agi phd 3 printelni vegso x - sci.u-szeged.hu

90
Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálata Ph.D. értekezés Czibula Ágnes Témavezetı: Dr. Raskó István MTA Szegedi Biológiai Központ Genetikai Intézet Biológiai Ph.D. Iskola, SZTE TTIK SZEGED 2010

Upload: others

Post on 17-Nov-2021

1 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálata

Ph.D. értekezés

Czibula Ágnes

Témavezetı: Dr. Raskó István

MTA Szegedi Biológiai Központ Genetikai Intézet

Biológiai Ph.D. Iskola, SZTE TTIK

SZEGED

2010

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

2

TARTALOMJEGYZÉK

RÖVIDÍTÉSEK JEGYZÉKE ............................................................................................................................. 4

IRODALMI ÁTTEKINTÉS ................................................................................................................................ 6

GENETIKAI MEGKÖZELÍTÉSEK AZ EMBERI BETEGSÉGEK ÖRÖKLETES TÉNYEZİINEK FELTÁRÁSÁRA .................... 6

AZ IDIOPATHIÁS SCOLIOSIS DEFINÍCIÓJA ............................................................................................................. 9

Az AIS klinikai tünetei .................................................................................................................................. 10

Cobb fok meghatározása .............................................................................................................................. 11

A gerincferdülés terápiája ........................................................................................................................... 12

A gerincferdülés epidemiológiája ................................................................................................................ 13

Az idiopathiás scoliosis etiológiája .............................................................................................................. 13

Strukturális eltérések ................................................................................................................................................. 14

Neurológia rendellenességek ..................................................................................................................................... 16

Növekedési és biomechanikai hatások ...................................................................................................................... 16

Vérlemezkék rendellenességei .................................................................................................................................. 17

Hormonok szerepe az AIS-ben .................................................................................................................................. 18

Genetikai tényezık .................................................................................................................................................... 19

Az etiológiai teóriák összegzése ................................................................................................................... 22

AZ ÉRTEKEZÉS SZEMPONTJÁBÓL KIEMELTEN FONTOS ETIOLÓGIAI FAKTOROK .................................................. 23

Leptin ........................................................................................................................................................... 23

Leptin szerepe a csonttömeg szabályozásban ............................................................................................................ 24

Leptinszint nemek közötti különbsége ...................................................................................................................... 26

Polimorfikus helyek vizsgálat a LEP gén szabályozó régiójában .............................................................................. 26

Leptin és az AIS ........................................................................................................................................................ 28

Az interleukin 6 ............................................................................................................................................ 28

Az IL6 szerepe a csontátépítésben............................................................................................................................. 29

Polimorfikus helyek vizsgálat az IL6 gén szabályozó régiójában ............................................................................. 30

Az IL6 és az AIS ....................................................................................................................................................... 31

CÉLKITŐZÉSEK .............................................................................................................................................. 33

ANYAGOK ÉS MÓDSZEREK......................................................................................................................... 34

KÍSÉRLETBE BEVONT SZEMÉLYEK ADATAI ÉS MINTÁI ....................................................................................... 34

DNS ALAPÚ MUNKAFOLYAMATOK ................................................................................................................... 35

Genomikus DNS tisztítása ............................................................................................................................ 35

SNP-k kimutatása PCR-RFLP módszerrel ................................................................................................... 35

RNS ALAPÚ MUNKAFOLYAMATOK ................................................................................................................... 37

RNS izolálás ................................................................................................................................................. 37

Northern gél elektroforézis .......................................................................................................................... 37

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

3

RNS mintacsoportok tisztítása ..................................................................................................................... 38

Fluoreszcensen jelölt próba készítése a microarray hibridizáláshoz........................................................... 39

A cDNS és a 3DNA hibridizációja a CHIP-hez ........................................................................................... 40

A hibridizáció utáni kiértékelés .................................................................................................................... 41

Valós idejő kvantitatív polimeráz láncreakció (QRT-PCR) ......................................................................... 42

STATISZTIKAI ANALÍZIS .................................................................................................................................... 43

A MUNKA SORÁN HASZNÁLT FONTOSABB ONLINE BIOINFORMATIKAI ESZKÖZÖK ÉS ADATBÁZISOK INTERNET

CÍMEI: ............................................................................................................................................................... 44

EREDMÉNYEK ................................................................................................................................................. 45

PARAVERTEBRÁLIS IZMOK RNS KIFEJEZİDÉSI MINTÁZATÁNAK VIZSGÁLATA CHIP MICROARRAY-VEL .......... 45

EGÉSZSÉGES ÉS SCOLIOSISOS BETEGEK IZOMBIOPSZIÁJÁNAK GÉNKIFEJEZİDÉSBELI ÖSSZEHASONLÍTÁSA ........ 45

SCOLIOSISOS BETEGEKBEN A GERINCOSZLOP KÉT OLDALÁRÓL SZÁRMAZÓ IZOMBIOPSZIÁK

GÉNKIFEJEZİDÉSBELI ÖSSZEHASONLÍTÁSA ....................................................................................................... 49

PARAVERTEBRÁLIS IZMOKBAN KIFEJEZİDİ MRNS-EK VIZSGÁLATA QRT-PCR-REL ....................................... 53

POLIMORFIKUS HELYEK VIZSGÁLATA ............................................................................................................... 55

Leptin promóter G-2548A polimorfizmusa .................................................................................................. 55

IL6 promóter C-174G polimorfizmusa ........................................................................................................ 57

A két polimorfizmus IS kialakulására hajlamosító együttes hatásának vizsgálata ...................................... 58

A polimorfizmusok hatása az IS súlyosbodására ......................................................................................... 60

EREDMÉNYEK MEGVITATÁSA .................................................................................................................. 61

IRODALOMJEGYZÉK .................................................................................................................................... 67

KÖSZÖNETNYILVÁNÍTÁS ............................................................................................................................ 78

ÖSSZEFOGLALÁS ........................................................................................................................................... 79

SUMMARY ......................................................................................................................................................... 83

KÖZLEMÉNYEK LISTÁJA ............................................................................................................................ 87

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

4

RÖVIDÍTÉSEK JEGYZÉKE

ACAN agrecan AIS adolescens idiopathiás scoliosis, serdülıkori, ismert ok nékül kialakuló

gerincferdülés BMP4 bone morphogenetic protein 4 C/EBP CCAAT/enhancer binding protein CART cocaine- and amphetamine-regulated transcript CDK5 cyclin-dependent kinase 5 CHD7 chromodomain helicase DNA binding protein 7 CHRDL1 chordin-like 1 CI confidence interval, megbízhatósági mérettartomány COL collagen DEPC diethylpyrocarbonate DST dystonin EDTA ethylenediaminetetraacetate EEG elektro-enkefalográf ER estrogen receptor EST expressed sequence tag FBN fibrillin FGF fibroblast growth factor FOXO 1 forkhead box O1 GDF growth differentiation factor GHR growth hormone receptor GLM Generalizált Lineáris Model GO génontológia GPC glypican HIF-1 hypoxia inducible factor 1 HOX7 msh homeobox 1 HPRT hypoxanthine phosphoribosyltransferase 1 HS3ST3 heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase, HWE Hardy-Weinberg egyensúly IGF insulin-like growth factor receptor IL4R interleukin 4 receptor IL6 interleukin-6 IRX iroquois homeobox IS idiopathiás scoliosis, ismert ok nékül kialakuló gerincferdülés JAK1 Janus kinase 1 KCNA potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily LD linkage disequilibrium , kapcsoltsági kiegyenlítetlenség LEP leptin LMNA lamin A MATN matrilin MDR Multifaktoros Dimenzionalitás Redukció

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

5

MFAP microfibrillar associated protein ML maximum likelihood MOPS 3-(N-morpholino)propanesulfonic acid MTNR melatonin receptor NLRP12 NLR family, pyrin domain containing 12 NOS nitric oxide synthase NP nucleus pulposus NTF neurotrophin OMIM Online Mendelian Inheritance in Man OR odds ratio, esélyhányados PCR polymerase chain reaction, polimeráz láncreakció PCR-RFLP polymerase chain reaction based restriction fragment length polymorphism POSTN periostin PRKAG2 protein kinase, AMP-activated, gamma 2 non-catalytic subunit alfa 1 QRT-PCR quantitative real time polymerase chain reaction, valós idejő kvantitatív

polimeráz láncreakció RANK NF-κβ activator RANKL NF-κβ receptor activator ligand SAGE Serial Analysis of Gene Expression SDS Sodium dodecyl sulfate SH3GL1 SH3-domain GRB2-like 1 SLC2A1 solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 1 SNP single nucletide polimorphism, egypontos nukleotid-polimorfizmus SNS sympathetic nervous system SNTG syntrophin SRS Scoliosis Research Society SSC saline-sodium citrate TNS1 tensin 1 UTR untranslated region, nem transzlálódó régió VDR vitamin D receptor

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

6

IRODALMI ÁTTEKINTÉS

Az orvostudomány egyik nagy és napjainkban egyre nagyobb jelentıségő feladata a

betegségek hátterében álló örökletes tényezık felderítése. A tudás birtokában lehetıvé válik a

betegség kialakításáért felelıs molekuláris mechanizmusok megismerése és ezáltal célzott

terápia kialakítása. Természetesen nagyon hosszú az út a labortól a betegágyig; több

tudományterületen dolgozó sok kutató és sok orvos munkájára van szükség ahhoz, hogy egy

terápia vagy gyógyszer a betegségben szenvedık gyógyulását jelenthesse. A személyre

szabott orvosláshoz az elsı lépés a betegség pathomechanizmusának feltárása és ebben

sarkalatos pont a betegséget okozó, vagy az arra hajlamosító gének leírása.

Genetikai megközelítések az emberi betegségek örökletes tényezıinek

feltárására

A humángenetika alapjait jelentı öröklıdési mechanizmusok egy részét már jóval a

gének természetének megismerése elıtt leírták. 1866-ban Gregor Mendel által publikált

öröklıdési törvények az emberi betegségek egy részének az öröklıdésére is igazak; a mai

napig az egyetlen gén hibájából kialakuló betegségeket mendeli öröklıdéső betegségeknek

nevezik a szakirodalomban. 1911-ben kezdıdött meg az emberi kapcsoltsági csoportok

leírása annak a megfigyelésével, hogy színtévesztés ugyanúgy öröklıdik, mint az X

kromoszóma. Az 1970-es években kifejlesztették a kromoszóma festés módszerét, ami

lehetıvé tette az autoszomális kromoszómán elhelyezkedı gének öröklıdésének követését.

Ugyanebben az évtizedben klónozták az elsı humán gént, a β-globint, és kimutatták, hogy a

β-globin lánc 6. aminosavának cseréje okozza a sarlóssejtes vérszegénységet. Ez volt az elsı

humán betegség, aminek meghatározták a genetikai okát. 1976-ban pedig már rendelkezésre

álltak azok a DNS próbák, melyekkel prenatális diagnosztikát lehetett végezni a

vérszegénység kimutatására. 1994-ben 600, 2001-ben 1112, napjainkban pedig az OMIM

adatbázis 2010. márciusi adata alapján, 3063 mendeli módon öröklıdı betegség génje ismert

(Peltonen and McKusick, 2001; Rasko, 1994).

Az új évszázadban a monogénes betegségek kutatásáról a bonyolultabb, nem mendeli

öröklıdésmenető betegségek felé fordult a figyelem, amiket komplex betegségeknek

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

7

neveznek, mivel több gén a környezeti hatásokkal kölcsönhatásban alakítja ki ıket. A

komplex betegségek a társadalom nagyobb részét érintik, mint a ritkán elıforduló monogénes

betegségek; ide tartoznak többek között a szív- és érrendszeri betegségek, a cukorbetegség és

a pszichiátriai betegségek nagy része.

A betegségeket okozó gének felderítésére alapvetıen két módszert használnak: a

kapcsoltsági analízist és az asszociációs vizsgálatokat. A kettı között a lényegi különbség az,

hogy a kapcsoltsági analízis a családfa elemzésekkel lokuszokat kapcsol a betegséghez, míg

az asszociációs vizsgálatokban populációk összehasonlításával egy gén valamelyik allélját

kötik az adott betegségekhez. Mindkét analízis használható mind a „reverz” mind „forward”

genetikai megközelítéssel. A „reverz” genetikai megközelítés szerint véletlenszerő, anonim

markerekkel végzik a vizsgálatot és utána keresik meg a jelölt markerrel fizikai kapcsolatban

lévı, betegséget okozó lokuszt, míg a „forward” genetikával a betegséggel valamilyen ok

alapján kapcsolatba hozható gén (kandidáns gén) polimorfizmusát vizsgálják.

A kapcsoltsági analízist a mendeli öröklıdéső betegségek vizsgálatára használták nagy

sikerrel, komplex betegségek esetén kevésbé alkalmazható ez a módszer, mivel csak a nagy

hatású géneket tudták vele azonosítani. Ennek oka a komplex betegségek jellegzetességeiben

rejlik. Elıször is a betegség fenotípusos megjelenése, kialakulásának idıpontja, súlyossága

nagyon eltérı, ami mögött a hasonló tüneteket okozó, de molekuláris folyamataiban

különbözı pathomechamizmus állhat. Másrészrıl a komplex betegségeket nem egy, hanem

több, alacsony penetranciájú, viszonylag kis kockázatú gén okozza, ráadásul a fenotípus

kialakulását még környezeti tényezık is befolyásolják.

Az asszociációs vizsgálatok használata a humángenetikusok leggyakrabban alkalmazott

módszerévé vált, amit a Human Genom Program befejezıdése után beindult HapMap projekt

adatainak felhasználása tesz alkalmassá a komplex betegségek vizsgálatára. A kapcsoltsági

kiegyenlítetlenségen alapuló térképezés (linkage disequilibrium maping, LD) az asszociációs

vizsgálatok „reverz” genetikai megközelítése. Azon a feltételezésen alapul, hogy betegségre

hajlamosító allél a közvetlen szomszédságában lévı polimorfikus helyekkel együtt öröklıdik,

míg a tıle távolabb lévı polimorfizmusok a betegséget okozó mutáció kialakulása óta eltelt

idıben, a rekombináció miatt, kapcsoltsági egyensúlyba kerülnek. A kapcsoltsági

kiegyenlítettlenséget statisztikai eszközökkel mutatják ki. A polimorfizmusok közül az

asszociációs vizsgálatra a legalkalmasabbak az egypontos nukleotid-polimorfizmusok (SNP),

melyek az emberi genetikai variációk 90%-át jelentik és átlagosan minden 300 bp-nyi DNS

szakaszon egy elıfordul belılük. Az LD térképezés alkalmas a kandidáns gén kiválasztására,

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

8

amit aztán további asszociációs vizsgálatokban az immár a „forward” genetikai megközelítés

szerint vizsgálhatnak.

A komplex betegségek epidemiológiai kutatásaiban a patológiás eltéréseket kísérı

génexpressziós változások vizsgálata a technikai tudásunk fejlıdése után válhatott a jelölt

gének kiválasztásának új módszerévé napjainkban. A századforduló környékén a

hibridizáláson és a szekvenáláson alapuló génexpressziós vizsgálatok vonatkozásában is átütı

technológiai újítások történtek. Egyrészrıl a DNS microarray vagy DNS chip technika

elterjedése, amely során egyetlen hibridizálási lépésben egy tárgylemeznyi területen több

tízezer mRNS analizálható egyszerre (1. ábra) (DeRisi et al., 1996), másrészrıl a

szekvenáláson alapuló nagy kapacitású módszerek kifejlesztése (Serial Analysis of Gene

Expression-SAGE, Next Generation Sequencing) adtak lehetıséget a transzkriptoma szintjén

történı változások detektálására. Bioinformatikai adatfeldolgozás és körültekintı statisztikai

elemzések után lehet olyan géneket kiválasztani, amelyek további vizsgálatokra érdemesek.

A kandidáns gének alléljainak elıfordulási gyakoriságát a beteg és az egészséges

kontroll populációban az ún. eset-kontroll tanulmányokban hasonlítják össze. Amennyiben

valamely allél elıfordulási gyakorisága szignifikánsan magasabb a beteg populációban, akkor

az adott gén, adott allélját a betegségre hajlamosítónak tekintik.

1. ábra cDNS-chipek alkalmazása génexpressziós mintázatok nyomonkövetésére

Jelen dolgozat egy komplex betegség, az idiopathiás scoliosis genetikai hátterét kutatja

a DNS chip technikán alapuló kandidáns gén kiválasztása után, „forward” genetikai

megközelítéssel, eset-kontroll asszociációs tanulmányban.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

9

Az idiopathiás scoliosis definíciója

A gerincoszlop betegségei a két lábon járás óta érintik az emberiséget. A gerinc

oldalirányú elhajlását Hippocrates írja le elıször, melyet izomproblémának tekint. Celsus -a

Krisztus utáni I. században- a gerincdeformitások kezelésére a tornáztatást javasolja. Az

orvostudományban a gerincnek a tér mindhárom irányába történı elferdülésére Galenus a II.

században a scoliosis nevet adta, ami a görögül azt jelenti, hogy görbe, ferde. A XIX. század

közepén Bauer írja le elıször a betegség súlyos tünetekkel járó, fiatalkorban manifesztálódó

formáját, és idiopathiás scoliosisnak nevezi. 1966-ban megalakul a gerincferdülésekkel

foglalkozó orvosokat, kutatókat nemzetközi szinten összefogó szervezet, a Scoliosis Research

Society (SRS) és definíciója alapján az idiopathiás scoliosis (IS) a gerinc ismeretlen okból

létrejövı strukturális laterális elhajlása minimum 10°-os Cobb szöggel (normális görbülettıl

való eltérés fokban kifejezve) és megegyezı csigolya rotációval.

Raffaello: A három grácia, (1498 körül). A középen álló grácián jobbra konvex

scoliosis látszik (Musée Condé, Chantilly)

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

10

A gerincferdülések egy része nem stukturális (tartási, kompenzációs scoliosis), vagy csak

átmenetileg (pl. gyulladás miatt) kialakuló strukturális gerincdeformitás, nagyobb részüket

azonban szerkezeti eltérések jellemzik, ezért strukturálisak. A strukturális scoliosisok egy

része veleszületett rendellenesség, más részük valamilyen más szindrómához társultan

jelentkezik (pl. neuromuszkuláris betegségekhez, kötıszöveti betegségekhez,

neurofibromatosishoz) és nagy részük kialakulásának az oka nem ismert.

A gerincferdülések 70-80%-át a strukturális idiopathiás scoliosis adja, melynek a megjelenés

ideje alapján három különbözı típusa különíthetı el: infantilis (0-3 életév), juvenilis (4-9 év),

adolescens (10-18 év). A zárójelben lévı évszámok a betegség kezdetét jelzik, de a

csontosodás állapotától függıen kissé eltérhetnek a megadott értéktıl.

Vizsgálataink során a leggyakrabban elıforduló, és ezért a kutatások homlokterében

álló adolescens idiopathiás scoliosisra (AIS) fókuszáltunk.

Az AIS klinikai tünetei

Gyermekkorban a deformitás az egyetlen tünet, ekkor fájdalom

még nem jelentkezik. Aszimmetrikus a nyak-váll vonal, a

lapockák vonala, a bordák és a csípılapátok elhelyezkedése. A

konvex oldalon a nyak-váll vonal és a lapocka magasabban áll,

utóbbi a törzstıl elemelkedik.

2. ábra Scoliosisos nıbeteg

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

11

A deformitás a gerinc több régióját is érintheti. A háti görbület a leggyakrabban elıforduló,

míg a nyaki vagy a medencei régió ritkán deformálódik. Az esetek 90%-ban a jobbra konvex

dorzális (háti) scoliosis fordul elı (2. ábra).

Cobb fok meghatározása

A klinikai vizsgálatok során nagyon fontos a mellkas röntgen

felvétele és az alapján az ún. Cobb fok meghatározása. A Cobb˚

a gerinc görbületének mértékét adja meg és fontos a további

diagnosztikában, illetve a megfelelı terápia kiválasztásában.

A mellkas anteroposterior felvételén láthatóvá válik a frontális

síkú elhajlás mértéke. A Cobb˚meghatározásakor az alsó és felsı

végcsigolyák görbület csúcsától távolabb esı zárólemezével

párhuzamos vonalra egy-egy merılegest húzunk, és az általuk

bezárt szög adja a görbület mértékét (3. ábra).

Nagyon fontos a görbület mértékének meghatározása a scoliosis megjelenésekor, mert a

betegség mindaddig progrediálhat, amíg a csontosodás be nem fejezıdik, tehát minél

fiatalabb a gyerek és minél nagyobb a növekedési potenciálja, valamint minél súlyosabb a

deformitás az észlelés pillanatában, annál nagyobb eséllyel fog tovább romlani a görbület

mértéke.

A korai iskolai szőréseken az Adam tesztet használják a gerincferdülés korai stádiumban

történı felfedezéséhez, melynek során a vizsgáló iskolaorvos megkéri a gyermeket, hogy

törzsben hajoljon elıre, térdben ne hajlítson, a karjait engedje szabadon lógni, és

megvizsgálja, hogy nincs e borda- vagy paravertebrális izom elıemelkedés. Hazánkban

évente mintegy 450 új esettel kell számolni, melyek közül 150 gyermeknek van szüksége

orthopédiai kezelésre.

3. ábra A röntgen felvételen

egy 62 Cobb˚-os scoliosisos

gerincoszlop látszik

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

12

A gerincferdülés terápiája

A scoliosisos beteg kezelését befolyásolja a beteg

életkora -biológiai és csontkor-, a görbület típusa és

lokalizációja.

A konzervatív kezelés célja a progresszió lassítása.

Ebbıl a célból gyógytorna, ill. főzı viselése javasolt.

Speciális gyógytorna elsajátítása gyógytornász

segítségével, melyet a beteg késıbb otthonában

végezhet, lehetıleg mindennap. Ajánlott kiegészítı

testmozgás az úszás, mely a gerincoszlop csökkent

gravitációs terhelése mellett mindkét testfél izomzatát

egyformán terheli. Az iskolai tornaóra alól csak a

súlyosabb esetekben szükséges felmentés, enyhébb

formáknál csak a kritikus feladatokat kell mellızni. Ma

már csak az esztétikailag elfogadható alacsony profilú

főzıket alkalmazzák. Főzı viselése javasolt 15-40

Cobb˚ között, és ha a nagyfokú görbület ellenére a

mőtét valamely okból ellenzett.

Mőtéti kezelés szükséges, ha az ágyéki görbület meghaladja a 30 Cobb fokot, vagy a háti

görbület a 40 Cobb fokot. Hatalmas elırelépést jelentett, és alapvetıen új lehetıségeket

teremtett a gerincdeformitások kezelésében Yves Cotrel és Jean Dubousset munkássága, akik

1983-ban új megközelítéső multiszegmentális rögzítést biztosító korrekciós eszközt vezettek

be a kezelésbe. A mőtéti technika forradalmasította a gerinc deformitások sebészetét. A

technika alapja, hogy a deformált gerincet több helyen horgokkal rögzítik a kívánt fiziológiás

görbületeknek megfelelıen meghajlított rúdhoz, majd a mőtıasztalon a rúd 90°-os

elforgatásával korrigálják az oldalirányú deformitást, így kialakulnak a fiziológiás

görbületek. Kb. 3 hónappal a mőtét után az elmerevített csontos gerincszakasz átveszi a

terhelést a fém rúdtól.

4. ábra Nicolas Andry ortopédiai

szakkönyv illusztrációja, Párizs 1741

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

13

A gerincferdülés epidemiológiája

A kismértékő (Cobb˚<10) gerincferdülés elıfordulási gyakorisága 1.5-3%, a 20 Cobb˚

értéket meghaladóé 0.3-0.5% és a nagymértékő (Cobb˚>30) gerincdeformitásé 0.2-0.3%. A

10-16 évesek körében a legmagasabb az idiopathiás scoliosis elıfordulási gyakorisága, a

gyerekek 2-4%-ánál figyelhetı meg. Az alacsony 10 Cobb˚ körüli deformitás esetén a fiúk és

a lányok aránya egyenlı, ám a 30 Cobb˚ feletti görbületeknél a lányok aránya tízszeres

(Roach, 1999). Magyarországon az 1970-es években Dr. Bellyei Árpád határozta meg az AIS

prevalenciáját, a 14 éven felüliekben 0.51-0.54 ±0.05%-ban fordult elı a gerincferdülés és a

10 Cobb˚ görbületet meghaladó idiopathiás scoliosisos betegek 0.29 ± 0.035%-ban voltak

jelen hazánkban (Bellyei et al., 1977). További vizsgálatok kimutatták, hogy a lányok aránya

3.4-szer magasabb a fiúkénál a 10 Cobb˚ görbületet meghaladó esetekben. A betegek

családját is megvizsgálva azt találták, hogy az elsıfokú rokonok 8.34±0.37%-ban érintettek,

másod és harmadfokú rokonok pedig 2.0±0.17% illetve 0.87±0.07%-ban. Amennyiben

mindkét szülı érintett volt, akkor a gyerekek 40%-ánál, ha csak az egyikük volt az, akkor

pedig 29.3 %-uknál jelent meg az AIS (Czeizel et al., 1978).

Az ikertanulmányok eredményei azt mutatták, hogy a egypetéjő ikrek között 73%, a

kétpetéjőek között 36%-os az együttes elıfordulás (konkordancia) (Kesling and Reinker,

1997).

Az idiopathiás scoliosis etiológiája

Az idiopathiás scoliosis etiológiájának tisztázására az elmúlt 40 év alatt sok próbálkozás

történt, számos területen keresték a deformitás kialakulásának okát. A fenotípusos megjelenés

is heterogén, eltérı például a kialakulás ideje, a progresszió mértéke és sebessége,

valószínőleg több különbözı patomechanizmus is eredményezheti ugyanazt a klinikai képet.

Világossá vált, hogy egy komplex és valószínőleg multifaktoriális folyamatról van szó. A

betegség kialakulásának okai között a genetikai faktor jelenléte általánosan elfogadott, bár az

öröklıdés módja kétséges.

Mivel az esetek döntı többségében a gerincferdülés kialakulása a serdülıkorra tehetı, a

növekedéssel kapcsolatos hormonális, metabolikus és biomechanikai változások is szerepet

játszhatnak az etiopathogenézisben, különösen a lányoknál a rövidebb idı alatt és gyorsabban

lezajló fejlıdés miatt. Az etiológiai kutatások az alábbi területen folynak:

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

14

1) Strukturális eltérések

A. Csontszöveti eltérések

B. Kötıszöveti eltérések

C. Harántcsíkolt izom szerkezeti eltérései

2) Neurológia rendellenességek

3) Növekedés és biomechanikai hatások

4) Vérlemezkék eltérései

5) Hormon háztartás

6) Genetikai tényezık

Strukturális eltérések

A. Csontszövet rendellenességek

Elıször 1982-ben Burner munkacsoportja talált összefüggést a csökkent csontsőrőség és az

idiopathiás scoliosis között és azóta több kutatócsoport is végzett hasonló méréseket (Burner,

III et al., 1982). A csontsőrőség mérési adatok összességében azt mutatják, hogy csont

ásványsőrősége csökkent az IS-es betegekben a korban egyeztetett kontroll populációhoz

képest, de nem bizonyítja, hogy a gyengébb csontminıség a kiváltó oka vagy okozata-e a

gerincferdülésnek (Li et al., 2008). Csigolya-tövisnyúlványból és a csípıcsontból származó

csontmintákon végzett szövettani kísérletekben azonban azt tapasztalták, hogy az IS

betegekben az oszteoklasztok száma csökkent, miáltal a csontátépítés dinamikája is csökkent.

