aula 3 etiologia parte b

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ETIOLOGIAClassificação e identificação

dos principais agentes etiológicos

Candidato: Milton Luiz da Paz Lima

Instituto Federal Goiano campus UrutaíCurso de AgronomiaDisciplina de Fitopatologia

Organograma da Apresentação

Introdução Desenvolvimento - Classificação e Identificação de:

- Fungos Fitopatogênicos- Bactérias Fitopatogênicas- Nematóides Fitopatogênicos- Vírus Fitopatogênicos

ConclusõesLiteratura consultada


2

Classificação - TaxonomiaÉ a ordenação das plantas em níveis hierárquicos, de acordo com as características apresentadas, de modo que cada nível reúna as características do superior.


3

Quando se denomina uma planta já descrita, está ocorrendo determinação das características comuns a outra já catalogada, está se fazendo uma identificação, enquanto que, quando se procura localizar uma planta ainda não conhecida, dentro de um sistema de classificação, está ocorrendo classificação

Identificação

Ferri et al. (1996)

INTRODUÇÃO

TaxonomiaÉ a ciência que se ocupa da classificação dos organismos vivos, utilizando um sistema uniforme que expressa, da forma mais fiel, o grau de semelhança entre eles.

Candidato: Milton Luiz da Paz Lima ([email protected])

4

TáxonsReino, Divisão, Classe

Ordem

Gênero e Espécie

Família

Isolados?, amostras?, estirpes?, variantes?

virus

Fungos, nematóides e bactérias

INTRODUÇÃO

Ferri et al. (1996)

Ecologia dos Agentes Patogênicos


5

§Fito = Planta; Patologia = Doença

Soença

Meio ambienteTemperatura

Umidade, luminosidade

Homem

Patógeno Phytophthora, Oidiopsis, Sclerotinea,

Plasmodiophora

Hospedeiro Café, feijão, batata, cana

§Doenças e as Relações Desarmônicas no Ecossistema;§Parasita vs Patógeno

INTRODUÇÃO

Amorin et al., 2011

Tamanho dos patógenos


6

INTRODUÇÃO

Agrios, 1997

Tipos de Patógenos


7Agrios, 1997

INTRODUÇÃO

Etiologia• Etiologia é uma palavra de origem grega, aetia

= causa + logos = estudo. • Estuda as causas das doenças de plantas e tem

como objetivo o estabelecimento de medidas corretas de controle.

• Patógeno é qualquer organismo capaz de causar doença infecciosa em plantas - fungos, bactérias, vírus, viróides, nematóides e protozoários.

• Patogenicidade é a capacidade que um patógeno possui, de associando-se ao hospedeiro, causar doença.

INTRODUÇÃO

CLASSIFICAÇÃO DOS PATÓGENOS• Parasitas obrigados - Biotróficos: são aqueles que vivem as

custas do tecido vivo do hospedeiro. Não são cultivados em meio de cultura. Ex: fungos causadores de míldios, oídios, ferrugens e carvões; vírus, viróides, nematóides e algumas bactérias.

• Saprófitas facultativos: são aqueles que vivem a maioria do tempo ou a maior parte de seu ciclo de vida como parasitas, mas em certas circunstâncias, podem sobreviver saprofiticamente sobre matéria orgânica morta. Podem ser cultivados em meio de cultura. Ex: fungos causadores de manchas foliares, como Alternaria spp., Colletotrichum spp. e Cercospora spp.

• Parasitas facultativos: são aqueles que normalmente se desenvolvem como saprófitas, mas que são capazes de passar parte, ou todo o seu ciclo de desenvolvimento como parasitas. São facilmente cultivados em meio de cultura. Ex: fungos como Rhizoctonia solani e Sclerotium rolfsii.

• • Parasitas acidentais: são aqueles organismos saprófitas que em determinadas condições (Ex.: planta com estresse) podem exercer o parasitismo. Ex: Pseudomonas fluorescens causando podridão em alface.

