agarose

5
The use of Quantitative Agarose Gel Electrophoresis for rapid analysis of the integrity of protein–DNA complexes (biomol agarose 1) Metode ini, disebut sebagai Kuantitatif Agarose Gel Elektroforesis (QAGE), memerlukan penggunaan "multigels" [10] yang terdiri dari 9 atau 18 jalur agarosa dari persentase yang berbeda (dari 0,2 hingga 3% dengan penambahan sebesar 0,1%). Percobaan awal untuk mengkalibrasi sistem dilakukan dengan sampel kromatin baik ditandai dihasilkan dari histon dimurnikan dan 5S rDNA mengulangi [8]. Kedua kepadatan muatan permukaan dan perubahan konformasi yang dipantau oleh analisis QAGE dan cocok perilaku yang diharapkan dari sampel kromatin bawah kondisi percobaan yang digunakan Agarose and polyacrylamide gel electrophoresis methods for molecular mass analysis of 5- to 500-kDa hyaluronan ( biomol agarose 2) Gel elektroforesis agarosa sistem dan polyacrylamide untuk pemisahan tergantung massa molekul Hyaluronan ( HA ) dalam berbagai ukuran sekitar 5-500 kDa diselidiki . Untuk sistem berbasis agarosa , kesesuaian jenis agarosa , konsentrasi agarosa , dan sistem penyangga ditentukan . Sejumlah metode elektroforesis gel agarosa untuk pemisahan hyaluronan HA telah dikembangkan . Untuk massa molekul tinggi HA ( 200-6000 kDa ) , kami mengembangkan sistem gel agarosa 0,5 % yang telah terbukti memberikan

Upload: elisa-cynthia-ardaricka

Post on 28-Dec-2015

15 views

Category:

Documents


3 download

TRANSCRIPT

Page 1: Agarose

The use of Quantitative Agarose Gel Electrophoresis for rapid analysis of the integrity of proteinndashDNA complexes (biomol agarose 1)

Metode ini disebut sebagai Kuantitatif Agarose Gel Elektroforesis (QAGE) memerlukan penggunaan multigels [10] yang terdiri dari 9 atau 18 jalur agarosa dari persentase yang berbeda (dari 02 hingga 3 dengan penambahan sebesar 01) Percobaan awal untuk mengkalibrasi sistem dilakukan dengan sampel kromatin baik ditandai dihasilkan dari histon dimurnikan dan 5S rDNA mengulangi [8] Kedua kepadatan muatan permukaan dan perubahan konformasi yang dipantau oleh analisis QAGE dan cocok perilaku yang diharapkan dari sampel kromatin bawah kondisi percobaan yang digunakan

Agarose and polyacrylamide gel electrophoresis methods for molecular mass analysis of 5- to 500-kDa hyaluronan

( biomol agarose 2)

Gel elektroforesis agarosa sistem dan polyacrylamide untuk pemisahan tergantung massa molekul Hyaluronan ( HA ) dalam berbagai ukuran sekitar 5-500 kDa diselidiki Untuk sistem berbasis agarosa kesesuaian jenis agarosa konsentrasi agarosa dan sistem penyangga ditentukan

Sejumlah metode elektroforesis gel agarosa untuk pemisahan hyaluronan HA telah dikembangkan Untuk massa molekul tinggi HA ( 1113088 200-6000 kDa ) kami mengembangkan sistem gel agarosa 05 yang telah terbukti memberikan baik pemisahan ukuran berbasis dan perhitungan yang akurat dari massa molekul rata-rata dan jumlah rata-rata [ 11 ] ( lihat juga artikel yang menyertainya dari Cowman et al ) Banyak komposisi gel agarosa lain dan kondisi elektroforesis telah dilaporkan [ 1730-50 ] Metode ini telah mempekerjakan sumber yang berbeda agarosa konsentrasi dan dimensi gel Tegangan dan waktu untuk pemisahan telah var - ied Perubahan dalam prosedur pewarnaan dan yang lebih penting prosedur destaining yang keduanya harus dikontrol dengan baik untuk menghasilkan scan densitometri kuantitatif telah dibuat Banyak metode baru memberikan rupanya pemisahan yang sangat baik dari tinggi sampai sedang massa molekul HA tetapi validasi akurasi sehubungan dengan distribusi massa molekul terdeteksi belum disediakan