Az abnormális csont metabolizmus megzavarhatja a növekedést így okozója lehet az AIS-es

betegek 20-38%-ában megfigyelt csontritkulásnak, ami akár elsıdleges kiváltó oka is lehet a

scoliosisnak (Cheng et al., 2001).

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

15

B. Kötıszöveti rendellenességek

A biomechanikai egységként értelmezett gerincoszlop funkcionális stabilitásáért a

kollagénekbıl, proteoglikánokból, elasztikus rostokból és egyéb extracelluláris mátrix

elemekbıl álló kötıszöveti elemek is felelısek. Ebbe a csoportba tartoznak a csigolyák

közötti porckorongok és a csigolyákat összefőzı hosszanti szalagpántok. Mivel több olyan

kötıszöveti rendellenesség (pl. Marfan szindróma) mellé is társulhat gerincferdülés,

feltételezhetı, hogy e szövetek eltérései az AIS kiváltó okaként is szerepelhetnek. Az AIS-es

betegek 82%-ában valóban találtak eltéréseket a ligamentum flavum fibrillin

rostszerkezetében, azonban nem igazolt, hogy az idiopathiás scoliosisos betegeknél

generalizált kötıszöveti rendellenesség állna fent (Kouwenhoven and Castelein, 2008). A

porckorongokat illetıen is számos tanulmány jelent meg , ám eredményeik nem egyöntetőek.

Carl Nicoladoni német sebész professzor már 1904-ben felfigyelt arra, hogy a porckorong

alakja a scoliosis korai fázisában, még a csigolyák alakjának változása elıtt ék alakúvá válik.

Többen leírták, hogy a ferde gerincbıl származó porckorong kocsonyamagja a görbület

konvex oldalára tolódik és belsı szerkezete is megváltozik, valamint proteoglikán és kollagén

tartalma is eltérıvé válik (Pedrini et al., 1973; Stokes and Aronsson, 2001). Egyes

kutatócsoportok ezeket az eredményeket vitatják, mások megerısítik, de az általánosan

elfogadott vélemény szerint a porckorongokban megfigyelt eltérések inkább a görbült

gerincben fellépı egyenetlen terhelés következményei és nem a gerincferdülés

kialakulásának okai (Oegema, Jr. et al., 1983; Roberts et al., 1993; Cheung et al., 2008).

C. Harántcsíkolt izom eltérések

Mivel a paravertebrális izmok ereje tartja a gerincoszlopot függıleges állapotban és több,

az izmok felépítését és az izomfunkciót érintı betegségben másodlagosan kialakul a

gerincferdülés, igen korán, már a XIX. században felmerült a kérdés, hogy neuromuszkuláris

elégtelenség okozza-e a gerincdeformitást (Kouwenhoven and Castelein, 2008). Hisztokémiai

vizsgálatok alapján Spencer és Eccles írta le elıször, hogy az IS-es betegek paravertebrális

izmaiban a gerincoszlop két oldalán eltérı a különbözı izomrostok (I-es típusú-lassú és II-es

típusú- gyors) aránya, oly módon, hogy a II-típusú izomrostok száma lecsökkent a konvex

oldalon (Spencer and Eccles, 1976). További megfigyelések igazolták, hogy nem csak a

mélyizmokban, hanem a felszíni izmokban is, a konvex oldalon az I-es típusú izomrostok

aránya magasabb a konvex oldalon, így a konvex oldalon megnövekedett izomaktivitás

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

16

szerepet játszhat a gerincferdülés kialakításában. Az elmúlt évek során elektromyográfiás

aktivitásmérésekkel is alátámasztották a konvex oldali dominanciát és kimutatták, hogy a

görbület progresszivitása is összefügg az izomaktivitással (Cheung et al., 2005a). Az

izomrendellenességek gerincferdülés kialakulásában játszott esetleges szerepe még távolról

sem tisztázott és annak ellenére, hogy a legtöbb kutató úgy gondolja, hogy az izomerı

egyenetlenség a görbült gerinc kompenzálása miatt alakult ki és következménye nem pedig

oka a gerincferdülésnek, további vizsgálatok szükségesek a kérdés megnyugtató lezárásához.

Neurológia rendellenességek

A gerincferdülések egy része neuromuszkuláris rendellenesség fennállása során fejlıdik

ki a szindrómás scoliosisos betegekben, ami felveti az esetleges idegrendszeri hibát az AIS

vonatkozásában is. A mai napig nem tisztázott, hogy az AIS-sel együtt megjelenı neurológiai

rendellenességek szerepet játszanak-e az idiopathiás scoliosis kialakulásában. Az IS-es

gyerekekben enyhe eltérések mutathatók ki az EEG aktivitásban, a testhelyzet uralásában

valamint a szomatoszenzoros neurológiai funkciókban (Kouwenhoven and Castelein, 2008).

Legújabb kutatások szerint, amelyekben 3 dimenziós mágneses rezonancia képalkotó

eljárások segítségével 99 neuroanatómiai agyterület nagyságát hasonlították össze 20 AIS-es

és 26 korban, nemben egyeztetett kontroll személy analízisével, a vizsgált agyterületek

mintegy negyedénél eltéréseket találtak a két csoport között (Liu et al., 2008). A

gerincferdülés kialakulásának lehetséges okát a Roth, illetve Porter által megalkotott

koncepció szerint, a gerincoszlop és a gerincvelı növekedési ütemének eltérése jelenti; ezek

nincsenek egymással szinkronban és a rövidebb velı magával húzza az egyébként normális

morfológiájú csontos szerkezetet, ezáltal alakítva ki gerincdeformitást (Roth, 1968; Porter,

2001a).

Növekedési és biomechanikai hatások

Az AIS kialakulása és progressziója egyértelmően a serdülıkorhoz köthetı, amikor a

növekedés a legintenzívebb. A lányokban a felgyorsult gerincnövekedés egy évvel korábban

kezdıdik, mint a fiúknál és gerincferdülésük is hamarabb alakul ki, a gerincferdülés

progressziója pedig gyorsabb és nagyobb fokú. Azt is megfigyelték, hogy a nagyobb

görbülettel rendelkezı gyermekek magasabbak mind az egészséges, mind a kisebb

görbülettel bíró társaiknál (Shohat et al., 1988). Ezekbıl a megfigyelésekbıl következıen a

gerincferdülést kiváltó okot eltérıen ítélik meg; Gou és mtsai a lányok csigolyáinak

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

17

karcsúságában és nagyobb magasságában látja az okot, Lowe szerint a gerincoszlop elülsı

részeinek a hátsó struktúrákhoz képest történı relatív túlnövekvése eredményezi a

gerincoszlop kezdeti elhajlását, Sevastin pedig a bordák aszimmetrikus növekedését tartja

fontosnak (Guo et al., 2003; Lowe et al., 2000; Sevastik et al., 2003). Mindezek az egyes

csigolyákra ható erık egyenetlen eloszlását okozzák. Mivel a gerincoszlopban a csigolyák

szorosan össze vannak kötve, a felsı csigolyákra ható hajlító erık az alsóbb részeken a

gerincoszlop oldalirányú elhajlását eredményezik a biomechanikai modell szerint (Stokes and

Laible, 1990).

Vérlemezkék rendellenességei

A könnyen izolálható vérlemezkék vonzó tárgyai a scoliosis kutatásának, mivel

kontraktilis rendszerük nagymértékben hasonlít a harántcsíkolt izmokéhoz, így egy, a

vázizmokat érintı rendellenesség kitőnıen vizsgálható bennük. Ezen felül további nagy

elınyük, hogy a gerincferdülés okozta másodlagos hatások nem károsítják ezt a rendszert.

Több tanulmány is megjelent, melyben az IS-es betegek vérlemezkéinek abnormális

szerkezetét és megváltozott funkcionális mőködését írták le, és az eltérések nagy része a

megváltozott Ca2+ transzportra utalt. A kalmodulin, amely egy Ca2+-függı receptorfehérje az

izomsejtekben és a trombocitákban kölcsönhat az aktinnal és a miozinnal és hatására megnı a

szarkoplazmatikus retikulumból történı Ca2+ kiáramlás. Kindsfater és mtsai megemelkedett

kalmodulin szintet mértek azon IS-es betegek vérlemezkéikben, ahol a görbület progresszív

volt (Kindsfater et al., 1994). A kalmodulin, mint neurotranszmitter a melatonin szekréció

szabályozásában is szerepet játszik, így a megemelkedett kalmodulin aktivitás a csökkent

melatonin termelıdéssel összefüggésben lehet (Machida et al., 1996).

Acaroglu és mtsai a kalmodulin és a melatonin szintjét is megvizsgálták mind a

trombocitákban, mind a paravertebrális izmokban az egészséges, trauma miatt operált

esetekben és a gerincferdülés korrigálása miatt mőtött IS-es betegekben is. Nem találtak

különbséget a melatonin szintben sem a beteg-kontroll viszonylatban sem pedig a jobb vagy

bal oldalról származó izombiopsziák között. Az IS-es betegeknél azonban a kalmodulin szint

magasabb volt a gerincoszlop konvex oldaláról származó izombiopsziában (Acaroglu et al.,

2009). Az eddigi kísérleti eredmények ugyan még nem elegendıek annak pontos eldöntésére,

hogy mi a szerepe a kalmodulinnak az IS etiológiájában, mégis úgy tőnik a Ca2+-függı

kalmodulin köthetı az IS súlyosbodásához.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

18

Hormonok szerepe az AIS-ben

Az a tény, hogy az AIS kialakulása és progressziója a serdülıkori gyors növekedési

szakaszhoz társul, felveti a növekedés komplex folyamatában résztvevı hormonok szerepét.

Feltételezték a növekedési hormon és a IGF-1 szerepét, ám a vérszérum szintben nem találtak

eltérést az IS-es betegeknél (Misol et al., 1971). Mivel a nagyobb Cobb fokú görbülettel bíró

eseteknél a lányok aránya magasabb, Esposito és mtsai a nıi nemi hormonok esetleges

szerepét vizsgálták és azt találták, hogy mind az ösztrogén, mind a progeszteron

vérszérumbeli szintje csökkent volt az IS-es lányokban az egészséges, korban egyezı

társaikéhoz képest (Esposito et al. 56-60). A serdülı korú lányok antropometriás vizsgálata

alapján az IS-es lányok magasabbaknak és vékonyabbaknak bizonyultak, mint a kontrollok,

az alacsonyabb testsúlyuk miatt egy, a zsírszövet által termelt hormon, a leptin szerepe is

felmerülhet a patogenezisben (Lee et al. 1024-35;Siu King et al. 2152-57). Mivel a dolgozat

egyik célja, ennek az etiológiai elemnek a vizsgálata, részletesebben egy késıbbi, külön

fejezetben fogom tárgyalni a leptin és az AIS kapcsolatát.

A tobozmirigy által termelt hormon, a melatonin etiológiai tényezıként azután került az

érdeklıdés középpontjába, miután 1959-ben Thillard munkacsoportja arról számolt be, hogy

a csirkében (amit a gerincferdülés modellállatának tartanak), a tobozmirigy kimetszése

(pinealectomia) után rendszeresen kialakul a scoliosis. Megfigyelésüket késıbb többen

megerısítették a csirkékkel és a két lábon járásra kényszerített patkányokkal végzett

kísérletekben is (THILLARD, 1959; Machida et al., 1999; Machida et al., 1993). Az újabb

kutatások szerint azonban pinealectomia hatására nem alakult ki gerincdeformitás az

emberhez evolúciósan közelebb álló, kétlábon járó rhesus majmokban (Cheung et al., 2005b).

Dubousset és Machida 30 IS-os serdülı betegben kimutatta, hogy a progresszív formákban

(melyekben az utóbbi évben több, mint 10 fokot nıtt a Cobb szög mértéke) az éjszakai

szérum melatonin szint 35%-kal csökkent a stabil, nem progrediáló gerincferdüléses

betegekkel és 50 kontroll egyénnel összevetve, ám ezt az eredményt több ezt követı

tanulmányban sem sikerült megerısíteni (Machida et al., 1996; Bagnall et al., 1996; Fagan et

al., 1998).

A fentiek alapján a melatonin szerepe az IS kialakításában, vagy a gerincferdülés

súlyosbodásában nem meggyızıen bizonyított, viszont a melatoninnal kapcsolatos kutatások

napjainkban újra az érdeklıdés középpontjába kerültek a melatonin csontnövekedés

szabályozásában játszott szerepe miatt (Roth et al., 1999; Satomura et al., 2007). In vitro

kísérletekben AIS betegekbıl származó primer oszteoblaszt sejtvonalakban a melatonin

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

19

szignáltranszdukciós útvonal nem megfelelı mőködését mutatta ki Moreau munkacsoportja

(Moreau et al., 2004). További megerısítést jelenthetnek a genetikai asszociációs vizsgálatok

is, amit a következı fejezetben írok le.

Genetikai tényezık

A genetikai tényezık szerepére kevés figyelem irányult az idiopathiás scoliosis

kutatásának kezdetén, mivel a betegség többnyire szórványosan lépett fel, és gyakran a

családon belül halmozódó esetek sem mutattak egyértelmő öröklıdésmenetet. A genetikai

háttér kutatása a hetvenes évek óta folyik, s mára már a legfontosabb és leginkább kutatott

területté vált.

Az epidemiológiai részben leírt elıfordulási gyakoriságok, különösen a betegek

családjában elıforduló magasabb incidencia és az ikerkutatások során kapott konkordancia

adatok arra utaltak, hogy létezik örökletes faktor. A külföldi populációs tanulmányok az elsı,

másod és harmadfokú rokonok között rendre 11%-os, 2.4%-os és 1.4%-os érintettséget

találtak, ami jó egyezést mutat a hazai adatokkal (Riseborough and Wynne-Davies, 1973).

Bellyeiék a magyar populációs adatokból poligénes, multifaktoriális öröklıdésmenetre

következtettek, amit megerısíteni látszik Wyne-Davies és Risenborough közös tanulmánya,

melyet 2869 önként jelentkezın, mindegyikük elsıfokú rokonain illetve 81%-uk másod és

harmadfokú rokonain végeztek (Czeizel et al., 1978; Riseborough and Wynne-Davies, 1973).

Wynne-Davies 2000 önként jelentkezın és elsıfokú rokonain végzett radiográfiás

vizsgálatokat, eredményeik domináns öröklıdésmenetre engedtek következtetni (Wynne-

Davies, 1968). Aksenovich komplex szegregációanalízissel 90 család 283 tagját vizsgálta és

eredményeik alapján egy autoszomális domináns, de nem teljes penetranciával öröklıdı

fontos gén jelenlétét valószínősítik, legalábbis a súlyosabb idiopáthiás scoliosisos esetekben

(Aksenovich et al., 1988). Cowell és mtsai 17 családot megvizsgálva nem találtak apáról-

fiúra történı öröklıdést, ezért X-hez kapcsolt, domináns öröklıdésmenetet véleményezetek

csakúgy, mint Miller és mtsai, akik szintén családfa analízissel jutottak ugyanerre a

következtetésre (Cowell et al., 1972; Justice et al., 2003).

Az etiológiai kutatások során feltárt eltérések alapján érintettnek gondolt gének

mutációinak célzott vizsgálatával kezdıdtek a molekuláris genetikai vizsgálatok. A

kötıszövet felépítésében fontos strukturális géneket, mint a kollagének (COL1A1, COL1A2,

COL2A1), fibrillinek (FBN1, FBN2), elasztin (ELN) és a heparán-szulfát glükózamin 3-O-

szulfotranszferázok (HS3ST3A1, HS3ST3B1), nem találták érintettnek az AIS-ben (Carr et

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

20

al., 1992; Miller et al., 1996; Salehi et al., 2002). A porcspecifikus mátrixmolekulák közül az

aggrekán (ACAN) nem mutatott kapcsoltságot az AIS-sel, míg a matrilin-1 (MATN1) gén

3’UTR régiójában elhelyezkedı mikroszatellita marker által jelölt, 103 bp-os allélje

asszociációt mutat az AIS-sel (Montanaro et al., 2006; Marosy et al., 2006). Mivel a

növekedés és a gerincferdülés között szoros kapcsolat áll fenn, a növekedési hormon receptor

(GHR) alléleloszlását is vizsgálták az AIS betegekben 5 SNP alapján, de nem találtak eltérést

a genotípus gyakoriságban a kontrollhoz viszonyítva (Qiu et al., 2007b). Hasonló kísérleti

elrendezéső vizsgálatban az inzulinszerő növekedési faktor (IGF1) promóterének SNP

analízise során sem találtak különbséget a genotípus eloszlásban, de az egyik homozigóta

genotípushoz magasabb Cobb˚ tartozott, ami alapján a szerzık az IGF1-et az AIS-t módosító,

progressziós faktornak tekintik az IGF1-et (Yeung et al., 2006). Az ösztrogén receptor β gén

(ERβ) polimorfikus helyeinek vizsgálatakor találtak egy olyan SNP-t, aminek egyik allélje

gyakrabban fordul elı a scoliosisos lányokban, mint a kontrollokban, ezért ezt a gént az AIS-

re hajlamosítónak gondolják a lányok esetén (Zhang et al., 2009). A melatonin metabolizmus

zavarát feltételezik az AIS kialakulásának egyik lehetséges okaként, ezért kínai kutatók

megvizsgálták a melatonin receptorainak polimorfikus helyeit asszociációt keresve a

gerincferdüléssel. Az oszteoblasztokban is kifejezıdı melatonin 1B receptor (MTNR1B) gén

promóterében olyan SNP polimorfizmust írtak le a-1193 pozícióban (C-1193 T, rs4753426),

melynek C allélja asszociál a gerincferdüléssel és azon egyéneknél, akik homozigóta

formában hordozzák a C allélt a gerincferdülés kialakulásának kockázata magasabb, mint a T

allélt is hordozóké (OR:1.29) a kínai populációban (Qiu et al., 2007a). Saját vizsgálataink

nem támasztják alá ezt az eredményt, a genotípus gyakoriságok nem mutattak eltérést az AIS-

es beteg és a kontroll populáció közt (közlés alatt). Megvizsgálták a másik melatonin receptor

(MTNR1A) egyik promóter polimorfizmusát is, de asszociációt nem tudtak kimutatni (Qiu et

al., 2008).

Az asszociációs vizsgálatokkal párhuzamosan kapcsoltsági analízist is végeztek

számos laboratóriumban és az elmúlt tíz évben számos kromoszóma szakaszt azonosítottak

az AIS-sel összefüggésben. Mind Chan, és mtsai, mind Alden munkacsoportja, egymással

rokoni kapcsolatban nem álló családokat elemezve a 19p13.3 régióban az AIS-hoz kapcsolt

lokuszt írtak le (Alden et al., 2006; Chan et al., 2002). Ocaka és mtsai is megerısítették

Miller munkacsoportja által jelzett 9q31.1-q34.2 régió kapcsoltságát az AIS-hez (Ocaka et

al., 2008; Miller et al., 2005). Salehi és mtsai egy háromgenerációs olasz családot vizsgáltak,

ahol a 17p11 kromoszóma régiót találták kapcsoltnak 11 érintett személy kapcsán, amit

Miller munkacsoportja is igazolt egy 50 családos mintán (Salehi et al., 2002; Miller et al.,

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

21

2005). Az 1. táblázat tartalmazza a kapcsoltsági analízis eredményeként kapott kromoszóma

régiókat és az ott elhelyezkedı, a szerzık által az AIS-ben potenciálisan érintettnek jelölt

géneket.

A kapcsoltsági analízissel jelölt gének közül a γ1 syntrophint (SNTG1) és a

kromodomént tartalmazó helikáz, DNS-kötı fehérje 7-t (CHD7) vizsgálták részletesen. A

SNTG1 génjében talált mutációk csak a vizsgált AIS-es betegek kis százalékában voltak

megfigyelhetık és a családi halmozódást mutató esetekben sem szegregálódott együtt az AIS

az SNTG1 mutációival. (Bashiardes et al., 2004) A CHD7 gén esetén Wise munkacsoportja

egy potenciálisan funkcióval rendelkezı polimorfizmust (rs4738824) kapcsoltnak talált az

AIS-sel beteg+szülık hármasát vizsgálva (Gao et al., 2007).

A jelenleg elfogadott etiológiai modell alapján a betegség kialakulása két szakaszra

osztható, egy iniciációs és egy progressziós fázisra. Mindkét fázisban több gén is szerepet

játszhat és eddig ismeretlen környezeti faktorok hathatnak a fázisokra külön-külön is. A

modell szerint az AIS komplex genetikai betegség, ahol egy vagy több gén egymással és a

környezeti tényezıkkel együtthatva alakítja ki a gerincdeformitást (Cheung et al., 2008).

1. táblázat A kapcsoltsági analízisek eredményeként az AIS-sel kapcsolatba hozható

kromoszóma szakaszok és jelölt gének

résztvevık száma család/egyén

kromoszóma lokalizáció

jelölt gének referencia

1/14 6q

10q 18q

(Wise et al., 2000)

1/17 17p11 HS3ST3A1 HS3ST3B1

(Salehi et al., 2002)

7/52 19p13.3 NLRP12, SH3GL1

(Chan et al., 2002)

202/1198 Xq23 Xq26.1

CHRDL1 COL4A5, 6

(Justice et al., 2003)

202/1198

6p22-p25 6q13-q16 9q31.1-q34.2

16p13.13-q13.2 17p12-q11.2

(Miller et al., 2005)

202/1198

5p13 13q13.3 13q32

IRX1, IRX2, IRX4 POSTN,FOXO1 GPC5

(Miller et al., 2006)

202/1198 19p13 (Alden et al., 2006)

52/123 1p 8q

10q

- SNTG1, CHD7

- (Gao et al., 2007)

25/116 9q31.2-q34.2

17q25.3-qtel (Ocaka et al., 2008)

7/54 12p3 NTF3,FGF3,GDF3 KCNA1,5,6,MFAP5

(Raggio et al., 2009)

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

22

Az etiológiai teóriák összegzése

Az elızı fejezetekben felsorolt rendellenességek leírása után minden szerzı kialakította a

saját megfigyelése alapján a saját teóriáját, így mára közel 20 elmélet létezik az AIS

kórfejlıdésére.

A legfontosabbak listaszerő felsorolása:

1. Genetikai betegség multifaktoriális öröklıdéssel (Kouwenhoven and Castelein,

2008; Miller et al., 2005)

2. A gerincoszlop növekedésének aránytalansága, miszerint az anterior rész

gyorsabban nı (Guo et al., 2003)

3. A gerincoszlop és a gerincvelı növekedésének aszinkronja (Roth, 1968; Porter,

2001b)

4. Tartási rendellenesség, ami kialakulhat a hátsó agy diszfunkciója miatt,

neuromuszkuláris eltérések miatt, vagy az idegrendszer test-sémájának megkésett

fejlıdése miatt (Burwell et al., 2008a; Lao et al., 2008; Veldhuizen et al., 2000)

5. Melatonin hiány, vagy a melatonin szignálút nem megfelelı mőködése (Machida et

al., 1996)

6. A vérlemezkékben talált kalmodulin diszfunkció szisztémás érvényesülése (Lowe

et al., 2000)

7. NOTOM (normal neuro-osseous timing of maturation) modell, ami több teória

egyesítésével jött létre (Burwell et al., 2008b)

8. LHS (leptin, hipotalamusz, szimpatikus idegrendszer) (Burwell et al., 2009)

Eddig egyetlen elmélet sem tudta az AIS-ben megfigyelt eltérések mindegyikét

beilleszteni a kórfejlıdésbe, ami azt sugallja, hogy az AIS, mint a legtöbb komplex betegség

pathomechanizmusa összetett. Egyre több adat utal arra, hogy a hormonháztartás nem

megfelelı mőködése fontos etiológiai tényezıje az AIS-nek. Saját kísérleti eredményeink is

arra utaltak, hogy fontos lenne az endokrin rendszer részének tekinthetı zsírszövet által

termelt fehérjéket, az adipokineket tanulmányozni. Eddig több mint 50 adipokint írtak le,

amelyek számos szerv mőködését befolyásolják,mint például a máj, az izmok, a csontok, a

szaporító szervek (Trayhurn and Wood, 2004). Az adipokinek közül részletesen a leptinnel és

az interleukin 6-tal foglalkozom, mivel mindkettınek fontos szerepe van a csonttömeg

átalakítás szabályozásában és szerepük valószínősíthetı az AIS kialakításában.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

23

Az értekezés szempontjából kiemelten fontos etiológiai faktorok

Leptin

A leptin egy, a citokinek családjába tartozó hormon, melyet 1994-es felfedezésekor az

energiaegyensúly fenntartásában és a táplálékfelvétel szabályozásában tartottak fontosnak

(Zhang et al., 1994). Elsıdleges feladatának a kövérség megelızését gondolták, erre utal az

elnevezése is, amely a görög leptos (jelentése vékony) szóból ered. Az elmúlt 15 évben

folytatott szerteágazó kutatások nyomán mára már elfogadott, hogy a leptin befolyásolja a

glükóz- és lipidmetabolizmust, fontos szerepe van neuroendokrin rendszer szabályozásában,

az immunrendszerben, a csontszerkezet átszervezıdésben.

A leptin gént (LEP) Friedman munkacsoportjának extrém kövér egértörzsek (ob/ob)

keresztezését követı pozícionális klónozással sikerült azonosítani (Zhang et al., 1994). Ezt

követıen emberben is azonosították a leptin génjét és megállapították, hogy aminosav szinten

84%-os a homológia a két faj leptin szekvenciája között, ami arra utal, hogy egy

funkcionálisan erısen konzervált fehérjérıl van szó.

A LEP gén az emberben a 7-es kromoszóma 7q31.3 régiójában található, ~16.5 kb

hosszúságú és 3 exonból valamint 2 intronból áll, a kódoló régiót a 2. és 3. exon tartalmazza

(Gong et al., 1996). A promóter régiója tanulmányozásakor C/EBP, SP-1, HIF-1 reszponzív

elemeket sikerült azonosítani (Ambrosini et al., 2002; Mason et al., 1998). A hozzájuk kötıdı

transzkripciós faktorok egy alapszintő átíráson túl indukálható leptin kifejezıdést is lehetıvé

tesznek. A leptin elsısorban a fehér zsírszövetben termelıdik, de kimutatták alacsony szintő,

de indukálható kifejezıdését a vázizmokban is (Ambrosini et al., 2002; Wang et al., 1998).

Termelıdését az inzulin és a glükokortikoidok fokozzák, a tesztoszteron pedig gátolja

(Saladin et al., 1995; Blum et al., 1997). A fenti hormonokon kívül még gyulladásos

citokinek is befolyásolják a termelıdését (Mantzoros and Moschos, 1998).

A leptin molekula egy glikozilálatlan 16 kDa molekulasúlyú, 4 alfa hélixet tartalmazó

polipeptid, amely a strukturális vizsgálatok alapján az IL6 citokin család tagjaival mutat

hasonlóságot (Zhang et al., 1997).

