aspecte de geneticĂ funcŢionalĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 m.pdf ·...

60
ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂ LA PLANTE Maria DUCA profesor universitar, academician organite celule ţesuturi organe caractere proteine metabiliţi ARN ADN Citogeneză Transcriere Translare Funcţie Organogeneză Histogeneză Autoreglare Diferenţierea celulară Replicare Autoasamblare Processing

Upload: others

Post on 30-Jan-2020

2 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂ

LA PLANTE

Maria DUCA

profesor universitar, academician

organite celule ţesuturi organe caractere proteine metabiliţi ARN ADN

Citogeneză Transcriere

Translare

Funcţie

Organogeneză

Histogeneză

Autoreglare

Diferenţierea

celulară

Replicare

Autoasamblare

Processing

Page 2: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

UNIVERSITATEA

ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A

MOLDOVEI

Organizat în baza Hotărârei CSŞDT

nr. 38 din 26.03.2009

Acreditat în baza Hotărârei Comisiei de acreditare a CNAA

nr. AC-2/3 din 24 martie 2011

GENOMICĂ FUNCŢIONALĂ ŞI BIOINFORMATICĂ

CENTRUL UNIVERSITAR

DE CERCETARE ȘI FORMARE PROFESIONALĂ

BIOLOGIE MOLECULARĂ

Page 3: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

52% cu vârsta

până la

35 ani

72%

în formare

Genomică Bioinformatică

14,5 unităţi

Proteomică

POTENŢIALUL UMAN 2016

doctori

habilitați

doctori în

științe

doctoranzi studenți,

masteranzi

alte

categorii

Page 4: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

1. Port Angela “Factori şi procese de semnalizare retro- şi anterogradă la floarea

- soarelui”

2. Abdușa Daniela “Identificarea și evaluarea unor gene potențial implicate în

bolile cardiovasculare.”

3. Acciu Adriana “Variabilitatea genetico-moleculară și distribuția rasial-

geografică a populațiilor de Orobanche cumana Wallr. din Republica Moldova ”

4. Nechifor Victoria “Acţiunea AG3 asupra microsporogenezei la floarea-

soarelui”

5. Mutu Ana “Diversitatea structurală și funcțională la Origanum”

6. Tabără Olesea “Estimarea modificărilor fiziologice și genetico-moleculare ale

răspunsului defensiv în sistemul gazdă-parazit (Helianthus annuus L. -

Orobanche cumana Wallr.) ”

1. Șestacova Tatiana “Controlul genetico-molecular al rezistenţei florii-soarelui la

mana (Plasmopara halstedii F. Berl et de Toni)” 2015

2. Martea Rodica “Variabilitatea genetico-moleculară la genotipurile de Salvia

sclarea L.” 2016

TEZE ÎN CURS DE REALIZARE

T E Z E S U S Ț I N U T E

Page 5: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

RESURSE FINANCIARE, 2016

Alocaţii BUGETARE – 1154,6 mii lei cercetări fundamentale 75%

Alocaţii EXTRABUGETARE – 380,4 mii lei 135, 0 – proiecte bilaterale

150,0 – grant internațional

95,4 – venituri colectate

25%

Page 6: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

instituţional

bilateral,

moldo-român

CERCETĂRI FUNDAMENTALE

CERCETĂRI APLICATIVE

1254,6 mii lei

60,0 mii lei

75,0 mii lei

Direcția strategică: Biotehnologie

15.817.05.03F. Rezistența florii – soarelui (Helianthus

annuus L.) la lupoaie (Orobanche cumana Wallr.):

mecanisme genetico-moleculare și fiziologice Conducător științific: acad. Duca Maria

Direcția strategică: Biotehnologie

16.80013.5107.20/Ro. Evaluarea unor hibrizi de floarea

soarelui, privind rezistența la stresul hidric și termic, în

Romania și Republica Moldova Conducător științific: acad. Duca Maria

Direcția strategică: Sănătate şi biomedicină

15.820.1804.10/B. Screening-ul proteinelor alergene, prin

metode proteomice și genomice, în soiurile de mere create

în Belarus și Republica Moldova Conducător științific: dr. Port Angela

bilateral,

moldo-belorus

PROIECTE DE CERCETARE REALIZATE ÎN 2016

Page 7: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

7

GENOMICA FUNCTIONALĂ MULTIDISCIPLINARĂ PENTRU

PROCESE BIOLOGICE DE BAZĂ

BIOINFORMATICA

RAPD-PCR

MARKERI SSR

PCR

RT-PCR

ELECTRFOREZA PROTEINELOR

ANALIZĂ HIBRODOLOGICĂ

ANALIZA MORFOFENOTIPICĂ

BIOCHIMIE

GENETICĂ MOLECULARĂ

GENETICĂ CLASICĂ

FIZIOLOGIE VEGETALĂ

IDENTIFICAREA GENELOR

INTERACŢIUNEA GENELOR

EXPRESIA GENELOR

P R O T E O M I C A

M E T A B O L O M I C A

CARACTER AGRONOMIC

G

E

N

O

M

I

C

A

Page 8: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

Conexiuni de semnalizare la

nivelul FT

Conexiuni de semnalizare

la nivelul protein-kinazelor

ASPECT

FUNDAMENTAL

ASPECT

APLICATIV

METABOLISM

Nucleu Citoplasmă

FT

FENOTIP

Rezistenţă, compoziţie biochimică şi dezvoltare

modificată

Ameliorarea caracterelor

cantitative şi calitative

Proteine

FUNCŢIE

Factori de creştere,

stres biotic şi abiotic

Procese redox,

fosforilare, transport etc.

METODOLOGIA CERCETĂRILOR

Page 9: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

9

Iraida Ciobanu

Floarea-soarelui

Page 10: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

Audieri parlamentare, februarie 2010 ©

10 SUNFLOWER CULTIVATION IN RM

First documentation about sunflower in RM. 1845

First evidence of oil production from sunflower seeds 1867

RM place regarding world sunflower seeds production.

19th

RM place regarding world sunflower oil export.

17th

Total agricultural land 65%

Place after wheat and corn 3th

Page 11: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

+AG3

Fenotipul plantelor fertile , cu androsterilitate citoplasmatică şi androsterilitate indusă de giberelină

Sistemul genetic ASC-Rf și ASI-

AG3 SISTEME GENETICE MODEL

ASC-Rf și ASI-AG3

Page 12: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

SISTEMUL M O D E L ASC – Rf

>>>> 11-kb-inversion >>>>

atpA orfH873 orfH708 cob

F

5-kb-insertion <<<< 11-kb-inversion <<<<

atpA

orfH873

3` orfH708

cob

S

orfH522

Rf – Gena nucleară reastauratoare

de androfertilitate

în genotipurile cu ASC.

