmesinde kullanılan temel yöntemler; modern tasarım tabanlı (design-based) stereolojinin temelleri sistematik rasgele örnekleme, disector, fractionator, rotator, nucleator vb teknikleri; stereolojiye ilişkin temel laboratuvar becerileri, stereolojinin sıklıkla kullanıldığı sinirbilimsel çalışmalar, laboratuvar uygulamalarına giriş.

Dersin Öğrenme Çıktıları Stereoloji teknikleri ve laboratuvar uygulamalarının öğrenilmesi

Haftalık Ders Programı

Hafta Konular

1. Morfometriye giriş – Stereolojide temel kavramlar2. Kesit kavramı; kesit ve biçim ilişkisi3. Kesitlerden obje sayılarının hesaplanmasındaki sorunlar4. Morfometride örneklemenin önemi5. Morfometrik çalışmalardaki hata kaynakları6. Biyolojik dokularda hakim ölçme yöntemleri: Cavalieri prensibi7. Sayı hesaplama: Disektör tekniği8. Parçalama (fractionator) tekniği ve uygulamaları9. Uzunluk hesaplama: Orientator ve Isector10. Vertikal ve izotropik kesit teknikleri11. Yüzey alanı hesaplama teknikleri12. Bilgisayar destekli stereoloji13. Diğer yöntemler14. Literatür örnekleriKaynaklar C.V. Howard & M.G. Reed, (2010) Unbiased Stereology Three Dimensional Measurement in

Microscopy. 2nd Ed.Öğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer,

ProjeToplam AKTS

3 2 2 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)AraSınav 1 30Ödev, Seminer 2 20Uygulama 1 10Final 1 40

Ek- 2. ECTS Information

YILDIRIM BEYAZIT UNIVERSITYINSTITUTE OF HEALTH SCIENCESDEPARTMENT OF PHYSIOLOGY2014-2015 ECTS INFORMATION

Course code: FIZ 703 Name of course: Basic Stereology and Neurostereology

Year/ Semester: SpringProgram: Physiology DoctorateLanguage of instruction: TurkishCategory: ElectivePrerequisites: Taken basic physiology and human biology coursesLength of course: 4 hours per weekResponsible for course: Assoc. Prof. Dr. Sinan Canan

Course objectives: The aim of this course is comprehension of stereology technics and laboratory applications

Course contents:

Basic methods used for getting digital data which will be obtained from biological tissues, as number, area, volume, length, density; basics of design-based stereology: systematic random sampling, dissector, fractionator, rotator, nucleator etc. technics; basic laboratory skills related stereology; neurological studies frequently used by stereology; introduction to laboratory applications

Learning outcomes: Learning stereology techniques and laboratory applicationsWeekly Course Flow

Week Subjects

1. Introduction to morphometry; Basic Concepts in stereology2. Concept of section; Section-form relationship

3. Problems with number estimation using sections4. Importance of sampling in morphometry5. Error sources in morphometric studies6. Volume estimation techniques: Cavalieri’s principle7. Number estimation: The Dissector8. The Fractionator: Technique and applications9. Length estimation: Orientator and Isector10. Vertical and isotropic sectioning11. Surface area estimation techniques12. Computer assisted stereology13. Other methodsReferences C.V. Howard & M.G. Reed, (2010) Unbiased Stereology Three Dimensional Measurement in

Microscopy. 2nd Ed.Education and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project Assignment ECTS3 2 2 8Evaluation Criteria: Number Rate(%)Midterm exam 1 30Assignment 2 20ProjectLaboratoryPractice 1 10Final exam 1 40

Ek- 1. AKTS Bilgi Formu

YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

FİZYOLOJİ ANABİLİM DALI2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU

Ders Kodu FİZ 704 Ders Adı Fizyolojide Kaos ve Fraktallar

Yarıyıl BaharProgram FizyolojiDersin Dili TürkçeDersin Türü SeçmeliDersin Düzeyi DoktoraDersin Ön koşulları Temel fizyoloji, insan biyolojisi derslerini almış olmak

Ders Süresi Haftada 2 saat

Öğretim Eleman(lar)ı Doç. Dr. Sinan CananDersin Amacı Kaos kuramı, canlıların kaotik anlamda incelenmesinin,

fractal analiz yöntemlerinin kavratılması

Ders İçeriği Doğrusal olmayan bir karmaşık sistem olarak canlı bedenlerin incelenmesi, kaos kuramının temelleri, kaotik sistemleri çalışmanın temel esasları, fraktal geometri, fraktal analiz yöntemleri, doğrusal olmayan sinyal işleme tekniklerine giriş.