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

24

Leptin szerepe a csonttömeg szabályozásban

Az elmúlt években több tanulmány jelent meg, amelyek rávilágítanak arra, milyen

bonyolult kapcsolatrendszer áll fenn a leptin, a központi idegrendszer és a csontszerkezet

átalakulása között. Az elsı arra utaló jel, hogy a leptin fontos szerepet játszik a megfelelı

csonttömeg kialakításában, abból két a megfigyelésbıl adódott, hogy a tartós energiahiánnyal

párosuló alacsony leptin szérumszint összefügg az alacsony csonttömeggel (pl. az anorexia

nervosa esetén) és, hogy a csontritkulás kevésbé fenyegeti az elhízott embereket (Soyka et al.,

1999; De Laet et al., 2005). Bár a pontos mechanizmusok még nem teljesen ismertek, úgy

tőnik, hogy a leptin két teljesen különbözı csonttömeg szabályozó folyamatban is részt vesz

(5. ábra piros nyilak). Az elsı, egy a hipotalamuszon keresztüli indirekt út, két egymással

ellentétes hatású folyamatból áll. Az egyik folyamatot Ducy és munkatársai írták le, miszerint

a leptin a szimpatikus idegrendszeren keresztül hat és hatására az oszteoklasztok

differenciációja fokozódik, ami a csontbontást erısíti (Ducy et al., 2000). A másik,

csontbontást gátló folyamatra Elefteriou csoportjának munkája során derült fény, melyben a

leptin egy hipotalamuszban kifejezıdı neuropeptid, a CART (kokain amfetamin által

szabályozott transzkript) expresszióját fokozza, amely az oszteoklaszt-differenciáció

gátlásához vezet (Elefteriou et al., 2005). A közvetlen úton keresztül a leptin a csontvelıi

ıssejtekre hat, mégpedig a csontépülésért felelıs oszteoblasztok differenciációját segíti és az

oszteoklasztok differenciációját gátolja (Thomas et al., 1999; Holloway et al., 2002). A fenti

mechanizmusok bonyolult kölcsönhatásaként a leptin szérumszintje határozza meg, hogy a

csonttömeg átalakulás egyensúlyi folyamatai közül melyik kerül túlsúlyba A szérum

leptinszint a különbözı koncentráció tartományokban a csontépítést és a csontbontást is

befolyásolhatja, de a koncentrációjától függıen ellentétesen (hormesis) (Martin et al., 2007).

Természetesen a leptin nem egymaga határozza meg a csonttömeg átalakulást, hanem számos

egyéb szabályozó úttal kölcsönhatásban, ami kielégítı magyarázatot szolgáltat arra, hogy

miért olyan ellentmondóak azok a klinikai adatok, amelyek a szérum leptinszint és a

csonttömeg közötti összefüggés vizsgáltával születtek.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

25

5. ábra A leptin és az IL6 szerepe a csontátépítésben

A csontátépülés a csontképzési és csontbontási folyamatok összehangolt, egymással egyensúlyban

lévı mőködésével valósul meg. A csontszövet sejtjei közül a csontlebontásért a hematopoetikus ıssejt

eredető oszteoklasztok (csontfaló sejtek) a felelısek, míg a csontépítés a mesenchymális ıssejt eredető

oszteoblasztok (csontépítı sejtek) feladata. Az oszteoblasztok egy részébıl alakul ki a csontszövet

szerkezetét adó oszteocita (csontsejt). A helyes csontátépülést ezeknek a sejteknek a differenciációja és

funkciója határozza meg, amit sejt-sejt kapcsolataik, illetve különbözı, szolubilis faktorok által

közvetített kölcsönhatásuk is biztosít. Mőködésük a központi idegrendszeren keresztüli hormonális

szabályozás alatt áll.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

26

Leptinszint nemek közötti különbsége

A leptin felfedezése után elıször részletesen a test zsírtartalma és a leptin szérumszint

összefüggését vizsgálták, és megállapították, hogy a nık leptin szintje még azonos testtömeg

index mellett is 2-3-szor magasabb mint a férfiaké (Ostlund, Jr. et al., 1996). Mivel a nıkben

magasabb a zsír százalékos aránya, nem meglepı, hogy a zsírsejtek által termelt leptin szintje

is különbözik. Ez az eltérés a pubertás korban válik kifejezetté, ami azt mutatja hogy a

zsírszövet mennyisége mellett a nemi hormonok is befolyásolják a leptin szérumszintjét. A

pubertás kezdetén mindkét nemben megnı a leptin szérumszintje, ami azt jelzi, hogy a

leptinnek fontos szerepe van a hipotalamusz-hipofízis-gonád tengely aktiválásában, azáltal,

hogy jelet szolgáltat az agynak arról, hogy megfelelı energiatartalékkal rendelkezik-e a

szervezet a reprodukcióhoz. Ezt alátámasztja az a megfigyelés, hogy alacsony leptinszinttel

rendelkezı élsportoló tornászoknál a serdülıkor kezdete késik és a sovány atlétanık

rendszerint amenorrheások (Weimann et al., 1999). További bizonyítékot jelent, hogy

azokban az esetekben, ahol a leptin génjében elıforduló misszensz mutáció következtében

nem termelıdik fehérje, a betegek az elhízás mellett hipogonadizmusban szenvednek (Strobel

et al., 1998). A serdülıkor késıbbi fázisában a leptin szérumszintje a lányokban tovább

emelkedik, szemben a fiúkkal akiknél inkább csökken kialakítva ezáltal a két nem közötti, az

élet további részében is fennmaradó leptinszintbeli különbséget (Blum et al., 1997).

Polimorfikus helyek vizsgálat a LEP gén szabályozó régiójában

Egy gén esetleges szerepét valamely fenotípus kialakításában leggyakrabban az adott gén

vagy vele genetikai kapcsoltságban lévı DNS szakaszon lévı polimorfikus helyek

vizsgálatával próbálják meg tisztázni az asszociációs vizsgálatokban. Eltérıen a LEP gén

kódoló szakaszától, ahol csak elvétve akad polimorfikus hely, az 5’végi szabályozó régióban

számos fellelhetı, közöttük olyanok is amelyek asszociációt mutattak az elhízással és a

testtömegindex-szel (a testtömegindex a testsúly és a testmagasság négyzetének a hányadosa,

amellyel a test zsírszövettartalmát lehet megbecsülni) (Carlsson et al., 1997). Több egymással

részben ellentmondó tanulmányban számos SNP-t azonosítottak, amelynek valamely allélja

kapcsoltságot mutat az alacsonyabb leptinszinttel vagy az elhízással.

A leggyakrabban vizsgált SNP, egy általánosan elıforduló polimorfizmus, amely a

transzkripciós starthelytıl 5’ irányban 2548 bázispárnyira helyezkedik el és egy G/A

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

27

tranzíciót jelent; jelölése G-2548A. Funkciójáról egyenlıre nincs adatunk, de számítógépes

elemzések azt mutatják, hogy evolúciósan nem konzervált régióban helyezkedik el és egyik

(eddig ismert) transzkripciós faktor kötıhely sem térképezhetı erre a pontra. Mivel azonban

számos vizsgálatban erıs asszociációt mutat az elhízással egy függetlenül ható, funkcionális

SNP-nek tekintik.

A vérszérum leptinkoncentrációja a szervezetben tárolt energia mennyiségérıl ad információt

és a test zsírszázalékával egyenesen arányos, bár az egyéni szérum leptinszintek azonos

testtömegindex mellett is nagy eltéréseket mutathatnak. Több tanulmány is foglalkozott azzal,

hogy a szérum leptinszintje és a G-2548A SNP alléljei közötti összefüggést feltárja, de a

kapott adatok ellentmondóak. Két kutatócsoport számolt be olyan eredményrıl, hogy a -2548

A/A homozigóta genotípus a magasabb szérum leptinszinttel hozható összefüggésbe. Az

egyik közlemény csak férfiakban tudta kimutatni ezt az összefüggést, a másik pedig, nem

elhízott felnıtt nıkben találta a magasabb leptin szérumszintet az A/A homozigótákkal

kapcsoltnak (Mammes et al., 2000; Hoffstedt et al., 2002). Több ellentétes értelmő publikáció

is megjelent, amikben a -2548 A/A genotípusú testesebb fiatal lányokban 20 %-kal

alacsonyabb szérum leptinszintet mutattak ki, mint a G/A vagy G/G genotípusúakban, illetve

50%-kal alacsonyabb receptorhoz kötött szérum leptinszintet A/A genotípusú normál súlyú

lányokban (Le Stunff et al., 2000; Yiannakouris et al., 2003). A legújabb témával foglalkozó

cikk az eddigiektıl eltérıen nem európai populációkat, hanem brazil nıket vizsgálva jutott

arra a következtetésre, hogy a -2548 G allél jelenléte összefüggésben van az emelkedett

szérum leptinszinttel (Hinuy et al., 2008). Meg kell említeni azonban, hogy olyan publikációk

is megjelentek, amelyek nem tudtak összefüggést kimutatni a LEP -2548 G/A allélok és a

szérum leptinszintje között (Bienertova-Vasku et al., 2008; Wang et al., 2006). Az

ellentmondó eredmények hátterében több jelenség is állhat. Egyik ilyen különbséghez vezetı

ok lehet a G-2548A polimorfizmussal kölcsönható másik allél jelenléte a leptin vagy a leptin

receptorának a génjében. Szintén eltérı eredmények megszületéséhez vezethetnek a

vizsgálatokba bevont populációk nagyságában, illetve nemi és testfelépítési paramétereiben

megnyilvánuló különbségek, valamint az eltérı statisztikai modellek használata.

A leptin rákos folyamatokban betöltött lehetséges részvételére elıször azon in vitro

eredmények hívták fel a figyelmet, amelyek igazolták a sejtosztódásban és a véredények

kialakulásában betöltött szerepét. E kísérletek nyomán a G-2548A polimorfizmust nemcsak

az elhízással kapcsolatban, hanem számos rákos elváltozással összefüggésben is

megvizsgálták (Dieudonne et al., 2002). Több, eddig vizsgált tumor kialakulása vagy

malignitásának vonatkozásában igazolást nyert, hogy a 2548 A/A homozigóta állapot

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

28

tekinthetı a magasabb kockázati tényezınek. A kutatások során tapasztalt, esélyhányados

értékük (OR) a mellrák esetén 3.17, nem kissejtes tüdıráknál 1.97, szájnyálkahártya tumor

esetén 1,56, non-Hodgkin limfóma esetén 2,3, és a prosztataráknál 2,93 (Ribeiro et al., 2004;

Ribeiro et al., 2006; Skibola et al., 2004; Snoussi et al., 2006; Yapijakis et al., 2009).

Leptin és az AIS

Mára már széleskörben elfogadott nézet, hogy az AIS kialakulása és súlyosbodása a

növekedéssel áll kapcsolatban. Az AIS-es betegeknek nemcsak alacsonyabb a testsúlyuk és a

testtömegindexük, hanem csonttömegük is és csontsőrőségük is csökkent (Cheng et al., 2000;

Sadat-Ali et al., 2008). Ez az állapot felnıttkorban is fennmarad, és a betegek további

életútját követı kísérletekbıl az is kiderült, hogy a gerincferdülésben szenvedı betegek 50%-

ában csontritkulásos kórkép alakult ki (Cheng et al., 1999; Thomas et al., 1992). Mivel az

elızı fejezetekben már részletesen leírtam, milyen szerepet tulajdonítanak a leptinnek a test-

és a csonttömeg szabályozásában logikusan merült fel a kérdés, van-e szerepe a leptinnek az

AIS kialakításában. Eddig a szakirodalomban egyetlen tanulmány jelent meg, ami a leptin

szérumszintjét vizsgálja a gerincferdüléssel összefüggésben (Qiu et al., 2007c). A kínai

kutatócsoport 120 AIS-es és 80 korban illesztett egészséges lány leptinszintjét vizsgálta meg

és azt találta, hogy a kontrollhoz képest mintegy a felére csökkent a szérum leptinszint az

AIS-es betegekben, 14.9 µl/L-rıl 7.2 µl/L-re függetlenül a görbület nagyságától.

Az interleukin 6

Az interleukin 6–ot (IL6) eredetileg mint makrofág differenciációs markert és hepatocita, B

sejt stimuláló faktort írták le, mára már igazolást nyert szerteágazó pleiotróp hatása az

immunrendszert, központi idegrendszert, sıt a csontrendszert érintı számos biológiai

folyamatban.

Az IL6 génje a 7-es humán kromoszóma 7p21 régiójában található és 6.1 kb hosszúságú. A

gén 5 exont tartalmaz és eddig 9 különbözı mRNS variánsát írták le. Az IL6 fehérje 212

aminosavból áll és különbözı poszttranszlációs módosulások jellemzik, mint az O- és N-

glikoziláció valamint a szerin és tirozin aminosavakon történı foszforiláció. A vérszérumban

jelenlévı 26 kDa-os fehérje mintegy 30%-a a zsírszövetben termelıdik, de az adipocitákon

kívül termelik még az oda bevándorló makrofágok is. A mőködı vázizom is nagy

mennyiségő IL6-ot termel, a maratoni táv lefutása után például a vérplazma IL6 szintje

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

29

mintegy 100-szorosára emelkedik, melynek mértéke hasonló, mint amekkorát egy komoly

fertızésben szenvedı betegnél tapasztalnak (Ostrowski et al., 1999). A csontfejlıdésben

parakrin módon szerepet játszó IL6-ot elsısorban az oszteoblasztok és a csontvelıi sztróma

sejtek termelik (Holt et al., 1996).

Az IL6 az antigénspecifikus immunválasz szabályozásában szintén meghatározó szerepet

játszik. A B sejtek plazmasejtté történı érését és ellenanyagtermelı képességét szabályozza,

indukálja a T sejtek növekedését és a citotoxikus T sejt differenciációt. Májsejtekben az akut

fázis proteinek, elsısorban a C reaktiv-protein termelıdését közvetlenül indukálja. Az akut

fázis válasz során az izom- és zsírszövetekben energiát mobilizál, ezáltal segítve elı a láz

kialakulását, illetve hatására alakul ki a gyulladás során megfigyelhetı súlyvesztés (Leon et

al., 1998).

Dolgozatom szempontjából talán a legérdekesebb megfigyelés, hogy az IL6 érintett több

elhízással járó megbetegedésben (2-es típusú diabetes, a szív- és érrendszeri

megbetegedések), illetve a csontritkulás kialakulásában is (Thalmann and Meier, 2007; Zhao

et al., 2008).

Az IL6 szerepe a csontátépítésben

A szervezetben lejátszódó csontátépítési esemény a csontbontás, illetve csontépítés

egymással ellentétes, viszont térben és idıben egymással szorosan kapcsolódó, egymással

összehangolt folyamatai által valósul meg, melyben a résztvevı oszteoklasztok és

oszteoblasztok egymással kölcsönhatásban szabályozzák differerenciációjukat és

mőködésüket. Ebben a folyamatban a legjobban vizsgált pont az oszteoblasztok és a

csontvelıi sztróma sejtek által termelt citokinek hatása az oszteoklaszt differenciációra. A

legnagyobb szerepet az oszteoblaszt/oszteoklaszt kommunikációban a RANKL (NF-κβ

receptor aktivátor ligandja) szolubilis citokinnek tulajdonítanak (5. ábrán szürke nyilak). A

RANKL kötıdése receptorához, a RANK-hoz (NF-κβ receptor aktivátor) stimulálja a pre-

oszteoklasztok differenciációját és aktiválja az érett oszteoklasztokat. Számos egyéb

gyulladáskeltı citokin, köztük az IL6 is befolyásolja a RANKL funkcionális hatását.

Legújabb adatok szerint az IL6 típusú citokinek hatására az oszteoblasztokban indukálódik a

RANKL expressziója, mely az oszteoklasztokra parakrin, az oszteoblasztokra autokrin

módon képes hatást gyakorolni, tovább stimulálva ez által a parakrin faktorok kifejezıdését

(5. ábra kék nyilak). A kaszkád eredményeképp a gyulladáskeltı citokinek végsı soron a

csontbontást segítik (Kwan et al., 2004). In vitro adatok szerint az IL6 típusú citokinek a

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

30

mesenchymális ıssejtek oszteoblaszt irányba történı differenciációját is segítik és védik az

oszteoblaszt sejteket az apoptózistól, ami pozitívan befolyásolja a csontépítés folyamatát

(Taguchi et al., 1998). Az in vitro kísérletekkel párhuzamosan különbözı transzgenikus és

génkiütött egerek létrehozásával in vivo is vizsgálták az IL6 típusú citokinek csontképzıdésre

kifejtett hatását. Az IL6 hiányos egerekben a csontépítés mértéke nıtt, míg az IL6-ot

túlzottan kifejezı transzgenikus egerekben mind az oszteoblasztok, mind az oszteoklasztok

csökkenı száma mellett, a csontbontás folyamata dominált. Összeségében úgy tőnik, hogy a

csontbontásból és csontépítésbıl álló csontátalakulási folyamat egészét szupresszálja az IL6

(Blanchard et al., 2009).

Polimorfikus helyek vizsgálat az IL6 gén szabályozó régiójában

Az IL6 vérszérum koncentrációja egy adott populáción belül lényeges eltéréseket mutat az

egyedek között. Különösen a gyulladásos folyamatokra jellemzı IL6 szérumszint emelkedés

mértéke mutat nagy egyedi eltérést. A különbözı immunstimulusra kialakuló magas IL6

szérumkoncentráció sokáig fennmarad, így jó molekuláris markere számos klinikai

állapotnak, mint pl. a hasi fertızéseknek, áttétes mellráknak, szív- és érrendszeri

megbetegedéseknek. Idıvel a vizsgálatok egyik lényeges kérdésévé az vált, hogy az egyén

genetikai háttere hogyan befolyásolja az IL6 szérumkoncentrációt egészséges és pathológiás

állapotokban. Mivel az IL6 gén kódoló szekvenciája csak néhány nagyon ritkán elıforduló

polimorfikus helyet tartalmaz, a gén szabályozó régiójában található és a génkifejezıdésre

ható variánsokat kezdték el vizsgálni. A leggyakrabban vizsgált SNP a transzkripciós

starthelytıl -174 bázispárnyira elhelyezkedı G>C transzverzió(G-174C, rs1800795), amely

az IL6 promóter egyik negatív regulációs doménjében helyezkedik el és in vitro kísérletek

alapján funkcionális variánsnak tekinthetı. HeLa sejteken végzett „reporter assay”

vizsgálatokban a -174C allélt tartalmazó konstrukciók luciferáz expressziója 0.624±0.15-ször

volt alacsonyabb a -174G allélt hordozó vektorénál. IL1 stimulust követıen a -174C reporter

gén aktivitása nem változott, míg a -174G allélt tartalmazó konstrukciók esetében az aktivitás

3.60±0.26-szorosára nıtt (Fishman et al., 1998). Számos tanulmány foglalkozott a G-174C

polimorfizmus és a vérszérum IL6 szintjének összefüggésével, de a kapott eredmények

ellentmondásosak. A G-174C polimorfizmust felfedezı, az elıbbiekben ismertetett in vitro

eredményeket közlı csoport egészséges emberek vizsgálatakor azt találta, hogy

összehasonlítva a G allélt is hordozó egyedeknél mért értékekkel, a C allélt homozigóta

formában hordozóknál szignifikánsan alacsonyabb az IL6 szérumszint (Fishman et al., 1998).

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

31

A késıbbiekben ennek épp az ellenkezıjét megállapító tanulmányok is megjelentek (Boiardi

et al., 2006; Ravaglia et al., 2005). Az ellentmondásos eredményekre egy lehetséges

magyarázattal szolgálhat az IL6 kifejezıdését szabályozó, egy másik régióban jelenlévı

polimorfizmus, amelyet Smith és mtsai le is írtak a közelmúltban (Smith et al., 2008).

A G-174C polimorfizmust a felfedezése óta eltelt tíz évben számtalan olyan betegséggel

kapcsolatban megvizsgálták, ahol az IL6 szerepe felmerülhetett. Ezek:

- a fiatalkori ízületi gyulladásban a -174C/C genotípus ritkábban fordul elı (Fishman

et al., 1998)

- a 2-es típusú diabetesben a kezdeti eredmények alapján a -174G allél, míg az

elhízással kapcsolatban a -174C allél jelenlétét tekintették a magasabb kockázati

tényezınek, ám ezeket az eredményeket a meta-analízisek már nem támasztják alá (Qi

et al., 2006) (Qi et al., 2007)

- a -174C/C genotípus hordozóinak a méhnyakrák kialakulására nagyobb a kockázata

(OR=3.16; p=0.014) míg a nyelıcsı tumor esetén a -174G/G genotípusú homozigóta

egyéneknek magasabb a esélyhányadosa (OR 2.28; P=0.001) (Gangwar et al., 2009;

Upadhyay et al., 2008)

- a csontritkulással kapcsolatos vizsgálatban azt találták, hogy a -174C/C

homozigótákban magasabb a csontsőrőség, mint a -174G/G homozigótákban (Xiao et

al., 2005)

Az IL6 és az AIS

A porckorongokat érı abnormális terhelés miatt a gerincferdülésben a porckorong alakja

megváltozik, kiékelıdik és ezt a változást követi a porckorong belsı kocsonyás magjának

(nucleus pulposus, NP) szerkezeti és metabolikus módosulása is (Oegema, Jr. et al., 1983;

Roberts et al., 1993; Taylor et al., 1981). Burke és mtsai kimutatták, hogy gyulladáskeltı

stimulusra a scoliotikus porckorong NP sejtjei megnövekedett IL6 szekrécióval válaszolnak,

ugyanakkor alapállapotban nincs eltérés az egészséges és scoliotikus sejtek IL6 termelésben

(Burke et al., 2003). A fenti eredmények ismeretében Logroscino munkacsoportja

megvizsgálta, hogy az IL6 promóterében lévı G-174C SNP eloszlása mutat-e eltérést az

egészséges és kontroll populáció között (Aulisa et al., 2007). A vizsgálatba Olaszország

középsı és déli részérıl származó 53 IS-es és 202 kontroll egyedet vontak be és eset-kontroll

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

32

asszociációs analízist végeztek. A kapott genotípus eloszlás mind a kontroll, mind a beteg

csoportban Hardy-Weinberg egyensúlyban volt és a kontroll minták alléleloszlása nem

mutatott eltérést a más populációt érintı irodalmi adatokhoz képest. A gerincferdülésben

szenvedı betegek között azonban kétszer olyan gyakran fordult elı a -174 G/G genotípus,

mint a kontroll csoportban (52.8% , illetve 26.2% p<0.001) míg a -174 C/C genotípus

gyakorisága szignifikánsan magasabb volt a kontroll csoportban (30,1%), mint a scoliosisos

betegek között (5.7%). Az elvégzett statisztikai elemzés szerint az IL6 -174 G/G homozigóta

genotípusú egyedek esélye a gerincferdülés kialakulására 10.54-szer, a G/C heterozigóta

genotípusú személyeké pedig 4.84-szer magasabb, mint a C/C homozigóta genotípusú

embereké, bár szignifikáns különbséget csak a két homozigóta pár között lehet kimutatni. Az

eredmények alapján a szerzık úgy gondolják, hogy az IL6 gén promóterének polimorfizmusa

fontos genetikai faktora lehet a gerincferdülésre való hajlamnak. Ugyanakkor a vizsgálatba

bevont 53 gerincferdülésben szenvedı beteg mintaszáma alacsony ahhoz, hogy a kapott

eredményeket maradéktalanul elfogadhassuk.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

33

CÉLKITŐZÉSEK

Az idiopathiás scoliosis kialakulásának okát évtizedek óta széles körben kutatták és kutatják a

mai napig. Az erıfeszítések ellenére azonban eddig nem sikerült olyan etiolóiai teóriát

kialakítani, ami minden, az AIS-ben megfigyelhetı jellegzetességet, rendellenességet, eltérést

be tudna illeszteni egy egységes rendszerbe. A munkánk során célul tőztük ki, hogy

molekuláris szintő vizsgálatokban, két megközelítéssel az AIS-re jellemzı további eltéréseket

tárjunk fel és az eltérések hátterében álló genetikai tényezıket vizsgáljuk.

A. Az elsı megközelítésben a gerincoszlop stabilitásáért felelıs paravertebrális izmok

génexpressziós mintázatát kívántuk megvizsgálni. A teljes izom transzkriptoma egyidejő

analízisével, a CHIP microarray módszerrel összehasonlítottuk az:

I. Egészséges és scoliotikus paravertebrális izmok génkifejezıdését

II. Scoliotikus izmokban a görbület konvex és konkáv oldali génkifejezıdését

Azokat a géneket vizsgáltuk tovább, amelyek kandidánsként szóbajöhetnek az alábbi

szempontok alapján:

1. Bioinformatikai módszerekkel meghatározott, a háttér eloszlástól eltérı

génontológiai kategóriába esnek

2. Közös az AIS szempontjából érdekes, biológiai, metabolikus folyamatban vesznek

részt

3. Az AIS vonatkozásában elvégzett kapcsoltsági analízisek által jelölt

kromoszómaszakaszra lokalizálódnak

4. Az általuk termelt fehérje a funkciója alapján beilleszthetı az AIS etiológiájába

B. Második lépésként a génexpressziós vizsgálatok által jelölt gén/gének SNP

polimorfizmusának asszociációs analízisét eset-kontroll tanulmányban terveztük vizsgálni. A

genotipizálás eredményeit különbözı, a gének közötti interakciók kimutatására alkalmas

statisztikai módszerekkel szándékoztuk kiértékelni. A genotípus adatokat a klinikai adatokkal

összevetve a statisztikai analízis lehetıséget ad annak a meghatározására, hogy a gén/gének

adott allélja a gerincferdülés kialakulásához vagy súlyosbodásához köthetı-e.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

34

ANYAGOK ÉS MÓDSZEREK

Kísérletbe bevont személyek adatai és mintái

Gerincferdülésben szenvedı betegek mintái

Az AIS-es betegek mintáit a Pécsi Tudományegyetem Általános Orvosi Kar Ortopédiai

Klinikájáról Prof. Illés Tamástól kaptuk. A vizsgálatba bevont személyeknél a kiválasztásuk

elıtt ortopédiai vizsgálat, gerincröntgen, laboratóriumi vizsgálat (szérum kalcium, foszfor,

alkalikus foszfatáz szint és vizelet kalcium és foszforszint mérés) történt. Teljes vázrendszeri

vizsgálat készült a lehetséges diszpláziák kiszőrésére. A betegeket és elsı fokú rokonaikat

egy genetikus vizsgálta meg a lehetséges genetikai szindrómák szempontjából. Az idiopathiás

scoliosis diagnózisát bizonyított genetikai szindróma, metabolikus, neurológiai-, kollagén-

vagy izombetegség hiányában állapították meg.

DNS minták egyrészt a mőtétek során nyert izom biopsziákból, másrészt IS-es betegek

perifériás vérébıl nyert fehérvérsejtjeibıl preparáltuk, összesen 126-ot.

RNS mintákat a korrekciós mőtéten átesett betegekbıl az operáció során nyert bilaterális

musculus latissimus dorsi izombiopsziából preparáltuk összesen 32-öt.

A betegeket minden esetben tájékoztattuk a kísérletbe történı bevonásukról és a

beleegyezésükkel történtek a mintavételek.

Kontroll személyek mintái

A kontroll személyek mintái több forrásból származnak, de a kiválasztásnál mindig szem

elıtt tartottuk a dél alföldi régióból való származást. A kontroll minták mintegy felét (112

minta) a Szegedi Tudományegyetem Gyerekgyógyászati Klinikájáról, Dr Endreffy Emıkétıl

kaptuk, a másik részét a munkacsoportunkban folytatott másik populációgenetikai

vizsgálathoz győjtöttük, fıleg az SZBK Genetika Intézet dolgozóitól. A kontroll személyek

sem egymással sem az AIS betegekkel nem állnak rokonságban.

DNS mintákat perifériás vérbıl kinyert fehérvérsejtekbıl, szájnyálkahártya kenetbıl és

hajszálak végén lévı hajhagymákból készítettük.

A microarray analízishez használt kontroll RNS mintákat trauma miatt operált betegek

bilaterális musculus latissimus dorsi biopsziából készítettük.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

35

DNS alapú munkafolyamatok

Genomikus DNS tisztítása

A genomikus DNS tisztítása perifériás vérbıl, izombiopsziából a hagyományos fenolos

extrakcióval (Short Protocols in Molecular Biology 1992), száj nyálkahártya kenetbıl és

hajszálakból pedig a Walsh és munkatársai által kidolgozott Chelex-alapú módszerrel történt

(Walsh et al., 1991).