La floarea-soarelui genele restauratoare

au fost identificate în H. petiolaris Nutt.

de către M. L. Kinman în 1970.

Ulterior ele au fost descoperite şi în alte

specii din flora spontană.

Page 13: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

ASC

Androsterile A.V. Anaschenco, 1972 Androfertile

G I B E R E L I N E

Androfertile J.N.R. Kasembe, 1969

S I S T E M U L M O D E L ASC-ASI

GA3

Sterilă Fertilă

0

2

4

6

8

10

12

Cotyledons First leaves Blossoming Active growth Flowering

IAA/GA3 F1 MB514 MB514 ASC RW637 Rf

Page 14: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

14

IDENTIFICAREA GENELOR ASC

0,5_

0,3_

321pb

B

M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13

C

321pb A

M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16

321pb

321pb

M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11

A. 1-14 – forma ♀; 15 - Xenia F1; 16 – forma ♂;

B. 1-11 – forma ♀; 12 - Drofa F1; 13 – forma ♂;

C. 1-9 - forma ♀; 10 - Valentino F1; 11 - forma ♂

• A FOST IDENTIFICATĂ GENA ANDROSTERILITĂŢII

• METODA DE DETERMINARE A GRADULUI DE STERILITATE

Page 15: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

15

IDENTIFICAREA UNUI NOU CADRU DE

CITIRE LA APLICAREA EXOGENĂ A GIBERELINELOR

M 1 2 3 1 2 3 M

1 - SW501

2 – SW501ASC

3 – Sambred

1 2 3 1 2 3

+GA3 -GA3 +GA3 -GA3

321 400 800

Gena orf H 522 la linia SW501 ASC cu primerul sens

CTNGGGGGTGGGTGTGCAACCCTCACGCAAGGGACGGATCCCGCGCTCGGGCTAAAATTTCAAGAACGAGTTGCCGG

AGTAAACTCACGGCTGCGGTTGCAGTGTCCTTAGACACAGGGACTTTCTTTCTATTTGGGTCATCGCCGGATCCACCA

GGGAGGGGGAGAATGCTTTGAGCATTTGGACCAGAAATACTTCGGCCTTTATAGGGCGTGATCTGTTCCATAAACACG

GAACAGGCTACTAATATCAAAAAAATAAAAAGACAGAAAAAGAGGAGTGCGCCACACGTCGNAAAGGCNTCNCCNCTG

CNATTCTGGA

Gena orf H 522 la linia SW501 ASC cu primerul antisens

NGGNNNTATNTNAACAGATGCNTGACTNGNTAAATTANCANTATNTANACANGTTCGTANCTGGTTTATGCGCTTTTNT

NCTTGANGGCAGTCNCCTCCCCCTNCCTGGGTGGATCCGGCGATGACCCAAATAGAAAGAAAGTCCCTGTGTCTAAGG

ACACTGCAACCGCAGCCGTGAGTTTACTCCGGCAACTCGTTCTTGAAATTTTANCCCGAGCGCGGGATCCGTCCTTGC

GTGAGGGTTTGCACAACCCAACCACCCAAGCGTGGAATAGGGCCATCACCACTGCCATTCAAGATCCGGCAACTCGTT

CTTGAAATTTTAGCCCGAGCGCGGGATCCGTCCTTGCGTGAGGGTTTGCACAACCCAACCACCCAAGCGTGGAATAGG

GCCATCACCACTGCCATTCAAGA

Gena orf H 522 la linia SW501 ASI cu primerul sens

CTNNCGTGGGGTGGNTGTGCAACCCTCAGGCGAGGGACGGATCCCGCGCGTCGGGCNAAAATTTCANCCANTTNAGT

TGNCGGAGNAAACTCANGGCTGNGGTTGNNGATGCCNTTTANACACAGGGACTTTCTTTCTATTTGGGTCATCGCCGG

ATCCACCAGGGAGGGGGAGAATGCTTTGAGCNTTTGGACCANAAATACTTCGGCCTTTATAGGGCGTGATCTGTTCCA

TAAACACGGAACAGGCTACTAATATCAAAAAAATAAAAAGACCGAAAAAGAGAGTGCGCCACAAGTNGAAAAGGCNTA

ACCANAAGAATTGTGNNAAANAAAGTGAATTTNTCCNGTTNAGGNATNTTGATCANAGAATAANAGGATNTNCCCCCCC

NNCNCAAAAAAAAAGGGCGCCCANAACAANGTNAATCGNCTCANNGTNNCNCAANNCTTTTTTGGGNGGGGGGGAACC

ATNTCCNC

Gena orf H 522 la linia SW501 ASI cu primerul antisens

NTTTGATAGNGCCTGTTCGTGTTATGGAACAGATCACGCCCTATAAAGGCCGAAGTATTTCTGGTCCAAATGCTCAA

AGCATTCTCCCCCTCCCTGGTGGATCCGGCGATGACCCAAATAGAAAGAAAGTCCCTGTGTCTAAGGACACTGCAAC

CGCAGCCGTGAGTTTACTCCGGCAACTCGTTCTTGAAATTTTAGCCCGAGCGCGGGATCCGTCCTTGCGTGAGGGTT

TGCACAACCCAACCACCCAAGCGTGGAATAGGGCCATCACCACTGCCATTCAAGAAA

GIBERELINELELE

APLICATE EXOGEN

INDUC SINTEZA

TRANSCRIPŢILOR

IDENTICI CELOR

IMPLICAŢI ÎN

ANDROSTERILITATEA

CITOPLASMATICĂ

Page 16: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

16

SEGREGAREA MOLECULARĂ A GENELOR Rf1 ÎN ASC PET 1

pb

-207 -165

-101

Produsele de digestie enzimatică la genotipul Drofa F2 M- marker molecular; ♀- rf1rf1 ; ♂- Rf1Rf1; F- Rf1rf1

M F F F ♂ ♂ ♂ F F ♂ F ♀ ♀ F F F ♀ F

Kb

0,5–

0,3_

0,2_

0,1 -

M F F ♀ ♂ F ♀ ♂ ♀ ♀ F F ♀ F ♀ F ♂ ♀

Kb

0,5–

0,3_

0,2_

0,1 -

pb

-207 -165

-101

METODA DE

DETERMINARE

A GRADULUI DE

HIBRIDARE

Electroforeza produsului de amplificare cu

primerul H 13 la liniile materne (A), paterne (B),

formele hibride F1 (C)