Dersin Öğrenme Çıktıları Kaos kuramı, canlıların kaotik anlamda incelenmesinin, fractal analiz yöntemlerinin öğrenilmesi

Haftalık Ders Programı

Hafta Konular

1. Bilim felsefesine giriş2. Kaos teorisine giriş

3. Fraktal geometriye giriş4. Temel zaman serisi analizi5. Kaotik davranışın ölçümlenmesi6. Fraktal boyut analizi7. Özbenzerlik kavramı8. Örnek çalışmalar9. Örnek çalışmalarKaynaklar Peitgen, H.O., Jürgens, H., Saupe, D. (2004) Chaos and fractals: New frontiers of science. 2nd Ed.

ISBN: 978-0387202297.Gleick, J. (1997) Kaos, TÜBİTAK yayınları, ISBN: 9754030294Fractals and Chaos - Larry S. Liebovitch ISBN: 978-0-19-51-2024-D

Öğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer,

ProjeToplam AKTS

2 - 2 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)AraSınav 1 30Ödev, Seminer 2 30UygulamaFinal 1 40

Ek- 2. ECTS Information

YILDIRIM BEYAZIT UNIVERSITYINSTITUTE OF HEALTH SCIENCESDEPARTMENT OF PHYSIOLOGY2014-2015 ECTS INFORMATION

Course code: FIZ 704 Name of course: Chaos and Fractals in Physiology

Year/ Semester: SpringProgram: Physiology DoctorateLanguage of instruction: TurkishCategory: ElectivePrerequisites: Taken basic physiology and human biology coursesLength of course: 2 hours per weekResponsible for course: Assoc. Prof. Dr. Sinan Canan

Course objectives: The aim of this course is comprehension of chaos theory, analyzing living organism

Course contents:

Analyzing living bodies as a nonlinear, complex systems; basics of chaos theory; basic principles of researching chaotic systems; fractal geometry; methods of fractal analyze; introduction to nonlinear signal processing tecnics

Learning outcomes: Learning chaos theory, analyzing living organismWeekly Course Flow

Week Subjects

1. Introduction to philosophy of science2. Introduction to chaos theory3. Introduction to fractal geometry4. Basic time series analysis5. Measurement of chaotic behavior6. Fractal dimension analysis7. Concept of self-similarity8. Case examples9. Case examplesReferences Peitgen, H.O., Jürgens, H., Saupe, D. (2004) Chaos and fractals: New frontiers of science. 2nd Ed.

ISBN: 978-0387202297.Gleick, J. (1997) Kaos, TÜBİTAK yayınları, ISBN: 9754030294

Fractals and Chaos - Larry S. Liebovitch ISBN: 978-0-19-51-2024-DEducation and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project Assignment ECTS2 - 2 8Evaluation Criteria: Number Rate(%)Midterm exam 1 30Assignment 2 30ProjectLaboratoryPracticeFinal exam 1 40

Ek- 1. AKTS Bilgi Formu

YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

FİZYOLOJİ ANABİLİM DALI2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU

Ders Kodu FİZ 705 Ders Adı Fizyolojide Güncel Uygulamalar

Yarıyıl GüzProgram FizyolojiDersin Dili TürkçeDersin Türü SeçmeliDersin Düzeyi DoktoraDersin Ön koşulları

Ders Süresi Haftada 3 saat

Öğretim Eleman(lar)ı Yrd. Doç. Dr. Zeynep Seçkin AkkılıkDersin Amacı

Ders İçeriği Fizyolojide yeni laboratuar teknikleri, en son geliştirilen laboratuar alet-ekipmanları, bilgisayar ve elektronik cihazların fizyoloji çalışmalarına uyarlanması.

Dersin Öğrenme Çıktıları Yeni fizyolojik teknik ve aletlerin öğrenilmesiHaftalık Ders Programı

Hafta Konular

1. Moleküler fizyoloji 12. Moleküler fizyoloji 23. Powerlab system 14. Powerlab system 25. Laboratuvar gereçleri 16. Laboratuvar gereçleri 27. Nörofizyoloji 18. Nörofizyoloji 2

9. Nörofizyoloji 310. Elektrofizyoloji 111. Elektrofizyoloji 212. Hayvan modelleri 113. Hayvan modelleri 214. Hayvan modelleri 3Kaynaklar

Öğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer,

ProjeToplam AKTS

2 2 2 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)Ara Sınav 1 30Ödev, Seminer 2 20Uygulama 1 10Final 1 40

Ek- 2. ECTS Information

YILDIRIM BEYAZIT UNIVERSITYINSTITUTE OF HEALTH SCIENCESDEPARTMENT OF PHYSIOLOGY2014-2015 ECTS INFORMATION

Course code: FIZ 705 Name of course: Current Applications in Physiology

Year/ Semester: AutumnProgram: Physiology DoctorateLanguage of instruction: TurkishCategory: ElectivePrerequisites: -Length of course: 3 hours per weekResponsible for course: Assistant Professor Dr. Zeynep Seçkin AkkılıkCourse objectives:

Course contents:Adapting new physiological laboratory technics, new developed laboratory device-equipments, computer and electronic devices to physiological studies

Learning outcomes: Learning new physiological technics and devicesWeekly Course Flow

Week Subjects

1. Laboratory equipments 12. Laboratory equipments 23. Animal models4. Animal models5. Animal models6. Powerlab system 17. Powerlab system 28. Molecular physiology 19. Molecular physiology 210. Electrophysiology 111. Electrophysiology 212. Neurophysiology 113. Neurophysiology 214. Neurophysiology 3References

Education and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project Assignment ECTS

2 2 2 8Evaluation Criteria: Number Rate(%)Midterm exam 1 30Assignment 2 20ProjectLaboratoryPractice 1 10Final exam 1 40

Ek- 1. AKTS Bilgi Formu

YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

FİZYOLOJİ ANABİLİM DALI2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU

Ders Kodu FİZ 706 Ders Adı Öğrenme ve Hafızanın Fizyolojik Temelleri

Yarıyıl GüzProgram FizyolojiDersin Dili TürkçeDersin Türü SeçmeliDersin Düzeyi DoktoraDersin Ön koşulları Temel fizyoloji, insan biyolojisi derslerini almış olmak

Ders Süresi Haftada 2 saat

Öğretim Eleman(lar)ı Doç. Dr. Sinan CananDersin Amacı Öğrenme ve hafızanın sinirsel temellerinin kavratılması

Ders İçeriği Öğrenme ve hafızanın sinirsel temelleri, sinaptik öğrenme modelleri, hafıza tipleri, öğrenme ve hafıza üzerine temel araştırma teknikleri, hafıza bozuklukları, öğrenme modelleri, konuyla ilgili güncel literatür bilgilerinin derlenmesi.

Dersin Öğrenme Çıktıları Öğrenme ve hafızanın sinirsel temellerinin öğrenilmesiHaftalık Ders Programı

Hafta Konular

1. Öğrenmenin psikolojisi2. Öğrenmenin temel nörobiyolojisi3. Episodik ve semantic öğrenme4. Beceri öğrenimi5. Duygusal öğrenme6. Ödül-ceza ve öğrenme7. Çalışma belleği8. İlişkisiz öğrenme9. Klasik koşullandırma10. Araçlı koşullandırma11. Duyular ve öğrenme

12. Yaşam boyu öğrenme13. Lisan öğrenimi14. Öğrenme ve hafıza nörobiyolojisinin felsefesiKaynaklar Gluck, Mark, Eduardo Mercado, and Catherine Myers. Learning and Memory: From Brain to

Behavior. New York, NY: Worth Publishers, 2007. ISBN: 9780716786542.Öğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer,

ProjeToplam AKTS

2 - 2 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)AraSınav 1 30Ödev, Seminer 2 30UygulamaFinal 1 40

Ek- 2. ECTS Information

YILDIRIM BEYAZIT UNIVERSITYINSTITUTE OF HEALTH SCIENCESDEPARTMENT OF PHYSIOLOGY2014-2015 ECTS INFORMATION

Course code: FIZ 706 Name of course: Physiological Basics of Learning and

Memory

Year/ Semester: AutumnProgram: Physiology DoctorateLanguage of instruction: TurkishCategory: ElectivePrerequisites: Taken basic physiology and human biology coursesLength of course: 2 hours per weekResponsible for course: Assoc. Prof. Dr. Sinan Canan

Course objectives: The aim of this course is comprehension of neurological basics of learning and memory

Course contents:

Neurological basics of learning and memory, synaptic learning models, types of memory, basic research methods on learning and memory, memory disorders, learning models, compilation of current literature information about this subject

Learning outcomes: Learning neurological basics of learning and memoryWeekly Course Flow

Week Subjects

1. Psychology of learning2. Basic neurobiology of learning3. Episodic and semantic learning4. Skill learning5. Emotional learning6. Reward-punishment and learning7. Working memory8. Non-associative learning9. Classical conditioning10. Instrumental conditioning11. Senses and learning12. Learning across life span13. Language learningReferences Gluck, Mark, Eduardo Mercado, and Catherine Myers. Learning and Memory: From Brain to

Behavior. New York, NY: Worth Publishers, 2007. ISBN: 9780716786542.Education and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project Assignment ECTS

2 - 2 8Evaluation Criteria: Number Rate(%)Midterm exam 1 30Assignment 2 30ProjectLaboratoryPracticeFinal exam 1 40

Ek- 1. AKTS Bilgi Formu

YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

FİZYOLOJİ ANABİLİM DALI2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU

Ders Kodu FİZ 707 Ders Adı Hücre ve Doku Kültürü Teknikleri

Yarıyıl BaharProgram FizyolojiDersin Dili TürkçeDersin Türü SeçmeliDersin Düzeyi DoktoraDersin Ön koşulları Yok

Ders Süresi Haftada 3 saat

Öğretim Eleman(lar)ı Doç. Dr. Sevil ÇaylıDersin Amacı Hücre ve doku kültürü ile ilgili temel bilgi ve

prensiplerin aktarılmasıdır.