SNP-k kimutatása PCR-RFLP módszerrel

A PCR-RFLP módszeren alapuló genotipizálás során elıször PCR-rel felszaporítjuk a

vizsgálni kívánt SNP-t tartalmazó DNS szakaszt, majd olyan restrikciós enzimmel emésztjük

az amplikont, melynek felismerı helyét a polimorfizmus érinti.

A leptin promóter G-2548A polimorfizmusát ezzel a módszerrel már többen is vizsgálták, mi

Yapijakis és kollégái által leírt módszer alapján végeztük el a genotipizálást. (Yapijakis et al.,

2009) Az IL6 promóter C-174G polimorfizmusát pedig Aulisa és munkatársai által használt

protokoll szerint vizsgáltuk. (Aulisa et al., 2007) A következı primereket (Merck Kft)

használtuk a PCR-hez:

Leptin (rs7799039) F:5`-TTTCCTGTAATTTTCCCGTGAG-3`

R:5`-AAAGCAAAGACAGGCATAAA-3`

IL6 (rs1800795) F:5’- TGACTTCAGCTTTACTCTTTgT-3’

R:5’- CTGATTGGAAACCTTATTAGG-3’

A PCR-t MJ Research PTC 200-as PCR készülékben végeztük GOTaq (Promega) DNS

polimerázzal a következık szerint:

� 25 µl össztérfogatban a PCR reakciót az alábbiak alkották: 100 ng DNS templát,

200 µM ΣdNTP, 2 mM MgCl2, 1 µM forward és 1 µM reverz primer, 1x GOTaq puffer

(Promega), 0.25 U GOTaq DNS polimeráz.

� A reakcióelegyet 94 oC–on 5 percig tartottuk a Taq polimeráz aktiválásához majd

35 ciklusban végeztük az amplifikálást: denaturálás 94 oC–on 30 másodpercig, primer

kapcsolódás (annealing) 52 oC-on 30 másodpercig, átírás 72 oC–on 30 másodpercig.

Végezetül a szál lezárása 72 oC–on 5 percig zajlott.

� A PCR termék restrikciós emésztését a következık szerint végeztük: a 20 µl

össztérfogatú reakcióelegyben: 8 µl PCR termék, a gyártó által szolgáltatott megfelelı 1x

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

36

puffer, 3 U HhaI (Fermentas), illetve 5 U NlaIII (New England Biolabs). A reakciót 37 oC–on

egész éjszakán át inkubáltuk. A restrikciós emésztéseknél mindig használtunk kontroll DNS

mintát, hogy ellenırizhessük az emésztés eredményességét.

� A PCR termékek kimutatására a Mini-PROTEAN III Electrophoresis System (BioRad)

gélelektroforézis rendszert használtunk. 8%-os natív poliakrilamid gélen 1x TBE futtató

puffer jelenlétében. A vizualizációhoz festettük a gélt 1 µg/ml etidium-bromidos vízben 10

percig, majd a GelBase (UVP) géldokumentációs rendszerrel archiváltuk és értékeltük a

géleket (6. ábra).

6.ábra A. A leptin G-2548A, illetve az IL6 C-174G SNP által meghatározott genotipusokhoz

tartozó restrikciós fragmentumok hossza

B. Gélfotó, amely a leptin G-2548A SNP meghatározását mutatja

C. Gélfotó, amely az IL6 C-174G SNP meghatározását mutatja

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

37

RNS alapú munkafolyamatok

RNS izolálás

� A hátizom biopsziából kb. 50-100 mg szövetet folyékony nitrogén alatt dörzsmozsárban

porítottuk, ehhez 1 ml TRIzol (Invitrogen) reagenst adtunk és 5 percig szobahımérsékleten

inkubáltuk a nukleoprotein komplexek disszociációja végett. A mintát nagy proteoglikán, zsír

és poliszacharid tartalma miatt 4 oC-on, 12000 g-vel, 10 percig centrifugáltuk.

� A felülúszót új Eppendorf csıbe helyeztük s ahhoz 200 µl kloroformot adtunk. 15

másodpercig összeráztuk, majd 15 perces inkubáció után 4 oC-on, 12000 g-n, 15 percig

centrifugáltuk. A kialakult három fázis közül az RNS-t is tartalmazó vizes óvatosan

eltávolítottuk, ügyelve, hogy az interfázistól elválasszuk.

� A vizes fázishoz hozzámértünk 0.5 ml izopropilalkoholt, majd 15 másodperc összerázás

után 10 percig szobahımérsékleten inkubáltuk. A 4 oC-on, 12000 g-vel, 10 percig tartó

centrifugálás hatására az Eppendorf csı aljára kicsapódott az RNS. A felülúszót leszívtuk, 1

ml 70%-os etil-alkohollal mostuk a csapadékot vortexelés mellett. 7500 g-s 5 perces

centrifugálás után az etil-alkoholt eltávolítottuk.

� Az RNS-t szobahımérsékleten szárítottuk, majd 50 µl RN-áz mentes, DEPC-s vizet

(Fermentas) mértünk a csapadékra. Az RNS oldódását az 55-60 oC-on történı 10 perces

inkubáció segítette.

Northern gél elektroforézis

Az RNS minták minıségének ellenırzésére használtuk.

� Agaróz gél összetétele: 1% agaróz (GIBCO), 1x MOPS pH:7, 0.65% formaldehid.

� A futtató puffer: 1x MOPS ph:7, 0.65%-os formaldehid.

� RNS minták gélfuttatás elıtti kezelése az alábbiak szerint történt: 3.5 µl RNS

oldathoz hozzámértünk 10 µl formamidot, 3.5 µl 35%-os formaldehidet, 2 µl 10x

MOPS pH:7 oldatot, 1 µl 1 mg/ml etídium-bromidot, majd 70 oC-on 10 percig

inkubáltuk.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

38

� A mintákhoz a gélre való feltöltés elıtt 0.1 térfogat Blue Juice oldatot (50%

glicerin, 0.4% bróm-fenolkék, 0.4% xilén-cianol, 1mM EDTA)adtunk.

� A gél futtatása 80 V-on kb. 2 órán keresztül történt.

� A vizualizációhoz és a dokumentációhoz a GelBase géldokumentációs rendszert

(UVP) használtuk.

7.ábra Northern agaróz gélelektroforézis

Az RNS mintákat akkor fogadtuk el megfelelı minıségőnek, amennyiben a 28S nagy

molekulasúlyú riboszomális RNS-ek is erısen látszottak, mint az a 7.ábrán is látható.

RNS mintacsoportok tisztítása

Az egyéni RNS mintákat egyenlı arányban összekevertük, létrehozva ezzel azokat a

mintacsoportokat (pool-okat), amelyekkel a továbbiakban dolgozni szándékoztunk. A további

munkafolyamatok elıtt a kialakított RNS oldatokat tovább tisztítottuk Macherey-Nagel

Nucleospin RNAII kitjével a gyártó leírása alapján:

� Az RNS oldathoz 450 µl RA1 oldat és 7 µl β-merkaptoetanol keverékét adtuk, majd

összeráztuk és 350 µl 70%-os etanolt hozzáadása után nukleinsav-kötı oszlopra

pipettáztuk. 2 percig centrifugáltuk 1000 RPM-mel.

� A membránhoz kötött RNS mosása után 90 µl 25 mM-os DN-áz I hozzáadásával 15

percig szobahımérsékleten inkubáltuk, majd hozzámértünk 200 µl RA2-t (DNase stop

solution buffer). 2 perces centrifugálás-1000 RPM-mel.

28S RNS

18S RNS

5S RNS

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

39

� A DN-áz tökéletes eltávolítása érdekében további mosásokkal tisztítottuk a

membránhoz kötött RNS-t: 300 µl RA3 puffer hozzáadása után 2 perc centrifugálás

1000 RPM-mel, majd 125 µl RA3 pufferrel történı mosás után 4 perc centrifugálás

1000 RPM-mel.

� A nukleinsav-kötı mosást követıen az oszlopot áttettük egy steril Epp.csıbe, 60 µl

DEPC H2O-t (Fermentas) mértünk rá és szobahımérséklet 10 percig állni hagytuk,

majd az RNS-t 4 perces 1000RPM-mel történı centrifugálással oldottuk le a

membránról.

� Amennyiben szükséges volt akkor az RNS oldatokat koncentráltuk Amicon

Microcon centrifugacsıvel (Millipore) 11000 RPM-mel 20 percig történı

centrifugálás után 8 µl DEPC H2O-t mértünk a nukleinsav-kötı oszlopra, majd a

csövet megfordítva 1 percig centrifugáltuk.

Fluoreszcensen jelölt próba készítése a microarray hibridizáláshoz

A próba készítéséhez a Cy5 fluoreszcens festékkel kapcsolt 3DNA Array 900MPX Kitet

(GeniSphere) használtuk a gyártó leírása alapján:

1. A reverz transzkripciót a RevertAid™ First Strand cDNA Synthesis Kittel (Fermentas)

végeztük a gyártó leírása alapján. Röviden:

� A mintacsoportonként 2.5 µg RNS-hez 5µl random hexamer primert és 1 µl oligo

dT primert adtunk 13 µl térfogatban. 10 percig 80 oC-on inkubáltuk, majd rögtön jégre

tettük.

� Hozzáadtunk 4 µl 5x Fermentas puffert, 1 µl 10mM ΣdNTP-t, 1 µl ribonukleáz

inhibitort és 1 µl Fermentas MMLV reverz transzkriptázt. Inkubáltuk 2 órán át 42 oC-

on.

� A mRNS-t hidrolizáltuk 3.5 µl 0.5M NaOH/50mM EDTA oldat hozzáadása után 65 oC-on 15 percig, majd a cDNS oldatot neutralizáltuk 5 µl TRIS-t pH:7.5

hozzáadásával. A mintákat -20 oC-on tároltuk másnapig.

2. A cDNS tisztítása MinElute Spin column 50 kittel (Qiagen) történt a gyártó leírása alapján:

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

40

� 50 µl cDNS-hez 250 µl PB puffert adtunk, és az oldatot a MinElute oszlopra

pipettáztuk, majd 1 percig 13000 RPM fordulatszámmal centrifugáltuk.

� Az átfolyt PB mosópuffer eltávolítása után 750 µl PE puffert mértünk az oszlopra és

1 percig centrifugáltuk majd az átfolyó puffert kiöntve újabb egy perces centrifugálás

történt a maradék etanol eltávolítása érdekében.

� A cDNS visszanyerésénél az oszlopot egy steril csıbe helyeztük, a nukleinsav-kötı

membránra 10 µl EB puffert pipettáztunk, 2 percig szobahımérsékleten inkubáltuk,

majd 2 perc centrifugálás után az oszlopot eltávolítottuk.

3. Címkézés

� A cDNS-hez 6.5 µl nukleázmentes desztillált vizet adtunk. A 16,5 µl-nyi mintát

80oC-on 10 percig melegítettük, majd rögtön jégre helyeztük.

� Hozzámértünk 2.5 µl 10x címkézı puffert, 4 µl 10 mM dTTP-t és 2 µl terminális

deoxynukleotidil transzferázt, 37 oC-on 30 percig, majd 65 oC-on 15 percig

inkubáltuk.

4. Ligálás

� A 25 µl mintát 10 percre 95 oC-ra helyeztük, majd rögtön jégre tettük.

� Hozzáadtunk 5 µl 6x Ligation Mix-et (Cy5/Alexa 647) és 2 µl T4 DNS ligázt.

Finoman összeráztuk, szobahımérsékleten fél óráig inkubáltuk.

� A reakciót leállítottuk 3.5 µl 0.5M EDTA oldat hozzáadásával és 10 másodpercig

vortex-szel összekevertük. 14.5µl TE8 hozzáadásával értük el az 50 µl-es

végtérfogatot.

5. A jelölt cDNS-t tisztítottuk, a fentebb már említett módon, Qiagen MinEluteTM Spin

columns 50 kittel.

A cDNS és a 3DNA hibridizációja a CHIP-hez

A Genishere jelölı kithez tartozó protokollt követtük a továbbiakban is a hibridizációs mix

elkészítéséhez.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

41

� DNS hibridizációs mixet állítottunk össze a következıképpen: 10 µl cDNS, 2 µl

LNA dT Blocker, 3 µl nukleáz mentes víz, 15 µl 2x hibridizációs puffer.

� A mixet összekevertük vortex-szel, röviden centrifugáltuk, 75-80 oC-on inkubáltuk

10 percig, majd 55-65 oC között tartottuk a további használatig.

� Rövid vortexelés és centrifugálás után a mixet az elımelegített CHIP lemezre

tettük.

A hibridizáció a Ventana hibridizáló állomásban (Ventana Discovery) „antibody” protokol

szerint zajlott.

� Az elsı hibridizálási lépés (cDNS hibridizálás) 42 oC-on 18 órán keresztül a

következı hibridizáló pufferben történt: 10x Denhart oldat, 0.25 M Na foszfát puffer

pH 7.0, 1 mM EDTA, 1x SSC, 0.5% SDS.

� A második hibridizálási lépés (3DNA hibridizálás) 2.5 µl Cy5 fluorofort tartalmazó

„elıhívó” reagens jelenlétében 200 µl „Chiphyb” hibridizáló pufferben (Ventana)

történt 42 oC-on 2 óráig.

� A hibridizálás után a lemezeket 0.2X SSC oldatban kétszer mostuk.

A hibridizáció utáni kiértékelés

� A lemezek leolvasása konfokális lézer szkennerrel (ScanArray Lite, GSI Luminics)

történt.

� A pontok kiértékelése GenePix analizáló programmal történt.

� A számszerősített adatokat Misrosoft Excell program segítségével, minıségi

paraméterek figyelembe vételével értékeltük és normalizáltuk. Azok a pontok,

melyeknél a minta és a kontroll fluoreszcencia intenzitás értékekbıl képzett,

normalizált hányados -ami a gén relatív kifejezıdési szintjét mutatja- 2 felett illetve

0,5 alatt van, olyan gént jelöl, amelynek kifejezıdése eltérı a kontrollból és betegbıl,

illetve a jobb és a bal oldalról származó izombiopsziákban.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

42

Valós idejő kvantitatív polimeráz láncreakció (QRT-PCR)

A génspecifikus primereket a Primer Express programmal (Applied Biosystem)

terveztük a szoftver által javasolt beállításokat követve. A primerek specifitását az NCBI

BLAST szerverének a primerek tesztelésére alkalmas programjával (“Search for Short,

Nearly Exact Matches”) ellenıriztük. A primerek szintetizálását az SZBK Nukleinsav

Szintézis Központi Laboratóriumában végezték el. A primer szekvenciák a következıek

voltak:

LMNA F:5’ GAGCTGCCTTCCCTAGCTTTAGA 3’

R:5’ CTCCCAGCACCCCACTTG 3’

VDR F: 5’ GATATGGCAGCGAAAGGATGTAA 3’

R: 5’ TGACAAACTTCTGGCAAACTTTTT3’

COL15A1 F:5’ CATCCCAACATAGGTTAAGAGCAA 3’

R:5’ 3ACACTCAACAACAATGGTTTAAAAGG’

JAK1 F: 5’ TGCCCAGAAGCAGTTCAAGA 3’

R: 5’ TCCGAACCGTGCAGACTGTA 3’

BMP4 F:5’ CAAGCGTAGCCCTAAGCATCA 3’

R:5’ GGCGCCGGCAGTTCTT 3’

IL4R F: 5’ GCACCTCGACTTGTGAACGA 3’

R: 5’ GGACAGTCTGCTGCAGAAGCT 3’

NTF3 F:5’ TCCAGCCGGTGATTGCA 3’

R:5’ CGGTGAGTTGTAGCGTCTCTGT 3’

LEP F:5’ TTGTCACCAGGATCAATGACA 3’

R:5’ GTCCAAACCGGTGACTTTCT 3’

CDK5 F:5’ TTAATTTCCTGAGTGACCAGCAT 3’

R:5’ AGCCTCCTTTGGAAAGGTCT 3’

HOX7 F:5’ ACATCGAGCCTTCAACGTG 3’

R:5’ ACTTTTTGCAAATGAAGAAACTAAGA 3’

NOS1 F:5’ CCTCCTGGGTTTACTCCTTGAGT 3’

R:5’ AGTTTTGTAAGAGCCACTGCAGATT 3’

NOS2 F:5’ CCTCAAGTCTTATTTCCTCAACGTT 3’

R:5’ CCGATCAATCCAGGGTGCTA 3’

NOS3 F:5’ GCGGCTGCATGACATTGAG 3’

R:5’ TCGCGGTAGAGATGGTCAAGT 3’

HPRT F:5’ CACTGGCAAAACAATGCAGACT 3’

R:5’ CGACCTTGACCATCTTTGGATT 3’

β-AKTIN F:5 ’CCAACCGCGAGAAGATGA 3’

R:5 ’CCAGAGGCGTACAGGGATAG 3’

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

43

A reverz transzkripciót oligoT és random hexamer primerek felhasználásával a RevertAid™

First Strand cDNA Synthesis Kittel (Fermentas) végeztük a gyártó leírása alapján, amint azt a

microarray próba készítésénél már röviden leírtam.

A valós idejő PCR során a Rotor-Gene 3000 (Corbett Research) PCR készüléket használtuk a

PCR termék amplifikálására és kimutatására, ami a SYBR-Green festésen alapuló detekciós

eljárást használtuk a keletkezı termék nyomon követésére. Röviden:

� 20 µl össztérfogatban a PCR reakciót az alábbiak alkották: 5 µl ötszörösére hígított

cDNS, 0.5 µl 10 µM-os forward primer, 0.5 µl 10 µM-os reverz primer, 4 µl nukleáz mentes

víz (Fermentas) és 10 µl ABsolute QPCR SYBR Green Mix (ABgene).

� A reakcióelegyet elıször 94 oC–on 10 percig tartottuk, a DNS polimeráz

aktiválásához, majd 50 ciklusban amplifikáltuk a következık szerint: denaturálás 94 oC–on

25 másodpercig, primer kapcsolódás 61 oC-on 25 másodpercig, átírás 15 másodpercig.

� Minden reakció után elvégeztük az olvadáspont analízist, amihez a PCR reakció

hımérsékletét 55 oC–ról 93 oC–ra emeltünk és folyamatosan, fél percenként mértük a SYBR-

Green festék floureszcencia jelét. A PCR termékre jellemzı olvadáspont meghatározásával a

keletkezett amplikont ellenıriztük. Minden primerpárhoz használtunk egy negatív kontrollt,

ahol a cDNS helyett vizet tettünk a reakcióelegybe, ellenırizve a primer dimer képzıdést.

Statisztikai analízis

A beteg-kontroll asszociációs vizsgálatoknál alapvetı fontosságú, hogy a biallélikus

polimorfikus pontok által meghatározott allél- és genotípus gyakoriság eloszlások Hardy-

Weinberg egyensúlyban (HWE) legyenek. A HWE fennállását a „Hardy-Weinberg

equilibrium calculator including analysis for ascertainment bias” web program

segítségével igazoltuk (http://www.oege.org/software/hwe-mr-calc.shtml) (Rodriguez et al.,

2009).

Pearson-féle χ 2 vagy Fisher egzakt teszt segítségével hasonlítottuk össze a LEP G-2548A és

az IL6 G-174C polimorfizmusok elıfordulási gyakoriságát a beteg és a kontroll

populációban, meghatároztuk az egyes genotípusokhoz tartozó esélyhányadosokat (OR, odds

ratio) és a hozzájuk tartozó 95%-os megbízhatósági tartományt (CI, confidence intervals).

A polimorfikus SNP-k közötti kölcsönhatások vizsgálatára két módszert használtunk. Az

MDR (Multifaktoros Dimenzionalitás Redukció) analízis egy genetikai modell-mentes, nem

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

44

paraméteres eljárás amihez Jason Moore Számítástechnikai Genetika Laborja által fejlesztett,

szabadon felhasználható szoftvercsomagot (MDR 2.0 Beta 6) használtuk és a következı

webcímrıl töltöttük le: http://www.multifactordimensionalityreduction.org (Hahn et al.,

2003b).

A másik módszer egy paraméteres eljárás, ami a génkombinációk hatásának ML (maximum

likelihood) becslését alkalmazza annak a kimutatására, hogy az adott génkombináció milyen

mértékben emeli meg a betegség kialakulásának esélyét a legkevésbé hajlamosító genotípus

kombinációhoz viszonyítva (Yamada et al., 2001). A relatív esélyhányadosok meghatározását

és kereszttáblába történı rendezését Hirose és mtsai közleménye alapján végeztük el (Hirose

et al., 2008).

A GLM (Generalizált Lineáris Model) analízist használtuk arra, hogy kimutassuk létezik-e

valamilyen összefüggés a Cobb˚ nagysága és a vizsgált két funkcionális SNP által

meghatározott genotípus, vagy kettıjük genotípus kombinációi között.

Az elızıekben említetteken kívül a statisztikai elemzésekhez az SPSS 16.0 for Windows

szoftvercsomagot használtuk. A p<0,05 statisztikai teszteredményeket tekintettük

szignifikánsnak.

A munka során használt fontosabb online bioinformatikai eszközök és

adatbázisok internet címei:

• DAVID: http://niaid.abcc.ncifcrf.gov/

• GeneCards: http://www.genecards.org/

• KEGG PATHWAY Database: http://www.genome.jp/kegg/pathway.html

• MDR 2.0: http://www.multifactordimensionalityreduction.org

• NCBI: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

• Scoliosis Research Society: www.srs.org

• STRING: http://string.embl.de/

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

45

EREDMÉNYEK

Az idiopathiás scoliosis etiológiájának genetikai komponensét két megközelítéssel

vizsgáltuk. Az elsıben a gerincoszlop tartásában szereppel bíró paravertebrális izmok

génexpresszió szintő vizsgálata volt a cél, a másodikban pedig a génkifejezıdésben

szabályozó szerepet játszó promóter polimorfizmusok asszociációját néztük eset-kontroll

tanulmányban.

Paravertebrális izmok RNS kifejezıdési mintázatának vizsgálata CHIP

microarray-vel

Az elsı megközelítés a kontroll és az IS-es betegek paravertebrális izmainak génexpressziós

analízise volt és abból a feltevésbıl indult ki, hogy az idiopathiás scoliosisban jelenlévı

strukturális változások tükrözıdnek a génexpresszió szintjén is. A PTE ÁOK Ortopédiai

Klinikától 95 beteg mőtéti anyagából bilaterális musculus latissimus dorsi biopsziákat

kaptunk, amibıl teljes RNS preparátumot készítettünk. Az SZBK Funkcionális Genomika

munkacsoportjával (CHIP Labor) közösen két microarray analízist végeztünk el. Az elsıben

gerincferdüléses és egészséges személyekbıl származó mintákat, a másodikban pedig a

gerincferdüléses személyeknél a gerincoszlop két oldaláról vett mintákat hasonlítottunk

össze.

Egészséges és scoliosisos betegek izombiopsziájának génkifejezıdésbeli

összehasonlítása

A CHIP kísérlet során két párhuzamos pool-t készítettünk (IS I és IS II), melyek esetében

egyenként 6-6 korban, nemben és a scoliosisos görbülete fokában közel megegyezı személy

RNS mintáit kevertük össze. Ez a ún. ”pool„ kialakítás arra szolgál, hogy az egyedi

különbségeket elfedjük és a közös, vizsgálni kívánt jelenséghez kapcsolható változás

hangsúlyozottabban jelenhessen meg. A választásnál figyelembe vettük a közel azonos

életkort és a Cobb fokot. (2. táblázat) A kontroll csoport 4 traumás eredető és ékcsigolya

miatt mőtött egyén mintáit tartalmazta.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

46

Minták IS I

életkor Cobb˚ IS II

életkor Cobb˚ Kontroll életkor

1 13.46 54.00 14.00 62.00 12.65

2 15.23 62.00 15.73 57.00 14.83

3 15.58 52.00 15.94 54.00 21.39

4 16.66 65.00 16.98 60.00 38.47

5 17.96 60.00 17.43 52.00

6 18.71 55.00 17.44 77.00

Átlag 16.27 58.00 16.25 60.33 21.84

2. táblázat Az RNS „pool”-ok kialakításában résztvevı egyének életkora és Cobb˚ értéke (az

AIS-es betegnél) a mintavétel idején. Két párhuzamos „pool” kialakítására volt lehetıség (IS

I, ill. IS II) a betegnél, míg kontrollként csak egy „pool”-t tudtunk használni

Az általunk készített RNS „pool”-okból kialakított próbákat a CHIP labor által elıállított

24 nukletoidos oligokat (Sigma-Aldrich) hordozó mikrochipekhez hibridizáltuk melyek

egyenként 13000 db részben annotált humán cDNS-t, illetve EST-t reprezentáltak. Az adatok

kiértékelése és statisztikai elemzése után 96 gént azonosítottunk úgy, hogy génkifejezıdésük

magasabb, míg 91-ot úgy, hogy alacsonyabb a gerincferdüléses betegek paravertebrális

izmaiban a kontroll egyedekhez képest.

A viszonylag nagyszámú génkifejezıdésbeli változás további feldolgozást igényelt, hogy

kiválaszthassuk azokat a géneket, amelyekkel érdemes tovább dolgozni. Ehhez a SAIC-

Frederick Inc. Bioinformatikai munkacsoportja által fejlesztett, szabad felhasználású,

interneten használható programot a DAVID-et (Database for Annotation, Visualization and

Integrated Discovery) használtuk (Huang et al., 2009). A DAVID 40 különbözı annotációs

kategóriát tartalmaz és a felhasználó által adott génlistában szereplı géneket csoportosítja a

kiválasztott kategória, vagy kategóriák kombinációja szerint és a csoportosítást különbözı

módon is láthatóvá teszi. Elvégeztük az expresszióváltozást mutató gének génontológiai

(GO) besorolását olyan GO kategóriákat keresve, amelyek a teljes humán genom

génkészletben tapasztalható GO eloszláshoz (háttér) képest statisztikailag alul vagy

felülreprezentáltak az adatainkban. A 3. táblázatban látható az a 25 legszignifikánsabb

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

47

változást mutató biológiai folyamatokat jelölı GO kategória, amelyben eltérést találtunk a

háttérhez képest. Ezek mindegyikének az általános sejtmőködésben és a sejtek metabolikus

folyamataiban van szerepe. Nem találtunk közöttük olyan GO kategóriát, amelyrıl

feltételezhetnénk, hogy az idiopathiás scoliosis etiopathológiájába beleillhet. Elvégeztük még

a funkcionális fehérje doméneket és a fehérje-fehérje kölcsönhatásokat tartalmazó

adatbázisok alapján történı besorolást is és azt is megnéztük, hogy létezik-e olyan biológiai

útvonal, amelyben a génlistánkból több gén is szerepel. Sajnos ezek a kutatások sem vezettek

eredményre, általuk sem tudtunk olyan géneket jelölni, amit érdemes lenne tovább vizsgálni.

3. táblázat. A DAVID programcsomag által szolgáltatott táblázat, amely a CHIP kísérletben

kapott, a scoliosisos és kontroll minták közötti génkifejezıdésbeli különbséget mutató gének

biológiai folyamatokat jelölı GO kategóriák szerinti besorolását mutatja

Következı lépésben a génlistánkon szereplı gének kromoszóma lokalizációját néztük

meg olyan kromoszóma szakaszokat keresve, ahová több expresszió változást mutató gén is

térképezıdik. Továbbá azoknak a gének az azonosítása volt a célunk, amelyek olyan

kromoszóma szakaszon helyezkednek el, amit más tudományos közlemények az AIS-sel már

korábban kapcsolatba hoztak. Egy gént találtunk, amelyik az 1. táblázatban bemutatott

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

48

kapcsoltsági analízisben jelöltként szerepelt, ez a 12 p13-as kromoszóma szakaszon található

NTF3 (neurotrofin 3) gén volt, ami egy neuronokra ható növekedési faktor (8. ábra). A

továbbiakban irodalmi kutatásokat végeztünk a microarray kísérletben szignifikáns

eredményt adó génekkel kapcsolatban, majd a vonatkozó GeneCards leírások és számos

publikáció elolvasása után 5 gént kiválasztottunk a további célzott vizsgálatok célpontjainak.