PARASITA OBRIGATÓRIO

SAPRÓFITAS FACULTATIVOS

PARASITAS FACULTATIVOS

PARASITAS Acidental

RESUMO

Postulados de Koch• 1. Associação constante patógeno-hospedeiro: um determinado

microrganismo deve estar presente em todas as plantas de uma mesma espécie que apresentam o mesmo sintoma. Em outras palavras, deve-se poder associar sempre um determinado sintoma a um patógeno particular.

• 2. Isolamento do patógeno: o organismo associado aos sintomas deve ser isolado da planta doente e multiplicado artificialmente.

• 3. Inoculação do patógeno e reprodução dos sintomas: a cultura pura do patógeno, obtida anteriormente, deve ser inoculada em plantas sadias da mesma espécie que apresentou os sintomas inicias da doença e provocar a mesma sintomatologia observada anteriormente.

• 4. Reisolamento do patógeno: o mesmo organismo deve ser isolado das plantas submetidas à inoculação artificial.

INTRODUÇÃO

Amorin et al., 2011

Designação dos patógenos• O nome genérico é escrito com inicial maiúscula e grifado. • O nome especifico é escrito com inicial minúscula e grifado. • Os nomes infraespecificos como: patovar (pv.), subespécie

(subsp.), variedade (var.) e forma specialis (f.sp.) também são escritos com inicial minúscula e não em itálico.

• O nome genérico deverá ser abreviado a partir da segunda citação em texto científico.

• O nome do autor ou autores que classificaram a espécie deve ser citado, toda vez que a mesma for escrita pela primeira vez, em qualquer texto científico, podendo ser abreviados.

• O termo spp. = várias espécies e sp. = espécie desconhecida. • Epiteto específico ou infraespecífico – podem se referir a

hospedeira de origem.

INTRODUÇÃO

Amorin et al., 2011

DENOMINAÇÃO DOS PATÓGENOS

• Colletotrichum gloeosporioides Penz. • Fusarium oxysporum f.sp. vasinfectum (Atk.) Snyder

& Hansen • Uromyces phaseoli var. typica Arth. • Erwinia carotovora subsp. atroseptica (van All) Dye • Xanthomonas campestris pv. campestris (Pammel)

Dowson • Cercospora sp. • Pseudomonas spp.

INTRODUÇÃO

Agente causal - Fungos• Aclorofilados• Talo eucariótico: a hifa é o talo vegetativo dos fungos. • Heterotrofismos: Todos os fungos sejam saprófitos ou

parasitos requerem carbono orgânico na sua nutrição como os animais.

• Absorção de nutriente: absorvidos a partir dos substratos em que crescem através das hifas (fagocitose – para fungos plasmodiais).

• formação de esporos (r. assexuada): unidades reprodutivas para produção em abundância de propágulos de disseminação.


15

INTRODUÇÃO

Importância dos Fungos


16

Podridão peduncular da berinjela: Stemphyllium botriosum

Hernia das CrucíferasPlasmodiophora brassicae

Requeima da batataPhytophthora infestans

Míldio da alfaceBremia lactucae

INTRODUÇÃO

Cladosporium sp.

Oidiopsis taurica

Stenphyllium sp.Phytophthora capsici


17Cylindrosporium mori Plasmopara viticola

INTRODUÇÃO

Importância dos Fungos

Agente causal - Nematóides§ Nemas=fio; oid=semelhante .§ Aquáticos que vivem em água doce, marinha

ou filmes d´água do solo;• Organismos eucariotos, multicelulares, não

segmentados, pseudocelomados, essencialmente aquáticos (água doce e salgada), em sua maioria microscópicos;

• A maioria é de vida livre alimentando-se de microrganismos sendo chamados de: Bactérias-BACTERIÓFAGO; Fungos-MICÓFAGO; Algas-ALGÍVOROS; Protozoários-PROTOZOÓFAGOS