308 pb

308 pb

308 pb

A

B

C

Page 17: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

17

Indexul liniei Generaţie

Segregare

fertile : sterile X2 Numărul

de gene

Tip

de interacţiune

Număr

de

familii real teoretic

SI 3376-3 F1

F2

FB

57:64

31:10

125:18

1:1

3.1

1:1

0,52

0,02

1,12

1 - 11

SI 2986-2 F1

FB

F2

78:0

45:15

30:5

-

3:1

15.1

-

0:00

2,98

2 Polimerie

necumulativă

12

VIR 199 F1

F2

FB

80:0

19:18

13:30

-

9:7

1:3

-

0,23

0,60

2 Interacţiune

complementară

4

K 2288-287 F1

FB

F2

65:0

13:24:17

26:18:3X

-

1:2:2

9:6:1

-

1,09

0,36

2 Polimerie

cumulativă

8

VIR 160-352 F1 62:8 7:1 0,06 3 Polimerie

necumulativă

3

X2 0,05 = 3,84

RESTAURAREA ANDROFERTILITĂŢII LA HIBRIZII

DE FLOAREA-SOARELUI PE BAZĂ DE ASC

Page 18: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

18

MOŞTENIREA ŞI INTERACŢIUNEA GENELOR NUCLEARE Rf

Rf1 - Horn R., 2002

Rf2 - Horn R., 2003

Rf3 - Jan C.C., 2007

Rf4 - Feng J., 2008

Page 19: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

VIR 199-1

RfPRfPrf1rf1

SL 2986-2

rfPrfPRf1Rf1

F1

RfPrfPRf1rf1

X

X X

X

F2

100% FERTILE

ASCP ASC1

(Fa)

1 fertile : 1 sterile

RfPrfPrf1rf1 rfPrfPRf1rf1

RfPrfPrf1rf1 rfPrfPrf1rf1

(Fa)

3 fertile : 1 sterile

RfPrfPRf1rf1 rfPrfPRf1rf1

RfPrfPrf1rf1

rfPrfPRf1rf1

IDENTIFICAREA GENEI Rfl în ASCl

A FOST IDENTIFICATĂ O GENĂ NOUĂ Rf l

Page 20: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

X X

F1

ASC1

RfprfpRf1rf1

ASCp ASC1

Fa 33:35

1 : 1

1 RfprfpRf1rf1 1rfprfpRf1rf1

1 Rfprfprf1rf1 1rfprfprf1rf1

Fa 32:10

3 : 1

1 RfprfpRf1rf1

1 Rfprfprf1rf1

1 rfprfpRf1rf1 1rfprfprf1rf1

X

F2

44:5

15 : 1

9 Rfp- Rf1- 1rfprfprf1rf1

3 Rfp- rf1rf1

3 rfprfpRf1-

A1813

ASC1

VIR200-328

RfpRfpRf1Rf1

X

IDENTIFICAREA ŞI TIPIZAREA SURSELOR DE ASC

Page 21: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

21

Eleonora Romanescu

Casa bătrânească, 1978

Page 22: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

? REORGANIZEAZĂ GENOMUL

MITOCONDRIAL CONTRIBUIND

LA APARIŢIA UNUI

NOU CADRU DE CITIRE

ACTIVEAZĂ O ZONĂ

REARANJATĂ, DEJA

EXISTENTĂ ÎN

GENOMUL MITOCONDRIAL

321

+GA3 -GA3

>>>> 11-kb-inversion >>>>

atpA orfH873 orfH708 cob

F

5-kb-insertion <<<< 11-kb-inversion <<<<

atpA orfH873 3` orfH708 cob

S

orfH522

0

20

40

60

80

100

120

0.1

1

0.4

2

0.7

4

1.0

6

1.3

8

1.6

9

2.0

1

2.3

3

2.6

6

2.9

8

3.3

1

3.6

3

3.9

5

4.2

4.5

8

4.9

RF

Heig

ht

Citoplasmic fraction Mitochondrial fraction

TRANSDUCEREA SEMNALELOR DE AG3

Page 23: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

NIVELUL DE EXPRESIE A GENEI orf H522

LA DIVERSE LINII IZOGENE

GA3 induce expresia genei orfH522

asociată cu ASC la plantele liniei

fertile, fapt ce demonstrează

similaritatea funcțională la nivel

molecular între ASC și ASI-GA3

Page 24: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

codul GSE

denumirea GSE

codul GPL

denumirea GPL

sumarul experienţei

referinţe bibliografice

cuvinte cheie

codul GSM

numele GSM

sumarul GSM

GEO

Analiza

seturilor de

date

BD

Extragerea

seturilor

de date

Stabilirea cuvintelor

cheie/specia/condiţiile şi

durata experienţei etc.

Investigarea profilurilor de

expresie microarray pentru

Arabidopsis thaliana

Extragerea informaţilor necesare

utilizând limbajul de programare

R şi pachete suplimentare

Investigarea profilurilor

referitoare la dezvoltarea

florii pentru Arabidopsis

thaliana

Elaborarea

tabelului analitic

cu informaţiile

extrase asupra

seturilor de date

Completarea tabelului pentru analiza ulterioară

Prelucrarea

statistică a

probelor după

replicările

biologice Verificarea datelor

pentru analiza ulterioară

Calcularea valorii medii

Elaborarea

listelor de

gene

selectate

Clasificarea

genelor după

anumite criterii

Compararea

listelor obţinute

Determinarea filtrelor pentru

selectarea datelor

Valoarea

coef-lui

p:

p ≤ 0,05

p ≤ 0,001

p ≤ 0,0001

Coeficienţi

de corelaţie

r ≥ 0,9

r = |(0; 0,3]|

r = |(0,3; 0,7]|

r = |(0,7; 1]|

Rapoartele

de

expresie

dintre

probe:

1:2

1:3

1:10

Determinarea filtrelor pentru

selectarea datelor

Expresie

diferenţiată

Adnotări KEGG

GA

22810 sonde

100 gene

Filtrare statistică

Adnotări GO

681 gene

1653 gene

281 gene

59 căi metabolice

KEGG PATHWAY

• 27 gene expresie ↑

• 80 gene expresie ↓

• 70% - ABA, MJ, AUX și ET

ANALIZA MICROARRAY

GENE ONTOLOGY

• Replicarea și repararea genetică

• Atașarea la ATP și a ribonucleotidelor

• Procese metabolice

• Remodelarea peretelui celular

• Determinarea presiunii osmotice

Page 25: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

F

E

G

H

A - metabolismul SRO

B - metabolismul energetic

C -activitatea și biogeneza mitocondriilor

D - dezvoltarea organelor reproductive, meioza

E - căile de semnalizare a AG și AJ

F - procese de reparație și recombinare a ADN-lui

G - semnalizare și transducția semnalelor

H - apoptoză

A

B

C

D

S E M N A L I Z A R E A C E L U L A R Ă

MITOCONDRII – NUCLEU

Page 26: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

0

0,5

1

1,5

2

2,5

B1 B2 B3 B4

Gena MEE 58, GE489951.1

Номер цикла

4136312621161161

Фл

уо

ре

сц

ен

ци

я

3 500

3 000

2 500

2 000

1 500

1 000

500

0

Gena EXP, GE514022.1

0

0,1

0,2

0,3

0,4

B1 B2 B3 B4

Martor Tratat

0

0,5

1

1,5

2

2,5

B1 B2 B3 B4

Gena ASK2, D849086.1

0

0,005

0,01

0,015

0,02

0,025

0,03

0,035

B1 B2 B3 B4

Gena DYAD, GE489553.1

Gena H1, CD856124.1

0

1

2

3

4

B1 B2 B3 B40

0,1

0,2

0,3

0,4

B1 B2 B3 B4

Martor Tratat

NIVELUL DE EXPRESIE A GENELOR LA PLANTELE

CU ASI

Exp

resia

rela

tiv

ă, u

n. c.

Exp

resia

rela

tiv

ă, u

n. c.

B1- microspor; B2 – tetrade; B3 – diviziuni; B4- leptoten-pahiten

Page 27: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

EFECTUL AG3 ASUPRA ACTIVITĂŢII A 13 GENE

IMPLICATE ÎN MEIOZĂ

30

22

Stimulare

Inhibare

32

20

Stimulare

Inhibare

3

8

10

9

Leptoten-pahiten Diviziuni

Tetrade Microspori

5

9

7

11

Leptoten-pahiten Diviziuni

Tetrade Microspori

Linia B Linia A

Expresie stimulată faţă de martor

Expresie inhibată faţă de martor

10

5

3

4

Leptoten-pahiten Diviziuni

Tetrade Microspori

8

4

6

2

Leptoten-pahiten Diviziuni

Tetrade Microspori

Page 28: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

SPECIA PROTEINA LOCALIZAREA PROTEINELOR ASC-Rf

Noncitoplasmatică Transmembranară Citoplasmatică

ASC

Petunia

proteină ASC 402 aa 38–46; 112–402 47–67; 88–111 68–87

Rf proteina genei Rf–PR591 – – 1–591

proteina genei Rf–PR592 – – 1–591

ASC Brassica

napus

proteina genei orf222 28–89 7–27; 90–108 1–6; 109–222

Rf proteina genei Rfo – – 1–667

ASC

Oryza

sativa

ORF 79 1–19 20–38 39–79

Rf

proteina genei Rf1a – – 1–791

proteina genei Rf1b – – 1–506

proteina genei Rf1c – – 1–794

ASC Raphanus

sativus

ORF 125 1–23 24–44 45–125

Rf proteina genei orf687 – – 1–687

LOCALIZAREA PROTEINELOR SISTEMULUI ASC-Rf

Page 29: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

29

DISTRIBUŢIA SPAŢIALĂ A PRODUSULUI DE EXPRESIE A

GENEI orfH522

0

20

40

60

80

100

120

0.1

1

0.4

2

0.7

4

1.0

6

1.3

8

1.6

9

2.0

1

2.3

3

2.6

6

2.9

8

3.3

1

3.6

3

3.9

5

4.2

4.5

8

4.9

RFH

eig

ht

Citoplasmic fraction Mitochondrial fraction

Polipeptida 16 kDa

Fracţia citoplasmatică

Fracţia mitocondrială

Mr, kDa

Rf

23 Domeniu

noncitoplasmatic

132 Domeniu

citoplasmatic

17 Domeniu

transmembranar

ORFH522

1 - SW501 N

2 - SW501 T

3 - SW501ASC N

4 - SW501ASC T

5 - RW637Rf N

6 - RW637Rf T

Page 30: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

ASC - ASI

CITOPLASMA

Ereditară Indusă de AG3

SW 501 ASI

MITOCONDRII

Fracţiunea salinoextractibilă

SW501ASC

Gena mitocondrială orf H522

APEX

Polipeptida 16 kDa

FRUNZE

CALATIDII CALATIDII

FRUNZE

APEX

Gena mitocondrială orf H522

Page 31: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

A S C - R f

(ADNm) (ADNn)

Gena mitocondrială orf H522

Genele nucleare Rf

? Proteine 16 kDa

Concentraţie redusă a giberelinelor

Concentraţia sporită de gibereline

Concentraţie înaltă a auxinelor

Concentraţie redusă a auxinelor

Raport înalt

AIA/AG3

Raport redus

AIA/AG3

Intensitatea

redusă a

proteosintezei

rH

reducător

Activitatea redusă a

peroxidazei

Activitate înaltă a

catalazei şi peroxidazei

Page 32: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

SISTEMUL ASC - Rf LA FLOAREA - SOARELUI

Semnale metabolice

MSH1 RecA

Familii de gene

[ATP]:[ADP]

H+ H+ H+

H2O O2

H2O O2 CAT

NO

BER

Kinaze / fosfataze/ adenilat ciclaze

MARK

Alterarea funcţiei

?

LTE

1O2 OH.

H2O2

mtAOX

MADS

TD/SPL/MYB

FADH2

NDH

NDH

UC

CII

CIII CIV

SOD, APX, CAT

ADP+Pa ATP

P

P

P

?

?

? ?

Stoichiometrie modificată

a reactanţilor

FT Amplificarea semnalului

? Stres oxidativ

? Semnal ? Semnal

?

Alterarea transcripţiei

Bcl 1/Bax inhibitor

Reducerea potenţialului membrnar

ONOO-

Fitohormoni Receptor

NADH+H

[Ca2+]

Citocrom C

orfH522

1- Leclercq P., 1966; 2 - Kinman M.L., 1970; 3 - Vranceanu A.V., Stoenescu F.M., 1976, 1978; 4 - Анашенко А. В., Дука М. В., 1985;

5 - Horn R., Kohler R.H., 1991; 6- Kohler R., Horn R., Lossl A., 1991; 7- Laver H., Reynolds S., Moneger F, 1991;

8 - Smart C., Moneger F., Leaver C.J., 1994; 9 - Gagliardi D., Leaver C., 1999; 10 - Balk J., Leaver C., 2001;

11- Duca M., 1998.