A kiválasztott gének a következık voltak: strukturális alkotókat kódoló gének: LMNA (lamin

A), COL15A1 (XV-ös típusú kollagén alfa 1 lánc); a VDR (D vitamin receptor); egy a

másodlagos jeltovábbításban szereplı kináz JAK1 (Janus kináz 1); sejtmembrán receptor;

IL4R (interleukin 4 receptor); a csontfejlıdésben szerepet játszó differenciációs faktor BMP4

(csont morfogenetikus protein 4); a Ca2+-szignálútban a kalmodulinnal kapcsolatban lévı

NOS1 (nitrogénmonoxid szintetáz 1). Ezeknek a géneknek a további, QRT-PCR-rel történı

vizsgálatára a fejezet egy késıbbi szakaszában még visszatérek.

8. ábra. Az ENSEMBL Genome browser által készített kariogram, ahol a CHIP kísérletben

kapott, a scoliosisos és kontroll minták közötti génkifejezıdésbeli különbséget mutató gének

kromoszóma lokalizációja látható grafikus ábrázolással. Piros nyíllal jelöltem azt a régiót,

amit az AIS-sel már korábban kapcsolatba hoztak.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

49

Scoliosisos betegekben a gerincoszlop két oldaláról származó

izombiopsziák génkifejezıdésbeli összehasonlítása

A második microarray analízis során 10-10 személy RNS mintáit kevertük össze, két-két

párhuzamos (IS I, IS II) konvex, illetve konkáv oldali mintát hozva létre, így a biológiai és a

technikai párhuzamosokkal a késıbbiekben lehetıségünk nyílt statisztikai kiértékelést

végezni. A „pool”-ok kialakításánál csak lányokból származó mintákat használtunk és

figyelembe vettük az életkort, valamint a Cobb görbület mértékét. (4. táblázat)

Minták IS I

életkor Cobb˚ IS II

életkor Cobb˚

1 15.23 62.00 17.72 88.00

2 14.00 62.00 16.93 79.00

3 17.44 77.00 14.58 51.00

4 15.94 54.00 16.27 63.00

5 14.28 78.00 14.97 46.00

6 17.43 52.00 19.83 42.00

7 15.58 52.00 24.60 66.00

8 13.46 54.00 15.22 48.00

9 16.98 60.00 16.06 33.00

10 16.66 65.00 20.91 57.00

Átlag 15.70 61.60 17.71 57.30

4. táblázat Az RNS „pool”-ok kialakításában résztvevı egyének életkora és Cobb˚ értéke a

mintavétel idején. Két párhuzamos „pool” kialakítására volt lehetıség (IS I, ill. IS II), és

mindkét „pool” esetén külön kezeltük a konvex oldali, illetve a konkáv oldali mintákat

A 4. táblázatban szereplı egyének RNS „pool”-jából készített próbákat a humán 20K

Genomic Microarray (Microarray Inc) mikrochipekhez hibridizáltattuk. A kapott

fluoreszcens jelek automatikus beolvasása és a kapott értékek statisztikai elemzése után 63

génben találtunk szignifikáns eltérést a gerincoszlop konvex és konkáv oldali expressziós

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

50

szintjében; 22 gén mutatott erısebb konvex oldali expressziót, 41 pedig erısebb konkáv

oldalit. A továbbiakban az elsı microarray kísérletnél leírt bioinformatikai elemzéseket

végeztük el ezzel a génlistával is. Az 5. táblázatban látható génontológiai besorolásuk után

két területen tapasztaltunk a humán genom GO eloszlásához képest lényeges eltérést. Az

egyik a lipid anyagcsere (az 5. táblázatban pirossal bekeretezve az egymást átfedı GO

katagóriák), ahol a 63-ból 7 gén szerepel, a másik a fejlıdés (az 5. táblázatban kékkel

bekeretezve az egymást átfedı GO kategóriák), ahol pedig 13.

5. táblázat. A DAVID programcsomag által szolgáltatott táblázat, amely a 2.CHIP

kísérletben kapott, a gerincferdüléses betegek gerincoszlopának konvex és konkáv oldalán

génkifejezıdésbeli különbséget mutató gének biológiai folyamatokat jelölı GO kategóriák

szerinti besorolásából a legszignifikánsabb 25-öt mutatja. Pirossal bekeretezve a lipid

anyagcseréhez, kékkel a fejlıdéshez tartozó, átfedı GO katagóriák.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

51

Az elemzések egy a KEGG Pathway adatbázisban szereplı biológiai útvonalat is a

felszínre hoztak, amelyben a génlistánkból 3 gén is szerepel. A KEGG Pathway (Kyoto

Encyclopedia of Genes and Genomes) adatbázis a Japán Humán Genom Program részeként

jött létre és a sejten belüli kölcsönhatások olyan győjteménye, amelyet folyamatosan

bıvítenek és magas szinten annotálnak így adatai a aktuális tudásunknak leginkább megfelelı

naprakész információkat hordozzák (Kanehisa et al., 2010). A 9. ábrán látható az adipocita

szignálút (KEGG_PATHWAY:hsa04920), aminek három tagja: LEP (Leptin), PRKAG2

(alfa 1 AMP-aktivált protein kináz katalitikus alegysége), SLC2A1 (szolubilis karrier család

2 4. tagja (facilitált glükóz transzporter)) mutatott szignifikáns génexpressziós eltérést a

gerincoszlop két oldalán. Mindhárom gén esetében a gerincferdülés konvex oldalán

magasabb génexpressziós szintet észleltünk, mint a konkávon.

9. ábra. A KEGG_PATHWAY:hsa04920 adipocita szignálút folyamatábrája. Piros csillag

jelöli azokat a géneket, amelyek expressziója eltérést mutat a gerincoszlop két oldala között a

gerincferdüléses betegekben.

Az elızı elemzésünkben, ahol a biológiai folyamatokat jelölı GO kategóriákba soroltuk a

génlistán lévı géneket (5. táblázat), a szignifikánsan (P<0.05) megjelenı génontológiai

kategóriák két fı csoportot határoztak meg, nevezetesen a lipid metabolizmust és a fejlıdési

folyamatokat. A leptin gén mindkét megnevezett biológiai folyamatban szerepet játszik. Az

irodalmi bevezetıben is ismertettem a leptin lehetséges kapcsolódását a gerincferdülés

kialakulásához, így ezt a gént mindenféleképp további vizsgálatra érdemesnek tartottuk.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

52

Irodalmi adatok alapján a fejlıdéssel kapcsolatba hozható GO kategóriába tartozó további

két, a microarray vizsgálatban szignifikánsnak mutatkozó gént, a HOX7-et (msh homeobox

1) és a CDK5-öt (ciklin-dependens kináz 5) is kiválasztottuk még célzott vizsgálatok

elvégzésére. A kromoszóma lokalizációs elemzéseket elvégezve hét olyan gént találtunk,

melyek olyan kromoszóma szakaszra esnek, amit más laboratóriumok kapcsoltsági

analízisben az AIS-sel összefüggésbe hoztak (ld. 1. táblázat). Ezek a gének a következık

voltak: GPR107 (G-proteinhez kapcsolódó receptor 107)-9q34.11, ATAD1 (ATP-áz családba

tartozó AAA domént tartalmazó fehérje 1)-10q23.2, APC2 (vastagbél adenomatózus

polipózis 2)-19p13.3, APLN (apelin)-Xq25, CDK5-7q36.1, ARMC7 (armadilló ismétlıdést

tartalmazó fehérje 7)-17q25.1, CPN3 (copine 3)-8q21.3. (10. ábra) Ezen felül a microarray

kísérletben szignifikáns eltérést mutató gének listáján szereplı összes gén GeneCards leírását

feldolgozva összefüggést próbáltunk találni a gének jelenleg ismert funkciója és az AIS

pathomechanizmusára vonatkozó jelenleg ismert modellek között. Két gént találtunk

érdekesnek, az izomerı meghatározásában szereplı a disztonint (DST) (Dalpe et al., 1999a)

és a sérült izmok regenerálódásában fontos tenzint (TNS1)(Ishii and Lo, 2001).

10. ábra. Az ENSEMBL Genome browser által készített kariogram, ahol a második CHIP

kísérletben kapott, a scoliosisos és kontroll minták közötti génkifejezıdésbeli különbséget mutató

gének kromoszóma lokalizációja látható grafikus ábrázolással. Piros nyíllal jelöltem azokat a

kromoszóma szakaszokat, amelyek korábbi a kapcsoltsági analízis során már kandidáns génként

felmerültek (1. táblázat).

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

53

A microarray kísérletek mindig kiváló kiindulási alapként szolgálnak a génexpressziós

vizsgálatokban, mivel látótérbe hoznak a vizsgált jelenséggel funkcionális kapcsolatban álló,

de eddig az adott kontextusban még le nem írt géneket. Második lépésként azonban

mindenképp szükséges ellenırizni egy független módszerrel, hogy valóban fennáll-e a

megfigyelt génkifejezıdésbeli különbség. Ez a független módszer napjainkban általában

QRT-PCR.

Paravertebrális izmokban kifejezıdı mRNS-ek vizsgálata QRT-PCR-rel

A microarray vizsgálatok után az AIS-es betegek konvex és a konkáv oldali paravertebrális

izmainak génexpressziós analízisét elvégeztük kvantitatív valós idejő polimeráz láncreakció

(QRT-PCR) módszerrel is. Mivel minden egyes génhez külön-külön kell PCR reakciót

végezni ez technika már nem alkalmas nagyszámú gén vizsgálatára, így az elızıekben

ismertetett CHIP analízisekben a szignifikáns expresszióbeli különbséget mutató és az

irodalmi adatok alapján kiválasztott gének közül 13-t analizáltam tovább. Ezek a gének a

LMNA, VDR, COL15A1, JAK1, BMP4, IL4R, NTF3, LEP, CDK5, HOX7, NOS1, illetve a

NOS2 és a NOS3.

A QRT-PCR során a cDNS mintákat 4-6 személy RNS-ének elegyébıl állítottam elı. A

QRT-PCR során lehetıség van az amplifikációval egy idıben a PCR kinetikai-görbéjének

felvételére és a kiindulási mRNS mennyiségével arányos áttörési ciklusszám (threshold cycle,

Ct) meghatározására (Higuchi et al., 1993). A vizsgálni kívánt target gének expressziós

szintjét egy adott referencia gén, esetünkben az aktin, illetve a HPRT (hipoxantin

foszforibozil-transferáz 1) expressziós szintjére vonatkoztatjuk azért, hogy

összehasonlíthassuk a gerincoszlop két oldalán a target gén kifejezıdést. A komparatív ∆Ct-

módszer alkalmazásával meghatároztuk azokat a géneket, ahol legalább kétszeres különbség

van a két oldali izombiopszia közt a relatív mRNS szint tekintetében, vagyis a ∆Ctkonvex-

∆Ctkonkáv 1-nél nagyobb, vagy -1-nél kisebb. A 13 gén közül egyedül a leptin esetén tudtunk

kimutatni eltérést, a konvex oldalon a leptin relatív mRNS mennyisége 2,5-szerese a

konkávénak. A 11. ábrán pirossal jelölve láthatók a leptinnél kapott értékek.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta

Ct átlag konvex

LMNA VDR COL15A1 AKT JAK1 19.615HPRT BMP4 21.685IL4R 22.325NTF3 26.275HPRT 21.505LEP CDK5 HOX7 HPRT NOS1 NOS2 25.795NOS3 21.945HPRT 20.045

11. ábra. Konvex és konkáv oldal közötti RNS expresszió

alkalmazásával 13 gén esetén. Az

ciklusszámok átlagát (Ct), a belı

ciklusszámot (∆ Ct) és a konvex és konkáv oldal közötti ci

Az ábra B. részén az A. rész

szemléletesen látható, hogy csak a LEP gén esetén található több, mint egy ciklusszám különbség,

amit konvencionálisan valós különbségnek lehet tekinteni a QRT

LMNA

VDR

COL15A1

JAK1

-1

-0.5

0

0.5

1

1.5

∆ ∆

Ct

konv

ex-k

onká

v

A

B

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

54

Ct átlag konvex

Ct átlag konkáv

∆ Ct konvex

∆ Ct konkáv

∆∆Ct konvex-konkáv

18.86 19.3 2.095 2.705 -0.61 24.52 24.37 7.755 7.775 -0.02 17.89 17.99 1.12 1.395 -0.275 16.77 16.59 0 0 0

19.615 19.49 -2.165 -2.405 0.24 21.78 21.895 0 0 0

21.685 22.56 0.18 0.82 -0.64 22.325 22.9 0.82 1.16 -0.34 26.275 26.035 4.77 4.295 0.475 21.505 21.74 0 0 0 21.53 20.16 1.69 0.37 1.32 21.33 21.55 1.49 1.76 -0.27

27.8 28.33 7.96 8.54 -0.58 19.84 19.79 0 0 0 21.45 21.37 1.405 0.97 0.435

25.795 26.25 5.75 5.85 -0.1 21.945 22.345 1.9 1.945 -0.13 20.045 20.4 0 0 0

Konvex és konkáv oldal közötti RNS expresszió különbség meghatározása a

Az ábra A. részén két párhuzamos QRT-PCR-bıl származó kitörési

(Ct), a belılük számított, aktin, illetve HPRT referenciagénhez normált

és a konvex és konkáv oldal közötti ciklusszám különbséget (∆∆ Ct) adtam meg

utolsó oszlopában lévı értékeket ábrázoltam grafikusan, így

szemléletesen látható, hogy csak a LEP gén esetén található több, mint egy ciklusszám különbség,

amit konvencionálisan valós különbségnek lehet tekinteni a QRT-PCR használatakor

COL15A1

JAK1

BMP4

IL4R

NTF3

LEP

CDK5

HOX7

NOS1

NOS2 NOS3

Ph.D. értekezés, 2010

a ∆Ct-módszer

l származó kitörési

HPRT referenciagénhez normált

Ct) adtam meg.

értékeket ábrázoltam grafikusan, így

szemléletesen látható, hogy csak a LEP gén esetén található több, mint egy ciklusszám különbség,

NOS3

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

55

Polimorfikus helyek vizsgálata

Annak ellenére, hogy több tanulmány is megjelent a paravertebrális izmok vizsgálatáról,

amelyekben a két oldal között eltérı strukturális, fehérjeszintbeli és génkifejezıdési

mintázatot írtak le, a tudományos közvélemény inkább a kialakult gerincferdülés

következményének, nem pedig az okának tartja a megfigyelt különbségeket. Amennyiben a

megfigyelt eltérések genetikai okaira sikerül fényt deríteni, akkor jelenthetı ki, hogy a

betegség kóroki tényezıi, nem pedig a gerincferdülés következtében kialakult eltérések a

megfigyelt jelenségek. Több strukturális gén kódoló szekvenciájában lévı mutációt

vizsgáltak eddig, de nem találtak eltérést az AIS-es betegekben. Egyre több humán betegség

kapcsán derül ki, hogy a gének szabályozó régióiban lévı nukleotid eltéréseknek szerepe

lehet az adott betegség kialakításában, így mindenképp indokoltnak láttuk, hogy a leptin gén

esetén megvizsgáljuk annak az SNP-nek az elıfordulási gyakoriságát, amelynek szerepe lehet

a leptin gén szabályozásában. Egy 2007-ben megjelent közleményben bemutatták, hogy az

IL6 promóter régiójában - a transzkripció szabályozásban érintett - polimorfikus hely

asszociációt mutat a gerincferdüléssel, amit mi is megpróbálunk igazolni (Aulisa et al., 2007).

Mivel mindkét vizsgálni kívánt SNP olyan gének szabályozásában vehet részt, amelyek az

AIS-sel kapcsoltba hozható, zsírszövetben termelıdı adipokint kódolnak, szükségesnek

láttuk a két polimorfikus hely kombinatorikus analízisét is elvégezni.

Leptin promóter G-2548A polimorfizmusa

Eset-kontroll asszociációs vizsgálatainkban 126 idiopathiás scoliosisos beteg és 197

egészséges, egymással nem rokon személy esetében határoztuk meg a leptin gén G-2548A

(rs7799039) SNP genotípus eloszlását PCR-RFLP módszerrel. A genotípus eloszlás alapján

mindkét vizsgált csoport Hardy-Weinberg egyensúlyban volt. A genotípus eloszlást a 6.

táblázat A. része mutatja. Mivel a nagyfokú görbülettel rendelkezı AIS-es betegek nagyrésze

lány volt - ami egyezik az irodalmi adatokkal – külön vizsgáltuk a genotípus és allél eloszlást

ebben a csoportban is ( 6. táblázat B. része). A Hardy-Weinberg egyensúly továbbra is

fennállt. Az A allél elıfordulási gyakoriságának értéke magasabb a beteg csoportban (0.48

vs. 0.42), de a statisztikai értékelés azt mutatta, hogy sem az allélgyakoriság, sem a genotípus

gyakoriság szignifikánsan nem tér el a beteg és a kontroll csoport között (χ2=1.705, p=0.192).

A relatív kockázatbecslést elvégezve azt kaptuk, hogy az A allél jelenléte hajlamosít a

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

56

gerincferdülésre, mert az A allélt homozigóta vagy heterozigóta állapotban hordozó

személyekben megnıtt a scoliosis kialakulásának esélye a kontroll populációhoz képest (AA

vs. GG: OR=1.49 (CI:0.769-2.921); AG vs. GG: OR=1.513 (CI:0.894-2.562)). Amennyiben

külön vizsgáljuk a lányokat, azt találtuk, hogy az A allél még magasabb arányban fordul elı

az IS-es betegek közt, mint a teljes populáció esetén (0.52 vs. 0.48), de szignifikáns

különbséget itt sem találtunk a sem a genotípus eloszlásban (χ2=2.63 p=0.269) sem az

alléloszlásban (χ2=2.053, p=0.168). Az A allélt homozigóta formában hordozó nık esetén a

relatív esélyhányados értéke megnıtt (AA vs. GG: OR=2.02 (CI:0.824-4.961)) és az A allélt

heterozigóta formában hordozó nıkben pedig a gerincferdülés kockázata nem tér el a GG

homozigótáéktól (AG vs. GG: OR=1.118 (CI:0.583-2.422)), ami azt mutatja, hogy a nıkben

a leptin gén promóterében lévı, funkcionális polimorfizmus hajlamosító faktor lehet a

gerincferdülés kialakulásában.

A.

összes GG GA AA G A

AIS 126 31 70 25 132 120

1 0.24 0.56 0.2 0.52 0.48

Kontroll 196 65 96 35 226 166

1 0.33 0.48 0.18 0.58 0.42

B.

összes GG GA AA G A

AIS 96 21 51 24 93 99

1 0.22 0.53 0.25 0.48 0.52

Kontroll 83 23 47 13 93 73

1 0.28 0.56 0.16 0.56 0.44

6. táblázat. Leptin gén genotípus és allél gyakoriság eloszlás idiopathiás scoliosis-os és

egészséges populációba: A. teljes vizsgált csoportban, B. nıkben.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

57

IL6 promóter C-174G polimorfizmusa

Szintén PCR-RFLP módszerrel határoztuk meg az IL6 promóter régiójában lévı,

funkcionális SNP allélgyakoriságát is. A genotípusok eloszlása szerint fennállt a Hardy-

Weinberg egyensúly. Sem az allél, sem a genotípus eloszlásban nem találtunk szignifikáns

eltérést a gerincferdüléssel élık és az egészséges kontroll személyek között (χ2=0.779,

p=0.378) (7. táblázat). A relatív kockázatbecsléseket elvégezve a különbözı genotípusok

vonatkozásában az esélyhányados 1 körüli értékeket mutatott, az 1-tıl történı legnagyobb

eltérés a homozigóta párok összehasonlításakor mutatkozott GG vs. CC: OR=0.765 (CI:

0.396-1.468), ami alapján a GG genotípus protektívnek mondható. Külön értékelve a lányok

szubpopulációját nem kaptunk eltérést a teljes populációhoz képest, sem az

allélgyakoriságban, sem a relatív esélyhányados mértékében (GG vs. CC: OR=0.594 (CI:

0.242-1.457)).

A.

összes CC GC GG C G

AIS 126 25 67 34 117 135

1 0.2 0.53 0.27 0.46 0.54

Kontroll 197 36 97 64 169 225

1 0.18 0.49 0.33 0.43 0.57

B.

összes CC GC GG C G

AIS 96 21 48 27 90 102

1 0.22 0.5 0.28 0.47 0.53

Kontroll 83 12 46 25 70 96

1 0.15 0.55 0.3 0.42 0.58

7. táblázat. IL6 gén genotípus és allél gyakoriság eloszlása idiopathiás scoliosis-os és

egészséges populációban: A. teljes vizsgált csoportban, B. nıkben.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

58

12. ábra. Az MDR analízis az összes genotípus

kombinációt besorolja a betegség kialakulása

szempontjából alacsony (világosszürke hátterő)

vagy magas (sötétszürke hátterő) kockázatot jelentı

kategóriába. Minden egyes négyzetben a bal oldali

oszlop a scoliosisos a jobb oldali pedig a kontroll

személyek eloszlását mutatja.

A két polimorfizmus IS kialakulására hajlamosító együttes hatásának vizsgálata

Multifaktoriális öröklıdéső betegségek esetén több gén eltérı hozzájárulással a

környezettel kölcsönhatásban vesz részt a legtöbbször heterogén fenotípus kialakításában, így

2-3 gén egy adott allélkombinációja, legalábbis az esetek egy részében, hozzájárulhat a

betegség etiológiájához. A gén-gén kölcsönhatás feltárásához két eljárást is használtunk, az

elsı az MDR analízis, amely kisszámú mintaelem esetén is kimutatja az episztázist és a

módszer kidolgozói rámutattak, hogy akkor is alkalmas a gének közötti szinergizmus

kimutatására, ha az allél eloszlásban nem mutatkozik eltérés a beteg-kontroll vizsgálat során

(Hahn et al., 2003a). A génkombinációk hatásának maximum likelihood becslését alkalmazza

a másik statisztikai módszer és

megadja, hogy egy adott

génkombináció milyen mértékben

emeli meg a betegség kialakulásának

esélyét egy másik

génkombinációhoz viszonyítva.

Az MDR analízis a LEP promóter

SNP és az IL6 promóter SNP között

szinergiát jelzett. A 12. ábrán a

kereszttáblán összerendezett

genotípus kombinációk láthatók,

minden egyes négyzetben bal oldali

oszlop a scoliosisos jobb oldali pedig

a kontroll személyek eloszlását

mutatja. Az MDR analízis

végeredményként minden genotípus

kombinációt besorol vagy alacsony,

vagy magas kockázatot jelentı

csoportba. A grafikus ábrázolás

szerint világosszürke kitöltéssel az

alacsony, míg sötétszürke háttérrel a

magas rizikójúakat jelölve.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

59

Mivel az MDR analízis arra alkalmas, hogy felfedje az episztázist és megadja azokat a

genotípus kombinációkat, amelyek hordozása kockázatot jelent az adott betegség

kialakulására, további vizsgálatot végeztünk annak a megállapítására, hogy milyen mértékő

kockázatot jelentenek az egyes genotípus kombinációk a gerincferdülés esetén. Ehhez a LEP

G-2548A és az IL6 C-174G polimorfizmus genotípusait páronként összerendeztük és relatív

kockázat közelítı becslését végeztük el a legkevésbé hajlamosító genotípus kombinációhoz

képest adva meg az esélyhányadosokat. Az elızı fejezetekben leírtak alapján a LEP gén

esetében az A allél hordozása jelentett magasabb kockázatot, ezért a GG homozigóta lehet a

legkevésbé hajlamosító genotípus, míg az IL6 esetén a GG genotípus protektívnek bizonyult.

Így a LEP GG-IL6 GG genotípus kombináció lehet a legkevésbé hajlamosító, amit alátámaszt

az MDR analízis is, mivel alacsony kockázattal bírónak jelölte ezt a genotípus kombinációt.

A relatív esélyhányadosok kiszámolásánál ez volt a referencia, amit 1.00-es szám jelöl a 8.

táblázatban. A LEP GG-IL6 GG genotípus kombinációhoz viszonyítva a leginkább

hajlamosító kombináció az IL6 CC-LEP AA, ami azt jelenti, hogy a hajlamosító genotípust

hordozó egyénnél szignifikánsan (χ2=5.511, p=0.019), közel ötször nagyobb (OR=4.667

(CI:1.237-17.6)) az esélye a gerincferdülés kialakulásának, mint a referenciának tekintett

genotípussal bíró személyé.

Az MDR analízis és a ML becslésen alapuló kombinációs hatás vizsgálat eredményei jól

összeegyeztethetık, mivel azokat a genotípus kombinációkat jelölte magas rizikót jelentınek

az elsı vizsgálat, amelyekben a relatív OR értéke magasabb volt 1.5-nél.

8. táblázat Az allélkombinációk kombinatorikus hatásának kimutatása a relatív

esélyhányadosok megadásával

LEP G-2548A

GG GA AA

CC 0.848 (0.212-3.391) 1.283 (0.439-3.752) 4.667 (1.237-17.600)

GC 1.273 (0.483-3.355) 1.887 (0.775-4.595) 1.51 (0.508-4.484)

GG 1.00 1.633 (0.626-4.264) 0.787 (0.183-2.814) IL6

C-1

74G

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

60

Amennyiben a relatív esélyhányadost meghatározzuk csak a lányok esetén, akkor azt kapjuk,

hogy a leginkább hajlamosító allélkombináció (IL6 CC-LEP AA) hordozása még nagyobb

kockázatot jelent a gerincferdülés kialakulásában (OR= 6.667 (CI:0.597-74.506). A relatív

esélyhányadoshoz tartozó konfidencia intervallum elég széles, ami az esélyhányados

értékének megbízhatóságát rontja és ez egyértelmően az alacsony mintaszámnak tudható be.

A polimorfizmusok hatása az IS súlyosbodására

További statisztikai elemzéseket végeztünk annak felderítésére, hogy a LEP promóter G-

2548A polimorfizmusa, illetve az IL6 promóter C-174T polimorfizmusa szerepet játszik-e a

gerincferdülés progressziójában. Nem találtunk szignifikáns összefüggést sem a LEP -

p=0.712 (ANOVA) -, sem az IL6 - p=0.586 (ANOVA) – polimorfizmusa és a Cobb˚ között.

Meghatároztuk minden egyes genotípus kombinációhoz tartozó átlagos Cobb˚-ot és nem

találtunk olyan genotípus kombinációt, amelyhez az összes adatból számolt átlagtól

szignifikánsan eltérı Cobb˚ társult volna. A fentiek alapján úgy gondoljuk, hogy a LEP AA-

IL6 CC genotípus kombináció a betegség kialakításában inkább hajlamosító, nem az AIS

súlyosbodásában vehet részt.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

61

EREDMÉNYEK MEGVITATÁSA

A komplex betegségek etiológiájának feltárása a XXI. század kutatóinak egyik

legnagyobb kihívása. A mendeli öröklıdésmenetet követı monogénes betegségek genetikai

hátterét a rendelkezésre álló módszerekkel jórészt feltárták, vagy nagy lépésekkel haladnak e

cél elérése felé. Ezzel ellentétben az emberek többségét érintı multifaktoriális, poligénes

betegségek genetikai elemeinek azonosítása eddig nem hozott áttörı eredményt.