18

INTRODUÇÃO

Importância dos Nematóides


19Bursaphelenchus cocophyllus

Bursaphelenchus xylophilus

INTRODUÇÃO

Agente causal - Bactérias§ Bactérias fitopatogênicas – baciliformes – gram

(-);§ 1600 spp. apenas 100 spp. fitopatogênicas;§ A morfologia bacteriana está diretamente

ligada a classificação. § A visualização bacteriana é feita em

microscópio óptico ou de varredura.§ As bactérias não apresentam movimento

amebóide, não fazem pinocitose nem fagocitose;


20

INTRODUÇÃO

Batata - Ralstonia solanacearumCandidato: Milton Luiz da Paz Lima

21

INTRODUÇÃO

Importância das bactérias

Agente causal - Virus§ São nucleoproteínas de ¼ a 1/10 menor do

que bactérias, com capacidade de causar doenças;

§ Não produzem esporos; substâncias patogênicas (toxinas e enzimas) o vírus não contém;

§ Seu tamanho é muito reduzido;§ Parasitas “exclusivamente” celulares-fora da

célula são inertes;§ Atacam animais-plantas-microrganismos;§ Morfologia –

Isodiamétricos/poliédricos/alongados;§ DNA ou RNA;


22

INTRODUÇÃO

Potato virus YPVY


23

Potato virus XPVY

INTRODUÇÃO

Objetivo • O ojetivo desta aula é apontar os métodos de

classificação e identificação dos principais agentes etiológicos de doenças de plantas – fungos, bactérias, virus e nematóides


24


DESENVOLVIMENTOClassificação e Identificação de

Fungos


25

Classificação e Identificação de Fungos

• Reino Protozoa [protozoários], Chromista [algas diatomáceas marrons, douradas e amarelo esverdeadas] e Fungi (Alexopoulos et al., 1996).

• Classificação baseada em critérios Morfologi cos.

• Diferenças nomenclaturais: teleo/anam.• ICBN – unificar os nomes - nome da fase

sexuada é o nome oficial da espécie;Candidato: Milton Luiz da Paz Lima

26Massola Jr. e Kruger (2011)

DESENVOLVIMENTO


• Ferramentas mais sensíveis a morfológica – técnicas moleculares – aplicação em casos em que os critérios não são claros;

• Fungos morfologicamente semelhantes – geneticamente diferentes (vice versa) – polêmica sobre critérios morfológicos!



DESENVOLVIMENTO

Utilizar critérios moleculares, Quando?

Sem dúvida?


28

Com dúvida?

CRITÉRIOS MORFOLÓGICOS

FERAMENTAS MOLECULARES

Massola Jr. e Kruger (2011)

DESENVOLVIMENTO


• KIRK et al. (2008) – Decisões sobre o comitê de fungos – International Code of Botanical Nomenclature – Congresso de Viena (2006).

• Principais grupos de fungos Fitopatogênicos– Reino Protozoa– Reino Chromista– Reino Fungi



DESENVOLVIMENTO

Taxonomia dos Fungos


30

Reinos Divisão/ Classes Ordem FamíliaReino Protozoa Classe Myxogastrea Classe Phytomysea Reino Chromista Classe Oomycetes Ordem Albuginales Familia Albuginaceae Ordem Pythiales Família Pythiaceae Ordem Peronosporales Família PeronosporaceaeReino Fungi Divisão Blastocladiomycota Divisão Chytridiomycota Divisão Zigomycota Ordem Mucorales Família Mucoraceae Família Choanephoraceae Divisão Ascomycota Ordem Taphrinales Ordem Eurotiales Ordem Microascales Ordem Ophiostomatales Ordem Xylariales Ordem Hypocreales Ordem Diaporthales Ordem Phyllachorales Ordem Helotiales Ordem Rhystismatales Ordem Capnodiales Ordem Botryosphaeriales Ordem Myriangiales Ordem Pleosporales Ordem Trichosphaeriales Ordem Erysiphales Ordem Glomerellaceae n/d Família Glomerellaceae n/d Família Magnaporthaceae n/d Família Plectosphaerellaceae Divisão Basidiomicota Classe Agaricomycetes Ordem Polyporales Ordem Agaricales Ordem Cantharellales Classe Pucciniales Classe Ustilaginomycetes Ordem Ustilaginales Classe Exobasidiomycetes Ordem Tilletiales Sclerotium ? Fungos Mitospóricos (Anamórficos) Grupo dos Hifomicetos Grupo dos Coelomicetos

