arqueobacterias (es)

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Departamento de Ingeniería Química y Bioquímica Carrera: Ing. Bioquímica Materia: Bioquímica y Fisiología Microbiana Profesor(a): Selene Aguilera Aguirre Alumnos: Jesica Lepe Ramos (12400398) Faustino de Jesús Gómez Ruvalcaba (13400006) Carlos Eduardo Camacho González (12400344) Trabajo de Investigación “Estructura y función celular de las arqueobacterias”

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Investigación de las extremofilas

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Page 1: Arqueobacterias (ES)

Departamento de Ingeniería Química y Bioquímica

Carrera: Ing. Bioquímica

Materia: Bioquímica y Fisiología Microbiana

Profesor(a): Selene Aguilera Aguirre

Alumnos:

Jesica Lepe Ramos (12400398)Faustino de Jesús Gómez Ruvalcaba (13400006)Carlos Eduardo Camacho González (12400344)

Trabajo de Investigación “Estructura y función celular de las arqueobacterias”

Fecha de Entrega: 15 de Febrero del 2016

Page 2: Arqueobacterias (ES)

Introducción

En los años 80, un microbiólogo americano, Carl Woese, dio a conocer sus estudios acerca

de un tipo de microorganismos con célula procariota pero características distintivas con

respecto a éstas e incluso más relacionadas con las células eucariotas. A este grupo

desconocido hasta el momento lo llamó Archaea (o Arqueobacterias) y se cree que

evolucionaron separadamente de las bacterias muy poco después del origen de la vida en la

Tierra, hace unos 3.800 millones de años.

Al principio, su descubridor Woese, observó que estas criaturas sólo podían vivir en

condiciones extremas de vida, en las que ningún otro ser vivo podía hacerlo. Sin embargo,

posteriormente se ha comprobado que también pueden aparecer poblaciones de

arqueobacterias en el oxigenado océano y no solo en hábitats desprovistos de oxígeno o

saturados en sal, azufre, etc.

Clasificación

Existen dos criterios para clasificar a las arqueas; uno se refiere al tipo de ambiente en el

que vive o, dicho de otra forma, basándose en su fisiología. Según este criterio las arqueas

se clasifican en tres grupos y un género que no corresponde a ningún grupo:

1. Metanógenas: Productoras de metano.

2. Halófilas: Viven en ambientes con concentraciones muy altas de cloruro sódico.

3. Termófilas e hipertermófilas: Viven alrededor de fuentes geotermales.

4. Género Thermoplasma: Termófilo desprovisto de pared celular.

Basándonos en su genoma, concretamente en las características de su 16 S ARNr, las

arqueas se dividen en tres grupos:

1. Crenarchaea: Hipertermófilos dependientes de azufre, acidófilos.

2. Euryarchaea: Metanógenos, halófilos.

3. Korarchaea: Sólo se conocen sus ácidos nucleicos, no se ha aislado ningún

organismo.

Page 3: Arqueobacterias (ES)

Elementos estructurales

Pared Celular

La mayor parte de archeas carecen del peptidoglicono en la pared

celular, la pared celular impide la lisis celular y le confiere la

forma a la célula. Las paredes de las Archaea, son resistentes en

condiciones naturales a la acción de lisozima y a las penicilinas

que son agentes que destruyen este componente e inhiben su síntesis todo esto es debido a

la ausencia de peptidoglicano.

Las Archaeas pertenecientes a la especie metanógenas contienen pseudopeptidoglicano,

este polímero es diferente del peptidoglicano.

El pseudopeptidoglicano está formado por de N - acetilglucosamina y N - acetil

talosaminurónico (ácido N - murámico), con enlaces glucosídicos ß (1-3) a diferencia de los

ß (1-4) que son los del peptidoglicano.

Figura 1. Bla blah

Las archaeas que no tienen pared celular son las del genero Thermoplasma y

Ferroplasma.

Page 4: Arqueobacterias (ES)

Figura 2. Archaeas metanógenas

En otras archaeas la pared se compone de polisacaridos,

glicoproteínas o proteínas.

Dentro de esta especie cabe destacar que poseen paredes celulares

diferentes, la más común es la capa superficial paracristalina (capa

S), compuesta por glicoproteína dispuesta en simetría hexagonal,

la pared se compone de proteínas de superficie, que forman una

capa S.

