kedvenc természettudósom: nikolaus rajewsky…
Post on 24-Feb-2016
40 Views
Preview:
DESCRIPTION
TRANSCRIPT
Kedvenc Természettudósom:Nikolaus Rajewsky…
„a microRNS Pápa”
Szabó Péter M., Informatikai Kar Eötvös Lóránt Tudományegyetem,Budpest
A bioinformatika születése
A molekuláris biológia és az informatika határterülete
Az új módszerekkel előállított hatalmas kísérletes adat feldolgozása csak informatikai módszerekkel képzelhető el.
Az első kézzelfogható eredménye az emberi DNS szekvenálása a Human Genome Project (HGP) volt.
Human Genome Project
A DNS szerkezeteAz emberi sejtekben a dezoxiribonukleinsav (DNS) molekula elkülönülve a sejt többi alkotórészétől a sejtmagban található.
A DNS egy adathordozó molekula, amely: két konstans vázszerkezetből És az őket összekötő variábilis, kódoló
molekulákból, nukleotidokból áll.
A kód négyféle értéket vehet fel: alanin (A) timin (T) citozin (C) uracil (U).
A DNS szerkezete
…a két DNS szál kódja pontosan a egymás „fordítottja” vagyis komplementere.
A két DNS-szálat a nukleotidok csak abban az esetben kapcsolják össze, ha az ekvivalens pontokon az adenin timinnel, a guanin pedig a citozinnal kapcsolódhat össze. Ezért...
GTC T
GT T
G GG GTT
AC
AC C T T
G A
A AC
A AC CC C
AAGC T
GT
G G A AC T
GénDefiníció szerint, fehérjét kódoló DNS szakasz.
Egy egyén minden sejtje ugyanazt a DNS-t tartalmazza, mégis óriási különbségek mutatkoznak azonos gének működésében az egyes sejttípusok között
A teljes emberi genom (DNS-kód) körülbelül 22000 gént tartalmaz, annak nagyjából 1 %-át teszik ki.
A teljes génállomány működtetésére egyedül a petesejt és egyes őssejtek képesek…
Génexpresszió
A AC
ACC
AAGC U
GU
GTC T
GT T
G GG GTT
AC
AC C T T
G A
A
A gének expressziója során egy messenger (hírvivő) RNS (mRNS) készül a gént tartalmazó DNS-szakaszról.
Az mRNS molekula a lemásolt DNS szakasz komplementer párja, néhány apró különbséggel, például benne a timint (T) uracil (U) helyetesíti.
DNS
RNS
22283 gén expressziója 26 egészséges emberi
szövetben(forrás: Gene Expression Omnibus)
alacsony expresszió
nincs mérhető expresszió
magas expresszió
(„magas”, „alacsony” vagy „azonos” a mediánhoz viszonyítva)
azonos expresszió
Génexpresszió
A sejtben jelenlévő egyetlen gént átírásával hatalmas mRNS kópiaszám jöhet létre, illetve az expresszió kikapcsolásával számuk minimálisra csökkenhet.
A gének expressziójának fokát a róluk átíródó mRNS molekulák mennyisége határozza meg.
A dekódolás a sejtmagon kívül történik, az mRNS-t fehérjék szállítják a riboszómákhoz, melyek a sejtek „fehérje gyárai”.
mRNS molekulák transzlációja(fordítása fehérjékké)
Az mRNS molekulák leolvasása során az olvasási keret három egymást követő nukleotidot (kodont) feletet meg egy aminosavnak.
Összesen 43 = 64 variáció képzelhető el. A fehérjéket húszféle aminosav építheti fel, így egyeseknek több kodon is megfeleltethető.
Létezik továbbá 2 STOP kodon (UAA, UAG), illetve a sorban az első AUG kód a START.
mRNS molekulák transzlációja:A kodonok jelentései
Nukleotidok rövidítései, és pozíciójuk
Kodonok
Aminosavak rövidítései
ACUAUGAUUCGCGGCAGCGCCCCGGCGGGAAAAUUAUAG
START
Met IleArg
Gly
UCG
Ala
GGG
Pro
RiboszómamRNS
mRNS molekulák transzlációja
…de ki az a Rajewsky?
…de mi az a mikroRNS?
http://people.inf.elte.hu/szpqabi/rajewsky
top related