Reinos, Divisões/ Classes/ordens/ familias de fungos de inportancia fitopatogênica


DESENVOLVIMENTO

Diversidade de espécies de fungos


31

Grupos Gêneros EspéciesReino Protozoa Acrasiomycota Dictyosteliomycota Myxomycota Myxomycetes Protosteliomycetes Plasmodiophoromycota

040474601416

12467196902945

Sub-total 1541Reino Chromista Hyphochytriomycota Labyrinthulomycota Oomycota

71395

2442694

Sub-total 760Reino Fungi Ascomycota Basidiomycota Basidiomycetes Teliomycetes Ustomycetes Chytridiomycota Zygomycota Zygomycetes Trichomycetes

325514284731676311217312540

32267222441385771341064793

1056867189

Sub-total 77622Fungos Mitospóricos 2547 14104Total de espécies conhecidas 94027

DESENVOLVIMENTO

Kirk et al. (2008)

Posicionamentos transitórios• Basidiomiceto vs ascomiceto:

– Sclerotium rolfsii – Athelia rolfsii (basidiomiceto);

– Sclerotium cepivorum – Stromatina cepivora (ascomiceto);


32

Paz L

ima,

200

4

Paz L

ima,

200

4

Paz L

ima,

200

4


DESENVOLVIMENTO

Associações entre hifomicetos e teleomorfos


33

Genero Teleomorfo Grupo TaxonômicoAspergillus sp. Emericella sp., Eurotium sp. Ordem EurotialesPenicillium sp. Eupenicillium sp. Talaromyces sp. Ordem EurotialesThielaviopsis sp. Ceratocystis sp. Ordem MicroascalesPesotum sp. = Graphium sp. Ophiostoma sp. Ordem OphiostomatalesPestalotia sp. Anphisphaeriaceae (vários) Ordem XylarialesFusarium sp. Haematonectria sp., Giberella sp. Ordem HypocrealesTubercularia sp. Nectria sp. Ordem HypocrealesCylindrocladium sp. Calonectria sp. Ordem HypocrealesMyrothecium sp. Incerto Ordem HypocrealesPhomopsis sp. Diaporthe sp. Ordem DiaporthalesStenocarpella sp. incerto Ordem DiaporthalesMonilia sp. Monilinia sp. Ordem HelotialesBotrytis sp. Botryotinia sp. Ordem HelotialesMarssonina sp. Diplocarpon sp. Ordem HelotialesCercospora sp. Mycosphaerella sp. Ordem CapnodialesCercosporella sp. Mycosphaerella sp. Ordem CapnodialesCercosporidium sp. Mycosphaerella sp. Ordem CapnodialesPseudocercospora sp. Mycosphaerella sp. Ordem CapnodialesRamularia sp. Mycosphaerella sp. Ordem CapnodialesAsperisporium sp. Mycosphaerella sp. Ordem CapnodialesSeptoria sp. Mycosphaerella sp. Ordem CapnodialesCladosporium sp. Davidiella sp. Ordem CapnodialesLasiodiplodia sp. Botryosphaeria sp. Ordem BotryosphaerialesPhyllosticta sp. Guignardia sp. Ordem BotryosphaerialesSphaceloma sp. Elsinoe sp. Ordem MyriangialesSpilocaea sp.=Fusicladium sp. Venturia sp. Ordem PleosporalesBipolaris sp. Cochliobolus sp. Ordem PleosporalesDrechslera sp. Cochliobolus sp. Ordem PleosporalesCurvularia sp. Cochliobolus sp. Ordem PleosporalesStemphylium sp. Pleospora sp. Ordem PleosporalesAlternaria sp. Lewia sp. Ordem PleosporalesPhoma sp. Didymella sp. Ordem PleosporalesAscochyta sp. Didymella sp. Ordem PleosporalesNigrospora sp. Khuskia sp. Ordem Trichosphaeriales

Oidium sp.