Una capa S es una agrupación rígida de moléculas proteínicas que cubren el exterior de la

célula como una cota de malla. Esta capa ofrece una protección química y física, y puede

servir de barrera, impidiendo que entren en contacto las macromoléculas con la membrana

celular.

Figura 3. Archaeas con capa S

Los procariotas

metanogénicos son

habitantes normales del

rumen de vacas y rumiantes.

Page 5: Arqueobacterias (ES)

En Arqueas la capa S da forma y rigidez a muchas especies, ejerciendo papeles

equivalentes al de una pared celular:

En arqueas halófilas (p. ej., Halobacterium) la capa S de glucoproteína contiene

glucopéptidos especiales, y está estabilizada por altas concentraciones de sodio,

presentes en su nicho.

En arqueas termoacidófilas (p. ej., Sulfolobus) existen glucoproteínas en matrices

hexagonales, ricas en aminoácidos polares (Ser, Thr), estando la capa S estabilizada

por los bajos pH del medio.

Figura 4. Imagen y características del genero Thermoplasma

Las Archaeas halófilas extremas (p. ej., Halococcus) a diferencia de la especie

Methanosancina, poseen grupos sulfatos adicionales.

Figura 5. Halococcus morrhuae

Page 6: Arqueobacterias (ES)

Membrana celular

Figura 6. Estructura de la membrana plasmática del dominio Archaea

Las membranas celulares de Archaea son químicamente diferentes al resto de las cosas

vivas, ya que incluyen derivados de una molécula de glicerol e isopreno en lugar de los

ácidos grasos. Las diferencias químicas entre Archaea y otros organismos, se presentan en

la membrana celular, entre las cuales se resaltan las más importantes:

1. Quiralidad del glicerol: La unidad básica de la cual se construyen las

membranas celulares es el fosfolípido. El glicerol de los fosfolípidos de Archaea

son esteroisómeros del glicerol usado por Bacterias y Eukaryas para construir

sus membranas. Dos moléculas que son esteroisómeros son imágenes espejo una

de otra. Mientras que las Bacterias y Eukaryas tienen D-glicerol en sus

membranas, las Archaeas tienen L-glicerol en el suyo. Éste es más que una

diferencia geométrica. Los componentes químicos de la célula tienen que ser

construidos por las enzimas, de este modo la quiralidad de la molécula es

determinado por la forma de esas enzimas. Una célula que construye una forma

no podrá construir la otra forma.

Page 7: Arqueobacterias (ES)

Figura 7. Diferencia entre fosfolípido con L-glicerol y D-glicerol

2. Acoplamiento de éter: Cuando las cadenas laterales se agregan al glicerol, la

mayoría de los organismos las unen con un acoplamiento de éster. La cadena

lateral agregada tiene dos átomos de oxígeno unidos a un extremo. Uno de estos

átomos de oxígeno se utiliza para formar el acoplamiento con el glicerol, y el

otro sobresale al lado cuando se hace la vinculación. Por el contrario, las

cadenas laterales de Archaea son limitadas usando un acoplamiento de éter, que

carece de ese átomo de oxígeno. Esto da origen a un fosfolípido que varía en sus

propiedades químicas de los lípidos de la membrana de otros organismos.

3. Cadenas de Isopreno: Las cadenas laterales en los fosfolípidos de Bacterias y de

Eukaryas son los ácidos grasos, cadenas de generalmente 16 a 18 átomos de

carbono. Archaea no utiliza los ácidos grasos para construir sus fosfolípidos

membranales. En su lugar, tienen cadenas laterales de 20 átomos de carbono

construidos de isopreno.

Page 8: Arqueobacterias (ES)

Figura 8. Isoprenoides se unen al glicerol por unión tipo éter

A diferencia de la Bacteria y Eukarya, carecen de ácidos grasos y en su lugar tienen

cadenas laterales compuestas de unidades repetitivas de isopreno (fentanilo o bifentanilo)

unidas por enlaces éter al glicerol que constituyen el gliceroldiéter, cuando se distribuyen a

manera de bicapa y el gliceroltetraéter, cuando es a manera de monocapa.