Természetesen tudtak azonosítani hajlamosító allélokat különbözı betegségekben, de csak

azoknál, ahol az adott allél jelenléte nagymértékben hozzájárult a betegség kialakulásához.

Jelen dolgozatban a serdülıkori populáció 10%-át érintı, ismert ok nélkül kialakuló

gerincferdülés genetikai hátterében álló elemek felkutatására vonatkozó vizsgálataimat írtam

le. Két megközelítést használtunk a munkánk során. Az elsı megközelítésünk szerint az AIS

etiológiájában szerepet játszó gének (kandidáns gén) kiválasztása a transzkriptoma szintjén

jelenlévı eltéréseken alapult. Vizsgálatainkra a gerincoszlop két oldalán elhelyezkedı izmok

RNS mintáit választottuk, amit a korrekciós mőtét során kivett izombiopsziákból nyertünk. A

paravertebrális izmok génexpressziós változásait vizsgáltuk microarray analízissel két

különbözı összehasonlítással. Az elsı CHIP kísérletben egészséges és AIS-es betegek külön-

külön „pool”-ozott mintáit vetettük össze és 187 génben tudtunk génexpresszióbeli eltérést

detektálni. A másodikban a kontroll minták kihagyásával csak az AIS-es betegek konvex és

konkáv oldali izmainak expressziós szintő összehasonlítását végeztük el és 63 génben

tudtunk különbséget kimutatni. A microarray kísérletek az elsı szőrıt jelentették a jelölt gén

kiválasztásában, a másodikat bioinformatikai adatelemzéssel végeztük el.

Meghatároztuk a génlistáinkon lévı gének kromoszóma lokalizációját és két szempont

szerint is átnéztük a gének elhelyezkedését. Egyrészrıl kerestünk olyan kromoszóma

szakaszokat, ahová több gén is térképezıdik közel egymáshoz, mert egy helyen lévı és

egyforma expressziós eltérést mutató gének esetén gondolhatunk valamiféle genomszintő

átrendezıdésre az adott régióban (delécióra vagy inszercióra). Ilyet nem tudtunk kimutatni.

Másrészrıl, azokat a géneket a késıbbiekben mindenféleképpen érdemes tovább vizsgálni,

amelyek olyan kromoszóma szakaszra esnek, amit családokon kapcsoltsági analízissel az

AIS-hez kötöttek (1. táblázat). Nyolc ilyen gént találtunk, amelyek közül kettınek (NTF3 és

CDK5) meghatároztuk a relatív mRNS mennyiségét az AIS-es betegek gerincoszlopának

konvex és konkáv oldalán QRT-PCR-rel és nem tudtunk különbséget kimutatni a két oldal

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

62

között. A többi 6 gén további vizsgálata még az elkövetkezendı idıszak hátralévı feladatai

közé tartozik.

A két elvégzett microarray egy 187, illetve egy 63 tagból álló génlistát eredményezett,

melyek tagjait a génontológiai kategóriákhoz rendeltük, olyan GO kategóriákat keresve,

amelyekben a génjeink a humán genom átlagos GO eloszlásához képest magasabb arányban

reprezentáltak és szerepük lehet az AIS kialakításában. Az elsı CHIP kísérletbıl nem tudtunk

ilyen kategóriát kiemelni, de a másodikból a lipid anyagcsere (GO:0006629) és a

morfogenezis (GO:0007275) is felvetıdött; ebbe a két katagóriába a 63 génbıl összesen 18-at

tudtunk besorolni. A lipid anyagcsere érintettségét az AIS-ben alátámaszthatja az a tény is,

hogy az adipociták szignálútjának (KEGG_Pathway: hsa04920) több elemében is (LEP,

PRKAG2, SLC2A1) ki tudtuk mutatni a génexpressziós különbséget a második microarray

analízisben, amikor a konvex és konkáv oldali paraspinális izmok transzkriptomáit

hasonlítottuk össze. A leptin szerepének további vizsgálatához elıször egy független

módszerrel, a QRT-PCR-rel meghatároztuk az AIS betegekre jellemzı génexpressziós

szintet. Az így kapott eredmény megerısítette a microarray analízisben megfigyelt értéket,

vagyis a LEP génrıl az izmokban termelıdı mRNS mennyisége a konvex oldalon 2.5-

szerese a konkávénak. Ahhoz, hogy minél kevesebb információt veszítsünk el a microarray

adatokból egy a tudományos szakirodalmi adatokon alapuló szőrıt is beépítettünk

vizsgálatainkba, azaz a listán szereplı gének közül az adatbázisokban és a rendelkezésre álló

publikációs forrásokban fellelhetı adatok tanulmányozása után kiemeltük azokat,

amelyeknek szerepük lehet az AIS etiológiájában. Egy részüket ezidáig már sikerült tovább

célzott vizsgáltnak alávetni arra vonatkozóan, hogy megerısíthetıek-e a microarray

analízisben kapott eredmények. A génlistánk másik részének esetében azonban ezek a

vizsgálatok még elıttünk állnak. QRT-PCR-módszert használtuk, annak a kimutatására, hogy

az AIS-es betegek paravertebrális izmaiban tapasztalható-e különbség az adott gének

expressziójában attól függıen, hogy a konvex vagy a konkáv oldalról származtak-e. A már az

elızıekben említett leptin kivitelével nem találtunk több gént, ahol szignifikáns expressziós

különbség állt volna fenn. Az irodalomban eddig egy közlemény jelent meg a paravertebrális

izmok molekuláris biológiai vizsgálatáról, ahol Western-blottinggal a kalmodulin és a NOS1

fehérje mennyiségét vizsgálták a görbült gerincoszlop két oldaláról származó sejtlizátumban.

Mind az egészséges kontrollhoz, mind pedig a konkáv oldalhoz képest csökkent fehérje

mennyiségeket találtak a konvex oldalon (Zhao and Qiu, 2004). Ennek az eredménynek a

kapcsán vizsgáltuk meg mindhárom nitrogénmonoxid szintetáz mRNS mennyiségét, mivel az

elsı microarray analíziskor mi is azt tapasztaltuk, hogy a kontrollhoz képest csökkent a

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

63

NOS1mRNS mennyisége az AIS-es betegben. Ezt az eltérést azonban nem tudtuk kimutatni

az AIS-es betegekben a konvex és konkáv oldali génexpresszió vonatkozásában.

A microarray analízisben kapott és az AIS kialakulásának lehetséges okai közé

beilleszthetı gének közül további vizsgálatra érdemesek azok a gének, amelyek a

kapcsoltsági vizsgálatok által jelölt kromoszóma szakaszra esnek. Mivel a paraspinális izmok

megfelelı izomereje nagyon fontos a gerincoszlop támasztásában és az AIS-es betegekben

valóban kimutattak eltéréseket a konvex és a konkáv oldali izomaktivitásban, azok a gének,

amelyek az izmok izomerejének kialakításában vesznek részt jelöltek lehetnek a betegség

súlyosbodásáért felelıs progressziós génként az AIS etiológiájában (Cheung et al., 2005a).

Az irodalmi adatok alapján a disztonin kandidáns lehet az AIS progressziós génjeként, mivel

a desmin és az aktin szálak keresztkötésével az izomsejtek struktúrájának stabilizálásában

van fontos szerepe. A disztonin hiányos egerek izomgyengeséget mutatnak (Dalpe et al.,

1999b). Az AIS-es betegek paravertebrális konvex és konkáv oldali izmainak expresszióját

összehasonlítva a disztonin gén mRNS mennyisége kétszer magasabb a konvex oldalon, mint

a konkávon a CHIP hibridizálás eredménye szerint, viszont ezt az eredményt független

módszerrel a késıbbiekben igazolni kell.

A génkifejezıdés szabályozása az egyik nagyon sokat tanulmányozott területe a molekuláris

biológiának. A transzkripciós faktorok, a cisz regulációs elemek és a kromatin átszervezıdés

génszabályozásban betöltött szerepe régóta a sejt és molekuláris biológia egyik

legintenzívebben kutatott területe. A komplex betegségek vonatkozásában az elmúlt

idıszakban egyre nagyobb figyelem fordul a génkifejezıdés módosulatai mögött álló

allélspecifikus transzkripció felé. Többen is kimutatták, hogy a humán gének 20 %-ában a

gén két alléljáról nem egyforma mértékben fejezıdnek ki a géntermékek, aminek az egyik

oka a gének promóter régiójában található, funkcionális polimorfizmus lehet (Lo et al., 2003).

A leptin gén promóter régiójában is található olyan SNP, aminek hatása lehet a

génkifejezıdésre, amint részletesen kifejtve a dolgozat bevezetıjében leírtam. A dolgozatban

bemutatott munka során megvizsgáltuk, hogy az általunk detektált génexpressziós

különbségben szerepet játszik-e a LEP G-2548A polimorfizmus. Az irodalmi adatok alapján

az összefüggés a LEP gén alléljei és a vérszérumban mért leptin szint között ellentmondó,

valószínőleg a köztük lévı kapcsolatot más tényezık is befolyásolják (Yiannakouris et al.,

2003). Egy eset-kontroll tanulmány során meghatároztuk a LEP genotípusok elıfordulási

gyakoriságát mindkét populációban és kiszámoltuk a különbözı genotípusok

esélyhányadosait. Nem kaptunk szignifikáns eltérést a két populáció között a genotípus

gyakoriságok tekintetében, de az esélyhányadosok meghatározása után úgy tőnik, hogy az A

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

64

allél jelenléte lehet hajlamosító faktor az AIS-ben. Vizsgálatainkban az AA vs. GG:

OR=1.513(CI:0.894-2.562), ami komplex betegségek esetén a hajlamosító allélokra jellemzı

értéknek tekinthetı (Baron, 2001).

Kíváncsiak voltunk arra, milyen más tényezı befolyásolja a LEP -2548A allél hatását.

Elıször a szérum leptinszint nemek közti különbségébıl kiindulva megvizsgáltuk a csak

külön a lányokat tartalmazó vizsgálati csoport esetében a LEP genotípus gyakoriságát, de

ebben a szubpopulációban sem kaptunk szignifikáns eltérést. Az esélyhányados értéke

megnıtt (AA vs. GG: OR=2.02(CI:0.824-4.961)), ami azt jelzi, hogy a leptinnek a lányokban

nagyobb szerepe lehet az AIS kialakításában. A komplex betegségekben a gének egymással

bonyolult kölcsönhatásban alakítják ki a fenotípust, ezért a leptinnel funkcionális

kölcsönhatásban lévı gének vizsgálatával is értékes információhoz juthatunk az AIS

etiológiáját illetıen. Bioinformatikai eszközök használatával jelenítettük meg az

interakciókat. Ehhez a STRING 8.2 adatbázist használtuk, ami az ismert és prediktált, fizikai

és funkcionális fehérje kölcsönhatásokat több forrásból összegyőjtve tartalmazza (Jensen et

al., 2009). Ez az adatbázis jelenleg 630 élılény 2,590,259 fehérjéjét tartalmazza. A 13. ábrán

látható a leptinre jellemzı hálózat ábrázolása. A leptin és a leptin receptora körül két csoport

rajzolódik ki, melyek több különbözı szempont alapján összegyőjtött kölcsönható fehérjéket

tartalmaznak. A 13. ábrán látható táblázatból további elemzésre az IL6-ot választottuk ki,

mert egy nemrég megjelent közleményben már vizsgálták az AIS-sel összefüggésben (Aulisa

et al., 2007).

13. ábra. A STRING

programcsomag által

készített hálózat, amely a leptin interakciós partnereit

jeleníti meg.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

65

Az IL6 G-174C SNP GG genotípusát szignifikánsan magasabb elıfordulási gyakorisággal

találták meg egy olasz eset-kontroll tanulmányban, ahol Aulisa és mtsai 53 AIS-es beteg és

206 egészséges kontroll egyed genotípusát határozták meg. A GG genotípus kétszer olyan

gyakran fordult elı az AIS-esek között, mint a kontroll populációban (0.52 vs. 0.26) és az

esélyhányados OR= 10.54-nak adódott, ami szokatlanul magas egy multifaktoriális betegség

esetén (Aulisa et al., 2007). Elvégezve a genotipizálást nem tudtunk kimutatni semmilyen

eltérést a genotípus eloszlásban, az OR értékének egytıl való legnagyobb eltérése a két

homozigóta pár összehasonlításánál adódott GG vs. CC: OR=0.765 (CI: 0.396-1.478), ami a

G allél protektív tulajdonságát jelzi, és ellentmond az olasz kutatócsoport által tett

megfigyelésnek. A komplex betegségek asszociációs vizsgálatánál a reprodukálhatóság kicsi,

aminek okát több összefoglaló cikk is taglalja (Hirschhorn et al., 2002; Newton-Cheh and

Hirschhorn, 2005). A megismételhetıség hiányának fıbb okait a nem megfelelı kísérleti

elrendezésben, a kicsi statisztikai erıben vagy a populáció rétegzıdésében jelölik meg.

Kiemelik, hogy a multifaktoriális betegségek esetén a gének és a környezeti tényezık közötti

komplex kölcsönhatás figyelembe vétele is fontos lehet. Még több, megfelelı statisztikai

erıvel rendelkezı, független populáción elvégzett eset-kontroll tanulmány elvégzése

szükséges ahhoz, hogy eldönthetı legyen az IL6 promóter polimorfizmusának asszociációja a

gerincferdüléshez.

A LEP és az IL6 gének közötti episztázis analízist két független statisztikai módszerrel is

elvégeztük, mindkettı szerint létezik az alléljeik között kölcsönhatás és a LEP AA-IL6 CC

genotípus kombináció hordozása szignifikánsan magasabb kockázatot jelent az AIS

kialakulásában (OR=4.667 (CI:1.237-17.6). Mivel a Cobb˚ és a genotípusok között nem

találtunk összefüggést úgy gondoljuk, hogy a LEP AA-IL6 CC genotípus kombináció az AIS

kialakulására hajlamosít, nem pedig a progressziójában játszhat szerepet.

Az AIS etiológiájában fontos szerepe van az örökletes tényezıknek, de a kiterjedt kutatások

ellenére a mai napig nem sikerült olyan gént/géneket találni, melyek hibái az AIS

kialakulásáért lennének felelısek. A sikertelenségnek több oka is lehet, és ezek a komplex

betegségekre általánosan jellemzı tulajdonságokból erednek. Egyrészrıl a komplex

betegségek multigénes öröklıdésőek, ahol egy-egy génhiba hozzájárulása a fenotípus

kialakulásához nem minden esetben egyforma, sıt még a környezeti tényezık is

befolyásolhatják azt. Másrészrıl egy adott betegség megjelenési formája mögött teljesen más

pathomechanizmus is állhat, mivel a komplex betegségek gyakran genetikailag heterogének.

Az AIS genetikai modellje szerint a betegség kialakulása két szakaszra osztható, egy

iniciációs és egy progressziós fázisra (14. ábra). Feltételezések szerint más-más gének hibái

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

66

felelısek a hajlamosításra és a súlyosbodásra. Ezért nem csak a prediszponáló, hanem a

progressziós gének azonosítása is fontos. Amennyiben bizonyos génhibák, vagy

polimorfizmusok ismeretében megjósolható a súlyosbodás mértéke, akkor a megfelelı

terápiás kezelések kerülhetnek alkalmazásra. A legújabb kutatási eredmények szerint

kifejlesztettek olyan genetikai tesztet, amely alkalmas annak az eldöntésére, hogy mennyi a

kockázata a görbület további súlyosbodásának (Ogilvie, 2009).

14.ábra A jelenleg elfogadott genetikai modell az AIS kialakulására

Környezeti faktorok

Progressziós gének

Normál pubertás

Az AIS kezdete

Iniciációs gének

A görbület progressziója a

csontosodás befejezıdéséig

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

67

IRODALOMJEGYZÉK

Acaroglu,E., I.Akel, A.Alanay, M.Yazici and R.Marcucio: Comparison of the melatonin and calmodulin in paravertebral muscle and platelets of patients with or without adolescent idiopathic scoliosis. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 34, E659-E663(2009).

Aksenovich,T.I., I.R.Semenov, E.K.Ginzburg and A.M.Zaidman: [Preliminary analysis of inheritance of scoliosis]. Genetika Dev. 24, 2056-2063 (1988).

Alden,K.J., B.Marosy, N.Nzegwu, C.M.Justice, A.F.Wilson and N.H.Miller: Idiopathic scoliosis: identification of candidate regions on chromosome 19p13. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 31, 1815-1819 (2006).

Ambrosini,G., A.K.Nath, M.R.Sierra-Honigmann and J.Flores-Riveros: Transcriptional activation of the human leptin gene in response to hypoxia. Involvement of hypoxia-inducible factor 1. J.Biol.Chem. Dev. 277, 34601-34609 (2002).

Aulisa,L., P.Papaleo, E.Pola, F.Angelini, A.G.Aulisa, F.C.Tamburrelli, P.Pola and C.A.Logroscino: Association between IL-6 and MMP-3 gene polymorphisms and adolescent idiopathic scoliosis: a case-control study. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 32, 2700-2702 (2007).

Bagnall,K.M., V.J.Raso, D.L.Hill, M.Moreau, J.K.Mahood, H.Jiang, G.Russell, M.Bering and G.R.Buzzell: Melatonin levels in idiopathic scoliosis. Diurnal and nocturnal serum melatonin levels in girls with adolescent idiopathic scoliosis. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 21, 1974-1978 (1996).

Baron,M.: The search for complex disease genes: fault by linkage or fault by association? Mol.Psychiatry Dev. 6, 143-149 (2001).

Bashiardes,S., R.Veile, M.Allen, C.A.Wise, M.Dobbs, J.A.Morcuende, L.Szappanos, J.A.Herring, A.M.Bowcock and M.Lovett: SNTG1, the gene encoding gamma1-syntrophin: a candidate gene for idiopathic scoliosis. Hum.Genet. Dev. 115, 81-89 (2004).

Bellyei,A., A.Czeizel, O.Barta, T.Magda and L.Molnar: Prevalence of adolescent idiopathic scoliosis in Hungary. Acta Orthop.Scand. Dev. 48, 177-180 (1977).

Bienertova-Vasku,J., P.Bienert, J.Tomandl, M.Forejt, M.Vavrina, J.Kudelkova and A.Vasku: No association of defined variability in leptin, leptin receptor, adiponectin, proopiomelanocortin and ghrelin gene with food preferences in the Czech population. Nutr.Neurosci. Dev. 11, 2-8 (2008).

Blanchard,F., L.Duplomb, M.Baud'huin and B.Brounais: The dual role of IL-6-type cytokines on bone remodeling and bone tumors. Cytokine Growth Factor Rev. Dev. 20, 19-28 (2009).

Blum,W.F., P.Englaro, S.Hanitsch, A.Juul, N.T.Hertel, J.Muller, N.E.Skakkebaek, M.L.Heiman, M.Birkett, A.M.Attanasio, W.Kiess and W.Rascher: Plasma leptin levels in healthy children and adolescents: dependence on body mass index, body fat mass, gender, pubertal stage, and testosterone. J.Clin.Endocrinol.Metab Dev. 82, 2904-2910 (1997).

Boiardi,L., B.Casali, E.Farnetti, N.Pipitone, D.Nicoli, F.Cantini, P.Macchioni, G.Bajocchi, M.G.Catanoso, L.Pulsatelli, D.Consonni and C.Salvarani: Relationship between interleukin 6

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

68

promoter polymorphism at position -174, IL-6 serum levels, and the risk of relapse/recurrence in polymyalgia rheumatica. J.Rheumatol. Dev. 33, 703-708 (2006).

Burke,J.G., G.W.RW, D.Conhyea, D.McCormack, F.E.Dowling, M.G.Walsh and J.M.Fitzpatrick: Human nucleus pulposis can respond to a pro-inflammatory stimulus. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 28, 2685-2693 (2003).

Burner,W.L., III, V.M.Badger and F.C.Sherman: Osteoporosis and acquired back deformities. J.Pediatr.Orthop. Dev. 2, 383-385 (1982).

Burwell,R.G., R.K.Aujla, M.P.Grevitt, P.H.Dangerfield, A.Moulton, T.L.Randell and S.I.Anderson: Pathogenesis of adolescent idiopathic scoliosis in girls - a double neuro-osseous theory involving disharmony between two nervous systems, somatic and autonomic expressed in the spine and trunk: possible dependency on sympathetic nervous system and hormones with implications for medical therapy. Scoliosis. Dev. 4, 24(2009).

Burwell,R.G., P.H.Dangerfield and B.J.Freeman: Concepts on the pathogenesis of adolescent idiopathic scoliosis. Bone growth and mass, vertebral column, spinal cord, brain, skull, extra-spinal left-right skeletal length asymmetries, disproportions and molecular pathogenesis. Stud.Health Technol.Inform. Dev. 135, 3-52 (2008a).

Burwell,R.G., P.H.Dangerfield and B.J.Freeman: Etiologic theories of idiopathic scoliosis. Somatic nervous system and the NOTOM escalator concept as one component in the pathogenesis of adolescent idiopathic scoliosis. Stud.Health Technol.Inform. Dev. 140, 208-217 (2008b).

Carlsson,B., K.Lindell, B.Gabrielsson, C.Karlsson, R.Bjarnason, O.Westphal, U.Karlsson, L.Sjostrom and L.M.Carlsson: Obese (ob) gene defects are rare in human obesity. Obes.Res. Dev. 5, 30-35 (1997).

Carr,A.J., D.J.Ogilvie, B.P.Wordsworth, L.M.Priestly, R.Smith and B.Sykes: Segregation of structural collagen genes in adolescent idiopathic scoliosis. Clin.Orthop.Relat Res. Dev. 305-310 (1992).

Chan,V., G.C.Fong, K.D.Luk, B.Yip, M.K.Lee, M.S.Wong, D.D.Lu and T.K.Chan: A genetic locus for adolescent idiopathic scoliosis linked to chromosome 19p13.3. Am.J.Hum.Genet. Dev. 71, 401-406 (2002).

Cheng,J.C., X.Guo and A.H.Sher: Persistent osteopenia in adolescent idiopathic scoliosis. A longitudinal follow up study. Spine Dev. 24, 1218-1222 (1999).

Cheng,J.C., L.Qin, C.S.Cheung, A.H.Sher, K.M.Lee, S.W.Ng and X.Guo: Generalized low areal and volumetric bone mineral density in adolescent idiopathic scoliosis. J.Bone Miner.Res. Dev. 15, 1587-1595 (2000).

Cheng,J.C., S.P.Tang, X.Guo, C.W.Chan and L.Qin: Osteopenia in adolescent idiopathic scoliosis: a histomorphometric study. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 26, E19-E23(2001).

Cheung,J., J.P.Halbertsma, A.G.Veldhuizen, W.J.Sluiter, N.M.Maurits, J.C.Cool and J.R.van Horn: A preliminary study on electromyographic analysis of the paraspinal musculature in idiopathic scoliosis. Eur.Spine J. Dev. 14, 130-137 (2005a).

Cheung,K.M., T.Wang, A.M.Poon, A.Carl, B.Tranmer, Y.Hu, K.D.Luk and J.C.Leong: The effect of pinealectomy on scoliosis development in young nonhuman primates. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 30, 2009-2013 (2005b).

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

69

Cheung,K.M., T.Wang, G.X.Qiu and K.D.Luk: Recent advances in the aetiology of adolescent idiopathic scoliosis. Int.Orthop. Dev. 32, 729-734 (2008).

Cowell,H.R., J.N.Hall and G.D.MacEwen: Genetic aspects of idiopathic scoliosis. A Nicholas Andry Award essay, 1970. Clin.Orthop.Relat Res. Dev. 86, 121-131 (1972).

Czeizel,A., A.Bellyei, O.Barta, T.Magda and L.Molnar: Genetics of adolescent idiopathic scoliosis. J.Med.Genet. Dev. 15, 424-427 (1978).

Dalpe,G., M.Mathieu, A.Comtois, E.Zhu, S.Wasiak, Y.De Repentigny, N.Leclerc and R.Kothary: Dystonin-deficient mice exhibit an intrinsic muscle weakness and an instability of skeletal muscle cytoarchitecture. Dev.Biol. Dev. 210, 367-380 (1999a).

Dalpe,G., M.Mathieu, A.Comtois, E.Zhu, S.Wasiak, Y.De Repentigny, N.Leclerc and R.Kothary: Dystonin-deficient mice exhibit an intrinsic muscle weakness and an instability of skeletal muscle cytoarchitecture. Dev.Biol. Dev. 210, 367-380 (1999b).

De Laet,C., J.A.Kanis, A.Oden, H.Johanson, O.Johnell, P.Delmas, J.A.Eisman, H.Kroger, S.Fujiwara, P.Garnero, E.V.McCloskey, D.Mellstrom, L.J.Melton, III, P.J.Meunier, H.A.Pols, J.Reeve, A.Silman and A.Tenenhouse: Body mass index as a predictor of fracture risk: a meta-analysis. Osteoporos.Int. Dev. 16, 1330-1338 (2005).

DeRisi,J., L.Penland, P.O.Brown, M.L.Bittner, P.S.Meltzer, M.Ray, Y.Chen, Y.A.Su and J.M.Trent: Use of a cDNA microarray to analyse gene expression patterns in human cancer. Nat.Genet. Dev. 14, 457-460 (1996).

Dieudonne,M.N., F.Machinal-Quelin, V.Serazin-Leroy, M.C.Leneveu, R.Pecquery and Y.Giudicelli: Leptin mediates a proliferative response in human MCF7 breast cancer cells. Biochem.Biophys.Res.Commun. Dev. 293, 622-628 (2002).

Ducy,P., M.Amling, S.Takeda, M.Priemel, A.F.Schilling, F.T.Beil, J.Shen, C.Vinson, J.M.Rueger and G.Karsenty: Leptin inhibits bone formation through a hypothalamic relay: a central control of bone mass. Cell Dev. 100, 197-207 (2000).

Elefteriou,F., J.D.Ahn, S.Takeda, M.Starbuck, X.Yang, X.Liu, H.Kondo, W.G.Richards, T.W.Bannon, M.Noda, K.Clement, C.Vaisse and G.Karsenty: Leptin regulation of bone resorption by the sympathetic nervous system and CART. Nature Dev. 434, 514-520 (2005).

Fagan,A.B., D.J.Kennaway and A.D.Sutherland: Total 24-hour melatonin secretion in adolescent idiopathic scoliosis. A case-control study. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 23, 41-46 (1998).

Fishman,D., G.Faulds, R.Jeffery, V.Mohamed-Ali, J.S.Yudkin, S.Humphries and P.Woo: The effect of novel polymorphisms in the interleukin-6 (IL-6) gene on IL-6 transcription and plasma IL-6 levels, and an association with systemic-onset juvenile chronic arthritis. J.Clin.Invest Dev. 102, 1369-1376 (1998).

Gangwar,R., B.Mittal and R.D.Mittal: Association of interleukin-6 -174G>C promoter polymorphism with risk of cervical cancer. Int.J.Biol.Markers Dev. 24, 11-16 (2009).

Gao,X., D.Gordon, D.Zhang, R.Browne, C.Helms, J.Gillum, S.Weber, S.Devroy, S.Swaney, M.Dobbs, J.Morcuende, V.Sheffield, M.Lovett, A.Bowcock, J.Herring and C.Wise: CHD7 gene polymorphisms are associated with susceptibility to idiopathic scoliosis. Am.J.Hum.Genet. Dev. 80, 957-965 (2007).

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

70

Gong,D.W., S.Bi, R.E.Pratley and B.D.Weintraub: Genomic structure and promoter analysis of the human obese gene. J.Biol.Chem. Dev. 271, 3971-3974 (1996).