Erysiphe sp., Uncinula sp., Microsphaera sp., Podosphaera sp., Sphaerotheca sp. Ordem Erysyphales

Oidiopsis sp. Leveillula sp. Ordem ErysyphalesOvulariopsis sp. Phyllactinia sp. Ordem Erysyphales

DESENVOLVIMENTO


34

DESENVOLVIMENTO

Exemplos de estruturas essenciais

Paz L

ima,

200

4

Paz L

ima,

200

4

Paz L

ima,

200

4


35Pa

z Lim

a, 2

004

Paz L

ima,

200

4Pa

z Lim

a, 2

004

Paz L

ima,

200

4Pa

z Lim

a, 2

004

Exemplos de Estruturas essenciaisDESENVOLVIMENTO

Hemileia vastatrix


36

Puccinia emiliae

Curvularia brachyspora

Phytophthora capsici

Colletotrichum gloeosporioidesFusarium sp.

Exemplos de Estruturas essenciais

DESENVOLVIMENTO



Nematóides.


37

Critérios para identificação de nematóides

• Envolvem critérios morfológicos e morfométricos do corpo.

• Reino Animália, Filo Nematoda, Classe Inglis e Enoplea Inglis (Ferraz e Monteiro, 2011).

• Variação morfológica para espécies com dimorfismo sexual.


38

DESENVOLVIMENTO

atenuada

cauda

Bulbo do estilete

DESENVOLVIMENTO


40

Dim

orfis

mo

sexu

al

DESENVOLVIMENTO

Tylenchulus semipenetransRotilenchulus

reniformis

Heterodera spp.

Meloidogyne spp.


41

DESENVOLVIMENTO

DESENVOLVIMENTO


43

DESENVOLVIMENTO

Tipos de Estilete: A. Estoma cilíndrico-nematóide de vida livre; B. ESTOMATOSTÍLIO DE FITONEMATÓIDE; c. Odontoestilete de

nematóide predador.

DESENVOLVIMENTO

Tipos de Estilete

DESENVOLVIMENTO

Ornamentações da Cutícula

DESENVOLVIMENTO

Orifícios da Região Perineal de uma fêmea de Meloidogyne sp.

Fasmídio

DESENVOLVIMENTO

IMPRESSÕES PERINEAISM. incognita M. javanica

M. arenaria M. hapla

DESENVOLVIMENTO

Fêmea de Meloidogyne sp.

Metacorpo

Póscorpo

Estomastostílio

Procorpo

ES

ÔFA

GO

Fêmea obesa

DESENVOLVIMENTO

Fêmea de Meloidogyne sp.

Região perineal

DESENVOLVIMENTO

Nematóide das galhas – Meloidogyne.

Impressão perineal

Célula Gigante


51

DESENVOLVIMENTO

Taxonomia Reino Animalia-Filo Nematoda

CLASSE ADENOPHOREA

Sub classe Chromadoria

Sub classe Enoplia

Ordem Dorilaimida Superfamília Dorylaimoidea Família Longidoridae Ordem Triplonchida Subordem diphtherophorina Família Diphtherophoroidea Família Tricodoridea

CLASSE SECERNENTEA

Sub classe Spiruria

Sub classe Rhabditia

Sub classe Diplogasteria

Subordem Tylenchina

Super Família Tylenchoidea

Super Família Criconematoidea

Família Tylenchidae Família Anguinidae Família Dolichoridae Família Belonolaimidae Família Pratylenchidae Família Hoplolaimidae Família Heteroderidae