Figura 9. Principales lípidos de la membrana plasmática de Archaea

Las monocapas lipídicas son muy estables a temperaturas altas, por lo tanto, no es una

sorpresa que se encuentre principalmente en las Archaeas termoacidófilas.

A.- Fitano en Bicapas

(Bacteria y Eukarya)

B.- Bifitano en Monocapas

(Arqueobacterias)

A

B

Page 9: Arqueobacterias (ES)

Figura 10. Diferencia de capas en Bacterias y Arqueobacterias

Flagelos

El flagelo arqueano es superficialmente similar al de la bacteria, ambos flagelos consisten

en filamentos que se extienden fuera de la célula y rotan para impulsar al microorganismo;

este tiene una estructura única, distinta en composición y ensamblado del flagelo bacteria;

no se ha observado ninguna homología genética con los flagelos de bacteria.

Los flagelos arqueanos son muy estables frente a las diferentes condiciones ambientales,

resisten el tratamiento con proteasas, son más estables a elevadas temperaturas que sus

equivalentes bacterianos

Además, mientras que los flagelos bacterianos están compuestos de una sola flagelina, los

flagelos arqueanos presentan varios tipos de flagelinas.

Sus filamentos son más delgados que el de las bacterias y están formados por un cilindro

macizo helicoidal (dextrógiro) constituido por diferentes flagelinas, pueden llegar a medir

de 10 a 12 nm.

Los flagelos bacterianos crecen por la incorporación de subunidades de flagelina en la

punta, mientras que flagelos de las arqueas crecen por la incorporación de subunidades

flagelina a la base.

Page 10: Arqueobacterias (ES)

Figura 11. Flagelo de las arqueobacterias

Como la pared de las arqueas carece de peptidoglicano, por encima de la membrana

citoplasmática se encuentra la capa S. Parece que el flagelo estaría anclado en la membrana

citoplasmática, en la capa S, y para estabilizarlo también se uniría a una estructura

citoplasmática denominada cabeza polar.

ARN y enzimas

El ARN y enzimas de arqueobacterias son diferentes al de las bacterias verdaderas.

A diferencia de las bacterias las arqueobacterias contienen intrones en los genes de ARNt y

contiene ribosomas los cuales son sensibles a la toxina difteria, sin embargo no presenta tal

sensibilidad hacia cloroamfenicol, kanamacina y estreptocimicina.

En las arqueas, solo se encuentra un tipo de ARN polimerasa (ARNP), la cual es

responsable de la síntesis de todos los ARN; este ARNP arqueano es similar

estructuralmente y mecánicamente al encontrado en las bacterias y a la eucariota ARNP I y

V; pero se encuentra especialmente relacionado con el ARNP II presente en las eucariotas.

Page 11: Arqueobacterias (ES)

Además las arqueobacterias presentan otra similitud con las bacterias, en las dos el

cromosoma se encuentra de manera circular y pueden presentar plásmidos que se pueden

propagar a través del contacto físico entre células (realizando un proceso similar a la

conjugación bacteriana).

La presencia de hasta un 15% de proteínas exclusivas codificadas por el genoma de las

arqueo bacterias las diferencias de otros organismos. Los genes con los que comparte cierta

similitud entre las bacterias y eucariotas son aquellas relacionadas con la transcripción,

traducción y el metabolismo de nucleótidos; Hasta el momento la mayoría de los genes de

los cuales se tiene conocimientos sobre su función se encuentran relacionados con la

metanogénesis, mientras que los otros no se han logrado identificar sus funciones.

Al hablar sobre la transcripción y traducción presenta más similitudes con las eucariotas (en

las subunidades y secuencias de la ARNP II y los ribosomas) sin embargo muchos otros

factores de transcripción de las arqueo bacterias son similares a las bacterias.

Page 12: Arqueobacterias (ES)

Bibliografía

García, J. (2010). Las membranas de las arqueobacterias. Recuperado el 11 de

Febrero de 2016, de http://biologia.laguia2000.com/microbiologia/las-membranas-

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Hiperbiología. (2007). Curso de Biología. Recuperado el 11 de Febrero de 2016, de

http://www.hiperbiologia.net/bacterias/arqueobacterias.htm#inicio

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