Rf1

Degenerarea celulelor tapet - MCP

[1-4]

[8-10] orfH522

[5-7]

[11]

[10]

[Ca2+]

orfH522

Page 33: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

33

Valentina Rusu-Ciobanu

Floarea-soarelui

Page 34: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

34

Xenia

M ♂ ♀ F

1

M ♂ ♀ F

1

M ♂ ♀ F

1

M ♂ ♀ F

1

p

b

M ♂ ♀ F

1

M ♂ ♀ F

1

♂ F

1

M ♂ ♀ F

1

4

p

b

M ♂ ♀ F1 M ♂ ♀ F

1

M ♂ ♀ F

1

M ♂ ♀ F

1

M ♂ ♀ F

1

M ♂ ♀ F

1

M ♂ ♀ F

1

M ♂ ♀ F

1

M ♂ ♀ F1 M ♂ ♀ F

1

M ♂ ♀ F

1

M ♂ ♀ F

1

p

b

M ♂ ♀ F1 M ♂ ♀ F

1

M ♂ ♀ F

1

M ♂ ♀ F

1

p

b

AFLP

ISSR

SSR

RAPD

METODE DE DETERMINARE A POLIMORFISMULUI

GENETIC

Page 35: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

c i c i c i

♀ ♂ F1

A

B

C

D

68

45

25

13,4

68

45

25

13,4

kDa

68

45

25

13,4

SPECTRELE POLIPEPTIDICE DIN RĂDĂCINILE (A, B) ŞI

FRUNZELE (C, D) DE HELIANTHUS ANNUUS L. ♀ ♂ F1 ♀ ♂ F1 ♀ ♂ F1 ♀ ♂ F1 ♀ ♂ F1

kDa

c i c i c i c i c i c i c i c i c i c i c i c i c i c i c i

68

45

25

13,4

c – control, i – infectat

15 zile 20 zile 30 zile 40 zile 50 zile 60 zile

Page 36: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

ANALIZA CANTITATIVĂ A POLIPEPTIDELOR UTILIZÂND

TEHNOLOGIA PROTEIN LAB CHIP

783.15

marto

r

783,15 ng/μl

infectat

91,22 ng/μl

1496

ng/μl

463,14

ng/μl

kDa

1314,13 ng/μl

500

ng/μl

1638,99

ng/μl*

150,

0

95,0

63,0

46,0

15,0

28,0

7,0

4,5

♂ martor

infectat

1638,55 ng/μl*

1122,7

ng/μl

887,38 ng/μl

62,85

ng/μl 64,81 ng/μl

kDa

F1

infectat

1674.52 ng/μl*

martor

954 ng/μl

kDa

B

kDa

infectat

111,9 ng/μl

martor

389,8 ng/μl*

martor

2327,8 ng/μl*

infectat

12,61 ng/μl

kDa

infectat

300 ng/μl*

martor

165 ng/μl

F1

kDa

A

Page 37: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

ANALIZE DE TIP CLUSTER DIVIZIV ŞI AGLOMERATIV

Dendrograma interpopulaţională realizată în baza distanței Euclidiene dintre

valorile medii ale caracterelor morfologice ale semințelor de Orobanche cumana

Dendrograma UPGMA generată pe baza distanţelor

genetice Jaccard conform secvenţelor microsatelite SSR

între populațiile de Orobanche cumana

Reprezentarea bidimensională a rezultatelor

analizei morfometrice a semințelor ale populațiilor

studiate de Orobanche cumana

Page 38: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

Modul de moştenire Frecvenţa Masa moleculară, kDa

♂ ♀ F1

+ + + 77 122; 98; 89; 59; 57; 53; 49; 46; 38; 36; 35; 29; 28; 24;

22,8; 22,3; 21,5; 17,6; 16,3; 15,3

+ + - 12 88; 80; 70; 49; 20,5; 18,7

- - + 30 117; 74; 62; 43; 34,2; 32,8; 27; 26; 20,1; 19

+ - + 6 34,2; 26; 23,7; 16,3

- + + 4 49; 46; 26; 16,3

+ - - 2 88; 18,7

- + - 5 88; 80; 28; 20,5; 18,7

ELUCIDAREA BAZELOR MOLECULARE ALE

FENOMENULUI DE HETEROSIS

Page 39: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

67

43

30

20,1

14,4

94

-βME +βME

M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 1 2 3 4 5 6 7 8 9

M – markerul maselor moleculare, kDa; 1 – Xenia ♀; 2 – Xenia ♂; 3 – Xenia F1; 4 – Valentino

♀; 5 – Valentino ♂; 6 – Valentino F1; 7 – Drofa ♀; 8 – Drofa ♂; 9 – Drofa F1. -βME –

electroforeza în lipsa β-mercaptoetanolului; +βME - electroforeza în prezenţa β-

mercaptoetanolului

EVALUAREA POLIMORFISMULUI GENETIC ÎN BAZA

HELIANTININEI LA FLOAREA-SOARELUI

Spectrul polipeptidic tipic (T) şi netipic (Nt)

al heliantininei la genotipul Xenia♀

Grupa II

Grupa III

Grupa I

15

20

14

16 17

18 19

1

2 3 4 5

6 7 8 9 10

11 12

21

16 17

18 19

1

2 3 4 5

6 7 8 9 10

11 12 13

21

T Nt

• METODA DE DETERMINARE A PURITĂȚII GENETICE A MATERIALULUI

SEMINCIER DE FLOAREA SOARELUI , brevet nr. A20060194 din 21.07.2006

Page 40: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

Elena Bontea

Natură statică cu fructe

și floarea-soarelui, 1984

Page 41: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

Însuşirile biologice ale parazitului Însuşirile biologice ale gazdei

Mecanisme fiziologice ale rezistenţei

Afinitatea

Virulenţa

Agresivitatea

Gene specifice

Gene nespecifice

S R O P R

INTERACŢIUNEA GAZDĂ-PATOGEN

Evaluarea polimorfismului genetic și amprentarea

genotipurilor valoroase de floarea-soarelui • Analiza SSR

Evaluarea potențialului de rezistență specifică

• Screening-ul genei Pl1 cu marker CAPS

• Screening-ul genei Pl6 cu marker STS

Elucidarea mecanismelor de rezistenţă nespecifică

• Colorarea cu DAB şi NBT • Expresia genelor asociate

cu rezistenţa

Page 42: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

IDENTIFICAREA GENELOR DE REZISTENŢĂ LA RUGINĂ

(Puccinia helianthi) R1 şi R2

IDENTIFICAREA GENEI DE REZISTENŢĂ LA MANA

(Plasmopara halstedii) Pl1

Markerul CAPS pentru locusul Ha-4W2 lincat cu

gena Pl1 (rezultatul restricţiei cu Tsp509I)

Page 43: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

Audieri parlamentare, februarie 2010 ©

43 43 SCRININGUL MOLECULAR AL REZISTENȚEI LA LUPOAIE

OPB 10 OPK 17

OPA 02 OPA 11

R E S T R I C T I O N

A N A L Y S I S

SCAR (rasa E) RAPD

DUCA, M., A. GLIJIN, A. ACCIU, M. GORCEAG and I. GISCA. 2014.