Família Criconematidae Família Tylenchulidae

Blum et al., 2007

DESENVOLVIMENTO



Bactérias


53

Código de Nomenclatura de Bactérias - ICNB

• Dá o Nome científico para a bactérias.- • Regido pelo Comite Internacional de Sistemática de

Procariotos (ICSP).• Originalmente o Código botânico manejava-se em

conjunto com Bactéria, até 1975. • Um código anterior de nomenclatura bacteriológica foi

aprovado no 4º Congresso Internacional de Microbiología em 1947, mas foi descartado mais tarde.

• A classificação mais aceitada é a elaborada pelo escritório editorial do Manual Bergey de Bacteriología Sistémica (Bergey's Manual of Systematic Bacteriology).

DESENVOLVIMENTO

http://pt.wikilingue.com/es/Bact%C3%A9ria

Discriminação de diversas técnicas empregadas na taxonomia polifásica (adaptada de Vandamme et al., 1996).

Família

Espé cie

Linhage m

Gê ne ro

SupraFamília

Té cnicaRFLP

LFRFA

RIBOTYPING

AFLP, AP-PCR, A

RDRA, DAF, R

APD

PHAGE AND BACTERIOCIN TYPING

SEROLOGY

MLEE, MLST

SDS - PAGE

DNA-DNA HYBRIDIZATIO

NS

% G+C

tDNA-PCR

POLYAMINES, Q

UINONES

FAME

CELL WALL STRUCTURE

PHENOTYPIC ANALYSIS

DNA-rRNA HYBRIDIZATIO

NS

rRNA SEQUENCING

DNA PROBES, MICROARRAYS

DNA SEQUENCING

Família

Espé cie

Linhage m

Gê ne ro

SupraFamília

Té cnicaRFLP

LFRFA

RIBOTYPING

AFLP, AP-PCR, A

RDRA, DAF, R

APD

PHAGE AND BACTERIOCIN TYPING

SEROLOGY

MLEE, MLST

SDS - PAGE

DNA-DNA HYBRIDIZATIO

NS

% G+C

tDNA-PCR

POLYAMINES, Q

UINONES

FAME

CELL WALL STRUCTURE

PHENOTYPIC ANALYSIS

DNA-rRNA HYBRIDIZATIO

NS

rRNA SEQUENCING

DNA PROBES, MICROARRAYS

DNA SEQUENCING

Classificação e Identificação de Bactérias

• Classificação baseada em critérios bioquímicos e biológicos

• Criaçõo dos postilados de Koch• Relações com as plantas: epifitismos (filoplano

ou rizosfera), parasitismo (endo) e simbiose (endo);

• Colonizaçao dos espaços intercelulares – ambiente pobre em nutrientes


56

DESENVOLVIMENTO

Classificação e identificação• Nomenclatura binomial – gênero e espécie• Podem ser classificadas – subespécies• Niveis infra-específicos: Patovares, raças e

biótipos (biovar, lisotipo e serotipo).• Hospedeiros específicos

(variedades/genótipos) – patovares e raças.• Ex. Xanthomonas campestris pv. malvacearum; X. campestris

pv. glycines; X. campestris pv. vesicatoria


57

DESENVOLVIMENTO

Classificações infraespecíficas

Biótipos


58

Patovares

Raça

Bactérias da mesma espécie

Características bioquímicas ou fisiológicas

Reação diferencial em cultivares diferenc.

Lisotipo SorotiposLise por

bacteriófagosReaçoes perante antissoros específicos.