Disease proteomics of high-molecular-mass proteins by two-dimensional gel electrophoresis with agarose gels in the first

dimension (Agarose 2-DE)1113092

biomol agarose 3pdf

Gel agarosa adalah media elektroforesis yang disukai saat ini digunakan untuk memisahkan massa molekul tinggi ( HMM ) protein ( MW gt 100 kDa ) Gel agarosa secara luas digunakan untuk kedua elektroforesis gel SDS - agarosa dan isoelektrik agarosa fokus ( IEF ) Sebuah metode gel elektroforesis dua dimensi menggunakan gel agarosa dalam dimensi pertama ( agarosa 2 - DE ) yang cukup baik pada memisahkan hingga 15 mg protein HMM dengan massa molekul besar seperti 500 kDa telah digunakan untuk memisahkan protein dari berbagai penyakit jaringan dan sel

Determination of agarose gel pore size Absorbance measurements vis a vis other techniques( agarose 4)

Agarose adalah polisakarida laut sering digunakan sebagai model biopolimer di gelasi Membentuk thermo gel reversibel yang terdiri dari bundel tebal rantai agarosa dihubungkan oleh ikatan hidrogen dengan pori-pori besar menahan air [1] Sebagai hidrogel agarosa menemukan berbagai aplikasi dalam elektroforesis gel kultur jaringan farmasi dan teknologi pangan Sifat mekanis dari gel diputuskan untuk sebagian besar oleh jala-ukuran jaringan (ukuran pori) yang pada gilirannya tergantung pada jenis dan konsentrasi agarosa pengaturan suhu dan lain-lain Beberapa metode dapat digunakan dalam karakterisasi ukuran pori gel agarosa Teknik-teknik lain yang mungkin adalah hamburan cahaya dinamis (DLS) gel elektroforesis dan panjang gelombang eksponen metode (WLE) sebagaimana digariskan oleh Aymard et al

Electrophoresis of DNA in agarose gels polyacrylamide gels and in free solution

(5)

Agarose merupakan kopolimer bolak 13-linked β-D-galaktosa dan 14-linked 36 - anhydro-α-L-galaktosa jarang diganti dengan karboksilat piruvat dan atau residu sulfat [29-33] Molekul Agarose dalam larutan memiliki struktur kumparan acak pada suhu tinggi [33-35] Polyacrylamide gel gel kimia silang yang dibentuk oleh reaksi dari akrilamida dengan agen ikatan silang bifunctional seperti N N-metilenabisakrilamida (Bis)

Two-dimensional intact mitochondrial DNA agarose electrophoresis reveals the structural complexityof the mammalian mitochondrial genome(6)

Elektroforesis gel agarosa merupakan metode yang kuat untuk memisahkan DNA plasmid topoisomers dan pertama kali digunakan untuk memeriksa kerusakan mtDNA dalam mitokondria sel HeLa terisolasi (2425)

AGAROSE GEL ELECTROPHORESIS ndash APPLICATIONS IN CLINICAL CHEMISTRY

(7)

Elektroforesis gel agarosa adalah teknik mapan secara rutin digunakan di laboratorium klinis untuk skrining kelainan protein dalam berbagai cairan biologis (serum urin CSF) Hal ini didasarkan pada prinsip-prinsip zona elektroforesis Protein sebagai molekul bermuatan bermigrasi dalam medium padat direndam dengan penyangga di bawah pengaruh medan listrik Migrasi tergantung-ent pada muatan bersih listrik titik isoelektrik dan massa molekul protein

Modified gel preparation for distinct DNA fragment analysis in agarose gel electrophoresis (8)