Identification of RAPD markers associated with sunflower resistance

to Orobanche cumana Wallr. In: Proc. 3rd Int. Symp. Conserv. of

Plant Diversity, Chisinau 22-24 May, 2014. p. 87.

DUCA M., GLIJIN A., ACCIU A. and GISCA I. 2013. Use of RAPD

markers in molecular screening of sunflower resistance to broomrape.

In: Proc. Int. Symp. Modern Agriculture – Achievements and

Prospects. Chisinau. p. 168-172.

DUCA M., GLIJIN A., LUPASCU V. and ROTARENCO V. 2009.

Molecular screening of sunflower resistance to broomrape (Orobanche

cumana Wallr.), race E. Journal of the Academy of Sciences, Life

Sciences. 3(309): 81-88.

Page 44: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

Audieri parlamentare, februarie 2010 ©

44

FIELDS

FENOTIPIC SCREENING OF THE RESISTANCE

TO BROOMRAPE

POTS

GREEN HOUSES

PETRI DISHES

MSU

UnASM

UnASM

AMG-Agroselect

AMG-Agroselect

SELECTIA

UnASM

AMG-Agroselect

NOVASEM

DUCA M., GLIJIN A., PACUREANU-JOITA M., ACCIU A. and GISCA I. 2013. Impact

of Orobanche cumana on sunflower cultivars on natural infested fields in Republic of

Moldova. p. 282. In: Proc. Int. Plant Breeding Congress. Antalya, Turkey.

DUCA M., GLIJIN A., LUPASHCU V., ROTARENCO V., TELEUTA A., ROTARU T.

2011. Phenotypic screening of broomrape resistance at sunflower genotypes cultivated

in Republic of Moldova. p. 20. In: Proc. Int. Symp. on Broomrape (Orobanche

spp.) in Sunflower, Chisinau.

BUCIUCIANU, M., I. PETCOVICI, E. LUNGU et al. 2009. Crearea materialului initial si

ameliorarea in baza lui a hibrizilor semitardivi de floarea-soarelui, toleranti la atacul

principalelor patogeni. p. 200-202. In: Proc. Int. Conf. Integrated protection of field

crops, Balti.

PETCOVICI I. P. 2008. Sozdanie ishodnogo materiala podsolnecinika, imunnogo k

bolezniam. p. 94-103. In: Proc. Int. Conf. Crops in modern agriculture. Balti. (in

Russian).

SHAROVA P. G. 1969. Selectia podsolnecinika na imunitet k agresivnim rasam

moldavskoi populiatii zarazihi. p. 28-31 In: P. G. Sharova, Trudi V Vsesoiuznogo

sovescianiia po imunitetu rastenii. Kiev. (in Russian).

Resistant

Tolerant

Susceptible

19%

9%

72%

Page 45: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

10 Rezistente

FS9, FS12,

FS17, FS21,

FS26, FS27,

ASC1,

Alcazar F1,

Favorit F1, Turbo F1

5 Tolerante

FS4, FS8,

FS11, ASC2,

Xenia ♂

Sensibile

FS10

37 Foarte sensibile

FS: 1-3, 5-6,

13, 15, 18-20, 22,

23, 25; ASC: 3-6, 8-11;

Xenia: ♀, F1;

Valentino: ♂, ♀, F1;

Drofa: ♂, ♀, F1;

Hibrizii: Olea,

Oxana, Performer

CLASIFICAREA GENOTIPURILOR DE FLOAREA-SOARELUI

DUPĂ FRECVENŢA ATACULUI CU LUPOAIE

Sistemul rasicul la

genotipul reziztent ASC1

Dezvoltarea fitoparazitului pe rădăcinile

Helianthus annuus L.

(hibrizii Xenia (A) şi Valentino (B)

