widespread occurrence and genetic diversity of marine parasitoids belonging to syndiniales...

Widespread occurrence and genetic diversity of marine parasitoids belonging to Syndiniales

(Alveolata)

Abondance et diversité génétique des parasitoïdes marins

appartenant aux Syndiniales (Alveolés)

L. Guillou, M. Viprey, A. Chambouvet, R. M. Welsh, A. R. Kirkham, R. Massana, D. J. Scanlan and A. Z. Worden

Baffreau AlexandrineCouet PaulineM1 Océanographie BEM

Les objectifs des auteurs

Améliorer la phylogénie des Alvéolés via les nouvelles séquences ARNr 18S et réaliser la phylogénie précise des groupes I et II des Syndiniales

Comparer la diversité génétique obtenue aux connaissances actuelles sur la taxonomie des Syndiniales

Elargir les milieux d’habitats des Dinoflagellés à travers leur séquences dans les banques de gènes

Extraire des informations générales sur l’écologie de certains membres des Syndiniales

Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion

Echantillons récoltés :→ à des saisons différentes → issus de milieux avec des conditions environnementales très différentes

• Profondeur• Lumière• Disponibilité en nutrients et dioxygène

Séquençage

Banques de séquences

Analyses phylogénétiques :→ Neighbour-Joining→ Maximum de vraisemblance→ Maximum de parcimonie→ Test Bootstrap

Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion

Groupes externesCiliés

Colpodellidae

Apicomplexes

AY665063 SCM38 C14, AF133909 Parvilucifera

Groupe I

Perkinsea

Groupe V

Groupe III

Groupe II

Groupe IV

Autres Dinophycées

Syndiniales

Dinoflagellés

Phylogénie des Dinobiontes parmi les Alvéolés

Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion

Phylogénie du groupe I des Syndiniales

Clade 7

Clade 4

Clade 8

Clade 6

Clade 3

Clade 1

Clade 2

Clade 5

HT

HT

HT

HT

HT

HT

HT

Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion

Proche de 10+11 ?

Clade 10+11

Clade 9

Clade 8

Clade 23

SingletonClade 12

SingletonSingletonClade 24

Clade 19

Clade 32Clade 28SingletonSingletonClade 38Clade 44SingletonSingletonClade 13

Clade 37SingletonClade 18Clade 34

Clade 14

Clade 21Clade 31

Clade 15

Clade 22

Clade 26

Clade 30

Clade 17

SingletonSingleton

Clade 16

Phylogénie du groupe II des Syndiniales

HT

HT

HT

HTHT

HT

HT

Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion

Clade 5

Clade 25Clade 39

Clade 42

Clade 3

Clade 2

Clade 33

Clade 4

Clade 1

Clade 41

Clade 7

Clade 29

Clade 43SingletonSingletonClade 40Clade 36Clade 27Singleton

Clade 20

Clade 35

Clade 6

Amoebophrya

Phylogénie du groupe II des Syndiniales

Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion

Sous-groupe 1

Sous-groupe 2

Sous-groupe 3

Sous-groupe 4

Sous-groupe 5

Sous-groupe 6

Sous-groupe 7

Sous-groupe 9

Sous-groupe 8

Kim & al (2008) :9 sous-groupes

Clade 1 + une séquence du clade 25

Biaisée par une séquence chimère

Clade 4

Clade 3

Clade 5

Clade 2

Clade 33

Chimère probable

Guillou & al (2008) : 8 clades du groupe II

1, 2, 3, 4, 5, 25, 33, 39, 41 et 42

Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion

Origine des séquences

Séquences des Dinoflagellés

Groupe I Syndiniales

Groupe II Syndiniales

Milieux continentaux

0,6 % 0 % 0 %

Milieux marins 29,8 % 23,9 % 50,1 %

Plancton de la colonne d'eau

33,2 % 23,9 % 51,5 %

Sediments 8,6 % 38,8 % 12,9 %

Diversité des habitats des Syndiniales

Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion

Clades présents sur toute la colonne d’eau

Clades spécialistes d’un milieu

Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion

Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion

Mode de vie des Syndiniales : exemple d’Amoebophrya

Montagnes 2008, modifié

Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion

Saldarriaga 2003, modifié

609075100

100100

10099

100 83879394

10099

100100100

Heterocapsa triquetra DINOFLAGELLES

Oxyrrhis marina OXYRRHIS

Perkinsus marinus PERKINSUS

Plasmodium falciparum

Toxoplasma gondii APICOMPLEXES

Paramecium caudatum

Tetrahymena thermophila CILIES

Stylonychia lemnae

Cryptosporidium parvum

0,1

Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion

Bloom àNoctiluca scintillans,

près de Cape Rodney, Hauraki Gulf,

Nouvelle-Zélande

Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion

Bibliographie

Chambouvet A, Guillou L (2009) Les Amoebophrya, parasitoïdes de dinoflagellés toxiques. Consulté sur http://www.sb-roscoff.fr/Phyto/index.php?option=com_content&task=view&id=82&Itemid=136#Pub2009 en novembre 2010

Guillou L, Viprey M, Chambouvet A, Welsh RM, Kirkham AR, Massana R, Scanlan DJ, Worden AZ (2008) Widespread occurrence and genetic diversity of marine parasitoids belonging to Syndiniales (Alveolata). Environ Microbiol 10: 3349-3365

Kim, S., Park, M.G., Kim, K.-Y., Kim, C.-H., Yih, W., Park, J.S., and Coats, D.W. (2008) Genetic diversity of parasitic dinoflagellates in the genus Amoebophrya and its relationship to parasite biology and biogeography. J Eukaryot Microbiol 55: 1–8

Montagnes DJS, Chambouvet A, Guillou L, Fenton A (2008) Responsibility of microzooplankton and parasite pressure for the demise of toxic dinoflagellate blooms. Aquat Microb Ecol 53: 211-225

Saldarriaga, J.F., McEwan, M.L., Fast, N.M., Taylor, F.J.R., and Keeling, P.J. (2003) Multiple protein phylogenies show that Oxyrrhis marina and Perkinsus marinus are early branches of the dinoflagellate lineage. Int J Syst Evol Microbiol 53: 355–365.

Images : Diapositive de présentation : http://www.smhi.se/oceanografi/oce_info_data/plankton_checklist/dinoflagellates/amoebophrya_ceratii.gifDiapositive de conclusion : http://citoyen.onf.ca/blogs/wp-content/uploads/2008/08/red_tide_generav3.jpg

Amoebophrya ceratii

Merci de votre attention !