Elektroforesis gel agarosa adalah metode standar yang digunakan untuk memisahkan mengidentifikasi dan memurnikan fragmen DNA Namun metode ini adalah memakan waktu dan mampu memisahkan jangkauan terbatas fragmen Sebuah teknik baru persiapan gel dikembangkan untuk meningkatkan analisis fragmen DNA melalui elektroforesis

(pembahasan)

Umumnya agarosa gel dilemparkan pada konsentrasi tunggal dengan melelehkan

agarose di hadapan buffer yang diinginkan (Tris-acetate-EDTA atau Tris-borat-EDTA) yang menetapkan pH dan memberikan ion untuk mendukung konduktivitas Adapun visibilitas ethidium bromide pewarna fluorescent yang intercalates antara dasar asam nukleat memungkinkan deteksi fragmen DNA pada gel Pengikatan etidium bromida DNA mengurangi mobilitas elektro-phoretic dengan memperluas panjang DNA linear dan membuat molekul DNA sirkular yang sobek lebih kaku

Page 2: Agarose

dimension (Agarose 2-DE)1113092

biomol agarose 3pdf

Gel agarosa adalah media elektroforesis yang disukai saat ini digunakan untuk memisahkan massa molekul tinggi ( HMM ) protein ( MW gt 100 kDa ) Gel agarosa secara luas digunakan untuk kedua elektroforesis gel SDS - agarosa dan isoelektrik agarosa fokus ( IEF ) Sebuah metode gel elektroforesis dua dimensi menggunakan gel agarosa dalam dimensi pertama ( agarosa 2 - DE ) yang cukup baik pada memisahkan hingga 15 mg protein HMM dengan massa molekul besar seperti 500 kDa telah digunakan untuk memisahkan protein dari berbagai penyakit jaringan dan sel

Determination of agarose gel pore size Absorbance measurements vis a vis other techniques( agarose 4)

Agarose adalah polisakarida laut sering digunakan sebagai model biopolimer di gelasi Membentuk thermo gel reversibel yang terdiri dari bundel tebal rantai agarosa dihubungkan oleh ikatan hidrogen dengan pori-pori besar menahan air [1] Sebagai hidrogel agarosa menemukan berbagai aplikasi dalam elektroforesis gel kultur jaringan farmasi dan teknologi pangan Sifat mekanis dari gel diputuskan untuk sebagian besar oleh jala-ukuran jaringan (ukuran pori) yang pada gilirannya tergantung pada jenis dan konsentrasi agarosa pengaturan suhu dan lain-lain Beberapa metode dapat digunakan dalam karakterisasi ukuran pori gel agarosa Teknik-teknik lain yang mungkin adalah hamburan cahaya dinamis (DLS) gel elektroforesis dan panjang gelombang eksponen metode (WLE) sebagaimana digariskan oleh Aymard et al

Electrophoresis of DNA in agarose gels polyacrylamide gels and in free solution

(5)

Agarose merupakan kopolimer bolak 13-linked β-D-galaktosa dan 14-linked 36 - anhydro-α-L-galaktosa jarang diganti dengan karboksilat piruvat dan atau residu sulfat [29-33] Molekul Agarose dalam larutan memiliki struktur kumparan acak pada suhu tinggi [33-35] Polyacrylamide gel gel kimia silang yang dibentuk oleh reaksi dari akrilamida dengan agen ikatan silang bifunctional seperti N N-metilenabisakrilamida (Bis)

Two-dimensional intact mitochondrial DNA agarose electrophoresis reveals the structural complexityof the mammalian mitochondrial genome(6)

Elektroforesis gel agarosa merupakan metode yang kuat untuk memisahkan DNA plasmid topoisomers dan pertama kali digunakan untuk memeriksa kerusakan mtDNA dalam mitokondria sel HeLa terisolasi (2425)

AGAROSE GEL ELECTROPHORESIS ndash APPLICATIONS IN CLINICAL CHEMISTRY

(7)

Elektroforesis gel agarosa adalah teknik mapan secara rutin digunakan di laboratorium klinis untuk skrining kelainan protein dalam berbagai cairan biologis (serum urin CSF) Hal ini didasarkan pada prinsip-prinsip zona elektroforesis Protein sebagai molekul bermuatan bermigrasi dalam medium padat direndam dengan penyangga di bawah pengaruh medan listrik Migrasi tergantung-ent pada muatan bersih listrik titik isoelektrik dan massa molekul protein