6 Susceptibile (Drofa ♀; ASC7; FS7; FS14; FS16; FS24)

Page 46: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

VARIAŢIA GRADULUI DE INFECTARE CU LUPOAIE ÎN FUNCŢIE DE

PARTICULARITĂŢILE FIZICO-CHIMICE ALE SOLULUI

Localităţile

Parametrii solului

Intensitatea atacului,

% Frecvenţa

atacului, % pH

% mg/100 g me/

100 g

>10 5-10 1-4 Humus N total NH4 NO3 P2O5 K2O Ca

Telenesti, Verejeni - 20 80 10 7.50 2.25 0.24 0.6 18.1 5.9 60.6 22.00

Telenesti, Cazanesti 1 15 84 10 8.00 1.85 0.31 0.7 3.7 9.3 64.0 22.90

Telenesti, Brinzeni 30 20 50 25 7.80 2.95 0.28 0.9 7.4 2.7 51.6 21.60

Orhei, Ciocilteni 8 17 75 40 7.80 3.65 0.26 0.9 1.8 1.5 29.0 22.60

Mun. Chisinau - 50 50 30 7.30 3.70 0.20 0.6 1.6 1.2 28.2 21.10

Hincesti, Buteni 5 20 75 30 8.00 3.05 0.19 0.6 4.9 1.5 30.2 27.60

Hincesti, Sarata-

Mereseni - - 100 10 7.40 2.65 0.26 1.1 1.0 3.8 26.6 16.80

Hincesti, Fundul-

Galbenei - - 100 5 7.40 2.65 0.16 0.6 5.8 1.4 25.8 20.25

Straseni, Rassvet - - 100 10 7.90 4.05 0.16 0.5 3.9 1.9 50.0 15.10

Localitatile

Parametrii solului

Intensitatea atacului,

% Frecventa

atacului, % pH

% mg/100 g me/

100 g

>10 5-10 1-4 Humus N total NH4 NO3 P2O5 K2O Ca

Leova, Cazangic - 30 70 70 7.45 3.30 0.15 0.6 1.4 1.3 21.4 13.25

Stefan-Voda, Ermoclia - 20 80 10 8.20 3.45 0.22 1.1 29.3 3.7 24.6 27.90

Comrat, Chirsova - - 100 10 8.30 2.30 0.18 0.6 4.3 1.6 24.6 19.10

Comrat, Besalma - - 100 20 8.20 2.50 0.18 0.9 24.4 4.0 29.4 18.00

Comrat, Svetlii - - 100 10 8.25 2.30 0.18 0.7 3.9 1.8 23.4 18.50

Basarabeasca,

Carabetovca

60 30 10 60 8.30 2.80 0.18 0.7 11.4 1.4 19.0 16.90

Cahul, Alexanderfeld 50 50 - 70 7.75 3.45 0.16 0.9 2.0 4.2 32.0 23.10

Cahul, Manta 10 30 60 80 7.75 3.25 0.24 0.9 2.3 3.9 19.0 23.10

Cahul, Slobozia-Mare 40 30 30 80 7.90 3.25 0.24 1.0 2.1 8.0 25.0 19.25

Cahul, Crihana-Veche - - 100 30 7.80 2.10 0.21 0.8 7.4 4.8 59.4 17.75

Page 47: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

20 30 40 50 60 20 30 40 50 60 20 30 40 50 60 20 30 40 50 60 20 30 40 50 60 20 30 40 50 60

Xenia m Xenia t Xenia F 1 V alentino m V alentino t V alentin F 1

s eminţe ataş ate tuberculi tuberculi cu rădăc ini adventive lăs tari s ubterani lăs tari aerieni

Nr.

ata

şam

ente

per

pla

ntă

♂ ♂ ♀ ♀

zile

DINAMICA DEZVOLTĂRII Orobanche cumana Wllar

30 zile 40 zile D

E

B

C

A 15 zile

50 zile F

G

H

60 zile

Page 48: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

48

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100FS

1FS

2FS

3FS

4FS

5FS

6FS

7FS

8FS

9FS

10

FS 1

1FS

12

FS 1

3FS

14

FS 1

5FS

16

FS 1

7FS

18

FS 1

9FS

20

FS 2

1FS

22

FS 2

3FS

24

FS 2

5FS

26

FS 2

7

ASC

1A

SC2

ASC

3A

SC4

ASC

5A

SC6

ASC

7A

SC8

ASC

9A

SC10

ASC

11

Tur

bo F

1A

lcaz

ar F

1Fa

vori

t F1

Ole

a F1

Oxa

na F

1Pe

rfor

mer

F1

Dro

fa ♀

Dro

fa ♂

Dro

fa F

1V

alen

tino

♀V

alen

tino

Val

enti

no F

1X

enia

♀X

enia

♂X

enia

F1 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53

o

%

F R E C V E N Ţ A A T A C U L U I

0

2

4

6

8

10

12

14

FS1

FS 2

FS 3

FS 4

FS 5

FS 6

FS 7

FS 8

FS 9

FS 1

0FS

11

FS 1

2FS

13

FS 1

4FS

15

FS 1

6FS

17

FS 1

8FS

19

FS 2

0FS

21

FS 2

2FS

23

FS 2

4FS

25

FS 2

6FS

27

ASC

1A

SC 2

ASC

3A

SC 4

ASC

5A

SC 6

ASC

7A

SC 8

ASC

9A

SC 1

0A

SC 1

1

Turb

o F1

Alc

azar

F1

Favo

rit F

1O

lea

F1O

xana

F1

Perf

orm

er

Dro

fa ♀

Dro

fa ♂

Dro

fa F

1V

alen

tino

♀V

alen

tino

Val

entin

o F1

Xen

ia ♀

Xen

ia ♂

Xen

ia F

1 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 1 6 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53

I N T E N S I T A T E A A T A C U L U I

Page 49: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

240 de secțiuni

Analiza histochimică a prezenței ligninei (A) și calozei (B)

A.

B.

540 probe, congelate și stocate pentru studiul

expresiei genelor

Genotipuri

Cod

genotip

Creșterea pe fundal de infecție cu O. cumana (zile)

Stadiu imediat de apărare a

plantei gazdă

Stadiu de apărare activă a

plantei gazdă

Stadiu de

stabilizare și

acomodare a

plantei gazdă

Etapa de penetrare a

rădăcinilor gazdei de

haustoriul lupoaiei

Etapa de

formare a

tuberculilor

Etapa de

formare a

lăstarului

subteran de

lupoaie

Etapa de

dezvoltare a

lăstarului

aerian de

lupoaie

18 21 35 53 63

C1 I1 C2 I2 C3 I3 C4 I4 C5 I5

RE

ZIS

TE

I

Favorit (Or6)

F1

(rasa F) R1 R1C1 R1I1 R1C2 R1I2 R1C3 R1I3 R1C4 R1I4 R1C5 R1I5

LC-1093A

(♀Favorit)

(rasa F) R2 R2C1 R2I1 R2C2 R2I2 R2C3 R2I3 R2C4 R2I4 R2C5 R2I5

Pioner F1

(PR64 LE20)

(rasa G-H) R3 R3C1 R3I1 R3C2 R3I2 R3C3 R3I3 R3C4 R3I4 R3C5 R3I5

LC-5542

(rasa H) R4 R4C1 R4I1 R4C2 R4I2 R4C3 R4I3 R4C4 R4I4 R4C5 R4I5

SE

NS

IBIL

Performer F1

(sensibil) S1 S1C1 S1I1 S1C2 S1I2 S1C3 S1I3 S1C4 S1I4 S1C5 S1I5

LG5525

(LMD1)

(sensibil) S2 S2C1 S2I1 S2C2 S2I2 S2C3 S2I3 S2C4 S2I4 S2C5 S2I5

Teza de doctorat drd. Olesea Tabără

STIDIUL PARTICULARITĂŢILOR MORFO-ANATOMICE ALE

SISTEMULUI H. ANNUUS L. - O. CUMANA WALLR.

Page 50: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

50

Specificitatea interacţiunii dintre gazdă şi

parazit, în baza testului de germinație

PRECONDIȚIONARE

45 populații

colectate din diferite

regiuni geografice

ale Moldovei

4 repetiții

biologice, cîte 70

semințe

GERMINAREA, cu utilizarea exudatelor a 5

genotipuri de floarea soarelui cu diferit grad de

afinitate pentru lupoaie:

genotipul sensibil de floarea-soarelui (LMD1)

şi exudate ale liniilor diferențiatoare pentru:

rasa E (LMD2);

rasa F (LC 1093A);

rasa G (LMD3);

rasa H (LG5661).