DESENVOLVIMENTO

CRITÉRIOS DE IDENTIFICAÇÃO DE BACTÉRIAS


59

MORFOLÓGICOS COLORAÇÃO

DIFERENCIALFISIOLÓGICO

SPATOGÊNICOS (Biológicas) BIOQUÍMICO

S

SOROLÓGICOS

GENÉTICOSGENÉTICOS

DESENVOLVIMENTO

Evolução do número de táxons

Tipos de Colorações

Reação GramCresc. Anaeróbico

Cresc. Aeróbico

Colôn. Amar.YDC

Colôn.Mucói.YDCPigm.Fluores KB

Pigm.NãoFluoDifus.UreaseOxidaseCresc. 40 o.C

Mais 4 flag. peritríqCresc.D1M ágarForm EsporosMicélio Aéreo

Utilização de Aspar.

Teste de Hipersensibilidade

Taxonomia• Reino Procariotae:• Divisão Gracilicutes: apresentam parede

celular, gram negativa.• Divisão Firmicutes: bactérias com parede

celular, gram positiva;• Divisão Tenericutes : não possuem parede

celular.


65

Taxonomia Bacteriana

Divisão Classe Atributo Família Gênero Gracilicutes Proteobacteria Não

Fotossintética Enterobacteriaceae Enterobacter

Erwinia Pantoea Serratia

Pseudomonadaceae Acidovorax Burkholderia Pseudomonas Ralstonia Rhizobacter Rhizomonas Xanthomonas Xylophilus

Rhizobacteriaceae Agrobacterium Não Definido Xillela


66

Erwinia amylovora

Erwinia psidii

Erwinia sp.


67

Acidovorax avenae


68

Burkholderia (Pseudomonas) cepacia

Pseudomonas syringae subsp. savastanoi pv. oleae


69

Xanthomonas campestris pv. fragariae

Ralstonia solanacearum


70

Agrobacterium tumefasciens


71

Xylella fastidiosa

Firmicutes Firmibacteria Simples G(+) Bacillus Clostridium

Tallobacteria Ramificado G(+)

Arthrobacter Clavibacter Curtobacterium Nocardia Rathayibacter rodococcus Streptomyces

Tenericutes Mollicutes Procarioto sem parede

Spiroplasmataceae Spiroplasma

Afiliação incorreta Mycoplasma-like organism

Taxonomia Bacteriana

Divisão Classe Atributo Família Gênero Gracilicutes Proteobacteria Não

Fotossintética Enterobacteriaceae Enterobacter

Erwinia Pantoea Serratia

Pseudomonadaceae Acidovorax Burkholderia Pseudomonas Ralstonia Rhizobacter Rhizomonas Xanthomonas Xylophilus

Rhizobacteriaceae Agrobacterium Não Definido Xillela


72


Classificação e Identificação de Virus


73


74

Morfologia e Composiçao de alguns virus de plantas


75von Regenmortell et al. 2000

Exemplos de alguns critérios ICTV


76


77

Propriedades para identificação de vírus

• Morfologia: Tamanho, forma e envelope• Físico químicas: massa molecular e densidade• Genoma: tipo de ácido nucléico;

segmentação, sequência.• Macromoléculas: proteínas e lipídios


78

Genoma e Replicação

• Organização do genoma• Estratégias de replicação• Estratégias de expressão

• Sítios de acumulação de proteinas virais• Citopatologia e formação de corpos de

inclusão.


79

Propriedades antigênicas

Relacionamento sorológico


80

Propriedades Biológicas• Transmissão

• Vetor• Gama de hospedeiros

Critérios Taxonômicos importantes

A. Organismo hospedeiros


81

Infectam eucariotos e procariotos. Ex, Bunyaviridade, Reoviridade e Rabdoviridae (animais e plantas)

B. Morfologia da Partícula

Simetria do capsídio; presença ou não do envelope

C. Tipo de Genoma

DNA ou RNA; ds ou ss; mono ou bissegmentado;

Categorias Taxonômicas de acordo com ICTV


82

30.000 a 40.000 isolados de vírus de bactérias, plantas e animais

Regras de Nomenclatura• Todos os organismo é

Binomial:– Xanthomonas campestris– Xylela fastidiosa– Meloidogyne incognita– Xiphinema index– Alternaria solani