Modified gel preparation for distinct DNA fragment analysis in agarose gel electrophoresis (8)

Elektroforesis gel agarosa adalah metode standar yang digunakan untuk memisahkan mengidentifikasi dan memurnikan fragmen DNA Namun metode ini adalah memakan waktu dan mampu memisahkan jangkauan terbatas fragmen Sebuah teknik baru persiapan gel dikembangkan untuk meningkatkan analisis fragmen DNA melalui elektroforesis

(pembahasan)

Umumnya agarosa gel dilemparkan pada konsentrasi tunggal dengan melelehkan

agarose di hadapan buffer yang diinginkan (Tris-acetate-EDTA atau Tris-borat-EDTA) yang menetapkan pH dan memberikan ion untuk mendukung konduktivitas Adapun visibilitas ethidium bromide pewarna fluorescent yang intercalates antara dasar asam nukleat memungkinkan deteksi fragmen DNA pada gel Pengikatan etidium bromida DNA mengurangi mobilitas elektro-phoretic dengan memperluas panjang DNA linear dan membuat molekul DNA sirkular yang sobek lebih kaku

Page 3: Agarose

Two-dimensional intact mitochondrial DNA agarose electrophoresis reveals the structural complexityof the mammalian mitochondrial genome(6)

Elektroforesis gel agarosa merupakan metode yang kuat untuk memisahkan DNA plasmid topoisomers dan pertama kali digunakan untuk memeriksa kerusakan mtDNA dalam mitokondria sel HeLa terisolasi (2425)

AGAROSE GEL ELECTROPHORESIS ndash APPLICATIONS IN CLINICAL CHEMISTRY

(7)

Elektroforesis gel agarosa adalah teknik mapan secara rutin digunakan di laboratorium klinis untuk skrining kelainan protein dalam berbagai cairan biologis (serum urin CSF) Hal ini didasarkan pada prinsip-prinsip zona elektroforesis Protein sebagai molekul bermuatan bermigrasi dalam medium padat direndam dengan penyangga di bawah pengaruh medan listrik Migrasi tergantung-ent pada muatan bersih listrik titik isoelektrik dan massa molekul protein

Modified gel preparation for distinct DNA fragment analysis in agarose gel electrophoresis (8)

Elektroforesis gel agarosa adalah metode standar yang digunakan untuk memisahkan mengidentifikasi dan memurnikan fragmen DNA Namun metode ini adalah memakan waktu dan mampu memisahkan jangkauan terbatas fragmen Sebuah teknik baru persiapan gel dikembangkan untuk meningkatkan analisis fragmen DNA melalui elektroforesis

(pembahasan)

Umumnya agarosa gel dilemparkan pada konsentrasi tunggal dengan melelehkan

agarose di hadapan buffer yang diinginkan (Tris-acetate-EDTA atau Tris-borat-EDTA) yang menetapkan pH dan memberikan ion untuk mendukung konduktivitas Adapun visibilitas ethidium bromide pewarna fluorescent yang intercalates antara dasar asam nukleat memungkinkan deteksi fragmen DNA pada gel Pengikatan etidium bromida DNA mengurangi mobilitas elektro-phoretic dengan memperluas panjang DNA linear dan membuat molekul DNA sirkular yang sobek lebih kaku

Page 4: Agarose

agarose di hadapan buffer yang diinginkan (Tris-acetate-EDTA atau Tris-borat-EDTA) yang menetapkan pH dan memberikan ion untuk mendukung konduktivitas Adapun visibilitas ethidium bromide pewarna fluorescent yang intercalates antara dasar asam nukleat memungkinkan deteksi fragmen DNA pada gel Pengikatan etidium bromida DNA mengurangi mobilitas elektro-phoretic dengan memperluas panjang DNA linear dan membuat molekul DNA sirkular yang sobek lebih kaku