Analiza microscopică și fotodocumentarea în

3 puncte de creștere – a 8-a, a 10-a și a 13 zi

de contact exudat-semințe de lupoaie

Cca 2500 de foto

Cca 50 de probe, congelate și stocate

pentru studiul expresiei genelor

AFINITATEA POPULAȚIILOR DE LUPOAIE COLECTATE DE PE

TERITORIUL REPUBLICII MOLDOVA

Page 51: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

Audieri parlamentare, februarie 2010 ©

51 RESEARCH OF BROOMRAPE FROM DIFFERENT REGIONS

Moldavian VNIIMK Station

Edinet, Balti, Chisinau,

Slobozia, Causeni, Vulcanesti 6

5

12

14 AMG-Agroselect

Soroca, Anenii-Noi (RM) ,

Tulcea (Romania)

SHAROVA P. G. 1977. Zaraziha – opasnii parazit

podsolnecinika. Chisinau. (in Russian).

GLIJIN A., ACCIU A. and MITA E. 2011. Effect of

root exudation from different sunflower

genotypes on broomrape seeds germination. p.

23. In: Proc. Int. Symp. on Broomrape

(Orobanche spp.) in Sunflower, Chisinau,

Republic of Moldova.

GLIJIN A., ACCIU A. and GISCA I. 2014.

Molecular analysis of Orobanche cumana

Wallr. from different geographical regions. In:

Proc. 3rd Int. Symp. Conserv. of Plant

Diversity, Chisinau 22-24 May, 2014, p. 16.

GISCA I., ACCIU A., GLIJIN A. and DUCA M.

2013. Highly virulent races of sunflower

broomrape in the Republic of Moldova. In:

Proc. Biotech. Congress. Current Opinion in

Biotech. 24(1):S132.

Page 52: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

Audieri parlamentare, februarie 2010 ©

EVOLUTION OF Orobanche cumana WALLR. IN THE RM

Third Symposium on Broomrape (Orobanche spp.) in Sunflower,

June 3 – 6, 2014, Córdoba, Spain

B C

E F-H

Race B,

Sharova P. G.

Moldavian VNIIMK

Station

Race C,

Burlov, 1976,

Antonova, 1978,

VNIIMK

Race E,

Popescu V.

Moldova State

University

Races D, E, F and G,

Gisca I., Duca M.,

Glijin A., Pacureanu-

Joita M.

University of ASM,

AMG-Agroselect,

NARDI

1968 1970

2004

2005 - 2014

Page 53: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

41 populații O. cumana

Nord Centru Sud

5 7 9

1 2 1

1 1 2

1 - 3

- 1 2

- 1 2

< E

E

F

G

G+

H

Rase:

STUDIUL PARTICULARITĂŢILOR MORFO-ANATOMICE ȘI FIZIOLOGICE

ALE SISTEMULUI H. ANNUUS L. - O. CUMANA

Teza de doctorat drd. Acciu Adriana

Page 54: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

54

Elena Bontea

Floarea-soarelui, 1965

Page 55: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

IDENTIFICAREA TRANSGENELOR Atesatarea prezenţei transgenelor la liniile de tutun

242 pb

`(bar)

2 7A 13 14 19A 24 6 25 5 8 10 30

A

B

44 kDa

(CsLFY)

23 kDa

(PAT)

44 kDa

(CsLFY)

23 kDa

(PAT)

Page 56: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

56

MOŞTENIREA GENEI bar

Page 57: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

57

Promotorul CaMV 35S

Transgena întrodusă

NOS poly-A

Gena hpt II Gena α lacZ

NOS poly-A

Exemplu de secvenţă de T-ADN inclusă în genomul tutunului

200 pb

100 pb

Rezultatul screening-ului după secvenţa NOS-teminator

M – marker, 1 – test negativ, 2 – GA-21 (test pozitiv), 3 – porumb,

4 – tomate „Gloria”, 5 – tomate “Băcioi”, 6 – tomate “Ialoveni”,

7 – cartofi „Irga”

M 1 2 3 4 5 6 7

Primer Secvenţa nucleotidică Concentraţia Tm % GC

Sens GAATCCTGTTGCCGGTCTT 30 pmol/µl 60,07 52,63

Antisens TTGCGCGCTATATTTTGTTTT 30 pmol/µl 59,78 33,33

Primer sens şi antisens pentru secvenţa NOS-terminator

SCREENING-UL OMG

DUPĂ SECVENŢA NOS-TERMINATOR

Page 58: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

• GENE ŞI REŢELE DE GENE IMPLICATE ÎN TRANSDUCŢIA

SEMNALELOR IN SILICO

Laboratorul BIOINFORMATICĂ

• SEMNALIZAREA RETRO- ŞI ANTEROGRADĂ LA

INTERACŢIUNEA NUCLEU-MITOCONDRII

Laboratorul GENOMICĂ

• MECANISME GENETICO-MOLECULARE DE INTERACŢIUNE

ÎN CADRUL DIFERITOR PATOSISTEME

Laboratorul PROTEOMICĂ

• POLIMORFISMUL GENETIC LA DIVERSE CULTURI AGRICOLE ȘI

PLANTE DIN FLORA SPONTANĂ A RM

Temă nefinanţată, Catedra BIOLOGIE

DIRECŢII NOI DE CERCETARE ÎN DOMENIUL

GENETICII FIZIOLOGICE

Page 59: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

C E L U L A R Analize citologice și histologice

Microscopie optică și electronică

O R G A N I S M Integrarea datelor

Rețele de gene, rețele proteice

CBM, UnAŞM Cercetări fundamentale

biochimice

genetice

fiziologice histologice

sociologice observații

PRODUCĂTORI Recomandări obținere de hibrizi rezistenți;

startegii de prevenire a infecției

morfologice

AGROSELECT

M O L E C U L A R Profile genetice SSR, ISSR

Expresia genelor Real-Time PCR

O R G A N Activitatea enzimatică

SOD, PAL, PPO

P O P U L A Ț I O N A L Distribuția geografică a raselor O.

cumana Wallr.

Variabilitatea intra- și

interpopulațională

LIMAGRAIN

Page 60: ASPECTE DE GENETICĂ FUNCŢIONALĂedu.asm.md/sites/default/files/raport iasi1 M.pdf · 2017-04-27 · UNIVERSITATEA ACADEMIEI DE ŞTIINŢE A MOLDOVEI Organizat în baza Hotărârei

60

Mulţumesc

pentru atenţie !