83

• Virus:• Inglês• Polinômios• Nome da hospedeira

Hospedeira – Sintomas - Virus

TomatoCucumbe

rLectuceBeansCitrus

Yellow leaf curlmosaicmosaicGolden mosaictristeza

+

VirusVirusVirusVirusvirus

+

Exemplos de espécies de Virus• Cucumber mosaic virus –

CMV• Tomato chlorotic mottle

virus – ToCMoV• Potato virus Y (PVY)• Tomato yellow leaf curl

virus (TYLCV)• Tomato spotted wilt virus

(TSWV)Candidato: Milton Luiz da Paz Lima ([email protected])

84

Família: BunyaviridaeGênero: TospovirusEspécie: Tomato spotted wilt virusAcrônimo: TSWV

Diagrama Famílias e gêneros de virus e viróides de plantas

85Candidato: Milton Luiz da Paz Lima ([email protected])

Diagrama Famílias e gêneros de virus e viróides de plantas


Considerações Finais• Através do apresentado pode-se

compreender que o sistema de classificaçao dos agentes fitopatogênicos seguem a codigos diferentes, contudo a regra binomial é válida para fungos, bactérias e nematóides, restando um sitema polinomial para identificaçao de virus.

• Quanto maior o tamanho e a variaçao morfológica entre os indivíduos maior a sustentaçao dos critérios morfológicos de identifiacão.

• A identificação é a premissa essencial para traçar medidas de controle.


87

Literatura Consultada• Nematóide: FERRAZ, L.C.C.B., MONTEIRO, A.R.

Nematóides. In: AMORIN, L., REZENDE, J.A.M.,, BERGAMIN FILHO, A. Manual de Fitopatologia – princípios e conceitos. Editora Ceres, São Paulo, SP, 2011.

• Fungos: MASSOLA JR, N.S. E KRUGER, T.L. Fungos Fitopatogênicos. In: AMORIN, L., REZENDE, J.A.M.,, BERGAMIN FILHO, A. Manual de Fitopatologia – princípios e conceitos. Editora Ceres, São Paulo, SP, 2011.

• Virus: REZENDE, J.A.M., KITAJIMA, E.W. Virus e viróides. In: AMORIN, L., REZENDE, J.A.M.,, BERGAMIN FILHO, A. Manual de Fitopatologia – princípios e conceitos. Editora Ceres, São Paulo, SP, 2011.

• Bactérias: BEDENDO, I.P. Bactérias fitopatogênicas. In: AMORIN, L., REZENDE, J.A.M.,, BERGAMIN FILHO, A. Manual de Fitopatologia – princípios e conceitos. Editora Ceres, São Paulo, SP, 2011.

• KIRK, P.M., CANNON, P.F., MINTER, D.W., STALPERS, J.A. Dictionary of Fungi Ainsworth & Bisby's. CABI Euroe - UK, 2008.

• ICZN International Comission on Zoological Nomenclature. Disponível em:< http://www.nhm.ac.uk/hosted-sites/iczn/code/>, acessado em 08 de março de 2012.

• IF Index Fungorun. Disponível em:< http://www.speciesfungorum.org/Names/Names.asp>, acessado em 8 de março de 2012.

• ICTV International Comitee os taxonomy of vírus. Disponivel em:< http://ictvonline.org/virusTaxonomy.asp?version=2009&bhcp=1>, acessado em 8 de março de 2012.

• ISPPWEB Names of Plant Pathogenic Bacteria, 1864-2004. Disponível em:< http://www.isppweb.org/names_bacterial_rath2005.asp>, acessado em março de 2012.


88

http://www.nhm.ac.uk/hosted-sites/iczn/code/

http://www.speciesfungorum.org/Names/Names.asp

http://ictvonline.org/virusTaxonomy.asp?version=2009&bhcp=1

http://www.isppweb.org/names_bacterial_rath2005.asp

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aula 3 etiologia parte b

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