Guo,X., W.W.Chau, Y.L.Chan and J.C.Cheng: Relative anterior spinal overgrowth in adolescent idiopathic scoliosis. Results of disproportionate endochondral-membranous bone growth. J.Bone Joint Surg.Br. Dev. 85, 1026-1031 (2003).

Hahn,L.W., M.D.Ritchie and J.H.Moore: Multifactor dimensionality reduction software for detecting gene-gene and gene-environment interactions. Bioinformatics. Dev. 19, 376-382 (2003b).

Hahn,L.W., M.D.Ritchie and J.H.Moore: Multifactor dimensionality reduction software for detecting gene-gene and gene-environment interactions. Bioinformatics. Dev. 19, 376-382 (2003a).

Higuchi,R., C.Fockler, G.Dollinger and R.Watson: Kinetic PCR analysis: real-time monitoring of DNA amplification reactions. Biotechnology (N.Y) Dev. 11, 1026-1030 (1993).

Hinuy,H.M., M.H.Hirata, N.Forti, J.Diament, M.F.Sampaio, D.Armaganijan, L.A.Salazar and R.D.Hirata: Leptin G-2548A promoter polymorphism is associated with increased plasma leptin and BMI in Brazilian women. Arq Bras.Endocrinol.Metabol. Dev. 52, 611-616 (2008).

Hirose,Y., K.Chiba, T.Karasugi, M.Nakajima, Y.Kawaguchi, Y.Mikami, T.Furuichi, F.Mio, A.Miyake, T.Miyamoto, K.Ozaki, A.Takahashi, H.Mizuta, T.Kubo, T.Kimura, T.Tanaka, Y.Toyama and S.Ikegawa: A functional polymorphism in THBS2 that affects alternative splicing and MMP binding is associated with lumbar-disc herniation. Am.J.Hum.Genet. Dev. 82, 1122-1129 (2008).

Hirschhorn,J.N., K.Lohmueller, E.Byrne and K.Hirschhorn: A comprehensive review of genetic association studies. Genet.Med. Dev. 4, 45-61 (2002).

Hoffstedt,J., P.Eriksson, S.Mottagui-Tabar and P.Arner: A polymorphism in the leptin promoter region (-2548 G/A) influences gene expression and adipose tissue secretion of leptin. Horm.Metab Res. Dev. 34, 355-359 (2002).

Holloway,W.R., F.M.Collier, C.J.Aitken, D.E.Myers, J.M.Hodge, M.Malakellis, T.J.Gough, G.R.Collier and G.C.Nicholson: Leptin inhibits osteoclast generation. J.Bone Miner.Res. Dev. 17, 200-209 (2002).

Holt,I., M.W.Davie and M.J.Marshall: Osteoclasts are not the major source of interleukin-6 in mouse parietal bones. Bone Dev. 18, 221-226 (1996).

Huang,d.W., B.T.Sherman and R.A.Lempicki: Systematic and integrative analysis of large gene lists using DAVID bioinformatics resources. Nat.Protoc. Dev. 4, 44-57 (2009).

Ishii,A. and S.H.Lo: A role of tensin in skeletal-muscle regeneration. Biochem.J. Dev. 356, 737-745 (2001).

Jensen,L.J., M.Kuhn, M.Stark, S.Chaffron, C.Creevey, J.Muller, T.Doerks, P.Julien, A.Roth, M.Simonovic, P.Bork and C.von Mering: STRING 8--a global view on proteins and their functional interactions in 630 organisms. Nucleic Acids Res. Dev. 37, D412-D416(2009).

Justice,C.M., N.H.Miller, B.Marosy, J.Zhang and A.F.Wilson: Familial idiopathic scoliosis: evidence of an X-linked susceptibility locus. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 28, 589-594 (2003).

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

71

Kanehisa,M., S.Goto, M.Furumichi, M.Tanabe and M.Hirakawa: KEGG for representation and analysis of molecular networks involving diseases and drugs. Nucleic Acids Res. Dev. 38, D355-D360(2010).

Kesling,K.L. and K.A.Reinker: Scoliosis in twins. A meta-analysis of the literature and report of six cases. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 22, 2009-2014 (1997).

Kindsfater,K., T.Lowe, D.Lawellin, D.Weinstein and J.Akmakjian: Levels of platelet calmodulin for the prediction of progression and severity of adolescent idiopathic scoliosis. J.Bone Joint Surg.Am. Dev. 76, 1186-1192 (1994).

Kouwenhoven,J.W. and R.M.Castelein: The pathogenesis of adolescent idiopathic scoliosis: review of the literature. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 33, 2898-2908 (2008).

Kwan,T.S., M.Padrines, S.Theoleyre, D.Heymann and Y.Fortun: IL-6, RANKL, TNF-alpha/IL-1: interrelations in bone resorption pathophysiology. Cytokine Growth Factor Rev. Dev. 15, 49-60 (2004).

Lao,M.L., D.H.Chow, X.Guo, J.C.Cheng and A.D.Holmes: Impaired dynamic balance control in adolescents with idiopathic scoliosis and abnormal somatosensory evoked potentials. J.Pediatr.Orthop. Dev. 28, 846-849 (2008).

Le Stunff,C., C.Le Bihan, N.J.Schork and P.Bougneres: A common promoter variant of the leptin gene is associated with changes in the relationship between serum leptin and fat mass in obese girls. Diabetes Dev. 49, 2196-2200 (2000).

Leon,L.R., A.A.White and M.J.Kluger: Role of IL-6 and TNF in thermoregulation and survival during sepsis in mice. Am.J.Physiol Dev. 275, R269-R277(1998).

Li,X.F., H.Li, Z.D.Liu and L.Y.Dai: Low bone mineral status in adolescent idiopathic scoliosis. Eur.Spine J. Dev. 17, 1431-1440 (2008).

Liu,T., W.C.Chu, G.Young, K.Li, B.H.Yeung, L.Guo, G.C.Man, W.W.Lam, S.T.Wong and J.C.Cheng: MR analysis of regional brain volume in adolescent idiopathic scoliosis: neurological manifestation of a systemic disease. J.Magn Reson.Imaging Dev. 27, 732-736 (2008).

Lo,H.S., Z.Wang, Y.Hu, H.H.Yang, S.Gere, K.H.Buetow and M.P.Lee: Allelic variation in gene expression is common in the human genome. Genome Res. Dev. 13, 1855-1862 (2003).

Lowe,T.G., M.Edgar, J.Y.Margulies, N.H.Miller, V.J.Raso, K.A.Reinker and C.H.Rivard: Etiology of idiopathic scoliosis: current trends in research. J.Bone Joint Surg.Am. Dev. 82-A, 1157-1168 (2000).

Machida,M., J.Dubousset, Y.Imamura, T.Iwaya, T.Yamada and J.Kimura: An experimental study in chickens for the pathogenesis of idiopathic scoliosis. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 18, 1609-1615 (1993).

Machida,M., J.Dubousset, Y.Imamura, Y.Miyashita, T.Yamada and J.Kimura: Melatonin. A possible role in pathogenesis of adolescent idiopathic scoliosis. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 21, 1147-1152 (1996).

Machida,M., I.Murai, Y.Miyashita, J.Dubousset, T.Yamada and J.Kimura: Pathogenesis of idiopathic scoliosis. Experimental study in rats. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 24, 1985-1989 (1999).

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

72

Mammes,O., D.Betoulle, R.Aubert, B.Herbeth, G.Siest and F.Fumeron: Association of the G-2548A polymorphism in the 5' region of the LEP gene with overweight. Ann.Hum.Genet. Dev. 64, 391-394 (2000).

Mantzoros,C.S. and S.J.Moschos: Leptin: in search of role(s) in human physiology and pathophysiology. Clin.Endocrinol.(Oxf) Dev. 49, 551-567 (1998).

Marosy,B., C.M.Justice, N.Nzegwu, G.Kumar, A.F.Wilson and N.H.Miller: Lack of association between the aggrecan gene and familial idiopathic scoliosis. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 31, 1420-1425 (2006).

Martin,A., V.David, L.Malaval, M.H.Lafage-Proust, L.Vico and T.Thomas: Opposite effects of leptin on bone metabolism: a dose-dependent balance related to energy intake and insulin-like growth factor-I pathway. Endocrinology Dev. 148, 3419-3425 (2007).

Mason,M.M., Y.F.He, H.Chen, M.J.Quon and M.Reitman: Regulation of leptin promoter function by Sp1, C/EBP, and a novel factor. Endocrinology Dev. 139, 1013-1022 (1998).

Miller,N.H., C.M.Justice, B.Marosy, K.F.Doheny, E.Pugh, J.Zhang, H.C.Dietz, III and A.F.Wilson: Identification of candidate regions for familial idiopathic scoliosis. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 30, 1181-1187 (2005).

Miller,N.H., B.Marosy, C.M.Justice, S.M.Novak, E.Y.Tang, P.Boyce, J.Pettengil, K.F.Doheny, E.W.Pugh and A.F.Wilson: Linkage analysis of genetic loci for kyphoscoliosis on chromosomes 5p13, 13q13.3, and 13q32. Am.J.Med.Genet.A Dev. 140, 1059-1068 (2006).

Miller,N.H., B.Mims, A.Child, D.M.Milewicz, P.Sponseller and S.H.Blanton: Genetic analysis of structural elastic fiber and collagen genes in familial adolescent idiopathic scoliosis. J.Orthop.Res. Dev. 14, 994-999 (1996).

Misol,S., I.V.Ponseti, N.Samaan and J.T.Bradbury: Growth hormone blood levels in patients with idiopathic scoliosis. Clin.Orthop.Relat Res. Dev. 81, 122-125 (1971).

Montanaro,L., P.Parisini, T.Greggi, M.Di Silvestre, D.Campoccia, S.Rizzi and C.R.Arciola: Evidence of a linkage between matrilin-1 gene (MATN1) and idiopathic scoliosis. Scoliosis. Dev. 1, 21(2006).

Moreau,A., D.S.Wang, S.Forget, B.Azeddine, D.Angeloni, F.Fraschini, H.Labelle, B.Poitras, C.H.Rivard and G.Grimard: Melatonin signaling dysfunction in adolescent idiopathic scoliosis. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 29, 1772-1781 (2004).

Newton-Cheh,C. and J.N.Hirschhorn: Genetic association studies of complex traits: design and analysis issues. Mutat.Res. Dev. 573, 54-69 (2005).

Ocaka,L., C.Zhao, J.A.Reed, N.D.Ebenezer, G.Brice, T.Morley, M.Mehta, J.O'Dowd, J.L.Weber, A.J.Hardcastle and A.H.Child: Assignment of two loci for autosomal dominant adolescent idiopathic scoliosis to chromosomes 9q31.2-q34.2 and 17q25.3-qtel. J.Med.Genet. Dev. 45, 87-92 (2008).

Oegema,T.R., Jr., D.S.Bradford, K.M.Cooper and R.E.Hunter: Comparison of the biochemistry of proteoglycans isolated from normal, idiopathic scoliotic and cerebral palsy spines. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 8, 378-384 (1983).

Ogilvie,J.: Adolescent idiopathic scoliosis and genetic testing. Curr.Opin.Pediatr. Dev. (2009).

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

73

Ostlund,R.E., Jr., J.W.Yang, S.Klein and R.Gingerich: Relation between plasma leptin concentration and body fat, gender, diet, age, and metabolic covariates. J.Clin.Endocrinol.Metab Dev. 81, 3909-3913 (1996).

Ostrowski,K., T.Rohde, S.Asp, P.Schjerling and B.K.Pedersen: Pro- and anti-inflammatory cytokine balance in strenuous exercise in humans. J.Physiol Dev. 515 ( Pt 1), 287-291 (1999).

Pedrini,V.A., I.V.Ponseti and S.C.Dohrman: Glycosaminoglycans of intervertebral disc in idiopathic scoliosis. J.Lab Clin.Med. Dev. 82, 938-950 (1973).

Peltonen,L. and V.A.McKusick: Genomics and medicine. Dissecting human disease in the postgenomic era. Science Dev. 291, 1224-1229 (2001).

Porter,R.W.: The pathogenesis of idiopathic scoliosis: uncoupled neuro-osseous growth? Eur.Spine J. Dev. 10, 473-481 (2001b).

Porter,R.W.: The pathogenesis of idiopathic scoliosis: uncoupled neuro-osseous growth? Eur.Spine J. Dev. 10, 473-481 (2001a).

Qi,L., R.M.van Dam, J.B.Meigs, J.E.Manson, D.Hunter and F.B.Hu: Genetic variation in IL6 gene and type 2 diabetes: tagging-SNP haplotype analysis in large-scale case-control study and meta-analysis. Hum.Mol.Genet. Dev. 15, 1914-1920 (2006).

Qi,L., C.Zhang, R.M.van Dam and F.B.Hu: Interleukin-6 genetic variability and adiposity: associations in two prospective cohorts and systematic review in 26,944 individuals. J.Clin.Endocrinol.Metab Dev. 92, 3618-3625 (2007).

Qiu,X.S., N.L.Tang, H.Y.Yeung, J.C.Cheng and Y.Qiu: Lack of association between the promoter polymorphism of the MTNR1A gene and adolescent idiopathic scoliosis. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 33, 2204-2207 (2008).

Qiu,X.S., N.L.Tang, H.Y.Yeung, K.M.Lee, V.W.Hung, B.K.Ng, S.L.Ma, R.H.Kwok, L.Qin, Y.Qiu and J.C.Cheng: Melatonin receptor 1B (MTNR1B) gene polymorphism is associated with the occurrence of adolescent idiopathic scoliosis. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 32, 1748-1753 (2007a).

Qiu,X.S., N.L.Tang, H.Y.Yeung, Y.Qiu and J.C.Cheng: Genetic association study of growth hormone receptor and idiopathic scoliosis. Clin.Orthop.Relat Res. Dev. 462, 53-58 (2007b).

Qiu,Y., X.Sun, X.S.Qiu, W.G.Li, Z.Z.Zhu, F.Zhu, B.Wang, Y.Yu and B.P.Qian: Decreased circulating leptin level and its association with body and bone mass in girls with adolescent idiopathic scoliosis. Spine Dev. 32, 2703-2710 (2007c).

Raggio,C.L., P.F.Giampietro, S.Dobrin, C.Zhao, D.Dorshorst, N.Ghebranious, J.L.Weber and R.D.Blank: A novel locus for adolescent idiopathic scoliosis on chromosome 12p. J.Orthop.Res. Dev. 27, 1366-1372 (2009).

Rasko,I.,Downes C.S.: Genes in Medicine Molecular biology and human genetic disorders (Chapman&Hall) (1994).

Ravaglia,G., P.Forti, F.Maioli, M.Chiappelli, P.Dolzani, M.Martelli, M.Bianchin, E.Mariani, L.Bolondi and F.Licastro: Associations of the -174 G/C interleukin-6 gene promoter polymorphism with serum interleukin 6 and mortality in the elderly. Biogerontology. Dev. 6, 415-423 (2005).

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

74

Ribeiro,R., A.P.Araujo, A.Coelho, R.Catarino, D.Pinto, A.Araujo, C.Calcada, C.Lopes and R.Medeiros: A functional polymorphism in the promoter region of leptin gene increases susceptibility for non-small cell lung cancer. Eur.J.Cancer Dev. 42, 1188-1193 (2006).

Ribeiro,R., A.Vasconcelos, S.Costa, D.Pinto, A.Morais, J.Oliveira, F.Lobo, C.Lopes and R.Medeiros: Overexpressing leptin genetic polymorphism (-2548 G/A) is associated with susceptibility to prostate cancer and risk of advanced disease. Prostate Dev. 59, 268-274 (2004).

Riseborough,E.J. and R.Wynne-Davies: A genetic survey of idiopathic scoliosis in Boston, Massachusetts. J.Bone Joint Surg.Am. Dev. 55, 974-982 (1973).

Roach,J.W.: Adolescent idiopathic scoliosis. Orthop.Clin.North Am. Dev. 30, 353-viii(1999).

Roberts,S., J.Menage and S.M.Eisenstein: The cartilage end-plate and intervertebral disc in scoliosis: calcification and other sequelae. J.Orthop.Res. Dev. 11, 747-757 (1993).

Rodriguez,S., T.R.Gaunt and I.N.Day: Hardy-Weinberg equilibrium testing of biological ascertainment for Mendelian randomization studies. Am.J.Epidemiol. Dev. 169, 505-514 (2009).

Roth,J.A., B.G.Kim, W.L.Lin and M.I.Cho: Melatonin promotes osteoblast differentiation and bone formation. J.Biol.Chem. Dev. 274, 22041-22047 (1999).

Roth,M.: Idiopathic scoliosis caused by a short spinal cord. Acta Radiol.Diagn.(Stockh) Dev. 7, 257-271 (1968).

Sadat-Ali,M., A.Al Othman, D.Bubshait and D.Al Dakheel: Does scoliosis causes low bone mass? A comparative study between siblings. Eur.Spine J. Dev. 17, 944-947 (2008).

Saladin,R., P.De Vos, M.Guerre-Millo, A.Leturque, J.Girard, B.Staels and J.Auwerx: Transient increase in obese gene expression after food intake or insulin administration. Nature Dev. 377, 527-529 (1995).

Salehi,L.B., M.Mangino, S.De Serio, D.De Cicco, F.Capon, S.Semprini, A.Pizzuti, G.Novelli and B.Dallapiccola: Assignment of a locus for autosomal dominant idiopathic scoliosis (IS) to human chromosome 17p11. Hum.Genet. Dev. 111, 401-404 (2002).

Satomura,K., S.Tobiume, R.Tokuyama, Y.Yamasaki, K.Kudoh, E.Maeda and M.Nagayama: Melatonin at pharmacological doses enhances human osteoblastic differentiation in vitro and promotes mouse cortical bone formation in vivo. J.Pineal Res. Dev. 42, 231-239 (2007).

Sevastik,J., R.G.Burwell and P.H.Dangerfield: A new concept for the etiopathogenesis of the thoracospinal deformity of idiopathic scoliosis: summary of an electronic focus group debate of the IBSE. Eur.Spine J. Dev. 12, 440-450 (2003).

Shohat,M., T.Shohat, M.Nitzan, M.Mimouni, R.Kedem and Y.L.Danon: Growth and ethnicity in scoliosis. Acta Orthop.Scand. Dev. 59, 310-313 (1988).

Skibola,C.F., E.A.Holly, M.S.Forrest, A.Hubbard, P.M.Bracci, D.R.Skibola, C.Hegedus and M.T.Smith: Body mass index, leptin and leptin receptor polymorphisms, and non-hodgkin lymphoma. Cancer Epidemiol.Biomarkers Prev. Dev. 13, 779-786 (2004).

Smith,A.J., F.D'Aiuto, J.Palmen, J.A.Cooper, J.Samuel, S.Thompson, J.Sanders, N.Donos, L.Nibali, D.Brull, P.Woo and S.E.Humphries: Association of serum interleukin-6 concentration with a functional IL6 -6331T>C polymorphism. Clin.Chem. Dev. 54, 841-850 (2008).

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

75

Snoussi,K., A.D.Strosberg, N.Bouaouina, S.Ben Ahmed, A.N.Helal and L.Chouchane: Leptin and leptin receptor polymorphisms are associated with increased risk and poor prognosis of breast carcinoma. BMC Cancer Dev. 6, 38(2006).

Soyka,L.A., S.Grinspoon, L.L.Levitsky, D.B.Herzog and A.Klibanski: The effects of anorexia nervosa on bone metabolism in female adolescents. J.Clin.Endocrinol.Metab Dev. 84, 4489-4496 (1999).

Spencer,G.S. and M.J.Eccles: Spinal muscle in scoliosis. Part 2. The proportion and size of type 1 and type 2 skeletal muscle fibres measured using a computer-controlled microscope. J.Neurol.Sci. Dev. 30, 143-154 (1976).

Stokes,I.A. and D.D.Aronsson: Disc and vertebral wedging in patients with progressive scoliosis. J.Spinal Disord. Dev. 14, 317-322 (2001).

Stokes,I.A. and J.P.Laible: Three-dimensional osseo-ligamentous model of the thorax representing initiation of scoliosis by asymmetric growth. J.Biomech. Dev. 23, 589-595 (1990).

Strobel,A., T.Issad, L.Camoin, M.Ozata and A.D.Strosberg: A leptin missense mutation associated with hypogonadism and morbid obesity. Nat.Genet. Dev. 18, 213-215 (1998).

Taguchi,Y., M.Yamamoto, T.Yamate, S.C.Lin, H.Mocharla, P.DeTogni, N.Nakayama, B.F.Boyce, E.Abe and S.C.Manolagas: Interleukin-6-type cytokines stimulate mesenchymal progenitor differentiation toward the osteoblastic lineage. Proc.Assoc.Am.Physicians Dev. 110, 559-574 (1998).

Taylor,T.K., P.Ghosh and G.R.Bushell: The contribution of the intervertebral disk to the scoliotic deformity. Clin.Orthop.Relat Res. Dev. 79-90 (1981).

Thalmann,S. and C.A.Meier: Local adipose tissue depots as cardiovascular risk factors. Cardiovasc.Res. Dev. 75, 690-701 (2007).

THILLARD,M.J.: [Vertebral column deformities following epiphysectomy in the chick.]. C R.Hebd.Seances Acad.Sci. Dev. 248, 1238-1240 (1959).

Thomas,K.A., S.D.Cook, T.C.Skalley, S.V.Renshaw, R.S.Makuch, M.Gross, T.S.Whitecloud, III and J.T.Bennett: Lumbar spine and femoral neck bone mineral density in idiopathic scoliosis: a follow-up study. J.Pediatr.Orthop. Dev. 12, 235-240 (1992).

Thomas,T., F.Gori, S.Khosla, M.D.Jensen, B.Burguera and B.L.Riggs: Leptin acts on human marrow stromal cells to enhance differentiation to osteoblasts and to inhibit differentiation to adipocytes. Endocrinology Dev. 140, 1630-1638 (1999).

Trayhurn,P. and I.S.Wood: Adipokines: inflammation and the pleiotropic role of white adipose tissue. Br.J.Nutr. Dev. 92, 347-355 (2004).

Upadhyay,R., M.Jain, S.Kumar, U.C.Ghoshal and B.Mittal: Association of interleukin-6 (-174G>C) promoter polymorphism with risk of squamous cell esophageal cancer and tumor location: an exploratory study. Clin.Immunol. Dev. 128, 199-204 (2008).

Veldhuizen,A.G., D.J.Wever and P.J.Webb: The aetiology of idiopathic scoliosis: biomechanical and neuromuscular factors. Eur.Spine J. Dev. 9, 178-184 (2000).

Walsh,P.S., D.A.Metzger and R.Higuchi: Chelex 100 as a medium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from forensic material. Biotechniques Dev. 10, 506-513 (1991).

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

76

Wang,J.L., R.Liu, M.Hawkins, N.Barzilai and L.Rossetti: A nutrient-sensing pathway regulates leptin gene expression in muscle and fat. Nature Dev. 393, 684-688 (1998).

Wang,T.N., M.C.Huang, W.T.Chang, A.M.Ko, E.M.Tsai, C.S.Liu, C.H.Lee and Y.C.Ko: G-2548A polymorphism of the leptin gene is correlated with extreme obesity in Taiwanese aborigines. Obesity (Silver.Spring) Dev. 14, 183-187 (2006).

Weimann,E., W.F.Blum, C.Witzel, S.Schwidergall and H.J.Bohles: Hypoleptinemia in female and male elite gymnasts. Eur.J.Clin.Invest Dev. 29, 853-860 (1999).

Wise,C.A., R.Barnes, J.Gillum, J.A.Herring, A.M.Bowcock and M.Lovett: Localization of susceptibility to familial idiopathic scoliosis. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 25, 2372-2380 (2000).

Wynne-Davies,R.: Familial (idiopathic) scoliosis. A family survey. J.Bone Joint Surg.Br. Dev. 50, 24-30 (1968).

Xiao,P., P.Y.Liu, Y.Lu, Y.F.Guo, D.H.Xiong, L.H.Li, R.R.Recker and H.W.Deng: Association tests of interleukin-6 (IL-6) and type II tumor necrosis factor receptor (TNFR2) genes with bone mineral density in Caucasians using a re-sampling approach. Hum.Genet. Dev. 117, 340-348 (2005).

Yamada,R., T.Tanaka, M.Unoki, T.Nagai, T.Sawada, Y.Ohnishi, T.Tsunoda, M.Yukioka, A.Maeda, K.Suzuki, H.Tateishi, T.Ochi, Y.Nakamura and K.Yamamoto: Association between a single-nucleotide polymorphism in the promoter of the human interleukin-3 gene and rheumatoid arthritis in Japanese patients, and maximum-likelihood estimation of combinatorial effect that two genetic loci have on susceptibility to the disease. Am.J.Hum.Genet. Dev. 68, 674-685 (2001).

Yapijakis,C., M.Kechagiadakis, E.Nkenke, Z.Serefoglou, D.Avgoustidis, A.Vylliotis, D.Perrea, F.W.Neukam, E.Patsouris and E.Vairaktaris: Association of leptin -2548G/A and leptin receptor Q223R polymorphisms with increased risk for oral cancer. J.Cancer Res.Clin.Oncol. Dev. 135, 603-612 (2009).

Yeung,H.Y., N.L.Tang, K.M.Lee, B.K.Ng, V.W.Hung, R.Kwok, X.Guo, L.Qin and J.C.Cheng: Genetic association study of insulin-like growth factor-I (IGF-I) gene with curve severity and osteopenia in adolescent idiopathic scoliosis. Stud.Health Technol.Inform. Dev. 123, 18-24 (2006).

Yiannakouris,N., L.Melistas, M.Yannakoulia, K.Mungal and C.S.Mantzoros: The-2548G/A polymorphism in the human leptin gene promoter region is associated with plasma free leptin levels; interaction with adiposity and gender in healthy subjects. Hormones.(Athens.) Dev. 2, 229-236 (2003).

Zhang,F., M.B.Basinski, J.M.Beals, S.L.Briggs, L.M.Churgay, D.K.Clawson, R.D.DiMarchi, T.C.Furman, J.E.Hale, H.M.Hsiung, B.E.Schoner, D.P.Smith, X.Y.Zhang, J.P.Wery and R.W.Schevitz: Crystal structure of the obese protein leptin-E100. Nature Dev. 387, 206-209 (1997).

Zhang,H.Q., S.J.Lu, M.X.Tang, L.Q.Chen, S.H.Liu, C.F.Guo, X.Y.Wang, J.Chen and L.Xie: Association of estrogen receptor beta gene polymorphisms with susceptibility to adolescent idiopathic scoliosis. Spine (Phila Pa 1976.) Dev. 34, 760-764 (2009).

Zhang,Y., R.Proenca, M.Maffei, M.Barone, L.Leopold and J.M.Friedman: Positional cloning of the mouse obese gene and its human homologue. Nature Dev. 372, 425-432 (1994).

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

77

Zhao,L.J., H.Jiang, C.J.Papasian, D.Maulik, B.Drees, J.Hamilton and H.W.Deng: Correlation of obesity and osteoporosis: effect of fat mass on the determination of osteoporosis. J.Bone Miner.Res. Dev. 23, 17-29 (2008).

Zhao,Y. and G.X.Qiu: [Expression of calmodulin and nNOS in the paraspinal muscles in idiopathic scoliosis]. Zhonghua Yi.Xue.Za Zhi. Dev. 84, 1358-1361 (2004).

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

78

KÖSZÖNETNYILVÁNÍTÁS

Ezúton szeretnék köszönetet mondani mindazoknak, akik a munkámban és a dolgozatom

elkészítésében segítettek.

Elıször is hálásan köszönöm Dr. Raskó Istvánnak, hogy lehetıvé tette a kutatómunkám

végezését a csoportjában, köszönöm a tudományos irányítást és az anyagi támogatás

biztosítását.