Ders İçeriği Ders kapsamında, hücre ve doku kültürünün temel prensipleri, doku kültürü laboratuarının tasarlanması ve kullanılan özel cihaz ve malzemeler, doku kültürü laboratuarlarında güvenlik, doku kültürü laboratuarında çalışma prensipleri, kontaminasyon, sterilizasyon teknikleri, kültür besiyerleri ve çözeltiler, hücre ve doku kültürü yöntemleri, deney hayvanlarının bakımı ve uygulamalar, primer hücre kültürü, özel hücre hatlarının kültürü, hücre kültürü yöntemlerinin moleküler biyoloji ve rekombinant DNA teknolojisindeki uygulama alanları güncel literatür bilgisi ile birlikte yer alacak ve uygulamaları gerçekleştirilecektir.

Dersin Öğrenme Çıktıları Hücre kültürü tekniklerini uygulayabilmekHücre/Doku kültürü laboratuvarını kurabilmek ve çalışma koşullarını optimize edebilmekHücre kültürü laboratuvarlarında kullanılan besiyeri ve çözeltilerin özellikleri bilmekHücre kültürü tiplerinin ve uygulamalarını bilmek

Haftalık Ders Programı

Hafta Konular1. Hayvan doku kültürüne giriş2. Hayvan doku kültürü uygulamaları ile ilgili örnekler3. Primer hücre hatları4. Ölümsüz hücre hatları

5. Hücre kaynakları ve hücre bankaları6. Hücre kültürü laboratuvar şartları ve çalışma ortamının tasarlanması7. Kullanılan sarf malzemelerin seçimi8. Kullanılan besiyerleri ve diğer malzemelerin seçimi9. Ara sınav10. Kültür teknikleri: Hücre morfolojisi11. Hücre canlılığını belirleme yöntemleri12. Hücre ölümünün belirlenmesi13. Özelleşmiş 2D hücre kültürü14. Final sınavıKaynaklar Culture of Animal Cells: A Manual of Basic Technique R. Freshney

www.pubmed.comÖğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer,

ProjeToplam AKTS

2 2 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)Ara Sınav 1 40%Ödev, Seminer YokUygulama Haftada 2 saatFinal 1 60%

Ek- 2. ECTS Information

YILDIRIM BEYAZIT UNIVERSITYINSTITUTE OF HEALTH SCIENCESDEPARTMENT OF PHYSIOLOGY2014-2015 ECTS INFORMATION

Course code: FIZ 707 Name of course: Technics of cell and tissue culture

Year/ Semester: SpringProgram: Physiology DoctorateLanguage of instruction: TurkishCategory: ElectivePrerequisites: -Length of course: 3 hours per weekResponsible for course: Assoc. Prof. Dr. Sevil Çaylı

Course objectives: To learn basic knowledge and principles of cell and tissue culture

Course contents:

In course content, cell and tissue culture techniques and basic principles, tissue culture room design, specific devices and materials, safety rules in tissue culture laboratories, working conditions, contamination sources, sterilization and cleaning techniques, culture media and solutions, methods for cell culture, animal husbandry and care principles, primary cell culture methods, specific cell lines and their cultivation techniques, recent advances in molecular biology and recombinant DNA technology related to cell culture are going to be discussed with recent findings placed in literature.

Learning outcomes:

To be able to apply cell culture techniquesTo be able to design cell/tissue culture laboratory and working conditionsTo know properties of media and solutions that are used in cell culture laboratoriesTo have knowledge about types of cell culture and their applicationTo be able to continue cell culture studies by using biosafety rules

Weekly Course Flow

Week Subjects

1. Introduction to mammalian cell culture 2. Examples related to mammalian cell culture applications3. Primary cell lines4. Immortal cell line5. Cell sources and cell banks6. Laboratory conditions and to design working place7. Selection of supplies

8. Selection of medium and other chemicals9. Midterm10. Culture techniques: Cell morphology11. Techniques for the detection of cell viability12. Determination of cell death13. Specific 2D cell culture14. Final examReferences Culture of Animal Cells: A Manual of Basic Technique R. Freshney

www.pubmed.comEducation and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project Assignment ECTS2 2 8Evaluation Criteria: Number Rate(%)Midterm exam 1 40AssignmentProjectLaboratoryPractice 2 hours /WeekFinal exam 1 60