Nagyon köszönöm a Humán Molekuláris Munkacsoport minden volt és jelenlegi tagjának a

jó munkahelyi légkört, a segítıkészséget és azt a támogatást, amit a hosszú évek alatt

nyújtottak. Külön köszönöm Dr. Mórocz Mónikának, Szécsényi Anitának, Dr. Álmos

Péternek, Dragon Annamáriának és Grózer Zsuzsannának, hogy a dolgozat megírásához

szakmai segítséget nyújtottak. Nem tudok elég hálás lenni Lehıcz Istvánnénak és Radóné

Dudás Máriának az asszisztensi munkájukért és barátságukért.

Köszönetemet szeretném kifejezni Dr. Endreffy Emıkének és Dr. Illés Tamásnak a

munkához szükséges mintákért; Dr. Zvara Ágnesnek a microarray kísérletekben nyújtott

baráti segítségért és végül, de nem utolsó sorban Dr. Monostori Évának az irántam való

türelméért és a dolgozat megírásához szükséges baráti támogatásért.

Köszönöm szüleimnek, férjemnek és gyerekeimnek, hogy a munkámmal járó nehézségeket

elviselték, a dolgozat megírását türelemmel fogadták és mindenben támogattak.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

79

ÖSSZEFOGLALÁS

A XXI. században a társadalom nagyobb részét érintı, komplex betegségek etiológiai

vizsgálatai kerültek a humángenetikai kutatások középpontjába. Ezekre a betegségekre

jellemzı, hogy több gén hibás mőködése a környezeti hatásokkal kölcsönhatásban alakítja ki

ıket és genetikailag is heterogének lehetnek, például a szív- és érrendszeri betegségek. Az

általunk vizsgált, a felnıttkor elején valamely ismert ok nélkül kialakuló gerincferdülés (AIS)

olyan komplex betegség, amelynek genetikai hátterérıl a kiterjedt kutatások ellenére nem

tudunk sokat. Az AIS klinikai kórképe változatos, eltérı lehet a kialakulás ideje, a görbület

progressziójának mértéke, sebessége és nagysága. Az esetek döntı többségében a

gerincferdülés kezdete a serdülıkorra tehetı, ezért valószínősítik, hogy a növekedéssel

kapcsolatos hormonális, metabolikus és biomechanikai változások szerepet játszhatnak az

AIS pathomechanizmusában. A lányoknál a rövidebb idı alatt és gyorsabban lezajló

serdülıkori fejlıdés lehet az oka annak, hogy 3.4-szer gyakoribb a nagyobb mértékő

gerincferdülés a körükben, mint a fiúknál. Az elmúlt 40 év alatt számos területen keresték a

deformitás kialakulásának okát, vizsgálták: a csont- és a kötıszövet, valamint a harántcsíkolt

izmok strukturális eltéréseit; a neurológiai rendellenességeket; a hormonháztartás

egyensúlyát; a biomechanikai hatásokat; a genetikai tényezıket. Az etiológiai kutatások

kezdetén kevés figyelem irányult a genetikai háttér felé, mivel a betegség többnyire

szórványosan lépett fel, és gyakran a családon belül halmozódó esetek sem mutattak

egyértelmő öröklıdést. Az AIS ma elfogadott, genetikai modellje szerint a betegség

kialakulása két szakaszra osztható, egy iniciációs és egy progressziós fázisra és feltételezések

szerint más-más gének hibái felelısek a hajlamosításra és a súlyosbodásra.

Magyarországon a Pécsi Tudományegyetem Általános Orvosi Kar Ortopédiai Klinikáján

végzik az évi 450 új eset döntı többségének mőtéti korrekcióját. A dolgozatomban leírt

munkát szoros együttmőködésben végeztük a klinika tanszékvezetı professzorával Dr. Illés

Tamással, akitıl az AIS-es betegek vérmintáit és a korrekciós mőtét során a gerincoszlop két

oldaláról származó izombiopsziákat kaptuk.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

80

A munkánk során célul tőztük ki, hogy molekuláris szintő vizsgálatokban az AIS-re

jellemzı további eltéréseket tárjunk fel a harántcsíkolt izmok transzkriptoma analízisével és

az eltérések hátterében álló genetikai tényezıket vizsgáljuk.

Elıször CHIP microarray módszerrel kívántuk összehasonlítani külön-külön az:

1. Egészséges és scoliotikus paravertebrális izmok génkifejezıdési mintázatát,

valamint a:

2. Scoliotikus izmokban a görbület konvex és konkáv oldali génkifejezıdését.

Másodszor a génexpressziós vizsgálatok által jelölt gének SNP polimorfizmusát terveztük

vizsgálni asszociációs analízissel eset-kontroll tanulmányban.

A két microarray analízis eredményeként egy 187, illetve egy 63 tagból álló génlistát

kaptunk, melyek tagjait négy szempont alapján elemeztük annak eldöntésére, melyek azok a

gének, amelyek számításba jöhetnek a további vizsgálatokban.

1. Elıször biológiai folyamatokat jelölı génontológiai (GO) kategóriákhoz rendeltük a

génlista tagjait és olyan GO kategóriákat kerestünk, amelyekben a vizsgált gének a

humán genom átlagos GO eloszlásához képest magasabb arányban vannak jelen és

szerepük lehet az AIS kialakításában. A gerincferdüléses betegek gerincoszlopának

konvex és konkáv oldalán génkifejezıdésbeli különbséget mutató gének két GO

kategóriában, a lipid anyagcserében (GO:0006629) és a morfogenezisben

(GO:0007275) nagyobb arányban jelentek meg, ebbe a két kategóriába a 63 génbıl

összesen 18-at tudtunk besorolni.

2. A génlisták tagjainak közös biológiai, metabolikus útvonalban való szereplése és

együttes génexpressziós változásuk jelzi az adott folyamat fontosságát, ilyen útvonal

keresésekor több gén is expressziós változást mutatott az adipociták jelátviteli

mechanizmusában (KEGG_Pathway: hsa04920), ami a lipid anyagcsere érintettségét

az AIS-ben alátámasztja.

3. Meghatároztuk a génlistáinkon lévı gének kromoszóma lokalizációját és két

szempont szerint is átnéztük a gének elhelyezkedését. Egyrészrıl kerestünk olyan

kromoszóma szakaszokat, ahová több gén is térképezıdik közel egymáshoz, mert egy

helyen lévı és egyforma génkifejezıdésbeli eltérést mutató gének esetén

gondolhatunk valamiféle genomszintő átrendezıdésre az adott régióban (delécióra

vagy inszercióra). Ilyet nem tudtunk kimutatni. Másrészrıl kiválogattuk azokat a

géneket, amelyek olyan kromoszóma szakaszra esnek, amit családokon kapcsoltsági

analízissel a szakirodalom az AIS-hez kötöttnek tekint. Nyolc ennek megfelelı gént

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

81

találtunk, amelyeknek további vizsgálata szükséges.

4. Irodalmi kutatásokat végeztünk és a vonatkozó GeneCards leírások és számos

publikáció alapján összefüggést próbáltunk találni a gének jelenleg ismert funkciója

és az AIS pathomechanizmusára vonatkozó jelenleg ismert modellek között. Az

érdekesnek talált gének közül ötöt már tovább vizsgáltunk, de két ígéretes gén, az

izomerı meghatározásában szereplı a disztonin és a sérült izmok regenerálódásában

fontos tenzin célzott vizsgálata még várat magára.

A microarray kísérletek kiváló kiindulási alapként szolgálnak, mivel látótérbe hoznak a

vizsgált jelenséggel kapcsolatban álló új géneket. Következı lépésként azonban mindenképp

szükséges ellenırizni egy független módszerrel, hogy valóban fennáll-e a megfigyelt

génkifejezıdésbeli különbség. Ez a független módszer napjainkban általában a kvantitatív

valós idejő polimeráz láncreakció (QRT-PCR). A vizsgálatra kiválasztott 13 gén közül

egyedül a leptin (LEP) esetén tudtunk kimutatni eltérést a QRT-PCR-rel is. A scoliosisos

betegekben a görbült gerincoszlop konvex oldalán a leptin relatív mRNS mennyisége 2,5-

szerese a konkáv oldalénak és ennek az eredménynek kapcsán kezdtük el vizsgálni a LEP

gént.

A leptin szerepe az AIS kialakításában napjainkban merült fel a szakirodalomban és

eddig egyetlen közlemény jelent meg, amelyben az AIS-es lányokban alacsonyabb leptin

szérumszintet találtak az egészséges kontrollokhoz viszonyítva. Egy eset-kontroll

tanulmányban asszociációs analízissel a leptin gén promóter régiójában vizsgáltuk annak az

SNP-ének az elıfordulási gyakoriságát, amelynek szerepe lehet a leptin gén szabályozásában.

Az asszociációs vizsgálatba bevontuk az interleukin 6 (IL6) szabályozó régiójában lévı

polimorfizmust is, mivel egy közlemény szerint a gerincferdüléssel asszociációt mutatott. A

két SNP, a LEP G-2548A és a IL6 G-174C kimutatására a PCR-RFLP módszert használtuk

és 126 idiopathiás scoliosisos beteg és 197 egészséges, egymással nem rokon személy

esetében határoztuk meg a jelenlévı allélokat. Mindkét populáció Hardy-Weinberg

egyensúlyban volt valamennyi vizsgált lókuszra. Egyik SNP esetén sem találtunk

szignifikáns különbséget sem az allélgyakoriságban, sem a genotípus gyakoriságban az AIS-

es és a kontroll csoport között de a különbözı genotípusok esélyhányadosainak

meghatározása után úgy tőnik a LEP-2548A allél jelenléte lehet hajlamosító faktor az AIS-

ben. Vizsgálatainkban az AA vs. GG: OR=1.513(CI:0.894-2.562), ami a komplex betegségek

esetén a hajlamosító allélokra jellemzı értéknek tekinthetı. Az esélyhányados értéke megnıtt

akkor, ha külön vizsgáltuk a lányokat (AA vs. GG: OR=2.02(CI:0.824-4.961)), ami azt jelzi,

hogy a lányokban nagyobb szerepe lehet az AIS kialakításában a LEP-2548A allélnak, mint a

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

82

fiúkban. Ugyanakkor nem találtunk összefüggést a görbület mértéke (Cobb˚) és az SNP által

meghatározott allélok között. Az IL6 G-174C polimorfizmusát vizsgálva nem tudtuk

megerısíteni a korábban, mások által leírt asszociációt. A reprodukálhatóság hiánya

egyáltalán nem egyedi, sıt a komplex betegségekre jellemzınek tartja a szakirodalom, ezért

szükséges több, megfelelı statisztikai erıvel rendelkezı, független populáción elvégezni az

asszociációs vizsgálatokat.

Mivel multifaktoriális öröklıdéső betegségekben a gének nem önmagukban hatnak,

hanem egymással kölcsönhatásban, ezért megvizsgáltuk létezik-e episztatikus kapcsolat az

általunk vizsgált két gén alléljei között. A gén-gén kölcsönhatás feltárásához két eljárást is

használtunk, az elsı az MDR analízis, amely kisszámú mintaelem esetén is kimutatja az

episztázist és alkalmas a gének közötti szinergizmus kimutatására akkor is ha az allél

eloszlásban nem mutatkozik eltérés a beteg és a kontroll csoport között. Az analízis

eredményeként megkaptuk azokat a genotípus kombinációkat , amelyek elıfordulása esetén

nagyobb a kockázata az AIS kialakulásának. A másik statisztikai módszer, ami a

génkombinációk hatásának maximum likelihood becslését alkalmazva megadja, hogy egy

adott génkombináció milyen mértékben emeli meg a betegség kialakulásának esélyét egy

másik génkombinációhoz viszonyítva. Az elemzés után a leginkább hajlamosító

allélkombináció (IL6 CC-LEP AA) hordozójának 4.667-szor nagyobb az esélye az AIS

kialakulására, mint az (IL6 GG-LEP GG) kombináció hordozójának. Ez az esélyhányados

még magasabb a lányok esetén, tehát a hajlamosító allélkombináció (IL6 CC-LEP AA)

hordozása még nagyobb kockázatot jelent náluk (OR= 6.667 (CI:0.597-74.506). Statisztikai

módszerrel megvizsgálva a genotípus kombinációk és a Cobb˚ közötti kapcsolatot, nem

találtunk semmiféle összefüggést köztük. A vizsgálati eredményeink alapján úgy gondoljuk,

hogy a LEP AA-IL6 CC genotípus kombináció az AIS kialakulására hajlamosít, nem pedig a

progressziójában játszhat szerepet.

Jelen dolgozatban az AIS kutatásában újszerő megközelítést használva a paravertebrális

izmok génexpressziós mintázatát vizsgáltuk és sikerült transzkriptoma szinten megjelenı

eltérést feltárni és független módszerrel visszaigazolni a leptin gén esetén. A további

genetikai és statisztikai elemzések az AIS kialakításában szerepet játszható gén-gén

kölcsönhatás felderítéséhez vezetett és elsıként sikerült kimutatnunk, hogy két adipokint

(leptint, interleukin-6-ot) termelı gén szabályozását befolyásoló polimorfizmus együttes

jelenléte szóba jöhet, mint hajlamosító faktor az AIS etiológiájában.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

83

SUMMARY

In the 21st Century the human genetic studies focus on revealing etiology of common

complex diseases. Complex diseases are believed to be caused by a several number of genes,

usually interacting with various environmental factors and to be genetically heterogenic like

coronary heart diseases. Adolescence idiopathic scoliosis, a multifactorial disease represents

a three-dimensional deformity of spine with lateral curvature in which the causes are

unknown. Many studies are conducted to uncover contributing genetic factors of AIS,

however, genetics underlying AIS have not been identified yet. Adolescent idiopathic

scoliosis occurs at the peripubertal period (between 10 and 16 years of age) supposing the

role in AIS pathomechamism the changes in endocrine, metabolic and biomechanical

alterations during growth spurt. It is widely accepted that scoliosis has a sex-conditioned

manifestation, girls have a higher risk for development of curve progression the ratio of girls

to boys is 3.4/1 with curves greater than 30 degrees. In the last 40 years many different

research area were involved in hunting for etiology factors of spine deformity like connective

tissue abnormalities, asymmetries in the central nervous system, hormonal variation and

genetics.

According to the most accepted model for inheritance the genetic factors can be divided into

predisposing factors, initiating factors and contributing factors in accordance with their role

in the pathogenesis of AIS. Moreover, the current view is that there are no major genes

causing AIS, but combinations of sequence variants of possible predisposition genes may

have synergic effects on determining the deformity. Therefore, it is important to identify such

sequence variants and combined genotype pattern of these susceptibility genes to get a better

understanding of AIS pathogenesis.

The major objectives of the work presented in my dissertation were the investigation of the

genetic background of AIS and the identification of novel molecular alterations that are

associated with this disease. The study was performed in close collaboration with Prof.

Tamás Illés at Department of Orthopaedics, Medical School University of Pécs, who

provided us the clinical samples of AIS patients.

For molecular biology studies I used two different molecular biological approaches.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

84

In the first approach I have investigated the gene expression pattern of the paravertebral

muscles responsible for the stability of the spinal column. By using the DNA microarray

technology in transcriptome profiling experiments I have compared:

I. The gene expression pattern of the paravertebral muscles in healthy control

individuals and AIS patients.

II. The gene expression pattern of the paravertebral muscles in the concave and the

convex side of the spinal column deformity.

I have collected those genes that could be candidates for further studies according to the

following criteria:

1. They are significantly accumulated in a functionally relevant Gene Ontology

group.

2. They are accumulated in a functionally relevant metabolic or signal transduction

pathway.

3. They are located in a chromosome region has been previously reported to be

involved in AIS.

4. According to the scientific publications reliable hypothesis could be built regarding

its involvement in AIS pathomechanism.

In the second approach the identified potential candidate genes were investigated in case-

control SNP polymorphism association studies. The data resulted by these experiments was

subjected to different statistical evaluation processes suitable for the identification of the

genetic interactions and the determination whether a particular gene is involved in the onset

or in the later progression phase of the AIS.

For revealing the gene expression differences in AIS 95 total RNA samples have been

prepared from muscle biopsies of patients subjected to correction surgery interventions. In

collaboration with the Functional Genomics Group of the BRC two microarray transcription

profiling experiments have been performed. In the first experimental layout I have compared

the gene expression levels in healthy and AIS individuals. In the second I have revealed the

differences in the transcriptional landscape of muscle samples derived from the concave and

the convex side of the spinal column deformity. To select genes for further genetic

investigations, the elements of the gene lists have been evaluated regarding to the following

four criteria:

1. The members of the gene lists has been classified according to their Gene Ontology

annotation, and the significantly overrepresented GO categories that functionally

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

85

might be involved in the AIS etiology have been identified. Genes from the lipid

metabolism (GO:0006629) and morphogenesis (GO:0007275) categories were

enriched in gene set showing expression difference in the concave and convex side of

the spinal cord deformity. These GO categories contained 18 out of the total 63 genes

of this list.

2. The simultaneous accumulation of genes with significantly altered expression in

particular metabolic or signal transduction networks might help to reveal molecular or

cell physiological processes involved in the appearance of a disease phenotype. In our

microarray investigations an adipocyte signalling cascade (KEGG_Pathway:

hsa04920) proved to be overrepresented in the significant gene list, indicating the

potential role of lipid metabolism in AIS disorder.

3. I have identified the chromosomal localization of genes showing significant

expression difference in microarray experiments and selected 8 of them to be

localized to chromosomal region have previously been reported in family based

linkage analysis as could be involved in AIS.

4. Performing very exhaustive data mining in different biomedical literature and gene

annotation databases like Pubmed, GenCards or OMIM, I tried to find connections

between the known functions of the selected genes and the different AIS pathogenesis

models suggested up till now by the scientific community working in this field. Two

of the identified genes might be very interesting in this respect. Distrophin (DTS) has

well characterized role in affecting the muscle strength, while tensin has an important

function in the regeneration process of the wounded muscles.

It is always necessary to validate the microarray results by an independent method. In bulk

majority of the currently applied experimental strategies this independent method is the

quantitative real time polymerase chain reaction (QRT-PCR). In QRT-PCR assay the

abundance of leptin gene relative mRNA was 2.5 times higher in the convex side of the spine

in AIS patients. These findings inspired me to make further studies concerning the

involvement of leptin gene in AIS pathogenesis.

In a case-control association study I have investigated the association of a promoter SNP in

the leptin gene with the manifestation of the AIS phenotype. In the same assay I have also

analyzed another SNP from IL6 gene promoter region that has been reported to be associated

with AIS. By using the PCR-RFLP method for the concurrent detection of LEP G-2548A and

IL6 G-174C polymorphisms I have determined the genotypes in 126 AIS and 197 healthy

individuals. Both investigated populations were in Hardy-Weinberg equilibrium at these loci.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

86

No significant differences were found for allele and genotype frequencies of the

polymorphisms of LEP G-2548A and IL6 G-174C between cases or controls. However the

determination of the odds ratio of the different genotypes indicates that the presence of the

LEP-2548A allele might be a susceptibility factor for AIS. In my studies the odds ratio of

LEP-2548 AA vs. LEP-2548 GG was OR=1.513 (CI:0.894-2.562) which is generally

accepted as an indicator for susceptibility alleles in the case of complex diseases. The odds

ratio value was further increased (LEP-2548 AA vs. LEP-2548 GG: OR=2.02(CI:0.824-

4.961)) when the female subpopulations was subjected, suggesting that in females LEP-

2548A allele might have a greater impact on the manifestation of AIS than in males. In the

other hand I didn’t find any association between the alleles determined by these SNPs and the

extent (Cobbo) of the spinal curve.

I have investigated whether there is any epistatic interaction between the alleles of leptin and

IL6 in respect of the manifestation of idiopathic scoliosis. I have used two different

approaches for revealing the gene-gene interactions. MDR analysis is suitable for detection of

epistatic interactions in such situations when the sample size is relatively small for the

investigation. As a result of this study the genotype combinations had increased risk of the

appearance of AIS could be emerged. The other statistical process based on the maximum

likelihood estimation can give a quantitative answer how a particular allelic combination

increases the chance of AIS manifestation compared to the other allelic patterns. By

performing these studies I have demonstrated that the IL6 CC-LEP AA allele combination

has the strongest susceptibility effect, which is 4.667 times higher to that of appear in the

presence of IL6 GG-LEP GG alleles. This relative odds ratio is even higher in the case of

female target population (OR= 6.667 (CI:0.597-74.506) indicating a higher genetic risk for

idiopathic scoliosis.

In the studies described in my Ph.D. dissertation I used a novel approaches, namely

microarray analyses in AIS research for the investigation of the gene expression pattern of the

paravertebral muscles. I could identify several genes where the altered gene expression

indicates their potential role in AIS pathogenesis. An independent method (QRT-PCR) was

successfully used to collect supporting evidence regarding the detected gene expression

difference in the case of leptin. Further genotyping studies and statistical investigations lead

to the identification of a gene-gene interaction resulting in increased susceptibility for AIS. I

could demonstrate that the simultaneous occurrence of allelic variants determined by single

nucleotide polymorphisms in the regulatory promoter regions of two adipokine genes (IL6

and leptin) might be a susceptibility factor in AIS etiology.

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

87

KÖZLEMÉNYEK LISTÁJA

1. Czibula, A; Leiker, G; Rasko, I

Changes in alkylation damage removal during in vitro neuronal differentiation

ACTA BIOLOGICA HUNGARICA Volume: 48 Issue: 1 Pages: 113-120 (1997)

2. Czibula, A; Morocz, M; Bachrati, CZ, et al.

Hunt for genetic susceptibility in a complex disease

JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE-THEOCHEM Volume: 666 Pages: 681-686

(2003)

3. Gervain J, Czibula A, Simon J, Kalmár T.

Structural analysis of the PKR-binding region of HCV 1b samples from patients with chronic

hepatitis C and the correlation with IFN-sensitivity

ORV HETIL. Volume:144 Issue: 24 Pages: 1179-84( 2003) Hungarian.

4. Bogácsi-Szabó E, Kalmár T, Csányi B, Tömöry G, Czibula A, Priskin K, Horváth F,

Downes CS, Raskó I.

Mitochondrial DNA of ancient Cumanians: Culturally Asian steppe nomadic immigrants with

substantially more western Eurasian mitochondrial DNA lineages

HUMAN BIOLOGY Volume: 77 Issue: 5 Pages: 639-662 ( 2005)

5. Ion G, Fajka-Boja R, Kovács F, Szebeni G, Gombos I, Czibula A, Matkó J, Monostori E.

Acid sphingomyelinase mediated release of ceramide is essential to trigger the mitochondrial

pathway of apoptosis by galectin-1

CELLULAR SIGNALLING Volume: 18 Issue: 11 Pages: 1887-1896 (2006)

6. Hegedus Z, Czibula A, Kiss-Toth, E

Tribbles: novel regulators of cell function; evolutionary aspects

CELLULAR AND MOLECULAR LIFE SCIENCES Volume: 63 Issue: 14 Pages: 1632-

1641 (2006)

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

88

7. Zana M, Szécsényi A, Czibula A, Bjelik A, Juhász A, Rimanóczy A, Szabó K, Vetró A,

Szucs P, Várkonyi A, Pákáski M, Boda K, Raskó I, Janka Z, Kálmán J.

Age-dependent oxidative stress-induced DNA damage in Down's lymphocytes

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS Volume:345

Issue:2 Pages: 726-733 (2006)

8. Hegedus Z, Czibula A, Kiss-Toth, E

Tribbles: A family of kinase-like proteins with potent signalling regulatory function

CELLULAR SIGNALLING Volume: 19 Issue: 2 Pages: 238-250 (2007)

9. Tömöry G, Csányi B, Bogácsi-Szabó E, Kalmár T, Czibula A, Csosz A, Priskin K, Mende

B, Langó P, Downes CS, Raskó I

Comparison of maternal lineage and biogeographic analyses of ancient and modern

Hungarian populations

AMERICAN JOURNAL OF PHYSICAL ANTHROPOLOGY Volume: 134 Pages: 354-368

(2007)

10. Sung HY, Guan H, Czibula A, King AR, Eder K, Heath E, Suvarna SK, Dower SK,

Wilson AG, Francis SE, Crossman DC, Kiss-Toth E.

Human tribbles-1 controls proliferation and chemotaxis of smooth muscle cells via MAPK

signaling pathways

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY Volume: 282 Issue: 25 Pages: 18379-18387

(2007)

11. Almos PZ, Horváth S, Czibula A, Raskó I, Sipos B, Bihari P, Béres J, Juhász A, Janka Z,

Kálmán J.

H1 tau haplotype-related genomic variation at 17q21.3 as an Asian heritage of the European

Gypsy population.

HEREDITY Volume: 101 Issue: 5 Pages: 416-419 (2008)

12. Csányi B, Bogácsi-Szabó E, Tömöry G, Czibula A, Priskin K, Csõsz A, Mende B, Langó

P, Csete K, Zsolnai A, Conant EK, Downes CS, Raskó I

Y-chromosome analysis of ancient Hungarian and two modern Hungarian-speaking

populations from the Carpathian Basin

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

89

ANNALS OF HUMAN GENETICS Volume: 72 Pages: 519-534 (2008)

13. Matusek,T.; Gombos,R.; Szecsenyi,A.; Sanchez-Soriano,N.; Czibula,A.; Pataki,C.;

Gedai,A.; Prokop,A.; Rasko,I.; Mihaly,J.

Formin proteins of the DAAM subfamily play a role during axon growth

JOURNAL OF NEUROSCIENCES Volume: 28 Issue: 49 Pages: 13310-13319 (2008)

14. Nagy,D.; Bogacsi-Szabo,E.; Varkonyi,A.; Csanyi,B.; Czibula,A.; Bede,O.; Tari,B.;

Rasko,I.

Prevalence of adult-type hypolactasia as diagnosed with genetic and lactose hydrogen breath

tests in Hungarians

EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL NUTRITION Volume: 63 Issue: 7 Pages: 909-912

(2009)

15. Mórocz M, Czibula A *, Grózer Zs, Szécsényi A, Álmos P, Dragon A, Raskó I, Illés T

Association study of MMP-3, IL-6, Leptin, BMP4, MTNR1B Gene Promoter Polymorphisms

and Adolescent Idiopathic Scoliosis

Közlésre elküldve a SPINE-ba, revízió alatt

*megosztott elsı szerzıség

Konferencia kiadványok

1. Regulation of the bovine leukemia-virus basal transcription

Kiss-Toth E, Unk I, Bachrati C, Czibula A

JOURNAL OF CELLULAR BIOCHEMISTRY Pages: 48-48 Supplement: 18C (1994)

2. Repair of alkylation damage by differentiating mouse teratocarcinoma cells

Czibula A, Leiker G, Margison GP, T, Rasko I

JOURNAL OF CELLULAR BIOCHEMISTRY Pages: 278-278 Supplement: (1995)

3. Changes of DNA repair during in vitro cellular differentiation

Czibula A, Gerencser A, Bachrati C, Borda S, Johnson RT, Rasko I

CELL BIOLOGY INTERNATIONAL Volume: 20 Pages: 220-220

(1996)

Czibula Ágnes: Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálta Ph.D. értekezés, 2010

90

4. A putative molecular genetic susceptibility allele for idiopathic scoliosis

Czibula A, Morocz M, Csiszar A, Bachrati C, Olah E, Szeszak F, Morava E, Szappanos L,

Rasko I

EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS Volume: 10 Pages: 76-77 (2002)

5. The correlation of genom mutations in HCV-1b with IFN-sensitivity in Hungarian patients

Gervain J, Simon J, Czibula A, Kalmar T

JOURNAL OF GASTROENTEROLOGY AND HEPATOLOGY Volume: 21 Pages: A139-

A139 Supplement: 2 (2006)